View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3833_low_18 (Length: 231)

Name: NF3833_low_18
Description: NF3833
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3833_low_18
NF3833_low_18
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (1-231)||(9481688-9481922)
chr4 (1-231)||(1503149-1503383)
chr4 (1-231)||(43149436-43149670)
chr4 (1-231)||(11925349-11925583)
chr4 (1-231)||(24811605-24811839)
chr4 (1-231)||(5702795-5703030)
chr4 (1-229)||(19366230-19366462)
chr4 (1-231)||(4566284-4566520)
chr4 (1-231)||(6515712-6515948)
chr4 (1-231)||(40097397-40097633)
chr4 (1-231)||(40112408-40112644)
chr4 (1-231)||(5492339-5492573)
chr4 (1-231)||(21962716-21962951)
chr4 (1-231)||(21977966-21978201)
chr4 (1-231)||(24108200-24108434)
chr4 (1-231)||(24120849-24121083)
chr4 (1-231)||(54826433-54826666)
chr4 (1-231)||(3910366-3910602)
chr4 (1-231)||(36322038-36322273)
chr4 (1-231)||(36336247-36336482)
chr4 (1-231)||(36351337-36351572)
chr4 (1-231)||(4999065-4999300)
chr4 (1-231)||(5014144-5014379)
chr4 (1-231)||(18792352-18792585)
chr4 (1-231)||(18806980-18807213)
chr4 (1-231)||(54841651-54841884)
chr4 (1-231)||(763849-764085)
chr4 (1-231)||(14751223-14751458)
chr4 (1-231)||(14770337-14770572)
chr4 (1-231)||(20330199-20330434)
chr4 (3-231)||(31118341-31118574)
chr4 (3-231)||(31131290-31131523)
chr4 (5-231)||(5406214-5406440)
chr4 (1-231)||(21534297-21534531)
chr4 (1-231)||(39858878-39859109)
chr4 (1-231)||(6563070-6563305)
chr4 (1-231)||(6578104-6578339)
chr4 (1-231)||(15611529-15611763)
chr4 (1-231)||(48915289-48915523)
chr4 (1-231)||(39845268-39845499)
chr4 (1-231)||(30746781-30747016)
chr4 (1-231)||(30762086-30762321)
chr4 (1-231)||(34180785-34181019)
chr4 (1-231)||(40566714-40566948)
chr4 (1-231)||(14727427-14727663)
chr4 (1-231)||(33665508-33665744)
chr4 (1-231)||(33684320-33684556)
chr4 (1-231)||(24465412-24465644)
chr4 (5-231)||(14091767-14092000)
chr4 (5-231)||(14106869-14107102)
chr4 (1-231)||(33674708-33674942)
chr4 (1-112)||(27193923-27194039)
chr4 (150-231)||(695706-695787)
chr4 (177-231)||(27193825-27193880)
[»] chr3 (107 HSPs)
chr3 (1-231)||(26426137-26426371)
chr3 (1-231)||(8204752-8204986)
chr3 (1-231)||(8219921-8220155)
chr3 (1-231)||(47198167-47198401)
chr3 (1-231)||(31038252-31038486)
chr3 (1-231)||(26683494-26683729)
chr3 (1-231)||(4621333-4621567)
chr3 (1-231)||(4632337-4632571)
chr3 (1-231)||(5006676-5006911)
chr3 (1-231)||(5021935-5022170)
chr3 (1-231)||(21667910-21668144)
chr3 (1-231)||(21683116-21683350)
chr3 (1-231)||(31027831-31028065)
chr3 (3-231)||(29140461-29140693)
chr3 (3-231)||(29155266-29155498)
chr3 (1-231)||(3064611-3064845)
chr3 (1-231)||(5708365-5708599)
chr3 (1-231)||(5730178-5730412)
chr3 (1-231)||(32288561-32288796)
chr3 (1-231)||(32298848-32299083)
chr3 (1-231)||(30009552-30009790)
chr3 (1-231)||(6534492-6534728)
chr3 (1-231)||(6548324-6548560)
chr3 (1-231)||(22490188-22490423)
chr3 (1-231)||(5719275-5719509)
chr3 (1-231)||(5761956-5762190)
chr3 (1-231)||(12675764-12675999)
chr3 (1-231)||(16600827-16601061)
chr3 (1-231)||(20051992-20052225)
chr3 (1-231)||(28107772-28108007)
chr3 (1-231)||(28365230-28365464)
chr3 (1-231)||(32432170-32432403)
chr3 (1-231)||(32447456-32447689)
chr3 (1-231)||(20568605-20568841)
chr3 (1-231)||(20583734-20583970)
chr3 (1-229)||(28029551-28029784)
chr3 (1-231)||(7081344-7081579)
chr3 (1-231)||(7989800-7990035)
chr3 (1-231)||(10636305-10636540)
chr3 (1-231)||(10651283-10651518)
chr3 (1-231)||(20074652-20074885)
chr3 (1-231)||(28123008-28123243)
chr3 (1-231)||(28332271-28332505)
chr3 (1-231)||(28347373-28347607)
chr3 (1-231)||(47016641-47016876)
chr3 (1-231)||(47031555-47031790)
chr3 (1-229)||(28014232-28014466)
chr3 (1-231)||(7066392-7066627)
chr3 (1-231)||(43715659-43715894)
chr3 (1-231)||(4409914-4410148)
chr3 (1-231)||(4425294-4425528)
chr3 (1-231)||(5601128-5601362)
chr3 (1-231)||(5616369-5616603)
chr3 (1-231)||(18218159-18218394)
chr3 (1-231)||(18233467-18233702)
chr3 (1-231)||(31956273-31956507)
chr3 (1-231)||(31971550-31971784)
chr3 (1-231)||(51775150-51775388)
chr3 (1-231)||(51790236-51790474)
chr3 (1-231)||(5518772-5519007)
chr3 (1-231)||(10387003-10387237)
chr3 (1-231)||(17976454-17976689)
chr3 (1-231)||(17992002-17992237)
chr3 (1-231)||(26336767-26337001)
chr3 (1-231)||(50141090-50141324)
chr3 (1-222)||(1774737-1774962)
chr3 (1-231)||(26681615-26681851)
chr3 (1-231)||(4338449-4338684)
chr3 (1-231)||(5460185-5460420)
chr3 (1-231)||(5475291-5475526)
chr3 (1-231)||(6225368-6225592)
chr3 (1-231)||(18284126-18284361)
chr3 (1-231)||(18299426-18299661)
chr3 (1-231)||(18314727-18314962)
chr3 (1-231)||(22769867-22770102)
chr3 (1-231)||(10404377-10404611)
chr3 (1-231)||(11117286-11117522)
chr3 (1-231)||(4353590-4353825)
chr3 (1-231)||(24321083-24321318)
chr3 (1-231)||(24336450-24336685)
chr3 (1-231)||(48458851-48459085)
chr3 (1-231)||(16402178-16402414)
chr3 (1-231)||(17968271-17968505)
chr3 (1-231)||(17998751-17998985)
chr3 (1-231)||(48474610-48474844)
chr3 (1-228)||(8579710-8579944)
chr3 (30-231)||(45187431-45187631)
chr3 (1-231)||(37004164-37004399)
chr3 (1-231)||(11102191-11102429)
chr3 (5-231)||(22862568-22862801)
chr3 (5-231)||(22877727-22877960)
chr3 (5-231)||(22892786-22893019)
chr3 (1-231)||(27142288-27142521)
chr3 (1-231)||(18250937-18251179)
chr3 (1-192)||(18216781-18216976)
chr3 (72-231)||(22120699-22120858)
chr3 (1-147)||(29657385-29657537)
chr3 (1-147)||(29672029-29672181)
chr3 (1-115)||(5588014-5588133)
chr3 (1-115)||(5622235-5622354)
chr3 (134-231)||(26294025-26294122)
chr3 (177-231)||(29657544-29657598)
chr3 (177-231)||(29672188-29672242)
chr3 (139-231)||(5588130-5588218)
chr3 (139-231)||(5622351-5622439)
chr3 (30-85)||(25009108-25009163)
chr3 (199-231)||(18216731-18216763)
[»] chr2 (77 HSPs)
chr2 (1-231)||(267819-268053)
chr2 (1-231)||(252289-252523)
chr2 (5-231)||(16861817-16862047)
chr2 (1-231)||(19408239-19408474)
chr2 (1-231)||(19423239-19423474)
chr2 (1-231)||(40226777-40227011)
chr2 (1-231)||(40241836-40242070)
chr2 (1-231)||(19556925-19557161)
chr2 (1-231)||(27212534-27212770)
chr2 (1-231)||(16158781-16159015)
chr2 (1-231)||(16169671-16169905)
chr2 (1-231)||(32042810-32043045)
chr2 (1-231)||(32058006-32058241)
chr2 (1-231)||(34272333-34272567)
chr2 (1-231)||(34299340-34299574)
chr2 (1-231)||(13928370-13928603)
chr2 (1-231)||(13943566-13943799)
chr2 (1-231)||(31869270-31869505)
chr2 (1-231)||(31884463-31884698)
chr2 (1-229)||(16963935-16964167)
chr2 (4-231)||(25911274-25911507)
chr2 (1-231)||(16032699-16032935)
chr2 (1-231)||(31895981-31896223)
chr2 (1-228)||(27113793-27114023)
chr2 (1-228)||(27124758-27124988)
chr2 (1-231)||(34802775-34803010)
chr2 (1-231)||(19550638-19550872)
chr2 (1-231)||(37918688-37918923)
chr2 (1-231)||(37933626-37933861)
chr2 (1-231)||(31865790-31866034)
chr2 (1-231)||(34279989-34280226)
chr2 (1-231)||(21668936-21669171)
chr2 (1-231)||(21683937-21684172)
chr2 (1-231)||(12581076-12581312)
chr2 (1-231)||(12595068-12595304)
chr2 (1-231)||(15708150-15708388)
chr2 (1-231)||(2729387-2729620)
chr2 (1-231)||(22919907-22920141)
chr2 (1-231)||(22933017-22933251)
chr2 (4-231)||(34152361-34152593)
chr2 (4-231)||(34163217-34163449)
chr2 (1-231)||(39043632-39043868)
chr2 (1-231)||(39058966-39059202)
chr2 (1-231)||(34869879-34870114)
chr2 (1-231)||(37368134-37368358)
chr2 (1-231)||(37385968-37386192)
chr2 (5-231)||(37943628-37943857)
chr2 (1-229)||(16821094-16821327)
chr2 (1-229)||(16876245-16876478)
chr2 (1-231)||(27770514-27770749)
chr2 (1-231)||(27784473-27784708)
chr2 (1-231)||(34854836-34855071)
chr2 (1-231)||(3779975-3780209)
chr2 (9-231)||(37677665-37677891)
chr2 (9-231)||(37692930-37693156)
chr2 (9-231)||(37708194-37708420)
chr2 (1-231)||(10984356-10984593)
chr2 (1-231)||(39883164-39883401)
chr2 (1-231)||(39898740-39898977)
chr2 (1-231)||(31474125-31474358)
chr2 (1-231)||(3792247-3792482)
chr2 (1-231)||(12708320-12708555)
chr2 (1-231)||(12723719-12723954)
chr2 (1-231)||(33842755-33842993)
chr2 (5-231)||(11626953-11627185)
chr2 (1-231)||(34184883-34185119)
chr2 (5-231)||(11648150-11648382)
chr2 (1-117)||(5798788-5798909)
chr2 (1-147)||(9341875-9342027)
chr2 (1-147)||(9356881-9357033)
chr2 (5-147)||(27796869-27797017)
chr2 (5-147)||(27811958-27812106)
chr2 (177-231)||(9342034-9342088)
chr2 (177-231)||(9357040-9357094)
chr2 (177-231)||(27796808-27796862)
chr2 (177-231)||(27811897-27811951)
chr2 (203-231)||(5798562-5798590)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (2-231)||(36567860-36568093)
chr1 (1-231)||(28147791-28148025)
chr1 (1-231)||(47765582-47765816)
chr1 (1-231)||(3649471-3649705)
chr1 (1-231)||(28158266-28158500)
chr1 (1-231)||(36765309-36765543)
chr1 (1-231)||(30729124-30729359)
chr1 (1-231)||(13768888-13769122)
chr1 (1-231)||(14892701-14892935)
chr1 (1-231)||(14415594-14415828)
chr1 (1-231)||(28578030-28578265)
chr1 (1-231)||(28593456-28593691)
chr1 (1-231)||(47199927-47200163)
chr1 (1-231)||(41785101-41785337)
chr1 (1-231)||(41800369-41800605)
chr1 (1-231)||(47354758-47354992)
chr1 (1-231)||(16185999-16186235)
chr1 (1-231)||(51632916-51633151)
chr1 (1-231)||(51646355-51646590)
chr1 (1-231)||(10933161-10933385)
chr1 (1-231)||(10970958-10971182)
chr1 (9-231)||(10934155-10934378)
chr1 (9-231)||(10953346-10953569)
chr1 (5-147)||(16560109-16560257)
chr1 (1-112)||(9077800-9077916)
chr1 (119-231)||(37877156-37877267)
chr1 (177-231)||(16560264-16560318)
chr1 (199-231)||(36083508-36083540)
chr1 (195-226)||(46197320-46197351)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (1-231)||(3715281-3715515)
chr8 (1-231)||(9349930-9350164)
chr8 (1-231)||(18687882-18688116)
chr8 (1-231)||(5565768-5566002)
chr8 (1-231)||(15777083-15777317)
chr8 (1-231)||(15766669-15766903)
chr8 (1-231)||(3986890-3987124)
chr8 (1-231)||(21924513-21924747)
chr8 (1-231)||(40009450-40009685)
chr8 (1-231)||(28353820-28354054)
chr8 (1-231)||(28369005-28369239)
chr8 (1-231)||(33266986-33267221)
chr8 (1-231)||(9363209-9363444)
chr8 (1-231)||(6054820-6055054)
chr8 (1-231)||(31348927-31349161)
chr8 (1-231)||(31362727-31362961)
chr8 (1-231)||(33251784-33252018)
chr8 (1-231)||(19667411-19667644)
chr8 (1-231)||(19682773-19683006)
chr8 (1-231)||(29823982-29824216)
chr8 (1-231)||(29837705-29837939)
chr8 (1-231)||(31481543-31481778)
chr8 (1-231)||(31496687-31496922)
chr8 (1-231)||(4488030-4488263)
chr8 (1-231)||(3336479-3336713)
chr8 (9-231)||(44569239-44569466)
chr8 (1-231)||(3339296-3339530)
chr8 (1-231)||(12084467-12084701)
chr8 (1-231)||(12099712-12099946)
chr8 (1-231)||(19200171-19200407)
chr8 (1-231)||(19215226-19215462)
chr8 (1-231)||(15904773-15905007)
chr8 (119-231)||(21576669-21576780)
chr8 (119-231)||(19296285-19296395)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (5-231)||(26428235-26428465)
chr7 (1-231)||(7233706-7233940)
chr7 (5-231)||(26443673-26443903)
chr7 (1-231)||(5134907-5135141)
chr7 (1-231)||(31082153-31082388)
chr7 (1-231)||(31094082-31094317)
chr7 (30-231)||(45728869-45729069)
chr7 (30-231)||(45739771-45739971)
chr7 (1-231)||(45380558-45380793)
chr7 (1-231)||(45395413-45395648)
chr7 (1-231)||(4196746-4196978)
chr7 (1-231)||(4207568-4207800)
chr7 (1-231)||(21995766-21996001)
chr7 (1-231)||(16714011-16714245)
chr7 (1-231)||(17688247-17688481)
chr7 (1-231)||(18537024-18537258)
chr7 (1-231)||(18547532-18547766)
chr7 (1-231)||(33000158-33000394)
chr7 (1-231)||(39352604-39352846)
chr7 (9-227)||(1593085-1593309)
chr7 (1-231)||(16160155-16160390)
chr7 (1-231)||(5138983-5139217)
chr7 (1-231)||(4137011-4137245)
chr7 (1-231)||(4151937-4152171)
chr7 (1-231)||(5152256-5152490)
chr7 (1-231)||(31118033-31118267)
chr7 (1-231)||(31132208-31132442)
chr7 (1-231)||(4272593-4272828)
chr7 (1-231)||(11028718-11028953)
chr7 (1-231)||(3058056-3058290)
chr7 (1-231)||(10834758-10834991)
chr7 (1-231)||(21474520-21474755)
chr7 (1-231)||(31556054-31556288)
chr7 (1-231)||(31571043-31571277)
chr7 (1-231)||(9613289-9613526)
chr7 (1-231)||(9840860-9841097)
chr7 (1-231)||(2583760-2583995)
chr7 (1-231)||(16743226-16743461)
chr7 (1-231)||(17516675-17516910)
chr7 (1-231)||(17536304-17536539)
chr7 (1-231)||(24584247-24584482)
chr7 (1-231)||(24893702-24893937)
chr7 (1-231)||(26695082-26695320)
chr7 (1-231)||(26499827-26500062)
chr7 (1-231)||(26597967-26598202)
chr7 (1-231)||(11434763-11434996)
chr7 (1-231)||(11449022-11449255)
chr7 (1-231)||(39994151-39994386)
chr7 (1-231)||(3438529-3438763)
chr7 (1-231)||(3453652-3453886)
chr7 (1-231)||(26521053-26521288)
chr7 (1-231)||(26690497-26690733)
chr7 (1-231)||(26661625-26661861)
chr7 (1-231)||(26676817-26677053)
chr7 (1-231)||(26686598-26686834)
chr7 (1-231)||(26311517-26311749)
chr7 (1-231)||(26266555-26266790)
chr7 (1-231)||(26326587-26326822)
chr7 (5-147)||(2769609-2769757)
chr7 (5-147)||(2781662-2781810)
chr7 (177-231)||(2769548-2769602)
chr7 (177-231)||(2781601-2781655)
chr7 (200-231)||(4677464-4677495)
chr7 (201-231)||(26592651-26592681)
[»] chr6 (84 HSPs)
chr6 (1-231)||(21169981-21170215)
chr6 (1-231)||(26782072-26782306)
chr6 (1-231)||(26794044-26794278)
chr6 (1-231)||(5245053-5245287)
chr6 (1-231)||(14136720-14136954)
chr6 (1-231)||(14148791-14149025)
chr6 (5-231)||(20214717-20214947)
chr6 (5-231)||(22108740-22108970)
chr6 (1-231)||(27282332-27282566)
chr6 (1-231)||(28979154-28979388)
chr6 (1-231)||(4451796-4452031)
chr6 (1-231)||(24049562-24049798)
chr6 (1-231)||(27037407-27037641)
chr6 (1-231)||(27065749-27065982)
chr6 (1-231)||(29542438-29542673)
chr6 (1-231)||(8190852-8191087)
chr6 (1-231)||(29557847-29558082)
chr6 (1-231)||(31543628-31543863)
chr6 (1-231)||(3690828-3691062)
chr6 (1-231)||(2651883-2652118)
chr6 (1-231)||(33367738-33367972)
chr6 (1-231)||(33379020-33379254)
chr6 (1-231)||(16935857-16936092)
chr6 (1-231)||(16950966-16951201)
chr6 (1-231)||(27353279-27353515)
chr6 (1-231)||(27365390-27365626)
chr6 (1-231)||(27455737-27455973)
chr6 (1-231)||(27621010-27621247)
chr6 (1-231)||(27636620-27636857)
chr6 (1-231)||(13515985-13516220)
chr6 (1-231)||(13526888-13527123)
chr6 (1-231)||(26664374-26664607)
chr6 (1-231)||(26770345-26770578)
chr6 (1-231)||(26799913-26800146)
chr6 (1-231)||(27478056-27478290)
chr6 (1-231)||(27493311-27493545)
chr6 (1-231)||(13776568-13776804)
chr6 (1-231)||(4518339-4518573)
chr6 (1-231)||(4533526-4533760)
chr6 (1-231)||(7985586-7985821)
chr6 (1-231)||(8896904-8897138)
chr6 (1-231)||(8908139-8908373)
chr6 (1-231)||(28200626-28200860)
chr6 (1-231)||(28215694-28215928)
chr6 (1-231)||(30549714-30549949)
chr6 (1-231)||(30564977-30565212)
chr6 (61-231)||(4219258-4219427)
chr6 (5-231)||(17018480-17018713)
chr6 (1-231)||(16562584-16562819)
chr6 (1-231)||(16667107-16667342)
chr6 (1-231)||(22002728-22002962)
chr6 (1-230)||(4537499-4537734)
chr6 (1-231)||(4765985-4766218)
chr6 (1-231)||(4786945-4787178)
chr6 (1-231)||(26108133-26108367)
chr6 (1-231)||(26123365-26123599)
chr6 (1-231)||(16682389-16682624)
chr6 (5-231)||(34456109-34456340)
chr6 (1-231)||(27202547-27202781)
chr6 (1-231)||(4731134-4731368)
chr6 (1-227)||(4551366-4551598)
chr6 (5-231)||(34470397-34470628)
chr6 (1-231)||(29565917-29566153)
chr6 (1-231)||(29581323-29581559)
chr6 (1-231)||(27246451-27246686)
chr6 (1-231)||(27258314-27258549)
chr6 (72-231)||(16743689-16743847)
chr6 (1-231)||(29494312-29494544)
chr6 (1-231)||(29509650-29509882)
chr6 (1-231)||(27190691-27190927)
chr6 (72-227)||(16762101-16762255)
chr6 (9-231)||(27000693-27000910)
chr6 (9-231)||(27016198-27016415)
chr6 (69-231)||(7229189-7229352)
chr6 (1-231)||(4754414-4754648)
chr6 (1-231)||(4781144-4781378)
chr6 (1-115)||(27295005-27295124)
chr6 (199-231)||(31922245-31922277)
chr6 (195-226)||(16995966-16995997)
chr6 (195-226)||(27211084-27211115)
chr6 (195-226)||(27238113-27238144)
chr6 (195-226)||(27309443-27309474)
chr6 (30-85)||(5994768-5994821)
chr6 (30-85)||(25550364-25550417)
[»] chr5 (93 HSPs)
chr5 (1-231)||(31583759-31583993)
chr5 (1-231)||(33285844-33286078)
chr5 (1-231)||(33300894-33301128)
chr5 (3-231)||(42066282-42066514)
chr5 (1-231)||(37209508-37209744)
chr5 (1-231)||(40480171-40480407)
chr5 (1-231)||(12057515-12057749)
chr5 (1-231)||(18120161-18120395)
chr5 (1-231)||(18130541-18130775)
chr5 (1-231)||(28951403-28951638)
chr5 (1-231)||(28967627-28967862)
chr5 (1-231)||(32598455-32598690)
chr5 (1-229)||(42135865-42136097)
chr5 (1-231)||(40465273-40465509)
chr5 (9-231)||(41668140-41668367)
chr5 (9-231)||(41682946-41683173)
chr5 (1-231)||(3782556-3782790)
chr5 (1-231)||(3797911-3798145)
chr5 (1-231)||(13176931-13177165)
chr5 (1-231)||(29973989-29974224)
chr5 (1-231)||(30022418-30022653)
chr5 (1-231)||(30037682-30037917)
chr5 (1-231)||(9542396-9542630)
chr5 (1-231)||(9555268-9555502)
chr5 (1-231)||(2503988-2504222)
chr5 (1-231)||(2519308-2519542)
chr5 (1-231)||(13189276-13189510)
chr5 (1-231)||(13434269-13434504)
chr5 (1-231)||(13445163-13445398)
chr5 (1-231)||(28571520-28571754)
chr5 (1-231)||(37350279-37350513)
chr5 (1-231)||(37663113-37663348)
chr5 (1-231)||(37678396-37678631)
chr5 (1-231)||(5341107-5341341)
chr5 (1-231)||(6867427-6867661)
chr5 (1-231)||(6882551-6882785)
chr5 (1-231)||(8657168-8657403)
chr5 (1-231)||(8672142-8672377)
chr5 (1-231)||(30145013-30145248)
chr5 (1-231)||(30160224-30160459)
chr5 (1-231)||(33872405-33872640)
chr5 (1-231)||(33883308-33883543)
chr5 (1-227)||(34609705-34609935)
chr5 (1-227)||(34624822-34625052)
chr5 (1-231)||(37365328-37365562)
chr5 (1-231)||(23394987-23395221)
chr5 (1-231)||(37725051-37725286)
chr5 (1-231)||(33509380-33509615)
chr5 (1-231)||(33524643-33524878)
chr5 (1-231)||(15650426-15650662)
chr5 (1-231)||(15665802-15666038)
chr5 (1-231)||(32587942-32588179)
chr5 (1-231)||(32606371-32606608)
chr5 (1-231)||(11331883-11332119)
chr5 (1-231)||(26446521-26446756)
chr5 (1-231)||(31424418-31424654)
chr5 (1-231)||(31439756-31439992)
chr5 (1-231)||(37743957-37744191)
chr5 (1-231)||(37748107-37748341)
chr5 (1-231)||(37763353-37763587)
chr5 (1-231)||(37778039-37778273)
chr5 (1-231)||(30142747-30142983)
chr5 (1-231)||(30176797-30177033)
chr5 (1-231)||(9310464-9310698)
chr5 (1-231)||(9325723-9325957)
chr5 (1-231)||(18367199-18367436)
chr5 (1-231)||(18382238-18382475)
chr5 (1-231)||(18492373-18492610)
chr5 (31-227)||(25639859-25640054)
chr5 (1-231)||(28657567-28657802)
chr5 (1-231)||(27288866-27289100)
chr5 (1-231)||(11321094-11321331)
chr5 (1-231)||(18507688-18507924)
chr5 (1-231)||(28642161-28642397)
chr5 (1-231)||(43071227-43071461)
chr5 (1-231)||(43086514-43086748)
chr5 (1-231)||(5631119-5631355)
chr5 (1-231)||(5645993-5646229)
chr5 (1-231)||(24716868-24717103)
chr5 (1-231)||(24732328-24732563)
chr5 (1-231)||(12125168-12125400)
chr5 (1-231)||(12140421-12140653)
chr5 (1-231)||(24674340-24674576)
chr5 (1-231)||(13316428-13316663)
chr5 (1-231)||(13331755-13331990)
chr5 (1-231)||(15750592-15750825)
chr5 (1-231)||(15765820-15766053)
chr5 (5-231)||(24787189-24787418)
chr5 (14-231)||(31818097-31818318)
chr5 (14-231)||(31833127-31833348)
chr5 (1-89)||(29893729-29893822)
chr5 (1-85)||(26473553-26473642)
chr5 (1-85)||(26488602-26488691)
[»] scaffold0418 (2 HSPs)
scaffold0418 (1-231)||(4034-4268)
scaffold0418 (5-231)||(14324-14555)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (1-231)||(2134-2368)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-231)||(26103-26338)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-231)||(46506-46741)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (1-231)||(90824-91059)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (1-231)||(22269-22505)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-231)||(14243-14479)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-231)||(12172-12405)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (1-231)||(57062-57300)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (1-231)||(1124-1358)
scaffold0038 (1-231)||(16192-16426)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (1-231)||(131368-131603)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (1-222)||(14398-14623)
[»] scaffold0279 (1 HSPs)
scaffold0279 (3-231)||(10157-10389)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (5-231)||(20519-20752)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-227)||(944-1174)
scaffold0159 (1-231)||(14355-14590)
[»] scaffold0580 (1 HSPs)
scaffold0580 (1-231)||(7149-7385)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-231)||(1322-1556)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (1-179)||(85641-85823)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (1-231)||(11748-11982)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (2-160)||(1222-1385)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (5-231)||(29572-29801)
[»] scaffold0489 (1 HSPs)
scaffold0489 (61-231)||(3749-3920)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (96-231)||(3916-4053)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (106-231)||(1-125)
[»] scaffold0792 (2 HSPs)
scaffold0792 (1-115)||(2412-2531)
scaffold0792 (139-231)||(2528-2616)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (1-117)||(5567-5689)
[»] scaffold1760 (1 HSPs)
scaffold1760 (1-112)||(1-117)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (169-231)||(1-63)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (177-231)||(15-69)
[»] scaffold0603 (1 HSPs)
scaffold0603 (1-84)||(1270-1358)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (164-231)||(6875-6943)
[»] scaffold1901 (1 HSPs)
scaffold1901 (1-51)||(1200-1255)
[»] scaffold1179 (1 HSPs)
scaffold1179 (1-51)||(2469-2524)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (198-231)||(22621-22654)
[»] scaffold1803 (1 HSPs)
scaffold1803 (1-29)||(14-42)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 9481688 - 9481922
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9481688 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 9481787  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9481788 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 9481886  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9481887 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 9481922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 1503149 - 1503383
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1503149 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 1503248  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  1503249 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 1503347  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1503348 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 1503383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43149670 - 43149436
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43149670 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 43149571  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  43149570 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 43149472  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43149471 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 43149436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11925583 - 11925349
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11925583 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 11925484  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11925483 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 11925385  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11925384 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 11925349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24811605 - 24811839
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24811605 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 24811704  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24811705 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 24811803  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24811804 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 24811839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5703030 - 5702795
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5703030 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5702931  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5702930 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcgaatttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatga 5702831  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5702830 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5702795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19366462 - 19366230
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19366462 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 19366363  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  19366362 ctaaaaatgacctcaacagattcaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 19366264  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 229  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19366263 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 19366230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4566284 - 4566520
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4566284 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaatttttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4566383  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4566384 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgactctgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatg 4566483  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4566484 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4566520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 6515712 - 6515948
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6515712 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 6515811  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaa-tgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  6515812 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattggcttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatttttaaaaatc 6515911  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6515912 aatctgaaaagactcagagacagtcgcaaggatgaaa 6515948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 40097397 - 40097633
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40097397 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctacgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 40097496  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40097497 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagactctgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatg 40097596  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40097597 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 40097633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 40112408 - 40112644
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40112408 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctacgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 40112507  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40112508 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagactctgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatg 40112607  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40112608 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 40112644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5492573 - 5492339
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5492573 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5492474  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  5492473 ctaaagatgacataaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 5492375  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5492374 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5492339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21962951 - 21962716
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21962951 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcccaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 21962852  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21962851 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcgaatttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatga 21962752  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21962751 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 21962716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21978201 - 21977966
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21978201 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcccaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 21978102  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21978101 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcgaatttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatga 21978002  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21978001 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 21977966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24108434 - 24108200
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24108434 gacaaagcggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatcttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 24108335  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  24108334 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 24108236  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24108235 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 24108200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24121083 - 24120849
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24121083 gacaaagcggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatcttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 24120984  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  24120983 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 24120885  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24120884 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 24120849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 54826666 - 54826433
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54826666 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 54826567  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  54826566 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 54826469  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54826468 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 54826433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3910602 - 3910366
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3910602 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 3910503  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3910502 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgactctgacactgactcagatgcgagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaaagttaaaaatg 3910403  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3910402 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 3910366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 36322038 - 36322273
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36322038 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 36322137  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||      
T  36322138 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacaccgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgataaagtgtaaaaaaaac 36322236  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36322237 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 36322273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 36336247 - 36336482
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36336247 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 36336346  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||      
T  36336347 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacaccgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgataaagtgtaaaaaaaac 36336445  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36336446 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 36336482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 36351337 - 36351572
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36351337 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 36351436  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||      
T  36351437 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacaccgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgataaagtgtaaaaaaaac 36351535  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36351536 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 36351572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4999300 - 4999065
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  4999300 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcacgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4999201  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  4999200 ctaaaattgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgtttaaaaata 4999101  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4999100 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4999065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5014379 - 5014144
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  5014379 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcacgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5014280  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  5014279 ctaaaattgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgtttaaaaata 5014180  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5014179 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5014144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18792352 - 18792585
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18792352 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctgtgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 18792451  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  |    
T  18792452 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatggaatg-taaaaaaca 18792549  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18792550 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 18792585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18806980 - 18807213
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806980 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctgtgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 18807079  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  |    
T  18807080 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatggaatg-taaaaaaca 18807177  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18807178 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 18807213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 54841884 - 54841651
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54841884 gacaaaacggactaaaacgaaccaatagcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtaaaatgaccaaaatgcccctaggg 54841785  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  54841784 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 54841687  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54841686 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 54841651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 763849 - 764085
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  763849 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 763948  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagttt-gaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  763949 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagttttgaaatgaatttaa-caaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaa 764047  T
Q  195 a-atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  764048 ccatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 764085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14751223 - 14751458
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14751223 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccgaaatgcccctaggg 14751322  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  14751323 ctaaaaatgtcctaaacagattcaaattggcttgacactgactcagatgcgagtttgaaataaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 14751421  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14751422 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 14751458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14770337 - 14770572
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14770337 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccgaaatgcccctaggg 14770436  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  14770437 ctaaaaatgtcctaaacagattcaaattggcttgacactgactcagatgcgagtttgaaataaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 14770535  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14770536 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 14770572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 20330199 - 20330434
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20330199 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 20330298  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt-aaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||      
T  20330299 ctaaaaatgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagcttgaaatgaattt-aacagggtttactgatgaaatgttaaaaaaac 20330397  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20330398 aatctggaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 20330434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 31118341 - 31118574
Alignment:
Q  3 caaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31118341 caaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct 31118440  T
Q  98 aaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaat 197  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||    
T  31118441 aaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacgctgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaaataat 31118540  T
Q  198 ttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31118541 ctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 31118574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 31131290 - 31131523
Alignment:
Q  3 caaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31131290 caaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct 31131389  T
Q  98 aaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaat 197  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||    
T  31131390 aaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacgctgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaaataat 31131489  T
Q  198 ttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31131490 ctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 31131523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 5406214 - 5406440
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5406214 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 5406313  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaattt 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||  ||| |    
T  5406314 aaatgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaat----aaaaacaatct 5406408  T
Q  200 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5406409 gaaaagactcagagacagttacaaggatgaaa 5406440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21534297 - 21534531
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21534297 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 21534396  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  21534397 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaatttcaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaa--a 21534494  T
Q  196 atttga-aaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21534495 ttctgagaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 21534531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39859109 - 39858878
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39859109 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtg--aaatgaccaaaatgcccctaggg 39859012  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||  |    
T  39859011 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaa---taaaaaaca 39858916  T
Q  196 atttg--aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39858915 atctgaaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 39858878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6563305 - 6563070
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6563305 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgcgaaatgaccaaaatgcccctaggg 6563206  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  |    
T  6563205 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaat-aattttaacaaggtttactgacgaaaggttaaaaaaca 6563107  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6563106 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 6563070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6578339 - 6578104
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6578339 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgcgaaatgaccaaaatgcccctaggg 6578240  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  |    
T  6578239 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaat-aattttaacaaggtttactgacgaaaggttaaaaaaca 6578141  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6578140 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 6578104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15611529 - 15611763
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15611529 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 15611628  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15611629 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttaaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 15611727  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15611728 atttaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 15611763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48915523 - 48915289
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48915523 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgtcaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 48915424  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  48915423 ctaaaaatgacctaaacagagccaaaatgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 48915325  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48915324 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 48915289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39845499 - 39845268
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39845499 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtg--aaatgaccaaaatgcccctaggg 39845402  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||  |    
T  39845401 ctaaaaatgacctgaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaa---taaaaaaca 39845306  T
Q  196 atttg--aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39845305 atctgaaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 39845268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30747016 - 30746781
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30747016 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtatttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 30746917  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  30746916 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 30746818  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30746817 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 30746781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30762321 - 30762086
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30762321 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtatttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 30762222  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  30762221 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 30762123  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30762122 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 30762086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 34180785 - 34181019
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34180785 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 34180884  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  34180885 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacctgacgctgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaatgtttaaaaaca 34180983  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34180984 aactgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 34181019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 40566714 - 40566948
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40566714 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 40566813  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  40566814 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacctgacgctgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaatgtttaaaaaca 40566912  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40566913 aactgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 40566948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14727663 - 14727427
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14727663 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 14727564  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt--aaaaat 193  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| |||  |||||     
T  14727563 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacgctgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaacgttaaaaaaaa 14727465  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14727464 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 14727427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 33665508 - 33665744
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33665508 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgtcaaaattttgtgtgaaatgaccaaagtgcccctaggg 33665607  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt--taaaaat 193  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||     
T  33665608 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaaa 33665706  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33665707 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 33665744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 33684320 - 33684556
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33684320 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgtcaaaattttgtgtgaaatgaccaaagtgcccctaggg 33684419  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt--taaaaat 193  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||     
T  33684420 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaaa 33684518  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33684519 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 33684556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24465412 - 24465644
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24465412 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 24465511  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||  ||||    ||||||||    
T  24465512 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactg--gaaagtaaaaaaatga 24465608  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24465609 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 24465644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14092000 - 14091767
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct-a 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14092000 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaattttgcgtgaaatgaccaaaatgcccctagggttga 14091901  T
Q  99 aaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaa--aatgaa 196  Q
    ||||||||||||||||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||    
T  14091900 aaaacgacctaaacagactcaagtcgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatg-attttaacaaggtttactgatgaaatgtaaaaagaatcaa 14091802  T
Q  197 tttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14091801 tttgaaaagactcaaagacagccacaaggatgaaa 14091767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14107102 - 14106869
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct-a 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14107102 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaattttgcgtgaaatgaccaaaatgcccctagggttga 14107003  T
Q  99 aaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaa--aatgaa 196  Q
    ||||||||||||||||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||    
T  14107002 aaaacgacctaaacagactcaagtcgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatg-attttaacaaggtttactgatgaaatgtaaaaagaatcaa 14106904  T
Q  197 tttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14106903 tttgaaaagactcaaagacagccacaaggatgaaa 14106869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33674942 - 33674708
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33674942 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccttaggg 33674843  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||   |    
T  33674842 ctaaaaacgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgctgaaatgttaaaacata 33674744  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33674743 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 33674708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 27194039 - 27193923
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27194039 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27193940  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaac 112  Q
    ||||||| |||||||||    
T  27193939 ctaaaaatgacctaaac 27193923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 231
Target Start/End: Original strand, 695706 - 695787
Alignment:
Q  150 ttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga-atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  695706 ttgaaatgaatttaa-caaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaaccatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 695787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27193880 - 27193825
Alignment:
Q  177 gatgaaatgttaaaaa-tgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27193880 gatgaaatgttaaaaaatgaatttgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 27193825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 107)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26426371 - 26426137
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26426371 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26426272  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26426271 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 26426173  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26426172 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26426137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8204986 - 8204752
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8204986 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgactaaaatgcccctaggg 8204887  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8204886 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaagca 8204788  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8204787 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 8204752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8220155 - 8219921
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8220155 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgactaaaatgcccctaggg 8220056  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8220055 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaagca 8219957  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8219956 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 8219921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 47198167 - 47198401
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47198167 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 47198266  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  47198267 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 47198365  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47198366 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 47198401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31038252 - 31038486
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31038252 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31038351  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31038352 ctaaaaatgacttaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 31038450  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31038451 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 31038486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26683729 - 26683494
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26683729 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggtttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26683630  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt-aaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26683629 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaatc 26683531  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26683530 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26683494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4621567 - 4621333
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4621567 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4621468  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4621467 ctaaaaatgacctaaacagattcaaactgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 4621369  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4621368 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4621333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4632571 - 4632337
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4632571 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4632472  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4632471 ctaaaaatgacctaaacagattcaaactgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 4632373  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4632372 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4632337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5006911 - 5006676
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5006911 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5006812  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5006811 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcgaatttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatga 5006712  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5006711 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5006676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5022170 - 5021935
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5022170 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5022071  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5022070 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcgaatttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatga 5021971  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5021970 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5021935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21668144 - 21667910
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21668144 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 21668045  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21668044 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattggcttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatattaaaaatca 21667946  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21667945 atctgaaaagactcagagacagtcgcaaggatgaaa 21667910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21683350 - 21683116
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21683350 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 21683251  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21683250 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattggcttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatattaaaaatca 21683152  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21683151 atctgaaaagactcagagacagtcgcaaggatgaaa 21683116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31027831 - 31028065
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31027831 gacaaaacggactaaaacgaaccaatagcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31027930  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31027931 ctaaaaatgacttaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 31028029  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31028030 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 31028065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 29140461 - 29140693
Alignment:
Q  3 caaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29140461 caaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct 29140560  T
Q  98 aaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaat 197  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29140561 aaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatcaat 29140659  T
Q  198 ttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29140660 ctgaaaagattcagagaccgtcacaaggatgaaa 29140693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 29155266 - 29155498
Alignment:
Q  3 caaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29155266 caaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct 29155365  T
Q  98 aaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaat 197  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29155366 aaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatcaat 29155464  T
Q  198 ttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29155465 ctgaaaagattcagagaccgtcacaaggatgaaa 29155498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3064845 - 3064611
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3064845 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 3064746  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |    
T  3064745 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaagtgtaaaaaaaca 3064647  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3064646 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 3064611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5708599 - 5708365
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5708599 gacaaaacggactaaaacgaaccaacggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5708500  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  5708499 ctaaaaatgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacagggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 5708401  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5708400 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5708365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5730412 - 5730178
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5730412 gacaaaacggactaaaacgaaccaacggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5730313  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  5730312 ctaaaaatgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacagggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 5730214  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5730213 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5730178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32288796 - 32288561
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32288796 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaatttttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 32288697  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32288696 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcggacgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatga 32288597  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32288596 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 32288561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32299083 - 32298848
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32299083 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaatttttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 32298984  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32298983 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcggacgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatga 32298884  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32298883 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 32298848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30009552 - 30009790
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30009552 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 30009651  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt----aaaa 191  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  30009652 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaaa 30009750  T
Q  192 atgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30009751 atcaatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 30009790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 6534492 - 6534728
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6534492 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 6534591  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaatg 194  Q
    ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  6534592 ctaaaattgacctaaacagattcgaattgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgtttaaaaatc 6534691  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6534692 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 6534728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 6548324 - 6548560
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6548324 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 6548423  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaatg 194  Q
    ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  6548424 ctaaaattgacctaaacagattcgaattgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgtttaaaaatc 6548523  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6548524 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 6548560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22490423 - 22490188
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22490423 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 22490324  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  22490323 ctaaaaatgacctaatcagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 22490225  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22490224 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 22490188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5719509 - 5719275
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5719509 gacaaaacggactaaaacgaaccaacggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctataccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5719410  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  5719409 ctaaaaatgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacagggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 5719311  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5719310 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5719275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5761956 - 5762190
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5761956 gacaaaacggactaaaacgaaccaacggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctataccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5762055  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  5762056 ctaaaaatgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacagggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 5762154  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5762155 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5762190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12675764 - 12675999
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12675764 gacaagacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 12675863  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12675864 ctaaaaatgacctaaacgtattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaaggttaaaaatca 12675962  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12675963 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 12675999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16601061 - 16600827
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16601061 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 16600962  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  16600961 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacctgacgctgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaagatttactgatgaaatgttaaaaatca 16600863  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16600862 atctgaaaagactcagagacagtcgcaaggatgaaa 16600827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20052225 - 20051992
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20052225 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagag 20052126  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20052125 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgtcactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtt-aaaatca 20052028  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20052027 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 20051992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28107772 - 28108007
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28107772 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28107871  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |    
T  28107872 ctaaaattgacctaaacagattgaaatggacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaagtgtttaaaaata 28107971  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28107972 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28108007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28365230 - 28365464
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28365230 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28365329  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  28365330 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgactcaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 28365428  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28365429 attcgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28365464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32432403 - 32432170
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32432403 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggtttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgctaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 32432304  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  32432303 ct-aaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgcaatgttaaaaatca 32432206  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32432205 atctgaaaagactcagagacagtcacagggatgaaa 32432170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32447689 - 32447456
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32447689 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggtttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgctaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 32447590  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  32447589 ct-aaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgcaatgttaaaaatca 32447492  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32447491 atctgaaaagactcagagacagtcacagggatgaaa 32447456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 20568605 - 20568841
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20568605 gacaaaacggactaaaacgaaccaacggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 20568704  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt--aaaaat 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||     
T  20568705 ctaaaaatgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacagggtttactgatgaaatgttaaaaaaaa 20568803  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20568804 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 20568841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 20583734 - 20583970
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20583734 gacaaaacggactaaaacgaaccaacggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 20583833  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt--aaaaat 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||     
T  20583834 ctaaaaatgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacagggtttactgatgaaatgttaaaaaaaa 20583932  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20583933 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 20583970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28029784 - 28029551
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28029784 gacaaaacggactaaaacgaaccaacggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaaagaccaaaatgcccctaggg 28029685  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  28029684 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgtttaaaaata 28029585  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 229  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28029584 atctgaaaagactcaaagacagtcacaaggatga 28029551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7081579 - 7081344
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7081579 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtatgaaatgaccaaaatgcccctaggg 7081480  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  7081479 ctaaaaatgtcctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagttggaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 7081381  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7081380 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 7081344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7990035 - 7989800
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7990035 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 7989936  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  |    
T  7989935 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtctactgatgaaatgtttaaaaata 7989836  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7989835 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 7989800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10636540 - 10636305
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10636540 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 10636441  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  |    
T  10636440 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtctactgatgaaatgtttaaaaata 10636341  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10636340 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 10636305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10651518 - 10651283
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10651518 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 10651419  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  |    
T  10651418 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtctactgatgaaatgtttaaaaata 10651319  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10651318 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 10651283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20074885 - 20074652
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20074885 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagag 20074786  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20074785 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgtcactgactcagattcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtt-aaaatca 20074688  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20074687 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 20074652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28123008 - 28123243
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28123008 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28123107  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |    
T  28123108 ctaaaattgacctaaacagattgaaatggacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaagtgtttaaaaata 28123207  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28123208 atctgaaaagattcagagacagtcacaaggatgaaa 28123243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28332505 - 28332271
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28332505 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28332406  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28332405 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 28332307  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28332306 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28332271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28347607 - 28347373
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28347607 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28347508  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28347507 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 28347409  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28347408 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28347373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47016876 - 47016641
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  47016876 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 47016777  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  47016776 ctaaaaacgacctaaactgaatcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 47016677  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47016676 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 47016641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47031790 - 47031555
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  47031790 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 47031691  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  47031690 ctaaaaacgacctaaactgaatcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 47031591  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47031590 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 47031555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28014466 - 28014232
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaa-ttttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28014466 gacaaaacggactaaaacgaaccaacggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaaattttgtgtgaaaagaccaaaatgcccctagg 28014367  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||      
T  28014366 gctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgtttaaaaat 28014267  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28014266 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 28014232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7066627 - 7066392
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7066627 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtatgaaatgaccaaaatgcccctaggg 7066528  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  7066527 ctaaaaatgtcctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagttggaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 7066429  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7066428 aatctgaaaagactcagagaaagtcacaaggatgaaa 7066392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43715894 - 43715659
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43715894 gacaaaatggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 43715795  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  43715794 ctaaaattgacctaaatagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 43715696  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43715695 aatctgaagagactcagagacagtcacaaggatgaaa 43715659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4410148 - 4409914
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4410148 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4410049  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4410048 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgatactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 4409950  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4409949 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4409914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4425528 - 4425294
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4425528 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4425429  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4425428 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgatactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 4425330  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4425329 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4425294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5601128 - 5601362
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5601128 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5601227  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5601228 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgagttt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatta 5601326  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5601327 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5601362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5616369 - 5616603
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5616369 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5616468  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5616469 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgagttt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatta 5616567  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5616568 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5616603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18218394 - 18218159
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18218394 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 18218295  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  18218294 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacgctgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaaata 18218195  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18218194 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 18218159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18233702 - 18233467
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18233702 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 18233603  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  18233602 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacgctgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaaata 18233503  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18233502 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 18233467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31956273 - 31956507
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31956273 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31956372  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31956373 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 31956471  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31956472 atctgaaaagattcagagacagtcacaaggatgaaa 31956507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31971550 - 31971784
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31971550 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31971649  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31971650 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 31971748  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31971749 atctgaaaagattcagagacagtcacaaggatgaaa 31971784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51775388 - 51775150
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51775388 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaatttttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 51775289  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt--aaaaa 192  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||    
T  51775288 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgactctgacactgactcagatgcgagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaaagttaaaaaaa 51775189  T
Q  193 tgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51775188 tgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 51775150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51790474 - 51790236
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51790474 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaatttttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 51790375  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt--aaaaa 192  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||    
T  51790374 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgactctgacactgactcagatgcgagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaaagttaaaaaaa 51790275  T
Q  193 tgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51790274 tgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 51790236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5518772 - 5519007
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5518772 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaaaaaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5518871  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  |||||      
T  5518872 ctaaaattgacctaaacagattcaaatggacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgagttt-aacaaggcttactgatgaaatgtaaaaaaaac 5518970  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5518971 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5519007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10387237 - 10387003
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10387237 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 10387138  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  10387137 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaatcgacttgacactgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaatgtttaaaaaca 10387039  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10387038 atttgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 10387003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 17976454 - 17976689
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17976454 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacccccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 17976553  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17976554 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacgctgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtcaaaaatga 17976653  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  17976654 atttgaaaagactcagagatagttataaggatgaaa 17976689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 17992002 - 17992237
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17992002 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacccccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 17992101  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17992102 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacgctgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtcaaaaatga 17992201  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  17992202 atttgaaaagactcagagatagttataaggatgaaa 17992237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26337001 - 26336767
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26337001 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26336902  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||  |    
T  26336901 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-aacaaagtttactgatgaaatgaaaaaaaaca 26336803  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26336802 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26336767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 50141090 - 50141324
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  50141090 gacaaaacggactaaaatgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccttaggg 50141189  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50141190 ctaaaaacgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 50141288  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50141289 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 50141324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1774962 - 1774737
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1774962 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 1774863  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1774862 ctaaaaatgacctaaacagactcaaatcgacttgacactgactcagatgcaggtttgagatgaatct-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 1774764  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcaca 222  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||    
T  1774763 atctgaaaagactcagagacagacaca 1774737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26681615 - 26681851
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681615 gacaaaacggactagaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtatcctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26681714  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg--ttaaaaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||  |||||||     
T  26681715 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgagttt-aataaggtttactgataaaatgttttaaaaaa 26681813  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26681814 caatctgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 26681851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4338449 - 4338684
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4338449 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4338548  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  |||||      
T  4338549 ctaaaaacgacctaaacagattcaagttaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaatgtaaaaaaaac 4338647  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4338648 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4338684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5460420 - 5460185
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5460420 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5460321  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  5460320 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 5460222  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5460221 aatctgaaaagactccgagacagtcacaaggatgaaa 5460185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5475526 - 5475291
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5475526 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5475427  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  5475426 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 5475328  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5475327 aatctgaaaagactccgagacagtcacaaggatgaaa 5475291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6225592 - 6225368
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6225592 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcccaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 6225493  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |          ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  6225492 c----------ctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaa-caaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaca 6225404  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6225403 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 6225368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18284126 - 18284361
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18284126 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatccccctaggg 18284225  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    | ||||| | | |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18284226 cgaaaaatgtcttaaacagattcaaattggcttgacactgactcagatgcgagtttgaaataaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 18284324  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18284325 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 18284361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18299426 - 18299661
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18299426 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatccccctaggg 18299525  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    | ||||| | | |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18299526 cgaaaaatgtcttaaacagattcaaattggcttgacactgactcagatgcgagtttgaaataaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 18299624  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18299625 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 18299661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18314727 - 18314962
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18314727 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatccccctaggg 18314826  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    | ||||| | | |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18314827 cgaaaaatgtcttaaacagattcaaattggcttgacactgactcagatgcgagtttgaaataaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 18314925  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18314926 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 18314962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22769867 - 22770102
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22769867 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 22769966  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| | |||||||      
T  22769967 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattgacttgacattgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaacgtttaaaaaac 22770065  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22770066 aatctgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 22770102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10404611 - 10404377
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10404611 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgcgaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 10404512  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  10404511 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaatcgacttgacactgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaatgtttaaaaaca 10404413  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10404412 atttgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 10404377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 11117286 - 11117522
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11117286 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 11117385  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg--ttaaaaat 193  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||     
T  11117386 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgcaaaaaaaaa 11117484  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11117485 caatctgaaaagactcaaagacggtcacaaggatgaaa 11117522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4353590 - 4353825
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4353590 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgatcaaaatgcccctaggg 4353689  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  |||||      
T  4353690 ctaaaaacgacctaaacagattcaagttaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaatgtaaaaaaaac 4353788  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4353789 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4353825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24321318 - 24321083
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24321318 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 24321219  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaatg 194  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||   |||||      
T  24321218 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacttgacactaactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-aacaaagcttactgatgaaatgaaaaaaaaac 24321120  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24321119 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 24321083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24336685 - 24336450
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24336685 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 24336586  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaatg 194  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||   |||||      
T  24336585 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacttgacactaactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-aacaaagcttactgatgaaatgaaaaaaaaac 24336487  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24336486 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 24336450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48459085 - 48458851
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48459085 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 48458986  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  48458985 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacgctgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaatgtttaaaaaca 48458887  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48458886 aactgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 48458851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16402178 - 16402414
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16402178 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgtcaaaattttgtgtgaaatgaccaaagtgcccctaggg 16402277  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt--taaaaat 193  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||     
T  16402278 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaaa 16402376  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16402377 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 16402414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 17968271 - 17968505
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17968271 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgtcaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 17968370  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  17968371 ctaaaaatgacctaaaccgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaa--a 17968468  T
Q  196 atttga-aaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17968469 ttctgagaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 17968505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 17998751 - 17998985
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17998751 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgtcaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 17998850  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  17998851 ctaaaaatgacctaaaccgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaa--a 17998948  T
Q  196 atttga-aaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17998949 ttctgagaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 17998985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48474844 - 48474610
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48474844 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctcgctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 48474745  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  48474744 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacgctgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaatgtttaaaaaca 48474646  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48474645 aactgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 48474610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8579944 - 8579710
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8579944 gacaaaacggactaaaatgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgcgtgaaatgactaaaatgcccctaggg 8579845  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg---ttaaaaa 192  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |     |||||    
T  8579844 ctaaaattgacctaaacagattcaaatcgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaacgcaaaaaaaaa 8579746  T
Q  193 tgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatg 228  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8579745 acaatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatg 8579710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45187631 - 45187431
Alignment:
Q  30 tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||  ||||||    
T  45187631 tgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccttagggctaaaaacgacctaaactgactcaaacagacttg 45187532  T
Q  130 acattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 229  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45187531 acactgactcagacgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 45187433  T
Q  230 aa 231  Q
    ||    
T  45187432 aa 45187431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 37004164 - 37004399
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37004164 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 37004263  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
     |||||| || |||| |||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  37004264 ttaaaaatgaactaagcagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 37004362  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37004363 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 37004399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 11102191 - 11102429
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11102191 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 11102290  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg----ttaaaa 191  Q
    ||||||| |||||||| |||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      ||||    
T  11102291 ctaaaaatgacctaaatagagccaaattgacttgacactgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgcaaaaaaaaa 11102389  T
Q  192 atgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11102390 aacaatctgaaaagactcaaagacggtcacaaggatgaaa 11102429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 22862568 - 22862801
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct-a 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  22862568 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaaggttaa 22862667  T
Q  99 aaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaa--aatgaa 196  Q
    ||||||||||||||||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||    
T  22862668 aaaacgacctaaacagactcaagtcgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatg-attttaacaaggtttactggtgaaatgtaaaaagaatcaa 22862766  T
Q  197 tttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22862767 tttgaaaagactcagagacagttacaagaatgaaa 22862801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 22877727 - 22877960
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct-a 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  22877727 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaaggttaa 22877826  T
Q  99 aaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaa--aatgaa 196  Q
    ||||||||||||||||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||    
T  22877827 aaaacgacctaaacagactcaagtcgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatg-attttaacaaggtttactggtgaaatgtaaaaagaatcaa 22877925  T
Q  197 tttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22877926 tttgaaaagactcagagacagttacaagaatgaaa 22877960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 22892786 - 22893019
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct-a 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  22892786 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaaggttaa 22892885  T
Q  99 aaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaa--aatgaa 196  Q
    ||||||||||||||||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||    
T  22892886 aaaacgacctaaacagactcaagtcgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatg-attttaacaaggtttactggtgaaatgtaaaaagaatcaa 22892984  T
Q  197 tttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22892985 tttgaaaagactcagagacagttacaagaatgaaa 22893019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27142521 - 27142288
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27142521 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27142422  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    || |||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||  |    
T  27142421 ct-aaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaatgtaaaaaaaca 27142324  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27142323 aattaaaaagactcagagacaatcacaaggatgaaa 27142288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18251179 - 18250937
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18251179 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 18251080  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt--------t 187  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||             
T  18251079 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaaa 18250981  T
Q  188 aaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18250980 aaaaaacaatctgaaaagactccgagacagtcacaaggatgaaa 18250937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18216976 - 18216781
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  18216976 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctatgg 18216877  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaa 192  Q
    | ||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18216876 cgaaaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaa 18216781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Original strand, 22120699 - 22120858
Alignment:
Q  72 gaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggt 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22120699 gaaaagaccaaaatgcccctagggactaaaatgacctaaactgactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggt 22120797  T
Q  172 ttactgatgaaatgtt-aaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120798 ttactgatgaaatgttaaaaaatcaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 22120858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 29657385 - 29657537
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29657385 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 29657484  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaa 147  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  29657485 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagactctgacactgactcagatgcaa 29657537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 29672029 - 29672181
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29672029 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 29672128  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaa 147  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  29672129 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagactctgacactgactcagatgcaa 29672181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 5588014 - 5588133
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5588014 gacaaaacggactaaaacgaaccaacggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5588113  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  5588114 ctaaaaatgacctaaacaga 5588133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 5622235 - 5622354
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5622235 gacaaaacggactaaaacgaaccaacggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5622334  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  5622335 ctaaaaatgacctaaacaga 5622354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26294122 - 26294025
Alignment:
Q  134 tgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26294122 tgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagtaatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26294025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Original strand, 29657544 - 29657598
Alignment:
Q  177 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29657544 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 29657598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Original strand, 29672188 - 29672242
Alignment:
Q  177 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29672188 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 29672242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Original strand, 5588130 - 5588218
Alignment:
Q  139 cagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5588130 cagacgcaagtttgaaatgaatttaa-caaggtttactgatgaaat---aaaaaacaatctgaaaagactcagagacagttacaaggatgaaa 5588218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Original strand, 5622351 - 5622439
Alignment:
Q  139 cagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5622351 cagacgcaagtttgaaatgaatttaa-caaggtttactgatgaaat---aaaaaacaatctgaaaagactcagagacagttacaaggatgaaa 5622439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 85
Target Start/End: Original strand, 25009108 - 25009163
Alignment:
Q  30 tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaat 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25009108 tgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaat 25009163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18216763 - 18216731
Alignment:
Q  199 tgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18216763 tgaaaagactccgagacagtcacaaggatgaaa 18216731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 267819 - 268053
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  267819 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 267918  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  267919 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 268017  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  268018 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 268053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 252289 - 252523
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  252289 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagtg 252388  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  252389 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 252487  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  252488 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 252523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 16861817 - 16862047
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16861817 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 16861916  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaattt 199  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16861917 aaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatcaatct 16862015  T
Q  200 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16862016 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 16862047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19408239 - 19408474
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19408239 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 19408338  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19408339 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcgaatttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatga 19408438  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19408439 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 19408474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19423239 - 19423474
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19423239 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 19423338  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19423339 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcgaatttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatga 19423438  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19423439 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 19423474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40227011 - 40226777
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40227011 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 40226912  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  40226911 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattggcttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatattaaaaatca 40226813  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40226812 atctgaaaagactcagagacagtcgcaaggatgaaa 40226777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40242070 - 40241836
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40242070 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 40241971  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  40241970 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattggcttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatattaaaaatca 40241872  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40241871 atctgaaaagactcagagacagtcgcaaggatgaaa 40241836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19557161 - 19556925
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19557161 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctacgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 19557062  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19557061 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagactctgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatg 19556962  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19556961 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 19556925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27212770 - 27212534
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  27212770 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctgggg 27212671  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27212670 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgactctgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatg 27212571  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27212570 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27212534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16159015 - 16158781
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16159015 gacaaaacggactaaaacgaaccaacggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 16158916  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  16158915 ctaaaaatgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacagggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 16158817  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16158816 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 16158781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16169905 - 16169671
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16169905 gacaaaacggactaaaacgaaccaacggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 16169806  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  16169805 ctaaaaatgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacagggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 16169707  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16169706 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 16169671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32043045 - 32042810
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32043045 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 32042946  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32042945 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcgaatttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatga 32042846  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32042845 atttgaaaagactcagaaacagtcacaaggatgaaa 32042810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32058241 - 32058006
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32058241 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 32058142  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32058141 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcgaatttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatga 32058042  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32058041 atttgaaaagactcagaaacagtcacaaggatgaaa 32058006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34272567 - 34272333
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34272567 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtatgaaatgaccaaaatgcccctaggg 34272468  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  34272467 ctaaaaatgtcctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 34272369  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34272368 aactgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 34272333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34299574 - 34299340
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34299574 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtatgaaatgaccaaaatgcccctaggg 34299475  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  34299474 ctaaaaatgtcctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 34299376  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34299375 aactgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 34299340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13928370 - 13928603
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  13928370 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaa-tttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctgggg 13928468  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  13928469 ctaaaaatgacctaaacagattgaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaatca 13928567  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13928568 atctgaaaagactcagagacagtcgcaaggatgaaa 13928603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13943566 - 13943799
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  13943566 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaa-tttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctgggg 13943664  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  13943665 ctaaaaatgacctaaacagattgaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaatca 13943763  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13943764 atctgaaaagactcagagacagtcgcaaggatgaaa 13943799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31869505 - 31869270
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31869505 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31869406  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31869405 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgacttagacgcgaatttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatga 31869306  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31869305 atttgaaaaaactcagagacagtcacaaggatgaaa 31869270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31884698 - 31884463
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31884698 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31884599  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31884598 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgacttagacgcgaatttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatga 31884499  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31884498 atttgaaaaaactcagagacagtcacaaggatgaaa 31884463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16963935 - 16964167
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16963935 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgcgaaatgaccaaaatgcccctaggg 16964034  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16964035 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatct-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 16964133  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 229  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16964134 atctgaaaagattcagagacagtcacaaggatga 16964167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 25911274 - 25911507
Alignment:
Q  4 aaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggcta 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25911274 aaaacggactaaaacgagccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctggggcta 25911373  T
Q  99 aaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaat 197  Q
    |||| |||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25911374 aaaatgacctaaaccaactcaaattgactctgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatgaat 25911473  T
Q  198 ttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25911474 ttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 25911507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16032699 - 16032935
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16032699 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 16032798  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||      
T  16032799 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttgctgatgaaatgtaaaaaaaca 16032898  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16032899 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 16032935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31895981 - 31896223
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31895981 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31896080  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt-------- 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||            
T  31896081 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaaa 31896179  T
Q  188 aaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31896180 aaaaatcaatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 31896223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27114023 - 27113793
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27114023 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27113924  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
     |||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  27113923 ttaaaaatgacctaaacatattcaaattgacctgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaa-ca 27113826  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatg 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27113825 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatg 27113793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27124988 - 27124758
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27124988 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27124889  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
     |||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  27124888 ttaaaaatgacctaaacatattcaaattgacctgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaa-ca 27124791  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatg 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27124790 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatg 27124758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 34802775 - 34803010
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34802775 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 34802874  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  |    
T  34802875 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgacgaaaggttaaaaaaca 34802973  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34802974 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 34803010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19550872 - 19550638
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19550872 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 19550773  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||  |    
T  19550772 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgacttgacactgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgcaaaaaaaca 19550674  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19550673 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 19550638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37918923 - 37918688
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  37918923 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 37918824  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  37918823 ctaaaaacgacctaaactgaatcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 37918724  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37918723 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 37918688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37933861 - 37933626
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  37933861 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 37933762  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  37933761 ctaaaaacgacctaaactgaatcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 37933662  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933661 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 37933626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31865790 - 31866034
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31865790 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31865889  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt-------- 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||            
T  31865890 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtttaaaaaaa 31865988  T
Q  188 --aaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
      |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31865989 aaaaaaatcaatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 31866034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34280226 - 34279989
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34280226 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 34280127  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt---taaaaa 192  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    |||||    
T  34280126 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgataaagtgtaaaaaaaaa 34280028  T
Q  193 tgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34280027 acaatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 34279989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21668936 - 21669171
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  21668936 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcacgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 21669035  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21669036 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcaaacttaaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgtcaaaaatga 21669135  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21669136 atttgaaaagactcagagatagtcacaaggatgaaa 21669171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21683937 - 21684172
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  21683937 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcacgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 21684036  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21684037 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcaaacttaaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgtcaaaaatga 21684136  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21684137 atttgaaaagactcagagatagtcacaaggatgaaa 21684172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12581312 - 12581076
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12581312 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctgggg 12581213  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt--taaaaat 193  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   |||||     
T  12581212 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaaa 12581114  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12581113 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 12581076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12595304 - 12595068
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12595304 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctgggg 12595205  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt--taaaaat 193  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   |||||     
T  12595204 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaaa 12595106  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12595105 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 12595068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15708150 - 15708388
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15708150 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 15708249  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt---aaaaa 192  Q
    ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  15708250 ctaaaaatgacctaaacatattctaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaaggtttaaaaaaa 15708348  T
Q  193 tgaatttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
      ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15708349 acaatctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 15708388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2729620 - 2729387
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2729620 gacaaaatggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 2729521  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  2729520 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 2729423  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2729422 atctgaaaagactcagagacagtcacagagatgaaa 2729387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22919907 - 22920141
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22919907 gacaaaacggactaaaatgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccttaggg 22920006  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22920007 ctaaaaacgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 22920105  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22920106 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 22920141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22933017 - 22933251
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22933017 gacaaaacggactaaaatgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccttaggg 22933116  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22933117 ctaaaaacgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 22933215  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22933216 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 22933251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34152593 - 34152361
Alignment:
Q  4 aaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggcta 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34152593 aaaacggactaaaacgagccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctggggcta 34152494  T
Q  99 aaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt-aaaaatgaat 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  34152493 aaaatgacctaaacagattcaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacagggtttactgatgaaatgttaaaaaaacaat 34152395  T
Q  198 ttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34152394 ctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 34152361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34163449 - 34163217
Alignment:
Q  4 aaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggcta 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34163449 aaaacggactaaaacgagccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctggggcta 34163350  T
Q  99 aaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt-aaaaatgaat 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  34163349 aaaatgacctaaacagattcaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacagggtttactgatgaaatgttaaaaaaacaat 34163251  T
Q  198 ttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34163250 ctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 34163217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 39043632 - 39043868
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39043632 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctgtgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 39043731  T
Q  96 ctaa-aaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaat 193  Q
    |||| ||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||     
T  39043732 ctaacaaatgacctaaacagactcaaattgacctgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacagggtttactgatgaaatgtaaaaaaaa 39043830  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39043831 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 39043868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 39058966 - 39059202
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39058966 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctgtgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 39059065  T
Q  96 ctaa-aaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaat 193  Q
    |||| ||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||     
T  39059066 ctaacaaatgacctaaacagactcaaattgacctgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacagggtttactgatgaaatgtaaaaaaaa 39059164  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39059165 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 39059202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34870114 - 34869879
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34870114 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 34870015  T
Q  96 cta-aaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||     
T  34870014 ctaaaaaatgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaaatt-agcagggtttactgatgaaatgttaaaaatc 34869916  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34869915 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 34869879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37368358 - 37368134
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37368358 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 37368259  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |          ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  37368258 c----------ctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaa-caaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaca 37368170  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37368169 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 37368134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37386192 - 37385968
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37386192 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 37386093  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |          ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  37386092 c----------ctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaa-caaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaca 37386004  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37386003 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 37385968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 37943628 - 37943857
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37943628 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgggtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 37943727  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaattt 199  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | ||||||  ||| |    
T  37943728 aattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aataaggtttactgacgaaa-ggtaaaaaacaatct 37943825  T
Q  200 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37943826 gaaaagactcagagactgtcacaaggatgaaa 37943857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16821094 - 16821327
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821094 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 16821193  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||||  |    
T  16821194 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacgctgactcagacgcaaatttgaaatgaactttaacaaagtttactgatgacatgtttaaaaata 16821293  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 229  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821294 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 16821327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16876245 - 16876478
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16876245 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 16876344  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||||  |    
T  16876345 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacgctgactcagacgcaaatttgaaatgaactttaacaaagtttactgatgacatgtttaaaaata 16876444  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 229  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16876445 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 16876478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27770749 - 27770514
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27770749 gacaaaacggactaaaacgaacaaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27770650  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  27770649 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaggtttgaaatgaattt-aacaaggcttactgatgaaatgctaaaaaaca 27770551  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27770550 atctgaaaaagactcagaaacagtctcaaggatgaaa 27770514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27784708 - 27784473
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27784708 gacaaaacggactaaaacgaacaaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27784609  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  27784608 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaggtttgaaatgaattt-aacaaggcttactgatgaaatgctaaaaaaca 27784510  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27784509 atctgaaaaagactcagaaacagtctcaaggatgaaa 27784473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34855071 - 34854836
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34855071 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 34854972  T
Q  96 cta-aaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||     
T  34854971 ctaaaaaatgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagacacaagtttgaaatgaaatt-agcagggtttactgatgaaatgttaaaaatc 34854873  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34854872 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 34854836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3780209 - 3779975
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||     ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3780209 gacaaaacggactaaaacgaaccaacggcctaaatgatgtacttcaaagtaacctccctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 3780110  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||  |||||  |    
T  3780109 ctaaaaacgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaatgaaaaaaaaca 3780011  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3780010 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 3779975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 37677665 - 37677891
Alignment:
Q  9 ggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37677665 ggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccttagggctaaaaac 37677764  T
Q  104 gacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaa 203  Q
    ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37677765 gacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaa 37677863  T
Q  204 agactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37677864 agactcagagacagtcacaaggatgaaa 37677891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 37692930 - 37693156
Alignment:
Q  9 ggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37692930 ggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccttagggctaaaaac 37693029  T
Q  104 gacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaa 203  Q
    ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37693030 gacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaa 37693128  T
Q  204 agactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37693129 agactcagagacagtcacaaggatgaaa 37693156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 37708194 - 37708420
Alignment:
Q  9 ggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37708194 ggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccttagggctaaaaac 37708293  T
Q  104 gacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaa 203  Q
    ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37708294 gacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaa 37708392  T
Q  204 agactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37708393 agactcagagacagtcacaaggatgaaa 37708420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10984593 - 10984356
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaa-cgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10984593 gacaaaacggactaaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 10984494  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaat 193  Q
    |||||||| ||||||||| || | |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  10984493 gctaaaaatgacctaaactgactcaaacagactctgacactgactcagatgcaagtttgaaatggatttaaacagggtttactgatgaaatgtcaaaaat 10984394  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10984393 gaatttgaaaaggctcagagatagtcacaaggatgaaa 10984356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39883401 - 39883164
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39883401 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 39883302  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  39883301 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagactctgacactgactcagatgcaagtttgaaatggatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaaac 39883202  T
Q  195 aatttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39883201 aatctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 39883164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39898977 - 39898740
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39898977 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 39898878  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  39898877 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagactctgacactgactcagatgcaagtttgaaatggatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaaac 39898778  T
Q  195 aatttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39898777 aatctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 39898740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31474125 - 31474358
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31474125 gacagaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaacgcccctaggg 31474224  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31474225 ctaaaat-gacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagacgcaaatttgaaatgaatttaa-caaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 31474322  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31474323 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 31474358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3792482 - 3792247
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||     ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3792482 gacaaaacggactaaaacgaaccaacggcctaaatgatgtacttcaaagtaacctccctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 3792383  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaatg 194  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||   |||||      
T  3792382 ctaaaaacgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaatgaaaaaaaaac 3792284  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3792283 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 3792247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12708320 - 12708555
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12708320 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 12708419  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
     |||||| || ||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  12708420 ttaaaaatgaactaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaacc 12708518  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12708519 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 12708555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12723719 - 12723954
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723719 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 12723818  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
     |||||| || ||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  12723819 ttaaaaatgaactaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 12723917  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723918 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 12723954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33842993 - 33842755
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaa-ttttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33842993 gacaaagcggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaaattttgtgtgaaatgactaaaatgcccctagg 33842894  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt---aaaa 191  Q
    ||||||   |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||   ||||    
T  33842893 gctaaatttgacctaaacagattcaaatcgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaatgtttaaaaaa 33842795  T
Q  192 atgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33842794 aacaatctgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 33842755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 11626953 - 11627185
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11626953 aaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctggggctaa 11627052  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatt 198  Q
    ||| |||||  ||  | | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||   ||     
T  11627053 aaatgacctggaccaactcaaattgactctgacactgacccagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttattgatgaattgtaaaaaaaacatc 11627152  T
Q  199 tgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11627153 tgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 11627185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 34184883 - 34185119
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34184883 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 34184982  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg--ttaaaaat 193  Q
    || |||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||     
T  34184983 ct-aaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggcttactgatgaaatgcaaaaaaaaa 34185080  T
Q  194 gaatttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185081 caatctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 34185119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 11648150 - 11648382
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11648150 aaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgatcaaaatgcccctggggctaa 11648249  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatt 198  Q
    ||| |||||  ||  | | ||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||   ||     
T  11648250 aaatgacctggaccaactcaaattgactctgacactcacccagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttattgatgaattgtaaaaaaaacatc 11648349  T
Q  199 tgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11648350 tgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 11648382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 5798909 - 5798788
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5798909 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5798810  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5798809 ctaaaaacgacctaaacagatt 5798788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 9341875 - 9342027
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  9341875 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctgggg 9341974  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaa 147  Q
    ||||||| |||||||||  | | |||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  9341975 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaatagactctgacactgactcagatgcaa 9342027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 9356881 - 9357033
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  9356881 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctgggg 9356980  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaa 147  Q
    ||||||| |||||||||  | | |||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  9356981 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaatagactctgacactgactcagatgcaa 9357033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27797017 - 27796869
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27797017 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgggtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 27796918  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaa 147  Q
    ||| ||||||||| || | |||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  27796917 aaatgacctaaactgactcaaacagactctgacactgactcagatgcaa 27796869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27812106 - 27811958
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27812106 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgggtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 27812007  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaa 147  Q
    ||| ||||||||| || | |||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  27812006 aaatgacctaaactgactcaaacagactctgacactgactcagatgcaa 27811958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Original strand, 9342034 - 9342088
Alignment:
Q  177 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9342034 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 9342088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Original strand, 9357040 - 9357094
Alignment:
Q  177 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9357040 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 9357094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27796862 - 27796808
Alignment:
Q  177 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27796862 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27796808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27811951 - 27811897
Alignment:
Q  177 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27811951 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27811897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5798590 - 5798562
Alignment:
Q  203 aagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5798590 aagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5798562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36568093 - 36567860
Alignment:
Q  2 acaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggc 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36568093 acaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggc 36567994  T
Q  97 taaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaa 196  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36567993 taaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatcaa 36567895  T
Q  197 tttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36567894 tctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 36567860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28148025 - 28147791
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28148025 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28147926  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28147925 ctaaaaatgacctaaacatattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 28147827  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28147826 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28147791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47765816 - 47765582
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47765816 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 47765717  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  47765716 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaaa 47765618  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47765617 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 47765582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3649705 - 3649471
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3649705 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 3649606  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  |    
T  3649605 ctaaaaatgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacagggtttactgacgaaatgttaaaaaaca 3649507  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3649506 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 3649471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28158500 - 28158266
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28158500 gacaaaacggactaaaacaaatcaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28158401  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28158400 ctaaaaatgacctaaacatattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 28158302  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28158301 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28158266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 36765309 - 36765543
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36765309 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 36765408  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  36765409 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattgacttgacactgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 36765507  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36765508 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 36765543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30729124 - 30729359
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30729124 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaaactctcaatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 30729223  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  30729224 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 30729322  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30729323 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 30729359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13768888 - 13769122
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13768888 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 13768987  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  13768988 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaataaaatt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaca 13769086  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13769087 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 13769122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14892935 - 14892701
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14892935 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 14892836  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14892835 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 14892737  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14892736 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 14892701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14415594 - 14415828
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14415594 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 14415693  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||  |    
T  14415694 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-aacaaagtttactgatgaaatgaaaaaaaaca 14415792  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14415793 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 14415828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28578265 - 28578030
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28578265 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28578166  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
     |||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  28578165 ttaaaaacgacctaaactgaatcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 28578066  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28578065 atccgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28578030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28593691 - 28593456
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28593691 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28593592  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
     |||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  28593591 ttaaaaacgacctaaactgaatcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 28593492  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28593491 atccgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28593456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47200163 - 47199927
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc------tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47200163 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgaccctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 47200064  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaat 193  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||     
T  47200063 gctaaaattgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-aacaaagtttactgatgaaatgtaaaaaaaa 47199965  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47199964 caatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 47199927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 41785101 - 41785337
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41785101 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 41785200  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt--taaaaat 193  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||   |||||     
T  41785201 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagacgcaagtttgagacgaaatt-aacaaagtttactgatgaaatgtaaaaaaaaa 41785299  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41785300 caatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 41785337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 41800369 - 41800605
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41800369 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 41800468  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt--taaaaat 193  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||   |||||     
T  41800469 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagacgcaagtttgagacgaaatt-aacaaagtttactgatgaaatgtaaaaaaaaa 41800567  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41800568 caatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 41800605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 47354758 - 47354992
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  47354758 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccttaggg 47354857  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||   |    
T  47354858 ctaaaaacgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgctgaaatgttaaaacata 47354956  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47354957 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 47354992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16186235 - 16185999
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16186235 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 16186136  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg--ttaaaaat 193  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||    |||||     
T  16186135 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-aacaaaatttactgatgaaatgaaaaaaaaaa 16186037  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16186036 caatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 16185999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51633151 - 51632916
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51633151 gacaaaacggactaaaatgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 51633052  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| | |||||      
T  51633051 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgccactgactcagacgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatgaaatgctaaaaaaat 51632953  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51632952 aatctgaaaaaactcagagacagtcacaaggatgaaa 51632916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51646590 - 51646355
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51646590 gacaaaacggactaaaatgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 51646491  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| | |||||      
T  51646490 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgccactgactcagacgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatgaaatgctaaaaaaat 51646392  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51646391 aatctgaaaaaactcagagacagtcacaaggatgaaa 51646355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10933385 - 10933161
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10933385 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgactaaaatgcccctaggg 10933286  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||           ||||  |    
T  10933285 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactg-----------aaaaaca 10933197  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10933196 atttgaaaagactcagagacagccacaaggatgaaa 10933161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10971182 - 10970958
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10971182 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgactaaaatgcccctaggg 10971083  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||           ||||  |    
T  10971082 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactg-----------aaaaaca 10970994  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10970993 atttgaaaagactcagagacagccacaaggatgaaa 10970958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10934378 - 10934155
Alignment:
Q  9 ggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaac 103  Q
    ||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10934378 ggactaaaacgaaccaacggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct-aaaac 10934280  T
Q  104 gacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaa 203  Q
    |||||||||||| | ||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||| ||||  |||||  ||| |||||    
T  10934279 gacctaaacagaatcaaatcaactcgacactgactcagatgtaagtttgaaatgaaatt-agcacggtttactgatggaatg--aaaaaacaatctgaaa 10934183  T
Q  204 agactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10934182 agactcagagacagtcacaaggatgaaa 10934155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10953569 - 10953346
Alignment:
Q  9 ggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaac 103  Q
    ||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10953569 ggactaaaacgaaccaacggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct-aaaac 10953471  T
Q  104 gacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaa 203  Q
    |||||||||||| | ||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||| ||||  |||||  ||| |||||    
T  10953470 gacctaaacagaatcaaatcaactcgacactgactcagatgtaagtttgaaatgaaatt-agcacggtttactgatggaatg--aaaaaacaatctgaaa 10953374  T
Q  204 agactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953373 agactcagagacagtcacaaggatgaaa 10953346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Original strand, 16560109 - 16560257
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16560109 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgggtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 16560208  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaa 147  Q
    ||| ||||||||| || | |||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  16560209 aaatgacctaaactgactcaaacagactctgacactgactcagatgcaa 16560257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9077916 - 9077800
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9077916 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 9077817  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaac 112  Q
    ||||||  |||||||||    
T  9077816 ctaaaattgacctaaac 9077800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37877267 - 37877156
Alignment:
Q  119 aaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagt 218  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  37877267 aaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaattag-caaggtttactgatggaatgtaaaaaaacaatctgaaaagactcagagacagt 37877169  T
Q  219 cacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||    
T  37877168 cacaaggatgaaa 37877156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Original strand, 16560264 - 16560318
Alignment:
Q  177 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16560264 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 16560318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 231
Target Start/End: Original strand, 36083508 - 36083540
Alignment:
Q  199 tgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36083508 tgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 36083540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 226
Target Start/End: Original strand, 46197320 - 46197351
Alignment:
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaagga 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46197320 aatttgaaaagactcagagacagtcacaagga 46197351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3715515 - 3715281
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3715515 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 3715416  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3715415 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 3715317  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3715316 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 3715281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9350164 - 9349930
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9350164 gacaaaacagactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 9350065  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9350064 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 9349966  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9349965 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 9349930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18687882 - 18688116
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18687882 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 18687981  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18687982 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 18688080  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18688081 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 18688116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5565768 - 5566002
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5565768 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5565867  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5565868 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 5565966  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5565967 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5566002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15777317 - 15777083
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15777317 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 15777218  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15777217 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 15777119  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15777118 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 15777083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15766903 - 15766669
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15766903 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcttaaatgaggtactttaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 15766804  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15766803 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 15766705  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15766704 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 15766669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3987124 - 3986890
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3987124 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagag 3987025  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3987024 ctaaaaatgacctaaacatattcaaattgatttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 3986926  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3986925 atctgaaaagactcagagacagccacaaggatgaaa 3986890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21924747 - 21924513
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21924747 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 21924648  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  21924647 ctaaaaatgacctaaacatattcaaattgtcttgatactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aataaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 21924549  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21924548 atctgaaaagactcagggacagtcacaaggatgaaa 21924513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 40009450 - 40009685
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40009450 gacaaaatggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 40009549  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  40009550 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 40009648  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40009649 aatctgaagagactcagagacagtcacaaggatgaaa 40009685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28353820 - 28354054
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28353820 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28353919  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28353920 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaat-a 28354018  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28354019 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28354054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28369005 - 28369239
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28369005 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28369104  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28369105 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaat-a 28369203  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28369204 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28369239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33267221 - 33266986
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33267221 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 33267122  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  33267121 ctaaaaacgacctaaactgaatcaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 33267022  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33267021 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 33266986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9363444 - 9363209
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9363444 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 9363345  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||  |    
T  9363344 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaat-aattttaaccaggtttactgacgaaaggttaaaaaaca 9363246  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9363245 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 9363209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 6054820 - 6055054
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6054820 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 6054919  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6054920 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 6055018  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6055019 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 6055054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31349161 - 31348927
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31349161 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31349062  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||  |||||  |    
T  31349061 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-aacaaagcttactgatgaaatgaaaaaaaaca 31348963  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31348962 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 31348927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31362961 - 31362727
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31362961 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31362862  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||  |||||  |    
T  31362861 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-aacaaagcttactgatgaaatgaaaaaaaaca 31362763  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31362762 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 31362727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33252018 - 33251784
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33252018 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccc-atgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 33251920  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  33251919 ctaaaaacgacctaaactgaatcaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 33251820  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33251819 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 33251784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19667644 - 19667411
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19667644 gacaaaatggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 19667545  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  19667544 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 19667447  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19667446 atctgaaaagactcagagacagtcacagagatgaaa 19667411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19683006 - 19682773
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19683006 gacaaaatggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 19682907  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  19682906 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 19682809  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19682808 atctgaaaagactcagagacagtcacagagatgaaa 19682773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29824216 - 29823982
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29824216 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 29824117  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||  |    
T  29824116 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-aacaaagtttactgatgaaatgaaaaaaaaca 29824018  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29824017 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 29823982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29837939 - 29837705
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29837939 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 29837840  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||  |    
T  29837839 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-aacaaagtttactgatgaaatgaaaaaaaaca 29837741  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29837740 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 29837705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31481543 - 31481778
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31481543 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31481642  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31481643 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgacttgacactgactcagacgcaagtttaaaatgaaattaaacagggtttactgatgaaatgtcaaaaatga 31481742  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  31481743 atttgaaaagactcagagatagttacaaggatgaaa 31481778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31496687 - 31496922
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31496687 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31496786  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31496787 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgacttgacactgactcagacgcaagtttaaaatgaaattaaacagggtttactgatgaaatgtcaaaaatga 31496886  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  31496887 atttgaaaagactcagagatagttacaaggatgaaa 31496922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4488030 - 4488263
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4488030 gacagaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4488129  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||  |    
T  4488130 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgcaaaaaaaca 4488229  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4488230 atctg--aagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4488263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 3336479 - 3336713
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3336479 gacaaaacggactaaaacaaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 3336578  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3336579 ctaaaaatgacctaaacagagccaaaatgactcgacactgactcagatgcaagtttgaagtgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 3336677  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3336678 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 3336713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44569466 - 44569239
Alignment:
Q  9 ggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44569466 ggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaac 44569367  T
Q  104 gacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaa 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||    
T  44569366 gacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagacgcaaattaaaaataaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaaataatctgaaa 44569267  T
Q  204 agactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44569266 agactcagagacagtcacaaggatgaaa 44569239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 3339296 - 3339530
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3339296 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 3339395  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    || |||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  3339396 ct-aaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 3339493  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3339494 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 3339530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12084467 - 12084701
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  12084467 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctagga 12084566  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
     |||||| ||||||||||||   ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  12084567 ttaaaaatgacctaaacagagccaaaatgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaagatttactgatgaaatgttaaaaatca 12084665  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12084666 atctgaaaagactcagagacagtcgcaaggatgaaa 12084701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12099712 - 12099946
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  12099712 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctagga 12099811  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
     |||||| |||||||| |||   ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  12099812 ttaaaaatgacctaaatagagccaaaatgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaagatttactgatgaaatgttaaaaatca 12099910  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12099911 atctgaaaagactcagagacagtcgcaaggatgaaa 12099946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19200171 - 19200407
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc------tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19200171 gacaaaacggactaaaacgaaccaattgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 19200270  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaat 193  Q
    |||||||  |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||     
T  19200271 gctaaaattgaccaaaacagattcaaattgactcgacactgactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-aacaaagtttactgatgaaatgtaaaaaaaa 19200369  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19200370 caaattgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 19200407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19215226 - 19215462
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc------tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19215226 gacaaaacggactaaaacgaaccaattgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 19215325  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaat 193  Q
    |||||||  |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||     
T  19215326 gctaaaattgaccaaaacagattcaaattgactcgacactgactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-aacaaagtttactgatgaaatgtaaaaaaaa 19215424  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19215425 caaattgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 19215462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15904773 - 15905007
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15904773 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 15904872  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    || |||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  |||||      
T  15904873 ct-aaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaatgtaaaaaaaac 15904970  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15904971 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 15905007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Original strand, 21576669 - 21576780
Alignment:
Q  119 aaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagt 218  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21576669 aaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaattag-caaggtttactgatggaaagttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagt 21576767  T
Q  219 cacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||    
T  21576768 cacaaggatgaaa 21576780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Original strand, 19296285 - 19296395
Alignment:
Q  119 aaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagt 218  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  19296285 aaatttacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-atcaaggtttactgatgaaatg-taaaaaacaatctgaaaagactcagagacagt 19296382  T
Q  219 cacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||    
T  19296383 cacaaggatgaaa 19296395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26428465 - 26428235
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26428465 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 26428366  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaattt 199  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26428365 aaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatcaatct 26428267  T
Q  200 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26428266 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26428235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 7233706 - 7233940
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7233706 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 7233805  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7233806 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 7233904  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7233905 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 7233940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26443903 - 26443673
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26443903 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 26443804  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaattt 199  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26443803 aaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcaaatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatcaatct 26443705  T
Q  200 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26443704 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26443673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5135141 - 5134907
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5135141 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5135042  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  5135041 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 5134943  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5134942 atccgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5134907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31082153 - 31082388
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31082153 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcacagtaacctccctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31082252  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |    
T  31082253 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatatttaaaaata 31082352  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31082353 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 31082388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31094082 - 31094317
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31094082 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31094181  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |    
T  31094182 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatatttaaaaata 31094281  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31094282 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 31094317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45729069 - 45728869
Alignment:
Q  30 tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45729069 tgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttg 45728970  T
Q  130 acattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45728969 acactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatcaatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 45728871  T
Q  230 aa 231  Q
    ||    
T  45728870 aa 45728869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45739971 - 45739771
Alignment:
Q  30 tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45739971 tgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttg 45739872  T
Q  130 acattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45739871 acactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatcaatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 45739773  T
Q  230 aa 231  Q
    ||    
T  45739772 aa 45739771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45380793 - 45380558
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  45380793 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 45380694  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  45380693 ctaaaaacgacctaaactgaatcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatggaaagttaaaaatga 45380594  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45380593 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 45380558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45395648 - 45395413
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  45395648 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 45395549  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  45395548 ctaaaaacgacctaaactgaatcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatggaaagttaaaaatga 45395449  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45395448 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 45395413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4196978 - 4196746
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4196978 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaccctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4196879  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||  |    
T  4196878 ctaaaaatgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaa--taaaaaaaca 4196782  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4196781 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4196746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4207800 - 4207568
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4207800 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaccctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4207701  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||  |    
T  4207700 ctaaaaatgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaa--taaaaaaaca 4207604  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4207603 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4207568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21996001 - 21995766
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21996001 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 21995902  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaatg 194  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||      
T  21995901 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgaaaaaaaaac 21995803  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21995802 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 21995766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16714245 - 16714011
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16714245 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 16714146  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16714145 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattgacttgacactgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 16714047  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16714046 atccgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 16714011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17688481 - 17688247
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17688481 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 17688382  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  17688381 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattgacttgacactgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 17688283  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17688282 atccgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 17688247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18537258 - 18537024
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537258 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 18537159  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18537158 ctaaaaatgacctaaacagactcaaatcgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaa-ttcaacaaggtttactgatgaaatgctaaaaatca 18537060  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537059 aactgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 18537024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18547766 - 18547532
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18547766 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 18547667  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18547666 ctaaaaatgacctaaacagactcaaatcgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaa-ttcaacaaggtttactgatgaaatgctaaaaatca 18547568  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18547567 aactgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 18547532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 33000158 - 33000394
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct------gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33000158 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggctttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 33000257  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||      
T  33000258 gctaaaattgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgacgaaatgtttaaaaat 33000357  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33000358 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 33000394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 39352604 - 39352846
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgcc-aaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39352604 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 39352703  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt------- 187  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           
T  39352704 gctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaa 39352802  T
Q  188 aaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39352803 aaaaatcaatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 39352846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 227
Target Start/End: Original strand, 1593085 - 1593309
Alignment:
Q  9 ggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1593085 ggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaat 1593184  T
Q  104 gacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaagg-tttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaa 202  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1593185 gacctaaacagaatcaaattgacttgacactgactcagacgcaagttcgaaatgaatttaaacagggttttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaa 1593284  T
Q  203 aagactcagagacagtcacaaggat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1593285 aagactcagagacagtcacaaggat 1593309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16160390 - 16160155
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16160390 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 16160291  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||      
T  16160290 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgataaagtgtaaaaaaaac 16160192  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16160191 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 16160155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5138983 - 5139217
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138983 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5139082  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  5139083 ctaaaaatgacctaaacagattgaaatcgacttgacactgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaatgtttaaaaaca 5139181  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5139182 atttgaaaagactcggaggcagtcacaaggatgaaa 5139217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4137011 - 4137245
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4137011 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4137110  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4137111 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 4137209  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4137210 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4137245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4151937 - 4152171
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4151937 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4152036  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4152037 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 4152135  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4152136 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4152171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5152256 - 5152490
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5152256 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5152355  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  5152356 ctaaaaatgacctaaacagattgaaatcgacttgacactgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaatgtttaaaaaca 5152454  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5152455 atctgaaaagactcggaggcagtcacaaggatgaaa 5152490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31118267 - 31118033
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31118267 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31118168  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31118167 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 31118069  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31118068 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 31118033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31132442 - 31132208
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31132442 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31132343  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31132342 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 31132244  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31132243 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 31132208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4272828 - 4272593
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4272828 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4272729  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||      
T  4272728 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgacttgacactgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgcaaaaaaaac 4272630  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4272629 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4272593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 11028718 - 11028953
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  11028718 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaagg 11028817  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||       
T  11028818 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgatactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaa-caaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 11028916  T
Q  196 -atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11028917 catctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 11028953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 3058056 - 3058290
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3058056 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 3058155  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  |    
T  3058156 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-aacaaagtttactgatgaaatgtaaaaaaaca 3058254  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3058255 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 3058290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 10834758 - 10834991
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10834758 gacaaaatggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 10834857  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  10834858 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 10834955  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10834956 atctgaaaagactcagagacagtcacagagatgaaa 10834991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21474755 - 21474520
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21474755 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 21474656  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||  |    
T  21474655 ctaaaaatgacctaaacagactcgaattgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaacgtttaaaaata 21474556  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474555 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 21474520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31556054 - 31556288
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31556054 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31556153  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  31556154 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaagatttactgatgaaatgttaaaaatca 31556252  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31556253 atctgaaaagactcagagacagtcgcaaggatgaaa 31556288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31571043 - 31571277
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31571043 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31571142  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  31571143 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaagatttactgatgaaatgttaaaaatca 31571241  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31571242 atctgaaaagactcagagacagtcgcaaggatgaaa 31571277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9613526 - 9613289
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaa-cgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9613526 gacaaaacggactaaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 9613427  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaat 193  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||     
T  9613426 gctaaaattgacctaaacagattgaaattgacttgacactgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaggtttactgatggaatgcaaaaaaaa 9613327  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9613326 caatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 9613289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9841097 - 9840860
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaa-cgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9841097 gacaaaacggactaaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 9840998  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaat 193  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||     
T  9840997 gctaaaattgacctaaacagattgaaattgacttgacactgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaggtttactgatggaatgcaaaaaaaa 9840898  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9840897 caatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 9840860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2583995 - 2583760
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2583995 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagga 2583896  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  |    
T  2583895 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaat-aattttaacaaggtttactgacgaaaggttaaaaaaca 2583797  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2583796 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 2583760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16743226 - 16743461
Alignment:
Q  1 gacaaaacggact-aaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16743226 gacaaaacggacttaaaacgaaccaacggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 16743325  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||| ||||||||| || |  ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16743326 gctaaaaatgacctaaactgactcgaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatgaaaagttaaaaatg 16743424  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16743425 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 16743461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17516910 - 17516675
Alignment:
Q  1 gacaaaacggact-aaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516910 gacaaaacggacttaaaacgaaccaacggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 17516811  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||| ||||||||| || |  ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17516810 gctaaaaatgacctaaactgactcgaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatgaaaagttaaaaatg 17516712  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516711 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 17516675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 17536304 - 17536539
Alignment:
Q  1 gacaaaacggact-aaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17536304 gacaaaacggacttaaaacgaaccaacggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 17536403  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||| ||||||||| || |  ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17536404 gctaaaaatgacctaaactgactcgaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatgaaaagttaaaaatg 17536502  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17536503 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 17536539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24584247 - 24584482
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24584247 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 24584346  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24584347 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 24584445  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24584446 atttgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 24584482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24893702 - 24893937
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24893702 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 24893801  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||  |    
T  24893802 ctaaaattgacccaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aataaggtttactgtcgaaaggttaaaaaaca 24893900  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24893901 atctgaaaaagactcagagactgtcacaaggatgaaa 24893937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26695320 - 26695082
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26695320 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaaccttcccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26695221  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt-aaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||      
T  26695220 ctaaaaatgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacagggtttactgatgaaatgttaaaaaaac 26695122  T
Q  195 aatttg---aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26695121 aatttgaaaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26695082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26499827 - 26500062
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26499827 gacaaaacggactaaaacaaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctgggg 26499926  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  26499927 ctaaaaacgacctaaacatattcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 26500025  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26500026 aatctaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26500062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26598202 - 26597967
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26598202 gacaaaacggactaaaacaaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctgggg 26598103  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  26598102 ctaaaaacgacctaaacatattcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 26598004  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26598003 aatctaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26597967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11434996 - 11434763
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11434996 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 11434897  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  11434896 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 11434799  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11434798 atctgaaaagactcagagacagtcacagagatgaaa 11434763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11449255 - 11449022
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11449255 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 11449156  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  11449155 ctaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 11449058  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11449057 atctgaaaagactcagagacagtcacagagatgaaa 11449022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 39994151 - 39994386
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39994151 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 39994250  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaatg 194  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||   |||||      
T  39994251 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-aacaaagtttactgatgaaatgaaaaaaaaac 39994349  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39994350 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 39994386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3438763 - 3438529
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3438763 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 3438664  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||  |||||  |    
T  3438663 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-aacaaaatttactgatgaaatgaaaaaaaaca 3438565  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3438564 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 3438529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3453886 - 3453652
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3453886 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 3453787  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||  |||||  |    
T  3453786 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-aacaaaatttactgatgaaatgaaaaaaaaca 3453688  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3453687 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 3453652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26521288 - 26521053
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26521288 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26521189  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
     |||||| || ||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  26521188 ttaaaaatgaactaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 26521090  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26521089 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26521053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26690497 - 26690733
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26690497 gacaaaacggactaaaatgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26690596  T
Q  96 ctaaaaac-gacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||  |||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||      
T  26690597 ctaaaaaatgacctacacagactcaaactgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaaggtttaaaaat 26690696  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26690697 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26690733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26661625 - 26661861
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26661625 gacaaaacggactaaaatgaaccaatggtttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26661724  T
Q  96 ctaaaaac-gacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||  |||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||      
T  26661725 ctaaaaaatgacctacacagactcaaactgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaaggtttaaaaat 26661824  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661825 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26661861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26676817 - 26677053
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26676817 gacaaaacggactaaaatgaaccaatggtttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26676916  T
Q  96 ctaaaaac-gacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||  |||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||      
T  26676917 ctaaaaaatgacctacacagactcaaactgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaaggtttaaaaat 26677016  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26677017 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26677053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26686834 - 26686598
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26686834 gacaaaacggactaaaatgaaccaatggtttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26686735  T
Q  96 ctaaaaac-gacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||  |||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||      
T  26686734 ctaaaaaatgacctacacagactcaaactgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaaggtttaaaaat 26686635  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686634 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26686598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26311517 - 26311749
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26311517 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgtcaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26311616  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    |    
T  26311617 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggcttactgatgaaatgttaaa----a 26311712  T
Q  196 atttga-aaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26311713 ttctgagaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26311749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26266555 - 26266790
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26266555 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26266654  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
     |||||| || ||| ||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||      
T  26266655 ttaaaaatgaactagacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggcttactgatgaaatgtaaaaaaaac 26266753  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26266754 aatctgaaaagactcagagacagccacaaggatgaaa 26266790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26326587 - 26326822
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26326587 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26326686  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
     |||||| || ||| ||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||      
T  26326687 ttaaaaatgaactagacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggcttactgatgaaatgtaaaaaaaac 26326785  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26326786 aatctgaaaagactcagagacagccacaaggatgaaa 26326822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2769757 - 2769609
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2769757 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgggtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 2769658  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaa 147  Q
    ||| ||||||||| || | |||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  2769657 aaatgacctaaactgactcaaacagactctgacactgactcagatgcaa 2769609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2781810 - 2781662
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2781810 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgggtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 2781711  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaa 147  Q
    ||| ||||||||| || | |||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  2781710 aaatgacctaaactgactcaaacagactctgacactgactcagatgcaa 2781662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2769602 - 2769548
Alignment:
Q  177 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2769602 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 2769548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2781655 - 2781601
Alignment:
Q  177 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2781655 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 2781601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4677495 - 4677464
Alignment:
Q  200 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4677495 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4677464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26592681 - 26592651
Alignment:
Q  201 aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26592681 aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26592651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 84)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21170215 - 21169981
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21170215 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 21170116  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  21170115 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 21170017  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21170016 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 21169981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26782306 - 26782072
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26782306 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26782207  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26782206 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 26782108  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26782107 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26782072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26794278 - 26794044
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26794278 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26794179  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26794178 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 26794080  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26794079 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26794044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5245287 - 5245053
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5245287 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5245188  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5245187 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 5245089  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5245088 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5245053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14136720 - 14136954
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14136720 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 14136819  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14136820 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 14136918  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14136919 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 14136954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14148791 - 14149025
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14148791 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 14148890  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14148891 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 14148989  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14148990 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 14149025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20214947 - 20214717
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20214947 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 20214848  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaattt 199  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20214847 aaatgacctaaacagattcaaattgacttgacaatgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatcaatct 20214749  T
Q  200 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20214748 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 20214717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22108970 - 22108740
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108970 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 22108871  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaattt 199  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22108870 aaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatcaatct 22108772  T
Q  200 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108771 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 22108740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27282332 - 27282566
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27282332 gacaaaatggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27282431  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27282432 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 27282530  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27282531 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27282566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28979154 - 28979388
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28979154 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28979253  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  28979254 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaca 28979352  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28979353 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28979388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4452031 - 4451796
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4452031 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4451932  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4451931 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 4451833  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4451832 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4451796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24049562 - 24049798
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  24049562 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctgggg 24049661  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24049662 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgactctgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatg 24049761  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24049762 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 24049798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27037641 - 27037407
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27037641 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27037542  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  27037541 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaggtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaca 27037443  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27037442 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27037407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27065982 - 27065749
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27065982 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27065883  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  27065882 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 27065785  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27065784 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27065749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29542673 - 29542438
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29542673 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 29542574  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  29542573 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 29542475  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29542474 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 29542438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 8190852 - 8191087
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaa-cgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8190852 gacaaaacggactaaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 8190951  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||  |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8190952 gctaaaattgacctaaacagactcaaattgacctgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatc 8191050  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8191051 aatctgaaaagacccagagacagtcacaaggatgaaa 8191087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29558082 - 29557847
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29558082 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 29557983  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  29557982 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagcttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 29557884  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29557883 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 29557847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31543863 - 31543628
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31543863 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31543764  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31543763 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcgagtttgaaataaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 31543665  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31543664 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 31543628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3691062 - 3690828
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3691062 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 3690963  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||  |    
T  3690962 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgataaagtgtaaaaaaaca 3690864  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3690863 atctgaaaagactcagagatagtcacaaggatgaaa 3690828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 2651883 - 2652118
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2651883 gacaaaatggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 2651982  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  2651983 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 2652081  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2652082 aatctgaagagactcagagacagtcacaaggatgaaa 2652118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 33367738 - 33367972
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33367738 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccgaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 33367837  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  33367838 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggttcactaatgaaatgttaaaaatca 33367936  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33367937 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 33367972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 33379020 - 33379254
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33379020 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccgaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 33379119  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  33379120 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggttcactaatgaaatgttaaaaatca 33379218  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33379219 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 33379254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16935857 - 16936092
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16935857 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 16935956  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagttt-gaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||  |||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16935957 ctaaaat-gacctaaacagaatcaaattgactcgacactgactcagatgcaagttttgaaatgaaatttaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatg 16936055  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16936056 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 16936092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16950966 - 16951201
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16950966 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 16951065  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagttt-gaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||  |||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16951066 ctaaaat-gacctaaacagaatcaaattgactcgacactgactcagatgcaagttttgaaatgaaatttaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatg 16951164  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16951165 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 16951201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27353279 - 27353515
Alignment:
Q  1 gacaaaacggact-aaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27353279 gacaaaacggacttaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgtcaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 27353378  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27353379 gctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcggacgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatg 27353478  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27353479 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27353515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27365390 - 27365626
Alignment:
Q  1 gacaaaacggact-aaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27365390 gacaaaacggacttaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgtcaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 27365489  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27365490 gctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcggacgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatg 27365589  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27365590 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27365626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27455737 - 27455973
Alignment:
Q  1 gacaaaacggact-aaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27455737 gacaaaacggacttaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgtcaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 27455836  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27455837 gctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcggacgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatg 27455936  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27455937 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27455973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27621010 - 27621247
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27621010 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgctaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27621109  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaa---aa 192  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||   ||    
T  27621110 ctaaaaatgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatg-attttagcaaggtttactgatgaaatgtaaaaaagaa 27621208  T
Q  193 tgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27621209 tcaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27621247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27636620 - 27636857
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27636620 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgctaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27636719  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaa---aa 192  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||   ||    
T  27636720 ctaaaaatgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatg-attttagcaaggtttactgatgaaatgtaaaaaagaa 27636818  T
Q  193 tgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27636819 tcaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27636857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13515985 - 13516220
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13515985 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 13516084  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  13516085 ctaaaaacgacctaaactgaatcaaattgacttgacactgactcagatgtaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 13516184  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516185 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 13516220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13526888 - 13527123
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13526888 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 13526987  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  13526988 ctaaaaacgacctaaactgaatcaaattgacttgacactgactcagatgtaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 13527087  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13527088 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 13527123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26664374 - 26664607
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664374 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26664473  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  26664474 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaagatttactgatgaaatgtt-aaaatca 26664571  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26664572 atctgaaaagactcagagacagtcgcaaggatgaaa 26664607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26770345 - 26770578
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26770345 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26770444  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  26770445 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaagatttactgatgaaatgtt-aaaatca 26770542  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26770543 atctgaaaagactcagagacagtcgcaaggatgaaa 26770578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26799913 - 26800146
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26799913 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26800012  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  26800013 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaagatttactgatgaaatgtt-aaaatca 26800110  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26800111 atctgaaaagactcagagacagtcgcaaggatgaaa 26800146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27478290 - 27478056
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27478290 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27478191  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27478190 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 27478092  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27478091 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27478056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27493545 - 27493311
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27493545 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27493446  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27493445 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 27493347  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27493346 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27493311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13776568 - 13776804
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13776568 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 13776667  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt--taaaaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||     
T  13776668 ctaaaaatgacctaaacagatccagattgacttgacactgacttagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaaa 13776766  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13776767 caatctgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 13776804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4518573 - 4518339
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4518573 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4518474  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4518473 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaacgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 4518375  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4518374 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4518339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4533760 - 4533526
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4533760 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4533661  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4533660 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaacgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 4533562  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4533561 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4533526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7985821 - 7985586
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7985821 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 7985722  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||  |    
T  7985721 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacgctgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgacatgtttaaaaata 7985622  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7985621 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 7985586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 8896904 - 8897138
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8896904 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 8897003  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||||||  |    
T  8897004 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattgacttgacactgactcggatgcaaatttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaacgttaaaaaaca 8897102  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8897103 atctgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 8897138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 8908139 - 8908373
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8908139 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 8908238  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||||||  |    
T  8908239 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattgacttgacactgactcggatgcaaatttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaacgttaaaaaaca 8908337  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8908338 atctgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 8908373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28200860 - 28200626
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28200860 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28200761  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28200760 ctaaaaatgacctaaacagagccaaaatgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 28200662  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28200661 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28200626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28215928 - 28215694
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28215928 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28215829  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28215828 ctaaaaatgacctaaacagagccaaaatgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 28215730  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28215729 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28215694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30549714 - 30549949
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30549714 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 30549813  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||  |    
T  30549814 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacgctgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgacatgtttaaaaata 30549913  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30549914 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 30549949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30564977 - 30565212
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30564977 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 30565076  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||  |    
T  30565077 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacgctgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgacatgtttaaaaata 30565176  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30565177 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 30565212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 61 - 231
Target Start/End: Original strand, 4219258 - 4219427
Alignment:
Q  61 aaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4219258 aaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaat 4219357  T
Q  161 ttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4219358 tt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatcaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4219427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17018713 - 17018480
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17018713 aaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctggggctaa 17018614  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgac-ttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaagg-tttactgatgaaatgttaaaaatgaat 197  Q
    ||| |||||||||  | | |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17018613 aaatgacctaaaccaactcaaattgactttgtcactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggttttactgatgaaacgttaaaaatgaat 17018514  T
Q  198 ttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17018513 ttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 17018480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16562819 - 16562584
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16562819 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 16562720  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16562719 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 16562621  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16562620 atttgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 16562584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16667342 - 16667107
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16667342 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 16667243  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt-aaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||| |||||      
T  16667242 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattgacttgacactgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaacgttaaaaaaac 16667144  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16667143 aatctgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 16667107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22002962 - 22002728
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22002962 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgcgaaatgaccaaaatgcccctaggg 22002863  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  |    
T  22002862 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaat-aattttaacaaggtttactgacgaaaggttaaaaa-ca 22002765  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22002764 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 22002728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 4537499 - 4537734
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4537499 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4537598  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||    
T  4537599 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgacgaaatgtcaaaaaatg 4537698  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaa 230  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4537699 aatttgaaaagactcggagatagtcacaaggatgaa 4537734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4766218 - 4765985
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4766218 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4766119  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  4766118 ctaaaattgacctaaacagagtcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatg-atcttaacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 4766021  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4766020 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4765985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4786945 - 4787178
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4786945 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4787044  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  4787045 ctaaaattgacctaaacagagtcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatg-atcttaacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 4787142  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4787143 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4787178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26108133 - 26108367
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26108133 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgcgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26108232  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26108233 ctaaaaatgacctaaacagagccaaaatgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 26108331  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26108332 atttgaaaagacccagagacagtcacaaggatgaaa 26108367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26123365 - 26123599
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26123365 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgcgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26123464  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26123465 ctaaaaatgacctaaacagagccaaaatgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 26123563  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26123564 atttgaaaagacccagagacagtcacaaggatgaaa 26123599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16682624 - 16682389
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16682624 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 16682525  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt-aaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||| |||||      
T  16682524 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaatagacttgacactgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaacgttaaaaaaac 16682426  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16682425 aatctgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 16682389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 34456109 - 34456340
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34456109 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 34456208  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaattt 199  Q
    ||  |||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||| ||  ||| |    
T  34456209 aattgacctaaacagactcaaattgacttaacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaagattttctgacgaaaggttaacaaacaatct 34456307  T
Q  200 g-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34456308 gaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 34456340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27202781 - 27202547
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27202781 gacaagacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27202682  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
     |||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  27202681 ttaaaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaacct-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaca 27202583  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27202582 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27202547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4731134 - 4731368
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4731134 gacagaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4731233  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaatg 194  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||      
T  4731234 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgcaaaaaaaac 4731333  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4731334 aatctg--aagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4731368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 4551366 - 4551598
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4551366 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4551465  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||    
T  4551466 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgacttagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgacgaaatgtcaaaaaatg 4551565  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggat 227  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4551566 aatttgaaaagactcggagatagtcacaaggat 4551598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 34470397 - 34470628
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34470397 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatggggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 34470496  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaattt 199  Q
    ||  |||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||| ||  ||| |    
T  34470497 aattgacctaaacagactcaaattgacttaacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaagattttctgaagaaaggttaacaaacaatct 34470595  T
Q  200 g-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34470596 gaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 34470628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29566153 - 29565917
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29566153 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 29566054  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt--taaaaat 193  Q
     |||||| || ||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   |||||     
T  29566053 ttaaaaatgaactaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaaa 29565955  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29565954 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 29565917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29581559 - 29581323
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29581559 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 29581460  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt--taaaaat 193  Q
     |||||| || ||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   |||||     
T  29581459 ttaaaaatgaactaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaaa 29581361  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29581360 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 29581323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27246451 - 27246686
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27246451 gacaagacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27246550  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
     |||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  27246551 ttaaaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaacct-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 27246649  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27246650 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27246686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27258314 - 27258549
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27258314 gacaagacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27258413  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
     |||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  27258414 ttaaaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaacct-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 27258512  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27258513 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27258549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16743847 - 16743689
Alignment:
Q  72 gaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggt 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16743847 gaaaagaccaaaatgcccctagggctaaaaatgacctaaacagattcacattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggt 16743749  T
Q  172 ttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16743748 ttactgatgaaatgttaaaaatcaatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 16743689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29494544 - 29494312
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  29494544 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctgggg 29494445  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||      
T  29494444 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgactctgtcactgattcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaa---taaaaaac 29494349  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29494348 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 29494312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29509882 - 29509650
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  29509882 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctgggg 29509783  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||      
T  29509782 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgactctgtcactgattcagacgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaa---taaaaaac 29509687  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29509686 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 29509650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27190927 - 27190691
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tga-ggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||     ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27190927 gacaagacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 27190828  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaat 193  Q
    | |||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||||     
T  27190827 gttaaaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaacct-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaa 27190729  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27190728 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27190691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16762255 - 16762101
Alignment:
Q  72 gaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggt 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16762255 gaaaagaccaaaatgcccctagggctaaaaatgacctaaacagattcacattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggt 16762157  T
Q  172 ttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggat 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16762156 ttactgatgaaatgttaaaaatcaatctgaaaagactcagagacagtcacaaggat 16762101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27000910 - 27000693
Alignment:
Q  9 ggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27000910 ggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaat 27000811  T
Q  104 gacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaa 203  Q
    ||||||||||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||         |||||| ||| |||||    
T  27000810 gacctaaacagagccaaaatgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcagggtttactga---------aaaaatcaatctgaaa 27000721  T
Q  204 agactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27000720 agactcagagacagtcacaaggatgaaa 27000693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27016415 - 27016198
Alignment:
Q  9 ggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27016415 ggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaat 27016316  T
Q  104 gacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaa 203  Q
    ||||||||||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||         |||||| ||| |||||    
T  27016315 gacctaaacagagccaaaatgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcagggtttactga---------aaaaatcaatctgaaa 27016226  T
Q  204 agactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27016225 agactcagagacagtcacaaggatgaaa 27016198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 69 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7229352 - 7229189
Alignment:
Q  69 tgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaa 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7229352 tgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaatgacctaaatagactcaaattgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaa 7229253  T
Q  169 ggtttactgatgaaatgttaaaaatga-atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     | ||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7229252 aggttactgatgaaatgtaaaaaaaaccatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 7229189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4754414 - 4754648
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4754414 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4754513  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaa-tttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||  ||| ||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||   |  |||      
T  4754514 ctaaaattgacctaaacagaatcaaattgatctgacactgactcagacacaaatttaaaatgaactttaatccagatttactgatgaaa--atgcaaaac 4754611  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4754612 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4754648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4781378 - 4781144
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4781378 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4781279  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaa-tttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||  ||| ||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||   |  |||      
T  4781278 ctaaaattgacctaaacagaatcaaattgatctgacactgactcagacacaaatttaaaatgaactttaatccagatttactgatgaaa--atgcaaaac 4781181  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4781180 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4781144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 27295005 - 27295124
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27295005 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27295104  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  27295105 ctaaaaatgacctaaacaga 27295124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 231
Target Start/End: Original strand, 31922245 - 31922277
Alignment:
Q  199 tgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31922245 tgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 31922277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16995997 - 16995966
Alignment:
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaagga 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16995997 aatttgaaaagactcagagacagtcacaagga 16995966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27211115 - 27211084
Alignment:
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaagga 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27211115 aatttgaaaagactcagagacagtcacaagga 27211084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 226
Target Start/End: Original strand, 27238113 - 27238144
Alignment:
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaagga 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27238113 aatttgaaaagactcagagacagtcacaagga 27238144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 226
Target Start/End: Original strand, 27309443 - 27309474
Alignment:
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaagga 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27309443 aatttgaaaagactcagagacagtcacaagga 27309474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5994821 - 5994768
Alignment:
Q  30 tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaat 85  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  5994821 tgaggtacttcaaagtaacctcttt--gccaaaattttgtctgaaacgacgaaaat 5994768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 25550417 - 25550364
Alignment:
Q  30 tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaat 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||| |||||    
T  25550417 tgaggtacttcaaagtaacctctct--gccaaaatttcgtttgaaacgacgaaaat 25550364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 93)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31583993 - 31583759
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31583993 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 31583894  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31583893 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 31583795  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31583794 atctgaaaagactcagagatagtcacaaggatgaaa 31583759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33286078 - 33285844
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33286078 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 33285979  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33285978 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 33285880  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33285879 atctgaaaagactcagagaccgtcacaaggatgaaa 33285844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33301128 - 33300894
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33301128 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 33301029  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33301028 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 33300930  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33300929 atctgaaaagactcagagaccgtcacaaggatgaaa 33300894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 42066282 - 42066514
Alignment:
Q  3 caaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42066282 caaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct 42066381  T
Q  98 aaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaat 197  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42066382 aaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatcaat 42066480  T
Q  198 ttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42066481 ctgaaaagactcagagaccgtcacaaggatgaaa 42066514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37209744 - 37209508
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  37209744 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctgggg 37209645  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37209644 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgactctgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatg 37209545  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37209544 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 37209508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 40480171 - 40480407
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  40480171 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaattttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctgggg 40480270  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40480271 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgactctgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatg 40480370  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40480371 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 40480407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12057515 - 12057749
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12057515 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtagcctctctatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 12057614  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||   |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  12057615 ctaaaggtgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggattactgatgaaatgttaaaaatca 12057713  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12057714 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 12057749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18120161 - 18120395
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18120161 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtactttaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 18120260  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  18120261 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatct-aacaaggtttattgatgaaatgttaaaaatca 18120359  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18120360 atctgaaaagactcagagacagtcacgaggatgaaa 18120395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18130541 - 18130775
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18130541 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtactttaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 18130640  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  18130641 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatct-aacaaggtttattgatgaaatgttaaaaatca 18130739  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18130740 atctgaaaagactcagagacagtcacgaggatgaaa 18130775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28951403 - 28951638
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28951403 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28951502  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28951503 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcggacgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatga 28951602  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28951603 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28951638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28967627 - 28967862
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28967627 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28967726  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28967727 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcggacgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatga 28967826  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28967827 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28967862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 32598455 - 32598690
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  32598455 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 32598554  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  32598555 ctaaaaacgacctaaactgaatcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatggaaagttaaaaatga 32598654  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32598655 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 32598690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42136097 - 42135865
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42136097 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 42135998  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  42135997 ctaaaaatgacctaaacagattcaaactgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaatct-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaca 42135899  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatga 229  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42135898 atctgaaaagattcagagacagtcacaaggatga 42135865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 40465273 - 40465509
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  40465273 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaattttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctgggg 40465372  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40465373 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgactctgacactgactcggatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatg 40465472  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40465473 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 40465509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41668367 - 41668140
Alignment:
Q  9 ggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41668367 ggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaat 41668268  T
Q  104 gacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttg-aa 202  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||    
T  41668267 gacctaaacatattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaacaatctgaaa 41668169  T
Q  203 aagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41668168 aagactcagagacagtcacaaggatgaaa 41668140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41683173 - 41682946
Alignment:
Q  9 ggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41683173 ggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaat 41683074  T
Q  104 gacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttg-aa 202  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||    
T  41683073 gacctaaacatattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaacaatctgaaa 41682975  T
Q  203 aagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41682974 aagactcagagacagtcacaaggatgaaa 41682946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3782790 - 3782556
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3782790 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 3782691  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  3782690 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgactcaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 3782592  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3782591 attcgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 3782556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3798145 - 3797911
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3798145 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 3798046  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  3798045 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgactcaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 3797947  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3797946 attcgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 3797911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13176931 - 13177165
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13176931 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 13177030  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  13177031 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaggtttgaaatgaattt-aacaaggcttactgatgaaatgctaaaaaaca 13177129  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13177130 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 13177165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 29973989 - 29974224
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29973989 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 29974088  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  29974089 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 29974188  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29974189 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 29974224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30022653 - 30022418
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30022653 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 30022554  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  30022553 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 30022454  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30022453 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 30022418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30037917 - 30037682
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30037917 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 30037818  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  30037817 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 30037718  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30037717 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 30037682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 9542396 - 9542630
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9542396 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 9542495  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  9542496 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgagttt-aataaggtttactgataaaatgttaaaaa-ca 9542593  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9542594 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 9542630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 9555268 - 9555502
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9555268 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 9555367  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  9555368 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgagttt-aataaggtttactgataaaatgttaaaaa-ca 9555465  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9555466 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 9555502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2504222 - 2503988
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2504222 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 2504123  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2504122 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatgaaaagttaaaaatga 2504024  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2504023 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 2503988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2519542 - 2519308
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2519542 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 2519443  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2519442 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatgaaaagttaaaaatga 2519344  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2519343 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 2519308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13189276 - 13189510
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13189276 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 13189375  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  13189376 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaggtttgaaatgaattt-aacaaggcttactgatgaaatgctaaaaaaca 13189474  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13189475 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 13189510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13434269 - 13434504
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13434269 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgggaaatgaccaaaatgcccctgggg 13434368  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  13434369 ctaaaaacgacctaaacagatttaaattgacccgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgtttaaaaata 13434468  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13434469 atctgaaaaggctcagagacagtcacaaggatgaaa 13434504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13445163 - 13445398
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13445163 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgggaaatgaccaaaatgcccctgggg 13445262  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  13445263 ctaaaaacgacctaaacagatttaaattgacccgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgtttaaaaata 13445362  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13445363 atctgaaaaggctcagagacagtcacaaggatgaaa 13445398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28571754 - 28571520
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28571754 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28571655  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||  |    
T  28571654 ctaaaactgacctaaacagaatcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatggattt-gataaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaca 28571556  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28571555 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28571520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 37350279 - 37350513
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37350279 gacaaaacggactaaaatgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 37350378  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37350379 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 37350477  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37350478 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 37350513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 37663113 - 37663348
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  37663113 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 37663212  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  37663213 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcaaatttaaaatgaatttagacagggtttactgatgaaatgtcaaaaatga 37663312  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37663313 atttgaaaagactcagagatagtcacaaggatgaaa 37663348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 37678396 - 37678631
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  37678396 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 37678495  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  37678496 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcaaatttaaaatgaatttagacagggtttactgatgaaatgtcaaaaatga 37678595  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37678596 atttgaaaagactcagagatagtcacaaggatgaaa 37678631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5341107 - 5341341
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5341107 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5341206  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5341207 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 5341305  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5341306 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5341341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6867661 - 6867427
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6867661 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 6867562  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6867561 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 6867463  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6867462 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 6867427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6882785 - 6882551
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6882785 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 6882686  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6882685 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 6882587  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6882586 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 6882551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 8657168 - 8657403
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  8657168 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcacgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 8657267  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  8657268 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcaaacttaaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgtcaaaaatga 8657367  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8657368 atttgaaaagactcagagatagtcacaaggatgaaa 8657403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 8672142 - 8672377
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  8672142 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcacgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 8672241  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  8672242 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcaaacttaaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgtcaaaaatga 8672341  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8672342 atttgaaaagactcagagatagtcacaaggatgaaa 8672377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30145248 - 30145013
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30145248 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 30145149  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  30145148 ctaaaaatgacctaaacagactcgaattgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 30145049  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30145048 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 30145013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30160459 - 30160224
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30160459 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 30160360  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  30160359 ctaaaaatgacctaaacagactcgaattgacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 30160260  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30160259 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 30160224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33872640 - 33872405
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33872640 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 33872541  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  33872540 ctaaaaacgacctaaactgaatcaaattgacttgacactgactcagatgtaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 33872441  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33872440 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 33872405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33883543 - 33883308
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33883543 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 33883444  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  33883443 ctaaaaacgacctaaactgaatcaaattgacttgacactgactcagatgtaagtttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgaaatgtttaaaagta 33883344  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33883343 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 33883308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34609935 - 34609705
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34609935 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 34609836  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  34609835 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgactcaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 34609737  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggat 227  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34609736 atccgaaaagactcagagacagtcacaaggat 34609705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34625052 - 34624822
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34625052 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 34624953  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  34624952 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgactcaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 34624854  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggat 227  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34624853 atccgaaaagactcagagacagtcacaaggat 34624822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 37365328 - 37365562
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||     || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37365328 gacaaaacggactaaaatgaaccaatggcctaaatgtggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 37365427  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37365428 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 37365526  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37365527 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 37365562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23395221 - 23394987
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23395221 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgccccta-gg 23395123  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||||||      
T  23395122 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgagttt-aataaggtttactgataaaatgtttaaaaaac 23395024  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23395023 aatctgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 23394987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37725286 - 37725051
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  37725286 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaagg 37725187  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||       
T  37725186 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgatactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaa-caaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 37725088  T
Q  196 -atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37725087 catctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 37725051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33509615 - 33509380
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33509615 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 33509516  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||  |    
T  33509515 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacgctgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgacatgtttaaaaata 33509416  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33509415 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 33509380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33524878 - 33524643
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33524878 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 33524779  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||  |    
T  33524778 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacgctgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgacatgtttaaaaata 33524679  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33524678 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 33524643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15650426 - 15650662
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15650426 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtatgaaatgaccaaaatgcccctaggg 15650525  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt--taaaaat 193  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||   |||||     
T  15650526 ctaaaaatgtcctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagcttgaaatgaattt-aacaaggttcaccgatgaaatgtaaaaaaaaa 15650624  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15650625 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 15650662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15665802 - 15666038
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15665802 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtatgaaatgaccaaaatgcccctaggg 15665901  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt--taaaaat 193  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||   |||||     
T  15665902 ctaaaaatgtcctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagcttgaaatgaattt-aacaaggttcaccgatgaaatgtaaaaaaaaa 15666000  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15666001 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 15666038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 32587942 - 32588179
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  32587942 gacaaaacgaactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaatttcgtatgaaatgaccaaaatgcccctgggg 32588041  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggttt-actgatgaaatgttaaaaat 193  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32588042 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgactctgtcactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggttttactgatgaaatgttaaaaat 32588141  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32588142 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 32588179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 32606371 - 32606608
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  32606371 gacaaaacgaactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaatttcgtatgaaatgaccaaaatgcccctgggg 32606470  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggttt-actgatgaaatgttaaaaat 193  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32606471 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgactctgtcactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggttttactgatgaaatgttaaaaat 32606570  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32606571 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 32606608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11332119 - 11331883
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11332119 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 11332020  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt-aaaaatg 194  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||      
T  11332019 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaat-aattttaacaaggtttactgacgaaaggttaaaaaaac 11331921  T
Q  195 aatttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11331920 aatctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 11331883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26446521 - 26446756
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26446521 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 26446620  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt-aaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||      
T  26446621 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtctgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaaaac 26446719  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26446720 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31424654 - 31424418
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccc-tagg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31424654 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgtcaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgccccctagg 31424555  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||| ||||||||| || | |||  | ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31424554 gctaaaaatgacctaaactgactcaaacaggcttgacactgactcggacgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatg 31424455  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31424454 aatttgaaaagactcagagacagtcacgaggatgaaa 31424418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31439992 - 31439756
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccc-tagg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31439992 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgtcaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgccccctagg 31439893  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||| ||||||||| || | |||  | ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31439892 gctaaaaatgacctaaactgactcaaacaggcttgacactgactcggacgcaagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaatgttaaaaatg 31439793  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31439792 aatttgaaaagactcagagacagtcacgaggatgaaa 31439756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 37743957 - 37744191
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37743957 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 37744056  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37744057 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattgatctgacactgactcagacgcaaatttaaaatgaactt-aacaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 37744155  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37744156 atttaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 37744191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37748341 - 37748107
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37748341 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 37748242  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37748241 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattgatctgacactgactcagacgcaaatttaaaatgaactt-aacaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 37748143  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37748142 atttaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 37748107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37763587 - 37763353
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37763587 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 37763488  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37763487 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattgatctgacactgactcagacgcaaatttaaaatgaactt-aacaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 37763389  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37763388 atttaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 37763353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 37778039 - 37778273
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37778039 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 37778138  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37778139 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattgatctgacactgactcagacgcaaatttaaaatgaactt-aacaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 37778237  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37778238 atttaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 37778273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30142983 - 30142747
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30142983 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 30142884  T
Q  96 cta--aaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaat 193  Q
    |||  |||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||    
T  30142883 ctaaaaaaatgacctaaacagactcaaattgactcgacactgactcagatgcaagttcgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagtaaaaaat 30142785  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30142784 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 30142747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30177033 - 30176797
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30177033 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 30176934  T
Q  96 cta--aaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaat 193  Q
    |||  |||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||    
T  30176933 ctaaaaaaatgacctaaacagactcaaattgactcgacactgactcagatgcaagttcgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagtaaaaaat 30176835  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30176834 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 30176797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9310698 - 9310464
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9310698 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgtcaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 9310599  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9310598 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaa--a 9310501  T
Q  196 atttga-aaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9310500 ttctgagaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 9310464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9325957 - 9325723
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9325957 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgtcaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 9325858  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9325857 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaa--a 9325760  T
Q  196 atttga-aaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9325759 ttctgagaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 9325723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18367199 - 18367436
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaa-cgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18367199 gacaaaacggactaaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 18367298  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaat 193  Q
    |||||||| ||||||||| || | |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18367299 gctaaaaatgacctaaactgactcaaacagactctgacactgactcagatgcaagtttgaaatggatttaaacagggtttactgatgaaatgtcaaaaat 18367398  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18367399 gaatttgaaaaggctcagagatagtcacaaggatgaaa 18367436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18382238 - 18382475
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaa-cgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18382238 gacaaaacggactaaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 18382337  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaat 193  Q
    |||||||| ||||||||| || | |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18382338 gctaaaaatgacctaaactgactcaaacagactctgacactgactcagatgcaagtttgaaatggatttaaacagggtttactgatgaaatgtcaaaaat 18382437  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18382438 gaatttgaaaaggctcagagatagtcacaaggatgaaa 18382475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18492373 - 18492610
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18492373 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 18492472  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt---aaaaa 192  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| |||   |||||    
T  18492473 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattgacttgacactgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaacgtttaaaaaaa 18492571  T
Q  193 tgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
      ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18492572 acaatctgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 18492610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Original strand, 25639859 - 25640054
Alignment:
Q  31 gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttga 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25639859 gaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaacgacctaaacagattgaaattgactcaa 25639958  T
Q  131 cattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggat 227  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25639959 cactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaacaatccgaaaagactcagagatagtcacaaggat 25640054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28657802 - 28657567
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28657802 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28657703  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||       
T  28657702 ctaaaat-gacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatggaatgtaaaaaaaac 28657604  T
Q  196 att-tgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28657603 attctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28657567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27288866 - 27289100
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27288866 gacaaaacggactaaaacgaaccaacgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 27288965  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
     |||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  27288966 ttaaaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaca 27289064  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27289065 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 27289100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11321331 - 11321094
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtg-tgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11321331 gacaaaacggactaaaacgaatcaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgatgaaatgaccaaaatgcccctagg 11321232  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt-aaaaat 193  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||     
T  11321231 gctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaat-aattttaacaaggtttactgacgaaaggttaaaaaaa 11321133  T
Q  194 gaatttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11321132 caatctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 11321094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18507688 - 18507924
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18507688 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctatgg 18507787  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt--aaaaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| |||  |||||     
T  18507788 ctaaaaatgacctaaacagaatcaaattgacttgacactgactcggatgcaagtttgaaatgaattt-gataaggcttactgatgaaacgtttaaaaaaa 18507886  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18507887 caatctgaaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 18507924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28642397 - 28642161
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28642397 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 28642298  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  |    
T  28642297 ctaaaat-gacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatggaatgtaaaaaaaaa 28642199  T
Q  196 -att-tgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28642198 cattctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 28642161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43071461 - 43071227
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43071461 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 43071362  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    || |||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  43071361 ct-aaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggcttactgatgaaatgctaaaaaaca 43071264  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43071263 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 43071227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43086748 - 43086514
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43086748 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 43086649  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    || |||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  43086648 ct-aaaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggcttactgatgaaatgctaaaaaaca 43086551  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43086550 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 43086514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5631355 - 5631119
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5631355 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5631256  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt--taaaaat 193  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| || ||   |||||     
T  5631255 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagttcgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagtaaaaaaaaa 5631157  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5631156 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5631119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5646229 - 5645993
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5646229 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 5646130  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt--taaaaat 193  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| || ||   |||||     
T  5646129 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagttcgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagtaaaaaaaaa 5646031  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5646030 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 5645993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24717103 - 24716868
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24717103 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 24717004  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
     |||||| || ||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  24717003 ttaaaaatgaactaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgcaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 24716905  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716904 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 24716868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24732563 - 24732328
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24732563 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 24732464  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
     |||||| || ||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  24732463 ttaaaaatgaactaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgcaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 24732365  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24732364 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 24732328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12125400 - 12125168
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12125400 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgtcaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 12125301  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |    
T  12125300 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgttaaa----a 12125205  T
Q  196 atttga-aaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12125204 ttctgagaaagactcagagacagtcacagggatgaaa 12125168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12140653 - 12140421
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12140653 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgtcaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 12140554  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |    
T  12140553 ctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgttaaa----a 12140458  T
Q  196 atttga-aaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12140457 ttctgagaaagactcagagacagtcacagggatgaaa 12140421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24674576 - 24674340
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24674576 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 24674477  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt--aaaaat 193  Q
     |||||| || ||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  |  |||||     
T  24674476 ttaaaaatgaactaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgcaatgaactt-aacaaggtttactgatgaaatagtaaaaaaaa 24674378  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24674377 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 24674340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13316428 - 13316663
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccc-tagg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13316428 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgtcaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgccccctagg 13316527  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||      
T  13316528 gctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaaattag-caaggtttactgatgaaatgctaaaaaat 13316626  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13316627 aatctgaaaaaactcagagacagtcacaaggatgaaa 13316663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13331755 - 13331990
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccc-tagg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13331755 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgtcaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgccccctagg 13331854  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    |||||||| ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||      
T  13331855 gctaaaaatgacctaaactgactcaaacagacttgacactgactcagacgcaagtttgaaatgaaattag-caaggtttactgatgaaatgctaaaaaat 13331953  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13331954 aatctgaaaaaactcagagacagtcacaaggatgaaa 13331990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15750592 - 15750825
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15750592 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgtcaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 15750691  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||| |||||| ||||||  |  ||||  |    
T  15750692 ct-aaaacgacctaaacagattcaaattgatctgacactgactcagacgcaaatttaaaatgaacttaatcaagatttactaatgaaa-atgcaaaaaca 15750789  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15750790 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 15750825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15765820 - 15766053
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15765820 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgtcaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 15765919  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||| |||||| ||||||  |  ||||  |    
T  15765920 ct-aaaacgacctaaacagattcaaattgatctgacactgactcagacgcaaatttaaaatgaacttaatcaagatttactaatgaaa-atgcaaaaaca 15766017  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15766018 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 15766053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 24787189 - 24787418
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24787189 aaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgcgaaatggccaaaatgcccctagggct-a 24787287  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaattt 199  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||  ||| |    
T  24787288 aaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaatgtaaaaaaacaatct 24787386  T
Q  200 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787387 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 24787418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 31818097 - 31818318
Alignment:
Q  14 aaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaacgacct 108  Q
    ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31818097 aaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgtcaaaattttgtgtgaaatgaccagaatgcccctagggctaaaaacgacct 31818196  T
Q  109 aaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagact 208  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||  |  ||||  ||| ||||||||||    
T  31818197 aaacagattcaaattgatctgacactgactcagacgcaaatttaaaatgaacttaatcaagatttactgatgaaa-atgcaaaaacaatctgaaaagact 31818295  T
Q  209 cagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31818296 cagagacagtcacaaggatgaaa 31818318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 31833127 - 31833348
Alignment:
Q  14 aaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaacgacct 108  Q
    ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31833127 aaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgtcaaaattttgtgtgaaatgaccagaatgcccctagggctaaaaacgacct 31833226  T
Q  109 aaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagact 208  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||  |  ||||  ||| ||||||||||    
T  31833227 aaacagattcaaattgatctgacactgactcagacgcaaatttaaaatgaacttaatcaagatttactgatgaaa-atgcaaaaacaatctgaaaagact 31833325  T
Q  209 cagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31833326 cagagacagtcacaaggatgaaa 31833348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 29893729 - 29893822
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgccc 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29893729 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacccctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgccc 29893822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 26473642 - 26473553
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaat 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26473642 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgtcaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaat 26473553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 26488691 - 26488602
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaat 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26488691 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgtcaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaat 26488602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4034 - 4268
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4034 gacaaaacggactaaaacgaaccaaaggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 4133  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4134 ctaaaaatgacctaaacggattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 4232  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4233 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 4268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14555 - 14324
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14555 aaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 14456  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaattt 199  Q
    ||  |||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||| ||  ||| |    
T  14455 aattgacctaaacagactcaaattgacttaacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaagattttctgacgaaaggttaacaaacaatct 14357  T
Q  200 g-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14356 gaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 14324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2368 - 2134
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2368 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 2269  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  2268 ctaaaattgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggcttactgatgaaacgttaaaaatca 2170  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2169 atctgaaaaggctcagagacagtcacaaggatgaaa 2134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26103 - 26338
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26103 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgtccctaggg 26202  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26203 ctaaaaatgacctaaacagattcgaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 26301  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26302 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 26338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46741 - 46506
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46741 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgtccctaggg 46642  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46641 ctaaaaatgacctaaacagattcgaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 46543  T
Q  196 atttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46542 atctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 46506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 91059 - 90824
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  91059 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatggcaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 90960  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt-taaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||      
T  90959 ctaaaaatgacctaaacagattgaaattgacttaacactgactcagacgcaagtttgaaacgaattt-aacaaagtttactgatgaaatgtaaaaaaaac 90861  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90860 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 90824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22269 - 22505
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22269 gacaaaacggactaaaacgatccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 22368  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt--aaaaat 193  Q
    ||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||     
T  22369 ctaaaattgacctaaacaaattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgacgaaatgttaaaaaaaa 22467  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22468 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 22505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14243 - 14479
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14243 gacaaaacggactaaaacgaaccaaaggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaatttttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 14342  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgact-tgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  14343 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgactctgacactgactcagatgcgagtttgaaatgaatttaaacagggtttactgatgaaaagtaaaaaatg 14442  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14443 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 14479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12405 - 12172
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12405 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 12306  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaa-tgttaaaaatg 194  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |   |||||||    
T  12305 ctaaaaatgacctaaacagagccaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactg--gaaagtaaaaaaaatg 12209  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12208 aatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 12172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 57062 - 57300
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57062 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 57161  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtt---aaaaa 192  Q
    ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  57162 ctaaaaatgacctaaacatattctaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgatgaaaggtttaaaaaaa 57260  T
Q  193 tgaatttg-aaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
      ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57261 acaatctgaaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 57300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1358 - 1124
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1358 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 1259  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1258 ctaaaaatgacctaaacagagccaaaatgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 1160  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1159 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16426 - 16192
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16426 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 16327  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16326 ctaaaaatgacctaaacagagccaaaatgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaaagttaaaaatga 16228  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16227 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 16192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 131368 - 131603
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  131368 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 131467  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||  |    
T  131468 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacgctgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaagtttactgatgacatgtttaaaaata 131567  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  131568 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 131603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14623 - 14398
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14623 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtactttaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 14524  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14523 ctaaaaatgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaggtttgagatgaatct-aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatca 14425  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcaca 222  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||    
T  14424 atctgaaaagactcagagacagacaca 14398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0279 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0279
Description:

Target: scaffold0279; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 10157 - 10389
Alignment:
Q  3 caaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10157 caaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggct 10256  T
Q  98 aaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaat 197  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||| ||||  |||    
T  10257 gaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgagttt-aatagggtttactgataaaatgtttaaaaacaat 10355  T
Q  198 ttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10356 ctggaaagactcggagacagtcacaaggatgaaa 10389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 20519 - 20752
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20519 aaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctggggctaa 20618  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgac-ttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaagg-tttactgatgaaatgttaaaaatgaat 197  Q
    ||| |||||||||  | | |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20619 aaatgacctaaaccaactcaaattgactttgtcactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggttttactgatgaaacgttaaaaatgaat 20718  T
Q  198 ttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20719 ttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 20752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 944 - 1174
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  944 gacaaaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctccctatgccaaaatttcgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 1043  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  1044 ctaaaaacgacctaaacggattgaaattgactcaacactgactcagacgcaagtttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatg-taaaaaaca 1142  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggat 227  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1143 atccgaaaagactcagagatagtcacaaggat 1174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14355 - 14590
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14355 gacaaaacggactaaaacgaacccatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 14454  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgtta-aaaatg 194  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| || | ||| | ||||||||||||||  | ||||      
T  14455 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacttgacactaactcagacgcaagtttgaaacgaaatt-agcaaagcttactgatgaaatgaaagaaaaac 14553  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14554 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 14590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0580 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0580
Description:

Target: scaffold0580; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 7149 - 7385
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7149 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 7248  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgt--taaaaat 193  Q
     |||||  |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||   |||||     
T  7249 ttaaaattgacctaaacagactcaaattgacttgacactgactcagatgcaagttcgaaatgaacct-aacaaggtttactgatgaaatgtaaaaaaaaa 7347  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7348 caatctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 7385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1556 - 1322
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1556 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctgggg 1457  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatga 195  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||  |    
T  1456 ctaaaaacaacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgctaatttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatg-caaaaaaca 1358  T
Q  196 atttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1357 atctgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 1322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 85823 - 85641
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85823 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccgaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 85724  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgat 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  85723 ctaaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaattt-aacaaggtttactgat 85641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 11748 - 11982
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11748 gacagaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 11847  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaatg 194  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||      
T  11848 ctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgactcagacgcaaatttgaaatgaattttaacaaggtttactgatgaaatgcaaaaaaaac 11947  T
Q  195 aatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11948 aatctg--aagactcagagacagtcacaaggatgaaa 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 1222 - 1385
Alignment:
Q  2 acaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggc 96  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1222 acaaaatggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggc 1321  T
Q  97 taaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaat 160  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1322 taaaaatgacctaaacagattcaaattgacttgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaat 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 29572 - 29801
Alignment:
Q  5 aaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29572 aaacggactaaaacgaaccaatgacctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgcgaaatggccaaaatgcccctagggct-a 29670  T
Q  100 aaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaattt 199  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||  ||| |    
T  29671 aaatgacctaaacagaatcaaattaactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaatt-agcaaggtttactgatggaatgtaaaaaaacaatct 29769  T
Q  200 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29770 gaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 29801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0489
Description:

Target: scaffold0489; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 61 - 231
Target Start/End: Original strand, 3749 - 3920
Alignment:
Q  61 aaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaacgacctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  3749 aaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagggctaaaaacgacctaaacagattcaaattgacctgacactgacttagacgcaaatttgaaatgaat 3848  T
Q  161 ttaaacaaggtttactgatgaaatg-ttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    || |||||||| |||||||||||||   |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3849 tttaacaaggtctactgatgaaatgcaaaaaaaacaatctgaaaagacttagagacagtcacaaggatgaaa 3920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4053 - 3916
Alignment:
Q  96 ctaaaaacgacctaaacagattgaaattgactt-gacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggttt-actgatgaaatgttaaaaat 193  Q
    ||||||| |||||||||  | | |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  4053 ctaaaaatgacctaaaccaactcaaattgactttgtcactgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacagggttttactgatgaaacgttaaaaat 3954  T
Q  194 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3953 gaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 3916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Original strand, 1 - 125
Alignment:
Q  106 cctaaacagattgaaattgacttgacattgactcagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaag 205  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1 cctaaacagagccaaattgactcgacactgactcagatgcaagtttgaaatgaaattag-caaggtttactgatggaaagttaaaaatgaatttgaaaag 99  T
Q  206 actcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  100 actcagagacagtcacaaggatgaaa 125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 2412 - 2531
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2412 gacaaaacggactaaaacgaaccaacggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 2511  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaacaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  2512 ctaaaaatgacctaaacaga 2531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Original strand, 2528 - 2616
Alignment:
Q  139 cagatgcaagtttgaaatgaatttaaacaaggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2528 cagacgcaagtttgaaatgaatttaa-caaggtttactgatgaaat---aaaaaacaatctgaaaagactcagagacagttacaaggatgaaa 2616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 5689 - 5567
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaa-cgaaccaatggct-----gaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 94  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5689 gacaaagcggactaaaaacgaaccaatggcttaaatgaggtacttcaaagtaacctctctatgccaaaatcttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctagg 5590  T
Q  95 gctaaaaacgacctaaacagatt 117  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  5589 gctaaaattgacctaaacagatt 5567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1760 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1760
Description:

Target: scaffold1760; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 117 - 1
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  117 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaatttcatgtgaaatgaccaaaatgcccctaggg 18  T
Q  96 ctaaaaacgacctaaac 112  Q
    ||||||| |||||||||    
T  17 ctaaaaatgacctaaac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 231
Target Start/End: Original strand, 1 - 63
Alignment:
Q  169 ggtttactgatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 ggtttactgatgaaaagttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 63  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Original strand, 15 - 69
Alignment:
Q  177 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15 gatgaaatgttaaaaatgaatttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 69  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0603 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0603
Description:

Target: scaffold0603; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 1270 - 1358
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctctctacgccaaaattttgtgtgaaatgaccaaaa 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1270 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctccccatgccaaaattttatgtgaaatgaccaaaa 1358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 231
Target Start/End: Original strand, 6875 - 6943
Alignment:
Q  164 aacaaggtttactgatgaaatgttaaaaat-gaatttgaaaaga-ctcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6875 aacaaggtttactgatggaa-gttaaaaatagaatttaaaaagaactcagagacagtcacaaggatgaaa 6943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1901 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1901
Description:

Target: scaffold1901; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 1200 - 1255
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctc 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  1200 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctc 1255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1179 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1179
Description:

Target: scaffold1179; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 2469 - 2524
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc-----tgaggtacttcaaagtaacctc 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  2469 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggcctaaatgaggtacttcaaagtaacctc 2524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22654 - 22621
Alignment:
Q  198 ttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22654 ttgaaaagactcagagacagtcacaaggatgaaa 22621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1803 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1803
Description:

Target: scaffold1803; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 42 - 14
Alignment:
Q  1 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42 gacaaaacggactaaaacgaaccaatggc 14  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University