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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
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Alignment Overview

Query: NF3943_low_74 (Length: 227)

Name: NF3943_low_74
Description: NF3943
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3943_low_74
NF3943_low_74
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (1-227)||(7509973-7510199)
chr4 (1-227)||(27071541-27071767)
chr4 (1-227)||(4943696-4943922)
chr4 (1-227)||(9767998-9768226)
chr4 (1-227)||(27151633-27151859)
chr4 (3-212)||(36352625-36352834)
chr4 (3-220)||(48945777-48945994)
chr4 (3-218)||(27023941-27024156)
chr4 (3-218)||(34802561-34802775)
chr4 (3-218)||(5944379-5944595)
chr4 (91-222)||(25887918-25888049)
chr4 (7-86)||(25888088-25888166)
chr4 (191-222)||(48426441-48426472)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (1-227)||(13497046-13497272)
chr1 (1-227)||(42436175-42436401)
chr1 (1-227)||(32050268-32050494)
chr1 (3-222)||(2023557-2023776)
chr1 (3-222)||(24775959-24776178)
chr1 (3-222)||(43642599-43642818)
chr1 (3-222)||(49005386-49005606)
chr1 (3-222)||(38983972-38984191)
chr1 (3-222)||(45537381-45537599)
chr1 (4-222)||(42807234-42807452)
chr1 (3-222)||(2840859-2841079)
chr1 (3-218)||(18410739-18410954)
chr1 (3-218)||(28645206-28645421)
chr1 (3-218)||(32523398-32523613)
chr1 (7-222)||(20274910-20275127)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (1-227)||(22514337-22514563)
chr8 (1-227)||(40557920-40558146)
chr8 (1-227)||(13279156-13279382)
chr8 (1-227)||(16428671-16428897)
chr8 (1-227)||(33441843-33442069)
chr8 (1-227)||(36895967-36896193)
chr8 (3-222)||(12501100-12501318)
chr8 (3-218)||(39621529-39621744)
chr8 (3-218)||(6417097-6417311)
chr8 (3-218)||(18385027-18385242)
chr8 (7-222)||(29088569-29088789)
chr8 (105-222)||(16888127-16888244)
chr8 (7-86)||(16885906-16885984)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (1-227)||(35505351-35505577)
chr7 (1-227)||(18784020-18784246)
chr7 (1-227)||(42047109-42047335)
chr7 (1-227)||(37315494-37315720)
chr7 (1-227)||(44044960-44045186)
chr7 (1-227)||(35113864-35114090)
chr7 (3-222)||(6613162-6613381)
chr7 (3-222)||(21953592-21953811)
chr7 (3-218)||(46805276-46805491)
chr7 (3-222)||(9178756-9178975)
chr7 (3-218)||(34643232-34643446)
chr7 (3-218)||(42049821-42050036)
chr7 (9-222)||(19295920-19296134)
chr7 (91-220)||(47400268-47400397)
chr7 (7-66)||(47400163-47400222)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (1-227)||(35350216-35350442)
chr3 (1-227)||(26705528-26705754)
chr3 (1-224)||(10122092-10122315)
chr3 (1-227)||(1002424-1002650)
chr3 (1-227)||(43845313-43845539)
chr3 (1-227)||(54610669-54610895)
chr3 (1-227)||(30107172-30107398)
chr3 (3-222)||(37965296-37965515)
chr3 (3-222)||(4066128-4066348)
chr3 (3-222)||(28417780-28417999)
chr3 (4-222)||(33956613-33956832)
chr3 (3-222)||(47333828-47334047)
chr3 (3-222)||(3344430-3344648)
chr3 (3-222)||(33955308-33955528)
chr3 (3-222)||(22398322-22398540)
chr3 (69-227)||(38189938-38190096)
chr3 (91-227)||(23303372-23303508)
chr3 (91-222)||(23302720-23302851)
chr3 (3-222)||(45579500-45579738)
chr3 (7-66)||(23303568-23303627)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (1-227)||(39121908-39122134)
chr2 (3-227)||(42842428-42842652)
chr2 (1-227)||(12256064-12256290)
chr2 (4-222)||(6904945-6905163)
chr2 (3-222)||(4650864-4651084)
chr2 (3-222)||(9616872-9617089)
chr2 (3-222)||(40263931-40264147)
chr2 (3-218)||(4720138-4720352)
chr2 (7-222)||(3554415-3554633)
chr2 (91-222)||(42224563-42224694)
chr2 (7-66)||(42224750-42224809)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-227)||(11596-11822)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (1-227)||(4271024-4271250)
chr6 (1-227)||(14180465-14180691)
chr6 (1-227)||(14175929-14176155)
chr6 (3-218)||(22510776-22510991)
chr6 (4-218)||(19421107-19421321)
chr6 (3-218)||(18902547-18902762)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (1-227)||(23106937-23107163)
chr5 (1-227)||(1212084-1212310)
chr5 (1-227)||(16476096-16476322)
chr5 (1-227)||(28968954-28969180)
chr5 (1-227)||(22720710-22720936)
chr5 (1-224)||(25336578-25336801)
chr5 (1-227)||(36789091-36789318)
chr5 (3-222)||(1598080-1598299)
chr5 (3-222)||(40830979-40831198)
chr5 (3-222)||(39564636-39564854)
chr5 (3-218)||(5811956-5812171)
chr5 (3-218)||(16478692-16478907)
chr5 (3-128)||(22496395-22496520)
chr5 (7-143)||(22386368-22386505)
chr5 (171-222)||(22386505-22386556)
chr5 (157-218)||(22496531-22496593)
[»] scaffold1788 (1 HSPs)
scaffold1788 (1-227)||(824-1052)
[»] scaffold0088 (3 HSPs)
scaffold0088 (3-222)||(755-974)
scaffold0088 (3-222)||(24639-24858)
scaffold0088 (7-212)||(11313-11518)
[»] scaffold1289 (1 HSPs)
scaffold1289 (3-222)||(696-915)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (3-218)||(198324-198538)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7510199 - 7509973
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7510199 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 7510100  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7510099 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 7510000  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7509999 ttcataacatttgaaatttaatttaat 7509973  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27071767 - 27071541
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27071767 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 27071668  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27071667 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 27071568  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27071567 ttcataacatttgaaatttaatttaat 27071541  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4943922 - 4943696
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4943922 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 4943823  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4943822 aatttgatcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 4943723  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4943722 ttcataacatttgaaatttaatttaat 4943696  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 9767998 - 9768226
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9767998 acgaaaaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatcaattaattatc 9768097  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtac--aaaaaatta 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9768098 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaagttatatttcatgtaacgtacaaaaaaaatta 9768197  T
Q  199 acttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9768198 acttcataacatttgaaatttaatttaat 9768226  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27151859 - 27151633
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27151859 acgaataactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataatttaattatc 27151760  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27151759 aatttgacagttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtgatttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 27151660  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27151659 ttcataacatttgaaaattaatttaat 27151633  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 36352625 - 36352834
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  36352625 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaa 36352724  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36352725 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaactt 36352824  T
Q  203 cataacattt 212  Q
    ||||||||||    
T  36352825 cataacattt 36352834  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 48945994 - 48945777
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||    
T  48945994 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaagctctactatttatatagaaaagtagtaccataacgattaatatctattaattattaa 48945895  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  48945894 tttgaccgttttaatattaatattatcaacttctttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctataaaaaattatctt 48945795  T
Q  203 cataacatttgaaattta 220  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48945794 cataacatttgaaattta 48945777  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 27023941 - 27024156
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  27023941 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagtgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaa 27024040  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27024041 tttgaccattttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatataacctacaaaaaattaactt 27024140  T
Q  203 cataacatttgaaatt 218  Q
    |||||||||| |||||    
T  27024141 cataacatttaaaatt 27024156  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34802775 - 34802561
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || ||    
T  34802775 gaagaactatattttatgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatacagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaataattaa 34802676  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  34802675 tttgaacgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctac-aaaaattaactt 34802577  T
Q  203 cataacatttgaaatt 218  Q
    |||||||||| |||||    
T  34802576 cataacatttaaaatt 34802561  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5944595 - 5944379
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaa--tagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |  | |||||||     
T  5944595 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaaatagtaccataacggttaatatctactaattatt 5944496  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5944495 aatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaattaac 5944397  T
Q  201 ttcataacatttgaaatt 218  Q
    |||||||||||| |||||    
T  5944396 ttcataacatttaaaatt 5944379  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25888049 - 25887918
Alignment:
Q  91 attaattatcaatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtaca 190  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25888049 attaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacttctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctaca 25887950  T
Q  191 aaaaattaacttcataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25887949 aaaaattaacttcataagatttgaaatttaat 25887918  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25888166 - 25888088
Alignment:
Q  7 aactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  25888166 aactatattttgtgattgttgtgtacttatacccaaaagtgcttctatttatatag-aaaatagtactataacgattaat 25888088  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 48426472 - 48426441
Alignment:
Q  191 aaaaattaacttcataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48426472 aaaaattaacttcataacatttgaaatttaat 48426441  T

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Target: chr1 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13497272 - 13497046
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13497272 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 13497173  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13497172 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 13497073  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13497072 ttcataacatttgaaatttaatttaat 13497046  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 42436401 - 42436175
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42436401 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 42436302  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42436301 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 42436202  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  42436201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 42436175  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32050494 - 32050268
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32050494 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 32050395  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32050394 aatttgaccgttttaaaattaatattaactacgtctttaatattataaaatgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaatgtacaaaaaattaac 32050295  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  32050294 ttcataacatttgaaatttaatttaat 32050268  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2023776 - 2023557
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  2023776 gaagaattatattttgtgattgttgtgtactcgaacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaa 2023677  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2023676 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattatattatatttcatgtaacctacaaaaaattaactt 2023577  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2023576 cataacatttgaaatttaat 2023557  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24776178 - 24775959
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  24776178 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatattaccataacggttaatatctattaattattaa 24776079  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24776078 tttgaccattttaaaattaatataatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgtttagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaactt 24775979  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24775978 cataacatttgaaatttaat 24775959  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 43642599 - 43642818
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  43642599 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccataagcgctactatttatatagaaaaatattatcataacggttaatatctattaattattaa 43642698  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43642699 tttgaccgttttaaaattaatataatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgtttagattttatttcatgtaacctacaaaaaattaactt 43642798  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43642799 cataacatttgaaatttaat 43642818  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 49005606 - 49005386
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||    
T  49005606 gaagaactatattttgtaattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttttatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattacttattaa 49005507  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtac-aaaaaattaact 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  49005506 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacttatttaatattataaaatgcgcattaaacgattatattatatttcatgtaacctacaaaaaaattaact 49005407  T
Q  202 tcataacatttgaaatttaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  49005406 tcataacatttgaaatttaat 49005386  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 38983972 - 38984191
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || ||    
T  38983972 gaagaactatattttgtgattgttgtgtacttctacccaaaagtgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaatcattaa 38984071  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  38984072 tttgatcgttttaaaattaatattatcaacgtatttaaaattataaaatatgcattaaacgattagattatatttgatgtaacctaaaaaaaattaactt 38984171  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38984172 cataacatttgaaatttaat 38984191  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 45537599 - 45537381
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  45537599 gaagagctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaa 45537500  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  45537499 tttggccgttttaaaattaatattatcaacatatttaatattataaaatgcgcattaaaagattatattatatttcatgcaacctacaaaaaa-taactt 45537401  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45537400 cataacatttgaaatttaat 45537381  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 42807452 - 42807234
Alignment:
Q  4 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaat 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |  ||||||||| |||    
T  42807452 aagaattatatattgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctactatttataaagaaaaatagtaccgtaaaagttaatatctattaattattaat 42807353  T
Q  104 ttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaacttc 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  42807352 ttgaccgttttaaaattaatattatcaacttctttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctataaaaaattatcttc 42807253  T
Q  204 ataacatttgaaatttaat 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  42807252 ataacatttgaaatttaat 42807234  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2841079 - 2840859
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || ||    
T  2841079 gaagaactatattttgtgattgttgtgtacttgtaccaaaaagtgctactatttatgtagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaatcattaa 2840980  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtac-aaaaaattaact 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  2840979 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaaaattataaaatatgcattaaacgattagattatatttgatgtaacctacaaaaaaattaact 2840880  T
Q  202 tcataacatttgaaatttaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2840879 tcataacatttgaaatttaat 2840859  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18410954 - 18410739
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaa-tagtaccataacggttaatgtaaattaattatca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  18410954 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaatagtaccataacggttaatatctactaattatta 18410855  T
Q  102 atttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaact 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18410854 atttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaattaact 18410756  T
Q  202 tcataacatttgaaatt 218  Q
    ||||||||||| |||||    
T  18410755 tcataacatttaaaatt 18410739  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 28645206 - 28645421
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaa-atagtaccataacggttaatgtaaattaattatca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  28645206 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaatagtaccataacggttaatatctactaattatta 28645305  T
Q  102 atttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaact 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28645306 atttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaattaact 28645404  T
Q  202 tcataacatttgaaatt 218  Q
    ||||||||||| |||||    
T  28645405 tcataacatttaaaatt 28645421  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 32523398 - 32523613
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaa-atagtaccataacggttaatgtaaattaattatca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  32523398 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaatagtaccataacggttaatatctactaattatta 32523497  T
Q  102 atttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaact 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  32523498 atttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaattaact 32523596  T
Q  202 tcataacatttgaaatt 218  Q
    ||||||||||| |||||    
T  32523597 tcataacatttaaaatt 32523613  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20275127 - 20274910
Alignment:
Q  7 aactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaat--taattatcaatt 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| || ||  ||||| | ||||    
T  20275127 aactacattttgtgattgttgtgtactcatatccaaaagtgctactatttatatagaaaa-tagtactataacgatcaatatatatattaattgttaatt 20275029  T
Q  105 tgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtac-aaaaaattaacttc 203  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20275028 tgactgttttaaaattaatattttcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaaaaattagattatatttcatgtaacctacaaaaaaattaacttc 20274929  T
Q  204 ataacatttgaaatttaat 222  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  20274928 ataagatttgaaatttaat 20274910  T

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Target: chr8 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22514563 - 22514337
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22514563 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 22514464  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22514463 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 22514364  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22514363 ttcataacatttgaaatttaatttaat 22514337  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40558146 - 40557920
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40558146 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 40558047  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40558046 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 40557947  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  40557946 ttcataacatttgaaatttaatttaat 40557920  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 13279156 - 13279382
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13279156 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaattaattatc 13279255  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13279256 aatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 13279355  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13279356 ttcataacatttgaaatttaatttaat 13279382  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16428897 - 16428671
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16428897 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaattaattatc 16428798  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428797 aatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 16428698  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16428697 ttcataacatttgaaatttaatttaat 16428671  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33442069 - 33441843
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33442069 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaagctctgctatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 33441970  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33441969 aatttgaccgttttaaaattaatattattaacaactttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 33441870  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  33441869 ttcataacatttgaaatttaatttaat 33441843  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 36895967 - 36896193
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36895967 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatatccaaaatctccactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 36896066  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36896067 aatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 36896166  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36896167 ttcataacatttgaattttaatttaat 36896193  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 12501100 - 12501318
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |     
T  12501100 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacc-aaaaacgctactattgatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattat 12501198  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12501199 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaactt 12501298  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  12501299 cataacatttaaaatttaat 12501318  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 39621529 - 39621744
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  39621529 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatatctattaattattaa 39621628  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  |||||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  39621629 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttagtattataaaatgtgtattaaataattagattatattttatgtaacctacaaaaaattaattt 39621728  T
Q  203 cataacatttgaaatt 218  Q
    |||||||||| |||||    
T  39621729 cataacatttaaaatt 39621744  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6417311 - 6417097
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| ||    
T  6417311 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaatagtaccataacggttaatatctactaattattaa 6417212  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6417211 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaattaactt 6417113  T
Q  203 cataacatttgaaatt 218  Q
    |||||||||| |||||    
T  6417112 cataacatttaaaatt 6417097  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 18385027 - 18385242
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaa-atagtaccataacggttaatgtaaattaattatca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  18385027 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaatagtaccataacggttaatatctactaattatta 18385126  T
Q  102 atttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaact 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18385127 atttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaattaact 18385225  T
Q  202 tcataacatttgaaatt 218  Q
    ||||||||||| |||||    
T  18385226 tcataacatttaaaatt 18385242  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 222
Target Start/End: Original strand, 29088569 - 29088789
Alignment:
Q  7 aactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaat----taattatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || ||    |||||   ||    
T  29088569 aactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaagtgctactatttatatagaaaa-tagtactataacgattaatatatatatattaattgctaa 29088667  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaa--ttaac 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  29088668 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacgtacaaaaaaattaaac 29088767  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  29088768 ttcataagatttgaaatttaat 29088789  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 222
Target Start/End: Original strand, 16888127 - 16888244
Alignment:
Q  105 tgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaacttca 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16888127 tgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaacttca 16888226  T
Q  205 taacatttgaaatttaat 222  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  16888227 taatatttaaaatttaat 16888244  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Original strand, 16885906 - 16885984
Alignment:
Q  7 aactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaat 86  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  16885906 aactatattttatgattgttgtgtactcatacctaaaagtgctactatttatatag-aaaatagtactataacgattaat 16885984  T

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Target: chr7 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35505577 - 35505351
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35505577 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 35505478  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35505477 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 35505378  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  35505377 ttcataacatttgaaatttaatttaat 35505351  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 18784020 - 18784246
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18784020 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaattaattatc 18784119  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18784120 aatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 18784219  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  18784220 ttcataacatttgaaatttaatttaat 18784246  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 42047335 - 42047109
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  42047335 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaattaattatc 42047236  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42047235 aatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 42047136  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  42047135 ttcataacatttgaaatttaatttaat 42047109  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 37315494 - 37315720
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37315494 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 37315593  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37315594 aatttgatcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 37315693  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  37315694 ttcataacatttgaaatttaatttaat 37315720  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 44044960 - 44045186
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44044960 acgaataactacattttgtgattgttgtttactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 44045059  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44045060 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacggttaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 44045159  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  44045160 ttcataacatttgaaatttaatttaat 44045186  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35114090 - 35113864
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35114090 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttagatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 35113991  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35113990 aatttgatcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 35113891  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  35113890 ttcataacatttgaaatttaatttaat 35113864  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6613381 - 6613162
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |     
T  6613381 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattac 6613282  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6613281 attgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaactt 6613182  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6613181 cataacatttgaaatttaat 6613162  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 21953592 - 21953811
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||    
T  21953592 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaataactattaattattaa 21953691  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21953692 tttgatcgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtacactaaacgattagattatatttcatttaacctacaaaaaattaactt 21953791  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21953792 cataacatttgaaatttaat 21953811  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 46805491 - 46805276
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  46805491 gaagaactatattttgtgattattgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatatctattaattattaa 46805392  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  46805391 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttagtattataaaatgtgtattaaataattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaattt 46805292  T
Q  203 cataacatttgaaatt 218  Q
    |||||||||| |||||    
T  46805291 cataacatttaaaatt 46805276  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 9178756 - 9178975
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||| ||    
T  9178756 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtaccgaaaagtgctactatttatataaaaaaatagttccataatggttaatatctattaattattaa 9178855  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatg-taacgtacaaaaaattaact 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  9178856 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatatgcattaaaagattagattatatttcatgttaacctac-aaaaattaact 9178954  T
Q  202 tcataacatttgaaatttaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9178955 tcataacatttgaaatttaat 9178975  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 34643232 - 34643446
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| ||    
T  34643232 gaagaactatattttgtgattgttgtgtacttgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaatagtaccataacggttaatatctactaattattaa 34643331  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34643332 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaattaactt 34643430  T
Q  203 cataacatttgaaatt 218  Q
    |||||||||| |||||    
T  34643431 cataacatttaaaatt 34643446  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42050036 - 42049821
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaa-tagtaccataacggttaatgtaaattaattatca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  42050036 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaatagtaccataacggttaatatctactaattatta 42049937  T
Q  102 atttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaact 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  42049936 atttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaattaact 42049838  T
Q  202 tcataacatttgaaatt 218  Q
    ||||||||||| |||||    
T  42049837 tcataacatttaaaatt 42049821  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 19295920 - 19296134
Alignment:
Q  9 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----gtaaattaattatcaatt 104  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     | |||||||||| ||||    
T  19295920 ctataatttgtgattgttgtttactcgtatcccaagacgctactaattatatagaaaaatagtaccataacagttaatattaattaattaattattaatt 19296019  T
Q  105 tgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaacttca 204  Q
    | ||||||||||||  ||||||   |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||    
T  19296020 taaccgttttaaaatcaatatt---aacgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatactaaaaactagcttca 19296116  T
Q  205 taacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19296117 taacatttgaaatttaat 19296134  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 220
Target Start/End: Original strand, 47400268 - 47400397
Alignment:
Q  91 attaattatcaatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtaca 190  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||||  || |    
T  47400268 attaattgttaatttgatcgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaaattaaa 47400367  T
Q  191 aaaaattaacttcataacatttgaaattta 220  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  47400368 aaaaattaactttataagatttgaaattta 47400397  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 66
Target Start/End: Original strand, 47400163 - 47400222
Alignment:
Q  7 aactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaa 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  47400163 aactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa 47400222  T

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Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 35350216 - 35350442
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35350216 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 35350315  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35350316 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 35350415  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  35350416 ttcataacatttgaaatttaatttaat 35350442  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 26705528 - 26705754
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26705528 acgaagaactatattttgtgattgttatgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 26705627  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26705628 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 26705727  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26705728 ttcataacacttgaaatttaatttaat 26705754  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 10122092 - 10122315
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10122092 acgaaaaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 10122191  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10122192 aatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 10122291  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaattt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10122292 ttcataacatttgaaatttaattt 10122315  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 1002424 - 1002650
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1002424 acgaataactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 1002523  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1002524 aatttgactgttttaaaattaatatcatcaacgtctttaatattataaaacatgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 1002623  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1002624 ttcataacatttgaaatttaatttaat 1002650  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43845539 - 43845313
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43845539 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 43845440  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43845439 aatttgatcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 43845340  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  43845339 ttcataacatttgaaatttaatttaat 43845313  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 54610895 - 54610669
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54610895 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 54610796  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54610795 aatttgatcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 54610696  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  54610695 ttcataacatttgaaatttaatttaat 54610669  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30107398 - 30107172
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30107398 acgaagagctatattttgtgattgttgtatactcatacccaaaagctcaactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 30107299  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30107298 aatttgaccgttttaaaattaatattataaacaactttaatattataaaaagtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 30107199  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  30107198 ttcataacacttgaaatttaatttaat 30107172  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37965515 - 37965296
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  37965515 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaa 37965416  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37965415 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaactt 37965316  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37965315 cataacatttgaaatttaat 37965296  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 4066128 - 4066348
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  4066128 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaa 4066227  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtac-aaaaaattaact 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4066228 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaaattaact 4066327  T
Q  202 tcataacatttgaaatttaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4066328 tcataacatttgaaatttaat 4066348  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 28417780 - 28417999
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  28417780 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagtgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaa 28417879  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28417880 tttgaccgttttaaaattaatattataaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaactt 28417979  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28417980 cataacatttgaaatttaat 28417999  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 33956613 - 33956832
Alignment:
Q  4 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||    
T  33956613 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtactcaagagctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaat 33956712  T
Q  104 ttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtac-aaaaaattaactt 202  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  33956713 ttgaccgtgttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcatttaacgattaaattatatttcatgtaacatacaaaaaaattaactt 33956812  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33956813 cataacatttgaaatttaat 33956832  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 47333828 - 47334047
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  47333828 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaa 47333927  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  47333928 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattttaaaatatgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaagaattaactt 47334027  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  47334028 cataacatttgaaatttaat 47334047  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 3344430 - 3344648
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  3344430 gaagaactatattt-gtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatatatatagaaaaataataccataacggttaatatctattaattattaa 3344528  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3344529 gttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaactt 3344628  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  3344629 cataacatttaaaatttaat 3344648  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 33955308 - 33955528
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  33955308 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttgtatagaaaaatagtactataacggttaatatctattaattattaa 33955407  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtac-aaaaaattaact 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33955408 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacttatttaatattataaaatgtgcatttaactattagattatatttcatgtaacctacaaaaaaattaact 33955507  T
Q  202 tcataacatttgaaatttaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33955508 tcataacatttgaaatttaat 33955528  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22398540 - 22398322
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  22398540 gaagagctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaa 22398441  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22398440 tttggccgttttaaaattaatattatcaacatatttaatattataaaatgcgcattaaaagattatattatatttcatgtaacctacaaaaaa-taactt 22398342  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22398341 cataacatttgaaatttaat 22398322  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 227
Target Start/End: Original strand, 38189938 - 38190096
Alignment:
Q  69 agtaccataacggttaatgtaaattaattatcaatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaa 168  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  38189938 agtaccataacggttaatataaattaattatcaatttgaccgttttaaaattaatattaactacgtctttaatattataaaatgtgcattaaacgattaa 38190037  T
Q  169 attatatttcatgtaacgtacaaaaaattaacttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38190038 attatatttcatgtaatgtacaaaaaattaacttcataacatttgaaatttaatttaat 38190096  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 91 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23303508 - 23303372
Alignment:
Q  91 attaattatcaatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtaca 190  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23303508 attaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaatgtacattaaacgattagattatatttcatgtaacctaca 23303409  T
Q  191 aaaaattaacttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23303408 aaaaattaacttcataacatttgaaatttaatttaat 23303372  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23302851 - 23302720
Alignment:
Q  91 attaattatcaatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtaca 190  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23302851 attaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacatctttaatattattaaatgtacattaaacgattagattatatttcatgtaacctaca 23302752  T
Q  191 aaaaattaacttcataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23302751 aaaaattaacttcataagatttgaaatttaat 23302720  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 45579500 - 45579738
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||| |  ||||| |  ||||||||| ||    
T  45579500 gaagaattatattttgtgagtgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatggaaaggtagtaccatagcaattaatatctattaattattaa 45579599  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattat--------------------caacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgt 182  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||                    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  || ||||||||||||||    
T  45579600 tttgaccgtgttaaaattaatattatatggaaaggtagtaccatagcaacgtctttaatattataaaatgtgcattaaatggatagattatatttcatgt 45579699  T
Q  183 aacgtacaaaaaattaacttcataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45579700 aaccta-aaaaaattaacttcataacatttgaaatttaat 45579738  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 23303627 - 23303568
Alignment:
Q  7 aactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaa 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23303627 aactatattttgtgattgttgtgtactcagacccaaaagtgctactatttatatagaaaa 23303568  T

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Target: chr2 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 39121908 - 39122134
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39121908 acgaagaactatattttgtgattgttatgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 39122007  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39122008 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 39122107  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  39122108 ttcataacatttgaaatttaatttaat 39122134  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 227
Target Start/End: Original strand, 42842428 - 42842652
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42842428 gaagaactatattttgtaattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatcaa 42842527  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42842528 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 42842627  T
Q  203 cataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  42842628 cataacatttgaaatttaatttaat 42842652  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 12256064 - 12256290
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12256064 acgaataactacattttgtgattgttgtttactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 12256163  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12256164 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacggttaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 12256263  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12256264 ttcataacatttgaaatttaatttaat 12256290  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6905163 - 6904945
Alignment:
Q  4 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||    
T  6905163 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctactatttataaagaaaaatagtaccgtaacggttaatatctattaattattaat 6905064  T
Q  104 ttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaacttc 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  6905063 ttgaccgttttaaaattaatattatcaacttctttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctataaaaaattatcttc 6904964  T
Q  204 ataacatttgaaatttaat 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6904963 ataacatttgaaatttaat 6904945  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 4650864 - 4651084
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || ||    
T  4650864 gaagaactatattttgtgattgttgtgtacttatacccaaaagtgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaatcattaa 4650963  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtac-aaaaaattaact 201  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  4650964 tttgatcgttttaaaattaatattatcaacgtatttaaaattataaaatatgcattaaacgattagattatatttgatgtaacctacaaaaaaattaact 4651063  T
Q  202 tcataacatttgaaatttaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4651064 tcataacatttgaaatttaat 4651084  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9617089 - 9616872
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| | ||    
T  9617089 gaagaactatattttatgattgttgtgtactcgtatccaaaagcg-tactatttatacagaaaaatagtactataacggttaatatctattaattgttaa 9616991  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9616990 tttgaccgttttaaagttaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 9616891  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  9616890 cataac-tttgaaatttaat 9616872  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40264147 - 40263931
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| ||   ||||||||||| |  ||||||||| |     
T  40264147 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactattgatataaaaaaatacta---taacggttaatatctattaattattat 40264051  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40264050 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaactt 40263951  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  40263950 cataacatttaaaatttaat 40263931  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 4720138 - 4720352
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  4720138 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgttttcaaaagtgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaa 4720237  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  4720238 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacttctttaatattat-aaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctataaaaaattatctt 4720336  T
Q  203 cataacatttgaaatt 218  Q
     |||||||||||||||    
T  4720337 tataacatttgaaatt 4720352  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 222
Target Start/End: Original strand, 3554415 - 3554633
Alignment:
Q  7 aactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaat----taattatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||    ||||| | ||    
T  3554415 aactatattttgtgattgttgtgtattcatacctaaaagtgctactatttatata-aaaaatagtactataacgattaatatatatatattaattgttaa 3554513  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3554514 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaactt 3554613  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  3554614 cataatatttgaaatttaat 3554633  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 42224694 - 42224563
Alignment:
Q  91 attaattatcaatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtaca 190  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  42224694 attaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaacgattagattatatttcatgtaacctaca 42224595  T
Q  191 aaaaattaacttcataacatttgaaatttaat 222  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42224594 aaaaattaactttataagatttgaaatttaat 42224563  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 42224809 - 42224750
Alignment:
Q  7 aactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaa 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  42224809 aactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaacttgctactatttatatagaaaa 42224750  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11822 - 11596
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11822 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaattaattatc 11723  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11722 aatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 11623  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11622 ttcataacatttgaaatttaatttaat 11596  T

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Target: chr6 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 4271024 - 4271250
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4271024 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaattaattatc 4271123  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4271124 aatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 4271223  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4271224 ttcataacatttgaaatttaatttaat 4271250  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14180691 - 14180465
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14180691 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaattaattatc 14180592  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14180591 aatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 14180492  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14180491 ttcataacatttgaaatttaatttaat 14180465  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14176155 - 14175929
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  14176155 acgaataactacattttgtgattgttatgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatttattaattatc 14176056  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14176055 aattttaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 14175956  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14175955 ttcataacatttgaaatttaatttaat 14175929  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22510991 - 22510776
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  22510991 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatgaccaaaaatgctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatatctattaattattaa 22510892  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22510891 tttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgtattaaatgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaactt 22510792  T
Q  203 cataacatttgaaatt 218  Q
    |||||||||| |||||    
T  22510791 cataacatttaaaatt 22510776  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19421321 - 19421107
Alignment:
Q  4 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaat 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| |||    
T  19421321 aagaactatattttatgattgttgtgtacttgtacccaaatgcgctactatttatatagaaaaatagtacgataacggttaatatctattaattattaat 19421222  T
Q  104 ttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaacttc 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19421221 ttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatatgtattaaatgattagattatatttcatgtaacttacaaaaaattaacttc 19421122  T
Q  204 ataacatttgaaatt 218  Q
    ||||||||| |||||    
T  19421121 ataacatttaaaatt 19421107  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 18902547 - 18902762
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaa-atagtaccataacggttaatgtaaattaattatca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  18902547 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaatagtaccataacggttaatatctactaattatta 18902646  T
Q  102 atttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaact 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18902647 atttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaattaact 18902745  T
Q  202 tcataacatttgaaatt 218  Q
    ||||||||||| |||||    
T  18902746 tcataacatttaaaatt 18902762  T

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Target: chr5 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 23106937 - 23107163
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23106937 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaattaattatc 23107036  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23107037 aatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 23107136  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  23107137 ttcataacatttgaaatttaatttaat 23107163  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 1212084 - 1212310
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1212084 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaattaattatc 1212183  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1212184 aatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaatgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 1212283  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1212284 ttcataacatttgaaatttaatttaat 1212310  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16476322 - 16476096
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16476322 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatatctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaattaattatc 16476223  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16476222 aatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 16476123  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16476122 ttcataacatttgaaatttaatttaat 16476096  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 28968954 - 28969180
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28968954 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaattaattatc 28969053  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28969054 aatttaatcgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 28969153  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28969154 ttcataacatttgaaatttaatttaat 28969180  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 22720710 - 22720936
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22720710 acgaataactacattttgtgattgttgtttactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 22720809  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22720810 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacggttaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 22720909  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22720910 ttcataacatttgaaatttaatttaat 22720936  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25336801 - 25336578
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25336801 acgaagtactatattttgtgattgttgtatactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatatattaattatc 25336702  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25336701 aatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 25336602  T
Q  201 ttcataacatttgaaatttaattt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  25336601 ttcataacatttgaaatttaattt 25336578  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 36789091 - 36789318
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaa-ttaattat 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  36789091 acgaataactatattttgtgattattgtatactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaaattaattat 36789190  T
Q  100 caatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaa 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36789191 caatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatattttatgtaacgtacaaaaaattaa 36789290  T
Q  200 cttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36789291 cttcataacatttgaaatttaatttaat 36789318  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 1598080 - 1598299
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  1598080 gaagaattatattttgtgattgttgtgtactcgaacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaa 1598179  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1598180 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattatattatatttcatgtaacctacaaaaaattaactt 1598279  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1598280 cataacatttgaaatttaat 1598299  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40831198 - 40830979
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  40831198 gaagaattatattttgtgattgttgtgtactcgaacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaa 40831099  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  40831098 tttggccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattatattatatttcatgtaacctacaaaaaatcaactt 40830999  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40830998 cataacatttgaaatttaat 40830979  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 39564636 - 39564854
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| ||    
T  39564636 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcg-acccaaaaacgctactatttatataaaaaaatagtaccataacggttaatatctaataattattaa 39564734  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39564735 tttgaccgttttaaaattaacattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaactt 39564834  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39564835 cataacatttgaaatttaat 39564854  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 5811956 - 5812171
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
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T  5811956 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatatctattaattattaa 5812055  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
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T  5812056 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttagtattataaaatgtgtattaaataattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaattt 5812155  T
Q  203 cataacatttgaaatt 218  Q
    |||||||||| |||||    
T  5812156 cataacatttaaaatt 5812171  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16478907 - 16478692
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaa-tagtaccataacggttaatgtaaattaattatca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  16478907 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaatagtaccataacggttaatatctactaattatta 16478808  T
Q  102 atttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaact 201  Q
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T  16478807 atttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaattaact 16478709  T
Q  202 tcataacatttgaaatt 218  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16478708 tcataacatttaaaatt 16478692  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Original strand, 22496395 - 22496520
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  22496395 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagtgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaa 22496494  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattat 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  22496495 tttgaccgttttaaaattaatattat 22496520  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 143
Target Start/End: Original strand, 22386368 - 22386505
Alignment:
Q  7 aactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggtta--atgtaaattaattatcaatt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || || ||||||| | ||||    
T  22386368 aactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaagtgcttctatttatatag-aaaatagtaccataacgattaatatatatattaattgttaatt 22386466  T
Q  105 tgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatat 143  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22386467 ttaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatat 22386505  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 22386505 - 22386556
Alignment:
Q  171 tatatttcatgtaacgtacaaaaaattaacttcataacatttgaaatttaat 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22386505 tatatttcatgtaacctacaaaaaattaacttcataagatttgaaatttaat 22386556  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 22496531 - 22496593
Alignment:
Q  157 ttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtac-aaaaaattaacttcataacatttgaaatt 218  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22496531 ttaaatgattatattatatttcatgtaacctacaaaaaaattaatttcataacatttaaaatt 22496593  T

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Target: scaffold1788 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold1788
Description:

Target: scaffold1788; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 824 - 1052
Alignment:
Q  1 acgaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  824 acgaaaaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaattaattatc 923  T
Q  101 aatttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtac--aaaaaatta 198  Q
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T  924 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaaaatta 1023  T
Q  199 acttcataacatttgaaatttaatttaat 227  Q
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T  1024 acttcataacatttgaaatttaatttaat 1052  T

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Target: scaffold0088 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 755 - 974
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
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T  755 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacagttaatatctgttaattattaa 854  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
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T  855 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtttttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaactt 954  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
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T  955 cataacatttaaaatttaat 974  T

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Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 24639 - 24858
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  24639 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgttctcaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaa 24738  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24739 tttggcagttttaaaattaatattatcaacgtatttaatatgataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctagaaaaaattaactt 24838  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  24839 cataacatttaaaatttaat 24858  T

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Target: scaffold0088; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11518 - 11313
Alignment:
Q  7 aactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaatttg 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  11518 aactatattttgtgatttttgtgtactcgtacccaaaagcgcgactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaatttg 11419  T
Q  107 accgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaacttcata 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11418 accgttttaaaattaatattatcaacatatttaatattataaaatgtgcattaaacacttagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaacttcata 11319  T
Q  207 acattt 212  Q
    ||||||    
T  11318 acattt 11313  T

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Target: scaffold1289 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1289
Description:

Target: scaffold1289; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 915 - 696
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
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T  915 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgttctcaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctattaattattaa 816  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  815 tttgtctgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatatgataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctataaaaaattaactt 716  T
Q  203 cataacatttgaaatttaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  715 cataacatttaaaatttaat 696  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 198324 - 198538
Alignment:
Q  3 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatgtaaattaattatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| ||    
T  198324 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaatagtaccataacggttaatatctactaattattaa 198423  T
Q  103 tttgaccgttttaaaaataatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgccttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaactt 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  198424 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaattaactt 198522  T
Q  203 cataacatttgaaatt 218  Q
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T  198523 cataacatttaaaatt 198538  T

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