View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3918_low_15 (Length: 678)

Name: NF3918_low_15
Description: NF3918
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3918_low_15
NF3918_low_15
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (298-673)||(41806110-41806484)
chr8 (58-298)||(30410246-30410486)
chr8 (61-298)||(28644562-28644799)
chr8 (58-299)||(30405737-30405961)
chr8 (103-298)||(33071918-33072113)
chr8 (103-298)||(42234656-42234851)
chr8 (103-298)||(38757003-38757186)
chr8 (347-583)||(41800036-41800270)
chr8 (145-299)||(43807485-43807641)
chr8 (145-298)||(43812044-43812199)
chr8 (145-300)||(202202-202361)
chr8 (145-300)||(317039-317198)
chr8 (145-299)||(197684-197842)
chr8 (145-299)||(312521-312679)
chr8 (202-298)||(41945339-41945434)
chr8 (198-299)||(41949801-41949902)
chr8 (585-653)||(42034087-42034154)
chr8 (120-174)||(27435169-27435223)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (61-298)||(30695293-30695530)
chr5 (103-298)||(32485947-32486143)
chr5 (61-299)||(40367531-40367758)
chr5 (103-298)||(19502307-19502504)
chr5 (103-299)||(26336767-26336965)
chr5 (61-298)||(40371669-40371892)
chr5 (103-298)||(36632314-36632497)
chr5 (113-278)||(43384972-43385138)
chr5 (145-299)||(7099374-7099532)
chr5 (145-299)||(12023288-12023446)
chr5 (145-298)||(7103943-7104100)
chr5 (145-298)||(12018731-12018888)
chr5 (145-299)||(16798668-16798826)
chr5 (145-298)||(16794108-16794265)
chr5 (117-250)||(20830304-20830437)
chr5 (145-298)||(10274546-10274698)
chr5 (190-304)||(10277198-10277312)
chr5 (145-299)||(37682035-37682182)
chr5 (298-445)||(278541-278689)
chr5 (145-298)||(37658732-37658878)
chr5 (176-250)||(20808675-20808749)
chr5 (467-583)||(278393-278511)
chr5 (142-174)||(5733082-5733114)
[»] chr7 (11 HSPs)
chr7 (58-299)||(27761396-27761638)
chr7 (58-298)||(27756846-27757087)
chr7 (61-292)||(47419498-47419729)
chr7 (58-298)||(22901154-22901396)
chr7 (117-299)||(35705633-35705815)
chr7 (103-298)||(7466485-7466669)
chr7 (109-285)||(733634-733811)
chr7 (145-299)||(7940083-7940241)
chr7 (145-298)||(7944636-7944793)
chr7 (126-286)||(13828087-13828248)
chr7 (190-286)||(37355573-37355669)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (58-298)||(39793831-39794070)
chr1 (58-298)||(16588395-16588635)
chr1 (58-299)||(26316012-26316240)
chr1 (58-298)||(26311522-26311749)
chr1 (103-299)||(43591783-43591979)
chr1 (145-299)||(10504435-10504588)
chr1 (142-174)||(41879945-41879977)
[»] chr3 (18 HSPs)
chr3 (58-299)||(21847108-21847351)
chr3 (58-299)||(21850198-21850441)
chr3 (103-298)||(9105275-9105470)
chr3 (103-298)||(11004365-11004560)
chr3 (103-299)||(43547722-43547920)
chr3 (103-298)||(9697586-9697783)
chr3 (145-299)||(54171924-54172082)
chr3 (145-299)||(54167344-54167502)
chr3 (145-298)||(39399127-39399279)
chr3 (102-222)||(43554645-43554765)
chr3 (298-568)||(24685192-24685444)
chr3 (349-544)||(24631841-24632035)
chr3 (117-237)||(755891-756012)
chr3 (221-299)||(43554291-43554371)
chr3 (366-441)||(24682519-24682594)
chr3 (332-494)||(24653501-24653664)
chr3 (145-250)||(38175790-38175894)
chr3 (195-228)||(755824-755857)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (58-298)||(8319960-8320199)
chr6 (58-299)||(8315421-8315662)
chr6 (58-299)||(27552026-27552268)
chr6 (58-298)||(17779914-17780155)
chr6 (103-298)||(17096236-17096431)
chr6 (61-300)||(27574657-27574886)
chr6 (109-298)||(17895691-17895881)
chr6 (103-298)||(14531749-14531945)
chr6 (109-299)||(17886816-17887001)
chr6 (145-260)||(6440865-6440979)
chr6 (196-237)||(17163689-17163730)
chr6 (195-233)||(7888212-7888250)
chr6 (196-285)||(17159610-17159700)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (58-299)||(31670089-31670330)
chr4 (103-299)||(53722006-53722202)
chr4 (103-298)||(10317025-10317220)
chr4 (103-299)||(8892582-8892779)
chr4 (103-298)||(27186142-27186341)
chr4 (103-305)||(43683636-43683826)
chr4 (145-299)||(44151557-44151715)
chr4 (145-298)||(3770842-3770999)
chr4 (145-298)||(44147023-44147180)
chr4 (103-299)||(50627904-50628088)
chr4 (145-298)||(41884925-41885076)
chr4 (103-202)||(35842843-35842942)
chr4 (145-299)||(31359150-31359303)
chr4 (145-300)||(49274517-49274670)
chr4 (203-298)||(31354678-31354772)
chr4 (104-264)||(53785880-53786039)
chr4 (195-247)||(45976222-45976274)
chr4 (221-271)||(35842797-35842847)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (58-299)||(8055391-8055632)
chr2 (58-298)||(8050839-8051079)
chr2 (58-298)||(6463355-6463583)
chr2 (103-298)||(12999426-12999622)
chr2 (145-299)||(36670502-36670660)
chr2 (145-299)||(36675050-36675208)
chr2 (136-298)||(13270980-13271131)
chr2 (145-299)||(35950443-35950596)
chr2 (145-298)||(41093824-41093976)
chr2 (198-285)||(29767953-29768041)
chr2 (145-233)||(34590280-34590366)
chr2 (207-244)||(27403696-27403733)
[»] scaffold0440 (2 HSPs)
scaffold0440 (145-299)||(2979-3137)
scaffold0440 (145-299)||(7505-7662)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (145-299)||(44865-45023)
scaffold0044 (145-298)||(49445-49602)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 298 - 673
Target Start/End: Original strand, 41806110 - 41806484
Alignment:
Q  298 attctcttcagtgcatatagaagcccatcttacattctttctacagttaacattcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatct 397  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41806110 attctcttcagtgcttatagaagcccgtcttacattctttctacagttaacattc-tcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatct 41806208  T
Q  398 cacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcatctaactttggagagagaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatttac 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41806209 cacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcatctaactttggagagaaaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatttac 41806308  T
Q  498 ggcttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatctttttcctgacttttctgtgctgcttgttttatctcttctggttcagaagagagaaacctaca 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41806309 ggcttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatctttttcctgacttttctgtgctgcttgttttatctcttctggttcagaagagagaaacctaca 41806408  T
Q  598 ttttgtgtttgtctaatgatcaagtgaacttgcatggtattcaaagcaactcccatcgaatgcgacctatgattct 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41806409 ttttgtgtttgtctaatgatcaagtgaacttgcatggtattcaaagcaactcccatcgaatgcgacctgtgattct 41806484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Original strand, 30410246 - 30410486
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30410246 aagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagta 30410345  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  30410346 caagcaatgtaacaaaatctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaattaaaacagaatgtgattaaccactgattg 30410445  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30410446 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 30410486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 61 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28644799 - 28644562
Alignment:
Q  61 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28644799 ttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctacatgcaaaaatatacaaaggaggtagcttatatacactgtctagctaagttgcttgaagcacaa 28644700  T
Q  161 gcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28644699 gcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtga 28644600  T
Q  261 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28644599 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 28644562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 299
Target Start/End: Original strand, 30405737 - 30405961
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30405737 aagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagta 30405836  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 || ||    
T  30405837 caagcaatgtaacaaattctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaca-----------------gaatg 30405919  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30405920 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 30405961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33072113 - 33071918
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  33072113 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctccaaca 33072014  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33072013 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaagaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 33071918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 42234656 - 42234851
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  42234656 aaaatatacaaagaaggtagtttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 42234755  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42234756 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 42234851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38757186 - 38757003
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38757186 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatatctggctaggttgcttgaatcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 38757087  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||            |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38757086 aacttgtaaca------------aactaaaacagaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 38757003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 347 - 583
Target Start/End: Original strand, 41800036 - 41800270
Alignment:
Q  347 acattcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatctcacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcatc 446  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  41800036 acattccccttgttcttcgggacctataaaatcaaataaccaggagaatctaacaaaatcaaacacaaaccataaactgtgcaggaaaaggaaatgcaca 41800135  T
Q  447 taactttggagagagaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatttacggcttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatc-tttttcctgac 545  Q
    | ||||||||||   |||||||| ||||||    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||  || ||||||||| ||||||||||     
T  41800136 tcactttggagaataaaaaacagaagtaag----atatttagaagattcacggcttgtgtttttctacctcgtttgagctcctacatcttttttcctgaa 41800231  T
Q  546 ttttctgtgctgcttgttttatc-tcttctggttcagaa 583  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41800232 ttttctgtgcttcttgttttatcttcttctagttcagaa 41800270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Original strand, 43807485 - 43807641
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgta 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43807485 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtg 43807584  T
Q  243 attaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43807585 attaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaagctaacat 43807641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 43812044 - 43812199
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgta 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43812044 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtg 43812143  T
Q  243 attaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43812144 attaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaagctaaca 43812199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 145 - 300
Target Start/End: Original strand, 202202 - 202361
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  202202 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 202301  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202302 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 202361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 145 - 300
Target Start/End: Original strand, 317039 - 317198
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  317039 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 317138  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  317139 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 317198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Original strand, 197684 - 197842
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  197684 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 197783  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197784 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 197842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Original strand, 312521 - 312679
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  312521 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 312620  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  312621 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 312679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 41945434 - 41945339
Alignment:
Q  202 aaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41945434 aaacttgtaaccaacttg-taacaaactaaaacaaagtgtgattaatcattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 41945339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41949902 - 41949801
Alignment:
Q  198 taacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaac 297  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41949902 taaccaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacagagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaagcttgaattaaaagaaactaac 41949803  T
Q  298 at 299  Q
    ||    
T  41949802 at 41949801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 42034154 - 42034087
Alignment:
Q  585 agagaaacctacattttgtgtttgtctaatgatcaagtgaacttgcatggtattcaaagcaactcccat 653  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42034154 agagaaacctacatcttgtgtttgtctaatg-tcaagtgaacttgcttggcattcaaagcaactcccat 42034087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 174
Target Start/End: Original strand, 27435169 - 27435223
Alignment:
Q  120 tagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaac 174  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27435169 tagcttatatacaatatctacttaggttgcttgaagcacaagctatgtaacaaac 27435223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 61 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30695530 - 30695293
Alignment:
Q  61 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30695530 ttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctacatacgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 30695431  T
Q  161 gcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30695430 gcaatgtaacaaactctagatcttatatactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtga 30695331  T
Q  261 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30695330 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 30695293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 32485947 - 32486143
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32485947 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaaggaggttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 32486046  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32486047 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 32486143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 61 - 299
Target Start/End: Original strand, 40367531 - 40367758
Alignment:
Q  61 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagtt-gcttgaagcaca 159  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  40367531 ttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctacatatgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctaaccaagtttgcttgaagcaca 40367630  T
Q  160 agcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||    
T  40367631 agcaatgtaacaaactctagatcttatctactagcctctaacaaacttg------------taacaaactaaaacaaaatgtgattaatctctgattgtg 40367718  T
Q  260 attatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40367719 attatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 40367758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19502504 - 19502307
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  19502504 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtttagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctatatcttattttctaacctctaaca 19502405  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgt-aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19502404 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgatttaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 19502307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 103 - 299
Target Start/End: Original strand, 26336767 - 26336965
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26336767 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 26336866  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaact-aaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26336867 aacatgtaacaaacatcataacaaactaaaaacaaaatgtgattaatcaccgattgtgattatcactaaaattaaacttgaattaaaacaaactaacat 26336965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 61 - 298
Target Start/End: Original strand, 40371669 - 40371892
Alignment:
Q  61 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 160  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              |||||    
T  40371669 ttatgatgaaattgtagttgattcttattgattctacatatgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctaac--------------cacaa 40371754  T
Q  161 gcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtga 260  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  40371755 acaatgtaataaactctagatcttatctactagcctctaacaaacttgtaacaatcttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatctctgattgtga 40371854  T
Q  261 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40371855 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 40371892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36632497 - 36632314
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  36632497 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 36632398  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||            |||||||||||| ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36632397 aacttgtaaca------------aactaaaacaaagtgtgattattcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 36632314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 43385138 - 43384972
Alignment:
Q  113 aaggaggtagctt-atatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaa 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  43385138 aaggaggtagctttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaaccctagattttatttgctaacttctaacaaacttgtaa 43385039  T
Q  212 caaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaact 278  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  43385038 caaacttcataacaaactaaaagcaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaact 43384972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Original strand, 7099374 - 7099532
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7099374 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7099473  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7099474 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 7099532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12023446 - 12023288
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12023446 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 12023347  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12023346 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 12023288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 7103943 - 7104100
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7103943 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7104042  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7104043 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7104100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12018888 - 12018731
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12018888 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 12018789  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12018788 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 12018731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16798826 - 16798668
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16798826 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 16798727  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
     |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798726 gattaaccacttattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 16798668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16794265 - 16794108
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16794265 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 16794166  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16794165 gattaaccacttattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 16794108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 117 - 250
Target Start/End: Original strand, 20830304 - 20830437
Alignment:
Q  117 aggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaac 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20830304 aggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaacacttgatcttatttgctaatctctaacaaacttgtaacaaac 20830403  T
Q  217 ttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaacca 250  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  20830404 ttcataacaaactgaaactaaatgtgattaacca 20830437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10274698 - 10274546
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  10274698 gttgcttgaagtacaagctaaataacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 10274600  T
Q  245 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10274599 taaccattaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 10274546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10277312 - 10277198
Alignment:
Q  190 ctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaac 289  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277312 ctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaac 10277213  T
Q  290 aaactaacattctct 304  Q
    |||||||||| ||||    
T  10277212 aaactaacatcctct 10277198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 37682182 - 37682035
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaat-gt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||| | ||    
T  37682182 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaactt-----------cataacaaactaaaacaaacttgt 37682094  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682093 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 37682035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 298 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 278689 - 278541
Alignment:
Q  298 attctcttcagtgcatatagaagcccatcttacattctttctacagttaacattcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatct 397  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || || |   |||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  278689 attctcttcagtgcttatagaagcacacctaatcatcttcctacatttaacattcctcttgttctttgggacctataatatcaaatgacaaggagaattt 278590  T
Q  398 cacaaaatc-aaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcat 445  Q
    || |||||| |||  ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  278589 cagaaaatcaaaatccaaaccataaaccgtggtggaaaaggaaatgcat 278541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37658878 - 37658732
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaat-gt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||           |||||||| |||||||||| | ||    
T  37658878 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaactt-----------cataacaagctaaaacaaacttgt 37658790  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37658789 gattaaccactgattatgattatgactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 37658732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 250
Target Start/End: Original strand, 20808675 - 20808749
Alignment:
Q  176 ctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaacca 250  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  20808675 ctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtaactaacttcataacaaactgaaactaaatgtgattaacca 20808749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 467 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 278511 - 278393
Alignment:
Q  467 cagtagtaagtgaaatatttagaagatttacgg--cttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatctttttcctgacttttctgtgctgcttgttt 564  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| | ||  ||| ||||||| | |||||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||||    
T  278511 cagtagtaagggagacatttagaagattcatgggccttctgtttgtta-cctcatttgagctcctagatctttttcctgaattttctgtgcttgtggttt 278413  T
Q  565 tat-ctcttctggttcagaa 583  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  278412 tatcctcttctggttcagaa 278393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5733114 - 5733082
Alignment:
Q  142 taagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaac 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5733114 taagttgcttgaagcacaagcaaagtaacaaac 5733082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 11)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 58 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27761638 - 27761396
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 156  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27761638 aagttatgatgaaaattgtaaatgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 27761539  T
Q  157 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27761538 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctacaaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtgattaaccactgatt 27761439  T
Q  257 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27761438 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 27761396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27757087 - 27756846
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 156  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27757087 aagttatgatgaaaattgtaaatgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 27756988  T
Q  157 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  27756987 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctacaaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgcgattaaccactgatt 27756888  T
Q  257 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27756887 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 27756846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 61 - 292
Target Start/End: Original strand, 47419498 - 47419729
Alignment:
Q  61 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  47419498 ttatgatgaaattgtaattgatttttattgattctacatacgaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaaacacaa 47419597  T
Q  161 gcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtga 260  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  47419598 acaatgtaacaaactctagatattatctgctaacctctaagaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtga 47419697  T
Q  261 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47419698 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaa 47419729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22901396 - 22901154
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaat-tgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 156  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22901396 aagttatgatgaatttgtaaaatgatctttattgattctacatacaaaa-tatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagc 22901298  T
Q  157 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtaattaaccattgat 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||    
T  22901297 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgat 22901198  T
Q  256 tgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22901197 tgtgattatcactaaaactaaactttaattaaaacaaactaaca 22901154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 117 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 35705815 - 35705633
Alignment:
Q  117 aggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaac 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35705815 aggtagcttatatacaatgtctagctg-gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaac 35705717  T
Q  217 ttcat-aacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35705716 tccataaacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 35705633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 7466485 - 7466669
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7466485 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 7466584  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||            ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7466585 aacttg------------taacaaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7466669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 109 - 285
Target Start/End: Original strand, 733634 - 733811
Alignment:
Q  109 tacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  733634 tacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgctcgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaaattg 733733  T
Q  209 taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaacca-ttgattgtgattatcactaaactaaacttgaatta 285  Q
    ||||||| |||||||||||||||   || |||| |||||||| || |   ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  733734 taacaaatttcataacaaactaactgaatatgtgattaaccatttaaacatgattatcactaatctaaacttgaatta 733811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Original strand, 7940083 - 7940241
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7940083 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7940182  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940183 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 7940241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 7944636 - 7944793
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7944636 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7944735  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7944736 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7944793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 286
Target Start/End: Original strand, 13828087 - 13828248
Alignment:
Q  126 atatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataaca 225  Q
    ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13828087 atatacactatctagttaggtagcttgaagcacaagcaatgtaacagaccctaactattattagatacactctaacaaacttgtaacaaacttcagaaca 13828186  T
Q  226 aactaaaacaaaatgtaattaacc-attgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaa 286  Q
    ||| |||  ||||||| ||||||| | | |   |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13828187 aacaaaatgaaaatgtgattaaccaactaaacatgattatcactaaggtaaacttgaattaa 13828248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 37355669 - 37355573
Alignment:
Q  190 ctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-aatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaa 286  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| | | ||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  37355669 ctaatctctaagaaacttgtaacaactttcataacaaactaaagcaataatatgattaaccactaagtgtgattatcact-aggtaaacttgaattaa 37355573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39794070 - 39793831
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39794070 aagttatgatgaaaatgtaattgatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 39793972  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  39793971 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgagattaaccactgattg 39793872  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39793871 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 39793831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Original strand, 16588395 - 16588635
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  16588395 aagttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctccatacaaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttaaaaca 16588494  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  16588495 caagcaatgtaacaaactctagatcttatatgataacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccacttattg 16588594  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16588595 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 16588635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26316240 - 26316012
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26316240 aagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctgcatacaaaa-tatacaaaggaagtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagca 26316142  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  26316141 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaaca------------aactaaaacagaatgtgattaaccactgattg 26316054  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26316053 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 26316012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26311749 - 26311522
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26311749 aagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctgcatacaaaa-tatacaaaggaagtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagca 26311651  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  26311650 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaaca------------aactaaaacagaatgtgattaaccactgattg 26311563  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26311562 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 26311522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 103 - 299
Target Start/End: Original strand, 43591783 - 43591979
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  43591783 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagccaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagattttatttgctaacctctaaca 43591882  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43591883 atattgtaacaaacttcataacaaactaaaataaagtgcgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 43591979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10504588 - 10504435
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  10504588 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 10504490  T
Q  245 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10504489 taatcactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 10504435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41879977 - 41879945
Alignment:
Q  142 taagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaac 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41879977 taagttgcttgaagcacaagcaaagtaacaaac 41879945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 18)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 58 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21847351 - 21847108
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847351 aagttatgatgaaattgtaaatgatctttattgattctatatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 21847252  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  21847251 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaactgtgattaaccactgattg 21847152  T
Q  258 tgattatcact-aaactaaacttgaatt-aaaacaaactaacat 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21847151 tgattatcactaaaactaaacttgaattaaaaacaaactaacat 21847108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 58 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21850441 - 21850198
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850441 aagttatgatgaaattgtaaatgatctttattgattctatatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 21850342  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  21850341 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaactgtgattaaccactgattg 21850242  T
Q  258 tgattatcact-aaactaaacttgaatt-aaaacaaactaacat 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21850241 tgattatcactaaaactaaacttgaattaaaaacaaactaacat 21850198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9105470 - 9105275
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  9105470 aaaatatacaaaggaggtagctcatatacaatgtctagttaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaaca 9105371  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9105370 aacttgtaacatacttcataacaaactaaagcaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 9105275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 11004365 - 11004560
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11004365 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaggttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 11004464  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11004465 aacttgtaacaatcttcataacaagctaaaacaaaatgtgattattcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 11004560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 103 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43547920 - 43547722
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  43547920 aaaatatacaaaggagatagcttatatacaatgtcttgctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaaca 43547821  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaact-aaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43547820 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaacaaaatgtaattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaagctaacat 43547722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9697783 - 9697586
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9697783 aaaatatacaaaggaggcagcttatatacaatgtctagctaagtttcttgaagcacaagcaatgttacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 9697684  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaact-aaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9697683 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaacaaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 9697586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Original strand, 54171924 - 54172082
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  54171924 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 54172023  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54172024 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 54172082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Original strand, 54167344 - 54167502
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatc--ttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  54167344 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacacccttatttggtaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 54167443  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54167444 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 54167502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 39399127 - 39399279
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  39399127 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 39399225  T
Q  245 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39399226 taaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 39399279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43554765 - 43554645
Alignment:
Q  102 aaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaac 201  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  43554765 aaaaatatacaaaagaggtagctcatatacaatgtcttactaagttgcttgaaacagaagcaatgtaataaactctagatcttatttgttaacctctaac 43554666  T
Q  202 aaacttgtaacaaacttcata 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43554665 aaacttgtaacaaacttcata 43554645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 298 - 568
Target Start/End: Original strand, 24685192 - 24685444
Alignment:
Q  298 attctcttcagtgcatatagaagcccatcttacattctttctacagttaacattcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatct 397  Q
    ||||||||| |||| |||| || | ||||| | ||||||  | || ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24685192 attctcttctgtgcttataaaaccacatctcatattcttcatgcatttaacattcctcttgttcttggggacctataaaatcaaataaccagaagaatct 24685291  T
Q  398 cacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcatctaactttggagagagaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatttac 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                   |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  |    
T  24685292 cacaaaatcaaacacaaaccataaactgtgcaggaaaa------------------agagagagaaaaacagtggtaagtgcaacatttagaagattcgc 24685373  T
Q  498 ggcttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatctttttcctgacttttctgtgctgcttgttttatc 568  Q
    ||||| |||||||| |||||| || || |||||  |||||||||||| || ||| |||| || ||||||||    
T  24685374 ggcttttgtttgtctacctcagtcgagctcctaggtctttttcctgaattctctctgcttctggttttatc 24685444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 349 - 544
Target Start/End: Original strand, 24631841 - 24632035
Alignment:
Q  349 attcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatctcacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcatcta 448  Q
    |||||||||||||   |||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || ||| |||||||| | ||  |||||| ||||| ||| |     
T  24631841 attcctcttgttctttgggactaataaaatcaaataaccgggataatctcacaaaatcgaaaacagaccataaattgtgttggaaaaagaaatccatatc 24631940  T
Q  449 actttggagagagaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatttacggcttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatctttttcctga 544  Q
    |||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  24631941 acttggaagaga-agaaacattagtaagtgaaatatttagaagatttgtggcttgtatctgtctacctcattcaagctcctggatctttttcctga 24632035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 756012 - 755891
Alignment:
Q  117 aggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaga-tcttatctactaac-ctctaacaaacttgtaacaa 214  Q
    ||||||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||   | |||| || | || ||||||||||||||||||||    
T  756012 aggtagcttatatacaccatctagttaggtagcttgaagcacaagcaatgtaacaaaccctaaccttttat-tagttacactctaacaaacttgtaacaa 755914  T
Q  215 acttcataacaaactaaaacaaa 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  755913 acttcaaaacaaactaaaacaaa 755891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43554371 - 43554291
Alignment:
Q  221 taacaaactaaaa-caaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43554371 taacaaactaaaaacaaaatgtgactaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 43554291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 366 - 441
Target Start/End: Original strand, 24682519 - 24682594
Alignment:
Q  366 ggacctataaaatcaaataacaaggagaatctcacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaat 441  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24682519 ggacctataaaatcaaagaaccaggagaatctcataaaatcaaacgcaaacaataaactgtgcaggaaaagtaaat 24682594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 332 - 494
Target Start/End: Original strand, 24653501 - 24653664
Alignment:
Q  332 ttctttctacagttaacattcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatct--cacaaaatcaaacacaaaccataaactttgca 429  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  |||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  24653501 ttcttcctacatttaacattcctctctttctttcggacctataaaatcaaagaaccaggagaatctcgcataaaatcaaacacacacaataaactgtgca 24653600  T
Q  430 gg--aaaaggaaatgcatctaactttggagagagaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatt 494  Q
    ||  ||||| |||||||| | | | |||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24653601 ggaaaaaagtaaatgcatatca-tatggaaaaag--aaacagtagtaagtgaaatatttagaagatt 24653664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 250
Target Start/End: Original strand, 38175790 - 38175894
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  38175790 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-atcttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaaactaaatgtgat 38175888  T
Q  245 taacca 250  Q
    ||||||    
T  38175889 taacca 38175894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 755857 - 755824
Alignment:
Q  195 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaac 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  755857 ctctaacaaacttgtaacaaacttcaaaacaaac 755824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Original strand, 8319960 - 8320199
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8319960 aagttatgatgaaaatgaaattgatctttattgattctacata-agaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagtttcttgaagca 8320058  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  8320059 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacatattgtgattaaccactgattg 8320158  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8320159 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8320199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 58 - 299
Target Start/End: Original strand, 8315421 - 8315662
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8315421 aagttatgatgaaaatgaaattgatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 8315519  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtaattaaccattgatt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||    
T  8315520 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgatt 8315619  T
Q  257 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8315620 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 8315662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 58 - 299
Target Start/End: Original strand, 27552026 - 27552268
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatac-aaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27552026 aagttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctccatacgaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 27552125  T
Q  157 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27552126 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacgtttaacaaacctgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgatt 27552225  T
Q  257 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27552226 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 27552268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17780155 - 17779914
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780155 aagttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctacatacgaaaatgtacaaaggagatagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 17780056  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||    
T  17780055 caagcaatgtaacaaactctaaatcttatctactagcctctaacaaacttttaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatctctgattg 17779956  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaatt-aaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17779955 tgattatcactaaactaaacttgaattcaaaacaaactaaca 17779914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 17096236 - 17096431
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17096236 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactatagatcttatctgctaacctctaaca 17096335  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17096336 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 17096431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 61 - 300
Target Start/End: Original strand, 27574657 - 27574886
Alignment:
Q  61 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatac-aaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcaca 159  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27574657 ttatggtgaaattgtaattgattcttattgattttccatacgaaaaatgttcaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcaca 27574756  T
Q  160 agcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtg 259  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27574757 agcaatgtaacaaactttagatcttatctgctaacctc-----------taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtg 27574845  T
Q  260 attatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27574846 attatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 27574886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 109 - 298
Target Start/End: Original strand, 17895691 - 17895881
Alignment:
Q  109 tacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17895691 tacaaaggaggtagcttatatacaatgcctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaattctagatcttatttgctaacctctaacaaacttg 17895790  T
Q  209 taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17895791 taacaaacttcagaacaaactaaaataaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 17895881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 14531749 - 14531945
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14531749 aaaatatacaaaggtggtagagtatatacaatgtctagctaagttgcttcaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 14531848  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14531849 aacctgtaacaaacttcataacgaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgattataactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 14531945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 109 - 299
Target Start/End: Original strand, 17886816 - 17887001
Alignment:
Q  109 tacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  17886816 tacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagctgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaactt- 17886914  T
Q  209 taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
          |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17886915 -----tactttataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 17887001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 260
Target Start/End: Original strand, 6440865 - 6440979
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  6440865 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 6440963  T
Q  245 taaccattgattgtga 260  Q
    |||||| | |||||||    
T  6440964 taaccactaattgtga 6440979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17163730 - 17163689
Alignment:
Q  196 tctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17163730 tctaaccaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaaa 17163689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 233
Target Start/End: Original strand, 7888212 - 7888250
Alignment:
Q  195 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaa 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7888212 ctctaacaaagttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaa 7888250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17159700 - 17159610
Alignment:
Q  196 tctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaa-ccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaatta 285  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | | || || | | | ||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17159700 tctaaccaacttgtaacaaacgtcaaaacaaactaaaacaaagtatgatcaatcaactaatcatgattatcactaatctaaacttgaatta 17159610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31670330 - 31670089
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31670330 aagttatgatgaaattgtaaatgatctttattgattctacattcaaaa-tatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagca 31670232  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  31670231 gaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaactgtgattaaccactgattg 31670132  T
Q  258 tgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31670131 tgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 31670089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 103 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 53722202 - 53722006
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  53722202 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatatagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctagcctctaaca 53722103  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53722102 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 53722006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 10317025 - 10317220
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10317025 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 10317124  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10317125 aacttgtaacaaacttcataacaaactacaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattataactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 10317220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 103 - 299
Target Start/End: Original strand, 8892582 - 8892779
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  8892582 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcgatgtaacaaactctatatcttatttgctaatctctaaca 8892681  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892682 aatttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 8892779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27186341 - 27186142
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27186341 aaaatatacaaaggaggcagcttatatacaatgtctagctaagtttcttgaagcacaagcaatgttacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 27186242  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataac-aaact--aaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27186241 aacttgtaacaaacttcataacaaaactaaaaaacaaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 27186142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 305
Target Start/End: Original strand, 43683636 - 43683826
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||         
T  43683636 aaaatatacaaaggatgtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctatatcttatttgctaacctc----- 43683730  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacattct 302  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  43683731 ------taacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaataaacttgaattaaaac-aactaacattgt 43683823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44151715 - 44151557
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44151715 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44151616  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44151615 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 44151557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3770999 - 3770842
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3770999 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 3770900  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3770899 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 3770842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 44147180 - 44147023
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44147180 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44147081  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44147080 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 44147023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 103 - 299
Target Start/End: Original strand, 50627904 - 50628088
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  50627904 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagtacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 50628003  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    ||||||            ||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50628004 aacttg------------taacaaactaaaaaaaaaagtgattaatcactgattgtgatta-cactaaaactaatcttgaattaaaacaaactaacat 50628088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 41885076 - 41884925
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  41885076 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-atcttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 41884979  T
Q  245 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41884978 taaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaaccaaca 41884925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35842942 - 35842843
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  35842942 aaaatatacaaaggaggtagtttatatacaatgtctaactaagttgcttgaagcacaagcattgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 35842843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31359303 - 31359150
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||| ||    
T  31359303 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcatagcaaactgaatctaaatgtgat 31359205  T
Q  245 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359204 taaccactaattgtgattatcattaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 31359150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 300
Target Start/End: Original strand, 49274517 - 49274670
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  49274517 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 49274614  T
Q  245 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 300  Q
    |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49274615 taaccactaattatgatcatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 49274670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31354772 - 31354678
Alignment:
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || | |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31354772 aacttgtaacaaaattcataacaa-ctgaatctaaatgtgattaaccactaattgtaattatcactaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 31354678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 53786039 - 53785880
Alignment:
Q  104 aaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaa 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   |||   |||   ||||||||    
T  53786039 aaatgtacaaag-aggtagcttatatactagaactagttaggttgcttgaagcacaagctatgtaacaaacccta-actatataagctagtttctaacaa 53785942  T
Q  204 acttgtaacaaacttcataacaaactaaaaca--aaatgtaattaaccattgattgtgattat 264  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  53785941 acttgtaacaaa-ttcttaacaaacaaaaacactaaatgtgattaaccactgagtgtgattat 53785880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 247
Target Start/End: Original strand, 45976222 - 45976274
Alignment:
Q  195 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaa 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  45976222 ctctaaaaaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaagatgtgattaa 45976274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35842847 - 35842797
Alignment:
Q  221 taacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaa 271  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35842847 taacatactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa 35842797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8055632 - 8055391
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 156  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055632 aagttatgatgaaaattgtaaaagatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 8055534  T
Q  157 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  8055533 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgcaacaaacttcataacaaactaaaatagaatgtgattaaccactgatt 8055434  T
Q  257 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055433 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 8055391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8051079 - 8050839
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 156  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8051079 aagttatgatgaaaattgtaaaagatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggcagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagc 8050981  T
Q  157 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  8050980 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaatagaatgtgattaaccactgatt 8050881  T
Q  257 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050880 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8050839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Original strand, 6463355 - 6463583
Alignment:
Q  58 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6463355 aagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctacatactaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagca 6463454  T
Q  158 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 257  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6463455 caaataatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg------------taacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattg 6463542  T
Q  258 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6463543 tgattatcactaaactaaacttgaattaagacaaactaaca 6463583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 12999426 - 12999622
Alignment:
Q  103 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 202  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12999426 aaaatatacaaaggagatagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagtaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 12999525  T
Q  203 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12999526 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgttattatcactaaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 12999622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36670660 - 36670502
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36670660 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 36670561  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36670560 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 36670502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36675208 - 36675050
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36675208 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 36675109  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36675108 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 36675050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 298
Target Start/End: Original strand, 13270980 - 13271131
Alignment:
Q  136 tctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||            |||||||||||||| |    
T  13270980 tctagctaagttgcttgaagcaaaaacaatgtaacaaactttagatcttatttactaacctctaacaaactt------------ataacaaactaaaata 13271067  T
Q  236 aaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13271068 aagtgtaattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 13271131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Original strand, 35950443 - 35950596
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | ||||    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  35950443 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttacgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaacctaaatgtgat 35950541  T
Q  245 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35950542 taaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 35950596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 41093976 - 41093824
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| || | |||| | ||    
T  41093976 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaatttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatatgat 41093878  T
Q  245 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41093877 taatcactaattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaaccaaca 41093824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29768041 - 29767953
Alignment:
Q  198 taacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaacca-ttgattgtgattatcactaaactaaacttgaatta 285  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| || || || || ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29768041 taaccaacttgtaacaaactttaaaacaaactaaaacaaagtgtgatcaatcaattaatcatgattatcactaaactaaacttgaatta 29767953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34590366 - 34590280
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaa 233  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||| |||  ||| || | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34590366 gttgcttaaagcacaagctatataacaaaccctaactct-atatgctaatctctaacaaacttgtaacaaa-ttcataacaaactaaaa 34590280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 244
Target Start/End: Original strand, 27403696 - 27403733
Alignment:
Q  207 tgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27403696 tgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaaagtgtaat 27403733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3137 - 2979
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3137 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 3038  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3037 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 2979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7662 - 7505
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgta 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  7662 gttgcttgaaacacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaattgtg 7563  T
Q  243 attaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7562 attaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 7505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Original strand, 44865 - 45023
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44865 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44964  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 299  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44965 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 45023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 49445 - 49602
Alignment:
Q  145 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  49445 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 49544  T
Q  242 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49545 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 49602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University