View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3825_low_4 (Length: 526)

Name: NF3825_low_4
Description: NF3825
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3825_low_4
NF3825_low_4
[»] chr5 (120 HSPs)
chr5 (237-512)||(39132773-39133048)
chr5 (2-240)||(14717505-14717743)
chr5 (2-237)||(41282242-41282477)
chr5 (2-240)||(8215800-8216038)
chr5 (2-240)||(30297752-30297990)
chr5 (2-240)||(33760473-33760711)
chr5 (2-240)||(38964117-38964354)
chr5 (2-240)||(11000731-11000969)
chr5 (2-240)||(16095963-16096200)
chr5 (2-238)||(40074850-40075086)
chr5 (2-240)||(6739958-6740196)
chr5 (2-240)||(26593283-26593521)
chr5 (2-240)||(30863153-30863391)
chr5 (2-240)||(39824456-39824694)
chr5 (2-240)||(14952224-14952462)
chr5 (2-240)||(20408433-20408671)
chr5 (2-240)||(23128916-23129154)
chr5 (2-240)||(31710182-31710420)
chr5 (2-240)||(8689472-8689710)
chr5 (2-238)||(42993418-42993654)
chr5 (2-240)||(3352005-3352242)
chr5 (2-240)||(4015877-4016114)
chr5 (2-240)||(6600139-6600377)
chr5 (2-240)||(35342080-35342318)
chr5 (2-240)||(20079261-20079498)
chr5 (2-204)||(6331277-6331479)
chr5 (2-240)||(11692150-11692388)
chr5 (2-240)||(28078408-28078646)
chr5 (2-222)||(26035367-26035587)
chr5 (2-222)||(16752016-16752236)
chr5 (1-237)||(19398199-19398435)
chr5 (2-237)||(30208408-30208638)
chr5 (51-238)||(39002030-39002217)
chr5 (2-238)||(1052436-1052669)
chr5 (1-233)||(27116109-27116335)
chr5 (2-238)||(43166274-43166501)
chr5 (2-240)||(27457200-27457434)
chr5 (2-240)||(6251893-6252110)
chr5 (2-240)||(27509878-27510109)
chr5 (2-238)||(8694766-8695002)
chr5 (2-222)||(444854-445074)
chr5 (51-240)||(11935395-11935583)
chr5 (98-240)||(19659504-19659646)
chr5 (4-120)||(20517060-20517176)
chr5 (4-105)||(19661769-19661870)
chr5 (2-95)||(37923546-37923639)
chr5 (2-60)||(6600096-6600154)
chr5 (2-60)||(20408656-20408714)
chr5 (2-60)||(28078365-28078423)
chr5 (2-62)||(8689693-8689753)
chr5 (2-62)||(26593240-26593300)
chr5 (2-62)||(27457157-27457217)
chr5 (2-62)||(31710403-31710463)
chr5 (1-60)||(30297708-30297767)
chr5 (2-60)||(6252095-6252153)
chr5 (2-60)||(11000688-11000746)
chr5 (2-60)||(11935568-11935626)
chr5 (2-60)||(33760430-33760488)
chr5 (1-60)||(43166228-43166287)
chr5 (2-60)||(1052656-1052714)
chr5 (2-60)||(6739915-6739973)
chr5 (2-60)||(8216023-8216081)
chr5 (2-60)||(20079218-20079276)
chr5 (2-60)||(39824679-39824737)
chr5 (2-59)||(6332900-6332957)
chr5 (1-60)||(4015833-4015892)
chr5 (1-60)||(27116058-27116117)
chr5 (2-57)||(39401952-39402007)
chr5 (2-60)||(3351962-3352020)
chr5 (2-60)||(8694989-8695047)
chr5 (2-60)||(16095920-16095978)
chr5 (2-60)||(19659461-19659519)
chr5 (1-59)||(30208361-30208419)
chr5 (2-60)||(35342303-35342361)
chr5 (2-62)||(23128872-23128933)
chr5 (8-60)||(14952447-14952499)
chr5 (2-62)||(30863374-30863433)
chr5 (2-62)||(38964074-38964134)
chr5 (2-62)||(39001985-39002045)
chr5 (1-60)||(27510094-27510153)
chr5 (2-57)||(42993644-42993699)
chr5 (2-60)||(40075073-40075131)
chr5 (2-60)||(41282465-41282523)
chr5 (2-59)||(19398153-19398210)
chr5 (2-54)||(9919734-9919786)
chr5 (12-60)||(14717728-14717776)
chr5 (2-56)||(17002343-17002397)
chr5 (2-52)||(33002932-33002982)
chr5 (2-52)||(35155363-35155413)
chr5 (2-52)||(42263047-42263097)
chr5 (2-54)||(9919242-9919294)
chr5 (1-36)||(39002201-39002236)
chr5 (2-67)||(31710153-31710216)
chr5 (2-39)||(3352234-3352271)
chr5 (2-39)||(6600369-6600406)
chr5 (25-62)||(11692130-11692167)
chr5 (2-39)||(11692380-11692417)
chr5 (2-39)||(17002389-17002426)
chr5 (2-39)||(20079490-20079527)
chr5 (2-39)||(20408404-20408441)
chr5 (2-39)||(26593513-26593550)
chr5 (2-35)||(27116331-27116364)
chr5 (2-39)||(41282213-41282250)
chr5 (2-37)||(16752242-16752277)
chr5 (2-37)||(26035326-26035361)
chr5 (1-39)||(16096192-16096230)
chr5 (2-39)||(4016106-4016143)
chr5 (2-39)||(6251864-6251901)
chr5 (2-39)||(6331248-6331285)
chr5 (199-240)||(6332873-6332914)
chr5 (2-39)||(6740188-6740225)
chr5 (2-39)||(8689443-8689480)
chr5 (2-31)||(19661872-19661901)
chr5 (2-31)||(20517029-20517058)
chr5 (2-39)||(27509849-27509886)
chr5 (2-39)||(30297982-30298019)
chr5 (2-39)||(39824427-39824464)
chr5 (2-39)||(42993389-42993426)
chr5 (2-39)||(43166493-43166530)
chr5 (12-52)||(35861227-35861267)
[»] chr7 (104 HSPs)
chr7 (2-240)||(47219045-47219283)
chr7 (2-240)||(1469496-1469734)
chr7 (2-240)||(31684137-31684375)
chr7 (2-240)||(44544309-44544547)
chr7 (2-240)||(47281127-47281367)
chr7 (2-240)||(47271881-47272119)
chr7 (2-240)||(47294294-47294532)
chr7 (1-240)||(30798371-30798610)
chr7 (1-240)||(35600125-35600364)
chr7 (2-240)||(11476559-11476797)
chr7 (2-240)||(30876159-30876397)
chr7 (2-240)||(45723494-45723732)
chr7 (2-240)||(41139411-41139653)
chr7 (1-240)||(30971944-30972183)
chr7 (2-240)||(23842205-23842443)
chr7 (2-240)||(43968262-43968500)
chr7 (1-240)||(27364342-27364581)
chr7 (2-240)||(38427566-38427803)
chr7 (1-238)||(8162717-8162954)
chr7 (2-238)||(4923116-4923352)
chr7 (2-237)||(29248242-29248477)
chr7 (2-240)||(33884225-33884457)
chr7 (2-240)||(42979341-42979579)
chr7 (2-240)||(48628705-48628943)
chr7 (2-240)||(11050264-11050502)
chr7 (2-240)||(43752779-43753017)
chr7 (2-240)||(7335960-7336197)
chr7 (2-240)||(37394001-37394238)
chr7 (2-240)||(47119891-47120131)
chr7 (2-240)||(18353044-18353282)
chr7 (2-240)||(40851183-40851412)
chr7 (2-238)||(47579091-47579328)
chr7 (2-222)||(37354284-37354501)
chr7 (2-238)||(44800415-44800651)
chr7 (2-240)||(221196-221413)
chr7 (20-195)||(40520836-40521011)
chr7 (2-222)||(3797544-3797754)
chr7 (74-237)||(41113349-41113512)
chr7 (1-162)||(39033961-39034122)
chr7 (66-222)||(27774072-27774228)
chr7 (115-240)||(2960643-2960768)
chr7 (2-127)||(42888775-42888900)
chr7 (4-145)||(43025014-43025155)
chr7 (2-131)||(45233570-45233699)
chr7 (32-151)||(29739711-29739829)
chr7 (2-104)||(44550938-44551040)
chr7 (2-146)||(29739572-29739713)
chr7 (2-60)||(11476516-11476574)
chr7 (2-60)||(31684094-31684152)
chr7 (2-60)||(37393958-37394016)
chr7 (2-60)||(43752736-43752794)
chr7 (2-60)||(47294251-47294309)
chr7 (2-59)||(30876383-30876440)
chr7 (1-60)||(23842428-23842487)
chr7 (2-60)||(2960600-2960658)
chr7 (2-60)||(11050221-11050279)
chr7 (2-60)||(47120116-47120174)
chr7 (2-60)||(48628928-48628986)
chr7 (2-62)||(35600082-35600142)
chr7 (2-57)||(30798328-30798383)
chr7 (1-60)||(38427522-38427581)
chr7 (2-60)||(221398-221456)
chr7 (2-60)||(2960768-2960826)
chr7 (2-60)||(41139369-41139426)
chr7 (2-60)||(43968219-43968277)
chr7 (2-60)||(44544532-44544590)
chr7 (2-60)||(47219268-47219326)
chr7 (2-60)||(18353267-18353327)
chr7 (2-67)||(40520787-40520852)
chr7 (2-78)||(41107270-41107346)
chr7 (2-62)||(45723451-45723511)
chr7 (2-60)||(1469453-1469511)
chr7 (2-56)||(5106168-5106222)
chr7 (2-60)||(41113500-41113558)
chr7 (190-240)||(42888937-42888987)
chr7 (2-60)||(47281084-47281142)
chr7 (2-49)||(25801526-25801573)
chr7 (1-60)||(44800369-44800428)
chr7 (2-56)||(7336186-7336240)
chr7 (2-60)||(8162672-8162730)
chr7 (2-60)||(40851397-40851455)
chr7 (2-60)||(42888972-42889030)
chr7 (2-60)||(47272104-47272162)
chr7 (2-55)||(27773036-27773089)
chr7 (28-69)||(42888900-42888941)
chr7 (2-54)||(27692011-27692063)
chr7 (2-49)||(34378568-34378615)
chr7 (1-60)||(42979298-42979356)
chr7 (2-56)||(27364299-27364353)
chr7 (20-62)||(30971919-30971961)
chr7 (2-40)||(31793822-31793860)
chr7 (2-60)||(47579047-47579104)
chr7 (187-240)||(5106127-5106179)
chr7 (2-62)||(33884440-33884500)
chr7 (1-39)||(31793852-31793890)
chr7 (2-39)||(11050494-11050531)
chr7 (2-39)||(37394230-37394267)
chr7 (114-153)||(12583313-12583352)
chr7 (2-39)||(35600355-35600392)
chr7 (2-35)||(39033932-39033965)
chr7 (2-39)||(39241844-39241881)
chr7 (2-39)||(44544280-44544317)
chr7 (2-39)||(45723724-45723761)
chr7 (2-39)||(47219016-47219053)
[»] chr1 (144 HSPs)
chr1 (2-240)||(23767417-23767655)
chr1 (2-240)||(38473629-38473867)
chr1 (1-240)||(28425366-28425605)
chr1 (2-240)||(19315540-19315778)
chr1 (2-240)||(7553019-7553257)
chr1 (20-240)||(46825449-46825669)
chr1 (2-240)||(12142965-12143210)
chr1 (1-240)||(25988274-25988513)
chr1 (2-240)||(19274459-19274697)
chr1 (2-240)||(7651560-7651800)
chr1 (1-240)||(49094714-49094953)
chr1 (2-240)||(18892229-18892467)
chr1 (2-240)||(23228197-23228435)
chr1 (2-240)||(33673917-33674155)
chr1 (2-240)||(49814200-49814438)
chr1 (2-240)||(50689844-50690081)
chr1 (2-240)||(33325627-33325865)
chr1 (2-240)||(36781175-36781413)
chr1 (2-240)||(46051350-46051588)
chr1 (2-240)||(52146893-52147131)
chr1 (2-240)||(36157681-36157919)
chr1 (2-240)||(45670489-45670727)
chr1 (2-240)||(7608769-7609007)
chr1 (2-240)||(9878787-9879025)
chr1 (2-240)||(26069792-26070030)
chr1 (2-240)||(26549288-26549526)
chr1 (2-240)||(48669399-48669637)
chr1 (2-240)||(52349927-52350165)
chr1 (1-240)||(46095078-46095317)
chr1 (2-240)||(24204474-24204711)
chr1 (2-240)||(41105916-41106154)
chr1 (2-240)||(50533283-50533521)
chr1 (2-240)||(52067654-52067895)
chr1 (2-240)||(43396575-43396813)
chr1 (1-240)||(41982238-41982478)
chr1 (1-240)||(45350720-45350956)
chr1 (2-222)||(48319067-48319287)
chr1 (1-223)||(9974741-9974963)
chr1 (4-240)||(34970982-34971218)
chr1 (2-237)||(5400771-5401005)
chr1 (2-237)||(18782095-18782330)
chr1 (2-240)||(8141489-8141727)
chr1 (2-240)||(16705770-16706008)
chr1 (2-240)||(37216796-37217034)
chr1 (31-240)||(48802334-48802543)
chr1 (4-240)||(6711342-6711578)
chr1 (2-206)||(12964546-12964750)
chr1 (2-222)||(33194672-33194892)
chr1 (9-240)||(18917431-18917662)
chr1 (2-240)||(9962660-9962889)
chr1 (2-240)||(21929421-21929664)
chr1 (1-222)||(30281530-30281751)
chr1 (1-240)||(21964964-21965203)
chr1 (2-240)||(33714364-33714600)
chr1 (2-240)||(40721251-40721481)
chr1 (2-240)||(25800543-25800779)
chr1 (2-150)||(44979281-44979429)
chr1 (2-180)||(50099120-50099298)
chr1 (51-240)||(17983901-17984090)
chr1 (66-222)||(16506809-16506965)
chr1 (2-146)||(32373650-32373794)
chr1 (5-132)||(49973845-49973972)
chr1 (2-146)||(17989864-17990008)
chr1 (142-240)||(44978771-44978868)
chr1 (2-62)||(7651783-7651843)
chr1 (2-62)||(19315761-19315821)
chr1 (2-61)||(44978728-44978787)
chr1 (2-60)||(21965188-21965246)
chr1 (2-60)||(25800764-25800822)
chr1 (2-60)||(28425323-28425381)
chr1 (2-60)||(46051573-46051631)
chr1 (2-60)||(48802291-48802349)
chr1 (1-62)||(7552975-7553036)
chr1 (2-62)||(50690064-50690124)
chr1 (2-60)||(12143195-12143253)
chr1 (1-59)||(23228153-23228211)
chr1 (2-60)||(24204431-24204489)
chr1 (2-60)||(25988231-25988289)
chr1 (2-60)||(33325850-33325908)
chr1 (2-60)||(36781132-36781190)
chr1 (2-60)||(37217019-37217077)
chr1 (2-60)||(38473586-38473644)
chr1 (2-60)||(45670446-45670504)
chr1 (2-60)||(46825654-46825712)
chr1 (3-60)||(19274682-19274739)
chr1 (2-62)||(9878744-9878804)
chr1 (2-62)||(18782049-18782109)
chr1 (2-62)||(52067611-52067671)
chr1 (2-57)||(43396801-43396856)
chr1 (2-60)||(7608726-7608784)
chr1 (2-60)||(12964755-12964813)
chr1 (2-60)||(18892452-18892510)
chr1 (2-60)||(26549511-26549569)
chr1 (2-60)||(33674140-33674198)
chr1 (2-60)||(36157638-36157696)
chr1 (2-60)||(40721466-40721524)
chr1 (2-60)||(46095035-46095093)
chr1 (2-60)||(49094671-49094729)
chr1 (4-62)||(49814421-49814479)
chr1 (2-59)||(9962875-9962932)
chr1 (2-59)||(21929650-21929707)
chr1 (2-55)||(22351085-22351138)
chr1 (2-67)||(46825400-46825465)
chr1 (2-62)||(6711561-6711621)
chr1 (2-62)||(23767375-23767434)
chr1 (2-62)||(26070013-26070073)
chr1 (4-55)||(16505199-16505250)
chr1 (2-57)||(45350677-45350732)
chr1 (2-60)||(5400993-5401051)
chr1 (2-60)||(16705993-16706051)
chr1 (2-62)||(18917645-18917705)
chr1 (2-62)||(41982195-41982255)
chr1 (2-62)||(52147114-52147174)
chr1 (2-44)||(24036661-24036703)
chr1 (14-60)||(50533506-50533552)
chr1 (2-55)||(16508117-16508169)
chr1 (5-60)||(8141450-8141504)
chr1 (1-60)||(17983857-17983916)
chr1 (2-57)||(33714321-33714376)
chr1 (2-52)||(49594922-49594972)
chr1 (20-60)||(48669374-48669414)
chr1 (2-45)||(49973972-49974015)
chr1 (1-39)||(8141719-8141757)
chr1 (1-35)||(17984075-17984109)
chr1 (2-52)||(49595162-49595212)
chr1 (2-39)||(7608999-7609036)
chr1 (2-39)||(23767647-23767684)
chr1 (2-39)||(24204703-24204740)
chr1 (2-39)||(38473859-38473896)
chr1 (2-39)||(50099091-50099128)
chr1 (27-60)||(52349909-52349942)
chr1 (1-33)||(48802562-48802594)
chr1 (2-33)||(19274430-19274461)
chr1 (2-33)||(41105887-41105918)
chr1 (1-39)||(25800513-25800551)
chr1 (2-67)||(37216767-37216830)
chr1 (1-35)||(45350952-45350986)
chr1 (2-39)||(5400742-5400779)
chr1 (2-39)||(12964517-12964554)
chr1 (2-39)||(18782322-18782359)
chr1 (2-35)||(25988509-25988542)
chr1 (31-60)||(41106139-41106168)
chr1 (2-39)||(49814171-49814208)
chr1 (2-38)||(18917396-18917432)
[»] chr8 (93 HSPs)
chr8 (2-240)||(37933542-37933780)
chr8 (2-240)||(2533172-2533410)
chr8 (2-240)||(43806536-43806774)
chr8 (2-237)||(22683994-22684229)
chr8 (1-240)||(35443210-35443449)
chr8 (2-240)||(259878-260115)
chr8 (2-240)||(655806-656043)
chr8 (2-240)||(841541-841778)
chr8 (2-240)||(513208-513445)
chr8 (1-238)||(9056343-9056580)
chr8 (1-240)||(35884433-35884672)
chr8 (1-240)||(38106999-38107237)
chr8 (2-240)||(1293386-1293624)
chr8 (2-240)||(28707449-28707687)
chr8 (2-240)||(24430574-24430812)
chr8 (2-240)||(40301896-40302134)
chr8 (7-240)||(41536530-41536763)
chr8 (2-222)||(7434786-7435006)
chr8 (2-222)||(23935133-23935353)
chr8 (2-240)||(440740-440978)
chr8 (2-240)||(28496358-28496595)
chr8 (2-240)||(23972298-23972538)
chr8 (2-238)||(39513344-39513580)
chr8 (1-222)||(29485186-29485406)
chr8 (3-238)||(12010450-12010688)
chr8 (1-240)||(38208651-38208891)
chr8 (1-240)||(13796988-13797226)
chr8 (2-240)||(4649050-4649288)
chr8 (2-240)||(38633713-38633945)
chr8 (2-240)||(33651741-33651979)
chr8 (2-222)||(6016105-6016325)
chr8 (50-240)||(3875856-3876046)
chr8 (4-240)||(42988230-42988465)
chr8 (87-240)||(36400073-36400226)
chr8 (1-240)||(36218784-36219022)
chr8 (107-240)||(15847117-15847250)
chr8 (2-167)||(8137073-8137239)
chr8 (2-180)||(24193356-24193524)
chr8 (2-91)||(9884756-9884845)
chr8 (2-112)||(39295288-39295392)
chr8 (1-81)||(15847038-15847118)
chr8 (2-62)||(36400030-36400090)
chr8 (1-60)||(41536486-41536545)
chr8 (2-60)||(440963-441021)
chr8 (1-62)||(2533393-2533454)
chr8 (2-62)||(22683948-22684008)
chr8 (2-62)||(23972255-23972315)
chr8 (2-62)||(43806493-43806553)
chr8 (1-60)||(33651964-33652023)
chr8 (2-60)||(3876031-3876089)
chr8 (178-240)||(24193133-24193195)
chr8 (2-60)||(28496315-28496373)
chr8 (2-60)||(37933765-37933823)
chr8 (2-60)||(38107222-38107280)
chr8 (2-59)||(35443435-35443492)
chr8 (2-62)||(260098-260158)
chr8 (2-62)||(655763-655823)
chr8 (2-62)||(841498-841558)
chr8 (1-60)||(24430530-24430589)
chr8 (2-60)||(513430-513488)
chr8 (2-60)||(4649273-4649331)
chr8 (2-60)||(12010675-12010733)
chr8 (6-60)||(35884394-35884448)
chr8 (1-59)||(38633669-38633727)
chr8 (2-62)||(1293607-1293667)
chr8 (2-57)||(13797214-13797269)
chr8 (2-60)||(15847235-15847293)
chr8 (2-62)||(36218741-36218801)
chr8 (2-60)||(24193090-24193148)
chr8 (239-334)||(26058964-26059057)
chr8 (2-62)||(40301853-40301913)
chr8 (2-54)||(42988187-42988239)
chr8 (2-52)||(18874173-18874223)
chr8 (3-60)||(9056299-9056356)
chr8 (5-57)||(28707410-28707461)
chr8 (2-62)||(38208874-38208933)
chr8 (2-54)||(43469202-43469254)
chr8 (2-40)||(8137275-8137313)
chr8 (2-52)||(18873944-18873994)
chr8 (2-52)||(21356654-21356704)
chr8 (1-39)||(38633937-38633975)
chr8 (2-52)||(43468963-43469013)
chr8 (2-39)||(4649021-4649058)
chr8 (2-35)||(35443181-35443214)
chr8 (2-37)||(6016331-6016366)
chr8 (2-52)||(5720481-5720531)
chr8 (204-238)||(8137240-8137274)
chr8 (1-54)||(27428406-27428464)
chr8 (1-39)||(43806766-43806804)
chr8 (2-39)||(1293357-1293394)
chr8 (2-35)||(15847009-15847042)
chr8 (2-39)||(39295384-39295421)
chr8 (2-39)||(39513572-39513609)
[»] chr2 (101 HSPs)
chr2 (2-240)||(16246196-16246434)
chr2 (2-237)||(771981-772216)
chr2 (2-240)||(7378863-7379101)
chr2 (2-238)||(2455910-2456146)
chr2 (1-240)||(920921-921160)
chr2 (2-237)||(1106565-1106800)
chr2 (2-240)||(28650429-28650669)
chr2 (2-240)||(9276474-9276712)
chr2 (4-232)||(8899584-8899812)
chr2 (2-240)||(27328487-27328722)
chr2 (2-236)||(3430631-3430865)
chr2 (2-240)||(19180322-19180559)
chr2 (2-240)||(33865270-33865508)
chr2 (2-240)||(38750948-38751186)
chr2 (2-238)||(2314980-2315216)
chr2 (2-238)||(36210946-36211182)
chr2 (2-240)||(11949429-11949670)
chr2 (1-240)||(40854508-40854747)
chr2 (2-240)||(33106972-33107210)
chr2 (2-238)||(25087801-25088037)
chr2 (1-240)||(2094413-2094652)
chr2 (2-240)||(7297237-7297473)
chr2 (1-240)||(36444231-36444470)
chr2 (2-240)||(2056826-2057064)
chr2 (2-240)||(12759753-12759990)
chr2 (2-240)||(17134129-17134367)
chr2 (2-240)||(34253042-34253280)
chr2 (2-240)||(45124019-45124257)
chr2 (2-222)||(8396572-8396792)
chr2 (20-240)||(41500505-41500725)
chr2 (8-240)||(43249415-43249647)
chr2 (2-240)||(17484553-17484791)
chr2 (2-240)||(37732196-37732434)
chr2 (2-238)||(29737648-29737884)
chr2 (2-203)||(41178059-41178260)
chr2 (2-240)||(42629856-42630100)
chr2 (2-218)||(37654008-37654224)
chr2 (3-240)||(37838180-37838435)
chr2 (2-222)||(19916008-19916227)
chr2 (2-158)||(23672958-23673114)
chr2 (151-240)||(14630663-14630752)
chr2 (103-240)||(9331757-9331894)
chr2 (153-240)||(23671814-23671901)
chr2 (2-60)||(9276697-9276755)
chr2 (2-60)||(9331879-9331937)
chr2 (2-60)||(16246153-16246211)
chr2 (2-60)||(17484510-17484568)
chr2 (2-62)||(7379084-7379144)
chr2 (2-62)||(28216924-28216984)
chr2 (1-60)||(2057049-2057108)
chr2 (1-60)||(37732152-37732211)
chr2 (2-60)||(2094370-2094428)
chr2 (2-60)||(12759710-12759768)
chr2 (2-60)||(27328707-27328765)
chr2 (2-62)||(7297194-7297254)
chr2 (2-62)||(14630735-14630795)
chr2 (1-60)||(34253265-34253324)
chr2 (1-60)||(38751171-38751230)
chr2 (2-60)||(771936-771993)
chr2 (2-60)||(2456133-2456191)
chr2 (2-60)||(11949386-11949444)
chr2 (2-60)||(19180544-19180602)
chr2 (2-60)||(28650386-28650444)
chr2 (2-60)||(33106929-33106987)
chr2 (2-60)||(36444188-36444246)
chr2 (2-60)||(37838420-37838478)
chr2 (2-60)||(40854732-40854790)
chr2 (2-60)||(41177995-41178053)
chr2 (2-60)||(41500462-41500520)
chr2 (2-60)||(42630085-42630143)
chr2 (2-60)||(43249372-43249430)
chr2 (2-50)||(3358110-3358158)
chr2 (1-60)||(921145-921204)
chr2 (2-60)||(2314935-2314993)
chr2 (2-62)||(8899803-8899862)
chr2 (4-60)||(17134352-17134407)
chr2 (2-57)||(45124245-45124300)
chr2 (6-60)||(25087760-25087814)
chr2 (2-60)||(29737871-29737929)
chr2 (2-42)||(9331665-9331705)
chr2 (2-73)||(19511522-19511593)
chr2 (2-60)||(1106519-1106577)
chr2 (2-60)||(3430584-3430642)
chr2 (2-60)||(36211169-36211228)
chr2 (1-39)||(7297465-7297503)
chr2 (1-39)||(7378833-7378871)
chr2 (1-39)||(12759982-12760020)
chr2 (2-60)||(23671772-23671829)
chr2 (2-39)||(16246426-16246463)
chr2 (2-39)||(37654237-37654274)
chr2 (20-60)||(33865245-33865285)
chr2 (2-37)||(19915967-19916002)
chr2 (1-39)||(1106792-1106830)
chr2 (204-238)||(28216969-28217003)
chr2 (1-31)||(31187383-31187413)
chr2 (1-31)||(31195443-31195473)
chr2 (2-32)||(37838151-37838181)
chr2 (2-39)||(2455881-2455918)
chr2 (2-31)||(8899553-8899582)
chr2 (2-39)||(19180293-19180330)
chr2 (2-54)||(3358147-3358199)
[»] chr6 (69 HSPs)
chr6 (2-240)||(3408089-3408327)
chr6 (2-240)||(12626536-12626774)
chr6 (2-240)||(2707359-2707597)
chr6 (2-238)||(1915348-1915584)
chr6 (2-240)||(6503618-6503856)
chr6 (2-240)||(29050172-29050410)
chr6 (2-240)||(26393012-26393250)
chr6 (2-240)||(30378917-30379155)
chr6 (2-240)||(17428275-17428513)
chr6 (2-240)||(2390165-2390403)
chr6 (5-240)||(26230935-26231170)
chr6 (2-240)||(10256137-10256375)
chr6 (2-240)||(9382417-9382657)
chr6 (4-240)||(11133775-11134012)
chr6 (2-240)||(3258810-3259048)
chr6 (2-240)||(17942938-17943174)
chr6 (2-222)||(26936507-26936727)
chr6 (1-240)||(8178252-8178491)
chr6 (1-240)||(16193209-16193448)
chr6 (1-240)||(6785104-6785340)
chr6 (22-240)||(1077154-1077375)
chr6 (2-236)||(26196328-26196562)
chr6 (13-223)||(35223919-35224129)
chr6 (54-240)||(2598102-2598290)
chr6 (2-240)||(10931151-10931392)
chr6 (2-240)||(25820552-25820790)
chr6 (2-118)||(17515007-17515123)
chr6 (156-240)||(31375971-31376055)
chr6 (2-60)||(12626759-12626817)
chr6 (2-60)||(29050395-29050453)
chr6 (2-60)||(30379140-30379198)
chr6 (2-59)||(16193434-16193491)
chr6 (2-60)||(2390388-2390446)
chr6 (2-60)||(2707582-2707640)
chr6 (2-60)||(9382642-9382700)
chr6 (2-60)||(17943159-17943217)
chr6 (2-60)||(31376040-31376098)
chr6 (2-59)||(3258767-3258824)
chr6 (2-62)||(1077358-1077418)
chr6 (2-62)||(3408310-3408370)
chr6 (1-60)||(11133997-11134056)
chr6 (185-240)||(12612974-12613029)
chr6 (2-60)||(1915303-1915361)
chr6 (2-60)||(6503841-6503899)
chr6 (2-56)||(8178209-8178263)
chr6 (2-60)||(12612808-12612866)
chr6 (2-60)||(12612931-12612989)
chr6 (2-60)||(17428232-17428290)
chr6 (2-62)||(2598059-2598119)
chr6 (2-60)||(6785061-6785119)
chr6 (2-60)||(10256360-10256418)
chr6 (164-237)||(12612854-12612927)
chr6 (2-57)||(25820509-25820564)
chr6 (2-60)||(10931108-10931166)
chr6 (2-60)||(26230892-26230950)
chr6 (4-54)||(26392971-26393021)
chr6 (1-60)||(26196280-26196339)
chr6 (2-67)||(6503589-6503652)
chr6 (2-67)||(12613028-12613091)
chr6 (2-35)||(8178487-8178520)
chr6 (2-39)||(12626507-12626544)
chr6 (2-35)||(16193180-16193213)
chr6 (2-39)||(17942909-17942946)
chr6 (2-33)||(1077105-1077136)
chr6 (2-37)||(26936733-26936768)
chr6 (1-39)||(30378887-30378925)
chr6 (2-39)||(1915576-1915613)
chr6 (2-39)||(29050143-29050180)
chr6 (2-38)||(12613026-12613062)
[»] chr4 (125 HSPs)
chr4 (2-240)||(28264543-28264781)
chr4 (2-240)||(42273700-42273940)
chr4 (2-240)||(26017323-26017561)
chr4 (2-237)||(48707739-48707974)
chr4 (2-240)||(33807783-33808021)
chr4 (2-240)||(28812290-28812527)
chr4 (2-237)||(28159959-28160194)
chr4 (6-240)||(11795157-11795391)
chr4 (2-240)||(33174023-33174261)
chr4 (1-240)||(24458634-24458873)
chr4 (1-240)||(40988532-40988771)
chr4 (2-240)||(4544988-4545226)
chr4 (2-240)||(8882016-8882254)
chr4 (2-240)||(15984910-15985148)
chr4 (2-240)||(17847099-17847336)
chr4 (2-240)||(23135009-23135247)
chr4 (2-240)||(35929940-35930177)
chr4 (2-240)||(49118511-49118749)
chr4 (2-237)||(9339129-9339367)
chr4 (5-240)||(2055181-2055416)
chr4 (2-240)||(17993020-17993258)
chr4 (2-240)||(31590977-31591213)
chr4 (2-240)||(39995170-39995408)
chr4 (1-240)||(10588479-10588718)
chr4 (2-240)||(32118614-32118852)
chr4 (39-240)||(55517188-55517389)
chr4 (2-237)||(25734229-25734464)
chr4 (2-240)||(14564696-14564934)
chr4 (2-240)||(25730140-25730378)
chr4 (2-240)||(48149399-48149637)
chr4 (2-240)||(50542357-50542595)
chr4 (2-222)||(19168816-19169036)
chr4 (2-237)||(37381746-37381981)
chr4 (2-240)||(30467006-30467248)
chr4 (2-240)||(31208648-31208882)
chr4 (15-240)||(44490232-44490457)
chr4 (2-237)||(12196378-12196604)
chr4 (2-240)||(33693336-33693575)
chr4 (2-240)||(50276141-50276376)
chr4 (2-222)||(24623048-24623268)
chr4 (2-240)||(22298419-22298656)
chr4 (2-240)||(23552962-23553202)
chr4 (2-222)||(42549643-42549862)
chr4 (20-240)||(51371050-51371270)
chr4 (20-238)||(19496107-19496337)
chr4 (44-240)||(31973533-31973729)
chr4 (2-240)||(48551767-48551987)
chr4 (14-237)||(32317857-32318088)
chr4 (6-240)||(39699949-39700183)
chr4 (2-183)||(56555200-56555384)
chr4 (2-240)||(30141111-30141347)
chr4 (50-240)||(5227338-5227528)
chr4 (2-124)||(44490110-44490232)
chr4 (162-240)||(20534225-20534303)
chr4 (2-62)||(11795114-11795174)
chr4 (2-62)||(15985131-15985191)
chr4 (2-60)||(8881973-8882031)
chr4 (2-60)||(28264766-28264824)
chr4 (2-60)||(44490442-44490500)
chr4 (2-60)||(48149622-48149680)
chr4 (2-60)||(49118734-49118792)
chr4 (2-67)||(19496321-19496386)
chr4 (2-62)||(25730361-25730421)
chr4 (4-60)||(50276100-50276156)
chr4 (2-60)||(5227513-5227571)
chr4 (2-60)||(28812247-28812305)
chr4 (2-60)||(33807740-33807798)
chr4 (2-59)||(30466963-30467020)
chr4 (2-59)||(31973715-31973772)
chr4 (2-58)||(22298643-22298699)
chr4 (2-62)||(48551724-48551784)
chr4 (2-62)||(55517145-55517205)
chr4 (2-60)||(4544945-4545003)
chr4 (2-60)||(12196592-12196650)
chr4 (2-60)||(17847056-17847114)
chr4 (2-60)||(20534288-20534346)
chr4 (6-60)||(24458595-24458649)
chr4 (2-60)||(26017546-26017604)
chr4 (2-60)||(31208867-31208925)
chr4 (2-60)||(42273925-42273983)
chr4 (2-59)||(32118838-32118895)
chr4 (2-62)||(9339083-9339143)
chr4 (2-62)||(23553185-23553245)
chr4 (1-60)||(30141067-30141126)
chr4 (2-65)||(31617613-31617676)
chr4 (2-57)||(50542314-50542369)
chr4 (4-59)||(51371262-51371317)
chr4 (2-60)||(10588703-10588761)
chr4 (2-60)||(19496062-19496120)
chr4 (2-60)||(23134966-23135024)
chr4 (2-60)||(31591198-31591256)
chr4 (2-60)||(33173980-33174038)
chr4 (2-60)||(33452369-33452427)
chr4 (2-59)||(35930163-35930220)
chr4 (1-62)||(37381967-37382028)
chr4 (2-59)||(39995127-39995184)
chr4 (2-62)||(2055399-2055459)
chr4 (22-68)||(8433822-8433868)
chr4 (2-60)||(28159913-28159971)
chr4 (2-60)||(32318076-32318133)
chr4 (2-60)||(33693293-33693351)
chr4 (2-60)||(48707693-48707751)
chr4 (2-54)||(1425269-1425321)
chr4 (1-60)||(56555124-56555183)
chr4 (2-60)||(14564919-14564977)
chr4 (2-45)||(9800377-9800420)
chr4 (8-59)||(51371013-51371064)
chr4 (2-52)||(33496133-33496183)
chr4 (2-39)||(17847328-17847365)
chr4 (27-60)||(17993002-17993035)
chr4 (2-39)||(22298390-22298427)
chr4 (2-39)||(31208619-31208656)
chr4 (2-39)||(32118585-32118622)
chr4 (2-60)||(40988756-40988810)
chr4 (2-39)||(48149370-48149407)
chr4 (2-60)||(25734183-25734241)
chr4 (2-39)||(8882246-8882283)
chr4 (2-39)||(11795387-11795424)
chr4 (2-39)||(12196349-12196386)
chr4 (2-39)||(17847357-17847394)
chr4 (2-39)||(19496378-19496415)
chr4 (2-39)||(28812519-28812556)
chr4 (2-39)||(33808013-33808050)
chr4 (2-39)||(42273671-42273708)
chr4 (2-39)||(44490081-44490118)
[»] chr3 (128 HSPs)
chr3 (2-240)||(1016944-1017182)
chr3 (2-240)||(38446376-38446614)
chr3 (1-240)||(20813444-20813683)
chr3 (2-240)||(1687551-1687789)
chr3 (2-237)||(22851896-22852131)
chr3 (2-240)||(21564396-21564634)
chr3 (2-240)||(47329178-47329416)
chr3 (1-238)||(41250785-41251022)
chr3 (2-240)||(20760074-20760312)
chr3 (2-238)||(36314977-36315213)
chr3 (2-240)||(21656418-21656656)
chr3 (2-240)||(31122562-31122800)
chr3 (2-240)||(42016773-42017011)
chr3 (2-240)||(50287466-50287704)
chr3 (2-238)||(19664441-19664677)
chr3 (2-240)||(35346474-35346706)
chr3 (6-240)||(20086317-20086551)
chr3 (2-235)||(12748291-12748524)
chr3 (1-240)||(27070742-27070981)
chr3 (2-240)||(26455482-26455720)
chr3 (1-240)||(51562061-51562300)
chr3 (2-240)||(21890070-21890308)
chr3 (2-240)||(35608134-35608371)
chr3 (2-240)||(53195914-53196152)
chr3 (2-238)||(55164120-55164356)
chr3 (2-237)||(3697046-3697281)
chr3 (2-237)||(32650826-32651061)
chr3 (2-240)||(10618483-10618721)
chr3 (2-240)||(42107102-42107340)
chr3 (2-240)||(1448738-1448973)
chr3 (5-240)||(48651151-48651386)
chr3 (1-211)||(19268420-19268630)
chr3 (2-240)||(37247856-37248094)
chr3 (2-222)||(50977764-50977984)
chr3 (2-222)||(51080896-51081116)
chr3 (2-222)||(51475267-51475489)
chr3 (2-240)||(20913757-20913995)
chr3 (2-240)||(20921875-20922113)
chr3 (2-240)||(40922168-40922406)
chr3 (2-222)||(50364908-50365128)
chr3 (2-240)||(45380263-45380501)
chr3 (2-240)||(39069627-39069864)
chr3 (1-237)||(53925985-53926221)
chr3 (2-240)||(44798167-44798405)
chr3 (2-240)||(33473242-33473480)
chr3 (2-215)||(28699585-28699798)
chr3 (2-179)||(44152600-44152777)
chr3 (2-240)||(52821052-52821302)
chr3 (68-240)||(33151662-33151834)
chr3 (50-240)||(29677424-29677614)
chr3 (2-166)||(47473130-47473294)
chr3 (51-222)||(34019409-34019580)
chr3 (89-238)||(38924003-38924152)
chr3 (2-100)||(42641295-42641393)
chr3 (2-62)||(35346431-35346491)
chr3 (2-60)||(21656641-21656699)
chr3 (2-60)||(33151819-33151877)
chr3 (133-222)||(42641199-42641288)
chr3 (2-62)||(20813401-20813461)
chr3 (1-60)||(40922124-40922183)
chr3 (2-60)||(21564619-21564677)
chr3 (2-60)||(21890293-21890351)
chr3 (2-60)||(27070699-27070757)
chr3 (2-60)||(42107059-42107117)
chr3 (2-59)||(45380220-45380277)
chr3 (2-62)||(20760031-20760091)
chr3 (2-62)||(26455703-26455763)
chr3 (1-60)||(10618439-10618498)
chr3 (1-60)||(38923957-38924016)
chr3 (2-60)||(1017167-1017225)
chr3 (2-60)||(20086274-20086332)
chr3 (2-60)||(31122785-31122843)
chr3 (1-59)||(33473198-33473256)
chr3 (2-60)||(37248079-37248137)
chr3 (2-62)||(39069847-39069907)
chr3 (2-62)||(44152794-44152854)
chr3 (2-62)||(47329135-47329195)
chr3 (1-60)||(48651371-48651430)
chr3 (2-60)||(1448695-1448753)
chr3 (2-60)||(1687774-1687832)
chr3 (2-60)||(19268650-19268708)
chr3 (2-56)||(29677603-29677657)
chr3 (2-60)||(41251009-41251067)
chr3 (2-60)||(44798390-44798448)
chr3 (2-60)||(50287689-50287747)
chr3 (2-60)||(52821009-52821067)
chr3 (2-59)||(20913714-20913771)
chr3 (2-59)||(20921832-20921889)
chr3 (1-53)||(28775435-28775487)
chr3 (2-62)||(38446597-38446657)
chr3 (2-62)||(42016994-42017054)
chr3 (2-62)||(53925939-53925999)
chr3 (2-60)||(3697269-3697327)
chr3 (6-59)||(51562286-51562339)
chr3 (2-62)||(55164075-55164135)
chr3 (2-60)||(35608091-35608149)
chr3 (2-60)||(53196137-53196194)
chr3 (2-59)||(32650780-32650837)
chr3 (1-67)||(55164322-55164386)
chr3 (290-344)||(5371786-5371840)
chr3 (2-40)||(22851867-22851905)
chr3 (2-39)||(19664412-19664449)
chr3 (2-39)||(20760304-20760341)
chr3 (2-55)||(50010083-50010136)
chr3 (2-39)||(50287437-50287474)
chr3 (9-52)||(19229181-19229224)
chr3 (2-37)||(28699811-28699846)
chr3 (2-60)||(36314931-36314990)
chr3 (201-240)||(44152772-44152811)
chr3 (2-37)||(51475226-51475261)
chr3 (2-52)||(19228940-19228990)
chr3 (2-60)||(19664664-19664721)
chr3 (1-39)||(21656388-21656426)
chr3 (2-44)||(22852135-22852177)
chr3 (3-37)||(34019586-34019620)
chr3 (1-39)||(40922398-40922436)
chr3 (1-39)||(45380493-45380531)
chr3 (2-32)||(48651119-48651149)
chr3 (2-52)||(49799071-49799121)
chr3 (2-39)||(3697017-3697054)
chr3 (2-39)||(20913987-20914024)
chr3 (2-39)||(20922105-20922142)
chr3 (2-39)||(27070972-27071009)
chr3 (2-39)||(32651053-32651090)
chr3 (2-39)||(33151869-33151906)
chr3 (2-39)||(36315205-36315242)
chr3 (2-39)||(52821294-52821331)
chr3 (2-34)||(50364867-50364899)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (2-240)||(218785-219024)
scaffold0004 (1-60)||(219009-219068)
[»] scaffold1986 (2 HSPs)
scaffold1986 (2-240)||(14-252)
scaffold1986 (27-60)||(237-270)
[»] scaffold0542 (2 HSPs)
scaffold0542 (2-222)||(1994-2214)
scaffold0542 (1-37)||(1952-1988)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (1-240)||(12994-13233)
scaffold0184 (1-62)||(13216-13277)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (1-240)||(59611-59850)
scaffold0078 (1-62)||(59567-59628)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (2-240)||(252441-252679)
scaffold0005 (2-60)||(252398-252456)
[»] scaffold0693 (2 HSPs)
scaffold0693 (2-240)||(5030-5268)
scaffold0693 (2-62)||(4987-5047)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (2-240)||(47862-48100)
scaffold0096 (2-60)||(48085-48143)
[»] scaffold0727 (2 HSPs)
scaffold0727 (2-240)||(5083-5323)
scaffold0727 (2-62)||(5306-5366)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (2-240)||(11265-11496)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (2-155)||(289-442)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (2-108)||(14549-14655)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (79-152)||(19758-19831)
[»] scaffold1562 (2 HSPs)
scaffold1562 (162-240)||(599-677)
scaffold1562 (2-60)||(662-720)
[»] scaffold1158 (2 HSPs)
scaffold1158 (162-240)||(1916-1994)
scaffold1158 (2-60)||(1873-1931)
[»] scaffold0952 (2 HSPs)
scaffold0952 (162-240)||(3374-3452)
scaffold0952 (2-60)||(3332-3389)
[»] scaffold0717 (2 HSPs)
scaffold0717 (162-240)||(1877-1955)
scaffold0717 (2-60)||(1940-1998)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (2-55)||(5728-5781)
[»] scaffold0416 (1 HSPs)
scaffold0416 (3-54)||(6644-6695)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (2-39)||(101234-101271)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 120)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 237 - 512
Target Start/End: Original strand, 39132773 - 39133048
Alignment:
Q  237 acgagctactatgggtacttcgttcatggttatgggaagattaccagacttgtgaatcagttgttaagagatggcgttgtatggaataaggaaatgcagg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39132773 acgagctactatgggtacttcgttcatggttatgggaagattaccagacttgtgaatcagttgttaggagatggcgttgtatggaataaggaaatgcagg 39132872  T
Q  337 cagcatttgaaaacaggtcaaaaatatannnnnnncccaaccaatgtttgaatgtcattattatttattagtcctatttgaaagaaggcatggctctatg 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39132873 cagcatttgaaaacaggtcaaaaatatatttttttcccaaccaatgtttgaatgccattattatttattagtcctatttgaaagaaggcatggctctatg 39132972  T
Q  437 cagttgtgtagtgctatttagtatttactctctaagcatcttttcaatttaataatgaactatgtgaccagttcag 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39132973 cagttgtgtagtgctatttagtatttactctctaagcatcttttcaatttaataatgaactatgtgactagttcag 39133048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 14717505 - 14717743
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14717505 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 14717604  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717605 agaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 14717704  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14717705 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 14717743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Original strand, 41282242 - 41282477
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41282242 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggataatggtgatgatttagatgatagcaacaa 41282341  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41282342 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41282441  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41282442 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaa 41282477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 8215800 - 8216038
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8215800 tttaaatttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 8215899  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8215900 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 8215999  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8216000 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 8216038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30297990 - 30297752
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30297990 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 30297891  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30297890 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctaggagccagatttggtaccaaagatgagttgaaggaagcaatt 30297791  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30297790 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 30297752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33760711 - 33760473
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33760711 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaattccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 33760612  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33760611 agagcattatccaccatttgtcatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaatt 33760512  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33760511 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 33760473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38964354 - 38964117
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38964354 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 38964255  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38964254 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38964156  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38964155 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 38964117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11000969 - 11000731
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11000969 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 11000870  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11000869 agagcattatccaccacttgccaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 11000770  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11000769 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 11000731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16096200 - 16095963
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16096200 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 16096101  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16096100 agagcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacc-aagatgagttcaaggaagcaatt 16096002  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16096001 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 16095963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Original strand, 40074850 - 40075086
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40074850 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtccttttacaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 40074949  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40074950 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 40075049  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40075050 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaac 40075086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6740196 - 6739958
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6740196 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 6740097  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740096 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6739997  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6739996 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 6739958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26593521 - 26593283
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26593521 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttggtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggataatggtgatggtttagatgatagcaacaa 26593422  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26593421 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaagaagcaatt 26593322  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26593321 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 26593283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 30863153 - 30863391
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30863153 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcgttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggctgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 30863252  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30863253 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 30863352  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30863353 accaactatgctatctacattatgacttgtttgaaacga 30863391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 39824456 - 39824694
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39824456 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtacttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 39824555  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39824556 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaatt 39824655  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39824656 accaactatgtcatctacaataggacttgtttgaaacga 39824694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 14952224 - 14952462
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  14952224 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgttgattcagatgatagcaacaa 14952323  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952324 agaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 14952423  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14952424 accaactatgttatctacaacaagacttgtttgaaacga 14952462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 20408433 - 20408671
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20408433 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 20408532  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20408533 agaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagctagatttggtaccaaatatgagttcaatgaagcaatt 20408632  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20408633 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 20408671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23129154 - 23128916
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  23129154 tttaagtttcaaaagtctaaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggataatggtgatgattcagatgatagcagcaa 23129055  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23129054 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 23128955  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23128954 accaattatgctatctacgatatgacttgtttgaaacga 23128916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 31710182 - 31710420
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31710182 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagagaatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 31710281  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31710282 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31710381  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31710382 accaactatgttatctacattatgacttgtttgaaacga 31710420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 8689472 - 8689710
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8689472 tttaagtttcaaaagtctcaaaaaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagagaatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 8689571  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8689572 agagcattatccactatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaatcaatt 8689671  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8689672 accaactatgttatctacattatgacttgtttgaaacga 8689710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Original strand, 42993418 - 42993654
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  42993418 tttaagtttcaaaagtcacaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagtaacaa 42993517  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993518 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 42993617  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  42993618 accaactatgctatctacaataggaattgtttgaaac 42993654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3352242 - 3352005
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3352242 tttaagtttcaaaagtcccatacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttta-agaatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 3352144  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3352143 agagcattatccaccctttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaatt 3352044  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3352043 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 3352005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4016114 - 4015877
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  4016114 tttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgatttagatgatagtaa-aa 4016016  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016015 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaatatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 4015916  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4015915 accaactatgttatctacaataggacttgcttgaaacga 4015877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6600377 - 6600139
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  6600377 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtcctcttagaggatgatggtgataattcagatgatagcaacaa 6600278  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600277 agaacattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6600178  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6600177 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 6600139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 35342080 - 35342318
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  35342080 tttaagtttcaaaagtcccaatcaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttaaaagatgatggtgatgattcagttgatagcaacaa 35342179  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35342180 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35342279  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35342280 atcaactatgctatctacaatgagacttgtttgaaacga 35342318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20079498 - 20079261
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  20079498 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa-tccttttagaggatgatggtgataattcagatgatagcaacaa 20079400  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20079399 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 20079300  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  20079299 accaactatgttatctacattaggacttgtttgaaacga 20079261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 6331277 - 6331479
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6331277 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagtaacaa 6331376  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6331377 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6331476  T
Q  202 acc 204  Q
    |||    
T  6331477 acc 6331479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11692388 - 11692150
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| || ||||| | ||| |||||||||    
T  11692388 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaaatccttttaaaggatgatggtggtgattcaaatgttagcaacaa 11692289  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11692288 agagcattatccaccatttgtgatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 11692189  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11692188 accaactatgctatctgcaatatgacttgtttgaaacga 11692150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28078646 - 28078408
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28078646 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtctttttagaggaagatggtgatgattcagatgatagcaacaa 28078547  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28078546 agagcattatctaccatttgtcatgcctaattagtttactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 28078447  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28078446 accaactatgctatctacattaggacttgtttgaaacga 28078408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26035587 - 26035367
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26035587 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatagtgatgatttagatgatagcaacaa 26035488  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26035487 agagcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtattaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 26035388  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  26035387 accaactatggtatctacaat 26035367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 16752016 - 16752236
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16752016 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 16752115  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752116 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggatccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16752215  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  16752216 accaactatgttatctacaat 16752236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19398435 - 19398199
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19398435 ttttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagtaaca 19398336  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19398335 aagaacattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaggctagatttggtaccaaagatgagttcaaagaaacaat 19398236  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19398235 taccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaa 19398199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30208638 - 30208408
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30208638 tttaagtttcaaaagtcccaaacaattccttttagtttttgaatc-----aaacaagtctttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 30208544  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30208543 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtaggtgttaggagccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 30208444  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  30208443 accaactatgttatctacaatagaacttgtttgaaa 30208408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 51 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39002217 - 39002030
Alignment:
Q  51 caaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 150  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39002217 caaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaatagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 39002118  T
Q  151 tgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39002117 tgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 39002030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Original strand, 1052436 - 1052669
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  1052436 tttaagtttcaaaagtctcaaataagtttttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatacagatgatagcaacaa 1052535  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1052536 agagcat---ccaccatttgccatgcttaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaggatgagttcaaggaagcaatt 1052632  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1052633 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 1052669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27116335 - 27116109
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |      ||||||||||||||    
T  27116335 ttttaagtttcaaaagtcccaaccaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatta------agatgatagcaaca 27116242  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27116241 aagaacattatccacgatttgtaatgcctaaaaagatgactaatttgaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaat 27116142  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgttt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27116141 taccaactatgctatctacaataggacttgttt 27116109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43166501 - 43166274
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||         ||| ||||||| |||||    
T  43166501 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgat---------ttaaatgatagaaacaa 43166411  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43166410 agagcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 43166311  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43166310 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 43166274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27457434 - 27457200
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||   ||  || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||    
T  27457434 tttaagtttcaaaa-tcccaaagaagtccgttaagtttcaaaa--gtctcaaacaagttcttttagaggatgatgatgatgattcaaatg-tggcaacaa 27457339  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27457338 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaatttaaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 27457239  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27457238 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacga 27457200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 6251893 - 6252110
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||                     |||||||||||||||    
T  6251893 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttt---------------------agatgatagcaacaa 6251971  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6251972 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 6252071  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6252072 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 6252110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 27509878 - 27510109
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27509878 tttaagtttcaaaagtctcgaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaggtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 27509977  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||        ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27509978 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ccttttag------tttttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 27510070  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  27510071 accaactatgcttattacaataggacttgtttgaaacga 27510109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Original strand, 8694766 - 8695002
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  8694766 tttaagtttcaaaagtaaaaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagcttttttaaaggatgatggtgatgattcaaatgatagcaacaa 8694865  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  ||||    
T  8694866 agagcattatccaccatttatcatgcctaagaacatgactaattttaagtgagtattatgagccagatttggtactaaagatgagttcaatgaaataatt 8694965  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8694966 atcaattatgctatctacaataggacttgtttgaaac 8695002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 444854 - 445074
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||    
T  444854 tttaaattttaaaagtcttaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcattttagaggatgatgttgatgatccagatgataacaataa 444953  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  444954 agatcatgatccaccatttgccacgcctaaaaagacgactgattttaagtgggttttaggagtcatatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaatt 445053  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  445054 accaactatgctatctacaat 445074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 51 - 240
Target Start/End: Original strand, 11935395 - 11935583
Alignment:
Q  51 caaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11935395 caaacaagtcattttagaggatgatggtgatgatttagatgataacaacaaagatcattatccactatttgttatgcctaaaaagatggctaattttaag 11935494  T
Q  151 tgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    || ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11935495 tgagtgttaggagccacatttggt-tcaaagatgagatcaaggaaacaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 11935583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 98 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19659646 - 19659504
Alignment:
Q  98 acaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagc 197  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  19659646 acaaagagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaaaagc 19659547  T
Q  198 aattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19659546 aattaccaactatgctatctacaataggacttatttgaaacga 19659504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Original strand, 20517060 - 20517176
Alignment:
Q  4 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  20517060 taagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaattgtttcaaataagtccttttagaggatgatgatgatgatttagattatagcaacaaaa 20517159  T
Q  104 agcattatccaccattt 120  Q
    |||||||||||||||||    
T  20517160 agcattatccaccattt 20517176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 19661870 - 19661769
Alignment:
Q  4 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19661870 taagtttcaaaagtcccaaacaagtttttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaag 19661771  T
Q  104 ag 105  Q
    ||    
T  19661770 ag 19661769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 37923639 - 37923546
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatag 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37923639 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtgtttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgatttagatgatag 37923546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 6600096 - 6600154
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600096 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 6600154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 20408714 - 20408656
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20408714 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 20408656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 28078365 - 28078423
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078365 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 28078423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 8689753 - 8689693
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8689753 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 8689693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 26593240 - 26593300
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26593240 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 26593300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 27457157 - 27457217
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27457157 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 27457217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 31710463 - 31710403
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31710463 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 31710403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 30297708 - 30297767
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30297708 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 30297767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 6252153 - 6252095
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6252153 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 6252095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 11000688 - 11000746
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11000688 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 11000746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 11935626 - 11935568
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11935626 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 11935568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 33760430 - 33760488
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33760430 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctcttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 33760488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 43166228 - 43166287
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43166228 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 43166287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 1052714 - 1052656
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1052714 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 1052656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 6739915 - 6739973
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6739915 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 6739973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 8216081 - 8216023
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8216081 tttaagttttaaaagtcccatacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 8216023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 20079218 - 20079276
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20079218 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 20079276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 39824737 - 39824679
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39824737 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 39824679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 6332957 - 6332900
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6332957 tttaagttttaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 6332900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 4015833 - 4015892
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4015833 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaagcaagtc 4015892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 27116058 - 27116117
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27116058 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcattttaaacaagtc 27116117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Original strand, 39401952 - 39402007
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 57  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39401952 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaa 39402007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 3351962 - 3352020
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3351962 tttaagtttcaaaagtctcgaacaagtcctttttgtttttgaatcgtttcaaacaagtc 3352020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 8695047 - 8694989
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8695047 tttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 8694989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 16095920 - 16095978
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16095920 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaacccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtc 16095978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 19659461 - 19659519
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19659461 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaataagtc 19659519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 30208361 - 30208419
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30208361 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcatttcaaacaagt 30208419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 35342361 - 35342303
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35342361 tttaagtttcaaaagtttcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 35342303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 23128872 - 23128933
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaa-caagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128872 tttaagtttcaaaagtctcaaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 23128933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14952499 - 14952447
Alignment:
Q  8 tttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952499 tttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 14952447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 30863433 - 30863374
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30863433 tttaagtttcaaaagtcc-aaacaagtcattttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcat 30863374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 38964074 - 38964134
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38964074 tttaagtttcaaaagtctcaaacgagtctttttagtttctgaatcgtttcaaacaagtcat 38964134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 39001985 - 39002045
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39001985 tttaagtttcaaaagttccaaataaatccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcat 39002045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 27510153 - 27510094
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27510153 ttttaagttttaaaagtttcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 27510094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 42993699 - 42993644
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 57  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42993699 tttaagtttcaaaagttccaaagaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaa 42993644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 40075131 - 40075073
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40075131 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcctttttgtttttgaattgtttcaaacaagtc 40075073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 41282523 - 41282465
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  41282523 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttaaatcatttcaaacaagtc 41282465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Original strand, 19398153 - 19398210
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19398153 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaattcttttagtttttgaatcatttcaaacaagt 19398210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 9919786 - 9919734
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9919786 tttaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttagtttctgaaacgtttcaaa 9919734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14717776 - 14717728
Alignment:
Q  12 aaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717776 aaaagttccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 14717728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 17002397 - 17002343
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 56  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17002397 tttaagtttcaaaagtcacagacaaatccttttagtttttaaatcgtttcaaaca 17002343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Original strand, 33002932 - 33002982
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttca 52  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  33002932 tttaagtttcaaaagtcccaaaatggtccttttagtttttgaatcgtttca 33002982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 35155413 - 35155363
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttca 52  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  35155413 tttaagtttcaaaagtcccaaagtggtccttttagtttttgaatcgtttca 35155363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 42263097 - 42263047
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttca 52  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  42263097 tttaagtttcaaaagtcccaaaatggtccttttagtttttgaatcgtttca 42263047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 54
Target Start/End: Original strand, 9919242 - 9919294
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaa 54  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9919242 tttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagtttctgaaacgtttcaaa 9919294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 39002236 - 39002201
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttag 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39002236 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttag 39002201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 31710153 - 31710216
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttag 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  31710153 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaag--tttcaaaagtctcaaacaagtcattttag 31710216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 3352271 - 3352234
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3352271 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 3352234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 6600406 - 6600369
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6600406 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 6600369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 62
Target Start/End: Original strand, 11692130 - 11692167
Alignment:
Q  25 aagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692130 aagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 11692167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 11692417 - 11692380
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11692417 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 11692380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 17002426 - 17002389
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17002426 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 17002389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 20079527 - 20079490
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20079527 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 20079490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 20408404 - 20408441
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20408404 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 20408441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 26593550 - 26593513
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26593550 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 26593513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 27116364 - 27116331
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttta 35  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27116364 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttta 27116331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 41282213 - 41282250
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41282213 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 41282250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 16752277 - 16752242
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagt 37  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16752277 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagt 16752242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 37
Target Start/End: Original strand, 26035326 - 26035361
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagt 37  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26035326 tttaaatttcaaaagtcccaaacaagtccttttagt 26035361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 16096230 - 16096192
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16096230 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagttt 16096192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 4016143 - 4016106
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4016143 tttaagtttcaaaagtaccaaacaagtcctttaagttt 4016106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 6251864 - 6251901
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6251864 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagttt 6251901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 6331248 - 6331285
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6331248 tttaagtttcaaaagtcccaagcaagtcctttaagttt 6331285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 240
Target Start/End: Original strand, 6332873 - 6332914
Alignment:
Q  199 attaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6332873 attaccaactattctatctacaatagaacttgtttgaaacga 6332914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 6740225 - 6740188
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6740225 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcctttaagttt 6740188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 8689443 - 8689480
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8689443 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtcctttaagttt 8689480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 19661901 - 19661872
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcct 31  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19661901 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcct 19661872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 31
Target Start/End: Original strand, 20517029 - 20517058
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcct 31  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20517029 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcct 20517058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 27509849 - 27509886
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27509849 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagttt 27509886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 30298019 - 30297982
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30298019 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtcctttaagttt 30297982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 39824427 - 39824464
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  39824427 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagttt 39824464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 42993389 - 42993426
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  42993389 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcctttaagttt 42993426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 43166530 - 43166493
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43166530 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtcctttaagttt 43166493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 52
Target Start/End: Original strand, 35861227 - 35861267
Alignment:
Q  12 aaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttca 52  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  35861227 aaaagtcccaaagtagtcattttagtttttgaatcgtttca 35861267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 104)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 47219045 - 47219283
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  47219045 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaataa 47219144  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47219145 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47219244  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47219245 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 47219283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1469734 - 1469496
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  1469734 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagaatgatggtgatgattcatatgatagcaacaa 1469635  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1469634 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaacaaagatgagttcaaggaagcaatt 1469535  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1469534 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 1469496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31684375 - 31684137
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31684375 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaa 31684276  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31684275 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31684176  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31684175 accaactattctatctacaataggacttgtttgaaacga 31684137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 44544309 - 44544547
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44544309 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 44544408  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44544409 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 44544508  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44544509 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 44544547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47281367 - 47281127
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatg--atgatgatgatttagatgatagcaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  47281367 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgtgatggtgatgatttagatgatagcaac 47281268  T
Q  100 aaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47281267 aaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 47281168  T
Q  200 ttaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47281167 ttaccaactatggtatctacaataggacttgtttgaaacga 47281127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 47271881 - 47272119
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47271881 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 47271980  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47271981 agagcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47272080  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47272081 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 47272119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47294532 - 47294294
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  47294532 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgattttgatgatagcaataa 47294433  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47294432 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47294333  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47294332 accaacgatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 47294294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30798610 - 30798371
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30798610 ttttaagtttcaatagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 30798511  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30798510 aagagcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 30798411  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  30798410 taccaactatgctatctacaataggatttgtttgaaacga 30798371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35600364 - 35600125
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | | |||| ||||||||||||||    
T  35600364 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtaaagattcagatgatagcaaca 35600265  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600264 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 35600165  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600164 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 35600125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11476797 - 11476559
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11476797 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 11476698  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11476697 agagcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 11476598  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11476597 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 11476559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 30876159 - 30876397
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30876159 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaagaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 30876258  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30876259 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcccaatttggtaccaaaaatgagttcaatgaagcaatt 30876358  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30876359 accaactatgctatctacaatagcacttgtttgaaacga 30876397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45723732 - 45723494
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  45723732 tttaagtttcaaaagtcccaaagaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgattatttagatgatagcaacaa 45723633  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  45723632 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaatt 45723533  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45723532 actaattatgctatctacaatatgatttgtttgaaacga 45723494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41139653 - 41139411
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41139653 tttaagtttcaaaagttccaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttataggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 41139554  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41139553 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41139454  T
Q  202 accaac----tatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  41139453 accaactatatatgctatttacaataggacttgtttgaaacga 41139411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30972183 - 30971944
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30972183 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgatttagatgatagtaaca 30972084  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  30972083 aagagcattatccacaatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgggtttaaggaagtaat 30971984  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30971983 taccaactatgccatctacaatatgacttgtttgaaacga 30971944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 23842205 - 23842443
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23842205 tttaagtttcaaaagttcaaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 23842304  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23842305 agagcattatccaccatctgccatgcctaaaaagatgactaatttgaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 23842404  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23842405 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 23842443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43968500 - 43968262
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43968500 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacgagtccttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaa 43968401  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  43968400 agagcattatccaccatttgtcatgcctataaagatgactaattttaagtgggtattatgagccaaatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 43968301  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43968300 accaactacgctatctacaataggacttgtttgaaacga 43968262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27364581 - 27364342
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27364581 ttttaagtttcaaaagtcacaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgacgattcagatgatagcaaca 27364482  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  27364481 aagagcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaat 27364382  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  27364381 taccaactatgttatctacaataggatctgtttgaaacga 27364342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38427803 - 38427566
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  38427803 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttagatgatgatgatg-tgatttagattatagcaacaa 38427705  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38427704 agagcattatccgccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38427605  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38427604 accaactatgctatctataataggacttgtttgaaacga 38427566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8162954 - 8162717
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8162954 ttttaagtttcaaaagttgcaaacaagtccttttagtttttaaatcttttcaaacaaatccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 8162855  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  8162854 aagagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataacaaagatgagttcaaggaagcaat 8162755  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8162754 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 8162717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Original strand, 4923116 - 4923352
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  4923116 tttaagtttcaaaagtcccaaactagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcaaatgatagcaacaa 4923215  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4923216 agaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaatt 4923315  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4923316 accaactatgctatccacaataggacttgtttgaaac 4923352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Original strand, 29248242 - 29248477
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29248242 tttaaatttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 29248341  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  29248342 agagaattatccacaatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttgatgccaaagatgagttcaaggaatcaatt 29248441  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29248442 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaa 29248477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 33884225 - 33884457
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||      |||||||||||    
T  33884225 tttaagtttcaaaagtaccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttggaggatgatggtgatgat------gatagcaacaa 33884318  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33884319 agaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 33884418  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33884419 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 33884457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42979579 - 42979341
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  42979579 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 42979480  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  42979479 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttgatatcaaagatgagttcaacgaagcaatt 42979380  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  42979379 accaactatgttatctacagtaggacttgtttgaaacga 42979341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 48628705 - 48628943
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  48628705 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatagtgatgatttagatgatagaaacaa 48628804  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  48628805 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtgcaaaaaatgagttcaaggaagcaatt 48628904  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48628905 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 48628943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11050502 - 11050264
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  11050502 tttaagtttcaaatgtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgctggtgatgattcagatgatagcaacaa 11050403  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11050402 agaacattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggaggcagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaatt 11050303  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11050302 accaaatatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 11050264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43753017 - 43752779
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  43753017 tttaagtttcaaaagcccaaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttaaaacaaattcttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 43752918  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43752917 agagcattatccaccatttgtcctgcctcaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43752818  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43752817 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 43752779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 7335960 - 7336197
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7335960 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttaaaggataatgatgatgatttagatgatagcaacaa 7336059  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7336060 atagtattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaatgatgagttcaaggaagcaatt 7336159  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  7336160 atcaactatgctatctacaata-gaactgtttgaaacga 7336197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37394238 - 37394001
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37394238 tttaagttt-aaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtcctcttagagtatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 37394140  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37394139 agaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaact 37394040  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37394039 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 37394001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 47119891 - 47120131
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  47119891 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaataagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 47119990  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47119991 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaatatgagttcaagaaagcaatt 47120090  T
Q  202 accaac--tatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  47120091 accaactatatgctctctacaataggacttgtttgaaacga 47120131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 18353044 - 18353282
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18353044 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 18353143  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||    
T  18353144 agaacattatccaccatttatcatgtctaaaaagatgactaattttaattaggtgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaagaaaacaatt 18353243  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  18353244 accaactatgctatctaccttaggacttgtttgaaacga 18353282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 40851183 - 40851412
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||         ||||||||||    
T  40851183 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatg---------atagcaacaa 40851273  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40851274 agagcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaatt 40851373  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  40851374 accaactattctacctacaataggacttgtttgaaacga 40851412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 47579328 - 47579091
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47579328 tttaagtttttaaagtctcaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacatgtcattttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 47579229  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagc-aat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47579228 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatggttaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaaat 47579129  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  47579128 taccaattatgctatctataataggacttgtctgaaac 47579091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37354501 - 37354284
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  37354501 tttaagttacaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgat---tcagatgatagcaacaa 37354405  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  37354404 acaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccaaatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 37354305  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37354304 accaactatgctatctacaat 37354284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44800651 - 44800415
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44800651 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaactaatccttttagtggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 44800552  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
     || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  44800551 ggaacattatccaccatatatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccatatttggtaccaaagatgagttcaatgaaacaatt 44800452  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  44800451 accaactatgttatctacaacaggacttgtttgaaac 44800415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 221196 - 221413
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  221196 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgttgatgatttagatgatagcaacaa 221295  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||                     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  221296 ag---------------------tgcctaaaaagaagactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 221374  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  221375 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 221413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 40520836 - 40521011
Alignment:
Q  20 caaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatt 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40520836 caaacaagtccttttagcttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatt 40520935  T
Q  120 tgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaa 195  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40520936 tgccatggctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaa 40521011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3797754 - 3797544
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||            | ||||||| |||||||||||||||    
T  3797754 tttaagtttcaaaagtttcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttac----------acgatgattcagatgatagcaacaa 3797665  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3797664 agagcattatccaccatttaacatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3797565  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  3797564 atcaactatgctatctacaat 3797544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 237
Target Start/End: Original strand, 41113349 - 41113512
Alignment:
Q  74 atgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttag 173  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41113349 atgatgatgattcagatgatagcaacaaagagcattattcatcatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgg 41113448  T
Q  174 taccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41113449 taccaaatatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaa 41113512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 39033961 - 39034122
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39033961 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcattttaaaggatgatggtgatcatttagatgatagcaaca 39034060  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39034061 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggcgttagga 39034122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 222
Target Start/End: Original strand, 27774072 - 27774228
Alignment:
Q  66 agaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcc 165  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  27774072 agaggatgatggtgataattcagataatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctgattttaagtgggttttaggagcc 27774171  T
Q  166 agatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27774172 agatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 27774228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 115 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2960768 - 2960643
Alignment:
Q  115 ccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgcta 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2960768 ccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgcta 2960669  T
Q  215 tctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2960668 tctacaataggacttgtttgaaacga 2960643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Original strand, 42888775 - 42888900
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  42888775 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagattatagcaacaa 42888874  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgc 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  42888875 agagcattatccaccatttgccatgc 42888900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 43025014 - 43025155
Alignment:
Q  4 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaag 103  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  43025014 taagattcaaaagtttcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggttatgattcagatgatagcaacaaag 43025113  T
Q  104 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatt 145  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43025114 agcaatatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaatt 43025155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 45233699 - 45233570
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  45233699 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggataatggtgatgatttaaatgatagtaacaa 45233600  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaa 131  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  45233599 atagcattatccactatttgtcatgcctaa 45233570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 29739711 - 29739829
Alignment:
Q  32 tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  29739711 tttagtttttgaatcgtttcaaacaattccttttagaggatgataatgatgattcagatgatagtaacaaagagcattatccaccatttaccatgcct-a 29739809  T
Q  132 aaagatgactaattttaagt 151  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29739810 aaagatgactaattttaagt 29739829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 44551040 - 44550938
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44551040 tttaagtttcaaaagtctcaaacacgtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctgtttagagaatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 44550941  T
Q  102 aga 104  Q
    |||    
T  44550940 aga 44550938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Original strand, 29739572 - 29739713
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||   ||  ||  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  29739572 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtcctttaaatttcaaaa--gtcccaaacaagtcattttaaaggatgagaatgatgattcagatgatagtaacaa 29739669  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 146  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  29739670 agagcattatccaccatttaccatgcct-aaaagatgactaattt 29739713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 11476516 - 11476574
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11476516 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 11476574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 31684094 - 31684152
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31684094 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 31684152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 37393958 - 37394016
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37393958 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 37394016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 43752736 - 43752794
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43752736 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 43752794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 47294251 - 47294309
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47294251 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 47294309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 30876440 - 30876383
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30876440 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 30876383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 23842487 - 23842428
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23842487 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 23842428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 2960600 - 2960658
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2960600 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 2960658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 11050221 - 11050279
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11050221 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttcagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 11050279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 47120174 - 47120116
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47120174 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 47120116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 48628986 - 48628928
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48628986 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 48628928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 35600082 - 35600142
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600082 tttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 35600142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Original strand, 30798328 - 30798383
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30798328 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttgttgaatcgtttcaaacaa 30798383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 38427522 - 38427581
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38427522 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 38427581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 221456 - 221398
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  221456 tttaagtttcaaaagttccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 221398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 2960826 - 2960768
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2960826 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttcaatcgtttcaaacaagtc 2960768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 41139369 - 41139426
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41139369 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcc-tttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 41139426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 43968219 - 43968277
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43968219 tttaagtttcaaaggtcacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 43968277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 44544590 - 44544532
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44544590 tttaagtttctaaagtcccaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtc 44544532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 47219326 - 47219268
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47219326 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttaaatcgtttcaaacaagtc 47219268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 18353327 - 18353267
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaa--agtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18353327 tttaagtttcaaatgagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 18353267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 40520787 - 40520852
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttag 67  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40520787 tttaagtttcgaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttag 40520852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Original strand, 41107270 - 41107346
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgat 78  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41107270 tttaaatttcaaaagtctcaaataagtctttatagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgat 41107346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 45723451 - 45723511
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45723451 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcat 45723511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 1469453 - 1469511
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469453 tttaagtttcaaaggtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 1469511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 5106222 - 5106168
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 56  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5106222 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 5106168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 41113558 - 41113500
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41113558 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 41113500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 240
Target Start/End: Original strand, 42888937 - 42888987
Alignment:
Q  190 aaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42888937 aaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 42888987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 47281084 - 47281142
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281084 tttaagcttcaaaagactcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 47281142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 49
Target Start/End: Original strand, 25801526 - 25801573
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtt 49  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25801526 tttaagtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtt 25801573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 44800369 - 44800428
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44800369 ttttaagtttcaaaaatctcaaacaagttcttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 44800428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 7336240 - 7336186
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 56  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7336240 tttaagtttcaaaaattccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaaca 7336186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 8162672 - 8162730
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8162672 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttattttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 8162730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 40851455 - 40851397
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40851455 tttaagtttcaaaaatttcaaacaagtccttttagcttttgaatcgtttcaaacaagtc 40851397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 42889030 - 42888972
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42889030 tttaagtttcaaaagtttcaaataagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 42888972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 47272162 - 47272104
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47272162 tttaagtttcaaaattctaaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 47272104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 55
Target Start/End: Original strand, 27773036 - 27773089
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaac 55  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27773036 tttaaatttcaaaagttccaaactagtccttttagtttttgaatcgtttcaaac 27773089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 42888941 - 42888900
Alignment:
Q  28 tccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagag 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42888941 tccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagag 42888900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 27692063 - 27692011
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27692063 tttaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttagtttctgaaacgtttcaaa 27692011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 49
Target Start/End: Original strand, 34378568 - 34378615
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtt 49  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34378568 tttaaatttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtt 34378615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 42979298 - 42979356
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42979298 ttttaagtttcaaaattct-aaacaagtccttttagtttgtgaatcgtttcaaacaagtc 42979356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Original strand, 27364299 - 27364353
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 56  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27364299 tttaagttttaaaagtttcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 27364353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 62
Target Start/End: Original strand, 30971919 - 30971961
Alignment:
Q  20 caaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30971919 caaacaagtcgttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 30971961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 31793860 - 31793822
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttt 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31793860 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttt 31793822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 47579047 - 47579104
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  47579047 tttaagtttcaaaagtcc-aaacaagtcattttagtttttgaattgtttcagacaagtc 47579104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 240
Target Start/End: Original strand, 5106127 - 5106179
Alignment:
Q  187 ttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  5106127 ttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataaga-atgtttgaaacga 5106179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 33884500 - 33884440
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33884500 tttaagttttaaaagtttcaaccaagtccttttcgtttttaaatcgtttcaaacaagtcat 33884440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 31793890 - 31793852
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31793890 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 31793852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 11050531 - 11050494
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11050531 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 11050494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 37394267 - 37394230
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37394267 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 37394230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 153
Target Start/End: Original strand, 12583313 - 12583352
Alignment:
Q  114 accatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg 153  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12583313 accatttttcatgcgtaaaaagatgactaattttaagtgg 12583352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 35600392 - 35600355
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35600392 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcttttaagttt 35600355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 35
Target Start/End: Original strand, 39033932 - 39033965
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttta 35  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39033932 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttta 39033965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 39241881 - 39241844
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39241881 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcctttaagttt 39241844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 44544280 - 44544317
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44544280 tttaagtttcaaaagtcccaaacaggtcctttaagttt 44544317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 45723761 - 45723724
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45723761 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagttt 45723724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 47219016 - 47219053
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  47219016 tttaagtttcaaacgtcccaaacaagtcctttaagttt 47219053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 144)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23767655 - 23767417
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23767655 tttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaa 23767556  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767555 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 23767456  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767455 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 23767417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38473867 - 38473629
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  38473867 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaactagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 38473768  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473767 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38473668  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38473667 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacga 38473629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28425605 - 28425366
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28425605 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaca 28425506  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425505 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 28425406  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28425405 taccaactatgctatctgcaataggacttgtttgaaacga 28425366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 19315540 - 19315778
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19315540 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttctagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 19315639  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19315640 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19315739  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19315740 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 19315778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7553257 - 7553019
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7553257 tttaattttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcttttcagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 7553158  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7553157 agagcattatccaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7553058  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7553057 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacga 7553019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Original strand, 46825449 - 46825669
Alignment:
Q  20 caaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825449 caaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatt 46825548  T
Q  120 tgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46825549 tgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctac 46825648  T
Q  220 aatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  46825649 aataggacttgtttgaaacga 46825669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 12142965 - 12143210
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttc-------aaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgata 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12142965 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaatttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgata 12143064  T
Q  95 gcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaagga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12143065 gcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaagga 12143164  T
Q  195 agcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12143165 agcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 12143210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25988513 - 25988274
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25988513 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagagaatgatagtgatgatttagatgatagcaaca 25988414  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25988413 aaaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaat 25988314  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25988313 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 25988274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 19274459 - 19274697
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19274459 tttatgtttcaaaagtcccaaataagtccttttagttttcgaatcgtttcaaacaagtcgttttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 19274558  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19274559 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 19274658  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19274659 accagctatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 19274697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 7651560 - 7651800
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatg--atgatttagatgatagcaac 99  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  7651560 tttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttatagaggatgatggtgtgatgatttagatgatagcaac 7651659  T
Q  100 aaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7651660 aaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaa 7651759  T
Q  200 ttaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7651760 ttatcaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 7651800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49094953 - 49094714
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  49094953 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgattctgatgatagcaaca 49094854  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49094853 aagaacattatccaccatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 49094754  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49094753 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 49094714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 18892229 - 18892467
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18892229 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 18892328  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18892329 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaggatgactaattttcagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 18892428  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18892429 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 18892467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23228435 - 23228197
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23228435 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 23228336  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23228335 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 23228236  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23228235 accaactatgctatctacaatagtacttgtttgaaacga 23228197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 33673917 - 33674155
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33673917 tttaagttttaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgattgtgatgatttagatgatagcaacaa 33674016  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33674017 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaagatgagttcaaggaagcaatt 33674116  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33674117 accagctatgctatctacaataggacttgtttgacacga 33674155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 49814200 - 49814438
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  49814200 tttaagtttcaaaagttccaaacaagttattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaataa 49814299  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49814300 aaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 49814399  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  49814400 accaactatgctatctagaatatgacttatttgaaacga 49814438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 50689844 - 50690081
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50689844 tttaagtttcaaaagtcccaa-caagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 50689942  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50689943 agagcattatccatcatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50690042  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50690043 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacga 50690081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 33325627 - 33325865
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  33325627 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcattttagaggatgatggtgatgatttagatgagtgcaacaa 33325726  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33325727 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtcttagaagccagatttgataccaaagatgagtttaaggaagcaatt 33325826  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33325827 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 33325865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36781413 - 36781175
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36781413 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 36781314  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36781313 aaagcattatccaccatttgccatgcccaaaaagacgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36781214  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36781213 accaactatgatatctacaataagacttgtttgaaacga 36781175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 46051350 - 46051588
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  46051350 tttaagtttcaaaagtcccaaataaggccttttagtttttgaatcgtttcaaactagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 46051449  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46051450 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 46051549  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  46051550 accaactatgctatctacaacaggacttgtttgaaacga 46051588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 52146893 - 52147131
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  52146893 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaactagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 52146992  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  52146993 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 52147092  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  52147093 acaaactatgctatatacaacatgacttgtttgaaacga 52147131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36157919 - 36157681
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaa-caagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36157919 tttaagtttcaaaagtcccaaaacaaatcattttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 36157820  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36157819 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 36157720  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36157719 t-ccaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 36157681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45670727 - 45670489
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  45670727 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 45670628  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45670627 agaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 45670529  T
Q  202 acc-aactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45670528 accaaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 45670489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7609007 - 7608769
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7609007 tttaagtttcaacagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggataatggtgatgattcagatgatagcaacaa 7608908  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  7608907 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtacaaaagatgagttcaaagaagcaatt 7608808  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7608807 atcaactatgctatctataataggacttgtttgaaacga 7608769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9879025 - 9878787
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  9879025 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgacagcaacaa 9878926  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9878925 agaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaacccgatatggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 9878826  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9878825 accaactattttatctacaatatgacttgtttgaaacga 9878787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 26069792 - 26070030
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26069792 tttaaatttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgataacaacaa 26069891  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26069892 agatcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccggatttgataccaaaaatgagttcaaggaaacaatt 26069991  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26069992 accaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaacga 26070030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 26549288 - 26549526
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26549288 tttaaatttcaaaagccacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagagaatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 26549387  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26549388 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 26549487  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  26549488 accaactatgctatctacaataggacttgtttaaaacga 26549526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48669637 - 48669399
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  48669637 tttatgtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 48669538  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  48669537 agaacattatccattatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatc 48669438  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48669437 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 48669399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 52350165 - 52349927
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52350165 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagagaatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 52350066  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  52350065 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaatt 52349966  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  52349965 accaactatgctatttacaataggacttgtttgaaacga 52349927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 46095317 - 46095078
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  46095317 ttttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgacttagatgatagcaaca 46095218  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||| ||||    
T  46095217 aagagcattatccaccatttgtcatgtttaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagacagatttgatatcaaagatgagttcaaggaaacaat 46095118  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46095117 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 46095078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24204711 - 24204474
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24204711 tttaagtttcaaa-gtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaataa 24204613  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24204612 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactcattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaatt 24204513  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24204512 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 24204474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 41105916 - 41106154
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  41105916 tttaaatttcaaaagttccaaaaaagtccttttaatttttgaaccgtttcaaacagatcattttataggatgatggtgatgatttaaataatagcaacaa 41106015  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41106016 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41106115  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41106116 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 41106154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 50533283 - 50533521
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  50533283 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaaaaagtcattttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 50533382  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50533383 agagcattatccaaaatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50533482  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  50533483 accaactatgttatctataataggacttgtttgaaacga 50533521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 52067895 - 52067654
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgat---ttagatgatagcaa 98  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||    
T  52067895 tttaagattcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatgattcagatgatagcaa 52067796  T
Q  99 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  52067795 caaagagcattatccaccatttgtcatccctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaacgatgagttcaaggaagca 52067696  T
Q  199 attaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  52067695 attacaaattatgccatctacaacatgacttgtttgaaacga 52067654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 43396575 - 43396813
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  43396575 tttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagagtatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 43396674  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43396675 agagcattatccatcatttgctatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43396774  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    | ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  43396775 atcaactctgctatctacagtaggatttgtttgaaacga 43396813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41982478 - 41982238
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttt-agaggatgatgatgatgatttagatgatagcaac 99  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41982478 ttttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaac 41982379  T
Q  100 aaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 199  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  41982378 aaaaaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaatatgactaattttaaatgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaa 41982279  T
Q  200 ttaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41982278 ttatcaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacga 41982238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45350956 - 45350720
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  45350956 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtttttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttt-agaggatgatggtgataatttagatgatagcaaca 45350858  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45350857 aaaaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagatcaaggaagcaat 45350758  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  45350757 taccaactatgttatctacaatagg--ttgtttgaaacga 45350720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 48319287 - 48319067
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  48319287 tttaagtttcaattgtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgcttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 48319188  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48319187 agaacattatccaccatttgtaatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 48319088  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  48319087 accaactatgctatatacaat 48319067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 9974741 - 9974963
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  9974741 ttttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgattgtgatgattcagatgatagcaaca 9974840  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9974841 aagaacattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccatatttagtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 9974940  T
Q  201 taccaactatgctatctacaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9974941 taccaactatgctatctacaata 9974963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 34970982 - 34971218
Alignment:
Q  4 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaag 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  34970982 taagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgacgatgattcagatgatagcaacaaag 34971081  T
Q  104 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 203  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  34971082 aacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagtcagatttgataccaaatatgagttcaaagaaacaattac 34971181  T
Q  204 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  34971182 caactatgttatctacattaggacttgtttgaaacga 34971218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Original strand, 5400771 - 5401005
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  5400771 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaagaagtccttttagaggatgatggtgattattcagatgatagcaacaa 5400870  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5400871 atagtattatccaccatttg-catgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagaaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 5400969  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5400970 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaa 5401005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18782330 - 18782095
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  18782330 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagagaatggtggtgatgattcagatgatagcaacaa 18782231  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18782230 agaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctatgaaccagattttgtaccaaagatgagttcaaataagcaatt 18782131  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18782130 atcaactatgctatctagaatatgacttgtttgaaa 18782095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8141727 - 8141489
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  8141727 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttttcgaatcgtttcaaacaagtccttttagatgatgatggtgatgattcgaatgatagcaacaa 8141628  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8141627 agaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacaagtcagatttggtactaaagatgagttcaaagaagcaatt 8141528  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8141527 acaaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 8141489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 16705770 - 16706008
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||| |||||    
T  16705770 tttaagtttcaaaagccacaaacaagtcctttaagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggataatgacgatgattcaggtgatagaaacaa 16705869  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16705870 agagcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggcgccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16705969  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16705970 accaactatgttatctaaaataagacttgtttgaaacga 16706008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 37216796 - 37217034
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37216796 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaattgtttcaaacaagtgcttttaaaggatgatggtgatgatttagatgataccaacaa 37216895  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37216896 agaacattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagctagagttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 37216995  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37216996 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 37217034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48802543 - 48802334
Alignment:
Q  31 ttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgccta 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48802543 ttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttatcatgccta 48802444  T
Q  131 aaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttg 230  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48802443 caaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaataagacttg 48802344  T
Q  231 tttgaaacga 240  Q
    ||||||||||    
T  48802343 tttgaaacga 48802334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 6711342 - 6711578
Alignment:
Q  4 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaag 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  6711342 taagtttcaaaagtctcaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaaaggatgatggtgatgattcaaatgatagcaacaaag 6711441  T
Q  104 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6711442 agcattatccaccatttaccatgtgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 6711541  T
Q  204 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6711542 caactataatgtctacaatatgacttgtttgaaacga 6711578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Original strand, 12964546 - 12964750
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12964546 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttaatttttgaattgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 12964645  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12964646 agagcattatacaacatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12964745  T
Q  202 accaa 206  Q
    |||||    
T  12964746 accaa 12964750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33194892 - 33194672
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33194892 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcatttgactttttgaatcgtttcgaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 33194793  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33194792 agagcattaaccaccattcgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaact 33194693  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33194692 accaactatgctatctacaat 33194672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 18917431 - 18917662
Alignment:
Q  9 ttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcat 108  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  18917431 ttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgataatgatgattcagatgatagtaacaaagagaat 18917530  T
Q  109 tatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaact 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  || |    
T  18917531 tatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaattattaaat 18917630  T
Q  209 atgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18917631 atgctatctacaatatgatttgtttgaaacga 18917662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 9962660 - 9962889
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||         ||||||||||    
T  9962660 tttaagtttcaaaagtctcaaacacgtccttttagtttttgaatcgtttcaaactagtctttttagaggatgatggtgatg---------atagcaacaa 9962750  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9962751 agaacattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaactagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 9962850  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  9962851 accaactatgctatctacaacagaacttgtttgaaacga 9962889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 21929421 - 21929664
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21929421 tttaagtttcaaaagttccagacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 21929520  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtacc-------aaagatgagttcaagga 194  Q
    |||  ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||    
T  21929521 agaagattatccaccatttgccat--ctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaagatgaaagatgagttcaagga 21929618  T
Q  195 agcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21929619 agcaattaccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacga 21929664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 30281530 - 30281751
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  30281530 ttttaagtttcaaaagttccaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatacttttagagaatgatggtgatgattcatatgatagcaaca 30281629  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30281630 aagagcattatccaccattttacatgcctaaaaagataactggtattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 30281729  T
Q  201 taccaactatgctatctacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30281730 taccaactatgctatctacaat 30281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 21964964 - 21965203
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  21964964 ttttaagtttcaaaagtctcaatcaaatccttttagttttcgaatcgtttcaaataagtctttttagagaatgatggtgataattcggatgatagcaaca 21965063  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  21965064 aagaacattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtaaggagtcagatttggtaccaaagatgagtttaatgaagcaat 21965163  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21965164 taccaattatgtcatctacaataggacttgtttgaaacga 21965203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33714600 - 33714364
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33714600 tttaaatttcaaaagttccaaacaagtcctcttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggataatggtgatgattcagatgatagcaacaa 33714501  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  33714500 agaatattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaa-tgtaagt-ggtgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaaacaatt 33714403  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    | |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  33714402 atcaactatgttatctacaataggatttgtttgaaacga 33714364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 40721251 - 40721481
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||         | |||||||||||||||    
T  40721251 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttctgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgat---------tcagatgatagcaacaa 40721341  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-gggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40721342 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataattaattttaggttgggtattaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaagaaagcaat 40721441  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40721442 tatcaactatgctatctacaataggacttgttggaaacga 40721481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 25800543 - 25800779
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttc-aaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |    
T  25800543 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttttaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattaagatgaaagcaaaa 25800642  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtacca----aagatgagttcaaggaag 196  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| ||||||    ||||||||||||||||||    
T  25800643 aagaacattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta------agatttggtaccaaattaagatgagttcaaggaag 25800736  T
Q  197 caattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25800737 caattaccaac-atgttatctacaataagacttgtttgaaacga 25800779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 44979429 - 44979281
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44979429 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttatgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 44979330  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44979329 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 44979281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 180
Target Start/End: Original strand, 50099120 - 50099298
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  50099120 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagaccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 50099219  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||| ||||||||    
T  50099220 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaaaagtcatatttggtaccaaa 50099298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 51 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17984090 - 17983901
Alignment:
Q  51 caaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 150  Q
    |||||||||| ||||| || |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17984090 caaacaagtccttttacagaatgatagtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 17983991  T
Q  151 tgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||    
T  17983990 tgggtgttatgaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattacaaactatgttatttacattaggacttggttgaaacga 17983901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 66 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16506965 - 16506809
Alignment:
Q  66 agaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcc 165  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16506965 agaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagatcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatggctgattttaagtgggtgttaggagcc 16506866  T
Q  166 agatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16506865 agatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 16506809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 32373794 - 32373650
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||    
T  32373794 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcttttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatcattcagatgatagtaacaa 32373695  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32373694 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 32373650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Original strand, 49973845 - 49973972
Alignment:
Q  5 aagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49973845 aagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaaga 49973944  T
Q  105 gcattatccaccatttgtcatgcctaaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49973945 gcattatccaccatttgtcatgcctaaa 49973972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17990008 - 17989864
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  17990008 tttaaatttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttaaatgatagtaacaa 17989909  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 146  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17989908 atagcattattcactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 17989864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 44978868 - 44978771
Alignment:
Q  142 aattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44978868 aattttaagtgg-tattaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattatcaattatgctatctacattctgacttgtttgaaacga 44978771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 7651843 - 7651783
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7651843 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 7651783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 19315821 - 19315761
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19315821 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 19315761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Original strand, 44978728 - 44978787
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44978728 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtca 44978787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21965246 - 21965188
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21965246 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 21965188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 25800822 - 25800764
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25800822 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 25800764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 28425323 - 28425381
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425323 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 28425381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 46051631 - 46051573
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46051631 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 46051573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 48802291 - 48802349
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48802291 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 48802349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 7552975 - 7553036
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7552975 ttttaagtttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 7553036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 50690124 - 50690064
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50690124 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 50690064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 12143253 - 12143195
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12143253 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 12143195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 23228153 - 23228211
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23228153 ttttaagtttcaaaagtccctaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 23228211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 24204431 - 24204489
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24204431 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgagtcgtttcaaacaagtc 24204489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 25988231 - 25988289
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25988231 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 25988289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 33325908 - 33325850
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33325908 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 33325850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 36781132 - 36781190
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36781132 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 36781190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 37217077 - 37217019
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37217077 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 37217019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 38473586 - 38473644
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473586 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 38473644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 45670446 - 45670504
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45670446 tttaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 45670504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 46825712 - 46825654
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825712 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 46825654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19274739 - 19274682
Alignment:
Q  3 ttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19274739 ttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtc 19274682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 9878744 - 9878804
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9878744 tttaagtttcaaaagtcccaaataagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 9878804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 18782049 - 18782109
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18782049 tttatgtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtcat 18782109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 52067611 - 52067671
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52067611 tttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 52067671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 43396856 - 43396801
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 57  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43396856 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 43396801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 7608726 - 7608784
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608726 tttaaatttcaaaaatcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 7608784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 12964813 - 12964755
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12964813 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgattcaaacaagtc 12964755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 18892510 - 18892452
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18892510 tttaagtttcaaaagttccaaaaaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 18892452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26549569 - 26549511
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26549569 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgttttaaacaagtc 26549511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 33674198 - 33674140
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33674198 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtgtcaaacaagtc 33674140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 36157638 - 36157696
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36157638 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 36157696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 40721524 - 40721466
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40721524 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttccaacaagtc 40721466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 46095035 - 46095093
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46095035 tttaagtttcaaaaattccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 46095093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 49094671 - 49094729
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49094671 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 49094729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 49814479 - 49814421
Alignment:
Q  4 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49814479 taagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaataagtcat 49814421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 9962932 - 9962875
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9962932 tttaagtttcaaaagtctcaaagaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 9962875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 21929707 - 21929650
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21929707 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagt 21929650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 55
Target Start/End: Original strand, 22351085 - 22351138
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaac 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22351085 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaac 22351138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 46825400 - 46825465
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttag 67  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46825400 tttaagtttcaaaagactcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtccttttag 46825465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 6711621 - 6711561
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6711621 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttttatttttgaatcgtttcaaacaagtcat 6711561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 23767375 - 23767434
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767375 tttaagtttcaaaagtctcaaacaa-tccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 23767434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 26070073 - 26070013
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26070073 tttaagtttcaaaagtctcaaagaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 26070013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 16505199 - 16505250
Alignment:
Q  4 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaac 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16505199 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaac 16505250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Original strand, 45350677 - 45350732
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 57  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45350677 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaa 45350732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 5401051 - 5400993
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5401051 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcttttcaaacaagtc 5400993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 16706051 - 16705993
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16706051 tttaagtttcaaaaatttcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 16705993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 18917705 - 18917645
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18917705 tttaagtttcataagtctcaaacaagtccttttagttttttaatcgtttcaaacaaatcat 18917645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 41982195 - 41982255
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41982195 tttaagtttcaaaagtctcatataagtccttttagtttttgcatcgtttcaaacaagtcat 41982255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 52147174 - 52147114
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52147174 tttaaatttcaaaaatctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtcat 52147114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Original strand, 24036661 - 24036703
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaa 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24036661 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaa 24036703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 50533552 - 50533506
Alignment:
Q  14 aagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50533552 aagtcccaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtc 50533506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 16508169 - 16508117
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaac 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16508169 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttag-ttttgaattgtttcaaac 16508117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 60
Target Start/End: Original strand, 8141450 - 8141504
Alignment:
Q  5 aagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8141450 aagtttcaaaagttccaaacaagtt-ttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 8141504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 17983857 - 17983916
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17983857 ttttaaatttcaaaagtcttaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaccaagtc 17983916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Original strand, 33714321 - 33714376
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 57  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  33714321 tttatgtttcaaatgtcccaaacaagtctttctagtttttgaatcgtttcaaacaa 33714376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Original strand, 49594922 - 49594972
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttca 52  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  49594922 tttaagtttcaaaagtcccaaagtggtccttttagtttttgaatcgtttca 49594972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 48669374 - 48669414
Alignment:
Q  20 caaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48669374 caaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtc 48669414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 49974015 - 49973972
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaat 45  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  49974015 tttaagtttcaaaagtttcaaacaagtccttttagtttttgaat 49973972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 8141757 - 8141719
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8141757 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 8141719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 17984109 - 17984075
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttta 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17984109 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttta 17984075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 49595212 - 49595162
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttca 52  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  49595212 tttaagtttcaaaagtcccaaagtggtcattttagtttttgaatcgtttca 49595162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 7609036 - 7608999
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7609036 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 7608999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 23767684 - 23767647
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23767684 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 23767647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 24204740 - 24204703
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24204740 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 24204703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 38473896 - 38473859
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38473896 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 38473859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 50099091 - 50099128
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50099091 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 50099128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 60
Target Start/End: Original strand, 52349909 - 52349942
Alignment:
Q  27 gtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52349909 gtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 52349942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 48802594 - 48802562
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttt 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48802594 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttt 48802562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 33
Target Start/End: Original strand, 19274430 - 19274461
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttt 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19274430 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttt 19274461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 33
Target Start/End: Original strand, 41105887 - 41105918
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttt 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41105887 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttt 41105918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 25800513 - 25800551
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25800513 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagttt 25800551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 37216767 - 37216830
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttag 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  37216767 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaag--tttcaaaagtctcaaacaagtcattttag 37216830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 45350986 - 45350952
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttta 35  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45350986 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttta 45350952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 5400742 - 5400779
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  5400742 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcctttaagttt 5400779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 12964517 - 12964554
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12964517 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagttt 12964554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 18782359 - 18782322
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18782359 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagccctttaagttt 18782322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 25988542 - 25988509
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttta 35  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25988542 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttta 25988509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 41106168 - 41106139
Alignment:
Q  31 ttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41106168 ttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 41106139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 49814171 - 49814208
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  49814171 tttaagtttcaaaagtcctaaacaagtcctttaagttt 49814208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 38
Target Start/End: Original strand, 18917396 - 18917432
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtt 38  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18917396 tttaagtttcaaaagccccaaacaagtcctttaagtt 18917432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 93)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 37933542 - 37933780
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37933542 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 37933641  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933642 agaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 37933741  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37933742 accaactatgctatctacgataagacttgtttgaaacga 37933780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 2533172 - 2533410
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2533172 tttaagtttcaaaagtcctaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 2533271  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2533272 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2533371  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2533372 accaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaacga 2533410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43806774 - 43806536
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  43806774 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 43806675  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43806674 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43806575  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43806574 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 43806536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22684229 - 22683994
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22684229 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 22684130  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22684129 agagcattattcaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 22684030  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22684029 accaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaa 22683994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 35443210 - 35443449
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35443210 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 35443309  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35443310 aagagcattatccactatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 35443409  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35443410 taccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacga 35443449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 259878 - 260115
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  259878 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaagaa 259977  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  259978 agaacattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 260076  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  260077 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 260115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 656043 - 655806
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  656043 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaagaa 655944  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  655943 agaacattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 655845  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  655844 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 655806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 841778 - 841541
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  841778 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaagaa 841679  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  841678 agaacattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 841580  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  841579 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 841541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 513208 - 513445
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  513208 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaattattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 513307  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  513308 agagcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 513406  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  513407 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 513445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9056580 - 9056343
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9056580 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcattttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaca 9056481  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9056480 aagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaat 9056381  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9056380 taccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaac 9056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35884672 - 35884433
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  35884672 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaata 35884573  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884572 aatagcattatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 35884473  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35884472 taccaactatgttatctacaataagacttgtttgaaacga 35884433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 38106999 - 38107237
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  38106999 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtc-ttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtacttttagatgatgatggtgataatttaaatgatagcaaca 38107097  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38107098 aagaacattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 38107197  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38107198 taccaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacga 38107237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 1293386 - 1293624
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1293386 tttaagtttcaaaaatcacaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaactagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 1293485  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1293486 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1293585  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1293586 accaactatgttatctacaacatgacttgtttgaaacga 1293624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28707687 - 28707449
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28707687 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttacaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 28707588  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28707587 agagcattatccaccatttgtcatgccttaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 28707488  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  28707487 accaattatgatatctacaataggatttgtttgaaacga 28707449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24430812 - 24430574
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24430812 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 24430713  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||  || |||||    
T  24430712 agagcattatccaccttttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagtagtgagatttggtaccaaagatgagttcaataaaacaatt 24430613  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24430612 atcaactatactatctacaataggacttgtttgaaacga 24430574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40302134 - 40301896
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40302134 tttaagtttaaaaagttccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagatgatgatgatgatgattcagatgatagcaacaa 40302035  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  40302034 agaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgagtgttaggagctagatttggtaccaaagataaattcaatgaagcaatt 40301935  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40301934 accaactatgctatctacaatatgacttttttgaaacga 40301896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41536763 - 41536530
Alignment:
Q  7 gtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  41536763 gtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttgaaacaattcattttagaggatgatggtgatgatttagatgatagtaacaaagagt 41536664  T
Q  107 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 206  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41536663 atttttcactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaattaccaa 41536564  T
Q  207 ctatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41536563 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 41536530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 7434786 - 7435006
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7434786 tttaaatttcgaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgcttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 7434885  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7434886 agagcattatccaccatttgtcaagcctataaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7434985  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  7434986 accaactatgttatctacaat 7435006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 23935133 - 23935353
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  23935133 tttaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattatgatgataacaacaa 23935232  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23935233 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 23935332  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  23935333 atcaactatgctatctacaat 23935353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 440740 - 440978
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  440740 tttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagcttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 440839  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  440840 agaacattatccaccgtttgccatgtctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaatt 440939  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  440940 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacga 440978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28496595 - 28496358
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28496595 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagttttttaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 28496496  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496495 agagtattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtatta-gaactagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28496397  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28496396 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 28496358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23972538 - 23972298
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgat-gatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  23972538 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgattggtgatgattcagatgatagcaaca 23972439  T
Q  101 aagagcattatccaccattt-gtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23972438 aagagtattatccaacattttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgataggagtcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaa 23972339  T
Q  200 ttaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23972338 ttaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacga 23972298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39513580 - 39513344
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  39513580 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaggtccttttagaggatgacgatgatgattcagatgatagcaacaa 39513481  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39513480 agagtattatccaccatatgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 39513381  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  39513380 accaactatgttatctacattaggacttatttgaaac 39513344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 29485186 - 29485406
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29485186 ttttaagtttcaaaagtcacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 29485285  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29485286 aagagcattatccatcatttgccatgcctaaaaa-atgactgattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 29485384  T
Q  201 taccaactatgctatctacaat 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  29485385 taccaactatgttatctacaat 29485406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 238
Target Start/End: Original strand, 12010450 - 12010688
Alignment:
Q  3 ttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  12010450 ttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagcttttgaatcgtttcaaacaagtccttttggaagatgatggcgatgattcagatgatagcaacaaa 12010549  T
Q  103 gagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatta 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12010550 gagcattatccaccatttgccatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggcaacaatta 12010649  T
Q  203 ccaactatgctat---ctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  12010650 ccaactatgctatctactacaataggacttgtttgaaac 12010688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 38208651 - 38208891
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38208651 ttttaaatttcaaaagtctcagacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggataatggtgatgattcagatgatagcaaca 38208750  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaag-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 199  Q
    || | |||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  38208751 aaaaacattatccaccatttgccatgtctaaaatggatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtagcaaagatgagttcaaagaagcaa 38208850  T
Q  200 ttaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38208851 ttaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacga 38208891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 13796988 - 13797226
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13796988 ttttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaca 13797087  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13797088 aagagcatcgtccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttatgtggatgttaggagccagatttgataccaaa-atgagttcaaagaagcaat 13797186  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  13797187 taccaactatgctatatacaataggatttgtttgaaacga 13797226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 4649050 - 4649288
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4649050 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagttttcgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 4649149  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4649150 agaacattatccaccatttgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtggatgttggaagtcagatttggtaccaaagacgagttcaaggaaacaatt 4649249  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4649250 accaattatgctatctacaattggacttgtttgaaacga 4649288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38633945 - 38633713
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||      ||||| |||||    
T  38633945 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgat------gatagtaacaa 38633852  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38633851 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38633752  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  38633751 accaactatgctatctacattagaacttgtttgaaacga 38633713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 33651741 - 33651979
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33651741 tttaagttttaaaagtctgaaacatgtcattttagtttttgaatcgttttaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 33651840  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||    
T  33651841 agagcattatccaccgtttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatgaaagatgagttcaaggaaacaatt 33651940  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33651941 acaaactatgctatctacgataggacttgtttgaaacga 33651979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 6016105 - 6016325
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  6016105 tttaagtttcaaaagtcacaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgattcagacgatagcaacaa 6016204  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| || |||||||||    
T  6016205 aaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccaaattgagtatcaaagatgagtttaaagaagcaatt 6016304  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6016305 accaactatgctatctacaat 6016325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 240
Target Start/End: Original strand, 3875856 - 3876046
Alignment:
Q  50 tcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaa 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875856 tcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttaaatgattgcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaa 3875955  T
Q  150 gtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3875956 gtgggtgttaggaaccagatatagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 3876046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42988465 - 42988230
Alignment:
Q  4 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaag 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42988465 taagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaataaag 42988366  T
Q  104 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| || |||| || ||||||||||     
T  42988365 agcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaatataagttaaatgaagcaattat 42988266  T
Q  204 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42988265 caactatattatctacaataggactt-tttgaaacga 42988230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 87 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36400226 - 36400073
Alignment:
Q  87 agatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgag 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  36400226 agatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaagatgag 36400127  T
Q  187 ttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36400126 ttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 36400073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36219022 - 36218784
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  36219022 ttttaacttttaaaagtcttaaacaagtccttttagtttttgaattatttcaaacaaattcttttagataatgatgatgatgcttcagatgataacaaca 36218923  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36218922 aagaccattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgctagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaa-gaagcaat 36218824  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    || |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36218823 tatcaactatattatctacatcatgacttgtttgaaacga 36218784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 107 - 240
Target Start/End: Original strand, 15847117 - 15847250
Alignment:
Q  107 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847117 attatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 15847216  T
Q  207 ctatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15847217 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 15847250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Original strand, 8137073 - 8137239
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8137073 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaactccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 8137172  T
Q  102 agagca-ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccag 167  Q
    ||| || ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8137173 agaacatttatccaccatttgctatgcctaaaaaaatgactaattttaagtaggtgttaggagccag 8137239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24193524 - 24193356
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||         | |||||||||||||||    
T  24193524 tttatgtttcaaaagtctcaaacaaatctttttagtttttgattcgtttcaaacaagtccttttagaggatgat---------tcagatgatagcaacaa 24193434  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaa 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24193433 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggagccagatttggtaccaaa 24193356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 91
Target Start/End: Original strand, 9884756 - 9884845
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatg 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9884756 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgagtcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatg 9884845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 39295392 - 39295288
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  39295392 tttaagtttcaaaagtcccaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc-----agaggatgatggtgatgattcaga-gatagcaacaa 39295299  T
Q  102 agagcattatc 112  Q
    ||| |||||||    
T  39295298 agatcattatc 39295288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 15847038 - 15847118
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgat 81  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  15847038 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacatgtccttttagaggatgatggtgat 15847118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 36400030 - 36400090
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36400030 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 36400090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 41536486 - 41536545
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41536486 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 41536545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 441021 - 440963
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  441021 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 440963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 2533454 - 2533393
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2533454 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 2533393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 22683948 - 22684008
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22683948 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtcat 22684008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 23972255 - 23972315
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23972255 tttaagtttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 23972315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 43806493 - 43806553
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43806493 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 43806553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 33652023 - 33651964
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33652023 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 33651964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 3876089 - 3876031
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3876089 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 3876031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24193195 - 24193133
Alignment:
Q  178 aaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24193195 aaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 24193133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 28496315 - 28496373
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496315 tttaagtttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 28496373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 37933823 - 37933765
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933823 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 37933765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 38107280 - 38107222
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38107280 tttaagtttcaaaagtcccaaaaaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 38107222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 35443492 - 35443435
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35443492 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttttgtttttgaatcgtttcaaacaagt 35443435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 260158 - 260098
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  260158 tttaagtttcaaaattctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 260098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 655763 - 655823
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  655763 tttaagtttcaaaattctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 655823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 841498 - 841558
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  841498 tttaagtttcaaaattctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 841558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 24430530 - 24430589
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24430530 ttttaagtttcaaaaatccaaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 24430589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 513488 - 513430
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  513488 tttaagtttcaaaagtctcaaactagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 513430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 4649331 - 4649273
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4649331 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 4649273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 12010733 - 12010675
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12010733 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 12010675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 60
Target Start/End: Original strand, 35884394 - 35884448
Alignment:
Q  6 agtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884394 agtttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 35884448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 38633669 - 38633727
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38633669 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaggtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 38633727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 1293667 - 1293607
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1293667 tttaaattttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 1293607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 13797269 - 13797214
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 57  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13797269 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaa 13797214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15847293 - 15847235
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847293 tttaagtttcaaaagctccaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 15847235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 36218741 - 36218801
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36218741 tttaactttcaaaagttctaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 36218801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 24193090 - 24193148
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24193090 tttaaattttaaaagtctcaaacaagtccttttagttttttaatcgtttcaaacaagtc 24193148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 334
Target Start/End: Original strand, 26058964 - 26059057
Alignment:
Q  239 gagctactatgggtacttcgttcatggttatgggaagattaccagacttgtgaatcagttgttaagagatggcgttgtatggaataaggaaatgca 334  Q
    ||||||| || ||| ||||| ||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||    
T  26058964 gagctaccataggtgcttcgctcatggtaatg--atgattaccagactcgtgaatcagttgttaaaaggtggctttgtatggaataaggacatgca 26059057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 40301853 - 40301913
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  40301853 tttaagtttcaaatgtcctaaataagtccttttagattttgaatcgtttcaaaaaagtcat 40301913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 54
Target Start/End: Original strand, 42988187 - 42988239
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaa 54  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42988187 tttaagttttaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaa 42988239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 18874223 - 18874173
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttca 52  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  18874223 tttaagtttcaaaagtcccaaagtggtccttttagtttttgaatcgtttca 18874173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 60
Target Start/End: Original strand, 9056299 - 9056356
Alignment:
Q  3 ttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9056299 ttaagtttcaaaagtttcaaacaaatcattttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 9056356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 28707410 - 28707461
Alignment:
Q  5 aagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 57  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28707410 aagtttcaaaagtctcaagcaagtc-ttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 28707461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 38208933 - 38208874
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38208933 tttaagtttcaaaggtcttaaacaagtt-ttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 38208874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 43469254 - 43469202
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43469254 tttaagtttcaaaagtcccaaagtggtcattttagtttttgaatcgtttcaaa 43469202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 8137313 - 8137275
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttt 40  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8137313 tttaagtttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttt 8137275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Original strand, 18873944 - 18873994
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttca 52  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  18873944 tttaagtttcaaaagtctcaaagtggtccttttagtttttgaatcgtttca 18873994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 21356704 - 21356654
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttca 52  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21356704 tttaagtttaaaaagtctcaaacaagttctttcagtttttgaatcgtttca 21356654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 38633975 - 38633937
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38633975 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 38633937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Original strand, 43468963 - 43469013
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttca 52  Q
    ||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  43468963 tttaagtttcaaaagtcccaaagtggttcttttagtttttgaatcgtttca 43469013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 4649021 - 4649058
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4649021 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 4649058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 35
Target Start/End: Original strand, 35443181 - 35443214
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttta 35  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35443181 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttta 35443214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 6016366 - 6016331
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagt 37  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6016366 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagt 6016331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Original strand, 5720481 - 5720531
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttca 52  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||    
T  5720481 tttaagtttcaaaagtcccaaagtggtcattttagtttttgaatcatttca 5720531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 8137240 - 8137274
Alignment:
Q  204 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8137240 caactatgctatctacaataagacttgtttgaaac 8137274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 27428464 - 27428406
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcc-----ttttagtttttgaatcgtttcaaa 54  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  27428464 ttttaaatttcaaaagttccaaacaagtcctttaattttagtttttgaatcgtttcaaa 27428406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 43806804 - 43806766
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  43806804 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagttt 43806766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 1293357 - 1293394
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1293357 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagttt 1293394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 35
Target Start/End: Original strand, 15847009 - 15847042
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttta 35  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15847009 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtcctttta 15847042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 39295421 - 39295384
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  39295421 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagttt 39295384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 39513609 - 39513572
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  39513609 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagttt 39513572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 101)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16246434 - 16246196
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16246434 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 16246335  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16246334 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16246235  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16246234 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 16246196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 772216 - 771981
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  772216 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 772117  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  772116 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 772017  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  772016 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaa 771981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 7378863 - 7379101
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7378863 tttaagtttcaaaagtcccaaagaagtccttttagtttttgaatcgtttcacacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 7378962  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7378963 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagaggactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7379062  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7379063 accaactattctatctacattatgacttgtttgaaacga 7379101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Original strand, 2455910 - 2456146
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2455910 tttaagtttcaaaagtcccaagcaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 2456009  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2456010 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2456109  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2456110 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 2456146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 920921 - 921160
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  920921 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcctttaagaggatgatggtgatgatttagatgatggcaata 921020  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  921021 aagagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 921120  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  921121 tatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 921160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1106800 - 1106565
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1106800 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 1106701  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1106700 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1106601  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1106600 accaattatgctatctacaataggacttatttgaaa 1106565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28650669 - 28650429
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatg--atgatttagatgatagcaac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  28650669 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgtgatgatttagatgataacaac 28650570  T
Q  100 aaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  28650569 aaagagcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaa 28650470  T
Q  200 ttaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28650469 ttaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 28650429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 9276474 - 9276712
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  9276474 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcaaatgaaagcaacaa 9276573  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9276574 agagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 9276673  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9276674 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 9276712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 8899584 - 8899812
Alignment:
Q  4 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  8899584 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgattgtgatgatttaaatgatagcaacaaag 8899683  T
Q  104 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 203  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8899684 agcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcatggaagcaattac 8899783  T
Q  204 caactatgctatctacaatatgacttgtt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899784 caactatgctatctacaatatgacttgtt 8899812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 27328487 - 27328722
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||    
T  27328487 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttaaaacaagtccttttagaggatg---atgatgattcagatgataacaacaa 27328583  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328584 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 27328683  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27328684 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 27328722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3430865 - 3430631
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3430865 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 3430766  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3430765 agagcattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 3430666  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3430665 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaa 3430631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 19180322 - 19180559
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19180322 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttattttagtttttgaatcgttttaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 19180421  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19180422 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta-gagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19180520  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19180521 actaactatactatctacaataagacttgtttgaaacga 19180559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33865508 - 33865270
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||    
T  33865508 tttatgtttcaaaagtcccaaccaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgaagattcaaatgatagcaacaa 33865409  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33865408 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 33865309  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33865308 accaactatgttatctacaataagacttgtttgaaacga 33865270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 38750948 - 38751186
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  38750948 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgacggtgatgattcagatgatagcaacaa 38751047  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38751048 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtggatgttaggagccacatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38751147  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38751148 accaactatactatctacattaggacttgtttgaaacga 38751186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2315216 - 2314980
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2315216 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttcgaggatgatgatgatgatttacatgataacaacaa 2315117  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2315116 atagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 2315017  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2315016 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaac 2314980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Original strand, 36210946 - 36211182
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36210946 tttaagtttcaaaagtcacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 36211045  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36211046 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 36211145  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    || ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  36211146 acaaactatgttatctagaataggacttgtttgaaac 36211182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11949670 - 11949429
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga---ggatgatgatgatgatttagatgatagcaa 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11949670 tttaagtttcaaaagtccaaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagatcaggatgatggtgatgattcagatgatagcaa 11949571  T
Q  99 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  11949570 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaaca 11949471  T
Q  199 attaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11949470 attaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 11949429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 40854508 - 40854747
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40854508 ttttaagttttaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatctttttaaagaatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 40854607  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40854608 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaat 40854707  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40854708 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 40854747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33107210 - 33106972
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33107210 tttaagtttcaaaagtcttaaacaaatccttttagtttttgagtcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 33107111  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33107110 agagcattatttaccatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 33107011  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33107010 accaactatgatatctacaataggactcgtttgaaacga 33106972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25088037 - 25087801
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25088037 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtttttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 25087938  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25087937 agaccattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccagagatgagttcaaggaagcaatt 25087838  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25087837 atcaactatgttatatacaataagacttgtttgaaac 25087801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2094652 - 2094413
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2094652 ttttaagtttgaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcctttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaaca 2094553  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2094552 aagagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccaaatttagtatcaaagattagttcaaggaagcaat 2094453  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2094452 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 2094413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7297473 - 7297237
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  7297473 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgataatttagatgataacaacaa 7297374  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  |||||    
T  7297373 ag--cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaagaagacaatt 7297276  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7297275 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 7297237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36444470 - 36444231
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36444470 ttttcagtttcaaaagtcacaaacaagtctttttagtttttgaatcgttacaaacaagtcattttaaaggatgatggtgataatttagatgatagcaaca 36444371  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36444370 aagagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtaggtgttatgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 36444271  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36444270 taccaactatgctatctactataggacttgtttgaaacga 36444231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 2056826 - 2057064
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2056826 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 2056925  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2056926 agtgcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctggatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2057025  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2057026 accaactatgttatctacaataagacttgtttgaaacga 2057064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12759990 - 12759753
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12759990 tttaagtttcaacagtctcaaacaagtcctttaagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 12759891  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12759890 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta-gaggcaaatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaatt 12759792  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12759791 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 12759753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 17134129 - 17134367
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||    
T  17134129 tttaagtttcaaaagttccaaacaggtcctttaagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggttatgattcacatgatagcaacaa 17134228  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17134229 agagcattatccatcatttgccattcctaaaaagatgactacttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 17134328  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17134329 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 17134367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 34253042 - 34253280
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  34253042 tttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcgaacaagtccttttagaggatgatggtgatcattcaaatgatagcaacaa 34253141  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34253142 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaatt 34253241  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34253242 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 34253280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 45124019 - 45124257
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45124019 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 45124118  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45124119 ggagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaagagtctgatttgataccaaagatgagtttaaggaaacaatt 45124218  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  45124219 accaactatgctatctacaataagatttgtttgaaacga 45124257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8396792 - 8396572
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8396792 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaa 8396693  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8396692 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggttttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 8396593  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  8396592 atcaactatgctatctacaat 8396572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41500725 - 41500505
Alignment:
Q  20 caaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatt 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41500725 caaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatt 41500626  T
Q  120 tgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctac 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41500625 tgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatgtac 41500526  T
Q  220 aatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  41500525 aataggacttgtttgaaacga 41500505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43249647 - 43249415
Alignment:
Q  8 tttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagca 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43249647 tttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcaaatgatagcaacaaagagca 43249548  T
Q  108 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  43249547 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgtattcaaggaaacaattaccaac 43249448  T
Q  208 tatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||||||    
T  43249447 tatgctatcatcaataggacttgttcgaaacga 43249415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17484791 - 17484553
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17484791 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaattctgtttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaa 17484692  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17484691 agaacattatccaccattttccatgcttaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 17484592  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17484591 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 17484553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37732434 - 37732196
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37732434 tttaaatttcaaaagtcctaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 37732335  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37732334 agagcattatccaccatttgtcatacataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaaaatgagttcaagaaagcaatt 37732235  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37732234 accaactatgttatttacaataagacttgtttgaaacga 37732196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Original strand, 29737648 - 29737884
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29737648 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 29737747  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29737748 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatcttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29737847  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  29737848 atcaactatgctatcgacaataggacttgtttgaaac 29737884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41178260 - 41178059
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41178260 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 41178161  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41178160 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41178061  T
Q  202 ac 203  Q
    ||    
T  41178060 ac 41178059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 42629856 - 42630100
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatg------atgatgatgatttagatgatag 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      |||||||||||| ||||||||     
T  42629856 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatgatgatgatgatgattcagatgataa 42629955  T
Q  96 caacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaa 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  42629956 caacaaagagcatcatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaagaaa 42630055  T
Q  196 gcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  42630056 gcaattatcaattatgctatctatgataggacttgtttgaaacga 42630100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 37654008 - 37654224
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  37654008 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtacttttagaggatgatagtgatgatttagatgatagcaacaa 37654107  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37654108 agaacattattcatcatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 37654207  T
Q  202 accaactatgctatcta 218  Q
    |||||||||| ||||||    
T  37654208 accaactatgttatcta 37654224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 37838180 - 37838435
Alignment:
Q  3 ttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgat------------------gat 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||                  |||    
T  37838180 ttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttgaatcatttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgatttagatgatggtgatgat 37838279  T
Q  85 ttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatg 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37838280 ttagatgatagcaacaaagaacattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatg 37838379  T
Q  185 agttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37838380 agttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 37838435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19916227 - 19916008
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||| |    
T  19916227 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc-ttttagagggtgatggtgatgattcagacaatagcaacca 19916129  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19916128 agagcattatccacaatttgtcaagcctaaaaagatgattgatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaatt 19916029  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19916028 accaactatgctatctacaat 19916008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23673114 - 23672958
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23673114 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggaggatgataatgatttagatgatagcaacaa 23673015  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 158  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23673014 agagcattttccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 23672958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 151 - 240
Target Start/End: Original strand, 14630663 - 14630752
Alignment:
Q  151 tgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14630663 tgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacga 14630752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 240
Target Start/End: Original strand, 9331757 - 9331894
Alignment:
Q  103 gagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |  ||  |||||||||||    
T  9331757 gagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaatcttaggtgggtgttaggagccaaatttggtacctaagataatatctgggaagcaatta 9331856  T
Q  203 ccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9331857 ccaacaatactatctacaataggacttgtttgaaacga 9331894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23671901 - 23671814
Alignment:
Q  153 ggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23671901 ggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaccatgttatctataataagacttgtttgaaacga 23671814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 9276755 - 9276697
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9276755 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 9276697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 9331937 - 9331879
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9331937 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 9331879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 16246153 - 16246211
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16246153 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 16246211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 17484510 - 17484568
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17484510 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 17484568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 7379144 - 7379084
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7379144 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 7379084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 28216924 - 28216984
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28216924 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtcat 28216984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 2057108 - 2057049
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2057108 ttttaagtttcaaaagtcccagacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 2057049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 37732152 - 37732211
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37732152 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 37732211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 2094370 - 2094428
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2094370 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 2094428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 12759710 - 12759768
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12759710 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 12759768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 27328765 - 27328707
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328765 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 27328707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 7297194 - 7297254
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7297194 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagattttgaatcgtttcaaacaagtcat 7297254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 14630795 - 14630735
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14630795 tttaagttttaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 14630735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 34253324 - 34253265
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34253324 ttttaagtttcaaaggtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 34253265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 38751230 - 38751171
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38751230 ttttaagtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagttttttaatcgtttcaaacaagtc 38751171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 771936 - 771993
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  771936 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatc-tttcaaacaagtc 771993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 2456191 - 2456133
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2456191 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 2456133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 11949386 - 11949444
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11949386 tttaagtttcaaatgtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 11949444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19180602 - 19180544
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19180602 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtccatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 19180544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 28650386 - 28650444
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28650386 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 28650444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 33106929 - 33106987
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33106929 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacgagtc 33106987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 36444188 - 36444246
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36444188 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtc 36444246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 37838478 - 37838420
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37838478 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtc 37838420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 40854790 - 40854732
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40854790 tttaagtttcaaaagtcccaaactagtcctttttgtttttgaatcgtttcaaacaagtc 40854732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 41177995 - 41178053
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41177995 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 41178053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 41500462 - 41500520
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41500462 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttctagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 41500520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 42630143 - 42630085
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42630143 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 42630085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 43249372 - 43249430
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43249372 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcgaacaagtc 43249430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Original strand, 3358110 - 3358158
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgttt 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3358110 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgttt 3358158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 921204 - 921145
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  921204 ttttaagtttcaaaagtcttaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 921145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 2314935 - 2314993
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2314935 tttaagtttcaaaggtcccaaataagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 2314993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 8899862 - 8899803
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8899862 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttc-aacaagtcat 8899803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 17134407 - 17134352
Alignment:
Q  4 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17134407 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttag-ttttaaatcgtttcaaacaagtc 17134352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 45124300 - 45124245
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 57  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45124300 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaattcttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 45124245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 60
Target Start/End: Original strand, 25087760 - 25087814
Alignment:
Q  6 agtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25087760 agtttcaaaagtcccaaacaagtcatttttgtttttgaattgtttcaaacaagtc 25087814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29737929 - 29737871
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29737929 tttaaatttcaaaaggcccaaacaaatccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 29737871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 42
Target Start/End: Original strand, 9331665 - 9331705
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttg 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9331665 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttg 9331705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 73
Target Start/End: Original strand, 19511522 - 19511593
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatg 73  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  19511522 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaattcttttagtttttaaattgtttcaaacaaatccttttaaaggatg 19511593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 1106519 - 1106577
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1106519 tttaaatttcaaaagttgcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaataagtc 1106577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 3430584 - 3430642
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||    
T  3430584 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctactagtttttgaataagttcaaacaagtc 3430642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 36211228 - 36211169
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaag-tcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  36211228 tttaagtttcaaaaggtctcaaacaagtccttttaatttttaaattgtttcaaacaagtc 36211169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 7297503 - 7297465
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7297503 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 7297465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 7378833 - 7378871
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7378833 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 7378871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 12760020 - 12759982
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12760020 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 12759982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 23671772 - 23671829
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23671772 tttaagtttcaaaagtctcaa-caaatcattttagattttgaatcgtttcaaacaagtc 23671829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 16246463 - 16246426
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16246463 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 16246426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 37654274 - 37654237
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37654274 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 37654237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 33865245 - 33865285
Alignment:
Q  20 caaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  33865245 caaacaagtcattctagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 33865285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 37
Target Start/End: Original strand, 19915967 - 19916002
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagt 37  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19915967 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagt 19916002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 1106830 - 1106792
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1106830 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagttt 1106792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28217003 - 28216969
Alignment:
Q  204 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28217003 caactatgttatctacaatatgacttgtttgaaac 28216969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 31187413 - 31187383
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcct 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31187413 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcct 31187383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 31195473 - 31195443
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcct 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31195473 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcct 31195443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Original strand, 37838151 - 37838181
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctt 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37838151 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctt 37838181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 2455881 - 2455918
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2455881 tttaagtttcaaaagtcgcaaacaagtcctttaagttt 2455918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 31
Target Start/End: Original strand, 8899553 - 8899582
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcct 31  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899553 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcct 8899582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 19180293 - 19180330
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19180293 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagttt 19180330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 3358199 - 3358147
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaa 54  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  3358199 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtcattttaatttttaaaacgattcaaa 3358147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 69)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 3408089 - 3408327
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3408089 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 3408188  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3408189 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 3408288  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3408289 accaactatactatctacaatatgacttgtttgaaacga 3408327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 12626536 - 12626774
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12626536 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaa 12626635  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12626636 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaatt 12626735  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12626736 accaactattctatctacaataggacttgtttgaaacga 12626774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 2707359 - 2707597
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2707359 tttaagttccaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 2707458  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2707459 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaatt 2707558  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2707559 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacga 2707597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1915584 - 1915348
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1915584 tttaagtttccaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttataggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 1915485  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1915484 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 1915385  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1915384 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 1915348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 6503618 - 6503856
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6503618 tttaagtttcaaaagtttcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttatatgatagcaacaa 6503717  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6503718 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgggttcaaggaagcaatt 6503817  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6503818 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacga 6503856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 29050172 - 29050410
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29050172 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 29050271  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29050272 agagcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29050371  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29050372 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 29050410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26393250 - 26393012
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26393250 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 26393151  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26393150 agaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 26393051  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  26393050 accaactatgctatctacaatagaagttttttgaaacga 26393012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 30378917 - 30379155
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30378917 tttaagtttcaacagtcccaaacaagtccttttaaattttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaa 30379016  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30379017 agaacattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 30379116  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30379117 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 30379155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17428513 - 17428275
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17428513 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtatttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaagatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 17428414  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17428413 agaacattattcaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 17428314  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17428313 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 17428275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 2390165 - 2390403
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2390165 tttaagtttcaaaagtctcaaacacgtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttagaggatgattgtgatgatttagatgatagcaacaa 2390264  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390265 atagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagctatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2390364  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2390365 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 2390403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26231170 - 26230935
Alignment:
Q  5 aagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaaga 104  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26231170 aagtttcaaaattctcaaacaagtccttttagtttttgaatcctttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattaagatgatagcaacaaaga 26231071  T
Q  105 gcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  26231070 gcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaactacc 26230971  T
Q  205 aactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||    
T  26230970 aactatgttatttacattaggacttgtttgaaacga 26230935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 10256137 - 10256375
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  10256137 tttaagtttcaaaagccccaaacaagtctttttagttttcgaatcgttttaaacaagttcttttagaggatgacggtgatgattgagatgatagcaacaa 10256236  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10256237 agagcattatccaccatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 10256336  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10256337 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 10256375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 9382417 - 9382657
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatga--tgatttagatgatagcaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||    
T  9382417 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagcccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgaattgattcagatgatagaaac 9382516  T
Q  100 aaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9382517 aaagagcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 9382616  T
Q  200 ttaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  9382617 ttaccaactatgttatctacatcaggacttgtttgaaacga 9382657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 11133775 - 11134012
Alignment:
Q  4 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaag 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11133775 taagtttcaaaagtcccaaataagtccttttaattttttaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaag 11133874  T
Q  104 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttc-aaggaagcaatta 202  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11133875 agcattatccatcatttgttatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaggaagcaatta 11133974  T
Q  203 ccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11133975 ccatctatgctatctacgataggacttgtttgaaacga 11134012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3259048 - 3258810
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3259048 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagagaatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 3258949  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3258948 agagcgttatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3258850  T
Q  202 acc-aactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  3258849 accaaactatggtatctacaatagaacttgtttgaaacga 3258810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 17942938 - 17943174
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17942938 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa--ccttttagatgatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 17943035  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17943036 agaacattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaatt 17943135  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17943136 accaattatgctatctacattaggacttgtttgaaacga 17943174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 26936507 - 26936727
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26936507 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatctttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaa 26936606  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26936607 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccggatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 26936706  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  26936707 atcaactatgctatctacaat 26936727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8178491 - 8178252
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  8178491 ttttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttaggttttgaatcgtttcaaacaagtgcttttaaaggatgacggtgatgatttgaatgatagcaaca 8178392  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8178391 aagagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 8178292  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8178291 taccaactatgctatctacaataggacatgtttgaaacga 8178252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 16193209 - 16193448
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  16193209 ttttaagtttcaaaattcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgataacaaca 16193308  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16193309 aagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 16193408  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||  ||||| || ||  |||||||||||||||    
T  16193409 taccaactattttatctgcattagaacttgtttgaaacga 16193448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6785340 - 6785104
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6785340 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaaca 6785241  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||      
T  6785240 aagagcattatacaaaatttgacatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagca-- 6785143  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
     ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  6785142 -accaattatgttatctacattaggacttgtttgaaacga 6785104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 1077154 - 1077375
Alignment:
Q  22 aacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcat---tatccaccat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  1077154 aacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaactagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcatcattatccaccat 1077253  T
Q  119 ttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatcta 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1077254 ttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatcta 1077353  T
Q  219 caatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||| ||||||| ||||||||||    
T  1077354 caacatgacttatttgaaacga 1077375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26196562 - 26196328
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26196562 tttaactttcaaaagtcccaaacaagtccttttaagttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 26196463  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26196462 aaaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagt-gttgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcacggaagcaatt 26196364  T
Q  202 acc-aactatgctatctacaatatgacttgtttgaa 236  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  26196363 accaaactatgttatctacaataggacttggttgaa 26196328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35224129 - 35223919
Alignment:
Q  13 aaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatc 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||     
T  35224129 aaagttccaaacaaatccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagaacaatata 35224030  T
Q  113 caccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgc 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35224029 cacaatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgc 35223930  T
Q  213 tatctacaata 223  Q
    |||||||||||    
T  35223929 tatctacaata 35223919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2598290 - 2598102
Alignment:
Q  54 acaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccac--catttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2598290 acaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaaaagcattatccacaccatttgccatgcctaaaaagatgagtaattttaagt 2598191  T
Q  152 gggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2598190 gggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaataaagcaattaccaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaacga 2598102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10931392 - 10931151
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||    
T  10931392 tttaagtttcaaaagtcacaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagataatagcaataa 10931293  T
Q  102 agagcattatccaccatttgt----catgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagc 197  Q
    ||| ||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  10931292 agaacattatccaccatttctcatgcatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaac 10931193  T
Q  198 aattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  10931192 aatta-caactatgctatccacattaggacttgtttgatacga 10931151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25820790 - 25820552
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25820790 tttaagtttcgaaagtccgaaacaagtcgttttagtttttgaatcgtttgaaacaactccttttagagattgatggtgatgatttagatgatagtaacaa 25820691  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | | |||||||||  ||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25820690 ataacattatccataatttgacatgactaaaattatgactaattttaaatgggtgttatgagttagatttggtaccaaacatgagttcaatgaagcaatt 25820591  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  25820590 accaactatgctatctacgataggaattgtttgaaacga 25820552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Original strand, 17515007 - 17515123
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17515007 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 17515106  T
Q  102 agagcattatccaccat 118  Q
    |||||||||||||||||    
T  17515107 agagcattatccaccat 17515123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 240
Target Start/End: Original strand, 31375971 - 31376055
Alignment:
Q  156 gttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31375971 gttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattaacaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 31376055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 12626817 - 12626759
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12626817 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 12626759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29050453 - 29050395
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29050453 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 29050395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 30379198 - 30379140
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30379198 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 30379140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 16193491 - 16193434
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193491 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 16193434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 2390446 - 2390388
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390446 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 2390388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 2707640 - 2707582
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2707640 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 2707582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 9382700 - 9382642
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9382700 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 9382642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 17943217 - 17943159
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17943217 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 17943159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 31376098 - 31376040
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31376098 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 31376040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Original strand, 3258767 - 3258824
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3258767 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 3258824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 1077418 - 1077358
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1077418 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaataagtcat 1077358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 3408370 - 3408310
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3408370 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 3408310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 11134056 - 11133997
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11134056 ttttaagtttcaaaagtcctaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 11133997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12613029 - 12612974
Alignment:
Q  185 agttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12613029 agttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 12612974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 1915303 - 1915361
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1915303 tttaagtttccaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatagtttcaaacaagtc 1915361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 6503899 - 6503841
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6503899 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtc 6503841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Original strand, 8178209 - 8178263
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 56  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8178209 tttaagttttaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 8178263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 12612808 - 12612866
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12612808 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 12612866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 12612931 - 12612989
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12612931 tttaaatttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 12612989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 17428232 - 17428290
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17428232 tttaaatttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 17428290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 2598059 - 2598119
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2598059 tttaagttttaaaggtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 2598119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 6785061 - 6785119
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6785061 tttatgtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 6785119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 10256418 - 10256360
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10256418 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttcgtttttgaatcgtttcaaacaagtc 10256360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12612927 - 12612854
Alignment:
Q  164 ccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12612927 ccagatttggtagcaaagatgagttcaatgaagcaagtactaactttgctatctacaataggacttgtttgaaa 12612854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Original strand, 25820509 - 25820564
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25820509 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttaattttttaatcgtttcaaacaa 25820564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 10931108 - 10931166
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10931108 tttaagtttcaaaagttccaaacaaatacttttagtttttgaatcgtatcaaacaagtc 10931166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 26230892 - 26230950
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26230892 tttaagttttaaaagtctcaaacaaatcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 26230950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Original strand, 26392971 - 26393021
Alignment:
Q  4 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaa 54  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26392971 taagtttcaaaggtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaa 26393021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 26196280 - 26196339
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26196280 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaaatcattttagtttttgaatcggttcaaccaagtc 26196339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 6503589 - 6503652
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttag 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  6503589 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaag--tttcaaaagtttcaaacaagtctttttag 6503652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 12613091 - 12613028
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttag 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||  || ||||||||||||||||||    
T  12613091 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttcaaaa--gtctcaaacaagtcattttag 12613028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 8178520 - 8178487
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttta 35  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8178520 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttta 8178487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 12626507 - 12626544
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12626507 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 12626544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 35
Target Start/End: Original strand, 16193180 - 16193213
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttta 35  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193180 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttta 16193213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 17942909 - 17942946
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17942909 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 17942946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 33
Target Start/End: Original strand, 1077105 - 1077136
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttt 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1077105 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttt 1077136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 26936768 - 26936733
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagt 37  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26936768 tttaagtttcaaaagtcccagacaagtccttttagt 26936733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 30378887 - 30378925
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  30378887 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagttt 30378925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 1915613 - 1915576
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1915613 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtcctttaagttt 1915576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 29050143 - 29050180
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29050143 tttaagtttcaaaagtcccaaaaaagtcctttaagttt 29050180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 12613062 - 12613026
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtt 38  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12613062 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtt 12613026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 125)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 28264543 - 28264781
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28264543 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 28264642  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28264643 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28264742  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28264743 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 28264781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 42273700 - 42273940
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatg--atgatttagatgatagcaac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  42273700 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgtgatgatttagatgatagcaac 42273799  T
Q  100 aaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42273800 aaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 42273899  T
Q  200 ttaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42273900 ttaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 42273940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 26017323 - 26017561
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26017323 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttaaatgatagcaacaa 26017422  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26017423 atagcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 26017522  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26017523 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 26017561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 48707974 - 48707739
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  48707974 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaggtcattttaaaggatgatggtgatgatttagatgataacaacaa 48707875  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48707874 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 48707775  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48707774 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaa 48707739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33808021 - 33807783
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33808021 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtcatttaagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 33807922  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33807921 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 33807822  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33807821 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 33807783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28812527 - 28812290
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  28812527 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaataa 28812428  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28812427 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgacttcaaggaagcaatt 28812329  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28812328 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 28812290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28160194 - 28159959
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28160194 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 28160095  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28160094 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaatt 28159995  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28159994 accaactatggtatctacaataagacttgtttgaaa 28159959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11795391 - 11795157
Alignment:
Q  6 agtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagag 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||    
T  11795391 agtttcaaaagtcacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattaaaatgaaagcaacaaagag 11795292  T
Q  106 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11795291 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattacca 11795192  T
Q  206 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11795191 actatgctatctagaatatgacttgtttgaaacga 11795157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33174261 - 33174023
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33174261 tttaaatttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 33174162  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33174161 ggagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 33174062  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  33174061 accaactatgaaatctacaataagacttgtttgaaacga 33174023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24458873 - 24458634
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  24458873 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaata 24458774  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24458773 aatagcattatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 24458674  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24458673 taccaactatgttatctacaataagacttgtttgaaacga 24458634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 40988532 - 40988771
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40988532 ttttaaattttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 40988631  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40988632 aagagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaat 40988731  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40988732 tatcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 40988771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4545226 - 4544988
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4545226 tttaagttttaaaagtctcaaacaaatctttttagtttttgaatcgttccaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 4545127  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4545126 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaatt 4545027  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4545026 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 4544988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8882254 - 8882016
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8882254 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaatcaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 8882155  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  8882154 aaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaagaagcaatt 8882055  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8882054 atcaactatgctatctagaataggacttgtttgaaacga 8882016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 15984910 - 15985148
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15984910 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttgtagaagatgatggtgatgatttagatgattgcaacaa 15985009  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15985010 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagattactgattttaagtaggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 15985109  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15985110 accaactatgttatctagaatatgacttgtttgaaacga 15985148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17847336 - 17847099
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17847336 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttataggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 17847237  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17847236 agagcattatccaccatttgccatgcct-aaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 17847138  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17847137 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 17847099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23135247 - 23135009
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23135247 tttaagtttaaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaataagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 23135148  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135147 agaacattagccaccatttggcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 23135048  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23135047 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 23135009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 35929940 - 35930177
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  35929940 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcgttttagaggatgatggtgatgattcagatgataacaacaa 35930039  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35930040 agagcattatccacc-tttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcatggaagcaatt 35930138  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35930139 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacga 35930177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 49118511 - 49118749
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  49118511 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggataatggtgatgatttagatgatagcaaaaa 49118610  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49118611 atagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 49118710  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49118711 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 49118749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9339367 - 9339129
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9339367 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcgacaa 9339268  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaa---gatgagttcaaggaagca 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  9339267 agagcattattcaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgatgagttcaaggaagca 9339168  T
Q  199 attaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9339167 attaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaa 9339129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 240
Target Start/End: Original strand, 2055181 - 2055416
Alignment:
Q  5 aagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaaga 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  2055181 aagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaaaa 2055280  T
Q  105 gcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  2055281 gcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaactttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattatc 2055380  T
Q  205 aactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2055381 aactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacga 2055416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17993258 - 17993020
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17993258 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagagaatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 17993159  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  17993158 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaatt 17993059  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17993058 accaactatgctatttacaataggacttgtttgaaacga 17993020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 31590977 - 31591213
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31590977 tttaagtttcaaaagtcccaa-caaattattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 31591075  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31591076 agagcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31591174  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31591175 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 31591213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39995408 - 39995170
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39995408 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgataatgattcagatgatagcaacaa 39995309  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39995308 agaggattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 39995209  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  39995208 accaactatgttatctacaatagaacttgtttgaaacga 39995170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 10588479 - 10588718
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10588479 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgttttaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 10588578  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10588579 aagagcattatctgccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaat 10588678  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10588679 taccaactatgctatctacaatacgacttgtttgaaacga 10588718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 32118614 - 32118852
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32118614 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttaaaggatgatgataatgattcagatgatagcaacaa 32118713  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32118714 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagggggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 32118813  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32118814 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacga 32118852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 39 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 55517389 - 55517188
Alignment:
Q  39 tttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55517389 tttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatg 55517290  T
Q  139 actaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55517289 actaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 55517190  T
Q  239 ga 240  Q
    ||    
T  55517189 ga 55517188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25734464 - 25734229
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25734464 tttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 25734365  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  25734364 ataacattatccaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtacgaaagatgagttcaattaagcaatt 25734265  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25734264 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaa 25734229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 14564696 - 14564934
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14564696 tttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 14564795  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  14564796 agagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaatt 14564895  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14564896 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacga 14564934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 25730140 - 25730378
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25730140 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagcccttttagaggatgatggtgatgatttagataatagcaacaa 25730239  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25730240 agaacattatccactatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcggatttagtgccaaagatgagttcaaggaatcaatt 25730339  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25730340 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 25730378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 48149399 - 48149637
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  48149399 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatgacgatgattcaaatgaaagcaacaa 48149498  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48149499 agtgcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgtcaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 48149598  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  48149599 accaactatgttatctacattaggacttgtttgaaacga 48149637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 50542595 - 50542357
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50542595 tttaagtttcagcagtcccaaacaagttcttttattttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaaaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaa 50542496  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50542495 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50542396  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  50542395 accaactatgctatctacaataagatttgtttaaaacga 50542357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19169036 - 19168816
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19169036 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagatgatgatgatgatgattcagatgatagcaacaa 19168937  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19168936 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgagtcaaatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19168837  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19168836 accaactatgctatctacaat 19168816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Original strand, 37381746 - 37381981
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  37381746 tttaagtttcaaaagtccaaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcctttcaaaggatgacggtgatgattcagatgatagcaacaa 37381845  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  37381846 aaagcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatatggtaccaaaaatgagtttaaggaagcaatt 37381945  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37381946 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 37381981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30467248 - 30467006
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatt----ttagaggatgatgatgatgatttagatgatagca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30467248 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagcttttgaatcgtttcaaacaagtccttccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagca 30467149  T
Q  98 acaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagc 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  30467148 acaaagaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaaatgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaga 30467049  T
Q  198 aattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30467048 aattaccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacga 30467006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 31208648 - 31208882
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31208648 tttaagtttcaaaagtatcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgttagcaacaa 31208747  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31208748 agagcattatccaccatttatcatgttt----agatgactaattttaagtgggtgttgggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31208843  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31208844 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 31208882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Original strand, 44490232 - 44490457
Alignment:
Q  15 agtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatcca 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44490232 agtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggataatggtgatgatttagatgatagcaacaaatagtattatcca 44490331  T
Q  115 ccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgcta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  44490332 ccatttgtcatgcctaaaaagatgactaactttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgata 44490431  T
Q  215 tctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44490432 tctacaataggacttgtttgaaacga 44490457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Original strand, 12196378 - 12196604
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||         ||||||||||  |||||||    
T  12196378 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatg---------atttagatgaaggcaacaa 12196468  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12196469 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 12196568  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12196569 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaa 12196604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33693575 - 33693336
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaa-acaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33693575 tttaagtttcaaaagtcccaagaaaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaactagtcctttcagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 33693476  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33693475 aagagcattatctatcatttgccatgtctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 33693376  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  33693375 taccaactatgctatctacaacaggacttgtttgaaacga 33693336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 50276376 - 50276141
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  50276376 tttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagtaacaa 50276277  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50276276 atagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaa---gactaattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 50276180  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50276179 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 50276141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 24623048 - 24623268
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  24623048 tttaagtttcaaaagtcctagacaagtcattttaatttttgaaccgtttcgaactagtccttttagaggatgatggtgatgattcaggtgatagcaacaa 24623147  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24623148 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaaaataactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 24623247  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24623248 accaactatgctatctacaat 24623268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 22298419 - 22298656
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  22298419 tttaagtttcaaaagtcccaa-caagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggatgatgatgaagatc-agatgatagcaacaa 22298516  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaa-agatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||| ||||    
T  22298517 agagcattatccaccatttgctatgcctaaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagtttaaggaaacaat 22298616  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22298617 taccaattatgctatctacaatagggcttgtttgaaacga 22298656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 23552962 - 23553202
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  23552962 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttataggatgatggtgatgattca-atgatagcaacaa 23553060  T
Q  102 aga----gcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagc 197  Q
    |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23553061 agatcattcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagc 23553159  T
Q  198 aattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23553160 aattaacaattatgctatctacaacatgacttgtttgaaacga 23553202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 42549862 - 42549643
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  42549862 tttaagtttcaaaggtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaataagtccttttagaggatgatggagatgattcagatgatagcaacaa 42549763  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42549762 agagcattttccacc-tttgtcatgcctaaaaagatgattgattttaagtgggtgttaggagccaaatttagtaccaaagataagttcaatgaagcaatt 42549664  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  42549663 accaactatgttatctacaat 42549643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 51371270 - 51371050
Alignment:
Q  20 caaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatt 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51371270 caaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtttttttagaggatgacggtgatgattcagatgatagcaacaaagagcattattcaccatt 51371171  T
Q  120 tgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctac 219  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51371170 tgccatgtctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaattaccaactatgctatctac 51371071  T
Q  220 aatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  51371070 aatagaacttgtttgaaacga 51371050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19496337 - 19496107
Alignment:
Q  20 caaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggat------------gatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||            |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19496337 caaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatcttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaaagagca 19496238  T
Q  108 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19496237 ttatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggcgccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 19496138  T
Q  208 tatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19496137 tatggtatctacaataggacttgtttgaaac 19496107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 240
Target Start/End: Original strand, 31973533 - 31973729
Alignment:
Q  44 atcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaa 143  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31973533 atcgtttcaaacaagtccttttcgaagatgatggtaatgattcagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaa 31973632  T
Q  144 ttttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31973633 ttttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacga 31973729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48551987 - 48551767
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||                  |||    
T  48551987 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatgatga------------------caa 48551906  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48551905 agaacattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagattttgtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 48551806  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48551805 accaaccatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 48551767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 32317857 - 32318088
Alignment:
Q  14 aagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgat--------agcaacaaagag 105  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||||||        |||||||||||     
T  32317857 aagtctcaaataagtccttttactttttgaatcgtttcaaacaaatctttttagaggatgatggtgattattcagatgataggctgatagcaacaaagaa 32317956  T
Q  106 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32317957 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagacagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 32318056  T
Q  206 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32318057 actatgttatctacaataggacttgtttgaaa 32318088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Original strand, 39699949 - 39700183
Alignment:
Q  6 agtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagag 105  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  39699949 agtttcaaaagtttcaaataaatccttttaatttttgaatcgtttcaaataagtctttttagaggatgatagtgatgattcagatgatattaacaaagag 39700048  T
Q  106 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 205  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39700049 cattattcacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaagagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattacca 39700148  T
Q  206 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39700149 attatgttatctataataagacttgtttgaaacga 39700183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 56555384 - 56555200
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgat---ttagatgatagcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||    
T  56555384 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaagaagtcattttagaggatgatgatgatgatgattcagataatagcaa 56555285  T
Q  99 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  56555284 caaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtcaggagccagatttggtaccaaagat 56555200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30141347 - 30141111
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  30141347 tttaagtttcaaaaatcacaaacaagtcctttaaatttc--aatagtttcaaacaattcgttttagaggatgatggtgatgctgcagatgatagcaacaa 30141250  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  30141249 agagcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 30141150  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30141149 accaactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacga 30141111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 240
Target Start/End: Original strand, 5227338 - 5227528
Alignment:
Q  50 tcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaa 149  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227338 tcaaacaagtctttttggaggaagattgtgatgattcagatgatagcaacgaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaa 5227437  T
Q  150 gtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5227438 gtggatactaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 5227528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 124
Target Start/End: Original strand, 44490110 - 44490232
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  44490110 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggataatggtgatgatttagatgatagcaaaaa 44490209  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtca 124  Q
    | || ||||||||||||||||||    
T  44490210 atagtattatccaccatttgtca 44490232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 240
Target Start/End: Original strand, 20534225 - 20534303
Alignment:
Q  162 agccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20534225 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacga 20534303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 11795114 - 11795174
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11795114 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 11795174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 15985191 - 15985131
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15985191 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 15985131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 8881973 - 8882031
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8881973 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 8882031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 28264824 - 28264766
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28264824 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 28264766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 44490500 - 44490442
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44490500 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 44490442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 48149680 - 48149622
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48149680 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 48149622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 49118792 - 49118734
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49118792 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 49118734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 19496386 - 19496321
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttag 67  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19496386 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttag 19496321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 25730421 - 25730361
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25730421 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 25730361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 50276100 - 50276156
Alignment:
Q  4 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50276100 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 50276156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 5227571 - 5227513
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227571 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 5227513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 28812247 - 28812305
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28812247 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 28812305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 33807740 - 33807798
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33807740 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 33807798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Original strand, 30466963 - 30467020
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30466963 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 30467020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 31973772 - 31973715
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31973772 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 31973715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22298699 - 22298643
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaag 58  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22298699 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaag 22298643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 48551724 - 48551784
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48551724 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 48551784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 55517145 - 55517205
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55517145 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 55517205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 4544945 - 4545003
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4544945 tttaagtttcaaaggtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 4545003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 12196650 - 12196592
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12196650 tttaagcttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 12196592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 17847056 - 17847114
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17847056 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttatagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 17847114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 20534346 - 20534288
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20534346 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtc 20534288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 60
Target Start/End: Original strand, 24458595 - 24458649
Alignment:
Q  6 agtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24458595 agtttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 24458649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26017604 - 26017546
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26017604 tttaagtttcaaaagtcacaaacaagtccttgtagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 26017546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 31208925 - 31208867
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31208925 tttaagtttcaaaagtccaaaacaactccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 31208867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 42273983 - 42273925
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42273983 tttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 42273925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 32118895 - 32118838
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32118895 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagt 32118838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 9339083 - 9339143
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9339083 tttaagtttcaaaagtctcaaacaattccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtcat 9339143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 23553245 - 23553185
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23553245 tttaagttttaaaagtcacaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 23553185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 30141067 - 30141126
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30141067 ttttaagtttcaaaaattctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 30141126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 31617676 - 31617613
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcatttt 65  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31617676 tttaagtttcaaaagtttcaaacaagtccttttagtttttgaatcgttccaaacaagtcttttt 31617613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Original strand, 50542314 - 50542369
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaa 57  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50542314 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgttttaaacaa 50542369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 51371317 - 51371262
Alignment:
Q  4 taagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51371317 taagtttcaaaagttccaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagt 51371262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 10588761 - 10588703
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10588761 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttaatttttggatcgtttcaaacaagtc 10588703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 19496062 - 19496120
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19496062 tttaaatttcaaaggtcccaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 19496120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 23134966 - 23135024
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23134966 tttaagtttcaaaagtttcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 23135024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 31591256 - 31591198
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31591256 tttaagtttcaaaagtctcaaacgagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 31591198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 33173980 - 33174038
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33173980 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagttttcaaatcgtttcaaacaagtc 33174038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 33452369 - 33452427
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33452369 tttaagtttcaaaaattccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 33452427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 35930220 - 35930163
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35930220 tttaagtttcaaaggttccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 35930163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 37382028 - 37381967
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  37382028 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttttgtttttaaatcatttcaaacaagtcat 37381967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Original strand, 39995127 - 39995184
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39995127 tttaagttttaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 39995184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 2055459 - 2055399
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2055459 tttaagttttaaaagttccaaacaagtcgtttttgtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 2055399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8433868 - 8433822
Alignment:
Q  22 aacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaga 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8433868 aacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaga 8433822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 28159913 - 28159971
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28159913 tttaagtttcaaaaatctcaaacaagttcttttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 28159971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 32318133 - 32318076
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32318133 tttaagtttcaaaagtaccaa-caagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 32318076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 33693293 - 33693351
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33693293 tttaaatttcaaaagttccaaataagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtc 33693351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 48707693 - 48707751
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48707693 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagattttgaatcttttcaaacaagtc 48707751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 1425321 - 1425269
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaa 54  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1425321 tttaagtttcaaaaatcccaaataagttcttttagtttttgaatcgtttcaaa 1425269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 56555124 - 56555183
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56555124 ttttaagtttcaaagattccaaacaaatctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 56555183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14564977 - 14564919
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14564977 tttaaatttcaaaactctcaaacaaatccatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 14564919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 9800420 - 9800377
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaat 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9800420 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatctttttagtttttgaat 9800377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 59
Target Start/End: Original strand, 51371013 - 51371064
Alignment:
Q  8 tttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51371013 tttcaaaagtctcaaataaatccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagt 51371064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Original strand, 33496133 - 33496183
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttca 52  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  33496133 tttaagtttcaaaagtcccaaagtgatccttttagtttttgaatcgtttca 33496183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 17847365 - 17847328
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17847365 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 17847328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 60
Target Start/End: Original strand, 17993002 - 17993035
Alignment:
Q  27 gtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993002 gtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 17993035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 22298390 - 22298427
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22298390 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 22298427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 31208619 - 31208656
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31208619 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 31208656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 32118585 - 32118622
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32118585 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 32118622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 40988810 - 40988756
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||    
T  40988810 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatt----aatcgtttcaaacaagtc 40988756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 48149370 - 48149407
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48149370 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 48149407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 25734183 - 25734241
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25734183 tttaagttttaaaagtctcaaacaactctagttagtttttgaatcatttcaaacaagtc 25734241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 8882283 - 8882246
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8882283 tttaagcttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 8882246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 11795424 - 11795387
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11795424 tttaagtatcaaaagtctcaaacaagtccttttagttt 11795387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 12196349 - 12196386
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12196349 tttaagtttcaaaagtcacaaacaagtcctttaagttt 12196386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 17847394 - 17847357
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17847394 tttaggtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 17847357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 19496415 - 19496378
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19496415 tttaagtttcaaaagtcccaaacaggtcctttaagttt 19496378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 28812556 - 28812519
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28812556 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtactttaagttt 28812519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 33808050 - 33808013
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33808050 tttaattttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 33808013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 42273671 - 42273708
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  42273671 tttaagttttaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 42273708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 44490081 - 44490118
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44490081 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagttt 44490118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 128)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 1016944 - 1017182
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1016944 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 1017043  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017044 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1017143  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1017144 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 1017182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 38446376 - 38446614
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  38446376 tttaagtttcaaaagtctcatacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 38446475  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38446476 agagcattatctactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38446575  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38446576 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 38446614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20813683 - 20813444
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20813683 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaaattcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 20813584  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813583 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 20813484  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20813483 taccaattatgctatctacattatgacttgtttgaaacga 20813444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 1687551 - 1687789
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1687551 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatatagatgatagcaacaa 1687650  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1687651 agatcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1687750  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1687751 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 1687789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Original strand, 22851896 - 22852131
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22851896 tttaagttttaaaagtcctaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 22851995  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22851996 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaacagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 22852095  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22852096 accaactatgctatctacaataggacttatttgaaa 22852131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 21564396 - 21564634
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21564396 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaataa 21564495  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21564496 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 21564595  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21564596 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 21564634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47329416 - 47329178
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47329416 tttaaatttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatgatgatgattaagatgatagcaacaa 47329317  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47329316 agagcattatccaccatttgccatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47329217  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  47329216 accaactatgctatctacgatatgacttgttggaaacga 47329178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 41250785 - 41251022
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41250785 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttcaaggatgatgatgatgatttacatgataacaaca 41250884  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41250885 aagagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaat 41250984  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41250985 taccaactatgctatctacaataagacttgtttgaaac 41251022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20760312 - 20760074
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20760312 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttaaaacaaatccttttagaggataatggtgatgatttagatgatagcaacaa 20760213  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20760212 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 20760113  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20760112 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 20760074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36315213 - 36314977
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  36315213 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaataa 36315114  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36315113 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaatt 36315014  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36315013 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 36314977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 21656418 - 21656656
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21656418 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtctcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 21656517  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21656518 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaaggtgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 21656617  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21656618 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacga 21656656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 31122562 - 31122800
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||    
T  31122562 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaaatcattttagaggatgatagtgatgattcaaatgatagcaacaa 31122661  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31122662 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtcttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31122761  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31122762 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacga 31122800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 42016773 - 42017011
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  42016773 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgataacaacaa 42016872  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42016873 aaagtattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 42016972  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42016973 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacga 42017011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 50287466 - 50287704
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  50287466 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaataa 50287565  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| || |||||||||    
T  50287566 agatcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaatatgagtttaatgaagcaatt 50287665  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50287666 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 50287704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Original strand, 19664441 - 19664677
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19664441 tttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 19664540  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19664541 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttatgagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 19664640  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19664641 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 19664677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35346706 - 35346474
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||      |||| ||||||    
T  35346706 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaaaggatgatggtgatgat------gataacaacaa 35346613  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346612 agaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35346513  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346512 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 35346474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20086551 - 20086317
Alignment:
Q  6 agtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||    
T  20086551 agtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatggtggtgatgattcaaatgatagcaacaaagag 20086452  T
Q  106 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 205  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20086451 cattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 20086352  T
Q  206 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20086351 agtatgctatctataataggacttgtttgaaacga 20086317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Original strand, 12748291 - 12748524
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  12748291 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgacggtgatgatttagatgatagtaacaa 12748390  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12748391 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12748490  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttga 235  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12748491 accaactatgctatctacaataggacttgtttga 12748524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27070981 - 27070742
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27070981 ttttaagtttcaaaaatcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgacttagatgatagcaaca 27070882  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27070881 aagagcattatccaccatttataatgtctgaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 27070782  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27070781 taccaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacga 27070742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 26455482 - 26455720
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  26455482 tttaaatttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaactagtcattttagaggataatggtgatgattcagatggtagcaacaa 26455581  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455582 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 26455681  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26455682 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacga 26455720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 51562061 - 51562300
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  51562061 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaggtctttttagaggatgatgatgataattcagatgatagcaaaa 51562160  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51562161 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaat 51562260  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||    
T  51562261 taccaactatgttatctacattagaacttgtttgaaacga 51562300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 21890070 - 21890308
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  21890070 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgattcaaatgatagcaacaa 21890169  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890170 agaatattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 21890269  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21890270 accaaatatgttatctataataggacttgtttgaaacga 21890308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35608371 - 35608134
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35608371 tttaagtttcaaaattcccaaacaagtc-ttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttaaaggattatgatgatgatttagatgatagcaacaa 35608273  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35608272 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttaggagtccgatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaatt 35608173  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35608172 accaattatgctatctacaataggacttatttgaaacga 35608134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 53195914 - 53196152
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  53195914 tttaagtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 53196013  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  53196014 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaataatt 53196113  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  53196114 accaactatgttatctacaataagacttctttgaaacga 53196152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 55164356 - 55164120
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  55164356 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacgagtcattttaaaggatgatggtgatgatttagataatagcaacaa 55164257  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  55164256 agagcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 55164157  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55164156 agcaactatgctatctacaatatgacttatttgaaac 55164120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Original strand, 3697046 - 3697281
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3697046 tttaagtttcaaaagttccaaacaagttcttttagtttttgaattgtttcaaacaaatcattttagaggaagatgatgatgattcagatgatagcaacaa 3697145  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3697146 atagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgaattcaatgaagcaatt 3697245  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3697246 accaactatactatctacaataggacttgtttgaaa 3697281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32651061 - 32650826
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32651061 tttaagtttcaaaagttccaaacaaattcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtttttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 32650962  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32650961 agaacattatccaccatttgccatgcctagaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 32650862  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  32650861 accaactatgctatctataatagaacttgtttgaaa 32650826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10618721 - 10618483
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10618721 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttttcgaatcgtttcaaacaagtctttttagagaataatggtgatgattcagatgatagcaacaa 10618622  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10618621 agaacattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 10618522  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10618521 accaattatgtcatctacaataggacttgtttgaaacga 10618483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42107340 - 42107102
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||| |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42107340 tttaagattcaaaagtctcagacaagccgttttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 42107241  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  42107240 agagcattatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtgtcaaagatgagttcaaggaagtaatt 42107141  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42107140 accaactatactatctacaataggacttgtttgaaacga 42107102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1448973 - 1448738
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1448973 tttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 1448874  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1448873 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaatt 1448774  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||   |||||| ||||| ||||||||||    
T  1448773 accaactatggta---acaataggacttctttgaaacga 1448738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 240
Target Start/End: Original strand, 48651151 - 48651386
Alignment:
Q  5 aagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  48651151 aagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttaggttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgataacaacaaaga 48651250  T
Q  105 gcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  48651251 gcattatccaccatttgccatgcctaaaaagacgattaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaattacc 48651350  T
Q  205 aactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  48651351 aactatgctatctacattaggacttgtttgaaacga 48651386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 19268420 - 19268630
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |  ||||||| |||||    
T  19268420 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagtggatgatggtgatgactcggatgataacaaca 19268519  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19268520 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaat 19268619  T
Q  201 taccaactatg 211  Q
    |||||||||||    
T  19268620 taccaactatg 19268630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 37247856 - 37248094
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  37247856 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcaaatgatagcaacaa 37247955  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37247956 agagcattattcatcatttgtcatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 37248055  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37248056 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 37248094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 50977764 - 50977984
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  50977764 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttacaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 50977863  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50977864 aaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaact 50977963  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  50977964 accaactatgctatctacaat 50977984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 51080896 - 51081116
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  51080896 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcatttcaaacaagtccttttacaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 51080995  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51080996 aaagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaact 51081095  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  51081096 accaactatgctatctacaat 51081116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 51475489 - 51475267
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgat--ttagatgatagcaac 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  51475489 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgatgatcagatgatagcaac 51475390  T
Q  100 aaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  51475389 aaagaccattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaa 51475290  T
Q  200 ttaccaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  51475289 ttaccaactatgctatctacaat 51475267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20913995 - 20913757
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20913995 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgttttaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattaagatgatagcaacaa 20913896  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20913895 atagcattattcaccattcgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 20913796  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20913795 atcaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacga 20913757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20922113 - 20921875
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20922113 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgttttaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattaagatgatagcaacaa 20922014  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20922013 atagcattattcaccattcgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 20921914  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20921913 atcaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacga 20921875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40922406 - 40922168
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  40922406 tttaagtttcaaaagtccaaaacaagtcattttagtttttgactcgtttcaaacaagtcattttaaaggatgatggtgatgattcacatgacagcaacaa 40922307  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40922306 agaacattatccaccattttccatgcctaaaaaaattactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaatt 40922207  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40922206 accaactatgctatctacaatacgacttgtttgaaacga 40922168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 50365128 - 50364908
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  50365128 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagattatagcaacaa 50365029  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50365028 agagcattacccaccatttgccatgcctaaaaagattactgattttaagtgagtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 50364929  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  50364928 accaactatgttatctacaat 50364908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45380501 - 45380263
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  45380501 tttaagtttcaaaagtctcaaataagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 45380402  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  45380401 agagcattatccaccatttaccatgcataaaaagatgactaattttaagt-ggtgttatgagccagatttggtaccaaagatgagtttaaagaagcaatt 45380303  T
Q  202 a-ccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    | | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  45380302 atcaaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacga 45380263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 39069627 - 39069864
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  39069627 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagatga-gatagtgatgattcagatgatagcaacaa 39069725  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  39069726 agagcattatccaccatttgccatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttggtaccaaagataagttaaaggaaacaatt 39069825  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39069826 atcaactatgctattaacaatatgacttgtttgaaacga 39069864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 53926221 - 53925985
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  53926221 ttttaagtttcaaaagtctaaaacaaatctttttagtttttgaaccgtttcaaacaaatctttctagaggatgattgtgatgattcagatgatagcaaca 53926122  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53926121 aagagcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaat 53926022  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaa 237  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  53926021 taccaactatactatctacaatatgacttatttgaaa 53925985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 44798167 - 44798405
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttt-agtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | |||||||| | ||||||||||||    
T  44798167 tttaagtttcaaaagtcctaaacatgtcctttttagtttttgaatcgtttcaaacacgtccttttagaggataacggtgatgattcatatgatagcaaca 44798266  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  44798267 aagagcattatccaccatttgacatgcctaaaaa-atgagtaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaagaaagcaat 44798365  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44798366 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 44798405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33473480 - 33473242
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33473480 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaattgtttcaaacaagtccttttaaaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 33473381  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  33473380 agagcattatccaccatttatcatgactaaaaagatgactaattttaagtgcgtgttagaaaccagatttggtaccaaagataaaatcaaggaaacaatt 33473281  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  33473280 accaactatgttatctacaataaaacttgtttgaaacga 33473242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 28699585 - 28699798
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28699585 tttaagtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagccctttaagaggatgatggtgatgattaagatgatagcaacaa 28699684  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28699685 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtgccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28699784  T
Q  202 accaactatgctat 215  Q
    | | |||| |||||    
T  28699785 atctactaagctat 28699798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 44152600 - 44152777
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44152600 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaa 44152699  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  44152700 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaa 44152777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 52821302 - 52821052
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggat------------gatgatgatgatttaga 89  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||            |||| |||||||| |||    
T  52821302 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatcttttagaggatgatggtgatgattcaga 52821203  T
Q  90 tgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  52821202 tgatagcaacaaagagcattatccatcatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagttttactaccaaagatgagttc 52821103  T
Q  190 aaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  52821102 aaagaagcaattaccaactatgttatctacaacaggacttgtttaaaacga 52821052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 68 - 240
Target Start/End: Original strand, 33151662 - 33151834
Alignment:
Q  68 aggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccag 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33151662 aggatgatggtgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccag 33151761  T
Q  168 atttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33151762 atttggtaccaaagattagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacga 33151834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 50 - 240
Target Start/End: Original strand, 29677424 - 29677614
Alignment:
Q  50 tcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaa 149  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29677424 tcaaacaagtccttttagagaatgatggtgatgatttagattatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaa 29677523  T
Q  150 gtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  29677524 atgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacaaactatgatatctacgataggacctgtttgaaacga 29677614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 166
Target Start/End: Original strand, 47473130 - 47473294
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||||||||    
T  47473130 tttaagtttcaaaagtccaaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggataacggggatgattcagatgatagcaacaa 47473229  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  47473230 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtggatgttaggagcca 47473294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 51 - 222
Target Start/End: Original strand, 34019409 - 34019580
Alignment:
Q  51 caaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||    
T  34019409 caaacaagtcattttagaggatgatgatgatgattcagatgatagcaacaaaaagcattatccaccatttgacatgcctaaaaatatggctgattttaag 34019508  T
Q  151 tgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 222  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34019509 tgggtgttaggagtcagatttggtaccaacagtgagttcaagtaagcaattatcaactatgctatctacaat 34019580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38924152 - 38924003
Alignment:
Q  89 atgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagtt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||    
T  38924152 atgatagcaacaaagagcgttattcattatttgtcatgcttaaagagatgattaattttaagtggatgttaggagtccaatttggtaccaaagataagtt 38924053  T
Q  189 caaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38924052 caacgaagcaattaccaactattttatctacgataggacttgtttgaaac 38924003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 42641393 - 42641295
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  42641393 tttaagtttcaaaagtcccaaataaatctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagatgatgatggtgataattcagatgatagcaaca 42641295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 35346431 - 35346491
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346431 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 35346491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21656699 - 21656641
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21656699 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 21656641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 33151877 - 33151819
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33151877 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 33151819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 42641288 - 42641199
Alignment:
Q  133 aagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 222  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  42641288 aagatgattgattttaagtgggtgttaggaggcagacttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaacttggctatatacaat 42641199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 20813401 - 20813461
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813401 tttaagtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 20813461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 40922124 - 40922183
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40922124 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 40922183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21564677 - 21564619
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21564677 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 21564619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21890351 - 21890293
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890351 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 21890293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 27070699 - 27070757
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27070699 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 27070757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 42107059 - 42107117
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42107059 tttaagtttcaaaagtcacaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 42107117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Original strand, 45380220 - 45380277
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45380220 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 45380277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 20760031 - 20760091
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20760031 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 20760091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 26455763 - 26455703
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455763 tttaagtttcaaaagtctcaaccaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 26455703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 10618439 - 10618498
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618439 ttttatgtttcaaaagtcctaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 10618498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 38923957 - 38924016
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38923957 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcattttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 38924016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 1017225 - 1017167
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017225 tttaagtttcaaaagtcccatacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 1017167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 20086274 - 20086332
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20086274 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 20086332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 31122843 - 31122785
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31122843 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 31122785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 33473198 - 33473256
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33473198 ttttaagtttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 33473256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 37248137 - 37248079
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37248137 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtacttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 37248079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 39069907 - 39069847
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39069907 tttaaatttcaaaagtctcaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 39069847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 44152854 - 44152794
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44152854 tttaaatttcaaaaatctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 44152794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 47329135 - 47329195
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  47329135 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttccaacaagtcat 47329195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 48651430 - 48651371
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48651430 ttttaaatttcaaaagtctcaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 48651371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 1448695 - 1448753
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1448695 tttaagtttcaaaagtaccaaacaagttcttttagtttttgaatcgtttcaaagaagtc 1448753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 1687832 - 1687774
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1687832 tttaagtttcaaaagtttcaaacaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagtc 1687774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19268708 - 19268650
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19268708 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttattttagtttttgaatcgttttaaacaagtc 19268650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 29677657 - 29677603
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  29677657 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccgtttagtttttcaatcgtttcaaaca 29677603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 41251067 - 41251009
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41251067 tttaagtttcaaaggtcccaaataagtccttttagtttttgaattgtttcaaacaagtc 41251009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 44798448 - 44798390
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44798448 tttaagtttcaaaattctcatacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 44798390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 50287747 - 50287689
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50287747 tttaagtttcaaaagtctcatacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 50287689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 52821009 - 52821067
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52821009 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtctttttagtttttgaatcgttttaaacaagtc 52821067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Original strand, 20913714 - 20913771
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913714 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 20913771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Original strand, 20921832 - 20921889
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20921832 tttaagtttcaaaagtctcaaacaaatctttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 20921889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 28775435 - 28775487
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaa 53  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28775435 ttttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaa 28775487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 38446657 - 38446597
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38446657 tttaagttttaaaagttccaaagaagtgcttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 38446597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 42017054 - 42016994
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42017054 tttaaatttcaaaagtttcaaacaggtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 42016994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 53925939 - 53925999
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  53925939 tttaagtttcaaaagttccaaacaagtcattttagtttttgaatcatttcaaataagtcat 53925999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 3697327 - 3697269
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3697327 tttaagttttaaaagtctcaaataagtccttttagtttttgaatcctttcaaacaagtc 3697269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 51562339 - 51562286
Alignment:
Q  6 agtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51562339 agtttcaaaagtctcaagcaagtccttttaatttttgaatcgtttcaaacaagt 51562286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 55164075 - 55164135
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  55164075 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttaatttttgaattgtttcaaataagtcat 55164135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 35608091 - 35608149
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35608091 tttaagtttcaaaaatgtcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaataagtc 35608149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 53196194 - 53196137
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  53196194 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttag-ttttgaatcgtttcaaagaagtc 53196137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Original strand, 32650780 - 32650837
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagt 59  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32650780 tttaagtttcaaaagtttcaaacaattctttttagtttttgaatcatttcaaacaagt 32650837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 55164386 - 55164322
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttag 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  55164386 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaag--tttcaaaagtctcaaacaagtcattttag 55164322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 344
Target Start/End: Original strand, 5371786 - 5371840
Alignment:
Q  290 gaatcagttgttaagagatggcgttgtatggaataaggaaatgcaggcagcattt 344  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  5371786 gaatcagttgttaaaagatggctttggatggaataaggaaatgcagccaccattt 5371840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 40
Target Start/End: Original strand, 22851867 - 22851905
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttt 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22851867 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagtttt 22851905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 19664412 - 19664449
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19664412 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 19664449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 20760341 - 20760304
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20760341 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 20760304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 55
Target Start/End: Original strand, 50010083 - 50010136
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaac 55  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  50010083 tttaaattttaaaagtcccaaacaaatccttttcgtttttgaattgtttcaaac 50010136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 50287437 - 50287474
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50287437 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 50287474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 19229224 - 19229181
Alignment:
Q  9 ttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttca 52  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  19229224 ttcaaaagtcccaaagtggtccttttagtttttgaatcgtttca 19229181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 28699846 - 28699811
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28699846 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtctttttagt 28699811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 36314931 - 36314990
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttag-tttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  36314931 tttaagtttcaaaatttccaaacaaatccttttcgttttttgaattgtttcaaacaagtc 36314990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 240
Target Start/End: Original strand, 44152772 - 44152811
Alignment:
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44152772 taccaactatgttatctataatatgacttgtttgaaacga 44152811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 37
Target Start/End: Original strand, 51475226 - 51475261
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagt 37  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51475226 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagt 51475261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Original strand, 19228940 - 19228990
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttca 52  Q
    ||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||    
T  19228940 tttaagtttcaaaagtcccaaagtgatcattttagtttttgaatcgtttca 19228990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19664721 - 19664664
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19664721 tttaagtttcaaaaatttcaaataagtctttttagtttttgaat-gtttcaaacaagtc 19664664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 21656388 - 21656426
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21656388 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagttt 21656426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 22852177 - 22852135
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaa 44  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22852177 tttaagtttcaacagttctaaacaagtccttttagtttttgaa 22852135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 34019620 - 34019586
Alignment:
Q  3 ttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagt 37  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34019620 ttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagt 34019586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 40922436 - 40922398
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  40922436 ttttaagtttcaaaagtaccaaacaagtcctttaagttt 40922398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 45380531 - 45380493
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  45380531 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtactttaagttt 45380493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Original strand, 48651119 - 48651149
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctt 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48651119 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctt 48651149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Original strand, 49799071 - 49799121
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttca 52  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||    
T  49799071 tttaagtttcaaaagtcccagtgtggtccttttagtttttgaatcgtttca 49799121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 3697017 - 3697054
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3697017 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagttctttaagttt 3697054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 20914024 - 20913987
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20914024 tttaagtttcaaaactcccaaacaagtcctttaagttt 20913987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 20922142 - 20922105
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20922142 tttaagtttcaaaactcccaaacaagtcctttaagttt 20922105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 27071009 - 27070972
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27071009 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcttttaagttt 27070972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 32651090 - 32651053
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  32651090 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagttt 32651053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 33151906 - 33151869
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33151906 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttaagttt 33151869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 36315242 - 36315205
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  36315242 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagttt 36315205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 52821331 - 52821294
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  52821331 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagttt 52821294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 34
Target Start/End: Original strand, 50364867 - 50364899
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttt 34  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50364867 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcctttt 50364899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 218785 - 219024
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  218785 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatagtaatgattcagatgatagcaacaa 218884  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-gggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  218885 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 218984  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  218985 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 219024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 219068 - 219009
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  219068 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttaattttcgaatcgtttcaaacaagtc 219009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 14 - 252
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  14 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcatttaagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttgtagaggatgatggtgatgattcatatgatagcaacaa 113  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  114 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 213  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  214 accgactatgctatctacattaggacttgtttgaaacga 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 270 - 237
Alignment:
Q  27 gtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  270 gtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2214 - 1994
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2214 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 2115  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2114 agagcattatccaccatttgtcatgcctaataagatgactgattttaagtaggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2015  T
Q  202 accaactatgctatctacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2014 accaactatgctatctacaat 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 1952 - 1988
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagt 37  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1952 ttttaagtttcaaaagttccaaacaagttcttttagt 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 12994 - 13233
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12994 ttttaagtttcacaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 13093  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  13094 aagaacattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaat 13193  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13194 tatcaattatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 13277 - 13216
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13277 ttttaagttttgaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 13216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 59850 - 59611
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaaca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  59850 ttttaagtttcacaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtctttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca 59751  T
Q  101 aagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 200  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  59750 aagaacattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaat 59651  T
Q  201 taccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59650 tatcaattatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 59611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 59567 - 59628
Alignment:
Q  1 ttttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59567 ttttaagttttgaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 59628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 252679 - 252441
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  252679 tttaagttttaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttaaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 252580  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  252579 agagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaatt 252480  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  252479 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacga 252441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 252398 - 252456
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  252398 tttaaatttcaaaactctcaaacaaatccatttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 252456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5268 - 5030
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||    
T  5268 tttaagtttcaaaaatctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgataattcagatgttagcaacaa 5169  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  5168 ataacattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagagggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaatt 5069  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5068 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 5030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 4987 - 5047
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4987 tttaagtttcaaaagtccaaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 5047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 47862 - 48100
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  47862 tttaagtttcaaaagtcccaaacaaatccttttagtttttgagtcatttcaaacaagttcttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 47961  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47962 aaaatattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaaggtgagttcaaggaagcaatt 48061  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||  || ||||||  ||||||||| ||||||    
T  48062 accaactatgtgatatacaatcggacttgtttaaaacga 48100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 48143 - 48085
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48143 tttaagtttcaaaagtccaaaacaagtccttttagtttttgaatcgttttaaacaagtc 48085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 5083 - 5323
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  5083 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaacaaatccttttataggatgatggtgatgattca-atgatagcaacaa 5181  T
Q  102 aga----gcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagc 197  Q
    |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5182 agatcattcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagc 5280  T
Q  198 aattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5281 aattaacaattatgctatctacaacatgacttgtttgaaacga 5323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 5366 - 5306
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 62  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5366 tttaagttttaaaagtcacaaacaaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcat 5306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 11265 - 11496
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  11265 tttaagtttcaaaagtctcaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtccttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaaca- 11363  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 201  Q
          |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  11364 ------ttatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccatagataagtttaaggaagcaatt 11457  T
Q  202 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||    
T  11458 accaactatgctacctacaataggtcttatttaaaacga 11496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 442 - 289
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  442 tttaagtttcaaaagtcacaaacaagtctttttagtttttgaatcgtttcaaacaaattcttttagaggatgatggtgatgattcagatgatagcaacaa 343  T
Q  102 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  342 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtgggt 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Original strand, 14549 - 14655
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtcattttagaggatgatgatgatgatttagatgatagcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  14549 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtgcttttaaaggatgatagtgatgatttggatgatagcaacaa 14648  T
Q  102 agagcat 108  Q
    |||||||    
T  14649 agagcat 14655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 152
Target Start/End: Original strand, 19758 - 19831
Alignment:
Q  79 gatgatttagatgatagcaacaaagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtg 152  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19758 gatgattcatatgatagcaacaaagagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtg 19831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 240
Target Start/End: Original strand, 599 - 677
Alignment:
Q  162 agccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  599 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacga 677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 720 - 662
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  720 tttaagtttcaaaagtctgaaataaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1994 - 1916
Alignment:
Q  162 agccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  1994 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacga 1916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 1873 - 1931
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1873 tttaagtttcaaaagtctgaaataaatccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 1931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3452 - 3374
Alignment:
Q  162 agccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||    
T  3452 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatcaacattaggacttatttgaaacga 3374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 3332 - 3389
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3332 tttaagtttcaaaaatcc-aaacaagtcattttagtttttgaatcgtttcaaataagtc 3389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 240
Target Start/End: Original strand, 1877 - 1955
Alignment:
Q  162 agccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacga 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  1877 agccagatttggtaccaaagatgaggtcaaggaagcaattatcaactatgctatcaacattaggacttgtttgaaacga 1955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 1998 - 1940
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 60  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1998 tttatgtttcaaaagtctcaaacaagtcgttttagtttttgaatcgtttcaaacaagtc 1940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 5781 - 5728
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaac 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5781 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgatttgtttcaaac 5728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0416 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0416
Description:

Target: scaffold0416; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 54
Target Start/End: Original strand, 6644 - 6695
Alignment:
Q  3 ttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagtttttgaatcgtttcaaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  6644 ttaagtttcaaaagtcccaaataagttcttttagtttctgaaacgtttcaaa 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 101271 - 101234
Alignment:
Q  2 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtccttttagttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  101271 tttaagtttcaaaagtcccaaacaagtcctttaagttt 101234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University