View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3918_low_103 (Length: 328)

Name: NF3918_low_103
Description: NF3918
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3918_low_103
NF3918_low_103
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (61-298)||(30695293-30695530)
chr5 (103-300)||(32485947-32486145)
chr5 (61-298)||(40367531-40367757)
chr5 (103-298)||(19502307-19502504)
chr5 (103-298)||(26336767-26336964)
chr5 (61-298)||(40371669-40371892)
chr5 (103-298)||(36632314-36632497)
chr5 (113-278)||(43384972-43385138)
chr5 (145-300)||(12018729-12018888)
chr5 (145-298)||(7099374-7099531)
chr5 (145-298)||(7103943-7104100)
chr5 (145-298)||(12023289-12023446)
chr5 (145-298)||(16794108-16794265)
chr5 (145-298)||(16798669-16798826)
chr5 (117-250)||(20830304-20830437)
chr5 (145-298)||(10274546-10274698)
chr5 (190-298)||(10277204-10277312)
chr5 (145-298)||(37682036-37682182)
chr5 (145-298)||(37658732-37658878)
chr5 (176-250)||(20808675-20808749)
chr5 (142-174)||(5733082-5733114)
[»] chr7 (11 HSPs)
chr7 (58-298)||(27761397-27761638)
chr7 (58-298)||(27756846-27757087)
chr7 (61-292)||(47419498-47419729)
chr7 (58-298)||(22901154-22901396)
chr7 (117-298)||(35705634-35705815)
chr7 (103-298)||(7466485-7466669)
chr7 (109-285)||(733634-733811)
chr7 (145-298)||(7940083-7940240)
chr7 (145-298)||(7944636-7944793)
chr7 (126-286)||(13828087-13828248)
chr7 (190-286)||(37355573-37355669)
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (58-298)||(30410246-30410486)
chr8 (61-300)||(28644560-28644799)
chr8 (58-298)||(30405737-30405960)
chr8 (103-298)||(33071918-33072113)
chr8 (103-298)||(42234656-42234851)
chr8 (103-298)||(38757003-38757186)
chr8 (145-298)||(43807485-43807640)
chr8 (145-298)||(43812044-43812199)
chr8 (145-298)||(197684-197841)
chr8 (145-298)||(202202-202359)
chr8 (145-298)||(312521-312678)
chr8 (145-298)||(317039-317196)
chr8 (202-298)||(41945339-41945434)
chr8 (198-298)||(41949802-41949902)
chr8 (120-174)||(27435169-27435223)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (58-298)||(39793831-39794070)
chr1 (58-298)||(16588395-16588635)
chr1 (58-298)||(26311522-26311749)
chr1 (58-298)||(26316013-26316240)
chr1 (103-298)||(43591783-43591978)
chr1 (145-298)||(10504436-10504588)
chr1 (142-174)||(41879945-41879977)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (58-298)||(21847109-21847351)
chr3 (58-298)||(21850199-21850441)
chr3 (103-298)||(9105275-9105470)
chr3 (103-298)||(11004365-11004560)
chr3 (103-298)||(43547723-43547920)
chr3 (103-301)||(9697583-9697783)
chr3 (145-298)||(54171924-54172081)
chr3 (145-298)||(54167344-54167501)
chr3 (145-298)||(39399127-39399279)
chr3 (102-222)||(43554645-43554765)
chr3 (117-237)||(755891-756012)
chr3 (221-298)||(43554292-43554371)
chr3 (145-250)||(38175790-38175894)
chr3 (195-228)||(755824-755857)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (58-298)||(8319960-8320199)
chr6 (58-298)||(8315421-8315661)
chr6 (58-298)||(27552026-27552267)
chr6 (58-299)||(17779913-17780155)
chr6 (103-298)||(17096236-17096431)
chr6 (61-298)||(27574657-27574884)
chr6 (109-298)||(17895691-17895881)
chr6 (103-299)||(14531749-14531946)
chr6 (109-298)||(17886816-17887000)
chr6 (145-260)||(6440865-6440979)
chr6 (196-237)||(17163689-17163730)
chr6 (195-233)||(7888212-7888250)
chr6 (196-285)||(17159610-17159700)
chr6 (299-328)||(31044073-31044102)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (58-298)||(31670090-31670330)
chr4 (103-298)||(53722007-53722202)
chr4 (103-299)||(10317025-10317221)
chr4 (103-298)||(8892582-8892778)
chr4 (103-301)||(27186139-27186341)
chr4 (145-298)||(3770842-3770999)
chr4 (103-291)||(43683636-43683813)
chr4 (145-298)||(44147023-44147180)
chr4 (145-298)||(44151558-44151715)
chr4 (103-298)||(50627904-50628087)
chr4 (145-298)||(41884925-41885076)
chr4 (103-202)||(35842843-35842942)
chr4 (145-298)||(31359151-31359303)
chr4 (145-298)||(49274517-49274668)
chr4 (203-299)||(31354677-31354772)
chr4 (104-264)||(53785880-53786039)
chr4 (195-247)||(45976222-45976274)
chr4 (221-271)||(35842797-35842847)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (58-298)||(8055392-8055632)
chr2 (58-298)||(8050839-8051079)
chr2 (58-298)||(6463355-6463583)
chr2 (103-299)||(12999426-12999623)
chr2 (145-298)||(36670503-36670660)
chr2 (145-298)||(36675051-36675208)
chr2 (136-298)||(13270980-13271131)
chr2 (145-298)||(35950443-35950595)
chr2 (145-298)||(41093824-41093976)
chr2 (198-285)||(29767953-29768041)
chr2 (145-233)||(34590280-34590366)
chr2 (207-244)||(27403696-27403733)
[»] scaffold0440 (2 HSPs)
scaffold0440 (145-298)||(2980-3137)
scaffold0440 (145-298)||(7506-7662)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (145-298)||(44865-45022)
scaffold0044 (145-298)||(49445-49602)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 61 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30695530 - 30695293
Alignment:
Q  61 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30695530 ttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctacatacgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 30695431  T
Q  161 gcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30695430 gcaatgtaacaaactctagatcttatatactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtga 30695331  T
Q  261 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30695330 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 30695293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 103 - 300
Target Start/End: Original strand, 32485947 - 32486145
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32485947 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaaggaggttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 32486046  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32486047 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacact 32486145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 61 - 298
Target Start/End: Original strand, 40367531 - 40367757
Alignment:
Q  61 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagtt-gcttgaagcaca 159  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  40367531 ttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctacatatgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctaaccaagtttgcttgaagcaca 40367630  T
Q  160 agcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||    
T  40367631 agcaatgtaacaaactctagatcttatctactagcctctaacaaacttg------------taacaaactaaaacaaaatgtgattaatctctgattgtg 40367718  T
Q  260 attatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40367719 attatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 40367757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19502504 - 19502307
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  19502504 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtttagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctatatcttattttctaacctctaaca 19502405  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgt-aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19502404 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgatttaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 19502307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 26336767 - 26336964
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26336767 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 26336866  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaact-aaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26336867 aacatgtaacaaacatcataacaaactaaaaacaaaatgtgattaatcaccgattgtgattatcactaaaattaaacttgaattaaaacaaactaaca 26336964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 61 - 298
Target Start/End: Original strand, 40371669 - 40371892
Alignment:
Q  61 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 160  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              |||||    
T  40371669 ttatgatgaaattgtagttgattcttattgattctacatatgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctaac--------------cacaa 40371754  T
Q  161 gcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtga 260  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  40371755 acaatgtaataaactctagatcttatctactagcctctaacaaacttgtaacaatcttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatctctgattgtga 40371854  T
Q  261 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40371855 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 40371892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36632497 - 36632314
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  36632497 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 36632398  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||            |||||||||||| ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36632397 aacttgtaaca------------aactaaaacaaagtgtgattattcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 36632314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 43385138 - 43384972
Alignment:
Q  113 aaggaggtagctt-atatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaa 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  43385138 aaggaggtagctttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaaccctagattttatttgctaacttctaacaaacttgtaa 43385039  T
Q  212 caaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaact 278  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  43385038 caaacttcataacaaactaaaagcaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaact 43384972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 145 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12018888 - 12018729
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12018888 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 12018789  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacact 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12018788 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacact 12018729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 7099374 - 7099531
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7099374 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7099473  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7099474 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7099531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 7103943 - 7104100
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7103943 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7104042  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7104043 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7104100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12023446 - 12023289
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12023446 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 12023347  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12023346 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 12023289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16794265 - 16794108
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16794265 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 16794166  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16794165 gattaaccacttattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 16794108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16798826 - 16798669
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16798826 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 16798727  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798726 gattaaccacttattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 16798669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 117 - 250
Target Start/End: Original strand, 20830304 - 20830437
Alignment:
Q  117 aggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaac 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20830304 aggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaacacttgatcttatttgctaatctctaacaaacttgtaacaaac 20830403  T
Q  217 ttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaacca 250  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  20830404 ttcataacaaactgaaactaaatgtgattaacca 20830437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10274698 - 10274546
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  10274698 gttgcttgaagtacaagctaaataacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 10274600  T
Q  245 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10274599 taaccattaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 10274546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 190 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10277312 - 10277204
Alignment:
Q  190 ctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaac 289  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277312 ctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaac 10277213  T
Q  290 aaactaaca 298  Q
    |||||||||    
T  10277212 aaactaaca 10277204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37682182 - 37682036
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaat-gt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||| | ||    
T  37682182 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaactt-----------cataacaaactaaaacaaacttgt 37682094  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37682093 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 37682036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37658878 - 37658732
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaat-gt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||           |||||||| |||||||||| | ||    
T  37658878 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaactt-----------cataacaagctaaaacaaacttgt 37658790  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37658789 gattaaccactgattatgattatgactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 37658732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 250
Target Start/End: Original strand, 20808675 - 20808749
Alignment:
Q  176 ctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaacca 250  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  20808675 ctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtaactaacttcataacaaactgaaactaaatgtgattaacca 20808749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5733114 - 5733082
Alignment:
Q  142 taagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaac 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5733114 taagttgcttgaagcacaagcaaagtaacaaac 5733082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 11)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27761638 - 27761397
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 156  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27761638 aagttatgatgaaaattgtaaatgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 27761539  T
Q  157 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27761538 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctacaaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtgattaaccactgatt 27761439  T
Q  257 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27761438 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 27761397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27757087 - 27756846
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 156  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27757087 aagttatgatgaaaattgtaaatgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 27756988  T
Q  157 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  27756987 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctacaaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgcgattaaccactgatt 27756888  T
Q  257 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27756887 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 27756846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 61 - 292
Target Start/End: Original strand, 47419498 - 47419729
Alignment:
Q  61 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  47419498 ttatgatgaaattgtaattgatttttattgattctacatacgaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaaacacaa 47419597  T
Q  161 gcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtga 260  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  47419598 acaatgtaacaaactctagatattatctgctaacctctaagaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtga 47419697  T
Q  261 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47419698 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaa 47419729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22901396 - 22901154
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaat-tgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 156  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22901396 aagttatgatgaatttgtaaaatgatctttattgattctacatacaaaa-tatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagc 22901298  T
Q  157 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtaattaaccattgat 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||    
T  22901297 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgat 22901198  T
Q  256 tgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22901197 tgtgattatcactaaaactaaactttaattaaaacaaactaaca 22901154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 117 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 35705815 - 35705634
Alignment:
Q  117 aggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaac 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35705815 aggtagcttatatacaatgtctagctg-gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaac 35705717  T
Q  217 ttcat-aacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35705716 tccataaacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 35705634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 7466485 - 7466669
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7466485 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 7466584  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||            ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7466585 aacttg------------taacaaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7466669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 285
Target Start/End: Original strand, 733634 - 733811
Alignment:
Q  109 tacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  733634 tacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgctcgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaaattg 733733  T
Q  209 taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaacca-ttgattgtgattatcactaaactaaacttgaatta 285  Q
    ||||||| |||||||||||||||   || |||| |||||||| || |   ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  733734 taacaaatttcataacaaactaactgaatatgtgattaaccatttaaacatgattatcactaatctaaacttgaatta 733811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 7940083 - 7940240
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7940083 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7940182  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940183 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7940240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 7944636 - 7944793
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7944636 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7944735  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7944736 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7944793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 286
Target Start/End: Original strand, 13828087 - 13828248
Alignment:
Q  126 atatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataaca 225  Q
    ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13828087 atatacactatctagttaggtagcttgaagcacaagcaatgtaacagaccctaactattattagatacactctaacaaacttgtaacaaacttcagaaca 13828186  T
Q  226 aactaaaacaaaatgtaattaacc-attgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaa 286  Q
    ||| |||  ||||||| ||||||| | | |   |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13828187 aacaaaatgaaaatgtgattaaccaactaaacatgattatcactaaggtaaacttgaattaa 13828248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 37355669 - 37355573
Alignment:
Q  190 ctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-aatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaa 286  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| | | ||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  37355669 ctaatctctaagaaacttgtaacaactttcataacaaactaaagcaataatatgattaaccactaagtgtgattatcact-aggtaaacttgaattaa 37355573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Original strand, 30410246 - 30410486
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30410246 aagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagta 30410345  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  30410346 caagcaatgtaacaaaatctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaattaaaacagaatgtgattaaccactgattg 30410445  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30410446 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 30410486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 61 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28644799 - 28644560
Alignment:
Q  61 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28644799 ttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctacatgcaaaaatatacaaaggaggtagcttatatacactgtctagctaagttgcttgaagcacaa 28644700  T
Q  161 gcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28644699 gcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtga 28644600  T
Q  261 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28644599 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacact 28644560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Original strand, 30405737 - 30405960
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30405737 aagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagta 30405836  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||                    
T  30405837 caagcaatgtaacaaattctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgt---------------- 30405920  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30405921 -gattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 30405960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33072113 - 33071918
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  33072113 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctccaaca 33072014  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33072013 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaagaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 33071918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 42234656 - 42234851
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  42234656 aaaatatacaaagaaggtagtttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 42234755  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42234756 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 42234851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38757186 - 38757003
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38757186 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatatctggctaggttgcttgaatcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 38757087  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||            |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38757086 aacttgtaaca------------aactaaaacagaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 38757003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 43807485 - 43807640
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgta 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43807485 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtg 43807584  T
Q  243 attaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43807585 attaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaagctaaca 43807640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 43812044 - 43812199
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgta 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43812044 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtg 43812143  T
Q  243 attaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43812144 attaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaagctaaca 43812199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 197684 - 197841
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  197684 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 197783  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197784 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 197841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 202202 - 202359
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  202202 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 202301  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202302 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 202359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 312521 - 312678
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  312521 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 312620  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  312621 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 312678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 317039 - 317196
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  317039 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 317138  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  317139 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 317196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 41945434 - 41945339
Alignment:
Q  202 aaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41945434 aaacttgtaaccaacttg-taacaaactaaaacaaagtgtgattaatcattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 41945339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 198 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 41949902 - 41949802
Alignment:
Q  198 taacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaac 297  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41949902 taaccaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacagagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaagcttgaattaaaagaaactaac 41949803  T
Q  298 a 298  Q
    |    
T  41949802 a 41949802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 174
Target Start/End: Original strand, 27435169 - 27435223
Alignment:
Q  120 tagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaac 174  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27435169 tagcttatatacaatatctacttaggttgcttgaagcacaagctatgtaacaaac 27435223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39794070 - 39793831
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39794070 aagttatgatgaaaatgtaattgatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 39793972  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  39793971 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgagattaaccactgattg 39793872  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39793871 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 39793831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Original strand, 16588395 - 16588635
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  16588395 aagttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctccatacaaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttaaaaca 16588494  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  16588495 caagcaatgtaacaaactctagatcttatatgataacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccacttattg 16588594  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16588595 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 16588635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26311749 - 26311522
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26311749 aagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctgcatacaaaa-tatacaaaggaagtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagca 26311651  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  26311650 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaaca------------aactaaaacagaatgtgattaaccactgattg 26311563  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26311562 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 26311522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26316240 - 26316013
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26316240 aagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctgcatacaaaa-tatacaaaggaagtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagca 26316142  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  26316141 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaaca------------aactaaaacagaatgtgattaaccactgattg 26316054  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26316053 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 26316013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 43591783 - 43591978
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  43591783 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagccaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagattttatttgctaacctctaaca 43591882  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43591883 atattgtaacaaacttcataacaaactaaaataaagtgcgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 43591978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10504588 - 10504436
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  10504588 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 10504490  T
Q  245 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10504489 taatcactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 10504436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41879977 - 41879945
Alignment:
Q  142 taagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaac 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41879977 taagttgcttgaagcacaagcaaagtaacaaac 41879945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21847351 - 21847109
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847351 aagttatgatgaaattgtaaatgatctttattgattctatatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 21847252  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  21847251 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaactgtgattaaccactgattg 21847152  T
Q  258 tgattatcact-aaactaaacttgaatt-aaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21847151 tgattatcactaaaactaaacttgaattaaaaacaaactaaca 21847109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21850441 - 21850199
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850441 aagttatgatgaaattgtaaatgatctttattgattctatatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 21850342  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  21850341 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaactgtgattaaccactgattg 21850242  T
Q  258 tgattatcact-aaactaaacttgaatt-aaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21850241 tgattatcactaaaactaaacttgaattaaaaacaaactaaca 21850199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9105470 - 9105275
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  9105470 aaaatatacaaaggaggtagctcatatacaatgtctagttaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaaca 9105371  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9105370 aacttgtaacatacttcataacaaactaaagcaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 9105275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 11004365 - 11004560
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11004365 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaggttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 11004464  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11004465 aacttgtaacaatcttcataacaagctaaaacaaaatgtgattattcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 11004560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 43547920 - 43547723
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  43547920 aaaatatacaaaggagatagcttatatacaatgtcttgctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaaca 43547821  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaact-aaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43547820 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaacaaaatgtaattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaagctaaca 43547723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 103 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9697783 - 9697583
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9697783 aaaatatacaaaggaggcagcttatatacaatgtctagctaagtttcttgaagcacaagcaatgttacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 9697684  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaact-aaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9697683 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaacaaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacact 9697584  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  9697583 t 9697583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 54171924 - 54172081
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  54171924 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 54172023  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54172024 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 54172081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 54167344 - 54167501
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatc--ttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  54167344 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacacccttatttggtaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 54167443  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54167444 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 54167501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 39399127 - 39399279
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  39399127 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 39399225  T
Q  245 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39399226 taaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 39399279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43554765 - 43554645
Alignment:
Q  102 aaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaac 201  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  43554765 aaaaatatacaaaagaggtagctcatatacaatgtcttactaagttgcttgaaacagaagcaatgtaataaactctagatcttatttgttaacctctaac 43554666  T
Q  202 aaacttgtaacaaacttcata 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43554665 aaacttgtaacaaacttcata 43554645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 756012 - 755891
Alignment:
Q  117 aggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaga-tcttatctactaac-ctctaacaaacttgtaacaa 214  Q
    ||||||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||   | |||| || | || ||||||||||||||||||||    
T  756012 aggtagcttatatacaccatctagttaggtagcttgaagcacaagcaatgtaacaaaccctaaccttttat-tagttacactctaacaaacttgtaacaa 755914  T
Q  215 acttcataacaaactaaaacaaa 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  755913 acttcaaaacaaactaaaacaaa 755891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 43554371 - 43554292
Alignment:
Q  221 taacaaactaaaa-caaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43554371 taacaaactaaaaacaaaatgtgactaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 43554292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 250
Target Start/End: Original strand, 38175790 - 38175894
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  38175790 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-atcttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaaactaaatgtgat 38175888  T
Q  245 taacca 250  Q
    ||||||    
T  38175889 taacca 38175894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 755857 - 755824
Alignment:
Q  195 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaac 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  755857 ctctaacaaacttgtaacaaacttcaaaacaaac 755824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Original strand, 8319960 - 8320199
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8319960 aagttatgatgaaaatgaaattgatctttattgattctacata-agaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagtttcttgaagca 8320058  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  8320059 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacatattgtgattaaccactgattg 8320158  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8320159 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8320199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Original strand, 8315421 - 8315661
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8315421 aagttatgatgaaaatgaaattgatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 8315519  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtaattaaccattgatt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||    
T  8315520 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgatt 8315619  T
Q  257 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8315620 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8315661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Original strand, 27552026 - 27552267
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatac-aaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27552026 aagttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctccatacgaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 27552125  T
Q  157 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27552126 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacgtttaacaaacctgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgatt 27552225  T
Q  257 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27552226 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 27552267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 58 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17780155 - 17779913
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780155 aagttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctacatacgaaaatgtacaaaggagatagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 17780056  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||    
T  17780055 caagcaatgtaacaaactctaaatcttatctactagcctctaacaaacttttaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatctctgattg 17779956  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaatt-aaaacaaactaacac 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17779955 tgattatcactaaactaaacttgaattcaaaacaaactaacac 17779913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 17096236 - 17096431
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17096236 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactatagatcttatctgctaacctctaaca 17096335  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17096336 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 17096431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 61 - 298
Target Start/End: Original strand, 27574657 - 27574884
Alignment:
Q  61 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatac-aaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcaca 159  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27574657 ttatggtgaaattgtaattgattcttattgattttccatacgaaaaatgttcaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcaca 27574756  T
Q  160 agcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtg 259  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27574757 agcaatgtaacaaactttagatcttatctgctaacctc-----------taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtg 27574845  T
Q  260 attatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27574846 attatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 27574884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 109 - 298
Target Start/End: Original strand, 17895691 - 17895881
Alignment:
Q  109 tacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17895691 tacaaaggaggtagcttatatacaatgcctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaattctagatcttatttgctaacctctaacaaacttg 17895790  T
Q  209 taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17895791 taacaaacttcagaacaaactaaaataaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 17895881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 103 - 299
Target Start/End: Original strand, 14531749 - 14531946
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14531749 aaaatatacaaaggtggtagagtatatacaatgtctagctaagttgcttcaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 14531848  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacac 299  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14531849 aacctgtaacaaacttcataacgaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgattataactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacac 14531946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 109 - 298
Target Start/End: Original strand, 17886816 - 17887000
Alignment:
Q  109 tacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  17886816 tacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagctgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaactt- 17886914  T
Q  209 taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
          |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17886915 -----tactttataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 17887000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 260
Target Start/End: Original strand, 6440865 - 6440979
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  6440865 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 6440963  T
Q  245 taaccattgattgtga 260  Q
    |||||| | |||||||    
T  6440964 taaccactaattgtga 6440979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17163730 - 17163689
Alignment:
Q  196 tctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17163730 tctaaccaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaaa 17163689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 233
Target Start/End: Original strand, 7888212 - 7888250
Alignment:
Q  195 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaa 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7888212 ctctaacaaagttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaa 7888250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17159700 - 17159610
Alignment:
Q  196 tctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaa-ccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaatta 285  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | | || || | | | ||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17159700 tctaaccaacttgtaacaaacgtcaaaacaaactaaaacaaagtatgatcaatcaactaatcatgattatcactaatctaaacttgaatta 17159610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 328
Target Start/End: Original strand, 31044073 - 31044102
Alignment:
Q  299 cttcttatctacaattttgagaaaaggaga 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31044073 cttcttatctacaattttgagaaaaggaga 31044102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31670330 - 31670090
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31670330 aagttatgatgaaattgtaaatgatctttattgattctacattcaaaa-tatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagca 31670232  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  31670231 gaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaactgtgattaaccactgattg 31670132  T
Q  258 tgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31670131 tgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 31670090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 53722202 - 53722007
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  53722202 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatatagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctagcctctaaca 53722103  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53722102 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 53722007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 103 - 299
Target Start/End: Original strand, 10317025 - 10317221
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10317025 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 10317124  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10317125 aacttgtaacaaacttcataacaaactacaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattataactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacac 10317221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 8892582 - 8892778
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  8892582 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcgatgtaacaaactctatatcttatttgctaatctctaaca 8892681  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892682 aatttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8892778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 103 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27186341 - 27186139
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27186341 aaaatatacaaaggaggcagcttatatacaatgtctagctaagtttcttgaagcacaagcaatgttacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 27186242  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataac-aaact--aaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27186241 aacttgtaacaaacttcataacaaaactaaaaaacaaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 27186142  T
Q  299 ctt 301  Q
    |||    
T  27186141 ctt 27186139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3770999 - 3770842
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3770999 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 3770900  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3770899 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 3770842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 103 - 291
Target Start/End: Original strand, 43683636 - 43683813
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||         
T  43683636 aaaatatacaaaggatgtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctatatcttatttgctaacctc----- 43683730  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaa 291  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43683731 ------taacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaataaacttgaattaaaacaa 43683813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 44147180 - 44147023
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44147180 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44147081  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44147080 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 44147023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 44151715 - 44151558
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44151715 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44151616  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44151615 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 44151558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 50627904 - 50628087
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  50627904 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagtacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 50628003  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||            ||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50628004 aacttg------------taacaaactaaaaaaaaaagtgattaatcactgattgtgatta-cactaaaactaatcttgaattaaaacaaactaaca 50628087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 41885076 - 41884925
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  41885076 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-atcttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 41884979  T
Q  245 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41884978 taaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaaccaaca 41884925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35842942 - 35842843
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  35842942 aaaatatacaaaggaggtagtttatatacaatgtctaactaagttgcttgaagcacaagcattgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 35842843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31359303 - 31359151
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||| ||    
T  31359303 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcatagcaaactgaatctaaatgtgat 31359205  T
Q  245 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359204 taaccactaattgtgattatcattaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 31359151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 49274517 - 49274668
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  49274517 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 49274614  T
Q  245 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49274615 taaccactaattatgatcatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 49274668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 203 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31354772 - 31354677
Alignment:
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacac 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || | |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31354772 aacttgtaacaaaattcataacaa-ctgaatctaaatgtgattaaccactaattgtaattatcactaaactaaacttaaattaaaacaaactaacac 31354677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 53786039 - 53785880
Alignment:
Q  104 aaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaa 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   |||   |||   ||||||||    
T  53786039 aaatgtacaaag-aggtagcttatatactagaactagttaggttgcttgaagcacaagctatgtaacaaacccta-actatataagctagtttctaacaa 53785942  T
Q  204 acttgtaacaaacttcataacaaactaaaaca--aaatgtaattaaccattgattgtgattat 264  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  53785941 acttgtaacaaa-ttcttaacaaacaaaaacactaaatgtgattaaccactgagtgtgattat 53785880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 247
Target Start/End: Original strand, 45976222 - 45976274
Alignment:
Q  195 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaa 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  45976222 ctctaaaaaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaagatgtgattaa 45976274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35842847 - 35842797
Alignment:
Q  221 taacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaa 271  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35842847 taacatactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa 35842797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8055632 - 8055392
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 156  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055632 aagttatgatgaaaattgtaaaagatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 8055534  T
Q  157 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  8055533 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgcaacaaacttcataacaaactaaaatagaatgtgattaaccactgatt 8055434  T
Q  257 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055433 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8055392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8051079 - 8050839
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 156  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8051079 aagttatgatgaaaattgtaaaagatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggcagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagc 8050981  T
Q  157 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  8050980 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaatagaatgtgattaaccactgatt 8050881  T
Q  257 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050880 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8050839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Original strand, 6463355 - 6463583
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6463355 aagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctacatactaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagca 6463454  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6463455 caaataatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg------------taacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattg 6463542  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6463543 tgattatcactaaactaaacttgaattaagacaaactaaca 6463583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 103 - 299
Target Start/End: Original strand, 12999426 - 12999623
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12999426 aaaatatacaaaggagatagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagtaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 12999525  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacac 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12999526 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgttattatcactaaaactaaacttaaattaaaacaaactaacac 12999623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36670660 - 36670503
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36670660 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 36670561  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36670560 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 36670503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36675208 - 36675051
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36675208 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 36675109  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36675108 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 36675051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 298
Target Start/End: Original strand, 13270980 - 13271131
Alignment:
Q  136 tctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||            |||||||||||||| |    
T  13270980 tctagctaagttgcttgaagcaaaaacaatgtaacaaactttagatcttatttactaacctctaacaaactt------------ataacaaactaaaata 13271067  T
Q  236 aaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13271068 aagtgtaattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 13271131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 35950443 - 35950595
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | ||||    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  35950443 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttacgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaacctaaatgtgat 35950541  T
Q  245 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35950542 taaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 35950595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 41093976 - 41093824
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| || | |||| | ||    
T  41093976 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaatttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatatgat 41093878  T
Q  245 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41093877 taatcactaattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaaccaaca 41093824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29768041 - 29767953
Alignment:
Q  198 taacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaacca-ttgattgtgattatcactaaactaaacttgaatta 285  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| || || || || ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29768041 taaccaacttgtaacaaactttaaaacaaactaaaacaaagtgtgatcaatcaattaatcatgattatcactaaactaaacttgaatta 29767953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34590366 - 34590280
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaa 233  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||| |||  ||| || | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34590366 gttgcttaaagcacaagctatataacaaaccctaactct-atatgctaatctctaacaaacttgtaacaaa-ttcataacaaactaaaa 34590280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 244
Target Start/End: Original strand, 27403696 - 27403733
Alignment:
Q  207 tgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27403696 tgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaaagtgtaat 27403733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3137 - 2980
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3137 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 3038  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3037 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 2980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7662 - 7506
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgta 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  7662 gttgcttgaaacacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaattgtg 7563  T
Q  243 attaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7562 attaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 44865 - 45022
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44865 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44964  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44965 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 45022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 49445 - 49602
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  49445 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 49544  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49545 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 49602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University