View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3854_high_1 (Length: 1036)

Name: NF3854_high_1
Description: NF3854
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3854_high_1
NF3854_high_1
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (9-1015)||(14768695-14769701)
chr2 (695-1015)||(452495-452822)
chr2 (781-1015)||(2609695-2609931)
chr2 (695-1015)||(8179869-8180198)
chr2 (695-1015)||(24584485-24584812)
chr2 (781-1015)||(45368504-45368741)
chr2 (844-1015)||(16291943-16292116)
chr2 (885-1015)||(38453497-38453628)
chr2 (804-878)||(39287849-39287923)
chr2 (801-877)||(6464948-6465024)
chr2 (896-959)||(37281388-37281451)
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (695-1015)||(33350685-33351012)
chr7 (695-1015)||(36651070-36651397)
chr7 (695-1015)||(39907258-39907585)
chr7 (781-1015)||(46356730-46356966)
chr7 (695-1015)||(32629688-32630011)
chr7 (801-1015)||(36870203-36870419)
chr7 (781-1015)||(38606206-38606441)
chr7 (695-880)||(22346588-22346778)
chr7 (815-1015)||(11593154-11593356)
chr7 (695-880)||(38896693-38896883)
chr7 (781-971)||(24178119-24178310)
chr7 (797-880)||(33738342-33738425)
chr7 (797-878)||(32483656-32483737)
chr7 (895-1015)||(49028563-49028684)
chr7 (799-969)||(48055743-48055913)
chr7 (791-874)||(17101504-17101588)
chr7 (695-766)||(11592765-11592835)
chr7 (828-908)||(21520321-21520402)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (695-1015)||(23907181-23907508)
chr4 (695-1015)||(435308-435635)
chr4 (695-959)||(48623463-48623733)
chr4 (792-1012)||(55769265-55769486)
chr4 (792-1012)||(55833521-55833742)
chr4 (804-1015)||(53703800-53704013)
chr4 (695-1015)||(1777894-1778223)
chr4 (800-960)||(39707650-39707810)
chr4 (781-956)||(27451112-27451288)
chr4 (799-864)||(33369027-33369092)
chr4 (821-939)||(44860318-44860435)
chr4 (781-881)||(16002175-16002274)
chr4 (790-838)||(41598166-41598214)
chr4 (804-842)||(2296364-2296402)
chr4 (890-935)||(41005617-41005662)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (695-1015)||(43241260-43241587)
chr1 (781-970)||(8671085-8671278)
chr1 (695-1015)||(51441643-51441970)
chr1 (695-1014)||(49348274-49348608)
chr1 (697-978)||(29173446-29173733)
chr1 (801-959)||(32405400-32405558)
chr1 (802-960)||(34828020-34828179)
chr1 (781-960)||(45833727-45833907)
chr1 (781-1015)||(35829272-35829506)
chr1 (885-1015)||(37463741-37463872)
chr1 (850-957)||(7813732-7813840)
chr1 (695-743)||(11681897-11681945)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (695-1017)||(30544-30873)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (695-1015)||(24177600-24177927)
chr5 (695-1015)||(20318067-20318394)
chr5 (695-1015)||(2076353-2076680)
chr5 (160-310)||(30415929-30416079)
chr5 (699-852)||(27039-27196)
chr5 (805-879)||(17212459-17212533)
chr5 (895-1015)||(1288468-1288589)
chr5 (908-1015)||(1274560-1274668)
chr5 (860-971)||(3301095-3301207)
chr5 (233-436)||(20836335-20836538)
chr5 (926-1015)||(12493241-12493331)
chr5 (798-879)||(37123755-37123836)
chr5 (233-436)||(20809980-20810183)
chr5 (808-878)||(30418593-30418662)
chr5 (695-742)||(1288687-1288734)
chr5 (908-962)||(7605754-7605809)
chr5 (695-742)||(25937173-25937220)
chr5 (814-872)||(31503071-31503129)
chr5 (798-844)||(35685042-35685088)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (781-1015)||(36566120-36566356)
chr8 (159-437)||(7166591-7166869)
chr8 (789-960)||(15216207-15216378)
chr8 (695-1015)||(36544228-36544555)
chr8 (695-960)||(42854948-42855221)
chr8 (159-315)||(3269111-3269267)
chr8 (129-348)||(31173812-31174031)
chr8 (159-295)||(3264453-3264589)
chr8 (164-315)||(3288384-3288535)
chr8 (220-433)||(3400608-3400821)
chr8 (235-313)||(13806935-13807013)
chr8 (215-312)||(13785638-13785735)
chr8 (210-310)||(3409295-3409395)
chr8 (781-841)||(6184827-6184887)
chr8 (804-878)||(11130955-11131029)
chr8 (798-852)||(25984734-25984788)
chr8 (691-742)||(41445401-41445452)
[»] chr3 (10 HSPs)
chr3 (695-1015)||(51448588-51448915)
chr3 (781-1015)||(52137995-52138231)
chr3 (152-289)||(32412883-32413020)
chr3 (804-1009)||(48220971-48221178)
chr3 (822-971)||(9258095-9258244)
chr3 (177-279)||(6907789-6907891)
chr3 (800-960)||(38849288-38849441)
chr3 (797-842)||(50630373-50630418)
chr3 (900-967)||(19736502-19736569)
chr3 (900-967)||(19757320-19757387)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (782-1015)||(9705943-9706178)
chr6 (695-959)||(5260184-5260454)
chr6 (789-960)||(6082575-6082747)
chr6 (781-1015)||(20428516-20428752)
chr6 (781-959)||(30670061-30670234)
chr6 (699-878)||(3629346-3629530)
chr6 (803-852)||(2681480-2681529)
chr6 (802-879)||(2208419-2208496)
chr6 (915-984)||(2680958-2681027)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (717-1015)||(13135-13442)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (695-852)||(90134-90296)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (781-942)||(5614-5778)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (802-879)||(518-595)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (191-298)||(8209-8316)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 904; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 904; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1015
Target Start/End: Original strand, 14768695 - 14769701
Alignment:
Q  9 acatcatcaagtacaatgaatacctttttccctctaagtcttgtctccaacttatttgctcccaacccaatgctatctatcttctcctttgttttcaggg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14768695 acatcatcaagtacaatgaatacctttttccctctaagtcttgtctccaacttatttgctcccaacccaatactatctatcttctcctttgttttcaggg 14768794  T
Q  109 catctgaaagaannnnnnnctgtaaatgaataacccctctataattatcattttcacaagcttctctgatattttcaacgaaacttctatgcacaaactt 208  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14768795 catctgaaagaatttttttctgtaaatgaataacccctctataattatcattttcacaagcttctctgatattttcaacgaaacttctatgcacaaactt 14768894  T
Q  209 gcgatgaattcgattatagatggatttggctgtggttgttttaccagatccacccattccccagatccctatcatacaaacattgcttgaatgtttttca 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14768895 gcgatgaattcgattgtagatggatttggctgtggttgttttaccagatccacccattccctagatccctatcatacaaacattgcttgaatgtttttca 14768994  T
Q  309 ataaactcggcaactttttgcacacgaggttccaacccaactgggaactcggaaatagacagaaatgaactgtctagttttgtgaaaacgtcaccaacaa 408  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14768995 ataaactcggccactttttgcacacgaggttccaacccaactgggaactcggaaatagacagaaatgaactgtctagttttgtgaaaacgtcaccgacaa 14769094  T
Q  409 tttgctttactagttcaccttcattccttagataattataaaacacaaaacaacacaacacatagaatgagaataaattacnnnnnnnnnnctatagggc 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||| |||    
T  14769095 tttgctttactagttcaccttcattccttagataattataaaacacaaaacaacacaacacatagaatgagaataaattacaaaaaaaaa-ctataaggc 14769193  T
Q  509 tctatttggccagatcaaaccactagtttatagaggaaagttatagcgcatgaacttgtatgctcaaagtaaggtcattctctaatgagtttataatgtt 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14769194 tctatttggccagatcaaaccactagtttatagaggaaagttatagcgcatgaacttgtatgctcaaagtaaggtcattctctaatgagtttataatgtt 14769293  T
Q  609 tcttcactagattatagcgaattttgacatgctactttaagcaacgtttgaacttataacttacggtatcaaatgatgattta-tggagactaagaaaag 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14769294 tcttcactagattatagcgaattttgacatgctactttaagcaacctttgaacttataacttacggtatcaaatggtgatttaatggagactaagaaaag 14769393  T
Q  708 agacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctacttatctgatggaacgatattggatggataaaa 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14769394 agacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctacttatctgatggaacgatattggatggataaaa 14769493  T
Q  808 aagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaataagaagaaaaaggttaagattgtt 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14769494 aagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaataagaagaaaaaggttaagattgtt 14769593  T
Q  908 tatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccgacaatttccgaaaacaatatgattgcacca 1007  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14769594 tatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcatcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccgacaatttcccaaaacaatatgattgcacca 14769693  T
Q  1008 agggtcaa 1015  Q
    ||||||||    
T  14769694 agggtcaa 14769701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 452822 - 452495
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||   |||||||||  ||      ||||||    
T  452822 agactaagaaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatgcct-gggaggtcgactatggaagca--atctacttacttcgacgcgtgatgg 452726  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaag-caataa 885  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |    |    
T  452725 agcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtacgatagagtaccgagagagattttgtggaaagcccggga 452626  T
Q  886 gaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaattt 984  Q
    |||||||  ||||| |||||  |||||| | ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||| | | |||| | | |||    
T  452625 gaagaaaggggttaggattgcctatattagggctatcaagaatatgtatgagggaggttcgactagtgtgaggacgcaggatgagactaccgaagatttt 452526  T
Q  985 ccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  452525 cccataacaataggattgcaccaagggtcaa 452495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 781 - 1015
Target Start/End: Original strand, 2609695 - 2609931
Alignment:
Q  781 tgatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagct-agagagattttgtggaaag 879  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2609695 tgatggatcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagt-gctgagagagattttgtggaaag 2609793  T
Q  880 -caataagaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccacc-g 977  Q
     |    ||||||||  ||| | |||||  |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| | |||      
T  2609794 ccccggagaagaaaggggtaaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagagagcttcgattagtgtgaggacgcaggatgggactaccaa 2609893  T
Q  978 acaatttccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    | | ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2609894 agattttcccataacaataggattgcaccaagggtcaa 2609931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Original strand, 8179869 - 8180198
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctacttatct--------gatgg 786  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||   |||||||||  |        |||||    
T  8179869 agactaagaaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatgcct-gggaggtcgactatgaaagca--atctacttactttgacgcgtgatgg 8179965  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagta--gctagagagattttgtggaaagcaat- 883  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||  |     
T  8179966 agcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggaaaagacgtatgatagagtaccgagagagagattttgtggaaagccctg 8180065  T
Q  884 aagaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaat 982  Q
     ||||||||  ||||| |||||   ||||| | |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | | ||||||  | |||| | | |    
T  8180066 gagaagaaaggggttaggattgccaatattagggctatcaaggatatgtacgagggagcttcgactagtgtgaggtcgcaggatggaactaccgaagatt 8180165  T
Q  983 ttccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    |||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  8180166 ttcccataacaataggattgcgccaagggtcaa 8180198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 24584812 - 24584485
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    ||||||||||| |||||| || |||  ||||||  |||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||  |||||||||  ||      ||||||    
T  24584812 agactaagaaaggagactcgagttatagataactgatttggttttatgtct-gggaggtcgagtatggaagcg--atctacttacttcgacgcgtgatgg 24584716  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aa 885  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||| |  |  |    
T  24584715 agcgatatcggacggataaaaaagacttacacctaattttcattgatttggagaaggcgtatgatagagtttccagagagattttgtggaaaaccctgga 24584616  T
Q  886 gaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaattt 984  Q
    |||||||  ||||| |||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||| |||| | | |||    
T  24584615 gaagaaaggggttaggattgcctatatcagagctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactactgtgaagacgcaggatggggctaccgaagatttt 24584516  T
Q  985 ccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24584515 cccataacaataggattgcaccaagggtcaa 24584485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 781 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 45368741 - 45368504
Alignment:
Q  781 tgatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagaga-ttttgtggaaag 879  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  45368741 tgatggagcgatatcggacggataaaaagaacttacacttagttttcattgattttgagaaggcgtatgatagagtacctagagagatttttgtggaaag 45368642  T
Q  880 caat-aagaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg- 977  Q
    |  |  |||||||   ||| | |||||  |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||  ||||     
T  45368641 ccctggagaagaatggggtgaggattgcctatattagagctatccaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggatgcaggatggggataccgt 45368542  T
Q  978 acaatttccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    | | ||||| | ||||||| || |||||||||||||||    
T  45368541 agattttcccataacaataggactgcaccaagggtcaa 45368504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 844 - 1015
Target Start/End: Original strand, 16291943 - 16292116
Alignment:
Q  844 cgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaata-agaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagc 942  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    |  ||||||||  ||||| |||||  |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  16291943 cgtatgatagagtatcgagagagattttgtggaaaatcctggagaagaaaggggttaggattgcctatattaggactatcaaggatatgtatgagagagc 16292042  T
Q  943 ttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccgacaa-tttccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| || ||||| | |||| || ||||||| ||||||||||    
T  16292043 ttcgactagtgtgaggacacaggatgggactaccgaaaattttcccataacattaggattgcatcaagggtcaa 16292116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 885 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 38453628 - 38453497
Alignment:
Q  885 agaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaatt 983  Q
    ||||||||  ||||| |||||  |||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||   |||| | | ||    
T  38453628 agaagaaaggggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagagagtttcgactagtgtgaggacgcaggatgggattaccgaagattt 38453529  T
Q  984 tccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38453528 tcccataacaataggattgcaccaagggtcaa 38453497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 804 - 878
Target Start/End: Complemental strand, 39287923 - 39287849
Alignment:
Q  804 aaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaa 878  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39287923 aaaaaggatttgcactcagttttcattgatttggagaagacatgtgataaagtggctagagagatttagtggaaa 39287849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 801 - 877
Target Start/End: Original strand, 6464948 - 6465024
Alignment:
Q  801 gataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaa 877  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  6464948 gataaaaaaaaattgcacttaattttcattgatttggataagacatatgataaagtacatagatagattttgtggaa 6465024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 896 - 959
Target Start/End: Original strand, 37281388 - 37281451
Alignment:
Q  896 gttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgagga 959  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37281388 gttaggattgattatattagaactatcaaggatatgtataagggagcttcaactagtgtgagga 37281451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 102; Significance: 4e-50; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 33351012 - 33350685
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    ||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||   |||||||||  ||      ||||||    
T  33351012 agactaagaaaggagactctagttacggataaccaatttggttttatgctt-gggaggtcgactatggaagca--atctacttacttcaacgcgtgatgg 33350916  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aa 885  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |  |    
T  33350915 agcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttctttgatttggaaaaggggtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagccctgga 33350816  T
Q  886 gaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaattt 984  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| | |||| | | |||    
T  33350815 gaagaaaagggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagagagcttcgactagtgtgaagacgcaggatgggactaccgaagatttt 33350716  T
Q  985 ccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33350715 cccataacaataggattgcaccaagggtcaa 33350685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Original strand, 36651070 - 36651397
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||   |||||||||  ||      ||||||    
T  36651070 agactaagaaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatgtct-gggaggtcgattatggaagca--atctacttacttcgacgcgtgatgg 36651166  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aa 885  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||  |  |    
T  36651167 agcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtaccgagagagatttcgtggaaagccctgga 36651266  T
Q  886 gaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaattt 984  Q
    |||| ||  ||||| |||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||||| | |||| |   |||    
T  36651267 gaagtaaggggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagtttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagttttt 36651366  T
Q  985 ccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36651367 cccataacaataggattgcaccaagggtcaa 36651397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 39907585 - 39907258
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    ||||||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||   |||||||||  ||      ||||||    
T  39907585 agactaagaaaggagacccgagttacggataaccaatttggttttatgcct-gggaggtcgactgtggaagca--atctacttacttcgacgcgtgatgg 39907489  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aa 885  Q
    | |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |  |    
T  39907488 agcgatatcggacagataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagccctgga 39907389  T
Q  886 gaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaattt 984  Q
    |||||||  ||||| |||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||| | || | | | |||    
T  39907388 gaagaaaggggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggatgcaggatgggactacggaagatttt 39907289  T
Q  985 ccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39907288 cccataacaataggattgcaccaagggtcaa 39907258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 781 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 46356966 - 46356730
Alignment:
Q  781 tgatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagc 880  Q
    ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  46356966 tgatggagcgatatcggacgaataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagc 46356867  T
Q  881 aat-aagaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccacc-ga 978  Q
      |  ||||||||  |||||  ||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |||  |    
T  46356866 cctggagaagaaaggggttagaattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccaaa 46356767  T
Q  979 caatttccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
     | ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  46356766 gattttcccataacaataggattgcaccaagggtcaa 46356730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Original strand, 32629688 - 32630011
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctacttatc----tgatggaacg 790  Q
    ||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||| ||||||  | || ||||| ||||||||||||  ||||||||       |||||||  |    
T  32629688 agactaagaaaagagactcacgttacggataaccaatttggctttatgcct-ggaaggtcgactatggaagcg--atctacttcgacgcgtgatggagag 32629784  T
Q  791 atattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aagaag 889  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  32629785 atatcggacggataaaaaagacttacacttagttttcattgatttggagaaggcgtatgatagagtacctagagagattttgtggaaagccctgaagaag 32629884  T
Q  890 aaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaatttccga 988  Q
    |||  ||| | |||||  ||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| | ||||||||  |||| | | ||||| |    
T  32629885 aaaggggtgaggattgcctatattaaagctatccaggatatgtatgagggagcttcgacctgtgtgaggacgcaggatggggataccgtagattttccca 32629984  T
Q  989 aaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
     ||||||| || |||||||||||||||    
T  32629985 taacaataggactgcaccaagggtcaa 32630011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 801 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 36870419 - 36870203
Alignment:
Q  801 gataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aagaagaaaaaggtta 899  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  |  | || |||  |||||    
T  36870419 gataaaaaatacttgcacttaattttcattgatttggagaaggcgtatgatagagtgcctagagagattttgtggaaagccctggaaaataaaggggtta 36870320  T
Q  900 agattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaatttccgaaaacaatatg 998  Q
     |||||  |||||| |||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||| | | ||||| | ||||||| |    
T  36870319 ggattgcctatattagagtcatcaaggatatgtatgagggagcttcaactagtgtgaggatgcaggatggggataccgcaaattttcccataacaatagg 36870220  T
Q  999 attgcaccaagggtcaa 1015  Q
    |||||||||||||||||    
T  36870219 attgcaccaagggtcaa 36870203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 781 - 1015
Target Start/End: Original strand, 38606206 - 38606441
Alignment:
Q  781 tgatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagc 880  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||||||    
T  38606206 tgatggagcgatatcggacggataaaaaagacttacacttagttttcattgattttgagaaggcgtatgat-gagtacctggagagattttgtggaaagc 38606304  T
Q  881 aat-aagaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-a 978  Q
      |  ||||||||  | | | |||||  |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||   |||| |    
T  38606305 cctggagaagaaagggatgaggattgcctatattagagctatccaagatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgggaataccgta 38606404  T
Q  979 caatttccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
     | ||| ||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  38606405 gatttttcgataacaataggactgcaccaagggtcaa 38606441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 695 - 880
Target Start/End: Original strand, 22346588 - 22346778
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    ||||||||||| |||||| || || | |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||   |||||||||  ||      ||||||    
T  22346588 agactaagaaaggagactcgagtttcggataaccaatttggttttatgcct-gggaggtcgactatggaagca--atctacttacttcgacacgtgatgg 22346684  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagc 880  Q
    | |||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  22346685 agcgatatcgaacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagc 22346778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 815 - 1015
Target Start/End: Original strand, 11593154 - 11593356
Alignment:
Q  815 gcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaata-agaagaaaaaggttaagattgtttatatt 913  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||  |  ||||||||  ||||| |||||  ||||||    
T  11593154 gcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtaccgagagagattttgtgacaagccctggagaagaaaggggttaggattgcctatatt 11593253  T
Q  914 ggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaatttccgaaaacaatatgattgcaccaagggt 1012  Q
     | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||| | | |||| | | ||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  11593254 agggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgagactaccgaagattttcccataacaataggattgcaccaagggt 11593353  T
Q  1013 caa 1015  Q
    |||    
T  11593354 caa 11593356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 695 - 880
Target Start/End: Original strand, 38896693 - 38896883
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctacttatctg--------atgg 786  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||   |||||||||  |         ||||    
T  38896693 agactaagaaaggagactcgagttacggataaccaattcggttttatgcct-gggaggtcaactatggaagca--atctacttacttcgacgcacaatgg 38896789  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagc 880  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  38896790 agcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattaatttggaaaaggtgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagc 38896883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 781 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 24178310 - 24178119
Alignment:
Q  781 tgatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagc 880  Q
    ||||||| |||||  ||| ||||| |||||  || || || ||||||||||||||||||| |  |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24178310 tgatggagcgataccggacggatacaaaagggttacaattagttttcattgatttggagacggtgtatgacagagtacctagagagattttgtggaaagc 24178211  T
Q  881 aat-aagaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatgggg 971  Q
      |  ||||||||  ||||| |||||  || |||  ||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  24178210 cctggagaagaaaggggttaggattgcctaaattaaagctatcaaggatgtgtatgagggagcttcgactagggtgaggacgccggatgggg 24178119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 797 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 33738425 - 33738342
Alignment:
Q  797 gatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagc 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  | || |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  33738425 gatggataaaaaagacttgcacttaattttcattgatttggaaaatgcatacgataaagtggctagaaagattttgtggaaagc 33738342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 797 - 878
Target Start/End: Original strand, 32483656 - 32483737
Alignment:
Q  797 gatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaa 878  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| || ||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  32483656 gatggataaaaaagacttgcacttaattttcattgatttgtagaagacatacgataaatcaccaagagagattttgtggaaa 32483737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 895 - 1015
Target Start/End: Original strand, 49028563 - 49028684
Alignment:
Q  895 ggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaatttccgaaaaca 993  Q
    ||||| |||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||| | |||| | | ||||| | ||||    
T  49028563 ggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgtaggatgggactaccgaagattttcccataaca 49028662  T
Q  994 atatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  49028663 ataggattgcaccaagggtcaa 49028684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 799 - 969
Target Start/End: Complemental strand, 48055913 - 48055743
Alignment:
Q  799 tggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaata-agaagaaaaaggt 897  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||  ||| ||||||||  |||||| |  || ||||||||  |||    
T  48055913 tggattaaaacgacttgcacttagttttcattgattcggagaaggcgtgtgatagagtgcctaaagagatttcatggaaatccctagagaagaaaggggt 48055814  T
Q  898 taagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatgg 969  Q
    || || ||  |||||| ||||||| || ||||| ||| || |||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  48055813 tagga-tgcctatattcgagctatgaaggatatctataagggagtctcaactagtgtgaggacacaggatgg 48055743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 791 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 17101588 - 17101504
Alignment:
Q  791 atattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaag-tagctagagagattttgtg 874  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  |||| ||||| || | |||||||| ||||||||    
T  17101588 atatcggatggataaaaaagacttgtacttagttttcatcgatttggagattacgtgtgatagagatggctagagaaattttgtg 17101504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 695 - 766
Target Start/End: Original strand, 11592765 - 11592835
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagc 766  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||    
T  11592765 agactaagaaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatggctt-ggaggtcgactatggaagc 11592835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 828 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 21520402 - 21520321
Alignment:
Q  828 attgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaata-agaagaaaaaggttaagattgttt 908  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| | |||||||||  || |||||||||| |||| ||||||||    
T  21520402 attgatttggagaagatgtatgataaaatgtttagagagatatcgtggaaagccctagagaagaaaaatgttatgattgttt 21520321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 102; Significance: 4e-50; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 23907508 - 23907181
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||   |||||||||  ||      ||||||    
T  23907508 agactaagaaaggagactcgagttacggataatcaatttggttttatgcct-gggaggtcgactatggaagca--atctacttacttcgacgcgtgatgg 23907412  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aa 885  Q
    | |||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |  |    
T  23907411 agcgatatcgaacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtaccaagagagattttgtggaaagccctgga 23907312  T
Q  886 gaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaattt 984  Q
    |||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||| | | |||| | | |||    
T  23907311 gaagaaaggggttaggattgtctatattagagctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgagactaccgaagatttt 23907212  T
Q  985 ccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23907211 cccataacaataggattgcaccaagggtcaa 23907181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Original strand, 435308 - 435635
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    ||||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||||   |||||||||  ||      |||| |    
T  435308 agactaagaaaggaggctcgagttacggataaccaatttggttttatgcct-gggaggttgactatggaagca--atctacttacttcgacgcgtgatag 435404  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aa 885  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |  |    
T  435405 agcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaagacgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagccctgga 435504  T
Q  886 gaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaattt 984  Q
    |||||||  ||||| |||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||| | |||| | | |||    
T  435505 gaagaaaggggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaagatgggactaccgaagatttt 435604  T
Q  985 ccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    || | ||||||| || |||||||||||||||    
T  435605 cccataacaataggagtgcaccaagggtcaa 435635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 695 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 48623733 - 48623463
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    |||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||   |||||||||  ||      ||||||    
T  48623733 agactaagaaagaagactcgagttacagataaccaatttggttttatgcct-gggaggtcgactatggaagca--atctacttagttcgacgcgtgatgg 48623637  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aa 885  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |  |    
T  48623636 agcgatataggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggtgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagccctgga 48623537  T
Q  886 gaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgagga 959  Q
    |||||||  ||||| |||||  |||||| | |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  48623536 gaagaaaggggttaggattgcctatattagggctatcaaagatatgtacgagggagcttcgactagtgtgagga 48623463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 792 - 1012
Target Start/End: Complemental strand, 55769486 - 55769265
Alignment:
Q  792 tattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaata-agaaga 890  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| || ||| |||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||  || ||||||    
T  55769486 tattggatggataaaaaagacttgcagttgattatcattgattttgataaggcgtatggtagagtgcctagacagattttgtggaaagctctagagaaga 55769387  T
Q  891 aaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccgacaa-tttccgaa 989  Q
    ||  | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||| |     
T  55769386 aagggattaggattgcttatattagagctatcaatgatatgtat-agggagcttcgactagtttgaggacgcaagatggagccacagacaattttcccat 55769288  T
Q  990 aacaatatgattgcaccaagggt 1012  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  55769287 aacaataggattgcaccaagggt 55769265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 792 - 1012
Target Start/End: Complemental strand, 55833742 - 55833521
Alignment:
Q  792 tattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaata-agaaga 890  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| || ||| |||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||  || ||||||    
T  55833742 tattggatggataaaaaagacttgcagttgattatcattgattttgataaggcgtatggtagagtgcctagacagattttgtggaaagctctagagaaga 55833643  T
Q  891 aaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccgacaa-tttccgaa 989  Q
    ||  | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||| |     
T  55833642 aagggattaggattgcttatattagagctatcaatgatatgtat-agggagcttcgactagtttgaggacgcaagatggagccacagacaattttcccat 55833544  T
Q  990 aacaatatgattgcaccaagggt 1012  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  55833543 aacaataggattgcaccaagggt 55833521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 804 - 1015
Target Start/End: Original strand, 53703800 - 53704013
Alignment:
Q  804 aaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aagaagaaaaaggttaaga 902  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||    
T  53703800 aaaaaggacttgcacttagttttcactgatttggaaaaggcgtatgattgagtaccgagagagattttgtggaaagccctgaagaagaaaggggttagga 53703899  T
Q  903 ttgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaatttccgaaaacaatatgatt 1001  Q
    |||  |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| | | |||||   ||||||| ||||    
T  53703900 ttgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacacaggatgggactaccgaagattttcccgtaacaataggatt 53703999  T
Q  1002 gcaccaagggtcaa 1015  Q
    ||||||||||||||    
T  53704000 gcaccaagggtcaa 53704013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 1778223 - 1777894
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--------tctgatgg 786  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||  | |||||||  |||||||||||   |||||||||        | ||||||    
T  1778223 agactaagaaaggagactcgagttacggataaccaatttgattttatgcct-gggaggttgactatggaagca--atctacttacttcgacgtgtgatgg 1778127  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaa-gacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaata- 884  Q
    | |||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |      
T  1778126 agcgatatcggacggataaaaaaaacttgcacttagttttcattgatttggaaaaaggtgtatgatagagtatcaagagagattttgtggaaagcccttg 1778027  T
Q  885 agaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagc-ttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaat 982  Q
    ||||||||  |||||  ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| | |||| | | |    
T  1778026 agaagaaaggggttagaattgcctatattagggctatcaatgatatgtatgagggagctttcaactagtgtgaggacgtaggatgggactaccgaagatt 1777927  T
Q  983 ttccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1777926 ttcccataacaataggattgcaccaagggtcaa 1777894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 800 - 960
Target Start/End: Original strand, 39707650 - 39707810
Alignment:
Q  800 ggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaataagaagaaaaaggtta 899  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||| ||  |    ||||||||  ||||     
T  39707650 ggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaagacgtatgatagagtgcctagagaggttttgtgaaagtcctggagaagaaaggggttt 39707749  T
Q  900 agattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggac 960  Q
     |||||  |||||| |||||||||| || ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||    
T  39707750 ggattgcctatattagagctatcaaggaaatgtatgagggagttttgactagcgtgaggac 39707810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 781 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 27451288 - 27451112
Alignment:
Q  781 tgatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagc 880  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| |    
T  27451288 tgatggagcgatatcggacggataaaaaagacttgcaattagttttcacttatttggagaaggcgtaggatagagtacttagagagattttgtggaaaac 27451189  T
Q  881 aat-aagaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtga 956  Q
      |  ||||||||  | | | |||||  |||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27451188 cctggagaagaaagggatgaggattgcctatattagagctatctgggatatgtatgagggagcttccactagtgtga 27451112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 799 - 864
Target Start/End: Original strand, 33369027 - 33369092
Alignment:
Q  799 tggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagag 864  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||    
T  33369027 tggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaagatgcatgatagagttgctagag 33369092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 939
Target Start/End: Original strand, 44860318 - 44860435
Alignment:
Q  821 ggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaata-agaagaaaaaggttaagattgtttatattggagct 919  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||  ||||| || ||| |||||| |||||    
T  44860318 ggttttcattgatttggaggaggcgtatgat--agtgcctagacagattttgtggaaagccttagagaagaaaggggttaggaatgtctatattcgagct 44860415  T
Q  920 atcaatgatatgtatgagag 939  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  44860416 atctaggatatgtatgagag 44860435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 781 - 881
Target Start/End: Original strand, 16002175 - 16002274
Alignment:
Q  781 tgatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagc 880  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16002175 tgatgtaacaatattgcacggataaaaaaaaatttcacttagttttcattgattt-gaaaaggcatatgaaaaagttcctagagagattttgtggaaagc 16002273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 790 - 838
Target Start/End: Original strand, 41598166 - 41598214
Alignment:
Q  790 gatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttgga 838  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41598166 gatattggatggataaaagagacttgcacttagttttcaatgatttgga 41598214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 804 - 842
Target Start/End: Original strand, 2296364 - 2296402
Alignment:
Q  804 aaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaag 842  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2296364 aaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaag 2296402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 890 - 935
Target Start/End: Original strand, 41005617 - 41005662
Alignment:
Q  890 aaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatg 935  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41005617 aaaaaggttaagattgcttatatttgagttatcaatgatatgtatg 41005662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 102; Significance: 4e-50; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 43241587 - 43241260
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    ||||||||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||   |||||||||  ||      ||||||    
T  43241587 agactaagaaaggagactcaagttacggataaccaatttggttttatgcct-gggaggtcgactatggaagca--atctacttacttcgacgcgtgatgg 43241491  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aa 885  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |  |    
T  43241490 agcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaagacgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagctctgga 43241391  T
Q  886 gaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaattt 984  Q
    |||||||  ||||| |||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||| | |||| | | |||    
T  43241390 gaagaaaggggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcacgatgggactaccgaagatttt 43241291  T
Q  985 ccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43241290 cccataacaataggattgcaccaagggtcaa 43241260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 781 - 970
Target Start/End: Original strand, 8671085 - 8671278
Alignment:
Q  781 tgatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagc 880  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  8671085 tgatggagcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagc 8671184  T
Q  881 aat-aagaagaaaaaggtt---aagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggg 970  Q
    | |  ||||||||  ||||   |  ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  8671185 actggagaagaaaggggttagaataattgtctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatggg 8671278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 51441970 - 51441643
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||   |||||||||  ||      ||||||    
T  51441970 agactaagaaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatgcct-gggaggtcgactatggaagca--atctacttacatcgacgcgtgatgg 51441874  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aa 885  Q
    |  |||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||  |  |    
T  51441873 agtgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaagcgtatgatagagtatcgtgagagattttgtggaaagccctgga 51441774  T
Q  886 gaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaattt 984  Q
    |||||||  |||||  ||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |  |||||| | |||| | | |||    
T  51441773 gaagaaatgggttagaattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgattagtgtgaggacgcaagatgggactaccgaagatttt 51441674  T
Q  985 ccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  51441673 cccataacaataggattgcaccaagggtcaa 51441643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 695 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 49348608 - 49348274
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    |||||||||||  ||||| || |||  |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||   |||||||||  ||      ||||||    
T  49348608 agactaagaaagaagactcgagttatggataaccaatttggttttatgcct-gggaggtcgactatggaagca--atctacttacttcgacgcgtgatgg 49348512  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgt--------atgataaagtagctagagagattttgtggaaa 878  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||        |||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  49348511 agcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtgtgatagtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaa 49348412  T
Q  879 gcaata-agaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg 977  Q
    ||  |  ||||||||| ||||| |||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||| | ||||    
T  49348411 gccctggagaagaaaagggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcatgatgggactaccg 49348312  T
Q  978 -acaatttccgaaaacaatatgattgcaccaagggtca 1014  Q
     | | ||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  49348311 aagattttcccataacaataggattgcaccaagggtca 49348274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 697 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 29173733 - 29173446
Alignment:
Q  697 actaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--------tctgatggaa 788  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||   || ||||||        | |||||||     
T  29173733 actaagaaaagagactcgagttacggataactaatttggttttatg-cctaggaggtcgactatggaagc--aatttacttacttcgacgtgtgatggag 29173637  T
Q  789 cgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaata-aga 887  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||| ||||||||||||   || |||    
T  29173636 cgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagtttttattgatttggagaaggcgtatgatagagtgccgagagaggttttgtggaaaggcctagaga 29173537  T
Q  888 agaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccga 978  Q
    ||| |  ||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  29173536 agagaggggttaggattgcctatattagagctatcaatgatatgcatggggaagtttcgactagtgtgaggacgcatgatggggctaccga 29173446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 801 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 32405558 - 32405400
Alignment:
Q  801 gataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaata-agaagaaaaaggtta 899  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||    
T  32405558 gataaaaaagatgtgcacttagttttcattgatttggaaaag-cgtatgatagagtgtctagagagattttgtggaaagccatagagaagaaaggggtta 32405460  T
Q  900 agattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgagga 959  Q
      |||| ||||||| ||||||| || |||| ||| | | ||||||  |||||| ||||||    
T  32405459 gaattgcttatattagagctataaaggatacgtacgcgggagctttgactagtttgagga 32405400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 802 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 34828179 - 34828020
Alignment:
Q  802 ataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaata-agaagaaaaaggttaa 900  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||| |||  ||| |||||||||||||||||   || |||||||| ||||||     
T  34828179 ataaaaatgactcgcacttagttttcattgatttgaagaatgtgtatgatatagtgtctaaagagattttgtggaaagtcctagagaagaaagaggttag 34828080  T
Q  901 gattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggac 960  Q
    ||||| ||||||| || ||||| | |||||||||||| | || || ||||||||||||||    
T  34828079 gattgcttatattcgatctatccaagatatgtatgagggggcctccactagtgtgaggac 34828020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 781 - 960
Target Start/End: Original strand, 45833727 - 45833907
Alignment:
Q  781 tgatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagc 880  Q
    |||||||  |||||||||   |||||||||| ||| |  | ||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  45833727 tgatggagtgatattggacaaataaaaaagatttgtatatagttttcattgatttgaagaaggcgtacgatagagtgtctagagatattttgtggaaagc 45833826  T
Q  881 aataagaagaaaaag--gttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggac 960  Q
      |||||  ||||||  |||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  45833827 -ctaagagaaaaaagatgttaggattgtttatactagagttatcaaagatatatatgagggagcttcgactaatgtgaggac 45833907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 781 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 35829506 - 35829272
Alignment:
Q  781 tgatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagc 880  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||  |||||||| |||| ||||||||    
T  35829506 tgatggaacaatattggacaaataaaaaagatatacacttagttttcattgatttggagaaggcttataata--gtgcctagagaggttttttggaaagc 35829409  T
Q  881 aata-agaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccgac 979  Q
      || | ||||||   |||| ||||| |||| || ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||    
T  35829408 cctagaaaagaaatgagttatgattgcttatgttcgagctatcaaatatatgcatgaggggacttcaactagtgtgagtacacaagatggggtcgccgac 35829309  T
Q  980 -aatttccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
     | ||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35829308 gattttcccataacaataggattgcaccaaggatcaa 35829272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 885 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 37463872 - 37463741
Alignment:
Q  885 agaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccga-caatt 983  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  | ||| ||| | |||||  | ||    
T  37463872 agaagaaaggggttaggattgcttatactagagctatcaaggatgtgtatgagggagctgcaactagtgtgaggatgcaggaggggcctaccgatgattt 37463773  T
Q  984 tccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  37463772 tcctataacaataggattgcaccaagggtcaa 37463741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 850 - 957
Target Start/End: Original strand, 7813732 - 7813840
Alignment:
Q  850 ataaagtagctagagagattttgtggaaagcaata-agaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaac 948  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| || || ||||||||   |||| || || ||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  7813732 ataaagtgtctagagagattttatggaaaacactagagaagaaatgtgttacgactgcttatattagagttatcaaggacatgtatgagagagcttcgac 7813831  T
Q  949 tagtgtgag 957  Q
    |||| ||||    
T  7813832 tagtatgag 7813840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 695 - 743
Target Start/End: Original strand, 11681897 - 11681945
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgt 743  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  11681897 agactaagaaaagagacttgagttaccgataatcaaattggttttatgt 11681945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 96; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 695 - 1017
Target Start/End: Original strand, 30544 - 30873
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||   |||||||||  ||      |||||     
T  30544 agactaagaaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatgcct-gggaggtcgactatggaagca--atctacttacttcaacgcgtgatga 30640  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aa 885  Q
    | ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    ||    
T  30641 agcgatatcagacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgaattggaaaaggcgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagccccgaa 30740  T
Q  886 gaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaattt 984  Q
    |||||||  ||||| |||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |||| | | |||    
T  30741 gaagaaaggggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagatttt 30840  T
Q  985 ccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaatc 1017  Q
    || ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30841 cccaaaacaataggactgcaccaagggtcaatc 30873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Original strand, 24177600 - 24177927
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||  | || ||||| |||| ||||||   |||||||||  ||      ||||||    
T  24177600 agactaagaaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatgcct-ggaaggtcgactacggaagca--atctacttacttcgacgcatgatgg 24177696  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aa 885  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |  |    
T  24177697 agcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttgaaaaaggcatatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagccctgga 24177796  T
Q  886 gaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaattt 984  Q
    |||||||  |||||  ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |||| | | |||    
T  24177797 gaagaaaggggttagcattgcctatattagagctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagatttt 24177896  T
Q  985 ccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24177897 ccgataacaataggattgcaccaagggtcaa 24177927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Original strand, 20318067 - 20318394
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||   |||||||||  ||      ||||||    
T  20318067 agactaagaaaggagactcgagttacagataaccaatttggttttatgcct-gggaggtcgactatggaagca--atctacttacttcgacgcgtgatgg 20318163  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aa 885  Q
    | |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||  |  |    
T  20318164 agcgatatcggacggataaataagacttgcacttagttttcattaatttggaaaaggcgtatgatagagtaccgggagagattttgtggaaagccctgga 20318263  T
Q  886 gaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaattt 984  Q
    |||||||  ||||| |||||  ||||||   |||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||||| | |||| | | |||    
T  20318264 gaagaaaggggttaggattgcctatattatggctatcaaggatatgtatgagggagtttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagatttt 20318363  T
Q  985 ccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20318364 cccataacaataggattgcaccaagggtcaa 20318394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 2076680 - 2076353
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctacttatct--------gatgg 786  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||   |||||||||  |        |||||    
T  2076680 agactaagaaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatgcct-gggaggtcgactatggaagca--atctacttacttcgacgcgggatgg 2076584  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaata-a 885  Q
    | |||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||  || |    
T  2076583 agcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttaattttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtaccgagagagattttgtggcaagccctaga 2076484  T
Q  886 gaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaattt 984  Q
    |||  ||  ||||| |||||  |||||    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||| | | |||| | | |||    
T  2076483 gaaataaggggttaggattgcctatatcatggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcatgatgagactaccgaagatttt 2076384  T
Q  985 ccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2076383 cccacaacaataggattgcaccaagggtcaa 2076353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30416079 - 30415929
Alignment:
Q  160 tttcacaagcttctctgatattttcaacgaaacttctatgcacaaacttgcgatgaattcgattatagatggatttggctgtggttgttttaccagatcc 259  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  || ||||||||  | ||    
T  30416079 tttcacaagtttctctaatattttcgatgaaacttctgtacacaaatttgcgatgaatttgattgtagatggctttggctgccgtagttttacccaaccc 30415980  T
Q  260 acccattccccagatccctatcatacaaacattgcttgaatgtttttcaat 310  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||    
T  30415979 tcccattccccatatgcctatcatacaaacctttgttgaattattttcaat 30415929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 699 - 852
Target Start/End: Original strand, 27039 - 27196
Alignment:
Q  699 taagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--------tctgatggaacg 790  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||  | || || ||||||||||||  |||||||||        | ||||| | ||    
T  27039 taagaaaaaagacttgagttactgataaccattttggttttatgctt--gaagatcgactatggaagcg--atctacttacttcaacgtgtgatgaagcg 27134  T
Q  791 atattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgata 852  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27135 atatcgaacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcgaatgata 27196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 805 - 879
Target Start/End: Original strand, 17212459 - 17212533
Alignment:
Q  805 aaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaag 879  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  17212459 aaaatgacttgcacttagatttcattgatttgaagaagacgtatgataaagtgcctagagagattttatggaaag 17212533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 895 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 1288589 - 1288468
Alignment:
Q  895 ggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaatttccgaaaaca 993  Q
    ||||| |||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |||| | | ||||| | ||||    
T  1288589 ggttatgattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagattttcccataaca 1288490  T
Q  994 atatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  1288489 ataggattgcaccaagggtcaa 1288468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 908 - 1015
Target Start/End: Original strand, 1274560 - 1274668
Alignment:
Q  908 tatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaatttccgaaaacaatatgattgcacc 1006  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |||| | | ||||| | |||||||  ||||||||    
T  1274560 tatattagggctatcaaagatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagattttcccataacaatagaattgcacc 1274659  T
Q  1007 aagggtcaa 1015  Q
    |||||||||    
T  1274660 aagggtcaa 1274668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 860 - 971
Target Start/End: Original strand, 3301095 - 3301207
Alignment:
Q  860 tagagagattttgtggaaagcaata-agaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgagg 958  Q
    |||||||||||||||||||||  |  ||||||||  ||| | |||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3301095 tagagagattttgtggaaagctttggagaagaaaggggtgaggattgcctatattagagttatccatgatatgtatgagggagcttcgactagtgtgagg 3301194  T
Q  959 acacgggatgggg 971  Q
    || | ||||||||    
T  3301195 acgcaggatgggg 3301207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20836538 - 20836335
Alignment:
Q  233 tttggctgtggttgttttaccagatccacccattccccagatccctatcatacaaacattgcttgaatgtttttcaataaactcggcaactttttgcaca 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||| || |  ||||||| || || || || |||||||    
T  20836538 tttggccgtggttgttttgcctaatccacccattccccatatccctatgatacagactttgcatgattgatcatcaataatcttggtaatttgttgcaca 20836439  T
Q  333 cgaggttccaacccaactgggaactcggaaatagacagaaatgaactgtctagttttgtgaaaacgtcaccaacaatttgctttactagttcaccttcat 432  Q
     | | |||||| ||||  || || || | ||||||||  |||||  | ||||||||| | |||| |||  |||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  20836438 tgggattccaatccaatcggaaattcagtaatagacaacaatgagatatctagttttctcaaaatgtcctcaacaattagctccactagttcaccttcat 20836339  T
Q  433 tcct 436  Q
    ||||    
T  20836338 tcct 20836335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 926 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 12493331 - 12493241
Alignment:
Q  926 gatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaatttccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |||| | | ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12493331 gatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaatattttcccataacaataggattgcaccaagggtcaa 12493241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 798 - 879
Target Start/End: Original strand, 37123755 - 37123836
Alignment:
Q  798 atggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaag 879  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||    
T  37123755 atggataaaaaagatgtgcacttagttttcattgatttggagaaactgtatgatagagttcctaaagagattttgtgtaaag 37123836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20810183 - 20809980
Alignment:
Q  233 tttggctgtggttgttttaccagatccacccattccccagatccctatcatacaaacattgcttgaatgtttttcaataaactcggcaactttttgcaca 332  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || | ||| || |  ||||||| || || || || |||||||    
T  20810183 tttggccgtggttgttttgcctgatccacccattccccatatccctatgatacagactttccatgattgatcatcaataatcttggtaatttgttgcaca 20810084  T
Q  333 cgaggttccaacccaactgggaactcggaaatagacagaaatgaactgtctagttttgtgaaaacgtcaccaacaatttgctttactagttcaccttcat 432  Q
    || | |||||| |||| |||  | || | ||||||||  |||||  | | ||||||||| |||| ||   |||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  20810083 cgggattccaatccaattggatattcagtaatagacaacaatgagatatttagttttgtcaaaatgtactcaacaatacccttcactagttcaccttcat 20809984  T
Q  433 tcct 436  Q
    ||||    
T  20809983 tcct 20809980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 808 - 878
Target Start/End: Original strand, 30418593 - 30418662
Alignment:
Q  808 aagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaa 878  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  30418593 aagacttccacttagttttcattaatttggagaagacata-gatagagtgcctagagagattttgtggaaa 30418662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 695 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 1288734 - 1288687
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatg 742  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  1288734 agactaagaaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatg 1288687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 908 - 962
Target Start/End: Original strand, 7605754 - 7605809
Alignment:
Q  908 tatattggagctatcaatgatatgtatgagagag-cttcaactagtgtgaggacac 962  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||    
T  7605754 tatattcgagctatcaatgatatgtatgagagagactttgactagtgttaggacac 7605809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 695 - 742
Target Start/End: Original strand, 25937173 - 25937220
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatg 742  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25937173 agactacgaaatgagactcgattttctgataaccaatttggttttatg 25937220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 814 - 872
Target Start/End: Complemental strand, 31503129 - 31503071
Alignment:
Q  814 tgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttg 872  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  31503129 tgcacttagtttttattgatttggagaagacatatgataaattgtctagaaagattttg 31503071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 798 - 844
Target Start/End: Original strand, 35685042 - 35685088
Alignment:
Q  798 atggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagac 844  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||    
T  35685042 atggataaaaaagacttacgcttaattttcattgatttggagaagac 35685088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 781 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 36566356 - 36566120
Alignment:
Q  781 tgatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagc 880  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  36566356 tgatggagcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtatcgagagagattttgtggaaagc 36566257  T
Q  881 aat-aagaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-a 978  Q
      |  ||||||||  ||||| |||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||| | | || | |    
T  36566256 cctggagaagaaaggggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgagactactgaa 36566157  T
Q  979 caatttccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
     | ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36566156 gattttcccataacaataggattgcaccaagggtcaa 36566120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 437
Target Start/End: Original strand, 7166591 - 7166869
Alignment:
Q  159 ttttcacaagcttctctgatattttcaacgaaacttctatgcacaaacttgcgatgaattcgattatagatggatttggctgtggttgttttaccagatc 258  Q
    ||||||||  ||||||| |  ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  7166591 ttttcacatacttctctaacgttttcaatgaaacttctattcaaaaatttgcgatgaatttgattatagatggctttggctgtggttgttttacccgacc 7166690  T
Q  259 cacccattccccagatccctatcatacaaacattgcttgaatgtttttcaataaactcggcaactttttgcacacgaggttccaacccaactgggaactc 358  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||  || ||||||| ||   |||||| ||||  |||| |||||| |||||||| || ||    
T  7166691 tgcccattccccatatccctatcatacaaactttgcttggctgagttgcaataaattcaataactttgtgcatgcgagattccaatccaactggaaattc 7166790  T
Q  359 ggaaatagacagaaatgaactgtctagttttgtgaaaacgtcaccaacaatttgctttactagttcaccttcattcctt 437  Q
    |  ||||||||   |||   ||||||||||||  ||||  ||  ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  7166791 gataatagacaaggatgcgttgtctagttttgccaaaagatcctcaacaatttgctgcactagttcagcttcactcctt 7166869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 789 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 15216378 - 15216207
Alignment:
Q  789 cgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaataagaa 888  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | || ||||    
T  15216378 cgatatcgaatggataaaaaagacttacatttagttttcattgatttgaataaggcgtatgatagagtacctagatagattttgtggaaatccatgagaa 15216279  T
Q  889 gaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggac 960  Q
    ||||  ||  | |||||  |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15216278 gaaaggggcgaggattgcctatattagagctatctatgatatatatgagggagcttcgactagtgtgaggac 15216207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Original strand, 36544228 - 36544555
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    ||||||||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||   |||||||||  ||      |||| |    
T  36544228 agactaagaaaggagactcaagttacggataaccaatttggttttatgcct-gggaggtcgactatggaagca--atctacttacttcgacgcgtgattg 36544324  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aa 885  Q
    | ||||||  || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||  |  |    
T  36544325 agcgatatctgacggataaaaaagatttgcacttagttttcattgatttgga-aaggcgtatgatagagtaccgagatagattttgtggaaagccctgga 36544423  T
Q  886 gaagaaaaaggtta-agattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaatt 983  Q
    |||||||  ||||| |  |||  |||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |||| | | ||    
T  36544424 gaagaaaggggttagaatttgcctatattagggctatcaaggatatatatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagattt 36544523  T
Q  984 tccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36544524 tcccataacaataggattgcaccaagggtcaa 36544555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 695 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 42855221 - 42854948
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||  |||||||||  ||      ||||||    
T  42855221 agactaagaaaagagactcgcgttacggataaccaatttggttttatgcct-gggaggtcgactattgaagcg--atctacttacttcgacgcgtgatgg 42855125  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaa--gacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaag-caat 883  Q
    | |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||| |       
T  42855124 agcgatattggacggataaaaaaaagacttacacttagttttcattgatttggagaaggcatatgatagagtgcctagagatattttgtggaaagcctcg 42855025  T
Q  884 aagaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggac 960  Q
     ||||||||  ||| | |||||  || ||| ||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42855024 tagaagaaaggggtgaggattgcctaaattagagctatccgggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggac 42854948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 315
Target Start/End: Original strand, 3269111 - 3269267
Alignment:
Q  159 ttttcacaagcttctctgatattttcaacgaaacttctatgcacaaacttgcgatgaattcgattatagatggatttggctgtggttgttttaccagatc 258  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||   ||  ||||| ||||||||||||   || |||||   | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  3269111 ttttcataaacttctctaatattttcaatgaaactgtgatctacaaatttgcgatgaattttgttgtagatatctctggctgttgttgttttacctgatc 3269210  T
Q  259 cacccattccccagatccctatcatacaaacattgcttgaatgtttttcaataaact 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3269211 cacccataccccagatccctatcatgcaaactttgcttgattgtttttcaataaact 3269267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31174031 - 31173812
Alignment:
Q  129 tgtaaatgaataacccctctataattatcattttcacaagcttctctgatattttcaacgaaactt---ctatgcacaaacttgcgatgaattcgattat 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||| ||||||  ||| |||||| |||||||   |||    ||||| | ||||| |||  ||| |    
T  31174031 tgtaaatgaataacccctctagaattattat---cacaaacttctcgaatactttcaaagaaacttgttctaccttcaaacctacgatggattttattgt 31173935  T
Q  226 agatggatttggctgtggttgttttaccagatccacccattccccagatccctatcatacaaacattgcttgaatgtttttcaataaactcggcaacttt 325  Q
    |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| || || |||||||||| || || |||    
T  31173934 agatagctttggctgtggttgttttcccggatccacccattccccatatccctatcatgcagactttgtttgattgattatcaataaacttggtaatttt 31173835  T
Q  326 ttgcacacgaggttccaacccaa 348  Q
    ||||||||| | |||||| ||||    
T  31173834 ttgcacacgggattccaatccaa 31173812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 295
Target Start/End: Original strand, 3264453 - 3264589
Alignment:
Q  159 ttttcacaagcttctctgatattttcaacgaaacttctatgcacaaacttgcgatgaattcgattatagatggatttggctgtggttgttttaccagatc 258  Q
    |||||| || ||||||| |||||||| | ||||||| ||| | |||| |||||||| ||| | || |||| || |||||||||||||||||||||  | |    
T  3264453 ttttcataaacttctctaatattttcgatgaaacttttatcctcaaatttgcgatggatttggttgtagacggctttggctgtggttgttttacccaacc 3264552  T
Q  259 cacccattccccagatccctatcatacaaacattgct 295  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  3264553 cacccattccccatattcccatcatacaaactttgct 3264589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 315
Target Start/End: Original strand, 3288384 - 3288535
Alignment:
Q  164 acaagcttctctgatattttcaacgaaacttctatgcacaaacttgcgatgaattcgattatagatggatttggctgtggttgttttaccagatccaccc 263  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| ||| ||   || |||| ||||  |||| | ||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  3288384 acaaacttctctaatattttcaatgaaacttgcatgcataaatttcaaattaatttgattgaagatagctttggctgttgttgttttccccgacccaccc 3288483  T
Q  264 attccccagatccctatcatacaaacattgcttgaatgtttttcaataaact 315  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  3288484 attccccagatccctgtcaaacaaactttgcttgattgattttgaataaact 3288535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 433
Target Start/End: Original strand, 3400608 - 3400821
Alignment:
Q  220 gattatagatggatttggctgtggttgttttaccagatccacccattccccagatccctatcatacaaacattgcttgaatgtttttcaataaactcggc 319  Q
    |||| ||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |   |||| || |  |||||||||| ||     
T  3400608 gattgtagatagctttggccgtggttgttttcccggatccacccattccccatatccctatcatacagacttctgttgattgatgatcaataaacttggt 3400707  T
Q  320 aactttttgcacacgaggttccaacccaactgggaactcggaaatagacagaaatgaactgtctagttttgtgaaaacgtcaccaacaatttgctttact 419  Q
    || || ||||||||| |  ||||| ||||| ||  | || | ||||||||  |||||  | ||||||||||  |||  |||  ||||||||||||| |||    
T  3400708 aatttgttgcacacgggaatccaatccaaccggatattcagtaatagacaacaatgagatatctagttttgccaaagtgtcctcaacaatttgcttcact 3400807  T
Q  420 agttcaccttcatt 433  Q
    ||||||||||||||    
T  3400808 agttcaccttcatt 3400821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13807013 - 13806935
Alignment:
Q  235 tggctgtggttgttttaccagatccacccattccccagatccctatcatacaaacattgcttgaatgtttttcaataaa 313  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  13807013 tggctgttgttgttttacctgatccacccatcccccagatccctatcaagcaaactttgcttgattgatttttaataaa 13806935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13785735 - 13785638
Alignment:
Q  215 aattcgattatagatggatttggctgtggttgttttaccagatccacccattccccagatccctatcatacaaacattgcttgaatgtttttcaataa 312  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  13785735 aatttgattgtagatggctttggctgtggttgttttccccgatccacccataccccagatccccatagagcaaacattgtttgattgattttcaataa 13785638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 310
Target Start/End: Original strand, 3409295 - 3409395
Alignment:
Q  210 cgatgaattcgattatagatggatttggctgtggttgttttaccagatccacccattccccagatccctatcatacaaacattgcttgaatgtttttcaa 309  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||||   ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  3409295 cgatgaatttcattgtagatggctttggctacagttgttttacctgatcctcccatgccccagatccctaccatacaaacatcgcccgaatgtttctcaa 3409394  T
Q  310 t 310  Q
    |    
T  3409395 t 3409395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 781 - 841
Target Start/End: Original strand, 6184827 - 6184887
Alignment:
Q  781 tgatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaa 841  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6184827 tgatggagcgatatcggacagataaaaaagacttacacttagttttcattgatttggagaa 6184887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 804 - 878
Target Start/End: Complemental strand, 11131029 - 11130955
Alignment:
Q  804 aaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaa 878  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  11131029 aaaaaatacttgcatctagttttcattgatttggataaggcgtatgataaagttttcagagagattttgtggaaa 11130955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 798 - 852
Target Start/End: Original strand, 25984734 - 25984788
Alignment:
Q  798 atggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgata 852  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  25984734 atggatcaaaaggacttgcacttggtttccattgatttggagaaggcatatgata 25984788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 691 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 41445452 - 41445401
Alignment:
Q  691 atggagactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatg 742  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||||||||||||    
T  41445452 atggagactaagaaaagacactcgagttacggctaaccaatttggttttatg 41445401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 695 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 51448915 - 51448588
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatgg 786  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||   ||||| |||  ||      ||||||    
T  51448915 agactaagaaaggagactcgagttacggataaccaatttggttttatacct-gggaggtcgactatggaagca--atctatttacttcgacgcgtgatgg 51448819  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaag-caataa 885  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |    |    
T  51448818 agcgatatcggacggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagcccggga 51448719  T
Q  886 gaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaattt 984  Q
    |||||||  ||||| | |||  |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | |||| | | |||    
T  51448718 gaagaaaggggttaggtttgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactggtgtgaggacgcaggatgggactaccgaagatttt 51448619  T
Q  985 ccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  51448618 cccataacaataggattgcaccaagggtcaa 51448588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 781 - 1015
Target Start/End: Original strand, 52137995 - 52138231
Alignment:
Q  781 tgatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagc 880  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  52137995 tgatggagcgatatcggacagataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggcgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagc 52138094  T
Q  881 aat-aagaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-a 978  Q
      |  ||||||||  ||||| |||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |||| |    
T  52138095 cctggagaagaaaggggttaggattgcctatattagggctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgggactaccgaa 52138194  T
Q  979 caatttccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
     | ||||| | |||||||  |||||||||||| ||||    
T  52138195 gattttcccataacaatagaattgcaccaaggatcaa 52138231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 289
Target Start/End: Original strand, 32412883 - 32413020
Alignment:
Q  152 attatcattttcacaagcttctctgatattttcaacgaaacttctatgcacaaacttgcgatgaattcgattatagatggatttggctgtggttgtttta 251  Q
    |||||| ||||||||   |||||| || ||||||| ||| |||||||   |||| |||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32412883 attatccttttcacagatttctctaatgttttcaatgaagcttctatctgcaaatttgcgattgatttgattatagatggcttttgctgtggttgtttta 32412982  T
Q  252 ccagatccacccattccccagatccctatcatacaaac 289  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32412983 cctgatccccccattccccaaatccctatcatgcaaac 32413020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 804 - 1009
Target Start/End: Original strand, 48220971 - 48221178
Alignment:
Q  804 aaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aagaagaaaaaggttaaga 902  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||| ||||| ||||||||  | || | |||| | ||||  |    
T  48220971 aaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaaaacgtatgatagattgcctagagatattttatggaaagccctgaaaaggaaataagttataa 48221070  T
Q  903 ttgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccgac-aatttccgaaaacaatatgatt 1001  Q
    ||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||   | |||| ||||||||||||  | ||||| | |||||||| ||||| | | ||||||| ||||    
T  48221071 ttacttatactcgagctatcaaagatatgtatgaggtggattcagctagtgtgaggatgcaggatgcgaccaccgacgaattttccataacaataggatt 48221170  T
Q  1002 gcaccaag 1009  Q
    ||||||||    
T  48221171 gcaccaag 48221178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 822 - 971
Target Start/End: Original strand, 9258095 - 9258244
Alignment:
Q  822 gttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaataagaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctat 921  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||  |    |  ||| ||||| |||||| |||||| |||||||    
T  9258095 gttttcattgatttggagaacgcatatgataaaattcctagagagattttatggaaagctctggataataaagggttaggattgtctatattagagctat 9258194  T
Q  922 caatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatgggg 971  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||    
T  9258195 aaacgatatgtatgagagagcttcgactattgtgaggacacatgatgggg 9258244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 279
Target Start/End: Original strand, 6907789 - 6907891
Alignment:
Q  177 atattttcaacgaaacttctatgcacaaacttgcgatgaattcgattatagatggatttggctgtggttgttttaccagatccacccattccccagatcc 276  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||||    
T  6907789 atattctcaatgaaacttctatgcacaaatttgcgatgaattttattgtagatgcctttggctgtggtagttttacccaacccgcccattccccaaatcc 6907888  T
Q  277 cta 279  Q
    |||    
T  6907889 cta 6907891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 800 - 960
Target Start/End: Original strand, 38849288 - 38849441
Alignment:
Q  800 ggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaata-agaagaaaaaggtt 898  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||   |||||||||        ||||  || ||||||||  ||||    
T  38849288 ggataaaaaacacttacacttagttttcattgatttggagaaggcgtaagatagagtttgtagagagat--------aagccctatagaagaaaggggtt 38849379  T
Q  899 aagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggac 960  Q
    | |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  38849380 atgattgcctatattagagctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggac 38849441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 797 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 50630418 - 50630373
Alignment:
Q  797 gatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaag 842  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50630418 gatggataaaaaagacttgcacttagttttcattgatttggagaag 50630373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 900 - 967
Target Start/End: Original strand, 19736502 - 19736569
Alignment:
Q  900 agattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggat 967  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  19736502 agattgtttatgttagagctatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtatgaggacacaggat 19736569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 900 - 967
Target Start/End: Original strand, 19757320 - 19757387
Alignment:
Q  900 agattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggat 967  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  19757320 agattgtttatgttagagctatcaaggatatgtacgagggagcttcgactagtatgaggacacaggat 19757387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 782 - 1015
Target Start/End: Original strand, 9705943 - 9706178
Alignment:
Q  782 gatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagca 881  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  9705943 gatggagcgatatcggacggataaaaaagacttacacttagttttcattgatttggagaaggcgtatgatagagtacctagagagattttgtggaaagcc 9706042  T
Q  882 at-aagaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-ac 979  Q
     |  ||||||||  ||| | |||||  || ||| ||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||  |||| |     
T  9706043 ctgtagaagaaaggggtgaggattgcctaaattagagctttccaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaggatgaggataccgtag 9706142  T
Q  980 aatttccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
    | ||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  9706143 attttcccataacaatatgactgcaccaagggtcaa 9706178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 695 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 5260454 - 5260184
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctacttat--------ctgatgg 786  Q
    ||||| ||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||  ||||  ||||        |||||||    
T  5260454 agacttagaaaagagactcacgttacggataaccaatttggttttatgtat-gggaggtcgattatggaagcg--atctctttatttcgacgcctgatgg 5260358  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaata-a 885  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||  || |    
T  5260357 agcgatatcggacggataaaaaagacttacacttagttttcatcgatttggagaaggcgtatgatagagtacctagagagatttagtggaaagccctaga 5260258  T
Q  886 gaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgagga 959  Q
     ||||||  ||| | ||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5260257 aaagaaaggggtgatgattgcttatattagagctatataggatatgtatgagggagcttcaactagtgtgagga 5260184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 789 - 960
Target Start/End: Original strand, 6082575 - 6082747
Alignment:
Q  789 cgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagcaat-aaga 887  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |  |||    
T  6082575 cgatatcggacggataaaaaggacttgcacttagttttcattgatttggaaaaggtgtatgatagagtaccgagagagattttgtggaaagccctggaga 6082674  T
Q  888 agaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggac 960  Q
    |||||  ||||| |||||  |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6082675 agaaaggggttaggattgcctatattagaactatcaaggatatgtatgagggagcttcgactagtgtgaggac 6082747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 781 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 20428752 - 20428516
Alignment:
Q  781 tgatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagc 880  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20428752 tgatggagcgatatcggacggataaaaaagacttacacctagttttcattgatttgtagaaggcgtatgatagagtacctagagagattttgtggaaagc 20428653  T
Q  881 aat-aagaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-a 978  Q
      |  ||||||||  ||| | |||||  |||||| |||||||| | |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    ||||||||  |||| |    
T  20428652 cctggagaagaaaggggtgaggattgcctatattagagctatccaggatatgtatgtgggagcttcgactagtgtgaggaagtaggatggggataccgta 20428553  T
Q  979 caatttccgaaaacaatatgattgcaccaagggtcaa 1015  Q
     | ||||| | ||||||| || |||||||||||||||    
T  20428552 tattttcccataacaataggactgcaccaagggtcaa 20428516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 781 - 959
Target Start/End: Original strand, 30670061 - 30670234
Alignment:
Q  781 tgatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagc 880  Q
    ||||||| |||||| |||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||||||||     
T  30670061 tgatggagcgatatcggacagagaaaaaagacttacacttagttttcattgatttggagaaggcgtttgata------ctagagagattttgtggaaagt 30670154  T
Q  881 aat-aagaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgagga 959  Q
      | ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||| || ||| ||  |||||||||||||    
T  30670155 cctgaagaagaaagaggttaagattgcctatattagagctatccaggatatgtataagggagttttgactagtgtgagga 30670234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 699 - 878
Target Start/End: Original strand, 3629346 - 3629530
Alignment:
Q  699 taagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--------tctgatggaacg 790  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||   |||||||||||        | ||||||| ||    
T  3629346 taagaaaagagactcgagttacggataatcaatttgattttatgctttgg-aggtcgacaatggaaa--tgatctacttacttcggcgtatgatggagcg 3629442  T
Q  791 atattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaa 878  Q
    |||| |||   | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  3629443 atatcggacaaacaaaaaagacttacacttagttttcattgatttgaagaaggcgtatgataaagtacctatggagattttgtggaaa 3629530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 803 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 2681529 - 2681480
Alignment:
Q  803 taaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgata 852  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2681529 taaaaaatacttgcacttagttttcattgatttggagaaggcgtatgata 2681480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 802 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 2208496 - 2208419
Alignment:
Q  802 ataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaag 879  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | |  ||||||||| ||| |||||||    
T  2208496 ataaaaacgacttgtacttagttttcattgatttggagaaggtgtatgatagaatgtctagagagactttttggaaag 2208419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 915 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 2681027 - 2680958
Alignment:
Q  915 gagctatcaatgatatgtatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccgacaattt 984  Q
    |||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  2681027 gagctatcaaggatatgcatgaaggagcttcgactagtgtgagaacacaggatggggctaccgaaaattt 2680958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 717 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 13442 - 13135
Alignment:
Q  717 ttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--tc------tgatggaacgatattggatggataaaaa 808  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||  |||||||||  ||      || |||| ||||||  || |||||| ||    
T  13442 ttacggataaccaatttggttttatgctt-gggaggtcgactatggaaacg--atctacttacttcgacgcgtggtggagcgatatatgacggataataa 13346  T
Q  809 agacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaag-caataagaagaaaaaggttaagattgtt 907  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |    |||||||  ||||||||||||      
T  13345 agacttacacttagttttcattgatttggagaaggcgtatgatagagttcctagagagattttgtggaaagtcctggagaagaacgaggttaagattgcc 13246  T
Q  908 tatattggagctatcaatgatatg--tatgagagagcttcaactagtgtgaggacacgggatggggccaccg-acaatttccgaaaacaatatgattgca 1004  Q
    |||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||| | |||| | | ||||| | ||||||| |||||||    
T  13245 tatattagagctatcaaggatatgtatatgagggagcttcgactagtgtgaggacgcaagatgggactaccgaagattttcccataacaataggattgca 13146  T
Q  1005 ccaagggtcaa 1015  Q
    |||||||||||    
T  13145 ccaagggtcaa 13135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 695 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 90296 - 90134
Alignment:
Q  695 agactaagaaaagagacttgatttactgataaccaatttggttttatgttttgggaggtcaactatggaagcgtgatctactta--------tctgatgg 786  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||  |||||||||||        | || | |    
T  90296 agactaagaaaagagactcgagttacggataaccaatttgattttatgcca-gggaggtcaactatggaag--tgatctacttaattcgacatgtggtcg 90200  T
Q  787 aacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgata 852  Q
    | || ||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  90199 agcgttatcggacggataaaaaagacttacacttagttttcattgatttggagaaggcgtatgata 90134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 781 - 942
Target Start/End: Original strand, 5614 - 5778
Alignment:
Q  781 tgatggaacgatattggatggataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaagc 880  Q
    ||||||| ||||||| ||  ||||||||| | | |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||   | |||||||||| |||||| |    
T  5614 tgatggagcgatatttgactgataaaaaacaatcgcacttagttttcatttatttggagaaggcgtatgatatagtgtgtcgagagattttatggaaaac 5713  T
Q  881 aat-aagaagaaaaaggttaagattgtttatattggagctatcaatgat--atgtatgagagagc 942  Q
      |  ||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  5714 tctggagaagaaaagggttaggattatgtatattagagctatcaaggatacatgtatgagagagc 5778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 802 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 595 - 518
Alignment:
Q  802 ataaaaaagacttgcacttggttttcattgatttggagaagacgtatgataaagtagctagagagattttgtggaaag 879  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | |  ||||||||| ||| |||||||    
T  595 ataaaaacgacttgtacttagttttcattgatttggagaaggtgtatgatagaatgtctagagagactttttggaaag 518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Original strand, 8209 - 8316
Alignment:
Q  191 acttctatgcacaaacttgcgatgaattcgattatagatggatttggctgtggttgttttaccagatccacccattccccagatccctatcatacaaaca 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||    ||||||| |||| ||||||||  | || ||||| ||||||||||||| |||  ||||     
T  8209 acttctatgcacaaacttgtgatgaattttattgtagacacctttggctatggtagttttacccaacccgcccatgccccagatccctaccatggaaact 8308  T
Q  291 ttgcttga 298  Q
    ||||||||    
T  8309 ttgcttga 8316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University