View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3941_low_1 (Length: 663)

Name: NF3941_low_1
Description: NF3941
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3941_low_1
NF3941_low_1
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (172-661)||(16653007-16653496)
chr6 (172-653)||(16554772-16555253)
chr6 (172-653)||(16631328-16631809)
chr6 (172-653)||(16578302-16578783)
chr6 (172-653)||(16616597-16617078)
chr6 (197-653)||(25421208-25421669)
chr6 (172-644)||(27647775-27648232)
chr6 (197-653)||(6027151-6027609)
chr6 (197-653)||(33341908-33342370)
chr6 (197-653)||(34166983-34167443)
chr6 (197-653)||(34164761-34165221)
chr6 (197-576)||(13153893-13154278)
chr6 (205-644)||(3072580-3073016)
chr6 (289-644)||(412014-412369)
chr6 (205-646)||(2171350-2171796)
chr6 (221-646)||(6097285-6097699)
chr6 (272-647)||(31404561-31404940)
chr6 (369-647)||(5406181-5406464)
chr6 (369-647)||(5410506-5410789)
chr6 (369-646)||(16452310-16452594)
chr6 (369-646)||(30834517-30834801)
chr6 (272-647)||(5413281-5413658)
chr6 (369-556)||(33160333-33160521)
chr6 (389-556)||(21588931-21589098)
chr6 (389-556)||(21593664-21593831)
chr6 (380-556)||(3808699-3808877)
chr6 (371-556)||(9183015-9183199)
chr6 (389-553)||(17758026-17758191)
chr6 (389-556)||(2972940-2973107)
chr6 (389-556)||(17762990-17763158)
chr6 (272-485)||(5408956-5409164)
chr6 (389-554)||(26830124-26830289)
chr6 (389-556)||(22424826-22424995)
chr6 (369-639)||(16568953-16569208)
chr6 (389-556)||(28137409-28137576)
chr6 (389-553)||(5043630-5043795)
chr6 (197-300)||(6136108-6136214)
chr6 (385-553)||(26954283-26954450)
chr6 (385-556)||(33211182-33211353)
chr6 (172-240)||(16552976-16553044)
chr6 (172-240)||(16629532-16629600)
chr6 (389-502)||(26800642-26800755)
chr6 (381-522)||(603081-603222)
chr6 (412-556)||(3038926-3039071)
chr6 (197-263)||(13159066-13159134)
chr6 (439-556)||(4045423-4045542)
chr6 (202-266)||(412374-412437)
chr6 (369-433)||(21356021-21356084)
chr6 (489-570)||(16567185-16567265)
chr6 (389-433)||(19643894-19643938)
[»] chr1 (72 HSPs)
chr1 (170-653)||(9036320-9036801)
chr1 (202-646)||(40282287-40282730)
chr1 (197-653)||(44203536-44203995)
chr1 (198-646)||(21053868-21054314)
chr1 (222-646)||(20622072-20622496)
chr1 (198-646)||(9987112-9987558)
chr1 (202-644)||(51765300-51765747)
chr1 (272-553)||(8550670-8550952)
chr1 (270-557)||(13316236-13316521)
chr1 (369-646)||(20762575-20762859)
chr1 (377-556)||(42297963-42298143)
chr1 (369-556)||(3189330-3189517)
chr1 (369-556)||(3198147-3198334)
chr1 (369-556)||(3206986-3207173)
chr1 (389-556)||(37168297-37168465)
chr1 (389-556)||(13547090-13547257)
chr1 (371-556)||(28220210-28220394)
chr1 (369-553)||(834149-834332)
chr1 (389-556)||(13549001-13549168)
chr1 (369-556)||(28265536-28265722)
chr1 (389-556)||(29136247-29136415)
chr1 (389-556)||(47255340-47255508)
chr1 (370-556)||(3156865-3157050)
chr1 (369-556)||(4552619-4552805)
chr1 (389-556)||(11348698-11348865)
chr1 (369-556)||(50169192-50169378)
chr1 (370-556)||(44455160-44455345)
chr1 (370-556)||(49918350-49918535)
chr1 (389-556)||(7482231-7482399)
chr1 (385-556)||(37033068-37033241)
chr1 (389-556)||(31925708-31925875)
chr1 (370-556)||(37503540-37503722)
chr1 (371-556)||(28223405-28223589)
chr1 (393-556)||(34603576-34603740)
chr1 (389-556)||(47115171-47115340)
chr1 (385-556)||(45644351-45644523)
chr1 (369-553)||(13659318-13659501)
chr1 (389-556)||(193611-193778)
chr1 (387-556)||(19754494-19754664)
chr1 (385-556)||(31659238-31659409)
chr1 (369-556)||(41360914-41361101)
chr1 (369-556)||(50167157-50167343)
chr1 (369-553)||(3847103-3847286)
chr1 (369-553)||(46064921-46065104)
chr1 (409-556)||(23555286-23555433)
chr1 (370-556)||(37559850-37560037)
chr1 (412-556)||(1833522-1833667)
chr1 (385-556)||(13137973-13138142)
chr1 (389-481)||(28242382-28242472)
chr1 (385-553)||(196904-197073)
chr1 (385-556)||(19752685-19752857)
chr1 (409-538)||(15820326-15820455)
chr1 (413-551)||(22079322-22079461)
chr1 (370-556)||(30476429-30476614)
chr1 (369-553)||(40122178-40122363)
chr1 (389-482)||(37876767-37876858)
chr1 (389-535)||(927977-928123)
chr1 (369-472)||(36683766-36683866)
chr1 (369-502)||(16455676-16455807)
chr1 (385-556)||(10925223-10925397)
chr1 (398-542)||(37282701-37282846)
chr1 (483-556)||(37879005-37879079)
chr1 (466-542)||(3460710-3460788)
chr1 (484-553)||(8871143-8871213)
chr1 (470-534)||(48382441-48382505)
chr1 (475-538)||(32736952-32737015)
chr1 (475-538)||(35109493-35109556)
chr1 (417-502)||(5459961-5460046)
chr1 (476-551)||(12318609-12318685)
chr1 (388-433)||(15916626-15916671)
chr1 (388-433)||(31422862-31422906)
chr1 (398-556)||(44650172-44650331)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (197-653)||(10593161-10593621)
chr5 (197-653)||(25078023-25078484)
chr5 (197-653)||(25135992-25136453)
chr5 (199-646)||(29720274-29720721)
chr5 (199-646)||(29722434-29722881)
chr5 (198-646)||(29750969-29751418)
chr5 (197-653)||(40379995-40380454)
chr5 (197-653)||(40382206-40382665)
chr5 (197-642)||(22536103-22536541)
chr5 (197-653)||(16544312-16544774)
chr5 (197-653)||(16546534-16546996)
chr5 (202-644)||(9789042-9789480)
chr5 (202-644)||(18441462-18441904)
chr5 (205-644)||(16409387-16409824)
chr5 (202-644)||(26177795-26178234)
chr5 (202-644)||(26170686-26171114)
chr5 (369-639)||(25412672-25412947)
chr5 (205-646)||(30182492-30182933)
chr5 (222-646)||(13342964-13343389)
chr5 (202-646)||(36073863-36074309)
chr5 (369-537)||(37439161-37439328)
chr5 (369-556)||(13239751-13239938)
chr5 (389-556)||(213465-213633)
chr5 (352-556)||(32636824-32637027)
chr5 (377-556)||(28278316-28278494)
chr5 (389-556)||(40147261-40147428)
chr5 (385-556)||(42428427-42428598)
chr5 (369-553)||(33831683-33831866)
chr5 (385-556)||(13488203-13488374)
chr5 (389-556)||(5058047-5058212)
chr5 (372-556)||(533769-533952)
chr5 (366-553)||(8565926-8566111)
chr5 (391-556)||(27637615-27637781)
chr5 (369-626)||(16452003-16452266)
chr5 (369-553)||(31182976-31183157)
chr5 (370-639)||(30682906-30683178)
chr5 (385-553)||(39468546-39468714)
chr5 (369-556)||(13695672-13695859)
chr5 (385-556)||(42426232-42426403)
chr5 (370-556)||(28750638-28750823)
chr5 (385-553)||(538028-538196)
chr5 (389-556)||(27015531-27015690)
chr5 (389-542)||(16640941-16641091)
chr5 (400-553)||(9049354-9049506)
chr5 (385-552)||(38747009-38747176)
chr5 (369-553)||(3075640-3075823)
chr5 (387-550)||(316769-316933)
chr5 (385-457)||(19806463-19806534)
chr5 (385-502)||(42309932-42310048)
chr5 (387-502)||(33906028-33906144)
chr5 (369-482)||(42926967-42927077)
chr5 (394-454)||(4160702-4160762)
chr5 (455-502)||(42926922-42926970)
chr5 (444-502)||(10054871-10054929)
chr5 (388-433)||(38882340-38882384)
chr5 (369-409)||(15464517-15464557)
chr5 (389-433)||(18596881-18596924)
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (196-646)||(45282893-45283346)
chr3 (196-646)||(54635035-54635484)
chr3 (197-653)||(3617352-3617813)
chr3 (197-653)||(25637331-25637793)
chr3 (172-644)||(6716412-6716881)
chr3 (197-642)||(4600549-4600998)
chr3 (197-642)||(4598328-4598777)
chr3 (197-642)||(10211309-10211758)
chr3 (197-642)||(10209089-10209538)
chr3 (197-653)||(10056122-10056582)
chr3 (197-653)||(10058344-10058804)
chr3 (197-653)||(10060566-10061026)
chr3 (197-653)||(10062788-10063248)
chr3 (197-653)||(10065010-10065470)
chr3 (202-593)||(7779821-7780208)
chr3 (205-644)||(801003-801435)
chr3 (202-646)||(23199957-23200402)
chr3 (271-646)||(23197823-23198203)
chr3 (455-653)||(10067232-10067431)
chr3 (369-652)||(45095062-45095350)
chr3 (272-644)||(9636010-9636390)
chr3 (205-644)||(5257967-5258407)
chr3 (522-644)||(6718596-6718718)
chr3 (369-556)||(37408458-37408645)
chr3 (222-647)||(5260162-5260589)
chr3 (197-428)||(10067435-10067669)
chr3 (272-553)||(19683774-19684054)
chr3 (385-556)||(7762265-7762437)
chr3 (369-545)||(7764476-7764651)
chr3 (370-556)||(34491212-34491397)
chr3 (385-549)||(9581290-9581454)
chr3 (377-556)||(49199457-49199638)
chr3 (369-556)||(29196368-29196555)
chr3 (377-556)||(43401789-43401970)
chr3 (389-556)||(4569952-4570120)
chr3 (385-553)||(39153358-39153526)
chr3 (377-552)||(30236129-30236304)
chr3 (370-644)||(40735288-40735568)
chr3 (385-556)||(40734498-40734669)
chr3 (385-556)||(44331545-44331716)
chr3 (389-556)||(41819523-41819691)
chr3 (381-556)||(43403736-43403913)
chr3 (369-553)||(760850-761033)
chr3 (389-556)||(6095600-6095767)
chr3 (396-553)||(22835010-22835167)
chr3 (369-644)||(32744418-32744689)
chr3 (385-556)||(44700476-44700646)
chr3 (389-556)||(54593704-54593871)
chr3 (370-556)||(5236440-5236624)
chr3 (369-554)||(31314447-31314631)
chr3 (385-553)||(29682362-29682530)
chr3 (385-556)||(29813063-29813234)
chr3 (389-556)||(46860474-46860642)
chr3 (370-552)||(51398818-51398999)
chr3 (369-553)||(16499033-16499215)
chr3 (377-498)||(40913352-40913472)
chr3 (377-537)||(46173377-46173536)
chr3 (370-556)||(29810868-29811053)
chr3 (396-556)||(53921511-53921671)
chr3 (369-556)||(23391891-23392077)
chr3 (396-554)||(32891105-32891264)
chr3 (369-553)||(9666448-9666632)
chr3 (389-496)||(55301972-55302079)
chr3 (377-553)||(47304254-47304430)
chr3 (369-551)||(4055745-4055926)
chr3 (428-556)||(51352150-51352278)
chr3 (422-556)||(36018852-36018987)
chr3 (466-556)||(5433952-5434046)
chr3 (369-547)||(23410311-23410487)
chr3 (455-556)||(31340266-31340369)
chr3 (397-456)||(27305719-27305777)
chr3 (457-542)||(5373247-5373335)
chr3 (485-544)||(28253363-28253423)
chr3 (430-551)||(35138746-35138868)
chr3 (483-536)||(25517069-25517121)
chr3 (389-457)||(2075076-2075143)
chr3 (484-536)||(4386875-4386926)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (194-642)||(25689869-25690316)
chr8 (172-644)||(3439416-3439886)
chr8 (197-642)||(15290438-15290887)
chr8 (197-642)||(15470807-15471256)
chr8 (197-642)||(42575130-42575578)
chr8 (202-644)||(2627647-2628087)
chr8 (270-646)||(31218160-31218541)
chr8 (272-647)||(34254217-34254594)
chr8 (272-646)||(17982556-17982935)
chr8 (272-647)||(34256393-34256770)
chr8 (205-646)||(19945182-19945625)
chr8 (272-645)||(44303758-44304137)
chr8 (272-556)||(42498193-42498477)
chr8 (369-542)||(1746200-1746371)
chr8 (370-556)||(15212786-15212971)
chr8 (369-556)||(3303652-3303838)
chr8 (385-556)||(27811278-27811449)
chr8 (389-556)||(42434992-42435159)
chr8 (370-556)||(43036423-43036608)
chr8 (389-556)||(4283524-4283691)
chr8 (385-556)||(33352150-33352321)
chr8 (389-556)||(18655400-18655567)
chr8 (385-554)||(40321082-40321251)
chr8 (385-542)||(12702631-12702787)
chr8 (369-553)||(1345353-1345536)
chr8 (369-556)||(19491680-19491867)
chr8 (385-556)||(40221745-40221916)
chr8 (370-556)||(4731658-4731843)
chr8 (377-554)||(10930188-10930365)
chr8 (370-550)||(30143346-30143525)
chr8 (369-556)||(30291606-30291794)
chr8 (415-553)||(40328782-40328922)
chr8 (385-552)||(5689275-5689442)
chr8 (395-556)||(18141821-18141981)
chr8 (427-553)||(44353796-44353923)
chr8 (385-553)||(6598975-6599143)
chr8 (385-553)||(6674428-6674596)
chr8 (386-556)||(9765745-9765914)
chr8 (369-556)||(1292446-1292631)
chr8 (389-552)||(11383989-11384152)
chr8 (385-552)||(41366612-41366778)
chr8 (389-556)||(8965692-8965859)
chr8 (369-472)||(4743196-4743296)
chr8 (389-538)||(4162516-4162663)
chr8 (370-480)||(4733784-4733891)
chr8 (369-502)||(10015136-10015265)
chr8 (389-497)||(3073875-3073981)
chr8 (396-556)||(3772192-3772352)
chr8 (400-502)||(8153813-8153914)
chr8 (413-532)||(11712024-11712145)
chr8 (394-502)||(18106087-18106191)
chr8 (484-551)||(1822297-1822365)
chr8 (484-551)||(1856742-1856810)
chr8 (396-502)||(7597669-7597776)
chr8 (389-551)||(29796320-29796485)
chr8 (469-552)||(41364926-41365011)
chr8 (205-253)||(3303494-3303541)
chr8 (484-532)||(6813771-6813818)
chr8 (205-253)||(43036720-43036767)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (196-646)||(20343807-20344256)
chr7 (197-653)||(18388565-18389024)
chr7 (197-653)||(6594363-6594822)
chr7 (197-653)||(18392001-18392460)
chr7 (197-653)||(6592145-6592604)
chr7 (197-642)||(32060127-32060579)
chr7 (323-646)||(24789751-24790074)
chr7 (197-472)||(1560470-1560749)
chr7 (205-644)||(43503975-43504411)
chr7 (269-644)||(39731281-39731656)
chr7 (486-653)||(1562103-1562268)
chr7 (280-646)||(35853818-35854190)
chr7 (205-646)||(25766780-25767219)
chr7 (369-645)||(29990959-29991240)
chr7 (205-646)||(48408705-48409152)
chr7 (205-646)||(4178678-4179118)
chr7 (385-556)||(23555039-23555212)
chr7 (385-556)||(34310712-34310884)
chr7 (272-626)||(25615785-25616137)
chr7 (370-556)||(22269973-22270158)
chr7 (369-644)||(19502083-19502365)
chr7 (369-556)||(41317416-41317602)
chr7 (371-556)||(14069817-14070001)
chr7 (371-556)||(14379845-14380029)
chr7 (370-556)||(27347817-27348002)
chr7 (389-556)||(8359316-8359485)
chr7 (385-556)||(30024729-30024900)
chr7 (369-553)||(41648993-41649175)
chr7 (391-556)||(29608737-29608902)
chr7 (377-538)||(2390301-2390461)
chr7 (370-556)||(18126644-18126829)
chr7 (369-553)||(38671204-38671387)
chr7 (389-556)||(3258995-3259162)
chr7 (393-556)||(6431971-6432134)
chr7 (385-556)||(8153342-8153513)
chr7 (389-502)||(32358055-32358167)
chr7 (409-556)||(48491579-48491727)
chr7 (389-556)||(48599335-48599502)
chr7 (370-556)||(48489431-48489616)
chr7 (389-556)||(4508707-4508874)
chr7 (385-556)||(31732966-31733137)
chr7 (369-556)||(36146390-36146576)
chr7 (394-556)||(2360978-2361140)
chr7 (370-556)||(26417316-26417501)
chr7 (370-556)||(47673927-47674111)
chr7 (370-556)||(47676119-47676304)
chr7 (385-556)||(4586161-4586332)
chr7 (387-556)||(43864244-43864413)
chr7 (369-553)||(495965-496148)
chr7 (205-327)||(24790230-24790349)
chr7 (369-556)||(4253510-4253697)
chr7 (389-556)||(4510549-4510716)
chr7 (389-556)||(4512391-4512558)
chr7 (369-553)||(1113660-1113843)
chr7 (396-537)||(23565069-23565210)
chr7 (386-531)||(2759195-2759339)
chr7 (389-553)||(31105394-31105558)
chr7 (377-502)||(6359941-6360065)
chr7 (399-556)||(23343975-23344130)
chr7 (394-551)||(22328395-22328556)
chr7 (369-482)||(24525484-24525594)
chr7 (369-494)||(31518965-31519089)
chr7 (485-556)||(24525992-24526065)
chr7 (369-556)||(12097849-12098027)
chr7 (368-556)||(36574497-36574683)
chr7 (457-556)||(31518795-31518896)
chr7 (389-491)||(18396384-18396486)
chr7 (387-457)||(30814536-30814605)
chr7 (465-552)||(1360226-1360316)
chr7 (554-646)||(24514934-24515025)
chr7 (484-537)||(28617182-28617234)
chr7 (369-409)||(47263663-47263703)
[»] chr4 (74 HSPs)
chr4 (197-653)||(8395508-8395967)
chr4 (197-653)||(8393299-8393758)
chr4 (197-653)||(7124804-7125265)
chr4 (197-653)||(7122585-7123046)
chr4 (197-653)||(5138193-5138654)
chr4 (197-653)||(5135967-5136429)
chr4 (208-644)||(31495130-31495573)
chr4 (205-646)||(13992114-13992551)
chr4 (369-556)||(56178618-56178805)
chr4 (389-645)||(29999806-30000069)
chr4 (369-556)||(52095344-52095530)
chr4 (377-552)||(2209717-2209894)
chr4 (369-556)||(48143042-48143230)
chr4 (385-537)||(5370079-5370232)
chr4 (370-556)||(9927441-9927626)
chr4 (392-556)||(41964415-41964580)
chr4 (377-556)||(26364236-26364415)
chr4 (370-556)||(12739533-12739718)
chr4 (389-556)||(46703500-46703669)
chr4 (369-556)||(47038393-47038577)
chr4 (377-556)||(54883020-54883199)
chr4 (370-537)||(12743908-12744073)
chr4 (370-537)||(12745297-12745462)
chr4 (370-556)||(26175619-26175804)
chr4 (369-554)||(46147373-46147557)
chr4 (389-556)||(12073392-12073560)
chr4 (385-556)||(36463386-36463557)
chr4 (389-556)||(40632445-40632612)
chr4 (389-556)||(41639426-41639593)
chr4 (369-556)||(45687164-45687351)
chr4 (370-556)||(34570397-34570582)
chr4 (369-556)||(48893620-48893810)
chr4 (387-556)||(36994524-36994693)
chr4 (389-553)||(379383-379548)
chr4 (389-538)||(6655975-6656123)
chr4 (389-556)||(8648139-8648306)
chr4 (409-556)||(8665408-8665556)
chr4 (377-552)||(50262689-50262865)
chr4 (377-554)||(12119540-12119719)
chr4 (369-556)||(6542161-6542349)
chr4 (387-556)||(37740625-37740794)
chr4 (389-556)||(37229722-37229890)
chr4 (385-556)||(27416962-27417133)
chr4 (389-502)||(50673848-50673960)
chr4 (370-556)||(54199890-54200074)
chr4 (369-556)||(52082645-52082825)
chr4 (372-556)||(5871820-5872003)
chr4 (369-553)||(52467336-52467519)
chr4 (389-556)||(4587958-4588126)
chr4 (385-556)||(5429679-5429850)
chr4 (369-556)||(31474150-31474337)
chr4 (389-549)||(5207843-5208003)
chr4 (397-556)||(35662441-35662600)
chr4 (427-556)||(12747794-12747924)
chr4 (429-537)||(12744087-12744195)
chr4 (429-556)||(12745476-12745604)
chr4 (394-541)||(26699447-26699596)
chr4 (385-482)||(13009441-13009536)
chr4 (370-556)||(29254494-29254679)
chr4 (439-556)||(24969112-24969230)
chr4 (389-556)||(51337064-51337231)
chr4 (385-553)||(3913451-3913618)
chr4 (413-502)||(33989899-33989989)
chr4 (377-554)||(21688250-21688428)
chr4 (466-551)||(44967906-44967992)
chr4 (457-552)||(48142444-48142542)
chr4 (467-556)||(55085442-55085532)
chr4 (484-542)||(1983252-1983309)
chr4 (466-538)||(5349929-5350002)
chr4 (369-435)||(24969787-24969851)
chr4 (484-556)||(41639263-41639336)
chr4 (369-551)||(29056363-29056545)
chr4 (415-502)||(33089933-33090021)
chr4 (377-433)||(5396720-5396775)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (197-653)||(2409-2868)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (197-653)||(12647191-12647650)
chr2 (222-646)||(6266601-6267023)
chr2 (197-576)||(13655834-13656220)
chr2 (202-644)||(32289477-32289916)
chr2 (205-644)||(4484151-4484594)
chr2 (205-558)||(30833342-30833693)
chr2 (270-646)||(4503017-4503397)
chr2 (272-646)||(45099658-45100036)
chr2 (369-647)||(5723237-5723520)
chr2 (369-646)||(36205646-36205928)
chr2 (369-556)||(2334399-2334586)
chr2 (272-644)||(36987961-36988338)
chr2 (369-556)||(6594987-6595175)
chr2 (389-556)||(45726929-45727096)
chr2 (385-556)||(29867869-29868040)
chr2 (369-538)||(723726-723893)
chr2 (389-556)||(35446885-35447052)
chr2 (369-556)||(36773562-36773748)
chr2 (385-556)||(38312240-38312411)
chr2 (369-553)||(34139752-34139936)
chr2 (369-556)||(11067305-11067491)
chr2 (369-556)||(11151573-11151759)
chr2 (369-556)||(36317991-36318177)
chr2 (370-556)||(17057352-17057537)
chr2 (370-556)||(17085335-17085520)
chr2 (391-556)||(1631735-1631900)
chr2 (409-553)||(42362355-42362500)
chr2 (377-556)||(24398055-24398238)
chr2 (389-551)||(33648176-33648340)
chr2 (369-553)||(14633807-14633991)
chr2 (423-556)||(13121769-13121901)
chr2 (369-556)||(33162432-33162618)
chr2 (385-553)||(11690504-11690672)
chr2 (389-502)||(17490149-17490261)
chr2 (389-556)||(26353184-26353351)
chr2 (378-556)||(42288101-42288278)
chr2 (439-556)||(7815323-7815441)
chr2 (389-556)||(11049550-11049721)
chr2 (389-502)||(7451173-7451284)
chr2 (385-457)||(39284936-39285007)
chr2 (385-457)||(17450678-17450748)
chr2 (457-548)||(24885669-24885762)
chr2 (369-433)||(1345590-1345653)
chr2 (457-535)||(7597077-7597158)
chr2 (485-552)||(14202501-14202569)
chr2 (388-433)||(42064725-42064770)
chr2 (377-433)||(2838079-2838134)
chr2 (369-409)||(28259249-28259289)
chr2 (400-452)||(28672036-28672088)
chr2 (486-538)||(28770730-28770781)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (197-653)||(6177-6638)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (218-653)||(3554-3990)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (269-644)||(11042-11425)
scaffold0491 (269-558)||(8616-8907)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (280-646)||(434436-434808)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (218-421)||(1-205)
[»] scaffold0286 (2 HSPs)
scaffold0286 (205-556)||(11557-11911)
scaffold0286 (606-646)||(22247-22286)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (385-646)||(820-1087)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (385-556)||(114602-114774)
scaffold0016 (475-538)||(102450-102513)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (389-556)||(18004-18171)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (389-556)||(7327-7494)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (370-556)||(20398-20583)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (369-553)||(149079-149262)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (389-532)||(10515-10656)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (458-552)||(80351-80447)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (400-502)||(27453-27556)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (369-409)||(8491-8531)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 425; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 172 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 16653496 - 16653007
Alignment:
Q  172 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16653496 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt--gtg 16653399  T
Q  272 caagcaacaatcaacaaaacaccacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaa 371  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16653398 caagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaa 16653299  T
Q  372 caaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttaca 470  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16653298 caaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 16653199  T
Q  471 aa-gggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgat 569  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653198 aaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgat 16653099  T
Q  570 tctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttgcttctcca 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16653098 tctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttgattctcca 16653007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 172 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 16555253 - 16554772
Alignment:
Q  172 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16555253 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt--gtg 16555156  T
Q  272 caagcaacaatcaacaaaacaccacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaa 371  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16555155 caagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaa 16555056  T
Q  372 caaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttaca 470  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16555055 caaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 16554956  T
Q  471 aa-gggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgat 569  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554955 aaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgat 16554856  T
Q  570 tctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554855 tctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16554772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 172 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 16631809 - 16631328
Alignment:
Q  172 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16631809 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt--gtg 16631712  T
Q  272 caagcaacaatcaacaaaacaccacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaa 371  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16631711 caagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaa 16631612  T
Q  372 caaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttaca 470  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16631611 caaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 16631512  T
Q  471 aa-gggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgat 569  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631511 aaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgat 16631412  T
Q  570 tctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631411 tctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16631328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 172 - 653
Target Start/End: Original strand, 16578302 - 16578783
Alignment:
Q  172 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16578302 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt--gtg 16578399  T
Q  272 caagcaacaatcaacaaaacaccacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaa 371  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16578400 caagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaa 16578499  T
Q  372 caaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttaca 470  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16578500 caaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 16578599  T
Q  471 aa-gggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgat 569  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578600 aaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgat 16578699  T
Q  570 tctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578700 tctctctttacaacgtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16578783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 172 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 16617078 - 16616597
Alignment:
Q  172 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16617078 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt--gtg 16616981  T
Q  272 caagcaacaatcaacaaaacaccacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaa 371  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16616980 caagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaa 16616881  T
Q  372 caaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttaca 470  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16616880 caaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 16616781  T
Q  471 aa-gggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgat 569  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616780 aaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgat 16616681  T
Q  570 tctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616680 tctctctttacaacgtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16616597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 25421669 - 25421208
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  25421669 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 25421570  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  25421569 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 25421472  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaa-gggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  25421471 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 25421372  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421371 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 25421272  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25421271 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25421208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 172 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 27648232 - 27647775
Alignment:
Q  172 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtg 271  Q
    ||||||||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27648232 tgttgtgaattccgatcaccta---gatcgaaccacaccaatacaaga--atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccgaacaaagtgtgtgtg 27648138  T
Q  272 caagcaacaatcaacaaaacaccacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaa 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||      ||||||  | |||||||||||||||||    
T  27648137 caagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaatacacaa------gataaa--aggagagggaagaagaaaa 27648046  T
Q  372 caaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaa 471  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27648045 caaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaa 27647947  T
Q  472 a-gggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatt 570  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647946 aagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatt 27647847  T
Q  571 ctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647846 ctctc--tacatggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 27647775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 6027609 - 6027151
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  6027609 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagaggggtaaccacctaacaaggtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 6027510  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |  |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  6027509 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa---atggagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 6027413  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaa-gggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  6027412 tcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 6027313  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6027312 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 6027215  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6027214 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6027151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Original strand, 33341908 - 33342370
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || |||||||||||    
T  33341908 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 33342007  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcacaagataaacaaag-agagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagatt 389  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||   || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  33342008 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagatt 33342105  T
Q  390 gttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaggga-tacaaaaggtt 487  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    
T  33342106 ggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggagtacaagaggtt 33342205  T
Q  488 acaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtg 586  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33342206 acaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtg 33342303  T
Q  587 tttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  33342304 tttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 33342370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 34167443 - 34166983
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||| || |||||||||||    
T  34167443 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaaaaatattgagcaagcaaaaaacaacaaaacac 34167344  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  34167343 cacctagatcaaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 34167246  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||||    
T  34167245 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaataagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 34167146  T
Q  490 aagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 588  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34167145 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtt 34167048  T
Q  589 tcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  34167047 tcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 34166983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 34165221 - 34164761
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||| || ||||||| |||    
T  34165221 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cac 34165123  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattg 390  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  34165122 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 34165025  T
Q  391 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggtta 488  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  34165024 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtta 34164925  T
Q  489 caagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 587  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34164924 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgt 34164827  T
Q  588 ttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  34164826 ttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 34164761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 197 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 13154278 - 13153893
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||| || |||||| ||||    
T  13154278 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaatacac 13154179  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||     
T  13154178 cacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgg 13154081  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||    
T  13154080 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 13153981  T
Q  490 aagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 576  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13153980 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 13153893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 205 - 644
Target Start/End: Original strand, 3072580 - 3073016
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaac-accacctaggtc 303  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||  | ||| ||| ||    
T  3072580 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgt--gtgcaagcaataatcaacaaaaatagcacatagatc 3072675  T
Q  304 taatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcg 403  Q
    ||||||||||||||||||  || || ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3072676 taatctaggaaacaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcg 3072773  T
Q  404 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac-aaagggatacaaaa--ggttacaagaaattag- 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||||     
T  3072774 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattaga 3072872  T
Q  500 cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt- 598  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||     
T  3072873 tttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttc 3072971  T
Q  599 tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
     | ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3072972 ccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtt 3073016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 289 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 412369 - 412014
Alignment:
Q  289 aacaccacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gaga 387  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  412369 aacagcacctagatctaatctaggtaacaagtgaaaaacacaatacacaagcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagaga 412272  T
Q  388 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagg-gatacaaaagg- 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |     
T  412271 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaa-tgagttcttacaaaagagatacaaaaaga 412173  T
Q  486 -ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaag 583  Q
     |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  412172 gttacaagaaattagatttgataagttcacaatgaacaa-ccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaag 412074  T
Q  584 gtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  412073 gtgtttcccatgttttcaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtt 412014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 205 - 646
Target Start/End: Original strand, 2171350 - 2171796
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtc 303  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  2171350 cacaccaatacgaacta-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgt--gtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatc 2171445  T
Q  304 taatctaggaaacaa-gtgtgaaa---cacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccag 399  Q
    ||||||||||| ||| |||  |||   || ||| ||||| |||||||||||   || ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2171446 taatctaggaatcaaagtgaaaaaaaacataaaacacaagcacaagataaa---agggagagaagagataaacaaatacaccaagagattgttcacccag 2171542  T
Q  400 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaaggttacaagaaattag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2171543 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaagggttacaagaaattag 2171641  T
Q  500 c-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 590  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||||||||||     
T  2171642 ctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttta 2171740  T
Q  591 ccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2171741 caatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgc 2171796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 221 - 646
Target Start/End: Original strand, 6097285 - 6097699
Alignment:
Q  221 aatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaa-caccacctaggtctaatctaggaaacaag 319  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| || ||||||||  |||||||| | ||||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  6097285 aatgatgtgtggagcaacggaaagtagtaaccactaa-caaagtgt--gtgcaagctataatcaacaaaaacagcaccttgatctaatctaggtaacaag 6097381  T
Q  320 tgtgaaa-cacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacc 417  Q
    ||  ||| |||||  |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097382 tggaaaaacacaatacacaatcacaagata--caaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacc 6097479  T
Q  418 tactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaaggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaat 516  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||         |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  6097480 tactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttaca---------aaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaa 6097569  T
Q  517 gaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatact 615  Q
    |||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||    
T  6097570 gaac-aatcctaatttctaccatttttccaatctcaccaaaacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaaccaaagagatact 6097668  T
Q  616 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097669 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 6097699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 272 - 647
Target Start/End: Original strand, 31404561 - 31404940
Alignment:
Q  272 caagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaa-cacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaa 369  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||    |||| |||||| ||||| || ||||||||   || ||| |||||   |    
T  31404561 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagaggaaagcacaaaccacaagcaaaagataaa---ag-gagagaagagaga 31404656  T
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31404657 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 31404754  T
Q  470 aaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagaca 560  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||    
T  31404755 aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcactgatgaacaagaca 31404853  T
Q  561 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtttt-ctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcc 647  Q
    |||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  31404854 ctcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaagaccctaaaccctaaagttgcc 31404940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 369 - 647
Target Start/End: Original strand, 5406181 - 5406464
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  5406181 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5406278  T
Q  469 caaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagac 559  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||    
T  5406279 caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 5406377  T
Q  560 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcc 647  Q
    ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5406378 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcc 5406464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 369 - 647
Target Start/End: Original strand, 5410506 - 5410789
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  5410506 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5410603  T
Q  469 caaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagac 559  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||    
T  5410604 caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 5410702  T
Q  560 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcc 647  Q
    ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5410703 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcc 5410789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 369 - 646
Target Start/End: Original strand, 16452310 - 16452594
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  16452310 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttc 16452407  T
Q  469 caaagggata-caaaaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caag 557  Q
    ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||    
T  16452408 caaagagatatgaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaag 16452506  T
Q  558 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  16452507 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaactctaaagttgc 16452594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 369 - 646
Target Start/End: Original strand, 30834517 - 30834801
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  30834517 aaacaaacacaccaa-agattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttc 30834614  T
Q  469 caaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caag 557  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||    
T  30834615 caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaag 30834713  T
Q  558 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    ||||||||||||| || ||   | |||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  30834714 acactcaatgattttcactcaccgaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accataaaccctaaagttgc 30834801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 272 - 647
Target Start/End: Original strand, 5413281 - 5413658
Alignment:
Q  272 caagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaa 369  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |  || |||||| ||||| || ||||||||   || ||| |||||   |    
T  5413281 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaa---ag-gagagaagagaga 5413376  T
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5413377 aacaaacacaccaa-agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 5413473  T
Q  470 aaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagaca 560  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||    
T  5413474 aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaatgaacaagaca 5413572  T
Q  561 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcc 647  Q
    |||||||||| || ||   ||| |||||| | ||||||  | |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5413573 ctcaatgattttcactcaccaatgtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcc 5413658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 33160333 - 33160521
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  33160333 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatc-aatgagttctta 33160430  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  33160431 caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 33160521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 21589098 - 21588931
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  21589098 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 21589001  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21589000 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21588931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 21593831 - 21593664
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  21593831 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 21593734  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21593733 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21593664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 380 - 556
Target Start/End: Original strand, 3808699 - 3808877
Alignment:
Q  380 ccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatac 479  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3808699 ccaagagattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatac 3808797  T
Q  480 aaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3808798 aaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 3808877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 371 - 556
Target Start/End: Original strand, 9183015 - 9183199
Alignment:
Q  371 acaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttaca 470  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9183015 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttaca 9183111  T
Q  471 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9183112 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 9183199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 389 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 17758191 - 17758026
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  17758191 tgttcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 17758093  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17758092 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 17758026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 2972940 - 2973107
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  2972940 tgttcacctagttcggtcgaa-cttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 2973037  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2973038 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2973107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 17763158 - 17762990
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||    
T  17763158 tgttcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatc-aatgagttcttccaaaaagatacaaatgagtt 17763060  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17763059 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 17762990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 272 - 485
Target Start/End: Original strand, 5408956 - 5409164
Alignment:
Q  272 caagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaa 369  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |  || |||||| ||||| || ||||||||   || ||| |||||   |    
T  5408956 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaa---ag-gagagaagagaga 5409051  T
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5409052 aacaaacacaccaa-agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 5409148  T
Q  470 aaagggatacaaaagg 485  Q
    |||| |||||||||||    
T  5409149 aaagagatacaaaagg 5409164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 389 - 554
Target Start/End: Original strand, 26830124 - 26830289
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaagg-tt 487  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  26830124 tgttcacccagttcagtc-aaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatggatt 26830221  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 554  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26830222 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccatttttccaatctcacc 26830289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 22424826 - 22424995
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa---gg 485  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||   ||    
T  22424826 tgttcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttacaaagagatacaaaaatggg 22424923  T
Q  486 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22424924 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 22424995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 369 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 16569208 - 16568953
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16569208 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 16569112  T
Q  469 caaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaat 566  Q
    |           ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||    
T  16569111 c-----------aaaggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct---caagacactcaat 16569026  T
Q  567 gattctctctt-tacaaggtgtttcccatgttttc-tacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 639  Q
    |||| || |||   |||||||||| | |||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16569025 gattttcacttacccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 16568953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 28137409 - 28137576
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  ||||    
T  28137409 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagaaatacaaatgggtt 28137506  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28137507 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 28137576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 389 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 5043795 - 5043630
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  5043795 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 5043697  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac 553  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  5043696 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctactcattttctcaatctcac 5043630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 300
Target Start/End: Original strand, 6136108 - 6136214
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  6136108 gatcgaaccataccaatacaaagaataatgatgtgtggagcaacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 6136207  T
Q  294 cacctag 300  Q
    |||||||    
T  6136208 cacctag 6136214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Original strand, 26954283 - 26954450
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag 484  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |    
T  26954283 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacagatg 26954380  T
Q  485 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 553  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  26954381 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttataccaatttcccaatctcac 26954450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Original strand, 33211182 - 33211353
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag 484  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  33211182 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttcttacaaagagatacaaatg 33211279  T
Q  485 -gttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
     | |||||||||||| ||| | |||| |||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33211280 agctacaagaaattaacttcatcaagctcacaaagaac-aaccataatttctaccaattttcccaatctcaccaa 33211353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16553044 - 16552976
Alignment:
Q  172 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16553044 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaagg 16552976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16629600 - 16629532
Alignment:
Q  172 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16629600 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaagg 16629532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 389 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 26800755 - 26800642
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa--ggt 486  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||   ||    
T  26800755 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttacaaagagatacaaaattagt 26800658  T
Q  487 tacaagaaattagctt 502  Q
    ||||||||||||||||    
T  26800657 tacaagaaattagctt 26800642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 522
Target Start/End: Original strand, 603081 - 603222
Alignment:
Q  381 caagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggataca 480  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||   ||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  603081 caagagattgttgacccagttcggtcc-aacttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatc-aacgagttcttacaaagagataca 603178  T
Q  481 aa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaa 522  Q
    ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||    
T  603179 aatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 603222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Original strand, 3038926 - 3039071
Alignment:
Q  412 ttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 509  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||     
T  3038926 ttgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaa-gagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagc 3039024  T
Q  510 tcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3039025 tcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 3039071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13159134 - 13159066
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaag 263  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  13159134 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaag 13159066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 4045542 - 4045423
Alignment:
Q  439 ctcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttcta 535  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  4045542 ctctccaatccactatcaa-tgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcataaagaacaaaccctaatttcta 4045444  T
Q  536 cccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    || ||||||||||||| ||||    
T  4045443 ccattttcccaatctctccaa 4045423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 412437 - 412374
Alignment:
Q  202 aaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt 266  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  412437 aaccacaccaataccaagta-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaaacaaagtgt 412374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 433
Target Start/End: Original strand, 21356021 - 21356084
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 433  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  21356021 aaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctggaggagaga 21356084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 16567265 - 16567185
Alignment:
Q  489 caagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatgatt 570  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  16567265 caagaaattagcttaaacaagctcacaaaaaacaaaacctaatttctaaccattttcccaatctca---agacactcaatgatt 16567185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 389 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 19643938 - 19643894
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 433  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19643938 tgtttaccaagttcggtccaaatttgacctactctgaaggagaga 19643894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 170 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 9036801 - 9036320
Alignment:
Q  170 cctgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttg 269  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036801 cctgttgtgaattccgatcccc-actagatcgaaccacaccaatgcaaagga-tgatgtgtggagctaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttg 9036704  T
Q  270 tgcaagcaacaatcaacaaaacaccacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaa 369  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9036703 tgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 9036604  T
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9036603 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaa-gagttcttac 9036505  T
Q  470 -aaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga 568  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036504 aaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga 9036405  T
Q  569 ttctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036404 ttctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 9036320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 202 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 40282730 - 40282287
Alignment:
Q  202 aaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaa-caaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccacctag 300  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40282730 aaccacaccaatgcaaacta-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctag 40282632  T
Q  301 gtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagt 400  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40282631 atctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagt 40282534  T
Q  401 tcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa-gggatacaaaaggttacaagaaattag 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40282533 tcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag 40282435  T
Q  500 ctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 598  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40282434 attagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt 40282335  T
Q  599 tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282334 tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 40282287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 44203995 - 44203536
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  44203995 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 44203896  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  44203895 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 44203798  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaa-gggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  44203797 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 44203698  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44203697 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 44203600  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44203599 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 44203536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 198 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 21054314 - 21053868
Alignment:
Q  198 atcgaaccacaccaatacaaaata-atgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccac 296  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21054314 atcgaaccacaccaatacaagaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaactaagtgt--gtgcaagcaataatcaacaaaacaccac 21054217  T
Q  297 ctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacc 396  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21054216 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacc 21054119  T
Q  397 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa-gggatacaaaaggttacaagaaa 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21054118 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttgcaagaaa 21054020  T
Q  496 ttagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccat 594  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  21054019 ttagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacacttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttttctctacaaggtgtttcccat 21053920  T
Q  595 gttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21053919 gttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 21053868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 222 - 646
Target Start/End: Original strand, 20622072 - 20622496
Alignment:
Q  222 atgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccacctaggtctaatctaggaaacaagtg 321  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20622072 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg 20622171  T
Q  322 tgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 421  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622172 agaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 20622269  T
Q  422 ctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa---gggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatg 517  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20622270 ctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatg 20622368  T
Q  518 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactct 617  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20622369 aacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacagtcaatgattttccctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 20622467  T
Q  618 aatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622468 aatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 20622496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 198 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 9987558 - 9987112
Alignment:
Q  198 atcgaaccacaccaatacaaaata-atgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccac 296  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  9987558 atcgaaccacaccaatacgaaaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaatcaaagtgt--gtgcaagcaataatcaacaaaacaccac 9987461  T
Q  297 ctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaat-acaccaagagattgttcac 395  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9987460 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacactatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcac 9987363  T
Q  396 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa-gggatacaaaaggttacaagaa 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9987362 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa-tgagttcttgcaaaagggatacaaaaggttgcaagaa 9987264  T
Q  495 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 593  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9987263 attagattagacaagttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccca 9987165  T
Q  594 tgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987164 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 9987112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 202 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 51765747 - 51765300
Alignment:
Q  202 aaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctag 300  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||  ||   ||  |||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  51765747 aaccacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaattaa---gtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctag 51765652  T
Q  301 gtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccag 399  Q
     ||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  51765651 atctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccag 51765555  T
Q  400 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac-aaagggatacaaaa--ggttacaagaaat 496  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  51765554 ttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaggggttacaagaaat 51765456  T
Q  497 tagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 587  Q
    |||| ||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||      |||||||||||||||||  | ||   ||||||||    
T  51765455 tagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgt 51765356  T
Q  588 ttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    || | |||||| | ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51765355 ttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagtt 51765300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 272 - 553
Target Start/End: Original strand, 8550670 - 8550952
Alignment:
Q  272 caagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaag-cacaatcacaagataaacaaagagagggaaga-ag 367  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||  |||||||||  ||||| ||||||||||| | |||    ||||| ||    
T  8550670 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcacaagataaagagagaa---gaagagag 8550766  T
Q  368 aaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt 467  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8550767 aaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 8550864  T
Q  468 acaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8550865 acaaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 8550952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 270 - 557
Target Start/End: Original strand, 13316236 - 13316521
Alignment:
Q  270 tgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaag 367  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||| || || |||||   || ||| |||||      
T  13316236 tgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaa---ag-gagagaagaga 13316331  T
Q  368 aaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt 467  Q
     |||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13316332 gaaacaaactcactaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt 13316429  T
Q  468 acaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaag 557  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13316430 ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaag 13316521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 369 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20762859 - 20762575
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20762859 aaacaaacacaccaa-agattggtcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 20762762  T
Q  469 caaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caag 557  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||       ||||    
T  20762761 cgaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaag 20762663  T
Q  558 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    | ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20762662 atactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgc 20762575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 377 - 556
Target Start/End: Original strand, 42297963 - 42298143
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaaggga 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  42297963 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttcttacaaagaga 42298061  T
Q  477 tacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42298062 tacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 42298143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 3189517 - 3189330
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3189517 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3189420  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  3189419 caaaaagatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3189330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 3198334 - 3198147
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3198334 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3198237  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  3198236 caaaaagatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3198147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 3207173 - 3206986
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3207173 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3207076  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  3207075 caaaaagatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3206986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 37168465 - 37168297
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa--ggt 486  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  37168465 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggt 37168368  T
Q  487 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37168367 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37168297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 13547090 - 13547257
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  13547090 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 13547187  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||| ||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13547188 acaagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13547257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 371 - 556
Target Start/End: Original strand, 28220210 - 28220394
Alignment:
Q  371 acaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttaca 470  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28220210 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttaca 28220306  T
Q  471 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28220307 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaa 28220394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Original strand, 834149 - 834332
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  834149 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttctta 834245  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 553  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  834246 caaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcac 834332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 13549001 - 13549168
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  13549001 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 13549098  T
Q  488 acaagaaatta-gcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||| ||||||| | || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13549099 acatgaaattaggtttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13549168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 28265536 - 28265722
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  28265536 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 28265632  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  28265633 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcgccaa 28265722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 29136415 - 29136247
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||  ||||    
T  29136415 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatc-aatgagttcttacaaagaaatacaaatgggtt 29136317  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
     ||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29136316 ccaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29136247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 47255340 - 47255508
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  47255340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 47255438  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  47255439 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 47255508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 3157050 - 3156865
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3157050 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 3156954  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3156953 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 3156865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 4552619 - 4552805
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  4552619 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatcaa-tgagttctta 4552715  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4552716 caaagggatacaaaggggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 4552805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 11348865 - 11348698
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  11348865 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttagaaagagatacaaatgggtt 11348768  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11348767 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 11348698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 50169192 - 50169378
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  50169192 aaacaaacacaccaa-agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagtactta 50169288  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  50169289 caaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 50169378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 44455345 - 44455160
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44455345 aacaaacacaccaa-agatcgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 44455249  T
Q  470 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||  |||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44455248 aaaaagatacaaatgagttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44455160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 49918535 - 49918350
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  49918535 aacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 49918439  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  49918438 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 49918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 7482231 - 7482399
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa--ggt 486  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  7482231 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggt 7482328  T
Q  487 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7482329 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaa 7482399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Original strand, 37033068 - 37033241
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa- 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||     
T  37033068 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatgcaaaat 37033166  T
Q  484 -ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
     | |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37033167 ggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37033241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 31925708 - 31925875
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  31925708 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 31925805  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  31925806 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-atccctaatttctacccatttttccactctcaccaa 31925875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Original strand, 37503540 - 37503722
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  37503540 aacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcgatccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 37503636  T
Q  470 aaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37503637 aaagagatac--aaggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 37503722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 556
Target Start/End: Original strand, 28223405 - 28223589
Alignment:
Q  371 acaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttaca 470  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28223405 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttaca 28223501  T
Q  471 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| || || | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28223502 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatc-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28223589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 393 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 34603740 - 34603576
Alignment:
Q  393 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa--ggttaca 490  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||    
T  34603740 cacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatc-aatgagttcttacaaagagataaaaaatgggttaca 34603643  T
Q  491 agaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  34603642 agaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaa 34603576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 47115340 - 47115171
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa--ggt 486  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||  |||    
T  47115340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatc-aatgggtttttacaaagagatacaaaatgggt 47115242  T
Q  487 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  47115241 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 47115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Original strand, 45644351 - 45644523
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag 484  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  45644351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatg 45644448  T
Q  485 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 556  Q
     ||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  45644449 agttgcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaa 45644523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Original strand, 13659318 - 13659501
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13659318 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 13659414  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 553  Q
    ||||| |||| |||  ||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13659415 caaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaac-aaccctaatttctatccgttttcccaatctcac 13659501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 193778 - 193611
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||    
T  193778 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttattacaaagagatacaaatgagtt 193681  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| | | || |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  193680 acaagaaattagcttcaacaagctaataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 193611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 387 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 19754664 - 19754494
Alignment:
Q  387 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-agg 485  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  19754664 attgttgacccacttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatcgg 19754567  T
Q  486 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  19754566 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaa 19754494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 31659409 - 31659238
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||      
T  31659409 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttcttacaaagagatacaaatg 31659312  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31659311 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-agccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 31659238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 41361101 - 41360914
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  41361101 aaacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtcc-aatatgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatc-aacgagttctta 41361004  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41361003 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41360914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 50167157 - 50167343
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  50167157 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttttta 50167253  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  50167254 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaataac-aaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaa 50167343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Original strand, 3847103 - 3847286
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |  |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3847103 aaacaaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatcaa-tgagttctta 3847199  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || |||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3847200 caaagggatacaaatgggttacaaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 3847286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 46065104 - 46064921
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  46065104 aaacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactat-gaatgagttctta 46065008  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 553  Q
    ||||| |||||| | | ||||||||||||||||||  || || |||||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  46065007 caaagagatacacatgagttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagaacaaa-cctaatttttatccattttcccaatctcac 46064921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 409 - 556
Target Start/End: Original strand, 23555286 - 23555433
Alignment:
Q  409 aacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gaca 506  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| ||  |||    
T  23555286 aacttgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttataagaaattagtttcaaca 23555383  T
Q  507 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23555384 agttcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 23555433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Original strand, 37559850 - 37560037
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-ggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||  |||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  37559850 aacaaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaac-gagttctta 37559946  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt--gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  37559947 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcctaatctcaccaa 37560037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 1833667 - 1833522
Alignment:
Q  412 ttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagcttgacaag-t 509  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| |  || |    
T  1833667 ttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaatagat 1833569  T
Q  510 tcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1833568 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 1833522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Original strand, 13137973 - 13138142
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||      
T  13137973 agattgttgacccagttcggtccaatat-gacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatc-aatgtgttcttacaaagagatgcaaatg 13138070  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |  ||||||||||| || |||  ||||||||||||    
T  13138071 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacga--cctaatttctatccatttttcaatctcaccaa 13138142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 389 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 28242472 - 28242382
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaa 481  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  28242472 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttacaaagagatacaa 28242382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Original strand, 196904 - 197073
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa 483  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  196904 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaagggatacaaat 197001  T
Q  484 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac 553  Q
    | |||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  197002 gagttacaagaaattaacttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttctcaatctcac 197073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 19752857 - 19752685
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||      
T  19752857 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaa-tgagttcttacaaagagatacaaatc 19752760  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  19752759 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaac-aaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaa 19752685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 409 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 15820455 - 15820326
Alignment:
Q  409 aacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gaca 506  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||    
T  15820455 aacttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatc-aatgagttcttaaaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaaca 15820357  T
Q  507 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 538  Q
    || |||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  15820356 agctcacaaagaacaaa-cctaatttttaccc 15820326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 413 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079322
Alignment:
Q  413 tgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 509  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||     
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatcaa-tgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagc 22079363  T
Q  510 tcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 551  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  22079362 tcacaaagaacaaa-cataatttctaccatttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Original strand, 30476429 - 30476614
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  | ||| | ||||||||  || | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  30476429 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctcatatggggtagagattgatctgtccaatccagtatcaa-tgagttcttac 30476525  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||| |||||| |||  ||||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30476526 aaagagatacaaatgggttacaataaattatcttcaacaagttcataaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 30476614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Original strand, 40122178 - 40122363
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactat--caaatgagttct 466  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  40122178 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaa-gagttct 40122274  T
Q  467 tacaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    ||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  40122275 tacaaagtgatacaaatgagttataagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttcgacccatttttccaatctcac 40122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 389 - 482
Target Start/End: Original strand, 37876767 - 37876858
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa 482  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  37876767 tgttcacccagttcggttcaa-cttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttattacaaagagatacaaa 37876858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 389 - 535
Target Start/End: Original strand, 927977 - 928123
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaagg-tt 487  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | |||| |||  ||||  |||||||||| || |||||| |||||||| ||| ||||||| ||    
T  927977 tgtttacccagttcggtctaa-cttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaa-tgagtttttacaaagagatccaaaagggtt 928074  T
Q  488 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttcta 535  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  928075 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta 928123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 36683866 - 36683766
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36683866 aaacaaacacaccaagagat-gtttactcagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatc-aatgagttctta 36683770  T
Q  469 caaa 472  Q
    ||||    
T  36683769 caaa 36683766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 16455807 - 16455676
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||  |||||| ||| |||  |||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16455807 aaacaaatacaccaagaaat-gtttacacagtttggtccaat-ttgaccgactatgggagagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctta 16455711  T
Q  469 caaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt 502  Q
    || || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  16455710 cacagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 16455676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 10925397 - 10925223
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatga---gttcttacaaagggatacaa 481  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||   ||| |||||||||||| |||||    ||||||||||| |||||||    
T  10925397 agattgttgacccagttcgatccaa-ctttacctaatctaggggagagattgatttctccaatccactatc-aatgaattcttcttacaaagagatacaa 10925300  T
Q  482 aag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    | | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| ||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  10925299 atgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctatccattttttcaatctcaccaa 10925223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 398 - 542
Target Start/End: Original strand, 37282701 - 37282846
Alignment:
Q  398 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaagggatacaaaagg-ttacaagaaa 495  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||   |||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| | |||    
T  37282701 agttcagtccaaa-ttgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccacta-ctaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttaccataaa 37282798  T
Q  496 ttagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 542  Q
    ||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  37282799 ttagcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttataccatttt 37282846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 483 - 556
Target Start/End: Original strand, 37879005 - 37879079
Alignment:
Q  483 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37879005 aggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 37879079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 3460788 - 3460710
Alignment:
Q  466 ttacaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 542  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3460788 ttacaaagatatacaaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaccctttt 3460710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 553
Target Start/End: Original strand, 8871143 - 8871213
Alignment:
Q  484 ggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 553  Q
    ||||||||||||||||||| | | |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8871143 ggttacaagaaattagcttcaacgaactcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttccaaatctcac 8871213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 48382505 - 48382441
Alignment:
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttct 534  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  48382505 aaagtgatacaaataggttacaagaaattaactt-acaagttcacaaagatcaaaccctaatttct 48382441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 475 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 32737015 - 32736952
Alignment:
Q  475 gatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 538  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32737015 gatacaaagaggttacaaaaaattagcttaa-aagttcataaagaacaaaccctaatttctaccc 32736952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 475 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 35109556 - 35109493
Alignment:
Q  475 gatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 538  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35109556 gatacaaataggttacaagaaattagcttaa-aagctcacaaagaacaaaccttaatttctaccc 35109493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 417 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 5460046 - 5459961
Alignment:
Q  417 ctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 502  Q
    ||||||| || |||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5460046 ctactctagatgagagattgatctctccaatctactatcaa-tgagttctttacaaagaaatataaaatgttacaagaaattagctt 5459961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 551
Target Start/End: Original strand, 12318609 - 12318685
Alignment:
Q  476 atacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12318609 atacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaa-cctaatttctacccatttccaaatctc 12318685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 15916671 - 15916626
Alignment:
Q  388 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 433  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  15916671 ttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagaga 15916626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 433
Target Start/End: Original strand, 31422862 - 31422906
Alignment:
Q  388 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 433  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31422862 ttgttcacccagctcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 31422906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 556
Target Start/End: Original strand, 44650172 - 44650331
Alignment:
Q  398 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagtt-cttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaa 495  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | | ||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||| |||| |||||  |||||| |||    
T  44650172 agttcggtccaaa-ttgacctacttttgggaagagattgatctcttcaatccactat-taatgaattatttacaaagagatataaaagatttacaataaa 44650269  T
Q  496 ttagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| || ||||  |||||| ||||||||| |||||| |||  ||||| ||||||| ||||    
T  44650270 ttagcgttaacaaactcacaaagaacaaaccataatttttacatttttctcaatctctccaa 44650331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 10593621 - 10593161
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10593621 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaacaaacaacaaaacac 10593522  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttc 393  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593521 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagtagaaaacaaatacaccaagagattgttc 10593422  T
Q  394 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac-aaagggatacaaaaggttacaag 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10593421 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaag 10593322  T
Q  493 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 592  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593321 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttctcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 10593222  T
Q  593 atgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10593221 atgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttccccctttg 10593161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 25078484 - 25078023
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  25078484 gatcgaaccacaccaatacaaagaagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 25078385  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  25078384 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 25078287  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaa-gggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  25078286 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 25078187  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078186 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 25078087  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25078086 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25078023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 25136453 - 25135992
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  25136453 gatcgaaccacaccaatacaaagaagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 25136354  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  25136353 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 25136256  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaa-gggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  25136255 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 25136156  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136155 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 25136056  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25136055 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25135992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 199 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 29720721 - 29720274
Alignment:
Q  199 tcgaaccacaccaatacaaaata-atgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccacc 297  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29720721 tcgaaccacaccaatacaagaaatatgttgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtacaagcaataatcaacaaaacaccacc 29720622  T
Q  298 taggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcaccc 397  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29720621 tagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcaccc 29720524  T
Q  398 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa-gggatacaaaaggttacaagaaat 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29720523 agttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 29720425  T
Q  497 tagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 595  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29720424 tagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatg 29720325  T
Q  596 ttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720324 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 29720274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 199 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 29722881 - 29722434
Alignment:
Q  199 tcgaaccacaccaatacaaaata-atgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccacc 297  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29722881 tcgaaccacaccaatacaagaaatatggtgtgtggagcaaagtagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtacaagcaataatcaacaaaacaccacc 29722782  T
Q  298 taggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcaccc 397  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29722781 tagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcaccc 29722684  T
Q  398 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa-gggatacaaaaggttacaagaaat 496  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29722683 agttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 29722585  T
Q  497 tagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 595  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29722584 tagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatg 29722485  T
Q  596 ttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722484 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 29722434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 198 - 646
Target Start/End: Original strand, 29750969 - 29751418
Alignment:
Q  198 atcgaaccacaccaatacaaaata-atgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccac 296  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29750969 atcgaaccacaccaatacaagaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaatgtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccac 29751068  T
Q  297 ctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaat-acaccaagagattgttcac 395  Q
    |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29751069 ctagatataatctagaaaacaagtgagaaacacagtacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcac 29751166  T
Q  396 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa-gggatacaaaaggttacaagaa 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29751167 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaa 29751265  T
Q  495 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 593  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29751266 attagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccca 29751365  T
Q  594 tgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751366 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 29751418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 40380454 - 40379995
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  40380454 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 40380355  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  40380354 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 40380257  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaa-gggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  40380256 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 40380157  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40380156 aagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 40380059  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  40380058 cccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 40379995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 40382665 - 40382206
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  40382665 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcggcggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 40382566  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  40382565 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 40382468  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaa-gggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  40382467 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 40382368  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40382367 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaacttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 40382270  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  40382269 cccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 40382206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 197 - 642
Target Start/End: Original strand, 22536103 - 22536541
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaa-caaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacacca 295  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |    
T  22536103 gatcgaaccacaccaatacaaag-aatgatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaagcaaagtgtatg--caagcaacaatcaacaaaaaac-a 22536198  T
Q  296 cctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcac 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22536199 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaacacaatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcac 22536296  T
Q  396 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa-gggatacaaaaggttacaagaa 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22536297 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaa 22536395  T
Q  495 attagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccat 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||    
T  22536396 attagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tgcagggtgtttcccat 22536493  T
Q  595 gttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 642  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536494 gttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 22536541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 16544774 - 16544312
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| || |||||||||||    
T  16544774 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacac 16544675  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcacaagataaacaaag-agagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagatt 389  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  16544674 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagatt 16544577  T
Q  390 gttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggtt 487  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  16544576 ggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggtt 16544477  T
Q  488 acaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtg 586  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16544476 atgagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtg 16544379  T
Q  587 tttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16544378 tttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 16544312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 16546996 - 16546534
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||| || |||||||||||    
T  16546996 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtgataaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacac 16546897  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcacaagataaacaaag-agagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagatt 389  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  16546896 cacctaaatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagatt 16546799  T
Q  390 gttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggtt 487  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  16546798 ggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggtt 16546699  T
Q  488 acaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtg 586  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16546698 acaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcctaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtg 16546601  T
Q  587 tttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16546600 tttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 16546534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 202 - 644
Target Start/End: Original strand, 9789042 - 9789480
Alignment:
Q  202 aaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccacctagg 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  9789042 aaccacaccaatacaaagta-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaa-caaagtgt--gtgcaagcaaaaatcaacaaaacagcacctaga 9789137  T
Q  302 tctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagt 400  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9789138 tctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaatacacaagcacaagataaacg--gagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagt 9789235  T
Q  401 tcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac-aaagggatacaaaag-gttacaagaaatta 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9789236 tcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaatta 9789334  T
Q  499 g-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtt 597  Q
    |  ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||    
T  9789335 gatttgacaagttcacaaggaac-aaccttaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttcccatgtt 9789433  T
Q  598 t-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    |  | ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9789434 tcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtt 9789480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 202 - 644
Target Start/End: Original strand, 18441462 - 18441904
Alignment:
Q  202 aaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccacctagg 301  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  18441462 aaccacaccaatacaaagtaa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaa-caaagtgt--gtgcaagcaataatcaacaaaacagcacctaga 18441557  T
Q  302 tctaatctaggaaacaagtgtgaaa----cacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacc 396  Q
    |||||||||||||| |||||  |||    |||||  ||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18441558 tctaatctaggaaagaagtgaaaaaaaaacacaatacacaagcacaagataaacg--gagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacc 18441655  T
Q  397 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac-aaagggatacaaaag-gttacaagaa 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  18441656 cagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaa 18441754  T
Q  495 attag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 593  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||    
T  18441755 attagatttgacaagttcacaaggaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttccca 18441853  T
Q  594 tgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    |||||  | ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18441854 tgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtt 18441904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 205 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 16409824 - 16409387
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtc 303  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||   |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  16409824 cacaccaatacaaagta-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgg--gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatc 16409729  T
Q  304 taatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagtt 401  Q
    ||||||||||||||| |||  || || ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16409728 taatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagtt 16409631  T
Q  402 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac-aaagggatacaaaag-gttacaagaaattag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16409630 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattag 16409532  T
Q  500 -cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 598  Q
      ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||    
T  16409531 atttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgttt 16409433  T
Q  599 -tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
      | ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16409432 cccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtt 16409387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 202 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 26178234 - 26177795
Alignment:
Q  202 aaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctag 300  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||  | |||| |||||||    
T  26178234 aaccacaccaatacgaagtaa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgt--gtgcaagcaataatcaatgataacaacacctag 26178139  T
Q  301 gtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcaccca 398  Q
     ||||||||||||| ||| |||  || || ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26178138 atctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcaccca 26178041  T
Q  399 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac-aaagggatacaaaag-gttacaagaaat 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26178040 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaat 26177942  T
Q  497 tag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 595  Q
    |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| |||||    
T  26177941 tagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatg 26177844  T
Q  596 ttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    |||  | ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26177843 tttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtt 26177795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 202 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 26171114 - 26170686
Alignment:
Q  202 aaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctag 300  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| || ||||||||  |||||||||| |||| |  | |||| |||||||    
T  26171114 aaccacaccaatacgaagtaa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaagcactaa-caaagtgt--gtgcaagcaataatcgatgataacaacacctag 26171019  T
Q  301 gtctaatctaggaaacaag-tgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcaccca 398  Q
     ||||||||||||| |||  ||  || || ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26171018 atctaatctaggaatcaaaatgaaaagcataaaacacaagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcaccca 26170921  T
Q  399 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaaggttacaagaaatta 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||         |||  ||||||||||||||    
T  26170920 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttaca---------aaagagttacaagaaatta 26170831  T
Q  499 g-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtt 597  Q
    |  ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| |||||||    
T  26170830 gatttgacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtt 26170733  T
Q  598 t-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    |  | ||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||||    
T  26170732 tcccaacccaagagaagctgtaatcaaag-actctaaaccctagagtt 26170686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 369 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 25412947 - 25412672
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25412947 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 25412850  T
Q  469 caaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagac 559  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  25412849 caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagac 25412751  T
Q  560 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 639  Q
    ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25412750 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 25412672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 205 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 30182933 - 30182492
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtc 303  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||  || |||||||  ||  ||| ||| ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  30182933 cacaccaaaacaaacta-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatg--caaacaataatcaacaataacaacacctagatc 30182838  T
Q  304 taatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttc 402  Q
    ||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||   || ||| |||||   ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  30182837 taatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacacaagcacaagataaa---ag-gagagaagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcatccagttc 30182743  T
Q  403 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc- 500  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||     
T  30182742 ggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttccaaagagatagaaaagggttacaagaaattagct 30182644  T
Q  501 ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 592  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| |     
T  30182643 ttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttgca 30182545  T
Q  593 atgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  30182544 atgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaatccctaaagttgc 30182492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 222 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 13343389 - 13342964
Alignment:
Q  222 atgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-g 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||  || |||||||  ||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  13343389 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaag 13343293  T
Q  320 tgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 419  Q
    ||  || |||||| ||||| || || |||||   || ||| |||||   ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13343292 tgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaa---ag-gagagaagagagaaacaaacacatcaa-agattgttcacccagttcggtccaaacatgaccta 13343198  T
Q  420 ctctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatg 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  13343197 ctctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-caaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaag 13343100  T
Q  518 aacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaa 607  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | ||||||    
T  13343099 aac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 13343001  T
Q  608 gagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  13343000 gaga-actctaatcagag-accctaaaccctaaagttgc 13342964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 202 - 646
Target Start/End: Original strand, 36073863 - 36074309
Alignment:
Q  202 aaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctag 300  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||  ||||||  || |||||||  ||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  36073863 aaccacaccaatacaaacta-tgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacagcacctag 36073958  T
Q  301 gtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccag 399  Q
     ||||||||||||| ||| |||  || |||||| ||||| || || |||||   || ||| |||||   ||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  36073959 atctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatcacaagcaaaacataaa---ag-gagagaagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcatccag 36074053  T
Q  400 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaatta 498  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36074054 ttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaatta 36074151  T
Q  499 gc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc----ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtg 586  Q
    || ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||    
T  36074152 gctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtg 36074250  T
Q  587 tttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36074251 tttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgc 36074309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 369 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 37439328 - 37439161
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37439328 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 37439231  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 537  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37439230 caaagagatacaaaagagttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 37439161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 13239938 - 13239751
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13239938 aaacaaacacaccaaaa-attgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 13239841  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  13239840 caaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaa 13239751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 213633 - 213465
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  213633 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 213535  T
Q  488 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  213534 acaagaaattagctttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 213465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 352 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 32637027 - 32636824
Alignment:
Q  352 aaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccac 451  Q
    |||| |||||||||   ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||    
T  32637027 aaagggagggaagagagaaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac 32636930  T
Q  452 tatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaat 548  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  32636929 tatcaaa-gagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaat 32636832  T
Q  549 ctcaccaa 556  Q
    ||||||||    
T  32636831 ctcaccaa 32636824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 377 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 28278494 - 28278316
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaaggga 476  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  28278494 acaccaaga-attgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttacaaagaga 28278398  T
Q  477 tacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28278397 tacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28278316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 40147428 - 40147261
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  40147428 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 40147331  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40147330 acaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40147261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Original strand, 42428427 - 42428598
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||      
T  42428427 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatg 42428524  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42428525 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 42428598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 33831866 - 33831683
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33831866 aaacaaaaacaccaa-agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctta 33831770  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33831769 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcac 33831683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 13488374 - 13488203
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||      
T  13488374 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatg 13488277  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13488276 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 13488203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 5058212 - 5058047
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || |    
T  5058212 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggat 5058115  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||| ||||||  ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5058114 acaagaaaatagcttcaacaagctcaca--gaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5058047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 372 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 533952 - 533769
Alignment:
Q  372 caaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaa 471  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  533952 caaagacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatcaa-tgagttcttacaa 533856  T
Q  472 agggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    || ||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  533855 agagatacaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaag-accaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 533769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 366 - 553
Target Start/End: Original strand, 8565926 - 8566111
Alignment:
Q  366 agaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc 465  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  8565926 agaaaacaaacacaccaaga--ttgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc 8566021  T
Q  466 ttacaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  8566022 ttacagagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaagttctacccattttctcaatctcac 8566111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 391 - 556
Target Start/End: Original strand, 27637615 - 27637781
Alignment:
Q  391 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa--ggtta 488  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  27637615 ttcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtta 27637712  T
Q  489 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27637713 caagaaattagtttaaacaagctcataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 27637781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 369 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 16452266 - 16452003
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  16452266 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactat-gaatgagttctta 16452170  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc-------accaaga 558  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||       | |||||    
T  16452169 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaa-cttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaaga 16452071  T
Q  559 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc-tacccaagagatactctaatcaaaga 626  Q
    |||||||||||| || |||  |||||||||| | |||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  16452070 cactcaatgattgtcacttaccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagaga-actctaatcaaaga 16452003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 31183157 - 31182976
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |  |||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  31183157 aaacaaacacaccaa-agaatgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaa-tgagttctta 31183061  T
Q  469 caaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 553  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||  |||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31183060 caaagggatacaaatggttacaagaaattaacttaaacaaactcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttccaatctcac 31182976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 370 - 639
Target Start/End: Original strand, 30682906 - 30683178
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgag--ttctt 467  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||  |||||    
T  30682906 aacaaacacaccaa-agattgttgacc-agttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtattctt 30683001  T
Q  468 acaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caag 557  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||    
T  30683002 acaaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaag----aaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaag 30683097  T
Q  558 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 639  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30683098 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcgcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 30683178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Original strand, 39468546 - 39468714
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||      
T  39468546 agattgttgacccagttcagtccaat-ttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaa-tgagttcttacaaagagatacaaatg 39468643  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39468644 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 39468714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 13695672 - 13695859
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt- 467  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| |   ||||  |||||||||| || |||||||||     
T  13695672 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacctagtttggtccaag-ttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaa-tgagttcttt 13695768  T
Q  468 acaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13695769 acaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttgtacccttttcccaatctctccaa 13695859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Original strand, 42426232 - 42426403
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||      
T  42426232 agattgttgacctagttcagtccaa-cttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatg 42426329  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  42426330 ggttgcaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 42426403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Original strand, 28750638 - 28750823
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28750638 aacaaacacaccaa-agattattgacccaattcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 28750734  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||  ||||||||  ||||||| ||||||| |||  |||| |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28750735 aaaaagatacaaatgggttacaggaaattaacttcaacaatttcataaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 28750823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 538196 - 538028
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||      
T  538196 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaa-tgagttcttacaaagagatacaaatg 538099  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  538098 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagagc-aaccttaatttctacccattttcccaatctcac 538028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 27015690 - 27015531
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaaggtta 488  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |     
T  27015690 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggt- 27015594  T
Q  489 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
          ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27015593 ------attagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 27015531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 389 - 542
Target Start/End: Original strand, 16640941 - 16641091
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16640941 tgtttacccagttcggcccta-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca----agttcttacaaagagatacaaaagagtt 16641035  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 542  Q
    |  |||||| |||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16641036 atcagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctaccatttt 16641091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 400 - 553
Target Start/End: Original strand, 9049354 - 9049506
Alignment:
Q  400 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa-ggttacaagaaatta 498  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||  |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9049354 ttcggtccaa-cttcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtcaa-tgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaagaaatta 9049451  T
Q  499 gctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 553  Q
    ||||  ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  9049452 gcttcaacaagctcacaa-aaacaaacactaatttctatcattttcccaaactcac 9049506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 385 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 38747176 - 38747009
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag 484  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||  |||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||| |    
T  38747176 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctgatctgagggagagattgatctctccaatcctctatcaa-tgagtttttccaaagagatacaaatg 38747079  T
Q  485 g-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 552  Q
    | |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38747078 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 38747009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Original strand, 3075640 - 3075823
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  |||| |||| ||||||| || || ||||||    
T  3075640 aaacaaacacaccaagaaat-gttcacccaatttggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatc-aacgaattctta 3075736  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac 553  Q
    ||||  ||||||||  |||||||||||||||| || | |||| |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  3075737 caaaaagatacaaatgggttacaagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctattttctcaatctcac 3075823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 316933 - 316769
Alignment:
Q  387 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttacaaagggatacaaaagg 485  Q
    |||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  | || | ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  316933 attgtttaccaagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatc-aatgagttctttacaaagagatacaaaagg 316835  T
Q  486 -ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatct 550  Q
     |||||||||||||||||  ||||| || | | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  316834 attacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaa-cctaatttctacctttttctcaatct 316769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 385 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 19806534 - 19806463
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaa 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  19806534 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 19806463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 502
Target Start/End: Original strand, 42309932 - 42310048
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag 484  Q
    |||||||| | ||| ||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||  |||   ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  42309932 agattgtttatccaattcggtc-aaacttaatctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatcaa-taagttcttacaaagagatacaaaag 42310029  T
Q  485 -gttacaagaaattagctt 502  Q
     ||||||||||||||||||    
T  42310030 agttacaagaaattagctt 42310048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 502
Target Start/End: Original strand, 33906028 - 33906144
Alignment:
Q  387 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttacaaagggatacaaaagg 485  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| | | ||||||||  || | ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33906028 attgtttacccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatc-aatgagttctttacaaagagatacaaaagg 33906126  T
Q  486 -ttacaagaaattagctt 502  Q
     ||||||||| |||||||    
T  33906127 attacaagaagttagctt 33906144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 42927077 - 42926967
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42927077 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacccagttcggtccaa-cttgacctactatgagagagagatttatttcttcaatccactgtcaa-tgagttctta 42926981  T
Q  469 caaagggatacaaa 482  Q
    ||||| ||||||||    
T  42926980 caaagagatacaaa 42926967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 394 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 4160762 - 4160702
Alignment:
Q  394 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactat 454  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  4160762 acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 455 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 42926970 - 42926922
Alignment:
Q  455 caaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42926970 caaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 42926922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 502
Target Start/End: Original strand, 10054871 - 10054929
Alignment:
Q  444 caatccactatcaaatgagttc-ttacaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 502  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10054871 caatacactatcaa-tgagttcattacaaagagatacaaaaggttataagaaattagctt 10054929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 38882384 - 38882340
Alignment:
Q  388 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 433  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38882384 ttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 38882340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 369 - 409
Target Start/End: Original strand, 15464517 - 15464557
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaa 409  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15464517 aaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa 15464557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 389 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18596924 - 18596881
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 433  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18596924 tgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 18596881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 196 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 45283346 - 45282893
Alignment:
Q  196 agatcgaaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacacca 295  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45283346 agatcgaaccacaccaatacaaag-aatgatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaataatcaacaaaacacca 45283248  T
Q  296 cctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcac 395  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  45283247 cctagatctaatctaggaaactagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcac 45283148  T
Q  396 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac----aaagggatacaaaaggttacaa 491  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  45283147 tcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaaaggttacaa 45283048  T
Q  492 gaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 591  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45283047 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttgcaaggtgtttcc 45282948  T
Q  592 catgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282947 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 45282893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 196 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 54635484 - 54635035
Alignment:
Q  196 agatcgaaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacacca 295  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54635484 agatcgagtcacaccaatactaaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacacca 54635385  T
Q  296 cctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttca 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  54635384 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 54635287  T
Q  395 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa-gggatacaaaaggttacaaga 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54635286 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 54635188  T
Q  494 aattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635187 aattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 54635088  T
Q  594 tgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635087 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 54635035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 3617813 - 3617352
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  3617813 gatcgaaccacaccaatacaaataagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 3617714  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  3617713 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 3617616  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaa-gggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  3617615 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 3617516  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617515 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 3617416  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3617415 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 3617352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 25637793 - 25637331
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||    
T  25637793 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagtgtattgtgcaagcaggaaacaacaaaacac 25637694  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca--caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattg 390  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  25637693 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattg 25637594  T
Q  391 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaa-gggatacaaaaggtta 488  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  25637593 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggtta 25637494  T
Q  489 caagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25637493 caagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtt 25637396  T
Q  589 tcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25637395 tcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagatacccctttg 25637331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 172 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 6716881 - 6716412
Alignment:
Q  172 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtg 271  Q
    ||||||||||||||||| || |   ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6716881 tgttgtgaattccgatcaccta---gatcgaaccacaccaatgcaaag-agtgatgtgtggagcaacggaaagcggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtg 6716786  T
Q  272 caagcaacaatcaac-aaaacaccacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaa 369  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  6716785 caagcaataatcaaccaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaactcaaaaatacaatcacaagataaa--aggggagggaagaagaa 6716688  T
Q  370 aacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6716687 aacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctta 6716589  T
Q  469 caaa-gggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatg 567  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716588 caaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatg 6716489  T
Q  568 attctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716488 attctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 6716412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 197 - 642
Target Start/End: Original strand, 4600549 - 4600998
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| | || |||||||||||    
T  4600549 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagccagaaacaacaaaacac 4600648  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgtt 392  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |    
T  4600649 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca-aatcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggt 4600747  T
Q  393 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggttaca 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  4600748 cacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaaaggttaca 4600847  T
Q  491 agaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4600848 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 4600945  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 642  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600946 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 4600998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 197 - 642
Target Start/End: Original strand, 4598328 - 4598777
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| || ||| |||||||    
T  4598328 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaataaaacac 4598427  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||     
T  4598428 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgg 4598525  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||    
T  4598526 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 4598625  T
Q  490 aagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 588  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  4598626 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacagggtgtt 4598723  T
Q  589 tcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 642  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598724 tcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 4598777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 197 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 10211758 - 10211309
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||||| || |||||||||||    
T  10211758 gatcgaaccacaccaatacagagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaatcaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacac 10211659  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||     
T  10211658 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagatgaaaacaataaacacaaagagattgg 10211561  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||    
T  10211560 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 10211461  T
Q  490 aagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 588  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10211460 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtt 10211363  T
Q  589 tcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 642  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211362 tcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 10211309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 197 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 10209538 - 10209089
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||||| || |||||||||||    
T  10209538 gatcgaaccacaccaatacagagaataatgatgtgtggagtgacggagagtggtaaccaccaatcaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacac 10209439  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||     
T  10209438 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagatgaaaacaataaacacaaagagattgg 10209341  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaggga-tacaaaaggttac 489  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  10209340 tcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggactacaagaggttac 10209241  T
Q  490 aagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 588  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10209240 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtt 10209143  T
Q  589 tcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 642  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209142 tcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 10209089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 10056582 - 10056122
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||| || ||||||| |||    
T  10056582 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cac 10056484  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattg 390  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  10056483 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 10056386  T
Q  391 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggtta 488  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  10056385 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtta 10056286  T
Q  489 caagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 587  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10056285 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgt 10056188  T
Q  588 ttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  10056187 ttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10056122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 10058804 - 10058344
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||| || ||||||| |||    
T  10058804 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cac 10058706  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattg 390  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  10058705 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 10058608  T
Q  391 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggtta 488  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  10058607 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtta 10058508  T
Q  489 caagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 587  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10058507 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgt 10058410  T
Q  588 ttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  10058409 ttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10058344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 10061026 - 10060566
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||| || ||||||| |||    
T  10061026 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cac 10060928  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattg 390  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  10060927 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 10060830  T
Q  391 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggtta 488  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  10060829 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtta 10060730  T
Q  489 caagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 587  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10060729 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgt 10060632  T
Q  588 ttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  10060631 ttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10060566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 10063248 - 10062788
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||| || ||||||| |||    
T  10063248 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cac 10063150  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattg 390  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  10063149 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 10063052  T
Q  391 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggtta 488  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  10063051 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtta 10062952  T
Q  489 caagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 587  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10062951 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgt 10062854  T
Q  588 ttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  10062853 ttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10062788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 10065470 - 10065010
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||| || ||||||| |||    
T  10065470 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cac 10065372  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattg 390  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  10065371 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 10065274  T
Q  391 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggtta 488  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  10065273 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtta 10065174  T
Q  489 caagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 587  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10065173 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgt 10065076  T
Q  588 ttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  10065075 ttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10065010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 202 - 593
Target Start/End: Original strand, 7779821 - 7780208
Alignment:
Q  202 aaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaa-caccacctag 300  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  7779821 aaccacaccaatacgaagtaa-gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaa-caaagtgt--gtgcaagcaataatcaacaaaaacagcacctag 7779916  T
Q  301 gtctaatctaggaaacaagtgtgaaa-cacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccag 399  Q
     ||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  7779917 atctaatctaggaaacaagtgaaaaaacacaatacacaagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccac 7780014  T
Q  400 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac-aaagggatacaaaaggttacaagaaatta 498  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7780015 tttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaggttacaagaaatta 7780113  T
Q  499 g-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 593  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  7780114 gatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcacgaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttccca 7780208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 205 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 801435 - 801003
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac--cacctaggt 302  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||  |||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |    
T  801435 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaat-aaagtgt--gtgcaagcaataatcaacaaaaaacagcacctagat 801340  T
Q  303 ctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaat-cacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagtt 401  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||     |||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  801339 ctaatctaggaaacaagtg-gaaaaaca-----caatacacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagtt 801248  T
Q  402 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac-aaagggatacaaaa--ggttacaagaaatta 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||    
T  801247 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaatta 801149  T
Q  499 g-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtt 597  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  801148 gatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtt 801050  T
Q  598 t-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    |  | ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  801049 tcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtt 801003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 202 - 646
Target Start/End: Original strand, 23199957 - 23200402
Alignment:
Q  202 aaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccacctagg 301  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||| ||| |||||||  || |||||||   |||||||||| ||||||||| | | |||||||     
T  23199957 aaccacaccaatacaaagta-tgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtga--gtgcaagcaataatcaacaataaaacacctaga 23200052  T
Q  302 tctaatctaggaaacaag-tgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagt 400  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23200053 tctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaaccacaagcataagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagt 23200149  T
Q  401 tcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattag 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23200150 tcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaattag 23200248  T
Q  500 c-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 591  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||      ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| |    
T  23200249 ctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttac 23200347  T
Q  592 catgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23200348 aatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgc 23200402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 271 - 646
Target Start/End: Original strand, 23197823 - 23198203
Alignment:
Q  271 gcaagcaacaatcaacaaaacaccacctaggtctaatctaggaaacaag-tgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaa 369  Q
    |||||||| ||||||||| | | ||| ||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||| ||||| |||    
T  23197823 gcaagcaataatcaacaataaaacacatagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaaccacaagcacaagataaa--aggagagagaagaggaa 23197920  T
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  23197921 aacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttcttac 23198018  T
Q  470 aaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac------caagaca 560  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||      |||||||    
T  23198019 aaaaagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaaaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagaca 23198117  T
Q  561 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    |||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23198118 ctcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgc 23198203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 455 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 10067431 - 10067232
Alignment:
Q  455 caaatgagttctt-acaaaggga-tacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 551  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10067431 caaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 10067332  T
Q  552 accaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  10067331 accaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctt 10067234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 369 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 45095350 - 45095062
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  45095350 aaacaaatacgccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 45095253  T
Q  469 caaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagac 559  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||    
T  45095252 caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 45095154  T
Q  560 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgccccttt 652  Q
    ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45095153 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcttt 45095062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 272 - 644
Target Start/End: Original strand, 9636010 - 9636390
Alignment:
Q  272 caagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaa 369  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || || ||| ||||| |||||||||||   || ||| | |||   |    
T  9636010 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaatcacaagcacaagataaa---agggagagcagagaga 9636106  T
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9636107 aacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttac 9636205  T
Q  470 aaagggatacaaaa-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctc-------accaaga 558  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||       |||||||    
T  9636206 aaaaagatacaaaagggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaaga 9636304  T
Q  559 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | || |||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9636305 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaaccctaaagtt 9636390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 205 - 644
Target Start/End: Original strand, 5257967 - 5258407
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtc 303  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||  || |||||||  ||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  5257967 cacaccaatacgaacta-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 5258062  T
Q  304 taatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttc 402  Q
    ||||||||||| ||| |||  || |||||| ||||| || || |||||   || ||| |||||   ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  5258063 taatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaa---ag-gagagaagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcaccaagttc 5258157  T
Q  403 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc- 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  5258158 ggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagct 5258256  T
Q  501 ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 591  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| |    
T  5258257 ttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttac 5258355  T
Q  592 catgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5258356 aatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagtt 5258407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 522 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 6718718 - 6718596
Alignment:
Q  522 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatc 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6718718 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 6718619  T
Q  622 aaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6718618 aaagaaccctaaaccctagagtt 6718596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 37408645 - 37408458
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37408645 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctta 37408548  T
Q  469 caaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37408547 caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 37408458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 222 - 647
Target Start/End: Original strand, 5260162 - 5260589
Alignment:
Q  222 atgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-g 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||  || |||||||   |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||| ||| |    
T  5260162 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtga--gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcaaag 5260258  T
Q  320 tgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 419  Q
    ||  || |||||| ||||| || || |||||   || ||| |||||   ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5260259 tgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaa---ag-gagagaagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcaccaagttcggtccaaacttgaccta 5260353  T
Q  420 ctctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatg 517  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5260354 ctttggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaag 5260452  T
Q  518 aacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaa 607  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||       ||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | ||||||    
T  5260453 aac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 5260551  T
Q  608 gagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcc 647  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5260552 gaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcc 5260589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10067669 - 10067435
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||| || ||||||| |||    
T  10067669 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cac 10067571  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcac--aatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattg 390  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  10067570 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 10067473  T
Q  391 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 428  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067472 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 10067435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 272 - 553
Target Start/End: Original strand, 19683774 - 19684054
Alignment:
Q  272 caagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaa-acaagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaagagagggaagaaga 368  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||||| | |||| || ||||||||   || ||| |||||       
T  19683774 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaataaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa---ag-gagagaagagag 19683869  T
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19683870 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 19683967  T
Q  469 caaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19683968 caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 19684054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 7762437 - 7762265
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7762437 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaaag 7762339  T
Q  485 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7762338 agttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 7762265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 369 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 7764651 - 7764476
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  7764651 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatc-aatgagttctta 7764554  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttccc 545  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7764553 caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttccc 7764476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 34491397 - 34491212
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  34491397 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 34491301  T
Q  470 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34491300 aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34491212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 385 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 9581454 - 9581290
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  9581454 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagggatacaaatg 9581356  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatc 549  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  9581355 ggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttccgaatc 9581290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 377 - 556
Target Start/End: Original strand, 49199457 - 49199638
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaaggga 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  49199457 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagaga 49199555  T
Q  477 tacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49199556 tacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 49199638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 29196368 - 29196555
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29196368 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctta 29196464  T
Q  469 caaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29196465 caaagagatacaaatgggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29196555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 377 - 556
Target Start/End: Original strand, 43401789 - 43401970
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaaggga 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  43401789 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagaga 43401887  T
Q  477 tacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43401888 taaaaaatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43401970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 4570120 - 4569952
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  4570120 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 4570022  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4570021 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Original strand, 39153358 - 39153526
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag 484  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  39153358 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttcttataaagggatacaaatg 39153455  T
Q  485 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39153456 agttacaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 39153526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 377 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 30236304 - 30236129
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaaggga 476  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  30236304 acaccaagaaattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagaga 30236207  T
Q  477 tacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 552  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30236206 tacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 30236129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 370 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 40735568 - 40735288
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  40735568 aacaaatacaccaa-agattgctgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 40735472  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagac 559  Q
    |||| ||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||    
T  40735471 aaagagatacaaactggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagac 40735373  T
Q  560 actcaatgattctctc-tttacaaggtgtttcccatgttttct-acccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    ||||||||||| || | ||| |||||||||| | |||||| || |||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  40735372 actcaatgattttcacttttccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 40735288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 40734669 - 40734498
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag 484  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  40734669 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaagggatacaaatg 40734572  T
Q  485 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40734571 tgttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40734498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 44331716 - 44331545
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag 484  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  44331716 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttcttacaaagagatacaaatg 44331619  T
Q  485 g-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    | |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44331618 gcttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaa 44331545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 41819523 - 41819691
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa--ggt 486  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  41819523 tgttcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat--aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggt 41819620  T
Q  487 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41819621 tacaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41819691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 381 - 556
Target Start/End: Original strand, 43403736 - 43403913
Alignment:
Q  381 caagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggataca 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  43403736 caagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagataaa 43403834  T
Q  481 aaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    | |   |||||||||||| |||||  ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43403835 acatgagttacaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaac-aagcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43403913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 761033 - 760850
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  761033 aaacaaacacaccaa-agattgttaacccatttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 760937  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  760936 caaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaga-cctaatttctacccattttcccaatctcac 760850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 6095600 - 6095767
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  6095600 tgttcacacagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 6095697  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||| |||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6095698 acaagaaattaacttcaagaagtttacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 6095767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 396 - 553
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835167
Alignment:
Q  396 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggttacaagaa 494  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22835010 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaa 22835107  T
Q  495 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22835108 attagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 22835167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 369 - 644
Target Start/End: Original strand, 32744418 - 32744689
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32744418 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaa-gagttctta 32744514  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaa 565  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||| ||| | ||||||    
T  32744515 caaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa--ctaatttctacccattttttcaatctca-caaaatactcaa 32744611  T
Q  566 tgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    ||||| || ||   ||| |||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  32744612 tgattttcactcaccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 32744689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Original strand, 44700476 - 44700646
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  44700476 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatgtgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaagagatacaaata 44700572  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44700573 ggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44700646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 54593871 - 54593704
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  54593871 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 54593774  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  54593773 acaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaa 54593704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Original strand, 5236440 - 5236624
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  ||||  |||||| |||||| |||||||||||    
T  5236440 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagtttggtccaaa-ttgacctaatctgg-ggaaagattgatctctcgaatccattatcaa-tgagttcttac 5236535  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5236536 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5236624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 369 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 31314631 - 31314447
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31314631 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 31314535  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 554  Q
    ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31314534 caaaaagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagatcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacc 31314447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 29682530 - 29682362
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  29682530 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaagggatacaaatg 29682433  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  29682432 ggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cataatttctacccattttcccaatctcac 29682362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 29813234 - 29813063
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||      
T  29813234 agattgttgacccagttcggtcc-aacatgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaagagatgcaaatg 29813137  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  29813136 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctatttttccaatctcaccaa 29813063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 46860642 - 46860474
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||  ||||    
T  46860642 tgttcatccaattcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatc-aatgagttattacaaagagatacaaatgggtt 46860544  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  46860543 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 46860474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 51398999 - 51398818
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  51398999 aacaaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaa-tgagttcttac 51398903  T
Q  470 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 552  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  51398902 aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcactaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctca 51398818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 16499215 - 16499033
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16499215 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 16499119  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 553  Q
    ||||| |||| |||  ||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16499118 caaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaa--aaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcac 16499033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 377 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 40913472 - 40913352
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaaggga 476  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  40913472 acaccaagagattgttgacccagttcggtcc-aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-gatgagttcttacaaagaga 40913375  T
Q  477 tacaaaag-gttacaagaaatta 498  Q
    |||||| | ||||||||||||||    
T  40913374 tacaaatgagttacaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 377 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 46173536 - 46173377
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaaggga 476  Q
    ||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  46173536 acaccaagaaattgttgatctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaagaga 46173439  T
Q  477 tacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 537  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  46173438 tacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 46173377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 29811053 - 29810868
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  29811053 aacaaacacaccaa-agattgttgacccaattcggtttaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 29810957  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||| |||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  29810956 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacatattttcctaatctcaccaa 29810868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 556
Target Start/End: Original strand, 53921511 - 53921671
Alignment:
Q  396 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaa 494  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||    
T  53921511 ccagttcggtc-aaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaatgatacaaatgagttacaagaa 53921608  T
Q  495 attagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||| || ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  53921609 attagctttaacaagctcacaaacaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 53921671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 23391891 - 23392077
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  23391891 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaa-gagttcttg 23391987  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23391988 caaagtgatacaaatgggttacaagaaattatcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctactcattttcccaaactcaccaa 23392077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 396 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 32891264 - 32891105
Alignment:
Q  396 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaa 494  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||   |||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  32891264 ccagttcggtccaa-catgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatc-aacgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaa 32891167  T
Q  495 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 554  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32891166 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcacc 32891105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Original strand, 9666448 - 9666632
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  9666448 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtcc-aactttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaa-gaattctta 9666544  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    ||||| | || ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9666545 caaagaggtataaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttttccaatctcac 9666632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 389 - 496
Target Start/End: Original strand, 55301972 - 55302079
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  55301972 tgttcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaagagatacaaataggtt 55302070  T
Q  488 acaagaaat 496  Q
    |||||||||    
T  55302071 acaagaaat 55302079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 47304430 - 47304254
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaaggga 476  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  47304430 acaccaataaattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacgaagaga 47304333  T
Q  477 taca-aaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    |||| |  |||||||||| |||| |||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  47304332 tacagatgggttacaagatattaacttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttctcaatctcac 47304254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 551
Target Start/End: Original strand, 4055745 - 4055926
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac-tctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagtt-ct 466  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4055745 aaacaaatacaccaagatttggtt-acccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagaga--gatctcttcaatccactatcaa-tgagtttct 4055840  T
Q  467 tacaaagggatacaaaag--gttacaagaaattagcttg-acaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 551  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||||| | | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4055841 tacaaagagatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttctccaagaacaa--cctaatttctacccatttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 428 - 556
Target Start/End: Original strand, 51352150 - 51352278
Alignment:
Q  428 gagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccc 526  Q
    |||||||||  ||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||    
T  51352150 gagagattgatctctcaaatccactctcaa-tgagttattacaaagaaatacaaatggttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaaccc 51352248  T
Q  527 taatttctacccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||| ||||| | |||||| |||||||||||    
T  51352249 taacttctatcattttcctaatctcaccaa 51352278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 422 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 36018987 - 36018852
Alignment:
Q  422 ctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatga 518  Q
    |||| ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||    
T  36018987 ctgggggagagattgacctctccaatccactat--aatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaaga 36018890  T
Q  519 acaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  36018889 ac-aaccctaatttcaacccattttcccaatttcaccaa 36018852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 556
Target Start/End: Original strand, 5433952 - 5434046
Alignment:
Q  466 ttacaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  5433952 ttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaa 5434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 547
Target Start/End: Original strand, 23410311 - 23410487
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  23410311 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccaattcgttccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctccaatccattatctaa-gagttctta 23410407  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaa 547  Q
    ||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||  ||||| |||||| ||| ||| | |||||||||||| ||| ||||    
T  23410408 caaagtgatacaaatgggttatacgaaattagcttaaacaagctcacaaagaataaa-cataatttctacccattttccaa 23410487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 556
Target Start/End: Original strand, 31340266 - 31340369
Alignment:
Q  455 caaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctc 551  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||    
T  31340266 caaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aacctcaatttctaccaattttcccaatctc 31340364  T
Q  552 accaa 556  Q
    |||||    
T  31340365 accaa 31340369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 456
Target Start/End: Original strand, 27305719 - 27305777
Alignment:
Q  397 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatca 456  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  27305719 cagttcggtccaaa-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 457 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 5373335 - 5373247
Alignment:
Q  457 aatgagttc-ttacaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 542  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| | |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5373335 aatgagttccttacaaagagatataaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcaaaaagaacaaagcctaatttctaccctttt 5373247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 485 - 544
Target Start/End: Original strand, 28253363 - 28253423
Alignment:
Q  485 gttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcc 544  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28253363 gttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacgaaccctaatttctaccattttcc 28253423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 430 - 551
Target Start/End: Original strand, 35138746 - 35138868
Alignment:
Q  430 gagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccc 526  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||  |||| | ||||||| |     
T  35138746 gagattgttctcttccatccactatc-aatgagttctttacaaagagatacaaaagagttgcaagaaattaacttcaacaaactcaccaagaacaaa-ca 35138843  T
Q  527 taatttctacccttttcccaatctc 551  Q
    |||||||||||| |||| |||||||    
T  35138844 taatttctacccatttctcaatctc 35138868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 536
Target Start/End: Original strand, 25517069 - 25517121
Alignment:
Q  483 aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 536  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25517069 aggttataagaaattagcttaa-aagctcacaaagaacaaaccctaatttctac 25517121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 389 - 457
Target Start/End: Original strand, 2075076 - 2075143
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaa 457  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  2075076 tgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaa 2075143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 4386926 - 4386875
Alignment:
Q  484 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 536  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4386926 ggttacaagaaattagcttaa-aagctcacaaagaacaaaacctaatttctac 4386875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 194 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 25690316 - 25689869
Alignment:
Q  194 caagatcgaaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25690316 caagatcgaaccacaccaatacaaag-aatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaagaatcaacaaaacac 25690218  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaa-gagattgt 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  25690217 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacacactcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattgt 25690120  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa-gggatacaaaaggttaca 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25690119 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttaca 25690021  T
Q  491 agaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690020 agaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 25689921  T
Q  591 ccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 642  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689920 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 25689869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 172 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 3439886 - 3439416
Alignment:
Q  172 tgttgtgaattccgatcccccacaagatcgaaccacaccaatac-aaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgt 270  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  3439886 tgttgtgaattccgatcaccacttagatcgaaccacaccaatactaaaaaaatgatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaacaaagtgt--gt 3439789  T
Q  271 gcaagcaacaatcaacaaaacaccacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaa 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  3439788 gcaagcaacaatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaa 3439691  T
Q  371 acaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3439690 acaaaagcaccaaagagattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttac 3439592  T
Q  470 aaa-gggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga 568  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439591 aaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgccaagttcataatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga 3439492  T
Q  569 ttctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439491 ttttctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 3439416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 197 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 15290887 - 15290438
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||| || |||||| ||||    
T  15290887 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaatacac 15290788  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||     
T  15290787 cacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgg 15290690  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggttac 489  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||    
T  15290689 acacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 15290590  T
Q  490 aagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 588  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15290589 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtt 15290492  T
Q  589 tcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 642  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290491 tcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 15290438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 197 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 15471256 - 15470807
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||| || |||||| ||||    
T  15471256 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaatacac 15471157  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||     
T  15471156 cacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgg 15471059  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggttac 489  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||    
T  15471058 acacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 15470959  T
Q  490 aagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 588  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15470958 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtt 15470861  T
Q  589 tcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 642  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470860 tcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 15470807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 197 - 642
Target Start/End: Original strand, 42575130 - 42575578
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| || |||||||||||    
T  42575130 gatcgaaccacaccaatacaaactataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacac 42575229  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca--caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattg 390  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  42575230 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaaccaaacacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 42575325  T
Q  391 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggtta 488  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  42575326 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtta 42575425  T
Q  489 caagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 587  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42575426 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgt 42575523  T
Q  588 ttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 642  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575524 ttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 42575578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 202 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 2628087 - 2627647
Alignment:
Q  202 aaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaa-tcaacaa-aacaccaccta 299  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||   |||||||||| || ||||||| |||| ||||||    
T  2628087 aaccacaccaatacaaagtaa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgg--gtgcaagcaaaaaatcaacaataacaacaccta 2627992  T
Q  300 ggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccag 399  Q
    | ||||||||||||||||||||  || || ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2627991 gatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattattcacccag 2627894  T
Q  400 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttaca-aagggatacaaaa--ggttacaagaaat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||   ||| ||||||||    
T  2627893 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacacaagagatacaaaaagagttgcaagaaat 2627795  T
Q  497 tag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 595  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  2627794 tagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatg 2627696  T
Q  596 ttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    |||  | ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2627695 tttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtt 2627647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 270 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 31218541 - 31218160
Alignment:
Q  270 tgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaag 367  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||| || || |||||||||||   || ||| |||||      
T  31218541 tgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacataagcacaagataaa---ag-gagagaagaga 31218446  T
Q  368 aaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt 467  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  31218445 gaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatc-aatgagttctt 31218348  T
Q  468 acaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caa 556  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||       |||    
T  31218347 ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaa 31218249  T
Q  557 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31218248 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgc 31218160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 272 - 647
Target Start/End: Original strand, 34254217 - 34254594
Alignment:
Q  272 caagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaa 369  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |  || |||||| ||||| || ||||||||   || ||| |||||   |    
T  34254217 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaa---ag-gagagaagagaga 34254312  T
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  34254313 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttcttac 34254410  T
Q  470 aaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagaca 560  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  34254411 aaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagaca 34254509  T
Q  561 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcc 647  Q
    |||||||||| || ||   |||||||||| | |||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34254510 ctcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtctccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcc 34254594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 272 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 17982935 - 17982556
Alignment:
Q  272 caagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaa 369  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || |||||| ||||| || || |||||   || ||| |||||   |    
T  17982935 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaa---ag-gagagaagagaga 17982840  T
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  17982839 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttcc 17982742  T
Q  470 aaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caaga 558  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||    
T  17982741 aaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaaga 17982643  T
Q  559 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17982642 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgc 17982556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 272 - 647
Target Start/End: Original strand, 34256393 - 34256770
Alignment:
Q  272 caagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaa 369  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |  || |||||| ||||| || ||||||||   || ||| |||||   |    
T  34256393 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaa---ag-gagagaagagaga 34256488  T
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  34256489 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 34256586  T
Q  470 aaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagaca 560  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||       |||||||    
T  34256587 aaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttccaatctcaccaatgaacaagaca 34256685  T
Q  561 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcc 647  Q
    |||||||||| || |    |||||||||| | |||||| | |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34256686 ctcaatgattttcacacaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagata-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcc 34256770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 205 - 646
Target Start/End: Original strand, 19945182 - 19945625
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtc 303  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||  || |||||||  ||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  19945182 cacaccaatacaaactt-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 19945277  T
Q  304 taatctaggaaac-aagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttc 402  Q
    ||||||||||| | |||||  || |||||| ||||| || || |||||   || ||| |||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19945278 taatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaa---ag-gagagaagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttc 19945372  T
Q  403 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagc 500  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  19945373 ggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttccaaagagatacaaaagtggttacaagaaattagc 19945471  T
Q  501 -ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 590  Q
     ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||||||||||     
T  19945472 tttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttta 19945570  T
Q  591 ccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  19945571 caatgtttcccgacccaagaga-actctaatcaaag-actctaaaccctaaagttgc 19945625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 272 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 44304137 - 44303758
Alignment:
Q  272 caagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaa 369  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| || ||| |||  || |||||| ||||| || ||||||||   || ||| |||||   |    
T  44304137 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaa---ag-gagagaagagaga 44304042  T
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  44304041 aacaaacacaccaa-agattgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttaa 44303944  T
Q  470 aaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc---ttttcccaatctcac-------caag 557  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||       ||||    
T  44303943 aaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaag 44303845  T
Q  558 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttg 645  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  44303844 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttg 44303758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 272 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 42498477 - 42498193
Alignment:
Q  272 caagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaagagagggaagaaga 368  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | |||| || ||||||||   || ||| ||||| |     
T  42498477 caagcaataattaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa---ag-gagagaagaggg 42498382  T
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42498381 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 42498284  T
Q  469 caaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  42498283 caaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 42498193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 369 - 542
Target Start/End: Original strand, 1746200 - 1746371
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  1746200 aaacaaacacaccaac-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 1746296  T
Q  469 caaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 542  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  1746297 caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccttttt 1746371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 15212971 - 15212786
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  15212971 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttcttac 15212875  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15212874 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 15212786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 3303652 - 3303838
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3303652 aaacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctta 3303748  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3303749 caaagagatacaaatgagttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 3303838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 27811449 - 27811278
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||      
T  27811449 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgggttcttacaaagagatacaaatg 27811352  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27811351 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27811278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 42434992 - 42435159
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  42434992 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 42435089  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42435090 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 42435159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 43036608 - 43036423
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  43036608 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatc-aatgagttcttac 43036512  T
Q  470 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| |||||||| |  |||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43036511 aaagagatacaaatgaattacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43036423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 4283691 - 4283524
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  4283691 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 4283594  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4283593 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4283524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 33352321 - 33352150
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||      
T  33352321 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatg 33352224  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33352223 ggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 33352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 18655567 - 18655400
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  18655567 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 18655470  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18655469 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 18655400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 385 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 40321251 - 40321082
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatac-aaaa 483  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||      
T  40321251 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagtttttacaaagagatactaatg 40321154  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 554  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40321153 ggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 40321082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 385 - 542
Target Start/End: Original strand, 12702631 - 12702787
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa- 483  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||     
T  12702631 agattgttgacccagttcggtcc-aacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttcttacaaagagacacaaaag 12702728  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 542  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12702729 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttt 12702787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Original strand, 1345353 - 1345536
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1345353 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatc-aatgagttcttt 1345449  T
Q  469 caaagggataca-aaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac 553  Q
    ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||  | ||  |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1345450 caaagagatacatatgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttcccaatctcac 1345536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 19491680 - 19491867
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  19491680 aaacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtcc-aatatgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatc-aacgagttctta 19491777  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19491778 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 19491867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 40221916 - 40221745
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||      
T  40221916 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttacaaagagatacaaatg 40221819  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40221818 ggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaa 40221745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 4731843 - 4731658
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4731843 aacaaacacaccaa-agattgttgacccaattcggtccaa-cttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttac 4731747  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4731746 aaagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagc-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4731658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 377 - 554
Target Start/End: Original strand, 10930188 - 10930365
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaaggga 476  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  10930188 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgtgttcttacaaagaga 10930285  T
Q  477 tacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcacc 554  Q
    || |||  |||||||||||||||||||  || || |||||| || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10930286 tataaatgggttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagagc-aaccctaatttctatccattttcccaatctcacc 10930365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 370 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 30143525 - 30143346
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||||| || ||| ||||||||  ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30143525 aacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcagttcaa-cttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 30143429  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatct 550  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30143428 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatct 30143346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 30291794 - 30291606
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt 467  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  30291794 aaacaaacacaccaa-agattgttgattcagttcggtccaa-cttggcataatctggagggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gaattctt 30291698  T
Q  468 acaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30291697 acaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30291606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 415 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328782
Alignment:
Q  415 acctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagctc 40328824  T
Q  512 acaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40328823 acaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 40328782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 385 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 5689442 - 5689275
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||      
T  5689442 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatg 5689345  T
Q  484 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 552  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  5689344 ggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagcac-caccttaatttctacccatttttccaatctca 5689275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 395 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 18141981 - 18141821
Alignment:
Q  395 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggttacaaga 493  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  18141981 cccagtttggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaagtgatacaaatgggttacaaga 18141884  T
Q  494 aattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18141883 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaa--cctaatttctacccattttcacaatctcaccaa 18141821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 427 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 44353923 - 44353796
Alignment:
Q  427 ggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaac 524  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||    
T  44353923 ggagagattgatcttttcaatccactatcaa-tgagttcttacaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aac 44353826  T
Q  525 cctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44353825 cctaatttctacccattttcccaatctcac 44353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 6599143 - 6598975
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||      
T  6599143 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttacaaaagtatacaaatg 6599046  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6599045 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcac 6598975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 6674596 - 6674428
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||      
T  6674596 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttacaaaagtatacaaatg 6674499  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6674498 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcac 6674428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 386 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765745
Alignment:
Q  386 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgta-ctcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||  | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||      
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagaga--gcagctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaagagatacaaatg 9765819  T
Q  484 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9765818 ggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 9765745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 1292446 - 1292631
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  1292446 aaacaaacacaccaagaaat-gtttgcccagttcggtccaa-cttgacctactctgg-ggagagatttatttctcaaatccactatcaa-tgagttctta 1292541  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1292542 caaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 1292631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 389 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 11384152 - 11383989
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |   ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||    
T  11384152 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatc-aatgggttcttacaaagagatacaaatgagtt 11384055  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 552  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11384054 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctca 11383989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 385 - 552
Target Start/End: Original strand, 41366612 - 41366778
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41366612 agattgttgtcccagttcggtccaa-cttgacctaatctag-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaagggatacaaata 41366708  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 552  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| | |||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41366709 ggttaaaagaaattagcttaaacaagcttacaaagaacaaa-cataatttctacccattttctcaatctca 41366778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 8965692 - 8965859
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaagg-tt 487  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  8965692 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaa-tgagttcttacaaagagatataaaagggtt 8965789  T
Q  488 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    | ||||||||| ||| | |||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8965790 ataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 8965859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 369 - 472
Target Start/End: Original strand, 4743196 - 4743296
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4743196 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 4743292  T
Q  469 caaa 472  Q
    ||||    
T  4743293 caaa 4743296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 389 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 4162663 - 4162516
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||   ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  4162663 tgtttacccaattcggtccaa-cttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaa-tgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 4162567  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 538  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  4162566 acaagaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaa-cctaacttctaccc 4162516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 370 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4733891 - 4733784
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  4733891 aacaaacacaccaa-agactgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatc-aatgaattcttac 4733795  T
Q  470 aaagggataca 480  Q
    |||| ||||||    
T  4733794 aaagagataca 4733784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 10015265 - 10015136
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||   |||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  10015265 aaacaaatacaccaagaaatgatt-acccagttcggtccaa-cttgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatcaa-tgagttccta 10015170  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 502  Q
     |||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10015169 -aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 10015136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 497
Target Start/End: Original strand, 3073875 - 3073981
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatac-aaaaggtt 487  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  3073875 tgtttacccagttcggcccaa-cttgacctactatgg-ggagagattgatctctccaagccattatcaa-tgagttcttacaaagagatacaaaaatgtt 3073971  T
Q  488 acaagaaatt 497  Q
    ||||||||||    
T  3073972 acaagaaatt 3073981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 396 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 3772352 - 3772192
Alignment:
Q  396 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaa 494  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||   || ||||||  |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||||| | ||||||||||    
T  3772352 ccagtttggtccaa-cttgacctactctgagagatagattgatctctccaatccactatc-aataaattcttacaaagatatacaaatgagttacaagaa 3772255  T
Q  495 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||  | ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  3772254 attagcttaaataagctcacaaagaacaaa-cctaatttctatcaattttctcaatctcaccaa 3772192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 8153914 - 8153813
Alignment:
Q  400 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaatta 498  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| |||    
T  8153914 ttcggtccaa-cttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatc-aatgagttcttacaaagatatacaaaagagttacacgaattta 8153817  T
Q  499 gctt 502  Q
    ||||    
T  8153816 gctt 8153813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 532
Target Start/End: Original strand, 11712024 - 11712145
Alignment:
Q  413 tgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagtt-cttacaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagt 509  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||  |||||     
T  11712024 tgacctactttgagggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttatttacaaagagatataaaagggtttcaagaaattagcttcaacaagc 11712122  T
Q  510 tcacaatgaacaaaccctaattt 532  Q
    || ||| ||||||| ||||||||    
T  11712123 tctcaaggaacaaaacctaattt 11712145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 502
Target Start/End: Original strand, 18106087 - 18106191
Alignment:
Q  394 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaag 492  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||||||    
T  18106087 acccagttcggtccaa-cttgacctattctgg-ggagagattgatctctccaaac-actatcaa-tgagttcttacaaaag-atacaaatgagttacaag 18106181  T
Q  493 aaattagctt 502  Q
    ||||||||||    
T  18106182 aaattagctt 18106191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 484 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1822365 - 1822297
Alignment:
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 551  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  1822365 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttctatcctttttgcaatctc 1822297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 484 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1856810 - 1856742
Alignment:
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 551  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  1856810 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttctatcctttttgcaatctc 1856742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 7597776 - 7597669
Alignment:
Q  396 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttacaaagggatacaaaagg-ttacaaga 493  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  7597776 ccagttcggtctaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgcattctttacaaagagatacaaaaggattataaga 7597678  T
Q  494 aattagctt 502  Q
    |||||||||    
T  7597677 aattagctt 7597669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 551
Target Start/End: Original strand, 29796320 - 29796485
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt--acaaagggatacaaaag-g 485  Q
    |||| ||| ||||||||||||   ||||||||  ||| ||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||| ||  |||||  | |||||||  |    
T  29796320 tgtttaccaagttcggtccaacaatgacctacattgggggagagattgatctctccaatccattat-aaatgagtttttttacaaataggtacaaaaatg 29796418  T
Q  486 ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 551  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | | ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  29796419 ttacaagaaatcagcttcaacaagttctccaagaacaaaccttgatttctactcttttcccaatctc 29796485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 552
Target Start/End: Original strand, 41364926 - 41365011
Alignment:
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctca 552  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41364926 caaagggatacaaatgtgttacaagaaattagcttaaacaaactcacaaagaacaaa-cctaatttctaccaattttcccaatctca 41365011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 253
Target Start/End: Original strand, 3303494 - 3303541
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaacca 253  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3303494 cacaccaatacaaacta-tgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaacca 3303541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 532
Target Start/End: Original strand, 6813771 - 6813818
Alignment:
Q  484 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaattt 532  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  6813771 ggttacaagaaattagcttg-caagctcacaaagaacaaaacctaattt 6813818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 43036767 - 43036720
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaacca 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  43036767 cacaccaatacaaaa-aatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 43036720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 196 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20344256 - 20343807
Alignment:
Q  196 agatcgaaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacacca 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20344256 agatcgaaccacaccaatgcaaag-aatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt--gtgcaagcaacaatcgacaaaaaacca 20344160  T
Q  296 ---cctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgt 391  Q
       ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  20344159 gcacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgt 20344062  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa-gggatacaaaaggttaca 490  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20344061 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttaca 20343963  T
Q  491 agaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343962 agaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 20343863  T
Q  591 ccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343862 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 20343807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Original strand, 18388565 - 18389024
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  18388565 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 18388664  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  18388665 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaagagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 18388762  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaa-gggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  18388763 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 18388862  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18388863 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 18388960  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18388961 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 18389024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Original strand, 6594363 - 6594822
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  6594363 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 6594462  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  6594463 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 6594560  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaa-gggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  6594561 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 6594660  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6594661 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 6594758  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6594759 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6594822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Original strand, 18392001 - 18392460
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  18392001 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacagagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 18392100  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  18392101 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 18392198  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaa-gggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  18392199 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 18392298  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18392299 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 18392396  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18392397 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 18392460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Original strand, 6592145 - 6592604
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  6592145 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 6592244  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  6592245 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagaaaaacaaggag--ggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 6592342  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaa-gggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  6592343 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 6592442  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6592443 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccatttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 6592540  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6592541 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6592604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 197 - 642
Target Start/End: Original strand, 32060127 - 32060579
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  32060127 gatcgaaccacaccaatataaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 32060226  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  32060227 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 32060324  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaa---gggatacaaaaggtt 487  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||    
T  32060325 tcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaaggggatacaagaggtt 32060424  T
Q  488 acaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060425 acaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 32060524  T
Q  588 ttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 642  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060525 ttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 32060579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 323 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 24790074 - 24789751
Alignment:
Q  323 gaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaa-caaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 421  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790074 gaaacacaatgcacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 24789977  T
Q  422 ctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa-gggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaa 519  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24789976 ctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaa-gagtttttacaaaagggatacaaaatgttacaagaaattagctttgacaagttcacaatgaa 24789878  T
Q  520 caaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaa 619  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24789877 caaaccctaatttttacccttttcccaatcttaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaa 24789778  T
Q  620 tcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24789777 tcaaagaaccctaaaccctagagttgc 24789751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 197 - 472
Target Start/End: Original strand, 1560470 - 1560749
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  1560470 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacagagtatattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 1560569  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgtt 392  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1560570 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggt 1560669  T
Q  393 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa 472  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560670 tacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 1560749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 205 - 644
Target Start/End: Original strand, 43503975 - 43504411
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccacctaggtct 304  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||   || |||| |||    
T  43503975 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaa-caaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaaa--cagctagatct 43504070  T
Q  305 aatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcg 403  Q
    |||||||||| ||| |||  || || ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43504071 aatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcg 43504168  T
Q  404 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac-aaagggatacaaaa--ggttacaagaaattag- 499  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||||     
T  43504169 atccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattaga 43504267  T
Q  500 cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt- 598  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||     
T  43504268 tttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcgatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttc 43504366  T
Q  599 tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
     | | ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43504367 ccaagccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtt 43504411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 269 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 39731656 - 39731281
Alignment:
Q  269 gtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaa 366  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||     
T  39731656 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaa--aggagagggaagag 39731559  T
Q  367 gaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttct 466  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39731558 gaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttct 39731461  T
Q  467 tac-aaagggatacaaaag-gttacaagaaattagct-tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactc 563  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39731460 tacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatctgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactc 39731362  T
Q  564 aatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    ||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39731361 aatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagtt 39731281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 486 - 653
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562268
Alignment:
Q  486 ttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggt 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggt 1562200  T
Q  586 gtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1562201 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 1562268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 280 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 35854190 - 35853818
Alignment:
Q  280 aatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaata 377  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || || ||| ||||| |||||||||||   || ||| |||||   ||||||| |    
T  35854190 aatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaagcaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaa---agggagagaagagagaaacaaaca 35854094  T
Q  378 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggat 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  35854093 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagat 35853995  T
Q  478 acaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatg 567  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||    
T  35853994 acaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatg 35853896  T
Q  568 attctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    ||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35853895 attttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actcaaatcaaag-accctaaaccctaaagttgc 35853818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 205 - 646
Target Start/End: Original strand, 25766780 - 25767219
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtc 303  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||  || |||||||   | |||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  25766780 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaaccaataa-caaagtga--gcgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatc 25766875  T
Q  304 taatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaa-gataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagtt 401  Q
    ||||||||| | ||| |||  ||||||||| ||||| || || ||||||   || ||| ||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25766876 taatctaggtatcaaagtgaaaaacacaaatcacaagcaaaaagataaa---agggagagaatagagaaacaaacacaccaagagattgttcacccagtt 25766972  T
Q  402 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaagg--ttacaagaaattag 499  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  25766973 cggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttcttcaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattag 25767071  T
Q  500 ctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttc-ccaatctcac----caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 593  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||     ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | |    
T  25767072 ctttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccttttttccaatctcaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaa 25767170  T
Q  594 tgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    ||||| | |   |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25767171 tgtttccca---aagagaaactctaatcaaaga-ccctaaaccctagagttgc 25767219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 369 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 29991240 - 29990959
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  29991240 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttatta 29991143  T
Q  469 caaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagac 559  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||    
T  29991142 gaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaataac-aaccctaatttctatccttttcccaatctcaccaatgaacaagac 29991044  T
Q  560 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttg 645  Q
    ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29991043 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttg 29990959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 205 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 48409152 - 48408705
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtc 303  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||  || |||||||   |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  48409152 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtga--gtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatc 48409057  T
Q  304 taatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaa-gataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagtt 401  Q
    ||||||||| | ||| |||  || |||||| ||||| || || ||||||   || ||| |||||   ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  48409056 taatctaggtatcaaagtgaaaagcacaaatcacaagcaaaaagataaa---agggagagaagagagaaacaaacacaccaagaaattgttcacccagtt 48408960  T
Q  402 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac-aaagggatacaaaa--ggttacaagaaatta 498  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  48408959 cggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatc-aatgagttatttcaaaagagatacaaaaggggttacaagaaatta 48408861  T
Q  499 gc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    || |||||||||| |||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||||||||||    
T  48408860 gctttgacaagtttacaaagaac-aacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttt 48408762  T
Q  590 cccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
     | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48408761 acaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgc 48408705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 205 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 4179118 - 4178678
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtc 303  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||  || |||||||  |||  |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  4179118 cacaccaatacaaacta-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatgt--aagcaataatcaacaataacagcacctagatc 4179023  T
Q  304 taatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttc 402  Q
    ||||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||| || || |||||   || ||| |||||   ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||     
T  4179022 taatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaa---ag-gagagaagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacctagttt 4178928  T
Q  403 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc- 500  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  4178927 ggttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatc-aatgagttctt-caaagagatacaaaagggttacaagaaattagct 4178830  T
Q  501 ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 592  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| |     
T  4178829 ttcccaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaca 4178731  T
Q  593 atgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4178730 atgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgc 4178678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 23555212 - 23555039
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23555212 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagaggtacaaaag 23555114  T
Q  485 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 556  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  23555113 tgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaa 23555039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Original strand, 34310712 - 34310884
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |    
T  34310712 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaaagatacaaatg 34310810  T
Q  485 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
     ||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34310811 tgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34310884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 272 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 25616137 - 25615785
Alignment:
Q  272 caagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaac-aagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaagagagggaagaaga 368  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | |||||  || |||||| | |||| ||||||||||| | |||    |||||       
T  25616137 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaagataaagagagaa---gaagagag 25616041  T
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  25616040 aaacaaacacaccaa-agattgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctta 25615943  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaa 565  Q
    ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||  ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  25615942 caaaatgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatct---caagacactcaa 25615847  T
Q  566 tgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-ctacccaagagatactctaatcaaaga 626  Q
    ||||| |||||    |||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  25615846 tgattttctctcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 25615785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22270158 - 22269973
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  22270158 aacaaacacaccaagagat-gttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatcagttcttac 22270062  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22270061 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 22269973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 369 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 19502365 - 19502083
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19502365 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 19502268  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caag 557  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||       ||||    
T  19502267 caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaac-aaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaag 19502169  T
Q  558 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  19502168 acactcaatgattctcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 19502083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 41317416 - 41317602
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  41317416 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 41317512  T
Q  469 caaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41317513 caaagggatacaaatggattacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 41317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 371 - 556
Target Start/End: Original strand, 14069817 - 14070001
Alignment:
Q  371 acaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttaca 470  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14069817 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttaca 14069913  T
Q  471 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14069914 aagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14070001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 371 - 556
Target Start/End: Original strand, 14379845 - 14380029
Alignment:
Q  371 acaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttaca 470  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14379845 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttaca 14379941  T
Q  471 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14379942 aagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14380029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 27348002 - 27347817
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27348002 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttcttac 27347906  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27347905 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27347817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 8359316 - 8359485
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa--ggt 486  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  8359316 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggt 8359414  T
Q  487 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8359415 tacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaa 8359485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Original strand, 30024729 - 30024900
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  30024729 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaagagatacaaatg 30024826  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30024827 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30024900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Original strand, 41648993 - 41649175
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41648993 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctta 41649089  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac 553  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  41649090 caaagggatacaaatgggttacaagaaattagctaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccaatttttccaatctcac 41649175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 391 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 29608902 - 29608737
Alignment:
Q  391 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttac 489  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  29608902 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 29608805  T
Q  490 aagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29608804 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29608737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 377 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 2390461 - 2390301
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaaggga 476  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| ||    
T  2390461 acaccaagagattattcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-atatgagttattacaaagaga 2390364  T
Q  477 tacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 538  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2390363 tacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 2390301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 18126829 - 18126644
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    || |||||||||||||| |||||||||||    
T  18126829 aacaaacacaccaa-agattgttgacccaggtcggtc-aaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatcaa-tgagttcttac 18126733  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttg-acaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  18126732 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaa 18126644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Original strand, 38671204 - 38671387
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38671204 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaa-tgagttctta 38671300  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38671301 caaagtgatacaaatgtgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 38671387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 3259162 - 3258995
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| | |||    
T  3259162 tgttcacccagttcggttcaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgggtttttacaaagagatacaaatgagtt 3259065  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3259064 acaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 3258995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 393 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6431971
Alignment:
Q  393 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggttacaa 491  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaa 6432037  T
Q  492 gaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6432036 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 6431971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 8153513 - 8153342
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag 484  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |    
T  8153513 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttattacaaagagatacaaatg 8153416  T
Q  485 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 556  Q
     |||||||||||||||| |||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8153415 agttacaagaaattagctttgacaatctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 8153342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 389 - 502
Target Start/End: Original strand, 32358055 - 32358167
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  32358055 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 32358152  T
Q  488 acaagaaattagctt 502  Q
    |||||||||||||||    
T  32358153 acaagaaattagctt 32358167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 48491727 - 48491579
Alignment:
Q  409 aacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 506  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  48491727 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctttcaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 48491629  T
Q  507 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48491628 agttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48491579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 48599335 - 48599502
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| | |||    
T  48599335 tgttcacccagttcggtccaa-cttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagctcttccaaagagatacaaatgagtt 48599432  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48599433 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaa 48599502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 48489616 - 48489431
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||| || |    
T  48489616 aacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-gaatgagttattgc 48489520  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48489519 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttttcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48489431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 4508707 - 4508874
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  4508707 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctcaa-tgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 4508804  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4508805 acaagaaattagcttcaataagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 4508874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Original strand, 31732966 - 31733137
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||      
T  31732966 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatcaa-tgagttcttacaaagagatacaaatg 31733063  T
Q  484 ggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  31733064 ggttacaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcagtctcaccaa 31733137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 36146390 - 36146576
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  36146390 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaa-tgagttctta 36146486  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36146487 caaagagatacaaatgggttac-agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36146576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 394 - 556
Target Start/End: Original strand, 2360978 - 2361140
Alignment:
Q  394 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaag 492  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  2360978 acccagttcggttcaa-cttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaa-tgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaag 2361075  T
Q  493 aaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2361076 aaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2361140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 26417501 - 26417316
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||  |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  26417501 aacaaacacaccaagaaattgttgacccagtttggtccaat-ttgacctaacctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaac-gagttcttac 26417405  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26417404 aaagagatacaaatgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26417316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Original strand, 47673927 - 47674111
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  47673927 aacaaacacaccaa-agattgttgattcagttcggtccaa-cttgacttaatatgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttac 47674022  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  47674023 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 47674111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Original strand, 47676119 - 47676304
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| || ||||||||| | |||||||||||    
T  47676119 aacaaacacaccaa-agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatc-attgagttcttac 47676215  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  47676216 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 47676304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 4586332 - 4586161
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||      
T  4586332 agattgtcgacccagttcggtccaag-ttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagataaaaatg 4586235  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4586234 ggttacaaaaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4586161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 387 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 43864413 - 43864244
Alignment:
Q  387 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-agg 485  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  ||    
T  43864413 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aattagtttttacaaagagatacaaatggg 43864316  T
Q  486 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  43864315 ttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaa 43864244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Original strand, 495965 - 496148
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  495965 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccggttctgtccaa-cttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 496061  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
     |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  496062 taaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-taccctaatttctacccattttcccaatctcac 496148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24790349 - 24790230
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccacctaggtct 304  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  24790349 cacaccaatgcaaagta-tgatgtgtggagcaacggaaagtggtaaccaccaaacaaagtgc--gtgcaagtaataatcaacaaaacaccacctagatct 24790253  T
Q  305 aatctaggaaacaagtgtgaaac 327  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    
T  24790252 aatctaggaaacaggtgagaaac 24790230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 4253510 - 4253697
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||  |||||| |||||| |||||||||     
T  4253510 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacctagttcggtccaaa-ttgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaa-tgagttcttt 4253606  T
Q  469 c-aaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    | |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  4253607 ccaaagagatataaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttaccaatttcaccaa 4253697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 4510549 - 4510716
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  4510549 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatc-aatgagttcttataaagagatacaaatgggtt 4510646  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  | ||  |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4510647 acaagaaattagcttcaataaactcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaa 4510716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 4512391 - 4512558
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  4512391 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatc-aatgagttcttataaagagatacaaatgggtt 4512488  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  | ||  |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4512489 acaagaaattagcttcaataaactcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaa 4512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 1113843 - 1113660
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  1113843 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcaattcggtc-aaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttctta 1113747  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 553  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  1113746 caaagagatacaaatgggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttctcaatctcac 1113660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 396 - 537
Target Start/End: Original strand, 23565069 - 23565210
Alignment:
Q  396 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaa 494  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23565069 ccagttcagtccaa-cttgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaa 23565166  T
Q  495 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 537  Q
    ||||| ||  ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  23565167 attagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctacc 23565210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 386 - 531
Target Start/End: Original strand, 2759195 - 2759339
Alignment:
Q  386 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag- 484  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |     
T  2759195 gattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatataaatga 2759292  T
Q  485 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatt 531  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2759293 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 389 - 553
Target Start/End: Original strand, 31105394 - 31105558
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaagg-tt 487  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||   |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||    
T  31105394 tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatcaa-tgagttcttacaaaaagatacaaatgggtt 31105491  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31105492 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaatctaatttctacccattttcccaatctcac 31105558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 502
Target Start/End: Original strand, 6359941 - 6360065
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaaggga 476  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  6359941 acaccaagaaattgttgacccagttcgatccaa-cttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatcaa-tgagttcttacaaagaga 6360038  T
Q  477 tacaaa-aggttacaagaaattagctt 502  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||    
T  6360039 tacaaatgggttacaagaaattagctt 6360065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 399 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 23344130 - 23343975
Alignment:
Q  399 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaagg-ttacaagaaatt 497  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    ||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||    
T  23344130 gttcggtccaa-cttgacctactctgg--gagagattaatttctccaatctattatcaa-tgagttctcacaaagatatactaaagggttacaagaaatt 23344035  T
Q  498 agcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| | |||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23344034 agcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatctcaccaa 23343975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 394 - 551
Target Start/End: Original strand, 22328395 - 22328556
Alignment:
Q  394 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagtt-cttacaaagggatacaaaag-gttacaa 491  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  ||||  ||||||||||  ||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  22328395 acccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactat-taatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaa 22328493  T
Q  492 gaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctt--ttcccaatctc 551  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22328494 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaacctttcttcccaatctc 22328556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Original strand, 24525484 - 24525594
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24525484 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagttccgtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 24525580  T
Q  469 caaagggatacaaa 482  Q
    ||||| ||||||||    
T  24525581 caaagagatacaaa 24525594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 31519089 - 31518965
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggag-gagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt 467  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  31519089 aaacaaacacaccaagaaat-gtttatccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtcaa-tgagttctt 31518993  T
Q  468 acaaagggatacaaaag-gttacaagaa 494  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||    
T  31518992 acaaagagatacaaatgagttacaagaa 31518965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526065
Alignment:
Q  485 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 24526065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 12097849 - 12098027
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||        
T  12097849 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta-caaa-gagtt---- 12097940  T
Q  469 caaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
       || |||||||| || ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12097941 ---agagatacaaatgggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 12098027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 556
Target Start/End: Original strand, 36574497 - 36574683
Alignment:
Q  368 aaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt 467  Q
    |||||||| ||| ||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | |||  |||||  |||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  36574497 aaaacaaacacatcaagaaat-gtttacccagtttggtccaaa-ttgacctactctag-ggatggattgatctctccaaaccactatcaa-tgagttctt 36574592  T
Q  468 -acaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 556  Q
     |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  36574593 tacaaagagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaatcttaatttcta-cctttccccaatctctccaa 36574683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 457 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 31518896 - 31518795
Alignment:
Q  457 aatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac 553  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31518896 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctattttcccaatctcac 31518798  T
Q  554 caa 556  Q
    |||    
T  31518797 caa 31518795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 18396486 - 18396384
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttacaaagggatacaaaaggtt 487  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||    
T  18396486 tgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatc-aatgaattctttataaagagatacaaaatgtt 18396388  T
Q  488 acaa 491  Q
    ||||    
T  18396387 acaa 18396384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 30814605 - 30814536
Alignment:
Q  387 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaa 457  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  30814605 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 30814536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 552
Target Start/End: Original strand, 1360226 - 1360316
Alignment:
Q  465 cttacaaagggatacaaaa---ggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctca 552  Q
    ||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||| | ||||||| | | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1360226 cttacaaagagatacaaaaaagggttacaagaaattcgcttcaacaagttctccaaga-caaaacctaatttctacctttttcccaatctca 1360316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 554 - 646
Target Start/End: Original strand, 24514934 - 24515025
Alignment:
Q  554 caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24514934 caagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgc 24515025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 28617234 - 28617182
Alignment:
Q  484 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 537  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28617234 ggttacaagaaattagcttaa-aagctcacaaagaacaaaacctaatttctacc 28617182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 369 - 409
Target Start/End: Original strand, 47263663 - 47263703
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaa 409  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  47263663 aaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa 47263703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 74)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 8395967 - 8395508
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  8395967 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaaaaaacaacaaaacac 8395868  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  8395867 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataca-atggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 8395769  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa-gggatacaaaaggttaca 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8395768 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttaca 8395669  T
Q  491 agaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 590  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8395668 agaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttc 8395571  T
Q  591 ccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  8395570 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 8395508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 8393758 - 8393299
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  8393758 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacgaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 8393659  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  8393658 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataca-atggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 8393560  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa-gggatacaaaaggttaca 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8393559 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttaca 8393460  T
Q  491 agaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 590  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8393459 agaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttc 8393362  T
Q  591 ccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  8393361 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccataaaccctagagcttcccctttg 8393299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 7125265 - 7124804
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  7125265 gatcgaaccacaccaatataaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 7125166  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  7125165 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 7125068  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaaggga-tacaaaaggttac 489  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||    
T  7125067 tcacccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 7124968  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124967 aagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 7124868  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  7124867 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 7124804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 7123046 - 7122585
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  7123046 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 7122947  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  7122946 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaagaagaaaacaataaacacaaagaaattgt 7122849  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaaggga-tacaaaaggttac 489  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||    
T  7122848 tcacccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 7122749  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122748 aagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 7122649  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  7122648 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 7122585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 5138654 - 5138193
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |  ||||||||||     
T  5138654 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagagacaacaaaacat 5138555  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacaca--aagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattg 390  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |  || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  5138554 cac-tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacaaagcaaccaaaa-cacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 5138457  T
Q  391 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggtta 488  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  5138456 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtta 5138357  T
Q  489 caagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 587  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  5138356 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtat 5138259  T
Q  588 ttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  5138258 ttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 5138193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 5136429 - 5135967
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |  ||||||||||     
T  5136429 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagagacaacaaaacat 5136330  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacaca--aagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattg 390  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |  || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  5136329 cac-tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacaaagcaaccaaaa-cacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 5136232  T
Q  391 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggtta 488  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  5136231 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtta 5136132  T
Q  489 caagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 587  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  5136131 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtat 5136034  T
Q  588 ttcccatg-ttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  5136033 ttcccatgtttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 5135967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 208 - 644
Target Start/End: Original strand, 31495130 - 31495573
Alignment:
Q  208 accaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccacctaggtctaat 307  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31495130 accaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccatcaa-caaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacagcacctagatctaat 31495227  T
Q  308 ctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaac------aaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagt 400  Q
    ||||||||||| |||  || || ||| ||||| |||||||||||       || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31495228 ctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagt 31495327  T
Q  401 tcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac-aaagggatacaaaa--ggttacaagaaatt 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||    
T  31495328 tcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaatt 31495426  T
Q  498 ag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 596  Q
    ||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  31495427 agatttgacaagttcacaatgaac-aatcctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgt 31495525  T
Q  597 tt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    ||  | ||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  31495526 ttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actataaaccctagagtt 31495573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 205 - 646
Target Start/End: Original strand, 13992114 - 13992551
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtc 303  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||  || |||||||   |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  13992114 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtga--gtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatc 13992209  T
Q  304 taatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaa-gataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagtt 401  Q
    ||||||||| | ||| |||  || |||||| ||||| || || ||||||   || ||| |||||   ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  13992210 taatctaggtatcaaagtgaaaagcacaaatcacaagcaaaaagataaa---agggagagaagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacctagtt 13992305  T
Q  402 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag- 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  13992306 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttac-aagagatacaaaagagttacaagaaattaga 13992403  T
Q  500 cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtt 597  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | |||||    
T  13992404 tttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtt 13992502  T
Q  598 t-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13992503 tcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgc 13992551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 56178618 - 56178805
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  56178618 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 56178715  T
Q  469 caaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56178716 caaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 56178805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 29999806 - 30000069
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac-aaagggatacaaaag-gt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| ||    
T  29999806 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagt 29999904  T
Q  487 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctcttt 578  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||| || ||      
T  29999905 tacaagaaattagctttgacatgttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactca 30000003  T
Q  579 acaaggtgtttcccatgttttc-tacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttg 645  Q
     |||||||||| | |||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30000004 ccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttg 30000069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 52095344 - 52095530
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  52095344 aaacaaacacaccaaaa-attgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gatttctta 52095440  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52095441 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 52095530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 377 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 2209894 - 2209717
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaaggga 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  2209894 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagaga 2209796  T
Q  477 tacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 552  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2209795 tacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctca 2209717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 48143230 - 48143042
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  48143230 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 48143133  T
Q  469 caaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 556  Q
      ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  48143132 tgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 48143042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 385 - 537
Target Start/End: Original strand, 5370079 - 5370232
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa- 483  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  5370079 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaaag 5370177  T
Q  484 ggttacaagaaattagc--ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 537  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5370178 ggttacaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 5370232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Original strand, 9927441 - 9927626
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9927441 aacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 9927537  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9927538 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 9927626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 392 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 41964580 - 41964415
Alignment:
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa--ggttac 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  41964580 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagggatacaaaatgggttac 41964483  T
Q  490 aagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    || ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41964482 aataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 41964415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 377 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 26364415 - 26364236
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaaggga 476  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  26364415 acaccaagaaattgttgacccagttcagtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-taatgagttcttacaaagaga 26364318  T
Q  477 tacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26364317 tacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26364236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Original strand, 12739533 - 12739718
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  12739533 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcatac 12739629  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12739630 aaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12739718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 46703669 - 46703500
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa--ggt 486  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  46703669 tgttcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggt 46703571  T
Q  487 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  46703570 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 46703500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 47038393 - 47038577
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  47038393 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtcctta 47038489  T
Q  469 caaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||  |||||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47038490 caaacagatacaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccaatctcaccaa 47038577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 377 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 54883199 - 54883020
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaaggga 476  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  54883199 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagaga 54883102  T
Q  477 tacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54883101 tacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54883020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 370 - 537
Target Start/End: Original strand, 12743908 - 12744073
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12743908 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 12744004  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 537  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12744005 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 370 - 537
Target Start/End: Original strand, 12745297 - 12745462
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12745297 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 12745393  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 537  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12745394 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12745462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Original strand, 26175619 - 26175804
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26175619 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 26175715  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26175716 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaa 26175804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 369 - 554
Target Start/End: Original strand, 46147373 - 46147557
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  46147373 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaa-gagttctta 46147469  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 554  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  46147470 caaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcacc 46147557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 12073560 - 12073392
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  12073560 tgttcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 12073462  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12073461 acaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 12073392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Original strand, 36463386 - 36463557
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  36463386 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaa-gagttcttacaaagagatacaaatg 36463483  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36463484 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-agccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 36463557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 40632612 - 40632445
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  40632612 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaataggtt 40632515  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40632514 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40632445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 41639593 - 41639426
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||  ||||    
T  41639593 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-gatgagttcttacaaatagatacaaatgggtt 41639496  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41639495 acaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 45687164 - 45687351
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  45687164 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtcc-aacttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttctta 45687260  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||  |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45687261 caaatagatacaaatgagttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaa 45687351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Original strand, 34570397 - 34570582
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  34570397 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcgatccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 34570493  T
Q  470 aaagggatacaa-aaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| |||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34570494 aaagagatacaattgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 34570582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 48893620 - 48893810
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  48893620 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 48893716  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttc----acaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48893717 caaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 48893810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 387 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 36994693 - 36994524
Alignment:
Q  387 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-agg 485  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  36994693 attgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaagggatacaaatggg 36994596  T
Q  486 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36994595 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36994524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 389 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 379548 - 379383
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  379548 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aattagttcttacaaagcgatacaaatgggtt 379450  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  379449 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcac 379383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 389 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 6656123 - 6655975
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  6656123 tgttcacccaattcggtccaa-cttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 6656026  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 538  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  6656025 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccc 6655975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 8648306 - 8648139
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  8648306 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 8648209  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    | |||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  8648208 ataagaaattagcttcaacaaactcacaatgaac-aaccctaatttctatccattttcccattctcaccaa 8648139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 8665556 - 8665408
Alignment:
Q  409 aacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  8665556 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 8665458  T
Q  507 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    || || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8665457 agctctcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 8665408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 377 - 552
Target Start/End: Original strand, 50262689 - 50262865
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaaggga 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  50262689 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatc-aatgagttcttacaaagaga 50262787  T
Q  477 tacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctca 552  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| ||||||| | || ||||||||||||||    
T  50262788 tacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccgtaatttcgatccattttcccaatctca 50262865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 377 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 12119719 - 12119540
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaggg 475  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  12119719 acaccaagaaattgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttctttacaaagag 12119622  T
Q  476 atacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcacc 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||    
T  12119621 atacaaaagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttccaatctcacc 12119540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 6542161 - 6542349
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||    
T  6542161 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacccagttcggtccaa-cttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttctta 6542257  T
Q  469 caaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  6542258 caaagagatacaaaaggctaacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctaccattttttcccaatctccccaa 6542349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 387 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 37740794 - 37740625
Alignment:
Q  387 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-agg 485  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  37740794 attgttgacacagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatggg 37740697  T
Q  486 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  37740696 ttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 37740625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 37229722 - 37229890
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa--ggt 486  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||  |||    
T  37229722 tgtttacctagttcggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaagagatataaaaagggt 37229819  T
Q  487 tacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| ||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37229820 tacaacaaatttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 37229890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Original strand, 27416962 - 27417133
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||      
T  27416962 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttacaaagagatacaaatg 27417059  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  27417060 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaa 27417133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 389 - 502
Target Start/End: Original strand, 50673848 - 50673960
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  50673848 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 50673945  T
Q  488 acaagaaattagctt 502  Q
    |||||||||||||||    
T  50673946 acaagaaattagctt 50673960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Original strand, 54199890 - 54200074
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  54199890 aacaaacacaccaaaa-attgttgacccagttcg-tccaa-cttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaa-tgagttcttac 54199985  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54199986 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54200074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 52082645 - 52082825
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||       |||||||||| || ||||||    
T  52082645 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatctc-------cactatcaaa-gatttctta 52082735  T
Q  469 caaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52082736 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 52082825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 372 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 5872003 - 5871820
Alignment:
Q  372 caaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaa 471  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||| |||    
T  5872003 caaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaa-gagttcttgcaa 5871907  T
Q  472 agggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    || |||| |||  |||||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5871906 agtgataaaaatgggttacaagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 5871820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Original strand, 52467336 - 52467519
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||| |||    
T  52467336 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-aagttatta 52467432  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  52467433 caaagtgatacaaatgggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaacctcac 52467519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 4588126 - 4587958
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa-ggtt 487  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4588126 tgtttacccagtttggtccaa-cttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 4588029  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||| | |||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  4588028 acaagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaatcttaatttctaccttttttcccaatttcaccaa 4587958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 5429850 - 5429679
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||      
T  5429850 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaatagatacaaatg 5429753  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5429752 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaa-taaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 5429679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 31474337 - 31474150
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||   |||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  31474337 aaacaaacacaccaagatat-gtttacccagttcggtccaa-cttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaa-tgagttctta 31474241  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||  ||| || ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31474240 caaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 31474150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 389 - 549
Target Start/End: Original strand, 5207843 - 5208003
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaagg-tt 487  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||  || | |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | |||| ||    
T  5207843 tgtttacccaattcagtccaaa-ttgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaa-tgagttcttacaaatagatatacaagggtt 5207940  T
Q  488 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatc 549  Q
     ||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5207941 gcaataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttccaatc 5208003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 397 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 35662600 - 35662441
Alignment:
Q  397 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaa 495  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  35662600 cagttcggtccaa-cttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaa 35662503  T
Q  496 ttagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||  ||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  35662502 ttagcttcaacaaactcataaagaac-aaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaa 35662441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 427 - 556
Target Start/End: Original strand, 12747794 - 12747924
Alignment:
Q  427 ggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaac 524  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  12747794 ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aac 12747891  T
Q  525 cctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12747892 cctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12747924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 429 - 537
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744195
Alignment:
Q  429 agagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccc 526  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccc 12744184  T
Q  527 taatttctacc 537  Q
    |||||||||||    
T  12744185 taatttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 429 - 556
Target Start/End: Original strand, 12745476 - 12745604
Alignment:
Q  429 agagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccc 526  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  12745476 agagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccc 12745573  T
Q  527 taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  12745574 taatttctacccattttcctaatctcgccaa 12745604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 394 - 541
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699596
Alignment:
Q  394 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaagggatacaaaag-gttacaa 491  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||   ||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaa 26699545  T
Q  492 gaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt 541  Q
    ||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  26699546 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatctatacccttt 26699596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 482
Target Start/End: Original strand, 13009441 - 13009536
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa 482  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13009441 agattgttgacacagttcggtctaa-cttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaagggatacaaa 13009536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 29254679 - 29254494
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  29254679 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac 29254583  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| || |||||  |||| |||||||||| |||  ||||| ||| ||  ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29254582 aaagagacacaaatgggttgcaagaaattaacttcaacaagctcataaaaaac-aactctaatttctacccaatttcccaatctcaccaa 29254494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 24969230 - 24969112
Alignment:
Q  439 ctcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 536  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  |||||||||||    
T  24969230 ctctccaatccactatcaatt-agttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttctac 24969133  T
Q  537 cc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    || |||| |||||||||||||    
T  24969132 ccatttttccaatctcaccaa 24969112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 51337231 - 51337064
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa-ggtt 487  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||  ||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  51337231 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatgtgtgggagagattgatctctctaatacactatcaa-tgagttcttaaaaagagatacaaaagggtt 51337134  T
Q  488 acaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaa-ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    | || |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51337133 ataataaattatctt-aaaagctcacaaagaacaaatccgtaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 51337064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 3913618 - 3913451
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||| || |||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||      
T  3913618 agattgttgacccagttcgatacaa-ctttacatactctag-ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagatatacaaatg 3913522  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac 553  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||  |||||| |||| | | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3913521 ggttaaaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-agctctaatttctactcattttcccaatctcac 3913451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 413 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989899
Alignment:
Q  413 tgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagtt-cttacaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt 502  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||  || |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactat-taacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctt 33989899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 21688428 - 21688250
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaaggga 476  Q
    ||||||||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| ||| | |||| |||||  |||| |||| || |||||| ||||||||| | ||| ||    
T  21688428 acaccaagaaattgttgactcaattcggtctaa-cttgacctaatctaggggagggattgatctctccaattcattatcaa-tgagttcttccgaagaga 21688331  T
Q  477 tacaaaag-gttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcacc 554  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| || | |||| |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  21688330 tacaaatgagttacaaaaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctacccatttttctcaatctcacc 21688250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 44967906 - 44967992
Alignment:
Q  466 ttacaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 551  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||| || | | || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44967906 ttacaaagagatacaaatggttacaagaaattggcttcagcaagctctccaagagcaaaacctaatttctaccattttcccaatctc 44967992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 457 - 552
Target Start/End: Original strand, 48142444 - 48142542
Alignment:
Q  457 aatgagttctt-acaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctca 552  Q
    ||||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  48142444 aatgagttctttacaaagagatatacaagggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcatgttcccaatctca 48142542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 467 - 556
Target Start/End: Original strand, 55085442 - 55085532
Alignment:
Q  467 tacaaagggatacaaaaggtt-acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| || |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  55085442 tacaaagagatacaaatggtttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccttaatttctacctattttccaatctcaccaa 55085532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 1983309 - 1983252
Alignment:
Q  484 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 542  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| ||||||    
T  1983309 ggttacaagaaattagcttg-caagctcacaaagaacaaaacataatttctatcctttt 1983252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 5350002 - 5349929
Alignment:
Q  466 ttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 538  Q
    |||||||| |||||||| | | |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5350002 ttacaaagagatacaaacgagctacaaggaattagcttcgacaagttcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 5349929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 369 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24969851 - 24969787
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 435  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  24969851 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggatagatt 24969787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 41639336 - 41639263
Alignment:
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41639336 ggttacaagaaattagcttcaaaaagtttacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 29056545 - 29056363
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgag-ttctt 467  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| || |||||||||| ||| | ||||||| ||||  ||||||| |  ||||  |||||| |||||| |||| || ||    
T  29056545 aaacaaacacaccaaga-agtgtttacacagttcggtcaaaa-tggacctacactgggtgagagataggtctctctaatccattatcaa-tgaggttgtt 29056449  T
Q  468 acaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagct-tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 551  Q
    |||||| |||| |||||| || ||||||||||| | | |||||  ||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  29056448 acaaagagatataaaaggattgcaagaaattagttctaacaagcacacaaagaacaaactctaattcctaccattttcccaatctc 29056363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089933
Alignment:
Q  415 acctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttacaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt 502  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctttacagagagatacaaaatggttataataaattagctt 33089933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 377 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 5396775 - 5396720
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 433  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  5396775 acaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctggaggagaga 5396720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Original strand, 2409 - 2868
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  2409 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 2508  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||    
T  2509 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaaaagattgt 2606  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaa-gggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  2607 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 2706  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2707 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 2804  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2805 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 2868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Original strand, 12647191 - 12647650
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  12647191 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 12647290  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  12647291 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgt 12647388  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaa-gggatacaaaaggttac 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  12647389 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 12647488  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12647489 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 12647586  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12647587 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 12647650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 222 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 6267023 - 6266601
Alignment:
Q  222 atgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccacctaggtctaatctaggaaacaagtg 321  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6267023 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgt--aagcaaaaatcaacaaaacaacacctagatctaatctaggaaagaagtg 6266926  T
Q  322 tgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaat-acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 420  Q
      ||||||||  ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266925 aaaaacacaatacacaagcacaagataaacg--gagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 6266828  T
Q  421 tctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa-gggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatga 518  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6266827 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatga 6266729  T
Q  519 acaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactcta 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6266728 acaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactcta 6266629  T
Q  619 atcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266628 atcaaagaaccctaaaccctagagttgc 6266601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 197 - 576
Target Start/End: Original strand, 13655834 - 13656220
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  13655834 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacagagtatattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 13655933  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaa-gagattg 390  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  13655934 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattg 13656033  T
Q  391 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaa-gggatacaaaaggttac 489  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13656034 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttac 13656133  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 576  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656134 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 13656220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 202 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 32289916 - 32289477
Alignment:
Q  202 aaccacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctag 300  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||   |||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  32289916 aaccacaccaatacaaagtaa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgg--gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctag 32289821  T
Q  301 gtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcaccca 398  Q
     ||||||||||||||||| |||  || || ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  32289820 atctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaggacaccaaagagattgttcaccca 32289723  T
Q  399 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac-aaagggatacaaaag-gttacaagaaat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32289722 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaat 32289624  T
Q  497 tag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 595  Q
    |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| |||||    
T  32289623 tagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatg 32289526  T
Q  596 ttttc-tacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    ||| |  ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32289525 tttccaaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtt 32289477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 205 - 644
Target Start/End: Original strand, 4484151 - 4484594
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtc 303  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||  || |||||||   |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  4484151 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtga--gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatc 4484246  T
Q  304 taatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttc 402  Q
    ||||||||||||||| |||  || || ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4484247 taatctaggaaacaaagtgaaaagcaaaaaccacaagcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttc 4484343  T
Q  403 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac-aaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc 500  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4484344 tgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagc 4484442  T
Q  501 -ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 591  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||      |||||||||||||||||  | ||   |||||||||| |    
T  4484443 tttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttac 4484541  T
Q  592 catgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
     ||||||  | ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4484542 aatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagtt 4484594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 205 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 30833693 - 30833342
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtc 303  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||  |   |||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  30833693 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccattaatta---tgtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatc 30833598  T
Q  304 taatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttc 402  Q
    ||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30833597 taatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttc 30833501  T
Q  403 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac-aaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc 500  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  30833500 agtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattaac 30833402  T
Q  501 -ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcaccaaga 558  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30833401 tttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaaga 30833342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 270 - 646
Target Start/End: Original strand, 4503017 - 4503397
Alignment:
Q  270 tgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaag 367  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||   || ||| |||||      
T  4503017 tgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacacaagcacaagataaa---ag-gagagaagaga 4503112  T
Q  368 aaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt 467  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4503113 gaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt 4503210  T
Q  468 acaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctc-------accaa 556  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||       | |||    
T  4503211 -caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaa 4503308  T
Q  557 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4503309 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaa-cctaaaccctaaagttgc 4503397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 272 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 45100036 - 45099658
Alignment:
Q  272 caagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaa 369  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || |||||| ||||| || || |||||   || ||| |||||   |    
T  45100036 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatcacaagcaaaatataaa---ag-gagagaagagaga 45099941  T
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  45099940 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-c 45099844  T
Q  470 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caaga 558  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||    
T  45099843 aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaaga 45099745  T
Q  559 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  45099744 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgc 45099658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 369 - 647
Target Start/End: Original strand, 5723237 - 5723520
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  5723237 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5723334  T
Q  469 caaagggatac-aaaaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagac 559  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||    
T  5723335 caaagagatacaaaaaggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aagcctaatttctacccttttctcaatctcaccaatgaacaagac 5723433  T
Q  560 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcc 647  Q
    ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  5723434 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accccaaaccctaaagttgcc 5723520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 369 - 646
Target Start/End: Original strand, 36205646 - 36205928
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| || || |||||||||||     
T  36205646 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtc-aatgagttctt- 36205742  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caaga 558  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||    
T  36205743 caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaaga 36205841  T
Q  559 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36205842 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgc 36205928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 2334399 - 2334586
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2334399 aaacaaacacaccaa-agattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 2334496  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2334497 caaagagatacaaaagagttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aacccttatttctacccattttcccaatctcaccaa 2334586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 272 - 644
Target Start/End: Original strand, 36987961 - 36988338
Alignment:
Q  272 caagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaagagagggaagaaga 368  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||| || ||||||||   || ||| |||||       
T  36987961 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaa---ag-gagagaagagag 36988056  T
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36988057 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 36988154  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caaga 558  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||       |||||    
T  36988155 caaagagatacaaaagagttacaagaaattagttttgacaagctcacatagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaaga 36988253  T
Q  559 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  36988254 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttactatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 36988338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 6594987 - 6595175
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||    
T  6594987 aaacaaacacaccaa-agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttctta 6595084  T
Q  469 caaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  6595085 caaagagattcaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcctaatctcaccaa 6595175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 45727096 - 45726929
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45727096 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaataggtt 45726999  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45726998 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 45726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 29868040 - 29867869
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  29868040 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaagagatacaaatg 29867943  T
Q  484 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29867942 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29867869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 369 - 538
Target Start/End: Original strand, 723726 - 723893
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  723726 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 723822  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 538  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  723823 caaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 723893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 35446885 - 35447052
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  35446885 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 35446982  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  35446983 acaagaaattagattcaacaagatcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttaccaatctcaccaa 35447052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 36773748 - 36773562
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36773748 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 36773652  T
Q  469 caaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  36773651 caaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaa 36773562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 38312411 - 38312240
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||      
T  38312411 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagatcttacaaagagatacaaatg 38312314  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38312313 ggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 38312240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Original strand, 34139752 - 34139936
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34139752 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 34139848  T
Q  469 c-aaagggataca-aaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34139849 caaaagggatacatatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcac 34139936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 11067491 - 11067305
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11067491 aaacaaacacaccaa-agattgttgaccgagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattat-aaatgagttctta 11067395  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  11067394 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagtac-aacactaatttctacccatttttccaatttcaccaa 11067305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 11151573 - 11151759
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||| |||||||||||| || |||||||||    
T  11151573 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaa-gagttctta 11151669  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11151670 caaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 11151759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 36317991 - 36318177
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36317991 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 36318087  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36318088 caaagagatacaaatgggttacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 36318177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Original strand, 17057352 - 17057537
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17057352 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 17057448  T
Q  470 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17057449 aaagagatacaaatgagttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 17057537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Original strand, 17085335 - 17085520
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17085335 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 17085431  T
Q  470 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17085432 aaagagatacaaatgagttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 17085520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 391 - 556
Target Start/End: Original strand, 1631735 - 1631900
Alignment:
Q  391 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggttac 489  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  1631735 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 1631832  T
Q  490 aagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1631833 aagatattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 1631900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 42362500 - 42362355
Alignment:
Q  409 aacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 506  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  42362500 aacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaaca 42362402  T
Q  507 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42362401 agctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 42362355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 377 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 24398238 - 24398055
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaggg 475  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| |    
T  24398238 acaccaagtaattgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttctttacaaagag 24398140  T
Q  476 atacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctt--ttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  24398139 atacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaa 24398055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 389 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 33648340 - 33648176
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttacaaagggatacaaaa-ggt 486  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| |||    
T  33648340 tgtttacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatc-aatgagttctttacaaagaaatacaaaagggt 33648242  T
Q  487 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 551  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  33648241 tacaggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttaccattttctcaatctc 33648176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Original strand, 14633807 - 14633991
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  14633807 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-tatgagttctta 14633903  T
Q  469 c-aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14633904 caaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttaccaatctcac 14633991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 423 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 13121901 - 13121769
Alignment:
Q  423 tggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaaca 521  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||    
T  13121901 tggaggagagattgatttcttcaatccactatcaa-tgagtttctacaaagagatacaaa-ggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaaca 13121804  T
Q  522 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13121803 aaccctaatttctaccattttcccagtctcaccaa 13121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 33162432 - 33162618
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  33162432 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctta 33162528  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    || || ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  33162529 cagagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcctaatttcaccaa 33162618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 11690672 - 11690504
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-a 483  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| || | ||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||      
T  11690672 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatcaac-gatttcttacaaagggatacaaatg 11690575  T
Q  484 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 553  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11690574 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 11690504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 389 - 502
Target Start/End: Original strand, 17490149 - 17490261
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  17490149 tgtttacccagttcggtccaaa-ttgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatc-aatgagttcttacaaagagttacaaaagagtt 17490246  T
Q  488 acaagaaattagctt 502  Q
    |||||||||||||||    
T  17490247 acaagaaattagctt 17490261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 26353351 - 26353184
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||    
T  26353351 tgtttacccggttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatcaa-tgagtacttacaaaaagatacaaaagtgtt 26353254  T
Q  488 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  26353253 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacacttttttcaatctcaccaa 26353184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 378 - 556
Target Start/End: Original strand, 42288101 - 42288278
Alignment:
Q  378 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggat 477  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||    
T  42288101 caccaagaaattattgacccagttcggtcc-aacttgacctaatctgg-ggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagctcttacaaagaaat 42288197  T
Q  478 acaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42288198 acaaatgggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 42288278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 439 - 556
Target Start/End: Original strand, 7815323 - 7815441
Alignment:
Q  439 ctcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 536  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |   || ||||||||||||||||| ||    
T  7815323 ctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaaccctaatttcaac 7815421  T
Q  537 ccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  7815422 ctttttctcaatctcaccaa 7815441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 11049721 - 11049550
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatac--aaaaggt 486  Q
    |||| ||||||||| ||||||  |||||||| | || |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| |||    
T  11049721 tgtttacccagttcagtccaat-ttgacctattatgaaggagagattgatcttttcaatctactatcaa-tgagttcttacaaagagatactaaaagggt 11049624  T
Q  487 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaa---tgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    || |||||||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  11049623 tataagaaattagcttcaacaagctcacaaattagaacaaaccctaatttataccattttcctaatctcaccaa 11049550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 389 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 7451284 - 7451173
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  ||    
T  7451284 tgttcacccagttcg-tccaa-cttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttattacaaagagatacaaatgaatt 7451188  T
Q  488 acaagaaattagctt 502  Q
    |||||||||||||||    
T  7451187 acaagaaattagctt 7451173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 385 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 39285007 - 39284936
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaa 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  39285007 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 39284936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 17450748 - 17450678
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaa 457  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  17450748 agattgttcacctagttcggtcc-aacttgacctactct-gtggagagattgatctctccaatccactatcaa 17450678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 457 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24885762 - 24885669
Alignment:
Q  457 aatgagttcttacaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaat 548  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  24885762 aatgagttcttacagaggggtacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctactcattttcccaat 24885669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 1345653 - 1345590
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 433  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  1345653 aaacaaacacaccaagaaattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctactctgggggagaga 1345590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 457 - 535
Target Start/End: Original strand, 7597077 - 7597158
Alignment:
Q  457 aatgagttctt-acaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta 535  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  7597077 aatgagttctttacaaaaagatacaaaagacttacaagaaattagtttcgacaagttcataaggaacaaaacctaatttcta 7597158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 552
Target Start/End: Original strand, 14202501 - 14202569
Alignment:
Q  485 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 552  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14202501 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cataatttctacccattttcccaatctca 14202569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 42064770 - 42064725
Alignment:
Q  388 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 433  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  42064770 ttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagaga 42064725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 377 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 2838134 - 2838079
Alignment:
Q  377 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 433  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  2838134 acaccaagaaattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctactctgggggagaga 2838079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 369 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28259289 - 28259249
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaa 409  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28259289 aaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa 28259249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 400 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 28672088 - 28672036
Alignment:
Q  400 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccact 452  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  28672088 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccact 28672036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 486 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 28770781 - 28770730
Alignment:
Q  486 ttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 538  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28770781 ttacaagaaattagcttaa-aagctcacaaagaacaaactctaatttctaccc 28770730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 197 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 6638 - 6177
Alignment:
Q  197 gatcgaaccacaccaatacaaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||| ||||    
T  6638 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatatgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaatacac 6539  T
Q  294 cacctaggtctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaa-caaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgt 391  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||     
T  6538 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaacaaggagagggaagaagaaaacaataacacaaagagattgg 6439  T
Q  392 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttc-ttac-aaagggatacaaaaggttac 489  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||    
T  6438 tcacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagggcttac 6339  T
Q  490 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6338 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 6241  T
Q  590 cccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6240 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 6177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 218 - 653
Target Start/End: Original strand, 3554 - 3990
Alignment:
Q  218 aataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccacctaggtctaatctaggaaac 316  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3554 aataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaac 3653  T
Q  317 aagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttg 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3654 aagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttg 3751  T
Q  415 acctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctt-acaaaggga-tacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttca 512  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3752 acctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttca 3851  T
Q  513 caatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagat 612  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3852 ctatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 3949  T
Q  613 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3950 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 3990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 145; Significance: 6e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 269 - 644
Target Start/End: Original strand, 11042 - 11425
Alignment:
Q  269 gtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaa 366  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||     
T  11042 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaaacacaaaccacaagcacaagataaa--aggagagggaagag 11139  T
Q  367 gaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttct 466  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  11140 gaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aacgagttct 11237  T
Q  467 tac-aaagggatacaaaa-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------ca 555  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      ||    
T  11238 tacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaaca 11336  T
Q  556 agacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 644  Q
    |||||||||||||||  | ||   |||||||||| | ||||||  | ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11337 agacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accataaaccctagagtt 11425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 269 - 558
Target Start/End: Original strand, 8616 - 8907
Alignment:
Q  269 gtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaa 366  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||  |||||  ||||||     
T  8616 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaaagaagag--ggaagag 8713  T
Q  367 gaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttct 466  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  8714 gaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aacgagttct 8811  T
Q  467 tac-aaagggatacaaaa-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcaccaaga 558  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8812 tacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttataagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaaga 8907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 280 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 434808 - 434436
Alignment:
Q  280 aatcaacaa-aacaccacctaggtctaatctaggaaacaa-gtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaata 377  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || |||||| ||||| |||||||||||   || ||| |||||   ||||||| |    
T  434808 aatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaacacaagcacaagataaa---agggagagaagagagaaacaaaca 434712  T
Q  378 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggat 477  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  434711 caccaa-atattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagat 434614  T
Q  478 acaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt--cccaatctcac-------caagacactcaat 566  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||       |||||||||||||    
T  434613 acaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaat 434515  T
Q  567 gattctctctttacaaggtgtttcccatgtttt-ctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    |||| || ||   |||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  434514 gattttcactcaccaaggtatttaccatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgc 434436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 128; Significance: 8e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 218 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 205 - 1
Alignment:
Q  218 aataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccacctaggtctaatctaggaaac 316  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  205 aataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaac 106  T
Q  317 aagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttg 414  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  105 aagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttg 8  T
Q  415 acctact 421  Q
    |||||||    
T  7 acctact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 205 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 11911 - 11557
Alignment:
Q  205 cacaccaatacaaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaatcaacaa-aacaccacctaggt- 302  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |     
T  11911 cacaccaatacgaacta-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca-ctaacaaagtg--tgtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagata 11816  T
Q  303 ctaatctaggaa-ac-aagtgtgaaa-----cacaaagcacaatcacaagataaacaaagagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcac 395  Q
    |||||||||||| || |||||  |||      | ||| ||||| |||||||||   |||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  11815 ctaatctaggaatacaaagtggaaaaaaaacaataaaacacaagcacaagata---aaagggagagaagagataaacaaatacaccaagagattgttcac 11719  T
Q  396 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gttacaagaa 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  11718 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaa 11620  T
Q  495 attagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11619 attagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 606 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 22286 - 22247
Alignment:
Q  606 aagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22286 aagagaaactctaatcaaaga-ccctaaaccctagagttgc 22247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 385 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1087 - 820
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa- 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||     
T  1087 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttgtt-caaagagatacaaaag 990  T
Q  484 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac------caagacactcaatgattctct 574  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||      ||||||||||||||||| ||     
T  989 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttca 891  T
Q  575 ctttacaaggtgtttcccatgttt-tctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc 646  Q
    ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  890 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgc 820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 114774 - 114602
Alignment:
Q  385 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag 484  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  114774 agattgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaaag 114676  T
Q  485 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  114675 cgttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 114602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 475 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 102513 - 102450
Alignment:
Q  475 gatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 538  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  102513 gatacaaagaggttacaagaaattatcttaa-aagctcacaaaaaacaaaccctaatttctaccc 102450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Original strand, 18004 - 18171
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaag-gtt 487  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||    
T  18004 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-ttacaaagagatacaaatgagtt 18101  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  18102 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccactctcaccaa 18171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 389 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 7494 - 7327
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaa-aggtt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  7494 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 7397  T
Q  488 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7396 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaa 7327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 370 - 556
Target Start/End: Original strand, 20398 - 20583
Alignment:
Q  370 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttac 469  Q
    |||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20398 aacaaacacaccaaaa-attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaa-gagttcttac 20494  T
Q  470 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 556  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  20495 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaa-cctaatttctgctcattttcccaatctcaccaa 20583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Original strand, 149079 - 149262
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttctta 468  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  149079 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 149175  T
Q  469 caaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 553  Q
    ||||| |||| |||  ||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  149176 caaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaac-aaccctaatttctatccgttttcccaatctcac 149262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 66; Significance: 8e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 389 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 10656 - 10515
Alignment:
Q  389 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagttcttacaaagggatacaaaa-ggtt 487  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10656 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aacgagttcttacaaagagatacaaaatggtt 10559  T
Q  488 acaagaaattagcttgaca--agttcacaatgaacaaaccctaattt 532  Q
    |||| ||||||||   |||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  10558 acaataaattagc---acaagagctcacaaagaacaaaccctaattt 10515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 458 - 552
Target Start/End: Original strand, 80351 - 80447
Alignment:
Q  458 atgagttcttacaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 552  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  80351 atgagttcttacaaaaagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 80447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 400 - 502
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27556
Alignment:
Q  400 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactcttcaatccactatcaaatgagtt-cttacaaagggatacaaaag-gttacaagaaatt 497  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  27453 ttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttatttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatt 27551  T
Q  498 agctt 502  Q
    |||||    
T  27552 agctt 27556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 369 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 8531 - 8491
Alignment:
Q  369 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaa 409  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8531 aaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa 8491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University