View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3925_low_12 (Length: 250)

Name: NF3925_low_12
Description: NF3925
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3925_low_12
NF3925_low_12
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (24-240)||(22439727-22439942)
chr2 (24-239)||(35959425-35959640)
chr2 (24-240)||(2182532-2182748)
chr2 (24-240)||(6431611-6431827)
chr2 (24-240)||(29044193-29044409)
chr2 (24-240)||(29768384-29768600)
chr2 (24-240)||(2994856-2995072)
chr2 (24-240)||(25879559-25879775)
chr2 (26-240)||(2611372-2611586)
chr2 (24-239)||(7298922-7299135)
chr2 (28-239)||(6283459-6283670)
chr2 (27-219)||(1834162-1834354)
chr2 (24-240)||(31452697-31452911)
chr2 (24-210)||(6419766-6419956)
chr2 (24-210)||(44092621-44092807)
chr2 (24-169)||(38446152-38446297)
chr2 (24-169)||(26260096-26260242)
chr2 (27-211)||(38086729-38086911)
chr2 (50-169)||(17740392-17740511)
chr2 (24-240)||(42516978-42517183)
chr2 (24-109)||(45434762-45434847)
chr2 (41-240)||(12465758-12465957)
chr2 (86-240)||(42077044-42077198)
chr2 (28-98)||(18681605-18681673)
chr2 (24-59)||(42077176-42077211)
chr2 (37-89)||(43639205-43639257)
chr2 (115-209)||(15899610-15899704)
chr2 (122-188)||(43639120-43639186)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (24-240)||(24133851-24134067)
chr3 (28-239)||(41129540-41129751)
chr3 (26-239)||(43010050-43010263)
chr3 (24-240)||(42294204-42294420)
chr3 (24-239)||(31405733-31405948)
chr3 (24-234)||(36265646-36265856)
chr3 (24-240)||(25593486-25593702)
chr3 (24-235)||(4356837-4357048)
chr3 (24-210)||(41636408-41636594)
chr3 (24-210)||(7046586-7046772)
chr3 (24-240)||(9338074-9338291)
chr3 (50-239)||(14751900-14752089)
chr3 (24-239)||(46136177-46136392)
chr3 (27-200)||(54447699-54447872)
chr3 (24-240)||(50638578-50638794)
chr3 (26-241)||(22523497-22523711)
chr3 (26-169)||(51302515-51302658)
chr3 (27-169)||(26020180-26020322)
chr3 (50-240)||(26994600-26994790)
chr3 (26-240)||(45387579-45387793)
chr3 (27-240)||(24120113-24120313)
chr3 (69-240)||(39889416-39889587)
chr3 (92-240)||(35761391-35761538)
chr3 (24-106)||(52274479-52274561)
chr3 (107-240)||(4481744-4481877)
chr3 (178-240)||(26020319-26020381)
chr3 (163-240)||(25536931-25537008)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (24-239)||(23555842-23556057)
chr1 (24-240)||(38671945-38672161)
chr1 (24-239)||(10312086-10312301)
chr1 (24-239)||(10805113-10805328)
chr1 (24-238)||(15849910-15850124)
chr1 (24-240)||(12298229-12298445)
chr1 (24-210)||(5499773-5499959)
chr1 (27-240)||(39919699-39919912)
chr1 (24-240)||(18342653-18342869)
chr1 (24-240)||(19507152-19507368)
chr1 (24-210)||(16452510-16452696)
chr1 (24-210)||(16461662-16461848)
chr1 (24-240)||(44912692-44912908)
chr1 (24-239)||(15321711-15321926)
chr1 (28-240)||(26257485-26257697)
chr1 (24-240)||(47367311-47367526)
chr1 (27-240)||(17386125-17386339)
chr1 (24-240)||(13077389-13077605)
chr1 (50-240)||(42384295-42384485)
chr1 (27-240)||(44779294-44779506)
chr1 (24-240)||(27090633-27090850)
chr1 (27-240)||(42649853-42650065)
chr1 (49-240)||(5506739-5506930)
chr1 (27-240)||(29522881-29523095)
chr1 (24-239)||(34049816-34050035)
chr1 (24-215)||(5616614-5616805)
chr1 (27-240)||(6305119-6305320)
chr1 (24-118)||(37536120-37536214)
chr1 (24-207)||(7329715-7329898)
chr1 (28-240)||(46313720-46313932)
chr1 (24-151)||(18700936-18701051)
chr1 (135-201)||(31316142-31316208)
chr1 (176-225)||(31502330-31502379)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (24-240)||(14921461-14921677)
chr8 (24-240)||(16364794-16365010)
chr8 (24-240)||(32983014-32983230)
chr8 (24-239)||(38600640-38600855)
chr8 (37-239)||(41478256-41478458)
chr8 (24-240)||(7382984-7383200)
chr8 (24-240)||(24580536-24580752)
chr8 (24-215)||(44710196-44710387)
chr8 (50-240)||(8000111-8000301)
chr8 (24-210)||(23444508-23444694)
chr8 (24-216)||(7960364-7960556)
chr8 (27-240)||(40680444-40680657)
chr8 (50-240)||(35056274-35056464)
chr8 (24-210)||(44755628-44755826)
chr8 (27-231)||(13450780-13450984)
chr8 (43-207)||(12638113-12638275)
chr8 (27-240)||(4158114-4158327)
chr8 (53-164)||(40860830-40860940)
chr8 (121-239)||(41478585-41478703)
chr8 (28-240)||(4376986-4377198)
chr8 (24-155)||(2121005-2121136)
chr8 (28-125)||(39506442-39506539)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (24-240)||(18295272-18295488)
chr5 (24-239)||(34855411-34855626)
chr5 (24-239)||(13916583-13916798)
chr5 (24-216)||(17869859-17870051)
chr5 (24-239)||(10017859-10018074)
chr5 (24-232)||(15397660-15397868)
chr5 (24-209)||(31624267-31624452)
chr5 (24-240)||(15677990-15678206)
chr5 (24-240)||(18158473-18158689)
chr5 (24-239)||(14949337-14949552)
chr5 (24-210)||(27054310-27054496)
chr5 (27-240)||(38254788-38255001)
chr5 (28-240)||(40084078-40084291)
chr5 (27-240)||(11877557-11877758)
chr5 (27-240)||(28210127-28210340)
chr5 (24-169)||(36113279-36113424)
chr5 (47-240)||(370251-370444)
chr5 (86-239)||(3880946-3881099)
chr5 (28-240)||(27332314-27332526)
chr5 (64-173)||(858803-858912)
chr5 (24-59)||(3880933-3880968)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (24-239)||(46903706-46903921)
chr4 (32-240)||(3095335-3095543)
chr4 (24-240)||(17981112-17981328)
chr4 (24-210)||(31842971-31843157)
chr4 (24-240)||(33239730-33239946)
chr4 (27-210)||(5258845-5259028)
chr4 (24-240)||(12582194-12582410)
chr4 (24-240)||(49389527-49389743)
chr4 (24-210)||(50636988-50637174)
chr4 (27-239)||(4422156-4422368)
chr4 (24-240)||(29590284-29590500)
chr4 (26-210)||(42431572-42431756)
chr4 (27-182)||(35041658-35041812)
chr4 (24-207)||(45783723-45783905)
chr4 (27-240)||(48659415-48659627)
chr4 (27-238)||(20392740-20392952)
chr4 (24-169)||(22270227-22270372)
chr4 (27-210)||(34553731-34553914)
chr4 (24-133)||(36488924-36489033)
chr4 (24-240)||(29525200-29525416)
chr4 (24-240)||(517643-517847)
chr4 (28-240)||(34432815-34433018)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (24-235)||(31377465-31377676)
chr7 (24-240)||(45470174-45470390)
chr7 (24-239)||(21441776-21441991)
chr7 (24-210)||(2940937-2941123)
chr7 (24-240)||(2196139-2196355)
chr7 (24-240)||(5667171-5667388)
chr7 (24-240)||(27595450-27595666)
chr7 (37-240)||(41631393-41631596)
chr7 (24-240)||(10227953-10228169)
chr7 (24-216)||(13391173-13391365)
chr7 (24-210)||(23670964-23671150)
chr7 (24-240)||(41902651-41902867)
chr7 (24-240)||(43341274-43341490)
chr7 (24-210)||(15757463-15757649)
chr7 (24-240)||(32584913-32585122)
chr7 (26-240)||(46191483-46191697)
chr7 (24-210)||(43595986-43596174)
chr7 (37-169)||(44848170-44848302)
chr7 (24-240)||(21806595-21806799)
chr7 (24-240)||(48829234-48829450)
chr7 (24-156)||(28489363-28489495)
chr7 (27-168)||(34002609-34002749)
chr7 (104-240)||(44409939-44410074)
chr7 (116-210)||(12419059-12419153)
chr7 (104-240)||(33450141-33450277)
chr7 (92-167)||(35709781-35709856)
chr7 (26-59)||(35709764-35709797)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (24-239)||(17156320-17156535)
chr6 (27-240)||(4229647-4229860)
chr6 (24-240)||(1101283-1101499)
chr6 (24-240)||(13041509-13041724)
chr6 (26-240)||(34858223-34858438)
chr6 (24-240)||(4174031-4174247)
chr6 (24-210)||(1558726-1558912)
chr6 (26-240)||(14500095-14500309)
chr6 (59-240)||(32187132-32187313)
chr6 (27-240)||(478995-479208)
chr6 (26-215)||(11982275-11982463)
chr6 (26-232)||(33042849-33043054)
chr6 (32-234)||(27797548-27797749)
chr6 (28-154)||(7458884-7459010)
chr6 (86-167)||(32158173-32158254)
chr6 (24-62)||(17607927-17607965)
chr6 (163-219)||(3027236-3027292)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (57-239)||(10703-10885)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (24-169)||(9290-9435)
[»] scaffold0886 (1 HSPs)
scaffold0886 (96-240)||(1672-1816)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 22439727 - 22439942
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22439727 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaaggcatgtttagccta 22439826  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||  ||    
T  22439827 tttaataggtcaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtagg-ctgataatatgttttcaggtcagtccatgcttttaaataggtcaggtcaggcc 22439925  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
    |||||||| | ||||||    
T  22439926 aagaaaaatgacctatg 22439942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35959640 - 35959425
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  35959640 aggctttgttgttataggcttttaagtatgctttaatctagttaaaatttacttgtagttaaataggcttttaagtaggctttgaggtatgtttaactta 35959541  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||    
T  35959540 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatataaagtaggcctgtaagtaggctttcaggtcagtccaggcttttaaataggtcaggccagacc 35959441  T
Q  224 aagaaaaacggcctat 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  35959440 aagaaaaacggcctat 35959425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 2182532 - 2182748
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2182532 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtagactttaagacatgtttaaccta 2182631  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  | |||||||||||| | ||| | ||||||||||||  || ||||  ||    
T  2182632 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggtctgtaagtaggctttcaggccggtccatgcttttaaataggccaagtcaggcc 2182731  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  2182732 tagaaaaacggcctatg 2182748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6431827 - 6431611
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6431827 aggctttgttgttataggcttttatgtaagctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 6431728  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || |||    
T  6431727 tttagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtagacctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggccaggccagacc 6431628  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  6431627 tagaaaaacggcctatg 6431611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29044409 - 29044193
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29044409 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 29044310  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||  ||    
T  29044309 tttagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatttgaagtagtcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggccaggtcaggcc 29044210  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||| ||||||||    
T  29044209 tagaaaaatggcctatg 29044193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29768600 - 29768384
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29768600 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtagtctttaagacatgtttaaccta 29768501  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||  ||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  ||    
T  29768500 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcatgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggccaggccaggcc 29768401  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  29768400 tagaaaaacggcctatg 29768384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 2994856 - 2995072
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  2994856 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagatatgtttaaccta 2994955  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  ||    
T  2994956 tttagtatgccaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtaggcttgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggccaggccaggcc 2995055  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  2995056 tagaaaaacggcctatg 2995072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 25879559 - 25879775
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25879559 aggctttgctgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaatagacttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 25879658  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| || || || |||||||||||  |||| ||  ||    
T  25879659 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccaatccagacttttaaataggccaggccaggcc 25879758  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  25879759 tagaaaaacggcctatg 25879775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2611586 - 2611372
Alignment:
Q  26 gctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatt 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  2611586 gctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataagcttttaagtaggcttgaagacatgtttaacctatt 2611487  T
Q  126 taataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaa 225  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||  || ||| |    
T  2611486 tagtagaccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggccagaccagaccta 2611387  T
Q  226 gaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||    
T  2611386 aaaaaacggcctatg 2611372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7299135 - 7298922
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  7299135 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagttaaatagg--cttaagtaggctttaaggcatgtttagctta 7299038  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| | || |||    
T  7299037 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatataaagtaggcttgtaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaatcggtcaagccagacc 7298938  T
Q  224 aagaaaaacggcctat 239  Q
    |||||||||| |||||    
T  7298937 aagaaaaacgacctat 7298922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6283670 - 6283459
Alignment:
Q  28 tttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattta 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  6283670 tttgttgttacaggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagttaaatagacatttaagtaggctttaaggcatgtttagcttattta 6283571  T
Q  128 ataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaaga 227  Q
     |||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||    
T  6283570 gtaggtcaaatgaactatttgatggtcttaatataaagtaggcctgtaagtaggctttcaggtcagtccagacttttaaataggtcaggccaggccaaga 6283471  T
Q  228 aaaacggcctat 239  Q
    ||||||||||||    
T  6283470 aaaacggcctat 6283459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Original strand, 1834162 - 1834354
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||     
T  1834162 ctttgttgctataggcttttaattaggctttaatctagttaaaatttacttatagtcaaataggcttttaggtagactttaaggcctgtttagcctattc 1834261  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtca 219  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1834262 agtaggccaaatgaactatttgatggccttattgttaagtaggcctgtaattaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaggtca 1834354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 31452697 - 31452911
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| |   ||||| || |    
T  31452697 aggctttgttgttataggcttttaagtagactttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggatgtaatgtccgtttagccaa 31452796  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||  ||    
T  31452797 tttaataggccaaatg-actatttgatggccttaatgtaaagtaagcctgaaagtaggctttcaggccagtc-agacttttaaataggtcaggtcaggcc 31452894  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
    |||||||||| ||||||    
T  31452895 aagaaaaacgacctatg 31452911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 6419766 - 6419956
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6419766 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 6419865  T
Q  124 tttaataggccaaatg----aactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||| |||||||||||    |||||||||||| |||||| || || |||| |||  | ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  6419866 tttagtaggccaaatgaactaactatttgatggccttaatgtgaattaggcctgtaagtagactttcatgtcagtccaggcttttaaatag 6419956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 44092621 - 44092807
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44092621 aggctttgttgttataggcttttatgtaggcttgaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataaacttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 44092720  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataa-taggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| || || |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  44092721 tttagtaggccaaatgaattatttgatggccttaatgtgaagtgggcct-ataagtaggctttcaggcaagtccaggcttttaaatag 44092807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Original strand, 38446152 - 38446297
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  38446152 aggctttgttgttatagacttttatgtaggctataatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtagtctttaagacatgtttaaccta 38446251  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtagg 169  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  38446252 tttagtaggtcaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtagg 38446297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Original strand, 26260096 - 26260242
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaatagg-tttttaagtagactttaaggcatgtttaacct 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||    
T  26260096 aggctttgttgttataggcttttatgtatgctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggctttttaagtagcctttaagataagtttaacct 26260195  T
Q  123 atttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtagg 169  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  26260196 atttagtaggctaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtagg 26260242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38086911 - 38086729
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||    
T  38086911 ctttgttgttatcagcttttaagtaggttttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaata-gcttttaagtaggctttaaggcttgtttagccaattt 38086813  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaataga 211  Q
    || |||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | |||| || ||||||||||| ||||  || ||||||||||||    
T  38086812 aacaggcaaaatg-actatttgacggccttaatgtaaaataagcctgaaaaaaggctttcaggtcagttcagacttttaaataga 38086729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 169
Target Start/End: Original strand, 17740392 - 17740511
Alignment:
Q  50 taggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttga 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17740392 taggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgatataggcttttaagtaggttttaaggcttgtatagcctatttagtaggccaaataaactatttga 17740491  T
Q  150 tgaccttaacgtaaagtagg 169  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  17740492 tggccttaatgtaaagtagg 17740511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42517183 - 42516978
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||    ||||          
T  42517183 aggctttgttgttttaggtttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtactgaaataagcttttaagcaggctttaag----gttt------ 42517094  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    || | ||||||||||| | |||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||  || |||    
T  42517093 ttaagtaggccaaatg-attatttgttggccttaatgtaaagtaggtctggaagtaggctttcagggcagttcatgcttttaaatagttcagaccagacc 42516995  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
    ||||||||||| |||||    
T  42516994 aagaaaaacggtctatg 42516978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 45434847 - 45434762
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaag 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45434847 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaag 45434762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12465957 - 12465758
Alignment:
Q  41 gcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatga 140  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||| |  | |||| |||||||| |||| ||||| |    
T  12465957 gcttttaagttgactttaatctagttaacatttacttatagtgaaatagacttttaagtaggttttaaagtctatttatcctatttagtaggtcaaataa 12465858  T
Q  141 actatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||  | |||||||| ||| ||||| ||  |||||||||  |||  |||  | |||||||||||||||||    
T  12465857 actatttgatgaccttaatgtaaagtagacctgtaagtaggcttttaggccagtccagatttttaaatacgtcaaatcatgcaaagaaaaacggcctatg 12465758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42077198 - 42077044
Alignment:
Q  86 ataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggcttt 185  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | ||||||||    
T  42077198 ataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaacctatttagtaagccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggcttt 42077099  T
Q  186 cagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
    |||  ||||| || |||||||||||  |||  ||  || ||||||||||||||||    
T  42077098 cagaccagtccagacttttaaataggccagaccaggcctagaaaaacggcctatg 42077044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18681673 - 18681605
Alignment:
Q  28 tttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||    
T  18681673 tttgttgttataggcttttaagtaggctt--atgttgttaaaatttgcttgcagtgaaatagaattttaag 18681605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 42077211 - 42077176
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaa 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42077211 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaa 42077176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 43639257 - 43639205
Alignment:
Q  37 ataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaatag 89  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  43639257 ataggcttttaattagtctttaatgttgttaaaatttgcttgtagtgaaatag 43639205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Original strand, 15899610 - 15899704
Alignment:
Q  115 tttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaata 209  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||    |||||||||||| ||| | || ||||||||||    
T  15899610 tttagcctatttagtaggtaaaatgaactatttaatgactttaatgtaaaataggtctggatgtaggctttcaggtcagaccagacttttaaata 15899704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 43639186 - 43639120
Alignment:
Q  122 tatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcag 188  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||  | |||||||||||    
T  43639186 tatttattaggtcaaatgaactatttgatgaccttaatttaaactaggtttggaagtaggctttcag 43639120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24134067 - 24133851
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24134067 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 24133968  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||    
T  24133967 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccagacc 24133868  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  24133867 tagaaaaacggcctatg 24133851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 239
Target Start/End: Original strand, 41129540 - 41129751
Alignment:
Q  28 tttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattta 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  41129540 tttgttgttataggcttttaagtagactttaatctagttaaaatttacttgtagttaaataggcttttaagtaggctttaaggcatgtttagcttattta 41129639  T
Q  128 ataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaaga 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||    
T  41129640 gtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatataaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccaggccaaga 41129739  T
Q  228 aaaacggcctat 239  Q
    ||||||||||||    
T  41129740 aaaacggcctat 41129751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 239
Target Start/End: Original strand, 43010050 - 43010263
Alignment:
Q  26 gctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  43010050 gctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagattttaaggtctgtttagcctatt 43010149  T
Q  126 taataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaa 225  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||  |||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  43010150 tagtaggtcaaatgaactatttgatgaccttaatttgaagtagtcctgtaagtaggctttcaggtcagtccagacttttaaataggtcaggccagaccaa 43010249  T
Q  226 gaaaaacggcctat 239  Q
    ||||||||||||||    
T  43010250 gaaaaacggcctat 43010263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42294420 - 42294204
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42294420 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 42294321  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  ||    
T  42294320 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaaggaggtctgtaagtaggctttcaggtcagtccaggcttttaaataggccaggccaggcc 42294221  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  42294220 tagaaaaacggcctatg 42294204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Original strand, 31405733 - 31405948
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  31405733 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatttagttaaaatttacttgtagttaaataggcttttaagtaggctttaaggcatgtttagctta 31405832  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||  | ||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||  |     
T  31405833 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatataaagtaggcctgtaagtaggctttcaggctagtccaggcttttaaataggtcaggccaggct 31405932  T
Q  224 aagaaaaacggcctat 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  31405933 aagaaaaacggcctat 31405948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 36265646 - 36265856
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  36265646 aggctttgttgctataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctataagacatgtttaaccta 36265745  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||    
T  36265746 tttagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtaggtctgtaagtagactttcagaccagtcgaggcttttaaataggccaggtcagacc 36265845  T
Q  224 aagaaaaacgg 234  Q
     ||||||||||    
T  36265846 tagaaaaacgg 36265856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 25593486 - 25593702
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25593486 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 25593585  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||  ||    
T  25593586 tttagtaggtcaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtctacgcttttaaataggccaggccaggcc 25593685  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     | ||||||||||||||    
T  25593686 taaaaaaacggcctatg 25593702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 4356837 - 4357048
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  4356837 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatccagttaaaatttacttgttgttaaataggattttaagtaggctttaaggcatgtttagttta 4356936  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  4356937 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatatgaagtaggcctgtaaataggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccaggcc 4357036  T
Q  224 aagaaaaacggc 235  Q
    ||||||||||||    
T  4357037 aagaaaaacggc 4357048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41636594 - 41636408
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41636594 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 41636495  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | ||||||||||||  |||| | ||||||||||||    
T  41636494 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggcgagtccaagcttttaaatag 41636408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 7046586 - 7046772
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7046586 aggctttgttgttataggattttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 7046685  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  7046686 tttagtacgccaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggtcagtccatgctttcaaatag 7046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 9338074 - 9338291
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  9338074 aggctttgttgttataggcttttatgtcggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacaagtttaaccta 9338173  T
Q  124 tttaa-taggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaac 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||  ||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  |    
T  9338174 tttaagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcttgtaagtaggctttcaggtcagtccaggcttttaaataggccaggccaggc 9338273  T
Q  223 caagaaaaacggcctatg 240  Q
    | ||||||||| ||||||    
T  9338274 ctagaaaaacgacctatg 9338291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14752089 - 14751900
Alignment:
Q  50 taggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttga 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  14752089 taggctttaatctagttaaaatttacttgtagttaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttagcttatttagtatgccaaatgaactatttga 14751990  T
Q  150 tgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctat 239  Q
    || ||||||  |||||||||||||  | ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14751989 tggccttaatataaagtaggtctgtaagtaggcttgcaggccagtctaggcttttaaataggtcaggtcaggccaagaaaaacggcctat 14751900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Original strand, 46136177 - 46136392
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||||   ||    
T  46136177 aggctttgttgttatatgcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagttaaataggcttttaagtaagttttaaggcatgtttagttta 46136276  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||  ||  ||    
T  46136277 tttagtaggtcaaatgaactatttgatgaccttaatataaagtaggcatgtaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaataggtcagaccaggcc 46136376  T
Q  224 aagaaaaacggcctat 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  46136377 aagaaaaacggcctat 46136392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 54447872 - 54447699
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  54447872 ctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaacctattt 54447773  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggc 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | ||| |||||||| ||||| ||||    
T  54447772 agtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtagactttcaggccagtccaggc 54447699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 50638794 - 50638578
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  50638794 aggctttgttgttgtagacttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacctgtagttaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 50638695  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |  | |||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||  ||  ||    
T  50638694 tttagtaggtcaaatgaactatttgatgaccttaatgtaaagtaggcacgtaagtaggctttcaggtcagtccagacttttaaataggccagaccaggcc 50638595  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  50638594 tagaaaaacggcctatg 50638578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22523711 - 22523497
Alignment:
Q  26 gctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatt 125  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  22523711 gctttgttgttattgacttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacatgtactaaaagaggcttttaagtaggctttaaggcttgttaagcctatt 22523612  T
Q  126 taataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaa 225  Q
    || ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| |||  | |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  22523611 tagtaggccaaatg-actatttgatagccttaatgtaaagtaggcctggaagtaggctttcaggccagtccaagcttttaaagaggccaggtcaagccaa 22523513  T
Q  226 gaaaaacggcctatgc 241  Q
    ||||||||||||||||    
T  22523512 gaaaaacggcctatgc 22523497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 51302658 - 51302515
Alignment:
Q  26 gctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatt 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  51302658 gctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttctagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaacctatt 51302559  T
Q  126 taataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtagg 169  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  51302558 tagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtagg 51302515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 169
Target Start/End: Original strand, 26020180 - 26020322
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26020180 ctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaacctattt 26020279  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtagg 169  Q
    | ||||| | ||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  26020280 agtaggctatatgaactatttgatggccttaatgtgaagtagg 26020322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 240
Target Start/End: Original strand, 26994600 - 26994790
Alignment:
Q  50 taggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttga 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26994600 taggctttaatctagttaaaatttacttatggtgaaataggcttttaagtaggctttaaggcctgtttagcctatttagtaggccaaatgaactatttga 26994699  T
Q  150 tgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
    || |||||| || |||||||  ||  | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  26994700 tggccttaatgttaagtaggcttgtaattagactttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccaggcctagaaaaacggcctatg 26994790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45387793 - 45387579
Alignment:
Q  26 gctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatt 125  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  45387793 gcttcgttgttatagtcttttaagtaggccttaatctaattaaaatttacttgtagtgaaataggcttttagctaggttttaaggcatgtttagcctatt 45387694  T
Q  126 taataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaa 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||   | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |  |||| || || ||    
T  45387693 tagtaggccaaatgaactatttgattgccttaatttaaagtaggcctctaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaatcggccaggccagacaaa 45387594  T
Q  226 gaaaaacggcctatg 240  Q
    ||||||| |||||||    
T  45387593 gaaaaacagcctatg 45387579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 24120113 - 24120313
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||            ||||||| | |||||| |||||||    
T  24120113 ctttgttgttataggcttttaattaggctttaatctagttaaaatttacttatagtgaaatagg------------ctttaagcc-tgtttagcctattt 24120199  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  24120200 agtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgttaagtaggcctgtaattaggctttcagaccagtccaggcttttaaataggtcaggtcagacctag 24120299  T
Q  227 aaaaacggcctatg 240  Q
    ||||||||||||||    
T  24120300 aaaaacggcctatg 24120313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39889587 - 39889416
Alignment:
Q  69 aatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtag 168  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  39889587 aatttacttatggtgaaataggcttttaagtaggctttaaggcctgtttagcctatttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgttaagtag 39889488  T
Q  169 gtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
    |  ||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  39889487 gcttgtaattaggctttcaggccagtccaggcttttaaataagccaggccagacctagaaaaacggcctatg 39889416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 240
Target Start/End: Original strand, 35761391 - 35761538
Alignment:
Q  92 ttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggc 191  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| |    
T  35761391 ttttaagtaggctttatgacatgtttaacctatttagtaggtcaaatga-ctatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggcc 35761489  T
Q  192 agtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||| || ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  35761490 ggtccagacttttaaataggtcaggccaggccaagaaaaacggcctatg 35761538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 52274561 - 52274479
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagacttt 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||    
T  52274561 aggctttgttgttataagcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgcagtgaaataagcttttaagtaggcttt 52274479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4481877 - 4481744
Alignment:
Q  107 aaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaa 206  Q
    ||||| |||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||| || || ||||  | | | |||||||||||| ||| | |||||||| |    
T  4481877 aaggcctgtttagcctatttagtacgtaaaatgaactatttgatgaccataatgttaaataggcttcaaattaggctttcaggccaggccaggcttttta 4481778  T
Q  207 atagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
    ||||  |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  4481777 ataggccaggccaggccaagaaaaacggcctatg 4481744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 240
Target Start/End: Original strand, 26020319 - 26020381
Alignment:
Q  178 taggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  26020319 taggctttcaggccagtccatgcttttaaataggtcaggccaggcctagaaaaacggcctatg 26020381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25537008 - 25536931
Alignment:
Q  163 aagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||  ||||||||    
T  25537008 aagtaggcctgtaaataggctttcaggccagaccaggcttttaaataggtcaggtcatgccaaaaaaataggcctatg 25536931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23556057 - 23555842
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  23556057 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagttaaataggcttttaagtaggctttaaggcatgtttagctta 23555958  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||    
T  23555957 tttagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatataaagtaggcctgtaagtaggcttttaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccagacc 23555858  T
Q  224 aagaaaaacggcctat 239  Q
    |||| |||||||||||    
T  23555857 aagataaacggcctat 23555842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 38671945 - 38672161
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  38671945 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 38672044  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  38672045 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccaggcc 38672144  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  38672145 tagaaaaacggcctatg 38672161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10312301 - 10312086
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | ||    
T  10312301 aggctttgttgttacaggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagttaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttagctta 10312202  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||    
T  10312201 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatataaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaatagatcaggccaggcc 10312102  T
Q  224 aagaaaaacggcctat 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  10312101 aagaaaaacggcctat 10312086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10805328 - 10805113
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  10805328 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatccagttaaaatttacttgttgttaaataggtttttaagtaggctttaaggcatgtttagttta 10805229  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  10805228 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatatgaagtaggcctgtaaataggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccaggcc 10805129  T
Q  224 aagaaaaacggcctat 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  10805128 aagaaaaacggcctat 10805113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15850124 - 15849910
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15850124 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 15850025  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  |||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||    
T  15850024 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtagtcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccagacc 15849925  T
Q  224 aagaaaaacggccta 238  Q
     ||||||| ||||||    
T  15849924 tagaaaaatggccta 15849910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12298445 - 12298229
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12298445 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagttaaataagtttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 12298346  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  ||    
T  12298345 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggccaggccaggcc 12298246  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  12298245 tagaaaaacggcctatg 12298229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 5499773 - 5499959
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5499773 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 5499872  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5499873 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaatag 5499959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39919912 - 39919699
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39919912 ctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaacctattt 39919813  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||  ||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  39919812 agtaggccaaatgaactatttgatggctttaatgtgaagtaggcatgtaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaataggtcaggccagacctag 39919713  T
Q  227 aaaaacggcctatg 240  Q
    ||||||||||||||    
T  39919712 aaaaacggcctatg 39919699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18342869 - 18342653
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18342869 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 18342770  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||  ||  | |||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||| ||  ||    
T  18342769 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcttgtaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaataggccaggacaggcc 18342670  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  18342669 tagaaaaacggcctatg 18342653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19507368 - 19507152
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19507368 aggctttgttgttataagcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 19507269  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  | | |||||||||| || || | ||||||||||||  |||| || |||    
T  19507268 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggtctgtaagtgggctttcaggccaatccatgcttttaaataggccaggccagacc 19507169  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  19507168 tagaaaaacggcctatg 19507152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16452696 - 16452510
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16452696 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 16452597  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  16452596 tttagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaaacttttaaatag 16452510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16461848 - 16461662
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16461848 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 16461749  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  16461748 tttagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaaacttttaaatag 16461662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 44912908 - 44912692
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  44912908 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggcttgaagacatgtttaaccta 44912809  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||  | |||||||| |||  |||| |||||||||||||| |||   || |||    
T  44912808 tttagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtaggcatgtaagtaggcttttaggctagtccaggcttttaaataggtcataccagacc 44912709  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  44912708 tagaaaaacggcctatg 44912692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Original strand, 15321711 - 15321926
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | ||    
T  15321711 aggctttgttgttatagacttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagttaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttagctta 15321810  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||  | |||||||||||   |||| || ||||||||||| ||||| || |||    
T  15321811 tttagtaagccaaatgaactatttgatggccttaatataaagtaggcctgtaagtaggctttcagactagtccagacttttaaataggtcaggccagacc 15321910  T
Q  224 aagaaaaacggcctat 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  15321911 aagaaaaacggcctat 15321926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26257697 - 26257485
Alignment:
Q  28 tttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattta 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  26257697 tttgttgttataggcttttatgtagactgtaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttatgacatgtttaacctattta 26257598  T
Q  128 ataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaaga 227  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||  || ||| |||    
T  26257597 gtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcagaccagtccaggcttttaaataggtcagaccagacctaga 26257498  T
Q  228 aaaacggcctatg 240  Q
    |||||||||||||    
T  26257497 aaaacggcctatg 26257485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 47367311 - 47367526
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  47367311 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggttttaagacatgtttaaccta 47367410  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||  ||    
T  47367411 tttagtaggccaaatgaactatttgatggtcttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaataggccaggtcaggcc 47367510  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     || |||||||||||||    
T  47367511 tag-aaaacggcctatg 47367526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 17386125 - 17386339
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttactt-gtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatt 125  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  17386125 ctttgttgttatagacttttatgtaggctttaatctagttgaaatttactttgtagtgaaataagcttttaagtaggctttaagacatatttaacctatt 17386224  T
Q  126 taataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaa 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  | |||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||  || |    
T  17386225 tagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaagccagtccaggcttttaaataggtcaggccaggccta 17386324  T
Q  226 gaaaaacggcctatg 240  Q
    |||||||||||||||    
T  17386325 gaaaaacggcctatg 17386339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13077605 - 13077389
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13077605 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaaattacttgtagtaaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 13077506  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| || |||||||  ||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  ||    
T  13077505 tttagtaggttaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcttgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggccaggccaggcc 13077406  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  13077405 tagaaaaacggcctatg 13077389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42384485 - 42384295
Alignment:
Q  50 taggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttga 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42384485 taggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaacctatttagtaggccaaatgaactatttga 42384386  T
Q  150 tgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
    || |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  42384385 tggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaataggtcaggccaggcctagaaaaacggcctatg 42384295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 44779294 - 44779506
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  44779294 ctttgttgttataggcttttatgtag-ctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaatctattt 44779392  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataa-taggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaa 225  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||  || ||| |    
T  44779393 agtaggtcaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcct-ataagtaggctttcagaccagtccaggcttttaaataggtcagaccagaccta 44779491  T
Q  226 gaaaaacggcctatg 240  Q
    |||||||||||||||    
T  44779492 gaaaaacggcctatg 44779506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 27090633 - 27090850
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaatagg-tttttaagtagactttaaggcatgtttaacct 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  27090633 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaatagactttttaagtaggttttaagacatgtttaacct 27090732  T
Q  123 atttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaac 222  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | ||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||  ||| |    
T  27090733 atttagtaggtcaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggctagtccaggcttttaaataggccagaccaagc 27090832  T
Q  223 caagaaaaacggcctatg 240  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  27090833 ctagaaaaatggcctatg 27090850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 42649853 - 42650065
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |||||||    
T  42649853 ctttgttgttataggcttctaattaggctttaatctagttaaaatttacttatagtgaaataggcttttaagtaggttttaa-gcttgtttagcctattt 42649951  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||  ||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||  || ||    
T  42649952 agtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtcaagtaggcttgtaattaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggccaggtcaggcctag 42650051  T
Q  227 aaaaacggcctatg 240  Q
    ||||||||||||||    
T  42650052 aaaaacggcctatg 42650065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 240
Target Start/End: Original strand, 5506739 - 5506930
Alignment:
Q  49 gtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttg 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5506739 gtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaacctatttagtaggccaaatgaactatttg 5506838  T
Q  149 atgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
    ||| |||||| || |||||||  ||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  || ||||||||||||||||    
T  5506839 atggccttaatgtgaagtaggcttgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggccaggccaggcctagaaaaacggcctatg 5506930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 29522881 - 29523095
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttg-tagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatt 125  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29522881 ctttgttgttatagacttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttggtagtgaaataagcttttaagtaggctttaagacatgtttaacctatt 29522980  T
Q  126 taataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaa 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||  ||  || |    
T  29522981 tagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaataggccagaccaggccta 29523080  T
Q  226 gaaaaacggcctatg 240  Q
    |||||||||||||||    
T  29523081 gaaaaacggcctatg 29523095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Original strand, 34049816 - 34050035
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgttta----a 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||         
T  34049816 aggctttgttattataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagttaaataggcttttaagtaggctttaaggcatgtttagtagg 34049915  T
Q  120 cctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtca 219  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |  ||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  34049916 cttatttagtaggccaaatcaactatttgatggccttaatataaagtatgcttgtaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaataggtcaggcca 34050015  T
Q  220 aaccaagaaaaacggcctat 239  Q
      |||| |||||||||||||    
T  34050016 ggccaaaaaaaacggcctat 34050035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5616805 - 5616614
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  5616805 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttatttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaacgta 5616706  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcag 215  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||  ||  | |||||||| | | ||||| || ||||||||||| ||||    
T  5616705 ttttgtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcttgtaagtaggcttttaagccagtccagacttttaaataggtcag 5616614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6305320 - 6305119
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||            |||||| || |||||| |||||||    
T  6305320 ctttgttgttataggcttttaattaggctttaatctagttaaaatttacttatagtgaaatagg------------ctttaaagcctgtttagcctattt 6305233  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||    
T  6305232 agtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgttaagtaggcctgtaattaggctttcagggcagtccaggcttttaaataggccaggtcagacctag 6305133  T
Q  227 aaaaacggcctatg 240  Q
    |||||| |||||||    
T  6305132 aaaaacagcctatg 6305119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 118
Target Start/End: Original strand, 37536120 - 37536214
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgttta 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37536120 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatccagttaaaatttacttgtagttaaataggcttttaagtaggctttaaggcatgttta 37536214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7329898 - 7329715
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||| ||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||| ||||    
T  7329898 aggctttgttgttacaggcttttaggtaggctttaatgctgttaaaatttgcttggagcaaaataggcttttaagtaggctttaaagcttgtttagccta 7329799  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtagg-tctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaa 207  Q
    ||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| || ||||||| || | ||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  7329798 tttagcaggtcaaatgaactacttgatggcctaaatgtaaagtgggctttga-agtaggctttcaggccagtccagacttttaaa 7329715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 46313932 - 46313720
Alignment:
Q  28 tttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattta 127  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||| || | ||||||||||  || |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  46313932 tttgttgttataggcttttaaacagccttttatgttgttaaaatttgtttttagtaaaataggcttttaagtaggctttaaggcctgtttaacctattta 46313833  T
Q  128 ataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaaga 227  Q
     || |  |||||||||||||||||||| ||| || || ||||  | | | |||||| ||||| ||| | | |||||| |||||  |||  ||  ||||||    
T  46313832 gtatgtaaaatgaactatttgatgaccataatgttaaataggcttcaaattaggctatcaggtcagaccatgctttttaataggccagaccaggccaaga 46313733  T
Q  228 aaaacggcctatg 240  Q
    |||||||||||||    
T  46313732 aaaacggcctatg 46313720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 151
Target Start/End: Original strand, 18700936 - 18701051
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||            |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18700936 aggctttgttgttatatgcttttatgtaggctttaatttagttgaaatttacttgtag------------ttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 18701023  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatg 151  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18701024 tttagtagtccaaatgaactatttgatg 18701051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31316208 - 31316142
Alignment:
Q  135 aaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||    
T  31316208 aaatgaactatttgatgaccttaatgtaaaataggtctgaaagtaggctttcaagccagtccaggct 31316142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 31502330 - 31502379
Alignment:
Q  176 aataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaa 225  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31502330 aataggctttcaggtcggtctagacttttaaataggtcaggtcagaccaa 31502379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14921677 - 14921461
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14921677 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 14921578  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  14921577 tttagtaggtcaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtaggcatgtaagtaggctttcaggccagtctaggcttttaaataggtcaggccaggcc 14921478  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  14921477 tagaaaaacggcctatg 14921461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 16364794 - 16365010
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16364794 aggctttgttgttataagcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtagtctttaagacatgtttaaccta 16364893  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  ||    
T  16364894 tttagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggccaggccaggcc 16364993  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  16364994 tagaaaaacggcctatg 16365010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 32983014 - 32983230
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32983014 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 32983113  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||  || |||    
T  32983114 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaataggtcagaccagacc 32983213  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  32983214 tagaaaaacggcctatg 32983230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Original strand, 38600640 - 38600855
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  38600640 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatccagttaaaatttacttgttgttaaataggcttttaagtaggctttaaggcatgtttagttta 38600739  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  38600740 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatatgaagtaggcctgtaaataggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccaggcc 38600839  T
Q  224 aagaaaaacggcctat 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  38600840 aagaaaaacggcctat 38600855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 41478256 - 41478458
Alignment:
Q  37 ataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaa 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41478256 ataggcttttatgtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaacctatttagtaggccaa 41478355  T
Q  137 atgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcc 236  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||    
T  41478356 atgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggtctgtaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaataggtcaggtcaggcttagaaaaacggcc 41478455  T
Q  237 tat 239  Q
    |||    
T  41478456 tat 41478458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 7382984 - 7383200
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  7382984 aggctttgttgttatatgcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaatagacttttaagtaggatttaagacatgtttaaccta 7383083  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||   |    
T  7383084 tttagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatatgaagtaggtctgtttgtaggctttcaggccagtctaagcttttaaataggtcagaccatgtc 7383183  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  7383184 tagaaaaacggcctatg 7383200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24580752 - 24580536
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24580752 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaatagacttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 24580653  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||   | |||||||||||| ||||| | ||||||||||||  |||| ||  ||    
T  24580652 tttagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagcaggtctttaagtaggctttcaggccagtccacgcttttaaataggccaggccaggcc 24580553  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     |||||||| |||||||    
T  24580552 tagaaaaacagcctatg 24580536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44710387 - 44710196
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44710387 aggcttttttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 44710288  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcag 215  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||  | |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  44710287 attagtaggccaaatgaactatttgatgactttaatgtgaagtaggcatgtaagtaggctttcagggcagtccagacttttaaataggtcag 44710196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8000301 - 8000111
Alignment:
Q  50 taggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttga 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8000301 taggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaacctatttagtaggccaaatgaactatttga 8000202  T
Q  150 tgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
    || |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  8000201 tggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggtcagtccaggcttttaaataagtcaggccagacctagaaaaacggcctatg 8000111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23444694 - 23444508
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  23444694 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtaggctttaagacaagtttaaccta 23444595  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | ||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  23444594 tttagtaggtcaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtagactttcaggccagtccagacttttaaatag 23444508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 7960364 - 7960556
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  7960364 aggctttgttgctataggcttttaagtaggctttaatatagttaaaatttgcttgtagtgaaaaaggcttctaagtaggctttaaggcttgtttagccta 7960463  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataa-taggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcagg 216  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| | ||||| || ||||||||||| |||||    
T  7960464 tttagtaggcgaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtaggtct-ataagtaggctttcaagccagtccagacttttaaataggtcagg 7960556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40680657 - 40680444
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||| |||||||    
T  40680657 ctttgttgttatagccttttaattaggctttaatctagttaaaatttacttatagtgaaataagcttttaagtaggctttaaagcttgtttagcctattt 40680558  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||  ||  | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||    
T  40680557 agtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgttaagtaggcttgtaattagactttcaggccagtctaggctttcaaataggccaggtcaggcctag 40680458  T
Q  227 aaaaacggcctatg 240  Q
    ||||| ||||||||    
T  40680457 aaaaatggcctatg 40680444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35056464 - 35056274
Alignment:
Q  50 taggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttga 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35056464 taggctttaatctagttaaaatttacttatagtgaaataggcttttaagtaggctttaaggcctgtttagcctatttagtaggccaaatgaactatttga 35056365  T
Q  150 tgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
    || |||||  || ||||||| | |  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||  || | ||||||||||||||    
T  35056364 tggccttattgttaagtaggcccgtaattaggctttcaggtcagtccaggcttttaaataggtcagatcaggcctaaaaaaacggcctatg 35056274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44755826 - 44755628
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaa------------gtagactttaaggc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||            |||| ||||||| |    
T  44755826 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctaattgaaatttatttgtagtgaaataggcttttaaataggcttttaagtaggctttaagac 44755727  T
Q  112 atgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44755726 atgtttaacctatttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggtcagtccaggcttttaaatag 44755628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13450984 - 13450780
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| |||  |||||| | | |||| |||||||    
T  13450984 ctttgttgttataggtttttaagtaggttttaatctagttaaaaattacttgtactgaaatagacttttaattaggttttaagacctatttagcctattt 13450885  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaag 226  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||  | ||||||||||||  |||| |  ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  13450884 tgtaggtcaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtagacatgtaagtaggctttcaggcaagtccatacttttaaattgatcagaccaaaccaag 13450785  T
Q  227 aaaaa 231  Q
    |||||    
T  13450784 aaaaa 13450780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12638275 - 12638113
Alignment:
Q  43 ttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaac 142  Q
    |||| |||||||||| || | ||||||||||  ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||| |||    
T  12638275 ttttcagtaggctttcatgttgttaaaatttgtttggagtgaaatatgcttt-aagtagactttaagggttgtttagcctatttagtaggtcaaattaac 12638177  T
Q  143 tatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaa 207  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12638176 tatttgatgacctaaatgtaaagtaggtctga-aataggctttcaggtcagtccaggcttttaaa 12638113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4158327 - 4158114
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |  ||||||||| |||| || |||| | |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||    
T  4158327 ctttgtttttatatgcttttaagcatgctttaatgttcttaaaatttgcttgcagcgaaacatgtttttaagtaggctttacgacatgtttagcctattt 4158228  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaag 226  Q
    | || | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||   ||| | |||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||   | ||||||    
T  4158227 agtatgtcaaatgaactatttgatgactttaatgtaaagtagacatgaaagtaggctttcaagtcagtctaagtttttaaatagttcagactagaccaag 4158128  T
Q  227 aaaaacggcctatg 240  Q
    ||||||| ||||||    
T  4158127 aaaaacgacctatg 4158114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 40860940 - 40860830
Alignment:
Q  53 gctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatga 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||||| | |||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40860940 gctttaatctagttaaaatttacttatactgaaataggcttttaagtatgctttaagacttgtttcgcctatttagtaggccaaat-aactatttgatga 40860842  T
Q  153 ccttaacgtaaa 164  Q
    |||||| |||||    
T  40860841 ccttaatgtaaa 40860830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 41478585 - 41478703
Alignment:
Q  121 ctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaa 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||     
T  41478585 ctatttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggtctttaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaataggtcaggccag 41478684  T
Q  221 accaagaaaaacggcctat 239  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  41478685 acttagaaaaacggcctat 41478703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4377198 - 4376986
Alignment:
Q  28 tttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattta 127  Q
    |||||||||||||| ||||||  || || | || | ||||||||||  || |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  4377198 tttgttgttataggtttttaaacagcctgtcatgttgttaaaatttgtttttagtaaaataggcttttaagtaggctttaaggcctgtttagcatattta 4377099  T
Q  128 ataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaaga 227  Q
     || |  |||||||||||||||||||| ||| || || ||||  | | | |||||||||||| ||| | || ||||| |||||  |||||||  ||||||    
T  4377098 gtatgtaaaatgaactatttgatgaccataatgttaaataggcttcaaagtaggctttcaggtcaggccagactttttaataggccaggtcaggccaaga 4376999  T
Q  228 aaaacggcctatg 240  Q
    ||||| |||||||    
T  4376998 aaaacagcctatg 4376986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 155
Target Start/End: Original strand, 2121005 - 2121136
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||   |||| |  |||||||||||    
T  2121005 aggctttgttgttacaagattttaagtaggttttaatgttgttaaaatttgcttggagtgaaatagacttttaagtaggtattaaagtttgtttaaccta 2121104  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgacct 155  Q
    |||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  2121105 tttagtagaacaaatgaactatttaatgacct 2121136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 125
Target Start/End: Original strand, 39506442 - 39506539
Alignment:
Q  28 tttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatt 125  Q
    |||||||||||||||||||||  || || | || | ||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  39506442 tttgttgttataggcttttaaacagcctgttatgttgttaaaatttatttttagtaaaataggcttttaagtaggctttaaggcatgtttagcctatt 39506539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18295488 - 18295272
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18295488 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 18295389  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || |||    
T  18295388 tttagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccaatccagacttttaaataggtcaggccagacc 18295289  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  18295288 tagaaaaacggcctatg 18295272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34855626 - 34855411
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  34855626 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagttaaataagcttttaagtagactttaaggcatgtttagctta 34855527  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  34855526 tttagtaggccaaataaactatttgatgaccttaatataaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccaggcc 34855427  T
Q  224 aagaaaaacggcctat 239  Q
    ||||||||| ||||||    
T  34855426 aagaaaaacagcctat 34855411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Original strand, 13916583 - 13916798
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  13916583 aggctttgttgttatagacttttaagtaggctttaatctagttaaaatttatttgtagttaaataggcttttaagtaggctttaaggcatgtttagctta 13916682  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataa-taggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaac 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  |    
T  13916683 tttaataggtcaaatgaactatttgatgaccttaacataaagtcggcct-ataagtaggctttcaggccagtccagacttttaaataggtcaggccaggc 13916781  T
Q  223 caagaaaaacggcctat 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  13916782 caagaaaaacggcctat 13916798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 17869859 - 17870051
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17869859 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 17869958  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcagg 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  17869959 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggcttttaggccagtccaggcttttaaataggtcagg 17870051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10018074 - 10017859
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  10018074 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatccagttaaaatttacttgttgttaaataggcttttaagtaggctttaaggcatgtttagttta 10017975  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||  ||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  10017974 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatatgaagtaggcatgtaaataggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccaggcc 10017875  T
Q  224 aagaaaaacggcctat 239  Q
    ||||||||||| ||||    
T  10017874 aagaaaaacggtctat 10017859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15397868 - 15397660
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15397868 aggcttttttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 15397769  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataa-taggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaac 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||  |||| ||| |    
T  15397768 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggtct-ataagtaggctttcaggccagtccgggcttttaactaggccaggccaagc 15397670  T
Q  223 caagaaaaac 232  Q
    | ||||||||    
T  15397669 ctagaaaaac 15397660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31624452 - 31624267
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  31624452 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaatagacttttaactaggctttaagacatgtttaaccta 31624353  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaata 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | || ||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  31624352 tttagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatgtaaagtaggcctgtaagtaagctttcaggtcagtccaagcttttaaata 31624267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 15677990 - 15678206
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15677990 aggctttgttgttataggtttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaaatagactttaagacatgtttaaccta 15678089  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||  | ||||||||||||  |||| |  |||||||||||  |||| || |||    
T  15678090 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaagcctgtaagtaggctttcaggctagtccaaacttttaaataggccaggccagacc 15678189  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  15678190 tagaaaaacggcctatg 15678206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18158689 - 18158473
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||  |  |||||||||    
T  18158689 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtaaaataggcttttaagtaggctttaagataaatttaaccta 18158590  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  ||    
T  18158589 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggccaggccaggcc 18158490  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  18158489 tagaaaaacggcctatg 18158473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Original strand, 14949337 - 14949552
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | ||    
T  14949337 aggctttgttgttatagacttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagttaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttagctta 14949436  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||  ||  ||    
T  14949437 tttagtatgccaaatgaactatttgatggccttaatataaagtaggcatgtaagtaggctttcaggtcagtccagacttttaaataggtcagaccaggcc 14949536  T
Q  224 aagaaaaacggcctat 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  14949537 aagaaaaacggcctat 14949552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 27054310 - 27054496
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27054310 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 27054409  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||   ||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27054410 tttagtaggcaaaatgaactatttgatagtcttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggtcagtccaggcttttaaatag 27054496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38255001 - 38254788
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  38255001 ctttgttgttattggcttttatgtagactttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttatcctattt 38254902  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  ||  | |||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||| |||  |    
T  38254901 agtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatatgaagtaggcatgtaagtaggctttcaggccagtccaagcttttaaataggccaggtcagacctgg 38254802  T
Q  227 aaaaacggcctatg 240  Q
    ||||||||||||||    
T  38254801 aaaaacggcctatg 38254788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40084291 - 40084078
Alignment:
Q  28 tttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaatagg-tttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  40084291 tttgttgttataggcttttatgtatgctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggctttttaagtagactttaagataagtttaacctattt 40084192  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaag 226  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| ||  || ||    
T  40084191 agtaggtcaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccaatccaggcttttaaatagaccaggccaggcctag 40084092  T
Q  227 aaaaacggcctatg 240  Q
    ||||||||||||||    
T  40084091 aaaaacggcctatg 40084078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11877758 - 11877557
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11877758 ctttgttgttatagacttttatgtaggctttaatctagttgaaatttatttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaagacaagtttaacctattt 11877659  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaag 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||| || |||            |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  11877658 agtaggccaaatgaactatttgatggtcttaatgtgaag------------taggctttcaggccagtttaggcttttaaataggtcaggtcagacctag 11877571  T
Q  227 aaaaacggcctatg 240  Q
    ||||||||||||||    
T  11877570 aaaaacggcctatg 11877557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 28210127 - 28210340
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |  |||||| |||||||    
T  28210127 ctttgttgttataggcttttaattaggctttaatctagttaaaatttacttatagtgaaataggcttttaagtaggttttaaagtctgtttagcctattt 28210226  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaag 226  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| || |||||||||||  | ||||| ||| ||    
T  28210227 agtaggccaaatgaacgatttgatggccttaatgttaagtaggcctgtaattaggctttcaggccagtccagacttttaaataggcctggtcagacctag 28210326  T
Q  227 aaaaacggcctatg 240  Q
    ||||| ||||||||    
T  28210327 aaaaatggcctatg 28210340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 36113424 - 36113279
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  36113424 aggctttgttgttatagacttttatgtaggctataatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtagactttaagacaagtttaaccta 36113325  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtagg 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  36113324 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtagg 36113279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 370444 - 370251
Alignment:
Q  47 aagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatt 146  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  370444 aagtaggctttaatatagttaaaatttacttatagtgaaatatgcttttaagtaggctttaaggtctgtttagcctatttagtaggccaaatgaactatt 370345  T
Q  147 tgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
    |||||  ||||| || ||||||| |||  | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||  || ||||||||||| ||||    
T  370344 tgatggtcttaatgttaagtaggcctgtaattagactttcaggccagtccaggcttttaaataggccagatcaggcctagaaaaacggcatatg 370251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 239
Target Start/End: Original strand, 3880946 - 3881099
Alignment:
Q  86 ataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggcttt 185  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||  ||  | ||||||||    
T  3880946 ataggcttttaagtaggctttaagacatgtttagcttatttagtaggccaaatgaactatttgatggtcttaatataaagtaggcttgtaagtaggcttt 3881045  T
Q  186 cagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctat 239  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3881046 caggccagtccaggcttttaaataggtcaggtcaggccaagaaaaacggcctat 3881099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 240
Target Start/End: Original strand, 27332314 - 27332526
Alignment:
Q  28 tttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattta 127  Q
    |||||||||||||||||||||  || |  | || | ||||||||||  || |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27332314 tttgttgttataggcttttaaacagccggttatgttgttaaaatttgtttttagtaaaataggcttttaagtaggctttaaggcctgtttaacctattta 27332413  T
Q  128 ataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaaga 227  Q
     || |  |||||||||||||||||||| ||| || || ||||  | |   |||||||||||| ||| | |||||||| |||||  |||||||  ||||||    
T  27332414 gtatgtaaaatgaactatttgatgaccataatgttaaataggcttcaaggtaggctttcaggccagaccaggctttttaataggccaggtcaggccaaga 27332513  T
Q  228 aaaacggcctatg 240  Q
    |||| ||||||||    
T  27332514 aaaaaggcctatg 27332526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 858912 - 858803
Alignment:
Q  64 gttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaa 163  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| || |  |||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  858912 gttaaaatttgcttgtagtaaaataagcttttaagtatgctttaaggcatgtttagtctatttagtatgtaaaataaactatttgatgactttaatgtaa 858813  T
Q  164 agtaggtctg 173  Q
    | ||||||||    
T  858812 aataggtctg 858803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 59
Target Start/End: Original strand, 3880933 - 3880968
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaa 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3880933 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaa 3880968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Original strand, 46903706 - 46903921
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  46903706 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagttaaataggcttttaagtaggctttaaggcatgtttagctta 46903805  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||    
T  46903806 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatataaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaataggtcaggccaggcc 46903905  T
Q  224 aagaaaaacggcctat 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  46903906 aagaaaaacggcctat 46903921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Original strand, 3095335 - 3095543
Alignment:
Q  32 ttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaatag 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  3095335 ttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaacctatttagtag 3095434  T
Q  132 gccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || ||| |||||||    
T  3095435 gccaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggttaggccagacctagaaaaa 3095534  T
Q  232 cggcctatg 240  Q
      |||||||    
T  3095535 tagcctatg 3095543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 17981112 - 17981328
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  17981112 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagatatgtttaaccta 17981211  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  ||    
T  17981212 tttagtatgccaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtaggcttgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggccaggccaggcc 17981311  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  17981312 tagaaaaacggcctatg 17981328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31843157 - 31842971
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31843157 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 31843058  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||  | || ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31843057 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaagcctgtaagtaagctttcagggcagtccatgcttttaaatag 31842971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33239946 - 33239730
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  33239946 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacaagtttaaccta 33239847  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  | |||||||||||| ||||| | ||||||||||||  |||| ||  ||    
T  33239846 ttttgtaggtcaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggtctgtaagtaggctttcaggccagtccaagcttttaaataggccaggccaggcc 33239747  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  33239746 tagaaaaacggcctatg 33239730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5259028 - 5258845
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  5259028 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacctgtattgaaataagtttttaagtaggctttaaggcttgtttagcctattt 5258929  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  5258928 agtaggccaaatgcactatttgatgaccttaatgtaaagtaggtctgtaagtaggctttcaggtcgttccaggcttttaaatag 5258845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12582410 - 12582194
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12582410 aggctttgttgttataggcttttatgtatgctttaatctaattgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 12582311  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  ||    
T  12582310 tttagtaggccagatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggccaggccaggcc 12582211  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     |||||||| |||||||    
T  12582210 tagaaaaacagcctatg 12582194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49389743 - 49389527
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49389743 aggctttgttgttataagcttttatgtagactttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 49389644  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||  ||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  49389643 tttagtaggccaaataaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcttgtaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaataggtcaggtcagacc 49389544  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     | |||||| |||||||    
T  49389543 taaaaaaacagcctatg 49389527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 50636988 - 50637174
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  50636988 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 50637087  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||  ||  | |||||||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  50637088 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcatgtaagtaggctttcagaccagtccatgcttttaaatag 50637174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4422368 - 4422156
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  4422368 ctttgttgttataggcttttaagtatgctttaatctagttaaaatttacttgcagttaaataggcttttaagtaggctttaaggcatgtttagcttattt 4422269  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataa-taggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaa 225  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| |||  ||||    
T  4422268 agtaggccaagtgaactatttgatgaccttaatataaagtaggcct-ataagtaggcttgcaggccagtccagacttttaaataggtcagatcaggccaa 4422170  T
Q  226 gaaaaacggcctat 239  Q
    ||||||| ||||||    
T  4422169 gaaaaacagcctat 4422156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 29590284 - 29590500
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29590284 aggctttgttgttataggtttttatataggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaatagacttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 29590383  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  | ||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||| ||  ||    
T  29590384 tttagtatgccaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggctagtccagacttttaaataggtcaggccaggcc 29590483  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     | ||||||||||||||    
T  29590484 taaaaaaacggcctatg 29590500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 210
Target Start/End: Original strand, 42431572 - 42431756
Alignment:
Q  26 gctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatt 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  42431572 gctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatcttgttgaaatttacttgtagtgaaatagacttttaagtaggctttaagacatgtttaacctatt 42431671  T
Q  126 taataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  |||  | |||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  42431672 tagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatatgaagtagacctgtaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaatag 42431756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 182
Target Start/End: Original strand, 35041658 - 35041812
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| | |||||    
T  35041658 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagttaaataggcttttaagtaggctttaggacatgtttagcttattt 35041757  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggc 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  35041758 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaatataaagtaggcct-ataataggc 35041812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 207
Target Start/End: Original strand, 45783723 - 45783905
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45783723 aggctttgttgttataggattttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 45783822  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaa 207  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  ||  | ||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  45783823 tttagtaggccaaatgaact-tttgatgaccttaatgtgaagtaggcatgtaagtagactttcaggccagtccaggcttttaaa 45783905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48659627 - 48659415
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |||||||    
T  48659627 ctttgttgttataggcttctaattaggctttaatctagttaaaatttacttatagtgaaataggcttttaagtaggttttaa-gcttgtttagcctattt 48659529  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaag 226  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||  ||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||  || ||    
T  48659528 agtaggtcaaatgaactatttgatggccttaatgtcaagtaggcttgtaattaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaagtcaggcctag 48659429  T
Q  227 aaaaacggcctatg 240  Q
    ||||||||||||||    
T  48659428 aaaaacggcctatg 48659415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Original strand, 20392740 - 20392952
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaatagg-tttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatt 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| ||||||    
T  20392740 ctttgttgttataggcttttaattaggctttaatctagttaaaatttacttatagtgaaataggctttttaagtaggctttaatgcttgtttagcctatt 20392839  T
Q  126 taataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaa 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||  ||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||  ||| |    
T  20392840 tagtaggccaaatgaactatttgatggccttattgttaagtaggcatgtaattaggctttcaggccagtccagacttttaaataggtcagatctgaccta 20392939  T
Q  226 gaaaaacggccta 238  Q
    |||||||| ||||    
T  20392940 gaaaaacgaccta 20392952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Original strand, 22270227 - 22270372
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  22270227 aggctttattgttataggcttttaagtatgttttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagcagactttaaggcctgtttagccta 22270326  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtagg 169  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  22270327 tttagtaggtcaaatgaactatttgatggccttaatataaagtagg 22270372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 210
Target Start/End: Original strand, 34553731 - 34553914
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34553731 ctttgttgttataggcatttaagtatgctttaatctagttaaaatttagttgtagtgaaatagacttttaagtaggctttaaggcatgtttagcctattt 34553830  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    | | || ||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||  ||  | |||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  34553831 agtgggtcaaatgaactatttgatggtcttgatgtaaagtaggcatgtaagtaggctttcaggccagtccaaccttttaaatag 34553914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 36489033 - 36488924
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36489033 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 36488934  T
Q  124 tttaataggc 133  Q
    |||| |||||    
T  36488933 tttagtaggc 36488924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29525416 - 29525200
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  29525416 aggctttgtcgtaatagacttttaagtaaactttaatcttgttaaaatttgcttgcagtgaaataagctttttagtaggctttaaggtctgtttaaccta 29525317  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||| ||  | || |||||||||||  ||||||||  |    
T  29525316 tttagtagatcaaatgaactatttgatgaccttaatgtaaagtaggcttggaaataggctttcaggccaagccagacttttaaataggccaggtcaagtc 29525217  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  29525216 aagaaaaatggcatatg 29525200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 517847 - 517643
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||            ||||||||  ||||||||||||    
T  517847 aggctttattgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgcagtgaaatag------------actttaagatatgtttaaccta 517760  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||  | ||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||  || |||    
T  517759 tttagtatgccaaatgaactattcgatgaccttaatgtgaagtaggcctgtaagtagactttcagatcagtccaggcttttaaataggtcagaccagacc 517660  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  517659 tagaaaaacggcctatg 517643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 240
Target Start/End: Original strand, 34432815 - 34433018
Alignment:
Q  28 tttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattta 127  Q
    |||||||||||||||||||||  || || | || | ||||||||||  || |||| ||||||| |||||||||| ||||||||         ||||||||    
T  34432815 tttgttgttataggcttttaaagagcctgttatgttgttaaaatttgtttttagtaaaataggcttttaagtaggctttaagg---------cctattta 34432905  T
Q  128 ataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaaga 227  Q
     || |  |||||||||||||||||||| ||| || || ||||  | | | |||||||||||| ||| | ||| |||| |||||  |||| ||  ||||||    
T  34432906 gtatgtaaaatgaactatttgatgaccataatgttaaataggcttcaaagtaggctttcaggccagaccaggttttttaataggccaggccaggccaaga 34433005  T
Q  228 aaaacggcctatg 240  Q
    |||||||| ||||    
T  34433006 aaaacggcttatg 34433018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31377676 - 31377465
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  31377676 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatccagttaaaatttacttgtagttaaataggcttttaagtaggctttaaggcatgtttagttta 31377577  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  31377576 tttagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatatgaagtaggcctgtaaataggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccaggcc 31377477  T
Q  224 aagaaaaacggc 235  Q
    ||||||||||||    
T  31377476 aagaaaaacggc 31377465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 45470174 - 45470390
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45470174 aggctttgttgttataggcttttatgtaggatttaatttagttgaaatctacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 45470273  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||    
T  45470274 tttagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttaaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccagacc 45470373  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     |||||||| |||||||    
T  45470374 tagaaaaacagcctatg 45470390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Original strand, 21441776 - 21441991
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21441776 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaatagacttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 21441875  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  ||    
T  21441876 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtagacctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggccaggccaggcc 21441975  T
Q  224 aagaaaaacggcctat 239  Q
     |||||||||||||||    
T  21441976 tagaaaaacggcctat 21441991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 2940937 - 2941123
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  2940937 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaggacatgtttaaccta 2941036  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2941037 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaatag 2941123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2196355 - 2196139
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  2196355 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaattaacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacaagtttaaccta 2196256  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataa-taggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaac 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  2196255 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcct-ataagtagactttcaggccagtctaggcttttaaataggtcaggccagac 2196157  T
Q  223 caagaaaaacggcctatg 240  Q
    | |||| ||||| |||||    
T  2196156 ctagaacaacggtctatg 2196139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5667388 - 5667171
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaatagg-tttttaagtagactttaaggcatgtttaacct 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||    
T  5667388 aggctttgttgttataggcttttatgtatgctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggctttttaagtaggctttaagataagtttaacct 5667289  T
Q  123 atttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaac 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||  |    
T  5667288 atttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggtcagtccaggcttttaaatagaccaggccaggc 5667189  T
Q  223 caagaaaaacggcctatg 240  Q
    | ||||||||||||||||    
T  5667188 ctagaaaaacggcctatg 5667171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 27595450 - 27595666
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27595450 aggctttgttgttataggcttttatgtaagctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaatagaattttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 27595549  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||    
T  27595550 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaataggtcaggccaggcc 27595649  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||| ||||    
T  27595650 tagaaaaacggcatatg 27595666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 240
Target Start/End: Original strand, 41631393 - 41631596
Alignment:
Q  37 ataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaa 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41631393 ataggcttttatgtaggctttaatcttgttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttgagtagactttaagacatgtttaacctatttagtaggccaa 41631492  T
Q  137 atgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcc 236  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||    
T  41631493 atgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccaggcctagaaaaacggcc 41631592  T
Q  237 tatg 240  Q
    ||||    
T  41631593 tatg 41631596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10228169 - 10227953
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  10228169 aggctttgttgttataggcttttatgtagactttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttagccta 10228070  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||  | |||||||||||| ||||| || |||||||||||  || ||||  ||    
T  10228069 tttagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtagtcctgtaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaataggccaagtcatgcc 10227970  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||| ||||||||    
T  10227969 tagaaaaatggcctatg 10227953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13391365 - 13391173
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13391365 aggctttgttgttataggcatttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagttaaatagtcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 13391266  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcagg 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  13391265 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgtagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtctaggcttttaaataggtcagg 13391173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 23670964 - 23671150
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23670964 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacctgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 23671063  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  23671064 tttagtaggccaaatgaactatttgataaccttaatatgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccagacttttaaatag 23671150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 41902651 - 41902867
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41902651 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtaaaatagacttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 41902750  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  | ||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||  ||  ||    
T  41902751 tttagtatgtcaaatgaactatttgatgaccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggctagtccaggcttttaaataggccagaccaggcc 41902850  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  41902851 tagaaaaacggcctatg 41902867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43341490 - 43341274
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  43341490 aggctttgttgttataggcttataagaagactttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggattttaagtaggctttaaggcctatttaaccta 43341391  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||  |  ||||||| ||| ||||| || |||||| |||| ||||  ||  ||    
T  43341390 tttagtaggccaaatgaactatccgatggccttaatgtaaagtaggtctggaagcaggcttttaggtcagtccagacttttacataggtcagaccatgcc 43341291  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
    |||||||||||||||||    
T  43341290 aagaaaaacggcctatg 43341274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 15757463 - 15757649
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15757463 aggctttgttgttatagacttttatgtaggttttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 15757562  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| |||  | |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  15757563 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgtagtaggcctggaagtaggctttcaggccagtccaggcttataaatag 15757649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32585122 - 32584913
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||       |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32585122 aggctttgttgttataggcttttatgtaggct-------agttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 32585030  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||    
T  32585029 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggcttttaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccagacc 32584930  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  32584929 tagaaaaacggcctatg 32584913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 46191483 - 46191697
Alignment:
Q  26 gctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatt 125  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  ||| || ||||||||    
T  46191483 gctttgttgttatagacttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtaaaataggcttttaagtaggctttaaaacatattcaacctatt 46191582  T
Q  126 taataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaa 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||  ||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  || |    
T  46191583 tagtaggccaaatgaactatttgatggctttaatgtgaagtaggcttgtaagtaggctttcaggccagtctagacttttaaataggtcaggtcaggccta 46191682  T
Q  226 gaaaaacggcctatg 240  Q
    |||||| ||||||||    
T  46191683 gaaaaatggcctatg 46191697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 43595986 - 43596174
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  43595986 aggctttgttgttataagcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttagttgtggtgaaataggcttttaagtaggctttaagacaagtttaaccta 43596085  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgacctt--aacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  43596086 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaaaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggattttaaatag 43596174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 44848302 - 44848170
Alignment:
Q  37 ataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaa 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44848302 ataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaacctatttagtaggccaa 44848203  T
Q  137 atgaactatttgatgaccttaacgtaaagtagg 169  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  44848202 atgaactatttgatggccttaatgtgaagtagg 44848170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21806799 - 21806595
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||            ||||||| |||||||||||||    
T  21806799 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaatagg------------ctttaagacatgtttaaccta 21806712  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||  ||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  ||    
T  21806711 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcatgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggccaggccaggcc 21806612  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  21806611 tagaaaaacggcctatg 21806595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48829450 - 48829234
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  48829450 aggctttgttgttatagatttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaatagacttttaagtaggctttaatacatgtttaaccta 48829351  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataa-taggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaac 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| || ||  ||  || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||  || ||    
T  48829350 tttagtaggccaaatgaactatttgatggctttaatgtgaaacagacct-ataagtaggctttcaggtcagtccaggcttttaaataggctagaccagac 48829252  T
Q  223 caagaaaaacggcctatg 240  Q
    | ||||||||||||||||    
T  48829251 ctagaaaaacggcctatg 48829234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28489495 - 28489363
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28489495 aggctttgttgtaataggcttttaagtaggctttaatgttgttaaaatttgcttgaagtgaaataaactttttagtaggctttaaggcatgtttagccta 28489396  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgacctt 156  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28489395 tttagtaggtcaaatgaactatttgatgacctt 28489363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 168
Target Start/End: Original strand, 34002609 - 34002749
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  34002609 ctttgttgttacggacttttaagtaggctttaatgttgttaaaatttgcttg-agtgaaataggcttttaagtaggctttaaggcctgtttagcctattt 34002707  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtag 168  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  34002708 agtaggtcaaatgaactatttgatggcctaaatgtaaagtag 34002749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 240
Target Start/End: Original strand, 44409939 - 44410074
Alignment:
Q  104 tttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttt 203  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||  | |||||||||||||||||| || ||||    
T  44409939 tttaaggcttgtttagtctatttagtaggtcaaatga-ctatttgatgaccttaatgaaaagtaggcctggaagtaggctttcagggcagtccagacttt 44410037  T
Q  204 taaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44410038 taaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggtctatg 44410074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 210
Target Start/End: Original strand, 12419059 - 12419153
Alignment:
Q  116 ttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12419059 ttaacctatttagtatgccaaatgaactatttgatggccttgatgtgaagtaggcctgcaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaatag 12419153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 240
Target Start/End: Original strand, 33450141 - 33450277
Alignment:
Q  104 tttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttt 203  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||| || || ||||  | | | |||||||||||| ||    |||||||    
T  33450141 tttaaggcctgtttagcctatttagtatgtaaaatgaactatttgatgaccataatgttaaataggcttcaaattaggctttcaggccaagacaggcttt 33450240  T
Q  204 taaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
    | ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  33450241 ttaataggtcaggtcaggccaagaaaaacggtctatg 33450277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 167
Target Start/End: Original strand, 35709781 - 35709856
Alignment:
Q  92 ttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagta 167  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  35709781 ttttaagtaggctttaagacctgtttagcctatttagtatgtcaaatgaactatttgatgatcttattgtaaagta 35709856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Original strand, 35709764 - 35709797
Alignment:
Q  26 gctttgttgttataggcttttaagtaggctttaa 59  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35709764 gctttgttgttatagacttttaagtaggctttaa 35709797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17156535 - 17156320
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  17156535 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatccagttaaaatttacttgttgttaaataggcttttaagtaggctttaaggcatgtttagctta 17156436  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || |||    
T  17156435 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatatgaagtaggcctgtaaataggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcagaccagacc 17156336  T
Q  224 aagaaaaacggcctat 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  17156335 aagaaaaacggcctat 17156320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 4229647 - 4229860
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4229647 ctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaatagacttttaagtaggatttaaggcatgtttaacctattt 4229746  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  | |||| ||||||| ||||| | ||||||||||||  |||||||  || ||    
T  4229747 agtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggtctgtaagtaggatttcaggccagtccatgcttttaaataggccaggtcaggcctag 4229846  T
Q  227 aaaaacggcctatg 240  Q
    ||||||||||||||    
T  4229847 aaaaacggcctatg 4229860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1101499 - 1101283
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  1101499 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacaagtttaaccta 1101400  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  ||    
T  1101399 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggccaggccaggcc 1101300  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     | ||||||||||||||    
T  1101299 taaaaaaacggcctatg 1101283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 13041509 - 13041724
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13041509 aggctttgttgttataggcttttatgtaggatttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaatagacttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 13041608  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | |||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||    
T  13041609 tttagta-gccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggcctgtaagtaggctttcaggccaatccaggcttttaaataggtcaggtcagacc 13041707  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  13041708 tagaaaaacggcctatg 13041724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34858438 - 34858223
Alignment:
Q  26 gctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatt 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  34858438 gctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaatagccttttaagtaagctttaagacatgtttaacctatt 34858339  T
Q  126 taatag-gccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacca 224  Q
    || ||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||     
T  34858338 tagtagtgtcaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaggtctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccaggcct 34858239  T
Q  225 agaaaaacggcctatg 240  Q
    ||||||||||||||||    
T  34858238 agaaaaacggcctatg 34858223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 4174031 - 4174247
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  4174031 aggctttgttgttataggcttttatgtagactttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaagagacttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 4174130  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaacc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||  | |||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||  ||    
T  4174131 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtaagcctgtaattaggctttcaggccagtccagacttttaaataggccaggtcaggcc 4174230  T
Q  224 aagaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  4174231 tagaaaaacggcctatg 4174247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1558912 - 1558726
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1558912 aggctttgttgttatagacttttatgtaggttttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaaccta 1558813  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatag 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| |||  | |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  1558812 tttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgtagtaggcctggaagtaggctttcaggccagtccaggcttataaatag 1558726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14500309 - 14500095
Alignment:
Q  26 gctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatt 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14500309 gctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaacctatt 14500210  T
Q  126 taataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaa 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||  |||  | |||||||||||  ||||| ||| ||||||||||  |||  || ||| |    
T  14500209 tagtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgtgatgtagacctgtaagtaggctttcagaccagtccaggtttttaaataggccagaccagaccta 14500110  T
Q  226 gaaaaacggcctatg 240  Q
     ||||||||||||||    
T  14500109 aaaaaacggcctatg 14500095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Original strand, 32187132 - 32187313
Alignment:
Q  59 atctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaa 158  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32187132 atctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaagacatgtttaacctatttagtaggccaaatgaactatttgatggccttaa 32187231  T
Q  159 cgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
      | |||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  32187232 tatgaagtaggtctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccaggcctagaaaaacggcctatg 32187313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 478995 - 479208
Alignment:
Q  27 ctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattt 126  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||| || |||||| |||||||    
T  478995 ctttgttgttataggcttttaattaagctttaatctagttaaaatttacttatagtgaaataggcttttaagtatgctttaaagcctgtttagcctattt 479094  T
Q  127 aataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||  ||  | ||||||||||||  |||| | ||||||||||||  ||| |||  || ||    
T  479095 agtaggccaaatgaactatttgatggccttaatgttaagtaggcatgtaattaggctttcaggcaagtccatgcttttaaataggccagatcaggcctag 479194  T
Q  227 aaaaacggcctatg 240  Q
    ||||||||||||||    
T  479195 aaaaacggcctatg 479208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 215
Target Start/End: Original strand, 11982275 - 11982463
Alignment:
Q  26 gctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatt 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  11982275 gctttgttgttatagacttttaagtaggctataatctagttaaaatttatttgtactggaatagtcttttaagtagactttaaggcatgtttagcttatt 11982374  T
Q  126 taataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcag 215  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||   | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  11982375 tagtaggtcaaatg-actatttgatgaccttaatgtaaagtaggccttgaagtaggctttcaggctagtctaggcttttaaataggtcag 11982463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33043054 - 33042849
Alignment:
Q  26 gctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatt 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  33043054 gctttgttgttataggtttttaagtaggctttaatttagttaaaatttacttgtactaaaatagacttttaagtaggctttaaggcttgtttagcctatt 33042955  T
Q  126 taataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaa 225  Q
    || |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||  ||  | |||||||||||| ||||| |  | ||||||||| ||||  ||  ||||    
T  33042954 tagtaggtcaaatg-actatttgatggccttaatgtaatgtaggcttggaagtaggctttcaggtcagtccatacgtttaaataggtcagcccaggccaa 33042856  T
Q  226 gaaaaac 232  Q
    |||||||    
T  33042855 gaaaaac 33042849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 234
Target Start/End: Original strand, 27797548 - 27797749
Alignment:
Q  32 ttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaa-taggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaata 130  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||  |||  |||||| |||  ||||||||||  |||||||| |||||| |||||||| ||    
T  27797548 ttgttatatgcttttaggtagggtttaatgttgttaaaatttgtttgcggtgaaaatagacttttaagtaggttttaaggcttgtttagcctatttagta 27797647  T
Q  131 ggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaa 230  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | || ||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||  |  |||||||||    
T  27797648 ggtaaaatgaactattagatgaccttaatgt-aagta-gtctgaaagtaagctttcaagtcagtctagacttttaaataagtcaggctaggccaagaaaa 27797745  T
Q  231 acgg 234  Q
    ||||    
T  27797746 acgg 27797749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 7459010 - 7458884
Alignment:
Q  28 tttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctattta 127  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | | || | ||||||||||  || |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  7459010 tttgttgttataggcttttaaacagcttgttatgttgttaaaatttgtttttagtaaaataggcttttaagtaggctttaaggcctgtttagcctattta 7458911  T
Q  128 ataggccaaatgaactatttgatgacc 154  Q
     || |  ||||||||||||||||||||    
T  7458910 gtatgtaaaatgaactatttgatgacc 7458884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32158254 - 32158173
Alignment:
Q  86 ataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagta 167  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  32158254 ataggcttttaagtaggctttaaggtctgtttaacttatttagtaagctaaatgaactatttgatggccttgatgtaaagta 32158173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 17607927 - 17607965
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatct 62  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17607927 aggctttgttgttatagggttttaagtaggctttaatct 17607965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Original strand, 3027236 - 3027292
Alignment:
Q  163 aagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtca 219  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  3027236 aagtaggcctgtaaataggctttcaggccaggccaggcttttaaataggtcaggtca 3027292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10885 - 10703
Alignment:
Q  57 taatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatgacctt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10885 taatctagttaaaatttacttgtagttaaatagacttttaagtaggctttaaggcatgtttagcttatttagtaggccaaatgaactttttgatgacctt 10786  T
Q  157 aacgtaaagtaggtctgataataggctttcagggcagtctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctat 239  Q
    ||  |||||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  10785 aatataaagtaggtctgtaagtaggctttcaggccagtccaggcttttaaataggtcaggccaggccaagaaaaacggcctat 10703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9435 - 9290
Alignment:
Q  24 aggctttgttgttataggcttttaagtaggctttaatctagttaaaatttacttgtagtgaaataggtttttaagtagactttaaggcatgtttaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  9435 aggctttgttgttataggcttttatgtaggctttaatctagttgaaatttacttgtagtgaaataggcttttaagtaggctttaaaacatgtttaaccta 9336  T
Q  124 tttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtagg 169  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  9335 tttagtaggccgaatgaactatttgatggccttaatgtgaagtagg 9290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0886 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0886
Description:

Target: scaffold0886; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 240
Target Start/End: Original strand, 1672 - 1816
Alignment:
Q  96 aagtagactttaaggcatgtttaacctatttaataggccaaatgaactatttgatgaccttaacgtaaagtaggtctgataa-taggctttcagggcagt 194  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||| |||||||||||| ||||    
T  1672 aagtaggctttaaggcctgtttagcctatttagtaggccaaatgaactatttgatgaccttaatgttaagta-gacttataattaggctttcaggccagt 1770  T
Q  195 ctaggcttttaaatagatcaggtcaaaccaagaaaaacggcctatg 240  Q
    | ||||||||||||||  |||||||  || | ||||||||||||||    
T  1771 ccaggcttttaaataggccaggtcaggcctaaaaaaacggcctatg 1816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University