View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3934_high_1 (Length: 1357)

Name: NF3934_high_1
Description: NF3934
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3934_high_1
NF3934_high_1
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (547-1338)||(10802533-10803335)
chr8 (14-852)||(43604593-43605431)
chr8 (14-852)||(40264507-40265348)
chr8 (17-841)||(29259498-29260332)
chr8 (14-830)||(41386090-41386915)
chr8 (24-852)||(7148063-7148888)
chr8 (31-852)||(2112808-2113635)
chr8 (150-852)||(42274989-42275681)
chr8 (14-483)||(10795597-10796067)
chr8 (14-497)||(41964815-41965290)
chr8 (105-497)||(43489259-43489650)
chr8 (24-540)||(9457842-9458360)
chr8 (14-452)||(4655492-4655930)
chr8 (458-841)||(4655075-4655458)
chr8 (392-748)||(41965406-41965761)
chr8 (530-852)||(28619860-28620183)
chr8 (564-852)||(9457560-9457848)
chr8 (530-852)||(4302551-4302875)
chr8 (543-852)||(30382432-30382741)
chr8 (550-841)||(8502659-8502951)
chr8 (543-841)||(37567130-37567419)
chr8 (550-841)||(35142070-35142361)
chr8 (580-841)||(9209064-9209325)
chr8 (674-852)||(1605902-1606080)
chr8 (676-841)||(40013363-40013526)
chr8 (14-157)||(39371398-39371542)
chr8 (507-591)||(41965320-41965404)
chr8 (1220-1271)||(10794091-10794142)
chr8 (639-841)||(24296506-24296708)
chr8 (550-610)||(40013264-40013324)
chr8 (639-841)||(14061574-14061776)
chr8 (660-765)||(23185801-23185906)
chr8 (19-58)||(43489714-43489753)
chr8 (1173-1209)||(10794057-10794093)
chr8 (755-841)||(39467670-39467755)
chr8 (788-841)||(14723955-14724008)
chr8 (792-841)||(24214830-24214879)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (15-852)||(24150060-24150899)
chr3 (14-852)||(26292793-26293634)
chr3 (14-841)||(30588867-30589699)
chr3 (14-852)||(36054242-36055074)
chr3 (14-841)||(38629041-38629856)
chr3 (106-852)||(50899749-50900514)
chr3 (24-841)||(19551395-19552204)
chr3 (24-698)||(26005092-26005768)
chr3 (15-430)||(35731309-35731727)
chr3 (512-852)||(35730949-35731289)
chr3 (530-841)||(13662576-13662887)
chr3 (543-841)||(46251961-46252259)
chr3 (572-852)||(26005770-26006050)
chr3 (234-550)||(23753871-23754185)
chr3 (543-852)||(26555831-26556123)
chr3 (543-852)||(27593169-27593478)
chr3 (234-497)||(23697351-23697609)
chr3 (234-497)||(23715807-23716065)
chr3 (234-497)||(23734263-23734521)
chr3 (14-311)||(26556415-26556715)
chr3 (543-852)||(52023961-52024267)
chr3 (530-841)||(36785999-36786309)
chr3 (547-830)||(39338062-39338342)
chr3 (569-852)||(38682443-38682728)
chr3 (18-279)||(2124932-2125196)
chr3 (684-841)||(53183972-53184129)
chr3 (105-199)||(23697604-23697698)
chr3 (105-199)||(23716060-23716154)
chr3 (105-199)||(23734516-23734610)
chr3 (105-199)||(23754180-23754274)
chr3 (660-852)||(6783976-6784168)
chr3 (674-766)||(25713327-25713420)
chr3 (753-841)||(10104982-10105070)
chr3 (753-841)||(10225758-10225846)
chr3 (718-766)||(33119571-33119619)
chr3 (786-841)||(10216162-10216217)
chr3 (19-58)||(23697762-23697801)
chr3 (19-58)||(23716217-23716256)
chr3 (19-58)||(23734673-23734712)
chr3 (19-58)||(23754335-23754374)
chr3 (639-766)||(43151261-43151388)
chr3 (792-841)||(35337652-35337701)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (24-852)||(43056910-43057748)
chr7 (14-852)||(151875-152715)
chr7 (14-841)||(35089329-35090162)
chr7 (14-852)||(27417880-27418709)
chr7 (14-841)||(30110831-30111647)
chr7 (14-609)||(47913553-47914153)
chr7 (14-481)||(47912629-47913100)
chr7 (105-550)||(33474810-33475256)
chr7 (105-497)||(12252752-12253127)
chr7 (606-852)||(47914878-47915124)
chr7 (530-852)||(40097111-40097434)
chr7 (547-841)||(39301018-39301302)
chr7 (643-841)||(24939509-24939705)
chr7 (639-841)||(31494267-31494469)
chr7 (660-841)||(47031273-47031454)
chr7 (605-713)||(46037170-46037278)
chr7 (19-57)||(12252652-12252690)
chr7 (786-841)||(3634241-3634296)
chr7 (787-841)||(28342259-28342313)
chr7 (792-841)||(8078314-8078363)
chr7 (19-60)||(33475315-33475356)
chr7 (792-841)||(34695150-34695199)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (14-841)||(52705421-52706251)
chr1 (14-852)||(26882048-26882893)
chr1 (14-852)||(45318477-45319329)
chr1 (24-497)||(45535131-45535609)
chr1 (530-841)||(1928149-1928460)
chr1 (543-852)||(36402264-36402573)
chr1 (543-852)||(29208772-29209081)
chr1 (543-852)||(10896817-10897126)
chr1 (543-841)||(33243072-33243366)
chr1 (543-841)||(33263245-33263539)
chr1 (105-250)||(14389005-14389150)
chr1 (564-829)||(45534847-45535089)
chr1 (660-852)||(9831316-9831499)
chr1 (381-550)||(39758260-39758432)
chr1 (381-550)||(39763614-39763786)
chr1 (568-653)||(9831782-9831867)
chr1 (598-841)||(9191159-9191402)
chr1 (145-292)||(39758447-39758602)
chr1 (145-292)||(39763801-39763956)
chr1 (19-60)||(14389212-14389253)
chr1 (577-713)||(48194746-48194882)
chr1 (605-713)||(19007400-19007508)
chr1 (577-713)||(48203504-48203640)
chr1 (245-280)||(14387660-14387695)
chr1 (790-841)||(50192789-50192840)
chr1 (792-841)||(19452090-19452139)
chr1 (792-841)||(38536287-38536336)
chr1 (792-841)||(38558505-38558554)
chr1 (792-841)||(42657742-42657791)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (14-841)||(81006-81838)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (14-852)||(8583233-8584072)
chr4 (18-770)||(42217674-42218431)
chr4 (108-841)||(3435294-3436008)
chr4 (369-841)||(44929905-44930382)
chr4 (168-692)||(7820239-7820753)
chr4 (105-497)||(42315247-42315640)
chr4 (549-852)||(8880460-8880764)
chr4 (543-841)||(52109434-52109732)
chr4 (530-852)||(25935803-25936127)
chr4 (543-841)||(45332694-45332992)
chr4 (543-841)||(47685172-47685470)
chr4 (543-841)||(42720747-42721046)
chr4 (530-852)||(26336094-26336407)
chr4 (543-852)||(54509731-54510038)
chr4 (543-790)||(45340435-45340682)
chr4 (307-550)||(56397732-56397973)
chr4 (105-315)||(56398552-56398770)
chr4 (550-763)||(33449944-33450157)
chr4 (543-841)||(40143804-40144086)
chr4 (168-271)||(7808724-7808827)
chr4 (189-290)||(44930371-44930472)
chr4 (725-841)||(7820124-7820240)
chr4 (14-97)||(3435050-3435133)
chr4 (674-766)||(5117064-5117156)
chr4 (788-852)||(42218407-42218471)
chr4 (24-60)||(7820756-7820792)
chr4 (577-713)||(38230928-38231064)
chr4 (24-60)||(42315672-42315708)
chr4 (24-60)||(56398829-56398865)
chr4 (787-841)||(27767973-27768027)
chr4 (792-841)||(39479597-39479646)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (14-830)||(34038-34846)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (246-841)||(40410618-40411220)
chr5 (14-497)||(13950023-13950506)
chr5 (105-497)||(3603790-3604179)
chr5 (543-852)||(6828549-6828859)
chr5 (550-841)||(17518456-17518748)
chr5 (14-260)||(11632918-11633165)
chr5 (550-841)||(10571139-10571430)
chr5 (605-713)||(2276025-2276133)
chr5 (639-761)||(6902525-6902647)
chr5 (639-841)||(7857053-7857255)
chr5 (25-60)||(3603694-3603729)
chr5 (753-841)||(28594410-28594499)
chr5 (753-841)||(26795601-26795689)
chr5 (728-766)||(26876251-26876289)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (273-852)||(29940962-29941549)
chr2 (407-852)||(6289127-6289566)
chr2 (105-497)||(7487468-7487865)
chr2 (14-415)||(42626632-42627037)
chr2 (511-841)||(45546959-45547289)
chr2 (105-406)||(21735989-21736290)
chr2 (14-464)||(45547341-45547769)
chr2 (14-360)||(6288779-6289126)
chr2 (543-852)||(11534852-11535161)
chr2 (530-853)||(34028677-34029001)
chr2 (530-852)||(20157502-20157824)
chr2 (534-852)||(11998167-11998484)
chr2 (531-841)||(24193232-24193542)
chr2 (550-841)||(24193577-24193875)
chr2 (168-396)||(35172007-35172220)
chr2 (589-841)||(45485390-45485631)
chr2 (14-208)||(29941549-29941753)
chr2 (105-182)||(35171755-35171832)
chr2 (675-841)||(2372997-2373163)
chr2 (605-766)||(38822753-38822915)
chr2 (446-497)||(21736289-21736340)
chr2 (675-841)||(27090663-27090829)
chr2 (19-59)||(21735887-21735927)
chr2 (458-497)||(35172338-35172377)
chr2 (753-841)||(2288489-2288575)
chr2 (787-841)||(22552000-22552054)
chr2 (787-841)||(43078594-43078648)
chr2 (792-841)||(16269610-16269659)
chr2 (800-841)||(25343248-25343289)
chr2 (19-60)||(35171651-35171692)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (14-841)||(6475975-6476769)
chr6 (28-540)||(29864989-29865504)
chr6 (18-470)||(3109586-3110038)
chr6 (564-852)||(29834064-29834352)
chr6 (564-852)||(29865498-29865786)
chr6 (530-852)||(30877869-30878191)
chr6 (543-841)||(3110043-3110341)
chr6 (543-841)||(10643770-10644070)
chr6 (614-852)||(7858203-7858440)
chr6 (605-713)||(709070-709178)
chr6 (577-713)||(7100320-7100456)
chr6 (577-713)||(8794174-8794310)
chr6 (753-841)||(5957154-5957242)
chr6 (507-540)||(29834037-29834070)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (30-540)||(20687-21198)
scaffold0237 (564-852)||(21192-21480)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (530-841)||(16303-16600)
[»] scaffold0922 (1 HSPs)
scaffold0922 (787-847)||(4112-4172)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (605-689)||(1705-1789)
[»] scaffold0287 (1 HSPs)
scaffold0287 (786-841)||(11789-11844)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 619; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 619; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 547 - 1338
Target Start/End: Original strand, 10802533 - 10803335
Alignment:
Q  547 tgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccatt 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10802533 tgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccatt 10802632  T
Q  647 aaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtga 746  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10802633 aaaatccgtagagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttga 10802732  T
Q  747 aaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaaccta 846  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |     
T  10802733 aaatcctaattgaatactacaagaatgttttacattttttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaataaaaaagtcttttaaaattatt 10802832  T
Q  847 tgaaat-----------acgcccccttaattccacatagttaattaaatttccaaatatttgtaaaaccacgctttcaattttgtttnnnnnnnggatct 935  Q
    ||||||           || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  10802833 tgaaatctcaattcaatacacccccttaattccacatagttaattaaatttccaaatgtctgtaaaaccacgctttcaattttgttttaaaaaaggatct 10802932  T
Q  936 ccttgcctattgcccttatgaggcgcaaaagtcttagtaggcttcccattaattaaagacagatgtgatacatttcatgtccttccacnnnnnnnnnnnc 1035  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  10802933 ccttgcctattgcccttatgaggcgcaaaagtcttagtaggcttcccaataattaaagacagatgtgatacatttcatgtccttccactttttttttttt 10803032  T
Q  1036 ctccttctggagatgaggaatgccaagaggatccaatttgatttatataattgtgatatgcaagtataatttgttagaaaaatattgaagataataagca 1135  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10803033 ctccttctggagatgaagaatgtcaagaggatccaatttgatttatataattgtgatatgcaagtataatttgttagaaaaatattgaagataataagca 10803132  T
Q  1136 gtaaacataaaagaaaagaagaatctaagtgcaaaatcaattgagtaaatatagagcatgaataggcattgaacaatgtatttcaactatgaagctcatt 1235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10803133 gtaaacataaaagaaaagaagaatctaagtgcagaatcaattgagtaaatatagagcatgaataggcattgaacagtgtatttcaactatgaagctcatt 10803232  T
Q  1236 attgacatatattatattcatacacatttctacaaatttattagcacaacacaaaaagaaaattcttcaaaatgttcaacatttacgaatgatcacgttg 1335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10803233 attgacatatattatattcatacacatttctacaaatttattaacacaacacaaaaagaaaattcttcaaaatgttcaacatttacgaatgatcacgttg 10803332  T
Q  1336 tca 1338  Q
    |||    
T  10803333 tca 10803335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 600; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 852
Target Start/End: Original strand, 43604593 - 43605431
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn-cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactatt 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||         |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  43604593 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaaatacagttataaatcaatcgaaaacaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactatt 43604692  T
Q  112 agataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgatta 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  43604693 agataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatataatatcaaaataaatagatctaaaaataagttatgttagtttattgatta 43604792  T
Q  212 taataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604793 taataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatt 43604892  T
Q  312 tgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggc 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43604893 tgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacaatatattcttttttttaatgaatgtacaagttatgttaagaaaagtgcaagttagatgc 43604992  T
Q  412 atgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaag 511  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         |||||    
T  43604993 atgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacaaaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaa--aaaag 43605090  T
Q  512 aatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaac 611  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  43605091 aatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaagtacattttacattaaac 43605190  T
Q  612 aatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaatac 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43605191 aatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatactagcagacaatttttaagttatgcgaaatctcaattgaatac 43605290  T
Q  712 cactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaag 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43605291 cactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaag 43605390  T
Q  812 acttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  43605391 acttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 43605431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 590; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 852
Target Start/End: Original strand, 40264507 - 40265348
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactatta 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||    
T  40264507 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttattaatcaaccgaaaaaaa-cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactatta 40264605  T
Q  113 gataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  40264606 gataatatactactagcagattgattaatcttaaaaatcatggacatatgatatcaaaataaatagatctaaaaataagttatgttagtttattgattat 40264705  T
Q  213 aataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataattt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40264706 aataatttgattgaaaaatgcatgttacatctagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataattt 40264805  T
Q  313 gatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttc-ttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggc 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  40264806 gatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtacattctttttttttaatgaacgtaaaagtcatgttaagaaaagtgcaagttagagga 40264905  T
Q  412 atgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt--nnnnnnnngaaa 509  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||    
T  40264906 atgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaaaa 40265005  T
Q  510 agaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaa 609  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| | |||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40265006 agattttggtagagtattacaaaatctaaaggctacgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 40265105  T
Q  610 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaat 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40265106 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccatagagttttgaataccattagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 40265205  T
Q  710 accactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccaga 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  40265206 accactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaatatcaca 40265305  T
Q  810 agacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  40265306 agacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 40265348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 585; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 841
Target Start/End: Original strand, 29259498 - 29260332
Alignment:
Q  17 gaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn---cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn----gacta 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||            |||||    
T  29259498 gaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccggaaaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttaaaaaaaaaaaagacta 29259597  T
Q  110 ttagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgat 209  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  29259598 ttagataatatactactggcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgat 29259697  T
Q  210 tataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29259698 tataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaataaacgtaaagttgtgatttttatgataa 29259797  T
Q  310 tttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagag 409  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29259798 tttgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtacattcttttttttaattaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagag 29259897  T
Q  410 gcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaa 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         |||    
T  29259898 gcatgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacaatagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaa 29259997  T
Q  510 a---gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacac 606  Q
    |   |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29259998 aaatgaatttggaatagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtacgtacattttacac 29260097  T
Q  607 taaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattg 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29260098 taaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattg 29260197  T
Q  707 aataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaatacc 806  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29260198 aataccactggatttcattggactcgttaaaaaatctcgaaaatcctaattgaatatcacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaatacc 29260297  T
Q  807 agaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29260298 acaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 29260332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 830
Target Start/End: Original strand, 41386090 - 41386915
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn--cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactat 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  41386090 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccggaaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactat 41386189  T
Q  111 tagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  41386190 tagataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgatt 41386289  T
Q  211 ataataatttgattg-aaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataa 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386290 ataataatttgattggaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataa 41386389  T
Q  310 tttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagag 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41386390 tttgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattattcagtacattcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaaatgcaagttagag 41386489  T
Q  410 gcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaa 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         |||    
T  41386490 gcatgatgatttcgacaataagtttgtcaaacaacatatataacctgcgattgttacaatagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaa 41386589  T
Q  510 a-----gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttac 604  Q
    |     |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41386590 aaaaatgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttac 41386689  T
Q  605 actaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaat 704  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41386690 actaaacaatctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaat 41386789  T
Q  705 tgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaata 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41386790 tgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaacaatgttatacattccttaaaaatcttgattgaata 41386889  T
Q  805 ccagaagacttttataaaacaaaaaa 830  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41386890 ccacaagacttttataaaacaaaaaa 41386915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 7148888 - 7148063
Alignment:
Q  24 aaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactattagataatatac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||    
T  7148888 aaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaatcgaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttaaaaaaaaagactattagataatatac 7148789  T
Q  123 tactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataataatttga 222  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  7148788 tactagcaggttgattgatcttaaaaattttggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattaattataataatttga 7148689  T
Q  223 ttgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatatagg 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7148688 ttgaaaaatgcatgttacatgtagagaaatgcaagtagaaaaattattataataccaattaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatatagg 7148589  T
Q  323 tagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataatttc 422  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7148588 tagatggtaaattaaccacaagattatccagtacattcttttttttaatgaacgtaaaaattatgttaagaaaagtgcaaggtagaggcatgatgatttc 7148489  T
Q  423 gacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaa--gaatttggaa 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||  ||||||||||    
T  7148488 gacaataagtttgtcaaacaaaatatataatctaccattgttacagtaaaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaaaatgaatttggaa 7148389  T
Q  521 gagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcaca 620  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7148388 gagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcaca 7148289  T
Q  621 aaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatt 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7148288 aaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatgccagtagacaatttctaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatt 7148189  T
Q  721 tcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttata 820  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7148188 tcattggactccttaaaaaatcttgaaaatcctaattgaatgccacaagaatgttttacattcctta------ttgattgaataccacaagacttttata 7148095  T
Q  821 aaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7148094 aaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 7148063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 549; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 2113635 - 2112808
Alignment:
Q  31 aaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn--gactattagataatatactactag 128  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||     
T  2113635 aaaaacaaatgtacaattataaatcaaccggaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttccaaaaaaaagactattagataatatagtactaa 2113536  T
Q  129 cagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataataatttgattgaaa 228  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2113535 caggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttattttagtttattgattataataatttgattgaaa 2113436  T
Q  229 aatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatataggtagatg 328  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2113435 aatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataatatcaatga-cgtaaagttgtgatttttataataatttgatatataggtagatg 2113337  T
Q  329 ataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataatttcgacaat 428  Q
     ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  2113336 gtaaat-aaccacaggattatacagtacgttcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagatgcatggtgatttcgacaat 2113238  T
Q  429 aagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaa-------gaatttggaag 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||         ||||       |||||||||||    
T  2113237 a-gtttgccaaacaaaatatataacctgccattattacagtagagcagaaaagattttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaaaaaaaaatgaatttggaag 2113139  T
Q  522 agtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaa 621  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2113138 agtattacaaaatctcaaggctatatgtgggagacagaaaagtctcaatgctaggtgtgagattgtcagtaggtacattttacactaaacaatctcacaa 2113039  T
Q  622 aatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggattt 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2113038 aatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcgaaatctcaattgaataccactggattt 2112939  T
Q  722 cattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataa 821  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2112938 cattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataa 2112839  T
Q  822 aacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2112838 aacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 2112808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 150 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 42275681 - 42274989
Alignment:
Q  150 ttctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaa 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42275681 ttctggacatataatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgattataataatttgattgaaaaatgcatgttaaaggtagaaa 42275582  T
Q  250 aatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattat 349  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42275581 aatgcaagtagaaaaattattataatatcaatgaacgtaaagttgtgatttttata-taatttgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattat 42275483  T
Q  350 acaatacgttcttattttt--aatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaata 447  Q
    ||| |||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||               ||    
T  42275482 acagtacgttattttttttttaat-aacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgatgatttcgacaataa---------------ta 42275399  T
Q  448 tataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaagaat----ttggaagagtattacaaaatttcaagagt 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |          ||| |||    |||||||||||||||||||| |||||  |    
T  42275398 tataacctaccattgttacagtagaacaaaaaagaatttggaagaaacataaaataaaataaaaaataaatttggaagagtattacaaaatctcaaggtt 42275299  T
Q  544 atgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattg-ttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42275298 atgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattggttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 42275199  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42275198 cataaaaatccgtagagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccgctggatttcatttgactcattaaaaaatc 42275099  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaa 842  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  42275098 ttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaaatcttttaaaat 42274999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 483
Target Start/End: Original strand, 10795597 - 10796067
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactatta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||    
T  10795597 acagaccaacaaatcacaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaacattgaatccatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactatta 10795696  T
Q  113 gataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattat 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10795697 gataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttaagttaatttattgattat 10795796  T
Q  213 aataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataattt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10795797 aataatttgattgaaaaatgcatgtaacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataattt 10795896  T
Q  313 gatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggca 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10795897 gatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacagtacgttcttttttttaatgaaagtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggca 10795996  T
Q  413 tgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10795997 tgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaa 10796067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 14 - 497
Target Start/End: Original strand, 41964815 - 41965290
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnngactattag 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||    
T  41964815 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgtaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaaactattag 41964914  T
Q  114 ataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaa-taaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattat 212  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||    
T  41964915 ataatatactactaacaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaaataaatagacctaaaaataagttatgttggtttattgattat 41965014  T
Q  213 aataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataattt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41965015 aataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataattt 41965114  T
Q  313 gatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggca 412  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  41965115 gatatataggtaaatggtaaattaaccacaaaattattcagtacattcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgtaagttagaggta 41965214  T
Q  413 tgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt 497  Q
    |         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41965215 t---------gacaataagtttgtcaaacaaaatatataacctgccattgttacattagaacagaaaagaatttggaataaacgt 41965290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 105 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 43489650 - 43489259
Alignment:
Q  105 gactattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaattta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  43489650 gactattagataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagttta 43489551  T
Q  205 ttgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttat 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43489550 ttgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaaagaacgtaaagttttgatttttat 43489451  T
Q  305 aataatttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43489450 aataatttgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtacattcttttttttaatgaacgtaaaag-tatgttaagaaaagtgcaagt 43489352  T
Q  405 tagaggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt 497  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  43489351 tagaggtatgatgatttcgagaataagtttgccaaacaaaatatataatctgccattgttacagtagaacaaaaaagaatttggatgaaacgt 43489259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 24 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 9458360 - 9457842
Alignment:
Q  24 aaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn--gactattagataatata 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  9458360 aaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaatattgaatcaatgagtgtaatatttcttaaaaaaaaaagactattagataatata 9458261  T
Q  122 ctactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataataatttg 221  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||     
T  9458260 ctactagcaggttggttaatcttaaaaatcatggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgattattataattta 9458161  T
Q  222 attgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatatag 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  9458160 attgaaaaatgcatgttgcatttagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgaaaaaaag 9458061  T
Q  322 gtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataattt 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9458060 gtagatggtaaattaaccacaagattatacagtacattcttttttttattgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgatgattt 9457961  T
Q  422 cgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaa-gaatttggaa 520  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||    
T  9457960 cgacaa-aagtttgccaaacaaaatatatatcctgccattgttacggtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaaatgaatttggaa 9457862  T
Q  521 gagtattacaaaatttcaag 540  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  9457861 gagtattacaaaatctcaag 9457842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 14 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 4655930 - 4655492
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn-cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn--gactat 110  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  4655930 acagaccaaaaaatctcaaa--caaaagtaaaattataaatcaaccgaaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaaagactat 4655833  T
Q  111 tagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  4655832 tagataatatactactagcaggttaattgatcttaaaaattctagacatatgatatcaaaacaaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgatt 4655733  T
Q  211 ataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataat 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4655732 ataataaattgattgaaaaatgcatgttacaggta-aaaaatgcaagtagaaaaattattataattccaatgaacgtaaagttttgatttttataataat 4655634  T
Q  311 ttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 410  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4655633 ttgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtacattcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 4655534  T
Q  411 catgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataa 452  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4655533 catgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataa 4655492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 458 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 4655458 - 4655075
Alignment:
Q  458 cattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaagaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagaca 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||   |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| |||| |    
T  4655458 cattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacataaaaaaaaaaaatatatttggaagagtatcacaaaatctcaaggctatgtgtgagagata 4655359  T
Q  558 gaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtag 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4655358 gaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtatgtacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcataacaatccattaaaatccgtag 4655259  T
Q  658 agttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaatt 757  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4655258 agttttgaataccggtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactgaatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaatt 4655159  T
Q  758 gaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4655158 gaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattaaataccacaagacttttattaaacaaaaaaatcttttaaaa 4655075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 259; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 392 - 748
Target Start/End: Original strand, 41965406 - 41965761
Alignment:
Q  392 gaaaagtgcaagttagaggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaag 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41965406 gaaaagtgcaagttagaggcatgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccatttttacagtagaacagaaaagaatttggaag 41965505  T
Q  492 aaacgtnnnnnnnngaaaa-gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttag 590  Q
    ||||||         |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41965506 aaacgtaaaaaaaaaaaaaagaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgcgagattgttag 41965605  T
Q  591 tagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagtta 690  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41965606 taggtacattttacactaaataatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatatgtagagttttgaataccagtagacaa--tttaagtta 41965703  T
Q  691 tgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaa 748  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41965704 tgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaa 41965761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 530 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 28620183 - 28619860
Alignment:
Q  530 aaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccatt 629  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  28620183 aaaatctcaaggttatgtgtgggagacagaaaagtctcaagattaggtgtgagattgttagtaggtacattgtacattaaacaatctcacaaagttcatt 28620084  T
Q  630 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggac 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  28620083 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactgaatttcattggat 28619984  T
Q  730 tcattaaaaa-atcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaa 828  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28619983 tcattaaaaatatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttaattgaataccacaaaacttttataaaacaaaa 28619884  T
Q  829 aagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||    
T  28619883 aagtcttttaaaatcctttgaaat 28619860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 564 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 9457848 - 9457560
Alignment:
Q  564 tctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 663  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9457848 tctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 9457749  T
Q  664 gaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaatac 763  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  9457748 gaataccgatagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaattctaaatgaatac 9457649  T
Q  764 cacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  9457648 cacaagaatgttttacattccttcaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaatgtcttttaaaatcctttgaaat 9457560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 530 - 852
Target Start/End: Original strand, 4302551 - 4302875
Alignment:
Q  530 aaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaa--gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatcca 627  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| | |||||||    
T  4302551 aaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaaatgtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcgctaaatcca 4302650  T
Q  628 ttactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattgg 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| |||||    
T  4302651 ttactcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaatactaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccattgaattttattgg 4302750  T
Q  728 actcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaa 827  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  4302751 actcattaaaaaatcctgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaacagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaa 4302850  T
Q  828 aaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  4302851 aaagtcttttaaaatcctttgaaat 4302875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Original strand, 30382432 - 30382741
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30382432 tatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttagatgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaattgattactcacaacaatc 30382531  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  30382532 cattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattgaactaattaaaaaatc 30382631  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaa 842  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  30382632 atgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttagaagtcttgattgaatacctaaagactttttaaaaacaaaaaagtcttttaaaat 30382731  T
Q  843 cctatgaaat 852  Q
    ||| ||||||    
T  30382732 cctttgaaat 30382741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 550 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 8502951 - 8502659
Alignment:
Q  550 gggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaa 649  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8502951 gggagacggaaaagtcttaaggctatgtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcataaaatccattactcacaacaatccattaaa 8502852  T
Q  650 atccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaa 749  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8502851 atccgtagaattttaaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatcttaattgaataccaccggattttattggactcattcaaaaatcttgaaaa 8502752  T
Q  750 tcctaattgaataccacaagaatgttttacgtt-ccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8502751 tcctaattgaataccacaagaatgttttacattcccttaaaaatcttaattaaataccacaagacttttttaaaacgaaaaagtcttttaaaa 8502659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 543 - 841
Target Start/End: Original strand, 37567130 - 37567419
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||     
T  37567130 tatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaaaagcctcacaaaatccattactcacaacaatt 37567229  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||          
T  37567230 cattaaaatccgtacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaatactactggattttattggactcattaa------ 37567323  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37567324 ---aaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttaattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaaatcttttaaaa 37567419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 550 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 35142361 - 35142070
Alignment:
Q  550 gggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaa 649  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  35142361 gggagaccgaaaagtcttgaggctagttgtgagagtgttagtaggtagattttacactaaaaagtctcataaaatccattactcacaacaatctaataaa 35142262  T
Q  650 atccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaa 749  Q
    |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  35142261 atccgtaatattttgaataccaatagacaatttttaagttgtacaaaatcttaattgaatacgaccggattttattggactcattaaaaaatcttgaaaa 35142162  T
Q  750 tcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35142161 tcctaattgaataccacaaaaatgttttacattccttaaaaattttgattgaataccacaagacttttttaaaacgaaaaagtcttttaaaa 35142070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 580 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 9209325 - 9209064
Alignment:
Q  580 gagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaa 679  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9209325 gagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaataaattacccacaacaaactattaaaatccttagagttttgaataccaatagacaa 9209226  T
Q  680 tttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttac 779  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  9209225 tttttaagttgtccaaaatttcaattgaataccactggattttattgaactcattaaaaaatcctgaaaatcttaattgaataccacaaaaatgttttag 9209126  T
Q  780 gttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9209125 attccttaaaagtcttgattcaatacctaaatacttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaa 9209064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 674 - 852
Target Start/End: Original strand, 1605902 - 1606080
Alignment:
Q  674 agacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatg 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1605902 agacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatactactggatttcattagactcattaaaaaatcttgaaaatcttaattgaataccacaagaatg 1606001  T
Q  774 ttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1606002 ttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 1606080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 676 - 841
Target Start/End: Original strand, 40013363 - 40013526
Alignment:
Q  676 acaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgtt 775  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  40013363 acaatttttaagttgtgcaaaatctaaattgaataccactgaattttattgaactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattaaataccacatgaatgtt 40013462  T
Q  776 ttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40013463 ttacattccttaaaaattttgattgaata-cacaa-acttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaa 40013526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 39371398 - 39371542
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttc-nnnnnnngactatta 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||    
T  39371398 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagctataaatcaaccgaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactatta 39371497  T
Q  113 gataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggac 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||    
T  39371498 gataatatactactagcaggttgattgatcttgaaaattttggac 39371542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 507 - 591
Target Start/End: Original strand, 41965320 - 41965404
Alignment:
Q  507 aaaagaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagt 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41965320 aaaagaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgcgagattgttagt 41965404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1220 - 1271
Target Start/End: Original strand, 10794091 - 10794142
Alignment:
Q  1220 aactatgaagctcattattgacatatattatattcatacacatttctacaaa 1271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10794091 aactatgaagctcattattgacatatattatattcatacacatttctacaaa 10794142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 639 - 841
Target Start/End: Original strand, 24296506 - 24296708
Alignment:
Q  639 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaa 738  Q
    ||||||||||||||  || | ||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||  |||  |||||||||||   ||||| |||| |||| ||||||    
T  24296506 aatccattaaaatctatacatttttgaatatcaagagactatttttaagttatgaaatttttttattgaataccatcagattttattgaactctttaaaa 24296605  T
Q  739 aatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtctttta 838  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |  ||||   || || |||||| ||||||||||||  |||| |||| || ||| |||||||||||||    
T  24296606 aatcatgaaaatcctagtggaataccaccagatttatttataatcttttaaaatcatgattgaatacctcaagatttttctataaccaaaaagtctttta 24296705  T
Q  839 aaa 841  Q
    |||    
T  24296706 aaa 24296708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 550 - 610
Target Start/End: Original strand, 40013264 - 40013324
Alignment:
Q  550 gggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaa 610  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  40013264 gggagacagaaaagtctcaaggccaagtgtgagattgttagtaggtatattttatactaaa 40013324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 14061776 - 14061574
Alignment:
Q  639 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaa 738  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||||||||||  ||||| ||| |||||    |||| | ||| ||||||||||| | ||||| ||| ||| | |||||    
T  14061776 aatccattaaaatttgtatacttttgaataccaacagacattttataagtcggccaaagtctcatttgaataccaccgaatttcgttgcactgaataaaa 14061677  T
Q  739 aatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtctttta 838  Q
    | || |||   || | |||||||||||||||| |  ||||  |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    ||||||||||||||    
T  14061676 agtcttgattgtcttgattgaataccacaagatttatttatattctataaaaatcttgattgaataccacaagacttttttactttaaaaaagtctttta 14061577  T
Q  839 aaa 841  Q
    |||    
T  14061576 aaa 14061574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 660 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 23185906 - 23185801
Alignment:
Q  660 ttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattga 759  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||  |  |||||  |  ||||||||||||||||    
T  23185906 tttttaataccaggagacaatttttaagttgtgaaaaattttgattgaataccaccagattttattggatcctataaaattttttgaaaatcctaattga 23185807  T
Q  760 atacca 765  Q
    ||||||    
T  23185806 atacca 23185801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 43489753 - 43489714
Alignment:
Q  19 ccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaac 58  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43489753 ccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaac 43489714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1173 - 1209
Target Start/End: Original strand, 10794057 - 10794093
Alignment:
Q  1173 caattgagtaaatatagagcatgaataggcattgaac 1209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10794057 caattgagtaaatatagagcatgaatagggattgaac 10794093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 755 - 841
Target Start/End: Original strand, 39467670 - 39467755
Alignment:
Q  755 attgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||  ||||||||||||||||    
T  39467670 attgaataccacaagacttttttaagttg-taaaaagtcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttttaaaa 39467755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 788 - 841
Target Start/End: Original strand, 14723955 - 14724008
Alignment:
Q  788 aaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  14723955 aaaatcttgattgaatacttcaagatttttctataacaaaaaagtcttttaaaa 14724008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 841
Target Start/End: Original strand, 24214830 - 24214879
Alignment:
Q  792 tcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  24214830 tcttgattgaataccacaagacttttttatgataaaaaagtcttttaaaa 24214879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 615; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 615; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 852
Target Start/End: Original strand, 24150060 - 24150899
Alignment:
Q  15 cagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactattag 113  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||    
T  24150060 cagacaaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaacattgaatcaatgagtataatatttcttcaaaaaaaagactattag 24150159  T
Q  114 ataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  24150160 ataatatactactagcagattgattgatcttaaaatttttggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgattata 24150259  T
Q  214 ataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24150260 ataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttttgatttttataataatttg 24150359  T
Q  314 atatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcat 413  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24150360 atatatagatagatggtaaattaaccacaagattatacagtacattcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcat 24150459  T
Q  414 gataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt-nnnnnnnngaaaaga 512  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||    
T  24150460 gatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccatttttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaaaaga 24150559  T
Q  513 atttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaaca 612  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24150560 atttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaca 24150659  T
Q  613 atctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaatacc 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24150660 atctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtggacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacc 24150759  T
Q  713 actggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaaga 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24150760 actggatttcattggactcattaaaaaatcttcaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaaga 24150859  T
Q  813 cttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  24150860 tttttataaaacaaaaaaatcttttaaaatcctttgaaat 24150899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 591; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 852
Target Start/End: Original strand, 26292793 - 26293634
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn---cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnngactat 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  26292793 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaagactat 26292892  T
Q  111 tagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  26292893 tagataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgctatcaaaataaatacacctaaaaataagttatgttagtttattgatt 26292992  T
Q  211 ataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26292993 ataataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagtcgtgatttttataataat 26293092  T
Q  311 ttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 410  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26293093 ttgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtatgttcctttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtggaagttagagg 26293192  T
Q  411 catgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaa 510  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||         ||||    
T  26293193 catgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaatagaaaagaatttggaagaaaagtaaaaaaaaaaaaa 26293292  T
Q  511 gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaa 610  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26293293 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacagaaaagtctcaagattaggtgtgaggttgttagtaggtacattttacactaaa 26293392  T
Q  611 caatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaata 710  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26293393 caatcacacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatactagtaaacaatttttaagttatgcaaaatctcaattaaata 26293492  T
Q  711 ccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaa 810  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26293493 tcactagatttcattggactcattaaaaaatattgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaa 26293592  T
Q  811 gacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26293593 aacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 26293634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 590; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 30589699 - 30588867
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactatta 112  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||    
T  30589699 acagacaaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccggaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactatta 30589600  T
Q  113 gataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattat 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  30589599 gataataaactactagcagattgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgattat 30589500  T
Q  213 aataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataattt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30589499 aataatttgattgaaaaatgcatgttacaagtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataatatcaatgaatgtaaagttgtgatttttataataattt 30589400  T
Q  313 gatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggca 412  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30589399 gatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacggtacattcttttttttaattaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggca 30589300  T
Q  413 tgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaa-- 510  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||      
T  30589299 tgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgtcattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaaaaa 30589200  T
Q  511 -gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggaga-cagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacacta 608  Q
     |||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30589199 tgaatttggaagagtattacaaaatctgaaggctatgtgtgggtgataaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacacta 30589100  T
Q  609 aacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaa 708  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  30589099 aacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgctaaatctcaattgaa 30589000  T
Q  709 taccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccag 808  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  30588999 taccactgaatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattctttaaaaatcttgattgaataccac 30588900  T
Q  809 aagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30588899 aagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 30588867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 852
Target Start/End: Original strand, 36054242 - 36055074
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn-cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactatt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  36054242 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaacaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactatt 36054341  T
Q  112 agataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgatta 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  36054342 agataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgatta 36054441  T
Q  212 taataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36054442 taataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacaaaaagttgtgatttttataataatt 36054541  T
Q  312 tgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttattttt-aatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 410  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36054542 tgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtacgttctttttttttaatgaacgtaaaaattatgttaagaaaagtgcaagttagagg 36054641  T
Q  411 catgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaa 510  Q
    |||||| |||||||||||||               ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||    
T  36054642 catgatgatttcgacaataa---------------tatataatctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaaa 36054726  T
Q  511 ------gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttac 604  Q
          |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36054727 aaaaatgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttaatagatacattttac 36054826  T
Q  605 actaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaat 704  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36054827 actaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaaaactagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaat 36054926  T
Q  705 tgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaata 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36054927 tgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaaaaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaata 36055026  T
Q  805 ccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36055027 ccacaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 36055074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 841
Target Start/End: Original strand, 38629041 - 38629856
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn--cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactat 110  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  38629041 acagatcaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactat 38629140  T
Q  111 tagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  38629141 tagataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgatt 38629240  T
Q  211 ataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38629241 ataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaa-----aaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataat 38629335  T
Q  311 ttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 410  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38629336 ttgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtacattcttttttttaatgaacgtaaaaattatgttaagaaaagtgcaagttagagg 38629435  T
Q  411 catgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaa 510  Q
    |||||| ||||||||||||           |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |         ||||    
T  38629436 catgatgatttcgacaata-----------caaaatatataatctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttgaaagaaacataaaaaaaaaaaaa 38629524  T
Q  511 ga-atttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaa 609  Q
     | |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38629525 aatatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaaatctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 38629624  T
Q  610 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaat 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38629625 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtatagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 38629724  T
Q  710 accactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccaga 809  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38629725 accgctgaatttcattgaactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaaaaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccaca 38629824  T
Q  810 agacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38629825 agacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 38629856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 504; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 852
Target Start/End: Original strand, 50899749 - 50900514
Alignment:
Q  106 actattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  50899749 actattagataatatactactagcaggttaattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttat 50899848  T
Q  206 tgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttata 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  50899849 tgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattattatacctattaacgtaaagttgtgatttttata 50899948  T
Q  306 ataatttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttctta------tttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtg 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50899949 ataatttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacagtacattattatttttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtg 50900048  T
Q  400 caagttagaggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnn 499  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  50900049 caagttagaggcatgatgatttcgaca--aaatttgccaaacaaaatatataacatgccattgttagagtataacagaaaagaatttggaagaaacgtaa 50900146  T
Q  500 nnnnnngaaaa---------------gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagat 584  Q
           ||||               |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50900147 aaaaaataaaataaaaaaaaaaaagagaatttggaagagtattacaaaatctcaaggaaatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagat 50900246  T
Q  585 tgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaattttt 684  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50900247 tgttagtatgtacattttacattaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatctctagagttttgaataccagtagacaattttt 50900346  T
Q  685 aagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttcc 784  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  50900347 aagttatgcaaaatctcaatcgaataccactggatttcattggactcattaaaaaagcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattct 50900446  T
Q  785 ttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  50900447 ttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 50900514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 841
Target Start/End: Original strand, 19551395 - 19552204
Alignment:
Q  24 aaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn------gactattagataa 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||             |||| ||||||||    
T  19551395 aaatctcaaaaacaaaagtatagttataaatcaaccgaaaaaaa-cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaaaaaaagactgttagataa 19551493  T
Q  118 tatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataataa 217  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19551494 tataccactagcaggttgattgatcttaaaaattctgaacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgattataataa 19551593  T
Q  218 tttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatat 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19551594 tttgattcaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataatactaatgaacgtaaagttttaatttttataataatttgatat 19551693  T
Q  318 ataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgata 417  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19551694 ataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtacattcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgatg 19551793  T
Q  418 atttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaagaatttg 517  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||    
T  19551794 atttcgacaataagtttgtcaaacaaaatatataacctgccattg-tacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaa--aaaaaaatttg 19551890  T
Q  518 gaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctc 617  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19551891 gaagagtattacaaaatctcaaggctatatgtgggagaaagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttattaggtacattttacactaaacaatttc 19551990  T
Q  618 acaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactgg 717  Q
    |||||||          |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  19551991 acaaaat----------caacaatcaattaaaatctgtagagttttgaataccactagacaatttttaagttatgcaaaatcttaattaaataccactgg 19552080  T
Q  718 atttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagactttt 817  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19552081 atttcattgaactcgttaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacatttcttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 19552180  T
Q  818 ataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    
T  19552181 ataaaataaaaaaatcttttaaaa 19552204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 698
Target Start/End: Original strand, 26005092 - 26005768
Alignment:
Q  24 aaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn----cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactattagataat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |            |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  26005092 aaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaactgaagaaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactattagataat 26005191  T
Q  119 atactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataataat 218  Q
     |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26005192 -tactactagcaggttgattgatcttaaaaattatggacatatgatatcaaaataaataaaccaaaaattaagttatgttagtttattgattataataat 26005290  T
Q  219 ttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatata 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26005291 ttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatata 26005390  T
Q  319 taggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataa 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26005391 taggtagatggtaaattaaccacaagattatacggtacattcttttttttaattaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgatga 26005490  T
Q  419 tttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaagaatttgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  26005491 tttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacatgtcattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaa--aaatgaatttgg 26005588  T
Q  519 aagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctca 618  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26005589 aagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctca 26005688  T
Q  619 caaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaat 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26005689 caaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccaatagacaatttttaagttatgcaaaat 26005768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 35731727 - 35731309
Alignment:
Q  15 cagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnngactattaga 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||    
T  35731727 cagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaagactattaga 35731628  T
Q  115 taatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataa 214  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35731627 taaaatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatataatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgattataa 35731528  T
Q  215 taatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35731527 taatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttttgatttttataataatttga 35731428  T
Q  315 ta-tataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttc--ttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggc 411  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35731427 tattataggtagatggtaaattaaccacaaaattatacaataaattcttttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggc 35731328  T
Q  412 atgataatttcgacaataa 430  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  35731327 atgatgatttcaacaataa 35731309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 512 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 35731289 - 35730949
Alignment:
Q  512 aatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaac 611  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  35731289 aatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaatgctaggtgtgagattgttagcaggtgcattttacactaaac 35731190  T
Q  612 aatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaatac 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35731189 aatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatac 35731090  T
Q  712 cactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaag 811  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  35731089 cactggatttgattggactcattaaaaaatcttgaaaatcttaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaatatcacaag 35730990  T
Q  812 acttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  35730989 acttttataaaacaaaaaaatcttttaaaatcctttgaaat 35730949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 530 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 13662887 - 13662576
Alignment:
Q  530 aaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccatt 629  Q
    ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662887 aaaatctcaaggttatgtgtgggaggcagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatccatt 13662788  T
Q  630 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggac 729  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662787 actcacaacaatccattaaaacccgtagtgttttgaatacgagtagacaatttttaagttgtgcgaaatctcaattgaataccactggatttcattggac 13662688  T
Q  730 tcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaa 829  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  13662687 tcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacgagaatgttttacattccttacaaatcttgattgaataccacgagacttttgtaaaacaaaaa 13662588  T
Q  830 agtcttttaaaa 841  Q
    ||||||||||||    
T  13662587 agtcttttaaaa 13662576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 543 - 841
Target Start/End: Original strand, 46251961 - 46252259
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46251961 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 46252060  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46252061 cattaaaatccgtaaagttttgaataccagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 46252160  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  46252161 ttgaaaatcctaattgaataccacaaaaatattttgcattccttaaaaatcttaattgaataccacgagacttgtttaaaacaaaaaaatcttttaaaa 46252259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 572 - 852
Target Start/End: Original strand, 26005770 - 26006050
Alignment:
Q  572 ctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatacca 671  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26005770 ctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccatagagttttgaatacca 26005869  T
Q  672 gtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaa 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26005870 gtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaa 26005969  T
Q  772 tgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||||| |||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26005970 tgttttacattcctttaaaatttttattgaatattacaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 26006050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 234 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 23754185 - 23753871
Alignment:
Q  234 atgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatataggtagatgataaa 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23754185 atgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttacaataatttgatatataggtagatggtaaa 23754086  T
Q  334 ttaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataatttcgacaataagtt 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  23754085 ttaaccacaagattatacagtacgttcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaaaaaaagtgcaagttagaggcatgatgatttcgacaataa--- 23753989  T
Q  434 tgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt---nnnnnnnngaaaagaatttggaagagtattaca 530  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||    
T  23753988 --ccaaacaaaatatataacctgccattgttacaatagaatagaaaagaatttggaagaaacgtataaaaaaataaaaaagaatttggaagagtattaca 23753891  T
Q  531 aaatttcaagagtatgtgtg 550  Q
    |||| | |||||| ||||||    
T  23753890 aaatctaaagagtttgtgtg 23753871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 26556123 - 26555831
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  26556123 tatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatccatta------------ 26556036  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
         ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26556035 -----aaatccgtagagttttgaatacccgtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 26555941  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaa 842  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26555940 tagaaaatcctaattgaataccacaataatattttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaat 26555841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 27593478 - 27593169
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27593478 tatgtgttggagacaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcacaacaatc 27593379  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27593378 cattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagatgtgcaaaacctcaattgaataccactgaattttattggactcattaaaaaatc 27593279  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaa 842  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  27593278 atgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaaatcttttaaaat 27593179  T
Q  843 cctatgaaat 852  Q
    ||| ||||||    
T  27593178 cctttgaaat 27593169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 234 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23697609 - 23697351
Alignment:
Q  234 atgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatataggtagatgataaa 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23697609 atgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataatactaatgaacgtaaaattgtgatttttataataatttgatatataggtagatgataaa 23697510  T
Q  334 ttaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataatttcgacaataagtt 433  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||       
T  23697509 ttaaccacaatattatacagtacgttcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgatgattttgacaataa--- 23697413  T
Q  434 tgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt 497  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23697412 --ccaaacaaaatatataacctgccattgttacaatagaacataaaagaatttggaagaaacgt 23697351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 234 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23716065 - 23715807
Alignment:
Q  234 atgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatataggtagatgataaa 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23716065 atgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataatactaatgaacgtaaaattgtgatttttataataatttgatatataggtagatgataaa 23715966  T
Q  334 ttaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataatttcgacaataagtt 433  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||       
T  23715965 ttaaccacaatattatacagtacgttcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgatgattttgacaataa--- 23715869  T
Q  434 tgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt 497  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23715868 --ccaaacaaaatatataacctgccattgttacaatagaacataaaagaatttggaagaaacgt 23715807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 234 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23734521 - 23734263
Alignment:
Q  234 atgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatataggtagatgataaa 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23734521 atgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataatactaatgaacgtaaaattgtgatttttataataatttgatatataggtagatgataaa 23734422  T
Q  334 ttaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataatttcgacaataagtt 433  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||       
T  23734421 ttaaccacaatattatacagtacgttcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgatgattttgacaataa--- 23734325  T
Q  434 tgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt 497  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23734324 --ccaaacaaaatatataacctgccattgttacaatagaacataaaagaatttggaagaaacgt 23734263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26556715 - 26556415
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn----gacta 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||           |||||    
T  26556715 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaa-cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaaaaagacta 26556617  T
Q  110 ttagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgat 209  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  26556616 ttagataataaactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgat 26556517  T
Q  210 tataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26556516 tataataatttgattgaaaaatgcatgttataggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataatatcaatgaacgtaaagttgtgatttttataataa 26556417  T
Q  310 tt 311  Q
    ||    
T  26556416 tt 26556415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Original strand, 52023961 - 52024267
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  52023961 tatgtgtgggagacaaaaaagtct----gttaggtgtgagattgttactaggtacattttatactaaaaagtctcttaaaatccattactcacaacaatc 52024056  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52024057 cattaaaatccgtagaattttgattactaatagacaatttttaaattgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggactcattaaaaaatc 52024156  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagac-ttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  52024157 ttgaaaatcataattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaa 52024256  T
Q  842 acctatgaaat 852  Q
     ||| ||||||    
T  52024257 tcctttgaaat 52024267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 530 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 36786309 - 36785999
Alignment:
Q  530 aaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccatt 629  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  36786309 aaaatctcaaggctatgtgtgagagacaaaaaagtctcaaggc-aggtgtgtgattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcataaaatccatt 36786211  T
Q  630 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggac 729  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36786210 actcacaacaattcattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaagtttaaagttttgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggac 36786111  T
Q  730 tcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaa 829  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  36786110 tcattaaaaaatccttaaaattctaattgaatgccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaa 36786011  T
Q  830 agtcttttaaaa 841  Q
    ||||||||||||    
T  36786010 agtcttttaaaa 36785999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 547 - 830
Target Start/End: Original strand, 39338062 - 39338342
Alignment:
Q  547 tgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccatt 646  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39338062 tgtgggagaca-aaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctca--aaatccattactcacaacaatccatt 39338158  T
Q  647 aaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtga 746  Q
    ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  39338159 aaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggactcattaaaaaatcctaa 39338258  T
Q  747 aaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaa 830  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  39338259 aaatcctaattgaataacacaagaatattttagattccttaaaagtctttattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaa 39338342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 569 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 38682728 - 38682443
Alignment:
Q  569 aggctaggtgtgagattgttagtagatac---attttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttga 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38682728 aggctaggtgtgagattgttagtaggtactacattttatactaaaaaatctctcaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagaattttga 38682629  T
Q  666 ataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcatt-aaaaaatcgtgaaaatcctaattgaatacc 764  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  38682628 ataccaata-acaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaatatcactgaagtttattggactcattaaaaaaatcttgaaaatcataattgaatacc 38682530  T
Q  765 acaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  38682529 acaataat-ttttacatttcttaaaaatcttgattgaataccacaagatttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 38682443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 279
Target Start/End: Original strand, 2124932 - 2125196
Alignment:
Q  18 accaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn--cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactattaga 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||    
T  2124932 accaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaaaacattgaatcaatgtgtgtaatatttcttcaaaaaaaagactattaga 2125031  T
Q  115 taatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataa 214  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2125032 taatatactactagcatgttgattgatcttaaaaattctggacatatgatataaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgattataa 2125131  T
Q  215 taatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataatacca 279  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2125132 taatttgattaaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataatacca 2125196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 684 - 841
Target Start/End: Original strand, 53183972 - 53184129
Alignment:
Q  684 taagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttc 783  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  53183972 taagttatgcaaaatctcaattgaataccaccagattttattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaatagcacaagaatgttttaccttc 53184071  T
Q  784 cttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  53184072 cttaaaaatcttgattgaataccacgagacttttttaaaacaaaaaaatcttttaaaa 53184129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23697698 - 23697604
Alignment:
Q  105 gactattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgtta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  23697698 gactattagataatatactactagcatgttgattgatcttaaaaattctgaacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataaattatgtta 23697604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23716154 - 23716060
Alignment:
Q  105 gactattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgtta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  23716154 gactattagataatatactactagcatgttgattgatcttaaaaattctgaacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataaattatgtta 23716060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23734610 - 23734516
Alignment:
Q  105 gactattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgtta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  23734610 gactattagataatatactactagcatgttgattgatcttaaaaattctgaacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataaattatgtta 23734516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23754274 - 23754180
Alignment:
Q  105 gactattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgtta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  23754274 gactattagataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattatgaacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataaattatgtta 23754180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 660 - 852
Target Start/End: Original strand, 6783976 - 6784168
Alignment:
Q  660 ttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattga 759  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| |  || ||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  6783976 ttttgaatatcaagagacaatttttaagttgtggaaaatcttgatggaataccaccgaatttggttggactctttaaaaaatcctgaaaatcttaattta 6784075  T
Q  760 ataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    ||||||| |||||  |||    || || ||||||||||||||||| |  |||| |||| || ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  6784076 ataccaccagaattatttctaatcttttaaaatcttgattgaatatctcaagatttttgtataactaaaaagtcttataaaatcctttgaaat 6784168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 674 - 766
Target Start/End: Original strand, 25713327 - 25713420
Alignment:
Q  674 agacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaa-tcgtgaaaatcctaattgaataccac 766  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||  ||||||  ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25713327 agacaatttttaagttgtgaaaaatcttgattgaataccaacggattttgttggattctttaaaaaaatcatgaaaatcctaattgaataccac 25713420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 753 - 841
Target Start/End: Original strand, 10104982 - 10105070
Alignment:
Q  753 taattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||  ||   ||||| |||||||||||||||| |||| |||| || || |||||||||||||||||    
T  10104982 taattgaataccacaagatttatttatattttataaaagtcttgattgaataccacaagatttttttataataaaaaagtcttttaaaa 10105070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 753 - 841
Target Start/End: Original strand, 10225758 - 10225846
Alignment:
Q  753 taattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||  ||   ||||| ||||||||||||| || ||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  10225758 taattgaataccacaagatttatttatattttataaaagtcttgattgaatagcacaagacttttttataataaaaaagtcttttaaaa 10225846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 718 - 766
Target Start/End: Original strand, 33119571 - 33119619
Alignment:
Q  718 atttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccac 766  Q
    |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33119571 attttattggattctttaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccac 33119619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 786 - 841
Target Start/End: Original strand, 10216162 - 10216217
Alignment:
Q  786 taaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||||||||||    
T  10216162 taaaagtcttgattgaataccacaagacttttttataataaaaaaatcttttaaaa 10216217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 23697801 - 23697762
Alignment:
Q  19 ccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaac 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23697801 ccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttattaatcaac 23697762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 23716256 - 23716217
Alignment:
Q  19 ccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaac 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23716256 ccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttattaatcaac 23716217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 23734712 - 23734673
Alignment:
Q  19 ccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaac 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23734712 ccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttattaatcaac 23734673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 23754374 - 23754335
Alignment:
Q  19 ccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaac 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23754374 ccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttattaatcaac 23754335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 43151388 - 43151261
Alignment:
Q  639 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaa 738  Q
    ||||||||||||||  || | |||| |||||||   ||||||||||||||| |  ||| |||  |||||||||||| | | || | | ||||| ||||||    
T  43151388 aatccattaaaatctatatatttttaaataccaaaggacaatttttaagttgtataaatttttgattgaataccaccgaaatttagtagactctttaaaa 43151289  T
Q  739 aatcgtgaaaatcctaattgaataccac 766  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||    
T  43151288 atttttgaaaatcctaattgaataccac 43151261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 35337701 - 35337652
Alignment:
Q  792 tcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  35337701 tcttgattgaataccacaagactttttcataataaaaaagtcttttaaaa 35337652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 613; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 613; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 852
Target Start/End: Original strand, 43056910 - 43057748
Alignment:
Q  24 aaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn-cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactattagataatata 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  43056910 aaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactattagataatata 43057009  T
Q  122 ctactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataataatttg 221  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43057010 ctactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttaatttattgattataataatttg 43057109  T
Q  222 attgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatatag 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43057110 attgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatatag 43057209  T
Q  322 gtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataattt 421  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43057210 atagatggtaaattaaccacaagattatacagtacattcttttttttaatgaacgtaaaaattatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgatgattt 43057309  T
Q  422 cgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaa--------gaa 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||        |||    
T  43057310 cgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatgaa 43057409  T
Q  514 tttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaa 613  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43057410 tttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaa 43057509  T
Q  614 tctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaatacca 713  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43057510 tctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 43057609  T
Q  714 ctggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagac 813  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| || |||||    
T  43057610 ctggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatattaatagaataacacaagac 43057709  T
Q  814 ttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  43057710 ttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 43057748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 600; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 152715 - 151875
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactatta 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||    
T  152715 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttattaatcaaccgaaaaaaa-cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactatta 152617  T
Q  113 gataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  152616 gataatatactactagcagattgattaatcttaaaaatcatggacatatgatatcaaaataaatagatctaaaaataagttatgttagtttattgattat 152517  T
Q  213 aataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataattt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  152516 aataatttgattgaaaaatgcatgttacatctagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataattt 152417  T
Q  313 gatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttc-ttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggc 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  152416 gatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtacattctttttttttaatgaacgtaaaagtcatgttaagaaaagtgcaagttagagga 152317  T
Q  412 atgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt-nnnnnnnngaaaa 510  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||    
T  152316 atgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaaaa 152217  T
Q  511 gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaa 610  Q
    || ||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  152216 gattttggtagagtattacaaaatctaaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa 152117  T
Q  611 caatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaata 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  152116 caatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccattagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata 152017  T
Q  711 ccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaa 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  152016 ccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaatatcacaa 151917  T
Q  811 gacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  151916 gacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 151875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 841
Target Start/End: Original strand, 35089329 - 35090162
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn-cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactatt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||    
T  35089329 acagaccaaaaaatctcaaaaataaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatttttcttcaaaaaaaagactatt 35089428  T
Q  112 agataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgatta 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35089429 agataatatactactagcagattgattaatcttaaaaattatggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttaatttattgatta 35089528  T
Q  212 taataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35089529 taataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccgatgaacgtaaagttgtgatttttataataatt 35089628  T
Q  312 tgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggc 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35089629 tgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacaatacattcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaaatgcaagttagaggc 35089728  T
Q  412 atgataatttcgacaataagtttgccaaac--aaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaa 509  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  || | |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||         |||    
T  35089729 atgatgatttcgacaataagtttgtcaaacaaaaaatatataatatgtcgttgttacagtagaatataaaagaatttggaaaaaacgtaaaaaaaaaaaa 35089828  T
Q  510 a--gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacact 607  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  35089829 aatgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttatacc 35089928  T
Q  608 aaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattga 707  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35089929 aaacaatctcacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattga 35090028  T
Q  708 ataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaatacca 807  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35090029 ataccacttgatttcattggactcattaaaaaatcatgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaattttgattgaatacca 35090128  T
Q  808 gaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35090129 caagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 35090162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 548; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 852
Target Start/End: Original strand, 27417880 - 27418709
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn-cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactatt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  27417880 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaacaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactatt 27417979  T
Q  112 agataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgatta 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  27417980 agataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgatta 27418079  T
Q  212 taataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27418080 taataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacaaaaagttgtgatttttataataatt 27418179  T
Q  312 tgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttattttt-aatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 410  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27418180 tgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtacgttctttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 27418279  T
Q  411 catgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaa 510  Q
    |||||| |||||||||||||               ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||    
T  27418280 catgatgatttcgacaataa---------------tatataatctgtcattgttatagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaaa 27418364  T
Q  511 ---gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacact 607  Q
       |||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27418365 aatgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctttgtgtgggagaccaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttaatagatacattttacact 27418464  T
Q  608 aaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattga 707  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27418465 aaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgattactagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattga 27418564  T
Q  708 ataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaatacca 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27418565 ataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaatacca 27418664  T
Q  808 gaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27418665 caagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 27418709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 519; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 30111647 - 30110831
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn-cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactatt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||         |||||||    
T  30111647 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaacaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttaaaaaaaaagactatt 30111548  T
Q  112 agataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgatta 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||| |||| |||||||||||    
T  30111547 agataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaa-----ttatgttagtttattgatta 30111453  T
Q  212 taataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30111452 taataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacaaaaagttgtgatttttataataatt 30111353  T
Q  312 tgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttattttt-aatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 410  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30111352 tgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtacgttctttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 30111253  T
Q  411 catgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaa 510  Q
    |||||| |||||||| ||||               ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||    
T  30111252 catgatgatttcgacgataa---------------tatataatctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaataa 30111168  T
Q  511 ------gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttac 604  Q
          |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30111167 aaaaatgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttaatagatacattttac 30111068  T
Q  605 actaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaat 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30111067 actaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataatagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaat 30110968  T
Q  705 tgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaata 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  30110967 tgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttaattgaata 30110868  T
Q  805 ccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30110867 ctacaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 30110831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 609
Target Start/End: Original strand, 47913553 - 47914153
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn-cattgaatcaatgagtgtaata---tttcttcnnnnnnngacta 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||   |||||||       |||||    
T  47913553 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaacaaaacattgaatcaatgagtgtaataatatttcttcaaaaaaagacta 47913652  T
Q  110 ttagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  47913653 ttagataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatataatatcaaaataaatagacctaaaaataagctatgttaatttattgat 47913752  T
Q  210 tataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47913753 tataataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataa 47913852  T
Q  310 tttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagag 409  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47913853 tttgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtacgttcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagag 47913952  T
Q  410 gcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaa 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||    
T  47913953 gcatgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctaccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaa 47914052  T
Q  510 a-gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacacta 608  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47914053 atgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacacta 47914152  T
Q  609 a 609  Q
    |    
T  47914153 a 47914153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 47913100 - 47912629
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn-cattgaatcaatgagtgtaata---tttcttcnnnnnnngacta 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||   |||||||       |||||    
T  47913100 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaacaaaacattgaatcaatgagtgtaataatatttcttcaaaaaaagacta 47913001  T
Q  110 ttagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  47913000 ttagataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatataatatcaaaataaatagacctaaaaataagctatgttaatttattgat 47912901  T
Q  210 tataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47912900 tataataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataa 47912801  T
Q  310 tttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagag 409  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47912800 tttgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatatagtacgttcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagag 47912701  T
Q  410 gcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaag 481  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47912700 gcatgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctaccattgttacagtagaacagaaaag 47912629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 321; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 105 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 33475256 - 33474810
Alignment:
Q  105 gactattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaattta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||    
T  33475256 gactattagataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatccaaataaatagacctaaaaataagttatgatagttta 33475157  T
Q  205 ttgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33475156 ttgattataataatttgattgaaatatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacataaagttgtgatttttat 33475057  T
Q  305 aataatttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttc--ttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaa 402  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33475056 aataatttgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagttcgttcttttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaa 33474957  T
Q  403 gttagaggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnn 502  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  33474956 gttagaggcatgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacatgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaa 33474857  T
Q  503 nnngaaaagaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtg 550  Q
        | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33474856 aaa-ataaaaatttggaagagtattacaaaatctcaagagtttgtgtg 33474810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 105 - 497
Target Start/End: Original strand, 12252752 - 12253127
Alignment:
Q  105 gactattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaattta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  12252752 gactattagataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctgaacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagttta 12252851  T
Q  205 ttgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttat 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||              ||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12252852 ttgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacaagtagaaaaat--------------tattataa---caatgaacgtaaaattgtgatttttat 12252934  T
Q  305 aataatttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagt 404  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12252935 aataatttgatatataggtatatggtaaattaaccacaagattatacagtacgttcttttttttaatgaacataaaagttatgttaagaaaagtgtaagt 12253034  T
Q  405 tagaggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt 497  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12253035 tagaggcatgatgattttgacaataagtttgccgaacaaaatatataacttgccattgttatagtagaacagaaaagaatttgaaagaaacgt 12253127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 606 - 852
Target Start/End: Original strand, 47914878 - 47915124
Alignment:
Q  606 ctaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaatt 705  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47914878 ctaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccataaaaatctgtagagttttgaatactagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaatt 47914977  T
Q  706 gaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaatac 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  47914978 gaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttcaaaatcttaattgaatac 47915077  T
Q  806 cagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47915078 cacaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctatgaaat 47915124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 530 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 40097434 - 40097111
Alignment:
Q  530 aaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccat 628  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  40097434 aaaatctcaagactatgtgtgggagacaaaaaaagtctcaaagctaggtgtgagattgttagtagatgcattttacattaaaaagtctcacaaaatccat 40097335  T
Q  629 tactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattgga 728  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40097334 tagtcataacaatccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctgaattgaataccactgaattttattgga 40097235  T
Q  729 ctcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaa 828  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  40097234 ctcattaaaaaattttgaaaatcataattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaa 40097135  T
Q  829 aagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||    
T  40097134 aagtcttttaaaatcctttgaaat 40097111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 547 - 841
Target Start/End: Original strand, 39301018 - 39301302
Alignment:
Q  547 tgtgggagacagaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccat 645  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||            |||||||||||||||||||| ||    
T  39301018 tgtgggagacaaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacattaaa------------atccattactcacaacaatctat 39301105  T
Q  646 taaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtg 745  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||    
T  39301106 taaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggaatttattggactcattaaaaaattctg 39301205  T
Q  746 aaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaac-aaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39301206 aaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattaaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaaagtcttttaaaa 39301302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 643 - 841
Target Start/End: Original strand, 24939509 - 24939705
Alignment:
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||  |||||||| ||||||| ||    
T  24939509 cattaaaatctataaatttttgaataccaa-agactatttttaagttatgaaaaattttaattgaataccatcagattttgttggactctttaaaaattc 24939607  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
     |||||||| ||||||||||||||  |||| | ||    || || |||||| ||||||||||||  |||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  24939608 atgaaaatcataattgaataccac-cgaatttattctaatcttttaaaatcatgattgaatacctcaagatttttctataaccaaaaagtcttttaaaa 24939705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 639 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 31494469 - 31494267
Alignment:
Q  639 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaa 738  Q
    ||||||||||||||  || | |||| |||||||  |||||||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||  |||||  || ||||| ||||||    
T  31494469 aatccattaaaatcaatacattttttaataccaagagacaatttttaagttgtaaaaaatcttgattgaataccaccagattttgtttgactctttaaaa 31494370  T
Q  739 aatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtctttta 838  Q
    |||| | |||||||||||||||||| ||  ||||  |||    || || |||||||||||||||||||  |||| |||| || ||| |||||||||||||    
T  31494369 aatcattaaaatcctaattgaatacaactggaattatttctaatcttttaaaatcttgattgaatacctcaagatttttctataaccaaaaagtctttta 31494270  T
Q  839 aaa 841  Q
    |||    
T  31494269 aaa 31494267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 660 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 47031454 - 47031273
Alignment:
Q  660 ttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattga 759  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||| || || ||  |||  || ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||||    
T  47031454 ttttaaataccaagagacaatttttaaattgtgaaattttttgatggaataccactggatttggttgaactctttaaaaattcttgaaaatcttaattga 47031355  T
Q  760 ataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||  ||||  ||||   |  || ||||||||||||||||| |  |||| |||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  47031354 ataccaccggaattatttataattttttaaaatcttgattgaatatctcaagatttttctataaccaaaaagttttttaaaa 47031273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 605 - 713
Target Start/End: Original strand, 46037170 - 46037278
Alignment:
Q  605 actaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaat 704  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |   ||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||  |||| |||||    
T  46037170 actaaaaagtctcacaaaatccattccatccaagaatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatagacaattcataagtcatgagaaatctcaat 46037269  T
Q  705 tgaatacca 713  Q
    |||||||||    
T  46037270 tgaatacca 46037278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 57
Target Start/End: Original strand, 12252652 - 12252690
Alignment:
Q  19 ccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaa 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12252652 ccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaa 12252690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 786 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 3634296 - 3634241
Alignment:
Q  786 taaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  3634296 taaaagtcttgattgaatatcacaagacttttttataataaaaaagtcttttaaaa 3634241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 787 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 28342313 - 28342259
Alignment:
Q  787 aaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||  ||||||||||||||||    
T  28342313 aaaaatcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttttaaaa 28342259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 8078363 - 8078314
Alignment:
Q  792 tcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  8078363 tcttgattgaataccacaagacttttttatgataaaaaagtcttttaaaa 8078314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 33475356 - 33475315
Alignment:
Q  19 ccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccg 60  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33475356 ccaaaaaatttcaaaaacaaaagtacagttataaatcagccg 33475315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 34695199 - 34695150
Alignment:
Q  792 tcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  34695199 tcttgattgaataccacaagactttttcataataaaaaagtcttttaaaa 34695150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 596; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 596; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 52706251 - 52705421
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn---gactat 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||          ||||||    
T  52706251 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaaaagactat 52706152  T
Q  111 tagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgatt 210  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  52706151 tagataataaactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgatt 52706052  T
Q  211 ataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52706051 ataataatttgattgaaaaatgcatgttataggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataatatcaatgaacgtaaagttgtgatttttataataat 52705952  T
Q  311 ttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 410  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52705951 tagatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacggtacattcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 52705852  T
Q  411 catgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaa 510  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         |||     
T  52705851 catgatgatttcgacaataagtttgtcaaacaaaatatataatctgccattgttacagtataacagaaaagaatttggaagaaacgtagaaaaaaaaaat 52705752  T
Q  511 gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaa 610  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  52705751 gaatttggaagagtattacaatatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtcttaaggctaggcgtgagattgttagtaagtacattttacaccaaa 52705652  T
Q  611 caatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaata 710  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52705651 caatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata 52705552  T
Q  711 ccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaa 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52705551 ccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaa 52705452  T
Q  811 gacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52705451 gacttttataaaacaaaaaaatcttttaaaa 52705421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 590; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 852
Target Start/End: Original strand, 26882048 - 26882893
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn--gactatt 111  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  26882048 acagacaaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttaaaaaaaaaagactatt 26882147  T
Q  112 agataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgatta 211  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||    
T  26882148 agataatatcctactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttcttgatta 26882247  T
Q  212 taataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26882248 taataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattatcataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataacaatt 26882347  T
Q  312 tgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggc 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26882348 tgatatataggtagatggtaaattaaccataagattatacaatacagtcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggc 26882447  T
Q  412 atgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaa--- 508  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||         ||       
T  26882448 atgatgatttcgacaataagtttgtcaaacaaaatatataacctgccattgttatagtagaacagaaaagaatttggaagaaatgtaaaaaaaaaaaaaa 26882547  T
Q  509 --aagaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacac 606  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26882548 ataataatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggtgatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtatatacattttacac 26882647  T
Q  607 taaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattg 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26882648 taaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatctgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattg 26882747  T
Q  707 aataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaatacc 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26882748 aataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataac 26882847  T
Q  807 agaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26882848 acaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 26882893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 45319329 - 45318477
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaa-caaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn---cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gact 108  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||           |||||||||||| ||||||||||||||||        ||||    
T  45319329 acagaccaaaaaatctcaaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccggaaaaaaaaaacattgaatcaataagtgtaatatttcttcaaaaaaaagact 45319230  T
Q  109 attagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattga 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  45319229 attagataataaactactagcaaattgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatacacctaaaaataagttatgttagtttattga 45319130  T
Q  209 ttataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataata 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45319129 ttataataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataatatcaatgaatgtaaagttgtgatttttataata 45319030  T
Q  309 atttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttaga 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45319029 atttgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacggtacattcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttaga 45318930  T
Q  409 ggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt---------nn 499  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||               
T  45318929 ggcatgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtataacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaagaaaag 45318830  T
Q  500 nnnnnngaaaagaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacat 599  Q
           |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  45318829 aaaaaaaaaaagaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggtgataaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacat 45318730  T
Q  600 tttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatt 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45318729 tttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatc 45318630  T
Q  700 tcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgatt 799  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45318629 tcaattgaataccactggatttcattggattcattagaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaataatgttttacattccttaaaaatcttgatt 45318530  T
Q  800 gaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45318529 gaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 45318477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 45535609 - 45535131
Alignment:
Q  24 aaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn---cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnngactattagataatat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||     
T  45535609 aaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaatcggaaaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatattacttcaaaaaaagactattagataata- 45535511  T
Q  121 actactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataataattt 220  Q
     |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45535510 -ctactagcaggttgattgatcttaaaaattctagacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttaatttattgattataataattt 45535412  T
Q  221 gattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatata 320  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45535411 gattgaaaaatgcatgttacaggtggaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtagagttgtgatttttataataatttgatatata 45535312  T
Q  321 ggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttc----ttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgat 416  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45535311 agtagatgataaattaaccataagattatacagtacgttcttttttttttttaatgaacgtaaatgttatgttaagaaaagtacaagttagaggcatgat 45535212  T
Q  417 aatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt 497  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  45535211 gatttcgacaataaatttgccaaacaaaatatatatcttgccattgttacaataaaacagaaaagaatttggaagaaacgt 45535131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 530 - 841
Target Start/End: Original strand, 1928149 - 1928460
Alignment:
Q  530 aaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccatt 629  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1928149 aaaatctcaagactatgtgtgggagacaaaaaagtcacaaggctaggtgtgagattgttagtagatgcattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 1928248  T
Q  630 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggac 729  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1928249 actcataacaatccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctgaattgaataccactggattttattggac 1928348  T
Q  730 tcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaa 829  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  1928349 tcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaa 1928448  T
Q  830 agtcttttaaaa 841  Q
    ||||||||||||    
T  1928449 agtcttttaaaa 1928460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 36402573 - 36402264
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36402573 tatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttagatgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcacaacaatc 36402474  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36402473 cattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggactcattaaaaaatc 36402374  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaa 842  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  36402373 ctgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaat 36402274  T
Q  843 cctatgaaat 852  Q
    ||| ||||||    
T  36402273 cctttgaaat 36402264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 29209081 - 29208772
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29209081 tatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttggtagatatatgttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcacaacaatc 29208982  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29208981 cattaaaatccttagaactttgaataccaatagacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggactcattaaaaaatc 29208882  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaa 842  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  29208881 ctgaaaatcctaattgaataccaccagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacatttttaaaacaaaaaagtcttttaaaat 29208782  T
Q  843 cctatgaaat 852  Q
    ||| ||||||    
T  29208781 cctttgaaat 29208772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 10897126 - 10896817
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10897126 tatgtgtgagagacaaaaaagtgtcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacattaaaatgtttcacaaaatccattactcataacaatc 10897027  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    |||||||||||    | |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10897026 cattaaaatcctaccaattttgaataccaatagacaatttttaagttgggcaaaatctcaattgaataccactggattttattagactcattaaaaaatc 10896927  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaa 842  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||     
T  10896926 ctgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaataaaaaaatcttttaaaat 10896827  T
Q  843 cctatgaaat 852  Q
    ||| ||||||    
T  10896826 cctttgaaat 10896817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 543 - 841
Target Start/End: Original strand, 33243072 - 33243366
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||||| |||||||||     ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  33243072 tatgtgtgggagacaaaaaagtctct----taggtgtgagattgttagtaggtacaatttacattaaaaagtttcacaaaatccattactcacaacaatc 33243167  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33243168 cattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtacaaaatctcaattgaataccactggattttattgtactcattaaaaaatc 33243267  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33243268 ttgaaaatcctaattgaataccacaagaatattttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaaaacttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaa 33243366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 543 - 841
Target Start/End: Original strand, 33263245 - 33263539
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||||| |||||||||     ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  33263245 tatgtgtgggagacaaaaaagtctct----taggtgtgagattgttagtaggtacaatttacattaaaaagtttcacaaaatccattactcacaacaatc 33263340  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33263341 cattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtacaaaatctcaattgaataccactggattttattgtactcattaaaaaatc 33263440  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33263441 ttgaaaatcctaattgaataccacaagaatattttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaaaacttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaa 33263539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14389150 - 14389005
Alignment:
Q  105 gactattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaattta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  14389150 gactattagataatatactactagtaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagttta 14389051  T
Q  205 ttgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14389050 ttgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaa 14389005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 564 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 45535089 - 45534847
Alignment:
Q  564 tctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 663  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       
T  45535089 tctcaaggctacgtgtgagattgttagtaggtacattttacactcaacaatctcaaaaaatccattactcacaacaatccattaaaatcagtagagt--- 45534993  T
Q  664 gaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaatac 763  Q
                       |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  45534992 -------------------ttaagttatgcaaaatctcaattgaataccgctgaatttcattggactcattaaaaaatcttaaaaatcctaattaaatac 45534912  T
Q  764 cacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaat-accagaagacttttataaaacaaaaa 829  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | |  |  ||||||||||||||||||||    
T  45534911 cacaagaatg--ttacattccttaaaaatcttgattgactaagtaccagacttttataaaacaaaaa 45534847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 660 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 9831499 - 9831316
Alignment:
Q  660 ttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattga 759  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         ||||||||    
T  9831499 ttttgaataccaatagacaatttgtaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggactcattaaaaaatc---------ctaattga 9831409  T
Q  760 ataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9831408 atactacaagaatgttttagattccttacaagttttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 9831316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 381 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 39758432 - 39758260
Alignment:
Q  381 agttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataatttcgacaa-taagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacag--tagaacaga 477  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  |||||||||    
T  39758432 agttctgttaagaaaagtgcaagtcagaggcatgatgatttcgacaagcaagtttgccaaacaaaatatataacctgccatcgtcatagtatagaacaga 39758333  T
Q  478 aaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaagaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtg 550  Q
    ||||||||| ||||||||||         ||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  39758332 aaagaattttgaagaaacgtcaaaaaaaaaattgaatttggaagagtatcacacaatctcaagagtttgtgtg 39758260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 381 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 39763786 - 39763614
Alignment:
Q  381 agttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataatttcgacaa-taagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacag--tagaacaga 477  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  |||||||||    
T  39763786 agttctgttaagaaaagtgcaagtcagaggcatgatgatttcgacaagcaagtttgccaaacaaaatatataacctgccatcgtcatagtatagaacaga 39763687  T
Q  478 aaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaagaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtg 550  Q
    ||||||||| ||||||||||         ||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  39763686 aaagaattttgaagaaacgtcaaaaaaaaaattgaatttggaagagtatcacacaatctcaagagtttgtgtg 39763614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 568 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 9831867 - 9831782
Alignment:
Q  568 aaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatcc 653  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9831867 aaggttaggtgtgagattgttagtaagtatattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatcc 9831782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 598 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 9191402 - 9191159
Alignment:
Q  598 attttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaac-aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaa 696  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| |||||  || | ||||||||||||  |||||||||||||||| |   ||    
T  9191402 attttaaaataaaaaatctcacaaaatccatt-ctaccaagtaatccattgaaatcaatacatttttgaataccaagagacaatttttaagttgtaataa 9191304  T
Q  697 atttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttg 796  Q
    || |  ||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||  |||    || || |||||||||    
T  9191303 atcttgattgaataccaccagattttgttggactctttaaaaaatcattaaaatcctaattgaataccaccggaattatttctaatcttttaaaatcttg 9191204  T
Q  797 attgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||| |  |||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  9191203 attgaataactcaagatttttctataaccaaaaagtcttttaaaa 9191159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 39758602 - 39758447
Alignment:
Q  145 aaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagaccta----aaagtaagttacgttaatt-tattgattataataatttgattgaaaaatgcatgtta 239  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |     ||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39758602 aaaaattatgggcatatgatatcaaaataaatagacatgcattaaaataagttatgttaagtctattcattataataatttgattgaaaaatgcatgtta 39758503  T
Q  240 c---atgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagt 292  Q
        | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  39758502 ttataggaagaaaaaagcaagtagaaaaattattataatgtcaatgaacataaagt 39758447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 39763956 - 39763801
Alignment:
Q  145 aaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagaccta----aaagtaagttacgttaatt-tattgattataataatttgattgaaaaatgcatgtta 239  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |     ||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39763956 aaaaattatgggcatatgatatcaaaataaatagacatgcattaaaataagttatgttaagtctattcattataataatttgattgaaaaatgcatgtta 39763857  T
Q  240 c---atgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagt 292  Q
        | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  39763856 ttataggaagaaaaaagcaagtagaaaaattattataatgtcaatgaacataaagt 39763801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14389253 - 14389212
Alignment:
Q  19 ccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccg 60  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14389253 ccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccg 14389212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 577 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 48194882 - 48194746
Alignment:
Q  577 tgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtaga 676  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||  |||||| | |||||||||||||||| |   ||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| | ||    
T  48194882 tgtgagattgttggaagagatatttttaactaaaaagtctcacaaaatccattccatccaagaatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatgga 48194783  T
Q  677 caatttttaagttatgcaaaatttcaattgaatacca 713  Q
    |||||  ||||| |||  |||| ||||||||||||||    
T  48194782 caattcataagtcatgagaaatctcaattgaatacca 48194746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 605 - 713
Target Start/End: Original strand, 19007400 - 19007508
Alignment:
Q  605 actaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaat 704  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |   ||| ||||||| ||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||  ||||| |||  |||| |||||    
T  19007400 actaaaaagtctcacaaaatccattccatccaagaatccatcaaaatctatagactttttaataccaatagacaattcataagtcatgagaaatctcaat 19007499  T
Q  705 tgaatacca 713  Q
    |||||||||    
T  19007500 tgaatacca 19007508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 577 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 48203640 - 48203504
Alignment:
Q  577 tgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtaga 676  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||  |||||| | |||||||||||||||| |   ||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||  | ||    
T  48203640 tgtgagattgttggaagagatatttttaactaaaaagtctcacaaaatccattccatccaagaatccatcaaaatctatagacttttgaatacctatgga 48203541  T
Q  677 caatttttaagttatgcaaaatttcaattgaatacca 713  Q
    |||||  ||||| |||  |||| ||||||||||||||    
T  48203540 caattcataagtcatgagaaatctcaattgaatacca 48203504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14387695 - 14387660
Alignment:
Q  245 agaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaa 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14387695 agaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaa 14387660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 790 - 841
Target Start/End: Original strand, 50192789 - 50192840
Alignment:
Q  790 aatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  50192789 aatcttgattgaataccacaagactttttcataataaaaaagtcttttaaaa 50192840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 841
Target Start/End: Original strand, 19452090 - 19452139
Alignment:
Q  792 tcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  19452090 tcttgattgaataccacaagactttttcaagataaaaaagtcttttaaaa 19452139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 841
Target Start/End: Original strand, 38536287 - 38536336
Alignment:
Q  792 tcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  38536287 tcttgattgaataccacaagacttttttataaataaaaagtcttttaaaa 38536336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 841
Target Start/End: Original strand, 38558505 - 38558554
Alignment:
Q  792 tcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  38558505 tcttgattgaataccacaagacttttttataaataaaaagtcttttaaaa 38558554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 42657791 - 42657742
Alignment:
Q  792 tcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  42657791 tcttgattgaataccacaagacttttttataattaaaaagtcttttaaaa 42657742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 595; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 595; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 841
Target Start/End: Original strand, 81006 - 81838
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn---gactat 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||          ||||||    
T  81006 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaaaagactat 81105  T
Q  111 tagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||    
T  81106 tagataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaataaacctaaaaataaattatgttagtttattgatt 81205  T
Q  211 ataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  81206 ataataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataatatcaatgaacgtaaagttatgatttttataataat 81305  T
Q  311 ttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 410  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81306 ttgatatataggtagatggtaaattaacaacaagattatacggtacattcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 81405  T
Q  411 catgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaa 510  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |         ||||    
T  81406 catgatgattttgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttagaagaaacataaaaaaaaaaaaa 81505  T
Q  511 --gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacacta 608  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81506 atgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgagagatagaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtagatacattttacacta 81605  T
Q  609 aacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaa 708  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  81606 aacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccaggagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaa 81705  T
Q  709 taccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccag 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  81706 taccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaatagcacaagaatgttttagattccttaaaaatcttgattgaataccac 81805  T
Q  809 aagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81806 aagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 81838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 594; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 594; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 852
Target Start/End: Original strand, 8583233 - 8584072
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn--cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactat 110  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  8583233 acagacaaaaaaatctcaaaaacaaaagtaca-ttataaatcaaccgaaaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactat 8583331  T
Q  111 tagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgatt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  8583332 tagataatatactactaacaggttgattgatcttaaaaattctagacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgatt 8583431  T
Q  211 ataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8583432 ataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataat 8583531  T
Q  311 ttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 410  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8583532 ttgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtacattcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 8583631  T
Q  411 catgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaa 510  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||         |||     
T  8583632 catgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatatgacctgccattgttatagtagaacagaaaagaatttggatgaaacgtaaaaaaaa-aaat 8583730  T
Q  511 gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaa 610  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8583731 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa 8583830  T
Q  611 caatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaata 710  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8583831 caatctcacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatcttaattgaata 8583930  T
Q  711 ccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaa 810  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8583931 ccactgaatttcattggactcgttaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaa 8584030  T
Q  811 gacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8584031 gacttttataaaataaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 8584072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 540; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 770
Target Start/End: Original strand, 42217674 - 42218431
Alignment:
Q  18 accaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactattagata 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||    
T  42217674 accaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaacagaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactattagata 42217773  T
Q  117 atatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataata 216  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42217774 atatactactagcatgttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaatgaatagacttaaaaataagttatgttagtttattgattataata 42217873  T
Q  217 atttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgata 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42217874 atttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgata 42217973  T
Q  317 tataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgat 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42217974 tataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtacattctttttttaaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgat 42218073  T
Q  417 aatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaa----ga 512  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         ||||    ||    
T  42218074 gatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataatctgccattgttacagtagaatagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaaaaaatga 42218173  T
Q  513 atttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaaca 612  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42218174 atttggaagaatattacaaaatctcaaggctatgtgtaggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaca 42218273  T
Q  613 atctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42218274 atctcacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatatcagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacc 42218373  T
Q  713 actggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaaga 770  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42218374 actggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaaga 42218431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 529; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 841
Target Start/End: Original strand, 3435294 - 3436008
Alignment:
Q  108 tattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  3435294 tattagataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaatcctgaacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattg 3435393  T
Q  208 attataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3435394 attataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataatagcaatgaacgtaaagttgtgatttttataat 3435493  T
Q  308 aatttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttag 407  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3435494 aatttgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtacattcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgtaagttag 3435593  T
Q  408 aggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnnga 507  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            |    
T  3435594 aggcatgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaagagaatttggaagaaa--------aaaaa 3435685  T
Q  508 aaagaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacact 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3435686 aaagaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctat------gagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacact 3435779  T
Q  608 aaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattga 707  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3435780 aaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagcacacaatttttaagttatgcaaaatctcaattga 3435879  T
Q  708 ataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaatacca 807  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  3435880 ataccactgaatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagattgttttacattccttaaaattcttgattgaatacc- 3435978  T
Q  808 gaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3435979 ----acttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 3436008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 369 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 44930382 - 44929905
Alignment:
Q  369 aatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacag 468  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44930382 aatgaacgtaaaagttatattaagaaaagtgcaagttagaggcatgatgatttcgacaataagtttgtcaaacaaaatatataacctgccattgttatag 44930283  T
Q  469 tagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaag-------aatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaa 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||         ||||        ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  44930282 tagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaataaaaataaaaaaaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaa 44930183  T
Q  562 agtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtt 661  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44930182 aatctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatcctttactcacaacaatccattaaaatccgtagagtt 44930083  T
Q  662 ttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaat 761  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44930082 ttgaatacccgtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactgaatttcattg--ctcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaat 44929985  T
Q  762 accacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44929984 accacaagaatattttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtattttaaaa 44929905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 168 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 7820753 - 7820239
Alignment:
Q  168 aaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaattt 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  7820753 aaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaatt 7820654  T
Q  268 attataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttt 367  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  7820653 attataataccaatgaacttaaagttgtgatttttataataatttgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtactttcttttttt 7820554  T
Q  368 taatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttaca 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7820553 taatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgtcattgttata 7820454  T
Q  468 gtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt-----nnnnnnnngaaaagaatttggaagagtattacaaaatttcaagag-tatgtgtgggagacagaaa 561  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||||||    
T  7820453 gtagaacataaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaaaaaaaagaatttggaagagtaatacaaaatcccaagggctatgtgtgggagacagaaa 7820354  T
Q  562 agtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtt 661  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||                ||| |||||||||||||||||||    
T  7820353 agtctccaggctaggtgtgagattgttagtaggtgcattttacactaaacaatctcataaa----------------aattcattaaaatccgtagagtt 7820270  T
Q  662 ttgaataccagtagacaatttttaagttatg 692  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7820269 ttgaatactagtagacaatttttaagttatg 7820239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 105 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 42315640 - 42315247
Alignment:
Q  105 gactattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaattta 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  42315640 gactattagataatacactactagcaggttgattgatcttaaaaattctcaacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagttta 42315541  T
Q  205 ttgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42315540 ttgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttat 42315441  T
Q  305 aataatttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttc-ttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42315440 aataatttgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacaatacgttctttttttttattgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaag 42315341  T
Q  404 ttagaggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt 497  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  42315340 ttagaggcatgatgatttcgacaataagtttgcaaaacaaaatatataacctgtcattgttacagtagaatagaaaagaatttgaaagaaacgt 42315247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 549 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 8880764 - 8880460
Alignment:
Q  549 tgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaa 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8880764 tgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaattcattactcacaacaatccattaa 8880665  T
Q  649 aatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaa 748  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8880664 aatccgtagagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaa 8880565  T
Q  749 atcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgatt-gaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctat 847  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8880564 atcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttaattggaataccacaagatttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatccttt 8880465  T
Q  848 gaaat 852  Q
    |||||    
T  8880464 gaaat 8880460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 543 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 52109732 - 52109434
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52109732 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgggattgttagtaggtacattttacattaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 52109633  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52109632 cattaaaatccgtagagttttgaatatcggtatacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccattggatttcattggactcattaaaaaatc 52109533  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52109532 atgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagatttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 52109434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 530 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 25936127 - 25935803
Alignment:
Q  530 aaaatttcaagagtatgtgtgggagaca--gaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatcca 627  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25936127 aaaatctcaagattatgtgtgggagacacagaaaagtctcaaggctag-tgtgagattgttaataggttcattttacactaaacaatctcacaaaatcca 25936029  T
Q  628 ttactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattgg 727  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25936028 ttactcacaacaatccattaaaattcgatgagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatactactagatttcattgg 25935929  T
Q  728 actcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaa-caa 826  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||    
T  25935928 actcattaaaaaattttgaaaatcctaattgaatatcacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccataaaacttttataaaataaa 25935829  T
Q  827 aaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25935828 aaaagtcttttaaaatcctttgaaat 25935803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 543 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 45332992 - 45332694
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  45332992 tatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttggtagatacattttacactaaaaagtttcataaaatccattactcacaacaatc 45332893  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45332892 cattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggactcattaaaaaatc 45332793  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  45332792 ctgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagttttgattgaatacctaaagacatttttaaaacaaaaaagtcttttaaaa 45332694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 543 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 47685470 - 47685172
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  47685470 tatgtgtgggagacaaaaaagtctcaagtttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcgcaaaatctattactcacaacaatc 47685371  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47685370 cattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgagcaaaatctcaattgaataccactgaattttattggactcattaaaaaatc 47685271  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47685270 ttgaaaatcctaattgaataccacaaaaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagatttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaa 47685172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 543 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 42721046 - 42720747
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaat 641  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  42721046 tatgtgtgggagacaaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttggtagatacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcacaacaac 42720947  T
Q  642 ccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaat 741  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42720946 ccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggactcattaaaaaat 42720847  T
Q  742 cgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | |||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  42720846 tctgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattacttaaaagttttgattaaatacctaaagacatttttaaaacaaaaaagtcttttaaaa 42720747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 530 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 26336407 - 26336094
Alignment:
Q  530 aaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccatt 629  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26336407 aaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttggtagatacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 26336308  T
Q  630 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggac 729  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26336307 actcacaataatccattaaaatccttagaattttgaataccaataaacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggac 26336208  T
Q  730 tcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaa 829  Q
    |||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  26336207 tcattaaaa---------aatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacatttttaaaacaaaaa 26336117  T
Q  830 agtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  26336116 agtcttttaaaatcctttgaaat 26336094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 54510038 - 54509731
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaat 641  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||   || ||||||    
T  54510038 tatgtgtgggagacaaaaaaagcctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt---cataacaat 54509942  T
Q  642 ccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaat 741  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54509941 ccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggactcattaaaaaat 54509842  T
Q  742 cgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54509841 tatgaaaatcctaattgaatatcacaagaatattttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaa 54509742  T
Q  842 acctatgaaat 852  Q
     ||| ||||||    
T  54509741 tcctttgaaat 54509731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 543 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 45340682 - 45340435
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  45340682 tatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttggtagatacattttacactaaaaagtttcataaaatccattactcacaacaatc 45340583  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  45340582 cattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggactcattaaaaaatt 45340483  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaa 790  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  45340482 ctgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaa 45340435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 307 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 56397973 - 56397732
Alignment:
Q  307 taatttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagtta 406  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  56397973 taatttgatatataggtagatggtaaattaaccacaacattatacagtacgttcttttttttaatgaacgtaaaaattatattaagaaaagtgcaaatta 56397874  T
Q  407 gaggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnng 506  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  56397873 gaggcatgatgatttcgacaataagtttgtcaaacaaaatatataacctgccattgttgcagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaat 56397774  T
Q  507 aaaagaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtg 550  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  56397773 aaa--aatttggaagagtattacaaaatctcaagagtttgtgtg 56397732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 105 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 56398770 - 56398552
Alignment:
Q  105 gactattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaattta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  56398770 gactattagataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattcaggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttacgttagttta 56398671  T
Q  205 ttgattataataatttga-ttgaaaaatgcatgttacat-------gtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtg 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  56398670 ttgattataataatttgatttgaaaaatgcatgttacatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataatatcaatgaacgtaaagttgtg 56398571  T
Q  297 atttttataataatttgat 315  Q
    |||||||||||||||||||    
T  56398570 atttttataataatttgat 56398552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 550 - 763
Target Start/End: Original strand, 33449944 - 33450157
Alignment:
Q  550 gggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaa 649  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33449944 gggagacagaaaagtgttgaggctatgtgtgagattgttagtagatacattttacactaaaatgtctcacaaaatccattactcacaataatccattaaa 33450043  T
Q  650 atccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaa 749  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33450044 atccgtagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccaccgaattttattggactcattaaaaaatcttgaaaa 33450143  T
Q  750 tcctaattgaatac 763  Q
    ||||||||||||||    
T  33450144 tcctaattgaatac 33450157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 543 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 40144086 - 40143804
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||                |||||    
T  40144086 tatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttaagtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaa----------------caatc 40144003  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    ||||||||| | || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  40144002 cattaaaattcttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaatacctctgaattttattggacttattaaaaaatc 40143903  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40143902 atgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaa 40143804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 168 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7808827 - 7808724
Alignment:
Q  168 aaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaattt 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  7808827 aaaataaatagacctaaaaataagtgacgttactttattgattataataatttgattgacaaatgcatgttacaagtagaaaaatgcaagtagaaaaatt 7808728  T
Q  268 atta 271  Q
    ||||    
T  7808727 atta 7808724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44930472 - 44930371
Alignment:
Q  189 aagttacgttaatttattgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgta 288  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  44930472 aagttatgttagtttattgattataataatttgattgaaaaatgcatgttataagtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataatatcaatgaacgta 44930373  T
Q  289 aa 290  Q
    ||    
T  44930372 aa 44930371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 725 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 7820240 - 7820124
Alignment:
Q  725 tggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaac 824  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  7820240 tggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaaaaatgttttagattccttgaaaattttgatggaataccacaaaacttttataaaac 7820141  T
Q  825 aaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    ||| |||||||||||||    
T  7820140 aaataagtcttttaaaa 7820124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 97
Target Start/End: Original strand, 3435050 - 3435133
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttc 97  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3435050 acagatcaaaaaatctcaaaaacaaaagcacagttataaatcaaccgaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttc 3435133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 5117156 - 5117064
Alignment:
Q  674 agacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccac 766  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| |  || ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  5117156 agacaatttttaagttgcgaaaaatcttgatggaataccaccggatttcattgaactctttaaaaagtcctgaaaatcttaattgaataccac 5117064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 788 - 852
Target Start/End: Original strand, 42218407 - 42218471
Alignment:
Q  788 aaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  42218407 aaaatcctaattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagttttttaaaatcctttgaaat 42218471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 7820792 - 7820756
Alignment:
Q  24 aaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccg 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7820792 aaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccg 7820756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 577 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 38231064 - 38230928
Alignment:
Q  577 tgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtaga 676  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||  |||||| | |||||||||||||||| |   ||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| | ||    
T  38231064 tgtgagattgttggaagagatatttttaactaaaaagtctcacaaaatccattccatccaagaatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatgga 38230965  T
Q  677 caatttttaagttatgcaaaatttcaattgaatacca 713  Q
    |||||  ||||| |||  |||| ||||||||||||||    
T  38230964 caattcataagtcatgagaaatctcaattgaatacca 38230928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 42315708 - 42315672
Alignment:
Q  24 aaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccg 60  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42315708 aaatctcaaaaacaaaagtacaattataaatcaaccg 42315672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 56398865 - 56398829
Alignment:
Q  24 aaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccg 60  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  56398865 aaatctcaaaaacaagagtacagttataaatcaaccg 56398829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 787 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 27768027 - 27767973
Alignment:
Q  787 aaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||  ||||||||||||||||    
T  27768027 aaaaatcttgattgaataccacaagactttttcataattaaaaagtcttttaaaa 27767973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 841
Target Start/End: Original strand, 39479597 - 39479646
Alignment:
Q  792 tcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  39479597 tcttgattgaataccacaagacttttttatgataaaaaagtcttttaaaa 39479646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 527; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 830
Target Start/End: Original strand, 34038 - 34846
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn---gactat 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||          ||||||    
T  34038 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaaaagactat 34137  T
Q  111 tagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||    
T  34138 tagataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaataaacctaaaaataaattatgttagtttattgatt 34237  T
Q  211 ataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34238 ataataatttgattgaaaaatgcatgttactggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataatatcaatgaacgtaaagttatgatttttataataat 34337  T
Q  311 ttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 410  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34338 ttgatatataggtagatggtaaattaacaacaagattatacggtacattcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagagg 34437  T
Q  411 catgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt--nnnnnnnngaa 508  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |           ||    
T  34438 catgatgattttgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttagaagaaacttaaaaaaaaataaa 34537  T
Q  509 aagaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacacta 608  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34538 atgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgagagatagaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtagatacattttacacta 34637  T
Q  609 aacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaa 708  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34638 aacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatatcagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaa 34737  T
Q  709 taccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccag 808  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||            ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  34738 taccactgtatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaat------------ccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaata-cac 34824  T
Q  809 aagacttttataaaacaaaaaa 830  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34825 aagacttttataaaacaaaaaa 34846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 469; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 246 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 40411220 - 40410618
Alignment:
Q  246 gaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatataggtagatgataaattaaccacaaga 345  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40411220 gaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatataggtagatggtaaattaaccacaaga 40411121  T
Q  346 ttatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaa 445  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40411120 ttatacagtacattcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaa 40411021  T
Q  446 tatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaa-------gaatttggaagagtattacaaaatttca 538  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         ||||       |||||||||| |||||||||||||||||    
T  40411020 tatataacctgtcattgttacagtagaatagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaatttggaaaagtattacaaaatttca 40410921  T
Q  539 agagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaac 638  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40410920 aggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaagtctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaac 40410821  T
Q  639 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaa 738  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40410820 aatccattaaaatccgtagagttttgaatacgagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactagatttcattggactcattaaaa 40410721  T
Q  739 aatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtctttta 838  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40410720 aatcatgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtctttta 40410621  T
Q  839 aaa 841  Q
    |||    
T  40410620 aaa 40410618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 497
Target Start/End: Original strand, 13950023 - 13950506
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnnga--ctatt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||        |  | |||    
T  13950023 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacaattataaatcaaccgaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaaaaaccatt 13950122  T
Q  112 agataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgatta 211  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13950123 agataatatgctactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaa-taagttacgttagtttattgatta 13950221  T
Q  212 taataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13950222 taataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatacaagtagaaaaattattataataccaataaacgtaaagttgtgatttttataataatt 13950321  T
Q  312 tgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggc 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13950322 tgatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacaatacatt-ttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaaatgcaagttagaggc 13950420  T
Q  412 atgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt 497  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13950421 atgatgatttcaacaataagtttgccaaacaaaatatataatctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttgaaagaaacgt 13950506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 105 - 497
Target Start/End: Original strand, 3603790 - 3604179
Alignment:
Q  105 gactattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaa-ttctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaattt 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  3603790 gactattagataatgtactactagcaggttgattgatcttaaaaaattctagacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagttt 3603889  T
Q  204 attgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgattttta 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||              |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  3603890 attgattataataatttgatttaaaaatgcatgttacaggtagaaaaat--------------tattataatatcaatgaacgtaaaattttgattttta 3603975  T
Q  304 taataatttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatga----------acgtaaaagttatgttaaga 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||    
T  3603976 taataatttgatatataggtagatggtaaattaaccataagattatacaatacgttcttttttttaatgaacttttatgaacgtaaaagttatgttaaga 3604075  T
Q  394 aaagtgcaagttagaggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaa 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3604076 aaagtgcaagttagaggcatgatgatttcgagaataagtttgtcaaacaaaatatataacctgccattgctacagtagaacaaaaaagaatttggaagaa 3604175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Original strand, 6828549 - 6828859
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaat 641  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6828549 tatgtgtgggagacaaaaaaagtctcaaggttagatgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcataacaat 6828648  T
Q  642 ccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaat 741  Q
    |||||||||||| || | ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6828649 ccattaaaatccttacaattttgaatatcaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggactcattaaaaaat 6828748  T
Q  742 cgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6828749 cctgaaaatcctaattaaataccacaagaatgttttagattccttaaaggtcttgattgaatacccaaagacttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaa 6828848  T
Q  842 acctatgaaat 852  Q
     ||| ||||||    
T  6828849 tcctttgaaat 6828859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 550 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 17518748 - 17518456
Alignment:
Q  550 gggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaa 649  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17518748 gggagacagaaaagtcttgaggctgggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcgcaacattccattaaa 17518649  T
Q  650 atccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaatacca-ctggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaa 748  Q
    ||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  17518648 atccgtagaattttgaatcccaataaacaatttttaagttgtgcaaaatcttaattgaataccaccgggattttattggactctttaaaaaatcttgaaa 17518549  T
Q  749 atcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17518548 atcctaattgaatagcacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttttaaaacgaaaaagtcttttaaaa 17518456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Original strand, 11632918 - 11633165
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactatta 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||    
T  11632918 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactatta 11633017  T
Q  113 gataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattat 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  11633018 gataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgattat 11633117  T
Q  213 aataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtag 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11633118 aataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtag 11633165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 550 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 10571430 - 10571139
Alignment:
Q  550 gggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaa 649  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| | | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  10571430 gggagacagaaaagtcttaaggttaggtgtgagattgttagtatgtacattttatactaaaaagtttcacaaaatccattcctgacaacaatctattaaa 10571331  T
Q  650 atccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaa 749  Q
     | | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  ||||||    
T  10571330 tttcatagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtacaaaatcttaattgaataccaccggattttattggactctttaaaaaattttgaaaa 10571231  T
Q  750 tcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10571230 tcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaattttgattgaatatcacaagacttttataaaacgaaaaagttttttaaaa 10571139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 605 - 713
Target Start/End: Original strand, 2276025 - 2276133
Alignment:
Q  605 actaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaat 704  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||  |||| ||||||||| || |||||||||  ||||| |||  |||||| |||    
T  2276025 actaaaaaatctcacaaaatccattatacaaaagaatccattaaaatctatagacttttgaatatcaatagacaattcataagtcatgagaaattttaat 2276124  T
Q  705 tgaatacca 713  Q
    |||||||||    
T  2276125 tgaatacca 2276133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 639 - 761
Target Start/End: Original strand, 6902525 - 6902647
Alignment:
Q  639 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaa 738  Q
    |||||||| |||||  || | ||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||    
T  6902525 aatccattgaaatcaatacatttttgaataccaagagacaatttttaagttgtaaaaaatcttgattgaataccaccagattttgttggactctttaaaa 6902624  T
Q  739 aatcgtgaaaatcctaattgaat 761  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  6902625 aatcattaaaatcctaattgaat 6902647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 7857255 - 7857053
Alignment:
Q  639 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaa 738  Q
    |||||||| |||||  || | ||||||||| ||  |||||||||||||||| |  |   ||| ||||||||||| |  |||||  |||||||| ||||||    
T  7857255 aatccattgaaatctatacatttttgaatatcaagagacaatttttaagttgtaaatttttttaattgaataccgccagattttgttggactctttaaaa 7857156  T
Q  739 aatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtctttta 838  Q
    | || | |||||||||||| |||||||| | |||  |||    || || |||||||||||||||||||  |||| |||| || ||| |||||||||||||    
T  7857155 attcattaaaatcctaattcaataccaccaaaattatttctaatcttttaaaatcttgattgaatacctcaagatttttctataaccaaaaagtctttta 7857056  T
Q  839 aaa 841  Q
    |||    
T  7857055 aaa 7857053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 60
Target Start/End: Original strand, 3603694 - 3603729
Alignment:
Q  25 aatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccg 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3603694 aatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccg 3603729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 753 - 841
Target Start/End: Original strand, 28594410 - 28594499
Alignment:
Q  753 taattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttata-aaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  28594410 taattaaataccacaagatttatttatgttttataaaaatcttgattgaataccacaagacttttttataataaaaaaagtcttttaaaa 28594499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 753 - 841
Target Start/End: Original strand, 26795601 - 26795689
Alignment:
Q  753 taattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||  ||   ||||| |||||||||||||||| |||| |||| || || |||||||||||||||||    
T  26795601 taattgaataccacaagatttatttatattttataaaagtcttgattgaataccacaagatttttttataataaaaaagtcttttaaaa 26795689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 26876289 - 26876251
Alignment:
Q  728 actcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccac 766  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26876289 actctttaaaaaatcctgaaaatcctaattgaataccac 26876251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 273 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 29941549 - 29940962
Alignment:
Q  273 aataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatg 372  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  29941549 aataccaatgaacgtaaaattttgatttttataataatttgatatataggtagattgtaaattaaccacaagattatacagtacattcttttttttaatg 29941450  T
Q  373 aacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtaga 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29941449 aacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgatgatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacatgccattgttacagtaga 29941350  T
Q  473 acagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaa--------gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagt 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||         | ||        |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  29941349 acagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaataaaaaaaaatgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatatgtgggagatagaaaagt 29941250  T
Q  565 ctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttg 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29941249 ctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttg 29941150  T
Q  665 aataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaatacc 764  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29941149 aataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattagactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaatacc 29941050  T
Q  765 acaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  29941049 acaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaat 29940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 407 - 852
Target Start/End: Original strand, 6289127 - 6289566
Alignment:
Q  407 gaggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnng 506  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||             
T  6289127 gaggcatgatgatttcgataataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaataaacgtaaaat---- 6289222  T
Q  507 aaaagaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacac 606  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6289223 aaaataaaatggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac 6289322  T
Q  607 taaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattg 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6289323 taaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatactagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattg 6289422  T
Q  707 aataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaatacc 806  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |    
T  6289423 aataccactggatttcattggattcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatct--attgaatatc 6289520  T
Q  807 agaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  6289521 acaaaacttttataaaacaaaaaagttttttaaaatcctttgaaat 6289566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 105 - 497
Target Start/End: Original strand, 7487468 - 7487865
Alignment:
Q  105 gactattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaattta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  7487468 gactattagataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagttta 7487567  T
Q  205 ttgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7487568 ttgattataataatttgattgaaaaatgcaggttacagtttgaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttat 7487667  T
Q  305 aataatttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttc-----ttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtg 399  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7487668 aataatttgatatataagtagatgataaattaaccataagattatacagtacgttctttttttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaggtg 7487767  T
Q  400 caagttagaggcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt 497  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7487768 caagtaagaggcatgataatttcgacaataagtttgtcaaacaaaatatataatctgtcattgttacagtagaacagaaaagaattttgaagaaacgt 7487865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 14 - 415
Target Start/End: Original strand, 42626632 - 42627037
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn----gacta 109  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||           |||||    
T  42626632 acagacaaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaaaaagacta 42626731  T
Q  110 ttagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  42626732 ttagataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagaattaaaaataagttatgttagtttattgat 42626831  T
Q  210 tataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42626832 tataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaaattattatgataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataa 42626931  T
Q  310 tttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagag 409  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42626932 tttgatatatagatagatggtaaattaaccacaagattatacagtacattcttttttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagag 42627031  T
Q  410 gcatga 415  Q
    | ||||    
T  42627032 gtatga 42627037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 511 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 45547289 - 45546959
Alignment:
Q  511 gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaa 610  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45547289 gaatttggaagtgtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatataaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa 45547190  T
Q  611 caatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaata 710  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  45547189 caatctcacaaaatccattacttacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgctaaatctcaattgaata 45547090  T
Q  711 ccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaa 810  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45547089 ccactgaatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaa 45546990  T
Q  811 gacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45546989 gacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 45546959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 105 - 406
Target Start/End: Original strand, 21735989 - 21736290
Alignment:
Q  105 gactattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaattta 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  21735989 gactattatataatatactactagcaggttgattgagcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagttta 21736088  T
Q  205 ttgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttat 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21736089 ttgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatacaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttat 21736188  T
Q  305 aataatttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagt 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21736189 aataatttgatatataggtagatgataaattaaccacaaaattatacaatacgttcttttttttaacgaacgtaaaagttatgttaagaaaaatgcaagt 21736288  T
Q  405 ta 406  Q
    ||    
T  21736289 ta 21736290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 45547769 - 45547341
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactatta 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||    
T  45547769 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacggttataaatcaaccgaaaaaaaatattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactatta 45547670  T
Q  113 gataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattat 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  45547669 gataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattcttgacatatgatatcaaaataaatagaccaaaaaataagttatgttagtttattgattat 45547570  T
Q  213 aataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataattt 312  Q
    |||||||||||||||                     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45547569 aataatttgattgaa---------------------aaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataattt 45547491  T
Q  313 gatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggca 412  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45547490 gatatataggtagatggtaaattaaccacaagattatacagtacat--ttttttttaatgaacgtaaaaattatgttaagaaaagtgcaagttagaggca 45547393  T
Q  413 tgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgtt 464  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  45547392 tgatgatttcgacaataagtttgtcaaacaaaatatataacctgtcattgtt 45547341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 6288779 - 6289126
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactatta 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||    
T  6288779 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacaattataaatcaaccgaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactatta 6288878  T
Q  113 gataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattat 212  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  6288879 gataatatactactagcaggttaattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgattat 6288978  T
Q  213 aataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataattt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6288979 aataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaaagaacgtaaagttgtgatttttataataattt 6289078  T
Q  313 gatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttc 360  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6289079 gacatataggtagatggtaagttaaccacaagattatacagtacgttc 6289126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 11535161 - 11534852
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535161 tatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttatgtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcacaacaatc 11535062  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11535061 cattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaattccactggattttattggactcattaaaaaatc 11534962  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaa 842  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  11534961 ctgaaaatcctaattaaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaat 11534862  T
Q  843 cctatgaaat 852  Q
    ||| ||||||    
T  11534861 cctttgaaat 11534852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 530 - 853
Target Start/End: Original strand, 34028677 - 34029001
Alignment:
Q  530 aaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccatt 629  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34028677 aaaatctcaagactatgtgtggcagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatgcattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 34028776  T
Q  630 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttca-ttgga 728  Q
    ||||  |||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||    
T  34028777 actcgtaacaatccattaaaatccttataattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctgaattgaataccactggattttatttgga 34028876  T
Q  729 ctcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaa 828  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  34028877 ctcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaa 34028976  T
Q  829 aagtcttttaaaaacctatgaaata 853  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||    
T  34028977 aagtcttttaaaatcctttgaaata 34029001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 530 - 852
Target Start/End: Original strand, 20157502 - 20157824
Alignment:
Q  530 aaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccatt 629  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20157502 aaaatctcaagactatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaagctaggtgtgagattgttagtagatgcattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 20157601  T
Q  630 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggac 729  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20157602 actcataacaatctattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatatttaagttgtgcaaaatctgaattgaataccactgaattttattggac 20157701  T
Q  730 tcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaa 829  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  20157702 tcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttctttaaaacaaaaa 20157801  T
Q  830 agtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  20157802 agtcttttaaaatcctttgaaat 20157824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 534 - 852
Target Start/End: Original strand, 11998167 - 11998484
Alignment:
Q  534 tttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactc 633  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11998167 tttcaaggctatgtgtgggagacaaaaaaatctcaaggct-ggtgtgagattgttggtagatacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactc 11998265  T
Q  634 acaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcat 733  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11998266 acaacaaaccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggactcat 11998365  T
Q  734 taaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtc 833  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  11998366 taaaaaattctgaaaatcctaattgaatacgacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaaaacatttttaaaacaaaaaagtc 11998465  T
Q  834 ttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||||| ||| ||||||    
T  11998466 ttttaaaatcctttgaaat 11998484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 531 - 841
Target Start/End: Original strand, 24193232 - 24193542
Alignment:
Q  531 aaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccatta 630  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24193232 aaatttcaagactatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttaagtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatta 24193331  T
Q  631 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggact 730  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24193332 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactgaattttattggact 24193431  T
Q  731 cattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaa 830  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||     
T  24193432 cattaaaaaatcctgaaaattctaattgaatatcacaagaatgttttagatttcttaaaagtcttgtttgaatacctaaaaacttttttaaaacaaaaat 24193531  T
Q  831 gtcttttaaaa 841  Q
    |||||| ||||    
T  24193532 gtctttaaaaa 24193542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 550 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 24193875 - 24193577
Alignment:
Q  550 gggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaa 649  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24193875 gggagacagaaaagtcttgaggctaagtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcacagcaatccattaaa 24193776  T
Q  650 a-------tccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    |       | |||||| |||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  24193775 aattaaaattcgtagaattttgaataccaataaacagtttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccaccgaattttattggactcattaaaaaatc 24193676  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24193675 ttgaaaatcctaattgaataccacaaaaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccccaagacttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaa 24193577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 168 - 396
Target Start/End: Original strand, 35172007 - 35172220
Alignment:
Q  168 aaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaattt 267  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||| ||    
T  35172007 aaaaaaaaaagacctaaaaataagttatgttagtttattgattataataatttgattgaaaaatgcatgttaca--------------agtagaaaaatt 35172092  T
Q  268 attataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35172093 attataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatataggtagatgataaattaatcacaagattatacaatacgttctt-tttt 35172191  T
Q  368 taatgaacgtaaaagttatgttaagaaaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35172192 taatgaacgtaaaagttatgttaagaaaa 35172220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 589 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 45485631 - 45485390
Alignment:
Q  589 agtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagt 688  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||          |    
T  45485631 agtaggtacattttacgctaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccatagaattttgaatattagtagac----------t 45485542  T
Q  689 tatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaa 788  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45485541 tatgcaaaatctcaattgaataccactgaattttattggattcattgaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaa 45485442  T
Q  789 aaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  45485441 aaatcttgattgaata-cacaagatttttataaaataaaaaagtattttaaaa 45485390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29941753 - 29941549
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn----cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn----- 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||                
T  29941753 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaaaaaa 29941654  T
Q  105 -gactattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaattt 203  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  29941653 agactattagataatatactattagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagttt 29941554  T
Q  204 attga 208  Q
    |||||    
T  29941553 attga 29941549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 182
Target Start/End: Original strand, 35171755 - 35171832
Alignment:
Q  105 gactattagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacct 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35171755 gactattagataatatactactggcatgttgattaatcttaaaatttctggacatatgatatcaaaataaatagacct 35171832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 675 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 2373163 - 2372997
Alignment:
Q  675 gacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgt 774  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |  ||| |||||||  | ||||  |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||   |||      
T  2373163 gacaatttttaagttgtgaaaaatcttgattaaataccaacgaattttgttggactctttaaaaattcatgaaaatcctaattgaataccaccgaaatta 2373064  T
Q  775 tttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||    || || |||||||||||||||||||  |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  2373063 tttctaatcttttaaaatcttgattgaatacctcaagatttttctataacaaaaaagtcttttaaaa 2372997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 605 - 766
Target Start/End: Original strand, 38822753 - 38822915
Alignment:
Q  605 actaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaat 704  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |  |  |||||||| |||||  || | |||| |||||||  |||||||||||||||| || ||||| |  ||    
T  38822753 actaaaaaatctcacaaaatccattataccaagtaatccattgaaatctatacattttttaataccaagagacaatttttaagttgtgaaaaatcttgat 38822852  T
Q  705 tgaataccactggatttcattggactcattaaaaaa-tcgtgaaaatcctaattgaataccac 766  Q
     ||||||||| ||||||  ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38822853 cgaataccaccggattttgttggattctttaaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccac 38822915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 497
Target Start/End: Original strand, 21736289 - 21736340
Alignment:
Q  446 tatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt 497  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21736289 tatataacatgccattgttacagtagaacagaaaagaatttgaaagaaacgt 21736340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 675 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 27090829 - 27090663
Alignment:
Q  675 gacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgt 774  Q
    ||||||||||||||| |  |||||   | ||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||      
T  27090829 gacaatttttaagttgttaaaaatcatagttgaataccactgaattttgttggactctttaaaaaatcagtaaaatcctaattgaataccaccagaatta 27090730  T
Q  775 tttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||    || || ||||||||||||||||||   |||| |||| || ||| ||||| ||||||||||    
T  27090729 tttctaatcttttaaaatcttgattgaatacttcaagatttttctataaccaaaaaatcttttaaaa 27090663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Original strand, 21735887 - 21735927
Alignment:
Q  19 ccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaacc 59  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21735887 ccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaacc 21735927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 497
Target Start/End: Original strand, 35172338 - 35172377
Alignment:
Q  458 cattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt 497  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35172338 cattgttacagtagaacataaaagaatttggaagaaacgt 35172377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 753 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 2288575 - 2288489
Alignment:
Q  753 taattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| ||   ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  2288575 taattgaataccacaagatttgtttacattttataaaagtcttgattgaataccactagacttttat--aataaaaaagtcttttaaaa 2288489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 787 - 841
Target Start/End: Original strand, 22552000 - 22552054
Alignment:
Q  787 aaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |  | |||||||||||||||||    
T  22552000 aaaaatcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaagtcttttaaaa 22552054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 787 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 43078648 - 43078594
Alignment:
Q  787 aaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||  ||||||||||||||||    
T  43078648 aaaaatcttgattgaataccacaagactttttcataatcaaaaagtcttttaaaa 43078594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 16269659 - 16269610
Alignment:
Q  792 tcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  16269659 tcttgattgaataccacaagactttttcataataaaaaagtcttttaaaa 16269610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 800 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 25343289 - 25343248
Alignment:
Q  800 gaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25343289 gaataccgaaagacttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaa 25343248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Original strand, 35171651 - 35171692
Alignment:
Q  19 ccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccg 60  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  35171651 ccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacaattataaattaaccg 35171692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 433; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 841
Target Start/End: Original strand, 6475975 - 6476769
Alignment:
Q  14 acagaccaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnn--cattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn--gacta 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          ||||||| ||||||||||||||||||||          |||||    
T  6475975 acagaccaaaaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaactgaaaaaaaaaacattgaaccaatgagtgtaatatttcttaaaaaaaaaagacta 6476074  T
Q  110 ttagataatatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  6476075 ttagataatatactactagcaggttgattgatcttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgat 6476174  T
Q  210 tataataatttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataa 309  Q
    ||||||||||||||||||                     |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6476175 tataataatttgattgaa---------------------aaatgcaagtagaaaaattattataatatcaatgaacgtaaagttgtgatttttataataa 6476253  T
Q  310 tttgatatataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagag 409  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6476254 ttttatatataggtagatggtaaattaaccacaagattata----acgttcttttttttaat-aacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttatag 6476348  T
Q  410 gcatgataatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaa 509  Q
    ||||||| |||||||||||||               |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | |    
T  6476349 gcatgatgatttcgacaataa---------------tatataacatggcattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaata 6476433  T
Q  510 a----gaatttggaagagtattacaaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttaca 605  Q
         ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6476434 tatatgaatttgaaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagttacattttaca 6476533  T
Q  606 ctaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaatt 705  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6476534 ctaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaatt 6476633  T
Q  706 gaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaatac 805  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  6476634 gaataccactggattttattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaaaaatgttttacatttcttaaaaatcttaattgaatac 6476733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 540
Target Start/End: Original strand, 29864989 - 29865504
Alignment:
Q  28 ctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn--gactattagataatatactac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||    
T  29864989 ctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaatattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaaagactattagataatatactac 29865088  T
Q  126 tagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataataatttgattg 225  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  29865089 tagcaggttgattgatcttaaaaatcatggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgattattataatttgattg 29865188  T
Q  226 aaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatataggtag 325  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29865189 aaaaatgcatgttgcatttagaaaaatgcaagcagaaaaattattataataccaatgaacgaaaagttgtgatttttataataatttgatatacaggtag 29865288  T
Q  326 atgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataatttcgac 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29865289 atggtaaattaaccacaagattatacagtacattcttttttttattgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgatgatttcgac 29865388  T
Q  426 aataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgt--nnnnnnnngaaaagaatttggaagag 523  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||    
T  29865389 aa-aagtttgccaaacaaaatatatatcctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaaaaagaatttggaagag 29865487  T
Q  524 tattacaaaatttcaag 540  Q
    ||||||||||| |||||    
T  29865488 tattacaaaatctcaag 29865504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 18 - 470
Target Start/End: Original strand, 3109586 - 3110038
Alignment:
Q  18 accaacaaatctcaaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactattagata 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||    
T  3109586 accaaaaaatctcaaaaacaaaagtacaattataaatcaaccgaaaaaaaacattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactattagata 3109685  T
Q  117 atatactactagcagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataata 216  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3109686 atatactactagcaggtttattgattttaaaaattctggatatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgattataata 3109785  T
Q  217 atttgattgaaaaatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgata 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3109786 atttgattgaaaaatgcatgttacaggtagaaaaatgcaagtagaaaaattattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgata 3109885  T
Q  317 tataggtagatgataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgat 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3109886 tataggtagatggtaaattaaccacaagattatatagtagattcttttttttaatg-acgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagtcagaggcatgat 3109984  T
Q  417 aatttcgacaataagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagta 470  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3109985 gatttcgacaataaatttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagta 3110038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 564 - 852
Target Start/End: Original strand, 29834064 - 29834352
Alignment:
Q  564 tctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 663  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29834064 tctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 29834163  T
Q  664 gaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaatac 763  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  29834164 gaataccgatagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaattctaattgcatac 29834263  T
Q  764 cacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  29834264 cacaagaatgttttacattccttcaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaatgtcttttaaaatcctttgaaat 29834352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 564 - 852
Target Start/End: Original strand, 29865498 - 29865786
Alignment:
Q  564 tctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 663  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29865498 tctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 29865597  T
Q  664 gaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaatac 763  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  29865598 gaataccgatagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaattctaattgcatac 29865697  T
Q  764 cacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  29865698 cacaagaatgttttacattccttcaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaatgtcttttaaaatcctttgaaat 29865786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 530 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 30878191 - 30877869
Alignment:
Q  530 aaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccatt 629  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30878191 aaaatctcaagactatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctagatgtgagattgttagtagatgcattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 30878092  T
Q  630 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggac 729  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30878091 actcataacaatccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagctgtacaaaatctgaattgaataccactagattttattggac 30877992  T
Q  730 tcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaa 829  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  30877991 tcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaatatcacaagaatattttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaa 30877892  T
Q  830 agtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  30877891 agtcttttaaaatcctttgaaat 30877869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 543 - 841
Target Start/End: Original strand, 3110043 - 3110341
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3110043 tatgtgtgggagatagaaaagtcttaatactaggtgcgagattgtcagtatgtacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 3110142  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatc 742  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3110143 cattaaaatccgtagagttttgaataactgcacacaattttcaagttaggcaaaatctcaattgaatatcactggatttcattggactcattaaaaaatc 3110242  T
Q  743 gtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3110243 ttgaaaattctaattgaataccacaaaaatgttttacattccttaaaaattatgattgaataccataagatttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 3110341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 543 - 841
Target Start/End: Original strand, 10643770 - 10644070
Alignment:
Q  543 tatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatc 642  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10643770 tatgtgtgggagacaaaaaagtcttaagattaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcacaacaatc 10643869  T
Q  643 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatg--caaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaa 740  Q
    ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10643870 cattaaaatccttacaattttgattaccaatagacaatttttaagttgtgatcaaaatctcaattgaataccactggattttattggactcattaaaaaa 10643969  T
Q  741 tcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaa 840  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10643970 tcctgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaagtcttttaaa 10644069  T
Q  841 a 841  Q
    |    
T  10644070 a 10644070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 614 - 852
Target Start/End: Original strand, 7858203 - 7858440
Alignment:
Q  614 tctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaatacca 713  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7858203 tctcacaaaatctattactcacaacaatgcattaaaatccgtagaattttgaatatcaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaatacca 7858302  T
Q  714 ctggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagac 813  Q
     || | || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || ||    
T  7858303 gtgcactttattgaactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattcctttaaaatcttgattgaacaccacaa-ac 7858401  T
Q  814 ttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  7858402 ttttttaaaacaaaaaaatattttaaaatcatatgaaat 7858440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 605 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 709178 - 709070
Alignment:
Q  605 actaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaat 704  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||  ||||||||||    
T  709178 actaaaaagtctcacaaaatccattacatccaagaatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatagacaattcataagtcatgagaaatttcaat 709079  T
Q  705 tgaatacca 713  Q
    |||||||||    
T  709078 tgaatacca 709070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 577 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 7100456 - 7100320
Alignment:
Q  577 tgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtaga 676  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||  |||||| | |||||||||||||||| |   ||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| | ||    
T  7100456 tgtgagattgttggaagagatatttttaactaaaaagtctcacaaaatccattccatccaagaatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatgga 7100357  T
Q  677 caatttttaagttatgcaaaatttcaattgaatacca 713  Q
    |||||  ||||| |||  |||| ||||||||||||||    
T  7100356 caattcataagtcatgagaaatctcaattgaatacca 7100320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 577 - 713
Target Start/End: Original strand, 8794174 - 8794310
Alignment:
Q  577 tgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtaga 676  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||  |||||| | |||||||||||||||| |   ||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| | ||    
T  8794174 tgtgagattgttggaagagatatttttaactaaaaagtctcacaaaatccattccatccaagaatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatgga 8794273  T
Q  677 caatttttaagttatgcaaaatttcaattgaatacca 713  Q
    |||||  ||||| |||  |||| ||||||||||||||    
T  8794274 caattcataagtcatgagaaatctcaattgaatacca 8794310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 753 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 5957242 - 5957154
Alignment:
Q  753 taattgaataccacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| ||   ||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  5957242 taattgaataccacaagatttgtttacattttataaaagtcttgattgaataccactagacttttttattataaaaaagtcttttaaaa 5957154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 507 - 540
Target Start/End: Original strand, 29834037 - 29834070
Alignment:
Q  507 aaaagaatttggaagagtattacaaaatttcaag 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29834037 aaaagaatttggaagagtattacaaaatctcaag 29834070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 540
Target Start/End: Original strand, 20687 - 21198
Alignment:
Q  30 caaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgnnnnnnnncattgaatcaatgagtgtaatatttcttcnnnnnnn-gactattagataatatactactag 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  20687 caaaaacaaaagtacagttataaatcaaccgaaaaaaaatattgaatcaatgagtgtaatatttcttcaaaaaaaagactattagataatatactactag 20786  T
Q  129 cagattgattgattttaaaaattctggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaagtaagttacgttaatttattgattataataatttgattgaaa 228  Q
    ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20787 caggttgattgatcttaaaaatcatggacatatgatatcaaaataaatagacctaaaaataagttatgttagtttattgattattataatttgattgaaa 20886  T
Q  229 aatgcatgttacatgtagaaaaatgcaagtagaaaatttattataataccaatgaacgtaaagttgtgatttttataataatttgatatataggtagatg 328  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20887 aatgcatgttgcatttagaaaaatgcaagcagaaaaattattataataccaatgaacgaaaagttgtgatttttataataatttgatatacaggtagatg 20986  T
Q  329 ataaattaaccacaagattatacaatacgttcttatttttaatgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgataatttcgacaat 428  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  20987 gtaaattaaccacaagattatacagtacattcttttttttattgaacgtaaaagttatgttaagaaaagtgcaagttagaggcatgatgatttcgacaa- 21085  T
Q  429 aagtttgccaaacaaaatatataacctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtnnnnnnnngaaaag-aatttggaagagtatt 527  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||||    
T  21086 aagtttgccaaacaaaatatatatcctgccattgttacagtagaacagaaaagaatttggaagaaacgtaaaaaaaaaaaaagaaatttggaagagtatt 21185  T
Q  528 acaaaatttcaag 540  Q
    ||||||| |||||    
T  21186 acaaaatctcaag 21198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 564 - 852
Target Start/End: Original strand, 21192 - 21480
Alignment:
Q  564 tctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 663  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21192 tctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 21291  T
Q  664 gaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaatac 763  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  21292 gaataccgatagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaattctaattgcatac 21391  T
Q  764 cacaagaatgttttacgttccttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctatgaaat 852  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  21392 cacaagaatgttttacattccttcaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaatgtcttttaaaatcctttgaaat 21480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 147; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 530 - 841
Target Start/End: Original strand, 16303 - 16600
Alignment:
Q  530 aaaatttcaagagtatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggcta--ggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaatctcacaaaatcca 627  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16303 aaaatttcaaggctatgtgtgagagacataaaagtctcaaggttataggtgtgagattgttagtaggtacactttacactaaacaatctcacaaaatcca 16402  T
Q  628 ttactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatttcaattgaataccactggatttcattgg 727  Q
    |||||||||                  |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16403 ttactcaca------------------tagaattttgaatactaatagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggattttattgg 16484  T
Q  728 actcattaaaaaatcgtgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacgttcctt--aaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaaca 825  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  16485 actcattaaaaattcttgaaaatactaattgaataccacaaaaatgttttacatttcttaaaaaaatcttgattaaataccacaagacttttttaaaaca 16584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0922 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0922
Description:

Target: scaffold0922; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 787 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 4172 - 4112
Alignment:
Q  787 aaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaaacctat 847  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||| |||||    
T  4172 aaaagtcttgattgaataccacaagactttttcaaaattaaaaagtcttttaaaatcctat 4112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 605 - 689
Target Start/End: Original strand, 1705 - 1789
Alignment:
Q  605 actaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagtt 689  Q
    |||||| | ||||||||||||||||   || || |||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  1705 actaaaaagtctcacaaaatccattctacaaaagaatccattaaaatctgcagatttttgaataccaatagacattttataagtt 1789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0287 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0287
Description:

Target: scaffold0287; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 786 - 841
Target Start/End: Original strand, 11789 - 11844
Alignment:
Q  786 taaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaa 841  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  11789 taaaagtcttgattgaatatcacaagacttttttataataaaaaagtcttttaaaa 11844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University