View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3892_low_20 (Length: 489)

Name: NF3892_low_20
Description: NF3892
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3892_low_20
NF3892_low_20
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (1-474)||(8975248-8975723)
chr4 (1-452)||(8972326-8972777)
chr4 (1-352)||(8930398-8930749)
chr4 (1-450)||(9002388-9002837)
chr4 (1-349)||(8916558-8916906)
chr4 (1-349)||(8905714-8906062)
chr4 (1-452)||(9027024-9027475)
chr4 (42-394)||(8952241-8952593)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (1-352)||(9401403-9401754)
chr5 (1-349)||(20075751-20076099)
[»] scaffold0287 (1 HSPs)
scaffold0287 (234-353)||(14118-14237)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (234-353)||(3631848-3631967)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8975723 - 8975248
Alignment:
Q  1 caaactttcttatagaggaataagatgacacacgcttgacactaaatatatgaatattacaaatttttcttaaatctctccaaggatcactatattgaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||| ||| | |  | ||||||||||||  |||||||||  |||||| ||| ||||    
T  8975723 caaactttcttatagaggaataatatgatacacgtttggaactaaataaatgcacaacagaaatttttcttatttctctccaaatatcactgtatggaga 8975624  T
Q  101 aaatgcaatttctgatccattataagataatttttgttggccatataggataggtctattacaaaacacatgatcattgtctttaaatatttctttggca 200  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||    
T  8975623 aaatacaatttctgacccattataagataatttttgttgaccatataatttaggtctattagaaaacacatgatcattgtttttcaacacttctttggca 8975524  T
Q  201 attttagctgaagaaacaacaattgctggccttaaaccaagttgaagtgaaaatagaggaccatatatttttgagaattgagaaaattgaagataaagat 300  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8975523 atttcagctgaacaaacaacaatagctggtcttaaaccaagttgaagtgaaaatagaggaccatatatttttgagaattgagaaaattgaagataaagat 8975424  T
Q  301 tagaaatgtctagttgatgaagattccctattattggaaggcctttaggacctgggggatagtgtttaatggttctatgtttgtggaagaacattaacaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8975423 tagaaatgtctagttgatgaagattccctattattggaaggcctttaggacctggggggtagtgtttaatggttctatgtttgtggaagaacattaacaa 8975324  T
Q  401 tggaataattaggcatagaacagatagaaatagtagtggcaacattgttacacttac--aattaatgtgacctatg 474  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8975323 tggaataattaggcatagaacaaatagaaatagcagtggcaacattgttacacttacaaaattaatgtgacctatg 8975248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 8972326 - 8972777
Alignment:
Q  1 caaactttcttatagaggaataagatgacacacgcttgacactaaatatatgaatattacaaatttttcttaaatctctccaaggatcactatattgaga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  8972326 caaactttcttatggaggaataatgtgatacacgtttggcactaaaaatatgaacaacacaaatttttcttatttctctccaaaaatcactatattgaga 8972425  T
Q  101 aaatgcaatttctgatccattataagataatttttgttggccatataggataggtctattacaaaacacatgatcattgtctttaaatatttctttggca 200  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||| |||||| |||    
T  8972426 aaataccatttctgacccattataagataatttttgttgaccatataatataggtctattagaaaaaacattaccattgtctttcaatacttcttttgca 8972525  T
Q  201 attttagctgaagaaacaacaattgctggccttaaaccaagttgaagtgaaaatagaggaccatatatttttgagaattgagaaaattgaagataaagat 300  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  8972526 atttcagctgaagaaacaacaatagcttgtcttaaaccaagtgaaagtgaaaatagaggaccatataattttgagaattgagataattgaagataaagct 8972625  T
Q  301 tagaaatgtctagttgatgaagattccctattattggaaggcctttaggacctgggggatagtgtttaatggttctatgtttgtggaagaacattaacaa 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  8972626 tagaaatatctagttgatgaagatttcctattatgggaaggcctttaggaccaggtggataatttttattggttctatatttgtggaagaacataagcaa 8972725  T
Q  401 tggaataattaggcatagaacagatagaaatagtagtggcaacattgttaca 452  Q
     |||| ||| | ||| | |||| | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  8972726 aggaagaatgaagcacacaacaaagagaaatagtagtgaaaacattgttaca 8972777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Original strand, 8930398 - 8930749
Alignment:
Q  1 caaactttcttatagaggaataagatgacacacgcttgacactaaatatatgaatattacaaatttttcttaaatctctccaaggatcactatattgaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  8930398 caaactttcttatagaagaataatatgacacacgcttggcgctaaatatatgaataacacaaagttttcttatctctctccaaaaatcactatattgaga 8930497  T
Q  101 aaatgcaatttctgatccattataagataatttttgttggccatataggataggtctattacaaaacacatgatcattgtctttaaatatttctttggca 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  8930498 aaatgcaatgtctgacccattataagataatttttgctggccatataacacaggtctattagaaaacacttgatcattatttttaaatatttctttcgca 8930597  T
Q  201 attttagctgaagaaacaacaattgctggccttaaaccaagttgaagtgaaaatagaggaccatatatttttgagaattgagaaaattgaagataaagat 300  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||||     
T  8930598 atttcagccgaagaaacaacaatagctgatcttaaacctagttgaagtgaaaatattggtccataaatttttgaaagttttgaaaattgaagataaagaa 8930697  T
Q  301 tagaaatgtctagttgatgaagattccctattattggaaggcctttaggacc 352  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  8930698 tagaattgtctagttgatgaagattccctattatgggtaggcctctaggacc 8930749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 450
Target Start/End: Original strand, 9002388 - 9002837
Alignment:
Q  1 caaactttcttatagaggaataagatgacacacgcttgacactaaatatatgaatattacaaatttttcttaaatctctccaaggatcactatattgaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||  |||| | ||||| ||    
T  9002388 caaaatttcttatagaagaataatatgacacacgtatggaactaaatatatgaataacacaaatttttcttatttctctccaaaaatcagtgtattgtga 9002487  T
Q  101 aaatgcaatttctgatccattataagataatttttgttggccatataggataggtctattacaaaacacatgatcattgtctttaaatatttctttggca 200  Q
    |||    |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||  || ||||||  ||| |||| |||||| |||    
T  9002488 aaaaaagatttctgacccattataagacaacttttgttgaccatataatataggtctattagaaaacaattggtcattggttttcaatacttcttttgca 9002587  T
Q  201 attttagctgaagaaacaacaattgctggccttaaaccaagttgaagtgaaaatagaggaccatatatttttgagaattgagaaaattgaagataaagat 300  Q
    ||||  || |||||||||||||| |||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |  |||||    
T  9002588 atttcggcagaagaaacaacaatagcttttcttaatccaagttgaattgaaaatagaggaccatatgtctttgagaattgagaaagttgaataggaagat 9002687  T
Q  301 tagaaatgtctagttgatgaagattccctattattggaaggcctttaggacctgggggatagtgtttaatggttctatgtttgtggaagaacattaacaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||    
T  9002688 tagaaatgtctagttgatgaagatttcctattatgggaaggcctttaggaccaagtggataatgtttaattgttctatggttttggaagaatattagcaa 9002787  T
Q  401 tggaataattaggcatagaacagatagaaatagtagtggcaacattgtta 450  Q
     |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  9002788 aggaataattaggcatagagcaagtagaaatagtactgacaacattgtta 9002837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 8916558 - 8916906
Alignment:
Q  1 caaactttcttatagaggaataagatgacacacgcttgacactaaatatatgaatattacaaatttttcttaaatctctccaaggatcactatattgaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  8916558 caaactttcttatagaagaataatatgacacacgcttcgcgctaaatatatgaataacacaaatttttcttatatctctccaaaaatcactatattgaga 8916657  T
Q  101 aaatgcaatttctgatccattataagataatttttgttggccatataggataggtctattacaaaacacatgatcattgtctttaaatatttctttggca 200  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  8916658 aaatacaatttctgacccattataagataatctttgctgaccatataacataggtctattagaaaacacatgatcattatttttaaatatctctttggca 8916757  T
Q  201 attttagctgaagaaacaacaattgctggccttaaaccaagttgaagtgaaaatagaggaccatatatttttgagaattgagaaaattgaagataaagat 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||  || ||||| |||||||| | ||  || |||||||||||||||     
T  8916758 attttatctgaagaaacaacaattgctggccttaaaccaagtttcaaggaaaatattggtccataaatttttgaaagttttgataattgaagataaagaa 8916857  T
Q  301 tagaaatgtctagttgatgaagattccctattattggaaggcctttagg 349  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  8916858 tagaattgtcaagctgatgaagattcccaattatgggtaggcctctagg 8916906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 8905714 - 8906062
Alignment:
Q  1 caaactttcttatagaggaataagatgacacacgcttgacactaaatatatgaatattacaaatttttcttaaatctctccaaggatcactatattgaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  8905714 caaactttcttatagaagaataatatgacacacgcttcgcgctaaatatatgaataacacaaatttttcttatatctctccaaaaatcactatattgaga 8905813  T
Q  101 aaatgcaatttctgatccattataagataatttttgttggccatataggataggtctattacaaaacacatgatcattgtctttaaatatttctttggca 200  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  8905814 aaatacaatttctgacccattataagataatctttgctgaccatataacataggtctattagaaaacacatgatcattatttttaaatatctctttggca 8905913  T
Q  201 attttagctgaagaaacaacaattgctggccttaaaccaagttgaagtgaaaatagaggaccatatatttttgagaattgagaaaattgaagataaagat 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||  || ||||| |||||||| |  |  || |||||||||||||||     
T  8905914 attttatctgaagaaacaacaattgctggccttaaaccaagtttcaaggaaaatattggtccataaatttttgaaagatttgataattgaagataaagaa 8906013  T
Q  301 tagaaatgtctagttgatgaagattccctattattggaaggcctttagg 349  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  8906014 tagaattgtcaagctgatgaagattcccaattatgggtaggcctctagg 8906062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 9027475 - 9027024
Alignment:
Q  1 caaactttcttatagaggaataagatgacacacgcttgacactaaatatatgaatattacaaatttttcttaaatctctccaaggatcactatattgaga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||  |||||  ||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||  |||| | ||||| ||    
T  9027475 caaactttcttatagatgaataatgtgatacacgtttggaactaagaatatgaacaacacaaatttttcttatttctctccaaaaatcagtgtattgtga 9027376  T
Q  101 aaatgcaatttctgatccattataagataatttttgttggccatataggataggtctattacaaaacacatgatcattgtctttaaatatttctttggca 200  Q
    ||||  |||||| || || |||||||  |||||||||||  ||||||   ||||||||| | |||||| ||| ||||||  ||| |||| |||||| |||    
T  9027375 aaatataatttccgacccgttataagtcaatttttgttgagcatataatctaggtctatcagaaaacaaatggtcattggttttcaatacttcttttgca 9027276  T
Q  201 attttagctgaagaaacaacaattgctggccttaaaccaagttgaagtgaaaatagaggaccatatatttttgagaattgagaaaattgaagataaagat 300  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||    
T  9027275 atttcagctgaagaaacaacaatagcttttcttaatccaagttgaattgaaaatagaggaccatatatctttgagaattgagaaagttgaataggaagat 9027176  T
Q  301 tagaaatgtctagttgatgaagattccctattattggaaggcctttaggacctgggggatagtgtttaatggttctatgtttgtggaagaacattaacaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||    
T  9027175 tagaaatgtctagttgatgaagatttcctattatgggaagtcctttaggaccaagtggataatgtttaatggttctatggttttggaagaatattagcaa 9027076  T
Q  401 tggaataattaggcatagaacagatagaaatagtagtggcaacattgttaca 452  Q
     |||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  9027075 aggaagaattaggcatagagcaagtagaattagtattgacaacattgttaca 9027024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 8952593 - 8952241
Alignment:
Q  42 ctaaatatatgaatattacaaatttttcttaaatctctccaaggatcactatattgagaaaatgcaatttctgatccattataagataatttttgttggc 141  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||| ||| |||  |||||||||| ||||||||| | ||| | | ||| |    
T  8952593 ctaaaaatatgaataacacaaatttttcttatttctctccaaaaatcaccatatggagcaaaaacaatttctgacccattataacacaatatgttttgac 8952494  T
Q  142 catataggataggtctattacaaaacacatgatcattgtctttaaatatttctttggcaattttagctgaagaaacaacaattgctggccttaaaccaag 241  Q
    |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8952493 catatgatataggtctattagaaaacacatgatcattgtttttgaatacttctttggcaatttcagctgaagaaacaacaatagctggtcttaaaccaag 8952394  T
Q  242 ttgaagtgaaaatagaggaccatatatttttgagaattgagaaaattgaagataaagattagaaatgtctagttgatgaagattccctattattggaagg 341  Q
    || ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8952393 tttaagtgaaaacaaaggaccatatatctttgagaattgagaaaattgaaaatgaagatttgagatatctagttgtagaagattccctattattggaagg 8952294  T
Q  342 cctttaggacctgggggatagtgtttaatggttctatgtttgtggaagaacat 394  Q
    ||||||||||| || ||||  | | || | ||| |||||||||||||||||||    
T  8952293 cctttaggaccaggtggattatttgtatttgttttatgtttgtggaagaacat 8952241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Original strand, 9401403 - 9401754
Alignment:
Q  1 caaactttcttatagaggaataagatgacacacgcttgacactaaatatatgaatattacaaatttttcttaaatctctccaaggatcactatattgaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9401403 caaactttcttatagaggaataagatgacacacgcttgacactaaatatatgaatattacaaatttttcttaaatctctccaaggatcactatattgaga 9401502  T
Q  101 aaatgcaatttctgatccattataagataatttttgttggccatataggataggtctattacaaaacacatgatcattgtctttaaatatttctttggca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9401503 aaatgcaatttctgatccattataagataatttttgttggccatataggataggtctattacaaaacacatgatcattgtctttaaatatttctttggca 9401602  T
Q  201 attttagctgaagaaacaacaattgctggccttaaaccaagttgaagtgaaaatagaggaccatatatttttgagaattgagaaaattgaagataaagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||  || |||||||||||||||     
T  9401603 attttagctgaagaaacaacaattgctggccttaaaccaagttgaagtgaaaatattggtccatatatttttgaaagttttgataattgaagataaagag 9401702  T
Q  301 tagaaatgtctagttgatgaagattccctattattggaaggcctttaggacc 352  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  9401703 tagaattgtctagctgatgaagattccctattatgggtaggcctctaggacc 9401754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 20075751 - 20076099
Alignment:
Q  1 caaactttcttatagaggaataagatgacacacgcttgacactaaatatatgaatattacaaatttttcttaaatctctccaaggatcactatattgaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  20075751 caaactttcttatagaagaataatatgacacacgcttagcgctaaatatatgaataacacaaaattttcttatatctctccaaaaatcactatattgaga 20075850  T
Q  101 aaatgcaatttctgatccattataagataatttttgttggccatataggataggtctattacaaaacacatgatcattgtctttaaatatttctttggca 200  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  20075851 aaatacaatttctgacccattataagataatctttgctggccatataacataggtctattagaaaacacatgatcattatttttaaatatctctttggca 20075950  T
Q  201 attttagctgaagaaacaacaattgctggccttaaaccaagttgaagtgaaaatagaggaccatatatttttgagaattgagaaaattgaagataaagat 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||  || ||||| |||||||| | ||  || ||||||||||| |||     
T  20075951 attttatctgaagaaacaacaattgctggccttaaaccaagtttcatggaaaatattggtccataaatttttgaaagttttgataattgaagatagagaa 20076050  T
Q  301 tagaaatgtctagttgatgaagattccctattattggaaggcctttagg 349  Q
    ||||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  20076051 tagaattatcaagctgatgaagattcccaattatgggtaggcctctagg 20076099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0287 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0287
Description:

Target: scaffold0287; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14237 - 14118
Alignment:
Q  234 aaaccaagttgaagtgaaaatagaggaccatatatttttgagaattgagaaaattgaagataaagattagaaatgtctagttgatgaagattccctatta 333  Q
    ||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||||  |   ||||||| | || |||||| ||| |||| |||||||| ||||| || ||||    
T  14237 aaaccaatttgaagagagaaaagaggaccatagatttttgagagattccaaaattgtaaatgaagatttgaagtgtcaagttgatggagatttccaatta 14138  T
Q  334 ttggaaggcctttaggacct 353  Q
    | ||||||||||| ||||||    
T  14137 taggaaggccttttggacct 14118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 353
Target Start/End: Original strand, 3631848 - 3631967
Alignment:
Q  234 aaaccaagttgaagtgaaaatagaggaccatatatttttgagaattgagaaaattgaagataaagattagaaatgtctagttgatgaagattccctatta 333  Q
    ||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||||  |   ||||||| | || |||||| ||| |||| |||||||| ||||| || ||||    
T  3631848 aaaccaatttgaagagagaaaagaggaccatagatttttgagagattccaaaattgtaaatgaagatttgaagtgtcaagttgatggagatttccaatta 3631947  T
Q  334 ttggaaggcctttaggacct 353  Q
    | ||||||||||| ||||||    
T  3631948 taggaaggccttttggacct 3631967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University