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Alignment Overview

Query: NF3892_low_28 (Length: 448)

Name: NF3892_low_28
Description: NF3892
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3892_low_28
NF3892_low_28
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (19-442)||(41564053-41564476)
chr2 (19-442)||(5351294-5351716)
chr2 (19-442)||(10620062-10620484)
chr2 (19-442)||(209073-209495)
chr2 (31-442)||(7267007-7267417)
chr2 (19-442)||(24753587-24754008)
chr2 (19-442)||(39798003-39798423)
chr2 (31-442)||(3795437-3795860)
chr2 (19-307)||(18000321-18000608)
chr2 (19-442)||(41181499-41181920)
chr2 (19-442)||(28342611-28343033)
chr2 (73-339)||(38950232-38950496)
chr2 (28-442)||(1096667-1097093)
chr2 (19-442)||(45479384-45479805)
chr2 (48-442)||(24601758-24602161)
chr2 (48-442)||(24611953-24612356)
chr2 (28-442)||(43943787-43944211)
chr2 (19-442)||(9659603-9660040)
chr2 (19-442)||(41052710-41053143)
chr2 (29-440)||(12905621-12906037)
chr2 (33-442)||(439373-439792)
chr2 (30-442)||(41004627-41005046)
chr2 (29-442)||(81813-82237)
chr2 (253-442)||(1150594-1150783)
chr2 (48-235)||(10825337-10825521)
chr2 (48-235)||(39950941-39951125)
chr2 (28-230)||(25184606-25184806)
chr2 (336-442)||(38949749-38949855)
chr2 (48-235)||(32952849-32953033)
chr2 (61-235)||(29398040-29398208)
chr2 (156-262)||(3206971-3207077)
chr2 (48-108)||(7189848-7189907)
chr2 (154-440)||(25613424-25613710)
chr2 (19-64)||(38950492-38950537)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (22-442)||(30301225-30301645)
chr8 (19-442)||(7344119-7344541)
chr8 (29-442)||(8419503-8419915)
chr8 (19-442)||(32375740-32376162)
chr8 (33-442)||(23924069-23924475)
chr8 (29-442)||(39556-39967)
chr8 (19-442)||(31959610-31960045)
chr8 (28-442)||(35962405-35962817)
chr8 (19-442)||(43376842-43377277)
chr8 (19-326)||(20548938-20549242)
chr8 (19-442)||(2124266-2124704)
chr8 (18-442)||(43679484-43679906)
chr8 (131-441)||(22588006-22588316)
chr8 (48-345)||(39751179-39751473)
chr8 (154-442)||(7171880-7172178)
chr8 (19-383)||(4867415-4867787)
chr8 (149-442)||(22661137-22661430)
chr8 (19-230)||(41743953-41744162)
chr8 (269-442)||(41744160-41744333)
chr8 (48-235)||(34367030-34367214)
chr8 (19-203)||(23578523-23578705)
chr8 (51-234)||(41238970-41239150)
chr8 (149-360)||(30972519-30972730)
chr8 (337-436)||(39751659-39751758)
chr8 (19-108)||(1116110-1116198)
chr8 (318-375)||(31281198-31281255)
chr8 (19-54)||(17924232-17924267)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (19-442)||(1608381-1608804)
chr6 (31-442)||(13382729-13383151)
chr6 (19-442)||(29286291-29286712)
chr6 (28-442)||(31150628-31151039)
chr6 (28-442)||(25140668-25141081)
chr6 (30-442)||(7537286-7537710)
chr6 (30-442)||(23958990-23959400)
chr6 (19-300)||(18351348-18351627)
chr6 (28-442)||(18609796-18610208)
chr6 (50-442)||(29667386-29667785)
chr6 (19-436)||(2051116-2051545)
chr6 (29-442)||(28362280-28362704)
chr6 (31-233)||(11840022-11840222)
chr6 (185-442)||(2259338-2259594)
chr6 (154-382)||(34230701-34230930)
chr6 (48-235)||(31771510-31771695)
chr6 (61-263)||(26702454-26702653)
chr6 (60-235)||(3502434-3502607)
chr6 (62-407)||(20448386-20448728)
chr6 (63-206)||(8304570-8304711)
chr6 (30-187)||(2258385-2258540)
chr6 (155-257)||(20439753-20439855)
chr6 (162-243)||(19129204-19129285)
chr6 (155-257)||(20436045-20436147)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (19-442)||(49563929-49564352)
chr4 (28-442)||(3407802-3408215)
chr4 (31-442)||(19069287-19069710)
chr4 (19-440)||(37394768-37395201)
chr4 (50-442)||(10422971-10423359)
chr4 (133-442)||(10374240-10374549)
chr4 (28-435)||(44050650-44051068)
chr4 (28-442)||(38460523-38460935)
chr4 (30-442)||(4774167-4774587)
chr4 (31-237)||(15995822-15996026)
chr4 (30-442)||(18578722-18579142)
chr4 (29-346)||(50904822-50905137)
chr4 (166-442)||(24415392-24415680)
chr4 (89-339)||(51642165-51642423)
chr4 (31-235)||(50278593-50278796)
chr4 (48-235)||(51492190-51492374)
chr4 (268-442)||(11506657-11506831)
chr4 (60-235)||(37016028-37016201)
chr4 (149-414)||(6186865-6187140)
chr4 (48-235)||(44674257-44674440)
chr4 (162-382)||(30043046-30043275)
chr4 (19-116)||(24414923-24415020)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (19-442)||(30943278-30943701)
chr3 (19-442)||(8156597-8157019)
chr3 (19-442)||(3952777-3953199)
chr3 (19-442)||(6744889-6745310)
chr3 (28-442)||(13743365-13743776)
chr3 (31-442)||(9426705-9427115)
chr3 (31-442)||(2857545-2857955)
chr3 (31-442)||(50957242-50957665)
chr3 (19-442)||(4002054-4002489)
chr3 (33-442)||(48246514-48246921)
chr3 (19-442)||(36812926-36813361)
chr3 (32-442)||(46989614-46990036)
chr3 (19-438)||(21951888-21952305)
chr3 (19-442)||(6489417-6489853)
chr3 (29-442)||(14402568-14402971)
chr3 (169-442)||(2743678-2743965)
chr3 (28-311)||(7841193-7841474)
chr3 (19-442)||(66962-67393)
chr3 (48-235)||(600314-600498)
chr3 (60-235)||(36134053-36134226)
chr3 (61-235)||(50213588-50213760)
chr3 (48-235)||(42166182-42166366)
chr3 (48-235)||(47070587-47070771)
chr3 (60-235)||(2271484-2271658)
chr3 (48-230)||(52387918-52388097)
chr3 (48-233)||(9473721-9473903)
chr3 (48-235)||(16646944-16647127)
chr3 (31-154)||(2743498-2743619)
chr3 (48-147)||(4004963-4005059)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (19-442)||(3993405-3993827)
chr1 (19-442)||(3944063-3944485)
chr1 (19-442)||(38771718-38772141)
chr1 (19-440)||(20353500-20353919)
chr1 (30-442)||(29352333-29352743)
chr1 (30-442)||(44469574-44469984)
chr1 (19-442)||(30909592-30910013)
chr1 (19-442)||(13633435-13633857)
chr1 (19-442)||(9710667-9711087)
chr1 (19-442)||(50113396-50113831)
chr1 (86-442)||(5081927-5082283)
chr1 (90-442)||(6558047-6558411)
chr1 (51-442)||(37018959-37019347)
chr1 (19-442)||(8459046-8459467)
chr1 (29-300)||(15051053-15051322)
chr1 (91-442)||(12643369-12643715)
chr1 (28-442)||(51666229-51666641)
chr1 (29-442)||(7966081-7966498)
chr1 (19-424)||(19495128-19495544)
chr1 (28-442)||(13177689-13178109)
chr1 (61-442)||(25039644-25040023)
chr1 (149-442)||(38690126-38690418)
chr1 (19-442)||(1655643-1656074)
chr1 (19-256)||(46886137-46886372)
chr1 (20-440)||(4517959-4518399)
chr1 (154-439)||(36072584-36072879)
chr1 (28-442)||(46978797-46979233)
chr1 (61-440)||(5141435-5141811)
chr1 (162-442)||(33168133-33168423)
chr1 (31-235)||(52805330-52805531)
chr1 (60-235)||(470840-471013)
chr1 (48-235)||(22527465-22527649)
chr1 (19-236)||(22345818-22346028)
chr1 (31-235)||(31780068-31780270)
chr1 (60-235)||(94527-94700)
chr1 (61-235)||(16281828-16281999)
chr1 (48-236)||(19521715-19521900)
chr1 (48-231)||(21144405-21144585)
chr1 (18-122)||(23359230-23359334)
chr1 (48-232)||(50617321-50617503)
chr1 (30-114)||(38690030-38690114)
chr1 (197-274)||(1179878-1179955)
chr1 (29-72)||(12643329-12643372)
chr1 (52-104)||(47714986-47715037)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (19-442)||(30790569-30790992)
chr7 (19-442)||(45767423-45767845)
chr7 (19-442)||(43619768-43620190)
chr7 (19-442)||(603868-604289)
chr7 (19-442)||(18109356-18109778)
chr7 (19-442)||(15069913-15070335)
chr7 (29-442)||(42503401-42503813)
chr7 (19-442)||(47742552-47742973)
chr7 (19-436)||(34622587-34623002)
chr7 (28-442)||(19044390-19044816)
chr7 (28-442)||(20709820-20710246)
chr7 (29-243)||(40928715-40928927)
chr7 (19-440)||(10705336-10705765)
chr7 (129-438)||(12111412-12111729)
chr7 (269-442)||(29592839-29593012)
chr7 (165-442)||(47064857-47065148)
chr7 (30-230)||(29592643-29592841)
chr7 (48-235)||(17838405-17838589)
chr7 (48-233)||(34742168-34742349)
chr7 (48-235)||(5537965-5538147)
chr7 (48-235)||(13323485-13323669)
chr7 (154-235)||(10522285-10522366)
chr7 (61-122)||(12111332-12111393)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (19-442)||(37814671-37815092)
chr5 (28-442)||(27863501-27863913)
chr5 (19-442)||(13563730-13564151)
chr5 (19-442)||(25890083-25890504)
chr5 (27-442)||(28882091-28882498)
chr5 (31-442)||(7017612-7018008)
chr5 (19-442)||(38855804-38856225)
chr5 (19-442)||(11029097-11029517)
chr5 (19-375)||(34079761-34080115)
chr5 (30-442)||(34122624-34123048)
chr5 (48-442)||(7796696-7797087)
chr5 (29-442)||(1039355-1039779)
chr5 (213-442)||(14280541-14280770)
chr5 (19-442)||(33994712-33995133)
chr5 (29-442)||(24053252-24053673)
chr5 (29-442)||(24050125-24050548)
chr5 (19-384)||(25877709-25878082)
chr5 (208-442)||(4196792-4197024)
chr5 (19-213)||(28388311-28388503)
chr5 (281-440)||(28387821-28387979)
chr5 (19-136)||(14280767-14280884)
chr5 (43-442)||(30352541-30352940)
chr5 (48-235)||(7762013-7762198)
chr5 (318-442)||(43179428-43179552)
chr5 (149-392)||(6267691-6267933)
chr5 (48-235)||(38407266-38407449)
chr5 (48-235)||(41799539-41799722)
chr5 (19-122)||(4196643-4196746)
chr5 (62-274)||(43179631-43179841)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (19-442)||(4889-5311)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (29-442)||(15518-15929)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (29-442)||(22500-22924)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (19-335)||(8288-8602)
[»] scaffold0219 (2 HSPs)
scaffold0219 (19-359)||(19743-20096)
scaffold0219 (357-442)||(19497-19582)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (48-438)||(21768-22144)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (292-442)||(10827-10977)
scaffold0169 (19-172)||(1517-1668)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (48-235)||(12522-12706)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (60-235)||(236006-236179)
[»] scaffold0794 (1 HSPs)
scaffold0794 (268-442)||(1314-1488)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 408; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 41564476 - 41564053
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41564476 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 41564377  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41564376 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 41564277  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41564276 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 41564177  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41564176 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 41564077  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  41564076 cgttttccatgcgtattcatctct 41564053  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 5351716 - 5351294
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5351716 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggtaatataatt 5351618  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5351617 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 5351518  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5351517 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 5351418  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5351417 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 5351318  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  5351317 cgttttccatgcgtattcatctct 5351294  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 10620062 - 10620484
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10620062 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggtaatataatt 10620160  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10620161 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 10620260  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10620261 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 10620360  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10620361 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 10620460  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  10620461 cgttttccatgcgtattcatctct 10620484  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 209073 - 209495
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  209073 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggtaatataatt 209171  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209172 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 209271  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  209272 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacata 209371  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209372 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 209471  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  209472 cgttttccatgcgtattcatctct 209495  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 31 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7267417 - 7267007
Alignment:
Q  31 tctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatga 129  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||   | ||    
T  7267417 tctgcataattgtaaagcatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatttatac--aaga 7267320  T
Q  130 ttgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7267319 ttgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaacctacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaat 7267220  T
Q  230 tcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaaca 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7267219 tcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattacatatggaacgaaca 7267120  T
Q  330 tacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatg 429  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7267119 tacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggtatatagcttgtcgttttccatg 7267020  T
Q  430 tgtattcatctct 442  Q
     ||||||||||||    
T  7267019 cgtattcatctct 7267007  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24754008 - 24753587
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24754008 cagacagcaagttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatt 24753909  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   | |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24753908 catac--aagattgaaactgggacataaacaagataaatacaatatcttttacaatttttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaa 24753811  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24753810 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcata 24753711  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24753710 tggaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatacgatgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaagcatatagcttgc 24753611  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||  ||||||||||||    
T  24753610 cgttttccatacgtattcatctct 24753587  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 39798423 - 39798003
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  39798423 cagacagtgggttctgcataattctagacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagacaatttccaaaggttaaataatt 39798324  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaattaaaca 217  Q
    ||||   |  |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39798323 catac--aatattgaaactcggtcataatcaagataaatgcaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaacattaaaca 39798226  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  39798225 aacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagt--ccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattacat 39798128  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798127 atggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 39798028  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  39798027 ccgttttccatgcgtattcatctct 39798003  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 442
Target Start/End: Original strand, 3795437 - 3795860
Alignment:
Q  31 tctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgat 130  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||    
T  3795437 tctgcataattctaaacatttccaagccatttttttggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aagat 3795534  T
Q  131 tgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3795535 tgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaatt 3795634  T
Q  231 catcaa--------------aacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattaca 316  Q
    ||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  3795635 catcaaattaaactactcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgca 3795734  T
Q  317 tatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagctt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3795735 tatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcacgaataagcaaaggcatatagctt 3795834  T
Q  417 gccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3795835 gccgttttccatgcgtattcatctct 3795860  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 307
Target Start/End: Original strand, 18000321 - 18000608
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18000321 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggtaatataatt 18000419  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18000420 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 18000519  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18000520 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaat 18000608  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 41181499 - 41181920
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  41181499 cagacagtgggttatgcataattctaatgcatttccaagccattttttgggc-agtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaa 41181597  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |  |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  41181598 tcatac--aacattgaaactcggtcataactaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaca 41181695  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41181696 aacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacat 41181795  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  41181796 atggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgtataagccaatgcatatagcttg 41181895  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||| |||||| |||||    
T  41181896 ccgttttccatgcgtattcgtctct 41181920  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 28342611 - 28343033
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  28342611 cagacagtgggttctgcataattctaaagaatttccaaactattttt-cggccagtttttatctgtaattaaaccagaacatttccaaaggcaatataaa 28342709  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |  |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  28342710 tcatac--aacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaca 28342807  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  28342808 aacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgttcataattaaacaattcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcat 28342907  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccg-aaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagctt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28342908 atggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagctt 28343007  T
Q  417 gccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||    
T  28343008 gccgttttacatgtgtattcgtctct 28343033  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 73 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 38950496 - 38950232
Alignment:
Q  73 tttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttaca 172  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38950496 tttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatac--aagattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttaca 38950399  T
Q  173 attgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcatta 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38950398 attgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcatta 38950299  T
Q  273 cacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatata 339  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38950298 cacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattacatatggaacgaacatacatatata 38950232  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Original strand, 1096667 - 1097093
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtat 127  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   |     
T  1096667 ggttatgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aa 1096764  T
Q  128 gattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaa 227  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||    
T  1096765 cattaaaactcggacataaacaagataaatacagtatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaactacacaaacgtttgaa 1096864  T
Q  228 attcatcaaaacattacaaagtgtccata--------------attaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaatt 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||              ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1096865 attcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgttcataattaaacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 1096964  T
Q  314 acatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatag 413  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||  | |||||||     
T  1096965 gcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaattcgacgtcgctatcgtcgcaaataagcccaagcatataa 1097064  T
Q  414 cttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1097065 cttgccgttttccatgcgtattcgtctct 1097093  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 45479805 - 45479384
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  45479805 cagacagtgggttctgcataattctaaagcattttcaagctattttt-cggccagtttttacttgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataac 45479707  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    | |||   |  ||| |||||| | |||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || | |    
T  45479706 taatac--aacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacaaa 45479609  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  45479608 aaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcat 45479509  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45479508 atggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgccgatatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttg 45479409  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  45479408 ccgttttccatgtgtattcatctct 45479384  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 48 - 442
Target Start/End: Original strand, 24601758 - 24602161
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |  |||||||||||| |||||     
T  24601758 atttccaagccattttt-cggtcagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatac--aacattgaaactcggtcataaa 24601854  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaa 247  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24601855 caagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacagacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaa 24601954  T
Q  248 gt--------------gtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacataca 333  Q
    ||              |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |    
T  24601955 gtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacat--a 24602052  T
Q  334 tatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgta 433  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24602053 tatataatatattatcttccaccatattccgaaaaataaatccgacgttgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatccgta 24602152  T
Q  434 ttcatctct 442  Q
    ||| |||||    
T  24602153 ttcgtctct 24602161  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 48 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24612356 - 24611953
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |  |||||||||||| |||||     
T  24612356 atttccaagccattttt-cggtcagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatac--aacattgaaactcggtcataaa 24612260  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaa 247  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24612259 caagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacagacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaa 24612160  T
Q  248 gtgtccataattaa--------------actactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacataca 333  Q
    ||||||||||||||              || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |    
T  24612159 gtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacat--a 24612062  T
Q  334 tatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgta 433  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24612061 tatataatatattatcttccaccatattccgaaaaataaatccgacgttgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatccgta 24611962  T
Q  434 ttcatctct 442  Q
    ||| |||||    
T  24611961 ttcgtctct 24611953  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Original strand, 43943787 - 43944211
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaa--tataattcatatg 124  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||      
T  43943787 ggttatgcataattctaaagcatttccaagccattttt-cggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaatataaatcatac- 43943884  T
Q  125 tatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgttt 224  Q
     |  ||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | | ||||    
T  43943885 -aacattaaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaaaaaagttt 43943983  T
Q  225 gaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaatta 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| ||          |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  43943984 gaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccatgcataaacaacacattacaattcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 43944083  T
Q  315 catatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||||    
T  43944084 catatggaacgaacatacatatatattatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcatcgcgaataagccaatgcatatagc 43944183  T
Q  415 ttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43944184 ttgccgttttccatgcgtattcatctct 43944211  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 9660040 - 9659603
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagt-atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  9660040 cagacagtgggttatgcataattctaaaacatttccaagccattttt-cggccagtttttacctttaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaa 9659942  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |  |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  9659941 tcatac--aacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaacgacatttggttaaaattacaca 9659844  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattaca--------------aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacatt 303  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||||              |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9659843 aacgcttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatacctacttacatt 9659744  T
Q  304 caatgcaattacatatggaacgaacatac--atatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagc 401  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||| |||||||||    
T  9659743 caacgcaattgcatattgaacgaacatacaaatataaaatatattatcttccaccatattccgaaacataaactcgacgtcgctatcgtcacgaataagc 9659644  T
Q  402 aaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9659643 caaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctct 9659603  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 41052710 - 41053143
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  41052710 cagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccattttt-cggccagtttttacctgtaattaaaccagagtatttccaaaggcaatataaa 41052808  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |  |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  41052809 tcatac--aacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaca 41052906  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac--tcattacaca--tcattaaa-----ttaaattcctacttacattcaatg 308  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |  | |||| |||  |||||| |     ||||||||||||||||||||||||    
T  41052907 aacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaattcattacacatcattaaattcctacttacattcaatg 41053006  T
Q  309 caattacatat--ggaacgaacatacatatataa-tatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaag 405  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  41053007 caattgcatatatggaacgaacacacatatataaatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaag 41053106  T
Q  406 gcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||    
T  41053107 gcatatagcttggcgttttcaatgcgtattcgtctct 41053143  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 440
Target Start/End: Original strand, 12905621 - 12906037
Alignment:
Q  29 gttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtat 127  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |     
T  12905621 gttctgcataattctaaagcatttccaagccattttt-cgaccagtttttac---taatttaaccagagcatttccaaaggcaatataactcatac--aa 12905714  T
Q  128 gattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaa 227  Q
     ||| |||||| | |||||  |||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| | |||||||    
T  12905715 catttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaa 12905814  T
Q  228 attcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||          |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||    
T  12905815 attcatcaaaacgttacatagtgtcaataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccgtacttacattcaacgcaattgcat 12905914  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12905915 atggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttg 12906014  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatct 440  Q
      |||||||||| ||||||||||    
T  12906015 ttgttttccatgcgtattcatct 12906037  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 33 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 439792 - 439373
Alignment:
Q  33 tgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgatt 131  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||   |  |||    
T  439792 tgcataattctaaagcatttccaagccattttt-cggtcagtttttacctgtaattaaaccagcgcatttccaaaggcaatataaatcatac--aacatt 439696  T
Q  132 gaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattc 231  Q
    ||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  439695 gaaactcggtcataaacaaga--aatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattc 439598  T
Q  232 atcaaaacattacaaagtgtccataattaa--------------actactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||              || ||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||   ||||| |||    
T  439597 atcaaagcgttacaaagtatccataattaagtgttcataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctccttacattcatcacaattgcat 439498  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  439497 atggaacgaacatacatatataatatattactttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccagggcatatagcttg 439398  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  439397 ccgttttccatgcgtattcatctct 439373  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Original strand, 41004627 - 41005046
Alignment:
Q  30 ttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatg 128  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||   |      
T  41004627 ttctgcataattctaaagcatttcaaagccatttt--cggtcagtttttacctgtaattaaaccgaagcatttccaaagacaatataaatcatac--aac 41004722  T
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 228  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||    
T  41004723 attgaaactcggtcataaacaagaaaaatataatatcttttacaattgtctataattaaatcaaaccaacatttggtttaaattacacaaaagtttgaaa 41004822  T
Q  229 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------actactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||          || |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||   ||||| ||||    
T  41004823 ttcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattatattaaatcactacttacattcatcacaattgcata 41004922  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  | || || ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||   ||||||| | ||||| |||||||     
T  41004923 tggaatgaacatacatatataatatataatttttcaacatattctgaaacataaatctgacgtcccaatcgtctttaataagccagggcatgtagcttgt 41005022  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  41005023 cgttttccatgcgtattcatctct 41005046  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 82237 - 81813
Alignment:
Q  29 gttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtat 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    |     
T  82237 gttctgcataattctaaagcattttcaaaccattttt-cggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcatttctaaaggcagtataaatcatcc--aa 82141  T
Q  128 gattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaa 227  Q
     ||  ||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  82140 catcaaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccata-ttaaatcaaaccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaa 82042  T
Q  228 attcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa--------------actactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaatt 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||              || ||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||   |||||    
T  82041 attcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtgcataattaaacaactcattacacatgattatattaaatgcatacttacattcatcacaatt 81942  T
Q  314 acatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatag 413  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||   |||||   ||||||  |||| ||||||    
T  81941 gcatatggaacgaacatacatatataatatattattttcaaccatattccgaaacataaatccgacgtcgttatcgtctttaataagtcaagggatatag 81842  T
Q  414 cttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  81841 cttgccgttttccatgcgtattcatctct 81813  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 253 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1150783 - 1150594
Alignment:
Q  253 cataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttc 352  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1150783 cataattaaacaattcattacacatcattaaattaaatcactacttacattcaatgaaattgcatatggaacgaacatacatatataatatagtatcttc 1150684  T
Q  353 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1150683 catcatattccaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcacaaataaaccaaggcgtatagtttgccgttttccatgcgtatttatctct 1150594  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Original strand, 10825337 - 10825521
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||   |  |||||||||| |||||||     
T  10825337 atttccaagc-attttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatac--aacattgaaactcagacataaa 10825433  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10825434 caagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacagacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 10825521  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39951125 - 39950941
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||   |  ||||||||||||||||||     
T  39951125 atttccaagcc-ttttttcgaccagtttttatctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatac--aacattgaaactcggacataaa 39951029  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  39951028 caagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatca 39950941  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25184806 - 25184606
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaagt-atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgta 126  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||   |    
T  25184806 ggttctgtataattctaaaacatttccaagccattttt-cggccagtttttacctgtaattaaaccagagtattttcaaaggcaatataaatcatac--a 25184710  T
Q  127 tgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttga 226  Q
      |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  25184709 acattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgatatttggttcaaattacacaaacgtttga 25184610  T
Q  227 aatt 230  Q
    ||||    
T  25184609 aatt 25184606  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 336 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 38949855 - 38949749
Alignment:
Q  336 tataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtatt 435  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38949855 tataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataacttgccgttttccatgcgtatt 38949756  T
Q  436 catctct 442  Q
    |||||||    
T  38949755 catctct 38949749  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Original strand, 32952849 - 32953033
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||   |  |||||||||| ||||| |     
T  32952849 attttcaagccattttt-cggtcagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatac--aacattgaaactcagacatcaa 32952945  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32952946 caagaaaaatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 32953033  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 235
Target Start/End: Original strand, 29398040 - 29398208
Alignment:
Q  61 tttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaataca 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||    || |||||||    
T  29398040 tttttcggccagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatac--aacattgaaactcggacataa----gaaaaataca 29398133  T
Q  161 atatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  29398134 atattttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttagttcaaattacacaaatgtttgaaattcatca 29398208  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 262
Target Start/End: Original strand, 3206971 - 3207077
Alignment:
Q  156 atacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccat 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||    
T  3206971 atacattatcttttacaattgtctataattaaatcaaaccgacatttagttcaaagtatacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttgcatggtgtccat 3207070  T
Q  256 aattaaa 262  Q
    |||||||    
T  3207071 aattaaa 3207077  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 7189907 - 7189848
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaagg 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7189907 atttccaagcc-ttttttcggccaatttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaagg 7189848  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 440
Target Start/End: Original strand, 25613424 - 25613710
Alignment:
Q  154 aaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtcc 253  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || |||||||| || | | ||||| ||| |||||| |   | |||||||||||||||||| ||||   ||| |      
T  25613424 aaatacataatcttttacaattgaccaaaattaaatcaatcaggcattttgtttaaattacaagaatgtttgaaattcatcaaaatattaatgagtattt 25613523  T
Q  254 ataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttcc 353  Q
      |||||| | || ||||||| ||||||| || ||||  ||| | |||||| |||||  | || |||||||||||| | | |||||||||||| ||||      
T  25613524 gaaattaatcaacacattacatatcattacataaaatctctattgacattctatgcacatgcagatggaacgaacacaaagatataatatattatcttta 25613623  T
Q  354 accatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatct 440  Q
    |  ||||||  |||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||  ||| |||||||    
T  25613624 attatattcataaacataaatcctacgtcgctatcgtcacgaataagtcaaggcacatagctcgccgttttccacatgtcttcatct 25613710  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 38950537 - 38950492
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttt 64  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38950537 cagacagtgggttctgcataattctaagtatttccgagccattttt 38950492  T

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Target: chr8 (Bit Score: 405; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 442
Target Start/End: Original strand, 30301225 - 30301645
Alignment:
Q  22 acagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30301225 acagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcat 30301324  T
Q  122 atgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30301325 atgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacg 30301424  T
Q  222 tttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatgg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30301425 tttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatgg 30301524  T
Q  322 aacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30301525 aacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgt 30301624  T
Q  422 tttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  30301625 tttccatgcgtattcatctct 30301645  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7344541 - 7344119
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344541 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttt-cggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 7344443  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7344442 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaatag 7344343  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7344342 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 7344243  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344242 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 7344143  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  7344142 cgttttccatgcgtattcatctct 7344119  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 442
Target Start/End: Original strand, 8419503 - 8419915
Alignment:
Q  29 gttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8419503 gttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttatctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggtaatataattcatatgtatg 8419601  T
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419602 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 8419701  T
Q  229 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419702 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 8419801  T
Q  329 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 428  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419802 gtacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 8419901  T
Q  429 gtgtattcatctct 442  Q
    | ||||||||||||    
T  8419902 gcgtattcatctct 8419915  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 32375740 - 32376162
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32375740 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggtaatataatt 32375838  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32375839 catatgtatgattgaaactcgaacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaatcgacatttggttaaaattaaacag 32375938  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32375939 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 32376038  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32376039 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 32376138  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  32376139 cgtttcccatgcgtattcatctct 32376162  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 33 - 442
Target Start/End: Original strand, 23924069 - 23924475
Alignment:
Q  33 tgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattg 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||   | |||||    
T  23924069 tgcataattctaaacattttcaagccattttt-cggtcagtttttacctgtaattaaactagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aagattg 23924165  T
Q  133 aaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattca 232  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23924166 aaactcggacataaaaaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattca 23924265  T
Q  233 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatac 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  23924266 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaactgcatatggaacgaacatac 23924365  T
Q  333 atatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgt 432  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23924366 atatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 23924465  T
Q  433 attcatctct 442  Q
    ||||||||||    
T  23924466 attcatctct 23924475  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 29 - 442
Target Start/End: Original strand, 39556 - 39967
Alignment:
Q  29 gttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatg 128  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |    
T  39556 gttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccaatttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aag 39653  T
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 228  Q
    |||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39654 attgaacctcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacatttgaaa 39753  T
Q  229 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39754 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaac 39853  T
Q  329 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 428  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39854 atacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacatcgccgtcgttgcgaataagcaaagacatatagcttgtcgttttccat 39953  T
Q  429 gtgtattcatctct 442  Q
    | ||||||||||||    
T  39954 gcgtattcatctct 39967  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 31960045 - 31959610
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  31960045 cagacagcaagttctgcataattctaaacatttgcaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatt 31959946  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  31959945 catat--aagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcatgattaaattaaacccacatttggttaaaattaaacaa 31959848  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataa--------------ttaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31959847 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaattgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattc 31959748  T
Q  305 aatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaa 404  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31959747 aacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccaaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaa 31959648  T
Q  405 ggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31959647 ggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 31959610  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Original strand, 35962405 - 35962817
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||| | ||||| || ||||||||||   |     
T  35962405 ggttctgcataattctaaacattttcaagccattttttcggccaatttttacgtgtaattataccagagtattacaaaaggcaaaataattcatac--aa 35962502  T
Q  128 gattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaa 227  Q
     ||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  35962503 cattaaaactcggatataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgaaatttggttcaaattacacaaacgtttgaa 35962602  T
Q  228 attcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaa 327  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35962603 attcatcaaaacgttacaaagtgtgcataattaaacaactcattgcacatcattaaattaaattcctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaa 35962702  T
Q  328 catacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca 427  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  35962703 catacgtatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgtcgttttcca 35962802  T
Q  428 tgtgtattcatctct 442  Q
    || ||||||||||||    
T  35962803 tgcgtattcatctct 35962817  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 43377277 - 43376842
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  43377277 cagacagtgggttctacataattctaaagcatttccaagccattttt-cggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaa 43377179  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |  |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| |||    
T  43377178 tcatac--aacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatgaaaccgaaatttggttcaagttacaca 43377081  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtcc--------------ataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacatt 303  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||              |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43377080 aacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccttaattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaattcctacttacatt 43376981  T
Q  304 caatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaa 403  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | |    
T  43376980 caacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcactatcgtcgcgaataaacca 43376881  T
Q  404 aggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43376880 atgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctct 43376842  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20549242 - 20548938
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  20549242 cagacagcaagttctgcataattctaaacatttccaagccatcatt-cggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaagacaaaataatt 20549144  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   | |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20549143 catac--aagattgaaactcggatataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgaaatttggttaaaattaaacaa 20549046  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||    
T  20549045 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccttacttacattcaacgcaattgcata 20548946  T
Q  319 tggaacga 326  Q
    ||||||||    
T  20548945 tggaacga 20548938  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 2124266 - 2124704
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaat---taaaccagagcatttccaaaggtaatat 114  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2124266 cagacagtgggttctgcataattctaatgcatttccaagccattttt-cggccactttttacctggaatatttaaaccagagcatttccaaaggcaatat 2124364  T
Q  115 aattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 214  Q
    || |||||   |  |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  2124365 aaatcatac--aacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccatagttaaatcaaaccgacatttggttcaaattac 2124462  T
Q  215 acagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagt--------------gtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttac 300  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||||              |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  2124463 acaaacatttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaagtccctacttac 2124562  T
Q  301 attcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataag 400  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||||    
T  2124563 attcaacgcaattgcatatggaacgaaaatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccaaagtcgctattgtcgcgaataag 2124662  T
Q  401 caaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2124663 caaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctct 2124704  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 442
Target Start/End: Original strand, 43679484 - 43679906
Alignment:
Q  18 acagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataa 116  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||  |||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  43679484 acagacagtgggttttgcataattctaaagcatttccaaatcatttttt-ggctaatttttacatgtaattaaaccaaaatatttccaaaggcaatataa 43679582  T
Q  117 ttcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaac 216  Q
     |||||   |  |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  43679583 atcatacaaa--attgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacac 43679680  T
Q  217 agacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattaca 316  Q
    | | |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||   ||||| ||    
T  43679681 aaaagtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtgttcataattaaacaactcattacacatcattatattaaatccctgcttacattcatcacaattgca 43679780  T
Q  317 tatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagctt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||   ||||||  |||||||||| |||    
T  43679781 tatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtctctatcgtctttaataagtcaaggcatataactt 43679880  T
Q  417 gccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    | ||||||||||| || |||||||||    
T  43679881 gtcgttttccatgcgtgttcatctct 43679906  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 131 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22588316 - 22588006
Alignment:
Q  131 tgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaatt 230  Q
    |||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  22588316 tgaaactcgatcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattatccataattaaatcaaaccgacattaggttcaaattacacaaacgtttgaaatt 22588217  T
Q  231 catcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacat 330  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  22588216 gatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacat 22588117  T
Q  331 acatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgt 430  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||||   ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  22588116 acatatataatatattatcttccaccatatttcaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattagccaagacatatagcttgccgttttccatgc 22588017  T
Q  431 gtattcatctc 441  Q
    |||||||||||    
T  22588016 gtattcatctc 22588006  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 48 - 345
Target Start/End: Original strand, 39751179 - 39751473
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||   |  |||||||||||| |||||     
T  39751179 atttccaagctatttttt-ggccagtttttaactataattaaaccagagcatttccaaagacaatataaatcatac--aacattgaaactcggtcataac 39751275  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaa 247  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39751276 caagaaaaatacaatatcttttacagttgtccgtaattaaatcaaactgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaa 39751375  T
Q  248 gtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatat 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39751376 gtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgtaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat 39751473  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 154 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7172178 - 7171880
Alignment:
Q  154 aaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtcc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||| | ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  7172178 aaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacccacattttgttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatgaaaacgttacatagtgtcc 7172079  T
Q  254 ataattaaactactcattaca----------catcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatat 343  Q
    |||||||||| || |||||||          ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7172078 ataattaaacaacacattacaactcagtacacatcattaaattaaatctctacttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatat 7171979  T
Q  344 attgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7171978 attattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattcatctct 7171880  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 4867787 - 4867415
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  4867787 cagacagtgggttttgcataattctaaagcatttccaagccatttttt-ggccagtttttacttgtaattaaactagagcatttccaaaggcaatataac 4867689  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |  ||| |||||| | |||||  |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||| || |||    
T  4867688 tcatac--aacatttaaactcagtcataaacaagaaaaatacaatatctttcaccattgtccataattaaatcaaaccaacatttgatttaaaatacaca 4867591  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaat 307  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||          |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  4867590 aaagtttgaaattcatcaaaacattacatagtctccataattaaacaacagattacaactcattacttatcattaaattaaatccctacttacattcaac 4867491  T
Q  308 gcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcg 383  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4867490 gcaattggatatggaacgaacatacgtatataatatattattttccaccataatccgaaacataaatccgacgtcg 4867415  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 149 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22661430 - 22661137
Alignment:
Q  149 aagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaag 248  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||| | ||    
T  22661430 aagaaaaatacattatcttttacggttgtccataattaaatcaaaccgatatttcgttaaaattacacgaatgtttgagattcatcaaaacattaaagag 22661331  T
Q  249 tgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgt 348  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  ||||| ||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22661330 tgtccataattaaacaacacattacatatcgttaaattaaatctctactgacattctgcgcagttgcatatggaacgaacatacatatataatatatcat 22661231  T
Q  349 cttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22661230 cttccaccatattccgaaacatagacccgacgtcgctatcgtcgtgaataagccaaggcatatggcttgccgttttccatgcatattcatctct 22661137  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 41743953 - 41744162
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  41743953 cagacagtgggttctgcataattttaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatt 41744052  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
     |||   | |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  41744053 tatac--aagattgaaactcgaacataaacaagataaatacaatattttttacaattgtccatgattaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaa 41744150  T
Q  219 acgtttgaaatt 230  Q
    ||||||||||||    
T  41744151 acgtttgaaatt 41744162  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 269 - 442
Target Start/End: Original strand, 41744160 - 41744333
Alignment:
Q  269 attacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaac 368  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  41744160 attacacatcattaaattaagtccctacttacattcaacgcaattgcatatggagcgaatatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaat 41744259  T
Q  369 ataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||| ||||||||  |||||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41744260 ataaatccgacgtcgctatcgtcatgaataagccaaggcatataacttgtcgttttccatgcgtattcatctct 41744333  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Original strand, 34367030 - 34367214
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||   |  ||||||||||||||||||     
T  34367030 atttccaagcc-ttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatac--agcattgaaactcggacataaa 34367126  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34367127 caagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 34367214  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 23578523 - 23578705
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  23578523 cagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cagccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaa 23578621  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttg 203  Q
    |  |||  |  |||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23578622 t--tatacaacattgaaactctgtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttg 23578705  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 234
Target Start/End: Original strand, 41238970 - 41239150
Alignment:
Q  51 tccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaa 150  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||   |  |||||| |||||||||||  ||    
T  41238970 tccaagccattttt-cagtcagttttaacctgtaattaaagcagagcatttcgaaatgcaaaataattcatac--aacattgaatctcggacataaacaa 41239066  T
Q  151 gataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatc 234  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41239067 gacaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatc 41239150  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30972730 - 30972519
Alignment:
Q  149 aagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaag 248  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||| ||  | |||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30972730 aagaaaaatacattatcttttacggttgtcgataattaaatcaattcaacatttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacattacagag 30972631  T
Q  249 tgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgt 348  Q
    | | ||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||  |||   |||||| | |||  | || ||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  30972630 tatacataattaaacaacacattacacatcattacataaaatatctatcgacattctacgcatgtgcaaatggaacaaacacacatatataatatattat 30972531  T
Q  349 cttccaccatat 360  Q
    |||| |||||||    
T  30972530 cttcaaccatat 30972519  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 337 - 436
Target Start/End: Original strand, 39751659 - 39751758
Alignment:
Q  337 ataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattc 436  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39751659 ataatatattatcttctaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaagacatatagtttgccgttttccatgcgtattc 39751758  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1116198 - 1116110
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaagg 108  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1116198 cagacagagggttctgcataattctaaacaattccaagccattttttcggccag-ttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaagg 1116110  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 31281198 - 31281255
Alignment:
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatc 375  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31281198 atggaacgaacataaagatataatatattatcttcaaccatattctgaaacataaatc 31281255  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 17924267 - 17924232
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttcca 54  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17924267 cagacagcaggtcctgcataattctaagtatttcca 17924232  T

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Target: chr6 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 1608381 - 1608804
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1608381 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaagtaatataatt 1608480  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1608481 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 1608580  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1608581 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 1608680  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1608681 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 1608780  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  1608781 cgttttccatgcgtattcatctct 1608804  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 31 - 442
Target Start/End: Original strand, 13382729 - 13383151
Alignment:
Q  31 tctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgat 130  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | | |    
T  13382729 tctgcataattgtaaacatttccaagccattttt-cgaccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aagtt 13382825  T
Q  131 tgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaatt 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13382826 tgaaactcggacataataaagataactacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaatt 13382925  T
Q  231 catcaa--------------aacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattaca 316  Q
    ||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  13382926 catcaaattaaactactcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgca 13383025  T
Q  317 tatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagctt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13383026 tatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataactt 13383125  T
Q  417 gccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  13383126 gacgttttccatgcgtattcatctct 13383151  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 29286291 - 29286712
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  29286291 cagacagtaggttctgcataattctaaagcatttccaagccattttt-cggccagtttttacttgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaatataaa 29286389  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |   ||||||||||| | |||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  29286390 tcatac--aacgttgaaactcggtcttaaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaca 29286487  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||    
T  29286488 aacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaacctctacttacattcaacgcaattgcat 29286587  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  29286588 atggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagtttg 29286687  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||| |||||||||| |||||    
T  29286688 ccgttttctatgtgtattcgtctct 29286712  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 31151039 - 31150628
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtat 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||   |     
T  31151039 ggttctgcataattctaaatatttccaagccattttt-cgcccagtttttacctataattaatccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aa 31150943  T
Q  128 gattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaa 227  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||    
T  31150942 cattgaaactcggacataaacaaggtaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttccaattacacaaacgtttgaa 31150843  T
Q  228 attcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaa 327  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| || | ||    
T  31150842 attcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacatacattcaacgcaattgcatatcgatcaaa 31150743  T
Q  328 catacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca 427  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31150742 catacatatataatatattatcttccaccatattctaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttcca 31150643  T
Q  428 tgtgtattcatctct 442  Q
     | ||||||||||||    
T  31150642 agcgtattcatctct 31150628  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25141081 - 25140668
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgta 126  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||   |    
T  25141081 ggttctgcataattctaaagcattttcaagccattttt-cggccaagttttacctgtaattaaaccagaacatttccaaaggcaatataaatcatac--a 25140985  T
Q  127 tgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttga 226  Q
      |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25140984 atattgaaactcggccataaacaagaaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattaaacaaacgtttga 25140885  T
Q  227 aattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacga 326  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25140884 aattcatcaacacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacga 25140785  T
Q  327 acataca-tatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttc 425  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25140784 acatacattatataatatattatctttcaccatattccgaaacataaatgcgacgtcgctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttc 25140685  T
Q  426 catgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| |||||    
T  25140684 catgtgtattcgtctct 25140668  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Original strand, 7537286 - 7537710
Alignment:
Q  30 ttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatg 128  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |      
T  7537286 ttctgcataattctaaagcatttccaagccattttt-cggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatac--aac 7537382  T
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 228  Q
    |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7537383 attgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttaaaattacacaaacgtttgaaa 7537482  T
Q  229 ttcatcaaaacattacaaagt--------------gtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaatta 314  Q
    |||||| ||||||||||||||              |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |     
T  7537483 ttcatctaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaaatcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaaatg 7537582  T
Q  315 catatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  7537583 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataac 7537682  T
Q  415 ttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  7537683 ttgctgttttccatgcgtattcgtctct 7537710  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Original strand, 23958990 - 23959400
Alignment:
Q  30 ttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatg 128  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||   |      
T  23958990 ttctgcataattctaaagcatttccaagccattttt-cgaccagattttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatac--aac 23959086  T
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 228  Q
    ||| |||||| | |||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||    
T  23959087 atttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatattttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaa 23959186  T
Q  229 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 328  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  23959187 ttcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaac 23959286  T
Q  329 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 428  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23959287 atacatatataatatattatcttacaccatattccgaaacataaatccaacgtcgctatcgtcgtgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccat 23959386  T
Q  429 gtgtattcatctct 442  Q
    | ||||||||||||    
T  23959387 gcgtattcatctct 23959400  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18351627 - 18351348
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  18351627 cagacagtgggttctgcataattctaaacatttccgagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaaaataatt 18351528  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18351527 catac--aagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaa 18351430  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18351429 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactacttattacacatcattaaattaaatccctacttac 18351348  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18610208 - 18609796
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgta 126  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||   |    
T  18610208 ggttctgcataattctaaagcatttccaagccattttt-cggtcagtttttacatgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaatataaatcatac--a 18610112  T
Q  127 tgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttga 226  Q
      |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||    
T  18610111 acattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatctggttcgaattacacaaacgtttga 18610012  T
Q  227 aattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacga 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  18610011 aattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacga 18609912  T
Q  327 acatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcc 426  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||   ||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  18609911 acatacatatataatatataattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatataacttgtcgttttcc 18609812  T
Q  427 atgtgtattcatctct 442  Q
    |||  |||| ||||||    
T  18609811 atgcatatttatctct 18609796  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 50 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 29667785 - 29667386
Alignment:
Q  50 ttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatga 149  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | |||    |  || |||||| | |||||  |    
T  29667785 ttccaagccattttt-cggccagtttttatctgtaatttaaccagagcattttcaaaggcaatataacttatacaact--tttaaactcagtcataaaca 29667689  T
Q  150 agataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagt 249  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  29667688 agtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacacagt 29667589  T
Q  250 gtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatata 339  Q
    |||||||||||||| ||          |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29667588 gtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatata 29667489  T
Q  340 atatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatc 439  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29667488 atatattaacttccaccatattccgaaacataaatctgacatcgctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatc 29667389  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 436
Target Start/End: Original strand, 2051116 - 2051545
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||| | |||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  2051116 cagacagtgggttatgcataattctaatgcattttcaagcaattttt-cggccagtttttatctgtaattaaaacagagcatttccaaaggcaatataaa 2051214  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |  |||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||    
T  2051215 tcatac--aacattgaaactcgatcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacaca 2051312  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtc--------------cataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||  || |||||||               ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2051313 aacgtttgaaattcatcaaaacgataaaaagtgttaataattaagtgttcataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatt 2051412  T
Q  304 caatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaa 403  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  2051413 caacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaataagcca 2051512  T
Q  404 aggcatatagcttgccgttttccatgtgtattc 436  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2051513 agacatataacttgccgttttccatgcgtattc 2051545  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 28362704 - 28362280
Alignment:
Q  29 gttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatg 128  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |      
T  28362704 gttctgcataattctaaacatttccaagccattttt-cggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataaatcatat--aac 28362608  T
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 228  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || ||||||    
T  28362607 attgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacagttgtctaaaattaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaccgattgaaa 28362508  T
Q  229 ttcatcaaaacattacaaag--------------tgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaatta 314  Q
    |||| |||||| ||||||||              ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||     
T  28362507 ttcaacaaaacgttacaaagtgttcataattaaatgtccatcattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacatacattctacacaattg 28362408  T
Q  315 catatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 414  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  28362407 catatcgatcgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaattcgacgtcgctatcatcgcaaataagccaaggcatatagc 28362308  T
Q  415 ttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||    
T  28362307 ttgccattttccatgcttattcatctct 28362280  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11840222 - 11840022
Alignment:
Q  31 tctgcataattctaagt-atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatga 129  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||   |  |    
T  11840222 tctgcataattctaaaacatttccaagccattttt-cggccagtttttacctgtaattaaaccagaacatttccaaaggcaaaataattcatac--aaca 11840126  T
Q  130 ttgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaat 229  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||    
T  11840125 ttgaaactcgaacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaat 11840026  T
Q  230 tcat 233  Q
    ||||    
T  11840025 tcat 11840022  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 185 - 442
Target Start/End: Original strand, 2259338 - 2259594
Alignment:
Q  185 taaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaa 284  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |  ||| |   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||    
T  2259338 taaatgaaaccgacatttggttcaaaatgcacaaaatgttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaacttattaaa 2259437  T
Q  285 ttaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgc 384  Q
    |||||| | ||||||||||||| | | || |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2259438 ttaaatccttacttacattcaacgta-ttgcatatggaacaaacatgcatatataatatattattttccaccatatttcgaaacataaatctgacgtcgc 2259536  T
Q  385 cgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
      |||||   ||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  2259537 tttcgtctttaataagccaatgcatatagcttgtcgttttctatgcgtattcatctct 2259594  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 154 - 382
Target Start/End: Original strand, 34230701 - 34230930
Alignment:
Q  154 aaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacg-tttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtc 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |   | | |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34230701 aaatacattatcttttacaattgtctataattaaatcaaaccgacatttcgttaaaattacatgaatgctttgaaattcatcaaaacattaaagagtgtc 34230800  T
Q  253 cataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttc 352  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34230801 cataattaaacaacacattacacatcgttaaattaaatctctactaacattctacacagttgcagatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 34230900  T
Q  353 caccatattccgaaacataaatctgacgtc 382  Q
     |||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  34230901 taccatattctaaaacataaatcggacgtc 34230930  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31771695 - 31771510
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||  ||| |||||| ||||| || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||     
T  31771695 atttccaagccattttttcagccattttttacctttaattaaagtagatcatttcgaaaggcaaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaa 31771598  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31771597 caagaaaaatacaatattttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 31771510  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26702653 - 26702454
Alignment:
Q  61 tttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaataca 160  Q
    ||||||| ||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||   |  || |||| |||| |||||  |||| |||||||    
T  26702653 tttttcgaccaatttttacatgtaattaaatcagagcatttccaaaggcagtataaatcatac--aacatagaaattcggtcataaacaagaaaaataca 26702556  T
Q  161 atatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataatta 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26702555 atatcttttacaattgtccataattaaat-aaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataatta 26702457  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3502607 - 3502434
Alignment:
Q  60 ttttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatac 159  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||||   |  ||||||||| || |||||  |||||||||||    
T  3502607 ttttttcggctagtttttacctgtaattacaccagagcatttcaaaaggcaaaacaattcatac--aacattgaaacttggccataaacaagataaatac 3502510  T
Q  160 aatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3502509 aatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 3502434  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20448728 - 20448386
Alignment:
Q  62 ttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaa 161  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||| |||||   |  ||| | |||  | |||||  ||||  ||||||     
T  20448728 ttttcggcctatttttatctgtaattcaaccagagcatttacagaggcaatataactcatac--accatttatacttagtcataaacaagaagaatacat 20448631  T
Q  162 tatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa 261  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |   | ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  20448630 tatcttttacagttgtccataattaaatcaatccgacatttcgttaaaattagaggaatgtttgaaattcataaaaacattaaagagtgtccataattaa 20448531  T
Q  262 actactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatatt 361  Q
    || || |||| || ||||||| || ||||  |||   |||||| |  || || || ||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| || |||||     
T  20448530 acaacacatttcatatcattacataaaatatctatcgacattctacacatttgcaaatgtaacaaacacacatatataatatattatctt-caacatata 20448432  T
Q  362 ccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggc 407  Q
    || ||||||||||   |||||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  20448431 cctaaacataaatgaaacgtcgctatcgtcacgaataagccaaggc 20448386  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 206
Target Start/End: Original strand, 8304570 - 8304711
Alignment:
Q  63 tttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaat 162  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||   |  |||   |||| | |||||  |||| ||||||| |    
T  8304570 tttcggccagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaagccaatatacctcatac--aacatttgcactcagtcataaacaagaaaaatacatt 8304667  T
Q  163 atcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggtt 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8304668 atcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggtt 8304711  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 2258385 - 2258540
Alignment:
Q  30 ttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatg 128  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| | | ||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||   |      
T  2258385 ttctgcataattctaaagaattttcaagtcattttt-cagtcagattttacttgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaatataactcata--caac 2258481  T
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaa 187  Q
    ||| |||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2258482 atttaaactcagtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaa 2258540  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20439855 - 20439753
Alignment:
Q  155 aatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtcca 254  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |   | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  20439855 aatacattatcttttacagttgtccataattaaatcaatccgacattttgttaaaattacaggaatgtttgaaattcatgaaaacattaaagagtgtcca 20439756  T
Q  255 taa 257  Q
    |||    
T  20439755 taa 20439753  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 243
Target Start/End: Original strand, 19129204 - 19129285
Alignment:
Q  162 tatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacatta 243  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| || | ||||||| ||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  19129204 tatcttttacagttgtccataattaaatcaatctgacatttcgttgaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacatta 19129285  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20436147 - 20436045
Alignment:
Q  155 aatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtcca 254  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| || |||||||||  ||||||||| |   | ||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||    
T  20436147 aatacattatcttttacagttgtccatgattaaatcaatccgacattttattaaaattacatgaatgtttgaaattcatgaaaacattaaagagtgttca 20436048  T
Q  255 taa 257  Q
    |||    
T  20436047 taa 20436045  T

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Target: chr4 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 49563929 - 49564352
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49563929 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 49564028  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49564029 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatattttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 49564128  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49564129 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 49564228  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49564229 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 49564328  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  49564329 cgttttccatgcgtattcatctct 49564352  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3408215 - 3407802
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   |     
T  3408215 ggttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aa 3408118  T
Q  128 gattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaattaaacagacgtttga 226  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3408117 gattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaaaattaaacaaacgtttga 3408018  T
Q  227 aattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacga 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3408017 aattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacga 3407918  T
Q  327 acatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcc 426  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407917 acatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcc 3407818  T
Q  427 atgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||||    
T  3407817 atgtgtattcatctct 3407802  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 31 - 442
Target Start/End: Original strand, 19069287 - 19069710
Alignment:
Q  31 tctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgat 130  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||    
T  19069287 tctgcataattgtaaacatttccaagccattttttcgaccagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aagat 19069384  T
Q  131 tgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19069385 tgaaactcggacataatgaagataagtaaaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaatt 19069484  T
Q  231 catcaa--------------aacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattaca 316  Q
    ||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  19069485 catcaaattaaactactcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgca 19069584  T
Q  317 tatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagctt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19069585 tatggaacgaacatacatgtataatatattatcttccaccatattccgaaacataaacccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagctt 19069684  T
Q  417 gccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19069685 gccgttttccatgcgtattcatctct 19069710  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 37395201 - 37394768
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  37395201 cagacagtgggttctgcataattctaaacattttcaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggaaaaataatt 37395102  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||     
T  37395101 catac--aacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttgattcaaattacacaa 37395004  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa--------------actactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattc 304  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||              || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37395003 acgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattc 37394904  T
Q  305 aatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaa 404  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  37394903 aacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaa 37394804  T
Q  405 ggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatct 440  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37394803 ggcatacaacttgccgttttccatgcgtattcatct 37394768  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 50 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 10423359 - 10422971
Alignment:
Q  50 ttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatga 149  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||   |  |||||||||||| |||||  |    
T  10423359 ttccaagccattttt-cggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaatataaatcatac--aacattgaaactcggtcataaaca 10423263  T
Q  150 agataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagt 249  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10423262 agaaaaataca-tatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacattaggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaatgt 10423164  T
Q  250 gtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtc 349  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10423163 gtccataattaaacaactcattacatatcattagattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatc 10423064  T
Q  350 ttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  10423063 ttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgcaatcgccgcgaataagccaagacatatagcttgtcgttttccatgtgtattcgtctct 10422971  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 133 - 442
Target Start/End: Original strand, 10374240 - 10374549
Alignment:
Q  133 aaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattca 232  Q
    |||||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  10374240 aaactcggtcataaccaagaaaaatacaataccttttacagttgtccataattaaatgaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattca 10374339  T
Q  233 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatac 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10374340 tcaaaacattacaaggtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatac 10374439  T
Q  333 atatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgt 432  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10374440 atatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatctgatgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 10374539  T
Q  433 attcatctct 442  Q
    |||| |||||    
T  10374540 attcgtctct 10374549  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 28 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44051068 - 44050650
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgta 126  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |    
T  44051068 ggttctgcataattctaaagcatttccaagccattttt-cggccagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatac--a 44050972  T
Q  127 tgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttga 226  Q
      |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  44050971 acattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttga 44050872  T
Q  227 aattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa--------------actactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaat 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||              || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  44050871 aattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttgcattcaacgcaat 44050772  T
Q  313 tacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatata 412  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||    
T  44050771 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaa-acatata 44050673  T
Q  413 gcttgccgttttccatgtgtatt 435  Q
    |||||  |||||||||| |||||    
T  44050672 gcttgttgttttccatgcgtatt 44050650  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Original strand, 38460523 - 38460935
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgta 126  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||   |    
T  38460523 ggttctgcataattctaaagcatttccaagccattttt-cggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaatataaatcatac--a 38460619  T
Q  127 tgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttga 226  Q
      |||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | ||||||    
T  38460620 acattgaaactcggtcataaacaagaaaaatataatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttgattcaaattacacaaaagtttga 38460719  T
Q  227 aattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacga 326  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||| ||| |    
T  38460720 aattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatgcaacaa 38460819  T
Q  327 acatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcc 426  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38460820 acatacatatataatatattattttccaccatattctgaaacataaatccaacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgccgttttcc 38460919  T
Q  427 atgtgtattcatctct 442  Q
    ||| | ||||||||||    
T  38460920 atgcgcattcatctct 38460935  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 4774587 - 4774167
Alignment:
Q  30 ttctgcataattct-aagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatg 128  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | |||   |      
T  4774587 ttctgcataattgttaagcatttccaagccattttt-cgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaagccaatataacttatac--aac 4774491  T
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 228  Q
    ||| |||||| | |||||  |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||    
T  4774490 atttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaatcgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaa 4774391  T
Q  229 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    ||||| ||| | ||||| |||||||||   ||||| ||          |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  4774390 ttcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcata 4774291  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  4774290 tggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgc 4774191  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  4774190 cgttttccatgcgtattcatctct 4774167  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 15995822 - 15996026
Alignment:
Q  31 tctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgat 130  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||    
T  15995822 tctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aagat 15995919  T
Q  131 tgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaatt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15995920 tgaaagtcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaatt 15996019  T
Q  231 catcaaa 237  Q
    |||||||    
T  15996020 catcaaa 15996026  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Original strand, 18578722 - 18579142
Alignment:
Q  30 ttctgcataattct-aagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatg 128  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | |||   |      
T  18578722 ttctgcataattgttaagcatttccaagccattttt-cggctagtttttacttgtaattcaaccagagtatttccaaaggcaatataacttatac--aac 18578818  T
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 228  Q
    ||| ||||||   |||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| || ||| | ||||||||    
T  18578819 atttaaactcactcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttgattcaaaatacacaaaagtttgaaa 18578918  T
Q  229 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||    
T  18578919 ttcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatcacttcttacattcaacgcaattgcata 18579018  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||   ||| ||| ||||||||||||||||    
T  18579019 tagaactaacatacatatataatatattatcttctaccatattccgaaacataaattcgacgtcgctatcgtcttcaattagccaaggcatatagcttgc 18579118  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  18579119 cgttttccatgcgtattcatctct 18579142  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 50905137 - 50904822
Alignment:
Q  29 gttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtat 127  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||   |     
T  50905137 gttctgcataattctaatgcatttccaagccattttt-cggccaatttttacctgtaattaaaccagagcatttctaaatgcaatataaatcatac--aa 50905041  T
Q  128 gattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaa 227  Q
     ||||||||||| ||||||  |||| |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||    
T  50905040 cattgaaactcgaacataaacaagaaaaatatgaaatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaacgtttgaa 50904941  T
Q  228 attcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaa 327  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||    
T  50904940 attcatcaaaacgatacaaagtgttcataattaaacaattcatttcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacaaa 50904841  T
Q  328 catacatatataatatatt 346  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  50904840 catacaaatataatatatt 50904822  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 166 - 442
Target Start/End: Original strand, 24415392 - 24415680
Alignment:
Q  166 ttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacta 265  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  24415392 ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaa 24415491  T
Q  266 c----------tcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccac 355  Q
    |          |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  24415492 cacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccat 24415591  T
Q  356 catattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggc--atatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||  |||||   ||||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24415592 catattccgaaacataaatgcaacgtcgctatcgtcttcaataagtcaaggcatatatagcttgtcgttttccatgtgtattcatctct 24415680  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 339
Target Start/End: Original strand, 51642165 - 51642423
Alignment:
Q  89 aaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaa 188  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||   |  |||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51642165 aaccagagcattttcaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcgatcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaa 51642262  T
Q  189 ttaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------actactcattacacatc 278  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          || |||||||||| |||    
T  51642263 tcaaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaattgtccataattaaacaacacattacaactcattacatatc 51642362  T
Q  279 attaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatata 339  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51642363 attaagttaaatcccaacttacattcatcacaattacatatagaacgaacatacatatata 51642423  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50278796 - 50278593
Alignment:
Q  31 tctgcataattctaag-tatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatga 129  Q
    ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  |||   |  |    
T  50278796 tctgcatgattctaaaatattttcaagccattttttcgatcagtttttacctgtaattaaaacagagcatttcgaaaggcaaaataatctatac--aaca 50278699  T
Q  130 ttgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaat 229  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  50278698 ttgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattattcataattaaatcaaaccgacatttggttgaaattacacaaacgtttgaaat 50278599  T
Q  230 tcatca 235  Q
    ||||||    
T  50278598 tcatca 50278593  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Original strand, 51492190 - 51492374
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||   |  ||| ||||||| ||||||     
T  51492190 atttccaagcc-ttttttcagccagattttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaataattcatac--aacattaaaactcgaacataaa 51492286  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  51492287 caagataagtacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 51492374  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 268 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 11506831 - 11506657
Alignment:
Q  268 cattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaa 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||    
T  11506831 cattacacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcaaaa 11506732  T
Q  368 cataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||| ||||||||  | |||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11506731 cataaatccgacgtcgctattgtctttaataagtcaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 11506657  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Original strand, 37016028 - 37016201
Alignment:
Q  60 ttttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatac 159  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||   || ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  37016028 ttttttcagccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatac--atcattgaaactcggacataaacaagataaatac 37016125  T
Q  160 aatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| || |||||| | | |||||||||||||||||    
T  37016126 aatatcttttacaattgtccataattaaatcaaactgacgtttgattcaaattacagaaacgtttgaaattcatca 37016201  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 414
Target Start/End: Original strand, 6186865 - 6187140
Alignment:
Q  149 aagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaag 248  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | | ||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |  |    
T  6186865 aagaaaaatacattatcttttatagtagtcaataattaaatcaatccgacatttcgttaaaattacacgtatgtttgaaattcatcaaaacattaaaggg 6186964  T
Q  249 tgtccataattaaactactcattacac----------atcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatat 338  Q
    ||||||||||||||| || |||||||           |||||||||||||||  ||||| |||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6186965 tgtccataattaaacaacacattacaacatattacatatcattaaattaaatctctactgacattctacgcatttgcatatggaacgaacatacatatat 6187064  T
Q  339 aatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 414  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||  | |||||  |||||| |||||||| ||| || |||||    
T  6187065 aatatattatcttccaccatattgctaaacataaatccaatgtcgctatcgtcgtgaataagccaagacacatagc 6187140  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Original strand, 44674257 - 44674440
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||   |  ||||||||||||||||||     
T  44674257 atttccaagccttttttt-ggccagttttcc-ctgtaattaaatcagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatac--aacattgaaactcggacataaa 44674352  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  44674353 caagataagtacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacatttaaaattcatca 44674440  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 30043275 - 30043046
Alignment:
Q  162 tatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa 261  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| |   |||||||||| || || |||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  30043275 tatcttttacaattatccataattaaatcaatccgacgtagagttaaaattacacggatgtttgaaatttatcaaaacattaaagagtg-ccataattaa 30043177  T
Q  262 actactca----------ttacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtctt 351  Q
    || || ||          ||||| ||| |||||| ||||  ||  | |||||| ||| | || || |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  30043176 acaacacactacaacacattacatatcgttaaatgaaatctctggtgacattctatgaagttgcaaatggaacgaaaatacaaatataatatattatctt 30043077  T
Q  352 ccaccatattccgaaacataaatctgacgtc 382  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  30043076 ccaccatattctgaaacataaatccgacgtc 30043046  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 116
Target Start/End: Original strand, 24414923 - 24415020
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataa 116  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24414923 cagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccatttat-cggacagtttttacctgtaattaaaccagaacatttccaaagataatataa 24415020  T

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Target: chr3 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 30943278 - 30943701
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30943278 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaagtaatataatt 30943377  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30943378 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 30943477  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30943478 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 30943577  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30943578 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 30943677  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  30943678 cgttttccatgcgtattcatctct 30943701  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 8156597 - 8157019
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8156597 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggtaatataatt 8156695  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8156696 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 8156795  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8156796 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 8156895  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8156896 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 8156995  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  8156996 cgttttccatgcgtattcatctct 8157019  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3953199 - 3952777
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3953199 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttt-cggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 3953101  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3953100 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaatag 3953001  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3953000 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 3952901  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3952900 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 3952801  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  3952800 cgttttccatgcgtattcatctct 3952777  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 6745310 - 6744889
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745310 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 6745211  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745210 catac--aagattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 6745113  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6745112 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 6745013  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6745012 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaagacatatagcttgc 6744913  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  6744912 cgttttccatgcgtattcatctct 6744889  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Original strand, 13743365 - 13743776
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||   |     
T  13743365 ggttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaactagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aa 13743462  T
Q  128 gattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaa 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13743463 gattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaa-ttaaacaaacgtttgaa 13743561  T
Q  228 attcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743562 attcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaa 13743661  T
Q  328 catacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743662 catacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca 13743761  T
Q  428 tgtgtattcatctct 442  Q
    || ||||||||||||    
T  13743762 tgcgtattcatctct 13743776  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 442
Target Start/End: Original strand, 9426705 - 9427115
Alignment:
Q  31 tctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatga 129  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | ||    
T  9426705 tctgcataattataaagcatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aaga 9426802  T
Q  130 ttgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9426803 ttgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaat 9426902  T
Q  230 tcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaaca 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9426903 tcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaacgaaca 9427002  T
Q  330 tacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatg 429  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9427003 tacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagtttgccgttttccatg 9427102  T
Q  430 tgtattcatctct 442  Q
     ||||||||||||    
T  9427103 cgtattcatctct 9427115  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 31 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 2857955 - 2857545
Alignment:
Q  31 tctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatga 129  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | ||    
T  2857955 tctgcataattgtaaagcatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aaga 2857858  T
Q  130 ttgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaat 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2857857 ttgaaacttggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaat 2857758  T
Q  230 tcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaaca 329  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2857757 tcatcttaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaatgaaca 2857658  T
Q  330 tacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatg 429  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2857657 tacatatataatatattattttccaccattttccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatg 2857558  T
Q  430 tgtattcatctct 442  Q
     ||||||||||||    
T  2857557 cgtattcatctct 2857545  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 31 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 50957665 - 50957242
Alignment:
Q  31 tctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgat 130  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||    
T  50957665 tctgcataattttaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaatcagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aagat 50957568  T
Q  131 tgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50957567 tgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaacagacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaatt 50957468  T
Q  231 catcaaa--------------acattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattaca 316  Q
    |||||||              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  50957467 catcaaattaaactactcaaaacattccaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgca 50957368  T
Q  317 tatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagctt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50957367 tatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacaaaaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaagacatatagctt 50957268  T
Q  417 gccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  50957267 gccgttttccatgcgtattcatctct 50957242  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 4002489 - 4002054
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4002489 cagacagcaagttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggcaagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatt 4002390  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4002389 catac--aagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaa 4002292  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaag--------------tgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4002291 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtctataactaagtgtccataattaaataactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattc 4002192  T
Q  305 aatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaa 404  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4002191 aacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccattttccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaa 4002092  T
Q  405 ggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4002091 ggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctct 4002054  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 33 - 442
Target Start/End: Original strand, 48246514 - 48246921
Alignment:
Q  33 tgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattg 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   |  ||||    
T  48246514 tgcataattctaaacattttcaagccatttttccggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaaaataattcataa--aacattg 48246611  T
Q  133 aaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattca 232  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  48246612 aaactcagacataagcaatataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattacacaaacttttgaaattca 48246711  T
Q  233 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatac 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  48246712 tcaaaaaattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcagttgcatatggaacaaacatac 48246811  T
Q  333 atatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgt 432  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  48246812 atatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaaagcatatagcttgtcgttttccatgcgt 48246911  T
Q  433 attcatctct 442  Q
    ||||||||||    
T  48246912 attcatctct 48246921  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 36812926 - 36813361
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  36812926 cagacagcaaattctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtagttaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatc 36813025  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36813026 catac--aagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttatacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaa 36813123  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaag--------------tgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattc 304  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||              ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  36813124 acgtttgaaattcattaaaacattacaaagtttccataattaattgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattatatccctacttacattc 36813223  T
Q  305 aatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaa 404  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36813224 aacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatattccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaa 36813323  T
Q  405 ggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  36813324 gacatatagcttgccgttttccacacgtattcatctct 36813361  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 32 - 442
Target Start/End: Original strand, 46989614 - 46990036
Alignment:
Q  32 ctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgatt 131  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| || ||||||||||   |||  |    
T  46989614 ctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccaaagtattttcaaaggcaaaataattcatacaaatg--t 46989711  T
Q  132 gaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattc 231  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||    
T  46989712 gaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaacatttgaaattc 46989811  T
Q  232 atcaaaacattacaaagt--------------gtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
    |||||||| |||||||||              |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||    
T  46989812 atcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcat 46989911  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46989912 gtggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccaaaacataaatccgacgtcgtcatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttg 46990011  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  46990012 ccgttttccatgcgtattcatctct 46990036  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 438
Target Start/End: Original strand, 21951888 - 21952305
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagt-atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  21951888 cagacagcaggttctgcagaattctaaaacaattccaagccattttt-cggccagttttgacttgtaattaaaccagagcatttccaaatgcaatataaa 21951986  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |  ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  21951987 tcatac--aacattgaaactcgaacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttgattaaaattacaca 21952084  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  21952085 aacgtttgaaattcatcaaaacgttacaatgtgtccatgattaaacaactcattacacgtcattaaattaaatccctagttacattcaatgcaattgcat 21952184  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21952185 atggaacgaacatacaaatataatatatcatcttccaccatattccgaaacctaaatccgacgtcgctatcatcgcgaataagccaaggcacatagcttg 21952284  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcat 438  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  21952285 ccgttttccatgcgtattcat 21952305  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 6489417 - 6489853
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6489417 cagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccattttt-cggccagtttttaccgctaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaa 6489515  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |  |||||||||||| |||||  |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  6489516 tcatac--aacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacattatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaca 6489613  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaa---------------gtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacat 302  Q
     |||||||||||||||  |||| |||||||               |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6489614 aacgtttgaaattcattgaaacgttacaaaagtgtccatacttaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaattcctacttacat 6489713  T
Q  303 tcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagca 402  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||| |||||||||     
T  6489714 tcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaatataaatccgacgacgctatcgtcacgaataagcc 6489813  T
Q  403 aaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6489814 aaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctct 6489853  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14402971 - 14402568
Alignment:
Q  29 gttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatg 128  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |    
T  14402971 gttctgcataattctaaacatttccaaaccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aag 14402874  T
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                      ||||||||| ||||||||||    
T  14402873 attgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataatta----------------------aattaaacaaacgtttgaaa 14402796  T
Q  229 ttcatcaaaacattacaaag--------------tgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaatta 314  Q
    ||||| ||||||||||||||              ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  14402795 ttcatgaaaacattacaaagtgtctataattaagtgtccataattaaacaactcattacacgtcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 14402696  T
Q  315 catatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14402695 catatagaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 14402596  T
Q  415 ttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14402595 ttgccgttttccatgcgtattcatctct 14402568  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 169 - 442
Target Start/End: Original strand, 2743678 - 2743965
Alignment:
Q  169 tacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaa--------------aacattacaaagtgtcca 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||              ||||||||||||||| ||    
T  2743678 tacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattacaaagtgttca 2743777  T
Q  255 taattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttcca 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2743778 taattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacgtatataatatattatcttcca 2743877  T
Q  355 ccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2743878 ccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 2743965  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 311
Target Start/End: Original strand, 7841193 - 7841474
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtat 127  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   |     
T  7841193 ggttatgcataattctaaacatttccaagccattttttcgaccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aa 7841290  T
Q  128 gattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaa 227  Q
     |||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  7841291 cattgaaactcagacataaacaagataaatacagtatcttttacaattgtccataagtaaattaaaccgacatttggttaaaattacacaaacgtttaaa 7841390  T
Q  228 attcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaa 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7841391 attcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 7841474  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 66962 - 67393
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattct-aagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||    
T  66962 cagacagtgggttctgcataattgttaagcatttccaagccattttt-cggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcaatcccaaatgcaatataat 67060  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |  ||| ||||||    ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||    
T  67061 tcatac--aacatttaaactcacttataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaactacaca 67158  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaat 307  Q
     | |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  67159 aaagtttgaaattcatcaaaacggtacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaatgaaatccctacttacattcaac 67258  T
Q  308 gcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggc 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||   ||||||| ||| |    
T  67259 gcaatcacatatggaacgaacatacatatataatgtattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctattgtctttaataagccaagac 67358  T
Q  408 atatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  67359 atatagcttgccgtttttcatgcgtattcatctct 67393  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 600498 - 600314
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||     
T  600498 atttccaagccattttt-cggccaatttttacctgtaattaaaccagagcatttttaaaggcaaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaa 600402  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  600401 caagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 600314  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36134226 - 36134053
Alignment:
Q  60 ttttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatac 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  36134226 ttttttcggccagtttttacctgtaattaaatcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaatac 36134129  T
Q  160 aatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  36134128 aatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatca 36134053  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 235
Target Start/End: Original strand, 50213588 - 50213760
Alignment:
Q  61 tttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaataca 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  |||| |||| ||    
T  50213588 tttttcggccagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagaaaaatgca 50213685  T
Q  161 atatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  50213686 atatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 50213760  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42166366 - 42166182
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||   |  ||||||||||||||||||     
T  42166366 atttccaagcc-ttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttgaaaggcaaaacaattcatac--aacattgaaactcggacataaa 42166270  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  | |||||||||| ||||    
T  42166269 caagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacactaatgtttgaaatttatca 42166182  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Original strand, 47070587 - 47070771
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||   |  ||||||||||| ||||||     
T  47070587 atttccaagccattttt-cggctagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatac--aacattgaaactcgaacataaa 47070683  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  47070684 caagataaatacaatatcttttccaattgtccataattaaatcaaaccgacgtttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 47070771  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Original strand, 2271484 - 2271658
Alignment:
Q  60 ttttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaa-ta 158  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||   |  ||||||||| ||||||||  |||||||| ||    
T  2271484 ttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatac--aacattgaaacttggacataaacaagataaaata 2271581  T
Q  159 caatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  2271582 caatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattagacaaacgtttaaaattcatca 2271658  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 52387918 - 52388097
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||   |  ||||||||||||||||||     
T  52387918 atttccaagcc-ttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaccaattcatac--aacattgaaactcggacataaa 52388014  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaatt 230  Q
     || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  52388015 caatataaatacaatatcttttacaattgaccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaacgtttgaaatt 52388097  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9473903 - 9473721
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||   |  ||||||||||||||||||     
T  9473903 atttccaagcc-ttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagatcatttcgaaaggcaaaacaattcatac--aacattgaaactcggacataaa 9473807  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcat 233  Q
     || ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||    
T  9473806 caatataaatacaatatctattacaattatccataattaaatcaaaccgacatttggttcaagttacacaaacgtttgaaattcat 9473721  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16647127 - 16646944
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||   |  |||||||||| |||||||     
T  16647127 atttccaagccattttc-cggccaatttttatctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatac--aacattgaaactcagacataaa 16647031  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16647030 -aagataaatataatatcttttacgattgtccataattaaatcaaaccgacatttggtttaaattacacaaacgtttgaaattcatca 16646944  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 154
Target Start/End: Original strand, 2743498 - 2743619
Alignment:
Q  31 tctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgat 130  Q
    ||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||    
T  2743498 tctgcataaatgtaaacatttcgaagccattttttcggccagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcata--caagat 2743595  T
Q  131 tgaaactcggacataatgaagata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2743596 tgaaactcggacataatgaagata 2743619  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 147
Target Start/End: Original strand, 4004963 - 4005059
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||   |  |||||||||||||||||||    
T  4004963 atttccaagc-attttttcggccagtttttacatgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcata--caacattgaaactcggacataat 4005059  T

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Target: chr1 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3993827 - 3993405
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3993827 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggtaatataatt 3993729  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3993728 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 3993629  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3993628 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 3993529  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3993528 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 3993429  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  3993428 cgttttccatgcgtattcatctct 3993405  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 3944063 - 3944485
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3944063 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggtaatataatt 3944161  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3944162 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 3944261  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3944262 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 3944361  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3944362 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 3944461  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  3944462 cgttttccatgcgtattcatctct 3944485  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 38771718 - 38772141
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38771718 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 38771817  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38771818 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcctttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 38771917  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38771918 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 38772017  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38772018 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcaccgtcgtcgcggataagcaaaggcatatagcttgc 38772117  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  38772118 cgttttccatgcgtattcatctct 38772141  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20353919 - 20353500
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20353919 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 20353820  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20353819 catac--aagattgaaactcggacataatgaagacaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 20353722  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20353721 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattatacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 20353622  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20353621 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 20353522  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatct 440  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  20353521 cgttttccatgcgtattcatct 20353500  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Original strand, 29352333 - 29352743
Alignment:
Q  30 ttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatga 129  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   | ||    
T  29352333 ttctacataattctaaacatttccaaaccattttttcggccaatttttacttgtaattaaaccagagcatttgcaaaggcaaaataattcatac--aaga 29352430  T
Q  130 ttgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29352431 ttgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaat 29352530  T
Q  230 tcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaaca 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29352531 tcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaaca 29352630  T
Q  330 tacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatg 429  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29352631 tacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatg 29352730  T
Q  430 tgtattcatctct 442  Q
     ||||||||||||    
T  29352731 cgtattcatctct 29352743  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 44469984 - 44469574
Alignment:
Q  30 ttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatga 129  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||   | ||    
T  44469984 ttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggtcagtttttacctgtaattgaaccagagcattttcaaaggcaaaataattcatac--aaga 44469887  T
Q  130 ttgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaat 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44469886 ttgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaat 44469787  T
Q  230 tcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaaca 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  44469786 tcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaaca 44469687  T
Q  330 tacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatg 429  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44469686 tacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatg 44469587  T
Q  430 tgtattcatctct 442  Q
     ||||||||||||    
T  44469586 cgtattcatctct 44469574  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 30910013 - 30909592
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30910013 cagacagagggttctgcataattctgaacaattccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatt 30909914  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  30909913 catac--aagattgaaactcggacataatgaacataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacgtttggttaaaattaaacaa 30909816  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30909815 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaagtactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcata 30909716  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30909715 tgaaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 30909616  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  30909615 tgttttccatgcgtattcatctct 30909592  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13633857 - 13633435
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||    
T  13633857 cagacagtgggttctgcataattctagacatttccaagccatttttccggccagtttttacctgtaattaaaccagacaatttccaaaggctaaataatt 13633758  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaattaaaca 217  Q
    ||||   |  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13633757 catac--aatattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatttaaccgacattttggttaacattaaaca 13633660  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13633659 aacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcaataaattaaatccctacttacattcaacgcaattacat 13633560  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13633559 atggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcatcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 13633460  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  13633459 ccgttttccatgcgtattcatctct 13633435  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 9710667 - 9711087
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  9710667 cagacagtgggttctgcataattctaaacatttccaagccattttt-cggtcagtttttacctgtaattaaacaagagtatttccaaaggtaaaataatt 9710765  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   |  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||     
T  9710766 catac--aacattgaaactaggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaactgacatttggttcaaattacacaa 9710863  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9710864 acgtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcata 9710963  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9710964 tggaaagaacatacatatataatatattatctttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 9711063  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||| |||| ||||||||||||    
T  9711064 cgtttttcatgcgtattcatctct 9711087  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 50113396 - 50113831
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  50113396 cagacagtgggttctgcataattctaaacattttcaatccattttttcggctagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatt 50113495  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   |   ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  50113496 catac--aacgttgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattacacaa 50113593  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaa--------------agtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  50113594 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataacaaagtgtccataattaaacaactcattacacattattaaattaaatccctacttacattc 50113693  T
Q  305 aatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaa 404  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  50113694 aacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaa 50113793  T
Q  405 ggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50113794 ggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 50113831  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 86 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 5082283 - 5081927
Alignment:
Q  86 ttaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcg--gacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataa 183  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   | |||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5082283 ttaaaccagagcattttcaaaggcaaaataattcatac--aagattgaaactctcagacataataaagataagtacaatatcttttacaattgttcataa 5082186  T
Q  184 ttaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5082185 ttaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaagtactccttacacatcattaa 5082086  T
Q  284 attaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcg 383  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5082085 attaaatccatatttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcg 5081986  T
Q  384 ccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  5081985 ccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataccttgtcgttttccatgcgtattcatctct 5081927  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 90 - 442
Target Start/End: Original strand, 6558047 - 6558411
Alignment:
Q  90 accagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaat 189  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6558047 accagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaat 6558144  T
Q  190 taaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaa--------------aacattacaaagtgtccataattaaactactcattacac 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6558145 taaaccgacatttggttaaaattaaacaaatgtttgaaattcatcaaattaaaccactcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacac 6558244  T
Q  276 atcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatc 375  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6558245 atcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatc 6558344  T
Q  376 tgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6558345 cgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 6558411  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 51 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 37019347 - 37018959
Alignment:
Q  51 tccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaa 150  Q
    ||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||   |  ||||||||||||| ||||  ||    
T  37019347 tccaagctattttttcggtcaaatttta-ctgtaattaaaccagagtattttcaaaggtaaaataattcatac--aacattgaaactcggatataaacaa 37019251  T
Q  151 gataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37019250 gataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccaacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtg 37019151  T
Q  251 tccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtct 350  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37019150 tccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatct 37019051  T
Q  351 tccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  37019050 tccaccatattccgaaacataaatcctatgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctct 37018959  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 8459046 - 8459467
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  8459046 cagacagtgggttctgcataattctaaagcatttctaagccattttt-cgaccagtttttacctgtaattaaaccatagcatttccaaaggcaatataaa 8459144  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |  ||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  8459145 tcatac--aacattgaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaca 8459242  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8459243 aacgtttgaaattcatcaaaacgttaaaaagtgtccataattaaacaactcattacacatgattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacat 8459342  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8459343 atagaacgaacatacatgtataatatattatcttctaccatattttgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaagacatatagcttg 8459442  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
     ||||||||||| ||||||||||||    
T  8459443 tcgttttccatgcgtattcatctct 8459467  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 29 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15051322 - 15051053
Alignment:
Q  29 gttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatg 128  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |    
T  15051322 gttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aag 15051225  T
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15051224 attgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaa 15051125  T
Q  229 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15051124 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttac 15051053  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 91 - 442
Target Start/End: Original strand, 12643369 - 12643715
Alignment:
Q  91 ccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 190  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||   | ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12643369 ccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aagattgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatt 12643466  T
Q  191 aaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattca---tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaatta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |   || | | ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12643467 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgttt--aattaagtgtctata-atta---agtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaatta 12643560  T
Q  288 aattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgt 387  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12643561 aatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgccgt 12643660  T
Q  388 cgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12643661 cgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 12643715  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 51666641 - 51666229
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgta 126  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||   |    
T  51666641 ggttctgcataattctaaagcattctcaagccattttt-cggccaatttttacctgtaattaaaccaaagcatttccaaaggcaatataaatcatac--a 51666545  T
Q  127 tgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttga 226  Q
      |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | | ||||||    
T  51666544 acattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacataaaagtttga 51666445  T
Q  227 aattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacga 326  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  51666444 aattcatcaaaaagttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacga 51666345  T
Q  327 acatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcc 426  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||   ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  51666344 acatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaattcgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtgttcc 51666245  T
Q  427 atgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||||    
T  51666244 atgtgtattcatctct 51666229  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 29 - 442
Target Start/End: Original strand, 7966081 - 7966498
Alignment:
Q  29 gttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtat 127  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||   |     
T  7966081 gttctgcataattctaaagcacttccaagccattttt-cggccagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatac--aa 7966177  T
Q  128 gattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatctttt-acaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttga 226  Q
     ||| |||||| | |||||  |||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||    
T  7966178 catttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatctttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttga 7966277  T
Q  227 aattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattac------acatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatg 320  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7966278 aattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacatttacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatg 7966377  T
Q  321 gaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 420  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7966378 gaacgaacatacatatgtaatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagc-aaggcatatagcttgccg 7966476  T
Q  421 ttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  7966477 ttttccatgcgtattcatctct 7966498  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 424
Target Start/End: Original strand, 19495128 - 19495544
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattct-aagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19495128 cagacagtgggttctgcataattgttaagcatttccaagctattttt-cggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 19495226  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |  ||| |||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||    
T  19495227 tcatac--aacatttaaactcagtcataaataagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacaca 19495324  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaaca---ttacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaattcctacttacattc 304  Q
     | |||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||| ||          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19495325 aaagtttgaaattcatcaaacgcgtgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaagtcattacacatcattaaattaaatccctacttacattc 19495424  T
Q  305 aatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaa 404  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||| ||    
T  19495425 aacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccaacgtcgctatcgtctcgaataagccaa 19495524  T
Q  405 ggcatatagcttgccgtttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19495525 ggcatatagcttgccgtttt 19495544  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13178109 - 13177689
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgta 126  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||       
T  13178109 ggttctgcataattataaagcacttccaagccatttttt-gaccagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatatt-- 13178013  T
Q  127 tgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttga 226  Q
      ||| |||||| | |||||  |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||    
T  13178012 --atttaaactcagtcataaacaagtaaaatataatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttga 13177915  T
Q  227 aattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattaca 316  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  13177914 aattcatcaaaacgttacatagtgtccatagttaaacaacacattacaactcattacacattattaaattaaatccctacttactttcaatgcaattgca 13177815  T
Q  317 tatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagctt 416  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  13177814 tatggaatgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgttgcgattaagccaagccatatagctt 13177715  T
Q  417 gccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13177714 gccgttttccatgcgtattcatctct 13177689  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 61 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25040023 - 25039644
Alignment:
Q  61 tttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaataca 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| |  ||   |  ||| |||||| | |||||  |||  |||||||    
T  25040023 tttttcggccagtttttacctgtaatttaaccagaacatttccaaagacaatataacttgtac--aacatttaaactcagtcataaacaagtaaaataca 25039926  T
Q  161 atatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataatta 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||| || ||| | |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||   ||    
T  25039925 atatcttttacaattgtccataattaaatcaaactgatatttggttcaaaatacacaaaagtttaaaattcatcaaatcgttacatagtgtccatgcata 25039826  T
Q  261 aactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatat 360  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25039825 aacaacacattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgtatatggaacgaacatacacatataatatattatcttccaccatat 25039726  T
Q  361 tccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25039725 tccgaaacataaatccgacgtcgttatcgacgcgaataagccaaggcgtatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 25039644  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 149 - 442
Target Start/End: Original strand, 38690126 - 38690418
Alignment:
Q  149 aagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaag 248  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38690126 aagaaaaatacaatatcttttacaattgtccatagttaaatcaaaccgacatttgattcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaag 38690225  T
Q  249 tgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgt 348  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  38690226 tgtccataattaaacaacacattacacatcattatattaaa-tcctacttacattcatcacaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattat 38690324  T
Q  349 cttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
     ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||  |||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38690325 tttccaccatattttgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 38690418  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1656074 - 1655643
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattct-aagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||||||||||||| | ||| | || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||     
T  1656074 cagacagtgggttctgcataattgttaagcactttcaagccattttt-cggccagtttttacctgtaatttaatcagagcatttccaaaggcaatataac 1655976  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    | |||   |  ||| ||| |  | |||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || |||    
T  1655975 ttatac--aacatttaaatttagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacggacatttggttcaaaatacaca 1655878  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaat 307  Q
     | ||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||   ||||| ||          ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||     
T  1655877 aaagtttgaaattcatcaaatcgttacatagtatccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatcattacttacattcaac 1655778  T
Q  308 gcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggc 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| |    
T  1655777 gcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaagac 1655678  T
Q  408 atatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1655677 atatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 1655643  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 46886372 - 46886137
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  46886372 cagacagtgggttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggctagtttttacctgtaattaaaccagagcctttccaaaggcaaaataatt 46886273  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  46886272 catac--aacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattacacaa 46886175  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccata 256  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46886174 acgtttgaaattcatcgaaacattacaaagtgtccata 46886137  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4518399 - 4517959
Alignment:
Q  20 agacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  4518399 agacagtaggttctgcataattctaaagcattttcaagccattttt-cggccagtttttacctgtaattaaaccaaagcatttccaaaggcaatataaat 4518301  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   |  |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||     
T  4518300 catac--aacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaa 4518203  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaa--------------gtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaattcct 294  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||||||              |||||||||||||||| ||          |||||||||||||||| ||  ||| |||    
T  4518202 aagtttgaaattcatcagaacgttacaaaatgtccataattaagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattatat--aatccct 4518105  T
Q  295 acttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcg 394  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |||       
T  4518104 acttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgttgctatagtcttt 4518005  T
Q  395 aataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatct 440  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4518004 aataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattcatct 4517959  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 154 - 439
Target Start/End: Original strand, 36072584 - 36072879
Alignment:
Q  154 aaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtcc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  36072584 aaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacattagatagtgtcc 36072683  T
Q  254 ataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatat 343  Q
    || ||||||| ||          ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36072684 atgattaaacaacatattacaactcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatat 36072783  T
Q  344 attgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatc 439  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||   ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  36072784 attatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcatcttcaattagccaaggcatatagcttgttgttttccatgcgtattcatc 36072879  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 46979233 - 46978797
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaagt-atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgta 126  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||| ||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||   |    
T  46979233 ggttctgcataattctaaaacattttcaagctattttt-cggtcagtttttacttgtaattaaatcagagcatttccaaaggcaatataaatcatac--a 46979137  T
Q  127 tgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttga 226  Q
      |||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||| ||| | ||||||    
T  46979136 acattgaaactcggtcataaacaagaaaaatagaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacagacatttgattcaaattacacaaaagtttga 46979037  T
Q  227 aattcatcaaaacattacaaagtgtcca--------------taattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaattcctacttacat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||| ||          |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  46979036 aattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaacacattacaattcattacacatcattatattaaatccctacttacat 46978937  T
Q  303 tcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagca 402  Q
    |||   ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||   |||||||     
T  46978936 tcatcacaattgcattaggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagcc 46978837  T
Q  403 aaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46978836 aaggcatatagcttgtcgttttccatgtgtattcatctct 46978797  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 61 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5141811 - 5141435
Alignment:
Q  61 tttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaataca 160  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||   |  ||| | |||| | |||||  |||| || ||||    
T  5141811 tttttcggtcagtttttacctgtaattaaagcagaacatttccaaaggcaatataactcatac--aacatttatactcaggcataaacaagaaaattaca 5141714  T
Q  161 atatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataatta 260  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||   ||||  |||||  |  | ||||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||||||    
T  5141713 -tatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacaaggggttcgaattactcgaatgtttgaaattcattaaaacgttaaatagtgtcaataatta 5141615  T
Q  261 aactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatat 360  Q
    ||| || ||||| | ||| |||||||||||  ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5141614 aacaacacattatatatcgttaaattaaatctctactgacattctacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatat 5141515  T
Q  361 tccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatct 440  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5141514 tccgaaacatacatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaacgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct 5141435  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 162 - 442
Target Start/End: Original strand, 33168133 - 33168423
Alignment:
Q  162 tatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa 261  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  | |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33168133 tatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacatttagttcaaagtacacgaaagtttgaaaatcatcaaaacgttacatagtgtccataattaa 33168232  T
Q  262 actac----------tcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtctt 351  Q
    || ||          |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  33168233 acaacacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacactcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatttt 33168332  T
Q  352 ccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  33168333 ccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtctaaaataagtcaaggcatatagcttgttgttttccatgcgtattcatctct 33168423  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52805531 - 52805330
Alignment:
Q  31 tctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgat 130  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  |  ||    
T  52805531 tctgcatgattctaaacatttccaagccattttt-cggtcagcttttacctgtaattaaaccagagtatttccaaaggcaaaataattcatat--aacat 52805435  T
Q  131 tgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaatt 230  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  52805434 tgaaactctgacataaataagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaatt 52805335  T
Q  231 catca 235  Q
    |||||    
T  52805334 catca 52805330  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 471013 - 470840
Alignment:
Q  60 ttttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatac 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  471013 ttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataagtac 470916  T
Q  160 aatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  470915 aatatcttttaccattgttcataatttaatcaaaccgacatttggttcaaattatacaaacgtttgaaattcatca 470840  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22527649 - 22527465
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||   |  ||||||||||||||||||     
T  22527649 atttccaagcc-ttttttcggctagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatac--aacattgaaactcggacataaa 22527553  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  22527552 caagataaatacaatatgttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatca 22527465  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22346028 - 22345818
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  22346028 cagacagtgggttctgcataattctaatgcatttccaagccattttt-cgaccagtttttacctgtaattaagccagagcatttccaaaggcaatataaa 22345930  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |  ||||||||||||||      |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  22345929 tcatac--aacattgaaactcggacc-----aagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataagtaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaca 22345837  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaa 236  Q
     ||||||||||||||||||    
T  22345836 aacgtttgaaattcatcaa 22345818  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 31780068 - 31780270
Alignment:
Q  31 tctgcataattctaag-tatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatga 129  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| || || || | ||||||||   |  |    
T  31780068 tctgcatcattctaaaatatttccaagc-attttttcggccaatttttacctgtaattaagccagagcatttcgaatggcaaaacaattcatac--aaca 31780164  T
Q  130 ttgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaat 229  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  31780165 ttgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattaggttcaaattacacaaacgtttgaaat 31780264  T
Q  230 tcatca 235  Q
    ||||||    
T  31780265 tcatca 31780270  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Original strand, 94527 - 94700
Alignment:
Q  60 ttttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatac 159  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||   |  ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  94527 tttttttgaccagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaatac 94624  T
Q  160 aatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  94625 aatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 94700  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 235
Target Start/End: Original strand, 16281828 - 16281999
Alignment:
Q  61 tttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaataca 160  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||   |  ||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  16281828 tttttcggtcagttttta-ctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatac--aacattaaaactcggacataaacaagaaaaataca 16281924  T
Q  161 atatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16281925 atattttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 16281999  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 236
Target Start/End: Original strand, 19521715 - 19521900
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||     
T  19521715 atttccaagccatttttt-ggtcactttttacctgcaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatac--agcattgaaactcggacataaa 19521811  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaa 236  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19521812 caagaaaaatactatatcttttacaattgtctataattaaatcaaatcgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaa 19521900  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21144585 - 21144405
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||   |  ||||||||||| ||||||     
T  21144585 atttccaagccattttt-cggccagtttttatctgtaagtaaagcagagaatttcgaaaggcaaaataattcatac--aacattgaaactcgaacataaa 21144489  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattc 231  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  21144488 caagaaaaatacaatatcttttacaattgtctataattaaatcaaatcgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattc 21144405  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23359334 - 23359230
Alignment:
Q  18 acagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23359334 acagacagcaagttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataat 23359235  T
Q  118 tcata 122  Q
    |||||    
T  23359234 tcata 23359230  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 50617321 - 50617503
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | |||||  ||||| || ||||||||||   |  |||||||||| |||||||     
T  50617321 attttcaagccattttt-cggccagtttttacctgtaattaaagcacaacattttgaaaggcaaaataattcatac--aacattgaaactctgacataaa 50617417  T
Q  148 gaagataaat-acaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattca 232  Q
     || | |||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  50617418 caaaaaaaaacacaatattttttacaattgtccatatttaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattca 50617503  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 38690030 - 38690114
Alignment:
Q  30 ttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatat 114  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  38690030 ttctacataattctaaagcatttccaagccatttt-tcggccagtttttatctgtaattaaaccagaggatttccaaaggcaatat 38690114  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 274
Target Start/End: Original strand, 1179878 - 1179955
Alignment:
Q  197 acatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattaca 274  Q
    |||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||    
T  1179878 acatttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacattaaagagtgtccacaattaaacaacacattaca 1179955  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 72
Target Start/End: Original strand, 12643329 - 12643372
Alignment:
Q  29 gttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccag 72  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  12643329 gttctgcataattctaaacattttcaagccattttttcggccag 12643372  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 47715037 - 47714986
Alignment:
Q  52 ccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttcca 104  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  47715037 ccaagccattttt-cggctagtttttacctataattcaaccagagcatttcca 47714986  T

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Target: chr7 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 30790992 - 30790569
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790992 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccattttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 30790893  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790892 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatagaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 30790793  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30790792 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 30790693  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790692 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 30790593  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  30790592 tgttttccatgcgtattcatctct 30790569  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 45767845 - 45767423
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45767845 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggtaatataatt 45767747  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45767746 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 45767647  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45767646 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 45767547  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45767546 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 45767447  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  45767446 cgttttccatgcgtattcatctct 45767423  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 43619768 - 43620190
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43619768 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggtaatataatt 43619866  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43619867 catatgtatgattgaaactcagacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 43619966  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43619967 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 43620066  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43620067 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 43620166  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  43620167 cgttttccatgcgtattcatctct 43620190  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 603868 - 604289
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  603868 cagacagtgggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagaacatttccaaaggtaaaataatt 603967  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  603968 catac--aagattgaaactcgaacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaatcgacatttggttaaaattaaacaa 604065  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  604066 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacata 604165  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  604166 tggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 604265  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  604266 cgttttccatgcgtattcatctct 604289  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18109778 - 18109356
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18109778 cagacagtgggttctgcataattctaaacatttccaaaccattttttcggccagtttttatctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatt 18109679  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaattaaaca 217  Q
    ||||   | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18109678 catac--aagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaaaattaaaca 18109581  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  18109580 aacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcat 18109481  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18109480 atggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 18109381  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  18109380 ccgttttccatgcgtattcatctct 18109356  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15070335 - 15069913
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  15070335 cagacagtgggttctgcataattctagacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaaataaaccagagcatttccaaaggctaaataatt 15070236  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaattaaaca 217  Q
    ||||   | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15070235 catac--aagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaaaattaaaca 15070138  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  15070137 aacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcat 15070038  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070037 atggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 15069938  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  15069937 ccgttttccatgcgtattcatctct 15069913  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 29 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 42503813 - 42503401
Alignment:
Q  29 gttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatg 128  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||  | | |    
T  42503813 gttctgcataattctagacatttccaagctattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatctccaaaggctaaataattcat--gcaag 42503716  T
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaattaaacagacgtttgaa 227  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  42503715 attgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttataattgttcatgattaaattaaaccaacattttggttaaaattaaacaaacgtttgaa 42503616  T
Q  228 attcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  42503615 attcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaa 42503516  T
Q  328 catacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca 427  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42503515 catacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatgtagcttgccgttttcca 42503416  T
Q  428 tgtgtattcatctct 442  Q
    || ||||||||||||    
T  42503415 tgcgtattcatctct 42503401  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 47742973 - 47742552
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  47742973 cagacagtgggttctgcataattctaaacatttccaagccatttttttggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaaaataatt 47742874  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   |  ||||||||  ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||     
T  47742873 catac--aacattgaaacatggacaaaaacaagataaatgcaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccaacatttggttcaaattacacaa 47742776  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  47742775 acgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcata 47742676  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  47742675 tggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgt 47742576  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  47742575 cgttttccatgcgtattcatctct 47742552  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 19 - 436
Target Start/End: Original strand, 34622587 - 34623002
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  34622587 cagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccattttt-cggtcagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaa 34622685  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |  |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  34622686 tcatac--aacattgaaactcggtcataaataagaaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaca 34622783  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||    
T  34622784 aacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaacttctacttacattcaacgcaattgcat 34622883  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34622884 atgaaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttg 34622983  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattc 436  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  34622984 ccgttttccatgcgtattc 34623002  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Original strand, 19044390 - 19044816
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgta 126  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||   |    
T  19044390 ggttttgcataattctaatgcatttccaagccattttt-cggctagtttttacctgtaattaaaccagagaatttccaaaggcaatataaatcatac--a 19044486  T
Q  127 tgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttga 226  Q
      ||||||| | || |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  19044487 acattgaaattgggtcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttga 19044586  T
Q  227 aattcatcaaaacattacaaagt--------------gtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||              |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  19044587 aattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaaatcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaat 19044686  T
Q  313 tacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatata 412  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19044687 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatata 19044786  T
Q  413 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
     ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  19044787 acttgccgttttccatgcatattcttctct 19044816  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20710246 - 20709820
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgta 126  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||   |    
T  20710246 ggttttgcataattctaatgcatttccaagccattttt-cggctagtttttacctgtaattaaaccagagaatttccaaaggcaatataaatcatac--a 20710150  T
Q  127 tgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttga 226  Q
      ||||||| | || |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  20710149 acattgaaattgggtcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttga 20710050  T
Q  227 aattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa--------------actactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||              || | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  20710049 aattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaaatcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaat 20709950  T
Q  313 tacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatata 412  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20709949 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatata 20709850  T
Q  413 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
     ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  20709849 acttgccgttttccatgcatattcttctct 20709820  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40928927 - 40928715
Alignment:
Q  29 gttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatg 128  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |    
T  40928927 gttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aag 40928830  T
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 228  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40928829 attgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaa 40928730  T
Q  229 ttcatcaaaacatta 243  Q
    |||||||||||||||    
T  40928729 ttcatcaaaacatta 40928715  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 440
Target Start/End: Original strand, 10705336 - 10705765
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| ||| || ||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||     
T  10705336 cagacagtgggttctgcataattctaaagcacttccaagtcattttt-cggtcaatttttacatgtaatttaaccaaagcatttctaaaggcaatataac 10705434  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    | |||   |  ||| |||||| | |||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||    
T  10705435 ttatac--aacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacaca 10705532  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacta----------ctcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaat 307  Q
     | |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |          |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||     
T  10705533 aaagtttaaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaatacattacaactcattacacatcaataaattaaatctctacttacattcaac 10705632  T
Q  308 gcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggc 407  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||   ||| ||| |||||    
T  10705633 gcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatcatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattagccaaggc 10705732  T
Q  408 atatagcttgccgttttccatgtgtattcatct 440  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10705733 atatagcttgtcgttttccatgcgtattcatct 10705765  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 129 - 438
Target Start/End: Original strand, 12111412 - 12111729
Alignment:
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 228  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  | |||| |||    
T  12111412 attgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttataattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaccaaagtttaaaa 12111511  T
Q  229 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacta----------ctcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |          ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||    
T  12111512 ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacaatacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattcatcacaattgcata 12111611  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||   ||||| | |||||||||||||||     
T  12111612 tggaacgaacatacatatata--atattattttccaccatattccgaaatataaatccgacgtcgctatcatctttaataaaccaaggcatatagcttgt 12111709  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcat 438  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12111710 cgttttccatgtgtattcat 12111729  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 269 - 442
Target Start/End: Original strand, 29592839 - 29593012
Alignment:
Q  269 attacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaac 368  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  29592839 attacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatgtattatcttccaccatattccgaaac 29592938  T
Q  369 ataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29592939 ataaatctgacgtcgctatcgttgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcgtattcatctct 29593012  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 165 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 47065148 - 47064857
Alignment:
Q  165 cttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagt--------------g 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||||||              |    
T  47065148 cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttgatttaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtatccataattaaatg 47065049  T
Q  251 tccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtct 350  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  47065048 tccataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattt 47064949  T
Q  351 tccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  || ||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47064948 tccaccatatttcgaaacataaatttgacgtcgctatcatctttaataaaccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 47064857  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Original strand, 29592643 - 29592841
Alignment:
Q  30 ttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatga 129  Q
    |||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | ||    
T  29592643 ttctgcataattttaaacatttccaaaccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggaaaaataattcatac--aaga 29592740  T
Q  130 ttgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaat 229  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||    
T  29592741 ttgaaactcggacataaacaagataaatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaacttttgaaat 29592840  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17838589 - 17838405
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||   |  ||||||||||||||||||     
T  17838589 atttccaagcc-ttttttcggccagtatttacttgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatac--aacattgaaactcggacataaa 17838493  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  17838492 caagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatca 17838405  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34742349 - 34742168
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || | ||||||||   |  ||||||||||||||||||     
T  34742349 atttccaagccattttt-cggtcagtttttacctgtaattaaagtagagcatttcgaaaggcaaaa-aattcatac--aacattgaaactcggacataaa 34742254  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcat 233  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||    
T  34742253 caagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaatcgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcat 34742168  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Original strand, 5537965 - 5538147
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||     
T  5537965 attttcaagccattttt-cggtcagtttttac--gtaattaaagcagagcatttcgaaagggaaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaa 5538059  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5538060 caagaaaaataaaatatcttatacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattatacaaacgtttgaaattcatca 5538147  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13323669 - 13323485
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||   |   ||||||||  ||||| |     
T  13323669 atttccaagccattttt-cgggcagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggtaaaataattcatac--aacgttgaaactgagacattaa 13323573  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13323572 caagaaaaatacaatattttttacaattttccataattaaattaaaccggcatttcgttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 13323485  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10522366 - 10522285
Alignment:
Q  154 aaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  10522366 aaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatca 10522285  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 122
Target Start/End: Original strand, 12111332 - 12111393
Alignment:
Q  61 tttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcata 122  Q
    |||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  12111332 tttttcagtcagtttttacttgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaatataaatcata 12111393  T

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Target: chr5 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 37814671 - 37815092
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  37814671 cagacagtgggttctgcatagttctaaacatttccaagccatttttccggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatt 37814770  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37814771 catac--aagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaa 37814868  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  37814869 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttactttcaacgcaattacata 37814968  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37814969 tggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgtgaataagcaaaggcatatagcttgc 37815068  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  37815069 cgttttccatgcgtattcatctct 37815092  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Original strand, 27863501 - 27863913
Alignment:
Q  28 ggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |   |     
T  27863501 ggttctgcataattctaaacattttcaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagaacatttccaaaggcaaaataattcacac--aa 27863598  T
Q  128 gattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaa 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27863599 gattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaa 27863698  T
Q  228 attcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  27863699 attcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcaaatggaacgaa 27863798  T
Q  328 catacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca 427  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27863799 catacatatataatatattatcttccaccatattccaaaacataaatccgacgtcgctgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgtttttca 27863898  T
Q  428 tgtgtattcatctct 442  Q
    || ||||||||||||    
T  27863899 tgcgtattcatctct 27863913  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 13563730 - 13564151
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13563730 cagacagtgggttctgcataattataaacatttccaagccattttttcggctagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatt 13563829  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13563830 catac--aagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaa 13563927  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13563928 acgtttgaaattcattaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcata 13564027  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13564028 tggatcgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcatcgcaaataagccaaggcatatagcttgc 13564127  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  13564128 cgttttccatgcgtattcatctct 13564151  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 25890083 - 25890504
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25890083 cagacaacaagttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatt 25890182  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25890183 catac--aagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttatacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaa 25890280  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25890281 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgttcataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcata 25890380  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25890381 tggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgacgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatcgcttgc 25890480  T
Q  419 cgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
     |||||||| | ||||||||||||    
T  25890481 tgttttccacgcgtattcatctct 25890504  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 27 - 442
Target Start/End: Original strand, 28882091 - 28882498
Alignment:
Q  27 aggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgta 126  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||        | ||  |    
T  28882091 aggttctacataattctaagcatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttacaaaggcaa--------acataca 28882182  T
Q  127 tgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttga 226  Q
     ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28882183 agattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttcgttaaaattaaacaaacgtttga 28882282  T
Q  227 aattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacga 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  28882283 aattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccccacttacattcaacgcaattgcatatggaacga 28882382  T
Q  327 acatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcc 426  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28882383 acatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcaaataagcaaatgcatatagcttgccgttttcc 28882482  T
Q  427 atgtgtattcatctct 442  Q
    ||| ||||||||||||    
T  28882483 atgcgtattcatctct 28882498  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 442
Target Start/End: Original strand, 7017612 - 7018008
Alignment:
Q  31 tctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgat 130  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||    
T  7017612 tctgcataattctaaacattttcaagccattttttcggccagtttttatctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aagat 7017709  T
Q  131 tgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7017710 tgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaatt 7017809  T
Q  231 catcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7017810 catcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacat 7017909  T
Q  331 acatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgt 430  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7017910 acatatataatatattatcttccaccatat-------------tctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccattttccatgt 7017996  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 38855804 - 38856225
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||    
T  38855804 cagacagtgggttctgcataattctagacatttccaagccattttt-cggtcagtttttacctgtaattaaaccagacaatttccaaaggctaaataatt 38855902  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaattaaaca 217  Q
    ||||   |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  38855903 catac--aatattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcgtaattaaattaaaccgacattttggttaacattaaaca 38856000  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38856001 aacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattcaatccctacttacattcaacgcaattacat 38856100  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856101 atggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 38856200  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  38856201 ccgttttccatgcgtattcatctct 38856225  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 11029097 - 11029517
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||    
T  11029097 cagacagtgggttctgcataattctagacatttccaagccattttttcgaccagtttttacctgtaattaaaccagacaatttccaaaggctaaataatt 11029196  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaattaaaca 217  Q
    ||||   |  |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11029197 catac--aatattgaaactcggtcataatcaagataaatgcaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaacattaaaca 11029294  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11029295 aacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagt--ccataattaaactactcatcacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacat 11029392  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11029393 atgaaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 11029492  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  11029493 ccgttttccatgcgtattcatctct 11029517  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34080115 - 34079761
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  34080115 cagacagtgggttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatt 34080016  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34080015 catac--aagattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaa 34079918  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||    
T  34079917 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccttacttacattcaacgcaattgcata 34079818  T
Q  319 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatc 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34079817 tggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatc 34079761  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 442
Target Start/End: Original strand, 34122624 - 34123048
Alignment:
Q  30 ttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatga 129  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   |  |    
T  34122624 ttctgcataattctaaatattttcaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaaaataattcatac--aaca 34122721  T
Q  130 ttgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaat 229  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  34122722 ttgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaat 34122821  T
Q  230 tcatcaaaacattacaa--------------agtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattac 315  Q
    |||||||||  ||||||              ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  34122822 tcatcaaaaggttacaaggtgttcataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaattcatacttacattcaatgcaattgc 34122921  T
Q  316 atatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagct 415  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  34122922 atatggaacgaacatatatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataact 34123021  T
Q  416 tgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||    
T  34123022 taccgttttccatgcgtattcatctct 34123048  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 48 - 442
Target Start/End: Original strand, 7796696 - 7797087
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |  ||||||||||||  ||||     
T  7796696 atttccaagctattttt-cggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatac--aacattgaaactcggttataaa 7796792  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaa 247  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7796793 caagaaaaatacaatatcttttataattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaa 7796892  T
Q  248 gtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattg 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7796893 gtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 7796992  T
Q  348 tcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7796993 tcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaagcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctct 7797087  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 29 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1039779 - 1039355
Alignment:
Q  29 gttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatg 128  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   | |    
T  1039779 gttctgcataatcctaaatatttccaagccattttttgggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaaaataattcatac--aag 1039682  T
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1039681 attgaaactcggacataaacacgataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaa 1039582  T
Q  229 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataatta--------------aactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaatta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||              ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |     
T  1039581 ttcatcaaaacattacaaagtgtctataattaagtgtcaataatttaacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaactg 1039482  T
Q  315 catatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 414  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1039481 catatggtacgaacatacatatataacatattattttccaccatattcc-aaacataaatccgatgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 1039383  T
Q  415 ttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1039382 ttgccgttttccatgcgtattcatctct 1039355  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 213 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14280770 - 14280541
Alignment:
Q  213 aaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14280770 aaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaat 14280671  T
Q  313 tacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatata 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280670 tacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatata 14280571  T
Q  413 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14280570 gcttgccgttttccatgcgtattcatctct 14280541  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 33995133 - 33994712
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattct-aagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||     
T  33995133 cagacagtgggttatgcataattgttaagcatttccaagccattttt-cggccagtttttacatgtaatttaaccagaacatttccaaaggcaatataac 33995035  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    | |||   |  ||| |||||| | |||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || | |    
T  33995034 ttatac--aacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacaaa 33994937  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
     | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  33994936 aaagtttgaaattcttcaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcat 33994837  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  33994836 atggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattaagaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagtttg 33994737  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||    
T  33994736 ccgttgtccatgcgtattcatctct 33994712  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 442
Target Start/End: Original strand, 24053252 - 24053673
Alignment:
Q  29 gttctgcataattct-aagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtat 127  Q
    ||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | |||   |     
T  24053252 gttctgcataattgtcaagcattttcaagccattttt-cggccagtttttacctgtaatttaaccagagcattttcaaaggcaatataacttatac--aa 24053348  T
Q  128 gattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaa 227  Q
     ||| |||||| | |||||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| || ||| | |||||||    
T  24053349 catttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattacatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaa 24053448  T
Q  228 attcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||| |||    
T  24053449 attcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacatattacaactcattacacatcattaaattatatccctaattacattcaacgcaattgcat 24053548  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||   |||  || |||||||||||||||    
T  24053549 atagaaagaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattcgccaaggcatatagcttg 24053648  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
     ||||||||||| ||||||||||||    
T  24053649 tcgttttccatgcgtattcatctct 24053673  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 442
Target Start/End: Original strand, 24050125 - 24050548
Alignment:
Q  29 gttctgcataattct-aagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtat 127  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| | |||   |     
T  24050125 gttctgcataattgttaagcatttccaagccattttt-cggccagttttcacatgtaatttaaccagagcattaccaaaggaaatataacttatac--aa 24050221  T
Q  128 gattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaa 227  Q
     ||| ||| || | |||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| | |||||||    
T  24050222 catttaaattcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaa 24050321  T
Q  228 attcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||          ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||    
T  24050322 attcatcaaaacgttacatagtatccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattatatccctacttacattcaacgcaattgcat 24050421  T
Q  318 atggaacgaacatacatatata--atatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagct 415  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||   |||  || |||||||||||||    
T  24050422 atagaacgaacatacatatataatatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattcgccaaggcatatagct 24050521  T
Q  416 tgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24050522 tgccgttttccatgcgtattcatctct 24050548  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 384
Target Start/End: Original strand, 25877709 - 25878082
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||     
T  25877709 cagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccattttt-cggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaagcaatataaa 25877807  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |  ||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||    
T  25877808 tcatac--aacattgaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaat--aaccgacatttggttcaaattacaca 25877903  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattaca--------------aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacatt 303  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||              |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||      
T  25877904 aaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacgtgattatattaaatccctacttaca-- 25878001  T
Q  304 caatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgc 384  Q
    ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25878002 catcacaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 25878082  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 208 - 442
Target Start/End: Original strand, 4196792 - 4197024
Alignment:
Q  208 aaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaat 307  Q
    |||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||      
T  4196792 aaattacacaaacgtttggtattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacatatgattatattaaatccctacttacattcatc 4196891  T
Q  308 gcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggc 407  Q
     ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||||||| |||||    
T  4196892 acaattgcatatggaacga--atacatatataatatattattttcgaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggc 4196989  T
Q  408 atatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  4196990 atgtagcttgtcgttttccatgcatattcatctct 4197024  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28388503 - 28388311
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28388503 cagacagtgggttctgcataattttaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatt 28388404  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 213  Q
    ||||   | |||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28388403 cata--caagattgaaattcggacataaacaaaataaatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaatta 28388311  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 281 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 28387979 - 28387821
Alignment:
Q  281 taaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacg 380  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28387979 taaattaaatccctacttacaatcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacg 28387880  T
Q  381 tcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatct 440  Q
    ||||  |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28387879 tcgctatcgtcgtgaataa-caaaggcatataacttgtcgttttccatgtgtattcatct 28387821  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14280884 - 14280767
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14280884 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaatgtaatataatt 14280785  T
Q  119 catatgtatgattgaaac 136  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14280784 catatgtatgattgaaac 14280767  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 442
Target Start/End: Original strand, 30352541 - 30352940
Alignment:
Q  43 taagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggac 142  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||  ||||   |  ||| |||||| | |    
T  30352541 taagcattttcaagccattttt-cgatcagtttttatctgtaaataaatcagagcatttccaaatgcaatataagccatac--aacatttaaactcagtc 30352637  T
Q  143 ataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacatt 242  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||     ||| ||||||||||| |||||  ||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  30352638 ataa--aagaaaaatacaatatctttt-----tgtccataattaaatcaaaccagcatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgtt 30352730  T
Q  243 acaaagtgtccataattaaact----------actcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatac 332  Q
    ||| |||||||||||||||||           |||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  30352731 acacagtgtccataattaaacagcacattacaactcattacatatcaataaattaaatctttacttacattcaatgcaattgcatatggaaaaaacatac 30352830  T
Q  333 atatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgt 432  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  |||||   || |||| |||||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  30352831 atatataatatattattttccacaatattccgaaacataaatacgacgtcgctatcgtctttaacaagccaaggcatataacttgccgtttttcatgcat 30352930  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7762198 - 7762013
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| || | ||||||||   |  ||||||||||| ||||||     
T  7762198 attttcaagcctttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccaaagcattttgaaaggcaaaacaattcatac--aacattgaaactcgaacataaa 7762101  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7762100 caagatagatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 7762013  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 318 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 43179552 - 43179428
Alignment:
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  43179552 atggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatcaaacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagctta 43179453  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||| || |||||||||    
T  43179452 ccgttttccatgcgtgttcatctct 43179428  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 149 - 392
Target Start/End: Original strand, 6267691 - 6267933
Alignment:
Q  149 aagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaag 248  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  || | ||||||||||| || |||||||||  ||||||||  |   | ||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  6267691 aagaaaaatacattatcttttaccgttatccataattaaatcaatccgacatttcattaaaattgcaagaatgtttgaaattcatcataacattaaagag 6267790  T
Q  249 tgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgt 348  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| | ||| || || ||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  6267791 tgtccataattaaacaacacattacatatcattaaattaaatctctactgacattctacgcagttgcagatggaacaaaaatacatatataatatattat 6267890  T
Q  349 cttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcg 392  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  6267891 cttccatcatattccg-aacataaattcgacgtcgccatcgtcg 6267933  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Original strand, 38407266 - 38407449
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||   |  |||||||||| |||||||     
T  38407266 atttccaagccatttt--cggccagtttttacctgtaattaaagcagaacatttcgaaaggcaaaataattcatac--aacattgaaactcagacataaa 38407361  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38407362 caagaaaaatacaatatcttttagaattgtccataattaaatcaaaccggcatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 38407449  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41799722 - 41799539
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||   |  ||||||||| ||||||||     
T  41799722 attttcaagccattttt-cggccagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatac--aacattgaaacttggacataaa 41799626  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
     |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41799625 caagaaaaatacaattt-ttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 41799539  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 4196643 - 4196746
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  4196643 cagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagctattttt-cggtcaatttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaa 4196741  T
Q  118 tcata 122  Q
    |||||    
T  4196742 tcata 4196746  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43179841 - 43179631
Alignment:
Q  62 ttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaa 161  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  | || ||   |  ||| | |||||| || ||  |||| ||||| |     
T  43179841 ttttcggtcagtttttacctgtaattcaaccagagcattttcaaaggcaatactagtcgtac--aacatttatactcggtcaaaaacaagaaaaatatat 43179744  T
Q  162 tatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa 261  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||   || || |||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  43179743 tatcttttacacttgtccataattaatacaatccaacatttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacgttaaagagtgtccataattaa 43179644  T
Q  262 actactcattaca 274  Q
    || || |||||||    
T  43179643 acaacacattaca 43179631  T

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Target: scaffold0494 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 5311 - 4889
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  5311 cagacagtgggttctgcataattctagacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggctaaataatt 5212  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaattaaaca 217  Q
    ||||   | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5211 catac--aagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaaaattaaaca 5114  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacat 317  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  5113 aacgtttgaaattcatgaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcat 5014  T
Q  318 atggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5013 atggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 4914  T
Q  418 ccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  4913 ccgttttccatgcgtattcatctct 4889  T

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Target: scaffold0116 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 29 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15929 - 15518
Alignment:
Q  29 gttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatg 128  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |    
T  15929 gttctgcataattctaaacatttctaagccatttgttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aag 15832  T
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15831 attgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttagttaaaattaaacaaacgtttgaaa 15732  T
Q  229 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15731 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaac 15632  T
Q  329 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 428  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15631 atacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtccccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 15532  T
Q  429 gtgtattcatctct 442  Q
      ||||||||||||    
T  15531 acgtattcatctct 15518  T

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Target: scaffold0201 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 29 - 442
Target Start/End: Original strand, 22500 - 22924
Alignment:
Q  29 gttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatg 128  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |    
T  22500 gttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccaatttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aag 22597  T
Q  129 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22598 attgaaactcggacataatcaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacg-ttgaaa 22696  T
Q  229 ttcatcaaaacattaca--------------aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaatta 314  Q
    |||||||||||||||||              |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  22697 ttcatcaaaacattacaaagtgttcataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 22796  T
Q  315 catatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 414  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22797 caaatggaacgaacatacatatataatataatattttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcaaataagcaaaggcatatagc 22896  T
Q  415 ttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22897 ttgccgttttccatgcgtattcatctct 22924  T

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Target: scaffold0513 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 8288 - 8602
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataatt 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  8288 cagacagtgggttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccaaagcatttccaaaggcaaaataatt 8387  T
Q  119 catatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacag 218  Q
    ||||   | ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  8388 catac--aagattgaaactcgggcataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccaacatttggttaaaattaaacaa 8485  T
Q  219 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacata 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8486 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcata 8585  T
Q  319 tggaacgaacatacata 335  Q
    |||||||||||||||||    
T  8586 tggaacgaacatacata 8602  T

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Target: scaffold0219 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20096 - 19743
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  20096 cagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagcttttttttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaa 19997  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 217  Q
    |||||   |  |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  19996 tcatac--aacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaca 19899  T
Q  218 gacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtcc--------------ataattaaactactcattacacatcattaaattaaattcctacttacatt 303  Q
     |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||              |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19898 aacgtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtggccgtaattaagtgttcataattaaacaactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacatt 19799  T
Q  304 caatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccata 359  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19798 caacgcaattgcatatggaacgagcatacatatataatatattatcttccaccata 19743  T

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Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 357 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19582 - 19497
Alignment:
Q  357 atattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19582 atattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaagcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctct 19497  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 438
Target Start/End: Original strand, 21768 - 22144
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||   |  ||||||||||| |          
T  21768 atttctaagccattttt-cggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaagcaatataaatcatac--aatattgaaactcgaa------ 21858  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaa 247  Q
          |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21859 ------aaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaaaaa 21952  T
Q  248 gtgtccataattaa----------actactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatata 337  Q
    ||||||||||||||          || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21953 gtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatata 22052  T
Q  338 taatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattca 437  Q
    |         | |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||  | |||   ||||||| ||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  22053 t---------ttttccaccatattccaaaacataaattcgacgtcgctattgtctttaataagccaagacatataacttgtcattttccatgcgtattca 22143  T

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Target: scaffold0169 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 292 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 10977 - 10827
Alignment:
Q  292 cctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtc 391  Q
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T  10977 cctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacaaatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatctgacgtcgctatcgtc 10878  T
Q  392 gcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
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T  10877 acgaataagccaaggcatatagcttgctgttttccatgcgtattcatctct 10827  T

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Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 1668 - 1517
Alignment:
Q  19 cagacagcaggttctgcataattcta-agtatttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataat 117  Q
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T  1668 cagacagtgggttctgcataattctatagcatttccaagccattttt-cggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaa 1570  T
Q  118 tcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttaca 172  Q
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T  1569 tcata--caacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttaca 1517  T

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Target: scaffold0199 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Original strand, 12522 - 12706
Alignment:
Q  48 atttccaagccattttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataat 147  Q
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T  12522 atttccaagcc-ttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaagcaaaacaattcatac--aacattgaaactcggacataaa 12618  T
Q  148 gaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
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T  12619 caagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgtttaaattacacaaacgtttaaaattcatca 12706  T

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Target: scaffold0011 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 236179 - 236006
Alignment:
Q  60 ttttttcggccagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatac 159  Q
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T  236179 ttttttcgaccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatac--aatattgaaactcagacataaacaagataaatac 236082  T
Q  160 aatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatca 235  Q
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T  236081 aatatcttttacaattgtccataattaaatcaaatcgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 236006  T

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Target: scaffold0794 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0794
Description:

Target: scaffold0794; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 268 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1488 - 1314
Alignment:
Q  268 cattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaa 367  Q
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T  1488 cattacacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcaaaa 1389  T
Q  368 cataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 442  Q
    |||||||| ||||||||  | |||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1388 cataaatccgacgtcgctattgtctttaataagtcaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 1314  T

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