View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3949_low_17 (Length: 377)

Name: NF3949_low_17
Description: NF3949
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3949_low_17
NF3949_low_17
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (14-362)||(16020-16370)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (14-362)||(10685975-10686325)
chr8 (14-362)||(18867381-18867731)
chr8 (14-362)||(35743415-35743765)
chr8 (23-362)||(26299399-26299740)
chr8 (47-338)||(28892552-28892845)
chr8 (47-340)||(28329683-28329978)
chr8 (47-337)||(16755361-16755653)
chr8 (49-340)||(21039221-21039514)
chr8 (47-340)||(33034429-33034724)
chr8 (113-310)||(15946517-15946716)
chr8 (277-340)||(25682332-25682395)
chr8 (227-298)||(8758424-8758496)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (14-362)||(24263034-24263384)
chr7 (14-362)||(16882953-16883303)
chr7 (20-362)||(21644063-21644407)
chr7 (14-362)||(18411683-18412034)
chr7 (14-362)||(9186856-9187206)
chr7 (33-362)||(21986946-21987277)
chr7 (131-362)||(4860758-4860991)
chr7 (14-344)||(49089732-49090064)
chr7 (38-337)||(25353131-25353432)
chr7 (47-340)||(25407202-25407497)
chr7 (221-362)||(24272042-24272184)
chr7 (19-340)||(3322886-3323208)
chr7 (104-340)||(44012628-44012866)
chr7 (47-341)||(7071839-7072135)
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (14-362)||(2673931-2674281)
chr3 (14-362)||(8515120-8515470)
chr3 (14-362)||(32478366-32478716)
chr3 (14-362)||(1308897-1309247)
chr3 (14-362)||(3325249-3325599)
chr3 (14-362)||(16262388-16262738)
chr3 (14-162)||(28490884-28491032)
chr3 (47-336)||(29912055-29912346)
chr3 (47-340)||(54190296-54190591)
chr3 (47-340)||(22624077-22624372)
chr3 (47-340)||(10096904-10097199)
chr3 (47-340)||(10203790-10204085)
chr3 (47-340)||(6305099-6305394)
chr3 (47-340)||(10898797-10899092)
chr3 (112-337)||(16459317-16459544)
chr3 (47-333)||(10610882-10611170)
chr3 (38-307)||(47881019-47881290)
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (14-362)||(31398703-31399053)
chr5 (14-362)||(27447849-27448199)
chr5 (14-362)||(33789382-33789732)
chr5 (14-362)||(37558313-37558663)
chr5 (14-362)||(43595147-43595497)
chr5 (14-362)||(43627941-43628291)
chr5 (14-362)||(24557295-24557645)
chr5 (14-362)||(24598327-24598677)
chr5 (14-362)||(28836327-28836668)
chr5 (47-337)||(25447275-25447567)
chr5 (14-362)||(31302307-31302645)
chr5 (34-137)||(31334833-31334936)
chr5 (164-362)||(31334619-31334824)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (14-362)||(19347304-19347654)
chr2 (14-362)||(25393912-25394262)
chr2 (47-340)||(2737993-2738288)
chr2 (59-340)||(17933884-17934167)
chr2 (47-340)||(39684036-39684330)
chr2 (47-340)||(45569178-45569473)
chr2 (47-340)||(20052858-20053153)
chr2 (112-337)||(22715335-22715562)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (14-362)||(14739283-14739633)
chr6 (14-362)||(33332787-33333137)
chr6 (14-362)||(24433032-24433381)
chr6 (47-340)||(25943457-25943752)
chr6 (47-340)||(13880527-13880822)
chr6 (47-337)||(35204164-35204456)
chr6 (47-340)||(17692953-17693248)
chr6 (47-340)||(22349069-22349364)
chr6 (20-184)||(24077129-24077295)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (14-362)||(9226115-9226462)
chr4 (30-362)||(18858602-18858936)
chr4 (14-362)||(16625704-16626054)
chr4 (14-362)||(5145934-5146284)
chr4 (47-340)||(4567127-4567422)
chr4 (47-336)||(15314106-15314397)
chr4 (47-307)||(16634279-16634541)
chr4 (104-310)||(47564607-47564815)
chr4 (223-280)||(51995289-51995346)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (14-362)||(41396265-41396615)
chr1 (14-362)||(47100529-47100879)
chr1 (47-340)||(9523516-9523811)
chr1 (47-340)||(2397326-2397616)
chr1 (239-306)||(9843247-9843314)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (9-362)||(534-889)
scaffold0006 (9-362)||(8690-9045)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (14-362)||(35036-35386)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (47-340)||(49304-49599)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (49-340)||(18116-18409)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (223-337)||(1245-1359)


Alignment Details
Target: scaffold0197 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 16020 - 16370
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16020 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtagaccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 16119  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16120 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 16219  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16220 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 16319  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16320 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 16370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 10685975 - 10686325
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10685975 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtagaccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 10686074  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10686075 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 10686174  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10686175 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 10686274  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10686275 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 10686325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 18867381 - 18867731
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18867381 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 18867480  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18867481 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacatttgaaaagtttaaagaatg 18867580  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18867581 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 18867680  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18867681 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccgagaacaccgcaacaaaat 18867731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 35743765 - 35743415
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35743765 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtagaccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 35743666  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35743665 gaggttcctattttctttctatcattgatgattactctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 35743566  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35743565 gcacactctcatagaaaatcaaatgagaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 35743466  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35743465 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaataacaccgcaacaaaat 35743415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26299740 - 26299399
Alignment:
Q  23 aagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcct 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26299740 aagtttggtagtggtatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttccaagactcctactcatgggggaggttcct 26299641  T
Q  123 attttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ct 220  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||    
T  26299640 attttctttccatcatggatgattattctaggagagtgtgcgtcttttttttgaaaaacaaaagtgacacatttgaaaagtttaaggaatggcacactct 26299541  T
Q  221 catagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaagga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26299540 catagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcaaagcaatttaatgagttttgcaggttgaaagga 26299441  T
Q  321 atcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26299440 atcaagaggcataggaccgtaccgagaacaccgcaacaaaat 26299399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 338
Target Start/End: Original strand, 28892552 - 28892845
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcct-actcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | |  | ||   ||||||| ||||| ||| |||||  | |||||||||||||||    
T  28892552 tctagtaggccttttgagtatgttcatttggatctttggggtccagc-atcagtcaagactcatgggggagtttcatatttcatgtctatcattgatgat 28892650  T
Q  146 tattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaacta 243  Q
    |||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |  || ||||||||||| || || ||||    
T  28892651 tattctagaagagtatgggtttacattctgaagaataaaagtgacgcctttgaaaaattcaaagaatgggatatacttatagaaaatcagattggcacta 28892750  T
Q  244 aactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaacc 338  Q
    |||| ||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||    
T  28892751 aactgaaagtgttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggaataaaggtataaagaggcatagaacc 28892845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Original strand, 28329683 - 28329978
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |   |||    ||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  28329683 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccaacatcgacgaagactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgatt 28329782  T
Q  147 attctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaatgggaactaa 244  Q
    ||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||| |  ||||  |||||||||| || || || ||    
T  28329783 attctagaagagtatgggtttacattctgaagaagaaaagtgatgcttttgaaaaattcaaggaatgggatacacttgtagaaaatcagattggtaccaa 28329882  T
Q  245 actaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    ||| ||||  || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  28329883 actgaaagtgttgagaactgacaatggcttggagtttgtttcagaacagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 28329978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16755653 - 16755361
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |   |||    || |||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  16755653 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccagcatcgacgaagacacatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgatt 16755554  T
Q  147 attctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaatgggaactaa 244  Q
    ||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||| |  ||||  |||||||||| || || || ||    
T  16755553 attctagaagagtatgggtttacattctgaagaagaaaagtgatgcttttgaaaaattcaaggaatgggatacacttgtagaaaatcagattggtaccaa 16755454  T
Q  245 actaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaac 337  Q
    ||| ||||  || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||    
T  16755453 actgaaagtgttgagaactgacaatggcttggagtttgtttcagaacagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaac 16755361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 340
Target Start/End: Original strand, 21039221 - 21039514
Alignment:
Q  49 tagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttc-taagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatta 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | | ||  |   ||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||    
T  21039221 tagtaggccttttaagtatgttcattcggatctttggggtccagcatcagt-taagactcatgtgggaggttcatatttcatgtctatcattgatgatta 21039319  T
Q  148 ttctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaa 245  Q
    |||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  | |||||||| || ||||||||| | |  ||  |||||||||| || || ||||||    
T  21039320 ttctagaagagtatgtgtttacattctgaagaataaaagtgatgcttttgaaaaatttaaagaatggtatatacttttagaaaatcagattggtactaaa 21039419  T
Q  246 ctaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    || ||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||    
T  21039420 ctgaaagtgttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggaaaaaaggtataaagaggcatagaaccgt 21039514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Original strand, 33034429 - 33034724
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttc-taagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgat 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | | ||  |   ||||||| |||||||||  ||||  | ||||| |||||||||    
T  33034429 tctagtaggccttttgagtttgttcattcggatctttggggtccaacatcagt-taaaactcatgggggaggttctaatttcatgtctattattgatgat 33034527  T
Q  146 tattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaatgggaacta 243  Q
    |||||||  |  || ||||| |   || | || || ||||||||| | |||||||| || |||||||||||  ||||  |||||||||| || |||||||    
T  33034528 tattctaaaatggtatgagtttacattctaaagaataaaagtgacgcttttgaaaaatttaaagaatggcatacacttgtagaaaatcagattggaacta 33034627  T
Q  244 aactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| || |||||||||||||||||    
T  33034628 aactgaaagtgttgagaactgacaatggcctgaagttcgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggaaaagaggtataaagaggcatagaaccgt 33034724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 310
Target Start/End: Original strand, 15946517 - 15946716
Alignment:
Q  113 ggaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaat 212  Q
    |||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||| || || || || |   ||| |||||| ||||||||  | |||||||| || |||||||    
T  15946517 ggaggttcatatttcatgtctattattgatgattattctagaagggtatgggtttacatttagaaaaataaaagtgatgcttttgaaaaatttaaagaat 15946616  T
Q  213 ggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcag 310  Q
    |||| |  ||  |||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||  |||||||| | || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  15946617 ggcataaacttgtagaaaatcatattggaactaaactgaaagtgttaagatttgacaatgtcttggagtttttttcagagcagtttaacgcgttttgcag 15946716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 340
Target Start/End: Original strand, 25682332 - 25682395
Alignment:
Q  277 agtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  25682332 agtttgtttcagaacagtttaatgagtttttcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 25682395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8758496 - 8758424
Alignment:
Q  227 aaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttg-tttcagagcagtttaa 298  Q
    ||||||||| |||||||||||    | |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||    
T  8758496 aaatcaaataggaactaaactttttgttttaagaactgacaatagcttggagtttggtttcagagcagtttaa 8758424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 24263034 - 24263384
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24263034 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtagaccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 24263133  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24263134 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 24263233  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24263234 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 24263333  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24263334 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 24263384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16883303 - 16882953
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16883303 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtagaccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 16883204  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883203 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 16883104  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883103 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 16883004  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16883003 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacacctcaacaaaat 16882953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21644407 - 21644063
Alignment:
Q  20 gtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggtt 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  21644407 gtgaagtttggtagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttccaagactcctacttatgtgggaggtt 21644308  T
Q  120 cctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca- 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||     
T  21644307 cctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacatttgaaaagtttaaggaatggcacac 21644208  T
Q  219 -ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaa 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  21644207 tctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagatctgacaatggcttggagtttgtttcagagcaatttaatgagttttgcaggtttaaa 21644108  T
Q  318 ggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  21644107 ggaatcaagaggcataggaccgtaccgaaaacaccgcaacaaaat 21644063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18412034 - 18411683
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18412034 catagagtaaagtttggtagtggcatgcatcattctagtaggctttttgagtatgtgcattcggatcttttgggtccttccaagactcctactcatgggg 18411935  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  18411934 gaggttcctattttctttccatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaaaaaaagtgacacattttaaaagtttaaggaatg 18411835  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatga-gttttgcag 310  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  18411834 acacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcaatttaatgattttttgcag 18411735  T
Q  311 gctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18411734 gttgaaaggaatcaagaggcataggaccgtaccgagaacaccgcaacaaaat 18411683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 9186856 - 9187206
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||    
T  9186856 catagagtaaagtttggtagtggtatgcatcattctagtaggcattttgagtatgtgcattcagacctttgggctccttccaagactcttactcatgggg 9186955  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  9186956 gaggttcctattttctttccatcattgatgattattctaggagagtgtgtgtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacatttgagaagtttaaggaatg 9187055  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  9187056 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaagggttaagaactaacaatggcctagagtttgtttcatagcaatttaatgagttttgcagg 9187155  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  9187156 ttgaaaggaatcaagaggcataggaccgtaccgagaacaccgcaacaaaat 9187206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 33 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21987277 - 21986946
Alignment:
Q  33 gtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttc 132  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21987277 gtggtatgcatcattctagtcggccttttgagtatgtacatccggacctttggggtccttccaagactcttactcatgggggatgttcctattttctttc 21987178  T
Q  133 tatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcacactc--atagaaaat 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||||||    
T  21987177 tatcattgatgattattctagaagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacatttgagaagtttaaggaatgacacactcttatagaaaat 21987078  T
Q  231 caaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggc 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  21987077 caaatgggaactaaactaaaagggttaagaactgacaatggcatggagtttgtttcagagcaatttaatgagttttgcaggttaaaatgaatcaagaggc 21986978  T
Q  331 atagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
    |||| |||||||| |||| ||| |||||||||    
T  21986977 ataggaccgtaccgagaataccacaacaaaat 21986946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 131 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4860991 - 4860758
Alignment:
Q  131 tctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcacactc--atagaaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||    
T  4860991 tctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacatttgaaaagtttaaggaatgacacactctcatagaaa 4860892  T
Q  229 atcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagag 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4860891 atcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggttgaaaggaatcaagag 4860792  T
Q  329 gcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4860791 gcatagaaccgtaccaagaacaccacaacaaaat 4860758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 49090064 - 49089732
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaa-gactcctactcatgag 112  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  49090064 catagagtaaagtttggtagtggtatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtacattcagacctttggggtccttccaaagactcttactcatggg 49089965  T
Q  113 ggaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaat 212  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||    
T  49089964 ggatgttcctattttctttccatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctt-gttttgaaaaacaaaagtgacatatttgagaagtttaaggaat 49089866  T
Q  213 ggcacactc--atagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcag 310  Q
    | |||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  49089865 gacacactctcatagaaaatcaactgggaactaaacgaaaagggttaagaactgacaatgacatggagtttatttcagagcaatttaatgagttttgcag 49089766  T
Q  311 gctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtacca 344  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49089765 gttaaaaggaatcaagaggcataggaccgtacca 49089732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 337
Target Start/End: Original strand, 25353131 - 25353432
Alignment:
Q  38 atgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttc-taagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatc 136  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | ||  |  |||||||| ||||||||| |||||  | ||||||    
T  25353131 atgcataaatctagtaggccttttgagtatgtccattcggatctttggggtccagcatcagt-taatactcatgggggaggttcatatttcgtgtctatc 25353229  T
Q  137 attgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaa 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |  |||| ||||||||||| |    
T  25353230 attgatgattattctagaagagtatgggtttacattctgaagaagaaaagtgatgcctttgaaaaattcaaagaatggaatacacttatagaaaatcaga 25353329  T
Q  235 tgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatag 334  Q
    | ||||||||||| ||||  || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  25353330 ttggaactaaactgaaagtgttgagaactgacaatagccttgagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatag 25353429  T
Q  335 aac 337  Q
    |||    
T  25353430 aac 25353432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Original strand, 25407202 - 25407497
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttc-taagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | ||  |   ||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  25407202 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccagcatcagt-taagactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgat 25407300  T
Q  146 tattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaatgggaacta 243  Q
    |||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  | |||||||| |||||||||||| |  ||||  |||||||||| || |||||||    
T  25407301 tattctagaagagtatgggtttacattctgaagaataaaagtgatgcttttgaaaaattcaaagaatgggatacacttgtagaaaatcagattggaacta 25407400  T
Q  244 aactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    |||| ||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  25407401 aactgaaagtgttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 25407497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 221 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24272184 - 24272042
Alignment:
Q  221 catagaaaatcaaatgg-gaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaagg 319  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  24272184 catagaaaatcaaatgaagaactaaactaaaagggttaagaaatgacaatggcctagagtttgtttcagagcaatttaatgagttttgcaggttaaaagg 24272085  T
Q  320 aatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24272084 aatcaagaggcatagaaccgtaccgagaacaccgcaacaaaat 24272042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3323208 - 3322886
Alignment:
Q  19 ggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggt 118  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |   |||    ||||||| |||||||    
T  3323208 ggtgaagtttgg-agtggggtgcataaatctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccagcatcgacgaagactcatgggggaggt 3323110  T
Q  119 tcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggca-- 216  Q
    || |||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  | |||||||| |||||||||||| |      
T  3323109 tcatatttcatgtctatcattgatgattattctagaagagtatgggtttacattctgaagaagaaaagtgatgcttttgaaaaattcaaagaatgggata 3323010  T
Q  217 cactcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaa 316  Q
    ||||  |||||||||| || || || ||||| ||||  || ||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    
T  3323009 cacttgtagaaaatcagattggtaccaaactgaaagtgttgagaactgacaatggcttggaatttgtttcagaacagtttaatgagttttgcagaaagaa 3322910  T
Q  317 aggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    ||| || |||||||||||||||||    
T  3322909 aggtataaagaggcatagaaccgt 3322886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44012866 - 44012628
Alignment:
Q  104 actcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagt 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |   || |||| || ||||||||| | |||||||| |    
T  44012866 actcatgagggaggttcatatttcatgtctattattgatgattattctagaagggtatgagtttacattatgaagaataaaagtgacgcttttgaaaaat 44012767  T
Q  204 tcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatga 301  Q
    | |||||||| ||  ||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44012766 ttaaagaatgacatacacttgtagaaaatcagattggaactaaactgaaagtgttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagaagtttaatga 44012667  T
Q  302 gttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    ||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||    
T  44012666 gttttgcaggaaaaaaggtataaagaggcatagaaccgt 44012628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 341
Target Start/End: Original strand, 7071839 - 7072135
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcct-actcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | |  | ||   ||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  7071839 tctagtaggccttttgagtatgttcatttggatctttggggtccagc-atcagtcaagactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgat 7071937  T
Q  146 tattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaacta 243  Q
    |||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |  || ||||| ||||| || || || |    
T  7071938 tattctagaagagtatgggtttacattctgaagaataaaagtgatgcctttgaaaaattcaaagaatgggatatacttatagagaatcagattggtacca 7072037  T
Q  244 aactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgta 341  Q
    |||| ||||  || |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||    
T  7072038 aactgaaagtgttgagaactaacaatggcttggagtttgtttcagaacagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgta 7072135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 2673931 - 2674281
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2673931 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtagaccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 2674030  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2674031 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgatacctttgaaaagttcaaagaatg 2674130  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2674131 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 2674230  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2674231 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 2674281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8515470 - 8515120
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8515470 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtagaccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 8515371  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8515370 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 8515271  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8515270 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 8515171  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8515170 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacacctcaacaaaat 8515120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32478716 - 32478366
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32478716 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtagaccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 32478617  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32478616 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 32478517  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32478516 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 32478417  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32478416 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacacctcaacaaaat 32478366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1309247 - 1308897
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  1309247 catagagtaaagtttggtagtggtatgcatcattctagtaagccttttgagtatgtgcattcagatctttggggtccttccaagactcctactcatgggg 1309148  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  1309147 gaggttcctattttctttcaatcattgatgattattctagaagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacatttgaaaagttgaaggaatg 1309048  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  1309047 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcaatttaatgagttttgcatg 1308948  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  1308947 ttgaaaagaatcaagaggcataggaccgtaccgagaacatcgcaacaaaat 1308897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 3325249 - 3325599
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||  |    
T  3325249 catagagtaaagtttggtagtggtatgcatcattctagtagaccttttgagtatgtacattcggacctttggggtccttccaagacactaactcatggag 3325348  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3325349 ggggttcctattttctttccatcattgatgattattctatgagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 3325448  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3325449 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaagggttaagaactgacaatggcccgaagtttgtttcagatcaatttaatgagttttgcagg 3325548  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3325549 ttgaaaggaatcaagaggcatatgaccgtaccgagaacaccgcaacaaaat 3325599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16262738 - 16262388
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  16262738 catagagtaaagtttggtagtggtatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtacattcagacctttggagtccttccaagactcttactcatgggg 16262639  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||  | |||||    
T  16262638 gaggttcctattttctttccatcattgatgattcttctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtaacacatttgagaagtttgaggaatg 16262539  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16262538 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaagggttaagaactgacaatggcatggagtttgtttcagagtaatttaatgagttttgcagg 16262439  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  16262438 ttaaaaggaatcaagaggcataggaccgtaccgagaacactgtaacaaaat 16262388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Original strand, 28490884 - 28491032
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  28490884 catagggtgaagtttggaagtgacatgcatcattctagtaggccttttgagaatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcgtgggg 28490983  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtg 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28490984 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtg 28491032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 29912346 - 29912055
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttc-taagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | | ||  |  |||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  29912346 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttagggtccagcatcagt-taatactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgat 29912248  T
Q  146 tattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggc--acactcatagaaaatcaaatgggaacta 243  Q
    |||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||||||| || |||||||    
T  29912247 tattctagaagagtatgtgtttacattctgaagaagaaaagtgatgcctttgaaaaattcaaagaatggtgtacacttgtagaaaatcagattggaacta 29912148  T
Q  244 aactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaa 336  Q
    |||| ||||  || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||    
T  29912147 aactgaaagtgttgagaactgacaatggtctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaa 29912055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Original strand, 54190296 - 54190591
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttc-taagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | | ||  |   ||||||| ||||||||| |||||  | |||||| ||||||||    
T  54190296 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtctagcatcagt-taagactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcgttgatgat 54190394  T
Q  146 tattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaatgggaacta 243  Q
    |||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  | |||||||| |||||||||||| |  ||||  |||||||||| || |||||||    
T  54190395 tattctagaagagtatgggtttacattctgaagaataaaagtgatgcttttgaaaaattcaaagaatgggatacacttgtagaaaatcagattggaacta 54190494  T
Q  244 aactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  54190495 aactgaaagtgttgagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 54190591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22624372 - 22624077
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcct-actcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |  | ||   ||||||| | ||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  22624372 tctagtaggccttttgagtatgttcattcagatctttggggtccagc-atcagtcaagactcatgggagaggttcatatttcatgtctatcattgatgat 22624274  T
Q  146 tattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaacta 243  Q
    |||||||| |||||||| || |   || |||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |  || ||||||||||| || |||||||    
T  22624273 tattctagaagagtgtgggtttacattctgaagaataaaagtgatgcctttgaaaaattcaaagaatgggatatacttatagaaaatcagattggaacta 22624174  T
Q  244 aactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    |||| ||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| || |||||| ||||||||||    
T  22624173 aactgaaagtgttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgtaggaagaaaggtataaagagggatagaaccgt 22624077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10097199 - 10096904
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |   |||    | ||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  10097199 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccagcatcgacgaagaatcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgatt 10097100  T
Q  147 attctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaa 244  Q
    ||||||| ||||| || || ||  || |||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||| | |  || ||||||||||| || || || ||    
T  10097099 attctagaagagtatgggttttcattctgaagaagaaaagtgatgcttttgaaaaattcaaggaatgggatatacttatagaaaatcagattggtaccaa 10097000  T
Q  245 actaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    ||| ||||  || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  10096999 actgaaagtgttgagaactgacaatggcttggagtttgtttcagaacagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 10096904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10204085 - 10203790
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |   |||    | ||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  10204085 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccaacatcgacgaagaatcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgatt 10203986  T
Q  147 attctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaa 244  Q
    ||||||| ||||| || || ||  || |||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||| | |  || ||||||||||| || || || ||    
T  10203985 attctagaagagtatgggttttcattctgaagaagaaaagtgatgcttttgaaaaattcaaggaatgggatatacttatagaaaatcagattggtaccaa 10203886  T
Q  245 actaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    ||| ||||  || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  10203885 actgaaagtgttgagaactgacaatggcttggagtttgtttcagaacagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 10203790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Original strand, 6305099 - 6305394
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |   |||    ||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  6305099 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccagcatcgacgaagactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgatt 6305198  T
Q  147 attctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaatgggaactaa 244  Q
    ||||||| ||||| || || |   || | || || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||| |  ||||  |||||||||| || || || ||    
T  6305199 attctagaagagtatgggtttacattctcaagaagaaaagtgatgcttttgaaaaattcaaggaatgggatacacttgtagaaaatcagattggtaccaa 6305298  T
Q  245 actaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    ||| ||||  || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  6305299 actgaaagtattgagaactgacaatggcttggagtttgtttcagaacagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 6305394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Original strand, 10898797 - 10899092
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |    |||   ||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  10898797 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctgtggggtccagcatcaactaagactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgatt 10898896  T
Q  147 attctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggc--acactcatagaaaatcaaatgggaactaa 244  Q
    ||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  | |||||||| ||||  ||||||   | |||  |||||||||| || ||||||||    
T  10898897 attctagaagagtatgggtttacattctgaagaataaaagtgatgcttttgaaaaattcatggaatgggttatacttgtagaaaatcagattggaactaa 10898996  T
Q  245 actaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    ||| ||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  10898997 actgaaagtgttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcaaagtagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 10899092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 337
Target Start/End: Original strand, 16459317 - 16459544
Alignment:
Q  112 gggaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaa 211  Q
    ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  |||||||||| ||||| |||    
T  16459317 gggaggttcatatttcatgtctatcattgatgattattctagaagagtatgggtttacattctgaagaagaaaagtgatgcctttgaaaaattcaaggaa 16459416  T
Q  212 tggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgca 309  Q
    ||| | |  ||  |||||||||| || ||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16459417 tgggatatacttgtagaaaatcagattggaactaaactgaaagtgttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgca 16459516  T
Q  310 ggctgaaaggaatcaagaggcatagaac 337  Q
    ||  |||||| || ||||||||||||||    
T  16459517 ggaagaaaggtataaagaggcatagaac 16459544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 10611170 - 10610882
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttc-taagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||  |   ||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  10611170 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtcctgcatcagt-taagactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgat 10611072  T
Q  146 tattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaacta 243  Q
    |||||||| ||||| || || |   || | |  || ||||||||  | |||||||| |||||||||||| | |  ||  |||||||||| || |||||||    
T  10611071 tattctagaagagtatgggtttacattctaaggaataaaagtgatgcttttgaaaaattcaaagaatgggatatacttgtagaaaatcagattggaacta 10610972  T
Q  244 aactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcata 333  Q
    |||| ||||  || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| || ||||||||||    
T  10610971 aactgaaagtgttgagaactgacaatggtctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgtaggaagaaaggtataaagaggcata 10610882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 47881290 - 47881019
Alignment:
Q  38 atgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttc-taagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatc 136  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | | ||  |   ||||||| ||||||||| |||||  | |||||     
T  47881290 atgcataaatctagtaggccttttgagtatgttaattcggatctttggggtccagcatcagt-taaaactcatgggggaggttcatatttcatgtctatt 47881192  T
Q  137 attgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaa 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  || |   || |||| || ||||||||| | |||||||| || |||||||||||  ||||  |||||||| | |    
T  47881191 attgatgattattctagaagagtataggtttacattctgaagaataaaagtgacgcttttgaaaaatttaaagaatggcatacacttgtagaaaattaga 47881092  T
Q  235 tgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttg 307  Q
    | | ||||||||| ||||  || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47881091 ttgaaactaaactgaaagtgttgagaaccgacaatggcctgtagtttgtttcagagcagtttaatgagttttg 47881019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 31398703 - 31399053
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31398703 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtagaccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 31398802  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31398803 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 31398902  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31398903 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 31399002  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31399003 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacactgcaacaaaat 31399053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27448199 - 27447849
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27448199 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 27448100  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27448099 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagtttaaagaatg 27448000  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27447999 gcacactctcatagaaaatcaaattggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggtctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 27447900  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27447899 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccgagaacaccgcaacaaaat 27447849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33789732 - 33789382
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  33789732 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtagaccttttgagtatgtgcattcggatctttggggcccttctaagactcctactcatgggg 33789633  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33789632 gaggttcctattttctttctatcattgatgattactctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 33789533  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33789532 gcacaccctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 33789433  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33789432 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 33789382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 37558313 - 37558663
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  37558313 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtagaccttttgagtatgtgcattcggatctttgggctccttctaagactcctactcatgggg 37558412  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37558413 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgatacctttgaaaagttcaaagaatg 37558512  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37558513 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 37558612  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37558613 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacacctcaacaaaat 37558663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43595497 - 43595147
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43595497 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtaggtcttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 43595398  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43595397 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagtttaaagaatg 43595298  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43595297 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 43595198  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  43595197 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccgagaacaccacaacaaaat 43595147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43628291 - 43627941
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43628291 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtaggtcttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 43628192  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43628191 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagtttaaagaatg 43628092  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43628091 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 43627992  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  43627991 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccgagaacaccacaacaaaat 43627941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 24557295 - 24557645
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  24557295 catagggtcaagtttgatagtggtatgcattattctagtaagccttttgagtatgtacattcggacctttggggtccttctaagactcttactcatggag 24557394  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  24557395 ggggttcctattttctttccatcattgatgattattctaggagagtgtgagtcgttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgagaagtttaaggaatg 24557494  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
     ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24557495 acacactctcatagaaaatgaaatgggaactaaactaaaagggttgagaactgacaatggcctggagtttgtttaagagcaatttaatgagttttgcagg 24557594  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  24557595 ttgaaaggaatcaagaggcataggaccgtactgagaacaccgcaacaaaat 24557645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 24598327 - 24598677
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  24598327 catagggtcaagtttgatagtggtatgcattattctagtaagccttttgagtatgtacattcggacctttggggtccttctaagactcttactcatggag 24598426  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  24598427 ggggttcctattttctttccatcattgatgattattctaggagagtgtgagtcgttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgagaagtttaaggaatg 24598526  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
     ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24598527 acacactctcatagaaaatgaaatgggaactaaactaaaagggttgagaactgacaatggcctggagtttgtttaagagcaatttaatgagttttgcagg 24598626  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  24598627 ttgaaaggaatcaagaggcataggaccgtactgagaacaccgcaacaaaat 24598677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28836668 - 28836327
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| |         ||||||  |    
T  28836668 catagagtaaagtttggtagtggtatgcatcattctagtagacgttttaagtatgtacattcggacctttggggttcttcca---------ctcatggag 28836578  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||    
T  28836577 ggggttcctattttcttttcatcattgatgattattctacaagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaattgacacctttgagaagtttaaggaatg 28836478  T
Q  214 gcacactc--atagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28836477 gcacactctcatagaaaatcaaatgggatctaaactaaaaggattgagaactgataatggcctggagtttgtttcagagcaatttaatgagttttgcagg 28836378  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     |||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  28836377 ttgaatggattcaagaggcataggactgtaccgagaacaccgcaacaaaat 28836327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 337
Target Start/End: Original strand, 25447275 - 25447567
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcct-actcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgat 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  | |  | ||   ||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  25447275 tctagtaggtcttttgagtatgttcattcggatctttggggttcagc-atcagtcaagactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgat 25447373  T
Q  146 tattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaatgggaacta 243  Q
    |||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||    |||||||| |||||||||||| |  ||||  |||||||||| || |||||||    
T  25447374 tattctagaagagtatgggtttacattctgaagaataaaagtgatggttttgaaaaattcaaagaatgggatacacttgtagaaaatcagattggaacta 25447473  T
Q  244 aactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaac 337  Q
    |||| ||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||    
T  25447474 aactgaaagtgttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagtttttcaggaagaaaggtataaagaggcatagaac 25447567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31302645 - 31302307
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| | |||||||  ||    
T  31302645 cataaggttaagtttggatgtggcatgcatcattctagtaggccctttgagtatgtgcatttggatttttggggtccttgtaagacacttactcatatgg 31302546  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||              ||    ||  | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  31302545 gaggttcctattttctttttatca--------------ag----gtacgggtctttcttttgaaaaataaaagtggcacctttgaaaagtttacaaaatg 31302464  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgt-------ttcagagcagtttaatgagtt 304  Q
    |||||  || |||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||||||| | |||||| |||  ||||| |       ||||||  ||||||||||| |    
T  31302463 gcacacccttatagaaaatcaaatcggaacgaaattgaaaactttaagaatttacaatgtccttgagtttttatttttcttcagaaaagtttaatgagat 31302364  T
Q  305 ttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
    ||||| | | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  31302363 ttgcatgttaaaaggtatcaagaggcata-aaccgtaccaagaacaccgcaataaaat 31302307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31334936 - 31334833
Alignment:
Q  34 tggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttct 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  31334936 tggcatgcatcattctagtaggtcctttgagtatgtgcatttggattttgggggtccttctaagacacttactcatatgggaggttcctattttcttttt 31334837  T
Q  134 atca 137  Q
    ||||    
T  31334836 atca 31334833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31334824 - 31334619
Alignment:
Q  164 gtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaa 261  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||||| |||  ||  ||||||||||||||||||| ||| | |||  |||||| |    
T  31334824 gtctttcttttgaaaaataaaagtggcacctttgaaaagtttacaaaatggtacaaccttgtagaaaatcaaatgggaacgaaattgaaaactttaagca 31334725  T
Q  262 ctgacaatggcc-tgaagttt--gtttc---agagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgca 355  Q
     | |||||| || |||| |||   ||||    ||| |||| |||||| |||||| | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31334724 tttacaatgtccttgaatttttattttctttggagaagttgaatgagatttgcatgttaaaaggtatcaagaggcata-aaccgtaccaagaacgccgca 31334626  T
Q  356 acaaaat 362  Q
    | |||||    
T  31334625 ataaaat 31334619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19347654 - 19347304
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19347654 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtagaccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 19347555  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19347554 gaggttcctattttctttctatcattgatgattactctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 19347455  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19347454 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 19347355  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19347354 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 19347304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25394262 - 25393912
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25394262 catagagtaaagtttggtagtggcatgtatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttccaagactcctacttatgagg 25394163  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  25394162 gaggttcctattttctttccatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacatttgaaaagtttaaggaatg 25394063  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25394062 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttgagaactgacaatggcctagagtttgtttcagagcaatttaatgagttttgcagg 25393963  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25393962 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccgagaacaccgcaacaaaat 25393912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Original strand, 2737993 - 2738288
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |   |||    ||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  2737993 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccagcatcgacgaagactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgatt 2738092  T
Q  147 attctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaa 244  Q
    ||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |  || ||||||||||| || || || ||    
T  2738093 attctagaagagtatgggtttacattctgaagaataaaagtgatgcctttgaaaaattcaaagaatggaatatacttatagaaaatcagattggtaccaa 2738192  T
Q  245 actaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    ||| ||||  || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  2738193 actgaaagtgttgagaactgacaatggcttggagtttgtttcagaacagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 2738288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 340
Target Start/End: Original strand, 17933884 - 17934167
Alignment:
Q  59 tttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttc-taagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggaga 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | ||  |  |||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17933884 tttgagtatgttcattcggatctttggggtccagcatcagt-taatactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgattattctagaaga 17933982  T
Q  158 gtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtt 255  Q
    || || || |   || |||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |  ||||  |||||||||| || || |||||||| ||||  |    
T  17933983 gtatgggtttacattctgaagaagaaaagtgatgcctttgaaaaattcaaagaatggaatacacttgtagaaaatcagattgggactaaactgaaagtgt 17934082  T
Q  256 taagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  17934083 tgagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 17934167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Original strand, 39684036 - 39684330
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |   |||    ||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  39684036 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccagcatcgacgaagactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgatt 39684135  T
Q  147 attctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaatgggaactaa 244  Q
    ||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||| |  ||||  |||||||||| || || || ||    
T  39684136 attctagaagagtatgggtttacattctgaagaagaaaagtgatgcttttgaaaaattcaaggaatgggatacacttgtagaaaatcagattggtaccaa 39684235  T
Q  245 actaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    ||| ||  ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  39684236 actgaagtgttga-gaactgacaatggcttgaagtttgtttcagaacagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 39684330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Original strand, 45569178 - 45569473
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |   |||    ||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  45569178 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccagcatcgacgaagactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgatt 45569277  T
Q  147 attctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaatgggaactaa 244  Q
    ||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  | |||||||| |||||||||||| |  ||||  |||||||||| || |  || ||    
T  45569278 attctagaagagtatgggtttacattctgaagaagaaaagtgatgcttttgaaaaattcaaagaatgggatacacttgtagaaaatcagattgataccaa 45569377  T
Q  245 actaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    ||| ||||  || ||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  45569378 actgaaagtgttgagaactgacaatggcttggaatttgtttcagaacagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 45569473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20053153 - 20052858
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttc-taagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | ||  |   ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  20053153 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccagcatcagt-taagactcatgagggaggttcatatttcatgtctatcattgatgat 20053055  T
Q  146 tattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaacta 243  Q
    |||||||| ||||| || || |   || |||| || || |||||  | |||||||| || ||||||||| | |  ||  |||||||||| || |||||||    
T  20053054 tattctagaagagtatgggtttacattctgaagaagaagagtgatgcttttgaaaaatttaaagaatgggatatacttgtagaaaatcagattggaacta 20052955  T
Q  244 aactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    |||| ||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| || |||||||||| ||||||    
T  20052954 aactgaaagtgttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagtttagcaggtaaaaaggtataaagaggcataaaaccgt 20052858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22715562 - 22715335
Alignment:
Q  112 gggaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaa 211  Q
    ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  |||||||||| ||||| |||    
T  22715562 gggaggttcatatttcatgtctatcattgatgattattctagaagagtatgggtttacattctgaagaagaaaagtgatgcctttgaaaaattcaatgaa 22715463  T
Q  212 tggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgca 309  Q
    ||| | |  ||  |||||||||| || ||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22715462 tggtatatacttgtagaaaatcagattggaactaaactgaaagtgttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgca 22715363  T
Q  310 ggctgaaaggaatcaagaggcatagaac 337  Q
    ||  |||||| || ||||||||||||||    
T  22715362 ggaagaaaggtataaagaggcatagaac 22715335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 14739283 - 14739633
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14739283 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcagatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 14739382  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14739383 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 14739482  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14739483 gcacactctcatagaaaatcaaatggaaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggtctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 14739582  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14739583 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccgagaacaccgcaacaaaat 14739633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 33332787 - 33333137
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  33332787 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtagaccttttgagtatgtgcattcagatctttggggtccttctaagagtcctactcatgggg 33332886  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33332887 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 33332986  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33332987 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 33333086  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33333087 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacacctcaacaaaat 33333137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 24433032 - 24433381
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||  |    
T  24433032 catagagtaaagtttggtagtggtatggatcatttaagtagaccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccttccaagacacttactcatggtg 24433131  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  24433132 gaggttcctattttctttccattattgatgattattctatgagagtgtgggtcttt-tttggaaaaacaaaagtgacatctttgagaagtttaatgaatg 24433230  T
Q  214 gcacactc--atagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  24433231 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttgagaagtgataatggcctgaagtttgtttcaaagcaatttaatgagttttgtagg 24433330  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24433331 ttgaaataaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccacaacaaaat 24433381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Original strand, 25943457 - 25943752
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  |      |   ||||||| ||||||||| |||||  | |||||||| |||||||    
T  25943457 tctagtaggccttttaagtatattcattcggatctttggggtccagcatctgttaagactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcatcgatgatt 25943556  T
Q  147 attctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaa 244  Q
    ||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |  || ||||||||||| || ||||||||    
T  25943557 attctagaagagtatgggtttacattctgaagaataaaagtgatgcctttgaaaaattcaaagaatggaatatacttatagaaaatcagattggaactaa 25943656  T
Q  245 actaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  25943657 actaaaagtgttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgtaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 25943752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Original strand, 13880527 - 13880822
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |   |||    | ||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  13880527 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccagcatcgacgaagaatcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgatt 13880626  T
Q  147 attctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaa 244  Q
    ||||||| ||||| || || ||  || |||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||| | |  || ||||||||||| || || || ||    
T  13880627 attctagaagagtatgggttttcattctgaagaagaaaagtgatgcttttgaaaaattcaaggaatgggatatacttatagaaaatcagattggtaccaa 13880726  T
Q  245 actaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    ||| ||||  || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  13880727 actgaaagtgttgagaactgacaatggcttggagtttgtttcagaacagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 13880822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 35204456 - 35204164
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |   |||    ||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  35204456 tctagtagaccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccagcatcgacgaagactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgatt 35204357  T
Q  147 attctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaa 244  Q
    ||||||| ||||| ||  | |   || |||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||  | |  || ||||||||||| || || || ||    
T  35204356 attctagaagagtatggatttacattatgaagaataaaagtgatgcctttgaaaaattcaaagaatgaaatatacttatagaaaatcagattggtaccaa 35204257  T
Q  245 actaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaac 337  Q
    ||| ||||  || ||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||    
T  35204256 actgaaagtgttgagaactgacaatggcttggaatttgtttcagaacagtttaatgagttttgcagaaagaaaggtataaagaggcatagaac 35204164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17693248 - 17692953
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |    |     ||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  17693248 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggaactttggggtccaacatcaaaaaagactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgatt 17693149  T
Q  147 attctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcacactcat--agaaaatcaaatgggaactaa 244  Q
    ||||||| ||||| || || |   || |||| || || |||||  | |||||||| |||||||||||| |||  | |  ||||||| | || ||||||||    
T  17693148 attctagaagagtatgggtgtacattctgaagaagaagagtgatgcttttgaaaaattcaaagaatgggacatacttgcagaaaattagattggaactaa 17693049  T
Q  245 actaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    ||  ||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  17693048 acggaaagtgttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcagaatagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 17692953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22349364 - 22349069
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttc-taagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgat 145  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | | || |    ||||||| || |||||| |||||  | || || |||||||||    
T  22349364 tctagtaggccttttgagtatgtttattcggatctttggggtccagcatcagtc-aagactcatggggaaggttcatatttcatgtcaattattgatgat 22349266  T
Q  146 tattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggc--acactcatagaaaatcaaatgggaacta 243  Q
    |||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  | ||||||||  |  || ||||||  | |||  |||||||||| || |||||||    
T  22349265 tattctagaagagtatgggtttacattctgaagaataaaagtgatgcttttgaaaaaatttaaaaatggcatatacttgtagaaaatcagattggaacta 22349166  T
Q  244 aactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    |||| ||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| || |||||| ||||||||||    
T  22349165 aactgaaagtgttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcaaagcagtttaatgagttttgcaggaaaaaaggtataaagaggaatagaaccgt 22349069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24077295 - 24077129
Alignment:
Q  20 gtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgaggga--gg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||   |||||||| ||||        
T  24077295 gtgaagtttggaagtggcatgcattattctagtaaaccctttgagtatgtgcaatggaatatttggggtccttctaagacaattactcatgggggaacca 24077196  T
Q  118 ttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaa 184  Q
    |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||    
T  24077195 ttcctacttcttatctatcattgatgattattctaggagggtatgagtatttattttgagaaacaaa 24077129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 9226115 - 9226462
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9226115 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 9226214  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9226215 gaggtttctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtct---ttttgaaaaacaaaagtgatacctttgaaaagttcaaagaatg 9226311  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9226312 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 9226411  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9226412 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 9226462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 30 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18858936 - 18858602
Alignment:
Q  30 ggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttct 129  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18858936 ggagtgacgtgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatggggtaggttcctattttct 18858837  T
Q  130 ttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18858836 ttctatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcacactctcatagaa 18858737  T
Q  228 aatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaaga 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18858736 aatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggttgaaaggaatcaaga 18858637  T
Q  328 ggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858636 ggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 18858602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 16625704 - 16626054
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  16625704 catagagtaaagtttggtagtggtatgcatcattctaataggccttttgagtatgtacattcggacctttggggtccttccaagactcttactcatgggg 16625803  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  16625804 gatgttcctattttctttccatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacatttgagaagtttaaggaatg 16625903  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16625904 acacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaatgtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcaatttaatgagttttgcagg 16626003  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16626004 tttaaaggaatcaagaggcataggaccgtaccgagaacactgcaacaaaat 16626054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5146284 - 5145934
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5146284 catagagtaaagtttggtagtggtatgcatcattctagtaggccttttgagtatgttcattcggacctttggggtccttccaagactcttactcatgagg 5146185  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  5146184 gatgttcctattttctttccatcattgatgattattctagaagagtttgggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacatttgagaagtttaaggaatg 5146085  T
Q  214 gcacactc--atagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  5146084 gcacactcttatagaaaatcaaatgggaactaatctaaaagggttaagaactgacaatggcttggagtttatttcagagcaatttaatgagttttgcacg 5145985  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     | |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5145984 ttaaaaggaatcaagaggcatatgaccgtaccgagaacaccgcaacaaaat 5145934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Original strand, 4567127 - 4567422
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |    | |   ||||||| ||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||    
T  4567127 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttagggtccaacatcaagttaaactcatgggggaggttcatatttcatgtctattattgatgatt 4567226  T
Q  147 attctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaatgggaactaa 244  Q
    ||||||| || || || || |   || |||| || ||||||||| | |||||||| || |||||||||||  ||||  |||||||||| || ||||||||    
T  4567227 attctagaagggtatgggtttacattctgaagaataaaagtgacgcttttgaaaaatttaaagaatggcatacacttgtagaaaatcagattggaactaa 4567326  T
Q  245 actaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    | | ||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||| || ||| |||||||||||||    
T  4567327 attgaaagtgttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgtaggaaaagaggtataaaggggcatagaaccgt 4567422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 336
Target Start/End: Original strand, 15314106 - 15314397
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcct-actcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgat 145  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  | | || |    ||| ||| ||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  15314106 tctagtaggccttttgagtaggttcattcggatcttttgggtccagc-atgagttaagacttatgggggaggttcatatttcacgtctatcattgatgat 15314204  T
Q  146 tattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaacta 243  Q
    || ||||| ||||| || || | | ||||||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||| | |  ||  |||||||||| || |||||||    
T  15314205 tactctagaagagtatgggtttatattttgaagaataaaagtgatgcttttgaaaaattcaaggaatgggatatacttgtagaaaatcagattggaacta 15314304  T
Q  244 aactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaa 336  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||    
T  15314305 aactgaaagtgttaagaactgacaatggccaggagtttgttttagagcagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaa 15314397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 307
Target Start/End: Original strand, 16634279 - 16634541
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatt 146  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |    | |    |||||| ||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||    
T  16634279 tctagtaggccttttgtgtatgttcattcggacctttggggtccaacatcaattaaacctcatgggggaggttcatatttcatgtctattattgatgatt 16634378  T
Q  147 attctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaatgggaactaa 244  Q
    ||||||| || || || || |   || |||| || ||||||||| | |||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||| | || | ||||||    
T  16634379 attctagaagggtatgggtttacattctgaagaataaaagtgacgcttttgaaaaatttaaagaatggcatacacttatagaaaattagattgaaactaa 16634478  T
Q  245 actaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttg 307  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16634479 actgaaagtgttaagaactgacaatggtctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttg 16634541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 310
Target Start/End: Original strand, 47564607 - 47564815
Alignment:
Q  104 actcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagt 203  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||| || || || || |   || |||| || ||||||||| | |||||||| |    
T  47564607 actcatgggggaggttcatatttcatgtctattattgatgattattctagaagggtatgggtttacattctgaagaataaaagtgacgcttttgaaaaat 47564706  T
Q  204 tcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatga 301  Q
    | |||||||| ||  ||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||  || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47564707 ttaaagaatgacatacacttgtagaaaatcagattggaactaaactgaaagtgttgagaacttacaatgacctgaagtttgtttcagagcagtttaatga 47564806  T
Q  302 gttttgcag 310  Q
    |||||||||    
T  47564807 gttttgcag 47564815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 51995346 - 51995289
Alignment:
Q  223 tagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtt 280  Q
    |||||||| | || ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  51995346 tagaaaattatataggaactaaactcaaagttttaagaactaacaatggtctgaagtt 51995289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41396615 - 41396265
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41396615 catagggtgaagtttggaagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgggg 41396516  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41396515 gaggttcctattttctttttgtcattgacgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaacgtgatacctttgaaaagttcaaagaatg 41396416  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41396415 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 41396316  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41396315 ttgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccgagaacaccgcaacaaaat 41396265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 47100529 - 47100879
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||  |    
T  47100529 catagagtaaagtttggtagtggtatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtacattcggacctttgcggtccttccaagacacttactcatggag 47100628  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||    
T  47100629 ggggttcctattttctttccatcattgatgattattctaggagagtgtgggtctttgttttgaaaaacaaaagtaacacctttgagaagtttaaggaatg 47100728  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47100729 gcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaagggttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcaatttaatgagttttgcagg 47100828  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
     | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  47100829 ttaaaaggaatcaagaggcataggaccgtaccgagaacaccgcaataaaat 47100879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Original strand, 9523516 - 9523811
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |   |      ||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  9523516 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccagcatcggtcaagactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgatt 9523615  T
Q  147 attctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaa 244  Q
    ||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |  || ||||||||||| || ||||||||    
T  9523616 attctagaagagtatgggtttacattctgaagaataaaagtgatgcctttgaaaaattcaaagaatgggatatacttatagaaaatcagattggaactaa 9523715  T
Q  245 actaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  9523716 actgaaagttttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 9523811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2397616 - 2397326
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttc-taagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | ||  |   ||||||| ||||||||| |||||     |||| |||||||||    
T  2397616 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccagcatcagt-taaaactcatgggggaggttcatattt-----ctattattgatgat 2397523  T
Q  146 tattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggca--cactcatagaaaatcaaatgggaacta 243  Q
    |||||||| ||||| || || |   || |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||  ||||  |||||||||| ||  ||||||    
T  2397522 tattctagaagagtatgggtttacattctgaagaataaaagtgacacttttgaaaaatttaaagaatggcatacacttgtagaaaatcagattagaacta 2397423  T
Q  244 aactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    |||| ||||  || |||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||    
T  2397422 aactgaaagtgttgagaactaataatggcatggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggaaaaaaggtataaagaggcatagaaccgt 2397326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 306
Target Start/End: Original strand, 9843247 - 9843314
Alignment:
Q  239 aactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagtttt 306  Q
    |||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  9843247 aactaaactagaagatttaaggattgacaatgtcctgaaatttgtgtcatagcagtttaatgattttt 9843314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 889 - 534
Alignment:
Q  9 agaagcatagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactca 108  Q
    |||| ||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  889 agaaacatagagtaaagtttggtagcggtatgcatcattctagtaggccttttaagtatgtacattcagacctatggggtccttccaagactcttactca 790  T
Q  109 tgagggaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaa 208  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||     
T  789 tgggggatgttcctattttctttccatcattgatgattattcttggagagtgggggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacatttgtgaagtttaag 690  T
Q  209 gaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagtttt 306  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  689 gaatggcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaagggttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcaatttaatgagtttg 590  T
Q  307 gcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  589 gcaggttaaaaggaatcaagaggcatacgaccgtaccgagaacaccgcaacaaaat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9045 - 8690
Alignment:
Q  9 agaagcatagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactca 108  Q
    |||| ||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9045 agaaacatagagtaaagtttggtagcggtatgcatcattctagtaggccttttaagtatgtacattcagacctatggggtccttccaagactcttactca 8946  T
Q  109 tgagggaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaa 208  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||     
T  8945 tgggggatgttcctattttctttccatcattgatgattattcttggagagtgggggtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacatttgtgaagtttaag 8846  T
Q  209 gaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagtttt 306  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  8845 gaatggcacactctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaagggttaagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcaatttaatgagtttg 8746  T
Q  307 gcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8745 gcaggttaaaaggaatcaagaggcatacgaccgtaccgagaacaccgcaacaaaat 8690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 35386 - 35036
Alignment:
Q  14 catagggtgaagtttgggagtggcatgcatcattctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcctactcatgagg 113  Q
    ||||| || |||||| | ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||    
T  35386 catagtgttaagttttgtagtggtatgcatcattaaagtagaccttttgagtatgtgcactcggatctttggggtccttccaagacacatactcatgggg 35287  T
Q  114 gaggttcctattttctttctatcattgatgattattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||     
T  35286 gaggttcctattttctttctatcattaatgattattctaggagagtgtggatctttgttttaaaaaacaaaagtgacacctttaataagtttaaggaatt 35187  T
Q  214 gcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcagg 311  Q
    |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |      
T  35186 gcacactctcataaaaaattaaatgggaactaaactgaaaggtttgtgaattgacattggcctggagtttgtttcagagcaatttaatcagttttggata 35087  T
Q  312 ctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 362  Q
      |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  35086 tagaaaggaatcaagaggaacatgaccgtaccaagaacaccgcaacaaaat 35036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 49599 - 49304
Alignment:
Q  47 tctagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttctaagactcc-tactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |  | ||  |||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  49599 tctagtaggccttttgagtatgttcattcggatctttggggtccagc-atcagtcaatactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgat 49501  T
Q  146 tattctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaacta 243  Q
    |||||||| ||||| ||||| |   || |||| || ||||||||  | |||||||| |||||||||||| | |  || ||||||||||| || |||||||    
T  49500 tattctagaagagtatgagtttacattctgaagaataaaagtgatgcttttgaaaaattcaaagaatgggatatacttatagaaaatcagattggaacta 49401  T
Q  244 aactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  49400 aactaaaagtgttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcatagcagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtataaagaggcatagaaccgt 49304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 340
Target Start/End: Original strand, 18116 - 18409
Alignment:
Q  49 tagtaggccttttgagtatgtgcattcggatctttggggtccttc-taagactcctactcatgagggaggttcctattttctttctatcattgatgatta 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | | ||  |   ||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||    
T  18116 tagtaggccttttaagtatgttcattcggatctttggggtccagcatcagt-taaaactcatgggggaggttcatatttcatgtctatcattgatgatta 18214  T
Q  148 ttctaggagagtgtgagtctttgttttgaaaaacaaaagtgacacctttgaaaagttcaaagaatggcaca--ctcatagaaaatcaaatgggaactaaa 245  Q
    |||||| ||||| ||||| |   || |||| || ||||||||  | |||||||| || ||||||||||| |  ||  |||||||||| || |||||||||    
T  18215 ttctagaagagtatgagtttacattctgaagaataaaagtgatgcttttgaaaaatttaaagaatggcatatacttgtagaaaatcagattggaactaaa 18314  T
Q  246 ctaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaatcaagaggcatagaaccgt 340  Q
    || ||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || || |||||||||||||||||    
T  18315 ctgaaagtgttgagaactgacaatggcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggaaaaagggtataaagaggcatagaaccgt 18409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1359 - 1245
Alignment:
Q  223 tagaaaatcaaatgggaactaaactaaaaggtttaagaactgacaatggcctgaagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggctgaaaggaat 322  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  1359 tagaaaatcagattggaactaaactgaaagtgttgagaactgacaatagcctggagtttgtttcagagcagtttaatgagttttgcaggaagaaaggtat 1260  T
Q  323 caagaggcatagaac 337  Q
     ||||||||||||||    
T  1259 aaagaggcatagaac 1245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University