View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3828_high_3 (Length: 465)

Name: NF3828_high_3
Description: NF3828
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3828_high_3
NF3828_high_3
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (17-460)||(26401184-26401626)
chr8 (25-458)||(26298201-26298633)
chr8 (25-458)||(26311458-26311890)
chr8 (25-458)||(33035769-33036201)
chr8 (25-458)||(10687100-10687532)
chr8 (25-458)||(35742208-35742640)
chr8 (25-458)||(18868506-18868938)
chr8 (87-460)||(4814166-4814538)
chr8 (87-460)||(28330764-28331136)
chr8 (87-460)||(16754200-16754572)
chr8 (87-394)||(28893698-28894005)
chr8 (87-394)||(25682841-25683148)
chr8 (73-181)||(40827427-40827535)
chr8 (87-394)||(15947596-15947903)
chr8 (177-382)||(21040376-21040581)
chr8 (164-330)||(40827259-40827425)
[»] chr3 (15 HSPs)
chr3 (25-458)||(1307690-1308122)
chr3 (17-458)||(16256880-16257320)
chr3 (25-458)||(22171144-22171576)
chr3 (25-458)||(32477159-32477591)
chr3 (25-458)||(8513913-8514345)
chr3 (25-458)||(2675056-2675488)
chr3 (80-458)||(3326362-3326739)
chr3 (87-460)||(54191377-54191749)
chr3 (87-460)||(10095746-10096118)
chr3 (87-460)||(10202632-10203004)
chr3 (87-460)||(10899878-10900250)
chr3 (84-394)||(47879826-47880136)
chr3 (87-394)||(10609713-10610020)
chr3 (87-392)||(16460400-16460705)
chr3 (87-247)||(22623065-22623225)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (25-458)||(18410476-18410908)
chr7 (25-458)||(24264159-24264591)
chr7 (25-458)||(16881746-16882178)
chr7 (25-458)||(21641509-21641941)
chr7 (17-458)||(21985730-21986170)
chr7 (17-460)||(9187979-9188421)
chr7 (23-458)||(24272736-24273174)
chr7 (71-385)||(12404835-12405149)
chr7 (87-460)||(3321728-3322100)
chr7 (87-460)||(7072920-7073292)
chr7 (87-460)||(25408283-25408655)
chr7 (87-394)||(25403591-25403898)
chr7 (114-334)||(5071564-5071774)
chr7 (25-68)||(12398574-12398617)
chr7 (411-448)||(45702773-45702810)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (25-458)||(18857395-18857827)
chr4 (17-458)||(16626828-16627268)
chr4 (17-458)||(3790969-3791409)
chr4 (17-458)||(5144721-5145159)
chr4 (142-458)||(9227237-9227552)
chr4 (87-394)||(15315251-15315558)
chr4 (87-460)||(4568212-4568584)
chr4 (87-394)||(16637095-16637402)
chr4 (29-83)||(9227542-9227596)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (36-458)||(24558420-24558841)
chr5 (36-458)||(24599452-24599873)
chr5 (25-458)||(27446642-27447074)
chr5 (25-458)||(33769858-33770290)
chr5 (25-458)||(37559429-37559861)
chr5 (25-458)||(28805558-28805990)
chr5 (25-458)||(31399828-31400260)
chr5 (25-458)||(43593940-43594372)
chr5 (25-458)||(43626734-43627166)
chr5 (17-323)||(28833870-28834176)
chr5 (76-458)||(31301202-31301584)
chr5 (319-458)||(28835415-28835553)
chr5 (89-394)||(25450691-25450996)
chr5 (237-458)||(31333674-31333896)
chr5 (118-266)||(30102726-30102874)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (25-458)||(17145-17577)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (25-458)||(14740408-14740839)
chr6 (25-457)||(33333913-33334344)
chr6 (146-457)||(24434151-24434460)
chr6 (87-460)||(13881608-13881980)
chr6 (87-460)||(35203003-35203375)
chr6 (87-460)||(25944538-25944910)
chr6 (87-460)||(17691792-17692164)
chr6 (17-149)||(24714604-24714730)
chr6 (91-394)||(22347917-22348222)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (17-458)||(39484568-39485008)
chr2 (25-458)||(39486047-39486479)
chr2 (25-458)||(19346097-19346529)
chr2 (19-458)||(31057771-31058209)
chr2 (71-443)||(31134429-31134805)
chr2 (87-460)||(39685116-39685488)
chr2 (87-460)||(2739074-2739446)
chr2 (87-392)||(22714174-22714479)
chr2 (87-460)||(20051702-20052073)
chr2 (231-460)||(17934953-17935181)
chr2 (87-145)||(17942004-17942062)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (17-460)||(47701871-47702312)
chr1 (57-458)||(41395102-41395502)
chr1 (17-287)||(47101013-47101283)
chr1 (225-451)||(13599886-13600111)
chr1 (87-460)||(9524597-9524969)
chr1 (87-460)||(2396195-2396567)
chr1 (43-214)||(7155149-7155319)
chr1 (275-312)||(13599844-13599881)
chr1 (58-163)||(34689683-34689788)
chr1 (58-163)||(34694211-34694316)
chr1 (409-458)||(34689393-34689442)
chr1 (409-458)||(34693921-34693970)
chr1 (25-61)||(41392271-41392307)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (25-458)||(221-653)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (25-457)||(33859-34289)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (225-451)||(7683-7908)
scaffold0006 (275-312)||(7641-7678)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (165-460)||(161-455)
[»] scaffold0559 (1 HSPs)
scaffold0559 (164-330)||(4835-5001)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 428; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 26401626 - 26401184
Alignment:
Q  17 ctcacccctcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctaggg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401626 ctcacccctcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaactggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctaggg 26401527  T
Q  117 ctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401526 ctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 26401427  T
Q  217 caccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401426 caccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 26401327  T
Q  317 cggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaatacc 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26401326 cggtgagaatatctcattgtagtcgatctcctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aactcccggaatacc 26401228  T
Q  417 ttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401227 ttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 26401184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Original strand, 26298201 - 26298633
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26298201 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaactggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 26298300  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26298301 caacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaacctttcggttgctccatgtagattgtctctttaaggtcaccatgt 26298400  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26298401 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacgatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaa 26298500  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26298501 agatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaataccttcctttt 26298599  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26298600 tcttgaagatccacttgcatcaaactaccctttg 26298633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Original strand, 26311458 - 26311890
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26311458 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaactggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 26311557  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26311558 caacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaacctttcggttgctccatgtagattgtctctttaaggtcaccatgt 26311657  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26311658 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacgatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaa 26311757  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26311758 agatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaataccttcctttt 26311856  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26311857 tcttgaagatccacttgcatcaaactaccctttg 26311890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 33036201 - 33035769
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33036201 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 33036102  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33036101 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttggacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 33036002  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33036001 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacgatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaa 33035902  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33035901 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttagccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaataccttcctttt 33035803  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33035802 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 33035769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 10687532 - 10687100
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10687532 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 10687433  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10687432 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 10687333  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  10687332 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaa 10687233  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  10687232 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 10687134  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10687133 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 10687100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Original strand, 35742208 - 35742640
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35742208 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaactggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 35742307  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35742308 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 35742407  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  35742408 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaa 35742507  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| || |||||||    
T  35742508 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttataccttggaccttc-aacacccagaatgccatcctttt 35742606  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35742607 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 35742640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 18868938 - 18868506
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18868938 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccccttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 18868839  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18868838 caacctatacaaagatttcttcaaaagacacaccttggacttgtcctccacagaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 18868739  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18868738 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaa 18868639  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  18868638 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttagccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 18868540  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18868539 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 18868506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Original strand, 4814166 - 4814538
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| || |||||||||||||    
T  4814166 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 4814265  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  4814266 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 4814365  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  4814366 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 4814465  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || || || |||| ||| || |||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  4814466 taccttggtgcttc-gacccctggtatacgttctttcttcttgaacacccacttgcttcccactaccctttgat 4814538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 28331136 - 28330764
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| || ||||||||||||     
T  28331136 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttcta 28331037  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    || ||||| |||||    
T  28331036 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagattatacatgttaacaatcgccat 28330937  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  28330936 aagtacccttatagaacaatgttttactaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaacccttcgctacaagtcttgcctta 28330837  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || || || |||||||| || |||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  28330836 taccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttcttcttgaacacccacttgcttcccactaccctttgat 28330764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Original strand, 16754200 - 16754572
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| || |||||||||||||    
T  16754200 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 16754299  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  16754300 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 16754399  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||     
T  16754400 aagtacccttatagaacaatgttttactaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaagccctttgctacaagtcttgcctta 16754499  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||   | || || |||||||| || |||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  16754500 taccttggtgcttc-ggcccctggtataccttctttcttcttgaacacccacttgcttcccactaccctttgat 16754572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 28894005 - 28893698
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| || | |||||||||||    
T  28894005 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctataaaaccttctg 28893906  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  28893905 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcagtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 28893806  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||| |||||||     
T  28893805 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagttttgcttta 28893706  T
Q  387 taccttgg 394  Q
    ||| ||||    
T  28893705 tacattgg 28893698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25683148 - 25682841
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| || ||||||||||||     
T  25683148 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttcta 25683049  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||  | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||   |    || ||||| |||||    
T  25683048 gttattgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctagctcaagatcatacatgttaacaatcgccat 25682949  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| | |||| |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  25682948 aagtacctttatagaacaatgctttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 25682849  T
Q  387 taccttgg 394  Q
    ||||||||    
T  25682848 taccttgg 25682841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 40827535 - 40827427
Alignment:
Q  73 tcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctc 172  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| |   | |||||||||||||||    
T  40827535 tcttcaaaataaactcatcaaactaacaataccatttcctagggctttgcttcaacctatagaaagatatcttcaaaatatgcaacttagacttgtcctc 40827436  T
Q  173 cacaaaacc 181  Q
    |||||||||    
T  40827435 cacaaaacc 40827427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15947903 - 15947596
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||||  ||| |||||||||||||| | ||||||||| || || || || |  ||||||||||    
T  15947903 tcatcaaaccgaagaaaccactgccttggactttgcttcaacctatagaaagatttcttcaacatacatacctttgaattatcttctatgaaaccttctg 15947804  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| |||||  | ||  | ||||| |  || || ||||  || ||||| ||||||||||| | ||  |||| |||||   |    || ||||  |||||    
T  15947803 gttgttccatacatatattttcttccaactctccatgtagaaatgcggtattcacatccatctattttaacttaagatcatacatgttaacaaacgccat 15947704  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||||||||||  || ||||||| |||| |||||| || || |  ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  15947703 aagtatccttatacaagaatgttttaccatcggtgaaaagattttgttgtaatcgatcccttccacctgagtaaaacccttagccacaagtcttgcctta 15947604  T
Q  387 taccttgg 394  Q
    ||||||||    
T  15947603 taccttgg 15947596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21040581 - 21040376
Alignment:
Q  177 aaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattca 276  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||   |    || |    
T  21040581 aaaccttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttcttactcaagatcatacatgttaa 21040482  T
Q  277 caatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaag 376  Q
    ||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||  ||||| |||||||| || |||||    
T  21040481 caatctccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaactgagtaaaaccctttgctacaag 21040382  T
Q  377 tcttgc 382  Q
    ||||||    
T  21040381 tcttgc 21040376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 40827425 - 40827259
Alignment:
Q  164 cttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaaga 263  Q
    ||||||||||||||||||   |  ||||||||| ||||||||||||||||  |  || |||||| |  |  ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40827425 cttgtcctccacaaaacccattccttgctccatttagattgtctcttcaaaatatccatgtaaggacacaatcttcacatccatttattccaaatcaaga 40827326  T
Q  264 ttgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatct 330  Q
    ||| ||| ||| |  |||  |||||||| ||||||  |||||||||| | ||| |||||||| ||||    
T  40827325 ttgtattcattgaatataaacataagtacccttattaaacaatgttttaacactggtgagaaaatct 40827259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Original strand, 1307690 - 1308122
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1307690 tcttcaacatgtacacataagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 1307789  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1307790 caacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttgaaggtcaccatgt 1307889  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1307890 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacgatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaa 1307989  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  1307990 agatctcattgtagtcgatcccctccacttaagtgaaacccttggccacaagtcttgttttgtaccttggaccttc-aacacccagaataccttcctttt 1308088  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1308089 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 1308122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 458
Target Start/End: Original strand, 16256880 - 16257320
Alignment:
Q  17 ctcacccctcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctaggg 116  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16256880 ctcactcctcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtctttaaaagaaattcatcaaatcgacgataccattgcctaggg 16256979  T
Q  117 ctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16256980 ctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 16257079  T
Q  217 caccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16257080 caccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagtcataagtatccttatggtacaatgtttcaccac 16257179  T
Q  317 cggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaatacc 416  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||     
T  16257180 cggtgaaaatatcttattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttagccacaagtcttgctttgtaccttggaccat-taacacccggaatacg 16257278  T
Q  417 ttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16257279 ttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 16257320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 22171576 - 22171144
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171576 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtctttaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 22171477  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22171476 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 22171377  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22171376 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaa 22171277  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  22171276 aaatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 22171178  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171177 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 22171144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Original strand, 32477159 - 32477591
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32477159 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 32477258  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32477259 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctctacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 32477358  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32477359 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcactatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaa 32477458  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  32477459 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 32477557  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32477558 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 32477591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Original strand, 8513913 - 8514345
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8513913 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagtgctttgctt 8514012  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8514013 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctctacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 8514112  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8514113 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcactatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaa 8514212  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  8514213 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 8514311  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8514312 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 8514345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 2675488 - 2675056
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2675488 tcttcaacatgtacacgcaagagtcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgaccataccattgcctaaggctttgctt 2675389  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2675388 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 2675289  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  2675288 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagatcgaattgattcactatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaa 2675189  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  2675188 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 2675090  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2675089 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 2675056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 80 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 3326739 - 3326362
Alignment:
Q  80 aagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  3326739 aagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacattccttagatttgtcttctacaaaa 3326640  T
Q  180 ccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3326639 ccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaa 3326540  T
Q  280 tagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtct 379  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3326539 tagcgatatgtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtaagaagatctcattgtagtcgatcccctccatttgagtgaaacccttggccacaagtct 3326440  T
Q  380 tgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3326439 tgctttgtaccttggaccttc-aacaccctgaataccttcttttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 3326362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 54191749 - 54191377
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| || |||||||||||||    
T  54191749 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacatacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 54191650  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  54191649 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 54191550  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  54191549 aagtacccttatagaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 54191450  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  54191449 taccttggtgcttc-gacccccggtataccttcttttttcttgaacacccacttgcttcccactaccctttgat 54191377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Original strand, 10095746 - 10096118
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || | ||| || || |  ||||| || |||||||||||||    
T  10095746 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccgtacaaagatttcttgaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 10095845  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  10095846 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 10095945  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  10095946 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 10096045  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || || || |||||||| ||  ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  10096046 taccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttcatcttgaacacccacttgcttcccactaccctttgat 10096118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Original strand, 10202632 - 10203004
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||| || | ||| || || |  ||||| || |||||||||||||    
T  10202632 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccgtacaaatatttcttgaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 10202731  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  10202732 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 10202831  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  10202832 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 10202931  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || || || |||||||| ||  ||||||| | ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  10202932 taccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttcatcttgaacacccatttgcttcccactaccctttgat 10203004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 10900250 - 10899878
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| |  || ||||||||||    
T  10900250 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttatacgaaaccttctg 10900151  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||||| ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  10900150 gttgctgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 10900051  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||| ||     
T  10900050 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctgcaagtcttgcctta 10899951  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || || || |||||||| || || || || | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  10899950 taccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttctttttaaacacccacttgcttcccactaccctttgat 10899878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 84 - 394
Target Start/End: Original strand, 47879826 - 47880136
Alignment:
Q  84 aattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaacctt 183  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| || ||||||||||    
T  47879826 aattcatcaatccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaacctt 47879925  T
Q  184 ctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagc 283  Q
    ||||||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |   ||| ||||| ||    
T  47879926 ctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatatgttctaactcaagatcatacatattaacaatcgc 47880025  T
Q  284 cataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgct 383  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||||||| || ||||  ||||| ||||| |||||| | || |||||||||||     
T  47880026 cataagtacccttatagaacaatgttttaccatcggtgaaaagatttcattgtaatcaatccattccacctgagtaaaacccattgctacaagtcttgcc 47880125  T
Q  384 ttgtaccttgg 394  Q
    || ||||||||    
T  47880126 ttataccttgg 47880136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 394
Target Start/End: Original strand, 10609713 - 10610020
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |  ||||| || || ||||||||||    
T  10609713 tcatcaaaccgacgataccactaccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaaaacaaacttttgtattgtcttctacgaaaccttctg 10609812  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||   |    || |||||  ||||    
T  10609813 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccattcgttctaactcaagatcatacatgttaacaattaccat 10609912  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||| ||     
T  10609913 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaatcctttgctacaagtcttgcctta 10610012  T
Q  387 taccttgg 394  Q
    ||||||||    
T  10610013 taccttgg 10610020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16460705 - 16460400
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| || |||||||||| ||    
T  16460705 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttatg 16460606  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  16460605 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtattcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 16460506  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  16460505 aagtacccttatagaacaatgttttactaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcacttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 16460406  T
Q  387 tacctt 392  Q
    ||||||    
T  16460405 tacctt 16460400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 247
Target Start/End: Original strand, 22623065 - 22623225
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| || |||||||||||||    
T  22623065 tcatcaaaccgacgataccattgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacatacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 22623164  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccat 247  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || |||||||||||||||||    
T  22623165 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccat 22623225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Original strand, 18410476 - 18410908
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18410476 tctttaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaagccggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 18410575  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18410576 caacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcgtccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 18410675  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18410676 aagaaagcaatcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacgatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaa 18410775  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18410776 agatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaataccttcctttt 18410874  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18410875 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 18410908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 24264591 - 24264159
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264591 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 24264492  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24264491 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 24264392  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24264391 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaa 24264292  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  24264291 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 24264193  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264192 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 24264159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Original strand, 16881746 - 16882178
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16881746 tcttcaacatgtacacacaagaatcatacccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 16881845  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16881846 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 16881945  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16881946 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcactatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaa 16882045  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  16882046 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 16882144  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16882145 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 16882178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Original strand, 21641509 - 21641941
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21641509 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 21641608  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21641609 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 21641708  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21641709 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacgatagtcataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaa 21641808  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  21641809 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttaaatgaaacccttagccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacactcggaataccttcctttt 21641907  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21641908 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 21641941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 458
Target Start/End: Original strand, 21985730 - 21986170
Alignment:
Q  17 ctcacccctcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctaggg 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21985730 ctcacccctcttcaacatgtacacacaagaatcatacccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaattcatgaaaccgacgatagcattgcctaggg 21985829  T
Q  117 ctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 216  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21985830 ctttgcttcaaccgatacaaagatttctttaaaaaacataccttagacttgtctttcaaaaaaccttctggtttctccatgtagattgtctcttcaaggt 21985929  T
Q  217 caccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21985930 caccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 21986029  T
Q  317 cggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaatacc 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||    
T  21986030 cggtgagaagatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacactcagaatacc 21986128  T
Q  417 ttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21986129 ttcctttttcttgaagatccacctgcatccaactaccctttg 21986170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 9188421 - 9187979
Alignment:
Q  17 ctcacccctcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctaggg 116  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| |     
T  9188421 ctcactcctcttcaacatgtacacacaagaatcatatctgcttctcacaaaaccgatcttcaaaagaaattcatcaaacttacaatacaattgcctatga 9188322  T
Q  117 ctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 216  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9188321 ctttgtttcaatccatacaaagatttctttaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttccgtttgctccatgtagattgtctcttcaagat 9188222  T
Q  217 caccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9188221 caccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcactac 9188122  T
Q  317 cggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaatacc 416  Q
    | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9188121 cagtgaaaagatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatacc 9188023  T
Q  417 ttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9188022 ttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 9187979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 24273174 - 24272736
Alignment:
Q  23 cctcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgc 122  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  24273174 cctcttcaacatgtacacacaataatcatatccgcttctcataaaaccggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctaagactttac 24273075  T
Q  123 ttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcacctt 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  24273074 ttcaacccatacaaagatttcttcaatagatataccttagacttgtcctccacaaaatcttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaagtcaccat 24272975  T
Q  223 gtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaac----tcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccg 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24272974 gtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcgatcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccg 24272875  T
Q  319 gtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaatacctt 418  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  24272874 gtgagaagatctcattgtagtcgatcccctccatttgagtgacacccttagccacaagtcttgctttgtaccttgaaccttc-aacacccggaatacctt 24272776  T
Q  419 cctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24272775 cttttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 24272736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 71 - 385
Target Start/End: Original strand, 12404835 - 12405149
Alignment:
Q  71 ggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcc 170  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12404835 ggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggcttttcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcc 12404934  T
Q  171 tccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaatt 270  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12404935 tccataaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaatt 12405034  T
Q  271 gattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggc 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12405035 gattcacaatagccataactatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtctatcccctccacttgagtgaaaccctttgc 12405134  T
Q  371 cacaagtcttgcttt 385  Q
    |||||||||||||||    
T  12405135 cacaagtcttgcttt 12405149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Original strand, 3321728 - 3322100
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| || |||||||||||||    
T  3321728 tcatcaaaccgacgataccattgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacatacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 3321827  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  3321828 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 3321927  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  3321928 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 3322027  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || || || |||||||| || |||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||    
T  3322028 taccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttcttcttgaacacccacttgcttcccactaacctttgat 3322100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 7073292 - 7072920
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||| |||||||||| | ||| || || |  ||||| || |||||||||||||    
T  7073292 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaatccatacaaatatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 7073193  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  7073192 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 7073093  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  7073092 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 7072993  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || || || |||||||| || ||| | || | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  7072992 taccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttcttcgtaaacacccacttgcttcccactaccctttgat 7072920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 25408655 - 25408283
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||| || || |  ||||| || || ||||||||||    
T  25408655 tcatcaaaccgacgataccactgcctaggactttgcttcaacccatacatggatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacgaaaccttctg 25408556  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || | ||| |||||    
T  25408555 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaataatcgccat 25408456  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  25408455 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccgatgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 25408356  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  25408355 taccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgat 25408283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25403898 - 25403591
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||| || || |  ||||| || || ||||||||||    
T  25403898 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacatggatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacgaaaccttctg 25403799  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || | ||| |||||    
T  25403798 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaataatcgccat 25403699  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||| ||     
T  25403698 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaatcctttgctacaagtcttgcctta 25403599  T
Q  387 taccttgg 394  Q
    ||||||||    
T  25403598 taccttgg 25403591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Original strand, 5071564 - 5071774
Alignment:
Q  114 gggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaa 213  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||      ||| ||||||||| |||||   | | |||||| ||    
T  5071564 gggctttgtttcaaccaatacaaatatttcttcaaaagacacatcttagacttgtcttc------accctctggttgcaccatg---agtctctcttaaa 5071654  T
Q  214 ggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcac 313  Q
    | |  || ||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||  ||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5071655 gctttccatgtaagaacatgatcttcacgtccatttgttccaactcg-gattatatcgattcacaatcgctataagtatccttatggaacaatgtttcac 5071753  T
Q  314 caccggtgagaatatctcatt 334  Q
    |||  ||| ||| ||||||||    
T  5071754 cacaagtgtgaaaatctcatt 5071774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 68
Target Start/End: Original strand, 12398574 - 12398617
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaa 68  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12398574 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaa 12398617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 448
Target Start/End: Original strand, 45702773 - 45702810
Alignment:
Q  411 aataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaa 448  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  45702773 aataccttccttgttcttgaagatccacttacatccaa 45702810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Original strand, 18857395 - 18857827
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18857395 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 18857494  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18857495 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 18857594  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18857595 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaa 18857694  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  18857695 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 18857793  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18857794 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 18857827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 16627268 - 16626828
Alignment:
Q  17 ctcacccctcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctaggg 116  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16627268 ctcacccctctgcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcaaaaaatcggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgccttggg 16627169  T
Q  117 ctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16627168 ctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctctacaaaaccttccagttgctccatgtagattgtcttttcaaggt 16627069  T
Q  217 caccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 316  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16627068 caccatgtaagaaaacggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccat 16626969  T
Q  317 cggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaatacc 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||||    
T  16626968 cggtgagaagatctcattgtagtccatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtacctaaaaccttc-aacacccggaatacc 16626870  T
Q  417 ttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626869 ttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 16626828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 3791409 - 3790969
Alignment:
Q  17 ctcacccctcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctaggg 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3791409 ctcacccctcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttcttacaaaaccggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctaggg 3791310  T
Q  117 ctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 216  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3791309 ctttacttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccaaaaaaccttccggttgctccatgtagattttctcttcaaggt 3791210  T
Q  217 caccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 316  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3791209 caccatgtaacaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 3791110  T
Q  317 cggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaatacc 416  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  3791109 cggtgagaagatctcattgtactcgatcccctccacttgagtgaaacccttgaccacaagtcttgctttgtacctaggaccttc-aacacccggaatacc 3791011  T
Q  417 ttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
     ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3791010 atccttttacaaaaagatccacttgcatccaactaccctttg 3790969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 458
Target Start/End: Original strand, 5144721 - 5145159
Alignment:
Q  17 ctcacccctcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctaggg 116  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  5144721 ctcacccttcttcaacatgtacacacaagaatcttatccgcttctcacaaaaccgggcttcaaaagaaattcatcaaactgatgataccattgcccaggg 5144820  T
Q  117 ctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 216  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5144821 atttgcttcaacccatacaaagatttctttaaaagacataccttagacttgtctttcacaaaaccttccggttgctccatgta--ttgtctcttcaaggt 5144918  T
Q  217 caccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 316  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5144919 caccatgtaagaaagcagtcttcacatccatttgttcaaactcaagattgaattgattcacaataaccataagtatcgttatggaacaatgtttcaccac 5145018  T
Q  317 cggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaatacc 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5145019 cggtgagaagatctcattgtagtcaatcccctccacttgagtgaaacccttggccataagtattgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatacc 5145117  T
Q  417 ttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5145118 tttctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 5145159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 142 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 9227552 - 9227237
Alignment:
Q  142 tcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcac 241  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9227552 tcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttctagttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcac 9227453  T
Q  242 atccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  9227452 atccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccactggtgaaaagatctcgttgtagtcg 9227353  T
Q  342 atcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9227352 atcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttg 9227254  T
Q  442 catccaactaccctttg 458  Q
    |||||||||||||||||    
T  9227253 catccaactaccctttg 9227237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15315558 - 15315251
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||    || || || || ||||||||||    
T  15315558 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttctattatcttctacgaaaccttctg 15315459  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  15315458 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 15315359  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  15315358 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtagtcaatcccttcaacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 15315259  T
Q  387 taccttgg 394  Q
    ||||||||    
T  15315258 taccttgg 15315251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 4568584 - 4568212
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| || || |  || || || || ||||||||||    
T  4568584 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaatatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttctg 4568485  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| |||||  | ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  4568484 gttgttgcatatagatattttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 4568385  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  4568384 aagtacccttatagaacaatgttttatcaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 4568285  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||  |||||||||||||    
T  4568284 taccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttctcactaccctttgat 4568212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16637402 - 16637095
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||  ||    || || || || ||||||| ||    
T  16637402 tcatcaaacagacgataccactgccttggactttgattcaatccatacaaagatttcttcaacaaacataattttatattatcttctacgaaaccttttg 16637303  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| ||  |||| |  || || ||||  || | |||||||||||| || ||||  ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  16637302 gttgttacatatagatagttacttccaaatctccatgtagaaatgtggtcttcacatctatctgttttaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 16637203  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  16637202 aagtacccttattgaacaatgttttaccaccgctgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacatgagtaaaaccctttgctacaagccttgcctta 16637103  T
Q  387 taccttgg 394  Q
    ||||||||    
T  16637102 taccttgg 16637095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 9227596 - 9227542
Alignment:
Q  29 caacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaaga 83  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9227596 caacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaaga 9227542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 24558841 - 24558420
Alignment:
Q  36 tacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcataca 135  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  24558841 tacacacatgaatcatatccgcttctcacaaaatcgatcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttggttcaacccatata 24558742  T
Q  136 aagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggt 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24558741 aagatttattcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtaaccgtgtaagaaagcggt 24558642  T
Q  236 cttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattg 335  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24558641 ctttacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattg 24558542  T
Q  336 tagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatc 435  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24558541 tagtcaatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtacctaggaccttc-aactcccggaataccttcctttttcttgaagatc 24558443  T
Q  436 cacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24558442 cacttgcatccaactaccctttg 24558420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 24599873 - 24599452
Alignment:
Q  36 tacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcataca 135  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  24599873 tacacacatgaatcatatccgcttctcacaaaatcgatcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttggttcaacccatata 24599774  T
Q  136 aagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggt 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24599773 aagatttattcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtaaccgtgtaagaaagcggt 24599674  T
Q  236 cttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattg 335  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24599673 ctttacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattg 24599574  T
Q  336 tagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatc 435  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24599573 tagtcaatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtacctaggaccttc-aactcccggaataccttcctttttcttgaagatc 24599475  T
Q  436 cacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24599474 cacttgcatccaactaccctttg 24599452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Original strand, 27446642 - 27447074
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27446642 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaattcatcaaaacgacgataccattgcctagggctttgctt 27446741  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27446742 caacccatacaaagatttctttaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 27446841  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  27446842 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaa 27446941  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  27446942 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttagaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 27447040  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27447041 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 27447074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Original strand, 33769858 - 33770290
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33769858 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 33769957  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33769958 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 33770057  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  33770058 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaa 33770157  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  33770158 agatctcgttgtagtcgaccccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttataccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 33770256  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33770257 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 33770290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 37559861 - 37559429
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37559861 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 37559762  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37559761 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacgccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 37559662  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  37559661 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattaattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaa 37559562  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  37559561 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttataccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 37559463  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37559462 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 37559429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 28805990 - 28805558
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28805990 tcttcaacatgtacacacaagagtcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcgtcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 28805891  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28805890 caacccatacaaagatttcttcaaaagacgcaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 28805791  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28805790 aagaaagcggtattcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaa 28805691  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  28805690 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 28805592  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28805591 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 28805558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 31400260 - 31399828
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31400260 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 31400161  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31400160 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 31400061  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31400060 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagatcgaattgattcactatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaa 31399961  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  31399960 agatctcgttgtagtcgatcccctacacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttataccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 31399862  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31399861 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 31399828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Original strand, 43593940 - 43594372
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43593940 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaattcatcaaaacgacgataccattgcgtagggctttgctt 43594039  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43594040 caacccatacaaagatttctttaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 43594139  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  43594140 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagtcataaatatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaa 43594239  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  43594240 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 43594338  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43594339 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 43594372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Original strand, 43626734 - 43627166
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43626734 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaattcatcaaaacgacgataccattgcgtagggctttgctt 43626833  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43626834 caacccatacaaagatttctttaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 43626933  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  43626934 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagtcataaatatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaa 43627033  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  43627034 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 43627132  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43627133 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 43627166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 323
Target Start/End: Original strand, 28833870 - 28834176
Alignment:
Q  17 ctcacccctcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctaggg 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28833870 ctcacccctcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaatcggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgatatcattgcctaggg 28833969  T
Q  117 ctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28833970 ctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagatataccttagacttgtcatccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 28834069  T
Q  217 caccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28834070 caccatgtaagaaagcggtcttcacatctatttgttccaaattaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 28834169  T
Q  317 cggtgag 323  Q
    |||||||    
T  28834170 cggtgag 28834176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 76 - 458
Target Start/End: Original strand, 31301202 - 31301584
Alignment:
Q  76 tcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccac 175  Q
    ||||||||| | |||| |||  |||||| |||||||| ||  |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  31301202 tcaaaagaattacatctaactaacgatatcattgccttggattttgtttcaattcttacaatgatttcttcaaaagacacaccttagatttgtcttccat 31301301  T
Q  176 aaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattc 275  Q
    ||||||||  |  ||||   |||||||||||| || ||||   || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||      
T  31301302 aaaacctttcgaatgctttgtgtagattgtctttttaaggggtccatgtaagaatgcggcattcacatccatttgttccaactcaatattgtattgataa 31301401  T
Q  276 acaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggcca-ca 374  Q
    || |||| | | |||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  |  |||  |    
T  31301402 acgatagtcgtgagtatctttatggaacaatgtttttctaccggtgagaagatctcattttagttgatcccctcaacttgagtgaaacctgtttccataa 31301501  T
Q  375 agtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    |  |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31301502 aaccttgctttataccttggacctt-taactcccggaatgcctgccttttttttgaagttccaattgcatccaactaccctttg 31301584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 319 - 458
Target Start/End: Original strand, 28835415 - 28835553
Alignment:
Q  319 gtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaatacctt 418  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||    
T  28835415 gtgagaagatctcattgtagtcgattcccttcacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtacctaggaccttc-aacacccgaaatacctt 28835513  T
Q  419 cctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28835514 cctttttcttgaagatccacttgcatcaaactaccctttg 28835553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25450996 - 25450691
Alignment:
Q  89 atcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggt 188  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| || |||||||||||||||    
T  25450996 atcaaaccgacgataccactaccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctggt 25450897  T
Q  189 tgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataa 288  Q
    |  | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||||    
T  25450896 tattgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccataa 25450797  T
Q  289 gtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgta 388  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||    
T  25450796 gtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcgttgtaatcaatcccttccacctaagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttata 25450697  T
Q  389 ccttgg 394  Q
    ||||||    
T  25450696 ccttgg 25450691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 237 - 458
Target Start/End: Original strand, 31333674 - 31333896
Alignment:
Q  237 ttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgt 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| || |||| | | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||| |    
T  31333674 ttcacatcaatttgttccaactcaatatcgtattgattaacgatagtcgtgagtatctttatggaacaatgtttttccaccggtgaaaagatctcatttt 31333773  T
Q  337 agtcgatcccctccacttgagtgaaacc-cttggcca-caagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagat 434  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||  |||  ||  |||||||| |||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||| |||||| |    
T  31333774 agttgatcccctcaacttgagtgaaacctgttttccataaaaccttgctttataccttggacctt-taactcctagaatgcctgccttttttttgaagtt 31333872  T
Q  435 ccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  31333873 ccaattgcatccaactaccctttg 31333896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 266
Target Start/End: Original strand, 30102726 - 30102874
Alignment:
Q  118 tttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtc 217  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30102726 tttgtttcaactcatacaaatatttcttcaaaagacccaccgtagatttatcctctacaaaaccttttggttgctctatgtaaattgtctcttcaaggtc 30102825  T
Q  218 accttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattg 266  Q
     || ||||||||| | || | |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  30102826 tccatgtaagaaaaccgtttacgtatccatttgttccaactcaaaattg 30102874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 17577 - 17145
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17577 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 17478  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17477 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 17378  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17377 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaa 17278  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  17277 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 17179  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17178 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 17145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 14740839 - 14740408
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14740839 tcttcaacatgtacacaca-gaatcatatccgcttctcacaaaactggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 14740741  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14740740 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 14740641  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  14740640 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaa 14740541  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  14740540 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 14740442  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14740441 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 14740408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 33334344 - 33333913
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33334344 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaactgacgataccattgcctagggctttgctt 33334245  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33334244 caacccgtacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgttccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 33334145  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  33334144 aagaaagcggtcttcacatccatctgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaa 33334045  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  33334044 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttttccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 33333946  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactacccttt 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33333945 tcttgaagatccacttgcatccaactacccttt 33333913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 146 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24434460 - 24434151
Alignment:
Q  146 caaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatcc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||| |    
T  24434460 caaaagacataccttagacttgtccaacacaaa-ccttcaggtttctccatatagattttcttttcaagatcaccgagtaagaaagcggtctttacatgc 24434362  T
Q  246 atttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcc 345  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  24434361 atttgttccaactcaaggttgaattgattcacaataaccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtaaatcc 24434262  T
Q  346 cctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatc 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  |||| ||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24434261 cctccacttgagtgaaacccttggccataagtcttgttgttcacctaggaccctc-aactcttggaatactttcctttttcttgaagatccacttgcatc 24434163  T
Q  446 caactacccttt 457  Q
    ||||||||||||    
T  24434162 caactacccttt 24434151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 13881980 - 13881608
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| || |||||||||||||    
T  13881980 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 13881881  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  13881880 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 13881781  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  13881780 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 13881681  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || || || |||||||| || |||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  13881680 taccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttcttcttgaacacccacttgcttcccactaccctttgat 13881608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Original strand, 35203003 - 35203375
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| || |||||||||||||    
T  35203003 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 35203102  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  35203103 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 35203202  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  35203203 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 35203302  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || || || |||||||| || |||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  35203303 taccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttcttcttgaacacccacttgcttcccactaccctttgat 35203375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 25944910 - 25944538
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||| || | ||| || || |  ||||| || |||||||||||||    
T  25944910 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccgtacaaaaatttcttaaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 25944811  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattg-aattgattcacaatagcca 285  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   || || || ||||| ||||    
T  25944810 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatatgttctaactcaagatcataaatg-ttaacaatcgcca 25944712  T
Q  286 taagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgcttt 385  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||| ||    
T  25944711 taagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacttgagtaaaaccctttgctagaagtcttgcctt 25944612  T
Q  386 gtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
     ||||||||  ||||  || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  25944611 ataccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttcttcttaaaaacccacttgcttcccactaccctttgat 25944538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Original strand, 17691792 - 17692164
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  || || || || ||||||||||    
T  17691792 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaataaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttctg 17691891  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  17691892 gttgttgcatatagatggtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 17691991  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  17691992 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 17692091  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||| ||  ||||  || |  || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  17692092 tacctcggtgcttc-gacccgtggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttccaaataccctttgat 17692164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 149
Target Start/End: Original strand, 24714604 - 24714730
Alignment:
Q  17 ctcacccctcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctaggg 116  Q
    ||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||    
T  24714604 ctcacccttcttcaacatgtacatacaagaatcatagccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacga------tgcctaggg 24714697  T
Q  117 ctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaa 149  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24714698 ctttgcttcaatccatacaaagatttcttcaaa 24714730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 394
Target Start/End: Original strand, 22347917 - 22348222
Alignment:
Q  91 caaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttg 190  Q
    |||||||||||||||  ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| || || |  || || || || ||||||||||||||    
T  22347917 caaaccgacgatacctctgccttggactttgcttcaacccatacaaatatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttctggttg 22348016  T
Q  191 ctccatgta--gattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataa 288  Q
     | ||| ||  ||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| | |||||    
T  22348017 ttgcatatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgtcataa 22348116  T
Q  289 gtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgta 388  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| | | ||| | ||| |||||||| || ||||||| ||| || ||    
T  22348117 gtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcacttacacctaagtaaaaccctttgctacaagtcatgccttata 22348216  T
Q  389 ccttgg 394  Q
    ||||||    
T  22348217 ccttgg 22348222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 458
Target Start/End: Original strand, 39484568 - 39485008
Alignment:
Q  17 ctcacccctcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctaggg 116  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||    
T  39484568 ctcacccatctccaacatgtacacacaagaatcatatctgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaattcataaaaacaacgataccattgcctaagg 39484667  T
Q  117 ctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39484668 ctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctctacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 39484767  T
Q  217 caccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 316  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39484768 taccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttctaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 39484867  T
Q  317 cggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaatacc 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  39484868 cggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtacctttgaccttc-aacacccggaatacc 39484966  T
Q  417 ttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39484967 ttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 39485008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 39486479 - 39486047
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39486479 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccagtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgatatcattgtctagggctttgctt 39486380  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  39486379 caacccatacaaagatatcttcaaaagacatatcttagacttgtcctccacaaaaccttctggttactccatgtagattgtctcttcaaggtcaacatgt 39486280  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39486279 aagaaagcggtcttcacatccatttcttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 39486180  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39486179 agatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttagccacaagtcttgctttgtacctagtactttc-aacacccggaataccttcctttt 39486081  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39486080 tcttgaagatcgacttgcatccaactaccctttg 39486047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Original strand, 19346097 - 19346529
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19346097 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 19346196  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  19346197 caacccatacaaagattttttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgttccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatat 19346296  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19346297 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaa 19346396  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  19346397 agatctcgttgtagtcgaccccctccacttgagtgaaaccctttaccacaagtcttgctttataccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 19346495  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19346496 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 19346529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 458
Target Start/End: Original strand, 31057771 - 31058209
Alignment:
Q  19 cacccctcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggct 118  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  31057771 cacccctcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccatttcctagggtt 31057870  T
Q  119 ttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtca 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31057871 ttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttccaattgctccatgtagattgtctcttcatggtca 31057970  T
Q  219 ccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccg 318  Q
     | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31057971 gcatgtaagaaatcagtcttcacatccatttgttccaacttaagattgaattgattcacaatggtcataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccg 31058070  T
Q  319 gtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaatacctt 418  Q
     |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  31058071 atgagaagatctgattgtagtggatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttctacctacgaccttc-aacacccgaaatacctt 31058169  T
Q  419 cctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31058170 cctttttcttgaagatccacttgaatccaactaccctttg 31058209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 31134805 - 31134429
Alignment:
Q  71 ggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcc 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || || || |||| || || ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  31134805 ggtcttcaaaagaaactcatcaaactgatga-actattgtcttggactttgtttcaacacatacaacaatttcttcaaaagacacatcttggacttgtcc 31134707  T
Q  171 tccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaatt 270  Q
    |||| |||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| || |||||  | ||||||||||||| | |    
T  31134706 tccataaaaccttccagtttctccatatagatcgtctcttcaatgtcaccatataagaaggcggtcttcatatacattttcttcaactcaagattgtaat 31134607  T
Q  271 gattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctt--- 367  Q
    ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||| |||||| ||||| || ||| |||||||||||||       
T  31134606 gattcatggtagctataagtaaccttatggaacaatgcttcaccacatgtgaaaagatctcatagtagtcaatcccttcaactagagtgaaaccctttcc 31134507  T
Q  368 ---ggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgca 443  Q
         |||||||||||||||||| |||  ||   || |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31134506 cacaaccacaagtcttgctttgtgcctcagattctc-aactcctgtaataccttcgtttttcttgaaaatccacttgca 31134429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 39685488 - 39685116
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| || ||||||| || ||    
T  39685488 tcatcaaaccgacgataccactgctttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaacgttatg 39685389  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    || ||||| |||||    
T  39685388 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagattatacatgttaacaatcgccat 39685289  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  39685288 aagtacccttatagaacaatgttttactaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaacccttcgctacaagtcttgcctta 39685189  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || || || |||||||| || |||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  39685188 taccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttcttcttgaacacccacttgcttcccactaccctttgat 39685116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 2739446 - 2739074
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||   | | ||| || || |  ||||| || |||||||||||||    
T  2739446 tcatcataccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttctattacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 2739347  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  2739346 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgtggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 2739247  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  2739246 aagtacccttatagaacaatgttttaccagcggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaacccttagctacaagtcttgcctta 2739147  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  2739146 taccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgat 2739074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 392
Target Start/End: Original strand, 22714174 - 22714479
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| || |||||||||| ||    
T  22714174 tcatcaaaccgacgataccaatgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttatg 22714273  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  22714274 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtattcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 22714373  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  22714374 aagtacccttatagaacaatgttttactaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcacttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 22714473  T
Q  387 tacctt 392  Q
    ||||||    
T  22714474 tacctt 22714479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Original strand, 20051702 - 20052073
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||| || || |  || || || || ||||||||||    
T  20051702 tcatcaaaccgacgatac-actgccttggactttgcttcaaccgatacaaagttttcttcaacaaacacactttggtattatcttctacgaaaccttctg 20051800  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  20051801 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 20051900  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  20051901 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattataatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 20052000  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || || || |||||| | || ||||| || | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  20052001 taccttggtgcttc-gacccctggtatacctcctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgat 20052073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 17935181 - 17934953
Alignment:
Q  231 gcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatct 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |    
T  17935181 gcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagattt 17935082  T
Q  331 cattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttga 430  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||  ||||  || || || |||||||| || ||||| |    
T  17935081 cattgtagtcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttataccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttcttcttaa 17934983  T
Q  431 agatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    | | |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  17934982 acacccacctgcttcccactaccctttgat 17934953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17942062 - 17942004
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttctt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17942062 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttctt 17942004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 47702312 - 47701871
Alignment:
Q  17 ctcacccctcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctaggg 116  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  47702312 ctcacccctcttcaacatgt-cacacaagaatcatatccgcttcttacaaaaccggtttccaaaagaaattcatcaaactgatgataccattgcctaggg 47702214  T
Q  117 ctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47702213 ctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgttctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 47702114  T
Q  217 caccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 316  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47702113 caccatgtaagaaagcggtattcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 47702014  T
Q  317 cggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaatacc 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  47702013 cggtgagaagatctcattgtagtcgatcccctccactttagtgaaacccttggctacaagtctttctttgtacctaggaccttc-aacacccggaatacc 47701915  T
Q  417 ttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47701914 ttcctttttcttgaagatccacttgcatccaaccaccctttgat 47701871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 57 - 458
Target Start/End: Original strand, 41395102 - 41395502
Alignment:
Q  57 cttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacata 156  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  41395102 cttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttggttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacaca 41395201  T
Q  157 ccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaa 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41395202 ccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtgaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaa 41395301  T
Q  257 ctcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41395302 ctcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagttctcgttgtagtcgatcccctccacttga 41395401  T
Q  357 gtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctt 456  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41395402 gtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctt 41395500  T
Q  457 tg 458  Q
    ||    
T  41395501 tg 41395502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47101283 - 47101013
Alignment:
Q  17 ctcacccctcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctaggg 116  Q
    ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  47101283 ctcaccccttttcaacatgtatacacaagaatcatatccgcttctcacaaatccgatcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgtctatgg 47101184  T
Q  117 ctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 216  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47101183 ctttgcttcaacctatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttccagttgctccatgtagattgtctcttcaaggt 47101084  T
Q  217 caccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccata 287  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47101083 caccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattcaattgattcacaatagccata 47101013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 225 - 451
Target Start/End: Original strand, 13599886 - 13600111
Alignment:
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  13599886 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaataatgtttcaccactggtgaga 13599985  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13599986 agatctcattgtagtcgatcccctccacttgattgaaacccttggccacaagtcttgctttgtatcttggaccttc-aacacccggaataccttcctttt 13600084  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaacta 451  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13600085 tcttgaagatccacttgcatccgacta 13600111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 9524969 - 9524597
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| || |||||||||||||    
T  9524969 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 9524870  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  9524869 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 9524770  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  9524769 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 9524670  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  9524669 taccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgat 9524597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 460
Target Start/End: Original strand, 2396195 - 2396567
Alignment:
Q  87 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  || || || || ||||||||||    
T  2396195 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttctg 2396294  T
Q  187 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 286  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||    
T  2396295 gttgttgcatatagatagtttcttccaaatctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 2396394  T
Q  287 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 386  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  2396395 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgagaagatttcattgtaataaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 2396494  T
Q  387 taccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    ||||||||  ||||  || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  2396495 taccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgat 2396567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7155319 - 7155149
Alignment:
Q  43 aagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagattt 142  Q
    |||||||||||||  ||||| || ||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||     |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  7155319 aagaatcatatcc--ttctcccacaaccggtcttcaaaagaaatttctcaaactgacgataccattcatgtgggctttgtttcaaggcatacaaagattt 7155222  T
Q  143 ctt-caaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaag 214  Q
     || ||||||||||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  7155221 ttttcaaaagacatgtcttaaccttatctttcacaaaaccttctagttactccatgtatattatctcttcaag 7155149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 312
Target Start/End: Original strand, 13599844 - 13599881
Alignment:
Q  275 cacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13599844 cacaatagccataagtatccttatggaataatgtttca 13599881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34689788 - 34689683
Alignment:
Q  58 ttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacatac 157  Q
    |||||||||||   || ||||||||||| |||||||||| | || |||||| |||  |||| || |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||| ||    
T  34689788 ttctcacaaaacatgtgttcaaaagaaactcatcaaacccatgacaccatttccttaggctatgtttcaacacatacaaaggtttgttctaaagacacac 34689689  T
Q  158 cttaga 163  Q
    ||||||    
T  34689688 cttaga 34689683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34694316 - 34694211
Alignment:
Q  58 ttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacatac 157  Q
    |||||||||||   || ||||||||||| |||||||||| | || |||||| |||  |||| || |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||| ||    
T  34694316 ttctcacaaaacatgtgttcaaaagaaactcatcaaacccatgacaccatttccttaggctatgtttcaacacatacaaaggtttgttctaaagacacac 34694217  T
Q  158 cttaga 163  Q
    ||||||    
T  34694216 cttaga 34694211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 34689442 - 34689393
Alignment:
Q  409 ggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  34689442 ggaatacctttcttattcttgaagatacacttgcatcacactaccctttg 34689393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 34693970 - 34693921
Alignment:
Q  409 ggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  34693970 ggaatacctttcttattcttgaagatacacttgcatcacactaccctttg 34693921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 61
Target Start/End: Original strand, 41392271 - 41392307
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttct 61  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41392271 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttct 41392307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 653 - 221
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  653 tcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcgtcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 554  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  553 caacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcttccacaaaaccttcaggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgt 454  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  453 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaa 354  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  353 agatctctttgtagtcgatcccctccacttgggtgaaaccctttgccacaagtcttgctttataccttggaccttc-aacacccggaatgccatcctttt 255  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254 tcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 25 - 457
Target Start/End: Original strand, 33859 - 34289
Alignment:
Q  25 tcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaattggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgctt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||   |||||| | |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  33859 tctttaacatatacacacaagaatcatacatgcttctaa-aaaactgatcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccatttcctaggactttgctt 33957  T
Q  125 caactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgt 224  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  33958 caacccatacaaagatttctttaaaagacacaccttagacttgtcctccccaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaagggtaccatgt 34057  T
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34058 aagaaagcagtctttacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatatccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 34157  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  34158 agatctcattatactcgatcccctccacctaagttaaacccttggccacaagtcttgttttgtacctaggaccttc-aactcctagaataccttcctttt 34256  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaactacccttt 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34257 tcttgaagatccacttgcatccaactacccttt 34289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 225 - 451
Target Start/End: Original strand, 7683 - 7908
Alignment:
Q  225 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7683 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaataatgtttcaccactggtgaga 7782  T
Q  325 atatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttt 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7783 agatctcattgtagtcgatcccctccacttgattgaaacccttggccacaagtcttgctttgtatcttggaccttc-aacacccggaataccttcctttt 7881  T
Q  425 tcttgaagatccacttgcatccaacta 451  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7882 tcttgaagatccacttgcatccgacta 7908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 312
Target Start/End: Original strand, 7641 - 7678
Alignment:
Q  275 cacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7641 cacaatagccataagtatccttatggaataatgtttca 7678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 460
Target Start/End: Original strand, 161 - 455
Alignment:
Q  165 ttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagat 264  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  161 ttgtcttctacaaaaccttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagat 260  T
Q  265 tgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacc 364  Q
       |   ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  261 catacatattaacaatcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaaaatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaacc 360  T
Q  365 cttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgat 460  Q
    |||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||  || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  361 ctttactacaagtcttgctttataccttggtgcttc-gacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgat 455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0559 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0559
Description:

Target: scaffold0559; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5001 - 4835
Alignment:
Q  164 cttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaaga 263  Q
    ||||||||||||||||||   |  ||||||||| ||||||||||||||||  |  || |||||| |  |  ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5001 cttgtcctccacaaaacccattccttgctccatttagattgtctcttcaaaatatccatgtaaggacacaatcttcacatccatttattccaaatcaaga 4902  T
Q  264 ttgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatct 330  Q
    ||| ||| ||| |  |||  |||||||| ||||||  |||||||||| | ||| |||||||| ||||    
T  4901 ttgtattcattgaatataaacataagtacccttattaaacaatgttttaacactggtgagaaaatct 4835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University