View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3853_low_2 (Length: 415)

Name: NF3853_low_2
Description: NF3853
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3853_low_2
NF3853_low_2
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (19-415)||(22732899-22733295)
chr2 (19-411)||(23039706-23040098)
chr2 (25-408)||(23104859-23105242)
chr2 (57-411)||(20320940-20321294)
chr2 (26-411)||(22742095-22742480)
chr2 (23-415)||(23028587-23028978)
chr2 (26-408)||(21320135-21320517)
chr2 (26-415)||(24678416-24678805)
chr2 (173-415)||(23065451-23065693)
chr2 (173-415)||(23074901-23075143)
chr2 (158-415)||(23029822-23030079)
chr2 (24-411)||(24704611-24704998)
chr2 (24-411)||(22462610-22462997)
chr2 (24-411)||(23116188-23116575)
chr2 (24-411)||(24656787-24657174)
chr2 (41-415)||(10871794-10872165)
chr2 (24-415)||(17001927-17002315)
chr2 (38-415)||(9338523-9338897)
chr2 (38-415)||(9487157-9487531)
chr2 (32-415)||(44382698-44383078)
chr2 (41-411)||(24265314-24265681)
chr2 (41-411)||(24873882-24874249)
chr2 (38-415)||(16984181-16984555)
chr2 (19-135)||(23065335-23065451)
chr2 (19-135)||(23074785-23074901)
chr2 (24-415)||(27374196-27374584)
chr2 (23-411)||(24816968-24817357)
chr2 (41-415)||(22322470-22322841)
chr2 (24-137)||(23205241-23205354)
chr2 (24-137)||(23676845-23676958)
chr2 (265-411)||(19817988-19818135)
chr2 (41-240)||(24712978-24713174)
chr2 (265-405)||(45534674-45534814)
chr2 (26-93)||(11351158-11351225)
chr2 (218-408)||(21901658-21901848)
chr2 (143-240)||(16931598-16931695)
chr2 (307-415)||(16931714-16931822)
chr2 (292-408)||(28351070-28351186)
chr2 (287-405)||(30208056-30208174)
chr2 (206-406)||(12577462-12577662)
chr2 (131-405)||(19716152-19716426)
chr2 (131-405)||(19720715-19720989)
chr2 (41-125)||(21139399-21139480)
chr2 (28-60)||(20848520-20848552)
chr2 (28-60)||(23274524-23274556)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (19-412)||(17497601-17497994)
chr3 (20-405)||(23078851-23079236)
chr3 (23-411)||(14873413-14873801)
chr3 (26-415)||(15065988-15066377)
chr3 (19-411)||(14578249-14578641)
chr3 (23-405)||(12842945-12843319)
chr3 (26-411)||(11861270-11861655)
chr3 (25-411)||(23414618-23415004)
chr3 (24-411)||(16803775-16804162)
chr3 (185-411)||(15459254-15459476)
chr3 (26-408)||(16695081-16695463)
chr3 (19-411)||(15262540-15262923)
chr3 (19-408)||(19727670-19728058)
chr3 (24-415)||(24186105-24186493)
chr3 (24-228)||(12501848-12502052)
chr3 (133-404)||(13028181-13028451)
chr3 (38-415)||(16638702-16639076)
chr3 (38-415)||(43165604-43165978)
chr3 (41-415)||(10008532-10008903)
chr3 (41-415)||(20058881-20059252)
chr3 (38-415)||(3688872-3689246)
chr3 (41-415)||(10909142-10909513)
chr3 (38-411)||(48428376-48428746)
chr3 (131-375)||(12508418-12508662)
chr3 (24-240)||(6596970-6597183)
chr3 (85-411)||(15359025-15359351)
chr3 (41-240)||(15713058-15713254)
chr3 (41-415)||(15345072-15345443)
chr3 (35-240)||(5421932-5422134)
chr3 (24-237)||(6603650-6603860)
chr3 (38-415)||(12889638-12890012)
chr3 (28-415)||(13255609-13255993)
chr3 (266-411)||(15263599-15263735)
chr3 (41-240)||(15399520-15399716)
chr3 (38-415)||(26790240-26790614)
chr3 (38-411)||(53381850-53382219)
chr3 (202-376)||(10416897-10417071)
chr3 (24-240)||(16753703-16753916)
chr3 (28-351)||(10408897-10409220)
chr3 (137-331)||(16326604-16326798)
chr3 (41-411)||(5110240-5110607)
chr3 (38-411)||(15586223-15586593)
chr3 (203-402)||(17738986-17739185)
chr3 (203-402)||(19040306-19040505)
chr3 (290-415)||(12502125-12502250)
chr3 (209-405)||(13317392-13317588)
chr3 (131-406)||(16831350-16831625)
chr3 (28-351)||(11958058-11958381)
chr3 (202-405)||(17494753-17494956)
chr3 (28-405)||(47126873-47127250)
chr3 (173-405)||(2036735-2036967)
chr3 (173-405)||(2040476-2040708)
chr3 (173-405)||(14039820-14040052)
chr3 (28-351)||(28757248-28757571)
chr3 (177-402)||(2245498-2245723)
chr3 (131-406)||(16384194-16384469)
chr3 (206-408)||(14290352-14290554)
chr3 (206-408)||(15230710-15230912)
chr3 (206-408)||(15236578-15236780)
chr3 (206-408)||(35983288-35983490)
chr3 (338-411)||(15399349-15399422)
chr3 (206-406)||(8744212-8744412)
chr3 (202-405)||(16825102-16825305)
chr3 (203-402)||(18131173-18131372)
chr3 (307-405)||(12181552-12181650)
chr3 (28-90)||(16831666-16831728)
chr3 (206-406)||(13945131-13945331)
chr3 (28-60)||(31692353-31692385)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (19-415)||(18880685-18881081)
chr8 (20-411)||(21390893-21391284)
chr8 (20-411)||(21780219-21780610)
chr8 (26-411)||(19981331-19981716)
chr8 (19-411)||(21671872-21672264)
chr8 (27-411)||(21163562-21163946)
chr8 (23-415)||(22990406-22990789)
chr8 (19-411)||(22420925-22421317)
chr8 (26-411)||(22043191-22043567)
chr8 (24-411)||(30310176-30310563)
chr8 (25-411)||(15536746-15537132)
chr8 (27-411)||(32603510-32603894)
chr8 (188-353)||(1757879-1758044)
chr8 (23-286)||(22523871-22524134)
chr8 (24-415)||(19115762-19116150)
chr8 (35-411)||(20015298-20015671)
chr8 (41-405)||(18859956-18860317)
chr8 (190-411)||(3274633-3274854)
chr8 (41-240)||(22126165-22126361)
chr8 (41-411)||(17671057-17671424)
chr8 (38-225)||(19481293-19481477)
chr8 (41-411)||(22117210-22117577)
chr8 (170-408)||(6606504-6606742)
chr8 (19-99)||(21254301-21254381)
chr8 (202-411)||(21928968-21929177)
chr8 (131-406)||(22054332-22054607)
chr8 (189-405)||(22710308-22710524)
chr8 (28-351)||(28984277-28984600)
chr8 (137-351)||(29300518-29300732)
chr8 (137-372)||(20391561-20391796)
chr8 (205-411)||(17830002-17830208)
chr8 (118-263)||(31413712-31413857)
chr8 (28-103)||(16268564-16268639)
chr8 (206-405)||(21970589-21970788)
chr8 (269-375)||(22004149-22004255)
chr8 (307-415)||(19481104-19481212)
chr8 (269-405)||(21998478-21998614)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (19-411)||(22401898-22402290)
chr1 (26-411)||(20081038-20081422)
chr1 (19-411)||(21752353-21752745)
chr1 (26-327)||(22496001-22496302)
chr1 (26-411)||(24784519-24784903)
chr1 (27-411)||(21228217-21228601)
chr1 (26-411)||(21176680-21177065)
chr1 (26-415)||(22435400-22435779)
chr1 (121-410)||(16379502-16379791)
chr1 (24-411)||(17041677-17042063)
chr1 (131-411)||(22117132-22117412)
chr1 (128-411)||(21044815-21045098)
chr1 (85-411)||(19109739-19110064)
chr1 (41-411)||(21842540-21842907)
chr1 (38-415)||(16347254-16347629)
chr1 (41-415)||(51330152-51330523)
chr1 (33-411)||(22400640-22401015)
chr1 (323-411)||(22459664-22459752)
chr1 (323-411)||(22470093-22470181)
chr1 (170-408)||(18273255-18273493)
chr1 (41-415)||(21833630-21834001)
chr1 (38-225)||(41350518-41350702)
chr1 (41-415)||(33387689-33388060)
chr1 (206-405)||(20853427-20853626)
chr1 (131-415)||(16353903-16354187)
chr1 (203-402)||(20921929-20922128)
chr1 (28-351)||(31536718-31537041)
chr1 (28-351)||(38909547-38909870)
chr1 (202-408)||(21742216-21742422)
chr1 (28-263)||(24096424-24096659)
chr1 (202-402)||(19857794-19857994)
chr1 (28-351)||(48426219-48426542)
chr1 (137-415)||(20074366-20074644)
chr1 (202-411)||(21738697-21738906)
chr1 (137-351)||(21961482-21961697)
chr1 (28-351)||(52989087-52989409)
chr1 (28-60)||(21739048-21739080)
chr1 (28-60)||(37680395-37680427)
chr1 (307-415)||(41350329-41350437)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (19-415)||(211-607)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (19-415)||(10468-10864)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (19-408)||(16944-17333)
scaffold0114 (28-90)||(40387-40449)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (19-376)||(5-362)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (19-411)||(8731-9123)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (19-415)||(15231-15627)
scaffold0403 (127-348)||(5-226)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (22-411)||(25429646-25430035)
chr5 (26-415)||(21883005-21883396)
chr5 (25-411)||(23526280-23526666)
chr5 (24-415)||(20803825-20804216)
chr5 (24-411)||(18782342-18782729)
chr5 (131-411)||(21331760-21332040)
chr5 (26-225)||(23461201-23461400)
chr5 (84-411)||(23536986-23537313)
chr5 (22-344)||(26735566-26735888)
chr5 (131-411)||(23474529-23474809)
chr5 (19-411)||(21631170-21631562)
chr5 (24-415)||(40712008-40712396)
chr5 (41-411)||(22329661-22330028)
chr5 (38-415)||(16359744-16360118)
chr5 (38-415)||(34569736-34570110)
chr5 (41-415)||(27521651-27522022)
chr5 (41-415)||(19773205-19773576)
chr5 (41-240)||(22137913-22138109)
chr5 (41-411)||(22351164-22351531)
chr5 (41-411)||(29472847-29473214)
chr5 (41-411)||(37288270-37288637)
chr5 (186-405)||(21410524-21410741)
chr5 (41-238)||(27682347-27682541)
chr5 (173-372)||(43122826-43123025)
chr5 (202-376)||(20824841-20825015)
chr5 (41-240)||(41774087-41774283)
chr5 (41-411)||(14996513-14996880)
chr5 (305-412)||(23461413-23461520)
chr5 (28-405)||(23077682-23078059)
chr5 (33-240)||(27613593-27613797)
chr5 (206-405)||(22465342-22465541)
chr5 (137-351)||(25851395-25851609)
chr5 (173-405)||(16257813-16258045)
chr5 (268-408)||(21560799-21560939)
chr5 (173-405)||(22591532-22591764)
chr5 (173-405)||(22595087-22595319)
chr5 (209-372)||(23670027-23670190)
chr5 (85-412)||(27665276-27665603)
chr5 (28-351)||(22505893-22506216)
chr5 (28-350)||(20345496-20345818)
chr5 (186-351)||(21983008-21983173)
chr5 (202-405)||(28891719-28891922)
chr5 (33-351)||(14883822-14884140)
chr5 (22-63)||(23474420-23474461)
chr5 (28-60)||(25851286-25851318)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (19-411)||(11583-11975)
scaffold0120 (19-411)||(14404-14796)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (71-412)||(6872-7213)
scaffold0319 (19-77)||(1352-1410)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (38-410)||(7250-7622)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (26-411)||(49937-50322)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (19-415)||(9267-9663)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (19-411)||(8543-8935)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (19-415)||(24314-24696)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (19-411)||(18404670-18405070)
chr6 (26-415)||(22437031-22437420)
chr6 (26-415)||(21764974-21765363)
chr6 (20-411)||(23081579-23081970)
chr6 (24-411)||(27558703-27559090)
chr6 (40-405)||(25756355-25756720)
chr6 (26-412)||(5835964-5836347)
chr6 (132-411)||(18182121-18182401)
chr6 (63-237)||(19867855-19868029)
chr6 (277-411)||(19868031-19868165)
chr6 (41-240)||(25115729-25115925)
chr6 (194-415)||(25958483-25958704)
chr6 (131-411)||(18660186-18660466)
chr6 (24-411)||(22829123-22829507)
chr6 (38-415)||(29589172-29589546)
chr6 (41-240)||(2871710-2871906)
chr6 (24-415)||(16575050-16575438)
chr6 (24-415)||(16619942-16620330)
chr6 (38-415)||(27205796-27206170)
chr6 (38-415)||(27243058-27243432)
chr6 (38-415)||(28312804-28313178)
chr6 (268-411)||(18326261-18326404)
chr6 (38-411)||(24292519-24292889)
chr6 (206-405)||(20010241-20010440)
chr6 (28-411)||(23084559-23084942)
chr6 (28-344)||(10465649-10465965)
chr6 (121-376)||(15462593-15462848)
chr6 (38-411)||(28259934-28260304)
chr6 (38-411)||(28285612-28285982)
chr6 (38-411)||(28338683-28339053)
chr6 (202-405)||(19456361-19456564)
chr6 (202-405)||(19466506-19466709)
chr6 (186-372)||(19486067-19486253)
chr6 (134-411)||(30677767-30678035)
chr6 (206-351)||(25771186-25771331)
chr6 (28-351)||(24367564-24367887)
chr6 (355-411)||(19666937-19666993)
chr6 (202-405)||(14376656-14376859)
chr6 (19-78)||(18182455-18182514)
chr6 (202-405)||(19438340-19438543)
chr6 (131-258)||(21566878-21567005)
chr6 (33-90)||(21474769-21474826)
chr6 (34-103)||(25771014-25771083)
chr6 (28-60)||(24515499-24515531)
chr6 (307-411)||(25115995-25116099)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (20-411)||(54958-55349)
scaffold0080 (23-408)||(32203-32588)
scaffold0080 (24-399)||(9843-10218)
scaffold0080 (24-279)||(12618-12873)
scaffold0080 (23-71)||(37669-37717)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (19-411)||(4147-4539)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (25-410)||(21930-22315)
scaffold0081 (25-410)||(37354-37739)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (25-415)||(36408-36798)
scaffold0042 (23-411)||(26676-27064)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (25-415)||(8540-8930)
scaffold0029 (202-372)||(93525-93695)
scaffold0029 (87-240)||(107540-107693)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (58-415)||(194456-194813)
scaffold0017 (38-415)||(16654-17031)
scaffold0017 (166-415)||(21176-21425)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (22-410)||(48053-48441)
scaffold0075 (22-411)||(55063-55452)
[»] chr4 (40 HSPs)
chr4 (22-410)||(8330-8718)
chr4 (105-411)||(15144278-15144583)
chr4 (22-411)||(15365-15754)
chr4 (69-415)||(16350067-16350413)
chr4 (19-411)||(14162761-14163153)
chr4 (24-405)||(18223808-18224189)
chr4 (19-411)||(16219479-16219871)
chr4 (19-411)||(16222799-16223191)
chr4 (28-411)||(16248005-16248388)
chr4 (24-411)||(13513646-13514033)
chr4 (220-411)||(16241439-16241630)
chr4 (24-411)||(18604148-18604535)
chr4 (38-415)||(17091477-17091851)
chr4 (41-405)||(14300317-14300678)
chr4 (24-415)||(8389708-8390096)
chr4 (41-346)||(14683880-14684182)
chr4 (41-411)||(19635449-19635816)
chr4 (38-415)||(12479910-12480284)
chr4 (38-415)||(23959057-23959431)
chr4 (41-240)||(40476353-40476549)
chr4 (38-411)||(8049955-8050325)
chr4 (220-411)||(14699951-14700142)
chr4 (24-415)||(16233320-16233708)
chr4 (38-415)||(19775121-19775495)
chr4 (220-318)||(16252648-16252746)
chr4 (137-415)||(20893440-20893718)
chr4 (38-240)||(27714646-27714845)
chr4 (18-225)||(14697391-14697598)
chr4 (170-404)||(13879551-13879785)
chr4 (28-351)||(11203881-11204204)
chr4 (28-351)||(3261443-3261766)
chr4 (140-351)||(44658515-44658726)
chr4 (137-327)||(7357676-7357866)
chr4 (209-405)||(27903866-27904061)
chr4 (33-90)||(15073664-15073721)
chr4 (137-251)||(8709086-8709200)
chr4 (28-60)||(29450477-29450509)
chr4 (28-60)||(44658806-44658838)
chr4 (206-406)||(51603386-51603586)
chr4 (206-406)||(53750064-53750264)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (23-404)||(341-722)
scaffold0621 (23-404)||(4758-5139)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (105-411)||(34364-34669)
scaffold0022 (20-411)||(41953-42344)
scaffold0022 (20-411)||(75673-76064)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (26-415)||(367-747)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (20-405)||(23543-23928)
scaffold0243 (202-345)||(9432-9573)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (26-411)||(30614-30999)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (27-407)||(252-632)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (19-411)||(9939-10331)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (20-411)||(110499-110890)
scaffold0040 (19-411)||(18165-18557)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (26-414)||(30163-30551)
scaffold0023 (23-411)||(43045-43433)
scaffold0023 (122-405)||(163999-164282)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (23-415)||(15145517-15145909)
chr7 (27-411)||(14042983-14043367)
chr7 (27-411)||(14353013-14353397)
chr7 (24-411)||(9591649-9592036)
chr7 (28-405)||(11984281-11984658)
chr7 (24-279)||(17703185-17703440)
chr7 (24-415)||(11549699-11550087)
chr7 (24-279)||(16726171-16726426)
chr7 (24-411)||(12690786-12691170)
chr7 (24-415)||(14957793-14958181)
chr7 (131-411)||(15627916-15628196)
chr7 (24-415)||(44787948-44788336)
chr7 (41-240)||(11233985-11234181)
chr7 (24-415)||(14335681-14336069)
chr7 (24-415)||(8710890-8711278)
chr7 (24-415)||(18586768-18587156)
chr7 (41-411)||(15157658-15158025)
chr7 (24-240)||(10873746-10873959)
chr7 (41-240)||(13689343-13689539)
chr7 (28-344)||(12459918-12460234)
chr7 (43-240)||(18181047-18181241)
chr7 (137-415)||(13024743-13025021)
chr7 (314-411)||(48810691-48810788)
chr7 (131-406)||(14145054-14145329)
chr7 (202-411)||(14260822-14261031)
chr7 (28-351)||(16947108-16947431)
chr7 (28-351)||(26091434-26091757)
chr7 (358-411)||(11526955-11527008)
chr7 (268-408)||(12203379-12203519)
chr7 (131-406)||(14282955-14283230)
chr7 (28-351)||(26115226-26115549)
chr7 (202-402)||(13676909-13677109)
chr7 (137-405)||(21755811-21756079)
chr7 (28-351)||(49155591-49155914)
chr7 (131-405)||(11385011-11385285)
chr7 (206-406)||(18050534-18050734)
chr7 (19-60)||(15627804-15627845)
chr7 (307-411)||(18181307-18181411)
chr7 (28-60)||(40924744-40924776)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (113-374)||(19812-20073)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (19-329)||(2309-2619)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (19-411)||(3871-4263)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (26-405)||(14639-15018)
scaffold0177 (26-405)||(10954-11333)
[»] scaffold0423 (2 HSPs)
scaffold0423 (162-415)||(1220-1473)
scaffold0423 (19-145)||(2121-2247)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (26-415)||(36825-37214)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (24-411)||(113-500)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (19-411)||(17569-17961)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (63-415)||(66118-66470)
scaffold0064 (26-59)||(69366-69399)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (26-415)||(63-452)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (34-411)||(104561-104938)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (19-398)||(18970-19346)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (26-411)||(17487-17872)
scaffold0044 (41-411)||(3766-4133)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (19-225)||(9221-9427)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (26-411)||(3869-4254)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (38-415)||(121764-122141)
scaffold0034 (209-405)||(70882-71078)
scaffold0034 (206-405)||(11504-11703)
scaffold0034 (28-60)||(1895-1927)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (33-415)||(448-819)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (24-411)||(72-459)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (26-405)||(229450-229829)
scaffold0009 (202-351)||(252122-252271)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (24-411)||(5323-5710)
[»] scaffold0010 (5 HSPs)
scaffold0010 (27-411)||(14752-15136)
scaffold0010 (19-411)||(5235-5627)
scaffold0010 (202-376)||(180466-180640)
scaffold0010 (202-402)||(38936-39134)
scaffold0010 (28-60)||(39276-39308)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (26-411)||(13622-14009)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (20-411)||(7194-7585)
scaffold0270 (20-411)||(14324-14715)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (220-402)||(16124-16306)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (185-411)||(2715-2937)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (24-411)||(3189-3576)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (27-405)||(469-847)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (38-412)||(15179-15544)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (24-411)||(361-748)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (24-411)||(139202-139589)
scaffold0008 (24-411)||(175-561)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (19-411)||(15730-16122)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (38-411)||(684-1057)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (24-405)||(204-585)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (24-405)||(12722-13103)
scaffold0109 (24-411)||(41480-41864)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (24-411)||(171443-171831)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (19-240)||(40270-40491)
scaffold0122 (335-411)||(40189-40265)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (19-411)||(216012-216404)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (19-224)||(1302-1507)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (131-411)||(50-329)
[»] scaffold0476 (3 HSPs)
scaffold0476 (188-404)||(11256-11471)
scaffold0476 (22-151)||(11108-11237)
scaffold0476 (131-415)||(133-417)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (25-392)||(28539-28906)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (127-393)||(11456-11722)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (131-411)||(13857-14137)
scaffold0342 (19-63)||(14205-14249)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (19-411)||(23125-23517)
scaffold0011 (202-350)||(153995-154143)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (24-411)||(7371-7758)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (19-351)||(57265-57598)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (134-411)||(16201-16478)
scaffold0100 (23-60)||(16552-16589)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (231-415)||(36315-36499)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (24-415)||(8583-8971)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (311-411)||(6594-6694)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (41-411)||(10710-11076)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (127-375)||(6539-6787)
scaffold0074 (202-405)||(15575-15778)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (28-411)||(22890-23273)
scaffold0018 (23-411)||(8942-9331)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (27-143)||(10018-10134)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (24-228)||(424633-424837)
scaffold0003 (131-406)||(203813-204088)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (28-405)||(1085-1462)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (131-372)||(5520-5761)
scaffold0529 (19-62)||(5408-5451)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (24-411)||(55329-55713)
scaffold0028 (141-411)||(11891-12161)
scaffold0028 (141-411)||(21419-21689)
scaffold0028 (41-120)||(11811-11887)
scaffold0028 (41-120)||(21339-21415)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (24-404)||(48990-49367)
scaffold0007 (203-402)||(162609-162808)
[»] scaffold1600 (2 HSPs)
scaffold1600 (131-348)||(498-715)
scaffold1600 (28-78)||(400-450)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (185-405)||(2237-2457)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (131-411)||(2431-2711)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (268-411)||(17951-18094)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (38-411)||(22586-22956)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (38-411)||(7575-7945)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (269-415)||(1-147)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (137-415)||(11415-11693)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (146-415)||(17686-17955)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (128-393)||(64932-65197)
scaffold0053 (33-411)||(62364-62742)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (271-411)||(3520-3661)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (131-411)||(1014-1294)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (131-411)||(442084-442364)
scaffold0001 (28-351)||(514005-514328)
scaffold0001 (22-63)||(496343-496384)
[»] scaffold0609 (1 HSPs)
scaffold0609 (170-404)||(8028-8262)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (137-344)||(963-1170)
[»] scaffold0282 (2 HSPs)
scaffold0282 (203-402)||(9723-9922)
scaffold0282 (19-258)||(13219-13458)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (137-351)||(30348-30562)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (141-351)||(66760-66970)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (202-402)||(1007-1208)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (202-411)||(30620-30829)
[»] scaffold0331 (2 HSPs)
scaffold0331 (236-411)||(14595-14770)
scaffold0331 (23-64)||(14918-14959)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (202-402)||(416-616)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (131-406)||(263658-263933)
scaffold0005 (28-90)||(263555-263617)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (348-411)||(30591-30654)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (189-324)||(40787-40922)
scaffold0035 (281-405)||(6386-6510)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (305-411)||(23818-23924)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (137-291)||(33084-33238)
[»] scaffold0848 (1 HSPs)
scaffold0848 (206-375)||(4639-4808)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (177-402)||(636-861)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (177-402)||(25938-26163)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (206-402)||(53024-53220)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (170-405)||(37-272)
[»] scaffold0067 (2 HSPs)
scaffold0067 (202-405)||(30127-30330)
scaffold0067 (131-406)||(64199-64474)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (203-402)||(433-632)
scaffold0046 (33-103)||(70442-70512)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (137-351)||(13706-13920)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (137-351)||(23575-23789)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (33-411)||(51985-52363)
[»] scaffold0523 (2 HSPs)
scaffold0523 (200-353)||(11393-11546)
scaffold0523 (202-411)||(5940-6149)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (19-96)||(1771-1848)
scaffold0447 (368-411)||(1604-1647)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (19-96)||(4635-4712)
scaffold0383 (368-411)||(4468-4511)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (202-351)||(5556-5705)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (33-90)||(176321-176378)
scaffold0020 (202-405)||(98181-98384)
scaffold0020 (269-348)||(176557-176636)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (206-406)||(5854-6054)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (202-402)||(8622-8822)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (202-402)||(3128-3328)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (24-411)||(263-636)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (131-405)||(85-359)
scaffold0222 (28-60)||(21143-21175)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (28-351)||(790-1113)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (131-404)||(17083-17356)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (281-411)||(17219-17349)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (206-411)||(30034-30238)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (202-393)||(4819-5010)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (131-242)||(9548-9659)
scaffold0239 (28-90)||(9700-9762)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (317-411)||(3896-3990)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (28-99)||(30230-30301)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (28-103)||(115953-116028)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (33-351)||(924-1242)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (137-406)||(2269-2538)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (269-411)||(6172-6314)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (33-351)||(27937-28255)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (146-351)||(455-660)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (33-90)||(34671-34728)
[»] scaffold1914 (1 HSPs)
scaffold1914 (206-406)||(827-1027)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (28-60)||(1254-1286)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (28-60)||(12126-12158)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (28-60)||(8073-8105)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (28-60)||(42064-42096)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 22733295 - 22732899
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22733295 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatttctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 22733196  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22733195 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 22733096  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22733095 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 22732996  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22732995 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 22732899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23040098 - 23039706
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23040098 atccccaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacagacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggccgtctaccttcgacc 23039999  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  23039998 atcctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggagactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttaa 23039899  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23039898 tatcctcctcgtagatcctgcaactgctcaccagctcggagaaaactcggatcttctgttaaccaattgccctcttaatctcagcacacaaaccgttctc 23039799  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23039798 aaatttgattcactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaactttgccaattccacaaacttggctacatactcagtcac 23039706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 25 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23105242 - 23104859
Alignment:
Q  25 aggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctc 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| | |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  23105242 aggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagagaaacaaataatctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctc 23105143  T
Q  125 tctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcct 224  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23105142 tgtttgcccttatcagcaggtgcactgtaaggcttagggcggctctgctggcccttagtcttctgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcct 23105043  T
Q  225 cctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaattt 324  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||  || || |||||||| ||    
T  23105042 cctcgtaaatcctgcaactgcccaccagctcggagaaaactcagatcttctggtaaccaattgccctcttgatttcagcacctaacccattctcaaactt 23104943  T
Q  325 gatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagt 408  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23104942 gatgcactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaactttgccaattccacaaacttggcagcatactcagt 23104859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 57 - 411
Target Start/End: Original strand, 20320940 - 20321294
Alignment:
Q  57 cacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaag 156  Q
    |||||| |||||| |||||||| | || |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  20320940 cacaagaaaaacaaacaatctcagcagaagcatcattcttcttcggccgtctatcttcgaccattatctgttttcccttatcagcaggggcactataagg 20321039  T
Q  157 attagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctca 256  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20321040 cttagggtgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttagtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcg 20321139  T
Q  257 gagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggag 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20321140 gagaaaactcggatcttctggtaaccaattgccctcttgatctcagcacgtaaaccgttctcaaatttgatgcactttgaaaactcagcagtctcaggag 20321239  T
Q  357 tgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20321240 tgtagtgcggataaaactttgccaattccacaaacttcgcagcatactcagtcac 20321294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22742480 - 22742095
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||   || | ||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||    
T  22742480 ggacaagcattgctcttgtggcatttctcaccacaattaaagcagacaatctcaccagcaacatccttcttcctcggccgtctatcctcaaccattctct 22742381  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22742380 gtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctc 22742281  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||    
T  22742280 ttcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcggagaaaactcggatcttctggtaaccaattgccctcttgatttcagcacgtaacccgttctcaaacttg 22742181  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |  |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22742180 aagcactttgaaaactcagcaatctcgggggtgtagtgcggataaaactttgccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 22742095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 23028978 - 23028587
Alignment:
Q  23 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattc 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| |    
T  23028978 ccaggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaa-taaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcc 23028880  T
Q  123 tctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatc 222  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23028879 tctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcctttagtattccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatc 23028780  T
Q  223 ctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaat 322  Q
    |||||| ||||| || |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||     
T  23028779 ctcctcataaattctacaactgttcaccaactcggagaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctttatatcagcccgcaatccattctcgaac 23028680  T
Q  323 ttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23028679 ttgatacacttcaaaaactcagcagtctctgcagcgtaatgcggataaaactttgccaactctacaaacttggcagcatactcagttacggac 23028587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21320517 - 21320135
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |    
T  21320517 ggacaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcagggacatccttcttcttaggccgcctatcctcgaccattcttt 21320418  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     ||||||||||||||||||||  || ||| | ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21320417 gtttgcccttatcagcaggggtgctataaggcttagggcaactctgctggcccctagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcatc 21320318  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||| || |||    
T  21320317 ctcataaattctgcagctattcaccagctcggagaaaactcggatttgttggtatccaattgccctctttatatcaggccgcaaaccattctcgaacttg 21320218  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagt 408  Q
    || |||||||| |||||||||||||||   || || ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21320217 atgcactttgagaactcagcagtctctactgtataatgcggataaaactttgccaactcaacaaacttggcagcatactcagt 21320135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 415
Target Start/End: Original strand, 24678416 - 24678805
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  24678416 ggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccatcctct 24678515  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24678516 gtttgcccttatcagcaggggcgctatagggcttagggcgactctattggcccttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctc 24678615  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
     || ||||| ||||||||| |||||| |||  | ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||     
T  24678616 gtcataaattctgcaactgttcaccaactcgcaaaaaactcggatctattggtatccaattgccctcttgatatcagcccgcaatccattctcgaactta 24678715  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||    ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24678716 atacacttcgaaaactcagcagtctctgcagcgtaacttggatagaactttgccaactctacaaacttggcagcatactcagttacggac 24678805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 173 - 415
Target Start/End: Original strand, 23065451 - 23065693
Alignment:
Q  173 tgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatct 272  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23065451 tgacctttagcctttcgctcattcacaatcttgtaattagtcttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcactagctcagagaaaactcgaatct 23065550  T
Q  273 tttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaa 372  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||    
T  23065551 tctggtaaccaatttctctctttatctcagcacacaaaccgttctcgaatttgatacacttcgaaaactcagtagtctctgcagtgtaatgtggataaaa 23065650  T
Q  373 cttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23065651 ctttgccaattccacaaacttggcagcatgctcagtcacggac 23065693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 173 - 415
Target Start/End: Original strand, 23074901 - 23075143
Alignment:
Q  173 tgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatct 272  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23074901 tgacctttagcctttcgctcattcacaatcttgtaattagtcttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcactagctcagagaaaactcgaatct 23075000  T
Q  273 tttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaa 372  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||    
T  23075001 tctggtaaccaatttctctctttatctcagcacacaaaccgttctcgaatttgatacacttcgaaaactcagtagtctctgcagtgtaatgtggataaaa 23075100  T
Q  373 cttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23075101 ctttgccaattccacaaacttggcagcatgctcagtcacggac 23075143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 158 - 415
Target Start/End: Original strand, 23029822 - 23030079
Alignment:
Q  158 ttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcag 257  Q
    ||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  23029822 ttaggacgactctgttgtcccctggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtgtcctcctcataaatcctgcaactactcaccaactcgg 23029921  T
Q  258 agaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagt 357  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  23029922 agaaaactcgaatcttttggtaaccaatcgcccttttgatctcagcccgcaatccattctcgaacttgatacacttcgaaaactcagcagtctctacagt 23030021  T
Q  358 gtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
     || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23030022 ataatgcggataaaacttagccaattccacaaacttggcggcatactcagtcacggac 23030079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24704998 - 24704611
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||    
T  24704998 caggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagataatctcagcaggaacatccttcttcttaggtcgtctttcctcgaccatcct 24704899  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24704898 atgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcc 24704799  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    ||||| || || || || ||  ||||||  || |  ||||| || |||| |||||| |  || || |||||||| ||||  || ||||| ||| |||| |    
T  24704798 tcctcatagattctacagctattcaccaaatctggaaaaacacgtatctgttggtatctgatcgccctcttaatatcaggccggaaaccattcacaaact 24704699  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||| | ||| || || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24704698 tgatgcattttgagaactcagcagtctcagcagtataatgtggataaaacttggccaattcaacaaacttggcagcatactcggtcac 24704611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22462997 - 22462610
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  22462997 caggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccacctatcatcgaccattct 22462898  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || || |||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||     
T  22462897 ctgttcgcccttattagaaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcatttacaaccttgtaatgagcctttgtatct 22462798  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    |||||||| || ||||| ||  |||| |  |||| |||||||||||| | |||||| |  || || ||||| || || |  | |||||| ||||| || |    
T  22462797 tcctcgtagattctgcagctattcactaaatcagcgaaaactcggatttgttggtatctgatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaact 22462698  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || || || |||||||||||||| | ||  || |||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22462697 tgatgcatttcgagaactcagcagtctcagcagcataatgcggatagaactttaccaactccacgaacttggcagcatactctgtcac 22462610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23116575 - 23116188
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  23116575 caggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatctctgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 23116476  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  23116475 ctgcttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgcttgcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcc 23116376  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || ||||| ||||| || ||| |||| |  |||| |||||||||||  | |||||| || || || ||||| || || |  | |||||| ||||| || |    
T  23116375 tcttcgtagatcctacagctgttcactaaatcagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaact 23116276  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || ||||| ||||||||| |||  | ||| ||||| || || |||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23116275 tgatgcattttgagaactcagcattctgagcagtatagtgtgggtagaactttgccatctccacgaacttggcagcatactctgtcac 23116188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24657174 - 24656787
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||    
T  24657174 caggacaaacagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagcaggaacatcctttttcttaggccgtctctcctcgaccatcct 24657075  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||    
T  24657074 ctgtttgcccttatcagtaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcc 24656975  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    ||||| || || ||||| ||  ||| ||  || |  ||||||||||||| |||||| || || || |||||||| ||||  | |||||| ||||| || |    
T  24656974 tcctcatagattctgcagctattcatcaaatctggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtcaggcctcaaaccattctcgaact 24656875  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || || || |||||||||||||| | ||| || || ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24656874 tgatgcatttcgagaactcagcagtctcagcagtataatgtggatagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactcggtcac 24656787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 415
Target Start/End: Original strand, 10871794 - 10872165
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  10871794 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaagctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 10871890  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10871891 caggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcttcgtagatcctgca 10871990  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||||||  | || |||    
T  10871991 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatacatctcgagaac 10872090  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||| |||| | ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10872091 tcagcattctcagcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 10872165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Original strand, 17001927 - 17002315
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  |    
T  17001927 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcgccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 17002023  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  17002024 ctgttttcctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcc 17002123  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    ||||| || |||||||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || |    
T  17002124 tcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaact 17002223  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| ||  | || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17002224 tgatgcatctcgagaactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 17002315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Original strand, 9338523 - 9338897
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  9338523 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 9338619  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  9338620 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 9338719  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  9338720 gcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 9338819  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9338820 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 9338897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Original strand, 9487157 - 9487531
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  9487157 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 9487253  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  9487254 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 9487353  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  9487354 gcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 9487453  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9487454 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 9487531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 44383078 - 44382698
Alignment:
Q  32 gcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgc 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| |    ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| |    
T  44383078 gcattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcaa---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttcc 44382982  T
Q  132 ccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgta 231  Q
    |||| ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  44382981 ccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcata 44382882  T
Q  232 aatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacac 331  Q
     |||||||| ||| | ||||  || |  |||||||  | |  ||| || ||||| || ||||| || || |  | || ||| ||||| |||||||||||     
T  44382881 gatcctgcagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtcgggcctcagaccattctcgaatttgatacat 44382782  T
Q  332 tttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
     | || ||||||||| |||| | ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44382781 ctcgagaactcagcattctcagcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 44382698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Original strand, 24265314 - 24265681
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  24265314 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttatcag 24265410  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||| | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  24265411 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgca 24265510  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  || || |||||||  | || ||| || ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  24265511 gctattaaccaagtctgaaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 24265610  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||| |||| | ||| |||| ||| || ||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24265611 tcagcattctcagcagtatagtacgggtagaactttgacagctccacgaacttggcagcatactctgtcac 24265681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24874249 - 24873882
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||   || | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||    
T  24874249 ttgtggcctttcccaccacagttgaaacacacaatctc---agtaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcag 24874153  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||  ||||||||| | |||||   ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  24874152 caggggcactgtacggcttagaacgactctgccgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 24874053  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
    |||  | ||||  || |  |||||||  | || ||| || ||||| || || || || || |  | |||||| ||||| || ||||||||  | || |||    
T  24874052 actatttaccaaatctggaaaaactctaagctgttgatacccaatcgcccttttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaacttgatacatctcgagaac 24873953  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24873952 tcagcattctcaggagtatagtgcgggtaaaacttcgccaactcaacaaacttggcagcatactcagtcac 24873882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Original strand, 16984181 - 16984555
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  16984181 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---cattcttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 16984277  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  16984278 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 16984377  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||| | ||||  ||    |||||||  | ||  ||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  16984378 gcagctgttaaccaaatcctgaaaaactctcagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 16984477  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16984478 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 16984555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Original strand, 23065335 - 23065451
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23065335 atccccaggacaagaatagctcttgtggcccttctcaccataagtaaaatagacaatctctgcaggaccatccttcttcttaggccgcctatcttcgacc 23065434  T
Q  119 attctctctttgccctt 135  Q
    ||||||| |||||||||    
T  23065435 attctctgtttgccctt 23065451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Original strand, 23074785 - 23074901
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23074785 atccccaggacaagaatagctcttgtggcccttctcaccataagtaaaatagacaatctctgcaggaccatccttcttcttaggccgcctatcttcgacc 23074884  T
Q  119 attctctctttgccctt 135  Q
    ||||||| |||||||||    
T  23074885 attctctgtttgccctt 23074901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Original strand, 27374196 - 27374584
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  |    
T  27374196 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 27374292  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || || ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||| | |||||   |||||  |||||||| | ||| || |||||||| ||||||    
T  27374293 ctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgcagtcccttgcccttcctttcattcactaccttatagtgagccttcgtatcc 27374392  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || ||||| |||||||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || |    
T  27374393 tcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaact 27374492  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| ||  | || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27374493 tgatgcatctcgagaactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 27374584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24817357 - 24816968
Alignment:
Q  23 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattc 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| | || || ||| |||||  |||||   || || ||   || ||    
T  24817357 ccagtacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagtatagcaaacaatctcagtagtagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcaatc 24817258  T
Q  123 tctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatc 222  Q
    | | ||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||| || | || |||  | |||   ||  ||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  24817257 tttgtttacccttatcagcaggagcactataaggcttagggagattttgttgattcctaggtctcttctcattcacagccttgtaatgagctttagtatc 24817158  T
Q  223 ctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaat 322  Q
     ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||    |||||||| || || |||||  |   ||| |||||| |||||||||| ||||||||     
T  24817157 ttcctcatagattctgcaactgctcaccagttcagaaaagtaacggatcttctgatacccaataacctgcttgatctcaacacgcaaaccattctcaaac 24817058  T
Q  323 ttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggat-aaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||| ||||| || |||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||  |||  ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24817057 ttgatgcacttggagaacttagcagtctcagtagtgtagtgaggattaaaacttagccagctccacaaactttgcagcatattcagtcac 24816968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 22322841 - 22322470
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    | ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || ||||    
T  22322841 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---cgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcag 22322745  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  22322744 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 22322645  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  22322644 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 22322545  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||| || |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22322544 tcagcattctcagcagtatagtgcgggtagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 22322470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 137
Target Start/End: Original strand, 23205241 - 23205354
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  23205241 caggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgaaggagcattcttcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 23205340  T
Q  124 ctctttgcccttat 137  Q
    ||  ||||||||||    
T  23205341 ctggttgcccttat 23205354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 137
Target Start/End: Original strand, 23676845 - 23676958
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  23676845 caggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgaaggagcattcttcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 23676944  T
Q  124 ctctttgcccttat 137  Q
    ||  ||||||||||    
T  23676945 ctggttgcccttat 23676958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 265 - 411
Target Start/End: Original strand, 19817988 - 19818135
Alignment:
Q  265 tcggatcttttggtaacc-aattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtg 363  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||   | | |||||    
T  19817988 tcggatcttctggtaccccaattgctcgcttaatctcagcacgcaagccattctcgaatttgatacaattagagaattcagcagtctcaacattatagtg 19818087  T
Q  364 cggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     |||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  19818088 tggataaaactttgccaactcaacaaacttagcagcatactccgtcac 19818135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Original strand, 24712978 - 24713174
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || ||||    
T  24712978 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcag 24713074  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||| |  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  24713075 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 24713174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 405
Target Start/End: Original strand, 45534674 - 45534814
Alignment:
Q  265 tcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgc 364  Q
    ||||||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| || || || | |||||| | | | ||||||    
T  45534674 tcggatcttctgatacccaatcgctcgcttaatctcagcacgcaagtcattctcgaatttgatacacttagagaattcggtagtctcagcattatagtgc 45534773  T
Q  365 ggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    ||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||||    
T  45534774 ggataaaactttgtcaactcaacaaacttagcagcatactc 45534814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 11351225 - 11351158
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatcctt 93  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11351225 ggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatcctt 11351158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 408
Target Start/End: Original strand, 21901658 - 21901848
Alignment:
Q  218 gtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttct 317  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||||  ||||| ||   || |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||  | |    
T  21901658 gtatcctcctcataaattctacagctgctcaccaattcagaaaattgtctgatcttttggtaaccaatggcccgcttaatatcagcacgcagaccaattt 21901757  T
Q  318 caaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagt 408  Q
    |||| || || |||||||| ||||||| |||||| |  || || || ||||| || ||  | |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21901758 caaactttatgcactttgagaactcagtagtctcagcggtataatgtggatagaatttaacaagctccacaaactttgcagcatactcagt 21901848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 240
Target Start/End: Original strand, 16931598 - 16931695
Alignment:
Q  143 ggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16931598 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 16931695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 415
Target Start/End: Original strand, 16931714 - 16931822
Alignment:
Q  307 caaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactca 406  Q
    |||||||||||| || ||||| ||  | || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||||||     
T  16931714 caaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactct 16931813  T
Q  407 gtcacggac 415  Q
    |||||||||    
T  16931814 gtcacggac 16931822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 408
Target Start/End: Original strand, 28351070 - 28351186
Alignment:
Q  292 cttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaac 391  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||  | |  |||||||||    
T  28351070 cttaatatcagcacgcagaccattctcaaacttaatgcacttggagaactcagcagtctcggcagtgtaatgtggataaaatttagcaagctccacaaac 28351169  T
Q  392 ttggcagcatactcagt 408  Q
     | ||||||||||||||    
T  28351170 cttgcagcatactcagt 28351186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 30208174 - 30208056
Alignment:
Q  287 gctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattcca 386  Q
    |||| |||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| || || ||  ||||||| |   | ||||||||||||||||||  ||| || |    
T  30208174 gctcacttaatctcaacacgaaagccattctcgaatttgatacacttagagaattcgacagtctcagcgttatagtgcggataaaactttgtcaactcaa 30208075  T
Q  387 caaacttggcagcatactc 405  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  30208074 caaacttagcagcatactc 30208056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 406
Target Start/End: Original strand, 12577462 - 12577662
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |  |||||||  ||||| |||| ||  |||| |||||| || || |||||||| || ||||| |    
T  12577462 taatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacagcgactcaccaaatcagaaaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgatgtcagctc 12577561  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     ||| || |||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  12577562 tcaagccattctcaaactttatgcacttggagaattcagctgtctccggagcataatggggatagaactttgcaagctccacaaattttgcagcatactc 12577661  T
Q  406 a 406  Q
    |    
T  12577662 a 12577662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 19716426 - 19716152
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgaccctta-gtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcg 229  Q
    ||||| ||| || ||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||  | ||| |||||||| || || || |||||     
T  19716426 cccttgtcaacaagggcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttagtgtcttcctca 19716328  T
Q  230 taaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatac 329  Q
    || |||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||  ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| | ||| || ||||| || || ||||    
T  19716327 tatatcctgcagctgcttaccaactcagagaaatttctaatcttctgatagccaatggctctcttgatatcagccctcaacccattctcgaacttaatac 19716228  T
Q  330 actttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||| || || ||||| ||||| | | |||| || || || |||||  | | |||||| ||||| |||||||||||    
T  19716227 acttggagaattcagctgtctccgcactgtaatgggggtagaacttagcaagttccacgaactttgcagcatactc 19716152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 19720989 - 19720715
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgaccctta-gtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcg 229  Q
    ||||| ||| || ||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||  | ||| |||||||| || || || |||||     
T  19720989 cccttgtcaacaagggcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttagtgtcttcctca 19720891  T
Q  230 taaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatac 329  Q
    || |||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||  ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| | ||| || ||||| || || ||||    
T  19720890 tatatcctgcagctgcttaccaactcagagaaatttctaatcttctgatagccaatggctctcttgatatcagccctcaacccattctcgaacttaatac 19720791  T
Q  330 actttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||| || || ||||| ||||| | | |||| || || || |||||  | | |||||| ||||| |||||||||||    
T  19720790 acttggagaattcagctgtctccgcactgtaatgggggtagaacttagcaagttccacgaactttgcagcatactc 19720715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21139480 - 21139399
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  21139480 ttgtggccttttccaccacaattgaaacacacaatctctgtag---catccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctct 21139399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Original strand, 20848520 - 20848552
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20848520 acaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 20848552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Original strand, 23274524 - 23274556
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274524 acaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 23274556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 412
Target Start/End: Original strand, 17497601 - 17497994
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17497601 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggctatctatcttcgacc 17497700  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||  ||| |||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17497701 atcttctgtttgcccttatcagcaagggtactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 17497800  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17497801 tatcctcctcctagatcctgcaactgctcaccagcttagagaaaactcgaatcttctagtaaccaattgctctctttatctcagcacgcaaaccgttctc 17497900  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacg 412  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17497901 aaatttgatacactttaaaaactcggcagtctctggagtgtagtgtggataaaactttgccaattccacaaacttggcagcatacttagtcacg 17497994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 20 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23079236 - 23078851
Alignment:
Q  20 tccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacca 119  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||    
T  23079236 tcccccggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacaaacaatcacagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgacca 23079137  T
Q  120 ttctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggt 219  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23079136 tcctctgttttcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggt 23079037  T
Q  220 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctca 319  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23079036 atcctcttcataaatcctgcaactgttcaccaactcggagaaaactcgaatctgttggtacctaattgccctcttaatctcagcacgtaacccgttctca 23078937  T
Q  320 aatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| | |   || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23078936 aacttgatgcactttgaaaactcagcagtctcagcaacataatgcggataaaactttgccaactccacaaacttggcagcgtactc 23078851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14873801 - 14873413
Alignment:
Q  23 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattc 122  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| |    
T  14873801 ccaggacaagcattgctcttatggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcatgagcatccttcttcctcggccgtctatcctcgaccatcc 14873702  T
Q  123 tctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatc 222  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| | ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14873701 tctgtttgcccttatcagcaagggcattatagggcttagggcgactctgttggcccttagtcttccgcacattcacaatcttgtaatgagccttggtatc 14873602  T
Q  223 ctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaat 322  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||| ||     
T  14873601 ctcctcatatatcctgcaactgttcaccaactcagagaaaactcggatctattggtatccaattgccctcttgatctcagccctcaatccattctcgaac 14873502  T
Q  323 ttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14873501 ttgatacacttcgaaaactcagtagtctctgcagcgtaatgcggataaaattttgccaactccacaaacttggaagcatactcagtcac 14873413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 26 - 415
Target Start/End: Original strand, 15065988 - 15066377
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15065988 ggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatcgcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccattctct 15066087  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15066088 gtttgcccttatcagcaggggaactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcttc 15066187  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||| ||||| || || ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||  ||||| || ||||| || |||    
T  15066188 ctcataaattctacagctgttcaccaactcggagaaaactcggatctattggtatccaattgccctctttatatcaggccgcaatccattctcgaacttg 15066287  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    || |||||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15066288 atgcactttgagaactcagcagtctcagcagcgtaatgcggataaaactttgccaactccacaaacttggcagcatactcagttacggac 15066377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14578641 - 14578249
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||   ||||||||| |||||  ||||  | ||||| || |||    
T  14578641 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagcatagcacacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctatcatcaacc 14578542  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||||| | ||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14578541 attctctgtttacccttatcggcaggagcattgtaaggcttaggacggctctgctgacccttggccttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 14578442  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14578441 tatcatcctcataaatcctgcaactgctcaccagcttagaaaagtcacggatcttctggtaaccaattgctctcttgatctcagcacgcaaaccattctc 14578342  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     || ||||| ||  | || ||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14578341 gaacttgatgcatctcgagaactcagcattctcagcggtgtagtgtggataaaacttagccaactccataaacttggcagcatactctgtcac 14578249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12843319 - 12842945
Alignment:
Q  23 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||| |||||| ||||| | || || || | |||||    
T  12843319 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcaatcattc 12843220  T
Q  123 tctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatc 222  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12843219 tctgtttgcccttatcagcaggagcactataaagctttggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatc 12843120  T
Q  223 ctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaat 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    || ||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  12843119 ctcctcataaatcctgcaactgctcaccagctcggaaaagttacgaatcttctggtaaccaattgcccgcttgatctcagcacgcaagccattctcaaat 12843020  T
Q  323 ttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    ||||||||||| ||||| |||||        | || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12843019 ttgatacacttagaaaattcagc--------gggtatagtgcggataaaactttgccaactccacaaacttggcagcatactc 12842945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 11861270 - 11861655
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  11861270 ggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctct 11861369  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  11861370 gtttgcctttatcagcaggggcactatagggcttagggtgactctggtggcccttactcttccactcattcacaaccttgtaatgagccttggtgtcttc 11861469  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||| || || || || ||  |||||| |||||  ||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||| |  |||    
T  11861470 ctcatagattctacagctattcaccaactcaggaaaaactcagatctgttggtatccgattgccctcttaatatcaggccgcaaaccattctcgagcttg 11861569  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||  || |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11861570 atacacttcgaaaactcagcagtctcagcagcataatgcggatagaactttgccaactcaacaaacttggcagcatacttagtcac 11861655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23415004 - 23414618
Alignment:
Q  25 aggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctc 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  23415004 aggacaaacattactcttgtggcctttctcgccatagttgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctc 23414905  T
Q  125 tctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcct 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  23414904 tgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctattggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtcatgagccttagtatcct 23414805  T
Q  225 cctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaattt 324  Q
    ||||||| || |||||  |  |||| |  |||| ||||||||||| || |||||| || ||||| ||||| || || |  | |||||| ||||| || ||    
T  23414804 cctcgtagattctgcaggtattcactaaatcagggaaaactcggagctgttggtatccgattgccctcttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaactt 23414705  T
Q  325 gatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||| || || || |||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23414704 gatgcatttcgagaactcagcagtctcagcagcatagtgcggatagaactttgccaactccacaaatttggcagcatactctgtcac 23414618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16804162 - 16803775
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  16804162 caggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 16804063  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16804062 ctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcc 16803963  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  ||||  ||||||||||||| ||||||  | || || |||||||| || |  | |||||| ||||| || |    
T  16803962 tcctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtattcgatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccattctcgaact 16803863  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || || || |||||| ||||||| | ||  |||||||| || |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16803862 tgatgcatttcgagaactcaacagtctcagcagcatagtgcgggtagaactctgccaactccacaaacttggcagcatactctgtcac 16803775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 185 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15459476 - 15459254
Alignment:
Q  185 ttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaa 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15459476 ttccgctcatacacaatcttgtaatgagtctttgtatcctcctcataaatcctgcaactgctcaccagcttagaaaatactcggatcttttggtaaccaa 15459377  T
Q  285 ttgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattc 384  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |    |||||||||||||| ||| || |||||||||||| || |||| ||    
T  15459376 ttgctctcttgatctcagcacgtaaaccgttctcgaatttgatgcatttcg----ctcagcagtctctgcagtataatgcggataaaaccttgccaactc 15459281  T
Q  385 cacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15459280 cacaaacttggcagcatactcagtcac 15459254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 408
Target Start/End: Original strand, 16695081 - 16695463
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||   |||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16695081 ggacaaacattactcttgcggcctttctcgccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctct 16695180  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16695181 gtttgcacttatcagcaggggcactataaggcttcgggcgactctgatggcccttggtcttccactcatttacaaccttgtaatgagccttagtatcctc 16695280  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||| || |||||||| ||  |||| |  |||| |||||||||||||| |||||| || || || ||||| || || |  | |||||| ||||| || ||     
T  16695281 ctcatagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaactta 16695380  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagt 408  Q
    || || || || |||||| |||| |  | |||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16695381 atgcatttcgagaactcatcagttttagcagtgtagtgcgggtagaactttgccaactccacaaacatggcagcatactcagt 16695463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 15262540 - 15262923
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||| ||| |  || ||   || || ||   |    
T  15262540 atccccaggacaagcattactcttatagcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttccttctacgcctcctctcatcattc 15262639  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||| ||  ||||| | || || ||||| || ||| | ||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15262640 attctttgtttacccttatcagcaggagcgttgtaaggctttggacgactttgttgatctttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttag 15262739  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||    
T  15262740 tatcctcctcatagattctgcaactgctcaccagctcagaaaagttacggatcttctagtaaccaattgctcgcttgatctcagcacgcaagccattctc 15262839  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||         ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15262840 aaatttgatgcattttgaaaactcagc---------agtgtagtgcggataaaacatagccaattccacaaacttggcagcatattcagtcac 15262923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 408
Target Start/End: Original strand, 19727670 - 19728058
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| | |  | |||| ||||| ||||||   || || ||   |    
T  19727670 atccccaggacaagcgttactcttatggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcagcaacaacatctttctttttaggcctcctctcatcattc 19727769  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    | ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | || ||  |||| |||||||| |   | |||  ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19727770 aatctttgtttgcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggaagactttgctgaccttgccttttct-ctcattcacaaccttgtaatgagccttag 19727868  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| | ||||||||| |||    ||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||    
T  19727869 tatcttcctcatatattctgcaactgctaatcagctcagaaaaagtatggatcttctggtaaccaattgcccgcttgatctcagcacgcaagccattctc 19727968  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagt 408  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||  |||  |||||||| || ||||||||||||||    
T  19727969 aaatttgatgcacttggagaactcagcagtctcgacagtgtagtgcgggtaaaacttagccagctccacaaattttgcagcatactcagt 19728058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Original strand, 24186105 - 24186493
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||  |||| || |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  24186105 caggacagacattgcttttgtggcctttcacaccacaattgaaacacacaatctc---agtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcct 24186201  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || ||||||||  ||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  24186202 ctgtttccctttatcagcgtgggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttccactcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcc 24186301  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || || || |||||||| ||  | ||||  || |  |||||||  |||| |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||| ||||| || |    
T  24186302 tcttcatagatcctgcagctattgaccaattctggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccattctcgaact 24186401  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24186402 tgatgcatttggaaaactcagcagtctctgcagcataatgcggataaaacttcgccaactcaacaaacttggcagcatactcagtcacggac 24186493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 12501848 - 12502052
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||    
T  12501848 caggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctttcctcgaccatcct 12501947  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12501948 ctgttttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctactggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcc 12502047  T
Q  224 tcctc 228  Q
    |||||    
T  12502048 tcctc 12502052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 133 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 13028451 - 13028181
Alignment:
Q  133 cttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaa 232  Q
    |||||||||||| | ||||||| | || || ||||||||||| || ||| || ||  ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  13028451 cttatcagcaggag-actgtaaggctttggacgactctgctggcctttactcctcttctcattcactatcttgaaatgagctttggtatcctcctcctag 13028353  T
Q  233 atcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacact 332  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| ||    |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13028352 atcctgcaactgctctccaactaagaaaatgtacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgatctccgcacgcaaaccattctcaaatttgatgcact 13028253  T
Q  333 ttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatact 404  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||    
T  13028252 tagaaaattcagcagtctcagcagtgtagtgtggataaaacttagccagctccacaaactttgcagcatact 13028181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Original strand, 16638702 - 16639076
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  16638702 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 16638798  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  16638799 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 16638898  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  16638899 gcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 16638998  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16638999 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 16639076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Original strand, 43165604 - 43165978
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  43165604 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 43165700  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  43165701 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 43165800  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  43165801 gcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 43165900  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43165901 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 43165978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 415
Target Start/End: Original strand, 10008532 - 10008903
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  10008532 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 10008628  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  10008629 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 10008728  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | || |  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  10008729 gctattaactaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 10008828  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10008829 tcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 10008903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 20059252 - 20058881
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  20059252 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 20059156  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  20059155 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgca 20059056  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  20059055 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 20058956  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||| |||| | ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20058955 tcagcattctcagcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 20058881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Original strand, 3688872 - 3689246
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||   || ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| ||||| |    
T  3688872 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---agcagcatccttcttcttaggccgcctaacgtcgaccatcttctgtttacccttgt 3688968  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  3688969 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcct 3689068  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  3689069 gcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 3689168  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3689169 aactcagcattctctgcagtatagtgtggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 3689246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 415
Target Start/End: Original strand, 10909142 - 10909513
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |    ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  10909142 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcaa---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 10909238  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  10909239 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 10909338  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | || |  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  10909339 gctattaactaagtcctgaaaaactctaagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 10909438  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10909439 tcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 10909513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 411
Target Start/End: Original strand, 48428376 - 48428746
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  48428376 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 48428472  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  48428473 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 48428572  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||| | ||||  ||    |||||||  | ||  ||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  48428573 gcagctgttaaccaaatcctgaaaaactctcagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 48428672  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  48428673 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcac 48428746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12508662 - 12508418
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | || || ||||| ||||||| ||||   |||| |||| ||| |  |||||||||||| || ||||||| ||| |    
T  12508662 cccttatcagccggagcactgtaaggctttggacgactttgctgactcttacctttcctctcactcatagccttgtaatgagctttcgtatccttctcat 12508563  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| ||    | |||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  12508562 agattctgcaactgctcaccagttcagaaaagttacagatcttctgatatccaatggccctcttgatctcagcacgcaagccattctcaaatttgatgca 12508463  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaactt 375  Q
    ||| || |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  12508462 cttggagaactcagcagtctcagcagtgtagtgtggataaaactt 12508418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 6596970 - 6597183
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  |    
T  6596970 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 6597066  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || || ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  6597067 ctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcc 6597166  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgca 240  Q
    ||||| || ||||||||    
T  6597167 tcctcatagatcctgca 6597183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 411
Target Start/End: Original strand, 15359025 - 15359351
Alignment:
Q  85 agcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtc 184  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| |||  | |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||   |    
T  15359025 agcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttcactttatcagcgggggcactgtacggcttagggcgactctgctgtcccttgccc 15359124  T
Q  185 ttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaa 284  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||    
T  15359125 ttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaa 15359224  T
Q  285 ttgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattc 384  Q
    | || ||||| || || |  | |||||| ||||| || ||||| ||  | || ||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||||||  |||| ||    
T  15359225 tcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaacttgatgcatctcgagaactcagcattctcagcagtatagtgcgggtaaaacttcgccaactc 15359324  T
Q  385 cacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  15359325 aacaaacttggcagcatactcagtcac 15359351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15713254 - 15713058
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||  || || |||||||    
T  15713254 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgtag---catccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgcttccctttatcag 15713158  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  15713157 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 15713058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15345443 - 15345072
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || ||||    
T  15345443 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcag 15345347  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | |||||||||||  | |||||  |||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  15345346 cgggggcactgtacggcttaggaggactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 15345247  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||||||  | || |||    
T  15345246 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatacatctcgagaac 15345147  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||| |||| | ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15345146 tcagcattctcagcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 15345072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5422134 - 5421932
Alignment:
Q  35 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgccct 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || |    
T  5422134 ttactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctt 5422038  T
Q  135 tatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaat 234  Q
    | ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  5422037 tgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 5421938  T
Q  235 cctgca 240  Q
    ||||||    
T  5421937 cctgca 5421932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Original strand, 6603650 - 6603860
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  |    
T  6603650 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 6603746  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || || ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  6603747 ctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcc 6603846  T
Q  224 tcctcgtaaatcct 237  Q
    ||||| || |||||    
T  6603847 tcctcatagatcct 6603860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Original strand, 12889638 - 12890012
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  12889638 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 12889734  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || |||||    
T  12889735 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 12889834  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||| ||||| || ||||| ||  | ||     
T  12889835 gcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaacttgatgcatctcgag 12889934  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12889935 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 12890012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 415
Target Start/End: Original strand, 13255609 - 13255993
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   |||||||| |||||||| | ||| | ||||||||  ||| |    
T  13255609 acaagcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgt 13255705  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| |    
T  13255706 ttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtgtcctctt 13255805  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    |||| |||||||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || |||||    
T  13255806 cgtagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgat 13255905  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
     ||  | || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13255906 gcatctcgagaactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatgctctgtcacggac 13255993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 411
Target Start/End: Original strand, 15263599 - 15263735
Alignment:
Q  266 cggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcg 365  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||         |||||||||||    
T  15263599 cggatcttctagtaaccaattgctcgcttgatctcagcacgcaagccattctcaaatttgatgcattttgaaaactcagc---------agtgtagtgcg 15263689  T
Q  366 gataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15263690 gataaaacatagccaattccacaaacttggcagcatattcagtcac 15263735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15399716 - 15399520
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  15399716 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctc---agtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcag 15399620  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||||    
T  15399619 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgaaccttggtatcctcttcctagatcctgca 15399520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 26790614 - 26790240
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || ||||    
T  26790614 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 26790518  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    ||   |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || |||||    
T  26790517 cattgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 26790418  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  |  | |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  26790417 gcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagttgttggtacccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 26790318  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26790317 aactcagtattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 26790240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 53382219 - 53381850
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  53382219 ctcttgtggcctttctcgccacagttgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 53382123  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||  |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| || |||||    
T  53382122 cagg-ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatccttctcatagatcct 53382024  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||| | ||||  || |  |||||||  | || ||| || ||||| || |||||||| || |  | || ||| ||||| || ||||||||  | ||     
T  53382023 gcagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttaatgtcgggcctcagaccattctcgaacttgatacatctcgag 53381924  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| |||| | ||| ||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  53381923 aactcagcactctcagcagtatagtgcggatagaactttgacagttccacgaacttggcagcatactctgtcac 53381850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 202 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10417071 - 10416897
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||| || |||||| || || || || ||||||||||| |||    
T  10417071 cttgtaatgagccttcgtatcctcctcataaattctgcagctactcaccagttctgagaaaattctgatcttctgatatcctatggctctcttaatatca 10416972  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttt 376  Q
    || | |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||    
T  10416971 gccctcaaaccattctcaaacttgatgcatttggagaactcagctgtctccgcagtgtagtgagggtaaaacttt 10416897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16753916 - 16753703
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  |    
T  16753916 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 16753820  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
     | ||| || || ||||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  16753819 ttgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactatgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcc 16753720  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgca 240  Q
    ||||| || ||||||||    
T  16753719 tcctcatagatcctgca 16753703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Original strand, 10408897 - 10409220
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||| |  ||||||||  || |||| |||   ||||| ||  ||||  ||| |    
T  10408897 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacatttgtaacaaacaatctcagctggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgt 10408996  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || |    
T  10408997 ttacccttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctggtgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttctt 10409096  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || || ||||| ||  | |||| |||||| ||||||| |||||  || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || |||||||| |||||    
T  10409097 catagattctgcacctattaaccaactcagaaaaaactctgatctgctgatatccaatagctcttttgatgtcagccctcaacccattctcaaacttgat 10409196  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    |||||| || |||||||| |||||    
T  10409197 acacttggagaactcagctgtctc 10409220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16326798 - 16326604
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| ||||||||||| |||||   | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  16326798 tcagcaggagcactgtcaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcc 16326699  T
Q  237 tgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacac 331  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || || |||||||||||||||    
T  16326698 tgcaactgtttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctctcttaatatcagctctcaacccattttcaaatttgatacac 16326604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5110607 - 5110240
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||| ||| || || ||||    
T  5110607 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctct---gcagcatccttcttcttaggctgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcag 5110511  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | ||| |||||||  | ||||| |||||||  || |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  5110510 cggggacactgtacggcttaggacgactctattgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 5110411  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  5110410 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 5110311  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||| || |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5110310 tcagcattctcagcagtatagtgcgggtagaacttcgacagctccacgaacttggcagcatactctgtcac 5110240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15586593 - 15586223
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||    | |||||||||| |||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  15586593 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---cgcagcatccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 15586497  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||| || || |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||    
T  15586496 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactttgttgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctttgtagatcct 15586397  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  15586396 gcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 15586297  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15586296 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcac 15586223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 402
Target Start/End: Original strand, 17738986 - 17739185
Alignment:
Q  203 ttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcag 302  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||  ||    |||||||| || || || ||||| | ||| |||||||    
T  17738986 ttgtaatgtgctttggtatcctcctcatagattctgcaactgctcactagttcagtcaagttacggatcttctgatatccgattgcccgcttgatctcag 17739085  T
Q  303 cacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcata 402  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| ||||||||||  |||  |||| |||||| ||||||||    
T  17739086 cacgcaagccactttcaaatttgatgcacttggaaaactcagcgttctcagcagtgtagtgcagataaaacttagccagctccataaactttgcagcata 17739185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 402
Target Start/End: Original strand, 19040306 - 19040505
Alignment:
Q  203 ttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcag 302  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||  ||    |||||||| || || || ||||| | ||| |||||||    
T  19040306 ttgtaatgtgctttggtatcctcctcatagattctgcaactgctcactagttcagtcaagttacggatcttctgatatccgattgcccgcttgatctcag 19040405  T
Q  303 cacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcata 402  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| ||||||||||  |||  |||| |||||| ||||||||    
T  19040406 cacgcaagccactttcaaatttgatgcacttggaaaactcagcgttctcagcagtgtagtgcagataaaacttagccagctccataaactttgcagcata 19040505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 290 - 415
Target Start/End: Original strand, 12502125 - 12502250
Alignment:
Q  290 ctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaa 389  Q
    |||||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||| || || |||||||||||| |||| || ||||    
T  12502125 ctcttaatatcaggccgcaaaccattctcgaacttgatgcattttgagaactctgcagtctcagcagtataatgtggataaaactttgccaactcgacaa 12502224  T
Q  390 acttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12502225 acttggcagcatactcagttacggac 12502250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13317588 - 13317392
Alignment:
Q  209 tgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgca 308  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |  |||||| || || ||||| |||||||| || ||||| | ||    
T  13317588 tgagcctttgtatcctcctcatatatcctacaactgctcaccaactccgagaaatttatgatcttctgatatccaatggctctcttgatatcagctctca 13317489  T
Q  309 aaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |  | || ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| | ||| ||||| || ||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||    
T  13317488 agtcattttcaaacttgatacatttggaaaactcaactgtctccgcagtatagtgagggtaaaattttgcaagttccacaaacttagcagcatactc 13317392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16831625 - 16831350
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttag-tcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | |||||  |||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||  | ||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  16831625 cccttatcagcaggggcactatacggcttaggatgactctgctgtcccttacctcttc-gctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctca 16831527  T
Q  230 taaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatac 329  Q
    || ||||||||||  || ||||  |||||||||| ||  |||| |||||| || || |||||||| || ||||| | ||| || || ||||| || ||||    
T  16831526 tagatcctgcaacgacttaccaaatcagagaaaattcttatctgttggtaccctatggctctcttgatgtcagctctcaagccattgtcaaactttatac 16831427  T
Q  330 actttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactca 406  Q
    | || || || ||||| ||||| | ||| ||||| || || |||||| | | |||||||||||| ||||||||||||    
T  16831426 atttggagaattcagctgtctccgcagtatagtgggggtagaactttgcaagttccacaaactttgcagcatactca 16831350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11958381 - 11958058
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||  || |||| ||||| || | |||||||||  || ||||| ||   ||||| ||   |||||||| |    
T  11958381 acaagcattgcttttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatttcagcaggagcatctctcctcttaagcctcctatcatcattcattctctgt 11958282  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||    ||| |||| |||  | |||||||||| | || || || ||||    
T  11958281 ttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgctgtcccttacctctcctctcactcatcaccttgtaatgaacttttgtgtcttcct 11958182  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| |||||    
T  11958181 cataaatcccgcagctgcttaccaactcagagaaaactctaatcttctgatacccaatagctcttttgatatcagccctcaacccattttcaaacttgat 11958082  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    |||||| || || ||||| |||||    
T  11958081 acacttggagaattcagctgtctc 11958058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 405
Target Start/End: Original strand, 17494753 - 17494956
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || || || ||||| |||| |||||| ||   ||  ||||| || |||||||| |||||||| || |||    
T  17494753 cttgtaatgagctttggtatcctcctcatagattctacagctgcttaccaactcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatggctctcttgatatca 17494852  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | |||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| | ||| ||||| || || |||||  | | |||||||||||| |||||||    
T  17494853 gctctcaaaccattctcaaacttaatacatttggagaactcagctgtctccgcagtatagtgggggtagaacttagcaagttccacaaactttgcagcat 17494952  T
Q  402 actc 405  Q
    ||||    
T  17494953 actc 17494956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 405
Target Start/End: Original strand, 47126873 - 47127250
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||   |||||||||  || |||| |||   ||||| ||  |||| ||||      
T  47126873 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgc 47126972  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||||  | ||| |||| ||| |||||| |||||||| ||||| || || |    
T  47126973 tttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttctt 47127072  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || || ||||| ||  | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || |||||||| |||||    
T  47127073 catagattctgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcagccctcaacccattctcaaacttgat 47127172  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||||| || |||||||| ||||| | | |||| || ||||||||  |  | |  ||||||||||| |||||||||||    
T  47127173 acacttggagaactcagctgtctccgcactgtaatgaggataaaatgtggcaagctccacaaactttgcagcatactc 47127250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 2036967 - 2036735
Alignment:
Q  173 tgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatct 272  Q
    ||||||||  || ||||||||||   |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  |||||| ||| || || |||| |||||    
T  2036967 tgacccttgttcctccgctcatttctaatcttatagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatct 2036868  T
Q  273 tttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaa 372  Q
      || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||| | |||| || || || ||    
T  2036867 gctgatacccaatagctctcttaatgtcagctctcaacccattctcaaacttaatgcacttggagaactccgctgtctctgcactgtaatgagggtagaa 2036768  T
Q  373 cttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||  | | |||||||||||| |||||||||||    
T  2036767 cttagcaagttccacaaacttagcagcatactc 2036735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 2040708 - 2040476
Alignment:
Q  173 tgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatct 272  Q
    ||||||||  || ||||||||||   |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  |||||| ||| || || |||| |||||    
T  2040708 tgacccttgttcctccgctcatttctaatcttatagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatct 2040609  T
Q  273 tttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaa 372  Q
      || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||| | |||| || || || ||    
T  2040608 gctgatacccaatagctctcttaatgtcagctctcaacccattctcaaacttaatgcacttggagaactccgctgtctctgcactgtaatgagggtagaa 2040509  T
Q  373 cttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||  | | |||||||||||| |||||||||||    
T  2040508 cttagcaagttccacaaacttagcagcatactc 2040476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 405
Target Start/End: Original strand, 14039820 - 14040052
Alignment:
Q  173 tgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatct 272  Q
    ||||||||  || ||||||||||   |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  |||||| ||| || || |||| |||||    
T  14039820 tgacccttgttcctccgctcatttctaatcttatagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatct 14039919  T
Q  273 tttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaa 372  Q
      || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||| | |||| || || || ||    
T  14039920 gctgatacccaatagctctcttaatgtcagctctcaacccattctcaaacttaatgcacttggagaactccgctgtctctgcactgtaatgagggtagaa 14040019  T
Q  373 cttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||  | | |||||||||||| |||||||||||    
T  14040020 cttagcaagttccacaaacttagcagcatactc 14040052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Original strand, 28757248 - 28757571
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||   |||||||||  || |||| |||   ||||| ||  ||||  |||      
T  28757248 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgc 28757347  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || |    
T  28757348 tttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttctt 28757447  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || || ||||| ||  | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || |||||||| |||||    
T  28757448 catagattctgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcagccctcaacccattctcaaacttgat 28757547  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    |||||| || |||||||| |||||    
T  28757548 acacttggagaactcagctgtctc 28757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 2245723 - 2245498
Alignment:
Q  177 ccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttg 276  Q
    ||||| || |||||||| |||  | ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||  | || ||||||| |||||| ||   ||  ||||| ||    
T  2245723 ccttattcctccgctcactcatcaccttataatgagctttggtatcatcctcataaatcctaaagctactcaccaactcagaaaagtttctaatcttctg 2245624  T
Q  277 gtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttt 376  Q
     |||||||| || | |||||| |||||||||| ||| ||||| || || || ||||| || ||||||||||||||    ||||| || |||||||||||     
T  2245623 ataaccaatggcccgcttaatatcagcacgcagaccattctcgaactttatgcacttagagaactcagcagtctcaacggtgtaatgtggataaaactta 2245524  T
Q  377 tccaattccacaaacttggcagcata 402  Q
     | |  ||||||||||| ||||||||    
T  2245523 gcaagctccacaaactttgcagcata 2245498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16384469 - 16384194
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttag-tcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||||| |||  | ||| |||||||| ||| | ||||||||     
T  16384469 cccttgtcagcaggggcactgtatggcttaggacgactctgttgtcccttacctcttc-gctcactcatcaccttataatgagctttgctgtcctcctca 16384371  T
Q  230 taaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatac 329  Q
    || ||||| || |  || ||||  |||||||||| ||  |||| |||||| || || |||||||| || ||||| | ||| || |||||||| || ||||    
T  16384370 tagatcctacagcaacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgatgtcagctctcaagccattctcaaactttatac 16384271  T
Q  330 actttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactca 406  Q
    | || || || ||||| ||||| | ||| || || || || |||||| | | |||||||||||| ||||||||||||    
T  16384270 atttggagaattcagctgtctccgcagtataatgggggtataactttgcaagttccacaaactttgcagcatactca 16384194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 14290554 - 14290352
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    |||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  |||  ||||| |||  ||  |||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  14290554 taatgagctttggtatcctcttcatagattctacaactgctttccaattcagaaaaatttcttatcttttgataaccaatagccctcttgatatcagctc 14290455  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     ||  || || ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||| || ||| | |  ||||||||||| |||||||||||    
T  14290454 tcaggccattttcaaacttgatgcatttggagaactcagctgtctccgcagtgtagtgtggatagaattttgcaagctccacaaacttagcagcatactc 14290355  T
Q  406 agt 408  Q
    |||    
T  14290354 agt 14290352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 408
Target Start/End: Original strand, 15230710 - 15230912
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||| ||| |||||| ||   || |||||| || |||||||| |  | |||||| |||||||    
T  15230710 taatgagctttggtatcctcctcatagattctacagctactccccaactcagaaaattgtctgatcttctgataaccaatggtccgcttaatgtcagcac 15230809  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    ||| ||| || ||||| || || |||||||| ||||||| |||||| | ||| || || ||||| || ||| | |  ||||||||||| | |||||||||    
T  15230810 gcagaccattttcaaacttaatgcactttgagaactcagtagtctcggcagtataatgtggatataattttgcaagctccacaaacttagaagcatactc 15230909  T
Q  406 agt 408  Q
    |||    
T  15230910 agt 15230912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 408
Target Start/End: Original strand, 15236578 - 15236780
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||| ||| |||||| ||   || |||||| || |||||||| |  | |||||| |||||||    
T  15236578 taatgagctttggtatcctcctcatagattctacagctactccccaactcagaaaattgtctgatcttctgataaccaatggtccgcttaatgtcagcac 15236677  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    ||| ||| || ||||| || || |||||||| ||||||| |||||| | ||| || || ||||| || ||| | |  ||||||||||| | |||||||||    
T  15236678 gcagaccattttcaaacttaatgcactttgagaactcagtagtctcggcagtataatgtggatataattttgcaagctccacaaacttagaagcatactc 15236777  T
Q  406 agt 408  Q
    |||    
T  15236778 agt 15236780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 408
Target Start/End: Original strand, 35983288 - 35983490
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    |||||||| ||||||||||| || || || || |||||||| ||||  ||||| |||  ||  ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  35983288 taatgagctttggtatcctcttcatagattctacaactgcttaccaattcagaaaaatttcttatcttatgataaccaatagccctcttgatatcagctc 35983387  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     ||  || || ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| ||| | |  ||||||||||| |||||||||||    
T  35983388 tcaggccattttcaaacttgatgcatttggagaactcagctgtctccgcagtatagtgtggataaaattttgcaagctccacaaacttagcagcatactc 35983487  T
Q  406 agt 408  Q
    |||    
T  35983488 agt 35983490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15399422 - 15399349
Alignment:
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| |||  | ||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15399422 aactcagcattcttagcagtatagtgcgggtaaaacttcgccaactcaacaaacttggcagcatactcagtcac 15399349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8744412 - 8744212
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |  |||||||  |||||||||| ||  ||||  ||||| || || |||||||| || ||||| |    
T  8744412 taatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacagcgactcaccaaatcagagaaaattctaatctgctggtatcctatggctctcttgatgtcagctc 8744313  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     ||| || |||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  8744312 tcaagccattctcaaactttatgcacttggagaattcagctgtctccggagcataatggggatagaactttgcaagctccacaaattttgcagcatactc 8744213  T
Q  406 a 406  Q
    |    
T  8744212 a 8744212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16825305 - 16825102
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| || ||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||| ||   ||  ||||| || |||||||| || ||||| || |||    
T  16825305 cttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcctacagctgcttaccaactcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatatca 16825206  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | ||  || |||||||  || |||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||    
T  16825205 gctctcaggccattctcaatctttatacacttggagaactcagcagtctccgcagtataatgaggataaaactttgcaagctccacaaacttagctgcat 16825106  T
Q  402 actc 405  Q
    ||||    
T  16825105 actc 16825102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 18131372 - 18131173
Alignment:
Q  203 ttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcag 302  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||||| || || |||||||  |||||||||| ||  ||||| || || ||||| |||||||| || ||||    
T  18131372 ttgtaatgagctttagtgtcttcttcatatatcctacagctactcaccatatcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtcag 18131273  T
Q  303 cacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcata 402  Q
    | | ||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |  || ||||| || || |||||  | | |||||||||||| ||||||||    
T  18131272 ctctcaagccattctcaaacttgatacatttggagaactcagctgtctccgtggtatagtgggggtagaacttagcaagttccacaaacttcgcagcata 18131173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 405
Target Start/End: Original strand, 12181552 - 12181650
Alignment:
Q  307 caaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| | ||| ||||| || || |||||  | | |||||||||||| |||||||||||    
T  12181552 caaaccattctcaaacttgatacatttggagaactcagctgtctccgcagtatagtgagggtagaacttagcaagttccacaaactttgcagcatactc 12181650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16831728 - 16831666
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatc 90  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| | |||||||||    
T  16831728 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcaggagcatc 16831666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 406
Target Start/End: Original strand, 13945131 - 13945331
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |  |||||||  |||||||||| ||  |||| |||||| || || |||||||| || | ||| |    
T  13945131 taatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacagcgactcaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgatgtaagccc 13945230  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     ||| || |||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| ||||  || || || || |||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  13945231 tcaagccattctcaaactttatgcacttggagaattcagctgtctccggagcataatgggggtagaactttgcaagctccacaaattttgcagcatactc 13945330  T
Q  406 a 406  Q
    |    
T  13945331 a 13945331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 31692385 - 31692353
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31692385 acaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 31692353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 19 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18881081 - 18880685
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18881081 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatttttgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgacc 18880982  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  18880981 attctctgtttgcccttatcagtaggggcactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcactatcttgtaatgagccttag 18880882  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||    
T  18880881 tatcctcctcataaatcctgcaattgctcaccagctcagaaaatacacggatcttctggtaaccaattgccctctttatctcagctcgcaaagcattctc 18880782  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18880781 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaactttgccaattccacaaacttggcagcatactcagtcatggac 18880685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21391284 - 21390893
Alignment:
Q  20 tccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  21391284 tccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagaaaaacaaacaatctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgacca 21391185  T
Q  120 ttctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggt 219  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21391184 ttctctatttgcccttatcaacaagggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattcacgatcttgtaatgagccttagt 21391085  T
Q  220 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21391084 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaacagctcagcgaaaactcgaatcttctggtaaccaattgatctcttaatctcagcacgtaacccgttctca 21390985  T
Q  320 aatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21390984 aacttgatacactttgaaaactcaaaagtctctggagtgtagtgcggatagaactttgccaattccacaaatatggcagcatactcagtcac 21390893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21780610 - 21780219
Alignment:
Q  20 tccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  21780610 tccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagaaaaacaaacaatctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgacca 21780511  T
Q  120 ttctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggt 219  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21780510 ttctctatttgcccttatcaacaagggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattcacgatcttgtaatgagccttagt 21780411  T
Q  220 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21780410 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaacagctcagcgaaaactcgaatcttctggtaaccaattgatctcttaatctcagcacgtaacccgttctca 21780311  T
Q  320 aatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21780310 aacttgatacactttgaaaactcaaaagtctctggagtgtagtgcggatagaactttgccaattccacaaatatggcagcatactcagtcac 21780219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 19981331 - 19981716
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| | ||  | |||||||||||||| ||||    
T  19981331 ggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagaagacaatctcagcaggaacatccttcttccttggtcgcctatcttcgaccatcctct 19981430  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19981431 atttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccactcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctc 19981530  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||||| |||    
T  19981531 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcggagaaaactcggatcttctggtaaccaattgccctcttgatctcagtacgtaacccgttctcaaacttg 19981630  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    || |||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19981631 atgcactttgagaactcagtagtctcagcagtgtaatgcggataaaactttgccaactccacaaacttggcagcatactcagtcac 19981716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 21671872 - 21672264
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||| |||||  |||   | ||||| || |||    
T  21671872 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagagcgcctatcatctacc 21671971  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21671972 attctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttgg 21672071  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21672072 catcctcctcataaatcctgcaactgctcaccagctcagaaaagactcggatcttctggtaaccaattgccctcttgatctcagcacgtaaaccgttctc 21672171  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21672172 gaatttgatgcatttcgaaaactcagcagtctctgcagtataatgcgaataaaactttgccaactccacaaacttggcagcatactctgtcac 21672264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 27 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21163946 - 21163562
Alignment:
Q  27 gacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctc 126  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||| ||||     
T  21163946 gacaagcattgctcttgtggtctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggtcgtctatcctcgaccatcctctg 21163847  T
Q  127 tttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21163846 tttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactttgttggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcc 21163747  T
Q  227 tcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttga 326  Q
    || ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  21163746 tcataaatcctgcaactgttcaccaactcggagaaaactcggatctgttggtatccaattgccctcttcatctcagcccgcaatccattctcgaacttga 21163647  T
Q  327 tacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21163646 tacacttcgaaaactcaacagtctctgcagcttaatgcggataaaaatttgccaactccacaaacttggcagcatactcagtcac 21163562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 415
Target Start/End: Original strand, 22990406 - 22990789
Alignment:
Q  23 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||   |||||| || |||||| ||||| | || || || | |||||    
T  22990406 ccaggacaagcattacccttgtggccgttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcgtctttcttcctaggccgcctctcatcaatcattc 22990505  T
Q  123 tctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatc 222  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| |||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22990506 tctatttgcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacctttgcctttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatc 22990605  T
Q  223 ctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaat 322  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||   ||| |||| ||||||||| || |||||||||    
T  22990606 ttcctcataaatcctgcaactgctcaccagctcagaaaaattacggatcttctggtaaccaattgcctgcttgatcttagcacgcaagccattctcaaat 22990705  T
Q  323 ttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||| || ||||||||||||         | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22990706 ttgatgcattttgaaaactca---------gtagtgtagtgcggataaaacttagccaattccacaaacttgacagcatactcagtcacggac 22990789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22421317 - 22420925
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    | |||||| |||||| ||||| | || || || |||    
T  22421317 atccccaggacaagcattacttttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatatcaaccgaagcatctttcttcctaggccgcctctcatcaacc 22421218  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| | || || |||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22421217 attctctgtttgcccttattagcaggagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttag 22421118  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  || ||    |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || || ||    
T  22421117 tatcctcctcataaatcctgcaactgctcacctggttggaaaagttacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgatctcagcacgcaagccattgtc 22421018  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22421017 aaatttaatacacttagaaaattcagtagtctcgacagtatagtgcggataaaactttgtcaactccacaaacttggtagcatactcagtcac 22420925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 22043191 - 22043567
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  22043191 ggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagttggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctct 22043290  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     ||||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22043291 gtttgcccttgtcagtaggggcactataaggcttagggtgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctc 22043390  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||| ||||||||||| ||  | ||||  |||| |||||||||||||| |||||| || || || |||||||| || |  | |||||||||||| || |||    
T  22043391 ctcataaatcctgcatctattaaccaaatcagggaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttg 22043490  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    || || || || ||||||||         ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22043491 atgcatttcgagaactcagc---------agtatagtgcggatagaactttgccaactccacaaacttggcagcatactctgtcac 22043567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 30310563 - 30310176
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  30310563 caggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattct 30310464  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30310463 ctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggtttagggcgactctgctgacccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcc 30310364  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    |||||||| || ||||||||  |||| |  |||| |||||||||||  | |||||| |  || || ||||| || || |  | |||||| ||||| || |    
T  30310363 tcctcgtagattctgcaactattcactaaatcagggaaaactcggagttgttggtatctgatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaact 30310264  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || || || |||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||| || | ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  30310263 tgatgcatttcgagaactcagcagtctcagcagcatagtgtggatagaactttgccgactccacgaaattggcagcataatctgtcac 30310176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 15536746 - 15537132
Alignment:
Q  25 aggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctc 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  15536746 aggacaaacattactcttgtggccttcttcgccacaattaaaacaaataatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctc 15536845  T
Q  125 tctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcct 224  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |    
T  15536846 tgcttgcccttatcggcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttactatctt 15536945  T
Q  225 cctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaattt 324  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||| |  |||| ||||||||| |  | |||||| || || || ||||| || || |  | |||||| ||||| || ||    
T  15536946 cctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcgaagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaactt 15537045  T
Q  325 gatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||| || || || |||||| ||||||| | ||  || | |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15537046 gatgcatttcgagaactcaacagtctcagcagcataatacggatagaactttgccaactccacaaacttggcagcatactctgtcac 15537132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 411
Target Start/End: Original strand, 32603510 - 32603894
Alignment:
Q  27 gacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctc 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||     
T  32603510 gacaaacattactcttgtggcctttcccaccacagttgaaacaaacaatttccgaaggagcatccttcttcttaggtcgcctatcatcgaccattctctg 32603609  T
Q  127 tttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcc 226  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||     
T  32603610 cttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctct 32603709  T
Q  227 tcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttga 326  Q
    ||||| ||||| || ||| ||||||  |||| |||||||||||  | ||| || || || || ||||| || ||||  | |||||| ||||| || ||||    
T  32603710 tcgtagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaactcggagttgttgatatccgatcgccctcttgatgtcaggcctcaaaccattctcgaacttga 32603809  T
Q  327 tacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    | || || || |||||| || |||| | ||| ||||| || || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32603810 tgcatttcgagaactcaacattctcagcagtatagtgtgggtagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactctgtcac 32603894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 188 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1758044 - 1757879
Alignment:
Q  188 cgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  1758044 cgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcataaatcctgcaactgctcaccagctcagaagagactcgaatcttctggtaaccaattg 1757945  T
Q  288 ctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctg 353  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1757944 ctcttttgatctcagcacgtaaaccgttctcgaatttgatacacttcgaaaactcagcagtctctg 1757879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Original strand, 22523871 - 22524134
Alignment:
Q  23 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattc 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||   ||||||||| |||||| ||||| | || || ||    | ||    
T  22523871 ccaggacaagcattactcctgtggcctttctcgccacaagtatagcacacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcattaactc 22523970  T
Q  123 tctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatc 222  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||| ||    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22523971 tttgttttcccttatcagcaggggcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgccttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatc 22524070  T
Q  223 ctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaatt 286  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||    |||||||| ||||||||||||    
T  22524071 ctccttataaatcctgcaactgctcaccagctcggaaaagttacggatcttctggtaaccaatt 22524134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Original strand, 19115762 - 19116150
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||| | || || |||| ||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  |    
T  19115762 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcgccacaattgaagcacacaacctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 19115858  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  19115859 ctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcc 19115958  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    ||||| || |||||||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || |    
T  19115959 tcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaact 19116058  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| ||  | || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19116059 tgatgcatctcgagaactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 19116150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20015671 - 20015298
Alignment:
Q  35 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgccct 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||  ||| ||| || |    
T  20015671 ttactcttgtggcccttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccctcttcttaggccgtctcacatcgaccatcttctgtttccctt 20015575  T
Q  135 tatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaat 234  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20015574 tatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcttcgtagat 20015475  T
Q  235 cctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacacttt 334  Q
    |||||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  |     
T  20015474 cctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctc 20015375  T
Q  335 gaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    || ||||||||| |||||| ||| |||||| |||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20015374 gagaactcagcattctctgcagtatagtgcagatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcac 20015298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 405
Target Start/End: Original strand, 18859956 - 18860317
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | || ||| || |||||||    
T  18859956 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcccctgtttccctttatcag 18860052  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||    
T  18860053 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctaca 18860152  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  || |  |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| || || || |||    
T  18860153 gctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatttcgagaac 18860252  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||| || |||||  |||  ||||| |||||||||||||||||    
T  18860253 tcagcattctcagcagtatagtgcgggtagaacttcgccagctccacgaacttggcagcatactc 18860317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 411
Target Start/End: Original strand, 3274633 - 3274854
Alignment:
Q  190 ctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgct 289  Q
    ||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||    |||||| |||||| | |||| ||     
T  3274633 ctcattcactattttgtaatgagctcttgtatcctcctcatagattctgcagctgctcaccagttcagaaaagttacggatcctttggtgatcaatggcc 3274732  T
Q  290 ctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaa 389  Q
    | |||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  |||  |||||||    
T  3274733 cgcttaatatcaggacgcaaaccattctcaaacttgatacatttcgaaaattcagcagtctcagcagtgtagtgtggataaaacttagccagctccacaa 3274832  T
Q  390 acttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| | ||||||||| |||||    
T  3274833 actttgtagcatactctgtcac 3274854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22126361 - 22126165
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||    
T  22126361 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtag---catccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcag 22126265  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  22126264 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 22126165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 17671424 - 17671057
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || ||||    
T  17671424 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcag 17671328  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  17671327 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 17671228  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||||||  | || |||    
T  17671227 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatacatctcgagaac 17671128  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| | |||| | ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17671127 tcagaattctcagcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcac 17671057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19481477 - 19481293
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| ||||| |    
T  19481477 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgt 19481381  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| | |||||| ||||||||    
T  19481380 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtaagccttcgtatcctc 19481293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22117577 - 22117210
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||| | | ||||| |||||||||     ||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| || |||||||    
T  22117577 ttgtggcctttcccaccacgattgaaacacacaatctct---atagcatccttattcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcag 22117481  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
      |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  22117480 tgggggcactgtacggcttaggacgactttgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 22117381  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||| ||||| || ||||| ||  | || |||    
T  22117380 gctattaaccaaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccattctcgaacttgatgcatctcgagaac 22117281  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||| || ||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22117280 tcagcattctcagcagtatagtgcgggtagaactttgacagctccacgaacttggcagcatactctgtcac 22117210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 6606742 - 6606504
Alignment:
Q  170 tgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcgga 269  Q
    |||||||||||  || |||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||| || || | ||    
T  6606742 tgctgacccttgttcctccgctcactcctaaccttataatgagccttcgtatcctcctcataaattctacaactactcaccaattcagaaaataccctga 6606643  T
Q  270 tcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggata 369  Q
    ||||||| ||||| ||  | | |||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| || || |||||||| | |||||| || |||||    
T  6606642 tcttttgataacctatgacccgcttaatgtcagcacgcaaaccattttcaaacttaatgcactttgagaattccgcagtctcggcagtgtaatgtggata 6606543  T
Q  370 aaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagt 408  Q
     || ||| | |  |||||||| || ||||||||||||||    
T  6606542 gaattttgcaagctccacaaatttagcagcatactcagt 6606504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 21254301 - 21254381
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttctt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21254301 atccccaggacaaggattactcttatggcccttctcaccacaagaaaaacaaaaaatctctgcaggagcatccttcttctt 21254381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 411
Target Start/End: Original strand, 21928968 - 21929177
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| ||||  ||||| |||  ||  ||||| || |||||||| || ||||| || |||    
T  21928968 cttgtaatgagctttggtatcctcttcatagattctacagctgcttaccaattcagaaaaatttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatatca 21929067  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | |||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||| || ||||    
T  21929068 gctctcaaaccattttcaaacttgatacatttggagaactcagcagtctccgcagtatagtgaggatagaactttgcaagctccacaaactttgctgcat 21929167  T
Q  402 actcagtcac 411  Q
    ||||||||||    
T  21929168 actcagtcac 21929177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 406
Target Start/End: Original strand, 22054332 - 22054607
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttag-tcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| | ||||||  ||||| ||||| |||  | ||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  22054332 cccttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgccgtcccttacctcttc-gctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctca 22054430  T
Q  230 taaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatac 329  Q
     | ||||||||||  |||||||  |||||||||| ||  |||| |||||| || || |||||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||    
T  22054431 cagatcctgcaacgactcaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgatattagctctcaagccattctcaaactttatac 22054530  T
Q  330 actttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactca 406  Q
    | || || || ||||| ||||| |  || ||||| || || |||||| | | |||||||||||| ||||||||||||    
T  22054531 atttggagaattcagctgtctccgcggtatagtgggggtagaactttgcaagttccacaaactttgcagcatactca 22054607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22710524 - 22710308
Alignment:
Q  189 gctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgc 288  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || |||||  |||| || || |||| ||| || ||   ||||||||| || || ||||| ||    
T  22710524 gctcattcagaatcttataatgagctttggtgtcatcttcataaattttgcagctacttaccaactcggaaaactgtcggatcttctgatacccaatcgc 22710425  T
Q  289 tctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccaca 388  Q
    || |||||||||| |||| || || ||||| ||||| | |||||| || || || |||||||| | | | |||||||||||||||||| |||| || |||    
T  22710424 tcgcttaatctcaacacgtaagccattctcgaatttaaaacacttagagaattcggcagtctcagcattatagtgcggataaaactttgccaactcaaca 22710325  T
Q  389 aacttggcagcatactc 405  Q
    ||||| |||||||||||    
T  22710324 aacttagcagcatactc 22710308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Original strand, 28984277 - 28984600
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||    ||||||||  || |||| |||   ||||| ||  |||| ||||      
T  28984277 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcaactggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgc 28984376  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| || || |    
T  28984377 tttcccttgtccgcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttgtaatgagctttggtgtcttctt 28984476  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | |||||||| || ||| | |||| |||||| || |||| ||||| ||| || ||||| ||||| || || ||||| | ||  || |||||||| || ||    
T  28984477 cataaatcctacacctgttaaccaactcagaaaagactctgatctgttgatatccaatggctcttttgatgtcagccctcagcccattctcaaacttaat 28984576  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    |||||| || |||||||| |||||    
T  28984577 acacttggagaactcagccgtctc 28984600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29300732 - 29300518
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||  || ||||||  | ||| |||| |||  | |||||||||||| || || |||||||| || ||||    
T  29300732 tcagcaggagcactgtaaggtttaggacgactctaatgtcccttacccctcctctcactcattaccttgtaatgagcttttgtgtcctcctcatatatcc 29300633  T
Q  237 tgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttga 336  Q
    |||| ||||| || | ||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  29300632 tgcagctgcttactaactcagagaaaactctaatcttctgatacccaatagctcttttgatgtcagccctcaacccattttcaaacttgatacacttgga 29300533  T
Q  337 aaactcagcagtctc 351  Q
     |||||||| |||||    
T  29300532 gaactcagctgtctc 29300518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 372
Target Start/End: Original strand, 20391561 - 20391796
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||||||| ||||||||  | || || ||||  |||||||| ||  || |||||||| ||| || ||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  20391561 tcagcaggagcactgtagggcttcggacgaccttgctgacctttgttcctccgctcactcataaccttataatgagctttggtatcctcttcataaattc 20391660  T
Q  237 tgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttga 336  Q
    | || ||||||||||  ||||| ||    | ||||||||| || ||||| || | |||||| |||||||||| ||| |||| ||| || || ||||| ||    
T  20391661 tacagctgctcaccaattcagaaaattgcctgatcttttgatacccaatggcccgcttaatatcagcacgcataccattctaaaactttatgcacttgga 20391760  T
Q  337 aaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaa 372  Q
     |||||||||||||| | |||||| || ||||||||    
T  20391761 gaactcagcagtctcggcagtgtaatgtggataaaa 20391796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 17830208 - 17830002
Alignment:
Q  205 gtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagca 304  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  |||| |  |||| ||||||||||| || ||| || || || || ||||| || || |      
T  17830208 gtaatgagcctttgtatcttcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggagctgttgatatccgatcgcactcttgatgtcgggc 17830109  T
Q  305 cgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatact 404  Q
    | |||||| ||||| || ||||| ||  | || ||||||||| |||| | ||| ||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17830108 ctcaaaccattctcgaacttgatgcatctcgagaactcagcattctcagcagtatagtgtgggtagaactttgccaattccacgaacttggcagcatact 17830009  T
Q  405 cagtcac 411  Q
    | |||||    
T  17830008 ccgtcac 17830002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31413857 - 31413712
Alignment:
Q  118 cattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttg 217  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||  | | |||||| |||  || ||||||||||| |||    
T  31413857 cattctctgctttcccttgtcagcaggggcgctgtaaggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttcgctcactcatcattttgtaatgagctttg 31413758  T
Q  218 gtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaa 263  Q
    || || ||||| || |||||||| ||| | |||| || ||||||||    
T  31413757 gtgtcttcctcatatatcctgcagctgtttaccaacttagagaaaa 31413712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16268639 - 16268564
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggc 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||| | |||||||||  |||||||||||    
T  16268639 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcttcttaggc 16268564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21970788 - 21970589
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||   ||  ||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |    
T  21970788 taatgggctttggtatcatcctcataaatcctacagctactcaccaactcagaaaagtttctaatcttctgataaccaatggctctcttgatgtcagctc 21970689  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     |||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||   |||| |  ||||| || |||||||||||  | |  ||||||||| | |||||||||||    
T  21970688 tcaaacgattctcgaatttgatacacttggagaactcaggtctctccgcggtgtaatgtggataaaacttagcaagctccacaaaccttgcagcatactc 21970589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22004255 - 22004149
Alignment:
Q  269 atcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggat 368  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |  ||||| || ||||    
T  22004255 atcttctgataaccaatggctctcttgatgttagctctcaagccattctcgaatttgatacacttggagaactcagctgtctccgcggtgtaatgtggat 22004156  T
Q  369 aaaactt 375  Q
    |||||||    
T  22004155 aaaactt 22004149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 307 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19481212 - 19481104
Alignment:
Q  307 caaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactca 406  Q
    |||||||||||| || ||||||||  | || ||||||| | |||| | ||| |||||||| || |||||   ||  ||||| |||||||||||||||||     
T  19481212 caaaccgttctcgaacttgatacatctcgagaactcagaattctcagcagtatagtgcgggtagaacttcgacagctccacgaacttggcagcatactct 19481113  T
Q  407 gtcacggac 415  Q
    |||||||||    
T  19481112 gtcacggac 19481104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21998614 - 21998478
Alignment:
Q  269 atcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggat 368  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||| || | ||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |  ||||| || ||||    
T  21998614 atcttctgataaccaatggctttcttgatgttagctctcaagccattctcgaatttgatacacttggagaactcagctgtctccgcggtgtaatgtggat 21998515  T
Q  369 aaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||||||  | |  ||||||||| | |||||||||||    
T  21998514 aaaacttagcaagctccacaaaccttgcagcatactc 21998478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 22401898 - 22402290
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22401898 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagaaaatttctgcaggagcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgacc 22401997  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22401998 attctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcatttacaatcttgtaatgagccttag 22402097  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  22402098 tatcctcctcataaatcctgcagctactcaccagctcataaaatacacggatcttctggtaaccaattgccctctttatctcagcttgcaaaccgttctc 22402197  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22402198 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctagagtgtagtgcggataaaactttgccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 22402290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20081422 - 20081038
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | || ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  20081422 ggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcatgaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctct 20081323  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20081322 gtttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttaaggcgactctgctggccgttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctc 20081223  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||    
T  20081222 ctcgtaaatactgcaactgctcaccaactcggagaaaactcggattttttggtaaccaattgccctcttgatctcagcacgtaacccgttctcacacttg 20081123  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20081122 -tacactttgaaaactcagcagtctcgggggtgtggtgcggataaaactttgccaactccacaaacttggcagcatactcattcac 20081038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 21752353 - 21752745
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||| |||||  | || || |||||||| |||    
T  21752353 atccccagtacaagcattgctcttttggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcatcaggagcatctttctttctcgggtgcctatcttcaacc 21752452  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21752453 actctctgttttcccttatcagcagtggcactgtaaggcttaggacgactctgctgacccttagcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttgg 21752552  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21752553 tatcttcctcataaatcctgcaactgctcaccagctcagagaagactcggatcttctagtaaccaattgctctcttgatctcagcacgtaaaccgttctc 21752652  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21752653 gaatttgatgcatttcgaaaactcagcagtctctgcagtataatgcggataaaactttgccaactccacaaacttggcagcatactctgtcac 21752745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22496302 - 22496001
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||   |||| ||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||||    
T  22496302 ggacaagcatcgctcttgtggcctttctcaccataattaaagcagacaatctcaacaggaacatccttcttccttggccgtctatactcgaccattctct 22496203  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     ||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22496202 gttttcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggagactctggtggcccttcgtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctc 22496103  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  22496102 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcggagaaaactcggatcatctggtaaccaattgccctcttgatctcagcacgtaacccgttctcaaacttg 22496003  T
Q  326 at 327  Q
    ||    
T  22496002 at 22496001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24784903 - 24784519
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  24784903 ggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccataattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctct 24784804  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24784803 gtttgcccttatcagcagaggcactatagggcttagggagactctgttggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttgttatcctc 24784704  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||| || || || || ||| ||||||  |||| |||||||||||||| |||||| || ||  | |||||||| ||||  || ||||| |||||||| |||    
T  24784703 ctcatagattctacagctgttcaccaaatcag-gaaaactcggatctgttggtatccgatcaccctcttaatatcaggtcgtaaaccattctcaaacttg 24784605  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    || || ||||| |||||||||||||| | ||| || || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24784604 atgcattttgagaactcagcagtctcagcagtataatggggataaaactttgccaactcaacaaacttggcagcatactcaatcac 24784519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21228601 - 21228217
Alignment:
Q  27 gacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctc 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||     
T  21228601 gacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctg 21228502  T
Q  127 tttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcc 226  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21228501 tttacccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcc 21228402  T
Q  227 tcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttga 326  Q
    || || |||||||| ||  | || |  |||| |||||||| ||||| |||||| || || || |||||||| || |  | |||||| ||||| || ||||    
T  21228401 tcatagatcctgcagctattaactaaatcagggaaaactcagatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccattctcgaacttga 21228302  T
Q  327 tacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    | || || || |||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21228301 tgcatttcgagaactcagcagtctcagcagtatagtgcgggtagaactttgccaactccacaaacttggcagcatactctgtcac 21228217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 21176680 - 21177065
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  21176680 ggacaaacattgctcttgtggactttctcaccacaattaatacagacaatctccacaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctct 21176779  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21176780 gtttgcccttatcagcaggggcactatatgtcttagggctactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctc 21176879  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||| || || || |||||  ||||||  ||||  ||||| ||||| | ||| || | |||||| |||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||    
T  21176880 ctcatagattctacaactattcaccaaatcaggaaaaacacggatttgttgatacctaattgccctcttaatatcaggccgcaatccattctcaaatttg 21176979  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    || || || |||||||||  |||||| | ||  |||||  |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21176980 atgcatttagaaaactcaatagtctcagcagcatagtgtagatagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactcggtcac 21177065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 22435779 - 22435400
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  | |||||||||||||| ||          ||| | |||||||||||    
T  22435779 ggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaatcttcgcaggagcatccttctcct----------atcattgaccattctct 22435690  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     ||| |||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22435689 gttttcccttatcagtaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctc 22435590  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||| || || || ||  || |||||| ||| |  |||||| |||||| |||||| ||||| || ||||| || ||||  ||||| || ||||| || |||    
T  22435589 ctcatagattctacagttgttcaccaactcgggaaaaacttggatctgttggtatccaatcgccctctttatatcaggccgcaatccattctcgaacttg 22435490  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| | || || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22435489 aaacacttcgaaaactcagcagtctcagcagcgtaatgcggataaaactttgcgaactcaacaaacatggcagcatactcagtcacggac 22435400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 121 - 410
Target Start/End: Original strand, 16379502 - 16379791
Alignment:
Q  121 tctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggta 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  16379502 tctctgtttgcccttatcagcagaggcactgtaaggcttaggacgactctgttgacccttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagta 16379601  T
Q  221 tcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaa 320  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| | |||||||||||| ||||| || |||| || ||| || ||||| |    
T  16379602 tcctcctcataaatcctgcatctgctcaccagctcagaaaaattacggatcttctagtaaccaattgccctcttcatatcaggacacaagccattctcga 16379701  T
Q  321 atttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtca 410  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16379702 atttgatacacttggaaaactcagcagtctcaacagtatagtgtggataaaatttagccaactccacaaacttagcagcatactcagtca 16379791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 17042063 - 17041677
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| | |||||  | ||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  17042063 caggataaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaa-aatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 17041965  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  17041964 ctgcttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcc 17041865  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || ||||| ||||| || ||| ||||||  |||| |||||||||||  | |||||| || || || ||||| || || |  | |||||| ||||| || |    
T  17041864 tcttcgtagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaact 17041765  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || || || ||||||||| |||| | ||| ||||| || || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17041764 tgatgcatttcgagaactcagcattctcagcagtatagtgtgggtagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactctgtcac 17041677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 131 - 411
Target Start/End: Original strand, 22117132 - 22117412
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    ||||||||||||||  |||||||| | || || ||||| |||||||||||    |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22117132 cccttatcagcaggaacactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcaaaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcgt 22117231  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| | |||||||||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||    
T  22117232 atattctgcaactgctcaccagctcagaaaagttacggatcttcttgtaaccaattgcccgcttgatctccgcacgcaagccattctcaaatttgatgca 22117331  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22117332 tttagaaaactcagcagtctcagcaatgtagtgcggataaaacttagccaactccacaaacttggcagcatattcagtcac 22117412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 128 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21045098 - 21044815
Alignment:
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| |||||||||||    |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21045098 ttgcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctcttattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcct 21044999  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21044998 catatattctgcaactgctcaccagctcagaaaagttacggatcttctgttaaccaattgctcgcttgatctcagcacgcaagccattctcaaatttgat 21044899  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  21044898 gcacttagaaaactcagcagtcttggcagtgtagtgcggataaaacttagctagctccacaaactttgcagcatattcaatcac 21044815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 411
Target Start/End: Original strand, 19109739 - 19110064
Alignment:
Q  85 agcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtc 184  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||   |    
T  19109739 agcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgccc 19109838  T
Q  185 ttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaa 284  Q
    |||| |||||| ||||||||  | |||||||| |||||||| || || |||||||| ||  | ||||  || | ||||||||  |||| |||||| ||||    
T  19109839 ttcctctcattgacaatcttacagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatccg-gaaaactctaatctgttggtatccaa 19109937  T
Q  285 ttgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattc 384  Q
    | || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||| ||  || || |||||||||||  |||||||    
T  19109938 tcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatttcgaaaactcagcagtctctgcagcataatgtggataaaacttcgccaattc 19110037  T
Q  385 cacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  19110038 aacaaacttggcagcatactcagtcac 19110064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Original strand, 21842540 - 21842907
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  21842540 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctc---agtagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcag 21842636  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | |||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||   ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  21842637 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgatgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgca 21842736  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||| ||||| || ||||| ||  | || |||    
T  21842737 gctattgaccaaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaacttgatgcatctcgagaac 21842836  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21842837 tcagcattctcagcagtatagtgcgggtaaaacttcgccaactcaacaaacttggcagcatactcagtcac 21842907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16347629 - 16347254
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||   || ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| ||||| |    
T  16347629 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---agcagcatccttcttcttaggccgcctaacgtcgaccatcttctgtttacccttgt 16347533  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16347532 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcct 16347433  T
Q  238 gcaactgctcacc-agctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttga 336  Q
    ||| ||  | ||| |  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||    
T  16347432 gcagctattaaccaaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcga 16347333  T
Q  337 aaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
     ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16347332 gaactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 16347254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 51330523 - 51330152
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||  | ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  51330523 ttgtggcctctctctccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctgacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 51330427  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  51330426 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 51330327  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  51330326 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 51330227  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  51330226 tcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 51330152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 411
Target Start/End: Original strand, 22400640 - 22401015
Alignment:
Q  33 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcc 132  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||| | ||||| ||||||||   || ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| ||    
T  22400640 cattacttttatggcctttccctccacaattgaaacacacaatctc---agtagcatccatcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccc 22400736  T
Q  133 cttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaa 232  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||     
T  22400737 tttatcagcaggggcactgtacagcttaggacgactctgctctcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtatcctcttcatag 22400836  T
Q  233 atcctgcaactgctcaccagct-cagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacac 331  Q
    |||||||| ||  | ||||  | |||| |||||||  | || |||| | ||||| || || || || || |  | |||||| ||||| ||  |||| ||     
T  22400837 atcctgcagctattgaccaaatccaga-aaaactctaagctgttggcatccaatcgcccttttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaacctgatgcat 22400935  T
Q  332 tttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    || || ||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22400936 ttcgagaactcagcattctcagtagtatagtgcgggtaaaacttcgccaactcaacaaacttggcagcatactcagtcac 22401015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 323 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22459752 - 22459664
Alignment:
Q  323 ttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22459752 ttgatgcactttgaaaactcagcagtctcgggggtgtagtgcggataaaactttgccaactccacaaacttggcagcatactcagtcac 22459664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 323 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22470181 - 22470093
Alignment:
Q  323 ttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22470181 ttgatgcactttgaaaactcagcagtctcgggggtgtagtgcggataaaactttgccaactccacaaacttggcagcatactcagtcac 22470093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 408
Target Start/End: Original strand, 18273255 - 18273493
Alignment:
Q  170 tgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcgga 269  Q
    |||||||||||  || |||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||  ||||| || |  | ||    
T  18273255 tgctgacccttgttcctccgctcactcctaaccttataatgagccttcgtatcctcctcataaattctacagctactcaccaattcagaaaatagcctga 18273354  T
Q  270 tcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggata 369  Q
    ||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||||||||| | ||| || || |||||    
T  18273355 tcttttggtaacctatggcccgcttaatgtcagcacgcaaaccattttcaaacttaatgcactttgagaactcagcagtctcagcagtataatgtggata 18273454  T
Q  370 aaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagt 408  Q
    ||| ||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18273455 aaattttgcaagctccacaaacttagcagcatactcagt 18273493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 415
Target Start/End: Original strand, 21833630 - 21834001
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  21833630 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttatcag 21833726  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||    
T  21833727 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctccatagatcctgca 21833826  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  21833827 gctattaaccaaatcctgaaaaactcttagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 21833926  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||| || |||||    |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21833927 tcagcattctcagcagtatagtgcgggtagaacttcgatagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 21834001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41350702 - 41350518
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| ||||| |    
T  41350702 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgt 41350606  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| | |||||| ||||||||    
T  41350605 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtaagccttcgtatcctc 41350518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 33388060 - 33387689
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || ||||    
T  33388060 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcag 33387964  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  33387963 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 33387864  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  |  |  |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || || || ||  | || |||    
T  33387863 gctattaaccaaattcggaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaactttatgcatctcgagaac 33387764  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||| || ||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33387763 tcagcattctcagcagtatagtgcgggtagaactttgacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 33387689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 20853626 - 20853427
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||  || ||||||| || |||||| || || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  20853626 taatgagcctttgtatcctcctcataaattctacagctactcaccaattctgagaaaattctgatcttctgatatccaatggctctcttgatgtcagctc 20853527  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     |||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| | | ||||   |||||||||||||||||    
T  20853526 tcaaaccattttcaaatttaatacatttggagaactcagctgtctccgcagtgtagtgaggataaaactttgcaagttccgtgaacttggcagcatactc 20853427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16354187 - 16353903
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16354187 cccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgt 16354088  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    | |||||||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||    
T  16354087 agatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgca 16353988  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
      | || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16353987 tctcgagaactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 16353903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 402
Target Start/End: Original strand, 20921929 - 20922128
Alignment:
Q  203 ttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcag 302  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || |||||||||||||| || ||||  ||    |||||||| || || |||||||| | ||| |||||||    
T  20921929 ttgtaatgtgctttggtatcctcttcatagattctgcaactgctcactagttcagtaaagttacggatcttctgatatccaattgcccgcttgatctcag 20922028  T
Q  303 cacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcata 402  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||| |||||| ||||||||    
T  20922029 cacgcaagccactttcaaatttgatgcacttggaaaactcggcgttctcagcagtgtagtgcggataaaacttagccagctccataaactttgcagcata 20922128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31537041 - 31536718
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| | |||||||||  || |||| ||    ||||| ||   ||| ||||      
T  31537041 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttataacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcctctgc 31536942  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || |    
T  31536941 tttcctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttctt 31536842  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | ||||| || || ||| | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  31536841 cataaattctacatctgtttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcagctctcaacccattctcaaatttgat 31536742  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    |||||| || |||||||| |||||    
T  31536741 acacttagagaactcagctgtctc 31536718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 38909870 - 38909547
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||   |||||||||  || |||| |||   ||||| ||  |||| ||||      
T  38909870 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgc 38909771  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||||  | ||| | || |||  |||||||||||||| ||||| || || |    
T  38909770 tttcctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttgtcccttacccctcctcccactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttctt 38909671  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | ||||| || || ||| | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  38909670 cataaattctacatctgtttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcagctctcaacccattctcaaatttgat 38909571  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    |||||| || |||||||| |||||    
T  38909570 acacttagagaactcagctgtctc 38909547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21742422 - 21742216
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||  ||||| |  |||||||| || ||||| || |||    
T  21742422 cttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagctactcaccaactcagagaaaattcttatcttctcataaccaatagccctcttgatatca 21742323  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | ||  || || ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| ||| | |  ||||||||||| |||||||    
T  21742322 gctctcaggccattttcaaacttgatgcatttagagaactcagctgtctccgtagtatagtgtggataaaattttgcaagctccacaaacttagcagcat 21742223  T
Q  402 actcagt 408  Q
    |||||||    
T  21742222 actcagt 21742216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24096659 - 24096424
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||   |||||||||  || |||| |||   || || ||   ||| |||| |    
T  24096659 acaagcattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcatcctctgt 24096560  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| || |||||| |  | |||||| ||   | |||||||||||| ||||| || ||||    
T  24096559 tttcctttgtcagcaggagcactataaggtttaggacgactctgttgtcccttacttcttcgctcactcgtcaccttgtaatgagctttggtgtcttcct 24096460  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaa 263  Q
    | || |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24096459 catatatcctgcagctgctcaccaactcagagaaaa 24096424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 402
Target Start/End: Original strand, 19857794 - 19857994
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || ||| | || ||||| |||| |||||| ||   ||  ||||| || || ||||| |||||||| || |||    
T  19857794 cttgtaatgagccttagtatcctcttcatagatcttacagctgcttaccaactcagaaaagtttctaatcttctgatagccaatggctctcttgatgtca 19857893  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | ||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| ||||| || || |||||  | | |||||||||||| |||||||    
T  19857894 gctctcaagccattctcaaacttgatacacttggagaactcagctgtctccgcagtatagtgggggtagaacttagcaacttccacaaacttcgcagcat 19857993  T
Q  402 a 402  Q
    |    
T  19857994 a 19857994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Original strand, 48426219 - 48426542
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||   |||||||||  || |||| |||   ||||| ||  ||||  |||      
T  48426219 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgc 48426318  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || |    
T  48426319 tttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttctt 48426418  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || || ||||| ||  | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || |||||||| |||||    
T  48426419 catagattctgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcagccctcaacccattctcaaacttgat 48426518  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    |||||| || |||||||| |||||    
T  48426519 acacttggagaactcagctgtctc 48426542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 20074644 - 20074366
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||||||  ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  20074644 tcagcagaagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattc 20074545  T
Q  237 tgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttga 336  Q
    | ||  || | |||| ||||||||| | || |||||  |  || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  20074544 tacacatgttaaccaactcagagaagaatctgatctgctaatacccaatagctcttttgatgtcagccctcaacccattctcaaatttgatacacttgga 20074445  T
Q  337 aaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
     |||||||| ||||| | | |||| || || || ||| |  | | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  20074444 gaactcagctgtctccgcactgtaatgagggtagaacgtagcaagttccacaaactttgcagcatactccgtgacggac 20074366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21738906 - 21738697
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || || ||||  ||||| |||   |  | |||||| || ||||| || ||||| || |||    
T  21738906 cttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagctacttaccaattcagaaaaattccttaccttttgatagccaatagccctcttgatatca 21738807  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
     | | |||||| || ||||| || ||||| || || |||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||  | | |||||||||||| |||||||    
T  21738806 actctcaaaccattttcaaactttatacatttggagaactcagcagtctccgcagtatagtgaggatagaacttagcgagttccacaaacttcgcagcat 21738707  T
Q  402 actcagtcac 411  Q
    |||| |||||    
T  21738706 actccgtcac 21738697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 351
Target Start/End: Original strand, 21961482 - 21961697
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||| ||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||    ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || || |||||      
T  21961482 tcagaaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacctctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatta 21961581  T
Q  237 tgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaatt-gctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttg 335  Q
    |||| ||| | ||||  |||||||| |||| |||||  || || |||||  ||||||||||| ||||| | ||| || || ||||||||||||||||| |    
T  21961582 tgcatctgtttaccaattcagagaagactctgatctgctgatacccaataagctctcttaatgtcagctctcaacccattttcaaatttgatacacttgg 21961681  T
Q  336 aaaactcagcagtctc 351  Q
    | || ||||| |||||    
T  21961682 agaattcagctgtctc 21961697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Original strand, 52989087 - 52989409
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |  |||| |||||||| | |||||||||  || ||||||||   ||||| ||   |||  |||      
T  52989087 acaaacattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgc 52989186  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||||  | ||| |||| |||  || ||||||||||| ||||| || || |    
T  52989187 tttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattttgctgtcccttacccctcctctcactcattat-ttgtaatgagctttggtgtcttctt 52989285  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | ||||| || || ||| | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  52989286 cataaattctacacctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcagccctcaacccattctcaaatttgat 52989385  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
     ||| | || |||||||| |||||    
T  52989386 gcacctggagaactcagctgtctc 52989409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21739080 - 21739048
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739080 acaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 21739048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Original strand, 37680395 - 37680427
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37680395 acaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 37680427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 307 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 41350437 - 41350329
Alignment:
Q  307 caaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactca 406  Q
    |||||||||||| || ||||||||  | || ||||||| | |||| | ||| |||||||| || |||||   ||  ||||| |||||||||||||||||     
T  41350437 caaaccgttctcgaacttgatacatctcgagaactcagaattctcagcagtatagtgcgggtagaacttcgacagctccacgaacttggcagcatactct 41350338  T
Q  407 gtcacggac 415  Q
    |||||||||    
T  41350337 gtcacggac 41350329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 19 - 415
Target Start/End: Original strand, 211 - 607
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  211 atccccaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctctgcaggagcatccttcttctttggccgtctatcttcgacc 310  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  311 atcctctgttttcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggagactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttgg 410  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  411 tatcttcctcatagatcctgcaactgctcaccagctcggagaaaacttggatcttctggtaaccaattgccctcgtaatctcagcacacaaaccgttctc 510  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  511 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaaatttaccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 19 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 10864 - 10468
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10864 atccctaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggccgtctgtcttcgacc 10765  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10764 atcctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactcttttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgaatcttgg 10665  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  10664 tatcctcctcatagatcttgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttctggtaaccaattgccatcttaatctcagcacgtaacccgttctc 10565  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10564 aaatttgatgcactttgaaaactcagaagtctctggagtgtagtgcggataaaactttgccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 10468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 19 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17333 - 16944
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17333 atccccaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgacc 17234  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17233 atcctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaataagtcttgg 17134  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||    
T  17133 tatcctcctcatagatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaatcaattgccctcttaatctcaagacgtaacccgttctc 17034  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagt 408  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17033 aaatttgatgcactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaactttgccaattccacaaacttggcagcattctcagt 16944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 40387 - 40449
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatc 90  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| ||||| | |||||||||    
T  40387 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttataacagactatctcagcaggagcatc 40449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 362 - 5
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  362 atcccaaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgacc 263  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  262 atcctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactcttctgacccttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttag 163  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  162 tatcctcatcataaatcctgcaactgctcaccatctcaaagaaaactcgaatcttctggtaaccaattgccctcttaaactcagcacgcaaaccgttctc 63  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttt 376  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  62 aaatttgatacactttgaaaaatcagcagtctctggagtatagtgcggataaaacttt 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 8731 - 9123
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8731 atccctaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctcagtaggagtatccttcttcttaggtcgtctatcttcgacc 8830  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8831 atcctctgttttcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttgg 8930  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8931 tatccttctcatagatcctgcaactactcaccagctcggagaaaactcggatcttttggtaaccaattgccctcttaatctcagcacgtaacccgttctc 9030  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9031 aaatttgatgcactttgaaaactcaggagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatacttagtcac 9123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 415
Target Start/End: Original strand, 15231 - 15627
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15231 atccctaggacaagcattacccttgtggcccttctcaccacaagaaaaaaaaacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgacc 15330  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15331 atcctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttgg 15430  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15431 tatcctcctcatagatcctgcaactgctcaccagctcggagaaaactcggatcttctagtaaccaattgccctcttaatctcagcacgtaacccgttctc 15530  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15531 aaatttgatgcactttgaaaactcaacagtctctggagtgtagtgcggataaaactttaccaattccacaagtttggcagcatactcagtcacggac 15627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 348
Target Start/End: Original strand, 5 - 226
Alignment:
Q  127 tttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || | ||||||    
T  5 tttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggtgactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctgatgtcctcc 104  T
Q  227 tcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttga 326  Q
    || || || || || ||  ||||||  || |  |||||| |||||| ||||||  | || ||||||||||| ||||  | |||||| ||||| || ||||    
T  105 tcatagattcttcagctattcaccaaatctgcaaaaactgggatctgttggtattcgatcgctctcttaatgtcaggcctcaaaccattctcgaacttga 204  T
Q  327 tacactttgaaaactcagcagt 348  Q
    | || || || |||||||||||    
T  205 tgcatttcgagaactcagcagt 226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 22 - 411
Target Start/End: Original strand, 25429646 - 25430035
Alignment:
Q  22 cccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccatt 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||     
T  25429646 cccaggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagtatccttcttcttaggccgcctatcttcaaccatc 25429745  T
Q  122 ctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtat 221  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25429746 ctctatttgcccttattagcaggggcactgtaaggcttaaggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtat 25429845  T
Q  222 cctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaa 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  25429846 cctcctcataaatcctgcaactgctcaccagctcagaaaatacacggatcttctggtaaccaattggtctctttatcttagcacgtaaaccgttctcgaa 25429945  T
Q  322 tttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25429946 tttgatacacttcgaaaacccagcagtctctggagtgtaatgcagataaaactttgtcaattccacaaacttggtagcatactctgtcac 25430035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 26 - 415
Target Start/End: Original strand, 21883005 - 21883396
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || | |||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  21883005 ggacaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcagaaacatctttcttcctcggccgtctatcctcgaccattctct 21883104  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagc--cttggtatcc 223  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  21883105 gtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagcctcttagtatcc 21883204  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| |    
T  21883205 tcctcatagatcctacaaccgctcaccagctcagcgaaaactctgatcttctggtaaccaattgccctcttgatctcagcacgtaacccattctcaaact 21883304  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21883305 tgatgcactttgagaactcagcagcctcaggggtgtagtgcgggcaaaactttgccaactccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 21883396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 23526280 - 23526666
Alignment:
Q  25 aggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| |||    
T  23526280 aggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctc 23526379  T
Q  125 tctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcct 224  Q
    | ||||||||| |||||| | ||||| ||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  23526380 tatttgcccttgtcagcaagagcactatagggcttagtgcgactctgctggcccttagtcttccactcattcacaatcttgtaatgagcctttgtgtcct 23526479  T
Q  225 cctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaattt 324  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||    
T  23526480 cctcataaatcctgcaactgttcaccaactcggagaaaactcggatctgttggtatccaattgctctcttgatctcagcccgcaatccattctcgaactt 23526579  T
Q  325 gatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||| || ||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23526580 gatacactttgaaaagttggtagtctctgcagcgtaatgcggatagaactttgccaactccacaaacttggtagcatactcagtcac 23526666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Original strand, 20803825 - 20804216
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  20803825 cagggcaaacatttctcttgtggcctttctcaccataattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 20803924  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||| || || |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20803925 ctatttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggagactttgttggcccttagtcttctgctcatccacaaccttgtaatgagccttggtatcc 20804024  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    ||||| || || ||||| ||  | |||| |||||  ||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||| || |    
T  20804025 tcctcatagattctgcagctatttaccaactcaggaaaaactcggatctgttggtatctgattgccctcttaatatcaggccgcaaaccattctcgaact 20804124  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20804125 tgatacattttgagaactcagcagtctcagcagcatagtgcggatagaactttgccaactcaacaaacttggcagcatactcagtcacggac 20804216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 18782342 - 18782729
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||    
T  18782342 caggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttagaccacctatcatcgaccattct 18782441  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||     
T  18782442 ctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgttggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaattagccttagtatct 18782541  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    |||||||| || ||||| ||  |||| |  | || |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||| ||||| || |    
T  18782542 tcctcgtagattctgcagctattcactaaattagggaaaactcggatctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaact 18782641  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || || || |||||||| ||||| | ||  ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18782642 tgatgcatttcgagaactcagcggtctcagcagcatagtgcggatagaactttgccaactccacaaatttggcagcatactctgtcac 18782729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 131 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21332040 - 21331760
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||| ||    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21332040 cccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgcctttcctctcattcacaatcctgtaatgagccttagtatcctcctcat 21331941  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21331940 aaatcctgcaactgctcaccagctcagaaaaattacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgatctcagcacgcaagccattctcaaatttgataca 21331841  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     |||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||  | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21331840 ttttgaaaactcagcagtctcagcagggtaatgcggataaaacttaactagttccacaaacttgacagcatattcagtcac 21331760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 23461201 - 23461400
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  23461201 ggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaatttccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctct 23461300  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  23461301 attttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctc 23461400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 84 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23537313 - 23536986
Alignment:
Q  84 gagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagt 183  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  23537313 gagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcaggaggggcactatagggcatagggcgactctgctggcccttagt 23537214  T
Q  184 cttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaacca 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||  ||||  ||||||| ||||| |||||| ||     
T  23537213 cttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcagatctgttggtatccg 23537114  T
Q  284 attgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaatt 383  Q
    || || |||||||| ||    | |||||| ||||| || ||||| || || || |||| |||| |||  | ||  ||||||||||| || ||| |||| |    
T  23537113 atcgccctcttaatgtcgtgcctcaaaccattctcgaacttgatgcatttcgagaactaagcaatcttagcagcatagtgcggatagaaatttgccaact 23537014  T
Q  384 ccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23537013 acacaaacttggcagcatactcggtcac 23536986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26735888 - 26735566
Alignment:
Q  22 cccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccatt 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | || ||||||||   ||||||||| |||||  |||||   || || ||    | |    
T  26735888 cccaggacaagcattactcttatggcctttctcacaacaagtgtagcaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcatcattaact 26735789  T
Q  122 ctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtat 221  Q
    || | ||| || ||||||| ||| ||||||||| | || || |||||||||||||| ||    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26735788 ctttgttttcctttatcagtaggagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgactttccgctcatttacaatcttgtaatgagccttagtat 26735689  T
Q  222 cctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaa 321  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26735688 cctcctcataaattctgcaactgctcaccagctcagaaaagacacggatcttctagtaacaaattgcccgctttatctcagcacgcaaaccattctcaaa 26735589  T
Q  322 tttgatacactttgaaaactcag 344  Q
    |||||| || |||||||||||||    
T  26735588 tttgatgcattttgaaaactcag 26735566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 131 - 411
Target Start/End: Original strand, 23474529 - 23474809
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | || || ||||| |||||||||||    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  23474529 cccttatcagcaggagcaatgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcat 23474628  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
      || ||||| |||||||||| |||||| ||    |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||| || | |||||||||||| ||    
T  23474629 gtattctgcagctgctcaccaactcagaaaagttacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgatctcagcaggcaagccatcctcaaatttgatgca 23474728  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  23474729 cttggagaactcagcagtctcggtagtgtagtgcggataaaacttagccaactctacaaactttgcagcatactcagtcac 23474809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21631562 - 21631170
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | || |||| ||| | || || ||| |||||  |||||   ||  | ||   |    
T  21631562 atccccagtacaagcattactcgtgtggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaacctcagcagtagtatctttctttctaggcctcctcacatcattc 21631463  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    |  || | ||| |||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| ||||||| | ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  21631462 accctttgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgactcctacccttcctctcattcacaaccttgtaatgagctttcg 21631363  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||| | ||    |||||||| || || ||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||||    
T  21631362 tatcttcctcatagattctgcaactgctcaccagttcataaaatttacggatcttctgatatccaatggcctgcttgatctcagcacgcaagccattctc 21631263  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  21631262 aaatttgatgcacttggagaactcagcagtctcagtagtgtagtgcgaataaaacttagccaggtccacaaactttgcagcatgctcggtcac 21631170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Original strand, 40712008 - 40712396
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  |    
T  40712008 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 40712104  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || || ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  40712105 ctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcc 40712204  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    ||||| || |||||||| ||| | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || |    
T  40712205 tcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaact 40712304  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| ||  | || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40712305 tgatgcatctcgagaactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 40712396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22330028 - 22329661
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  22330028 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 22329932  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  22329931 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 22329832  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  || |  |||||||  | || |||||| |||||||| ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  22329831 gctattgaccaaatctggaaaaactctcagctgttggtacccaattgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 22329732  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||| || ||||||  || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22329731 tcagcattctcagcagtatagtgcgggtagaactttgacagttccacgaacttggcagcatactctgtcac 22329661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Original strand, 16359744 - 16360118
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  16359744 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 16359840  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  16359841 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 16359940  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  16359941 gcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 16360040  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16360041 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 16360118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Original strand, 34569736 - 34570110
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  34569736 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 34569832  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  34569833 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 34569932  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  34569933 gcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 34570032  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34570033 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 34570110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 415
Target Start/End: Original strand, 27521651 - 27522022
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||| | | ||| | ||||||||  ||| ||| || || ||||    
T  27521651 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttagaccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 27521747  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||    
T  27521748 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtgtcctcttcatagatcctgca 27521847  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  |||| |||    
T  27521848 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcaactgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatcttgagaac 27521947  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27521948 tcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 27522022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 415
Target Start/End: Original strand, 19773205 - 19773576
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  19773205 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 19773301  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  19773302 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 19773401  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  19773402 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 19773501  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||| |||| | ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  19773502 tcagcattctcagcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcataatctgtcacggac 19773576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Original strand, 22137913 - 22138109
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||   |  ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| || |||||||    
T  22137913 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctc---aatagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcag 22138009  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  22138010 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcttcttcatagatcctgca 22138109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Original strand, 22351164 - 22351531
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  22351164 ttgtggcctttcccaccacagttgaaacacacaatctc---agtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcag 22351260  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||| | ||||||||||| |||||   ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  22351261 caggggcactgtacggcttatgacgactctgctgccccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgca 22351360  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  || |  |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||| ||||| ||  |||||||  | || |||    
T  22351361 gctattaaccaaatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaacatgatacatctcgagaac 22351460  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||| || |||||  |||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  22351461 tcagcattctcagcagtatagtgcgggtagaacttcgccaactcaacaaacttggcagcatactctgtcac 22351531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 29473214 - 29472847
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||    
T  29473214 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtag---catccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcag 29473118  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | ||| |||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||    
T  29473117 cggggacactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcattcgtatcctcttcatagatcctgca 29473018  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  || |  |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  29473017 gctattaaccaaatccggaaaaactcttagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 29472918  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||| || ||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  29472917 tcagcattctcagcagtatagtgcgggtagaactttgacagctccacgaacttggcagcatactctgtcac 29472847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37288637 - 37288270
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||    
T  37288637 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtag---catccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcag 37288541  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | || ||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || || |||||    
T  37288540 cgggagcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagattctgca 37288441  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  ||    |||||||  |  | |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  37288440 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagttgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 37288341  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||| |||| | |||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37288340 tcagcattctcagcagtgtagtgcgggtagaactttgacagctccacaaacttggcagcatactctgtcac 37288270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 405
Target Start/End: Original strand, 21410524 - 21410741
Alignment:
Q  186 tccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaat 285  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||| |||| | ||   ||||||||| ||||| |||||    
T  21410524 tccgctcattcataatcttataatgagctttggtgtcatcttcataaattctgcagctactcaccaactcaaaaaactgtcggatcttctggtacccaat 21410623  T
Q  286 tgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattcc 385  Q
    ||||| ||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||  ||| || ||| ||||||| | | | ||||| |||||||||||| |||| ||     
T  21410624 tgctcgcttaatctcagcacgaaagccattctggaatttgatacac--tgagaattcaacagtctcagcattatagtgtggataaaactttgccaactca 21410721  T
Q  386 acaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  21410722 acaaacttagcagcatactc 21410741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27682541 - 27682347
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||  | ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  27682541 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggacgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 27682445  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctg 238  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||| | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  27682444 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctg 27682347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 372
Target Start/End: Original strand, 43122826 - 43123025
Alignment:
Q  173 tgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatct 272  Q
    ||||||||  || |||||||||||  || ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||  ||  ||||    
T  43122826 tgacccttgttcctccgctcattcctaaccttatagtgagctttcgtatcctcctcgtaaatcctacagctgctcaccaattcagaaaaatttcttatct 43122925  T
Q  273 tttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaa 372  Q
    ||||||| ||||| || | |||||| |||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  43122926 tttggtacccaatggcccgcttaatatcagcacgcagaccattttcaaacttaatacactttgagaactcagcagtctcagcggtataatgcggataaaa 43123025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 376
Target Start/End: Original strand, 20824841 - 20825015
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||||| || |||||| || || ||||| ||||||||||| |||    
T  20824841 cttgtaatgagtcttcgtatcctcctcgtaaattctgcagctactcaccaattctgagaaaattctgatcttctgatacccaatggctctcttaatatca 20824940  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttt 376  Q
    || |  ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||    
T  20824941 gcccttaaaccattctcaaacttgatgcatttggagaactcagctgtctccgcagtgtagtgagggtaaaacttt 20825015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Original strand, 41774087 - 41774283
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||   || ||||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  41774087 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---agcagcattcttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 41774183  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  41774184 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgca 41774283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14996880 - 14996513
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||  | ||| | || |||||  ||| ||| || |||||||    
T  14996880 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcaaccatcttctgtttccctttatcag 14996784  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||| | ||||||||| | || ||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  14996783 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactacctcgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 14996684  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  || |  |||||||  | || ||| || ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  14996683 gctattaaccaagtctggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 14996584  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||| || ||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14996583 tcagcattctcagcagtatagtgcgggtagaactttgacagctccacgaacttggcagcatactctgtcac 14996513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 305 - 412
Target Start/End: Original strand, 23461413 - 23461520
Alignment:
Q  305 cgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatact 404  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23461413 cgcaaaccattctcgaacttgatgcactttgagaactcagcagtctcagcagcatagtgcggatagaactttgccaactccacaaacgtggcagcatact 23461512  T
Q  405 cagtcacg 412  Q
    ||||||||    
T  23461513 cagtcacg 23461520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23078059 - 23077682
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| | |||||||||  || |||| |||   ||||| ||   |||  |||      
T  23078059 acaagcattgcttttgtggcctttttcaccacacttgaaacatacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcttctgc 23077960  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||  | ||| |||| |||  | |||||||||||| ||||| || ||||    
T  23077959 ttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcattaccttgtaatgagctttggtgtcttcct 23077860  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || |||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| | ||  || |||||||| || ||    
T  23077859 catatatcctgcagctgcttaccaactcagagaaaattctaatcttctgatacccaatagctcttttgatatcagccctcagtccattctcaaacttaat 23077760  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||||| || |||||||| ||||| | | |||| || || || |||||  | | |||||| ||||| |||||||||||    
T  23077759 acacttggagaactcagctgtctccgcactgtaatgggggtagaacttagcaagttccacgaacttagcagcatactc 23077682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 240
Target Start/End: Original strand, 27613593 - 27613797
Alignment:
Q  33 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcc 132  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||| ||||||||||| ||||  | |||||||   ||| ||| ||    
T  27613593 cattgctcttgtggcccttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccctcttcttaggccgtctcacatcgaccaccttctgtttccc 27613689  T
Q  133 cttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaa 232  Q
     ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||     
T  27613690 tttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtag 27613789  T
Q  233 atcctgca 240  Q
    || |||||    
T  27613790 attctgca 27613797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 206 - 405
Target Start/End: Original strand, 22465342 - 22465541
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||  |  ||||||| |  |||||| || || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  22465342 taatgagcctttgtatcctcctcataaattctacagctactcaccaattatgagaaaattatgatcttctgatatccaatggctctcttgatgtcagctc 22465441  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     |||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| | | ||||   |||||||||||||||||    
T  22465442 tcaaaccattttcaaatttaatacatttggagaactcagctgtctccgcagtgtagtgaggataaaactttgcaagttccgtgaacttggcagcatactc 22465541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 351
Target Start/End: Original strand, 25851395 - 25851609
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  25851395 tcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattc 25851494  T
Q  237 tgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttga 336  Q
    |||| ||  | |||| |||||||||||||| |||||  || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  25851495 tgcacctattaaccaactcagagaaaactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcagccctcaacccattctcaaacttgatacacttgga 25851594  T
Q  337 aaactcagcagtctc 351  Q
     |||||||| |||||    
T  25851595 gaactcagctgtctc 25851609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16258045 - 16257813
Alignment:
Q  173 tgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatct 272  Q
    ||||||||  || |||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  |||||| ||| || || |||| |||||    
T  16258045 tgacccttgttcctccgctcattcctaatcttatagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatct 16257946  T
Q  273 tttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaa 372  Q
      || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||| | |||| || || || ||    
T  16257945 gctgatacccaatagctctcttaatgtcagctctcaagccattctcaaacttaatgcacttggagaactccgctgtctctgcactgtaatgagggtagaa 16257846  T
Q  373 cttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||  | | |||||||||||| |||||||||||    
T  16257845 cttagcaagttccacaaacttagcagcatactc 16257813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21560939 - 21560799
Alignment:
Q  268 gatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcgga 367  Q
    ||||||||| |||||||| || | |||||| |||||||||| ||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| | |||||| || |||    
T  21560939 gatcttttgataaccaatggcccgcttaatatcagcacgcagaccattctcaaactttatgcacttggagaactcagcagtctcggcagtgtaatgtgga 21560840  T
Q  368 taaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagt 408  Q
    ||||| ||  | |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21560839 taaaatttagcaagatccacaaactttgcagcatactcagt 21560799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22591764 - 22591532
Alignment:
Q  173 tgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatct 272  Q
    ||||||||  || |||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  |||||| ||| || || |||| |||||    
T  22591764 tgacccttgttcctccgctcattcctaatcttatagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatct 22591665  T
Q  273 tttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaa 372  Q
      || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||| | |||| || || || ||    
T  22591664 gctgatacccaatagctctcttaatgtcagctctcaagccattctcaaacttaatgcacttggagaactccgctgtctctgcactgtaatgagggtagaa 22591565  T
Q  373 cttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||  | | |||||||||||| |||||||||||    
T  22591564 cttagcaagttccacaaacttagcagcatactc 22591532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22595319 - 22595087
Alignment:
Q  173 tgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatct 272  Q
    ||||||||  || |||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  |||||| ||| || || |||| |||||    
T  22595319 tgacccttgttcctccgctcattcctaatcttatagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatct 22595220  T
Q  273 tttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaa 372  Q
      || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||| | |||| || || || ||    
T  22595219 gctgatacccaatagctctcttaatgtcagctctcaagccattctcaaacttaatgcacttggagaactccgctgtctctgcactgtaatgagggtagaa 22595120  T
Q  373 cttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||  | | |||||||||||| |||||||||||    
T  22595119 cttagcaagttccacaaacttagcagcatactc 22595087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 372
Target Start/End: Original strand, 23670027 - 23670190
Alignment:
Q  209 tgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgca 308  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||  ||  ||||||||||| || || || | |||||| ||||||||||    
T  23670027 tgagctttcgtatcctcctcgtaaatcctacagctgctcaccaattcagaaaaatttcttatcttttggtacccgatggcccgcttaatatcagcacgca 23670126  T
Q  309 aaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaa 372  Q
     ||| || ||||| || |||||| |||| |||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  23670127 gaccattttcaaacttaatacaccttgagaactcagcagtctcagcggtataatgcggataaaa 23670190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 27665603 - 27665276
Alignment:
Q  85 agcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtc 184  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |    
T  27665603 agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 27665504  T
Q  185 ttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaa 284  Q
    ||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || ||| || ||||    
T  27665503 ttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttgatacccaa 27665404  T
Q  285 ttgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattc 384  Q
    | || ||||| || || |  |  |||||||||||||| ||||| ||  | || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||    
T  27665403 tcgccctcttgatgtcgggccttaaaccgttctcaaacttgatgcatctcgagaactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctc 27665304  T
Q  385 cacaaacttggcagcatactcagtcacg 412  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27665303 cacgaacttggcagcatactctgtcacg 27665276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Original strand, 22505893 - 22506216
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||| | |||||||||  || ||||||||   ||||| ||   |||  |||      
T  22505893 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgc 22505992  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||  | ||| |||| |||  ||||| |||||||| ||||| || || |    
T  22505993 tttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttataatgagctttggtgtcttctt 22506092  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | ||||| ||||| ||| | |||| ||||||||| |||| ||| |  || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  22506093 cataaattctgcacctgttaaccaactcagagaagactctgatttgctgatatccaatagctcttttgatgtcagccctcaacccattctcaaatttgat 22506192  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
     ||| | || |||||||| |||||    
T  22506193 gcacctggagaactcagctgtctc 22506216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Original strand, 20345496 - 20345818
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||  |  |||| |||||||| | |||||||||  || |||| |||   ||||| ||  ||||  |||      
T  20345496 acaaacattactcttgtgggctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgc 20345595  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||| ||| ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  20345596 tttcctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgattctactgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcct 20345695  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | ||||| ||||| ||  | |||| |||||| || |||| |||||  || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  20345696 cataaattctgcacctattaaccaactcagaaaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcagccctcaacccattctcaaatttgat 20345795  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtct 350  Q
     ||||| || |||||||| ||||    
T  20345796 gcacttggagaactcagctgtct 20345818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21983173 - 21983008
Alignment:
Q  186 tccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaat 285  Q
    |||||||| ||| || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |  ||||| ||   || ||||||||| ||||||||    
T  21983173 tccgctcactcataaacttataatgagctttcgtatcctcctcataaattctacagctgctcacaaattcagaaaattttctgatcttttgataaccaat 21983074  T
Q  286 tgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
      | | |||||| |||||||||| ||| |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||    
T  21983073 gtcccgcttaatatcagcacgcagaccattctcaaagtttatgcacttggagaactcagcagtctc 21983008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 28891922 - 28891719
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||  || ||||||| || |||||| || || || || ||||| || || |||    
T  28891922 cttgtaatgagccttcgtatcctcctcataaattctgcagcaactcaccaattctgagaaaattctgatcttctgatatcctatggctcttttgatatca 28891823  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | |||||| || || || ||||| || || || |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||| | | ||||   |||||||| ||||    
T  28891822 gccctcaaaccattttcgaacttgatgcatttggagaactcagctgtctccgcagtgtagtgagggtaaaactttgcaagttccgtgaacttggctgcat 28891723  T
Q  402 actc 405  Q
    ||||    
T  28891722 actc 28891719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14884140 - 14883822
Alignment:
Q  33 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||| |  ||||||||  || |||| |||   ||||| ||  |||| ||||  || ||    
T  14884140 cattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagctggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcc 14884041  T
Q  133 cttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaa 232  Q
     || |||| ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||||  | ||| |||| ||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||     
T  14884040 tttgtcagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatag 14883941  T
Q  233 atcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacact 332  Q
    || ||||| ||  | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| || || || || ||||| | ||| || |||||||| ||||||||||    
T  14883940 attctgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagcccttttgatgtcagccctcaacccattctcaaacttgatacact 14883841  T
Q  333 ttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    | || |||||||| |||||    
T  14883840 tggagaactcagctgtctc 14883822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 63
Target Start/End: Original strand, 23474420 - 23474461
Alignment:
Q  22 cccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagt 63  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23474420 cccaggacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagt 23474461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Original strand, 25851286 - 25851318
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25851286 acaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 25851318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 11583 - 11975
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11583 atccccaagacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcatgagcatccttcttcttaggccgcctatcttcgacc 11682  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11683 attctctgtttgcccttatcagtaggagcactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgaaatgagccttgg 11782  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  11783 tatcctcctcataaattctgcaactgctcaccagctcagaaaagacacggatcttctggtaaccaatcgctctcttgttttcagcacgtaaaccgttctc 11882  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     |||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11883 gaatttgaagcattttgaaaactcatcagtctctggagtgtagtgcggataaaactttgccaattccacagacttggcagcatactcagtcac 11975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 14404 - 14796
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||    
T  14404 atccccaagacaagcattactcttatggcctttctcgccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcattgacc 14503  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14504 attctctgtttgcccttatcagcagaggcactataaggcttagggcgactctgttgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttag 14603  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  14604 tatcctcctaatatattctgcaactgctcaccagctcagagaacacacagatcttctggtaaccaattgctctcttgatttcagcacgtaaaccgttctc 14703  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     |||||||| || || |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14704 gaatttgatgcatttcgaaaactctgcagtcttaggagtgtagtgcgggtaaaactttgccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 14796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 71 - 412
Target Start/End: Original strand, 6872 - 7213
Alignment:
Q  71 acaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactct 170  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6872 acaatctctccaggagcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccatcctctgtttgcacttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactct 6971  T
Q  171 gctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggat 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6972 gctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcgtagatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcgaat 7071  T
Q  271 cttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataa 370  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  7072 cttctggtaatcaattgccctcttaatctcatcatgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcaggagtctctggagtgtagtgtggatat 7171  T
Q  371 aacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacg 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7172 aactttgccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacg 7213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Original strand, 1352 - 1410
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatct 77  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1352 atccccaggataagcattactcttgtgacctttctcaccacacgtaaaacagacaatct 1410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 38 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7622 - 7250
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7622 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccattctctgtttgcccttat 7523  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7522 cagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgctggcctttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcttcctcataaatcct 7423  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||    
T  7422 gcaactgttcaccaactcggagaaaactcggatctgttggtaaccaattgccctcttgatctcagcacgtaacccgttctcgaacttgatacacttcgaa 7323  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtca 410  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7322 aactcagcagtctctagagtgtaatgcggataaaaccttgccaattccacaaacttggcagcatactcagtca 7250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 50322 - 49937
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  50322 ggacaagcattgcttttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctct 50223  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50222 gtttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggagactctgctagcccatagccttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctc 50123  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  50122 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccaactcggagaaaactcggatcttttggtaaccaattgccctcttgatctcagcacgtaacccgttctcaaactta 50023  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50022 atacactttgaaaactcagcagtctcgcgggtgtagtgcggataaaactttgccaactccacaaacttggcagcatactcagtcac 49937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 19 - 415
Target Start/End: Original strand, 9267 - 9663
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9267 atccccaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctttgcaggagcatccttcttcttaggttatctatcttcgacc 9366  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  9367 atcctctgtttgcccttatcaccaggggcactataaggattagcgcgactctgttgacccttagctttccgctccttcacaatctagtaatgagtcttgg 9466  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  9467 tatcctcctcatagatcctataactgctcaccagctcggagaaatctcagatcttctggtaaccaattgccttcttaatctcagcacgtaacccgttctc 9566  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9567 aaatttgatgcattttgaaaactcagcagtctctagagtgtagtgcggataaaactttgccaattctacaaacttggcagcatactcagtcatggac 9663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 8543 - 8935
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||    
T  8543 atccctaggacaagcattactcttgtggcctttctgaccacaagtaaagcagacaatctttgcaggagcatccttcttcttaggccgcctattatcgacc 8642  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8643 attctctgtttgcccttatcggcaagagcactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttag 8742  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  8743 tatcctcctcataaattctgcaactactcaccagctcagaaaagacacggatcttctggtaaccaattgctctctttatctcagcacacaatccgttctc 8842  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8843 gaatttgatacacttcgaaaactcagcagtctctgcagaataatgcggataaaactttgccaactccacaaacttggcagcatactctgtcac 8935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 24696 - 24314
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||              |||||    
T  24696 atccccaggacaagaattacttttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctctgtaggagcatccttcttctt--------------cgacc 24611  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |    
T  24610 atcctctgtttacccttatcagcaggggcactataaggtttagggcgactctattgatccttagtcttccgctcattcacgatcttgtaataatccttag 24511  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24510 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcggagaaaactcggatcttctggtaaccaattgccctcttaatctcagcacgtaacccgttctc 24411  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24410 aaatttgatgcactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaactttgccaattccacaaacttagcagcatactcagtcacggac 24314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18405070 - 18404670
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  18405070 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtgaaacagacaatctttgcaggagcatccttcttgttaggccgcctatcttcgacc 18404971  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggca----ctgtaaag----attagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatg 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||    ||||        ||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  18404970 attctctgtttgcccttatcagcaggaccattctctgtttgcccttattagggcgactctgttgacctttagcctttcactcattcacaatcttgtaatg 18404871  T
Q  211 agccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaa 310  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18404870 agtcttggtatcctcctcataaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttctggtaaccaattgctctctttatctcagcacgcaaa 18404771  T
Q  311 ccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtca 410  Q
    | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |  || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18404770 cggttctcaaatttgatacacttcaaaaactcagcagtctctgcagtgtaatctgggtaaaactttgccaactccacaaacttggcagcatactcagtca 18404671  T
Q  411 c 411  Q
    |    
T  18404670 c 18404670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 26 - 415
Target Start/End: Original strand, 22437031 - 22437420
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  22437031 ggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctct 22437130  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     |||| |||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22437131 atttggccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtctttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 22437230  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
     || ||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  22437231 ttcataaatcctgcaactgttcacaaactaggagaaaactcgaatctgttggtaccaaattgccctcttaatctcagcacgtaacccgttctcaaacttg 22437330  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22437331 atgcactttgaaaactcagcagtctcgggggtgtagtgcggataaaactttgccaattccacaaacttggcagcatactcagtcatggac 22437420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 415
Target Start/End: Original strand, 21764974 - 21765363
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  21764974 ggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctct 21765073  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  21765074 aattgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctcagtgttccactcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctc 21765173  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||| || ||  | || ||| ||||||  ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||| || ||     
T  21765174 ctcatagattttacagctgttcaccaaatcagcaaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctttatatcaggccgcaaaccattctcgaacttt 21765273  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21765274 atgcactttgagaactcaacagtctctacagcgtagtgcggataaaactttgccaactctacaaacttggcagcatactcagtcacggac 21765363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 411
Target Start/End: Original strand, 23081579 - 23081970
Alignment:
Q  20 tccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||||||||| |||||| ||||| | || || ||    |    
T  23081579 tccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtataacaaacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcattaa 23081678  T
Q  120 ttctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggt 219  Q
     ||| |  || || ||||||||||  ||||||||| | || || |||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23081679 ctctttgctttcctttatcagcagcagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagt 23081778  T
Q  220 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctca 319  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||    || ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||      
T  23081779 atcctcctcataaattctgcaactgctcactagctcagaaaaggtacgaatcttctggtaaccaattgcccgcttgatctcagcacgcaaaccattctag 23081878  T
Q  320 aatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23081879 aatttaatacacttagaaaactcagtagtctcagcagtgtagtgcggataaaacttagccaattccacaaatttggcagcatactcagtcac 23081970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27559090 - 27558703
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||| | |||| ||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| ||    
T  27559090 caggacaaacagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagcaggaacatgctttttcttaggccgtctttcctcgaccatcct 27558991  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||    
T  27558990 ctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcc 27558891  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    ||||| ||||| ||||| ||  || |||  || |  ||||||||||| | |||||| || || || |||||||| ||||  | |||||| |||||||| |    
T  27558890 tcctcataaattctgcagctattctccaaatctggaaaaactcggatttgttggtatccgatcgccctcttaatgtcaggcctcaaaccattctcaaact 27558791  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || || || |||||||||||||| | ||| || || || || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27558790 tgatgcatttcgagaactcagcagtctcagcagtataatgtgggtagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactcggtcac 27558703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 25756720 - 25756355
Alignment:
Q  40 cttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatca 139  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25756720 cttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatca 25756621  T
Q  140 gcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgc 239  Q
     |  ||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||   ||| |||||||| || |||||||    
T  25756620 actagggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccggtcattaaccaccttgtaatgagctcgggtgtcctcctcatagatcctgc 25756521  T
Q  240 aactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaa 339  Q
    | ||  |||| |  ||    |||||| ||| || |||||| || || || |||||||| || |  | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||    
T  25756520 agctattcactaaatcctgaaaaacttggacctgttggtatcctatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccattctcgaacttgatgcattttgagaa 25756421  T
Q  340 ctcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25756420 ctcagcagtctcagcggtgtagtgtggatagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactc 25756355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 5836347 - 5835964
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| |||| || | |||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||    
T  5836347 ggacaaacattgctttcgtggcctttcccaccacagttgaaacacacaatctc---agcagcatccttcttcttgggtcgcctatcatcgaccatcctct 5836251  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     ||| || ||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| || |||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  5836250 gtttccctttatcagcaggggcactatacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttccgctcattcacagtcttgtagtgagctttggtatcctc 5836151  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
     |||||||||||||| ||  | ||||  || |  |||||||  |||| |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||| ||||| || |||    
T  5836150 ttcgtaaatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctaatctattggtacccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccattctcgaacttg 5836051  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacg 412  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| | ||  || ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5836050 atacattttgaaaactcggcagtctcagcagcataatgcgggtaaaactttgccaactcaacaaacttggcagcatactcagtcacg 5835964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18182401 - 18182121
Alignment:
Q  132 ccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgta 231  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||||  ||||||||||||| |||   |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||    
T  18182401 ccttatcagcaggagcacggtaaggcttaggatgactctgctgacctttacctttcctctcattcacaaccttctaatgagccttagtatccgcctcata 18182302  T
Q  232 aatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaact-cggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18182301 aattctgcaactgctcaccagctcagcaaaagttacggattttctggtaaccaattgccctcttgatatcagcacgcaaaccattctcaaatttgatgca 18182202  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||| |  |||||||||| ||| | ||| || || |||||||| ||  |||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18182201 cttggggaactcagcagactcagcagtataatgtggataaaatttagccagctccacaaacttagcagcatactcagtcac 18182121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 19867855 - 19868029
Alignment:
Q  63 taaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagg 162  Q
    |||| |||||||| || | |||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| | |||||    
T  19867855 taaagcagacaatatcagcaggaacatctttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggctctataaggcttagg 19867954  T
Q  163 gcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19867955 gcgactctgctggcccttagtctgccactcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 19868029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 277 - 411
Target Start/End: Original strand, 19868031 - 19868165
Alignment:
Q  277 gtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttt 376  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  19868031 gtaaccaattgccctcttgatctcagcacgtaacccgttctcaaacttgatgcactttgaaaactcagcagtctcgggggtgtagtgcggataaaacttc 19868130  T
Q  377 tccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19868131 gccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 19868165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Original strand, 25115729 - 25115925
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || |||||||    
T  25115729 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctc---agtagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcag 25115825  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  25115826 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgca 25115925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 194 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 25958704 - 25958483
Alignment:
Q  194 ttcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctct 293  Q
    ||||| |||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| || | ||    
T  25958704 ttcactatcttgtagtgagctctagtatcctcctcataaatcctgcaactgctcaccagctcagaaaagacacggatcatctggtaaccaatggccccct 25958605  T
Q  294 taatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaactt 393  Q
    | || || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||| |||||||||   |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  25958604 tgatatcggcacgcaaaccattctcgaacttgatgcacttggagaacttagcagtctcaacagtgtaatgcggataaaacttagccaactccacaaactt 25958505  T
Q  394 ggcagcatactcagtcacggac 415  Q
     ||||||||| | |||||||||    
T  25958504 cgcagcatacgcggtcacggac 25958483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 411
Target Start/End: Original strand, 18660186 - 18660466
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| ||||||| ||||   |||| |||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||| |    
T  18660186 cccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgactcttacctttcctctcactcacagccttgtaatgagctttcgtatcctcctcat 18660285  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| ||    |||||||| |  || |||||  | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  |    
T  18660286 agattctgcaactgctcaccagttcagaaaagttacggatcttctaatatccaatgaccctcttgatctcagcacgcaagccattctcaaatttgatgta 18660385  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||| || |||||||| |||||    
T  18660386 cttggagaactcagcagtctcagcagtgtagtgcggataaaacttagccagctctacaaactttgccgcatactcggtcac 18660466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22829507 - 22829123
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||  |||| || |||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  22829507 caggacagacattgcttttgtggccttttccaccacaattgaaacacacaatctc---agtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 22829411  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||   ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22829410 ctatttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtatcc 22829311  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || || || |||||||| ||  | ||||  || |  |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||| ||||| || |    
T  22829310 tcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaact 22829211  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| ||  | ||  | |||||| |||| | ||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22829210 tgatgcatctcgagtaatcagcattctcagcagtatagtgcgggtaaaacttcgccaactcaacaaacttggcagcatactcagtcac 22829123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 29589546 - 29589172
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  29589546 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 29589450  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||  |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  29589449 cagtgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 29589350  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  29589349 gcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 29589250  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29589249 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 29589172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2871906 - 2871710
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  2871906 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 2871810  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  2871809 caggggcactgtacagcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctctcattcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgca 2871710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Original strand, 16575050 - 16575438
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  |    
T  16575050 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 16575146  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || || ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  16575147 ctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 16575246  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || ||||| |||||||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || |    
T  16575247 tcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaact 16575346  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| ||  | || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16575347 tgatgcatctcgagaactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccatgaacttggcagcatactccgtcacggac 16575438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16620330 - 16619942
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  |    
T  16620330 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 16620234  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || || ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  16620233 ctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 16620134  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || ||||| |||||||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || |    
T  16620133 tcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaact 16620034  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| ||  | || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16620033 tgatgcatctcgagaactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccatgaacttggcagcatactccgtcacggac 16619942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Original strand, 27205796 - 27206170
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  | | ||| || ||||    
T  27205796 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttat 27205892  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    | || || ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || |||||    
T  27205893 cggcgggagcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 27205992  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||  || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||||||  ||||     
T  27205993 gcagctattaaccaagtcttgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatacatcttgag 27206092  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||| | |||| | ||| |||||||| || |||||   ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27206093 aactcagaattctcagcagtatagtgcgggtagaacttcgacagctccacaaacttggcagcatactctgtcacggac 27206170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27243432 - 27243058
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  | | ||| || ||||    
T  27243432 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttat 27243336  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    | || || ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || |||||    
T  27243335 cggcgggagcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 27243236  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||  || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||||||  ||||     
T  27243235 gcagctattaaccaagtcttgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatacatcttgag 27243136  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||| | |||| | ||| |||||||| || |||||   ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27243135 aactcagaattctcagcagtatagtgcgggtagaacttcgacagctccacaaacttggcagcatactctgtcacggac 27243058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Original strand, 28312804 - 28313178
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  28312804 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgt 28312900  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || |||||    
T  28312901 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 28313000  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||  || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||||||  | ||     
T  28313001 gcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatacatctcgag 28313100  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28313101 aactcagaattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 28313178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 268 - 411
Target Start/End: Original strand, 18326261 - 18326404
Alignment:
Q  268 gatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcgga 367  Q
    |||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||   | |||||||||||    
T  18326261 gatcttctgatatccaattgctcgcttaatctcagcacgcaagccattctcaaacttgatgcacttcgaaaatgcagcagtctcattattgtagtgcgga 18326360  T
Q  368 taaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  18326361 taaaactttaccaactccacaaacttagcagtatactctgtcac 18326404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24292889 - 24292519
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || ||||    
T  24292889 ctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacctcgaccatcttctgtttccctttat 24292793  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  24292792 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattct 24292693  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  24292692 gcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 24292593  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| |||| | ||| |||||||| || |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24292592 aactcagcattctcagcagtatagtgcgggtagaacttcgacagctccacgaacttggcagcatactctgtcac 24292519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 20010440 - 20010241
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||  || ||||||| || |||||| || || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  20010440 taatgagcctttgtatcctcctcataaattctacagctactcaccaattctgagaaaattctgatcttctgatatccaatggctctcttgatgtcagctc 20010341  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     |||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| | | ||||   |||||||||||||||||    
T  20010340 tcaaaccattttcaaatttaatacatttggagaactcagctgtctccgcagtgtagtgaggataaaactttgcaagttccgtgaacttggcagcatactc 20010241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23084942 - 23084559
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||| ||| | || || ||| |||||  ||||   ||| || ||   || ||| | |    
T  23084942 acaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtatagcaaacaacctcagcagtagtatctttctttctaggtcctctctcatcattcactctttgt 23084843  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || |||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||| | |||||   | |||   ||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||| ||||    
T  23084842 ttacccttatcaggaggagcactgtaaggcttaggacgattttgctggttcctaggtctcctctcattcacagccttgtaatgagctttagtatcttcct 23084743  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || || || |||||||||||||| ||||| |||   |||||||| |  || ||||| || |  || |||||||||| |||| | |||||||| |||||    
T  23084742 catagattctacaactgctcaccagttcagaaaaattacggatcttctaatacccaatggcccgtttgatctcagcacacaaatcattctcaaacttgat 23084643  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     ||||| || |||||||||||||| | |||| |||  |||||||||||  | |  |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23084642 gcacttggagaactcagcagtctcagcagtgcagtatggataaaacttaactagctccacaaactttccagcatactcagtcac 23084559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10465965 - 10465649
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||| | |||| ||||  || |||| |||   ||||| ||   |||| |||      
T  10465965 acaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggaacatctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgc 10465866  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || ||||| |||||| | ||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||  | ||| |||| |||  | |||||||||||| || || || ||||    
T  10465865 tttcccttgtcagcaagagcattgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcct 10465766  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| || || || || || ||||| || ||||| | |||||| || ||||| |||||    
T  10465765 catatatcctgcagctgctcaccaactcagagaaaactctaatcttctgataccctatagccctcttgatatcagccctcaaaccattttcaaacttgat 10465666  T
Q  328 acactttgaaaactcag 344  Q
    |||||| || |||||||    
T  10465665 acacttggagaactcag 10465649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 376
Target Start/End: Original strand, 15462593 - 15462848
Alignment:
Q  121 tctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggta 220  Q
    ||||| |||||| || | |||||| ||||||||  | || ||||||||   |||||||||| || ||  |||| |||  | |||||||||||| || |||    
T  15462593 tctctgtttgcctttgttagcaggagcactgtagggcttcgggcgactactctgacccttattcctcttctcactcatcaccttgtaatgagctttcgta 15462692  T
Q  221 tcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaa 320  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||| ||| |||||||  | |||||| || || ||||| |||||||| || ||||| | |||||| || ||||    
T  15462693 tcctcctcataaatcctacagctactcaccaactccgagaaaatcctgatcttctgatatccaatggctctcttgatgtcagctctcaaaccattttcaa 15462792  T
Q  321 atttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttt 376  Q
    | || ||||| || || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  15462793 acttaatacatttggagaactcagccgtctccgcagtgtagtgaggataaaacttt 15462848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28260304 - 28259934
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  28260304 ctcttgtggcctttcccaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 28260208  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  |||||  || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || |||||    
T  28260207 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgccccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 28260108  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || ||| || ||||  || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||||||  | ||     
T  28260107 gcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttgatacccaagcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatacatctcgag 28260008  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||| | |||| | ||| |||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28260007 aactcagaattctcagcagtatagtgcgggtaaaactttgacagctccacaaacttggcagcatactctgtcac 28259934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 411
Target Start/End: Original strand, 28285612 - 28285982
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  28285612 ctcttgtggcctttcccaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 28285708  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  |||||  || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || |||||    
T  28285709 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgccccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 28285808  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || ||| || ||||  || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||||||  | ||     
T  28285809 gcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttgatacccaagcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatacatctcgag 28285908  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||| | |||| | ||| |||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28285909 aactcagaattctcagcagtatagtgcgggtaaaactttgacagctccacaaacttggcagcatactctgtcac 28285982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28339053 - 28338683
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  28339053 ctcttgtggcctttcccaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 28338957  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  |||||  || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || |||||    
T  28338956 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgccccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 28338857  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || ||| || ||||  || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||||||  | ||     
T  28338856 gcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttgatacccaagcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatacatctcgag 28338757  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||| | |||| | ||| |||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28338756 aactcagaattctcagcagtatagtgcgggtaaaactttgacagctccacaaacttggcagcatactctgtcac 28338683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 405
Target Start/End: Original strand, 19456361 - 19456564
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| || | ||| ||||||  ||  |||||||| || |||||  ||||||| || |||    
T  19456361 cttgtaatgagccttagtatcctcttcatatatcctgcagctgcttactaactctgagaaatttcttatcttttgatagccaatacctctcttgatatca 19456460  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |  || ||||| || || |||||  | | |||||||||||| |||||||    
T  19456461 gccctcaaaccattctcaaacttgatacacttggagaactcagctgtctccgcggtatagtgggggtagaacttagcaagttccacaaactttgcagcat 19456560  T
Q  402 actc 405  Q
    ||||    
T  19456561 actc 19456564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 405
Target Start/End: Original strand, 19466506 - 19466709
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| || | ||| ||||||  ||  |||||||| || |||||  ||||||| || |||    
T  19466506 cttgtaatgagccttagtatcctcttcatatatcctgcagctgcttactaactctgagaaatttcttatcttttgatagccaatacctctcttgatatca 19466605  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |  || ||||| || || |||||  | | |||||||||||| |||||||    
T  19466606 gccctcaaaccattctcaaacttgatacacttggagaactcagctgtctccgcggtatagtgggggtagaacttagcaagttccacaaactttgcagcat 19466705  T
Q  402 actc 405  Q
    ||||    
T  19466706 actc 19466709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19486253 - 19486067
Alignment:
Q  186 tccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaat 285  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  ||||| ||    |  ||||| || ||||||||    
T  19486253 tccgctcactcataaccttgtaatgagctttggtatcctcttcgtagattctacaactgctcaccaattcagaaaattgcctaatcttctgataaccaat 19486154  T
Q  286 tgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaa 372  Q
     || | |||||| |||||||||| ||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| | |||||| || ||||||||    
T  19486153 ggcccgcttaatatcagcacgcagaccattctcaaactttatgcacttggagaactcagcagtctcggcagtgtaatgtggataaaa 19486067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 30678035 - 30677767
Alignment:
Q  134 ttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaa 233  Q
    ||||||||||| ||  ||||| | || || ||| ||||||||| ||||  | |||||||| ||| || |||||||| ||| |||||||| ||||| || |    
T  30678035 ttatcagcaggagcgttgtaaggctttggacgattctgctgactcttacccctccgctcactcataaccttgtaattagctttggtatcttcctcataga 30677936  T
Q  234 tcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactt 333  Q
    |||||||||||||||| |  ||||| ||    |||||||| || || ||||| || | ||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  30677935 tcctgcaactgctcactaattcagaaaattgacggatcttctgatatccaatggcccgcttgatctcagcacgcaagccattatcaaacttaatacactt 30677836  T
Q  334 tgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     || || | ||||||         |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30677835 ggagaatttagcagt---------gtagtgtggataaaacttagccaattccacaaacttagcagcatactcggtcac 30677767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 351
Target Start/End: Original strand, 25771186 - 25771331
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||| |||| |||||| |||   |  ||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||    
T  25771186 taatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacagctgcttaccaactcagaaaaattccttatcttttggtagccaatagcccgcttaatatcagcac 25771285  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  25771286 gcaaaccattttcaaacttgatgcattttgagaattcagcagtctc 25771331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Original strand, 24367564 - 24367887
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||   | |||||||  || |||| |||   ||||| ||  ||||  |||      
T  24367564 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacatgagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgc 24367663  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || |    
T  24367664 tttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttctt 24367763  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
      || || || || ||| | |||| |||| |||| |||| |||||  || || ||||| |||||||| || ||||| | ||| || |||||||| |||||    
T  24367764 gatagattctacacctgttaaccaactcatagaagactctgatctgctgatatccaatggctctcttgatgtcagccctcaacccattctcaaacttgat 24367863  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    |||||| || |||||||| |||||    
T  24367864 acacttggagaactcagctgtctc 24367887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 411
Target Start/End: Original strand, 19666937 - 19666993
Alignment:
Q  355 agtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  19666937 agtgtattgcggataaaactttgccaactctacaaatttggcagcatactctgtcac 19666993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14376859 - 14376656
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||  ||||||||   || |||||| || || |||||  ||||||| || |||    
T  14376859 cttgtaatgagctttcgtgtcctcctcatagatcctgcagctactaaccaattcagagaagtttctgatcttctgatacccaatgtctctcttgatgtca 14376760  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | ||| || |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| | ||| ||||| || || |||||  | | |||||||||||| |||||||    
T  14376759 gctctcaagccattctcaaactttatacatttggagaattcagctgtctccgcagtatagtgagggtagaacttagcaagttccacaaactttgcagcat 14376660  T
Q  402 actc 405  Q
    ||||    
T  14376659 actc 14376656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 18182514 - 18182455
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctc 78  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18182514 atcccaagtacaagcattactcttttgatctttctcaccacaagtataacaaacaatctc 18182455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 405
Target Start/End: Original strand, 19438340 - 19438543
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || ||||| |||| |||||| ||   || |||||| || || ||||| |||||||| || |||    
T  19438340 cttgtaataagccttcgtatcctcttcatagatcctacagctgcttaccaactcagaaaagtttctgatcttctgatacccaatggctctcttgatgtca 19438439  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | ||| || |||||||| || ||||| || || || ||||| || || | ||| || || || || |||||| | | |||||||||||| |||||||    
T  19438440 gctctcaagccattctcaaactttatacatttggagaattcagctgtttccgtagtataatgggggtagaactttgcaagttccacaaacttagcagcat 19438539  T
Q  402 actc 405  Q
    ||||    
T  19438540 actc 19438543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21567005 - 21566878
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||| || |||||||| |||  | |||||||||||| || | ||| ||||| |    
T  21567005 cccttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttactcctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcat 21566906  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcaga 258  Q
    | || || || ||||| |||| ||||||    
T  21566905 agattctacagctgcttaccaactcaga 21566878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 90
Target Start/End: Original strand, 21474769 - 21474826
Alignment:
Q  33 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatc 90  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| | |||||||||    
T  21474769 cattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatctcagtaggagcatc 21474826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 103
Target Start/End: Original strand, 25771014 - 25771083
Alignment:
Q  34 attactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggc 103  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||    
T  25771014 attattcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggagcatctctcctcttaggc 25771083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24515531 - 24515499
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24515531 acaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 24515499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 307 - 411
Target Start/End: Original strand, 25115995 - 25116099
Alignment:
Q  307 caaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactca 406  Q
    |||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| | ||| |||||||| || |||||  |||| || |||||||||||| |||||||     
T  25115995 caaaccattctcgaacttgatacatctcgagaactcagcattctcagcagtatagtgcgggtagaacttcgccaactcaacaaacttggcatcatactct 25116094  T
Q  407 gtcac 411  Q
    |||||    
T  25116095 gtcac 25116099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 411
Target Start/End: Original strand, 54958 - 55349
Alignment:
Q  20 tccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacca 119  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||  | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  54958 tccctaggacaaccattactcttgtggcccttctcacaataagaaaaacaaacaatcttagcaggagcatccttcttcttcggccgtctatcttcgacca 55057  T
Q  120 ttctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggt 219  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||| || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55058 tcctctgtttgctcttatcagcaggggcactataaggcttatggcgactttgttggcacttagtcttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggt 55157  T
Q  220 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  55158 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcggagaaaactaggatcttctggtaaccaattgccctcttgatctcaggacgtaacccgttctca 55257  T
Q  320 aatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55258 accttgatacacttcgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcgaataaaattttgccaattccacaaacttggcaacatactcagtcac 55349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 408
Target Start/End: Original strand, 32203 - 32588
Alignment:
Q  23 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattc 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  32203 ccaggacaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattc 32302  T
Q  123 tctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatc 222  Q
    | | |||||||||||||||| |||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32303 tttgtttgcccttatcagcaagggcgctatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatc 32402  T
Q  223 ctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaat 322  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||     
T  32403 ctcctcataaattctgcaactgttcaccaacttggagaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctttatatcagcccgcaatccattctcgaac 32502  T
Q  323 ttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagt 408  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32503 ttgatacacttcaaaaactcagcagtctctacagcgtaatgcggataaaacttttccaactctacaaacttggcagcatactcagt 32588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10218 - 9843
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |  | ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  10218 caggacaaacattactcttgtggcctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattct 10119  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  10118 ctgcttgcccttatcagcaagggcactataaggtttagggcgactctgctgacccttggtctacttctcattaacaatcttgtaatgagctctggtatcc 10019  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || || || |||||||| ||  |||| |  |||| ||||||| |||||| |||||| || || || || || || || |  | |||||| ||||| || |    
T  10018 tcttcatagatcctgcagctattcactaaatcagcgaaaacttggatctattggtatccgatcgccctgttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaact 9919  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagc 399  Q
    |||| || || || |||||||||||||| | ||  ||||  || || |||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  9918 tgatgcatttcgagaactcagcagtctcagcagcatagttggggtagaactttgccaactccacgaacttggcagc 9843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12873 - 12618
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |  | ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  12873 caggacaaacattactcttgtggcctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattct 12774  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  12773 ctgcttgcccttatcagcaagggcactataaggtttagggcgactctgctgacccttggtctacttctcattaacaatcttgtaatgagctctggtatcc 12674  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggta 279  Q
    || || || |||||||| ||  |||| |  |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  12673 tcttcatagatcctgcagctattcactaaatcagcgaaaacttggatctattggta 12618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Original strand, 37669 - 37717
Alignment:
Q  23 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacaga 71  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  37669 ccaggacaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacaga 37717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4539 - 4147
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | ||||| || |||    
T  4539 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttttcaccacaagtatagcagacaatctccacaggagcatctttcttcttaggccgcctatcatcaacc 4440  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4439 attctctgtttatccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggttttccgctcattcacaatcttgtaataagtcttgg 4340  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||     
T  4339 tatcctcctcatatatcctgcaactgctcaccagctcagaaaagacacggatcttctggtaaccaatcgctctcttgatcccagcacgtaaaccgttctt 4240  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4239 gaatttgatgcatttcgaaaactcagcagtctctgcagtgtagtgtggataaaactttgccaattccacaaacttggcagcatactctgtcac 4147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 25 - 410
Target Start/End: Original strand, 21930 - 22315
Alignment:
Q  25 aggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctc 124  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| |||    
T  21930 aggacaagcattgatcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccatcctc 22029  T
Q  125 tctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcct 224  Q
    | ||||||||||  |||||||||||| ||  | ||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22030 tgtttgcccttaaaagcaggggcactatagggcttaagacgactcagctggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcct 22129  T
Q  225 cctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaattt 324  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||    
T  22130 cctcataaatcctgcaactgttcaccaacttggagaaaactcggatctgttggtatccaattgctctcttgatctcagcccgcaatccattctcgaactt 22229  T
Q  325 gatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtca 410  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22230 gatacacttcgaaaactcagcagtctctgcagcgtaatgcagataaaactttgccaactccacaaacttggcagcatactcagtca 22315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 25 - 410
Target Start/End: Original strand, 37354 - 37739
Alignment:
Q  25 aggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctc 124  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| |||    
T  37354 aggacaagcattgatcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccatcctc 37453  T
Q  125 tctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcct 224  Q
    | ||||||||||  |||||||||||| ||  | ||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37454 tgtttgcccttaaaagcaggggcactatagggcttaagacgactcagctggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcct 37553  T
Q  225 cctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaattt 324  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||    
T  37554 cctcataaatcctgcaactgttcaccaacttggagaaaactcggatctgttggtatccaattgctctcttgatctcagcccgcaatccattctcgaactt 37653  T
Q  325 gatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtca 410  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37654 gatacacttcgaaaactcagcagtctctgcagcgtaatgcagataaaactttgccaactccacaaacttggcagcatactcagtca 37739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 36798 - 36408
Alignment:
Q  25 aggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctc 124  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||     
T  36798 aggacaagcattgctcttatggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctt 36699  T
Q  125 tctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcct 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36698 tgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttactcttccgctaattcacaatcttgtaatgagccttggtatcct 36599  T
Q  225 cctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaattt 324  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||    
T  36598 cctcataaattctgcaactgttcaccaactcggagaaaactcagatctgttggtatccaattgccctcttgatctcagcccgcaatccattctcgaactt 36499  T
Q  325 gatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36498 gatacacttttaaaactcagcagtctctgcagcgtaatgcggataaaactttgccaactctacaaacttggcagcatactcagttacggac 36408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 411
Target Start/End: Original strand, 26676 - 27064
Alignment:
Q  23 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattc 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||| | || || ||| |||||  |||||   || || ||   || ||    
T  26676 ccagtacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcaaacaacctcagcagtagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcactc 26775  T
Q  123 tctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatc 222  Q
    | |  || |||||| ||||||| ||||||||| | || || ||| | | ||||| ||||   || | ||||| ||||| |||||||||||| || ||||     
T  26776 tttgcttacccttaccagcaggagcactgtaaggctttggacgaatttactgactcttaccttttctctcatgcacaaccttgtaatgagctttcgtata 26875  T
Q  223 ctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaat 322  Q
     ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||    || |||||||  || ||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||||||||    
T  26876 ttcctcatagattctgcaactgctcaccagttcagaaaatttacgaatctttttatatccaatggccctcttgatctcaacacgcaagccattctcaaat 26975  T
Q  323 ttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  26976 ttgatgcacttggagaactcagcagtcttagtagtgtagtgcggataaaacttagccagctcaacaaactttgcagcatactctgtcac 27064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 415
Target Start/End: Original strand, 8540 - 8930
Alignment:
Q  25 aggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctc 124  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | | |||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||    
T  8540 aggacaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagataatctcagcaagagcgtccttcttctttggccgtctatcctcgaccatcctc 8639  T
Q  125 tctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcct 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8640 tgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgttggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcat 8739  T
Q  225 cctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaattt 324  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  8740 cctcataaattctgcaactgttcaccagctcggagaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctttatatcagcccgcaatccattctcgaactt 8839  T
Q  325 gatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8840 gatacacttcaaaaactcagtagtctctgcagcgtagtgcggataaaactttgccaactccacaaacttggcagcatactcggtcatggac 8930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 93695 - 93525
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||||| || |||||| || || || || ||||||||||| |||    
T  93695 cttgtaatgagccttcgtatcctcctcataaattctgcagctactcaccaattctgagaaaattctgatcttctgatatcctatggctctcttaatatca 93596  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaa 372  Q
    || | |||||| || || || ||||| || || || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  93595 gccctcaaaccattttcgaacttgatgcatttggagaactcagctgtctccgcagtgtagtgtggataaaa 93525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 107693 - 107540
Alignment:
Q  87 catccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtctt 186  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||   |||    
T  107693 catctttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgccctt 107594  T
Q  187 ccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    || ||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  107593 cctctcattcactatctcgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 107540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 58 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 194813 - 194456
Alignment:
Q  58 acaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaaga 157  Q
    |||| |||| ||||||||||| | |||  ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  194813 acaattaaagcagacaatctcagcagggacatccttattcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggc 194714  T
Q  158 ttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcag 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  194713 ttagggcgactctgctggcccttagtcttccgttcatttacaatcttgtaataagccttagtgtcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccaactcgg 194614  T
Q  258 agaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  194613 agaaaactcggatcttttggtaaccaattgccttcttgatctcagcacgtaacccattctcaaacttgatacactttgaaaactcagcagtctcgggggt 194514  T
Q  358 gtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  194513 gtagtgcagataaaactttgccaactctacgaacttggcagcatactcagtcacggac 194456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 17031 - 16654
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||| | |||| ||||||| ||||||||  || | || |||||||| |||| |||||||||||    
T  17031 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagcaggaacatcctttttcttaggtcgtttctcctcgaccatcctctgtttgcccttat 16932  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    ||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||| || |||||    
T  16931 cagcaggggcactatatggcttagggctactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcatagatcct 16832  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
     || ||| ||||||  || |  |||||| |||||| |||||| || || || |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| || || ||     
T  16831 acagctgttcaccaaatctggaaaaactgggatctgttggtatccgatcgccctcttaatatcaggacgcaaaccattctcaaacttgatgcatttcgag 16732  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||||||||||| | ||| || |  || || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16731 aactcagcagtctcagcagtataatatgggtagaactttgccaactcaacaaacttggcagcatactccgtcacggac 16654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 21425 - 21176
Alignment:
Q  166 actctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaact 265  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||| || ||||| || ||| ||||||  || |  ||||||    
T  21425 actctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcatagatcctacagctgttcaccaaatctggaaaaact 21326  T
Q  266 cggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcg 365  Q
     |||||| |||||| || || || |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| | ||| || |  |    
T  21325 gggatctgttggtatccgatcgccctcttaatatcaggacgcaaaccattctcaaacttgatgcatttcgagaactcagcagtctcagcagtataatatg 21226  T
Q  366 gataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    | || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21225 ggtagaactttgccaactcaacaaacttggcagcatactccgtcacggac 21176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 410
Target Start/End: Original strand, 48053 - 48441
Alignment:
Q  22 cccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccatt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||| |||||  ||||  | || || || ||||||    
T  48053 cccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccatt 48152  T
Q  122 ctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtat 221  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48153 ctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtat 48252  T
Q  222 cctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaa 321  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  48253 cctcctcataaattctgcaactgctcaccaactcagaaaagacacggatcttctggtaaccaattgctctcttaatctcagcacacaaaccgttatcaaa 48352  T
Q  322 tttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtca 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  48353 tttgatacactttgaaaactcagcagtctcggcagtatagtgcggatagaactttgccaactccataaaattggcagcatactctgtca 48441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 55452 - 55063
Alignment:
Q  22 cccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccatt 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||| |||||  ||||  | || || || ||||||    
T  55452 cccaggataagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccatt 55353  T
Q  122 ctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttc-cgctcattcacaatcttgtaatgagccttggta 220  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55352 ctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaagtcttaggacgactctgctgaccttt-gtcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggta 55254  T
Q  221 tcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaa 320  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55253 tcctcctcataaattctgcaactgctcaccaactcagaaaagacacgaatcttctggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaa 55154  T
Q  321 atttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  55153 atttgatacactttgaaaactcagcagtctcggcagtatagtgtggatagaactttgccaactccacaaacttggcaacatactctgtcac 55063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 410
Target Start/End: Original strand, 8330 - 8718
Alignment:
Q  22 cccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccatt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||| |||||  ||||  | || || || ||||||    
T  8330 cccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttatagggcgcctctcatcaaccatt 8429  T
Q  122 ctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtat 221  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8430 ctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtat 8529  T
Q  222 cctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaa 321  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8530 cctcctcataaattctgcaactgctcaccaactcagaaaagacacggatcttctggtaaccaattgctctcttaatctcagcacacaaaccgttatcaaa 8629  T
Q  322 tttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtca 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  8630 tttgatacactttgaaaactcagcagtctcggcagtatagtgcggatagaactttgccaactccataaaattggcagcatactctgtca 8718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 105 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15144583 - 15144278
Alignment:
Q  105 gtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatctt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15144583 gtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacgacctt 15144484  T
Q  205 gtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagca 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15144483 gtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaacagctcaccagctcggagaaaactcggatcttctagtaaccaattgccctcttgatctcagca 15144384  T
Q  305 cgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatact 404  Q
    || ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15144383 cgtaactcgttctcaaacttgatgcactttgaaaactcagcagtcttgggggtgt-gtgcggataaaactttgccaattccacaaacttggcagcatact 15144285  T
Q  405 cagtcac 411  Q
    |||||||    
T  15144284 cagtcac 15144278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15754 - 15365
Alignment:
Q  22 cccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccatt 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||| |||||  ||||  | || || || ||||||    
T  15754 cccaggataagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccatt 15655  T
Q  122 ctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtat 221  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||| ||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15654 ctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaagtcttaggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtat 15555  T
Q  222 cctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaa 321  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15554 cctcctcataaattctgcaactgctcaccaactcagaaaagacacgaatcttctggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaa 15455  T
Q  322 tttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15454 tttgatacactttgaaaactcagcagtctcggcagtatagtgtggatagaactttgccaactccacaaacttggcaacatactctgtcac 15365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16350413 - 16350067
Alignment:
Q  69 agacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgact 168  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  16350413 agacgatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgact 16350314  T
Q  169 ctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcgg 268  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||  || ||||||  ||||  |||||||||    
T  16350313 ctgctggcccttagtcttccgctcatttacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcctcatagattctacagttgttcaccaaatcaggaaaaactcgg 16350214  T
Q  269 atcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggat 368  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||  || |||||||    
T  16350213 atctgttggtatccaattgccctcttaatatcaggccgcaaaccattctcaaacttgattcactttgagaacttagcagtctcagcagcataatgcggat 16350114  T
Q  369 aaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350113 aaaactttgccaacttaacaaacttggcagcatactcagtcacggac 16350067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 14162761 - 14163153
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||   ||||||||| ||| |  ||||  | ||||| ||||||    
T  14162761 atccccaggacaagcatcactcttgtggcctttcacaccacaagcatagcagacaatctcaacaggagcatctttccttctagggcgcctatcctcgacc 14162860  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||   ||| | || ||||||| |||||| |||||||| |    
T  14162861 attctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgtcccttaactttctgttcgttcacaaccttgtagtgagccttag 14162960  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  14162961 tatccttttcataaatcctgcaactgctcaccagctctgaaaaatttcggatcttctggtaaccaattgccctcttgatctcagcacgtaaatcgttctc 14163060  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     || ||||| || || || ||||| ||| |||| | ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14163061 gaacttgatgcatttggagaactctgcattctcagcagtatagtgcggatagaactttgccaattccacgaacttggcagcatactcagtcac 14163153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 18224189 - 18223808
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18224189 caggacaaacattacacttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattct 18224090  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18224089 ctgtttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatct 18223990  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    |||||||| || ||||| ||  |||| |  |||| ||||||| |||||| |||||| || || ||  |||| || |  |  | |||||| || || || |    
T  18223989 tcctcgtagattctgcagctattcactaaatcagggaaaactgggatctgttggtatccgatcgccatcttcatgttgggcctcaaaccattgtcgaact 18223890  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||| || || || |||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  18223889 tgatgcatttcgagaactcagcagtctcagcagcatagtgcggatagaactttgccaactccacaaatttggcagcgtactc 18223808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 16219479 - 16219871
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || | ||||||   ||||||||| |||||  |||||   || || ||        
T  16219479 atccccaggacaagcattactcttatggcctttctcgccacaagtatagcacataatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcgtcatta 16219578  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| | || || |||||| ||||||| ||  | |||| ||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  16219579 actctttgttttcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactcggctgacctttgcttttcctctcattcacaatcttataatgatccttcg 16219678  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||| ||| | || || ||||| |||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||    
T  16219679 tatcttccacatagattctgcagctgctcaccaactcagaaaaagtacggatcttttggtaaccaattgcccgcttgatctcagcacgcaagccattctc 16219778  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16219779 aaatttgatacatttggaaaactcagcaatctcagcagtgtagtgcggataaaacttagccaattccacaaacttggcagcatattcagtcac 16219871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 16222799 - 16223191
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || | ||||||   ||||||||| |||||  |||||   || || ||        
T  16222799 atccccaggacaagcattactcttatggcctttctcgccacaagtatagcacataatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcgtcatta 16222898  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| | || || |||||| ||||||| ||  | |||| ||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  16222899 actctttgttttcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactcggctgacctttgcttttcctctcattcacaatcttataatgatccttcg 16222998  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||| ||| | || || ||||| |||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||    
T  16222999 tatcttccacatagattctgcagctgctcaccaactcagaaaaagtacggatcttttggtaaccaattgcccgcttgatctcagcacgcaagccattctc 16223098  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16223099 aaatttgatacatttggaaaactcagcaatctcagcagtgtagtgcggataaaacttagccaattccacaaacttggcagcatattcagtcac 16223191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16248388 - 16248005
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||   |||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |    
T  16248388 acaaacattactcttgtggcctttctcaccataattgaaacatgtaatctcagttggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 16248289  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16248288 tggcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcct 16248189  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
      || |||||||| ||  | ||||  |||| |||||||||||||| |||||| |  || || |||||| | || |  | |||||| ||||| || |||||    
T  16248188 tatagatcctgcagctattaaccaaatcagggaaaactcggatctgttggtatctgatcgccctcttattgtcgggcctcaaaccattctcgaacttgat 16248089  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     || || || |||||||||||||| | ||| || ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16248088 gcatttcgagaactcagcagtctcagcagtatattgcgggtagaactttgccaactccacaaacttggcagcatactctgtcac 16248005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 13513646 - 13514033
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  13513646 caggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacagttgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattct 13513745  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  13513746 ctgcttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcc 13513845  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    ||||| || || ||||| ||  ||||||  ||||  ||||||||||||| |||||| || || || |||||||| || |  | |||||| ||||| || |    
T  13513846 tcctcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatatcgggcctcaaaccattctcgaact 13513945  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || || || |||||| ||||||| | ||  || |  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13513946 tgatgcatttcgagaactcaacagtctcagcagaataataaggatagaactttgccaactccacaaacttggcagcatactcggtcac 13514033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 220 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16241630 - 16241439
Alignment:
Q  220 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctca 319  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  16241630 atcctcctcatatatccggcaactgctcaccagctcagagaaaacttggatcttatagtaaccaatttctctctttatctcagcacgtaaaccgttctcg 16241531  T
Q  320 aatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16241530 aatttgatacacttcgaatactcagcagtctctggagtgtaatgcggataaaactttgccaattccaaaaacttggcagcatactcagtcac 16241439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18604535 - 18604148
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  18604535 caggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttaaaacaaataatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 18604436  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  18604435 ctgcttgcccttatcagcaggggcattataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctatggtatcc 18604336  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || || || ||||| || ||| ||||||  |||| |||||||||||  | |||||| || || || ||||| || || |  | |||||| ||||| || |    
T  18604335 tcttcatagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaact 18604236  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || || || | |||| || |||| | ||| ||||| || || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18604235 tgatgcatttcgagagctcaacattctcagcagtatagtgtgggtagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactctgtcac 18604148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 17091851 - 17091477
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  17091851 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 17091755  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  17091754 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 17091655  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||| | ||||  ||    |||||||  | ||  ||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  17091654 gcagctgttaaccaaatcctgaaaaactctcagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 17091555  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17091554 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 17091477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14300678 - 14300317
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  14300678 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 14300582  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  14300581 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 14300482  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  14300481 gctattgaccaaatcttgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 14300382  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||| || ||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  14300381 tcagcattctcagcagtatagtgcgggtagaactttgacagttccacaaacttggcagcatactc 14300317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Original strand, 8389708 - 8390096
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||  | ||| | ||||||||  |    
T  8389708 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatctt 8389804  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  8389805 ctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcc 8389904  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    ||||| || |||||||| ||| | ||||  ||    |||||||  | ||  ||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || |    
T  8389905 tcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatcctgaaaaactctcagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaact 8390004  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| ||  | || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8390005 tgatgcatctcgagaactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 8390096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 346
Target Start/End: Original strand, 14683880 - 14684182
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||    | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||    
T  14683880 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctc---ggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcag 14683976  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  14683977 caggggcactgtatggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgca 14684076  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
    |||  | ||||  || |  |||||||  |||| |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| || ||  |||||    
T  14684077 actattgaccaaatctggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatttctaaaac 14684176  T
Q  341 tcagca 346  Q
    ||||||    
T  14684177 tcagca 14684182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Original strand, 19635449 - 19635816
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||    
T  19635449 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcag 19635545  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | |||||||||||  | ||||| | ||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  19635546 cgggggcactgtacggcttaggacaactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 19635645  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
    |||  | ||||  || |  |||||||  |  | |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  19635646 actattaaccaaatccggaaaaactctcagttgttggtacccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 19635745  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||| || ||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19635746 tcagcattctcagcagtatagtgcgggtagaactttgacagctccacgaacttggcagcatactctgtcac 19635816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Original strand, 12479910 - 12480284
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   |||||||| |||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  12479910 ctcttatggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 12480006  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  12480007 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcct 12480106  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  12480107 gcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 12480206  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12480207 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 12480284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Original strand, 23959057 - 23959431
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  23959057 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgt 23959153  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  23959154 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattct 23959253  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  23959254 gcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 23959353  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23959354 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 23959431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Original strand, 40476353 - 40476549
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  40476353 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctc---agtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcag 40476449  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| |||||| |||| |||||   ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  40476450 caggggcactgtacggcttaggacgactccgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgca 40476549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8050325 - 8049955
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||  ||| ||| || ||||    
T  8050325 ctcttgtggcccttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccctcttcttaggccgtctcacatcgaccatcttctgtttccctttat 8050229  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || |||||    
T  8050228 cagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 8050129  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  8050128 gcagctattgaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 8050029  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8050028 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcac 8049955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 411
Target Start/End: Original strand, 14699951 - 14700142
Alignment:
Q  220 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctca 319  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||    |||||||| | |||||||||||| | ||| |||||| |||||||  | ||||||    
T  14699951 atcctcctcatagattctgcaactgctcaccagctcaaaaaagttacggatcttctagtaaccaattgcccgcttgatctcaacacgcaagtcattctca 14700050  T
Q  320 aatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||  | | ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  14700051 aatttgatgcacttagaaaactcagcagtctcaacagtgtaatgcggataaaacttagctagttccacaaattttgcagcatattcagtcac 14700142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16233708 - 16233320
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  |    
T  16233708 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagtacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 16233612  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
     | ||| || || ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||     
T  16233611 ttgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatct 16233512  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || ||||| |||||||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || |    
T  16233511 tcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaact 16233412  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| ||  | || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16233411 tgatgcatctcgagaactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 16233320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19775495 - 19775121
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  19775495 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaatcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgt 19775399  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  19775398 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattct 19775299  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || ||| || ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  19775298 gcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 19775199  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||| |||| | ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19775198 aactcagcattctcagcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 19775121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16252746 - 16252648
Alignment:
Q  220 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  16252746 atcctcctcatatatccggcaactgctaaccagctcagagaaaactcgaatcttctagtaaccaattgctctctttatcttagcacgtaaaccgttctc 16252648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 415
Target Start/End: Original strand, 20893440 - 20893718
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||   | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || | ||||||||    
T  20893440 tcagcaggagcactttaaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttctttgtaaatcc 20893539  T
Q  237 tgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttga 336  Q
    |||||||| | |||| |||||| || |||| |||||  || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||||||| | |     
T  20893540 tgcaactgtttaccaactcagaaaagactctgatctgctgatacccaatagctctcttaatatcagctctcaacccattctcaaatttgatacacctggc 20893639  T
Q  337 aaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
     |||||||| |||||   | |||| || || || |||||  | | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  20893640 gaactcagctgtctccacactgtaatgagggtagaacttagcaagttccacaaactttgcagcatactccgtgacggac 20893718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 240
Target Start/End: Original strand, 27714646 - 27714845
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  27714646 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgt 27714742  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  27714743 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattct 27714842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 14697391 - 14697598
Alignment:
Q  18 aatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgac 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| | || |||||| |||||  |||||   || || ||       
T  14697391 aatccccaagacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcagcagtagcatctttctttctaggcctcctctcatcatt 14697490  T
Q  118 cattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttg 217  Q
    || ||| |  || |||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| |||||||||||    |||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  14697491 caatctttgcttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaactttgtaatgagctttg 14697590  T
Q  218 gtatcctc 225  Q
    ||||||||    
T  14697591 gtatcctc 14697598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 404
Target Start/End: Original strand, 13879551 - 13879785
Alignment:
Q  170 tgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcgga 269  Q
    |||||||||||  || |||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||| || |  | ||    
T  13879551 tgctgacccttgttcctccgctcactcctaaccttataatgagccttcgtatcctcctcataaattctacaactactcaccaattcagaaaatatcctga 13879650  T
Q  270 tcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggata 369  Q
    ||||||| ||||| || || | |||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||| |||||| | ||| || |  |||||    
T  13879651 tcttttgttaacctatggcccgcttaatgtcagcacgcaaaccattttcaaacttaatgcactttgagaactcagtagtctcagcagtataatatggata 13879750  T
Q  370 aaacttttccaattccacaaacttggcagcatact 404  Q
     || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  13879751 gaattttgcaagctccacaaacttagcagcatact 13879785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11204204 - 11203881
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| | |||||||||  || |||| ||    ||||| ||   |||  |||      
T  11204204 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttataacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctac 11204105  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || |    
T  11204104 tttcctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttctt 11204005  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | ||||| || || ||| | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  11204004 cataaattctacatctgtttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcagctctcaacccattctcaaatttgat 11203905  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    |||||| || |||||||| |||||    
T  11203904 acacttggagaactcagctgtctc 11203881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3261766 - 3261443
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||   |||||||||  || |||| |||   ||||| ||  ||||  |||      
T  3261766 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgc 3261667  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || |    
T  3261666 tttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttctt 3261567  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || || ||||| ||  | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || |||||||| |||||    
T  3261566 catagattctgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcagccctcaacccattctcaaacttgat 3261467  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    |||||| || |||||||| |||||    
T  3261466 acacttggagaactcagctgtctc 3261443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 44658726 - 44658515
Alignment:
Q  140 gcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgc 239  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || || || || || |    
T  44658726 gcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattctac 44658627  T
Q  240 aactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaa 339  Q
    | ||| | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| |||||||| || ||||| | ||| || |||||||| ||||||||||| || ||    
T  44658626 acctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatatccaatggctctcttgatgtcagccctcaacccattctcaaacttgatacacttggagaa 44658527  T
Q  340 ctcagcagtctc 351  Q
    |||||| |||||    
T  44658526 ctcagctgtctc 44658515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 327
Target Start/End: Original strand, 7357676 - 7357866
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||| ||| |||| || ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  7357676 tcagcaggagcaatgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagccttggtgtcttcttcataaatcc 7357775  T
Q  237 tgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || ||| | |||| |||||| || |||| ||||| ||| || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || |||||||||||    
T  7357776 tacacctgttaaccaactcagaaaagactctgatctgttgatacccaatagctcttttgatgtcagccctcaaaccattttcaaatttgat 7357866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 405
Target Start/End: Original strand, 27903866 - 27904061
Alignment:
Q  209 tgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgca 308  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| | || || |||||||  |||||||||  || |||||| || || ||| |  ||||||| || ||||| | ||    
T  27903866 tgagcctttgtatcctcctcataaatcttacagctactcaccaattcagagaaatttctgatcttctgataccca-tgactctcttgatatcagctctca 27903964  T
Q  309 aaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    | || || ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| | | ||||   ||||| |||||||||||    
T  27903965 agccattttcaaacttgatacatttggagaactcagctgtctccgcagtgtagtgaggataaaactttgcaagttccgtgaacttagcagcatactc 27904061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 90
Target Start/End: Original strand, 15073664 - 15073721
Alignment:
Q  33 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatc 90  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| | |||||||||    
T  15073664 cattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggagcatc 15073721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 251
Target Start/End: Original strand, 8709086 - 8709200
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||||||| ||||| || || || || ||||  |||||||| ||  || |||||||| ||| || |||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  8709086 tcagcaggagcactatagagcttcggacgaccttgctgacctttgttcctccgctcactcataaccttgtaatgagctttgatatcctcttcgtagattc 8709185  T
Q  237 tgcaactgctcacca 251  Q
    | |||||||||||||    
T  8709186 tacaactgctcacca 8709200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29450509 - 29450477
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29450509 acaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 29450477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 44658838 - 44658806
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44658838 acaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 44658806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 51603586 - 51603386
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |  |||||||  |||||||||| ||  ||||  ||||| || || |||||||| || ||||| |    
T  51603586 taatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacagcgactcaccaaatcagagaaaattctaatctgctggtatcctatggctctcttgatgtcagctc 51603487  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     ||| || |||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| || |  || || ||||| |||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  51603486 tcaagccattctcaaactttatgcacttggagaattcagctgtctccggggcataatggggatagaactttgcaagctccacaaattttgcagcatactc 51603387  T
Q  406 a 406  Q
    |    
T  51603386 a 51603386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 53750264 - 53750064
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |  |||||||  |||||||||| ||  ||||  ||||| || || |||||||| || ||||| |    
T  53750264 taatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacagcgactcaccaaatcagagaaaattctaatctgctggtatcctatggctctcttgatgtcagctc 53750165  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     ||| || |||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| || |  || || ||||| |||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  53750164 tcaagccattctcaaactttatgcacttggagaattcagctgtctccggggcataatggggatagaactttgcaagctccacaaattttgcagcatactc 53750065  T
Q  406 a 406  Q
    |    
T  53750064 a 53750064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 404
Target Start/End: Original strand, 341 - 722
Alignment:
Q  23 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||| ||||||||||||   ||||| || |||||||    
T  341 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctccacaagagcatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattc 440  T
Q  123 tctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatc 222  Q
    ||  ||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  441 tcggtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatc 540  T
Q  223 ctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaat 322  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  541 ctcctcatatatcctgcaactgctcaccagctcagaaaagacacggatcttctggtaaccaatcgctctcttgatctcagcacgtaaaccgttctcgaat 640  T
Q  323 ttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatact 404  Q
    ||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  641 ttgatgcatttcgaaaactcaacagtctctgcagtgtagtgcggataaaactttgccaattccacaaacttggtagcgtact 722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 404
Target Start/End: Original strand, 4758 - 5139
Alignment:
Q  23 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||| ||||||||||||   ||||| || |||||||    
T  4758 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctccacaagagcatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattc 4857  T
Q  123 tctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatc 222  Q
    ||  ||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4858 tcggtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatc 4957  T
Q  223 ctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaat 322  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  4958 ctcctcatatatcctgcaactgctcaccagctcagaaaagacacggatcttctggtaaccaatcgctctcttgatctcagcacgtaaaccgttctcgaat 5057  T
Q  323 ttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatact 404  Q
    ||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5058 ttgatgcatttcgaaaactcaacagtctctgcagtgtagtgcggataaaactttgccaattccacaaacttggtagcgtact 5139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 105 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 34669 - 34364
Alignment:
Q  105 gtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatctt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  34669 gtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacgacctt 34570  T
Q  205 gtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagca 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34569 gtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaacagctcaccagctcggagaaaactcggatcttctagtaaccaattgccctcttgatctcagca 34470  T
Q  305 cgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatact 404  Q
    || ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34469 cgtaactcgttctcaaacttgatgcactttgaaaactcagcagtcttgggggtgt-gtgcggataaaactttgccaattccacaaacttggcagcatact 34371  T
Q  405 cagtcac 411  Q
    |||||||    
T  34370 cagtcac 34364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 411
Target Start/End: Original strand, 41953 - 42344
Alignment:
Q  20 tccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||| ||||||   ||| ||||| |||||  ||||  | || || || ||||    
T  41953 tccccaggacaagcattactcttgtgacctttctcaccacaagtattgtagaaaatctcaacaggggcatctttctttctagggcgcctctcatcaacca 42052  T
Q  120 ttctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggt 219  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42053 ttctctgtttacccttatcagcagaagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagt 42152  T
Q  220 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctca 319  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| | |||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42153 atcctcctcatagatcctgcaactgctcaccagatcataaaaagtacggatcttctggtaaccaattcctctcttaatctcagcacgcaaaccattctca 42252  T
Q  320 aatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42253 aatttgataaactttgaaaattcagcagtctctgcaatgtagtgcggacaaaacttttccaactccacaaacttggcagcatactctgtcac 42344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 411
Target Start/End: Original strand, 75673 - 76064
Alignment:
Q  20 tccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||| ||||||   ||| ||||| |||||  ||||  | || || || ||||    
T  75673 tccccaggacaagcattactcttgtgacctttctcaccacaagtattgtagaaaatctcaacaggggcatctttctttctagggcgcctctcatcaacca 75772  T
Q  120 ttctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggt 219  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  75773 ttctctgtttacccttatcagcagaagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagt 75872  T
Q  220 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctca 319  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| | |||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  75873 atcctcctcatagatcctgcaactgctcaccagatcataaaaagtacggatcttctggtaaccaattcctctcttaatctcagcacgcaaaccattctca 75972  T
Q  320 aatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  75973 aatttgataaactttgaaaattcagcagtctctgcaatgtagtgcggacaaaacttttccaactccacaaacttggcagcatactctgtcac 76064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 26 - 415
Target Start/End: Original strand, 367 - 747
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||||| ||||    
T  367 ggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacaaacaatctcagcaggaacatccttcttccttggccgcctatcttcgaccatcctct 466  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  467 gtttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcatacacaaccttgtaatgagccttagtgtcctc 566  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  567 ctcataaatcctgcaactgctcaccaactcagagagaactcgaatcttttggtaaccaattgccctcttaatctcagctcgtaagccgttctcaaacttg 666  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    || |||||||| ||||||||         |||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  667 atgcactttgagaactcagc---------agtgtaatgcggatagaattttgccaactccacaaacttggcagcgtactcagtcacggac 747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23928 - 23543
Alignment:
Q  20 tccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||| ||| ||||||||||||   ||||| || ||||    
T  23928 tccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtataacagacaatctcaacatgagtatctttcttcttaggccacctatcatcaacca 23829  T
Q  120 ttctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggt 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23828 ttctctgtttgcccttatcagcaggagcactgtatggcttaggacgactctgctgacctttagctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggt 23729  T
Q  220 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctca 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||     
T  23728 atcctcctcataaatcctgcaactgcttaccagctcagaaaagacacggatcttctggtaagcaattgctctcttaatttgagcacgtaaaccattctcg 23629  T
Q  320 aatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||    
T  23628 aattcgatacacttcaaaaactcagcagtctctacagtatagtgcggataaaactttgccaactctacgaacttggcagcatactc 23543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9573 - 9432
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||| || ||||||| ||||||||| | ||  ||||| || || ||||| |||||||| || |||    
T  9573 cttgtaaagagccttagtatcctcctc--atatcctgcagctactcaccaactcagagaagattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtca 9476  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagc 345  Q
    || | ||| || |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  9475 gctctcaagccattctcaaacttgatacatttggagaactcagc 9432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 30614 - 30999
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  30614 ggacaagcattgctcttgtggtctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttagaccgcctatcctcgaccattctct 30713  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  30714 gtttgcctttatcagcaggggcactgtacggcttaggatgactctgttgtcccctggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgaaccttagtgtcctc 30813  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  30814 ctcataaatcctgtaactgctcaccaactcggagaaaactcggatcttttggtaaccaatcgcccttttgatctcagcccgcaatccattctcgaacttg 30913  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30914 atacacttcgaaaaatcagcagtctctgcagtgtaatgcggataaaactttgccaactccacaaatttggcagcatactcagtcac 30999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Original strand, 252 - 632
Alignment:
Q  27 gacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctc 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  252 gacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctatcctcgaccattctctg 351  T
Q  127 tttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||    
T  352 tttgcccttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctattgtcccctggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgaaccttagtgtcatcc 451  T
Q  227 tcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttga 326  Q
    || ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  452 tcataaatcctgaaactactcaccaactcggagaaaactcggatcttttggtaaccaatcgcccttttgatctcagcccgcaatccattctcgaacttga 551  T
Q  327 tacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcag 407  Q
    |||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  552 tacaattcgaaaactcggcagtctctgcagtgtaatgcggataaaacttaaccaattccacaaacttggcggcatactcag 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 9939 - 10331
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||||||||| |||||| ||||  | || || || |||    
T  9939 atccccaggacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtacaacatacaatctcgacaggagcatctttcttcctagggcgcctctcatcaacc 10038  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||| | ||| ||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||  | |  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10039 attctttgtttacccttattagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctgtggctttccgctcattcacgatcttgtaatgagtcttgg 10138  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  10139 tatcctcctcataaattctgcaactgctcaccagctcagaaaagacacggatcttctggtaaccaattactctcttaatcttagcacgcaaaccattctt 10238  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10239 aaatttgatacactttgaatattcagcagtctctgcagtatagtgcggataagactttgccaactccacgaacttggcagcatactctgtcac 10331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 110890 - 110499
Alignment:
Q  20 tccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacca 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||| |||||  ||||  | || || || ||||    
T  110890 tccccaagacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaacca 110791  T
Q  120 ttctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggt 219  Q
    ||||||  || |||||||| ||||| ||||||| | | ||||| || ||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110790 ttctctgcttccccttatcggcaggagcactgtgaggcttaggacggctctgctgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggt 110691  T
Q  220 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaact-cggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  110690 atcctcctcataaatcctgcaactcctcaccagctc-gaaaagattacgaatcttctggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccattctc 110592  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  110591 gaatttgatacactttgaaaactcagctgtctctgcagtgtagtgcggataaaacttagccaattccacaaacttggcagcatactctgtcac 110499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 18165 - 18557
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | || |||||| |||||  | |||   || || ||        
T  18165 atccccagaacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagcagtagcatctttctttcttggcctcctctcatcatta 18264  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    | ||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| | || || ||||| | |||||| |||   |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  18265 actctttgcttacccttatcagcaggagcattgtaaggctttggacgacttttctgacctttacctttcctctcattcacagccttgtaatgagctttgg 18364  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | ||    |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||    
T  18365 tatcttcttcataaattctgcaactactcaccagctcaaaaaagttacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgatctcagcacgcaagccattctc 18464  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    || |||||| ||||| || |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18465 aactttgatgcacttggagaactcagcagtcacagcagtgtagtgcggataaaacttagccagctccacaaactttgcagcatactcagtcac 18557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 30551 - 30163
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||| || |||| |||||||| ||||    
T  30551 ggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtttatcctcgaccatcctct 30452  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     ||| |||||||||||||||| ||| ||  |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30451 gttttcccttatcagcaggggtactatagggcctagggcgactctgctggcctttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 30352  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
     |||||||| || |||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||  |||| || ||||| || |||    
T  30351 ttcgtaaattctacaactgttcaccaactcgaagaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctttatatcagcctgcaatccattctcgaacttg 30252  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacgga 414  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30251 atacacttcgaaaactctgaagtctctgtagcgtaatgcggataaaactttgccaactccacaaacttggcagcatactcagttacgga 30163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 43433 - 43045
Alignment:
Q  23 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || | | || |||| |||||||| ||| | ||||| || || ||||    
T  43433 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatttcagcaagaccatctttcttcttgggccgcctatcatcaactattc 43334  T
Q  123 tctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatc 222  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43333 tctgtttacccttatcagcaggagcactataaggcttagggcgactctgcttacctttggttttccgctcattcacaatcttgtattgagccttggtatc 43234  T
Q  223 ctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaat 322  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| || |||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  43233 ctcctcatatatcctgcaactgctcaccagttcaaaaaagacacggatcttctgttaacgaatcactctcttgatctcagcacgtaaaccgttctcgaat 43134  T
Q  323 ttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43133 ttgatgcatttcgaaaactcagcagtctctgcagtgtagtgtggataaaactttaccaattccacaaacttagcagcatactctgtcac 43045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 164282 - 163999
Alignment:
Q  122 ctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttag-tcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggta 220  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| || |||  ||||| | ||| |||  | |||||||||||| || ||     
T  164282 ctctgttttcccttgtcagcaggggcactgtatgatttaggacgactctgctgtcctttacctcttc-gttcactcatcaccttgtaatgagctttcgtg 164184  T
Q  221 tcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaa 320  Q
    | |||||| || |||||||| || ||||||| ||| ||||||| || |||||| || || ||||| |||||||| ||  |||| | ||| |  |||||||    
T  164183 ttctcctcatatatcctgcagctactcaccaactcggagaaaattctgatcttctgatacccaatggctctcttgataccagctctcaagcaattctcaa 164084  T
Q  321 atttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    | || ||||| || || ||||||||  |||| |  |||||||| || || ||| || | | |||||||||||| |||||||||||    
T  164083 actttatacatttggagaactcagctatctccgcggtgtagtgggggtagaaccttgcaagttccacaaacttagcagcatactc 163999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15145909 - 15145517
Alignment:
Q  23 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattc 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||| || || | ||    
T  15145909 ccaggacaagcattactcctgtggcctttctcaccacaagtaaagaagacaatctcagcaggagcatccttcttcttagggcgcctatcatcaactactc 15145810  T
Q  123 tctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatc 222  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15145809 tctgtttgcccttatcagcagggggactataaggcttaggacgactctgttgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatc 15145710  T
Q  223 ctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaat 322  Q
     |||||  | |||||||||||||||||||||||| | || | ||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||     
T  15145709 ttcctcaaagatcctgcaactgctcaccagctcataaaagattcgaatcttctggtaaccaattactctctttatctcagcacgcaactcattctcgaac 15145610  T
Q  323 ttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15145609 ttgatacacttagaaaactccgcagtctcagcagtatagtgcgaataaaactttgccaattccactaacttggcagcatactcagtcacggac 15145517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 411
Target Start/End: Original strand, 14042983 - 14043367
Alignment:
Q  27 gacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||   | ||||||| |||||  ||||  | || || || ||||||||||     
T  14042983 gacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcatacaatctcaacatgagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctg 14043082  T
Q  127 tttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcc 226  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||| | || || | |||||| ||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14043083 tttacccttatcagcaggagcactataaggctttggacaactctgttgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcc 14043182  T
Q  227 tcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttga 326  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14043183 tcataaatcctgcaactgctcaccagatcagaaaaagtacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgatctcagcacgcaaaccattctcaaatttga 14043282  T
Q  327 tacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || |||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14043283 tacatttcgaaaactttgcagtctctgcagtatagtgcggataaaacttagccaattccacaaacttggcagcatactctgtcac 14043367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 411
Target Start/End: Original strand, 14353013 - 14353397
Alignment:
Q  27 gacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||   | ||||||| |||||  ||||  | || || || ||||||||||     
T  14353013 gacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcatacaatctcaacatgagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctg 14353112  T
Q  127 tttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcc 226  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||| | || || | |||||| ||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14353113 tttacccttatcagcaggagcactataaggctttggacaactctgttgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcc 14353212  T
Q  227 tcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttga 326  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14353213 tcataaatcctgcaactgctcaccagatcagaaaaagtacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgatctcagcacgcaaaccattctcaaatttga 14353312  T
Q  327 tacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || |||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14353313 tacatttcgaaaactttgcagtctctgcagtatagtgcggataaaacttagccaattccacaaacttggcagcatactctgtcac 14353397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 9591649 - 9592036
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  9591649 caggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacagttgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattct 9591748  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  9591749 ctgcttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcc 9591848  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    ||||| || || ||||| ||  ||||||  ||||  ||||||||||||| |||||| || || || |||||||| || |  | |||||| ||||| || |    
T  9591849 tcctcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatatcgggcctcaaaccattctcgaact 9591948  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || || || |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9591949 tgatgcatttcgagaactcagcagtctcagcagtgtagtgtggatagaactttgccaactccacaaacttggcagcatactcggtcac 9592036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 405
Target Start/End: Original strand, 11984281 - 11984658
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  11984281 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctctgt 11984380  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  11984381 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttctt 11984480  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    |||| ||||| |||||| | ||||  ||||  ||||||||||| | |||||| || || || |||||||| || |  | |||||| ||||| || |||||    
T  11984481 cgtagatcctacaactgttaaccaaatcaggaaaaactcggatttgttggtatccgatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccattctcgaacttgat 11984580  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     || ||  | || ||||||||||| | ||  |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11984581 gcatttcaagaattcagcagtctcagcagcatagtgcgggtagaactttgccaactccacaaacttggcagcatactc 11984658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17703440 - 17703185
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  | ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  17703440 caggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattct 17703341  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  17703340 ctgtttgcccttatcagtaggggcactataaggtttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcc 17703241  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggta 279  Q
    || || || ||||| || ||| ||||||  |  | |||||||||||||| ||||||    
T  17703240 tcttcatagatcctacagctgttcaccaaataggcgaaaactcggatctgttggta 17703185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 11550087 - 11549699
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||  |||| || |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||    | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  11550087 caggacagacattgcttttgtggcctttcacaccacaattgaaacacacaatctc---ggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcct 11549991  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||   ||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  11549990 ctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttccccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcc 11549891  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || || || |||||||| ||  | ||||  || |  |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || |    
T  11549890 tcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaact 11549791  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549790 tgatacatttcgaaaactcagcagtctctgcagcataatgcggataaaacttcgccaactcaacaaacttggcagcatactcagtcacggac 11549699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16726426 - 16726171
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  | ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  16726426 caggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattct 16726327  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  16726326 ctgtttgcccttatcagtaggggcactttaaggtttagggcgactctgctggcccttggtctttcgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcc 16726227  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggta 279  Q
    || || || ||||| || ||| ||||||  |  | |||||||||||||| ||||||    
T  16726226 tcttcatagatcctacagctgttcaccaaataggcgaaaactcggatctgttggta 16726171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 12690786 - 12691170
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||  |||| || |||||| ||||| |||||||| | ||||| |||||||| | ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  12690786 caggacagacattgcttttgtggactttcacaccacaattgaaacacacaatctcggtag---catccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcct 12690882  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  12690883 ctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcc 12690982  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || || || |||||||| ||  | ||||  || |  |||||||  |||| |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || |    
T  12690983 tcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaact 12691082  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || || |||||||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12691083 tgatgcatttcgaaaactcagtagtctctgcagcataatgcggataaaacttcgccaactcaacaaacttggcagcatactcagtcac 12691170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Original strand, 14957793 - 14958181
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||  |||| || |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||| | || |   ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  14957793 caggacagacattgcttttgtggcctttcacaccacaattgaaacacacaatctcggtagta---tccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcct 14957889  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| |||| || ||| |||||   ||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  14957890 ctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgaccctactgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcc 14957989  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || || || |||||||| ||  | ||||  || |  |||||||  |||| |||||| |||||  | |||||||| || |  | |||||||| ||| ||      
T  14957990 tcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaatctgttggtatccaatcaccctcttaatgtcgggcctcaaaccgtcctcgaaca 14958089  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14958090 tgatgcattttgaaaactcagcagtctctgcagcataatgcagataaaacttcgccaactcaacaaacttggcagcatactcagtcacggac 14958181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 411
Target Start/End: Original strand, 15627916 - 15628196
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| || |||| |||| | |||| |||||||| || |||||||||||| || ||||||||||| |    
T  15627916 cccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgttgactcttacttttcctctcattcataaccttgtaatgagctttcgtatcctcctcat 15628015  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    | |||| |||||| || ||||  ||||| |    | ||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  15628016 agatccggcaactacttaccaattcagaaattttttggatcttctgatatccaattgctcgcttaatctcagcacgcaagccattctcaaatttgatgca 15628115  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||| || |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||   ||  ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  15628116 cttagagaactcaacagtctcagcagtgtagtgtggataaaacttagtcagctccacaaacatagcagcatactcggtcac 15628196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 44788336 - 44787948
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  |    
T  44788336 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcgccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 44788240  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || ||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  44788239 ctgttttcctttatcagtaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcc 44788140  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    ||||| || |||||||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || |    
T  44788139 tcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaact 44788040  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| ||  | || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44788039 tgatgcatctcgagaactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 44787948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11234181 - 11233985
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||    
T  11234181 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtag---catccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcag 11234085  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  11234084 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgca 11233985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Original strand, 14335681 - 14336069
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  |    
T  14335681 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 14335777  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || || ||||| |||||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  14335778 ctgtttccctttgtcagcgggggcattgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 14335877  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || ||||| |||||||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || |    
T  14335878 tcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaact 14335977  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| ||  | || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14335978 tgatgcatctcgagaactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 14336069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Original strand, 8710890 - 8711278
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  |    
T  8710890 caggacaggcgttgcttttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 8710986  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || || ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  8710987 ctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 8711086  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || ||||| |||||||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| || || || |||||||| || |  | |||||||||||| || |    
T  8711087 tcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccgatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaact 8711186  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| ||  | || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  8711187 tgatgcatctcgagaactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttgacagcatactctgtcacggac 8711278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18587156 - 18586768
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  |    
T  18587156 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgtag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 18587060  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || || ||||| |||||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  18587059 ctgtttccctttgtcagcgggggcattgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 18586960  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || ||||| |||||||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || |    
T  18586959 tcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaact 18586860  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| ||  | || ||||||||| |||| | ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18586859 tgatgcatctcgagaactcagcattctcagcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcacggac 18586768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15158025 - 15157658
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  15158025 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 15157929  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||| | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  15157928 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 15157829  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  15157828 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 15157729  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| || ||||||  |   ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15157728 tcagcattctctgcagtatagtgcgggtagaactttgacggctccacgaacttggcagcatactctgtcac 15157658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 10873746 - 10873959
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||| || || ||||||||| |||||||||||||| | || || |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  |    
T  10873746 caggacaggcgttgctcttgtggtctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 10873842  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || || ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||| |   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  10873843 ctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccctgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcc 10873942  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgca 240  Q
    ||||| || ||||||||    
T  10873943 tcctcatagatcctgca 10873959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Original strand, 13689343 - 13689539
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  13689343 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 13689439  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
     ||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||   ||| | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  13689440 taggggcactgtacggcttaggacgactctggtgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 13689539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 344
Target Start/End: Original strand, 12459918 - 12460234
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||| | |||| ||||  || |||| |||   ||||| ||   |||| |||      
T  12459918 acaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggaacatctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgc 12460017  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || ||||| |||||| | ||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||  | ||| |||| |||  | |||||||||||| || || || ||||    
T  12460018 tttcccttgtcagcaagagcattgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcct 12460117  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| || || || || || ||||| || ||||| | |||||| || ||||| |||||    
T  12460118 catatatcctgcagctgctcaccaactcagagaaaactctaatcttctgataccctatagccctcttgatatcagccctcaaaccattttcaaacttgat 12460217  T
Q  328 acactttgaaaactcag 344  Q
    |||||| || |||||||    
T  12460218 acacttggagaactcag 12460234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 240
Target Start/End: Original strand, 18181047 - 18181241
Alignment:
Q  43 gtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagca 142  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || ||||||||     
T  18181047 gtggcctttctcgccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacctcgaccatcttctgtttccctttatcagcg 18181143  T
Q  143 ggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||  | |||||  ||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  18181144 ggggcactgtacggcttaggaagactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 18181241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 415
Target Start/End: Original strand, 13024743 - 13025021
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||| ||| ||||||  | ||| |||| |||  | |||||||||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  13024743 tcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctactgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcc 13024842  T
Q  237 tgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttga 336  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| | ||  || || ||||| ||||||||||| ||    
T  13024843 tgcagctgcttaccaactcagagaaaactctaatcttctgatacccaatagctcttttgatatcagccctcagcccattttcaaacttgatacacttgga 13024942  T
Q  337 aaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
     |||||||| ||||| | | |||| || || || |||||  | | |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  13024943 gaactcagctgtctccgcactgtaatgggggtagaacttagcaagttccacgaacttagcagcataatcagtaacggac 13025021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 314 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 48810788 - 48810691
Alignment:
Q  314 ttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  48810788 ttctcaaatttgatgcacttggagaactcaacagtctcggcagtgtagtgcggataaaacttagccagctccacaaactttgcagcatactcggtcac 48810691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 406
Target Start/End: Original strand, 14145054 - 14145329
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttag-tcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||  | ||| |||||||| |||||  |||||||     
T  14145054 cccttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacctcttc-gctcactcatcaccttataatgagctttggtgccctcctca 14145152  T
Q  230 taaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatac 329  Q
    || ||||||||||  |||||||  |||| ||||| ||  |||| |||||| || || |||||||| || ||||| | ||| || |||||||| || ||||    
T  14145153 tagatcctgcaacgactcaccaaatcagggaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgatgtcagctctcaagccattctcaaactttatac 14145252  T
Q  330 actttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactca 406  Q
    | || || || ||||| ||||| | ||| || || || || |||||| | | |||||||||||| ||||||||||||    
T  14145253 atttggagaattcagctgtctccgcagtatattgggggtataactttgcaagttccacaaactttgcagcatactca 14145329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14261031 - 14260822
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| ||||||||||   |  |||||||| || ||||| || ||||| || |||    
T  14261031 cttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagctactcaccaactcagagaaattccttatcttttgatagccaatagccctcttgatatca 14260932  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | |||||  || ||||| || ||||| || || |||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||  | | |||||||||| | |||||||    
T  14260931 gctctcaaactattttcaaactttatacatttggagaactcagcagtctccgcagtatagtgaggatagaacttagcgagttccacaaacctcgcagcat 14260832  T
Q  402 actcagtcac 411  Q
    |||| |||||    
T  14260831 actccgtcac 14260822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16947431 - 16947108
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||| ||||| ||    ||||||||  || |||| |||  ||| || ||   ||||||||      
T  16947431 acaagcattactcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatttcaactggagcatctctcctcttgggccttctctcatcattcattctctgc 16947332  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || ||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  | | | |||| |||  | |||||||||||| || |||||||| |    
T  16947331 tttcccttgtcagcaggggcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttctctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctctt 16947232  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || || ||||| || |||||||  |||||||||| ||  ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || ||||| || || ||    
T  16947231 catagattctgcagctactcaccaattcagagaaaattctaatcttctgatacccaatggctcttttgatatcagccctcaacccattctcgaacttaat 16947132  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    |||||| || |||||||| |||||    
T  16947131 acacttggagaactcagctgtctc 16947108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26091757 - 26091434
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||   |||||||||  || |||| |||   ||||| ||  ||||  |||      
T  26091757 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgc 26091658  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || |    
T  26091657 tttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttctt 26091558  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || || ||||| ||  | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || |||||||| |||||    
T  26091557 catagattctgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcagccctcaacccattctcaaacttgat 26091458  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    |||||| || |||||||| |||||    
T  26091457 acacttggagaactcagctgtctc 26091434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 11527008 - 11526955
Alignment:
Q  358 gtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11527008 gtagtgcggataaaacttagccaactccacaaacttggcagcatactcagtcac 11526955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 12203519 - 12203379
Alignment:
Q  268 gatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcgga 367  Q
    |||||| || |||||||| || | |||||| |||||||||| ||| || ||||| || || |||||||| |||||||||||||  | ||| || || |||    
T  12203519 gatcttctgataaccaatggcccgcttaatatcagcacgcagaccattttcaaacttaatgcactttgagaactcagcagtcttagcagtataatgtgga 12203420  T
Q  368 taaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagt 408  Q
    ||||| ||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12203419 taaaattttgcaagctccacaaacttagcagcatactcagt 12203379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 14283230 - 14282955
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||||| |||||| || | | |||| |||  | |||||||||||| || || |||||||| |    
T  14283230 cccttatcagcaggggcactatacggcttcgggcgactctgctgtcccttattccttctctcactcatcaccttgtaatgagctttagtgtcctcctcat 14283131  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    | ||||||||||  || ||||  |||||||||| ||  |||| ||| || || ||  ||||||| || ||||| | ||| || |||||||| || |||||    
T  14283130 agatcctgcaacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttgctaccctatgactctcttgatgtcagctctcaagccattctcaaactttataca 14283031  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactca 406  Q
     || || || ||||| ||||| |  || | ||| || || |||||| | | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  14283030 tttggagaattcagctgtctccgcggtattgtgagggtagaactttgcaagttccacaaactttgcaacatactca 14282955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26115549 - 26115226
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||| |  ||||||||  || |||| |||   ||||| ||   |||  |||      
T  26115549 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagccggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcactcatcttctgc 26115450  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||| |  ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || |    
T  26115449 tttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttatcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttctt 26115350  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || || || || ||| | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| |||||||| || ||||| | ||| || |||||||| |||||    
T  26115349 catagattctacacctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatatccaatggctctcttgatgtcagccctcaatccattctcaaacttgat 26115250  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    |||||| || |||||||| |||||    
T  26115249 acacttggagaactcagctgtctc 26115226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 402
Target Start/End: Original strand, 13676909 - 13677109
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| || ||||| || || || |||||||| || |||||||  |||||||||| ||  ||||| || || ||||| |||||||| || ||     
T  13676909 cttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatcctgcagctactcaccaaatcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtcg 13677008  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | ||| || ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |  || ||||| || || |||||| | | |||||||||||| |||||||    
T  13677009 gctctcaagccattctctaacttgatacatttggagaactcagctgtctccgcggtatagtgggggtagaactttgcaagttccacaaacttagcagcat 13677108  T
Q  402 a 402  Q
    |    
T  13677109 a 13677109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 405
Target Start/End: Original strand, 21755811 - 21756079
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||| | || || ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||| | || || || ||||| |    
T  21755811 tcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattttgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttgatgtcttcttcataaattc 21755910  T
Q  237 tgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttga 336  Q
    | || ||| | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  21755911 tacacctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcagccctcaaaccattttcaaatttgatgcacttgga 21756010  T
Q  337 aaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     |||||||  ||||| | | |||| || ||||| ||| |  | | |||||||||||| |||||||||||    
T  21756011 gaactcagttgtctccgcactgtaatgaggatagaacgtagcaagttccacaaactttgcagcatactc 21756079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Original strand, 49155591 - 49155914
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||   |||||||||  || |||| |||   ||||| ||  |||| ||||      
T  49155591 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcctcacccatcctctgc 49155690  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||||  | ||| |||| ||| |||||| |||||||| ||||| || || |    
T  49155691 tttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttctt 49155790  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || || ||||| ||  | || | ||||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||| || || || || | ||| || |||||||| |||||    
T  49155791 catagattctgcatctattaactaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcggccctcaatccattctcaaacttgat 49155890  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    |||||| || |||||||| |||||    
T  49155891 acacttggagaactcagctgtctc 49155914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 11385285 - 11385011
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||||  ||||||| || ||||||  | |||||||| |||  |||||||||||||| || | ||| ||||| |    
T  11385285 cccttgtcagcaggggcactgtacggcttaggatgactctgttgtcccttacccctccgctcactcatcatcttgtaatgagcttttgaatcttcctcat 11385186  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    | || ||||| ||||| |||| |||||| |||  || |||||| || || ||||| || ||||| || || || | ||| || ||||| ||||| |||||    
T  11385185 agattctgcagctgcttaccaactcagaaaaagttctgatcttctgatagccaatggccctcttgatatcggccctcaacccattctcgaattttataca 11385086  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     || || || ||||| ||||| | ||| || || || || |||||  | | |||||| ||||| |||||||||||    
T  11385085 tttggagaattcagctgtctccgcagtatactgagggtagaacttagctagttccacgaacttcgcagcatactc 11385011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18050734 - 18050534
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |  |||||||  |||||||||| ||  ||||  ||||| || || |||||||| || ||||| |    
T  18050734 taatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacagcgactcaccaaatcagagaaaattctaatctgctggtatcctatggctctcttgatgtcagctc 18050635  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     ||| || |||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  18050634 tcaagccattctcaaactttatgcacttggagaattcagctgtctccggagcataatggggatagaactttgcaagctccacaaattttgcagcatactc 18050535  T
Q  406 a 406  Q
    |    
T  18050534 a 18050534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Original strand, 15627804 - 15627845
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15627804 atcccaagtacaagcgttactcttgtggcctttctcaccaca 15627845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 307 - 411
Target Start/End: Original strand, 18181307 - 18181411
Alignment:
Q  307 caaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactca 406  Q
    |||||||||||| || ||||| ||  | || ||||||||| |||| | ||| |||||||| || ||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||     
T  18181307 caaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaactcagcattctcagcagtatagtgcgggtagaactttgacagctccacgaacttggcagcatactct 18181406  T
Q  407 gtcac 411  Q
    |||||    
T  18181407 gtcac 18181411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 40924776 - 40924744
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40924776 acaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 40924744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 19812 - 20073
Alignment:
Q  113 tcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgag 212  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19812 tcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgag 19911  T
Q  213 ccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaacc 312  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19912 tcttggtatcctcctcatagatcctgcaactgctcaccagctcggagaaaactcggatcatctggtaaccaattgccctcttaatctcagcatgcaaacc 20011  T
Q  313 gttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaact 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20012 gttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaact 20073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 329
Target Start/End: Original strand, 2309 - 2619
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| | |||| |||| |||||||||||  ||||||| || |||    
T  2309 atccccatgacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcacacaatctcagtaggaacatctttcttcttagggcgtctatcatcaacc 2408  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2409 attctctattttcccttatcagcaagggcactgtaaggcttaggacgactctgttgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttgg 2508  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2509 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagaaaagactcggatcttctggtaaccaatttctctctttatctcagcacgcaaaccgttctc 2608  T
Q  319 aaatttgatac 329  Q
    |||||||||||    
T  2609 aaatttgatac 2619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 3871 - 4263
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| || | ||||||||| |||||||||||| | ||||| || |||    
T  3871 atccccaggacaagcattactcttgtggtctttcacaccataagtatagcagacaatttcagcaggagcatctttcttcttaggccgcctatcatcaacc 3970  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  3971 attctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaagacttaggacgactctgctgacctttggttttcctctcatttacaatcttgtaatgagtctagg 4070  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || || || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  4071 tatcctcctcgtaaatcctataactgctcaccagctcagaaaagacacgaatcttctagtaaccaatcgctcttttgatctcagcacgtaaaccattctc 4170  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     ||| |||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4171 gaatatgatgcatttcgaaaactcagcagtctctacagtgtagtgcggataaaactttgccaattccacaaacttggaagcatactctgtcac 4263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 15018 - 14639
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15018 ggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctct 14919  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14918 gtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctc 14819  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||  || || || |||||  ||||||  ||||  ||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| ||||  || || || ||||||||||||    
T  14818 ctaatagattctacaactattcaccaaatcaggaaaaactcggatttgttgatacccaattgccctcttaatatcaggccgtaatccattctcaaatttg 14719  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    || || || |||||||||||| |||| | ||  ||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14718 atgcatttagaaaactcagcaatctcagcagcatagtgtggatagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactc 14639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 11333 - 10954
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11333 ggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctct 11234  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11233 gtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggtaactttgttggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctc 11134  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||  || || || |||||  ||||||  ||||  ||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| ||||  || || || ||||||||||||    
T  11133 ctaatagattctacaactattcaccaaatcaggaaaaactcggatttgttgatacccaattgccctcttaatatcaggccgtaatccattctcaaatttg 11034  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    || || || |||||||||||| |||| | ||  ||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11033 atgcatttagaaaactcagcaatctcagcagcatagtgtggatagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactc 10954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 162 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1473 - 1220
Alignment:
Q  162 ggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaa 261  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1473 ggcgactctgttgacccttagctttccgttcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcataaatcctgcaactgctcaccagctcggagaa 1374  T
Q  262 aactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtag 361  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1373 aactctgatcttctggtaaccaatttccctcttaatctatgcacgtaacccgttctcaaatttgatgcactttgaaaactcagcagtctctggagtgtag 1274  T
Q  362 tgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1273 tgtggataaaactttgccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 1220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2247 - 2121
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2247 atccccaggacaagcattactcttgtggcccttgtcaccacaagaaaaacaaacaatctctacaggagcatccttcttcttcggccgtctatcttcgacc 2148  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggg 145  Q
    || |||| |||||||||||||||||||    
T  2147 atcctctgtttgcccttatcagcaggg 2121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 415
Target Start/End: Original strand, 36825 - 37214
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  36825 ggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacgatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctct 36924  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  36925 gtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggagactctgctggcccttagtcttccgctcatttacaaccttgtaatgagctttggtgtcctc 37024  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||| || || || ||  || ||||||  ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||    
T  37025 ctcatagattctacagttgttcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccaattgccctcttaatatcaggccgcaaaccattctcaaacttg 37124  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    || |||||||| |||| ||||||||| | ||  || ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37125 attcactttgagaacttagcagtctcagcagcataatgcggataaaactttgccaacttaacaaacttggcagcatactcagtcacggac 37214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 113 - 500
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  113 caggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 212  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  213 ctgttttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgccggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcc 312  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    ||||| || || || || ||| ||||||  | ||  ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  313 tcctcatagattctacagctgttcaccaaattaggaaaaactcggatctgttgatatccaattgccctcttaatatcaggccgtaaaccattctcgaact 412  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  413 tgatacacttcgaaaactcagcagtctcagcagcataatgtggatagaactttgccaactcaacaaacttggcagcatacccagtcac 500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 17961 - 17569
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||   || |||||| |||||  ||||  | || || || |||    
T  17961 atcccccggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaagaatagtagacaatctcaacagaagcatctttctttctagggcgcctctcatcaacc 17862  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| ||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  17861 attctctatttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctaacctttggcttttcgctcattcacgatcttgtaatgagtcttag 17762  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  17761 tatcctcctcataaattctgcaactactcaccagctcagaaaagacacgaatcttctggtaaccaattgctctcttaatctctacacgcaaaccattctc 17662  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17661 aaatttgatacactttgaaaattcagcaatctctgcagtatagtgctggtaaaactttgccaactccacgaacttggcagcatactctgtcac 17569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 63 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 66470 - 66118
Alignment:
Q  63 taaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagg 162  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||    
T  66470 taaaacagacaatctcaataggagcatccttcttccttggccgtctatcctcaaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagg 66371  T
Q  163 gcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaa 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||| |||| | ||| ||||||    
T  66370 gcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttcctcataaattctacagctgttcacgaactcggagaaa 66271  T
Q  263 actcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagt 362  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||| |    
T  66270 actcggatctgttggtatccaattgccctctttatatcaacacgcaatccattctcgaacttgatgcactttgagaactcagcagtctctgcagcgtaat 66171  T
Q  363 gcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||| |||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  66170 gcggatagaactatgccaactctacaaacttggcagcatactcagttacggac 66118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 69399 - 69366
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccac 59  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  69399 ggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccac 69366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 415
Target Start/End: Original strand, 63 - 452
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||    
T  63 ggacaaacattgcttttgtggcctttctcaccacaaatgaaacagacaatctccgcaagagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgacaatactct 162  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||    
T  163 atttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtgatgagctttggtgtcttc 262  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||| |||||||| || ||| ||||||  ||||  ||||||| |||||||||||| || |||||  ||||||| ||||  |||||||| ||||| || |||    
T  263 ctcataaatcctacagctgttcaccaaatcaggaaaaactctgatcttttggtatccgattgccatcttaatatcaggccgcaaaccattctcgaacttg 362  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| | ||  || || |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  363 atacacttcaaaaactcagcagtctcggcagcataatgtggataaaactttgccaactcaacaaatttggcagcatactcagtcacggac 452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 411
Target Start/End: Original strand, 104561 - 104938
Alignment:
Q  34 attactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgccc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||   ||||||||| |||||  ||||| | || || || | |||||||| ||| |||    
T  104561 attactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggccgcctctcatcaatcattctctgttttccc 104660  T
Q  134 ttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaa 233  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||    || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  104661 ttatcagcaggagcactataaggctttggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttagtatcctcctcataaa 104760  T
Q  234 tcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||    
T  104761 tcctgcaactgctcaccagctcagaaaaagtacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgatctcagcacgcaaaccattctcaaatttaatgcattt 104860  T
Q  334 tgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104861 agaaaactcaacagtctcagcagtgtagtgcggataaaacttagctagttccacaaacttggcagcatactcagtcac 104938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 398
Target Start/End: Original strand, 18970 - 19346
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||   |||||| || ||||| || ||  | ||||| || |||    
T  18970 atccccgggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatttcaacaggagcttctttctttttggggcgcctatcatcaacc 19069  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19070 attctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactttgc-gacctttagcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttgg 19168  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||    
T  19169 tatcctcctcataaatcctgcaactgctcatcagctcagaaaagacacgaatcttctggtaaccaattgctcttttga--tcagcacgtaaaccgttctc 19266  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcag 398  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||    
T  19267 gaatttgatacacttcgaaaactcaacagtctctgcagtataatgcggataaaactttgtcaactccacgaacttggcag 19346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 17487 - 17872
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |    
T  17487 ggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctat 17586  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17587 gtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccgtgtaatgagccttggtatcctc 17686  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||| ||||| ||||| ||  | ||||  ||||  ||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| | ||  | |||||| ||||| || |||    
T  17687 ctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgattgccctcttaatgtaaggcctcaaaccattctcgaacttg 17786  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    || || || || ||||||| |||||| | |   |||||| |||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17787 atgcatttcgacaactcaggagtctcagcaacatagtgcagatagaactttgccaactccaaaaacttggcagcatactcggtcac 17872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Original strand, 3766 - 4133
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||    
T  3766 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtag---catccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcag 3862  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || ||  |||||||    
T  3863 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataggtcctgca 3962  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  || |  |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | || |||    
T  3963 gctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgagaac 4062  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||| || ||||||   |  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4063 tcagcattctcagcagtatagtgcgggtagaactttgatagctccacaaacttggcagcatactctgtcac 4133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9427 - 9221
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  9427 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttctaaggccgcctatcttcgacc 9328  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9327 attctcggtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttaaggcgactctgctgacccttagtcttcggctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 9228  T
Q  219 tatcctc 225  Q
    |||||||    
T  9227 tatcctc 9221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 3869 - 4254
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    ||||||||| |||||  ||||  | || || || |||||| | |    
T  3869 ggacaagcattacttttgtggcctttctcaccacaagaatagcagacaatctgaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccatttttt 3968  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     ||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||||   |||||| || ||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3969 gtttacccttatcagtaggagcactgtaaggcttagcatgactctcctaacctttggcttttcgctcattcacgatcttgtaatgagtcttggtatcctc 4068  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||| |||||||    
T  4069 ctcataaattctgcaactgctcaccagctcagaaaagacacggatcttctggtaaccaattactctcttaatctaagcacgaaaacaattctaaaatttg 4168  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4169 atacactttgaaaattcagcagtctctgaagtatagtgcggataaaactttgccaactccacgaacttggcagcatactctgtcac 4254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 122141 - 121764
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||   |||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  122141 ctcttgtggcctttttcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttat 122042  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  122041 cagcaggggcactatagggcttagggcgactctattggcccttagtcgtccgctcatttacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattct 121942  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  |||||| |||||  ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || ||||  | |||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  121941 gcagctattcaccaactcaggaaaaactcggatctgttggtatccgattgccctctttatatcaggccacaaaccattctcgaacttgatacacttcgaa 121842  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||||||||||| | ||  || |||||||| |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  121841 aactcagcagtctcagcagcataatgcggatagaactttgccaactcaacaaacttggaagcatactcagtcacggac 121764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 405
Target Start/End: Original strand, 70882 - 71078
Alignment:
Q  209 tgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgca 308  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| | || || |||||||  |||||||||  || |||||| || || ||||| ||||| || || ||||| | ||    
T  70882 tgagcctttgtatcctcctcataaatcatacagctactcaccaattcagagaaatttctgatcttctgatacccaatggctcttttgatatcagctctca 70981  T
Q  309 aaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    | ||  | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| | | ||||   ||||| |||||||||||    
T  70982 agccactttcaaacttgatacatttggagaactcagctgtctccgcagtgtagtgaggataaaactttgcaagttccgtgaacttagcagcatactc 71078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 11703 - 11504
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    ||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||  |||||||||| |   |||||||| || || || |||||||| || ||||| |    
T  11703 taatgagccttagtgtcctcttcatatatcctgcagctgcttaccaaatcagagaaaattttaatcttttgataccctatggctctcttgatgtcagctc 11604  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     ||| || ||||| || |||||||| || |  |||||||  |||||    |||||||| || || |||||| | | |||||||||||| |||||||||||    
T  11603 tcaagccattctcgaacttgatacatttggtgaactcagttgtctccacggtgtagtgggggtagaactttgcaagttccacaaacttagcagcatactc 11504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 1927 - 1895
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1927 acaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 1895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 33 - 415
Target Start/End: Original strand, 448 - 819
Alignment:
Q  33 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcc 132  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  448 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcattcttcttcttaggtcgcctatcatcgaccattctctgtttgcc 547  T
Q  133 cttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaa 232  Q
    |||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  548 cttatcagcaggagcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcttcgtcataa 647  T
Q  233 atcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacact 332  Q
    || || || ||| |||||           ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||   ||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  648 attctacagctgttcacc-----------aactcggatctgttggtatccaattgccctctttatatcaagccgcaatccattctcgaacttgatgcact 736  T
Q  333 ttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  737 ttgagaactcagcagtctcagcagcgtaatgcggataaaaatttgccaactctacaaacttggcagcatactcagttacggac 819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 459 - 72
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  459 caggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaaacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 360  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
     | |||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  359 ttgtttgcccttatcagcaggggcaatataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcc 260  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || || || || || |||||  ||||||  ||||  ||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| || |  | |||||| ||||| || |    
T  259 tcttcatagattctacaactattcaccaaatcaggaaaaactcggatttgttgatacccaattgccctcttaatatcgggcctcaaaccattctcgaact 160  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||  | || || |||||||||||||| | ||  |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  159 tgatgtatttcgagaactcagcagtctcagcagcatagtgcgggtagaactttgccaactccacaaacttggcagcatactctgtcac 72  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 229829 - 229450
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  229829 ggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttattaggccgcctatcatcgaccattctct 229730  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  229729 gtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggtccttagtcttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctc 229630  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttg 325  Q
    ||| ||||| ||||| ||  | ||||  ||||  ||||||||||||| |||||| |  || || |||||||| ||||  | |||||| ||||  || |||    
T  229629 ctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatctgatcgccctcttaatgtcaggcctcaaaccattcttgaacttg 229530  T
Q  326 atacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    || || || || |||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  229529 atgcatttcgagaactcagcagtctcagcagtatagtgtggatagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactc 229450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 351
Target Start/End: Original strand, 252122 - 252271
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||  ||||| || || | ||| ||||| || || |||    
T  252122 cttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgcagctgcttaccaattcagagaaaattctaatcttctgatacctaatagctcttttgatatca 252221  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    || | ||  || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  252222 gccctcagtccattctcaaatttaatacacttggagaactcagctgtctc 252271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 5323 - 5710
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  5323 caggacaaacattactcttatggcccttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 5422  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5423 ctgtttgcccttatcagcaagggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcc 5522  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || || || || ||||| ||  ||||||  ||||  ||||||||||||| |||||| || || || |||||||| || |  | |||||| ||||| || |    
T  5523 tcatcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccattctcgaact 5622  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| || || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5623 tgatgcattttgagaactcagcagtctcagcagtatagtgtgggtagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactcggtcac 5710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 5)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 411
Target Start/End: Original strand, 14752 - 15136
Alignment:
Q  27 gacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctc 126  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||     
T  14752 gacaaacattactcttgtggccattctcgccacacttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcatatcatcgaccattctctg 14851  T
Q  127 tttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  14852 tttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaacctagtaatgagccttggtatcttcc 14951  T
Q  227 tcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttga 326  Q
    ||||| || ||||| ||  |||| |  ||||  ||||||||||||| |||||| || || || |||||||| || |    |||||| ||||| || ||||    
T  14952 tcgtagattctgcagctattcactaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtcgggcgtcaaaccattctcgaacttga 15051  T
Q  327 tacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    | || || || |||||||||||||| | ||  || |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15052 tgcatttcgagaactcagcagtctcagcagcataatgcggatagaactttgccaactccacaaacttggcagcatactctgtcac 15136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 5235 - 5627
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | |  | |||| |||||  |||||    | || ||        
T  5235 atccccaggacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagcaacaacatctttctttctaggcctcatctcatcatta 5334  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    | ||| | |||||||||||||||||| |||| |||| | || || ||||| |||||||||||    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5335 actctttgtttgcccttatcagcaggagcaccgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttag 5434  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||| ||||| || || |||||| ||||||||| |||||| ||    |||||||| | |||||||||||| | ||| ||||||||| |||| || |||||    
T  5435 tatcttcctcatatattctgcaattgctcaccaactcagaaaagttacggatcttctagtaaccaattgcccgcttgatctcagcatgcaagccattctc 5534  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||| |||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  5535 aaatttgatgcacttggagaactcagcagtctcggcagtgtagtgcggataaaacttagtcaactccacaaattttgcaacatattcagtcac 5627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 180640 - 180466
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||||| || |||||| || || || || ||||||||||| |||    
T  180640 cttgtaatgagccttcgtatcctcctcataaattctgcagctactcaccatttctgagaaaattctgatcttctgatatcctatggctctcttaatatca 180541  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttt 376  Q
    || | |||||| || || || ||||| || || || |||||||| ||||| |  |||||||| || |||||||||    
T  180540 gccctcaaaccattttctaacttgatgcatttggagaactcagctgtctccgctgtgtagtgtgggtaaaacttt 180466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 39134 - 38936
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||| |||  |||||| ||  ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||    
T  39134 cttgtaatgagctttagtatcttcctcatatatcctgcagctactcaccaactc--agaaaattctaatcttctggtacccaatggctctcttgatgtca 39037  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
     | | ||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |  || ||||| || || ||||||   | |||||||||||| |||||||    
T  39036 tctctcaagccattctcaaacttgatacatttggagaactcagctgtctccgcggtatagtgggggtagaactttgaaagttccacaaacttagcagcat 38937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 39308 - 39276
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39308 acaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 39276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14009 - 13622
Alignment:
Q  26 ggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctct 125  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  14009 ggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctct 13910  T
Q  126 ctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 225  Q
     ||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||    
T  13909 gtttgcccttatcatcaggggcactatagggcttagggcgactctgttggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctc 13810  T
Q  226 ctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatctttt--ggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |  || |  |||||||| |||| ||  |||| ||||| || |||||||| || |  | |||||| ||||| || |    
T  13809 ctcgtagatcctgcagctattcactaaatctggaaaaactcgaatctgttgcggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccattctcgaact 13710  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||  | ||  | ||||||||||| || | ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13709 tgatgtatttcaagaactcagcagtttcagcagtgtagtgtggatagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactcagtcac 13622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 411
Target Start/End: Original strand, 7194 - 7585
Alignment:
Q  20 tccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacca 119  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||   ||||||||| |||||  |||||   || || ||   ||    
T  7194 tccctaggacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcatcattca 7293  T
Q  120 ttctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggt 219  Q
    |||| |  || |||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| ||||||| |||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  7294 ttctttgcttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggtcgactttgctgactcttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagt 7393  T
Q  220 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctca 319  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  7394 atcttcctcatatatcctgcaactgctcaccagctcagaaaaattacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgatctcagcacgcaagccattctca 7493  T
Q  320 aatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||| ||||  || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  |||  |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  7494 aatttgatgcactaggagaactcagcagtctcagcagtatagtgcggataaaacttagccagctccacaaattttgcagcatattcagtcac 7585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 411
Target Start/End: Original strand, 14324 - 14715
Alignment:
Q  20 tccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacca 119  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||   ||||||||| |||||  |||||   || || ||   ||    
T  14324 tccctaggacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcatcattca 14423  T
Q  120 ttctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggt 219  Q
    |||| |  || |||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| ||||||| |||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14424 ttctttgcttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggtcgactttgctgactcttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagt 14523  T
Q  220 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctca 319  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  14524 atcttcctcatatatcctgcaactgctcaccagctcagaaaaattacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgatctcagcacgcaagccattctca 14623  T
Q  320 aatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||| ||||  || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  |||  |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  14624 aatttgatgcactaggagaactcagcagtctcagcagtatagtgcggataaaacttagccagctccacaaattttgcagcatattcagtcac 14715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 220 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 16306 - 16124
Alignment:
Q  220 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16306 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagaaaagtttcgaatcttctggtaaccaattgctctcttaatctcagctcgcaaaccattctca 16207  T
Q  320 aatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcata 402  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16206 aacttgatacactttgaaaactcagcagtctctgcagtgtagtgcggataaaactttgccaattccacgaacttggcagcata 16124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 185 - 411
Target Start/End: Original strand, 2715 - 2937
Alignment:
Q  185 ttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaa 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2715 ttccgctcatacacaatcttgtaatgagtctttgtatcctcctcataaatcctgcaactgctcaccagcttagaaaatactcggatcttttggtaaccaa 2814  T
Q  285 ttgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattc 384  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |    |||||||||||||| ||| || |||||||||||| || |||| ||    
T  2815 ttgctctcttgatctcagcacgtaaaccgttctcgaatttgatgcatttcg----ctcagcagtctctgcagtataatgcggataaaaccttgccaactc 2910  T
Q  385 cacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  2911 cacaaacttggcagcatactcagtcac 2937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 3189 - 3576
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |   |||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||    
T  3189 caggacaagcagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaagaagtaatctcagcaggaacatcctttttcttaggccgtctctcctcgaccatcct 3288  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||    
T  3289 ctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcc 3388  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    ||||  ||||| ||| |  |  ||||||  || |  ||||||||||||| |||||| || || || |||||||| || |  | |||||| ||||| || |    
T  3389 tccttataaattctgtagttattcaccaaatctggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccattctcgaact 3488  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || || || |||||| ||||||| | ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3489 tgatgcatttcgagaactcatcagtctcagcagtgtagtgtggatagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactcggtcac 3576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 405
Target Start/End: Original strand, 469 - 847
Alignment:
Q  27 gacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctc 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||||   |||| ||||||| ||||| ||  |||| || |||||||| ||||     
T  469 gacaagcagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcaacaggaacatcctttttcttgggtcgtctctcctcgaccatcctctg 568  T
Q  127 tttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcc 226  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  569 tttgcccttatcaacaggggaactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcc 668  T
Q  227 tcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttga 326  Q
    || ||||| ||||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| || ||  | |||||||| || |  | |||||| ||||| || ||||    
T  669 tcataaattctgcaactattcaccaactcggagaaaactcagatctgttggtatccgatccccctcttaatgtcgggcctcaaaccattctcgaacttga 768  T
Q  327 tacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    | || || || ||||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  769 tgcatttcgagaactcagcaatctcagcagtgtagtgtggatagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactc 847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15544 - 15179
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15544 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagatgatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttat 15445  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||| ||  | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||| || || |||||||| || || ||    
T  15444 cagctggggcactatagggcttagggcaactctgctggcgcttagtcttccactcatttacaacattgtaatgagctttcgtgtcctcctcatagattct 15345  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
     || ||| ||||||  ||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||||| ||||| || ||||| ||||||||     
T  15344 acagctgttcaccaaatcaggaaaaactcagatctgttggtatccaattgccctcttaatatcaggctgcaaaccattctcgaacttgatgcactttgag 15245  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacg 412  Q
    ||||||||         ||  || ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15244 aactcagc---------agcataatgcggataaaactttgccaactcaacaaacttggcagcatactaagtcacg 15179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 748 - 361
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||   |||||| |  ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  748 caggacaaacattactcttgtggtctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 649  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  648 ctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgcttgtccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatct 549  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    |||||||| ||||||||  |  |||| |  | || |||||||||||  | |||||| || || || ||||| || |  |  | |||||| ||||| || |    
T  548 tcctcgtagatcctgcagttattcactaaataagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgttgggcctcaaaccattctcgaact 449  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    | || || || || |||||| |||||||   |||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  448 ttatgcatttcgagaactcaccagtctcaacagtgtaatgtggatagaactttgccaactccacaaacttggcagcatactctgtcac 361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 139589 - 139202
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||   |||||| |  |||| |||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  139589 caggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcaagtaatctcagctggagtatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 139490  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  139489 ctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagcctttgtatct 139390  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    |||||||| |||||||| ||  |||| |  |||| ||||| ||||| || ||| || || || || ||||| || || |  | || ||| ||||| || |    
T  139389 tcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaattcggagctgttgatatccgatcgccctcttgatgtcgggcctcacaccattctcgaact 139290  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| ||  | || ||||||||| |||| | | | ||||| || || |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  139289 tgatgcatctcgagaactcagcattctcagcaatatagtgtgggtagaactttgccaattccacgaacttgtcagcatactccgtcac 139202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 175 - 561
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||   ||||||    ||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  175 caggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcaagtaatctcaactggagcatccctcttcttagggcgcctatcatcgaccattct 274  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  275 ctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttaga-cgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagcctttgtttct 373  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    |||||||| |||||||| ||  |||| |  |||| ||||||||||| || |||||| || || || ||||| || || |  |||||||| ||||| || |    
T  374 tcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggagctgttggtatccgatcgccctcttgatgtcgggccgcaaaccattctcgaact 473  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| ||  | || ||||| ||| | || | | | ||||| || || ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  474 tgatgcatctcgagaactcggcattttcagcaatatagtgtgggtagaactttgtcaattccacgaacttggcaccatactccgtcac 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 15730 - 16122
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | |  | |||| |||||  | ||| | || || ||        
T  15730 atccccaggacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagcaacaacatctttcttgctgggccgcctctcatcatta 15829  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    | ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| ||| ||  |||    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15830 actctttgtttgcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgcggaaacttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttag 15929  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctct-cttaatctcagcacgcaaaccgttct 317  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||   |||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||| || ||||    
T  15930 tatcctcctcatagattctgcaactgctcaccaactcagaaaaattacggatcttctggtaaccaattt-tctgcttgatcttagcacgcaagccattct 16028  T
Q  318 caaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16029 caaatttgatgcatttagaaaactcagcagtctcagcagtgtagtgcggataaaacttagccaactccacaaactttgcaacatactcagtcac 16122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1057 - 684
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||| |||||||||| |||||| | ||||||  |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| || || ||||| |||| | ||| |||||    
T  1057 ctcttgcggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatctcagtaggaacatccttcttcttaggccgtctttcctctaccatcctctgtgtgcgcttat 958  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    ||||||||||||| ||  | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || || || ||    
T  957 cagcaggggcactatagggcttagggcaactctgttggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcctcatcatagattct 858  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
     || ||  ||||||  |  |  ||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| || |||||     
T  857 acagctattcaccaaatatggaaaaactcggatctgttggtatccaaacgccctcttaatatcaggccgcaaaccattctcaaacttgatgcattttgag 758  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||| ||||||| | ||| || || || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  757 aactcaacagtctcagcagtataatgtgggtaaaactttgccaactccacgaacttggcagtatactcggtcac 684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 405
Target Start/End: Original strand, 204 - 585
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  | ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  204 caggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggcttcctatcatcgaccattct 303  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  304 ctgcttgcccttatctgcaggggcactataaggtttagggcgactctgctggctcttggtcttcttctcattaacaatcttgtaatgagctttgatatcc 403  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || || || |||||||| ||  |||| |  |||  |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| || |  | |||||| ||||| || |    
T  404 tcttcatagatcctgcagctattcactaaatcaacgaaaactcggatctgttggtatccgattgccctcttaatgtcgggcctcaaaccattctcgaact 503  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||| ||  | || |||||||||||||| | ||  ||||  || || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  504 tgatgcatgtcgagaactcagcagtctcagcagcatagttggggtagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactc 585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13103 - 12722
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  | ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  13103 caggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggcttcctatcatcgaccattct 13004  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13003 ctgcttgcccttatctgcaggggcactataaggtttagggcgactctgctggctcttggtcttcttctcattaacaatcttgtaatgagctttgatatcc 12904  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || || || |||||||| ||  |||| |  |||  |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| || |  | |||||| ||||| || |    
T  12903 tcttcatagatcctgcagctattcactaaatcaacgaaaactcggatctgttggtatccgattgccctcttaatgtcgggcctcaaaccattctcgaact 12804  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||| ||  | || |||||||||||||| | ||  ||||  || || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12803 tgatgcatgtcgagaactcagcagtctcagcagcatagttggggtagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactc 12722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 41480 - 41864
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  41480 caggacaaacattgcttttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctc---agtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 41576  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || |||| |||||||||| ||||  | ||||| | ||||||||| || ||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  41577 ctgtttccctttattagcaggggcaatgtacggcttaggacaactctgctgtccattgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtattc 41676  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || || || |||||||| ||  | ||||  |  |  |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | ||| || ||||| || |    
T  41677 tcttcatagatcctgcagctattgaccaaattcggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaagccattctcgaact 41776  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| ||  | || ||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  41777 tgatgcatctcgagaactcagcattctcaggagtatagtgcgggtaaaacttcgccacctcaacaaacttggcagcatactcagtcac 41864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 171443 - 171831
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||   ||||||    ||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||||    
T  171443 caggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgtaacaagtaatctcaactggagcatccttcttctttggccgcctatcaacgaccattct 171542  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  171543 ctgtttgcccttatcagcaggggcgctatagggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatct 171642  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    |||||||| || ||  | ||  |||| |  |||  ||||||  |||||| |||||| || || || ||||| || || |  | |||||| ||||| ||||    
T  171643 tcctcgtagattctatagctattcactaaatcaacgaaaacatggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaatt 171742  T
Q  324 tgatacactttga-aaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    | || || || || ||||||||||||||| | ||  || |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  171743 taatgcatttcgagaaactcagcagtctcagcagcataatgcggatagaactttgccaactccacaaacttggcagcatactctgtcac 171831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40491 - 40270
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||| | ||||||||| |||||  | ||  | ||||| || |||    
T  40491 atccccaggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaagtatagaattcaatctcagcaggagcatctttctttctcgggcgcctatcatcaacc 40392  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40391 actctctgttttcccttatcagcaggggcactgtaaggcttaggacgactctgttgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttgg 40292  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40291 tatcctcctcgtaaatcctgca 40270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 335 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40265 - 40189
Alignment:
Q  335 gaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40265 gaaaactcagtagtctctgcagtgtaatgcggataaaactttgccaattccacaaacttggcagcatactctgtcac 40189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 216404 - 216012
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | |  | |||| |||||  |||||   || |  ||   |    
T  216404 atccctaggacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagcaacatcatctttctttctaggcctccttttatcattc 216305  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    | ||| |  || |||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| |||||||||||    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  216304 aatctttgcttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttag 216205  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||||| ||| || ||  |||||||||||| ||||||||| ||    |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||    
T  216204 tatccttctcatatattatgcaactgctcagcagctcagaaaagttacggatcttctggtaaccaattgcccacttgatctcagcacgcaagccattctc 216105  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  216104 aaaattgatgcacttggagaactcagcagtctcggcagtgtagtgcggataaaacttagccagctccacaaattttgcagcatattcagtcac 216012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Original strand, 1302 - 1507
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   |||||| ||| ||||  | ||  | ||||| || |||    
T  1302 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtataacaaacaatctcaacaggagcttccatctttctcgggcgcctatcatcaacc 1401  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  1402 attctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttagggcgactctgttggcccttggtcttccgttcattcacaatcttgtaatgagccttcg 1501  T
Q  219 tatcct 224  Q
    ||||||    
T  1502 tatcct 1507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 131 - 411
Target Start/End: Original strand, 50 - 329
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| |||||||| |   | |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  50 cccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgaccttgcct-ttcctctcattcacaaccttgtaatgagctttggtatcttcctcat 148  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||| ||    ||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  149 agattttgcaactgctcaccagctcagaaaagttacggattttctggtaaccaattgcccgcttgatctcagcacgcaagccattctcaaatttgatgca 248  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  249 cttagaaaactcagtagtctcagcagtgtagtgcggataaaacttagccagctccacaaattttgcagcatattcagtcac 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 188 - 404
Target Start/End: Original strand, 11256 - 11471
Alignment:
Q  188 cgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| | |||||||||||    
T  11256 cgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcacaaattctgcaaatgctcaccagcttagaaaagacacggatcttctagtaaccaattg 11355  T
Q  288 ctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccac 387  Q
    |||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||| || ||||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||    
T  11356 ctcttttgatctcagtacgtaaaccgttctcgaattggatacatttcgaaaactcagaag-ctctgcagtataatggggataaaactttgccaattccac 11454  T
Q  388 aaacttggcagcatact 404  Q
     ||||||||||||||||    
T  11455 gaacttggcagcatact 11471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Original strand, 11108 - 11237
Alignment:
Q  22 cccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccatt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||| || |||||  ||||  ||||||| || ||||||    
T  11108 cccaggacaagcattactcttgtggcatttctcaccataagtataacagacaatctcaacaggagcttctttctttctagggcgtctatcatcaaccatt 11207  T
Q  122 ctctctttgcccttatcagcaggggcactg 151  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  11208 ctctgtttacccttatcagtaggggcactg 11237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 417 - 133
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  | ||||| |||||||| || ||||||  | |||||||| |||  | |||||||||||| || | ||| |||||||    
T  417 cccttgtcagcagggggactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcgt 318  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    | || ||||| ||||| |||| |||||| |||  || |||||| || || ||||| || ||||| ||  |||| | ||| || ||||| ||||| |||||    
T  317 agattctgcagctgcttaccaactcagaaaaagttctgatcttctgatagccaatggccctcttgataacagccctcaacccattctcgaattttataca 218  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||| || || |||||  | | ||| || ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  217 cttggagaattcagctgtctccgcagtatagtgagggtagaacttagctagttctacgaactttgcagcatactctgtgacggac 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28906 - 28539
Alignment:
Q  25 aggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctc 124  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||||  | |||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  28906 aggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatcttagcaggaacatccttcttcttaggccgtctctcctcgaccattctc 28807  T
Q  125 tctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcct 224  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||    
T  28806 tgtttgcccttatcaacaggggcactatatggcttagggcaacactgctggcccttagtcttctgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcct 28707  T
Q  225 cctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaattt 324  Q
    ||||||| || ||||| ||| |||| |  || |  |||| |||||||| |||||| || || || |||||||| || |  | |||||| ||||| || ||    
T  28706 cctcgtagattctgcagctgttcactaaatctggaaaaattcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccattctcgaactt 28607  T
Q  325 gatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaact 392  Q
    ||| || || || |||||||||||||| | ||| || || ||||| |||||| |||| ||||| ||||    
T  28606 gatgcatttcgagaactcagcagtctcagaagtataatgtggatagaactttgccaactccacgaact 28539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Original strand, 11456 - 11722
Alignment:
Q  127 tttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||| |||||||||||    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  11456 tttgcccttatcagcaggggcactataaggcttgggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcc 11555  T
Q  227 tcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttga 326  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| || || ||||||||||    
T  11556 tcatatattctgcaactgctcaccagctcagaaaagttacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgatctcagcacacaagccattatcaaatttga 11655  T
Q  327 tacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaactt 393  Q
    | ||||| || |||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||    
T  11656 tgcacttagagaactcaacagtctcagcagtgtagtgcagataaaacttaaccagctccacaaactt 11722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 131 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14137 - 13857
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | || || ||||| |||||||||||    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  14137 cccttatcatcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcat 14038  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||| ||     |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||    
T  14037 atattctgcaactgctcaccagcttagaaaagttatggatcttttggtaaccaattgcccgcttgatctcagcacacaagccattctcaaatttgatgca 13938  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||| || |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||  |||  |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  13937 cttggagaactcagctgtctcaacagtgtagtgcggataaaacttagccagctccacaaattttgcagcatattcagtcac 13857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 14249 - 14205
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagt 63  Q
    |||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||    
T  14249 atccccaggacaagcattactcctatagtctttctcaccacaagt 14205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23517 - 23125
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | |  | |||| || ||  |||||   || || ||   |    
T  23517 atccccaggacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagcaacaacatctttatttctaggcctcctctcatcattc 23418  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| | || || ||| | | |||||| ||    |||| ||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  23417 aatctttgttttcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgagtttactgacctttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgacccttag 23318  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||| ||||| || || ||||||||| |||| | |||||| |||   |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||    
T  23317 tatcttcctcatatattctgcaactgttcactaactcagaaaaattacggatcttctggtaaccaattgctcgcttgatctcagcacgcaagccattctc 23218  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| |||| ||||| ||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  23217 aaatctgatgcacttagaaaattcagcagtctcaaaagtatagtgcggataaaacttagccaactccacaaactttgccgcatattcagtcac 23125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 350
Target Start/End: Original strand, 153995 - 154143
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||   ||  ||||| || |||||||| |||||||| || |||    
T  153995 cttgtaatgagctttcgtctcctcctcataaatcctacagctgcttaccaactcagagaagtttctaatcttctgataaccaatggctctcttgatgtca 154094  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtct 350  Q
    || | ||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  154095 gctctcaagccattctcaaacttgatacacttggagaactcagctgtct 154143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 7758 - 7371
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  | ||||| ||||| || | ||||| | |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  7758 caggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagtagccttattctttggccgcctatcgtcgaccattct 7659  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  7658 ctatttgcctttatcagcaggggcactataaggtttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcc 7559  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || || || ||||| ||  || |||| |  |||| || ||||||||||| |||||| || || || ||||| || || |  | || ||| |  || || |    
T  7558 tcttcatagatcctacagatgttcactaaatcagcgacaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtcgggcctcagaccatattcgaact 7459  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| || || || |||||||||||| | | ||  ||||| || || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7458 tgatgcatttcgagaactcagcagtcccagcagcatagtgtgggtagaactttgccaactccacgaacttggcagcatactctgtcac 7371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 57598 - 57265
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||   ||||||||| |||||  |||||   || || ||   |    
T  57598 atcccaaggacaagcattactcttatggcctttctcgccacaagtatagtaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcatcattc 57499  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    ||||| |  || |||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| |||||||| ||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  57498 attctttgcttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacctttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttag 57399  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctc 318  Q
    |||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  57398 tatcttcctcatatattctacaactgctcaccagctcagaaaagttacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgatctcagcatgcaaaccattctc 57299  T
Q  319 aaatttgatacactttgaaaa-ctcagcagtctc 351  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  57298 aaatttgatgcatttagaaaatctcagcagtctc 57265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16478 - 16201
Alignment:
Q  134 ttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaa 233  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | || || ||||||||||||| ||||  | |||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| ||||| || |    
T  16478 ttatcagcaggagcactataaggctttggacgactctgctgactcttacccctccgctcactcataaccttgtaatgagctttggtatcttcctcataga 16379  T
Q  234 tcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactt 333  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||     ||||||| || || |||||  ||| ||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  16378 tcctgcaacttctcaccaattcagaaaattaatggatcttctgctatccaatgactcgcttgatctcagcgcgcaagccattctcaaacttaatacactt 16279  T
Q  334 tgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     || || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16278 ggagaattcagcagtctcagcagtgtagtgtggataaaacttagccaattccacaaacttagcagcatactcggtcac 16201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 16589 - 16552
Alignment:
Q  23 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16589 ccaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccaca 16552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 231 - 415
Target Start/End: Original strand, 36315 - 36499
Alignment:
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  36315 aaatcctgcaactgctcaccagctaagaaaagacacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgatatcagcacgcaaaccattctcaaacttgatgca 36414  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    ||| || ||||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  36415 cttggagaactcagcaatctcagcagtgtaatgcgcataaaacttagccaactccacaaacttcgcaacatactcggtcacggac 36499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Original strand, 8583 - 8971
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||  |||| || ||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||| | ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  8583 caggacagacattgcttttgtggcctctcccaccacaattgaaacacacaatctcggtag---catccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcct 8679  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || |||||||  |||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||   ||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||     
T  8680 ctgtttccctttatcagttggggcactgtacggcttaggacgactctgatgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatct 8779  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || || || |||||||| ||  | ||||  || |  |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | ||||||||| || || |    
T  8780 tcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttgtcgaact 8879  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    | || || || ||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8880 taatgcatttcgaaaactcagcagtctctgtagcataatgcggataaaacttcgccaactcaacaaacttggcagcatactcagtcacggac 8971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 311 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 6694 - 6594
Alignment:
Q  311 ccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtca 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6694 ccgttctcaaacttgatacacttcgaaaactcagcagtctctagaatgtagtgcggataaaactttgccaattccacaaacttggcagcatactcagtca 6595  T
Q  411 c 411  Q
    |    
T  6594 c 6594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Original strand, 10710 - 11076
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcag 140  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  10710 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctc---agtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcag 10806  T
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  10807 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcccctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgca 10906  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  || | ||||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||| ||||| || ||||| ||  | || |||    
T  10907 gctattgaccaaatccg-gaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcggacctcaaaccattctcgaacttgatgcatctcgagaac 11005  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||| || |||| | ||| || ||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11006 tcaacattctcagcagtataatgcgggtaaaacttcgccaactcgacaaacttggcagcatactcagtcac 11076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 375
Target Start/End: Original strand, 6539 - 6787
Alignment:
Q  127 tttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcc 226  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| | || || | ||| || ||||||||    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||    
T  6539 tttgcccttatcagccggagcactgtaaggttttggacaactttgttgacccttgactttccgctcattcacaaccttgtaatgatccttagtatcttcc 6638  T
Q  227 tcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttga 326  Q
    || || || || ||||| |||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||| ||   ||| || ||| |||| || ||||||||||||||||    
T  6639 tcatatattctacaacttctcaccagctcagaaaagttacggatcttctggtaaccaatggcctgcttgatatcaacacgtaagccgttctcaaatttga 6738  T
Q  327 tacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaactt 375  Q
    | ||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6739 tgcacttggagaactcagcagtctcggtagtgtagtgcggataaaactt 6787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 405
Target Start/End: Original strand, 15575 - 15778
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || || ||||| || || ||||  |||||||||  || |||||| || || ||||| |||||||| || |||    
T  15575 cttgtaatgagctttcgtttcctcctcatagattctgcagctacttaccaattcagagaaatttctgatcttctgatacccaatggctctcttgatgtca 15674  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | ||| || |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| | ||| || || || || |||||  | | |||||||||||| |||||||    
T  15675 gctctcaagccattctcaaactttatacatttggagaattcagctgtctcagcagtataatgagggtagaacttagcaagttccacaaactttgcagcat 15774  T
Q  402 actc 405  Q
    ||||    
T  15775 actc 15778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23273 - 22890
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| | || ||  || |||||  |||||  ||| || ||   || ||||| |    
T  23273 acaagcattactcttatggcctttctcaccaaaagtataacaaacaacctcagcagtagtctctttctttctaggccttctctcatcattcaatctctgt 23174  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||||||    |||   ||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||| ||||    
T  23173 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattttgctgatttctaggtctcctctcattcacagccttgtaatgagctttagtatcttcct 23074  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || ||  |||| || ||||||| |||||| ||    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||    
T  23073 catagattttgcagctactcaccaactcagaaaagttacggatcttttgatacccaatggccctcttgatctcagcacgcaagccattttcaaacttgat 22974  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     ||||| || ||||||||| |||| |  ||||| || |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22973 gcacttggagaactcagcaatctcagctgtgtaatgtggataaaacttagccaactccacaaactttgcagcatattcagtcac 22890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9331 - 8942
Alignment:
Q  23 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattc 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| | || || ||| |||||  |||||   || || ||   || ||    
T  9331 ccagtacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagtatagcaaacaatctcagtagtagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcaatc 9232  T
Q  123 tctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatc 222  Q
    | | ||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||| || | || |||  | |||   ||  ||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  9231 tttgtttacccttatcagcaggagcactataaggcttagggagattttgttgattcctaggtctcttctcattcacagccttgtaatgagctttagtatc 9132  T
Q  223 ctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaat 322  Q
     ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||    |||||||| || || |||||  |   ||| |||||| |||||||||| ||||||||     
T  9131 ttcctcatagattctgcaactgctcaccagttcagaaaagtaacggatcttctgatacccaataacctgcttgatctcaacacgcaaaccattctcaaac 9032  T
Q  323 ttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggat-aaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||| ||||| || |||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||  |||  ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9031 ttgatgcacttggagaacttagcagtctcagtagtgtagtgaggattaaaacttagccagctccacaaactttgcagcatattcagtcac 8942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10134 - 10018
Alignment:
Q  27 gacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctc 126  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  10134 gacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctctg 10035  T
Q  127 tttgcccttatcagcag 143  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  10034 ttttcccttgtcagcag 10018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 424633 - 424837
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||| |||||||  | || || |||||||| | ||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||||  |    
T  424633 caggacaaacattgcttttgtggcctttcacaccacagttgaagcacacaatctcagtaggagcacccttcttcgtaggccgcctatcatcgaccatatt 424732  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
     | ||| || ||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  424733 ttgtttccctttatcagcaggggcattgtacggcttaggacgactatgctgtcccttgcccttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcc 424832  T
Q  224 tcctc 228  Q
    |||||    
T  424833 tcctc 424837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 406
Target Start/End: Original strand, 203813 - 204088
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttag-tcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||  | ||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  203813 cccttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacctcttc-gctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctca 203911  T
Q  230 taaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatac 329  Q
    || ||||||||||  || ||||  |||||||||| ||  |||| |||||| || || |||||||| || ||||| | ||| || |||||||| || ||||    
T  203912 tagatcctgcaacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtaccctatggctctcttgatatcagctctcaagccattctcaaactttatac 204011  T
Q  330 actttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactca 406  Q
    | || || || ||||| ||||| | ||| ||||| || || |||||| | | |||||||||||| ||||||||||||    
T  204012 atttggagaattcagctgtctccgcagtatagtgagggtagaactttacaagttccacaaactttgcagcatactca 204088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1085
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||| | |||||||||  || |||| |||   ||||| ||   |||| ||| |    
T  1462 acaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgt 1363  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||    ||| |||| |||  | |||||||||||| || || || ||||    
T  1362 tttcccttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacctctcctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcct 1263  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | || ||||| || ||||| |||| ||||||||| |||| |||||| || || || || ||||| || || ||||| | |||||| || ||||| |||||    
T  1262 catatatcctacagctgcttaccaactcagagaagactctgatcttctgataccctatagctcttttgatatcagccctcaaaccattttcaaacttgat 1163  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    |||||| || |||||||| ||||| | | |||| || || || |||||  | | |||||||||||| |||||||||||    
T  1162 acacttggagaactcagctgtctccgcactgtaatgagggtagaacttagcaagttccacaaacttagcagcatactc 1085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 372
Target Start/End: Original strand, 5520 - 5761
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    |||||||||||| |  |||||||| | ||  | ||||| ||||||| | ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  5520 cccttatcagcaagaacactgtaaggctttagacgactttgctgactcctacccttcctctcattcacaaccttgtaatgagctttcgtatcttcctcat 5619  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||| || || ||||| || | ||| |||||||||||| | || ||| |||||||||| ||    
T  5620 agattctgcaactgctcaccagttcagaaaagtcacggatcttctgatatccaatggcccacttgatctcagcacgcgagccattcacaaatttgatgca 5719  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaa 372  Q
    ||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5720 cttggcaaactcagcagtctcatcagtgtagtgcggataaaa 5761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Original strand, 5408 - 5451
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaag 62  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5408 atccccagtacaagcattactcttgtggcctttcacaccacaag 5451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 55329 - 55713
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||  | || || ||||| ||   || | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  55329 caggacaaccattgctcttgtggccttttccaccacagttgaagcacacaatttc---agaaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 55425  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| || || ||   ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  55426 ctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcctttgcccttcttctcattcaccatcttgtaatgagccttagtatct 55525  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    |||||||| || ||||| ||  | ||||  || |  ||||  |  |||| | | |  ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || |    
T  55526 tcctcgtagattctgcagctattaaccaaatccggaaaaatcctaatctgtcgatgcccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaact 55625  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    | || || || ||||||||||||| ||||| ||  || ||||| ||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  55626 taatgcatttcgaaaactcagcagcctctgcagcataatgcgggtaaaactttgccaactcaacgaacttggcagcatactcagtcac 55713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 411
Target Start/End: Original strand, 11891 - 12161
Alignment:
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  11891 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgctcttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgca 11990  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  || |  |||||||  |||| |||||| ||||| || ||||| || || |  |   |||| ||||| || ||||| ||  | || |||    
T  11991 gctattgaccaaatccggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggccttcaaccattctcgaacttgatgcatctcgagaac 12090  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||| || |||| | ||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12091 tcaacattctcagcagtatagtgcgggtaaaacttcgccaactcaacaaacttggcagcatactcagtcac 12161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 411
Target Start/End: Original strand, 21419 - 21689
Alignment:
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  21419 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgctcttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgca 21518  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||  | ||||  || |  |||||||  | || |||||| ||||| || ||||| || || |  | |||||| ||||| || ||||| ||  | || |||    
T  21519 gctattgaccaaatccggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtcgggcctcaaaccattctcgaacttgatgcatctcgagaac 21618  T
Q  341 tcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||| || |||| | ||| |||||||| ||||||||  ||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21619 tcaacattctcagcagtatagtgcgggtaaaacttcgccaacaaaacaaacttggcagcatactcagtcac 21689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 120
Target Start/End: Original strand, 11811 - 11887
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccat 120  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  11811 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctc---agtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccat 11887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 120
Target Start/End: Original strand, 21339 - 21415
Alignment:
Q  41 ttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccat 120  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  21339 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctc---agtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccat 21415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 404
Target Start/End: Original strand, 48990 - 49367
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |  | ||||| | ||| ||   || ||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  48990 caggacaaccattgctcttgtggcctttcccaccatagttgaaacacaaaatttc---agaagcatccttcttcttaggccgcctatcatcggccattct 49086  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || ||||||| ||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  49087 ctgtttccctttatcagtaggggcattgtacggtttaggacgactctgctgtcccttgcccttcttctcattcaccatcttgtaatgagccttagtatct 49186  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    |||||||| || ||||| ||  | ||||  || |  ||||  |  |||| | | |  ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || |    
T  49187 tcctcgtagattctgcagctattaaccaaatccgtaaaaatcctaatctgtcgatgcccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaact 49286  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatact 404  Q
    | || || || ||||||||||||||||||| ||  || || || ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  49287 taatgcatttcgaaaactcagcagtctctgcagcataatgtgggtaaaactttgccaactcaacaaacttggcagcatact 49367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 162808 - 162609
Alignment:
Q  203 ttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcag 302  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||  ||    ||||||||||| || |  ||||| | ||| |||||||    
T  162808 ttgtaatgtgctttggtatcctcctcatagattctgcaactgctcactagttcagtcaatttacggatcttttgatatctgattgcccgcttgatctcag 162709  T
Q  303 cacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcata 402  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||| |||||  ||||||| ||  ||||   ||||||||| |||||||||||  |||  |||| |||||| ||||||||    
T  162708 cacgcaagccactttcaaatttgatgcacttgaaaaactcggcgttctcaacagtgtagtgtggataaaacttagccagctccataaactttgcagcata 162609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1600 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold1600
Description:

Target: scaffold1600; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 348
Target Start/End: Original strand, 498 - 715
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    |||||||||||||| || |||||| | || |||||||| ||||||||||||   |||| |||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||| |    
T  498 cccttatcagcaggagcgctgtaaggctttgggcgactttgctgacccttacctttcctctcactcacagccttgtaatgagctttagtatcctcctcat 597  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    | |  |||||||||| |||||| ||||| ||    ||||||||||| || ||||| ||  |||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||    
T  598 agactctgcaactgcacaccagttcagaaaagttacggatcttttgatatccaatggccatcttgatctcatcacgcaagccattctcaaatttgatgca 697  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagt 348  Q
    ||| || |||||||||||    
T  698 cttggagaactcagcagt 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1600; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Original strand, 400 - 450
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctc 78  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||    
T  400 acaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagtatagcaaacaatctc 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 405
Target Start/End: Original strand, 2237 - 2457
Alignment:
Q  185 ttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaa 284  Q
    |||| ||| |||| || |||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||  ||||| |||   |||||||| |  || ||||    
T  2237 ttcctctccttcaaaaccttgtaatgagctttcgtatcctcctcatagattctgcaactactcaccaattcagaaaaatgacggatcttctaatatccaa 2336  T
Q  285 ttgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattc 384  Q
    |  ||| ||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| || || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||  ||    
T  2337 tgcctcgcttgatctcagcacgcaagccattctcaaacttaatgcacttggagaattcagcagtctctgcagtgtagtgtggataaaacttagccagctc 2436  T
Q  385 cacaaacttggcagcatactc 405  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  2437 cacaaacttagcagcatactc 2457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 411
Target Start/End: Original strand, 2431 - 2711
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||||| ||    ||||  | ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |    
T  2431 cccttatcagccggagcactgtaaggcttaggacgactctactagttcttacccctccgctcattcatgatcttataatgagctttggtctcttcctcat 2530  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    |||||||||| || || |||| ||| || ||     ||||| | || || | |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  2531 aaatcctgcagctactaaccaactctgaaaactgatggatcctctgatatctaattgcttgcttaatctcagcacgcaaaccattctcaaatttaatgca 2630  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||| ||||| ||||| |||||   | | || |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2631 cttagaaaattcagctgtctcatcattataatgcgaataaaacttttccaactccacaaacttagcagcatactccgtcac 2711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 268 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18094 - 17951
Alignment:
Q  268 gatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcgga 367  Q
    |||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||   | |||||||||||    
T  18094 gatcttctgatatccaattgctcgcttaatctcagcacgcaagccattctcaaacttgatgcacttcgaaaatgcagcagtctcattattgtagtgcgga 17995  T
Q  368 taaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  17994 taaaactttaccaactccacaaacttagcagtatactctgtcac 17951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 411
Target Start/End: Original strand, 22586 - 22956
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||   | || |||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  22586 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctct---gcagtatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 22682  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| | |||   |||||  |||||||| | |||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  22683 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtctcttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccatcgtatcctcttcgtagatcct 22782  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  22783 gcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 22882  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22883 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcac 22956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 411
Target Start/End: Original strand, 7575 - 7945
Alignment:
Q  38 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||   | || |||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || || |    
T  7575 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctct---gcagtatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 7671  T
Q  138 cagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 237  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| | |||   |||||  |||||||| | |||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  7672 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtctcttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccatcgtatcctcttcgtagatcct 7771  T
Q  238 gcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa 337  Q
    ||| ||  | ||||  ||    |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| || |  | |||||||||||| || ||||| ||  | ||     
T  7772 gcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtcgggcctcaaaccgttctcgaacttgatgcatctcgag 7871  T
Q  338 aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7872 aactcagcattctctgcagtatagtgcggatagaacttagacagctccacgaacttggcagcatactctgtcac 7945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 269 - 415
Target Start/End: Original strand, 1 - 147
Alignment:
Q  269 atcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggat 368  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||  |||||| | ||  || |||||||    
T  1 atctgttggtatccaattgccctcttaatatcaggccgcaaaccattctcgaacttgatgcactttgagaactcaatagtctcagcagcataatgcggat 100  T
Q  369 aaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 aaaactttgccaactcaacaaacttggcagcatactcagtcacggac 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 415
Target Start/End: Original strand, 11415 - 11693
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  11415 tcagcaggagcactataaggcttaggacgaatctgctgacccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcataaatcc 11514  T
Q  237 tgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttga 336  Q
    |||| ||| | |||| ||||||||| |||| |||||  || || |||||  |||||||||| ||||| | ||| || || ||||||||||||||| | ||    
T  11515 tgcagctgtttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaataactctcttaatatcagctctcaacccattttcaaatttgatacacctgga 11614  T
Q  337 aaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
     |||||||| ||||| | | |||| || || || |||||  | | |||||| ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  11615 gaactcagctgtctccgcactgtaatgagggtagaacttagcaagttccacgaacttagcagcatactccgtaacggac 11693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 415
Target Start/End: Original strand, 17686 - 17955
Alignment:
Q  146 gcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgc 245  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||  | ||| |||| |||  ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||     
T  17686 gcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattctgcaactgt 17785  T
Q  246 tcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagc 345  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || || ||||||||||||||| | || ||||||||    
T  17786 ttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctctcttaatatcagctctcaatccattttcaaatttgatacacctggagaactcagc 17885  T
Q  346 agtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcacggac 415  Q
     |||||   | ||||||| || || |||||  | | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  17886 tgtctccacactgtagtgagggtagaacttagcaagttccacaaactttgcagcatactccgtgacggac 17955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 65197 - 64932
Alignment:
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| || || ||| || | | |||| |||  | |||||||||||| || |||||||| |    
T  65197 ttgcccttatcagcaggggcactatatggcttcgggcgactctgttgtccattattccttctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 65098  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  || ||| || || |||||||| |||||||| || ||||| | ||| || |||||||| || ||    
T  65097 cataaattctgcagctactcaccaactcagagaaatttctgattttctgataaccaatggctctcttgatatcagccctcaatccattctcaaacttaat 64998  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaactt 393  Q
    ||| || || |||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||  | | ||||||||||||    
T  64997 acatttggagaactcagctgtctccgcagtatagtgaggataaaacttggcgagttccacaaactt 64932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 62742 - 62364
Alignment:
Q  33 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||  | ||||| || | |||||||||  || ||||||||   || || ||   || |||||  || ||    
T  62742 cattactcttgtggcctttctcaccacacttgaattaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaatctctgcttacc 62643  T
Q  133 cttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtct-tccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgta 231  Q
    ||| |||||||||||||| ||  | || || ||||||||||| ||||| | || | |||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  62642 cttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgcccctt-gcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcata 62544  T
Q  232 aatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacac 331  Q
     |||||||| || || |||| ||||||||||   |  |||||||| || ||||| || ||||| || |||||   ||||||  | ||||| || |||||     
T  62543 tatcctgcagctacttaccaactcagagaaattccttatcttttgatagccaatagccctcttgatatcagctatcaaaccaatttcaaactttatacat 62444  T
Q  332 tttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    || || ||||||||| |||| | ||| | ||| ||||| || ||| | |  ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  62443 ttggagaactcagcaatctccgcagtattgtgtggatagaattttgcaagctccacaaacttagctgcatattcagtcac 62364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 271 - 411
Target Start/End: Original strand, 3520 - 3661
Alignment:
Q  271 cttttggtaaccaattgctctcttaatctcag-cacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggata 369  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||  ||| ||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  3520 cttttggtatccaatggccctcttgatctcaaacacacaagccattctcaaatttgatgcacttggagaactcagcagtctcagcagtgtattgcggata 3619  T
Q  370 aaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3620 aaacttagccagctccacaaactttgcagcatactcagtcac 3661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1294 - 1014
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    |||||||||||||| | ||||||| | || || ||| |||| |||| ||||   |||| |||| |||||  ||||| |||||| || ||||||||||| |    
T  1294 cccttatcagcaggagtactgtaaggctttggacgattctgttgactcttacctttcctctcactcacagccttgtgatgagctttcgtatcctcctcat 1195  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    | || ||||||||||||||||| | ||| ||    | |||||| || || ||||  || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||    
T  1194 agattctgcaactgctcaccagtttagaaaagttaccgatcttctgatatccaacggccctcttgatctcggcacgcaagccattctcaaatttgatgca 1095  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||| || |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||  |||  || |||||||| || |||||||| |||||    
T  1094 cttggagaactcagttgtctcagcagtgtagtgcggataaaatttagccagctctacaaactttgccgcatactcggtcac 1014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 411
Target Start/End: Original strand, 442084 - 442364
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgt 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | | ||||||| | |||   |||  ||||||||   |||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  442084 cccttatcagcaggagcactgtaaggcttagggcaattttgctgactcctaggtctcctttcattcacggccttgtaatgagctttagtatcttcctcat 442183  T
Q  231 aaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgataca 330  Q
    | || || || ||||||||||| ||||| ||    || ||||| || || ||||| ||   ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  442184 agattctacagctgctcaccagttcagaaaagttacgaatcttatgatacccaatggccagcttgatctcagcacgcaaaccattctcaaacttgatgca 442283  T
Q  331 ctttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||| || ||| ||| |||||| | ||||||||| |||||||||||  | |  || |||||||| |||||||||||||||||    
T  442284 cttggagaacccagtagtctcagcagtgtagtgtggataaaacttagctagctctacaaactttgcagcatactcagtcac 442364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 514328 - 514005
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||| | |||||||||  || ||||||||   ||||| ||   |||  |||      
T  514328 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttcttc 514229  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || |    
T  514228 tttcctttgtcagcaggagcactttaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttctt 514129  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | ||||| || || ||| | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || || |||||||||||    
T  514128 cataaattctacacctgtttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctctttttatttcagctctcaacccattttcaaatttgat 514029  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
     ||| | || |||||||| |||||    
T  514028 tcacctggagaactcagctgtctc 514005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 63
Target Start/End: Original strand, 496343 - 496384
Alignment:
Q  22 cccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagt 63  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  496343 cccaggacaagcattgctcttatggcctttttcaccacaagt 496384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 404
Target Start/End: Original strand, 8028 - 8262
Alignment:
Q  170 tgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcgga 269  Q
    |||||||||||  || |||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||| || |  | ||    
T  8028 tgctgacccttgttcctccgctcactcctaaccttataatgagccttcgtatcctcctcataaattctacaactactcaccaattcagaaaatatcctga 8127  T
Q  270 tcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggata 369  Q
    ||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| || || |||||||| | ||| || || |||||    
T  8128 tcttttggtaacctatggcccgcttaatgtcagcacgcaaaccattttcaaacttaatgcactttgacaattccgcagtctcagcagtataatgtggata 8227  T
Q  370 aaacttttccaattccacaaacttggcagcatact 404  Q
     || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  8228 gaattttgcaagctccacaaacttagcagcatact 8262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 963
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||| ||| |||||   | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  1170 tcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattcttctgtccctttcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcgtaaatcc 1071  T
Q  237 tgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttga 336  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| | || |||||  || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || || ||||||||||||||| | ||    
T  1070 tgcaactgtttaccaactcagagaagaatctgatctgctgatacccaatagctctcttaatgtcagctctcaacccattttcaaatttgatacacctgga 971  T
Q  337 aaactcag 344  Q
     |||||||    
T  970 gaactcag 963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 9922 - 9723
Alignment:
Q  203 ttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcag 302  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||  ||    |||||||| || || |||||||| | ||| |||||||    
T  9922 ttgtaatgtgctttggtatcctcttcatagattctgcaactgctcactaattcagtaaagttacggatcttctgatatccaattgcccgcttgatctcag 9823  T
Q  303 cacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcata 402  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||| |||||| ||||||||    
T  9822 cacgcaagccactttcaaatttgatgcacttggaaaactcggcattctcagcagtgtagtgcggataaaacttagccagctccataaactttgcagcata 9723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13458 - 13219
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | |  | |||| |||||  |||||   || || ||   |    
T  13458 atccccaggacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagtaacaacatctttctttctaggcctcctctcatcattc 13359  T
Q  119 attctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttgg 218  Q
    | ||| |  || |||||||||||||| |||||| ||   || || | ||| |||||||||||    |||| ||||||||||| || |||| ||||||| |    
T  13358 aatctttgcttacccttatcagcaggagcactgcaagactttggacaactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaacctcgtaacgagccttag 13259  T
Q  219 tatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcaga 258  Q
    |||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  13258 tatcttcctcatatattctacaactgctcaccagctcaga 13219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 351
Target Start/End: Original strand, 30348 - 30562
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||   | ||| |||| |||   ||||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  30348 tcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattgtcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattc 30447  T
Q  237 tgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttga 336  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || |||||||||||||||||| | ||    
T  30448 tgcaactgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctctattgatgtcagccctcaacccattctcaaatttgatacacctgga 30547  T
Q  337 aaactcagcagtctc 351  Q
     |||||||| |||||    
T  30548 gaactcagctgtctc 30562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 66970 - 66760
Alignment:
Q  141 caggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 240  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||   | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  66970 caggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcataaatcctgca 66871  T
Q  241 actgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaac 340  Q
     ||| | ||||  |||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || || ||||||||||||||| | || |||    
T  66870 gctgtttaccaaatcagagaacactctgatctgctgatacccaatagctctcttaatatcagctctcaacccattttcaaatttgatacacctggagaac 66771  T
Q  341 tcagcagtctc 351  Q
    ||||| |||||    
T  66770 tcagctgtctc 66760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 402
Target Start/End: Original strand, 1007 - 1208
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || || ||||| || ||||||| ||||||||||| ||  ||||| || || ||||| |||||||| || |||    
T  1007 cttgtaatgagccttattatcctcctcatatattctgcagctactcaccaactcagagaaaattctaatcttctgatacccaatggctctcttgatgtca 1106  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcgg-ataaaacttttccaattccacaaacttggcagca 400  Q
    || | ||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |  || ||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||    
T  1107 gctctcaagccattctcaaacttgatacatttggagaactcagctgtctccgcggtatagtggggaatagaactttgccagttccacaaacttagtagca 1206  T
Q  401 ta 402  Q
    ||    
T  1207 ta 1208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 30829 - 30620
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  ||||| ||    |  ||| | || |||||||| || | |||||| |||    
T  30829 cttgtaatgagctttggtatcctcttcgtagattctacaactgctcaccaattcagaaaattgcctaatcctctgataaccaatggcccgcttaatatca 30730  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    ||| ||| ||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||  | |  ||||||||||| |||||||    
T  30729 gcatgcagaccattctcaaactttatgcacttggagaactcagcagtctcggcagtgtaatgtggataaaatttagcaagctccacaaactttgcagcat 30630  T
Q  402 actcagtcac 411  Q
    ||||||||||    
T  30629 actcagtcac 30620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14770 - 14595
Alignment:
Q  236 ctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttg 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||    |||||||| || || ||  | |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  14770 ctgcagctgctcaccagctcagaaaagttacggatcttctgatacccgttggctcgcttgatctcagcatgcaaaccattctcaaacttgatgcacttgg 14671  T
Q  336 aaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    | ||||||||||| || | ||| ||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14670 agaactcagcagtatcagcagtatagtgtggataaaatttagccagctccacaaactttgcagcatattcagtcac 14595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 14959 - 14918
Alignment:
Q  23 ccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagta 64  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14959 ccagtacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagta 14918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 616 - 416
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| || || ||||  ||||||||   ||  || || || |||||||| |||||||| || |||    
T  616 cttgtaatgagctttggtatcttcctcagaaatcctgcagctacttaccaaatcagagaagtttcttattttctgataaccaatggctctcttgatgtca 517  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | |||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| | ||| ||||| || || |||||| | | |||||||||||| |||||||    
T  516 gctctcaaaccattctcgaacttgatacatttggagaactcagctgtctccgcagtatagtgaggctagaactttgcaagttccacaaacttagcagcat 417  T
Q  402 a 402  Q
    |    
T  416 a 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 406
Target Start/End: Original strand, 263658 - 263933
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttag-tcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||  | ||| |||||| | ||||| ||||||||     
T  263658 cccttgtcagcaggggcactgtacggcttaagacgactctgctgtcccttacctcttc-gctcactcatcaccttataatgaactttggtgtcctcctca 263756  T
Q  230 taaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatac 329  Q
    || ||||||||||  || ||||  |||||||||| ||  |||| |||||| || || |||||||| || ||||| | ||| || |||||||| || ||||    
T  263757 tagatcctgcaacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtaccctatggctctcttgatatcagctctcaagccattctcaaactttatac 263856  T
Q  330 actttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactca 406  Q
    | || || || ||||| ||||| |  || ||||| || || |||||| | | |||||||||||| ||||||||||||    
T  263857 atttggagaattcagctgtctccgcggtatagtgagggtagaactttgcaagttccacaaactttgcagcatactca 263933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 263555 - 263617
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatc 90  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| | |||||||||    
T  263555 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcaggagcatc 263617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 348 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 30654 - 30591
Alignment:
Q  348 tctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  30654 tctctggagtatagtgcggataaaactttgccaattccacaaactctacagcatactcagtcac 30591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40922 - 40787
Alignment:
Q  189 gctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgc 288  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||| ||| || ||   ||||||||| ||||| | ||||||    
T  40922 gctcattcataatcttataatgagctttggtgtcatcgtcataaattctgcagctactcaccaactcggaaaactgtcggatcttctggtatcaaattgc 40823  T
Q  289 tctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaattt 324  Q
    || ||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  40822 tcgcttaatctcagaacgcaagccattctcaaattt 40787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 405
Target Start/End: Original strand, 6386 - 6510
Alignment:
Q  281 ccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttcca 380  Q
    ||||| |||||||| || ||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||  || ||||| || || |||||  | |    
T  6386 ccaatggctctcttgatgtcagctctcaaaccattctcaaacttgatacacttggagaactcagctgtctctgaggtatagtgagggtagaacttagcaa 6485  T
Q  381 attccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     |||||||||||| |||||||||||    
T  6486 gttccacaaactttgcagcatactc 6510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23924 - 23818
Alignment:
Q  305 cgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatact 404  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| | | | || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23924 cgcaaaccattcttaaacttgatgcattttgagaactcagcagtctcagcaatataatgtggataaaactttgccaactccacgaacttggcagcatact 23825  T
Q  405 cagtcac 411  Q
    | |||||    
T  23824 cggtcac 23818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33238 - 33084
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  | | |||||| |||  | |||||||||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  33238 tcagcaggagcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcc 33139  T
Q  237 tgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctct 291  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| ||  |||||||| || ||||| |||||    
T  33138 tgcagctgcttaccaactcagagaaaattctaatcttttgatacccaatagctct 33084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0848 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0848
Description:

Target: scaffold0848; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4808 - 4639
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||    || ||||| || |||||||| || | |||||| |||||||    
T  4808 taatgggctttggtatcatcctcataaattctacagctactcaccagctcagaaaattgacgaatcttctgataaccaatggcccgcttaatatcagcac 4709  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaactt 375  Q
    ||| ||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |  ||||| || |||||||||||    
T  4708 gcagaccattctcaaactttatgcacttggagaactcagcagtctcagcggtgtaatgtggataaaactt 4639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 861 - 636
Alignment:
Q  177 ccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttg 276  Q
    ||||| || |||||||| |||  | ||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||   ||  ||||| ||    
T  861 ccttattcctccgctcactcatcaccttataatgagctttggtatcatcctcataaatcctacagctactcaccaactcagaaaagtttctaatcttctg 762  T
Q  277 gtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttt 376  Q
     |||||||| || | |||||| |||||||||| ||| ||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |  | ||| || |||||||||||     
T  761 ataaccaatggcccgcttaatatcagcacgcagaccattctcgaactttatgcacttagagaactcagcagtctcagcggcgtaatgtggataaaactta 662  T
Q  377 tccaattccacaaacttggcagcata 402  Q
     | |  ||||||||||| ||||||||    
T  661 gcaagctccacaaactttgcagcata 636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 402
Target Start/End: Original strand, 25938 - 26163
Alignment:
Q  177 ccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttg 276  Q
    ||||| || |||||||| |||  | ||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||   ||  ||||| ||    
T  25938 ccttattcctccgctcactcatcaccttataatgagctttggtatcatcctcataaatcctacagctactcaccaactcagaaaagtttctaatcttctg 26037  T
Q  277 gtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttt 376  Q
     |||||||| || | ||||||  ||||||||| ||| |||||||| || || ||||| || ||||||||| |||| |  ||||| || |||||||||||     
T  26038 ataaccaatggcccgcttaataacagcacgcagaccattctcaaactttatgcacttagagaactcagcaatctcagcggtgtaatgtggataaaactta 26137  T
Q  377 tccaattccacaaacttggcagcata 402  Q
     | |  ||||||||||| ||||||||    
T  26138 gcaagctccacaaactttgcagcata 26163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 53220 - 53024
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||  || ||||| | ||  |||||||| || ||||| |||||||| || ||||  |    
T  53220 taatgagccttggtgtcttcctcatatatcctgcagctactcaccaaatccgagaagattctaatcttttgatacccaatggctctcttgatgtcagttc 53121  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcata 402  Q
     ||| || ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||| |  |||||||| || || |||||| | | |||||||||||| ||||||||    
T  53120 tcaagccattctcgaactcgatacacttagagaactcagctgtctccgcggtgtagtgggggtagaactttgcaagttccacaaactttgcagcata 53024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 405
Target Start/End: Original strand, 37 - 272
Alignment:
Q  170 tgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcgga 269  Q
    |||||||||||  || |||||||||||  || ||| || |||||  | |||||||| || |||||||| |  ||||| ||||  ||||| |||  ||  |    
T  37 tgctgacccttgttcctccgctcattcctaaccttatagtgagctctcgtatcctcttcataaatcctactgctgcttaccaattcagaaaaatttctaa 136  T
Q  270 tcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggata 369  Q
    |||| || ||||| || |||||||| || ||||| | ||| || |||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||  ||||| || || ||    
T  137 tcttctgataacctatggctctcttgatgtcagctctcaagccattctcaaacttgatacacttagagaactaagctgtctctgccgtgtaatgagggta 236  T
Q  370 aaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    ||||||| | | ||| |||||||| |||||||||||    
T  237 aaactttgcaagttctacaaactttgcagcatactc 272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 405
Target Start/End: Original strand, 30127 - 30330
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||||||   ||  || || || |||||||| |||||||| || |||    
T  30127 cttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcctacagctgcttaccaaatcagagaagtttcttattttctgataaccaatggctctcttgatatca 30226  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | |||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| | ||| || || || || |||||  | | |||||||||||| |||||||    
T  30227 gctctcaaaccattctcaaactttatacatttggataactcagctgtctccgcagtataatgagggtagaacttagcaagttccacaaacttcgcagcat 30326  T
Q  402 actc 405  Q
    ||||    
T  30327 actc 30330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 64474 - 64199
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttag-tcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcg 229  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||  | ||| |||||||| || |  ||||||||     
T  64474 cccttgtcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttc-gctcactcatcaccttataatgagcttttgagtcctcctca 64376  T
Q  230 taaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatac 329  Q
    || ||||||||||  || ||||  |||||||||| ||  |||| ||| || || || |||||||| || ||||| | ||| || |||||||| || ||||    
T  64375 tatatcctgcaacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttgataccctatggctctcttgatgtcagctctcaagccattctcaaactttatac 64276  T
Q  330 actttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactca 406  Q
    |||| || || ||||| ||||| |  || ||||| || || |||||| | | ||||||||||||  |||||||||||    
T  64275 acttggagaattcagctgtctccgcggtatagtgagggtagaactttgcaagttccacaaacttcacagcatactca 64199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 402
Target Start/End: Original strand, 433 - 632
Alignment:
Q  203 ttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcag 302  Q
    |||||||| || ||||||||| | || || || |||||||||||||| || ||||  ||    | |||||| || || |||||||| | ||| |||||||    
T  433 ttgtaatgtgctttggtatccacttcatagattctgcaactgctcactagttcagtaaagttacagatcttctgatatccaattgcccgcttgatctcag 532  T
Q  303 cacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcata 402  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| | |||||||||||||||||| ||  |||  |||| |||||| ||||||||    
T  533 cacgcaagccactttcaaatttgatgcacttggaaaactcggcgttctcagtagtgtagtgcggataaaagttagccagctccataaactttgcagcata 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 103
Target Start/End: Original strand, 70442 - 70512
Alignment:
Q  33 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||| | |||||||||  || ||||||||    
T  70442 cattactcttgtggcctttctcaccacacttaaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttaggc 70512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13920 - 13706
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||  | ||| |||| |||  ||||| |||||||| ||||| || || || || || |    
T  13920 tcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttttaatgagctttggtgtcttcttcatagattc 13821  T
Q  237 tgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttga 336  Q
    | || ||| | |||| ||||||||| |||| |||||  || || | ||| |||||||| || ||||| | ||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  13820 tacacctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatatctaatagctctcttgatgtcagccctcaacccattctcaaacttgatacacttgga 13721  T
Q  337 aaactcagcagtctc 351  Q
     |||||||| |||||    
T  13720 gaactcagctgtctc 13706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23789 - 23575
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 236  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||  | ||| |||| ||| |||||| |||||||  ||||| || || || || || |    
T  23789 tcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagttttggtgtcttcttcatagattc 23690  T
Q  237 tgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttga 336  Q
    |||| ||  | |||| ||||||||| |||| |||||  || || ||||| ||||| || || ||||| | ||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  23689 tgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcagccctcaacccattctcaaacttgatacacttgga 23590  T
Q  337 aaactcagcagtctc 351  Q
     |||||||| |||||    
T  23589 gaactcagcggtctc 23575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 411
Target Start/End: Original strand, 51985 - 52363
Alignment:
Q  33 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| | |||||||||  || || |||||   || || ||   ||  |||| ||| ||    
T  51985 cattactcttgtggcctttctcaccacacttgaaacagataatctcagtaggagcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacc 52084  T
Q  133 cttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaa 232  Q
     || |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||||    | |||||| |||  |  || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  52085 tttgtcagcaggagcactatacagtttcggacggctctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagcctttgtatcctcttcataa 52184  T
Q  233 atcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacact 332  Q
    ||||| || ||||| ||||  ||||| | |   |  |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| | |||||| || ||||| || ||||| |    
T  52185 atcctacagctgcttaccaattcagaaatattccttatcttttgataaccaatagcccgcttgatatcagctctcaaaccattttcaaactttatacatt 52284  T
Q  333 ttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    | ||  ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||| | |  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  52285 tggagcactcagcagtctccgcagtatagtgtggataaaattttgcaagctccacaaacttagctgcatactcagtcac 52363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11546 - 11393
Alignment:
Q  200 atcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||| | |||| ||| || || |||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  11546 atcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcctacacctgttaaccaactccgaaaagactctgatctgttgatacccaatggctcttttaatgt 11447  T
Q  300 cagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctg 353  Q
    |||| | ||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  11446 cagccctcaacccattttcaaacttgatacacttggagaactcagccgtctctg 11393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 411
Target Start/End: Original strand, 5940 - 6149
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||| ||| || |||||||| || || |||||||| || || ||||  |||||||||   |  |||||||| || ||||| || ||||| || |||    
T  5940 cttgtaataagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagctacttaccaattcagagaaattccttatcttttgatagccaatagccctcttgatatca 6039  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | |||||| || ||||| || ||||| || || |||||||||||||| | | | ||||| ||||| |||||  | | |||||||||| | |||||||    
T  6040 gctctcaaaccattttcaaactttatacatttggagaactcagcagtctccgcaatatagtgaggatagaacttagcgagttccacaaacctcgcagcat 6139  T
Q  402 actcagtcac 411  Q
    |||| |||||    
T  6140 actccgtcac 6149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 1848 - 1771
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttctt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||||||   ||||||||| |||||    
T  1848 atccccaggacaagcattactcttatggcctttctcgccacaagcatagcacacaatctcattaggagcatctttctt 1771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 368 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1647 - 1604
Alignment:
Q  368 taaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1647 taaaacttagccaattccacaaacttggcagcatactcattcac 1604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 4712 - 4635
Alignment:
Q  19 atccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttctt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||||||   ||||||||| |||||    
T  4712 atccccaggacaagcattactcttatggcctttctcgccacaagcatagcacacaatctcattaggagcatctttctt 4635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 368 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4511 - 4468
Alignment:
Q  368 taaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4511 taaaacttagccaattccacaaacttggcagcatactcattcac 4468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 351
Target Start/End: Original strand, 5556 - 5705
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| || ||||| || || || |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||  ||||| || || ||||| | |||||| || |||    
T  5556 cttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatcctgcagctactcaccaactcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggttctcttgatgtca 5655  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    || | ||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  5656 gctctcaagccattctcaaacttgatacatttggagaactcagctgtctc 5705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 90
Target Start/End: Original strand, 176321 - 176378
Alignment:
Q  33 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatc 90  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  176321 cattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctctgtaggagcatc 176378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 98384 - 98181
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |  ||||| || ||||| |||| |||||| ||   || |||||| || || ||||| |||||||| || |||    
T  98384 cttgtaatgagccttcgtatcctcttcattgatcctacagctgcttaccaactcagaaaagtttctgatcttctgatacccaatggctctcttgatgtca 98285  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | ||| || |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| | ||| || || || ||||||||| | | ||||| |||||| |||||||    
T  98284 gctctcaagccattctcaaactttatacatttggagaattcagctgtctccgtagtataatgagggtaaaactttgcaagttccataaacttagcagcat 98185  T
Q  402 actc 405  Q
    ||||    
T  98184 actc 98181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 269 - 348
Target Start/End: Original strand, 176557 - 176636
Alignment:
Q  269 atcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagt 348  Q
    ||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||||| || | ||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  176557 atcttttggtagccaatggcccgcttaatatcagcacgcaaaccatttttaaacttaatacattttgagaactcagcagt 176636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 6054 - 5854
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   || ||||  |||||||||| ||  |||| |||||| || || |||||||| || ||||| |    
T  6054 taatgagctttggtgtcctcctcataaatcctgcaatgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgatatcagctc 5955  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     ||| || |||||||| || || || || || || ||||| ||||| |  || ||||| || || |||||| | | |||||||||||| |||||||||||    
T  5954 tcaagccattctcaaactttattcatttggagaattcagctgtctccgcggtatagtgtgggtagaactttgcaagttccacaaactttgcagcatactc 5855  T
Q  406 a 406  Q
    |    
T  5854 a 5854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 8822 - 8622
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    ||||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||  | ||| || || ||||| |||||||| || |||    
T  8822 cttgtcatgagctttagtatcttcctcatatatcctgcagctactcaccaactcagagaaaattctaaccttctgatacccaatggctctcttgatgtca 8723  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | ||| || |||||||| |||||||| || || ||| |||| || || |  || ||||| || || |||||| | | |||||||||||| |||||||    
T  8722 gctctcaagccattctcaaacttgatacatttggagaacacagctgtgtccgcggtatagtgggggtagaactttgcaagttccacaaacttagcagcat 8623  T
Q  402 a 402  Q
    |    
T  8622 a 8622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 402
Target Start/End: Original strand, 3128 - 3328
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| || ||||| || || || |||||||| || |||||||  |||||||||| ||  ||||| || || ||||| |||||||| || ||     
T  3128 cttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatcctgcagctactcaccaaatcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtcg 3227  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcat 401  Q
    || | ||| || ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |  || ||||| || || |||||| | | |||||||||||| |||||||    
T  3228 gctctcaagccattctctaacttgatacatttggagaactcagctgtctccgcggtatagtgggggtagaactttgcaagttccacaaacttagcagcat 3327  T
Q  402 a 402  Q
    |    
T  3328 a 3328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 263 - 636
Alignment:
Q  24 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattct 123  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||| ||||| || | ||||| ||||| ||   || ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  263 caggacaaacattgcttttgtggcctttcccaccataattgaaacacacaatttc---agtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcct 359  T
Q  124 ctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 223  Q
    || ||| || | ||||||| |           | ||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  360 ctgtttcccttcatcagcacg-----------gcttaggacgactctgctgccccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttagtatcc 448  T
Q  224 tcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatt 323  Q
    || || || ||||| ||  |  | ||||  || |  |||||||  | || |||||| ||||| || |||||||| |  |  | |||||| ||||| || |    
T  449 tcttcatagatcctacagatattgaccaaatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtagggcctcaaaccattctcgaact 548  T
Q  324 tgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| ||  | |||||||||||| |||| | ||  || || |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  549 tgatgcatatcgaaaactcagcaatctcagaagaataatgaggataaaacttcgccaactcaacaaacttggcagcatactcagtcac 636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 359 - 85
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttag-tcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||||| ||||||| || ||||||  ||||| | ||| |||  | ||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  359 cccttgtcagcaggggcactgtacggcttagggtgactctgttgtcccttacctcttc-gttcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcg 261  T
Q  230 taaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatac 329  Q
    || ||||| ||||| |||||||  |||||||| | ||  ||||| || || ||||| |||||||| || |||||   ||| || ||||| || || ||||    
T  260 tagatcctacaactactcaccaaatcagagaagattcttatcttctgatagccaatggctctcttgatatcagccatcaacccattctcgaactttatac 161  T
Q  330 actttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    | || || || ||||| ||||| | ||| || || || || |||||  | | |||||||||||| |||||||||||    
T  160 atttggagaattcagctgtctccgcagtataatgagggtagaacttagcaagttccacaaactttgcagcatactc 85  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Original strand, 21143 - 21175
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143 acaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 21175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 351
Target Start/End: Original strand, 790 - 1113
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 127  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |  |||| |||||||| | |||||||||  || ||||||||   ||||| || | ||   |||      
T  790 acaaacattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcaatcaacttctac 889  T
Q  128 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 227  Q
    || || || |||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||  | ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| || || |    
T  890 tttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttctt 989  T
Q  228 cgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgat 327  Q
    | ||||| ||||| ||| | |||| ||||||||| | || |||||  || ||   ||| ||||| || || ||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  990 cataaattctgcatctgttaaccaactcagagaagattctgatctgctgatactgaatagctcttttgatgtcagccctcaacccattctcaaatttgat 1089  T
Q  328 acactttgaaaactcagcagtctc 351  Q
     ||| | || |||||||| |||||    
T  1090 gcacctggagaactcagctgtctc 1113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17356 - 17083
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgaccctta-gtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||  | ||| |||||||| || || ||||||||     
T  17356 cccttgtcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctca 17258  T
Q  230 taaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatac 329  Q
    || ||||||||||   | ||||  |||||||| | ||  |||| ||| || || || |||||||| || ||||| | ||| || |||||||| || ||||    
T  17257 tagatcctgcaacgatttaccaaatcagagaagattctaatctgttgctaccctatggctctcttgatgtcagctctcaagccattctcaaactttatac 17158  T
Q  330 actttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatact 404  Q
    | || || || ||||| ||||| |  || ||||| || || |||||| | | |||||||||||| ||||||||||    
T  17157 atttggagaattcagctgtctccgcggtatagtgagggtagaactttgcaagttccacaaactttgcagcatact 17083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 411
Target Start/End: Original strand, 17219 - 17349
Alignment:
Q  281 ccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttcca 380  Q
    ||||| || ||||| || ||||| | |||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||  | |    
T  17219 ccaatagccctcttgatatcagctctcaaaccattttcaaacttgatgcatttggagaactcagcagtctccgcagtatagtgaggataaaacttagcga 17318  T
Q  381 attccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
     |||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  17319 gttccacaaacctcgcagcatactccgtcac 17349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 411
Target Start/End: Original strand, 30034 - 30238
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||  |||||||||  ||  ||||||||||| || || || | |||||| |||||||    
T  30034 taatgagcctttgtatcctcttcatagattctacaactactcaccaaatcagagaaat-tcttatcttttggtagccgatggcccgcttaatttcagcac 30132  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
    ||| ||| || || || ||||| |  || || |||||||||||||| | ||| ||||| || ||||| ||| | |  ||| ||||||| || ||||||||    
T  30133 gcagaccattttccaacttgatgcgtttagagaactcagcagtctcagcagtatagtgtgggtaaaattttgcaagctccgcaaacttagctgcatactc 30232  T
Q  406 agtcac 411  Q
    ||||||    
T  30233 agtcac 30238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 5010 - 4819
Alignment:
Q  202 cttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctca 301  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || ||| |||| || |||||||  |||||||||| ||  ||||| || || ||||| |||||||| || |||    
T  5010 cttgtaatgagctttagtgtcttcctcatatatcatgcagctactcaccaattcagagaaaattctaatcttctgatacccaatggctctcttgatgtca 4911  T
Q  302 gcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaa-aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaactt 393  Q
    || | ||| || |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||| || || || || |||||| | | ||||||||||||    
T  4910 gctctcaagccattctcaaacttgataca-tttgaagaactcagctgtctccgcagtataatgggggtagaactttgcaagttccacaaactt 4819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9659 - 9548
Alignment:
Q  131 cccttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgaccctta-gtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| || ||||||  |||| |||||| |||  | ||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  9659 cccttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctca 9561  T
Q  230 taaatcctgcaac 242  Q
    || ||||||||||    
T  9560 tagatcctgcaac 9548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 9762 - 9700
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatc 90  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| | |||||||||    
T  9762 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcaggagcatc 9700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 317 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3990 - 3896
Alignment:
Q  317 tcaaatttgatacactttgaa-aactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||| | |  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3990 tcaaacttgataca-tttgaagaactcagcagtctccgtagtgtagtgtggatagaattttgcaagctccacaaactttgctgcatactcagtcac 3896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 30301 - 30230
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttctt 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |||| |||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  30301 acaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatctcagcaggagcatctttcctctt 30230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 103
Target Start/End: Original strand, 115953 - 116028
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggc 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||| || | |||||||||| || ||||||||    
T  115953 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacatgaaacaaacaatatcagtaggagcatccctcctcttaggc 116028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1242 - 924
Alignment:
Q  33 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcc 132  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  | |||||||||  || || |||||   || || ||   || |||||  || ||    
T  1242 cattacccttgtggcctttttcaccacatttaaaacagacaatcttagtaggagcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcagtctctgcttacc 1143  T
Q  133 cttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaa 232  Q
    ||| ||| |||| ||||| ||  | || || ||||||||||| ||||||    | |||||| |||  | ||| |||||||| || || |||||||| ||     
T  1142 cttgtcaacaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctcatat 1043  T
Q  233 atcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacact 332  Q
    || ||||| || |||||||  |||||||||   |  ||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||| || ||||| || ||||| |    
T  1042 attctgcagctactcaccaaatcagagaaattccttatcttttggtaaccaatggcctgcttaatatcagcacgcagaccattttcaaacttaatacatt 943  T
Q  333 ttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    | || |||||| |||||||    
T  942 tagacaactcaacagtctc 924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 406
Target Start/End: Original strand, 2269 - 2538
Alignment:
Q  137 tcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttag-tcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatc 235  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||  | ||| |||||||| || || |||||||| || |||    
T  2269 tcagtaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttc-gctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctcatagatc 2367  T
Q  236 ctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttg 335  Q
     ||||||  || || |  |||||||||| ||  |||| ||| || || || |||||||| || ||||| | ||| || |||||||| || ||||| || |    
T  2368 ttgcaacgacttactaaatcagagaaaattctaatctgttgataccctatggctctcttcatgtcagctctcaagccattctcaaactttatacatttgg 2467  T
Q  336 aaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactca 406  Q
    | || ||||| ||||| |  || ||||| || || |||||| | |||||||||||| | ||||||||||||    
T  2468 agaattcagctgtctccgcggtatagtgagggtagaactttgcaaattccacaaaccttgcagcatactca 2538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 411
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6314
Alignment:
Q  269 atcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggat 368  Q
    |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| | || ||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||   ||| ||||| ||||    
T  6172 atcttttgataaccaatggcccgcttgatatcagctctcagaccattttcaaactttatacatttggagaactcagcagtctccacagtatagtgtggat 6271  T
Q  369 aaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactcagtcac 411  Q
    |||| ||| | |  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6272 aaaattttgcaagctccacaaacttagctgcatactcagtcac 6314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28255 - 27937
Alignment:
Q  33 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcc 132  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  | |||||||||  || || |||||   || || ||   || |||||  || ||    
T  28255 cattacccttgtggcctttttcaccacatttaaaacagacaatcttagtaggagcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcagtctctgcttacc 28156  T
Q  133 cttatcagcaggggcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaa 232  Q
    ||| ||| |||| ||||| ||  | || || ||||||||||| ||||||    | |||||| |||  | ||| |||||||| || || |||||||| ||     
T  28155 cttgtcaacaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctcatat 28056  T
Q  233 atcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacact 332  Q
    || ||||| || |||||||  |||||||||   |  ||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||| || ||||| || ||||| |    
T  28055 attctgcagctactcaccaaatcagagaaattccttatcttttggtaaccaatggcctgcttaatatcagcacgcagaccattttcaaacttaatacatt 27956  T
Q  333 ttgaaaactcagcagtctc 351  Q
    | || |||||| |||||||    
T  27955 tagacaactcaacagtctc 27937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 660 - 455
Alignment:
Q  146 gcactgtaaagattagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgc 245  Q
    ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||  | ||| || | |||  |||||||||| | | ||||| || || || ||||| || || |||     
T  660 gcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctaactcattatcttgtaataaactttggtgtcttcttcataaattctacacctgt 561  T
Q  246 tcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcacgcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagc 345  Q
    | |||| ||||||||| ||||  ||||  || || ||||| ||| ||||||| ||||| | |||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  560 taaccaactcagagaagactctaatctgctgatacccaatagctatcttaatgtcagctctcaaaccattttcaaacttgatacacttggagaactcagc 461  T
Q  346 agtctc 351  Q
     |||||    
T  460 tgtctc 455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 90
Target Start/End: Original strand, 34671 - 34728
Alignment:
Q  33 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctggaggagcatc 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| || | |||||||||    
T  34671 cattactcttgtggcctttctcaccacacttgaaacaaacaatgtcagtaggagcatc 34728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1914 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1914
Description:

Target: scaffold1914; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1027 - 827
Alignment:
Q  206 taatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagagaaaactcggatcttttggtaaccaattgctctcttaatctcagcac 305  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |  |||||||  | |||||||| || ||||| |||||| || || || ||||| || ||||| |    
T  1027 taatgagctttggtgtcctcctcatagatcctgcagcgactcaccaaattagagaaaattctgatctgttggtatcctatggccctcttgatatcagctc 928  T
Q  306 gcaaaccgttctcaaatttgatacactttgaaaactcagcagtctctggagtgtagtgcggataaaacttttccaattccacaaacttggcagcatactc 405  Q
     ||| || |||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| ||||  || || || || |||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  927 tcaagccattctcaaacttaatgcacttggagaattcagctgtctccggagcataatgggggtagaactttgcaagctccacaaattttgcagcatactc 828  T
Q  406 a 406  Q
    |    
T  827 a 827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 1286 - 1254
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1286 acaagcattactcttgtggcctttttcaccaca 1254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Original strand, 12126 - 12158
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12126 acaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 12158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Original strand, 8073 - 8105
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8073 acaagcattactcttgtggcctttttcaccaca 8105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Original strand, 42064 - 42096
Alignment:
Q  28 acaagcattactcttgtggcctttctcaccaca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064 acaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 42096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University