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Alignment Overview

Query: NF3899_high_11 (Length: 249)

Name: NF3899_high_11
Description: NF3899
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3899_high_11
NF3899_high_11
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (1-239)||(10822718-10822956)
chr3 (1-224)||(11239135-11239359)
chr3 (1-224)||(48339772-48339996)
chr3 (1-224)||(8476323-8476547)
chr3 (1-224)||(26848854-26849078)
chr3 (1-224)||(1099031-1099254)
chr3 (1-224)||(33217928-33218152)
chr3 (8-224)||(40908104-40908321)
chr3 (1-224)||(20414480-20414704)
chr3 (1-224)||(47114872-47115096)
chr3 (1-215)||(46359784-46359999)
chr3 (1-224)||(6231516-6231740)
chr3 (1-224)||(44952140-44952364)
chr3 (1-224)||(9320463-9320687)
chr3 (1-224)||(20297625-20297849)
chr3 (1-220)||(31611004-31611224)
chr3 (1-224)||(28124451-28124675)
chr3 (1-144)||(19532977-19533120)
chr3 (1-224)||(24574399-24574631)
chr3 (2-224)||(31435938-31436160)
chr3 (3-224)||(53165740-53165961)
chr3 (2-220)||(12228275-12228492)
chr3 (1-224)||(43132172-43132395)
chr3 (23-220)||(1246921-1247116)
chr3 (1-115)||(29512432-29512546)
chr3 (3-224)||(28770225-28770446)
chr3 (1-136)||(43719033-43719164)
chr3 (1-200)||(26849194-26849384)
chr3 (58-204)||(12930976-12931121)
chr3 (3-209)||(27823109-27823315)
chr3 (60-139)||(18460831-18460910)
chr3 (157-224)||(2565475-2565542)
chr3 (1-224)||(32071279-32071496)
chr3 (156-224)||(40584588-40584656)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (1-224)||(11855670-11855894)
chr5 (1-224)||(4765575-4765799)
chr5 (1-224)||(14206836-14207060)
chr5 (1-224)||(12970545-12970769)
chr5 (1-224)||(19065520-19065744)
chr5 (1-224)||(22935927-22936151)
chr5 (1-224)||(18412041-18412265)
chr5 (1-224)||(555721-555945)
chr5 (1-224)||(29543030-29543254)
chr5 (1-224)||(6091547-6091771)
chr5 (1-224)||(28602388-28602611)
chr5 (1-224)||(8406726-8406950)
chr5 (8-215)||(8646415-8646623)
chr5 (1-224)||(32535769-32535993)
chr5 (1-224)||(36703706-36703930)
chr5 (1-224)||(27481189-27481413)
chr5 (1-224)||(27480843-27481065)
chr5 (4-220)||(42012198-42012414)
chr5 (1-224)||(6930474-6930700)
chr5 (3-224)||(20962425-20962646)
chr5 (3-222)||(31583080-31583297)
chr5 (1-137)||(1664563-1664699)
chr5 (18-210)||(17251662-17251854)
chr5 (154-224)||(26637058-26637128)
chr5 (3-224)||(40275770-40275991)
chr5 (3-140)||(35348624-35348760)
chr5 (6-224)||(43346910-43347128)
chr5 (67-138)||(19089818-19089889)
chr5 (1-39)||(36703614-36703652)
chr5 (79-137)||(28023744-28023802)
chr5 (154-200)||(28429687-28429733)
chr5 (83-137)||(30899470-30899524)
chr5 (161-209)||(36978201-36978249)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (1-224)||(20260101-20260325)
chr1 (1-224)||(3572580-3572804)
chr1 (1-224)||(9115670-9115894)
chr1 (1-224)||(25789596-25789820)
chr1 (1-224)||(46666541-46666765)
chr1 (1-224)||(9831885-9832109)
chr1 (1-224)||(14788556-14788780)
chr1 (1-224)||(39930290-39930514)
chr1 (8-224)||(2430336-2430553)
chr1 (1-224)||(1597357-1597581)
chr1 (1-224)||(12190192-12190416)
chr1 (1-224)||(39329441-39329665)
chr1 (1-224)||(5518519-5518742)
chr1 (1-224)||(52630606-52630830)
chr1 (1-224)||(32824754-32824979)
chr1 (1-224)||(6978603-6978827)
chr1 (1-224)||(8331847-8332071)
chr1 (1-224)||(48916037-48916260)
chr1 (1-224)||(2632686-2632909)
chr1 (1-224)||(36361616-36361839)
chr1 (1-224)||(51445095-51445318)
chr1 (1-224)||(13653685-13653908)
chr1 (2-224)||(35187290-35187513)
chr1 (47-224)||(47037337-47037514)
chr1 (1-224)||(38964694-38964918)
chr1 (1-220)||(50190784-50191003)
chr1 (1-221)||(4683392-4683612)
chr1 (1-139)||(32202413-32202552)
chr1 (1-222)||(37436638-37436858)
chr1 (1-224)||(6911318-6911550)
chr1 (1-224)||(30240844-30241066)
chr1 (3-224)||(52699481-52699702)
chr1 (1-224)||(5806306-5806515)
chr1 (2-224)||(49822932-49823134)
chr1 (1-224)||(29091505-29091723)
chr1 (58-198)||(46960519-46960658)
chr1 (79-221)||(13521233-13521374)
chr1 (54-224)||(11014456-11014626)
chr1 (79-221)||(19083123-19083265)
chr1 (79-221)||(19131011-19131153)
chr1 (83-224)||(1007663-1007804)
chr1 (1-65)||(1007604-1007668)
chr1 (1-100)||(48462364-48462463)
chr1 (80-200)||(17475360-17475480)
chr1 (154-221)||(20505007-20505074)
chr1 (83-224)||(13931899-13932039)
chr1 (154-224)||(52186061-52186131)
chr1 (1-65)||(47031692-47031757)
chr1 (1-142)||(47677477-47677618)
chr1 (1-139)||(1227978-1228116)
chr1 (80-224)||(31806771-31806913)
chr1 (3-224)||(38519077-38519297)
chr1 (6-98)||(52186170-52186262)
chr1 (55-136)||(29769399-29769481)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (1-224)||(18726634-18726859)
chr8 (1-224)||(35818439-35818663)
chr8 (1-224)||(37392561-37392785)
chr8 (1-224)||(38363913-38364137)
chr8 (1-224)||(42755699-42755923)
chr8 (1-224)||(32660948-32661173)
chr8 (1-224)||(12710477-12710701)
chr8 (1-224)||(7931071-7931295)
chr8 (2-224)||(1554369-1554592)
chr8 (1-221)||(26601956-26602176)
chr8 (1-224)||(38132752-38132977)
chr8 (1-224)||(3049841-3050065)
chr8 (1-224)||(16313522-16313746)
chr8 (1-224)||(18297944-18298168)
chr8 (1-224)||(26061976-26062200)
chr8 (1-224)||(25837743-25837967)
chr8 (1-224)||(41228729-41228952)
chr8 (1-224)||(10896232-10896455)
chr8 (1-224)||(21137147-21137370)
chr8 (1-224)||(5020505-5020730)
chr8 (1-221)||(29421507-29421727)
chr8 (3-202)||(19160778-19160977)
chr8 (1-224)||(35394223-35394446)
chr8 (1-224)||(7317209-7317429)
chr8 (1-224)||(33444641-33444861)
chr8 (1-144)||(6805718-6805861)
chr8 (3-224)||(41432575-41432796)
chr8 (1-137)||(31117632-31117762)
chr8 (3-221)||(16218961-16219178)
chr8 (16-224)||(15226813-15227020)
chr8 (1-65)||(40197227-40197292)
chr8 (154-224)||(40197091-40197161)
chr8 (16-144)||(43872061-43872189)
chr8 (156-221)||(25899620-25899685)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (1-224)||(11329825-11330049)
chr7 (1-224)||(35488204-35488428)
chr7 (1-224)||(40212721-40212945)
chr7 (1-225)||(34930480-34930706)
chr7 (1-224)||(8419604-8419828)
chr7 (1-224)||(16825369-16825593)
chr7 (1-224)||(39554015-39554239)
chr7 (1-224)||(45045458-45045682)
chr7 (1-226)||(9947003-9947229)
chr7 (1-224)||(27213870-27214094)
chr7 (1-224)||(27419239-27419463)
chr7 (1-224)||(43949077-43949301)
chr7 (1-224)||(48341195-48341418)
chr7 (1-224)||(9814233-9814453)
chr7 (1-224)||(25097901-25098125)
chr7 (1-224)||(25924652-25924876)
chr7 (1-224)||(27248125-27248349)
chr7 (1-224)||(44565877-44566101)
chr7 (1-224)||(45265063-45265287)
chr7 (1-224)||(38396381-38396605)
chr7 (1-224)||(41632379-41632603)
chr7 (1-224)||(48313954-48314178)
chr7 (1-224)||(45448774-45448998)
chr7 (1-224)||(33378666-33378898)
chr7 (1-224)||(38544026-38544250)
chr7 (29-224)||(18824007-18824202)
chr7 (1-224)||(28904201-28904425)
chr7 (1-222)||(37534120-37534341)
chr7 (1-224)||(44820086-44820310)
chr7 (2-224)||(41684037-41684259)
chr7 (18-224)||(25045633-25045838)
chr7 (1-182)||(45722982-45723163)
chr7 (1-224)||(30686007-30686230)
chr7 (5-224)||(6656239-6656457)
chr7 (18-224)||(11000552-11000759)
chr7 (1-224)||(6656488-6656709)
chr7 (1-124)||(48160689-48160812)
chr7 (1-144)||(43569780-43569923)
chr7 (3-179)||(45440742-45440918)
chr7 (1-138)||(31921828-31921963)
chr7 (154-224)||(48160606-48160676)
chr7 (18-144)||(22156274-22156401)
chr7 (18-144)||(22212189-22212316)
chr7 (58-224)||(43445898-43446064)
chr7 (3-137)||(40385729-40385864)
chr7 (154-200)||(10902689-10902735)
chr7 (172-224)||(45723211-45723263)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (1-224)||(6279936-6280160)
chr4 (1-224)||(13230004-13230228)
chr4 (1-224)||(25932277-25932501)
chr4 (1-224)||(42773784-42774008)
chr4 (1-224)||(48879161-48879385)
chr4 (1-224)||(27762914-27763138)
chr4 (1-224)||(35999522-35999746)
chr4 (1-224)||(45596104-45596328)
chr4 (1-224)||(39730308-39730532)
chr4 (1-224)||(40435736-40435960)
chr4 (1-224)||(41859062-41859285)
chr4 (1-224)||(48518906-48519130)
chr4 (1-224)||(47670198-47670422)
chr4 (1-224)||(45747811-45748034)
chr4 (1-224)||(8322081-8322305)
chr4 (1-224)||(43723100-43723324)
chr4 (1-224)||(55968015-55968239)
chr4 (1-224)||(25916050-25916272)
chr4 (1-224)||(41744235-41744460)
chr4 (1-224)||(34049612-34049836)
chr4 (2-224)||(23686624-23686847)
chr4 (1-224)||(32953359-32953583)
chr4 (1-203)||(50672941-50673143)
chr4 (1-224)||(18405249-18405472)
chr4 (1-224)||(39498661-39498885)
chr4 (1-224)||(39502000-39502224)
chr4 (1-224)||(39835322-39835546)
chr4 (1-224)||(935962-936186)
chr4 (1-224)||(18931589-18931813)
chr4 (1-184)||(34238009-34238193)
chr4 (5-224)||(30415743-30415962)
chr4 (1-226)||(38414044-38414266)
chr4 (1-121)||(48873857-48873978)
chr4 (1-224)||(27942573-27942803)
chr4 (1-137)||(31937971-31938108)
chr4 (8-115)||(27555269-27555377)
chr4 (83-224)||(10400820-10400961)
chr4 (1-109)||(36858243-36858351)
chr4 (1-200)||(52469535-52469734)
chr4 (3-139)||(18405592-18405728)
chr4 (55-224)||(7258854-7259022)
chr4 (61-224)||(51968673-51968837)
chr4 (3-138)||(38394745-38394881)
chr4 (154-224)||(27555400-27555470)
chr4 (2-137)||(48059893-48060028)
chr4 (58-140)||(30790436-30790518)
chr4 (30-221)||(47426258-47426451)
chr4 (55-139)||(37014485-37014569)
chr4 (154-224)||(36860108-36860177)
chr4 (2-51)||(10400970-10401019)
chr4 (179-224)||(34237435-34237480)
chr4 (154-222)||(26165354-26165422)
chr4 (3-99)||(36858517-36858613)
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (1-224)||(346360-346584)
chr2 (1-224)||(6171623-6171847)
chr2 (1-224)||(9733861-9734085)
chr2 (1-224)||(11071437-11071661)
chr2 (1-224)||(41750361-41750585)
chr2 (1-224)||(28311712-28311935)
chr2 (1-224)||(4559391-4559615)
chr2 (1-224)||(37192354-37192578)
chr2 (1-224)||(5770125-5770349)
chr2 (1-224)||(42674676-42674900)
chr2 (1-224)||(1988144-1988367)
chr2 (1-224)||(37233262-37233485)
chr2 (1-224)||(2050698-2050922)
chr2 (1-221)||(14777516-14777737)
chr2 (1-226)||(26310099-26310327)
chr2 (1-224)||(2521507-2521731)
chr2 (1-224)||(18713672-18713895)
chr2 (2-224)||(45409084-45409306)
chr2 (1-224)||(638426-638649)
chr2 (1-224)||(41729145-41729369)
chr2 (8-224)||(37533791-37534008)
chr2 (1-224)||(34356715-34356938)
chr2 (1-224)||(14832643-14832866)
chr2 (1-224)||(21737415-21737647)
chr2 (2-224)||(27357978-27358200)
chr2 (1-224)||(17965815-17966039)
chr2 (1-221)||(20426501-20426721)
chr2 (1-224)||(40950874-40951098)
chr2 (1-224)||(39995146-39995378)
chr2 (1-139)||(13760799-13760938)
chr2 (3-224)||(45694023-45694244)
chr2 (1-224)||(3902289-3902512)
chr2 (68-224)||(14253422-14253578)
chr2 (1-137)||(23943995-23944132)
chr2 (83-226)||(6571602-6571745)
chr2 (33-224)||(11763386-11763577)
chr2 (3-224)||(40569852-40570076)
chr2 (3-144)||(41298013-41298154)
chr2 (68-140)||(25724925-25724997)
chr2 (1-115)||(7007417-7007531)
chr2 (3-99)||(13790125-13790221)
chr2 (157-224)||(5002852-5002919)
chr2 (3-137)||(4875611-4875745)
chr2 (68-224)||(39819593-39819752)
chr2 (112-224)||(25454968-25455080)
chr2 (1-221)||(1623216-1623435)
chr2 (154-224)||(24499428-24499496)
chr2 (2-39)||(11763601-11763638)
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[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (1-224)||(28967-29191)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (1-224)||(1316851-1317074)
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chr6 (154-224)||(8029319-8029389)
chr6 (54-224)||(21008039-21008208)
chr6 (62-224)||(10849798-10849961)
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[»] scaffold0006 (3 HSPs)
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[»] scaffold0702 (1 HSPs)
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[»] scaffold0662 (1 HSPs)
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[»] scaffold0238 (1 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10822956 - 10822718
Alignment:
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T  10822956 ctttataatattcttaggaaccatacaaatagggattattatagataactatttatgattttattcccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 10822857  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
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T  10822856 ctagggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaattttttttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacacttctatcattttatt 10822757  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactttattcccaccctttg 239  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10822756 cccggaaatcaacaaatataactttattcccaccctttg 10822718  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11239359 - 11239135
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11239359 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 11239260  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11239259 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 11239160  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  11239159 tcccgggaatcaacaattataactt 11239135  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48339996 - 48339772
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  48339996 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 48339897  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  48339896 ccttgggaaattttttctattcccatgaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttatatcattttat 48339797  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  48339796 tcccggaaatcaacaattataactt 48339772  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8476547 - 8476323
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8476547 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 8476448  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||    
T  8476447 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacaggcatatacattccaatcattttat 8476348  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  8476347 tcccgggaatcaacaattataactt 8476323  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 26848854 - 26849078
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26848854 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactttattcccaccctttt 26848953  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26848954 ccttaggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 26849053  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  26849054 tcccgggaatcaacaattataactt 26849078  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 1099031 - 1099254
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1099031 ctttataatatttctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaatatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttc 1099130  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1099131 cttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagggatatacatttctatcattttatt 1099230  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||    
T  1099231 cccgggaatcaacaattataactt 1099254  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33218152 - 33217928
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  33218152 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattcccaccctttt 33218053  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||         | |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  33218052 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttaataaatttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 33217953  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  33217952 tcccggaaatcaacaattataactt 33217928  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 40908104 - 40908321
Alignment:
Q  8 atattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataact-atttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctaggg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40908104 atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccacccttttccttggg 40908203  T
Q  107 aaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccaga 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |     
T  40908204 aaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg 40908303  T
Q  207 aatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  40908304 aatcaacaattataactt 40908321  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20414704 - 20414480
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20414704 ctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 20414605  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||         |||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  20414604 ccttgggaatttttttttatttccaagaacattttatacccgggaataaaatttagtaaatttataacaaacataggcatatacattccaatcattttat 20414505  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  20414504 tcccagaaatcaacaattataactt 20414480  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47115096 - 47114872
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47115096 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 47114997  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  47114996 ccttgggaatttttttttatttccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 47114897  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    
T  47114896 tcccaggaatcaacaattataactt 47114872  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 46359784 - 46359999
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatag-ataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46359784 ctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 46359883  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  46359884 ccttgggaaatattttctattcacaagaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcctatcattttat 46359983  T
Q  200 tcccagaaatcaacaa 215  Q
    ||| ||||||||||||    
T  46359984 tccaagaaatcaacaa 46359999  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6231740 - 6231516
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatag-ataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  6231740 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttt 6231641  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    | | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6231640 cattgggaaattttttctattccaaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 6231541  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    || | | ||||||||| ||||||||    
T  6231540 tctcgggaatcaacaattataactt 6231516  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 44952140 - 44952364
Alignment:
Q  1 ctttataatattc-ttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttt 98  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44952140 ctttataatattccttaggaac-ataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttt 44952238  T
Q  99 tcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcatttta 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44952239 tccttgggaaattttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcatttta 44952338  T
Q  199 ttcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  44952339 ttcccgggaatcaacaattataactt 44952364  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9320687 - 9320463
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  9320687 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggatcataataagtaaactatttatgaatttatttccatctccatgggaactttattcccaccttttt 9320588  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||    
T  9320587 ccttaggaaattttttctattcccaggaatattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagtatatacattcctatcattttat 9320488  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  9320487 tcccgggaatcaacaattataactt 9320463  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 20297625 - 20297849
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataact-atttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20297625 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 20297724  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20297725 ccttggaaatttttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 20297824  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | || | ||||||||| ||||||||    
T  20297825 ttccgggaatcaacaattataactt 20297849  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31611224 - 31611004
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  31611224 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattcccaccctttt 31611125  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||    
T  31611124 tcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttat 31611025  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatata 220  Q
    |||| | ||||||||| ||||    
T  31611024 tcccgggaatcaacaattata 31611004  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28124675 - 28124451
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  28124675 ctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataatatgtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttt 28124576  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28124575 ccttgggaaattttttatattccgaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataacaaacataggcatatacattcctatcattttat 28124476  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||   ||||||||| ||||||||    
T  28124475 tcccgagaatcaacaattataactt 28124451  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 19532977 - 19533120
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19532977 ctttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaactatttatgaatttattcccatctccaaggaaactttattcccacccttttc 19533076  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccggga 144  Q
    || || |||   |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19533077 cttggaaaaaaatttctattcccaggaacattttatacccggga 19533120  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 24574399 - 24574631
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  24574399 ctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccatttt 24574498  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaa--------cattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctat 191  Q
     || ||||||||||||||||| |||  ||        |||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  24574499 tcttgggaaattttttctatttccagaaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctat 24574598  T
Q  192 cattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24574599 cattttattcccgggaatcaacaattataactt 24574631  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31436160 - 31435938
Alignment:
Q  2 tttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcc 101  Q
    |||||||||||  | |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||  |  || ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||  ||||     
T  31436160 tttataatatttcttggaatcataaaaataaggattataataggtaactacattagaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccaatttct 31436061  T
Q  102 tagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattc 201  Q
    | |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31436060 ttgggaaaatttttctattttcaggaacattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattc 31435961  T
Q  202 ccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  31435960 tcaggaatcaacaaatataactt 31435938  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 53165961 - 53165740
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcct 102  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  53165961 ttataatattcctaggaatcataaaaatagatattataataggtaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttttct 53165862  T
Q  103 agggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcc 202  Q
     || |||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||      
T  53165861 tggaaaaaattttctattcccagaaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatatatattcctatcattttattta 53165762  T
Q  203 cagaaatcaacaaatataactt 224  Q
      | ||||||||||||||||||    
T  53165761 tgggaatcaacaaatataactt 53165740  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12228492 - 12228275
Alignment:
Q  2 tttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcc 101  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| || |||||||     
T  12228492 tttatgatattcttaggaatcataaaaataagtattataatagataactacatatgattttattctcatctccatgggaactttattctca-ccttttct 12228394  T
Q  102 tagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattc 201  Q
    | || || |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||         ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12228393 ttggaaatttttttctattcccagaaacattttgtacccgagaataaaatttagtaaacttgtaataaacataggcatatatatttctatcattttattc 12228294  T
Q  202 ccagaaatcaacaaatata 220  Q
     ||| ||| ||||| ||||    
T  12228293 gcaggaattaacaactata 12228275  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43132395 - 43132172
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  43132395 ctttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaactatttatgaatttaatctcatctccgtgggaactctattcccacccttttc 43132296  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || ||||||   ||| ||||| || | |||||||||||  |  |         | ||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  43132295 cttgggaaaaaatttatattctcaggtacattttatacatgaaaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatatattcctattattttatt 43132196  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | |   ||||||||||||||||||    
T  43132195 ctcgagaatcaacaaatataactt 43132172  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1247116 - 1246921
Alignment:
Q  23 ataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcc 122  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||| | |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |    
T  1247116 ataaaaatatggattataatagataactatataagaatttattccgatctccatgtgaact--attcccacctttttccttcggaaattttttctattac 1247019  T
Q  123 caagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatata 220  Q
    || ||||||||||| |  ||||         ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  1247018 caggaacattttattcttgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatatgtatttctatcattttattcccgagaatcaacaaatata 1246921  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 29512432 - 29512546
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagat-aactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||    
T  29512432 ctttataatattcataggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaattta-ttccatctctatgggaactttatttccaccctttt 29512530  T
Q  100 cctagggaaatttttt 115  Q
    ||| ||||||||||||    
T  29512531 ccttgggaaatttttt 29512546  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28770446 - 28770225
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcct 102  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  |||||  | ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  28770446 ttataatattatcgggaaccataaaaatagggattataataggtaattacatatgaaatcattcccatcttcatgagaactttattcccaccattttctt 28770347  T
Q  103 agggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcc 202  Q
     |||||| |||||||||| | | |||| |||||||||| |||         |||||||||||| ||||||||| |||  | | ||||||| |||||||||    
T  28770346 tgggaaaatttttctattgctaggaacgttttatacccaggaatcaaatttagtaaacttgtaccaaacatagacatgcatatttctatctttttattcc 28770247  T
Q  203 cagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||| |||| || ||||||||||    
T  28770246 caggaatctacgaatataactt 28770225  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 43719164 - 43719033
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataact-atttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| | |||||||| ||     |||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  43719164 ctttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataataagtaaattatttatgaatt-----ccatctccatgggatctttattcccaccctttt 43719070  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttat 136  Q
    ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  43719069 ccttgggaaattttttctattctcaggaacattttat 43719033  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26849384 - 26849194
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||  ||||||  |   ||||||||||||||| ||||     
T  26849384 ctttataatattcataggaaccataaaaatagagattataataggtaactatttatgaatttattctcatctctgtaggaactttattcccaccattttt 26849285  T
Q  101 ctaggga-aattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||  | |   |||||||||||||||  ||| |||||||||||||          |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  26849284 ctttgaatttttttttctattcccagaaactttttatacccggg----------agtaaacttgtaacaaacatagacatatatatttctatcattttat 26849195  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12931121 - 12930976
Alignment:
Q  58 attttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagta 157  Q
    |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| | | ||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||         ||||    
T  12931121 attttattcccatctctatgggaactttattcccaccattttctttgagaaaacttttctattcccataaacattttata-ccgggaataaaatttagta 12931023  T
Q  158 aacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattccca 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||    
T  12931022 aacttgtaacaaacatagccatatgcatttttatgattttattccca 12930976  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 27823109 - 27823315
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcct 102  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| | || ||| ||   |||| ||| ||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |    
T  27823109 ttataatattcctagaaatcataaaaatatggattataacaggtaattacacatgaatttgttctcatcttcatgagaattttattcccacccttttctt 27823208  T
Q  103 agggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcc 202  Q
     |||||| |||| ||||| | | |||| |||||||| |||||         ||||||||| || ||||||||| ||| || | |||||||||||||||||    
T  27823209 tgggaaaattttcctatttcgatgaacgttttatactcgggaataaaatttagtaaacttatagcaaacatagacatttatatttctatcattttattcc 27823308  T
Q  203 cagaaat 209  Q
    || ||||    
T  27823309 cataaat 27823315  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 139
Target Start/End: Original strand, 18460831 - 18460910
Alignment:
Q  60 tttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacc 139  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18460831 tttattttcatctccaagagaactttatttccaccattttctttgggaaaatttttctattcccagaaacattttatacc 18460910  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2565542 - 2565475
Alignment:
Q  157 aaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  2565542 aaacttgtaacaaacacaggtatatatatttctattattttattcctaagaatcaacaaatataactt 2565475  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 32071279 - 32071496
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||  ||  | ||||||  |||||||||| || |||||||| | ||||||||    
T  32071279 ctttataatattcctaggaaccataaaaataaagattataataggtaactacatacaaatttattctcatctccatgtaa-ctttattctcgcccttttc 32071377  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     |   |||| | |||||||| ||| |||||||| ||||||   |         |||||||||||||||||||||    |||| | |||||||||||||||    
T  32071378 tttaagaaaatctttctatttccatgaacatttcatacccaa-aataaaatttagtaaacttgtaacaaacata----tatatatttctatcattttatt 32071472  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
       ||||||||| |||||||||||    
T  32071473 tttagaaatcaataaatataactt 32071496  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 224
Target Start/End: Original strand, 40584588 - 40584656
Alignment:
Q  156 taaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||| || || ||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  40584588 taaacttgtagaaaacatagacatatgcatttttatgattttattctcaggaatctacaaatataactt 40584656  T

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Target: chr5 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11855894 - 11855670
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11855894 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccaccctttt 11855795  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11855794 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 11855695  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||    
T  11855694 tctcaggaatcaacaattataactt 11855670  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4765799 - 4765575
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4765799 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 4765700  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4765699 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 4765600  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  4765599 tcccgggaatcaacaattataactt 4765575  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14207060 - 14206836
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14207060 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 14206961  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14206960 ccttgggaaattttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 14206861  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  14206860 tcccggaaatcaacaattataactt 14206836  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12970769 - 12970545
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12970769 ctttataatattcataggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccaccctttt 12970670  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12970669 ccttaagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 12970570  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  12970569 tcccgggaatcaacaattataactt 12970545  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19065744 - 19065520
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19065744 ctttataatattcctaggaaccataaatatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 19065645  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19065644 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 19065545  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  19065544 tcccgggaatcaacaattataactt 19065520  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22936151 - 22935927
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22936151 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 22936052  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  22936051 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 22935952  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  22935951 tcccgggaatcaacaattataactt 22935927  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 18412041 - 18412265
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  18412041 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccttttt 18412140  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18412141 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 18412240  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||| |||||| || ||||||||    
T  18412241 tcccaggaatcaataattataactt 18412265  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 555945 - 555721
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  555945 ctttataatattcctaggaaccatcaaattagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccaccctttt 555846  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  555845 ccttgggaaattttttctattccctggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcattttat 555746  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  555745 tcccgggaatcaacaattataactt 555721  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29543254 - 29543030
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29543254 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttt 29543155  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||    
T  29543154 tcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttat 29543055  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    
T  29543054 tcccaggaatcaacaattataactt 29543030  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 6091547 - 6091771
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataact-atttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  6091547 ctttataatattcctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccactctttt 6091646  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6091647 ccttgggaaaatttttctattcccaagaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttatatcattttat 6091746  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  6091747 tcccgggaatcaacaattataactt 6091771  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 28602388 - 28602611
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28602388 ctttataatattcctaggaaccatacaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 28602487  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  28602488 ccttgggaaattttttctattctcagaaacattttata-ccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 28602586  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  28602587 tcccgggaatcaacaattataactt 28602611  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 8406726 - 8406950
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatag-ataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  8406726 ctttataatattccaaggaaccaaaaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttt 8406825  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         || |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||    
T  8406826 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagcaaacttgtaacaaatataggcatgtacattcctatcattttat 8406925  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    || |  |||||||||| ||||||||    
T  8406926 tctcgaaaatcaacaattataactt 8406950  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8646623 - 8646415
Alignment:
Q  8 atattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataact-atttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctaggg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8646623 atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg 8646524  T
Q  107 aaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccaga 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |     
T  8646523 aaattttttctattcccaggaacattttataaccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccggg 8646424  T
Q  207 aatcaacaa 215  Q
    |||||||||    
T  8646423 aatcaacaa 8646415  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 32535769 - 32535993
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32535769 ctttataatattctcaggaaccataaaaataggggttataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 32535868  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |         |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  32535869 ccttaggaaattttttctattcccaataacattttataccaagaaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacatttctatcattttat 32535968  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||  | ||||||||| ||||||||    
T  32535969 tcctgggaatcaacaattataactt 32535993  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 36703706 - 36703930
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  36703706 ctttataatattcctaggaaccatcaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattcccaccctttt 36703805  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36703806 tcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcattttat 36703905  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||   ||||||||| ||||||||    
T  36703906 tcccgataatcaacaattataactt 36703930  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 27481189 - 27481413
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  27481189 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataatatgtaaactatttatgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccaccctttt 27481288  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27481289 ccttgggaaatattttttattctcaggaatattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 27481388  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | ||| ||||||| || ||||||||    
T  27481389 ttccaaaaatcaaaaattataactt 27481413  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 27480843 - 27481065
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  27480843 ctttataatatttctatgaaccataaaaatagaaattataataggtagctatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattctca-ccttttc 27480941  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || || |||  ||||||||||||| ||||||||||||| | |||         |||||||||||||||||||||| |||| | | | |||||||||||||    
T  27480942 cttggaaaaaattttctattcccatgaacattttatacacaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatacatattcctatcattttatt 27481041  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | || |||||||||||||||||||    
T  27481042 ctcaaaaatcaacaaatataactt 27481065  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42012414 - 42012198
Alignment:
Q  4 tataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttccta 103  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || || ||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  42012414 tataatactccttggaaccataaaaatatggattataataggtaactatataagaatttattctgatctccatgtgaactttattcccacccttttcctt 42012315  T
Q  104 gggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattccc 203  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||         |||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  42012314 cggaaattttttctattcctaggaacattttatactcgagaataaaatttagtaaatttgtaacaaacatagacatatgtatttctatcattttattccc 42012215  T
Q  204 agaaatcaacaaatata 220  Q
       ||||||||||||||    
T  42012214 gagaatcaacaaatata 42012198  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 6930474 - 6930700
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || | |||| |||||| |||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||    
T  6930474 ctttataatattcctagaaaccttacagatagagattataatagataactagatataaatttatttccatcttcatgggaactttattcccacaattttc 6930573  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggc----atatacacttctatcattt 196  Q
     | |||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||  |         |||||||||||||||||||||  |    ||||| | |||||||||||    
T  6930574 tttgggaaa-tttttctattcccaataatattttatatccgaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatatatatatatttctatcattt 6930672  T
Q  197 tattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6930673 tattctcaggaatcaacaaatataactt 6930700  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Original strand, 20962425 - 20962646
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcct 102  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || || | || | ||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20962425 ttataatatttctgggaaccataaaaataggaattataataggaaattactcattaatttattctcatctccatgagaactttactcccacccttttcct 20962524  T
Q  103 agggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcc 202  Q
     ||||||  |||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||         |||||||||||||||||||||||||  |  | | |||||||||||||||    
T  20962525 tgggaaaaattttctattcccagaaacgttttatatccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcacgtgtattcctatcattttattcc 20962624  T
Q  203 cagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||  |||| || ||||||||||    
T  20962625 caagaatctacgaatataactt 20962646  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31583297 - 31583080
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcct 102  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||  ||||| || ||||||||||   ||  ||||||||||||||| ||||| |    
T  31583297 ttataatattctcaggaaccgtaaaaatagggattataataggtacttacatatgaatt-atttccatctttgtgggaactttattcccacctttttctt 31583199  T
Q  103 agggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcc 202  Q
     || ||||||||||||||||   |||| |||||||| |||||         |||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||| ||||||| |    
T  31583198 tggaaaattttttctattcctgggaacgttttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagaca-atatatttctatcgttttatttc 31583100  T
Q  203 cagaaatcaacaaatataac 222  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  31583099 cagaaatctacgaatataac 31583080  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 1664563 - 1664699
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||| | ||||||  ||||||||||  || || |||||||||| ||||    
T  1664563 ctttataatattcttatgaaccataaaaatagggattataataggtaactacatataaatttattctcatctccatgggaatttaattcccacccgtttc 1664662  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttata 137  Q
     | ||||||   ||||||||| || ||||||||||||    
T  1664663 tttgggaaaaaatttctattctcaggaacattttata 1664699  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 17251662 - 17251854
Alignment:
Q  18 gaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttct 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||   |||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||    
T  17251662 gaaccataaaaatagggattataatatatagttacacatgaatttattttcatcttcatggaaactttattcccatcattttctttgggaaattttttct 17251761  T
Q  118 attcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatc 210  Q
    |||  || ||||||||||||| || ||         |||||| || |||||||||||  ||| || | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  17251762 attatcatgaacattttatactcgagaataaaatttagtaaaattataacaaacataaacatgtatatttctatcattttattctcaggaatc 17251854  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26637128 - 26637058
Alignment:
Q  154 agtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26637128 agtaaacttgtaacaaatatagacatatataattctatcattttattcccattaatcaacaaatataactt 26637058  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40275991 - 40275770
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcct 102  Q
    |||||||||||   |||||| |||||||||||||| | |||| | | ||   || |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| | ||||| |    
T  40275991 ttataatattccatggaaccttaaaaatagggattttaataggttattagagataattttattcccatcttcatgggaactttattcccatcattttctt 40275892  T
Q  103 agggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcc 202  Q
     ||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||| | ||||         || ||||||||||||||||||| |||||  | || ||| ||||||||||    
T  40275891 tgggaaaacttttctattcccaggaatatttcatatctgggaataaaatttagcaaacttgtaacaaacatagacatatgtatttttataattttattcc 40275792  T
Q  203 cagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    || ||||| |||||||||||||    
T  40275791 caaaaatctacaaatataactt 40275770  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35348760 - 35348624
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcct 102  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||  | ||| ||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  35348760 ttataatattcccgggaaccataaaaatatgaattataataggtaattacatgtgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccacccttttctt 35348661  T
Q  103 agggaaattttttctattcccaagaacattttataccc 140  Q
     ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35348660 tgggaaa-attttctattcccaaaaacattttataccc 35348624  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43347128 - 43346910
Alignment:
Q  6 taatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagg 105  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||  |||| ||| ||   || ||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | ||    
T  43347128 taatattcgaaggaaccttaaaaatagggattaaaataggtaattacgcataattttattctcatcttcatgggaactttattcccacccttttcattgg 43347029  T
Q  106 gaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccag 205  Q
     |||  ||||||||| |||  |||| |||||||| ||||         ||||||||||||||||||| |  |||||  | || ||| ||||||||  |||    
T  43347028 aaaaacttttctattgccagaaacaatttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacatacatatgtatttttatgattttattttcag 43346929  T
Q  206 aaatcaacaaatataactt 224  Q
     |||| |||||||||||||    
T  43346928 gaatctacaaatataactt 43346910  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19089889 - 19089818
Alignment:
Q  67 ccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatac 138  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19089889 ccatcttcatgagaactttatacccatcattttctttgggaaattttttctattcccaaaaacgttttatac 19089818  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 36703614 - 36703652
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattat 39  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36703614 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattat 36703652  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 137
Target Start/End: Original strand, 28023744 - 28023802
Alignment:
Q  79 aaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttata 137  Q
    ||||||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28023744 aaactttattctcacccttttgtttgagaaattttttctattcccaaacacattttata 28023802  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 200
Target Start/End: Original strand, 28429687 - 28429733
Alignment:
Q  154 agtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||    
T  28429687 agtaaacttgtaacaaatataggcatgtatatttctatcattttatt 28429733  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 137
Target Start/End: Original strand, 30899470 - 30899524
Alignment:
Q  83 tttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttata 137  Q
    ||||||| |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  30899470 tttattctcacccttttctttggaaaattgtttctattcccaagaatattttata 30899524  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36978249 - 36978201
Alignment:
Q  161 ttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaat 209  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||  |||||||    
T  36978249 ttgtaacaaacatagacatatatatttctatcattttattttcagaaat 36978201  T

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Target: chr1 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20260325 - 20260101
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20260325 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 20260226  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  20260225 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 20260126  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    
T  20260125 tcccaggaatcaacaattataactt 20260101  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3572804 - 3572580
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3572804 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 3572705  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3572704 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 3572605  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  3572604 tcccgggaatcaacaattataactt 3572580  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 9115670 - 9115894
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9115670 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 9115769  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9115770 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 9115869  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  9115870 tcccgggaatcaacaattataactt 9115894  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 25789596 - 25789820
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25789596 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 25789695  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25789696 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 25789795  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  25789796 tcccgggaatcaacaattataactt 25789820  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 46666541 - 46666765
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46666541 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 46666640  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  46666641 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 46666740  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  46666741 tcccgggaatcaacaattataactt 46666765  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9832109 - 9831885
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9832109 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 9832010  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9832009 ccttgggaaaatttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 9831910  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||  | ||||||||| ||||||||    
T  9831909 tcctgggaatcaacaattataactt 9831885  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 14788556 - 14788780
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14788556 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 14788655  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||    
T  14788656 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaatataatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctattattttat 14788755  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | |||||| || ||||||||    
T  14788756 tcccgggaatcaaaaattataactt 14788780  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 39930290 - 39930514
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39930290 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattcccaccctttt 39930389  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39930390 ccttggaaatttttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 39930489  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  39930490 tcccgggaatcaacaattataactt 39930514  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 2430336 - 2430553
Alignment:
Q  8 atattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataact-atttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctaggg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2430336 atattcctaggaaccataaaaatagggattataataagtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg 2430435  T
Q  107 aaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccaga 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |     
T  2430436 aaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg 2430535  T
Q  207 aatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  2430536 aatcaacaattataactt 2430553  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1597581 - 1597357
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  1597581 ctttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttt 1597482  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || || ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1597481 tcttggaaaaatttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 1597382  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  1597381 tcccggaaatcaacaattataactt 1597357  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12190416 - 12190192
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatag-ataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  12190416 ctttataatattccaaggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccatttt 12190317  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  12190316 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatgtacattcctatcattttat 12190217  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||    
T  12190216 tcccgaaaatcaacaattataactt 12190192  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 39329441 - 39329665
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39329441 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 39329540  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||    
T  39329541 tcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttat 39329640  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  39329641 tcccgggaatcaacaattataactt 39329665  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5518742 - 5518519
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  5518742 ctttataacattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaactatatataaatttattctcatctccatgggaactttattcccacctttttc 5518643  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5518642 cttgggaaaatttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttctatcattttatt 5518543  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||  | ||||||||||||||||||    
T  5518542 cctgggaatcaacaaatataactt 5518519  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 52630606 - 52630830
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  52630606 ctttataatattcctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttt 52630705  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||         |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  52630706 ctttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttat 52630805  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    
T  52630806 tcccaggaatcaacaattataactt 52630830  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 32824754 - 32824979
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagat-aactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  32824754 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttt 32824853  T
Q  100 cc-tagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcatttta 198  Q
    || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  32824854 cctttgggaaattttttctattcccaggaacaatttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctattatttta 32824953  T
Q  199 ttcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    || || ||||||||||| ||||||||    
T  32824954 tttccggaaatcaacaattataactt 32824979  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 6978603 - 6978827
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6978603 ctttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattcccaccctttt 6978702  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| | ||||||||||||||||||   ||||||||||||   |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6978703 ccttgagaaattttttctattccctgaaacattttatacgaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 6978802  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  6978803 tcccgggaatcaacaattataactt 6978827  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 8331847 - 8332071
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagat-aactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8331847 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttt 8331946  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |  |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  8331947 ccttgaaattttttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgcaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 8332046  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  8332047 tcccggaaatcaacaattataactt 8332071  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48916260 - 48916037
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||    
T  48916260 ctttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggcaactacatatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccatccttatc 48916161  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |         ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48916160 tttgggaaattttttctattcccatgaacattttatacccgaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttatt 48916061  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | | | ||||||||||||||||||    
T  48916060 ctctggaatcaacaaatataactt 48916037  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 2632686 - 2632909
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||    
T  2632686 ctttataatatttctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcacatctccatgggaactttattcc-accatttt 2632784  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  2632785 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctattattttat 2632884  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  2632885 tcccgggaatcaacaattataactt 2632909  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 36361616 - 36361839
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |  ||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  36361616 ctttataatattcctatgaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttactctcatctccatgggaactttattccc-ccctttt 36361714  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  36361715 ccttgggaaattttttctattcctaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 36361814  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  36361815 tcccgggaatcaacaattataactt 36361839  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51445318 - 51445095
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  51445318 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttt 51445219  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||         ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  51445218 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttata-ctaagaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacatttatatcattttat 51445120  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  51445119 tcccgggaatcaacaattataactt 51445095  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 13653685 - 13653908
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  13653685 ctttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaactacatatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccattttc 13653784  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||||||||    
T  13653785 tttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtatacatatatatttctatcattttatt 13653884  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||    
T  13653885 ctcaggaatcaacaaatttaactt 13653908  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 35187290 - 35187513
Alignment:
Q  2 tttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||  |||||   |||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  35187290 tttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaacttattcttatctccatgggaactttattcccacccttctc 35187389  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  35187390 cttgggaaattttttctattcccacgaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacatttctatcattttatt 35187489  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||    
T  35187490 cccgggaatcaacaattataactt 35187513  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 224
Target Start/End: Original strand, 47037337 - 47037514
Alignment:
Q  47 aactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggann 146  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||      
T  47037337 aactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaat 47037436  T
Q  147 nnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  47037437 aaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataactt 47037514  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38964918 - 38964694
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataact-atttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||     
T  38964918 ctttataatattcctaataaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattccaatctccatgggaactttattcccaccctttc 38964819  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||          |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  38964818 tcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaatttttgtaaacttgtaacaaacataagcatatacatttctatcattttat 38964719  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  38964718 tcccgggaatcaacaattataactt 38964694  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 50191003 - 50190784
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  50191003 ctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatt-ccatcttcatgggaactttattcccaccttttt 50190905  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||    
T  50190904 ccttgggaaattttttctattccaaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtaggcatatacattcctagcattttat 50190805  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatata 220  Q
    | || ||||| ||||| ||||    
T  50190804 ttccggaaattaacaattata 50190784  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4683612 - 4683392
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagat-aactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  4683612 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcacatctccatgggaactttattccc-ccctttt 4683514  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
      | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||         |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4683513 ttttgggaaattttttctattcctaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaatttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 4683414  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataa 221  Q
    | |  | ||||||||| |||||    
T  4683413 ttctgggaatcaacaattataa 4683392  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 32202552 - 32202413
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32202552 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 32202453  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacc 139  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32202452 ccttgggaaattttttctattcccataaacattttatacc 32202413  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37436858 - 37436638
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  37436858 ctttataatattcttaggaaccataaaaataaggattataatagataactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattctcacccttttc 37436759  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     | ||||||  |||||||||| ||  ||||||||||| |||  |         ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  37436758 tttgggaaa-attttctattctcagtaacattttatatccgaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatatacattcctatcattttatt 37436660  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataac 222  Q
    | |   ||||||||||||||||    
T  37436659 ctcgtgaatcaacaaatataac 37436638  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 6911318 - 6911550
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  6911318 ctttttaatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattcccaccatttt 6911417  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaa--------cattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctat 191  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  6911418 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcttat 6911517  T
Q  192 cattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  6911518 cattttattcccgagaatcaacaattataactt 6911550  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 30240844 - 30241066
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||  ||| | ||||||  ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  30240844 ctttataatattcctaagaaccataaaagtagggattataataggtaattacatataaatttattctcatcttcatgagaactttattctcactcttttc 30240943  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     | ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| || ||||         | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  30240944 tttgggaatttttttctattcccaataactttttattcc-gggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatatatttctatcattttatt 30241042  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
     ||| |||||||||||||||||||    
T  30241043 accaaaaatcaacaaatataactt 30241066  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 52699702 - 52699481
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcct 102  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||  || || | |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  52699702 ttataatattcctgggaaccatgaaaataggaattataataggaaattactcatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttctt 52699603  T
Q  103 agggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcc 202  Q
     ||||||  | ||||||||||| |||| ||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||    
T  52699602 tgggaaaaatgttctattcccaggaacgttttatacccgggaataaaattcagtaaacttgtaacaaacataggcatgtgtattcctatcattttattcc 52699503  T
Q  203 cagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||| |||| || ||||||||||    
T  52699502 caggaatctacgaatataactt 52699481  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5806515 - 5806306
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagat-aactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||           ||    
T  5806515 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatttccatctccatgggaacttta-----------tt 5806427  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5806426 ccttggaaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaa----aggcatatacatttctatcattttat 5806331  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  5806330 tcccgggaatcaacaattataactt 5806306  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 49823134 - 49822932
Alignment:
Q  2 tttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataact-atttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  49823134 tttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattatcatctccatgggaactttattcccacccttttc 49823035  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || |||||||||||||||||| | |||| ||||                    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49823034 cttgggaaattttttctattctc-agaaaattt--------------------agtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttatt 49822956  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||   ||||||||| ||||||||    
T  49822955 cccgagaatcaacaattataactt 49822932  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 29091505 - 29091723
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | | | ||||||     |||||||  ||||||||||||||| ||||     
T  29091505 ctttataatattactaggaaccataaaaatagggtttataataggtaactatgtgtaaatttatt-----ctccatgggaactttattcccacctttttt 29091599  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     | ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||         |||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||    
T  29091600 tttgggaaattttttctattccgatgaacattttttactcgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatatatttttatcattttatt 29091699  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
      ||| ||||||||||||||||||    
T  29091700 atcaggaatcaacaaatataactt 29091723  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 198
Target Start/End: Original strand, 46960519 - 46960658
Alignment:
Q  58 attttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagta 157  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||    
T  46960519 attttatttc-atcttcatgggaactttattcccacccttttcattgggaaaacttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagta 46960617  T
Q  158 aacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcatttta 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||    
T  46960618 aacttgtaacaaacataggcatatgcatttttatgatttta 46960658  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 221
Target Start/End: Original strand, 13521233 - 13521374
Alignment:
Q  79 aaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggca 178  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||         ||||||||||||||||||| || ||    
T  13521233 aaactttatttccacccttttctttgggaaattttttctattcccaagaacattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacagaca 13521332  T
Q  179 tatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataa 221  Q
    | || | |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  13521333 tgtatatttctatcattgta-tcccaaaaatctacaaatataa 13521374  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11014626 - 11014456
Alignment:
Q  54 tatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnn 153  Q
    ||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |  | || |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||             
T  11014626 tatgaatttattctcatcttcatgagaactttatttccacccttttcttttgaaatttttttctattcccagaaacattttatatccgtgaatataattt 11014527  T
Q  154 agtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  11014526 attaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttattcccaggaatctacatatataactt 11014456  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19083265 - 19083123
Alignment:
Q  79 aaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggca 178  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||         ||||||||| |||||||||||| ||    
T  19083265 aaactttatttccacccttttctttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttataacaaacatagaca 19083166  T
Q  179 tatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataa 221  Q
    | || | |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  19083165 tgtatatttctatcattgtattcccaaaaatctacgaatataa 19083123  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19131153 - 19131011
Alignment:
Q  79 aaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggca 178  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||         ||||||||| |||||||||||| ||    
T  19131153 aaactttatttccacccttttctttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttataacaaacatagaca 19131054  T
Q  179 tatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataa 221  Q
    | || | |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  19131053 tgtatatttctatcattgtattcccaaaaatctacgaatataa 19131011  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 1007663 - 1007804
Alignment:
Q  83 tttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatata 182  Q
    ||||||| ||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1007663 tttattctcaccctttttcttggtaaaatttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacctagacatata 1007762  T
Q  183 cacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
     | |  ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  1007763 tattcatatcattttattctcgggaatcaacaaatataactt 1007804  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 1007604 - 1007668
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatt 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  1007604 ctttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataataggtaactatttatgaatttatt 1007668  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 48462364 - 48462463
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||||  |||||||| |||| |||||||    
T  48462364 ctttataatatttgtaggaaccataaaaataaggattataataggtaactatttatgaatttattcccaattccatgggaactttatacccatccttttc 48462463  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17475480 - 17475360
Alignment:
Q  80 aactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcat 179  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||  |||    
T  17475480 aactttattcccactcttttctttgggaaattttatttattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataacaaacataaacat 17475381  T
Q  180 atacacttctatcattttatt 200  Q
    ||| | ||||||| |||||||    
T  17475380 atatatttctatcgttttatt 17475360  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20505074 - 20505007
Alignment:
Q  154 agtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataa 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20505074 agtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttattctcagaaatctacaaatataa 20505007  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13932039 - 13931899
Alignment:
Q  83 tttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatata 182  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||||||     
T  13932039 tttattcccacccttttctttaggaaaacatttctattcc-aggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatg 13931941  T
Q  183 cacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
     | || ||| |||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  13931940 tatttttatgattttattcctaggaatctacaaatataactt 13931899  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 52186131 - 52186061
Alignment:
Q  154 agtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  52186131 agtaaacttgtaacaaatatagacatatatatttctatcattttattataagaaatcaacaaatataactt 52186061  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 47031692 - 47031757
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagat-aactatttatgattttatt 65  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||    
T  47031692 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatt 47031757  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 47677477 - 47677618
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||| ||   || |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||||| |    
T  47677477 ctttgtaatattctaaggaaccttaaaaatagggattataatatgtaattacacataattttattcccatcttcatgggaactttattcccatcctttcc 47677576  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgg 142  Q
     | ||||||  ||||||||||    |||||||||||||||||    
T  47677577 tttgggaaaacttttctattcaatggaacattttatacccgg 47677618  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1228116 - 1227978
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||| ||| | |  || ||||||||   |||| ||||  ||||||||||||  |||||||    
T  1228116 ctttataatatttcaaggaaccttaaaaatagggattataataggtaattctacataattttattctaatcttcatgggaactttattcccgaccttttc 1228017  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacc 139  Q
     |  |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  1228016 tttcggaaatcttttctattccaagaaacattttatacc 1227978  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31806913 - 31806771
Alignment:
Q  80 aactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcat 179  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||   || ||         |||||||  |||||||||||| ||||    
T  31806913 aactttatttccacccttttatttgggaatttttttctattcccaggaacgttttatgttcgagaataaaatttagtaaac--gtaacaaacataagcat 31806816  T
Q  180 atacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
     || | |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  31806815 gtatatttctatcattttattctcaggaatctacaaatataactt 31806771  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38519297 - 38519077
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattccc-acccttttc 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||  |||  |||| ||| || | |  | ||||  |||||||||||| | |||||||    
T  38519297 ttataatattcttggaaaccataaaaatagggattataataggtaatttatacatgaattt-ttcctaatttcatgggaactttattcccaaaccttttc 38519199  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||| |||| |  | ||||||   ||||||    
T  38519198 tttgggaaaatttttc--ttcccaaaaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatctgtatttctattgatttatt 38519101  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
     ||| ||||| |||||||||||||    
T  38519100 tccaaaaatctacaaatataactt 38519077  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 52186262 - 52186170
Alignment:
Q  6 taatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttt 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||  | ||||||  |||||| |||  ||||| |||||||||||||    
T  52186262 taatattcttagaaaccataaaaatagaaattataataggtaactatgtagaaatttattcacatctcaatgtgaacttaattcccacccttt 52186170  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 136
Target Start/End: Original strand, 29769399 - 29769481
Alignment:
Q  55 atgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccc-ttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttat 136  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||| || ||||||| ||| |||||||||||    
T  29769399 atgaatttattttcatcttcatggaaactttattcccaccctttttctttaggaaaattgttctattgccaggaacattttat 29769481  T

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Target: chr8 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18726859 - 18726634
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18726859 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatttccatctccatgagaactttattcccaccctttt 18726760  T
Q  100 cctagggaaatt-ttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcatttta 198  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18726759 ccttgggaaatttttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatttta 18726660  T
Q  199 ttcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  18726659 ttcccgggaatcaacaattataactt 18726634  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35818663 - 35818439
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35818663 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 35818564  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  35818563 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 35818464  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  35818463 tcccgggaatcaacaattataactt 35818439  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37392785 - 37392561
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37392785 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 37392686  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  37392685 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 37392586  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  37392585 tcccgggaatcaacaattataactt 37392561  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 38363913 - 38364137
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38363913 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 38364012  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  38364013 tcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 38364112  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  38364113 tcccgggaatcaacaattataactt 38364137  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 42755699 - 42755923
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42755699 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattcccaccctttt 42755798  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||         |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42755799 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacaaaggaataaattttagtaaacttgtaactaacataggcatatacatttctatcattttat 42755898  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    
T  42755899 tcccaggaatcaacaattataactt 42755923  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32661173 - 32660948
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32661173 ctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 32661074  T
Q  100 -cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcatttta 198  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32661073 cccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatttta 32660974  T
Q  199 ttcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32660973 ttcccaggaatcaacaattataactt 32660948  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 12710477 - 12710701
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12710477 ctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttt 12710576  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12710577 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 12710676  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  12710677 tcccgggaatcaacaattataactt 12710701  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 7931071 - 7931295
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7931071 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 7931170  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||         ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  7931171 ccttgggaaattttttctattctcaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttataacaaacatatacatatacatttctatcattttat 7931270  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    
T  7931271 tcccaggaatcaacaattataactt 7931295  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1554592 - 1554369
Alignment:
Q  2 tttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataact-atttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1554592 tttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaaattatgtatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccacccttttc 1554493  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  1554492 cttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttatt 1554393  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||    
T  1554392 cccgggaatcaacaattataactt 1554369  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26602176 - 26601956
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26602176 ctttataatattccttggaaccataaaaatagggattataatagctaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttt 26602077  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26602076 ccttgggaaattttttctattcccaagaacattttata-ccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 26601978  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataa 221  Q
    |||| | ||||||||| |||||    
T  26601977 tcccgggaatcaacaattataa 26601956  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38132977 - 38132752
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38132977 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcacatctccatgagaactttattcccaccctttt 38132878  T
Q  100 cctagggaaatt-ttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcatttta 198  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38132877 ccttgggaaatttttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcatttta 38132778  T
Q  199 ttcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||   ||||||||| ||||||||    
T  38132777 ttcccgagaatcaacaattataactt 38132752  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 3049841 - 3050065
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3049841 ctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttt 3049940  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    | | || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3049941 ctttggaaatttttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 3050040  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  3050041 tcccgggaatcaacaattataactt 3050065  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16313746 - 16313522
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatag-ataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  16313746 ctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccatttt 16313647  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  16313646 tcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcctatcattttat 16313547  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  16313546 tcccggaaatcaacaattataactt 16313522  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 18297944 - 18298168
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18297944 ctttataatatttctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttattcccaccctttt 18298043  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  18298044 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcctatcattttat 18298143  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||   |||||| || ||||||||    
T  18298144 tcccgagaatcaaaaattataactt 18298168  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 26061976 - 26062200
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataact-atttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26061976 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 26062075  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26062076 tcttgggaatttttttctattcccagggacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggaatatacatttctatcattttat 26062175  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||   ||||||||| ||||||||    
T  26062176 tcccgagaatcaacaattataactt 26062200  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 25837743 - 25837967
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  25837743 ctttataatattcctatgaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattgccaccctttt 25837842  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
      | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  25837843 ttttgggaaaatttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattttgtaaacttgtaacaaacataggcatgtacattcctatcattttat 25837942  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  25837943 tcccgggaatcaacaattataactt 25837967  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41228952 - 41228729
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  41228952 ctttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatt-ctatctccataggaactttattcccaccctttt 41228854  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||    
T  41228853 cctcgggaaattttttctattccaaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtaggcatatacattcctaccattttat 41228754  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||    
T  41228753 tcccgggaattaacaattataactt 41228729  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10896455 - 10896232
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagat-aactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10896455 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 10896356  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     ||  |    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10896355 tct-tgatttttttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaatttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 10896257  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||  | ||||||||| ||||||||    
T  10896256 tcctgggaatcaacaattataactt 10896232  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21137370 - 21137147
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||  |||||||| || ||||||||| ||||| |||||    
T  21137370 ctttataatattcctaggaaccataaaaatacggattataataggtaactacatatgaatttattctcatctccacgagaactttatttccaccattttc 21137271  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     | || ||| | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21137270 tttggaaaaatatttatattcccacaaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttctattattttatt 21137171  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | ||| ||||||||||||||||||    
T  21137170 ctcaggaatcaacaaatataactt 21137147  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5020730 - 5020505
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  5020730 ctttataatattctg-ggaatcataaaaatatggattataataggtaactacttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccacccttttc 5020632  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatataca---cttctatcatttt 197  Q
    || |||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||         ||||||||||||| ||||||| ||||||| |   || ||||||||||    
T  5020631 cttgggaaaatttttctattcacagaaacattttatacccgagagtaaactttagtaaacttgtaagaaacatatgcatatatattcctcctatcatttt 5020532  T
Q  198 attcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||    
T  5020531 attcccatgaatcaacaaatataactt 5020505  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29421727 - 29421507
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||| | ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  29421727 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaactacatataaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccattttc 29421628  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     | |||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| ||         | |||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||    
T  29421627 tttgggaaaatttttctattcccagaaatattttatacccgagaataaaatttaataaacttgtaacaaacataaacatatatatttctatcattttatt 29421528  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataa 221  Q
    | ||  |||||||||||||||    
T  29421527 ctcatgaatcaacaaatataa 29421507  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19160977 - 19160778
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcct 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| || |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  19160977 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaattacatatgaattcattctcatctccatgacaactttattcccacccttttctt 19160878  T
Q  103 agggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcc 202  Q
     || |  |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||| ||||||||||    
T  19160877 tggaattttttttatattcccaagaatattttatacacgggaatgaaatttagtaaacttgtaacaaacatctgcatatatatttatattattttattcc 19160778  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 35394223 - 35394446
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||| || |||||||| |   ||||||||||||||| ||||     
T  35394223 ctttataatattcctatgaaccataaaaataaggattataataggtaactatatatgagtttgttcccatctccttaggaactttattcccaccattttt 35394322  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || || || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||    
T  35394323 cttggaaatttttttctattacgtagaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatatatttctttcattttatt 35394422  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | |   |||||| |||||||||||    
T  35394423 ctcgtgaatcaataaatataactt 35394446  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 7317209 - 7317429
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||     
T  7317209 ctttataatattcctag-aaccatgaaaatagggattataataggtaactatttacgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttt 7317307  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || |||||| |||||||| ||| | ||||| |||||| || |||         ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  7317308 cttgggaaaatttttcta-tcctaggaacactttatatcc-ggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatattcctatcattttatt 7317405  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
         |||||||||||||||||||    
T  7317406 tttgaaaatcaacaaatataactt 7317429  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33444861 - 33444641
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| | |||| ||||||  |||||  |||| || |||| ||||  ||||||||||||||| |||||    
T  33444861 ctttataatattcctagcaatcatacaaatagtgattctaataggtaactacatatgaaattatctc-atcttcatgggaactttattcccaccattttc 33444763  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||| |||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||    
T  33444762 tttgggcaattttttctattcccaagaacattttata-ccgggaataaaatttagt-aacttgtaacaaacatagacatatatatttttatcattttatt 33444665  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | ||| ||||||||||||||||||    
T  33444664 ctcaggaatcaacaaatataactt 33444641  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6805861 - 6805718
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| | |||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6805861 ctttataatattcccaggaaccatgaaaatagagattttaataggtatctatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattctcacccttttc 6805762  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccggga 144  Q
     |  |||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6805761 tttaggaaaaattttctattcccaagaacatattatactcggga 6805718  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Original strand, 41432575 - 41432796
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatt-tccatctccatgaaaactttattcccacccttttcc 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || || | |||| |||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  41432575 ttataatattcttgggagccataaaaataggaattataataggaaattactcatgaatttattctcaatctccatgggaactttatttccaccctttttc 41432674  T
Q  102 tagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattc 201  Q
    ||||||||  |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||         |||||||||||||||||||||  ||| |  | | ||||||||||||||    
T  41432675 tagggaaaaattttctattcccataaacgttttata-ccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatgtgtattcctatcattttattc 41432773  T
Q  202 ccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| |||| || ||||||||||    
T  41432774 ccaggaatccacgaatataactt 41432796  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31117762 - 31117632
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||      ||| |||||  ||||||||||||||||||||     
T  31117762 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagatattataataggtaactatttatgaattt------atccccatgggaactttattcccacccttttt 31117669  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttata 137  Q
    || || || ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31117668 cttggaaatttttttctattctgaagaacattttata 31117632  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16219178 - 16218961
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcct 102  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||    ||  |||||| |||||| ||||  ||  ||||||||||| ||||| |    
T  16219178 ttataatattcttgggaaccatgaaaatggggattataataggtaattacacgtggatttattcccatcttcatgggaagattattcccacc-ttttctt 16219080  T
Q  103 agggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcc 202  Q
     ||| || |||| |||||||  ||||| ||||| |||| |||         ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  16219079 tggggaaattttactattcctgagaacgttttaaaccccggaataaaatctagtaaacttgtaacaaacataggcatacatatttctatcgttttattcc 16218980  T
Q  203 cagaaatcaacaaatataa 221  Q
    |||||| | || |||||||    
T  16218979 cagaaaactacgaatataa 16218961  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 15226813 - 15227020
Alignment:
Q  16 aggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaatttttt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |    || ||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||    
T  15226813 aggaaccttaaaaatagggattataataggtaattccacataattttattctcatcttcatgggaactttattcccacccttttctttggg-aatctttt 15226911  T
Q  116 ctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaa 215  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||  |||||  | || ||| |||||||||  || |||| || |    
T  15226912 ctattcgcaggaatattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatatgtatttatatgattttattcagaggaatctacga 15227011  T
Q  216 atataactt 224  Q
    |||||||||    
T  15227012 atataactt 15227020  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 40197292 - 40197227
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagat-aactatttatgattttatt 65  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||    
T  40197292 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatt 40197227  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40197161 - 40197091
Alignment:
Q  154 agtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  40197161 agtaaacttataacaaacataaacatatacatttctatcattttatttccgggaatcaacaattataactt 40197091  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 43872189 - 43872061
Alignment:
Q  16 aggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaatttttt 115  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||| ||| |||   |||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||  |||| | |  ||| | |||    
T  43872189 aggaacctcaaaaatagggattataataggtaattatacgtgattttattcccatctccatatgaactttattcctaccaatttctttgaaaaaatattt 43872090  T
Q  116 ctattcccaagaacattttatacccggga 144  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43872089 atattcccaggaacattttatacccggga 43872061  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Original strand, 25899620 - 25899685
Alignment:
Q  156 taaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataa 221  Q
    |||||||| ||||||||||| || || || || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25899620 taaacttgcaacaaacatagacacatgcatttttatgattttattcccaggaatctacaaatataa 25899685  T

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Target: chr7 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 11329825 - 11330049
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11329825 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 11329924  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11329925 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 11330024  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  11330025 tcccgggaatcaacaattataactt 11330049  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35488428 - 35488204
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  35488428 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattcccaccctttt 35488329  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  35488328 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 35488229  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  35488228 tcccggaaatcaacaattataactt 35488204  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 40212721 - 40212945
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40212721 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagataaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccctttt 40212820  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  40212821 tcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccccggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 40212920  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||   ||||||||| ||||||||    
T  40212921 tcccgcgaatcaacaattataactt 40212945  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34930706 - 34930480
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34930706 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagataaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 34930607  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaac-aaacataggcatatacacttctatcatttta 198  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34930606 tcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaaacataggcatatacatttctatcatttta 34930507  T
Q  199 ttcccagaaatcaacaaatataacttt 225  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  34930506 ttcccaggaatcaacaattataacttt 34930480  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8419828 - 8419604
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8419828 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 8419729  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  8419728 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 8419629  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  8419628 tcccgggaatcaacaattataactt 8419604  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16825593 - 16825369
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16825593 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 16825494  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16825493 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 16825394  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||| || ||| ||||| ||||||||    
T  16825393 tcctaggaattaacaattataactt 16825369  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 39554015 - 39554239
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39554015 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 39554114  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39554115 ccttgggaaattttttctattctcaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 39554214  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  39554215 tcccgggaatcaacaattataactt 39554239  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 45045458 - 45045682
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45045458 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 45045557  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |         | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45045558 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 45045657  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  45045658 tcccgggaatcaacaattataactt 45045682  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9947229 - 9947003
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| |||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9947229 ctttataatattcataggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttaatctcatctccatgggaactttattcccaccctttt 9947130  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9947129 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 9947030  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataacttta 226  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||    
T  9947029 tcccgggaatcaaaaattataacttta 9947003  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27214094 - 27213870
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  27214094 ctttataatattcctaggaaccataaaaacagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattcccaccctttt 27213995  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27213994 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 27213895  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  27213894 tcccgggaatcaacaattataactt 27213870  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27419463 - 27419239
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27419463 ctttataatattcctagggaccataaaaatagagattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 27419364  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27419363 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 27419264  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||| ||| ||||||||    
T  27419263 tcccgggaatcagcaattataactt 27419239  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 43949077 - 43949301
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  43949077 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttt 43949176  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43949177 ccttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 43949276  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  43949277 tcccgggaatcaacaattataactt 43949301  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 48341195 - 48341418
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  48341195 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttt 48341294  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||         | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48341295 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttata-ccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 48341393  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  48341394 tcccgggaatcaacaattataactt 48341418  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9814453 - 9814233
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Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
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T  9814453 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataatagataaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccctttt 9814354  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    |||||||| | ||||||||||||    
T  9814353 tcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaaca----catatacattcctatcattttat 9814258  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  9814257 tcccgggaatcaacaattataactt 9814233  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 25097901 - 25098125
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25097901 ctttataatattcctaggaaccataaatatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 25098000  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  25098001 ccttaggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatgggcatatacattcctatcattttat 25098100  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||    
T  25098101 tcccgaaaatcaaaaattataactt 25098125  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25924876 - 25924652
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  25924876 ctttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctctatgggaactttattcccaccctttt 25924777  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25924776 cctggggaaattttttctattcccaggaacattttatacaaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 25924677  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  25924676 tcccgggaatcaacaattataactt 25924652  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 27248125 - 27248349
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27248125 ctttataatattcctatgaactataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 27248224  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  27248225 ccttgggaaattttttctattcccagtaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 27248324  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  27248325 tcccgggaatcaacaattataactt 27248349  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 44565877 - 44566101
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44565877 ctttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttt 44565976  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  44565977 ccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttat 44566076  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | || ||||||||||| ||||||||    
T  44566077 ttccggaaatcaacaattataactt 44566101  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45265287 - 45265063
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45265287 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttt 45265188  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |         ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  45265187 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttataacaaacataggcatatacattccaatcattttat 45265088  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||   ||||||||| ||||||||    
T  45265087 tcccgagaatcaacaattataactt 45265063  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38396605 - 38396381
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatag-ataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  38396605 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccgtgggaactttattcccaccatttt 38396506  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  38396505 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataccaaacatagacatatacattcctatcattttat 38396406  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  38396405 tcccgggaatcaacaattataactt 38396381  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41632603 - 41632379
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41632603 ctttataatattcctatgaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttt 41632504  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41632503 tcttgggaaattttttctattcctaagaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaataaacataggcatatacatttctatcattttat 41632404  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||    
T  41632403 tctcaggaatcaacaattataactt 41632379  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 48313954 - 48314178
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatag-ataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  48313954 ctttataatattccaaggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttt 48314053  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48314054 ccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttctaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 48314153  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  48314154 tcccgggaatcaacaattataactt 48314178  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 45448774 - 45448998
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  45448774 ctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataatagataaactatttatgaatttattcccctctctatgggaactttattcccaccctttt 45448873  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||    
T  45448874 tcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatctacattcctatcattttat 45448973  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||   |||||| || ||||||||    
T  45448974 tcccgagaatcaaaaattataactt 45448998  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 33378666 - 33378898
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  33378666 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttt 33378765  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaa--------cattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctat 191  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  33378766 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctat 33378865  T
Q  192 cattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  33378866 cattttattcccgggaatcaacaattataactt 33378898  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 38544026 - 38544250
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  38544026 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccatttt 38544125  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||         ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  38544126 tcttgagaaattttttctattcccagaaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacctgtaataaacataggcatatacattcctatcattttat 38544225  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | || | ||||||||| ||||||||    
T  38544226 ttccgggaatcaacaattataactt 38544250  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 224
Target Start/End: Original strand, 18824007 - 18824202
Alignment:
Q  29 atagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaa 128  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  18824007 atagggattataataggtaattatttatgaatttattcccatctccatggaa-ctttattcccacctttttccttgggaaaatttttctattcccaaaaa 18824105  T
Q  129 cattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatataca-cttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18824106 cattttatacccgggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatatattttctatcattttattcccaaaaatcaacaaatacaactt 18824202  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28904425 - 28904201
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28904425 ctttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 28904326  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     ||    || |||||||||||||||  |||||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28904325 tcttataaatttttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcattttat 28904226  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    || | | ||||||||| ||||||||    
T  28904225 tctcgggaatcaacaattataactt 28904201  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37534341 - 37534120
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37534341 ctttataatattcttaggaactataataatagggattataataagtaactatttatgaatttattcacatctccatgggaactttattcccacccttttc 37534242  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||| |||| ||   || ||| ||||||||    
T  37534241 cttgggaaattttttctattcccataaatattttatacccggaaataaaagttagtaaacttgtaacaaacatatgcatgtatgtttttatgattttatt 37534142  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataac 222  Q
     |||| |||| |||| ||||||    
T  37534141 tccaggaatctacaattataac 37534120  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 44820086 - 44820310
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44820086 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggactataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 44820185  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  |||         | ||||| ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||    
T  44820186 ccttgggaaattttttctgttccgaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacatgtaacaaacacatacaaatacatttctatcattttat 44820285  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||   |||||||||| ||||||||    
T  44820286 tcctgaaaatcaacaattataactt 44820310  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41684259 - 41684037
Alignment:
Q  2 tttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcc 101  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  41684259 tttataatatttataggaaccataaaaatagagattataataggtaactacatataaatttattttcatctccatgagaactttattcccactcttttct 41684160  T
Q  102 tagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattc 201  Q
    | ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |         |||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||    
T  41684159 ttgggcaaaattttctattcccaagaacatcttatatccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatatatatttctatcatattattc 41684060  T
Q  202 ccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  41684059 tcaggaatcaacaaatataactt 41684037  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25045838 - 25045633
Alignment:
Q  18 gaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttct 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||  ||| ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||    
T  25045838 gaaccatgaaaatatggattataatatgtaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttacgaaaatttttct 25045739  T
Q  118 attcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaat 217  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  25045738 attcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatatatattcctatctttttatccccag-aatcaacaaat 25045640  T
Q  218 ataactt 224  Q
    |||||||    
T  25045639 ataactt 25045633  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 45722982 - 45723163
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || | ||||  ||||||||||||||| ||||     
T  45722982 ctttataatattcctagaaatcataaaaatatggattataataggtaactatttatgaatttatttctattttcatgggaactttattcccaccattttt 45723081  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatata 182  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45723082 cttgggaaaatttttctattcccaagaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtgacaaacataggcatata 45723163  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30686230 - 30686007
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||||| |   ||||||||||||||| |||||    
T  30686230 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagcgattataataagtaactatttatgaatttattcccatctccctaggaactttattcccacctttttc 30686131  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || || |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| |||| ||   || ||| ||||||||    
T  30686130 cttggaattttttttctattcccatgaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatgtatgtttttatgattttatt 30686031  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    || |  |||| |||| ||||||||    
T  30686030 ccaacgaatctacaattataactt 30686007  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6656457 - 6656239
Alignment:
Q  5 ataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctag 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | |    
T  6656457 ataatattcttaggaaccaaaaaaatacagattataataggtaactatttatgattttattcccatctccatggaaactttatttccaccctttttattg 6656358  T
Q  105 ggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattccca 204  Q
    |||||  ||||||||| |||  || ||||||||| | | |         ||||||||| ||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||| |||    
T  6656357 ggaaaacttttctatttccagaaatattttatactc-gaaaataaatttagtaaacttataacaaacataggtatatatattcatatcattttatttcca 6656259  T
Q  205 gaaatcaacaaatataactt 224  Q
     |||||||||||||||||||    
T  6656258 aaaatcaacaaatataactt 6656239  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 11000552 - 11000759
Alignment:
Q  18 gaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttct 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   |||   ||||| ||||||  ||| | ||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  11000552 gaaccataaaaatagggattataataggcgacttcatatgaatttattctcatatgcatgggaactttattcccacccttttctttgggaaaatttttct 11000651  T
Q  118 attcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggc-atatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaa 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  11000652 attcccaagaatattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggctatatatatttatatcattttatttccaggaatcaacata 11000751  T
Q  217 tataactt 224  Q
    ||||||||    
T  11000752 tataactt 11000759  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6656709 - 6656488
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||   |||||    
T  6656709 ctttataatatttctaagaaccaaaaaaatatagattataataggtaactatttatgactttattcccatctccatgggaactttattcccatatttttc 6656610  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     | ||||||  |||||||||||||  |||||||||||| | | |         ||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||    
T  6656609 attgggaaaacttttctattcccagaaacattttatactc-gaaaataaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatattcatatca-tttatt 6656512  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
     ||| |||||||||||||||||||    
T  6656511 tccaaaaatcaacaaatataactt 6656488  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 48160812 - 48160689
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagat-aactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  48160812 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttt 48160713  T
Q  100 cctagggaaattttttctattccca 124  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||    
T  48160712 cct-tggaaattttttctcttccca 48160689  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 43569923 - 43569780
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||  || |||||||||||||||||     
T  43569923 ctttataatatttttagaaatcataaaaatagggattataatagataattatttatgaatttatttacatcctcatgtgaattttattcccacccttttt 43569824  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccggga 144  Q
    ||  || || ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||    
T  43569823 cttaggtaaatttttatatttcgaagaatattttatacccggga 43569780  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Original strand, 45440742 - 45440918
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcct 102  Q
    |||||||||||  || |||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||  |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  45440742 ttataatattccaagtaaccttaaaactagggattataataggtaattatacatgatttttttcccatctccatgagaactttattcccactactttctt 45440841  T
Q  103 agggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcat 179  Q
     |||||| ||||| |||||| | ||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45440842 tgggaaaatttttatattccgaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcat 45440918  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 31921963 - 31921828
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| ||||   ||||| ||||| ||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  31921963 ctttataatatttctaggaaccataaaaatagacattataatagg--actatatatgaatttattctcatctctatgggaactttattcccacccttttc 31921866  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatac 138  Q
     | || || |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31921865 tttggaaatttttttctattcccacaaacattttatac 31921828  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48160676 - 48160606
Alignment:
Q  154 agtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  48160676 agtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataactt 48160606  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22156401 - 22156274
Alignment:
Q  18 gaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaatt-ttttc 116  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||  |||||  |||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||    
T  22156401 gaaccataaaaatatggattataatatgtaattacatatgaacttattctcatctctatgagaactttattcctacccttttctttgggaaatttttttc 22156302  T
Q  117 tattcccaagaacattttatacccggga 144  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  22156301 tattcccaggaacgttttatacgcggga 22156274  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22212316 - 22212189
Alignment:
Q  18 gaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaatt-ttttc 116  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||  |||||  |||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||    
T  22212316 gaaccataaaaatatggattataatatgtaattacatatgaacttattctcatctctatgagaactttattcctacccttttctttgggaaatttttttc 22212217  T
Q  117 tattcccaagaacattttatacccggga 144  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  22212216 tattcccaggaacgttttatacgcggga 22212189  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43446064 - 43445898
Alignment:
Q  58 attttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagta 157  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||  |||| ||||| || ||||||||||||  || ||         ||||    
T  43446064 attttattctcatctccatgagaactttattcccaccattttctttgggaaaacttttttattctcatgaacattttatattcgagaataaaatttagta 43445965  T
Q  158 aacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| ||  |||| | |||||||||||    
T  43445964 aacttataacaaatataggcatatacatttttataattttattcgcaagaatctataaatataactt 43445898  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40385864 - 40385729
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttt-tcc 101  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||   |||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||| |      
T  40385864 ttataatattcctaagaaccataaaaatatggattataataggtagttacacatgagtttatttccatcttaatgggaactttattcccaccatttcttt 40385765  T
Q  102 tagggaaattttttctattcccaagaacattttata 137  Q
    | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40385764 ttgggatattttttctattcccagaaacattttata 40385729  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10902735 - 10902689
Alignment:
Q  154 agtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||    
T  10902735 agtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttatt 10902689  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 224
Target Start/End: Original strand, 45723211 - 45723263
Alignment:
Q  172 ataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  45723211 ataggcatatatattcctatcattttattctcgggaatcaacaaatataactt 45723263  T

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Target: chr4 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6280160 - 6279936
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6280160 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccctttt 6280061  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  6280060 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcatatcattttat 6279961  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  6279960 tcccgggaatcaacaattataactt 6279936  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13230228 - 13230004
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13230228 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 13230129  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13230128 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 13230029  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||| || || ||||||||    
T  13230028 tcccgggaataaaaaattataactt 13230004  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 25932277 - 25932501
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25932277 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 25932376  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25932377 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 25932476  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||    
T  25932477 tcctaggaatcaacaattataactt 25932501  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 42773784 - 42774008
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42773784 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 42773883  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  42773884 ccttgggaaattttttttatccccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 42773983  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  42773984 tcccagaaatcaacaattataactt 42774008  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 48879161 - 48879385
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  48879161 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 48879260  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48879261 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 48879360  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  48879361 tcccgggaatcaacaattataactt 48879385  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27763138 - 27762914
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27763138 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 27763039  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  27763038 ccttgggaaatattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 27762939  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  27762938 tcccgggaatcaacaattataactt 27762914  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 35999522 - 35999746
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35999522 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 35999621  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35999622 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 35999721  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||   ||||||||| ||||||||    
T  35999722 tcccgagaatcaacaattataactt 35999746  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 45596104 - 45596328
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45596104 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactttattcccaccctttt 45596203  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45596204 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 45596303  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||    
T  45596304 tcccgaaaatcaacaattataactt 45596328  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39730532 - 39730308
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39730532 ctttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgtgaactttattcccaccctttt 39730433  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  39730432 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttat 39730333  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | |||||| || ||||||||    
T  39730332 tcccgggaatcaaaaattataactt 39730308  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 40435736 - 40435960
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  40435736 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattcccaccctttt 40435835  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40435836 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 40435935  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  40435936 tcccgggaatcaacaattataactt 40435960  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41859285 - 41859062
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41859285 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 41859186  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  41859185 ccttgggaaat-ttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 41859087  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  41859086 tcccggaaatcaacaattataactt 41859062  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48519130 - 48518906
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  48519130 ctttataatattcctaggaaccataaaaataggtattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 48519031  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48519030 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 48518931  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | |||||| || ||||||||    
T  48518930 tcccgggaatcaaaaattataactt 48518906  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 47670198 - 47670422
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||    
T  47670198 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatcttcatggaaactttatttccaccatttt 47670297  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47670298 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 47670397  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||    
T  47670398 ttccaggaatcaacaattataactt 47670422  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45748034 - 45747811
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  45748034 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataatggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccccccttttc 45747935  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  45747934 cttgggaaattttttctattcctaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt 45747835  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||    
T  45747834 cccgggaatcaacaattataactt 45747811  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 8322081 - 8322305
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataact-atttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8322081 ctttataatattcataggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttt 8322180  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8322181 ccttggaaatttttttctattcccaagaatattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcattttat 8322280  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    
T  8322281 tcccaggaatcaacaattataactt 8322305  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 43723100 - 43723324
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  43723100 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattctcaccctttt 43723199  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43723200 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 43723299  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |  | | ||||||||| ||||||||    
T  43723300 tttcgggaatcaacaattataactt 43723324  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 55968239 - 55968015
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  55968239 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 55968140  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||| || |||||||| | | ||||||||||    
T  55968139 tcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacagagacatatacattccaatcattttat 55968040  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  55968039 tcccgggaatcaacaattataactt 55968015  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25916272 - 25916050
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  25916272 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttt 25916173  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  25916172 ccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc--atacattcctatcattttat 25916075  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | |||||| || ||||||||    
T  25916074 tcccgggaatcaaaaattataactt 25916050  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41744460 - 41744235
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  41744460 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactaattatgaatttattctcatctccataggaactttattcccaccctttt 41744361  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacc-cgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcatttta 198  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |         ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41744360 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaagaaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcatttta 41744261  T
Q  199 ttcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41744260 ttcccggaaatcaacaattataactt 41744235  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34049836 - 34049612
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatag-ataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  34049836 ctttataatattccaaggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttt 34049737  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  34049736 tcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccctggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttat 34049637  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | || | ||||||||| ||||||||    
T  34049636 ttccgggaatcaacaattataactt 34049612  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 23686624 - 23686847
Alignment:
Q  2 tttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23686624 tttataatattcctaggaaccataaaaatatgaattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttc 23686723  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || |||||||||||||||||||||  || ||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23686724 cttgggaaattttttctattcccagaaatattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttctatcattttatt 23686823  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||    
T  23686824 cccgggaatcaacaattataactt 23686847  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 32953359 - 32953583
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatag-ataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32953359 ctttataatatttcaaggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccatttt 32953458  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||         ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |    
T  32953459 ccttgggaaattttttctattcctaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaagataggcatatacattcctatcattttgt 32953558  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||  | ||||||||| ||||||||    
T  32953559 tcctgggaatcaacaattataactt 32953583  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 50673143 - 50672941
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  50673143 ctttataatattcctaggaaccataaaa-tagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 50673045  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||         |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  50673044 ccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttat 50672945  T
Q  200 tccc 203  Q
    ||||    
T  50672944 tccc 50672941  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18405472 - 18405249
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagat-aactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  18405472 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattctcaccctttt 18405373  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18405372 cct-tggaaattttttttattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctataattttat 18405274  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    || | | ||||||||| ||||||||    
T  18405273 tctcgggaatcaacaattataactt 18405249  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 39498661 - 39498885
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  39498661 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgagaactttatttccaccctttt 39498760  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| || |  ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  39498761 ccttggaattttttttctattcccatgaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacatttctatcattttat 39498860  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | || | ||||||||| ||||||||    
T  39498861 ttccgggaatcaacaattataactt 39498885  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 39502000 - 39502224
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  39502000 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgagaactttatttccaccctttt 39502099  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| || |  ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  39502100 ccttggaattttttttctattcccatgaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacatttctatcattttat 39502199  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | || | ||||||||| ||||||||    
T  39502200 ttccgggaatcaacaattataactt 39502224  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39835546 - 39835322
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39835546 ctttataatattcctagaaatcataaaaataaggattataataggtaaactatttatgaatttattctaatctccatgggaactttattcccaccctttt 39835447  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  39835446 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatatgcatatacatttatatcattttat 39835347  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  39835346 tcccgggaatcaacaattataactt 39835322  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 935962 - 936186
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  935962 ctttataatattcctaggaactataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttattcccaccctttt 936061  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||         ||||||||||||||||||||||| ||||| | | | ||||||||||    
T  936062 tcttgtgaaattttttctattcccaggaacattttatgcccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagggatatatattccaatcattttat 936161  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    || | | ||||||||| ||||||||    
T  936162 tctcgggaatcaacaattataactt 936186  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 18931589 - 18931813
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatag-ataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  18931589 ctttataatattcctatgaactataaaaatagggattataataggaaaattatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttt 18931688  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||         ||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  18931689 tcttggaaatttttttctattcccaggaacattttatacacgggaataaaatttagtaaacttataccaaacatagacatatacattcctatcattttat 18931788  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  18931789 tcccagaaatcaacaattataactt 18931813  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34238193 - 34238009
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34238193 ctttataatattcctaggaacaaaaaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttt 34238094  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatataca 184  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34238093 ccttgggaaattgtttctattcccaagaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca 34238009  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 30415743 - 30415962
Alignment:
Q  5 ataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||||| |||||  ||| ||| |||||||||||| ||||| | |    
T  30415743 ataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaattatttatgaaattattttcatctttatggaaattttattcccaccattttctttg 30415842  T
Q  105 ggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattccca 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||         ||||||||||||||||||| || |||||| | | |||||||||||||  |     
T  30415843 ggaaattttttctattccaaagaacattttatatttgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacagacatatatattcctatcattttattatcg 30415942  T
Q  205 gaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  30415943 ggaatcaacaaatataactt 30415962  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 38414044 - 38414266
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38414044 ctttataatattcttagaaaccataaaaataggaattataataggtaactacatatgaatttattaccatctccatgagaactttattcccacccttttc 38414143  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || |||||||||||| |||||||   ||||||||||| |  |||         ||||||||| | |||||||||| ||| || | |||||||||||||||    
T  38414144 cttgggaaattttttatattcccggaaacattttata-catggaataaaatttagtaaacttattacaaacatagacatgtatatttctatcattttatt 38414242  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataacttta 226  Q
    |||   ||||||||||||||||||||    
T  38414243 ccc--gaatcaacaaatataacttta 38414266  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 48873857 - 48873978
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  48873857 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 48873956  T
Q  100 cctagggaaattttttctattc 121  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  48873957 ccttgggaaattttttctattc 48873978  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 27942573 - 27942803
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataact-atttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | |||||||| ||||||  ||| || |||  ||||||||||||||||||||    
T  27942573 ctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatttcaatgggaactttattcccaccctttt 27942672  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacata------ggcatatacacttctatca 193  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||| ||| |||||||      | |||||||| | ||||||    
T  27942673 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataataaacataaacatagacatatacattcctatca 27942772  T
Q  194 ttttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  27942773 ttttatttccgggaatcaacaattataactt 27942803  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31938108 - 31937971
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccc-tttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  31938108 ctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaactgtttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttt 31938009  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttata 137  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31938008 ccttggaaaattttttttattcccaagaacattttata 31937971  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 115
Target Start/End: Original strand, 27555269 - 27555377
Alignment:
Q  8 atattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataact-atttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctaggg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27555269 atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg 27555368  T
Q  107 aaatttttt 115  Q
    |||||||||    
T  27555369 aaatttttt 27555377  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10400961 - 10400820
Alignment:
Q  83 tttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatata 182  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  ||         ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10400961 tttattcccaccaatttctttgggaaattttttctatttccaggaatattttatacccaagaataaaatttagtaaacttgtaataaacatagacatata 10400862  T
Q  183 cacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10400861 catttctatcattttattcccaaaaatcaacaaatataactt 10400820  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 36858243 - 36858351
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36858243 ctttgtaatattcctaggaaccataaaaataaggattataacaggtaactatatatgaatttattcccatctccatgagaattttattcccacccttttc 36858342  T
Q  101 ctagggaaa 109  Q
     | ||||||    
T  36858343 tttgggaaa 36858351  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 52469535 - 52469734
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||    
T  52469535 ctttataatattcctatgaaccataaatatagagattataataggtaactatattggaatttatttccatctccatgggaactttattcccaccaatttc 52469634  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || || |||   |||||||||| |  ||||||||||  |||| |         | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  52469635 cttggaaaaaaatttctattcctagaaacattttattgccggaaataaaatttaataaacttgtaacaaacatagacatatgcaattctatcattttatt 52469734  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Original strand, 18405592 - 18405728
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcct 102  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||   |||  |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18405592 ttataatatttctaggaaccataaaaatagagattataataggtaattacacatggatttattcccatcttaatgagaactttattcccacccttttctt 18405691  T
Q  103 agggaaattttttctattcccaagaacattttatacc 139  Q
      |||||  ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18405692 taggaaaaattttctattcctaggaacattttatacc 18405728  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 224
Target Start/End: Original strand, 7258854 - 7259022
Alignment:
Q  55 atgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnna 154  Q
    |||| |||||| |||| | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |         |    
T  7258854 atgaatttattcccatattcatgggaactttattcccactcttttcttttggaaattttttctattcccaggaacattttatacgcggaaataaaattta 7258953  T
Q  155 gtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||  || |||| || ||||||||||    
T  7258954 gtaaacttgtaacaaacaaagacatgtata-ttctatcattttattctaaggaatctaccaatataactt 7259022  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 224
Target Start/End: Original strand, 51968673 - 51968837
Alignment:
Q  61 ttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttccta-gggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaa 159  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||| |||| |||||||| |  ||         || |||    
T  51968673 ttatttccatcttcatgggaactttattcccaccctttttctttgggaaacattttctattcccaggaacgttttatactcaagaataaaatttagcaaa 51968772  T
Q  160 cttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  51968773 cttgtaacaaacataggcatgcatatttctatctttttattcccagaaatttacgaatataactt 51968837  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 138
Target Start/End: Original strand, 38394745 - 38394881
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattccca-cccttttcc 101  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||  || || | |||| |||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||     
T  38394745 ttataatatttttgggaaccataaaaataggaattataataggaaattactcatgaatttatttccatctctatcagaactttattcccaccccttttct 38394844  T
Q  102 tagggaaattttttctattcccaagaacattttatac 138  Q
    | ||||| |||||| |||| |||  || |||||||||    
T  38394845 ttgggaatttttttatatttccagaaatattttatac 38394881  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 224
Target Start/End: Original strand, 27555400 - 27555470
Alignment:
Q  154 agtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  27555400 agtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccgagaatcaacaattataactt 27555470  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 137
Target Start/End: Original strand, 48059893 - 48060028
Alignment:
Q  2 tttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcc 101  Q
    |||||||||||  ||||||  ||||||||| | ||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||  || |  |||| ||||||||||||||| ||||      
T  48059893 tttataatatttctaggaattataaaaataagaattataataggtaattatatatgaatttatttatatttttatgagaactttattcccaccattttat 48059992  T
Q  102 tagggaaattttttctattcccaagaacattttata 137  Q
    | |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  48059993 ttgggaaattttttctattcccataaatattttata 48060028  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 140
Target Start/End: Original strand, 30790436 - 30790518
Alignment:
Q  58 attttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttataccc 140  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | || |||  |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  30790436 attttatttccatcttcatggaaactttattcccatccttttcattggaaaaacttttctattctcagaaacattttataccc 30790518  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47426451 - 47426258
Alignment:
Q  30 tagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccc-ttttcctagggaaattttttctattcccaagaa 128  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||| |||| || |  ||  |||||||||| ||| |||    
T  47426451 tagggattataataggtaactatttatgaatttattttcatcttcatgggaactttattgccacccttttttcttgataatatttttctatttccaggaa 47426352  T
Q  129 cattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttc-tatcattttattcccagaaatcaacaaatataa 221  Q
    ||||||||| |  | |         |||||||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||    
T  47426351 cattttatatcaagaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataatattcatatcattttattctcaggaatcgataaatataa 47426258  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 37014569 - 37014485
Alignment:
Q  55 atgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacc 139  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  37014569 atgaatttattctcatcttcatgagaactttatttccactcttttctttgggaaattttttctattcctatgaacatgttatacc 37014485  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 224
Target Start/End: Original strand, 36860108 - 36860177
Alignment:
Q  154 agtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  36860108 agtaaacttgtaacaaacataaacatatatatttatatcattttatt-taagaaatcaacaaatataactt 36860177  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 10401019 - 10400970
Alignment:
Q  2 tttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataacta 51  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  10401019 tttataatattcctcggaaccataaaaataaggattataataggtaacta 10400970  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34237480 - 34237435
Alignment:
Q  179 tatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  34237480 tatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataactt 34237435  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 26165354 - 26165422
Alignment:
Q  154 agtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataac 222  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| | || || ||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  26165354 agtaaacttgtaacaaacataaacatgtgcatttttatgattttattctcaggaatctacaaatataac 26165422  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 36858613 - 36858517
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||  ||| ||  |||||  |||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  36858613 ttataatattcccggaaaccataaaaatagggattataatatgtaattacatatgaaattattctcatcttcatgggaactttattcccaccctttt 36858517  T

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Target: chr2 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 346584 - 346360
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  346584 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 346485  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  346484 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 346385  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  346384 tcccgggaatcaacaattataactt 346360  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 6171623 - 6171847
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  6171623 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttt 6171722  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6171723 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 6171822  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    || | | ||||||||| ||||||||    
T  6171823 tctcgggaatcaacaattataactt 6171847  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9734085 - 9733861
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9734085 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 9733986  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9733985 ccttgggaaattttttttattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 9733886  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  9733885 tcccgggaatcaacaattataactt 9733861  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 11071437 - 11071661
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  11071437 ctttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttt 11071536  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11071537 tcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 11071636  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  11071637 tcccggaaatcaacaattataactt 11071661  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 41750361 - 41750585
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41750361 ctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 41750460  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41750461 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat 41750560  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||    
T  41750561 tcctaggaatcaacaattataactt 41750585  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28311935 - 28311712
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  28311935 ctttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaactatttatgaatttattcccatctccacgggaactttattcccacccttttc 28311836  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  28311835 cttgggaaagattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattcagtaaacttgtaacaaacataggcatatatattcctatcattttatt 28311736  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  28311735 cccgggaatcaacaaatataactt 28311712  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 4559391 - 4559615
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4559391 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 4559490  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  4559491 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 4559590  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||   | ||||||||| ||||||||    
T  4559591 tcttgggaatcaacaattataactt 4559615  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 37192354 - 37192578
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37192354 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccaatctccatggaaactttattcccaccctttt 37192453  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37192454 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcattttat 37192553  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  37192554 tcccgggaatcaacaattataactt 37192578  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5770349 - 5770125
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatag-ataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  5770349 ctttataatattcctagcaaccataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccatttt 5770250  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5770249 tcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 5770150  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    
T  5770149 tcccaggaatcaacaattataactt 5770125  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42674900 - 42674676
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42674900 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactttattcccaccctttt 42674801  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  42674800 tcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatgcccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 42674701  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  42674700 tcccgggaatcaacaattataactt 42674676  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 1988144 - 1988367
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || || ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1988144 ctttataatattccttggaaccaaaaaaatagggattataataggtaactatataagaatttattctcatctccatggaaactttattcccacccttttc 1988243  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |         | |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  1988244 cttgagaaaatttttctattcccaagaacattttatatccggaaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatgtatatttctatcattttatt 1988343  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1988344 cccagaaatcaacaaatataactt 1988367  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 37233262 - 37233485
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37233262 ctttataatattcctaggaaccatgaaaataaggattataataggtaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttc 37233361  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || |||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||    
T  37233362 cttgggaacgattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatgttcctatcattttatt 37233461  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  37233462 cccgggaatcaacaaatataactt 37233485  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 2050698 - 2050922
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatag-ataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2050698 ctttataatattcctaggaatcataaaaataggaattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 2050797  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  2050798 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcctatcattttat 2050897  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    || | | ||||||||| ||||||||    
T  2050898 tctcgggaatcaacaattataactt 2050922  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14777737 - 14777516
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||   || |||||||||||| ||||    
T  14777737 ctttataatattcctaggaactataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaattttattcccaccatttt 14777638  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  14777637 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 14777538  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataa 221  Q
    |||| | ||||||||| |||||    
T  14777537 tcccgggaatcaacaattataa 14777516  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 26310099 - 26310327
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26310099 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 26310198  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaac--ataggcatatacacttctatcatttt 197  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||         | ||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  26310199 ctttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacttctaacaaacatatagacatatacatttctatcatttt 26310298  T
Q  198 attcccagaaatcaacaaatataacttta 226  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  26310299 attcccgggaatcaacaattataacttta 26310327  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 2521507 - 2521731
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  2521507 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaattttattcccaccctttt 2521606  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  2521607 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 2521706  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |  | | ||||||||| ||||||||    
T  2521707 tttcgggaatcaacaattataactt 2521731  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18713895 - 18713672
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||  ||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18713895 ctttataatattcctatgaaccataaaaatagggtttataataggttactacgtataaatttatttccatctccatgggaactttattcccacccttttc 18713796  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  18713795 tttgggaaattttttttattaccaagaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttatatcattttatt 18713696  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
     |||  ||||||||||||||||||    
T  18713695 accatgaatcaacaaatataactt 18713672  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 45409084 - 45409306
Alignment:
Q  2 tttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcc 101  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  45409084 tttataatatttctaggaaccataaaaataaggattataataggtaactatttatgaatttatttccatctccatgggaactttattcccacccttttcc 45409183  T
Q  102 tagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattc 201  Q
    | ||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |         ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  45409184 ttgggtaaatttttctattcccatgaatattttatacccggtaataaaatttagtaaacttgtaaaaaacataggcatatacattcctatcattttatac 45409283  T
Q  202 ccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
       | ||||||||||||||||||    
T  45409284 ttgggaatcaacaaatataactt 45409306  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 638426 - 638649
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagat-aactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  638426 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattccc-ccctttt 638524  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |         ||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  638525 ccttgggaaattttttatattcctaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacctgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttat 638624  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | || ||||||||||| ||||||||    
T  638625 ttccggaaatcaacaattataactt 638649  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41729369 - 41729145
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41729369 ctttataatattcctagtaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattcccaccctttt 41729270  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |         |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  41729269 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatctggcaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatccattcctatcattttat 41729170  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||| || || ||||||||    
T  41729169 tcccgggaataaaaaattataactt 41729145  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 37533791 - 37534008
Alignment:
Q  8 atattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataact-atttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctaggg 106  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||  | |||    
T  37533791 atattcctgggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttttttggg 37533890  T
Q  107 aaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccaga 206  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  37533891 aaattttttctattccaaggaacattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccgga 37533990  T
Q  207 aatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  37533991 aatcaacaattataactt 37534008  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34356938 - 34356715
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatag-ataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| | || ||||||||| |||||| |||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  34356938 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataataggaaaattatttatgaatttattcccat-tccgtgggaactttattcccaccatttt 34356840  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34356839 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataccaaacatagacatatacatttctatcattttat 34356740  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  34356739 tcccgggaatcaacaattataactt 34356715  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 14832643 - 14832866
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||  || ||  ||| | ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14832643 ctttataatattcctatgaaccataaaaataaggattataataggaaattacgtataaatttattctcatctcaatgagaactttattcccacccttttc 14832742  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14832743 tttgggaaaatttttctattcccaagaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttttaacaaacataggcatatatatttctatcattttatt 14832842  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    || || ||||||||||||||||||    
T  14832843 cctaggaatcaacaaatataactt 14832866  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21737647 - 21737415
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  21737647 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttt 21737548  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacatt--------ttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctat 191  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||| |||         |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  21737547 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctat 21737448  T
Q  192 cattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  21737447 cattttattcccgggaatcaacaattataactt 21737415  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27358200 - 27357978
Alignment:
Q  2 tttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcc 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  27358200 tttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaactatttatgaatttattctcatctctatgggaactttattcccacccttttcc 27358101  T
Q  102 tagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattc 201  Q
    | ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |    
T  27358100 ttgggtaaatttttctattcccatgaatattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatccctatcattttatac 27358001  T
Q  202 ccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |  | ||||||||||||||||||    
T  27358000 ctgggaatcaacaaatataactt 27357978  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 17965815 - 17966039
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  17965815 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattcccaccctttt 17965914  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
     |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||    
T  17965915 tcatgggaaattttttctattcctaggaacattttatacccgggaataaaatttggtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttat 17966014  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |  | | ||||||||| ||||||||    
T  17966015 tatcgggaatcaacaattataactt 17966039  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20426721 - 20426501
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  20426721 ctttataatattcctaccaaccataaaaatagagattataataggtaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattctcacccttttc 20426622  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
    || ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||          ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  20426621 cttgggaaaaattttctattcccaggaacattttatatccggggataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataaattcctatcattttatt 20426522  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataa 221  Q
    ||| | |||||||||||||||    
T  20426521 cccgggaatcaacaaatataa 20426501  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40951098 - 40950874
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40951098 ctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttt 40950999  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| || || |||||| |||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  40950998 ccttggaaatttttttgtattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataagcatatatatttctatcattttat 40950899  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||   ||||||||| ||||||||    
T  40950898 tcccgagaatcaacaattataactt 40950874  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39995378 - 39995146
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  39995378 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccatttt 39995279  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacatt--------ttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctat 191  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||        ||||| || |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  39995278 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttatatccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctat 39995179  T
Q  192 cattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  39995178 cattttattcccgggaatcaacaattataactt 39995146  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 13760799 - 13760938
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13760799 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 13760898  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacc 139  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13760899 ccttgggaaattttttctattcccataaacattttatacc 13760938  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Original strand, 45694023 - 45694244
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcct 102  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |  || || | |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45694023 ttataatattcctgggaaccataaaaataggaattataattgcaaattactcatgaatttattttcatctccatgggaactttattcccacccttttcct 45694122  T
Q  103 agggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcc 202  Q
     ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| ||| |  | | |||||||||||||||    
T  45694123 tgggaaaaattttctattcccatgaacgttttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtgtattcctatcattttattcc 45694222  T
Q  203 cagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||| || ||||||||||    
T  45694223 cagaaatctacgaatataactt 45694244  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 3902289 - 3902512
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||| |  ||||||||||||||| |||||    
T  3902289 ctttataatattcacaggaaccataaaaatagggattataataggtaactatatatgaatttattctcatctccaagggaactttattcccaccattttc 3902388  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     | ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||         ||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||    
T  3902389 tttgggaatttttttctattcccaggaacattttaaacctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgtctatatatttctatcattttatt 3902488  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | ||| ||  ||||||||||||||    
T  3902489 ctcaggaaagaacaaatataactt 3902512  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 224
Target Start/End: Original strand, 14253422 - 14253578
Alignment:
Q  68 catctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaac 167  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||         ||||||||||||||    
T  14253422 catcttcatgaaaattttattcacacccttttctttgagaaattttttctattcccataaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaac 14253521  T
Q  168 aaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  14253522 aaacatagacatatatatttctatcattttattcccgagaatcaacaaatataactt 14253578  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 23943995 - 23944132
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataact-atttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||| | |||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23943995 ctttataatattcctaggaaccataaaaataaagattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttt 23944094  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttata 137  Q
    | | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23944095 cgttgagaaattttttctattcccaggaacattttata 23944132  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 226
Target Start/End: Original strand, 6571602 - 6571745
Alignment:
Q  83 tttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatata 182  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | ||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6571602 tttattcctaccctttttcttgggaaattttttatattccccggaacattttatacctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata 6571701  T
Q  183 cacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataacttta 226  Q
     | | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6571702 tattcctatcattttatttccggaaatcaacaaatataacttta 6571745  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11763577 - 11763386
Alignment:
Q  33 ggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacatt 132  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  || |||    
T  11763577 ggattataataggtaactatttatgaatttattctcatcttcatggaaactttattcccacctttttcctttggaaattttttctattcccagaaatatt 11763478  T
Q  133 ttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||  ||| ||         |||||| || |||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||    
T  11763477 ttatgtccgagaataaaatttagtaaatttataacaaacatagacatatatattcctatcatttcattcccgaaaaacaacaaatataactt 11763386  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Original strand, 40569852 - 40570076
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactt---tattcccaccctttt 99  Q
    ||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||| ||||||  |||||   |||||||||| ||||    
T  40569852 ttataatgttccaaggaacctcaaaaatagggattataataggtaattatacatgattttattcccatttccatgggaacttctttattcccaccatttt 40569951  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    | | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||         |  ||||||||||||||||||||||| ||   || ||| |||||||    
T  40569952 ctttgggaaaaattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaacaaacttgtaacaaacataggcatgtatgtttttatgattttat 40570051  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||    
T  40570052 tcccaggaatctacaattataactt 40570076  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41298154 - 41298013
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcct 102  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| |||  |||| | ||||  ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |    
T  41298154 ttataatattccaaggaaccataagaatagagattataataggtaattataaatgaatatattctcatcttcatgagaactttattcacaccctttgctt 41298055  T
Q  103 agggaaattttttctattcccaagaacattttatacccggga 144  Q
     |||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||||    
T  41298054 tgggaaattttttttatttctaaaaacattttatatccggga 41298013  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 140
Target Start/End: Original strand, 25724925 - 25724997
Alignment:
Q  68 catctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttataccc 140  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25724925 catcttcatgagaactttattcccacccttttctttgggaaactttttctattcccagaaacattttataccc 25724997  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 7007417 - 7007531
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||  ||||| ||||||  ||||||||||  || |||||||||||| |||||    
T  7007417 ctttataatattcctaagaaccattaaaatagggagtataataggtaactacatatgaatttattctcatctccatggtaattttattcccaccattttc 7007516  T
Q  101 ctagggaaatttttt 115  Q
     | ||||| ||||||    
T  7007517 tttgggaattttttt 7007531  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Original strand, 13790125 - 13790221
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactattt-atgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  13790125 ttataatattccaaggaaccttaaaaatagggattataataggtaa-tattacatgattttattcccatctccatgggaactttattcccaccgtttt 13790221  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5002919 - 5002852
Alignment:
Q  157 aaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  5002919 aaacttgtaacaaatatatgcatgtatacttctatcattttattcttagaaatctacaaatataactt 5002852  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Original strand, 4875611 - 4875745
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcct 102  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||  ||||| ||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |    
T  4875611 ttataatatgccgaggaaccataaaaatagggattataatatgtaattacatatgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccacccgtttctt 4875710  T
Q  103 agggaaattttttctattcccaagaacattttata 137  Q
     ||||  |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  4875711 tgggattttttttttattctcgagaacgttttata 4875745  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 224
Target Start/End: Original strand, 39819593 - 39819752
Alignment:
Q  68 catctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacatttt---atacccgggannnnnnnnnagtaaacttgt 164  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | || || ||||||| ||||||| ||||||| |   ||||||||||         |||||||||||    
T  39819593 catcttcatgagaactttattcccaccattttctttggaaatttttttcaattcccaggaacattattatatacccgggaatgaaatttagtaaacttgt 39819692  T
Q  165 aacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||||||||||||  | ||  || ||||||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  39819693 aacaaacataggcatatgtattttcatgattttattttcaggaatctacaaatataactt 39819752  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 25454968 - 25455080
Alignment:
Q  112 ttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatca 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||         |||||||||||||||||||||| |||||  | || ||| ||||||||| ||| ||||     
T  25454968 ttttctattcccaggaacattttatactcgagaatgaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatgtatttttatgattttattctcaggaatct 25455067  T
Q  212 acaaatataactt 224  Q
    |||||||||||||    
T  25455068 acaaatataactt 25455080  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 1623216 - 1623435
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| || | ||||||  ||||| ||||||  ||| | |||  ||||||||||||| || | |||    
T  1623216 ctttatattattcgtaggaaccataaaaatagagattataattggtaactacatatgaatttattctcatattcattgaaactttattcccgccatgttc 1623315  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     | || ||| ||| ||| | | || |||||||||||| ||||||         | |||||| ||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||| |    
T  1623316 tttggaaaaatttctctgtactcaggaacattttataaccgggaatcaaatttaataaactcgtaac-aacatagacatatatatttctattattttact 1623414  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataa 221  Q
    |  || |||||||||||||||    
T  1623415 cttaggaatcaacaaatataa 1623435  T

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Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 224
Target Start/End: Original strand, 24499428 - 24499496
Alignment:
Q  154 agtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  24499428 agtaaacttataacaaacatag--atatatatttctatcattttatttctatgaatcaacaaatataactt 24499496  T

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Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 11763638 - 11763601
Alignment:
Q  2 tttataatattcttaggaaccataaaaatagggattat 39  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11763638 tttataatattcctaagaaccataaaaatagggattat 11763601  T

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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14403316 - 14403248
Alignment:
Q  156 taaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| || | || |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  14403316 taaacttgtaataaatgtaggcatgtatatttttatcattttatttccaggaatcaacaaatacaactt 14403248  T

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Target: scaffold0189 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29191 - 28967
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatag-ataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29191 ctttataatattcctaggaattataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttattcccaccctttt 29092  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29091 ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat 28992  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||    
T  28991 tcccgaaaatcaacaattataactt 28967  T

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Target: chr6 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 1316851 - 1317074
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  1316851 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttt 1316950  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  1316951 ccttgggaaa-tttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat 1317049  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  1317050 tcccgggaatcaacaattataactt 1317074  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 2657532 - 2657756
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatag-ataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2657532 ctttataatattcctagtaatcataaaaatatggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 2657631  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  2657632 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcctatcattttat 2657731  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    
T  2657732 tcccgggaatcaacaattataactt 2657756  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 16968757 - 16968981
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  16968757 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattcccaccctttt 16968856  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||         |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||    
T  16968857 ccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatagattcctatcattttat 16968956  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||    
T  16968957 tctcaggaatcaacaattataactt 16968981  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7344320 - 7344121
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7344320 ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcc 7344221  T
Q  102 tagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattc 201  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7344220 ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcatatacattcctatcattttattc 7344121  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 18897753 - 18897977
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  18897753 ctttataatattcctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccctttt 18897852  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||         | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18897853 ccttgggaaattttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcactttat 18897952  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | || | ||||||||| ||||||||    
T  18897953 ttccgggaatcaacaattataactt 18897977  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7053817 - 7053585
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  7053817 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttt 7053718  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacatt--------ttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctat 191  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  7053717 ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctat 7053618  T
Q  192 cattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  7053617 cattttattcccgggaatcaacaattataactt 7053585  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 14170847 - 14171069
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagat-aactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14170847 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaattta-ttccatctccatgggaactttattcccaccctttt 14170945  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttat 199  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||         ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  14170946 cct-tggaaattttttctattcccaggaacattttatatccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatagattcctatcattttat 14171044  T
Q  200 tcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||| | |||||| || ||||||||    
T  14171045 tcccgggaatcaaaaattataactt 14171069  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 8029135 - 8029274
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccctttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8029135 ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt 8029234  T
Q  100 cctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacc 139  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8029235 ctttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacc 8029274  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6705936 - 6705780
Alignment:
Q  68 catctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaac 167  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||||||||    
T  6705936 catctccatgggaactttattcccacccttttctttgggaacatttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaaatttagtaaacttgtaac 6705837  T
Q  168 aaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  6705836 aaacatagacatatatatttctaccattttattccaatgaatcaacaaatataactt 6705780  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 10246355 - 10246259
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccaccct 96  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10246355 ctttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct 10246259  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 224
Target Start/End: Original strand, 8029319 - 8029389
Alignment:
Q  154 agtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8029319 agtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataactt 8029389  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21008208 - 21008039
Alignment:
Q  54 tatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnn 153  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  | |  |  |||||||||||||||||||||||| ||   |||||             
T  21008208 tatgaatttattcccatctctatgagaactttattcccacctttttgtttga-attttttttctattcccaagaacatttcatgttcgggaataaaattt 21008110  T
Q  154 agtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21008109 agtaaacctgtaacaaatagaggcatatatatttttatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 21008039  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10849961 - 10849798
Alignment:
Q  62 tatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttccta-gggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaac 160  Q
    |||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||| |||||||||| |||| |||         | |||||    
T  10849961 tattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttttctttgggaacatttttctattcccaggaacattttacacccaggaagaaaagttactaaac 10849862  T
Q  161 ttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||| || ||||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||    
T  10849861 ttgtaactaatataggaagatataattctatcattttattcccaggaatctataaaaataactt 10849798  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 346051 - 345845
Alignment:
Q  19 aaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttcta 118  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||  || || | |||| ||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||    
T  346051 aaccataaaaataggaattttaataggaaattactcatgaatttattctcatctccattggaactttattcccacccttttctttgggaaaaattttcta 345952  T
Q  119 ttcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcatttta-ttcccagaaatcaacaaat 217  Q
    |||| || ||| ||||||| ||| ||         |||||||||||||||||||||| ||| |  | | ||||||||||| |||| || |||| || |||    
T  345951 ttcctaaaaacgttttatatccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtgtattcctatcattttatttcctaggaatctacgaat 345852  T
Q  218 ataactt 224  Q
    |||||||    
T  345851 ataactt 345845  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 224
Target Start/End: Original strand, 3869523 - 3869561
Alignment:
Q  186 ttctatcattttattcccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3869523 ttctatcattttattcccagaaatctacaaaaataactt 3869561  T

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Target: scaffold0006 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 201764 - 201981
Alignment:
Q  8 atattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataact-atttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctaggg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  201764 atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg 201863  T
Q  107 aaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcccaga 206  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |     
T  201864 aaattttttctattcccaggaatattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg 201963  T
Q  207 aatcaacaaatataactt 224  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  201964 aatcaacaattataactt 201981  T

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Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 143446 - 143669
Alignment:
Q  1 ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  143446 ctttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaactacatatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccattttc 143545  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||||||||    
T  143546 tttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtatacatatatatttctatcattttatt 143645  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||    
T  143646 ctcaggaatcaacaaatttaactt 143669  T

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Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 221
Target Start/End: Original strand, 119228 - 119374
Alignment:
Q  76 tgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacatag 175  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | || |||  ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||         ||||||||||||||||||||||    
T  119228 tgaaaactttatttccacccttttctttggaaaaaattttctattcccaggaacattttatactcatgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag 119327  T
Q  176 gcatatacacttctatcattttattccc-agaaatcaacaaatataa 221  Q
     ||| || | |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  119328 acatgtatatttctatcattgtattcccaaaaaatctacaaatataa 119374  T

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Target: scaffold0702 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3801 - 3580
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcct 102  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| ||   || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |    
T  3801 ttataatattccaaggaaccttaaaaatagggaatataataggtaattacacataattttattttcatctccatgggaactttattcccaccattttctt 3702  T
Q  103 agggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttattcc 202  Q
     | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||    
T  3701 tgagaaaacttttctattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttttataattttattcc 3602  T
Q  203 cagaaatcaacaaatataactt 224  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  3601 tagaaatctacaaatataactt 3580  T

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Target: scaffold0662 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0662
Description:

Target: scaffold0662; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Original strand, 4301 - 4524
Alignment:
Q  3 ttataatattcttaggaaccataaaaatagggattattatagataactat--ttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttc 100  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| ||   |  | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  4301 ttataatattccaaggaaccttaaaaatagggaatataataggtaattacactattaattttattttcatctccatgggaactttattcccaccattttc 4400  T
Q  101 ctagggaaattttttctattcccaagaacattttatacccgggannnnnnnnnagtaaacttgtaacaaacataggcatatacacttctatcattttatt 200  Q
     | | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||    
T  4401 tttgagaaaacttttctattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttttataattttatt 4500  T
Q  201 cccagaaatcaacaaatataactt 224  Q
    || ||||||| |||||||||||||    
T  4501 cctagaaatctacaaatataactt 4524  T

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Target: scaffold0238 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23517 - 23314
Alignment:
Q  18 gaaccataaaaatagggattattatagataactatttatgattttatttccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaattttttct 117  Q
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