View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3954_high_3 (Length: 495)

Name: NF3954_high_3
Description: NF3954
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3954_high_3
NF3954_high_3
[»] scaffold0080 (6 HSPs)
scaffold0080 (27-475)||(11150-11598)
scaffold0080 (31-475)||(30829-31273)
scaffold0080 (31-475)||(36294-36739)
scaffold0080 (28-422)||(53635-54029)
scaffold0080 (253-468)||(50044-50259)
scaffold0080 (27-113)||(13805-13891)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (27-475)||(30311495-30311943)
chr8 (27-475)||(15535365-15535813)
chr8 (27-475)||(22131392-22131840)
chr8 (28-467)||(17672375-17672814)
chr8 (27-475)||(22041809-22042257)
chr8 (27-469)||(32602132-32602575)
chr8 (28-475)||(20016615-20017062)
chr8 (28-475)||(18858559-18859006)
chr8 (28-475)||(22118527-22118974)
chr8 (28-475)||(22127311-22127758)
chr8 (27-475)||(21164889-21165337)
chr8 (27-475)||(19979949-19980397)
chr8 (28-467)||(19482424-19482855)
chr8 (28-469)||(21252932-21253373)
chr8 (28-469)||(21782772-21783213)
chr8 (28-469)||(21392213-21392654)
chr8 (28-469)||(21786707-21787148)
chr8 (49-469)||(23652029-23652449)
chr8 (29-469)||(19864446-19864887)
chr8 (28-475)||(22422244-22422691)
chr8 (29-469)||(22375806-22376246)
chr8 (31-469)||(22246788-22247226)
chr8 (113-469)||(21920185-21920541)
chr8 (27-434)||(31414820-31415227)
chr8 (31-466)||(23656918-23657353)
chr8 (27-469)||(29301777-29302219)
chr8 (28-292)||(22522711-22522975)
chr8 (27-469)||(21323630-21324071)
chr8 (28-466)||(23887015-23887457)
chr8 (49-469)||(20008294-20008714)
chr8 (223-469)||(22988718-22988964)
chr8 (49-469)||(21927415-21927836)
chr8 (311-475)||(19114672-19114836)
chr8 (28-180)||(21781539-21781691)
chr8 (31-469)||(20394488-20394926)
chr8 (30-228)||(22989274-22989472)
chr8 (27-455)||(16269575-16270003)
chr8 (27-452)||(28982916-28983341)
chr8 (27-452)||(28988135-28988560)
chr8 (27-455)||(4984044-4984472)
chr8 (31-425)||(31569198-31569591)
chr8 (27-455)||(27356538-27356966)
chr8 (58-469)||(19861423-19861834)
chr8 (27-469)||(22052851-22053293)
chr8 (110-455)||(6605660-6606005)
chr8 (27-466)||(20390090-20390516)
chr8 (28-449)||(16875447-16875868)
chr8 (49-233)||(19984404-19984588)
chr8 (27-242)||(22061030-22061245)
chr8 (28-452)||(21848689-21849113)
chr8 (27-90)||(22030470-22030533)
chr8 (28-449)||(20650707-20651128)
chr8 (28-158)||(23155394-23155524)
chr8 (154-455)||(14567144-14567445)
chr8 (27-157)||(22373168-22373298)
chr8 (28-135)||(16414413-16414520)
chr8 (28-170)||(22436590-22436732)
chr8 (28-134)||(23902487-23902593)
chr8 (174-269)||(19869881-19869976)
chr8 (28-135)||(21194892-21194999)
chr8 (28-135)||(24932176-24932283)
chr8 (341-449)||(21195204-21195312)
chr8 (256-449)||(23155620-23155813)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (27-475)||(21233711-21234159)
chr1 (27-475)||(17042995-17043443)
chr1 (28-467)||(33389010-33389449)
chr1 (28-475)||(21838881-21839328)
chr1 (28-475)||(21832233-21832680)
chr1 (28-468)||(51331474-51331914)
chr1 (40-475)||(24792609-24793044)
chr1 (28-467)||(16348576-16349016)
chr1 (28-475)||(19108299-19108746)
chr1 (40-475)||(22503282-22503717)
chr1 (28-467)||(41351649-41352082)
chr1 (27-469)||(22360224-22360666)
chr1 (28-469)||(430097-430538)
chr1 (27-468)||(20140021-20140462)
chr1 (49-469)||(50618400-50618820)
chr1 (28-469)||(21750877-21751318)
chr1 (28-466)||(21862354-21862792)
chr1 (28-339)||(16378162-16378473)
chr1 (27-451)||(19661116-19661540)
chr1 (49-469)||(21743554-21743974)
chr1 (27-455)||(48424855-48425283)
chr1 (27-455)||(52987723-52988151)
chr1 (31-455)||(24097587-24098011)
chr1 (27-455)||(37679031-37679459)
chr1 (23-430)||(19856281-19856688)
chr1 (27-475)||(20854740-20855188)
chr1 (27-455)||(20296363-20296791)
chr1 (49-434)||(20833902-20834287)
chr1 (27-455)||(31537977-31538405)
chr1 (313-475)||(21026104-21026266)
chr1 (27-469)||(20938043-20938485)
chr1 (27-469)||(38910806-38911248)
chr1 (196-317)||(20944119-20944240)
chr1 (27-455)||(21952860-21953288)
chr1 (25-269)||(41310694-41310938)
chr1 (28-449)||(20829373-20829794)
chr1 (28-158)||(35930806-35930936)
chr1 (28-158)||(41215837-41215967)
chr1 (307-469)||(41308610-41308772)
chr1 (28-443)||(20927017-20927432)
chr1 (28-158)||(20527301-20527431)
chr1 (392-469)||(16378079-16378156)
chr1 (28-149)||(22133735-22133856)
chr1 (28-89)||(21200935-21200996)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (27-468)||(16805094-16805535)
chr3 (28-475)||(16637308-16637755)
chr3 (28-475)||(48426982-48427429)
chr3 (28-467)||(5108759-5109198)
chr3 (28-467)||(15346393-15346832)
chr3 (28-475)||(15587540-15587987)
chr3 (28-475)||(13254225-13254672)
chr3 (28-469)||(6602277-6602718)
chr3 (28-469)||(10007141-10007582)
chr3 (28-475)||(15400665-15401112)
chr3 (28-469)||(10907751-10908192)
chr3 (27-475)||(16693699-16694147)
chr3 (28-467)||(12888252-12888691)
chr3 (28-475)||(20060202-20060649)
chr3 (30-467)||(53383168-53383605)
chr3 (28-467)||(3687486-3687925)
chr3 (28-467)||(5423078-5423517)
chr3 (28-467)||(16754849-16755288)
chr3 (57-475)||(14874676-14875094)
chr3 (116-475)||(15723170-15723529)
chr3 (31-469)||(17491391-17491829)
chr3 (166-475)||(12499783-12500092)
chr3 (28-469)||(15261171-15261612)
chr3 (203-475)||(15340804-15341076)
chr3 (28-207)||(15357886-15358065)
chr3 (27-455)||(11959305-11959733)
chr3 (29-249)||(14579557-14579777)
chr3 (27-455)||(47125509-47125937)
chr3 (23-469)||(13318634-13319080)
chr3 (27-452)||(31693321-31693746)
chr3 (27-452)||(31940471-31940896)
chr3 (31-455)||(28755883-28756307)
chr3 (27-469)||(12358663-12359105)
chr3 (27-469)||(11950044-11950486)
chr3 (49-469)||(17187925-17188345)
chr3 (28-468)||(15013904-15014344)
chr3 (28-165)||(24185035-24185172)
chr3 (31-475)||(16379068-16379512)
chr3 (27-469)||(12179889-12180337)
chr3 (31-367)||(13943677-13944013)
chr3 (27-469)||(10418181-10418623)
chr3 (31-425)||(41179117-41179511)
chr3 (49-469)||(15229154-15229574)
chr3 (49-469)||(15235022-15235442)
chr3 (49-369)||(16826439-16826754)
chr3 (49-431)||(18132504-18132886)
chr3 (31-425)||(44778842-44779236)
chr3 (52-213)||(11888526-11888687)
chr3 (27-332)||(12510619-12510924)
chr3 (28-449)||(30139377-30139798)
chr3 (28-449)||(30148928-30149349)
chr3 (27-475)||(16834651-16835094)
chr3 (28-135)||(43164550-43164657)
chr3 (27-469)||(14088224-14088666)
chr3 (27-268)||(10407720-10407961)
chr3 (49-258)||(14291690-14291899)
chr3 (28-449)||(15611674-15612095)
chr3 (28-105)||(15714204-15714281)
chr3 (27-248)||(24189076-24189297)
chr3 (29-449)||(8272548-8272968)
chr3 (28-443)||(15948618-15949033)
chr3 (27-469)||(16327796-16328238)
chr3 (49-469)||(13970278-13970698)
chr3 (28-449)||(6151001-6151422)
chr3 (28-452)||(13965500-13965925)
chr3 (112-284)||(12269946-12270118)
chr3 (28-128)||(18437022-18437122)
chr3 (31-233)||(8745530-8745732)
chr3 (223-398)||(11889623-11889798)
chr3 (28-80)||(26791561-26791613)
chr3 (27-158)||(17200496-17200627)
chr3 (260-455)||(10385236-10385431)
chr3 (34-104)||(12272254-12272324)
chr3 (28-160)||(25768178-25768310)
chr3 (304-449)||(25767889-25768034)
chr3 (405-449)||(18915297-18915341)
[»] chr4 (46 HSPs)
chr4 (27-475)||(18225094-18225542)
chr4 (28-475)||(8051272-8051719)
chr4 (28-475)||(14301628-14302075)
chr4 (28-467)||(8388336-8388775)
chr4 (28-475)||(27713252-27713699)
chr4 (28-475)||(23957663-23958110)
chr4 (28-475)||(12478516-12478963)
chr4 (28-475)||(14682483-14682930)
chr4 (28-475)||(19776442-19776889)
chr4 (28-475)||(40474956-40475403)
chr4 (28-396)||(17092798-17093166)
chr4 (27-475)||(15145541-15145981)
chr4 (28-399)||(16234641-16235012)
chr4 (113-475)||(16353241-16353604)
chr4 (28-469)||(14849015-14849456)
chr4 (28-468)||(14696036-14696476)
chr4 (27-452)||(16149650-16150075)
chr4 (27-452)||(16153796-16154221)
chr4 (27-469)||(15357028-15357470)
chr4 (29-296)||(16218325-16218592)
chr4 (29-296)||(16221645-16221912)
chr4 (297-475)||(18613742-18613920)
chr4 (27-385)||(44659774-44660132)
chr4 (27-455)||(3262702-3263130)
chr4 (28-452)||(14161409-14161833)
chr4 (28-185)||(22631910-22632067)
chr4 (27-469)||(15001273-15001714)
chr4 (27-469)||(29451445-29451887)
chr4 (31-425)||(51604704-51605098)
chr4 (49-379)||(1647207-1647537)
chr4 (29-260)||(23443237-23443467)
chr4 (49-452)||(15072298-15072701)
chr4 (27-469)||(27902308-27902750)
chr4 (27-131)||(16251498-16251602)
chr4 (27-385)||(11205140-11205498)
chr4 (27-469)||(8707833-8708271)
chr4 (28-398)||(15257921-15258290)
chr4 (365-475)||(1640326-1640436)
chr4 (223-469)||(15323139-15323385)
chr4 (28-449)||(15291067-15291488)
chr4 (23-93)||(16353174-16353244)
chr4 (402-475)||(29037427-29037500)
chr4 (31-133)||(12340777-12340879)
chr4 (405-449)||(14999257-14999301)
chr4 (291-435)||(8322948-8323092)
chr4 (184-356)||(18547684-18547856)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (28-475)||(18780962-18781409)
chr5 (28-475)||(16358350-16358797)
chr5 (28-475)||(34568342-34568789)
chr5 (28-475)||(27520254-27520701)
chr5 (28-475)||(27612202-27612649)
chr5 (31-475)||(22330981-22331425)
chr5 (28-475)||(14997830-14998277)
chr5 (28-467)||(40710636-40711075)
chr5 (28-467)||(27666581-27667020)
chr5 (28-475)||(37289587-37290034)
chr5 (28-475)||(41772690-41773137)
chr5 (28-475)||(19771808-19772255)
chr5 (28-475)||(22136516-22136963)
chr5 (28-475)||(22349767-22350214)
chr5 (28-475)||(27683491-27683938)
chr5 (28-475)||(29474164-29474611)
chr5 (51-475)||(20801245-20801669)
chr5 (28-469)||(25428287-25428728)
chr5 (28-469)||(26736818-26737259)
chr5 (28-469)||(21337385-21337826)
chr5 (31-469)||(23473081-23473519)
chr5 (28-469)||(20466190-20466631)
chr5 (27-455)||(24796487-24796915)
chr5 (27-385)||(21562115-21562472)
chr5 (27-455)||(14885081-14885509)
chr5 (27-455)||(20344132-20344560)
chr5 (49-468)||(22234032-22234451)
chr5 (27-455)||(37541471-37541899)
chr5 (27-469)||(20823289-20823731)
chr5 (27-469)||(28893032-28893474)
chr5 (27-469)||(28921858-28922300)
chr5 (31-416)||(17267428-17267813)
chr5 (27-455)||(25849925-25850353)
chr5 (27-475)||(22463781-22464229)
chr5 (27-455)||(22504529-22504957)
chr5 (27-329)||(20777889-20778191)
chr5 (28-449)||(21935279-21935700)
chr5 (28-449)||(23507540-23507961)
chr5 (28-449)||(24583066-24583487)
chr5 (164-469)||(28914640-28914945)
chr5 (164-469)||(28929908-28930213)
chr5 (340-469)||(21679181-21679310)
chr5 (169-269)||(21679010-21679110)
chr5 (49-164)||(21676946-21677061)
chr5 (346-465)||(24618704-24618823)
chr5 (346-465)||(24714935-24715054)
chr5 (346-465)||(24747963-24748082)
chr5 (405-449)||(23505100-23505144)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (28-475)||(40100-40547)
scaffold0109 (23-475)||(14031-14484)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (27-467)||(16113-16553)
scaffold0044 (28-467)||(2375-2816)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (27-475)||(15267-15715)
chr7 (28-475)||(10872595-10873042)
chr7 (28-475)||(11235131-11235578)
chr7 (28-475)||(14334301-14334748)
chr7 (28-475)||(15158975-15159422)
chr7 (28-475)||(11551020-11551467)
chr7 (28-475)||(14956459-14956906)
chr7 (28-475)||(8709510-8709957)
chr7 (28-475)||(12689407-12689854)
chr7 (28-467)||(44789269-44789708)
chr7 (28-469)||(18179656-18180097)
chr7 (28-398)||(13688023-13688393)
chr7 (28-374)||(18588089-18588435)
chr7 (27-469)||(15146801-15147244)
chr7 (31-452)||(14041623-14042044)
chr7 (31-452)||(14351653-14352074)
chr7 (27-269)||(9590479-9590721)
chr7 (28-469)||(48813170-48813610)
chr7 (49-469)||(15626436-15626856)
chr7 (27-469)||(15100498-15100940)
chr7 (49-469)||(12204717-12205137)
chr7 (27-455)||(13966563-13966991)
chr7 (27-455)||(26092693-26093121)
chr7 (49-469)||(16948389-16948809)
chr7 (27-455)||(26116485-26116913)
chr7 (49-468)||(14262162-14262580)
chr7 (31-475)||(14139585-14140029)
chr7 (27-455)||(49154227-49154655)
chr7 (27-434)||(13675399-13675806)
chr7 (27-455)||(11301108-11301536)
chr7 (27-455)||(13023283-13023711)
chr7 (49-469)||(19149123-19149541)
chr7 (27-469)||(11386324-11386766)
chr7 (57-469)||(16070222-16070632)
chr7 (31-392)||(23503769-23504130)
chr7 (27-455)||(12458566-12458994)
chr7 (49-469)||(20748522-20748940)
chr7 (307-469)||(11770438-11770600)
chr7 (27-469)||(15342343-15342785)
chr7 (31-392)||(18051852-18052213)
chr7 (28-449)||(7825831-7826252)
chr7 (28-449)||(27105692-27106113)
chr7 (28-449)||(27172212-27172633)
chr7 (27-469)||(19614587-19615029)
chr7 (376-475)||(14213579-14213678)
chr7 (27-469)||(14284271-14284713)
chr7 (390-475)||(8200533-8200618)
chr7 (28-134)||(11770320-11770426)
chr7 (27-87)||(16727300-16727360)
chr7 (27-87)||(17704372-17704432)
chr7 (28-151)||(4442157-4442280)
chr7 (28-158)||(13379105-13379235)
chr7 (29-158)||(17925872-17926001)
chr7 (174-356)||(39210-39392)
chr7 (422-475)||(13687969-13688022)
chr7 (256-379)||(17143422-17143545)
chr7 (28-158)||(13458257-13458387)
chr7 (32-149)||(15716825-15716942)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (28-475)||(9485763-9486210)
chr2 (29-475)||(24711581-24712027)
chr2 (28-467)||(44384019-44384458)
chr2 (28-467)||(16926915-16927354)
chr2 (28-467)||(17000555-17000994)
chr2 (28-475)||(21143490-21143937)
chr2 (28-467)||(27219571-27220010)
chr2 (28-467)||(10870405-10870844)
chr2 (28-468)||(41606834-41607274)
chr2 (28-475)||(24263917-24264364)
chr2 (28-475)||(27372816-27373263)
chr2 (61-475)||(23189466-23189879)
chr2 (27-475)||(24677036-24677484)
chr2 (28-475)||(24875199-24875646)
chr2 (28-475)||(24705931-24706378)
chr2 (28-469)||(21323715-21324156)
chr2 (28-398)||(9337206-9337576)
chr2 (28-469)||(23106177-23106618)
chr2 (31-469)||(22734226-22734664)
chr2 (28-469)||(23073416-23073857)
chr2 (28-469)||(24818679-24819120)
chr2 (49-468)||(23112290-23112712)
chr2 (27-455)||(1065318-1065746)
chr2 (27-469)||(19650498-19650940)
chr2 (27-469)||(23098466-23098908)
chr2 (307-475)||(22323584-22323752)
chr2 (27-455)||(31832225-31832653)
chr2 (31-425)||(27789337-27789731)
chr2 (27-452)||(23278346-23278771)
chr2 (31-392)||(12575983-12576344)
chr2 (27-284)||(25255657-25255914)
chr2 (27-469)||(19717465-19717907)
chr2 (49-469)||(30010654-30011074)
chr2 (49-452)||(30209387-30209790)
chr2 (109-434)||(24950178-24950503)
chr2 (61-126)||(23611069-23611134)
chr2 (209-469)||(27208802-27209062)
chr2 (307-469)||(25264607-25264769)
chr2 (28-449)||(24829637-24830058)
chr2 (31-134)||(22279993-22280096)
chr2 (326-456)||(23295501-23295631)
chr2 (28-158)||(25130473-25130603)
chr2 (352-449)||(22279678-22279775)
chr2 (49-158)||(22760039-22760148)
chr2 (27-63)||(23204273-23204309)
chr2 (349-469)||(45534493-45534613)
chr2 (28-158)||(24568117-24568247)
chr2 (229-380)||(10037982-10038133)
chr2 (229-380)||(10098367-10098518)
chr2 (405-449)||(12639059-12639103)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (27-475)||(57962-58410)
scaffold0017 (25-475)||(17975-18426)
scaffold0017 (73-469)||(195444-195840)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (28-475)||(8885-9332)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (28-469)||(107723-108164)
scaffold0029 (27-267)||(94805-95045)
scaffold0029 (25-469)||(114512-114956)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (28-475)||(9313-9760)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (28-475)||(22828409-22828856)
chr6 (29-468)||(24293837-24294276)
chr6 (28-467)||(28261251-28261690)
chr6 (28-467)||(28284226-28284665)
chr6 (28-467)||(28340000-28340439)
chr6 (27-475)||(27563886-27564334)
chr6 (28-467)||(27189224-27189663)
chr6 (28-467)||(27259577-27260016)
chr6 (29-469)||(16961537-16961977)
chr6 (28-467)||(2872857-2873296)
chr6 (27-475)||(19866467-19866915)
chr6 (27-469)||(16925692-16926133)
chr6 (28-467)||(25114340-25114779)
chr6 (27-475)||(22435649-22436097)
chr6 (27-469)||(5837272-5837714)
chr6 (28-469)||(20633994-20634435)
chr6 (43-469)||(25763297-25763723)
chr6 (23-466)||(22760504-22760947)
chr6 (31-469)||(25607918-25608356)
chr6 (109-475)||(22444047-22444413)
chr6 (28-469)||(18405998-18406439)
chr6 (28-266)||(16573879-16574117)
chr6 (28-266)||(16621263-16621501)
chr6 (164-466)||(23080258-23080560)
chr6 (28-410)||(23085825-23086207)
chr6 (29-270)||(18183422-18183663)
chr6 (27-471)||(10466902-10467346)
chr6 (49-469)||(14377991-14378411)
chr6 (49-469)||(14379541-14379961)
chr6 (27-186)||(21755002-21755160)
chr6 (28-469)||(15461122-15461563)
chr6 (28-271)||(18963142-18963385)
chr6 (27-469)||(25769630-25770072)
chr6 (27-455)||(24366212-24366640)
chr6 (52-469)||(19881084-19881501)
chr6 (31-392)||(28280870-28281231)
chr6 (27-452)||(19454827-19455251)
chr6 (27-233)||(24516461-24516667)
chr6 (49-451)||(18796494-18796896)
chr6 (27-469)||(19436788-19437230)
chr6 (28-449)||(16380427-16380848)
chr6 (28-182)||(30679061-30679215)
chr6 (27-469)||(34643639-34644081)
chr6 (28-449)||(16648023-16648444)
chr6 (27-452)||(21473404-21473828)
chr6 (265-469)||(18196024-18196228)
chr6 (29-469)||(21568046-21568486)
chr6 (28-151)||(23998352-23998475)
chr6 (28-449)||(1646868-1647289)
chr6 (27-152)||(8761805-8761930)
chr6 (28-158)||(14130566-14130696)
chr6 (28-158)||(16100112-16100242)
chr6 (319-469)||(18965640-18965790)
chr6 (220-469)||(19487528-19487767)
chr6 (28-158)||(23025800-23025930)
chr6 (28-105)||(23080573-23080650)
chr6 (253-443)||(16099821-16100011)
chr6 (28-66)||(28311819-28311857)
chr6 (27-63)||(23496245-23496281)
chr6 (405-468)||(16234815-16234878)
chr6 (56-179)||(18450579-18450702)
chr6 (341-439)||(18836275-18836373)
chr6 (341-397)||(5295573-5295629)
chr6 (369-449)||(18578015-18578095)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (27-475)||(37731-38179)
scaffold0042 (28-466)||(22661-23099)
[»] scaffold0079 (4 HSPs)
scaffold0079 (27-475)||(35442-35891)
scaffold0079 (113-299)||(28222-28408)
scaffold0079 (27-469)||(2669-3111)
scaffold0079 (23-93)||(28405-28475)
[»] scaffold0008 (6 HSPs)
scaffold0008 (29-464)||(85709-86144)
scaffold0008 (28-467)||(85142-85581)
scaffold0008 (28-170)||(132401-132543)
scaffold0008 (342-449)||(132715-132822)
scaffold0008 (27-158)||(26031-26162)
scaffold0008 (341-449)||(25799-25907)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (31-468)||(10428-10865)
scaffold0028 (31-468)||(16890-17327)
scaffold0028 (32-467)||(45106-45541)
scaffold0028 (49-469)||(48447-48867)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (27-475)||(54902-55350)
scaffold0031 (29-468)||(109584-110023)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (31-475)||(35973-36417)
scaffold0081 (31-475)||(20549-20993)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (28-469)||(16594-17035)
scaffold0309 (49-469)||(11746-12167)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (28-469)||(24857-25298)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (105-475)||(7961-8331)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (29-437)||(51258-51666)
scaffold0102 (27-469)||(41650-42091)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (28-469)||(151063-151504)
scaffold0023 (28-468)||(2417-2857)
scaffold0023 (112-469)||(86722-87078)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (28-371)||(21296-21639)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (28-469)||(7571-8012)
scaffold0647 (28-437)||(2884-3293)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (28-469)||(3385-3826)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (29-469)||(719-1157)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (28-469)||(8002-8443)
scaffold0358 (28-469)||(17198-17639)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (139-469)||(23097-23427)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (28-469)||(12-453)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (28-468)||(8326-8765)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (28-437)||(20223-20632)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (28-469)||(7174-7615)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (28-469)||(725-1162)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (28-466)||(40588-41026)
scaffold0022 (28-466)||(74308-74746)
scaffold0022 (49-469)||(55708-56128)
scaffold0022 (28-449)||(8738-9159)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (28-469)||(6999-7440)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (28-469)||(7973-8414)
scaffold0120 (28-158)||(24440-24570)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (28-466)||(691-1126)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (50-469)||(1-420)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (28-466)||(18253-18691)
scaffold0114 (23-294)||(22002-22273)
scaffold0114 (31-171)||(39307-39447)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (29-469)||(3534-3974)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (28-469)||(1294-1735)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (28-468)||(24445-24885)
scaffold0011 (27-469)||(150522-150964)
scaffold0011 (405-449)||(181897-181941)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (40-469)||(3867-4296)
scaffold0010 (27-455)||(40244-40672)
scaffold0010 (31-269)||(45342-45580)
scaffold0010 (361-469)||(45645-45752)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (93-469)||(30898-31274)
scaffold0026 (49-469)||(50763-51183)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (80-425)||(28446-28772)
scaffold0215 (319-475)||(28774-28930)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (31-469)||(14394-14832)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (142-475)||(4141-4474)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (28-469)||(13123-13564)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (28-469)||(17607-18042)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (29-469)||(103186-103618)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (28-469)||(10653-11094)
scaffold0018 (28-469)||(24210-24651)
scaffold0018 (141-469)||(16958-17286)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (40-468)||(405-832)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (28-462)||(494978-495412)
scaffold0001 (49-469)||(453146-453566)
scaffold0001 (27-455)||(515264-515692)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (139-443)||(6354-6658)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (29-299)||(29828-30098)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (49-467)||(14423-14841)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (28-469)||(16830-17270)
scaffold0040 (403-469)||(111775-111841)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (30-469)||(15135-15574)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (29-468)||(5825-6264)
scaffold0270 (29-468)||(12955-13394)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (183-475)||(407-699)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (29-469)||(5065-5504)
scaffold0074 (57-371)||(11172-11486)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (28-398)||(2623-2993)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (31-469)||(217335-217773)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (28-249)||(15906-16128)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (28-469)||(15890-16330)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (31-248)||(1-218)
scaffold0149 (27-452)||(5262-5686)
scaffold0149 (27-452)||(9693-10117)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (31-469)||(5804-6242)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (40-469)||(8958-9387)
scaffold0083 (40-130)||(1324-1414)
scaffold0083 (40-130)||(6628-6718)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (74-304)||(10284-10514)
scaffold0476 (67-469)||(1496-1898)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (27-469)||(24167-24609)
scaffold0104 (49-452)||(44350-44753)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (27-301)||(1-275)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (27-469)||(10781-11223)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (27-469)||(201379-201821)
scaffold0004 (57-469)||(324657-325069)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (267-475)||(7844-8052)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (27-469)||(9969-10410)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (268-469)||(44795-44996)
scaffold0130 (49-182)||(4822-4955)
scaffold0130 (196-434)||(8888-9126)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (27-455)||(250587-251015)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (55-434)||(2892-3271)
scaffold0034 (27-469)||(69323-69765)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (28-450)||(28594-29016)
scaffold0067 (49-422)||(50113-50486)
scaffold0067 (49-422)||(59147-59520)
scaffold0067 (49-422)||(65535-65908)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (238-469)||(38070-38301)
scaffold0122 (28-93)||(41417-41482)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (27-452)||(2183-2608)
[»] scaffold0560 (2 HSPs)
scaffold0560 (31-196)||(8657-8822)
scaffold0560 (190-251)||(10914-10975)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (27-452)||(29196-29621)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (49-469)||(19305-19725)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (27-469)||(1822-2264)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (28-469)||(4702-5143)
scaffold0035 (28-452)||(42019-42443)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (49-456)||(4142-4552)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (27-469)||(25066-25508)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (49-452)||(49074-49477)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (49-455)||(31252-31658)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (319-475)||(3556-3712)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (49-469)||(49808-50228)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (27-469)||(766-1207)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (27-469)||(13247-13689)
scaffold0261 (27-469)||(21426-21868)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (49-466)||(16068-16485)
scaffold0266 (23-449)||(7768-8194)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (29-469)||(22099-22538)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (27-383)||(19545-19901)
scaffold0077 (304-449)||(26454-26599)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (27-434)||(215-621)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (27-469)||(99473-99915)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (310-475)||(999-1164)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (27-434)||(37636-38043)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (27-469)||(33287-33730)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (27-469)||(268561-269003)
scaffold0007 (28-437)||(84432-84840)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (55-469)||(950-1364)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (49-466)||(5022-5439)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (27-469)||(599-1038)
scaffold0420 (27-227)||(7809-8007)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (49-466)||(28481-28898)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (27-469)||(14153-14601)
scaffold0124 (28-449)||(5718-6141)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (49-466)||(176277-176694)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (27-269)||(653-895)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (27-469)||(9014-9456)
scaffold0222 (27-269)||(1400-1642)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (27-452)||(42887-43311)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (49-452)||(1418-1821)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (27-466)||(79742-80181)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (27-469)||(262177-262619)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (27-449)||(10697-11119)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (27-415)||(21127-21515)
scaffold0058 (28-437)||(27160-27569)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (82-469)||(6703-7090)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (27-469)||(52998-53440)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (49-452)||(64452-64844)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (28-233)||(114950-115155)
scaffold0037 (307-469)||(115172-115334)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (49-469)||(46967-47387)
scaffold0053 (49-452)||(55780-56183)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (27-469)||(31588-32030)
scaffold0076 (27-233)||(54322-54528)
scaffold0076 (28-449)||(42231-42652)
scaffold0076 (250-469)||(55034-55253)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (49-270)||(520-741)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (28-449)||(25367-25788)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (28-449)||(34058-34479)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (28-449)||(14881-15302)
scaffold0162 (31-158)||(11089-11216)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (25-146)||(11067-11189)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (167-469)||(1900-2202)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (27-469)||(20802-21244)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (27-233)||(18394-18600)
scaffold0348 (73-269)||(9831-10027)
scaffold0348 (27-113)||(5760-5846)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (27-284)||(9372-9629)
scaffold0235 (27-284)||(19586-19843)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (29-469)||(747-1187)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (27-455)||(28900-29327)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (27-449)||(184-606)
scaffold0302 (27-449)||(7126-7548)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (27-455)||(919-1347)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (154-469)||(39-354)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (357-432)||(9215-9290)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (27-455)||(6056-6484)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (27-95)||(12267-12335)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (49-179)||(11201-11331)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (193-385)||(14790-14982)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (350-452)||(3896-3998)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (28-449)||(715-1135)
[»] scaffold0876 (2 HSPs)
scaffold0876 (29-158)||(859-988)
scaffold0876 (304-425)||(1134-1255)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (29-449)||(1865-2285)
scaffold0218 (28-128)||(26621-26721)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (29-151)||(1797-1919)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (29-135)||(16345-16451)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (244-469)||(947-1172)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (28-158)||(13537-13667)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (166-456)||(12349-12639)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (253-455)||(8920-9122)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (31-151)||(7015-7135)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (28-383)||(1533-1888)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (277-471)||(33914-34108)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (196-469)||(16229-16502)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (49-158)||(89764-89873)
scaffold0021 (28-132)||(7445-7549)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (220-452)||(44753-44985)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (402-469)||(6939-7006)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (28-158)||(6917-7047)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (27-104)||(9865-9942)
scaffold0146 (27-104)||(17532-17609)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (225-469)||(1277-1521)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (28-95)||(4838-4905)
scaffold0610 (119-449)||(6932-7262)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (28-151)||(7152-7275)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (28-134)||(380-486)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (405-468)||(2218-2281)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
scaffold1208 (175-270)||(1748-1843)
[»] scaffold0827 (1 HSPs)
scaffold0827 (174-269)||(5259-5354)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (229-380)||(8937-9088)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (27-62)||(2838-2873)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (367-466)||(36069-36168)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (376-469)||(23339-23432)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (352-469)||(195193-195310)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (49-93)||(2267-2311)


Alignment Details
Target: scaffold0080 (Bit Score: 405; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Original strand, 11150 - 11598
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11150 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 11249  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11250 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 11349  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11350 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgatatttt 11449  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11450 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaattttatgctaaattgtctaagtgtgaa 11549  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  11550 ttctggttgaaggaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 11598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 31273 - 30829
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  31273 ttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagatatgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattaatttga 31174  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  31173 gattaggttatcaccagatcaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcga 31074  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  31073 tgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgttttcatcgaagatattttaatt 30974  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30973 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgttaaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttct 30874  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  30873 ggttgaaagaggtcagttttcttggccatgttatttctggtgatg 30829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 36739 - 36294
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  36739 ttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagatttgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattaatttga 36640  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  36639 gattaggttatcaccagatcaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcga 36540  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || || || ||||| || |||||||| |||    
T  36539 tgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatctttttgtggttgtttttattgatgatatttttatt 36440  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36439 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgttaaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttct 36340  T
Q  431 ggttgaaggaagtaa-gttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||| || |||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  36339 ggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttctggtgatg 36294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 54029 - 53635
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54029 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 53930  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  53929 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttctgaacacggtatggtccctatgagtacaaagttatgccttt 53830  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |  || |||||||||    
T  53829 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcaatgatgatattttg 53730  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 422  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  53729 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtg 53635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 253 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 50259 - 50044
Alignment:
Q  253 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaac 352  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |  || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  50259 tttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcaatgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaac 50160  T
Q  353 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    ||| ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  | |||||    
T  50159 atgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattttggttgaaagaagtgggctttct 50060  T
Q  453 gggcgatgttatttct 468  Q
     ||  |||||||||||    
T  50059 tggacatgttatttct 50044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 113
Target Start/End: Original strand, 13805 - 13891
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13805 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttt 13891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Original strand, 30311495 - 30311943
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311495 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgataattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 30311594  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311595 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 30311694  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  30311695 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgttgttgtgtttattgacgatatttt 30311794  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311795 aatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 30311894  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  30311895 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 30311943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 15535813 - 15535365
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535813 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 15535714  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535713 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagttatcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 15535614  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15535613 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacatttt 15535514  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535513 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 15535414  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  15535413 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 15535365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Original strand, 22131392 - 22131840
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131392 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 22131491  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131492 ttgagaacagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttaagaacgcattacggtcactatgaatataaagttatgcctt 22131591  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||    
T  22131592 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcgattctttgttgtgtttatcgatgatatttt 22131691  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131692 gatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 22131791  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22131792 ttctggttgaaggaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 22131840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 17672375 - 17672814
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17672375 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 17672474  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672475 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 17672574  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  17672575 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 17672674  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672675 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 17672774  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  17672775 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 17672814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22042257 - 22041809
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22042257 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcgaaagttttcagcaagattgat 22042158  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22042157 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 22042058  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22042057 tcggtgtgaccaattcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatatttt 22041958  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22041957 gatgtactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagcgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgagaa 22041858  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22041857 ttctggttgaaagaaataagttttcttggccatgttatttctggtgatg 22041809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 32602575 - 32602132
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32602575 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagagggtgcaaaagttttcagcaagattgat 32602476  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32602475 ttgagatcagggtatcaccagattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 32602376  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  32602375 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtgtttatcgatgatatttt 32602276  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32602275 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaa 32602176  T
Q  427 ttc-tggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  32602175 ttcttggttgaaagaagtaagtttttttggccatgttatttctg 32602132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 20016615 - 20017062
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20016615 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 20016714  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016715 tgaggtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 20016814  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  20016815 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 20016914  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20016915 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 20017014  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  20017015 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 20017062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 18859006 - 18858559
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  18859006 cagtggaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 18858907  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858906 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 18858807  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  18858806 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgacattttg 18858707  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858706 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 18858607  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  18858606 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 18858559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 22118527 - 22118974
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  22118527 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 22118626  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22118627 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataaagttatgccttt 22118726  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  22118727 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 22118826  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22118827 atttactccaagactgaagaagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 22118926  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||| ||| || || |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22118927 tctggtcgaaagaggtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 22118974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 22127311 - 22127758
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  22127311 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 22127410  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22127411 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataaagttatgccttt 22127510  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  22127511 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 22127610  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22127611 atttactccaagactgaagaagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 22127710  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||| ||| || || |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22127711 tctggtcgaaagaggtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 22127758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Original strand, 21164889 - 21165337
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  21164889 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcattttcagcaagattgat 21164988  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21164989 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 21165088  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||| | ||||||||    
T  21165089 tcggtgttacgaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcattcttggatcgattcgtggttgtttttatctatgatatttt 21165188  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  21165189 aatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatccaagtgtgag 21165288  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  21165289 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 21165337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 19980397 - 19979949
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19980397 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 19980298  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19980297 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgtagaagacaactttcagaacactgtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 19980198  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  19980197 ttggtgttaccaatgcgcctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatatttt 19980098  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||     
T  19980097 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagaatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaattttatgctaaattatctaagtatgat 19979998  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  19979997 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 19979949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 19482424 - 19482855
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  19482424 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattga--------tggatcagttagtgggtgcgcgagttttcagcaagattgatt 19482515  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19482516 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 19482615  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  19482616 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgtgttcatcgacgatattttg 19482715  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482716 atttactccaagactgaagaagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 19482815  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  19482816 tctggttgaaagaagtgagttttcttggtcatgttatttc 19482855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21253373 - 21252932
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21253373 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaactttcgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21253274  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21253273 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21253174  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||    
T  21253173 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgaggttgtttttatcgatgatattttg 21253074  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21253073 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttctgcaagtattgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgagaat 21252974  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  21252973 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 21252932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 21782772 - 21783213
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21782772 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21782871  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21782872 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagagcgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21782971  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| |||    
T  21782972 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatgatatattg 21783071  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21783072 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgcgaat 21783171  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  21783172 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 21783213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 21392213 - 21392654
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21392213 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21392312  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21392313 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagagcgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21392412  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| |||    
T  21392413 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatgatatattg 21392512  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21392513 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcaaaattgtctaagtgcgaat 21392612  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  21392613 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 21392654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 21786707 - 21787148
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21786707 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21786806  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21786807 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagagcgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21786906  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| |||    
T  21786907 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatgatatattg 21787006  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21787007 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcaaaattgtctaagtgcgaat 21787106  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  21787107 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 21787148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 23652449 - 23652029
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  23652449 aagaataggtatctacttctgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttaagatcaggttatcaccaga 23652350  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  23652349 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaggtttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgccttttggtgttacaaatgcacctgg 23652250  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || || |||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  23652249 tgtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatactttgatttactccaagactgaagag 23652150  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  23652149 gaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaagaggtaagtt 23652050  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| |||| |||||||    
T  23652049 ttcttggccatgtcatttctg 23652029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 19864446 - 19864887
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  19864446 agttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgctaaatttttcagcaagatagattt 19864545  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19864546 gagatcaggttatcaccagattaaagtaaaatatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtagaaagttatgcctttc 19864645  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| | || || || || || ||||||||||    
T  19864646 ggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatctcatctttcatgcatttttggattggttcatggttgttttcattgatgatattttga 19864745  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattg-tcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||| ||||  | | | || ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19864746 tttactctaagtctgaagaagaacatattgagcatttgaaactggtttttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 19864845  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||    
T  19864846 tctggttgaaagaagtgagttttcttggacatgttatttctg 19864887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 22422244 - 22422691
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||| |    
T  22422244 cagttgaataaagtgacgataaagaataggtattcacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgact 22422343  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  22422344 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatagcattcagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 22422443  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||    
T  22422444 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttg 22422543  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22422544 atttactccaagtccgaagaagaacatgttgaacatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaat 22422643  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    | |||||||| || || ||||| || ||| |||||||||||| |||||    
T  22422644 tatggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttctggtgatg 22422691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 22375806 - 22376246
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  22375806 agttgaataaagtaacgataaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtattcagcaagattgattt 22375905  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  22375906 gagatcgggttatcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattattaatataaagtgatgcctttc 22376005  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
     |  | || |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |    
T  22376006 agcattacaaatgcaccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatattttta 22376105  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| || | | ||||    
T  22376106 tatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaactataaatt 22376205  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||  |  | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  22376206 ctggttgaaatagatgagttttcttggccatgttatttctg 22376246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 31 - 469
Target Start/End: Original strand, 22246788 - 22247226
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  22246788 ttgaataaggtaacgataaagaatgggtatccacttccaagaattgatgctttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagcaagattgatttga 22246887  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  22246888 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagaccgcttttagaacaagttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgg 22246987  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||     
T  22246988 tgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcctgcgtttttggatcgtttcatggttgtgttcatcgacgatattttgata 22247087  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22247088 tactccaagattgaaggagaacatgttgagcatttgtagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattttcaaagtgtgaattct 22247187  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||| || |  |||||||  ||| ||||||||||||    
T  22247188 ggttgaaagaggcgagttttcatggccatgttatttctg 22247226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 113 - 469
Target Start/End: Original strand, 21920185 - 21920541
Alignment:
Q  113 tcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  21920185 tcagcaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagta 21920284  T
Q  213 taaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgttt 312  Q
    ||| || ||| | |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || || |||    
T  21920285 taaggtgatgtcgttcggtgttacaaatgcacatggagtatttatggagtacatgaattgtatctttcaagcatttttggatcggttcgtggttgttttt 21920384  T
Q  313 atcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaat 412  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21920385 attgatgatattttgatttacttcaagactgaagaagaatatgctgagcatttgaagttagttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaat 21920484  T
Q  413 tgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  21920485 tgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 21920541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 434
Target Start/End: Original strand, 31414820 - 31415227
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  31414820 tcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagcaagattgac 31414919  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  31414920 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 31415019  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || |||||||| || |||||| |    
T  31415020 tcggtgttactaatgcgcctggggtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 31415119  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||| |     
T  31415120 gatttattctaagaccgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtaag 31415219  T
Q  427 ttctggtt 434  Q
    ||||||||    
T  31415220 ttctggtt 31415227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23657353 - 23656918
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23657353 ttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttcgtaggtgcaaaagttttcagcaagattgacttga 23657254  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  23657253 ggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcgg 23657154  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||  | || || ||||| || |||||| | ||     
T  23657153 tgttactaatgcgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttatggttgtatttattgatgatattctaata 23657054  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| || ||||| |||||||| || |    
T  23657053 tattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgagttat 23656954  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 466  Q
    |||| |  |||||||||||||| ||| || ||||||    
T  23656953 ggttaagtgaagtaagttttcttggccatattattt 23656918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 29301777 - 29302219
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||| || |||||     
T  29301777 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgatgatctgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagtaaaattgac 29301876  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  29301877 ttgaggtcgggttatcactagattaaggtgaaagatgagaatatgcagaagacggcattcagaacacgttatgggcattatgagtataaggtgatgcctt 29301976  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||  | || || |||||||| || |||| ||| || ||||| ||||| || || ||| |    
T  29301977 ttggtgttacaaatgcacctggggtatttatggagtacatgaacagaatttttcatgcattcttagatcagtttgttgtggtatttattgatgacattct 29302076  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||||||||| ||||| || ||| ||||||| || ||  |||||||||| || ||||||| |||||||| |||  | ||||| || ||||| || ||||||    
T  29302077 gatttactctaagaccgaagaataacatgcagaacacttgaagattgtgttacaagtgttgaaagagaggaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaa 29302176  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  29302177 ttctggttgagtgaagtaagttttcttggccacgttatttctg 29302219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22522975 - 22522711
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || || |||||||||||||    
T  22522975 cagttgaacaaagtaacgataaagaacaggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattgatt 22522876  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| | || ||||| |||||||| ||||||||    
T  22522875 tgagatcgggttatcaccagaataaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcttttagaacacgttatcgacattatgagtataaagtgatgccttt 22522776  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttgg 292  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22522775 cggtgttacaaatgcgccaggagtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttgg 22522711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 21323630 - 21324071
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  21323630 tcagttgaataaagttacaataaagaataggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttttagtaagattgac 21323729  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || || || || || || |||||||    
T  21323730 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaatgtgatgcctt 21323829  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   ||||| || ||||||||||| || ||| |    
T  21323830 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttatcgatgacattct 21323929  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  21323930 gatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaa-aagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 21324028  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  21324029 ttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 21324071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23887457 - 23887015
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  23887457 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttcgaagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 23887358  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| |   | ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || || |||||||| || || || |||  ||| ||||||||    
T  23887357 tgaggttgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcataagacggcctttaggacacgttatggacattacgagtattcagtgatgccttt 23887258  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||| || |  |||||||||||||| |||||||  || || ||||| | ||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  23887257 cggtgttactaatgcgccagatgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 23887158  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgc----tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgt 423  Q
    || ||||| ||| || | ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||    
T  23887157 atatactctaagtctaaagaagaacatgtatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgt 23887058  T
Q  424 gaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 466  Q
    ||||||| |||||| || || |||||||| ||| |||||||||    
T  23887057 gaattctagttgaatgaggtgagttttcttggccatgttattt 23887015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Original strand, 20008294 - 20008714
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   || ||||| |||||||||||||| ||| | || || ||||    
T  20008294 aagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatggatcaattagtgggtgcacgcgtgttcagtaagattgatttgagctcaggttaccatcaga 20008393  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  20008394 ttaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 20008493  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||  || |||||  | ||||| || |||| ||| |||    
T  20008494 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttagtgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaa 20008593  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  20008594 gagcatgcagagcatatgaagattgtgttgcaactgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagtt 20008693  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| || |||||||||    
T  20008694 ttcttggccatattatttctg 20008714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 223 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22988964 - 22988718
Alignment:
Q  223 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgata 322  Q
    ||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  22988964 cctttcggtgtcaccaatacgccacgtgtgtttatggaatacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgata 22988865  T
Q  323 ttttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 422  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22988864 ttttgatatattccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtg 22988765  T
Q  423 tgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  22988764 tgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctg 22988718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21927836 - 21927415
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    || ||||| || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  21927836 aagaataggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 21927737  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||  | || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||| |||||    
T  21927736 ttaaggtgaaggatgagcatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgcgcctgg 21927637  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||    
T  21927636 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaa 21927537  T
Q  349 gaaca-tgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagt 447  Q
    || || ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||     
T  21927536 gagcattgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaaga 21927437  T
Q  448 tttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||| ||| || |||||||||    
T  21927436 tttcttggccatattatttctg 21927415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 311 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 19114836 - 19114672
Alignment:
Q  311 ttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19114836 ttatcgacgatattttgatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaa 19114737  T
Q  411 attgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  19114736 attgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 19114672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 21781539 - 21781691
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21781539 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21781638  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagaca 180  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21781639 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagaca 21781691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 469
Target Start/End: Original strand, 20394488 - 20394926
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || || |  |||||||||||||    
T  20394488 ttgaacaaagtgacaataaagaatagggatccacttctaagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttattaagattgatttga 20394587  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    ||||  | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   | | ||||||||  |    
T  20394588 gatcgggctatcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcaatgatgccttttag 20394687  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||  || |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || || ||||| || ||||||||||||||     
T  20394688 tgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgctttgttgttgtgttcattgacgatattttgata 20394787  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  20394788 tactctaagtctgaagaagaacatgccgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattct 20394887  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||  | || |||||||| ||| || |||||||||    
T  20394888 ggttgaataaggtgagttttcttggccatattatttctg 20394926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22989472 - 22989274
Alignment:
Q  30 gttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttg 129  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||    
T  22989472 gttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaataattgatgacttgatggatcagttagtggctgcaagtgtgtttagcaagattgatttg 22989373  T
Q  130 agatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  22989372 agatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaatacagctttcagaacgcgttatgggtattatgaatataaagtgatgcctttc 22989274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Original strand, 16269575 - 16270003
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  16269575 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 16269674  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  16269675 ttgaggtctagttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 16269774  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || |  ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || |||||||| || || ||||| ||    
T  16269775 tcggtgttactaacgggcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgttcattgatgatatctt 16269874  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  16269875 gatttattccaagaatgaagaggagcatgcagagcacctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 16269974  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  16269975 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 16270003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 28983341 - 28982916
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  28983341 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagtaagattgat 28983242  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    |||||  |  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  28983241 ttgagggctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 28983142  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||| ||||| || |||||| |    
T  28983141 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatattct 28983042  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || ||  | ||||||    
T  28983041 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcacaatgtgaa 28982942  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    ||||||||    ||||||||||||||    
T  28982941 ttctggttacgtgaagtaagttttct 28982916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 28988560 - 28988135
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  28988560 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagtaagattgat 28988461  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    |||||  |  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  28988460 ttgagggctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 28988361  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||| ||||| || |||||| |    
T  28988360 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatattct 28988261  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || ||  | ||||||    
T  28988260 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcacaatgtgaa 28988161  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    ||||||||    ||||||||||||||    
T  28988160 ttctggttacgtgaagtaagttttct 28988135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 4984472 - 4984044
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| | |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  4984472 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaagtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 4984373  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4984372 ttgaggtctggttatcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 4984273  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||  ||| || |||||||| ||  | ||||  ||    
T  4984272 tcggtgtaactaaagcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattaatgatacctt 4984173  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||  || || ||||||||||  || ||||||  | | |||| ||| ||||| || |||||     
T  4984172 gatttattccaagaacgaggaagagcatgcagagcatctgagaatagtattgcaagtgttaaaggagaagcgattgtatgttaagttgtcaaaatgtgag 4984073  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  4984072 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 4984044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 425
Target Start/End: Original strand, 31569198 - 31569591
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  31569198 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 31569297  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31569298 ggtca-gttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 31569396  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||    
T  31569397 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 31569496  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||    
T  31569497 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtga 31569591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 27356966 - 27356538
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||||||     
T  27356966 tcagttgaacaaagtttcgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgac 27356867  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||  | ||  | ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  27356866 ttgagatctggttactatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 27356767  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  27356766 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 27356667  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  27356666 aatttattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttaaaagagaagaggttgtatgcgaagttgtcgaaatgtgag 27356567  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  27356566 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 27356538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 19861834 - 19861423
Alignment:
Q  58 tatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtga 157  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || ||||   | ||| ||||||| ||| | || || |||||||| ||||    
T  19861834 tatcgacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtggtcgtgtgttcatgtaaattaatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtga 19861735  T
Q  158 aagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttat 257  Q
    | |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  19861734 aggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtaatgcccttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttat 19861635  T
Q  258 ggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgct 357  Q
    | ||||||||||  | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || |||||  | ||||| || |||| ||| |||||||||||     
T  19861634 gaagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaagaacatgca 19861535  T
Q  358 gagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcg 457  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| | |||||  | ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||     
T  19861534 gagcatctgaagattgagttgcaagtgttgaaataaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttggcc 19861435  T
Q  458 atgttatttctg 469  Q
    || |||||||||    
T  19861434 atattatttctg 19861423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22053293 - 22052851
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||  ||||||  ||||||||     
T  22053293 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgagaattgatgacttgatggatcagctggttggtgcaaagattttcaataagattgac 22053194  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||  | || |||||||    
T  22053193 ttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaataccaggtgatgcctt 22053094  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||  ||| || |  || || || || |||||  |    
T  22053093 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcctttctggataagtttgtgggtgtattcattgatgatatcct 22052994  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||  | |||||||| ||||  || ||||||    
T  22052993 aatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgttgaaatgtgaa 22052894  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  22052893 ttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 22052851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 110 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 6606005 - 6605660
Alignment:
Q  110 ttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatga 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  6606005 ttttcagtaagattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacga 6605906  T
Q  210 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtg 309  Q
     || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || |||||     
T  6605905 gtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggta 6605806  T
Q  310 tttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgcta 409  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| || ||||   | |||||||    
T  6605805 tttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaggtgttgaaggaaaagaggttgtatgcta 6605706  T
Q  410 aattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    | || || || ||||| |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  6605705 agttatcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctggg 6605660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20390516 - 20390090
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   || || ||||||||||||    
T  20390516 tcagttgaataaagtgacgataaataataggtatccacttccgagaattgatgattttatggatcagttagtgggttcacgtgtgtttagcaagattgat 20390417  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||  |||||||||| ||| |||    
T  20390416 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacaaatataaagtgatgtctt 20390317  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||  ||||             ||  |||||| | || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || || || ||    
T  20390316 tcggtgttactaatgtgcctg-------------gtgcatgaatagaattttccatgctttcttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatctt 20390230  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||| || || ||  | ||||| || ||||| || | ||||    
T  20390229 gatttattctaagactgaagaagagcatgcggagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaaaaagttgtatgccaagttgtccaaatttgaa 20390130  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 466  Q
    |||| ||| |  |||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  20390129 ttctagttaagtgaagcaagttttcttggccatattattt 20390090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Original strand, 16875447 - 16875868
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  16875447 cagttgaacaaggtgacgattaagaattggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 16875546  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  16875547 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 16875646  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  16875647 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 16875746  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  16875747 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 16875846  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  16875847 tttggttgaaggaagtgagttt 16875868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19984588 - 19984404
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||| || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  19984588 aagaataggtatccacttctgaggattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 19984489  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 233  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  19984488 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaataaaaggtgatgcctttcggtgt 19984404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 242
Target Start/End: Original strand, 22061030 - 22061245
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22061030 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttcccaggattgatgacttaatgaatcagttggtgggtgcaaaagttttcagtaagattgac 22061129  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||  || || || || || |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  22061130 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggaaatgcagaagaaggcctttaggacacgatatggtcattatgaatacaaggtgatgcctt 22061229  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgc 242  Q
    ||||||| || |||||    
T  22061230 tcggtgttactaatgc 22061245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 452
Target Start/End: Original strand, 21848689 - 21849113
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  21848689 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccatttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 21848788  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |   |||||||    || || || ||| ||||  | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  21848789 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcgaaagatatatccaaaactgcgttccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 21848888  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  21848889 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 21848988  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || ||||||||||| || |    
T  21848989 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgggagt 21849088  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    | |||||||||||||| ||||||||    
T  21849089 tttggttgaaggaagtgagttttct 21849113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22030533 - 22030470
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22030533 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggat 22030470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Original strand, 20650707 - 20651128
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  20650707 cagttgaacaaggtgacaattaagaatcggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcaactagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 20650806  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| || |||| ||| || |  ||||||||    || ||||| ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  20650807 tgagatcaggatatcatcaaattagagtaaaggcagaagatatatccaaaacagcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 20650906  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | ||||| || || || || || |||||||||||| | || ||  || | | | |||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  20650907 tggagtatctaatgcgccaggtgtcttcatagagtatatgaatagaatattttatccttatctggaccgttttgtagtggtgttcatagatgatattttg 20651006  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||  ||||||| || ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| | ||| |||||  |  | | |||||| ||||||||||||||      
T  20651007 gtgtattcgaaatctgaggaggagcatgccgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgaga 20651106  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  20651107 tttggttgaaggaagtgagttt 20651128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Original strand, 23155394 - 23155524
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| || || ||||||||||    
T  23155394 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttctgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaagtgtttagtaagattgatt 23155493  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  23155494 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 23155524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 14567445 - 14567144
Alignment:
Q  154 gtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgt 253  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |    
T  14567445 gtgaaggatgaggatttgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaaggcgcctggtgttt 14567346  T
Q  254 ttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaaca 353  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||| |||||| || ||    
T  14567345 ttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaggaggagca 14567246  T
Q  354 tgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctg 453  Q
    |||  |||| || || || || |||||||||| ||| || |||| | | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| || ||||||    
T  14567245 tgcaaagcacctaaaaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctg 14567146  T
Q  454 gg 455  Q
    ||    
T  14567145 gg 14567144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22373298 - 22373168
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||    
T  22373298 tcagttgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagcaaaattgat 22373199  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtga 157  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||    
T  22373198 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtga 22373168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16414520 - 16414413
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  16414520 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 16414421  T
Q  128 tgagatca 135  Q
    ||||||||    
T  16414420 tgagatca 16414413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22436732 - 22436590
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| | | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  22436732 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttatgaggattgatgatttgatggatcggctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 22436633  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatat 170  Q
    |||||||| | ||||| || |||| ||||||||  ||||||||    
T  22436632 tgagatcaggatatcatcatattagagtgaaagcggaagatat 22436590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23902593 - 23902487
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || ||||||  |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  23902593 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcagtatccgcttctgaggattgatgatttaatggatcagctggttggtgcggaagtgttcagtaagattgatt 23902494  T
Q  128 tgagatc 134  Q
    |||||||    
T  23902493 tgagatc 23902487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19869976 - 19869881
Alignment:
Q  174 gaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 269  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||| || ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  19869976 gaagactgccttcagaacccgttatggtcattatgagtattcagtgatgccttttggagtgtccaacgcgccaggagtgtttatggagtatatgaa 19869881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 135
Target Start/End: Original strand, 21194892 - 21194999
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  21194892 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttctgaggattgatgatttaatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 21194991  T
Q  128 tgagatca 135  Q
    | ||||||    
T  21194992 tcagatca 21194999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 135
Target Start/End: Original strand, 24932176 - 24932283
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| || || || || ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  24932176 cagttgaacaaagtgacgattaaaaatcggtatccacttccaatgattgatgatttgatggatcagctggtcggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24932275  T
Q  128 tgagatca 135  Q
    ||||||||    
T  24932276 tgagatca 24932283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 449
Target Start/End: Original strand, 21195204 - 21195312
Alignment:
Q  341 ctgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagga 440  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||| |||||  |  | | |||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||    
T  21195204 ctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagagtgagttttggttgcagga 21195303  T
Q  441 agtaagttt 449  Q
    |||||||||    
T  21195304 agtaagttt 21195312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 449
Target Start/End: Original strand, 23155620 - 23155813
Alignment:
Q  256 atggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatg 355  Q
    ||||| ||||||||| | || || ||| | | |||||| || || || ||||||||||| || ||||||||  | || || ||| ||||||| || ||||    
T  23155620 atggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccgttttgtggtggtgtttattgatgatattttagtgtattcgaagtctgaggaggatcatg 23155719  T
Q  356 ctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
     ||||||| ||| |||||| ||| |||| | ||| || ||  |  | | |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  23155720 ttgagcatttgaggattgtgttgtaagtcttgaaggataatcagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttt 23155813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Original strand, 21233711 - 21234159
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233711 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 21233810  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233811 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 21233910  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21233911 tcggtgtgatcaatgcacctcgagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacatttt 21234010  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21234011 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 21234110  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  21234111 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 21234159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Original strand, 17042995 - 17043443
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17042995 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 17043094  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17043095 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacatctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 17043194  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  17043195 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtgtttatcgatgatatttt 17043294  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17043295 gatttactccaagactaaagaagaacatgctgagcatatgaagattgtcttgcaagtattgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaa 17043394  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  17043395 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 17043443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 33389010 - 33389449
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33389010 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 33389109  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389110 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 33389209  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  33389210 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 33389309  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389310 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 33389409  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  33389410 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 33389449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 21839328 - 21838881
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21839328 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 21839229  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839228 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 21839129  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  21839128 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 21839029  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839028 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 21838929  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  21838928 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 21838881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 21832680 - 21832233
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21832680 cagttgaacaaggtaactatcaagattaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 21832581  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21832580 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 21832481  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  21832480 cggtgtgaccaatgcacatggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 21832381  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21832380 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 21832281  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  21832280 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 21832233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 51331474 - 51331914
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  51331474 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 51331573  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331574 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 51331673  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  51331674 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 51331773  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  51331774 atttactccaagactgaagaagaacatgcggagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttttatgctaaattgtctaagtgtgaat 51331873  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  51331874 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttct 51331914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 40 - 475
Target Start/End: Original strand, 24792609 - 24793044
Alignment:
Q  40 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  24792609 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggtt 24792708  T
Q  140 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24792709 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaaggtatgccttttggtgtgaccaa 24792808  T
Q  240 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24792809 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaag 24792908  T
Q  340 actgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 439  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  24792909 actgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaag 24793008  T
Q  440 aagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  24793009 aagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 24793044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 16348576 - 16349016
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16348576 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16348675  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348676 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16348775  T
Q  228 cggt-gtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
     ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16348776 tgggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatatttt 16348875  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348876 gatttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 16348975  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  16348976 ttctggttgaaagaagtgagttttctaggtcatgttatttc 16349016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 19108746 - 19108299
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19108746 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 19108647  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19108646 tgaggtcaggttatcaccagataaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcaccatgaatataaagttatgccttt 19108547  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19108546 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccacgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgatgatattttg 19108447  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19108446 atttactctaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttccaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 19108347  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  19108346 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 19108299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 40 - 475
Target Start/End: Original strand, 22503282 - 22503717
Alignment:
Q  40 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  22503282 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcaggtt 22503381  T
Q  140 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22503382 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgtctttcggtgttaccaa 22503481  T
Q  240 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 339  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22503482 tgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcggggttgttttcatcgatgatattttgatttactccaag 22503581  T
Q  340 actgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 439  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |    
T  22503582 actgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaaatatctaagtgtgagttctggttgaaag 22503681  T
Q  440 aagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    | ||||||||||| ||| |||| |||| || |||||    
T  22503682 aggtaagttttcttggccatgtcatttatggtgatg 22503717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 41351649 - 41352082
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaa-taggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  41351649 cagttgaacaaggtaactatcaagaaataggtatccacttccgagaaat-------tgatggatcagttagtgggtgcgcgagttttcagcaagattgat 41351741  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41351742 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctt 41351841  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  41351842 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgtgttcatcgacgatatttt 41351941  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41351942 gatttactccaagactgaagaagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 41352041  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  41352042 ttctggttgaaagaagtgagttttcttggtcatgttatttc 41352082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 22360224 - 22360666
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  22360224 tcagttgaacaaggtgacaataaagaatagatatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcaacaagatagat 22360323  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  22360324 ttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctt 22360423  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  22360424 tcggtgttacaaatgcaccttgagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcattttaggatcggttcgtcgttgtttttattgatgatatttt 22360523  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||  | || ||||| |||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22360524 gatttactccaagtctgaagaagaacctgctgagcatttgaaactggttttgcaggtgttgaaagagaagatgatttatgcgaaattgtctaagtgtgaa 22360623  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| ||  ||||||||||||    
T  22360624 ttctggttgaaggaagtgagctatcttggacatgttatttctg 22360666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 430097 - 430538
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  430097 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaacttccaaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 430196  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  430197 tgagatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagccttcagaacgcggtatgctcactatgagtacaaggttatgccttt 430296  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || || |||||||||    
T  430297 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgattcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatattttg 430396  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  430397 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattatctaagtgtgaat 430496  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  430497 tctggttaaaagaagtgagctttcttgggcatgttatttctg 430538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20140462 - 20140021
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  20140462 tcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 20140363  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || || ||| | |    
T  20140362 ttgagttcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaggtaatgtcgt 20140263  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || || || || ||||||||    
T  20140262 tcggtgtcacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttttggttgttttcattgatgatatttt 20140163  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20140162 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgatcacttgaagattgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctctatgctaaattgtctaagtgtgaa 20140063  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||| |||||||||||    
T  20140062 ttctggttgaaaaaagtgagctttcttggccatgttatttct 20140021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Original strand, 50618400 - 50618820
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || | ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  50618400 aagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttaacaagattgatttgagatcgggttatcaccaga 50618499  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  50618500 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcccctgg 50618599  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  50618600 agtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcattttttgatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgaggaa 50618699  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  50618700 gaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagtt 50618799  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||  ||||||||||||    
T  50618800 ttcttggacatgttatttctg 50618820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21751318 - 21750877
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  21751318 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtaggtgcaagtgttttcaacaagatagatt 21751219  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  21751218 tgagatcgggtcatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacaacttttaggacgcggtatggacattatgagtataaagttatgccttt 21751119  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| || ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||     
T  21751118 tggtgttactaatgctcttggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatatttta 21751019  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21751018 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaaaagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 21750919  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  21750918 tctggttaaaagaagtaatttttcttggacatgttatttctg 21750877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Original strand, 21862354 - 21862792
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||   || |||||||||||  |||    
T  21862354 cagttgaacaaagtaacgagaaagaataggtatccacttccaagaatagatgacttgatggatcagttggtgggtgcacgtgtgttcagcaagatacatt 21862453  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| |||||||||||||||||    
T  21862454 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatgcacattatgagtataaagttatgccttt 21862553  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || || |||||     
T  21862554 cggtgttacaaatgcacctagtgtgtttatggagcacatgaatcgcatttttcatgcatttttggaccgtttcgtggttgtttttattgatgacatttta 21862653  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21862654 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatttgaagatggttttgcaagtgttcaaagagaagaagctttatgctaaattatctaagtgtgaat 21862753  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 466  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||  |||||||||    
T  21862754 tctggttgaaagaggtgagttttcttggacatgttattt 21862792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16378473 - 16378162
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||    
T  16378473 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcaacaagattgatt 16378374  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  16378373 tgagatcaggttatcactagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 16378274  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||  ||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||||||    
T  16378273 cggtgttacaaatgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaatcgaatttttcatgtgtttttggatcgtttcgtggttgtgtttattgatgacattttg 16378174  T
Q  328 atttactccaag 339  Q
    || |||| ||||    
T  16378173 atatacttcaag 16378162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 451
Target Start/End: Original strand, 19661116 - 19661540
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  19661116 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaatgttttcagtaagattgac 19661215  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  19661216 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctctaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctt 19661315  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   | |||   ||||| || |||||||| || || || ||    
T  19661316 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctagataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 19661415  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || | |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  19661416 gatttattcaaggactgaagaagagcatgcatagcatctgaagattgtattgtaagtgttaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 19661515  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttc 451  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||    
T  19661516 ttctggttaagtgaagtgagttttc 19661540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Original strand, 21743554 - 21743974
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || || || || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  21743554 aagaataggtatccacttccgagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 21743653  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| |||||  |||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  21743654 ttaaggtgaagaatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 21743753  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| ||  | || || ||||| || |||||||| |||    
T  21743754 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttaatttattctaagactgaagaa 21743853  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  |||||||||     
T  21743854 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagtc 21743953  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| |  |||||||||    
T  21743954 ttcttggccacattatttctg 21743974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 48425283 - 48424855
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  48425283 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 48425184  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  48425183 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 48425084  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  48425083 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 48424984  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  48424983 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 48424884  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  48424883 ttctggttaaatgaagtaagttttctggg 48424855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 52988151 - 52987723
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  52988151 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 52988052  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  52988051 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 52987952  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  52987951 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 52987852  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  52987851 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 52987752  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  52987751 ttctggttaaatgaagtaagttttctggg 52987723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 455
Target Start/End: Original strand, 24097587 - 24098011
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  24097587 ttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagcaagatcgacttga 24097686  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||  || || ||||| || || |||||||||||    
T  24097687 ggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatgaacattacgaatacaaggtgatgcctttcgg 24097786  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || || ||| ||||     
T  24097787 tgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatc 24097886  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    || || |||||||| || || ||||| ||  ||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  24097887 tattctaagactgaagaggagcatgcagaaaatctgaagattgtattgtaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttct 24097986  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||    
T  24097987 ggttaagtgaagtgagttttctggg 24098011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 37679459 - 37679031
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||  | || || |||||||||    
T  37679459 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatatttagtaagattgat 37679360  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37679359 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 37679260  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  37679259 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 37679160  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || ||||||    
T  37679159 aatctattccaagaatgaggagaagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaa 37679060  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    ||||||||    |||||||||||| ||||    
T  37679059 ttctggttaggtgaagtaagttttttggg 37679031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 19856688 - 19856281
Alignment:
Q  23 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 122  Q
    ||||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19856688 atcatcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcaattagtgggtgcaaaggttttcagtaagat 19856589  T
Q  123 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 222  Q
    ||| || || ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  19856588 tgacttaaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggttactatgaatataaggtgatg 19856489  T
Q  223 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgata 322  Q
    ||||||| ||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   ||||| || |||||||| |  || |    
T  19856488 cctttcgttgttactcatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgtgtttattggtgaca 19856389  T
Q  323 ttttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 422  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||||  || ||||||||||| || |||||| | |  ||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||    
T  19856388 ttttgatttattctaagactgaagaagagcatgaagaacatctgaagatagtattgcaaatattaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtg 19856289  T
Q  423 tgaattct 430  Q
    ||| ||||    
T  19856288 tgagttct 19856281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Original strand, 20854740 - 20855188
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  20854740 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 20854839  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  20854840 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 20854939  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  20854940 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatttt 20855039  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    |||||| || || ||||| || || ||||| || ||  |||||||||| |||||  | | ||| ||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||    
T  20855040 gatttattctaaaactgaagaggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaggag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 20855138  T
Q  426 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
     |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  20855139 gttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 20855188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 20296791 - 20296363
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  20296791 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgaggatttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 20296692  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  20296691 ttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 20296592  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  20296591 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 20296492  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||| ||| || || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||| ||| || |||| | | ||||| || ||||| || |||||     
T  20296491 aatttattctaagaatgaagaggagcatgcagagcatctaagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 20296392  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  20296391 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 20296363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 434
Target Start/End: Original strand, 20833902 - 20834287
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| ||| | || || || |    
T  20833902 aagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggttttcagtatgattgacttgaggtcaggttaccatcaaa 20834001  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| | |||    
T  20834002 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttaggtgttactaatgcgcgtgg 20834101  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   ||||| || |||||||| || |||||| ||||||| || |||||||| |||    
T  20834102 tgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattcaaagactgaagaa 20834201  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtt 434  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| |||||| | | ||||||||| |   | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  20834202 gaacatgcagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaggttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtt 20834287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Original strand, 31537977 - 31538405
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||  | || ||||| ||  | || || ||||| |||    
T  31537977 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaactggttggtgctaagatatttagtaagatagat 31538076  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  31538077 ttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 31538176  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  31538177 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 31538276  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  31538277 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 31538376  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  31538377 ttctggttaaatgaagtaagttttctggg 31538405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 313 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 21026266 - 21026104
Alignment:
Q  313 atcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaat 412  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  21026266 atcgatgatattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaaa 21026167  T
Q  413 tgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  21026166 tatctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagtttttttggccatgttatttctggtgatg 21026104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 20938043 - 20938485
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  20938043 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttcctaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 20938142  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  20938143 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 20938242  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |  ||||||   ||||| || |||||||| || || | | |    
T  20938243 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacttggataaattcgtggttgtgtttattgatgacagtct 20938342  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||  || || || ||||| | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  20938343 gatttattcgaagactgaagaagagcatgtagagcatctgagaatagtattacaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 20938442  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  |||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  20938443 ttctggttaattgaagtaagttttcttggccacattatttctg 20938485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 38910806 - 38911248
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  38910806 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 38910905  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||| || || |||||||    
T  38910906 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 38911005  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||  |||||  ||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  38911006 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccaaattttccatgctttcctggataagtttgttgtggtatttattgatgatatttt 38911105  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | ||||||||  |||| || |||||     
T  38911106 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagctgtcgaaatgtgag 38911205  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||  || |||||||||    
T  38911206 ttctggttaagtgaagtgagctttctgggtcatattatttctg 38911248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 196 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20944240 - 20944119
Alignment:
Q  196 tatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 295  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20944240 tatggtcattatgaataaaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 20944141  T
Q  296 ggttcgtagtggtgtttatcga 317  Q
    |||||||||| ||||| |||||    
T  20944140 ggttcgtagttgtgttcatcga 20944119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 21953288 - 21952860
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||||||     
T  21953288 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttcctggaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgac 21953189  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  21953188 ttgaggtcgggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 21953089  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  21953088 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 21952989  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| |||||||  || || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| ||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  21952988 aatttattccaagaacgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgag 21952889  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  21952888 ttctggttaagcgaagtgagctttctggg 21952860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41310938 - 41310694
Alignment:
Q  25 catcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattg 124  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   || ||  | || | ||    
T  41310938 catcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttcgtaaaactg 41310839  T
Q  125 atttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc 224  Q
    ||||||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  41310838 atttgaggtccggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataacgtgatgtc 41310739  T
Q  225 tttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 269  Q
    ||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  41310738 tttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaa 41310694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Original strand, 20829373 - 20829794
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  20829373 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 20829472  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  20829473 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 20829572  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  20829573 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 20829672  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  20829673 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 20829772  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  20829773 tttggttgaaggaagtgagttt 20829794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Original strand, 35930806 - 35930936
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  35930806 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgctgaggtgtttagtaagattgatt 35930905  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  35930906 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 35930936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Original strand, 41215837 - 41215967
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||  |||| || || ||||||||||    
T  41215837 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatt 41215936  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  41215937 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 41215967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 307 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 41308772 - 41308610
Alignment:
Q  307 gtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatg 406  Q
    |||||||| || || || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||    
T  41308772 gtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatg 41308673  T
Q  407 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  41308672 ccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctg 41308610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20927432 - 20927017
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| || || || |||||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || ||||||||||||     
T  20927432 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcgatatccacttcaaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagcaagattgata 20927333  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  20927332 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 20927233  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | ||||  | || || |||||||| || || |||||||||    
T  20927232 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacagttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 20927133  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||||| | ||| |||||  |  | | |||||| || ||||||||||| |    
T  20927132 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaatcagttatgtgctaagttatctaagtgtgagt 20927033  T
Q  428 tctggttgaaggaagt 443  Q
    | ||||||||||||||    
T  20927032 tttggttgaaggaagt 20927017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20527431 - 20527301
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||  | | |||| || || || ||||||||||    
T  20527431 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagaagatacaaaggtgtttagtaagattgatt 20527332  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    |||||||| | ||||| | ||||| ||||||    
T  20527331 tgagatcaggatatcatctgattagagtgaa 20527301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16378156 - 16378079
Alignment:
Q  392 agaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  16378156 agaagaagctatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggttagttttcttggccatgttatttctg 16378079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 149
Target Start/End: Original strand, 22133735 - 22133856
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||| || | ||| |  || | || || ||||||||||    
T  22133735 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaagggttgatgatctgatggatcagctatttggtactgaaatgtttagtaagattgatt 22133834  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagat 149  Q
    |||||||| | ||||| |||||    
T  22133835 tgagatcaggatatcatcagat 22133856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 21200935 - 21200996
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatgga 89  Q
    |||||||| |||||||  || |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21200935 cagttgaataaggtaatgattaagaatcgatatccactcccgaggattgatgatttgatgga 21200996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 16805094 - 16805535
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805094 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 16805193  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805194 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagcacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 16805293  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16805294 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacatttt 16805393  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805394 gatttactccaagactgaaggagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 16805493  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16805494 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttct 16805535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 16637755 - 16637308
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16637755 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16637656  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16637655 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 16637556  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16637555 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 16637456  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16637455 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 16637356  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  16637355 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 16637308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 48427429 - 48426982
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  48427429 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 48427330  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427329 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 48427230  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48427229 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 48427130  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427129 atctactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 48427030  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  48427029 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 48426982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 5108759 - 5109198
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5108759 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 5108858  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5108859 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 5108958  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  5108959 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatatcttg 5109058  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5109059 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 5109158  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  5109159 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 5109198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 15346393 - 15346832
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15346393 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 15346492  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346493 tgaggtcaggttatcaccagcttaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 15346592  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15346593 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 15346692  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346693 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 15346792  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  15346793 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 15346832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 15587540 - 15587987
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15587540 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 15587639  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587640 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggtcactatgaatataaagttatgccttt 15587739  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15587740 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 15587839  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587840 atctactccaagactgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 15587939  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  15587940 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 15587987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 13254672 - 13254225
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13254672 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 13254573  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13254572 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 13254473  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  13254472 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 13254373  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13254372 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 13254273  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  13254272 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 13254225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 6602718 - 6602277
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6602718 cagttgagcaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 6602619  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6602618 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcaaaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 6602519  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6602518 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 6602419  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6602418 atttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgacgattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 6602319  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  6602318 tctggttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttctg 6602277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 10007582 - 10007141
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10007582 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 10007483  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10007482 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 10007383  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10007382 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 10007283  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10007282 atttactccaagactgaagaagaacattctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 10007183  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  10007182 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctg 10007141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 15400665 - 15401112
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  15400665 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 15400764  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400765 tgaggtcaggttatcaccaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 15400864  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  15400865 tggtgttaccaatgcacttggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 15400964  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15400965 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 15401064  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  15401065 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 15401112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 10908192 - 10907751
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10908192 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 10908093  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908092 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 10907993  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10907992 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 10907893  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10907892 atttactccaagactgaagaagaacattttgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 10907793  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  10907792 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctg 10907751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 16694147 - 16693699
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16694147 tcagttgaataaggtaactatcaagaatatgtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcgaaagtcttcagcaagattgat 16694048  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16694047 ttgagatcaggttatcaccagattaatgtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatataaagttatgccat 16693948  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16693947 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttatagacgaaatttt 16693848  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16693847 gatatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgag 16693748  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  16693747 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggtcatgttatttctggtgatg 16693699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 12888691 - 12888252
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12888691 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 12888592  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12888591 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 12888492  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  12888491 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtagtgttcatcgatgatattttg 12888392  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12888391 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcacctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgcaaaattgtctaagtgtgaat 12888292  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  12888291 tctggttgaaagaagtgagtttacttggccatgttatttc 12888252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 20060202 - 20060649
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20060202 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 20060301  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060302 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 20060401  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  20060402 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 20060501  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20060502 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 20060601  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  20060602 tttggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 20060649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 467
Target Start/End: Original strand, 53383168 - 53383605
Alignment:
Q  30 gttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttg 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  53383168 gttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatttg 53383267  T
Q  130 agatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcg 229  Q
    |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53383268 agatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcg 53383367  T
Q  230 gtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  53383368 gtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgat 53383467  T
Q  330 ttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattc 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53383468 ttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaggtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattc 53383567  T
Q  430 tggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  53383568 tggttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttc 53383605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 3687925 - 3687486
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  3687925 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggagcacgagttttcagcaagattgatt 3687826  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3687825 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 3687726  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3687725 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 3687626  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3687625 atttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaat 3687526  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  3687525 tctggttgaaagaagtgagttttctaggtcatgttatttc 3687486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 5423078 - 5423517
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5423078 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 5423177  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423178 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 5423277  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  5423278 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttatgttcatcgacgatatcttg 5423377  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423378 atttactctaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 5423477  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  5423478 tcttgttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttc 5423517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 16754849 - 16755288
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16754849 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16754948  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16754949 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 16755048  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  16755049 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttattgacgatattttg 16755148  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  16755149 atttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtttgtgtgtgaat 16755248  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  16755249 tctggttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttc 16755288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 57 - 475
Target Start/End: Original strand, 14874676 - 14875094
Alignment:
Q  57 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  14874676 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagta 14874775  T
Q  157 aaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgttta 256  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |    
T  14874776 aaagacgaagatttgcagaagacatctttcagaacgcggtatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtattca 14874875  T
Q  257 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgc 356  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14874876 tggagtacatgaatcgcatctttcatgcctttttggatcgattcgtggttgtttttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 14874975  T
Q  357 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggc 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  14874976 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaagtaagttttcttggc 14875075  T
Q  457 gatgttatttctgatgatg 475  Q
      ||||||||||| |||||    
T  14875076 cttgttatttctggtgatg 14875094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 116 - 475
Target Start/End: Original strand, 15723170 - 15723529
Alignment:
Q  116 gcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 215  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15723170 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataa 15723269  T
Q  216 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatc 315  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  15723270 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatc 15723369  T
Q  316 gacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgt 415  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15723370 gatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgt 15723469  T
Q  416 ctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  15723470 cgaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 15723529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 17491829 - 17491391
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  17491829 ttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgattatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatttga 17491730  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |    
T  17491729 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcag 17491630  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||    
T  17491629 tgttacaaatgcacctggagtatttatgaagtacatgaatcgcatctttcattcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatt 17491530  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17491529 tactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattct 17491430  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  17491429 ggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 17491391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 166 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 12500092 - 12499783
Alignment:
Q  166 gatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12500092 gatatgcataagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtaca 12499993  T
Q  266 tgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatct 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12499992 tgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatct 12499893  T
Q  366 gaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatt 465  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  12499892 gaagattgtcttgcaagtgttgatagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatt 12499793  T
Q  466 tctgatgatg 475  Q
    |||| |||||    
T  12499792 tctggtgatg 12499783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15261612 - 15261171
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  15261612 cagttaaacaaagtgacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgaattgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 15261513  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  15261512 tgagatcgggttatcactagattaaactgaaagatgaagatatgcagaagatggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 15261413  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| |  ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  15261412 cggtgttagaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtattcatcgatgatattttg 15261313  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15261312 atatattccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaaattgtaaaagtgtgaat 15261213  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  15261212 tctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctg 15261171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 203 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 15341076 - 15340804
Alignment:
Q  203 actatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15341076 actatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgt 15340977  T
Q  303 agtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt 402  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15340976 ggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgttgaaagagaagaaactt 15340877  T
Q  403 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  15340876 tatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 15340804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15358065 - 15357886
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  15358065 cagttgaacaaggttactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 15357966  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 207  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357965 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 15357886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Original strand, 11959305 - 11959733
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||    
T  11959305 tcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgagtgcaaaggtgttcagtaagattgat 11959404  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||  |||| || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  11959405 ttgaggtctggttaccatcagatgaaggtcaaggatgaggatatgcagaagacgacttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 11959504  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||| |||||   ||  |||| |||||||| || ||||||||    
T  11959505 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggaatatatgaataggattttccatgcttttctggataaatttctagttgtgtttattgatgatatttt 11959604  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| ||||   | ||||| || ||||| || ||||||    
T  11959605 aatctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgaa 11959704  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  11959705 ttctggttaagtgaagtgagttttctggg 11959733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 249
Target Start/End: Original strand, 14579557 - 14579777
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  14579557 agttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgattt 14579656  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||| || ||| | |||    
T  14579657 gaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaatgcggtatggacattatgagtataaggtgatgtcgttc 14579756  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctgga 249  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  14579757 ggtgttacaaatgcacctgga 14579777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 47125937 - 47125509
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  47125937 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagatttttagtaagattgat 47125838  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  47125837 ttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 47125738  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || |||||| |    
T  47125737 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattct 47125638  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || ||||||    
T  47125637 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaa 47125538  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  47125537 ttctggttacatgaagtaagttttctggg 47125509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 469
Target Start/End: Original strand, 13318634 - 13319080
Alignment:
Q  23 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 122  Q
    ||||||||||||| || || || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||    
T  13318634 atcatcagttgaataaagttacaataaagaacagatatccactcccgaggattgatgatttgatggatcagttggtgggtgcaaaagtttttagtaaaat 13318733  T
Q  123 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 222  Q
    ||| ||||| ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || |  |||||||| || ||||| || || |||    
T  13318734 tgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatg 13318833  T
Q  223 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgata 322  Q
    || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || ||||    
T  13318834 ccattcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtggtggtatttattgatgata 13318933  T
Q  323 ttttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagt 421  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || || ||||| || |||||||||||| | |||||| | | ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  13318934 ttttaatttattccaagactaaagaggagcatgcagaacatctgaagattatgttgcaaattttgaaagag-agaaatttgtatgctaaattgtcgaagt 13319032  T
Q  422 gtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    | || |||||||| |  ||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  13319033 gcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggctacgttatttctg 13319080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 452
Target Start/End: Original strand, 31693321 - 31693746
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  31693321 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagggttgacgacttgatggaccagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 31693420  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| || || |||||||    
T  31693421 ttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattatgaatacaaggtgatgcctt 31693520  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||   ||||| || || ||||| || || ||  |    
T  31693521 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaactgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatact 31693620  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| |  |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  | |||||||| ||||| || |||||     
T  31693621 gatttatttaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 31693720  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  31693721 ttctggttaagtgaagtaagttttct 31693746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 31940896 - 31940471
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  31940896 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggaccagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 31940797  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||  || |||||||| || || |||||||    
T  31940796 ttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaggatgaggatatgcataagacagcctttaggacacgatatgcacattatgaatacaaggtgatgcctt 31940697  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||   ||||| || || ||||| || || ||  |    
T  31940696 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatact 31940597  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  | |||||||| ||||| || |||||     
T  31940596 gatttattcaaagactgaagaatagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 31940497  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  31940496 ttctggttaagtgaagtaagttttct 31940471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 28756307 - 28755883
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||  ||  |||| || |||||||||||||    
T  28756307 ttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgttaagatttttagtaagattgatttga 28756208  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28756207 ggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 28756108  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || ||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  28756107 tgttactaatgcgccgggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatt 28756008  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || ||||| ||||    
T  28756007 tattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttct 28755908  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  28755907 ggttaaatgaagtaagttttctggg 28755883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 12358663 - 12359105
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||| |||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||     
T  12358663 tcagttgcacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagaatgac 12358762  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |  || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  12358763 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 12358862  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   || || || || ||||| || || ||| |    
T  12358863 tcggtgttactaaagcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattagtggttgtatttattgatgacattct 12358962  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  12358963 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 12359062  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  12359063 ttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 12359105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 11950044 - 11950486
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||  ||||| || ||||||||     
T  11950044 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcatttggtgggtgcaagggtttttagtaagattgac 11950143  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || |  |||||||    
T  11950144 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggggatgcctt 11950243  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |   |||||   ||||| || |||||||| || |||||| |    
T  11950244 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtagatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattct 11950343  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  11950344 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatttgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 11950443  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  11950444 ttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 11950486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 17188345 - 17187925
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  17188345 aagaacaggtatccacttccgaggatggatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaga 17188246  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  17188245 tcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 17188146  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| | |||||||   || || || || || || || || ||| ||||||| || | ||||||||||    
T  17188145 tgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatttggataaatttgtggttgtattcattgatgacattctgatttattcaaggactgaggaa 17188046  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||||    
T  17188045 gagcatgcagaacatctgaaaattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagtt 17187946  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| |  |||||||||    
T  17187945 ttcttggccacattatttctg 17187925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 15013904 - 15014344
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||| ||||   || ||||| ||||||||||    
T  15013904 cagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccgaggatccacgatttgatggattagttagtggatgcacgtgtgttcagtaagattgatt 15014003  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    | |||||  | |||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||||  | || || ||  ||||||| || || ||||||   || ||||||||    
T  15014004 taagatcgggctatcaccatatcagagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacatgttatggacattacgaatattcggtgatgccttt 15014103  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||||||||| || || || |||||||| || |||||| |     
T  15014104 cggtgttactaacgcgcctggagtgtttatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgatttgttgttgtgtttatagatgatattcta 15014203  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaag-attgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| || || ||||| |||||||||  ||| ||||||||  | ||||| || || || ||||| |||    
T  15014204 atatactctaagaccgaggaggaacatgccgagcat-tgtagaattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaa 15014302  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||    
T  15014303 ttctggttgaacgaagtgagttttcttggccatattatttct 15014344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24185172 - 24185035
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24185172 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 24185073  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaa 165  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24185072 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaa 24185035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 475
Target Start/End: Original strand, 16379068 - 16379512
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  16379068 ttgaacaaagttacaattaagaataggcatccacttccgaggattgatgacttgatggaccacctagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgatttga 16379167  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  16379168 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaatgatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 16379267  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||   ||| | ||||| ||||| || |||||| |||||    
T  16379268 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaattcctggtggtatttattgatgatattctgatt 16379367  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    || || |||||| | ||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| |||||||| || ||||| || |    
T  16379368 tattctaagacttaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagtttt 16379467  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    || | |  ||||||||||| || ||  || ||||||||| |||||    
T  16379468 ggctaagtgaagtaagtttccttggtcatattatttctggtgatg 16379512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 12180337 - 12179889
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||   || || || ||||||||     
T  12180337 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtatttagtaagattgac 12180238  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcac------tatgaatataaagtta 220  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||      ||||||||||| || |    
T  12180237 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatatatatgaatataaggtga 12180138  T
Q  221 tgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacga 320  Q
    || |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   || ||   ||||| || |||| ||| || ||    
T  12180137 tgtctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctgaataaattcgtggttgtgtctattgatga 12180038  T
Q  321 tattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaag 420  Q
     ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||  | |||||||| ||||| |||    
T  12180037 cattctaatttattataagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaag 12179938  T
Q  421 tgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  12179937 tgtgagttctggttaattgaagtgagttttcttggccacattatttctg 12179889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13944013 - 13943677
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  13944013 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 13943914  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  13943913 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 13943814  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||    
T  13943813 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 13943714  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctga 367  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  13943713 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctga 13943677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 10418181 - 10418623
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  10418181 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 10418280  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || || || ||||| |||||||    
T  10418281 ttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggacgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 10418380  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  10418381 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatctt 10418480  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||| || || || ||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||| | | |||||||| |||  | ||||| ||  |||| ||||| ||     
T  10418481 gatctattcaaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaggaagttgtatgccaagctgtcgaagtgcgag 10418580  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  10418581 ttctggttaaatgaagtgagttttctaggccacgttatttctg 10418623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 41179511 - 41179117
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  41179511 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 41179412  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  41179411 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcgg 41179312  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||    
T  41179311 tgttactaacgcacccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 41179212  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    || || |||||||| ||||| ||| | || |||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||    
T  41179211 tattcgaagactgaagaagagcattcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtga 41179117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15229574 - 15229154
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  15229574 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatcgatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 15229475  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| |  ||||||||| |||| || || || || || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||| |    
T  15229474 ttaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctag 15229375  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||| || |||||| | |  |||||||| | | | |||   || || || |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  15229374 tgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattctaagactgaagaa 15229275  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||  | ||||| |  ||||| || ||||||||| |||| |  ||||||||||    
T  15229274 gagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccatgttgtccaaatgtgaattcgggttaagtgaagtaagtt 15229175  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| |  |||||||||    
T  15229174 ttcttggccacattatttctg 15229154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15235442 - 15235022
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  15235442 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatcgatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 15235343  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| |  ||||||||| |||| || || || || || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||| |    
T  15235342 ttaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctag 15235243  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||| || |||||| | |  |||||||| | | | |||   || || || |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  15235242 tgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattctaagactgaagaa 15235143  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||  | ||||| |  ||||| || ||||||||| |||| |  ||||||||||    
T  15235142 gagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccatgttgtccaaatgtgaattcgggttaagtgaagtaagtt 15235043  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| |  |||||||||    
T  15235042 ttcttggccacattatttctg 15235022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 369
Target Start/End: Original strand, 16826439 - 16826754
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   || || || || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  16826439 aagaataggtatccacttccgaggattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 16826538  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||  ||||    
T  16826539 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttttggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgtctgg 16826638  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||||||     |||||   || || || |||||||| || || || |||||||| ||  ||||||| |||    
T  16826639 tgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgc-----tggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctgagactgaagaa 16826733  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaag 369  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  16826734 gagcatgcagagcatctgaag 16826754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 431
Target Start/End: Original strand, 18132504 - 18132886
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  18132504 aagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaga 18132603  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  18132604 ttaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 18132703  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |   |||||   || || || |||||||| ||||||||  | ||||| || |||||||| ||     
T  18132704 tgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatatcctaatttattcaaagactgaagag 18132803  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctg 431  Q
    || | | | || ||||||| |||| | |||||||||| |||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  18132804 gagcttacggaacatctgaggattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctg 18132886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 44779236 - 44778842
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  44779236 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgagaattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 44779137  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  44779136 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 44779037  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || || || || || || || ||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || || ||| |||||    
T  44779036 tgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtttatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatt 44778937  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| | |||||| | |||| | ||||| ||| |||| || |||||    
T  44778936 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaaattgtatgccaaactgtcgaaatgtga 44778842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 213
Target Start/End: Original strand, 11888526 - 11888687
Alignment:
Q  52 aataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagatta 151  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  11888526 aataggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagatta 11888625  T
Q  152 aagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatat 213  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||| || |||||||||    
T  11888626 aagtgaaagacgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgttatggacattatgaatat 11888687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 332
Target Start/End: Original strand, 12510619 - 12510924
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| ||||||||     
T  12510619 tcagttgaaaaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgac 12510718  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || ||  |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||| | |||||||    
T  12510719 ttgaggtctggttaccattagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcatttaggacacgttatggtcattacgagtacaaaatgatgcctt 12510818  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  12510819 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 12510918  T
Q  327 gattta 332  Q
     |||||    
T  12510919 aattta 12510924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 30139798 - 30139377
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  30139798 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 30139699  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  30139698 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 30139599  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  30139598 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 30139499  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  30139498 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 30139399  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  30139398 tttggttgaaggaagtgagttt 30139377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 30149349 - 30148928
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  30149349 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 30149250  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  30149249 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 30149150  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  30149149 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 30149050  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  30149049 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 30148950  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  30148949 tttggttgaaggaagtgagttt 30148928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Original strand, 16834651 - 16835094
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||     ||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||     
T  16834651 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgaga-----tgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattttcagtaagattgac 16834745  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || | ||| || || |||||||    
T  16834746 ttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatggagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgtatacaaggtgatgcctt 16834845  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||| |||||  ||| || || || ||||| || || ||  |    
T  16834846 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcatttctggataagtttgtggttgtatttattgatgacatcct 16834945  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| |||||||| || |||||     
T  16834946 aatttattctaagactgacgaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgag 16835045  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    || ||| | |  ||||| ||||| || ||| || ||||||||| |||||    
T  16835046 ttttggctaagtgaagtgagtttccttggccatattatttctggtgatg 16835094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 43164657 - 43164550
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||  ||    
T  43164657 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaatatttttt 43164558  T
Q  128 tgagatca 135  Q
    ||||||||    
T  43164557 tgagatca 43164550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 14088666 - 14088224
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || |||||     
T  14088666 tcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgac 14088567  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  14088566 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 14088467  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||   || || || || || || || || |||||    
T  14088466 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacatttt 14088367  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||| || || |  ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| ||     
T  14088366 gatctattcgagaactgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgag 14088267  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    || ||||| |  ||||| |||||||| ||| || |||||||||    
T  14088266 ttttggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctg 14088224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10407961 - 10407720
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  10407961 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 10407862  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  10407861 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtaatgcctt 10407762  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatga 268  Q
    || |||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  10407761 tctgtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatga 10407720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 258
Target Start/End: Original strand, 14291690 - 14291899
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||||||| ||  | || || ||||    
T  14291690 aagaacaggtatccacttctgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcttgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcgggttaccatcaga 14291789  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || |||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  14291790 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttttggtcactatgaatataagatgatgcatttcggtgttactaatgcgcctgg 14291889  T
Q  249 agtgtttatg 258  Q
     |||||||||    
T  14291890 tgtgtttatg 14291899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15612095 - 15611674
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  15612095 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgctgaggtgtttagtaagattgatt 15611996  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  15611995 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 15611896  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| ||||||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  15611895 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 15611796  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| ||     | | ||| || ||||||||| |||| |    
T  15611795 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagttttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagcgtgagt 15611696  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  15611695 tttggttgaaggaagtgagttt 15611674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 105
Target Start/End: Original strand, 15714204 - 15714281
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15714204 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 15714281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24189297 - 24189076
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  24189297 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 24189198  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||||||||| ||| |||    
T  24189197 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaatataaagtgatgtctt 24189098  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    ||||||| || ||||| |||||    
T  24189097 tcggtgttactaatgcgcctgg 24189076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 8272548 - 8272968
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || |||||||||||    
T  8272548 agttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgattt 8272647  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||     
T  8272648 gagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccattt 8272747  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||     
T  8272748 ggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttgg 8272847  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | |  || || |||||||||||||| ||    
T  8272848 tgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagtt 8272947  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  8272948 ttggttgaaggaagtgagttt 8272968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Original strand, 15948618 - 15949033
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  15948618 cagttgaacaaagtaacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 15948717  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||| | | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  15948718 tgagattaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattccgtgatgccatt 15948817  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  ||||||| || || || |||||||| ||||||||| | || || ||| | | |||||| || || || ||||| || || || |||||||||    
T  15948818 tggagtatccaatgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccgatttgtggtggttttcatagatgatattttg 15948917  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | |  || || ||||||||||||||||    
T  15948918 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgagccaagttgtctaagtgtgaat 15949017  T
Q  428 tctggttgaaggaagt 443  Q
    | ||||||||||||||    
T  15949018 tttggttgaaggaagt 15949033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 16327796 - 16328238
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| ||||| |  || ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||||||     
T  16327796 tcagttgaataaggtcatgataaagaacaggtatccactttcgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgac 16327895  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||  ||  | || || |||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||  |||| || || || |||||||| || || || || || |||||||    
T  16327896 ttgatgtctggttaccatcagattaaggtgaagaatgaggatatgcagaaaacgacttttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctt 16327995  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||  | ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  ||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  16327996 tcggtgttactaacacgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcctttccggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 16328095  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || || |||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||  | |||||||||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  16328096 aatctattctaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagatttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 16328195  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    || ||||| |  ||||| |||||||||||  || |||||||||    
T  16328196 ttatggttaagtgaagtgagttttctgggtcatattatttctg 16328238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Original strand, 13970278 - 13970698
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||| | || || ||||    
T  13970278 aagaacagatatccgcttccgaggattgacgacctgatggatcagttggttggtgcgaagatttttagtaaaattgacttgagatcaggttaccatcaga 13970377  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  13970378 tcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 13970477  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||   || || || || || || || || |||||||| || || |  |||||||||    
T  13970478 tgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaa 13970577  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| || ||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||    
T  13970578 gagcatgcagaacatctgagggttgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagtt 13970677  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| || |||||||||    
T  13970678 ttcttggccatattatttctg 13970698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Original strand, 6151001 - 6151422
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  6151001 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcgatatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 6151100  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || |  ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  6151101 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaaggcagaagatatatccaaaactgtgttccgaacgaggtatggacactatgagtattttgtgatgccatt 6151200  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | ||||| || || || ||||||||||||||||||   || || ||| | | | | || || || || ||||||||||| || |||||||||    
T  6151201 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggagtatatgaataaaatatttcatccttatctagaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttg 6151300  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||  |  | | |||||| ||||||||||| || |    
T  6151301 gtgtattcgaaatctgaggaggagcatgctgagcatctgacgattgtgttgcaagtgttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgcgagt 6151400  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  6151401 tttggttgaaggaagtgagttt 6151422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 452
Target Start/End: Original strand, 13965500 - 13965925
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  13965500 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 13965599  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
     ||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  | ||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  13965600 cgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggtagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 13965699  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  ||||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  13965700 tggagtatccaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 13965799  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaa-catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     | || || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||  | |||||||||  |  | | ||| || ||||||||||||||     
T  13965800 gtgtattcgaagtctgaggaagaagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagacttgaaagagaaccagttgtctgccaatttgtctaagtgtgag 13965899  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    || |||||||||||||| ||||||||    
T  13965900 ttttggttgaaggaagtgagttttct 13965925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12270118 - 12269946
Alignment:
Q  112 ttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaat 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| ||||||||||    
T  12270118 ttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacactatgaat 12270019  T
Q  212 ataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgc 284  Q
    |||| || |||||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  12270018 ataaggtgatgcctttcggtgttactaatgttcctgatgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgc 12269946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18437122 - 18437022
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  18437122 cagtttaacaaagtgacaataaagaatatgtatccactcccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 18437023  T
Q  128 t 128  Q
    |    
T  18437022 t 18437022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Original strand, 8745530 - 8745732
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  8745530 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 8745629  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    |  || | || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  8745630 ggacaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgccctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 8745729  T
Q  231 tgt 233  Q
    |||    
T  8745730 tgt 8745732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 398
Target Start/End: Original strand, 11889623 - 11889798
Alignment:
Q  223 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgata 322  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||    
T  11889623 cctttcggtgtcactaatgcgccaggtgtgttcatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgata 11889722  T
Q  323 ttttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaa 398  Q
    ||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||    
T  11889723 ttttgatatactctaagtttaaggaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaa 11889798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Original strand, 26791561 - 26791613
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatga 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791561 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatga 26791613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17200627 - 17200496
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||| | || || || |||||||||    
T  17200627 tcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgctcccgaggattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagattgat 17200528  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  17200527 ttgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 17200496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10385431 - 10385236
Alignment:
Q  260 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctga 359  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||  ||| || |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||| |     
T  10385431 agtacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattgatgatatcttgatttattccaagaacgaggaagagcatgcagg 10385332  T
Q  360 gcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  10385331 gcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctggg 10385236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 12272324 - 12272254
Alignment:
Q  34 aacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgc 104  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12272324 aacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgc 12272254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25768310 - 25768178
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| || || || |||||| | ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || || |||||||    
T  25768310 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcgatatccgcttctaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaacattgatt 25768211  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaag 160  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  25768210 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaaag 25768178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 304 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 25768034 - 25767889
Alignment:
Q  304 gtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaacttt 403  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | || || ||  ||||| | || |||||||||||| ||| |||| | |||||||| | ||| |||||  |  | |    
T  25768034 gtggtgtttatagatgatattttggtgtattcaaaatctgagaaggagcatgctgagcatttgaggattatgttgcaagtcttgaaggagaaccagttat 25767935  T
Q  404 atgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
     |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  25767934 gtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttt 25767889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18915341 - 18915297
Alignment:
Q  405 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18915341 tgctaagttgtccaagtgtgaattttggttgaaggaagtaagttt 18915297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Original strand, 18225094 - 18225542
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225094 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 18225193  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225194 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 18225293  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18225294 tcggtgtgaccaatgcacctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtgtttattgacgacatttt 18225393  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225394 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 18225493  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  18225494 ttctggttgaaagaagtaccttttcttggccatgttatttctggtgatg 18225542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 8051272 - 8051719
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8051272 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 8051371  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8051372 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 8051471  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  8051472 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 8051571  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8051572 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 8051671  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  8051672 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 8051719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 14301628 - 14302075
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14301628 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 14301727  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301728 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 14301827  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  14301828 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 14301927  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301928 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 14302027  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  14302028 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 14302075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 8388775 - 8388336
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8388775 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 8388676  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8388675 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 8388576  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8388575 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatatttta 8388476  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8388475 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 8388376  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||| ||||||||||    
T  8388375 tctggttgaatgaggtgagtttccttggccatgttatttc 8388336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 27713699 - 27713252
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27713699 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatgggtcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 27713600  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27713599 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27713500  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27713499 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 27713400  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27713399 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27713300  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  27713299 tctagttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 27713252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 23958110 - 23957663
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  23958110 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 23958011  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958010 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 23957911  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  23957910 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 23957811  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23957810 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 23957711  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  23957710 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 23957663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 12478963 - 12478516
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12478963 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 12478864  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12478863 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 12478764  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12478763 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 12478664  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12478663 atttactccaagaccgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 12478564  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  12478563 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 12478516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 14682930 - 14682483
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  14682930 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatc 14682831  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14682830 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgacgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaggttatgccttt 14682731  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14682730 tggtgttaccaatgcacctggagagtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 14682631  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14682630 atttactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 14682531  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  14682530 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 14682483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 19776442 - 19776889
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19776442 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 19776541  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19776542 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 19776641  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19776642 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 19776741  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19776742 atttactccaagaccgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 19776841  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  19776842 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 19776889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 40475403 - 40474956
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  40475403 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 40475304  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40475303 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcataagacagctttcagaacccgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 40475204  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||    
T  40475203 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgatgatattttg 40475104  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40475103 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcgaagtgtgaat 40475004  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  40475003 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 40474956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 28 - 396
Target Start/End: Original strand, 17092798 - 17093166
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17092798 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 17092897  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092898 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 17092997  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  17092998 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 17093097  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaag 396  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17093098 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaag 17093166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Original strand, 15145541 - 15145981
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  15145541 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattga--------tggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaacattgat 15145632  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15145633 ttgagatcgggttatcactagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 15145732  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  15145733 tcggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttggatcgattcgtggttgtctttatcgatgatatttt 15145832  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  15145833 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaacattgtcttgcaagtgttgaaagagaggaaactttatgctaaattatctaagtgtgag 15145932  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  15145933 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 15145981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 28 - 399
Target Start/End: Original strand, 16234641 - 16235012
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16234641 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16234740  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234741 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16234840  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16234841 tggagttaccaatacacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 16234940  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaa 399  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16234941 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaa 16235012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 113 - 475
Target Start/End: Original strand, 16353241 - 16353604
Alignment:
Q  113 tcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16353241 tcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 16353340  T
Q  213 taaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgttt 312  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |     
T  16353341 caaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttctc 16353440  T
Q  313 atcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaat 412  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16353441 atcgatgatattttaatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaat 16353540  T
Q  413 tgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctg-ggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||    
T  16353541 tatctaagtgtgagttctggttaaaagaggtaagttttctntggccatgttatttctggtgatg 16353604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 14849015 - 14849456
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    || || |||||| ||||||    
T  14849015 cagttgaataaagtaacgataaagaatagatatccacttccaaaaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcgcgtgtatttagcaaggttgatt 14849114  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  14849115 tgagatcgggttatcaccaaattaaagtgagagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagagatgccttt 14849214  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  14849215 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttg 14849314  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || ||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||    
T  14849315 atatactccaagtccgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaat 14849414  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  14849415 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccaagttatttctg 14849456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14696476 - 14696036
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   || || |||||||||||||    
T  14696476 cagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatctacttccaagaattgatgattttatggatcagttagtgggtgtacgtgtgtttagcaagattgatt 14696377  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||||  ||| ||||||||    
T  14696376 tgagatcgggttaacaccaaattaaagtgaaagataaggatatgcagaagacggcctttagaacgcgttatggacattattaatattcagtgatgccttt 14696277  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||    || || ||||| | ||||||| | ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  14696276 tggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaactctatttttcatgcgtatttggattgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttg 14696177  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || ||||| ||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |    
T  14696176 atatactcgaagtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaatttatatgctaagttgtcaaagtgtgagt 14696077  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||    
T  14696076 tctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttct 14696036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16150075 - 16149650
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  16150075 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 16149976  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  16149975 ttgaggtcaggttaccaccagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 16149876  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   || || || |||||||| ||||||||| |    
T  16149875 tcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatattct 16149776  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || | |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||  | |||||||| || || ||||||||     
T  16149775 gatttattcaatgactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttatcgaagtgtgag 16149676  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  16149675 ttctggttaagtgaagtaagttttct 16149650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16154221 - 16153796
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  16154221 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 16154122  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  16154121 ttgaggtcaggttaccaccagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 16154022  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   || || || |||||||| ||||||||| |    
T  16154021 tcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatattct 16153922  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || | |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||  | |||||||| || || ||||||||     
T  16153921 gatttattcaatgactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttatcgaagtgtgag 16153822  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  16153821 ttctggttaagtgaagtaagttttct 16153796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 15357028 - 15357470
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  15357028 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagcaagattgac 15357127  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    || || ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  15357128 ttaaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatacaaggtgatgcctt 15357227  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  |||||  || || ||||| || || ||| |    
T  15357228 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataagttcgcggttgtatttattgatgacattct 15357327  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  15357328 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgag 15357427  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||| |||||||||| ||| |  |||||||||    
T  15357428 ttctggttaagtgaattaagttttcttggccacattatttctg 15357470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16218592 - 16218325
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||   || || ||||||||||| ||    
T  16218592 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggattagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgactt 16218493  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  16218492 gaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttc 16218393  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcg 296  Q
    ||||| || ||||   | || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16218392 ggtgttacaaatgtgtcaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcg 16218325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16221912 - 16221645
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||   || || ||||||||||| ||    
T  16221912 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggattagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgactt 16221813  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  16221812 gaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttc 16221713  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcg 296  Q
    ||||| || ||||   | || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16221712 ggtgttacaaatgtgtcaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcg 16221645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 475
Target Start/End: Original strand, 18613742 - 18613920
Alignment:
Q  297 gttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaag 396  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18613742 gttcgtagttgtgtttattgacgacattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaag 18613841  T
Q  397 aaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||    
T  18613842 aaactttatgcaaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaaaaagtaagttttctaggccatgttatatctggtgatg 18613920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 385
Target Start/End: Original strand, 44659774 - 44660132
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  44659774 tcagttgaacaaggttacgatcaagaacagatatccgctccctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 44659873  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  44659874 ttgaggtcaggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 44659973  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  44659974 tcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgacgatatttt 44660073  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 385  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  44660074 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgt 44660132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Original strand, 3262702 - 3263130
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  3262702 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 3262801  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  3262802 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 3262901  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  3262902 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 3263001  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  3263002 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 3263101  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  3263102 ttctggttaaatgaagtaagttttctggg 3263130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 14161833 - 14161409
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||    
T  14161833 cagttgaacaaggtaacgatacagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcaacaagattgatt 14161734  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| || || |||||  | || ||||||| |  ||| ||||||||    
T  14161733 tgagatcgggttatcaccagattagagtaaagaatgaagatatacagaagacggcttttaggacacgttacagacattatgaattttcagtgatgccttt 14161634  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    ||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||  | || || ||||| | | |||||  ||||||||| || ||||| || |||||  |     
T  14161633 cggtgtttctaatgcacctggagtatttatggagtatatgaacagaatttttcatgcttatctggataagttcgtagttgtatttattgatgatatccta 14161534  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||||| ||  |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  | || |||| ||| || ||| || || ||||| || ||||| || ||||||    
T  14161533 atttattctgagacagaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttctacaggtgttgaagga-aagtaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgaa 14161435  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    ||||||||||| || || ||||||||    
T  14161434 ttctggttgaatgaggtgagttttct 14161409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22632067 - 22631910
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  22632067 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 22631968  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttt 185  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22631967 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttt 22631910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 15001273 - 15001714
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   || || || || ||||||    
T  15001273 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgat 15001372  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15001373 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctt 15001472  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||  || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || ||    
T  15001473 tcggtgatactaatgcgcctgttgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 15001572  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||| ||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || |||| ||| |||| |    
T  15001573 gatttattctaagattgaagaagagcatgcagaacatctgaggattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtttaaatgtg-a 15001671  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     ||||||| |  |||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  15001672 gtctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 15001714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 29451445 - 29451887
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  29451445 tcagttgaacaaggttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 29451544  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  29451545 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 29451644  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  29451645 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatatttt 29451744  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| || |||||||  ||||| |||||||||| ||| || |||| | | ||||| || ||||| || |||||     
T  29451745 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagatcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcgaaatgtgag 29451844  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||  || |||||||||    
T  29451845 ttctggttaagtgaagtgagctttctgggtcatattatttctg 29451887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 425
Target Start/End: Original strand, 51604704 - 51605098
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  51604704 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 51604803  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  51604804 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 51604903  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||    
T  51604904 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 51605003  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||    
T  51605004 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtga 51605098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 379
Target Start/End: Original strand, 1647207 - 1647537
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| | || || || |    
T  1647207 aagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgcaaaagtttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaa 1647306  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  1647307 ttaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggactcgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 1647406  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||| ||     
T  1647407 tgtgtttatggagtatatgaataggattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtattcattgatgatattttgatttattctaagactgaagag 1647506  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgc 379  Q
    || ||||| || || ||||||||||| ||||    
T  1647507 gagcatgcagaacacctgaagattgtgttgc 1647537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23443467 - 23443237
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || | ||||||||||||    
T  23443467 agttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatgtgtgtttaccaagattgattt 23443368  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||    
T  23443367 gagattgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcataagacaacttttagaacacgttatggacattatgagtataaagtgatgcctttc 23443268  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgga 260  Q
    ||| | || ||||| || || |||||||||||    
T  23443267 ggt-ttacgaatgcgccaggtgtgtttatgga 23443237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 15072701 - 15072298
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||||||| ||| | || || || |    
T  15072701 aagaacagatatccacttccgataattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaaa 15072602  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| || || || || || || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  15072601 ttaaggtgaaggatgaagatacgcaaaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 15072502  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     |||||||||||||| |||||| |  | |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || |||||  | ||||| || |||| |||  ||    
T  15072501 tgtgtttatggagtacatgaatagagttttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaataa 15072402  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||   | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  15072401 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 15072302  T
Q  449 ttct 452  Q
    ||||    
T  15072301 ttct 15072298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 27902750 - 27902308
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | || |||||||||||||| || || |||||     
T  27902750 tcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccaaatggtaggtgcaaaagtttttagtaaaattgac 27902651  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  27902650 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 27902551  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||  |||||   ||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  27902550 tcggtgttactaaagcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctttcctggataaattcgtggtggtatttattgatcatatttt 27902451  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||| || ||  |||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||    
T  27902450 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacacatgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 27902352  T
Q  426 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     |||| ||| || ||||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  27902351 gttctagttaaatgaagtgagttttctaggccacattatttctg 27902308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 16251498 - 16251602
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16251498 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatgtatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 16251597  T
Q  127 ttgag 131  Q
    |||||    
T  16251598 ttgag 16251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 385
Target Start/End: Original strand, 11205140 - 11205498
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||  | || |||||||||||     
T  11205140 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatctttagcaagattgac 11205239  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  11205240 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 11205339  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  11205340 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 11205439  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 385  Q
     ||||| ||||||| ||| || || ||||| || || ||||  ||||| ||||||||||    
T  11205440 aatttattccaagaatgaagaggagcatgcagaacacctgagaattgtattgcaagtgt 11205498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 8708271 - 8707833
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || || || ||||||       
T  8708271 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagtaagatt--- 8708175  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
     |||| ||  | || || || |||||||| ||||||||||||||| |||| || || || || || || ||||| || || ||||||  ||| |||||||    
T  8708174 -tgaggtcgggttaccatcatattaaagtaaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttagcacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctt 8708076  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || |  || |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | |||||||||||| || || |||||||| || || || ||    
T  8708075 tcggtgttactaacgcgcggggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatctt 8707976  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||||  |||  |||| |||||||||| ||| || |||||  | ||||| || ||||| || ||||||    
T  8707975 gatttattctaagtctgaagaagagcatgcagagcattagaaagttgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagatgtatgccaagttgtccaaatgtgaa 8707876  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    || ||||| |  |||||||||||| | ||| || |||||||||    
T  8707875 ttttggttaagtgaagtaagttttattggccatattatttctg 8707833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15258290 - 15257921
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||||||    || || ||||||||||| |    
T  15258290 cagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgatta-atcgatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattgact 15258192  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | || || ||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  15258191 tgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgccttt 15258092  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| | | || ||   || || || |||||||| || ||||| |||    
T  15258091 cggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctgaataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttg 15257992  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaa 398  Q
    ||||| || | ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  15257991 atttattcaaggaccgaagaagagcatgcagagcatctaaagattgtattgcaagtatcgaaagaaaagaa 15257921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 365 - 475
Target Start/End: Original strand, 1640326 - 1640436
Alignment:
Q  365 tgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttat 464  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  || |||||||    
T  1640326 tgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattttcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttagccatgttat 1640425  T
Q  465 ttctgatgatg 475  Q
    ||||| |||||    
T  1640426 ttctggtgatg 1640436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15323385 - 15323139
Alignment:
Q  223 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgata 322  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||| | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || ||||    
T  15323385 cctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggaatacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgata 15323286  T
Q  323 ttttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 422  Q
    || | ||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||    
T  15323285 ttgtaatttattctaagagtgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatg 15323186  T
Q  423 tgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  15323185 tgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctg 15323139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Original strand, 15291067 - 15291488
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  15291067 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 15291166  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  15291167 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 15291266  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| || ||||||   || || ||| | | | |||| |  || || |||||||| || || |||||||||    
T  15291267 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaataaaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttcatagatgatattttg 15291366  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | |  || || |||||||||||||| |    
T  15291367 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagt 15291466  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  15291467 tttggttgaaggaagtgagttt 15291488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 93
Target Start/End: Original strand, 16353174 - 16353244
Alignment:
Q  23 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 93  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16353174 atcatcagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 16353244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 402 - 475
Target Start/End: Original strand, 29037427 - 29037500
Alignment:
Q  402 ttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  29037427 ttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 29037500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 133
Target Start/End: Original strand, 12340777 - 12340879
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    ||||||||||| || || || ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||||||||| |    
T  12340777 ttgaacaaggtgacgattaacaattggtatccgctcccgaggattgatgatttgatggatcaattggttggtgcagaagtgttcagtaagattgatttaa 12340876  T
Q  131 gat 133  Q
    |||    
T  12340877 gat 12340879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14999301 - 14999257
Alignment:
Q  405 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14999301 tgctaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagttt 14999257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 291 - 435
Target Start/End: Original strand, 8322948 - 8323092
Alignment:
Q  291 ggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaa 390  Q
    ||||| ||| || |||||||| || |||||||||||| | || || |||   ||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||| |  | | |||     
T  8322948 ggatcagtttgtggtggtgttcatagacgatattttggtgtattcgaagttggaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattggagatcttgaag 8323047  T
Q  391 gagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttg 435  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  8323048 gagaagaaattgtatgctaagttgtcgaagtgtgatttctggttg 8323092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 356
Target Start/End: Original strand, 18547684 - 18547856
Alignment:
Q  184 ttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatg 283  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||   || | |||||||||  || | || || || |||||||||||||||||||||||  | |||||||||     
T  18547684 ttcagaacccgttatggtcattatgagtattcggtgaagcctttcggaatgtctaacgcgccaggagtgtttatggagtatatgaacagaatcttccatc 18547783  T
Q  284 catttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgc 356  Q
    | | ||| |||| ||| || ||||| || || || ||||||||| | ||||| ||  | ||||| ||||||||    
T  18547784 cgtatttagatcagtttgttgtggtattcattgatgatattttggtgtactctaaatcggaggaggaacatgc 18547856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 388; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 18781409 - 18780962
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18781409 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacctccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 18781310  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18781309 tgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 18781210  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18781209 cggtgtgaccaacgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttg 18781110  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18781109 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttttgcgaaattgtctaagtgtgaat 18781010  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  18781009 tctgattgaaggaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 18780962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 16358797 - 16358350
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16358797 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16358698  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16358697 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 16358598  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16358597 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 16358498  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358497 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 16358398  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  16358397 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 16358350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 34568789 - 34568342
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34568789 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 34568690  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34568689 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 34568590  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34568589 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 34568490  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34568489 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 34568390  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  34568389 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 34568342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 27520701 - 27520254
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27520701 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 27520602  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27520601 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27520502  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  27520501 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatatttta 27520402  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27520401 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27520302  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  27520301 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 27520254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 27612649 - 27612202
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27612649 cagttgaacaaggtaactatcaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggaccagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 27612550  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27612549 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27612450  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27612449 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatattttg 27612350  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27612349 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27612250  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  27612249 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 27612202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 475
Target Start/End: Original strand, 22330981 - 22331425
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  22330981 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatttga 22331080  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22331081 ggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 22331180  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  22331181 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatt 22331280  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22331281 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 22331380  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22331381 ggttgaaagaagtgagttttctaggctatgttatttctggtgatg 22331425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 14997830 - 14998277
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  14997830 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 14997929  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997930 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 14998029  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14998030 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 14998129  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14998130 atttactccaagactgaagaggaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 14998229  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  14998230 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 14998277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 40711075 - 40710636
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40711075 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 40710976  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40710975 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 40710876  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  40710875 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 40710776  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40710775 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 40710676  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||| ||||||||||    
T  40710675 tctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttc 40710636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 27666581 - 27667020
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  27666581 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactttcgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagatagatt 27666680  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27666681 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttttgccttt 27666780  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  27666781 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgttcatcgacgatatcttg 27666880  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666881 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27666980  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  27666981 tctggttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttc 27667020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 37289587 - 37290034
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  37289587 cagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 37289686  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37289687 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcattatgaatataaagttatgccttt 37289786  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  37289787 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 37289886  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37289887 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 37289986  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  37289987 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 37290034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 41773137 - 41772690
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41773137 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 41773038  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773037 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 41772938  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  41772937 tggtgttaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatatcttg 41772838  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41772837 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaatttttatgctaaattgtctaaatgtgaat 41772738  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  41772737 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 41772690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 19772255 - 19771808
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  19772255 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 19772156  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772155 tgaggtgaggatatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 19772056  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||    
T  19772055 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgacgatatcttg 19771956  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19771955 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 19771856  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||    
T  19771855 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttttggtgatg 19771808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22136963 - 22136516
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  22136963 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 22136864  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136863 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 22136764  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  22136763 tggtgttactaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgacattttg 22136664  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22136663 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttttgctaaattgtctaagtgtgaat 22136564  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22136563 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 22136516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22350214 - 22349767
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  22350214 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccatttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 22350115  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350114 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 22350015  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  22350014 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttg 22349915  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22349914 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 22349815  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||    
T  22349814 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttatggtgatg 22349767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 27683491 - 27683938
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  27683491 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 27683590  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27683591 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27683690  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  27683691 tggtgttaccaatgcacctggagtgtctatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacaatattttg 27683790  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27683791 atttactccaagactgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgagagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27683890  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||| |||| |||||    
T  27683891 tctggttcaaagaagtgagttttctaggccatgttatctctggtgatg 27683938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 29474164 - 29474611
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  29474164 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 29474263  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29474264 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatggagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 29474363  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  29474364 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 29474463  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  29474464 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgataaattatcgaagtgtgaat 29474563  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  29474564 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 29474611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 51 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 20801669 - 20801245
Alignment:
Q  51 gaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagatt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20801669 gaataggtatcctcttccgagaattgatgatttcatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagatt 20801570  T
Q  151 aaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggag 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20801569 aaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggag 20801470  T
Q  251 tgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaaga 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20801469 tgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttttctttatcgatgatattttaatttactccaagactgaagaaga 20801370  T
Q  351 acatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtttt 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||     
T  20801369 acatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagtttc 20801270  T
Q  451 ctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    || ||| |||| ||||||| |||||    
T  20801269 cttggccatgtcatttctggtgatg 20801245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 25428728 - 25428287
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||     
T  25428728 cagttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatc 25428629  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25428628 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggccactatgaatacaaagttatgccttt 25428529  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||    
T  25428528 cggtgttacaaatgcacctggactatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggaccgattcgtggttgtttttattgatgatattttg 25428429  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25428428 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaatctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 25428329  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  25428328 tctagttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 25428287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 26736818 - 26737259
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  26736818 cagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacatgtatttagcaagattgatt 26736917  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  26736918 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacaatatgaatataaagtgatgccttt 26737017  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  26737018 cggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcaaatttttcatgcatttttagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 26737117  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||  |||||| |||||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  26737118 atttactccaagtccgaagaagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtgctgaaagataagaagttatatgctaaattatcaaagtgtgaat 26737217  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26737218 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctg 26737259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 21337385 - 21337826
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   || || |||||||||||||    
T  21337385 cagttgaccaaagtaacgataaagaataggtatccaattccaagaattgatgacttgatggatcagttattgggtgcatgtgtgtttagcaagattgatt 21337484  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  21337485 tgaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaatacagcttttagaacacgttatggatattatgaatataaagtgatgccttt 21337584  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||| | || || || || || |||||||||||||||    
T  21337585 cggtgttacgaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatagcttagtggttgtattcatcgacgatattttg 21337684  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21337685 atttactccaagtttgaagaagaacatgctgagcacttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaat 21337784  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| | ||||||||||    
T  21337785 tctggttgaaagaggtgagttttctcggccacgttatttctg 21337826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 23473519 - 23473081
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||    
T  23473519 ttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatttga 23473420  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    ||||    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  23473419 gatcggtttatcatcaaattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgg 23473320  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || ||||| || || |||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  23473319 tgttacaaatgcgccaggtgtgtctatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatg 23473220  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||| | | ||  |||| |||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23473219 tactcaaagtctgaagaagaacatgctgagcgtttaaaagttgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgagttct 23473120  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     |||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  23473119 agttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttctg 23473081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 20466190 - 20466631
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| ||  |||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || || |||||||||||||    
T  20466190 cagttgaataaactaacaataaagaataagtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttactgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 20466289  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  20466290 taagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 20466389  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||    
T  20466390 tggtgttactaatgcaccgggtgtgtttatgaagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgatcatcgatgatattttg 20466489  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  | ||||| || ||||| |||||||| |    
T  20466490 atatactctaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgagt 20466589  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  20466590 tctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttctg 20466631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Original strand, 24796487 - 24796915
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  24796487 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagtaagattgat 24796586  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  24796587 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 24796686  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || |||||| |    
T  24796687 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattct 24796786  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || ||||||    
T  24796787 aatttattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaa 24796886  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  24796887 ttctggttacatgaagtaagttttctggg 24796915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 385
Target Start/End: Original strand, 21562115 - 21562472
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||    
T  21562115 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatggtttaatggatcagttagtgg-tgcacgcgtgttcagcaagattgat 21562213  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || |||||||||||||| ||| |||    
T  21562214 ttgaggtcgggttaccaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtgatgtctt 21562313  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || |||||  |||| |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | ||| ||| |||| ||||| |||||||| || || ||  |    
T  21562314 tcggtgttactaatgcgtctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcctatttagattggtttgtagttgtgtttatagatgacatcct 21562413  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 385  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||| | || ||||| || |||||||    
T  21562414 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatttaaaaattgtgtttcaagtgt 21562472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Original strand, 14885081 - 14885509
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  14885081 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagtaagattgat 14885180  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  14885181 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 14885280  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  14885281 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatatctt 14885380  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| ||||| || |||||     
T  14885381 aatttattccaagaatgaggaggaacacgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 14885480  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  14885481 ttctggttaaatgaagtaagtttcctggg 14885509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 20344560 - 20344132
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||     
T  20344560 tcagttgaacaaagtcacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagcaagattgac 20344461  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  20344460 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 20344361  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || |  ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  20344360 tcggtgttactaacgtgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 20344261  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||   | |||||||| ||||| || |||||     
T  20344260 aatttattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtcttgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 20344161  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  20344160 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 20344132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 468
Target Start/End: Original strand, 22234032 - 22234451
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   || || || || ||||||||||| | | | || || ||||    
T  22234032 aagaataggtatccacttccgaggattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgatttgaggttaggttaccatcaga 22234131  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||  ||||| ||||||| |||||| || || || ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  22234132 ttaaggtgatggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 22234231  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     |||||| |||||||||||||    || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||    
T  22234232 tgtgtttgtggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaa 22234331  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||  || || || || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  22234332 gagcatgcagatcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgtcaagttatcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 22234431  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttct 468  Q
    |||| ||| || ||||||||    
T  22234432 ttcttggccatattatttct 22234451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Original strand, 37541471 - 37541899
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  37541471 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatttttagtaagattgat 37541570  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37541571 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 37541670  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||| ||||| || |||||| |    
T  37541671 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggaatacatgaatcgaattttccatgcctttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattct 37541770  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  37541771 aatctattccaagaatgaggaggaacacgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 37541870  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  37541871 ttctggttaaatgaagtaagttttctggg 37541899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 20823731 - 20823289
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  20823731 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 20823632  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  20823631 ttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 20823532  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||||||||| || ||||| ||    
T  20823531 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttatagatgatatatt 20823432  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    ||| || || || ||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||    
T  20823431 gatctattcaaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 20823333  T
Q  426 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     |||||||| |  ||||| ||||| || ||| | ||||||||||    
T  20823332 gttctggttaagtgaagtgagtttcctcggccacgttatttctg 20823289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 28893032 - 28893474
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||     
T  28893032 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagcaagattgac 28893131  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  28893132 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 28893231  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  28893232 tcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatatt 28893331  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    ||| || || || ||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||    
T  28893332 gatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 28893430  T
Q  426 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |||| |||||||    
T  28893431 gttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtcatttctg 28893474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 28921858 - 28922300
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||     
T  28921858 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagcaagattgac 28921957  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  28921958 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 28922057  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  28922058 tcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatatt 28922157  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    ||| || || || ||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||    
T  28922158 gatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 28922256  T
Q  426 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |||| |||||||    
T  28922257 gttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtcatttctg 28922300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 416
Target Start/End: Original strand, 17267428 - 17267813
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  17267428 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 17267527  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  17267528 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 17267627  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || |||||| |||||    
T  17267628 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaatttgtggtggtatttattgatgatattctgatt 17267727  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtc 416  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || || ||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| ||||||||    
T  17267728 tattcaaagactgaagaagagcatgcagaacacctgagaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtc 17267813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 25850353 - 25849925
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||||||    
T  25850353 tcagttgaacaaggttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaaatttttagtaagattgat 25850254  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  25850253 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 25850154  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||| |||||  ||| || || ||||| || || ||||| ||    
T  25850153 tcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaaccaaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtagtgttcattgatgatatctt 25850054  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||| ||| || || ||||| ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  25850053 gatttattcgaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaatagtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgag 25849954  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  25849953 ttctggttaagtgaagtgagttttctggg 25849925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22464229 - 22463781
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  22464229 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 22464130  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
     |||| ||  | || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  22464129 ctgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 22464030  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || |||||  |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  22464029 tcggtgttactaacgcgcctggtatgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatttt 22463930  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    |||||| || || ||||| || || ||||| || ||  |||||||||| |||||  | | ||| ||| ||||| || ||||| || ||||| ||||  ||    
T  22463929 gatttattctaaaactgaagaggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaggag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtacga 22463831  T
Q  426 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
     |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22463830 gttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 22463781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 22504957 - 22504529
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |   ||||||| ||||||||     
T  22504957 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttcatagaattgatgacttgatgaatcagttggttggtgctaggattttcagtaagattgac 22504858  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || || |||||||| || || || ||||| |||||||    
T  22504857 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 22504758  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || |  ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  22504757 tcggtgttactaacgagcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 22504658  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || ||||  || || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  22504657 aatttattctaagaacgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 22504558  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  22504557 ttctggttaagtgaagtgagttttctggg 22504529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20778191 - 20777889
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  20778191 tcagttgaacaaggttacaataaagaataggtatccactcccgcggattgacgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 20778092  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||    
T  20778091 ttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctt 20777992  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||||||||| || ||||||||    
T  20777991 tcggtgttactaacgcgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttatagatgatatttt 20777892  T
Q  327 gat 329  Q
    |||    
T  20777891 gat 20777889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Original strand, 21935279 - 21935700
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  21935279 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 21935378  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||  | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  21935379 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 21935478  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  21935479 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 21935578  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  21935579 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 21935678  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  21935679 tttggttgaaggaagtgagttt 21935700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23507961 - 23507540
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  23507961 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 23507862  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  23507861 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 23507762  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  23507761 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 23507662  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |    | ||| || |||||||||||||| |    
T  23507661 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagtgatgtgcaaagttgtctaagtgtgagt 23507562  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  23507561 tttggttgaaggaagtgagttt 23507540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24583487 - 24583066
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  24583487 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24583388  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |   |||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  24583387 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcaaaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 24583288  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  24583287 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 24583188  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || |||  ||||||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||| | |||||||||  |  | |  || || |||||||||||||| |    
T  24583187 gtgtattcaaagtttgaggaagagcatgctgagcatttgagaattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagt 24583088  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  24583087 tttggttgaaggaagtgagttt 24583066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 469
Target Start/End: Original strand, 28914640 - 28914945
Alignment:
Q  164 aagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagta 263  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| ||||||||    
T  28914640 aagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagta 28914739  T
Q  264 tatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcat 363  Q
    |||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| || || ||     
T  28914740 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacac 28914839  T
Q  364 ctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgtt 462  Q
    ||||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||||| ||| ||||     
T  28914840 ctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtc 28914938  T
Q  463 atttctg 469  Q
    |||||||    
T  28914939 atttctg 28914945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 469
Target Start/End: Original strand, 28929908 - 28930213
Alignment:
Q  164 aagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagta 263  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| ||||||||    
T  28929908 aagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagta 28930007  T
Q  264 tatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcat 363  Q
    |||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| || || ||     
T  28930008 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacac 28930107  T
Q  364 ctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgtt 462  Q
    ||||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||||| ||| ||||     
T  28930108 ctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtc 28930206  T
Q  463 atttctg 469  Q
    |||||||    
T  28930207 atttctg 28930213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 469
Target Start/End: Original strand, 21679181 - 21679310
Alignment:
Q  340 actgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 439  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |  |    
T  21679181 actgaggaagagcatgcagaacatccgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtg 21679280  T
Q  440 aagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| |||||||| ||| || |||||||||    
T  21679281 aagtgagttttcttggccatattatttctg 21679310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 269
Target Start/End: Original strand, 21679010 - 21679110
Alignment:
Q  169 atgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatga 268  Q
    ||||||||||| || || || || || |||||||| || | |||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  21679010 atgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacggatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatga 21679109  T
Q  269 a 269  Q
    |    
T  21679110 a 21679110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 164
Target Start/End: Original strand, 21676946 - 21677061
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  21676946 aagaatagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaga 21677045  T
Q  149 ttaaagtgaaagatga 164  Q
    | || |||||||||||    
T  21677046 tcaaggtgaaagatga 21677061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 465
Target Start/End: Original strand, 24618704 - 24618823
Alignment:
Q  346 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaa 445  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||   | ||||| || ||||| || || || |||||||| |  |||||||    
T  24618704 gaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaagtaa 24618803  T
Q  446 gttttctgggcgatgttatt 465  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  24618804 gttttctgggccatattatt 24618823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 465
Target Start/End: Original strand, 24714935 - 24715054
Alignment:
Q  346 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaa 445  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||   | ||||| || ||||| || || || |||||||| |  |||||||    
T  24714935 gaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaagtaa 24715034  T
Q  446 gttttctgggcgatgttatt 465  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  24715035 gttttctgggccatattatt 24715054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 465
Target Start/End: Original strand, 24747963 - 24748082
Alignment:
Q  346 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaa 445  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||   | ||||| || ||||| || || || |||||||| |  |||||||    
T  24747963 gaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaagtaa 24748062  T
Q  446 gttttctgggcgatgttatt 465  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  24748063 gttttctgggccatattatt 24748082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23505144 - 23505100
Alignment:
Q  405 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  23505144 tgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttt 23505100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 40547 - 40100
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  40547 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 40448  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40447 tgagatcagggtatcactagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 40348  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  40347 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgatgacattttg 40248  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40247 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 40148  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  40147 tctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 40100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 475
Target Start/End: Original strand, 14031 - 14484
Alignment:
Q  23 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14031 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 14130  T
Q  123 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 222  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14131 tgatttgagatcggggtatcactagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 14230  T
Q  223 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgata 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14231 cctttcggtgtgaccaatgcacctggaatgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgata 14330  T
Q  323 -ttttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagt 421  Q
     |||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14331 ttttttatttactccatgactgaagaagaatatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattttctaagt 14430  T
Q  422 gtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  14431 gtgaattctgtttgaaggaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 14484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 16553 - 16113
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16553 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 16454  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttgtggtcactatgaatataaagttatgcctt 16354  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16353 tccgtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttattgacgatatttt 16254  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16253 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaaatttatgctaacttgtctaagtgtgaa 16154  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  16153 ttctggttgaaagaattaagttttcttggccatgttatttc 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 2816 - 2375
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||| |||||||||||||    
T  2816 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgaacgtgtttttagcaagattgatt 2717  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2716 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 2617  T
Q  228 -cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2616 ccggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatatttt 2517  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaatt-gtctaagtgtga 425  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  2516 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaataacctttatgctaacttggtctaagtgtga 2417  T
Q  426 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  2416 attctggttgaaagaattaagttttcttggccatgttatttc 2375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Original strand, 15267 - 15715
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15267 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgaggatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 15366  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 15466  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15467 tcggtgtaaacaatgcgcctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgcgtttatcgacgatatttt 15566  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15567 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgatgattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 15666  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||    
T  15667 ttctggttgaaggaagtaagttttcttggccatgttatttttggtgatg 15715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 10873042 - 10872595
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10873042 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 10872943  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872942 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 10872843  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  10872842 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggtcgtgtttatcgacgatattttg 10872743  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10872742 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattgtctaagtgtgaat 10872643  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  10872642 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 10872595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 11235131 - 11235578
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11235131 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 11235230  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11235231 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 11235330  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  11235331 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 11235430  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11235431 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 11235530  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  11235531 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 11235578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 14334748 - 14334301
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14334748 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 14334649  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14334648 tgaggtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 14334549  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14334548 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 14334449  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14334448 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 14334349  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  14334348 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 14334301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 15158975 - 15159422
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  15158975 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 15159074  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159075 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 15159174  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15159175 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 15159274  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159275 atttactccaagactgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 15159374  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  15159375 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 15159422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 11551020 - 11551467
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11551020 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 11551119  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551120 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 11551219  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  11551220 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 11551319  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11551320 atttattccaagactgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 11551419  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  11551420 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 11551467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 14956906 - 14956459
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14956906 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 14956807  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956806 tgaggtcaggttatcaccaaattaaagtaaaagatgaaaatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 14956707  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14956706 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 14956607  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14956606 atttactccaagactgaagaagaagatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 14956507  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  14956506 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 14956459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 8709957 - 8709510
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  8709957 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 8709858  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8709857 tgaggtcaggatatcaccagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 8709758  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||    
T  8709757 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttatggttgtgtttatcgacgatattttg 8709658  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8709657 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 8709558  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  8709557 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 8709510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 12689854 - 12689407
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  12689854 cagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 12689755  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12689754 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctctgagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 12689655  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  12689654 tggtgttaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttg 12689555  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12689554 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 12689455  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  12689454 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 12689407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 44789269 - 44789708
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44789269 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 44789368  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44789369 tgagatcaggttgtcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 44789468  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  44789469 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttatgtttatcgacgatattttg 44789568  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44789569 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 44789668  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||| ||||||||||    
T  44789669 tctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttc 44789708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 18180097 - 18179656
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18180097 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttcagagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 18179998  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18179997 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactacgaatataaagttatgccttt 18179898  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  18179897 cggtgtgaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggttcgtaattgtgtttatcgaccatattttg 18179798  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaa-gaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18179797 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctcaagattgtcttacaagtgttg-aagagaangacactttatgccaaattgtctaagtatgaa 18179699  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  18179698 ttctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctg 18179656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 28 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13688393 - 13688023
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  13688393 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 13688294  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13688293 tgaggtcaggttatcactagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtccctatgaatataaagttatgccttt 13688194  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  13688193 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 13688094  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaa 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13688093 atttactccaagactgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaa 13688023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 28 - 374
Target Start/End: Original strand, 18588089 - 18588435
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  18588089 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 18588188  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18588189 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaaaataaagttatgccttt 18588288  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  18588289 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaattgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 18588388  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgt 374  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18588389 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgt 18588435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 15146801 - 15147244
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||    
T  15146801 tcagttgaataaagtaactatgaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagatagat 15146900  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  15146901 ttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaaaacgcgatatggacattacgagtataaagttatgcctt 15147000  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgca-tttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattt 325  Q
    | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || || |||||||    
T  15147001 ttggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgcattttccatgcattttttggatcggttcgtggtttttttcattgatgatattt 15147100  T
Q  326 tgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15147101 ttatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcaaaattgtctaagtgtga 15147200  T
Q  426 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15147201 gttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctg 15147244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 31 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 14042044 - 14041623
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  14042044 ttgaacaaagtaacgataaagaataggtgtccacttccaagaattgagaacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgacttga 14041945  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  14041944 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcgg 14041845  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | || || || ||||||||||||    
T  14041844 tgttacaaatgcacctgatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtagttattttcattgatgatattttgatt 14041745  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14041744 tactccaagactgaggaagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaataaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattct 14041645  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
     |||||| || || ||||||||    
T  14041644 agttgaaagaggtgagttttct 14041623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 31 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 14352074 - 14351653
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  14352074 ttgaacaaagtaacgataaagaataggtgtccacttccaagaattgagaacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgacttga 14351975  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  14351974 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcgg 14351875  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | || || || ||||||||||||    
T  14351874 tgttacaaatgcacctgatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtagttattttcattgatgatattttgatt 14351775  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14351774 tactccaagactgaggaagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaataaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattct 14351675  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
     |||||| || || ||||||||    
T  14351674 agttgaaagaggtgagttttct 14351653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 27 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9590721 - 9590479
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9590721 tcagttgaacaaggtaactatcaagtataggtatccacttctgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaatttttcagcaagattgat 9590622  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9590621 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 9590522  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 269  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9590521 ttggtgtgaccaatgcacttggagtgtttatggagtatatgaa 9590479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 48813170 - 48813610
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || ||||| || ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || || |||||||||||||    
T  48813170 cagttgaataaagtaacgataaagtattggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggcgcacgtgtgtttagcaagattgatt 48813269  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| | || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  48813270 tgagatcaggttatcaccaaattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 48813369  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||| ||  | |||||||||||||| |||||| | || || ||||| | ||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  48813370 cggtgttactaatgcgccaagtgtgtttatggagtacatgaattgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttg 48813469  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  | |||||  ||||||| ||||||||||    
T  48813470 atatactctaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtgttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgc-caattgtcaaagtgtgaat 48813568  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  48813569 tctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttctg 48813610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15626856 - 15626436
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  15626856 aagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggctatcaccaga 15626757  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| || || |||||  | || || ||||||   || ||||||||| |||| || |||||||| ||    
T  15626756 ttaaactgaaagatgaagatacgaagaagacggcttttaggacacgttacagacattacgaatattcggtgatgcctttcagtgttactaatgcaccagg 15626657  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     || ||||||||||| ||||| || || || ||||| | ||| ||||| ||||| || | ||| ||||| |||||||| || ||||  ||| |||| |||    
T  15626656 tgtatttatggagtacatgaaccgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgcgttcatcgatgatattttaatatactataagtctgaagaa 15626557  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    |||||||  ||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  15626556 gaacatgtcgagtatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagtt 15626457  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    | || ||| || |||||||||    
T  15626456 tccttggccatattatttctg 15626436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 15100498 - 15100940
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||    
T  15100498 tcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtattcagcaaaattgat 15100597  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || |||||||| ||  ||||||| || |||||||    
T  15100598 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctt 15100697  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   ||||| || |||||||| || || || ||    
T  15100698 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 15100797  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  15100798 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagatcgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgag 15100897  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  |||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  15100898 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 15100940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Original strand, 12204717 - 12205137
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  12204717 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcatgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 12204816  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||| || || || || |  || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  12204817 ttaaggtgaagtatgaagatatgcagaaaacggcctttaggatacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 12204916  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | | |||||   |  || || |||||||| || ||||| || ||||| |  |||||||| |||    
T  12204917 tgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatctgtggtcgtgtttattgatgatatcttaatttattttaagactgaagaa 12205016  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  12205017 gagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 12205116  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| |  |||||||||    
T  12205117 ttcttggccacattatttctg 12205137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Original strand, 13966563 - 13966991
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||||||    
T  13966563 tcagttgaacaaagtcacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaaatttttagtaagattgat 13966662  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  13966663 ttgagatctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 13966762  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  13966763 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 13966862  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||   | |||||||| ||||| || |||||     
T  13966863 aatttattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtcttgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 13966962  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  13966963 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 13966991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Original strand, 26092693 - 26093121
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  26092693 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 26092792  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  26092793 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 26092892  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  26092893 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 26092992  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  26092993 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 26093092  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  26093093 ttctggttaaatgaagtaagttttctggg 26093121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Original strand, 16948389 - 16948809
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| | || || || |    
T  16948389 aagaataggtatccactcccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaa 16948488  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16948489 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 16948588  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || |||||||| || |||||| ||||||| || || |  || ||     
T  16948589 cgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaaaatcgaagag 16948688  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||||||  |||| |||||||| || ||||| |  ||||| ||||    
T  16948689 gagcacgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgctaagctgtcaaagtgtgagttttggttaagtgaagtgagtt 16948788  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  |||||||||    
T  16948789 ttctgggccacattatttctg 16948809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Original strand, 26116485 - 26116913
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  26116485 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 26116584  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || | ||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  26116585 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacattatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 26116684  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||  |||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  26116685 tcggtgttactaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttcttgtggtgtttattgacgatatttt 26116784  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  26116785 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgag 26116884  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  26116885 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 26116913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 468
Target Start/End: Original strand, 14262162 - 14262580
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||| ||| | || || || |    
T  14262162 aagaataggtatccacttccgaggtttgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcata 14262261  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || |  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  14262262 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacaatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 14262361  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||||||||||||| | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| | | ||||||| |||    
T  14262362 tgtgtttatggagtatatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaattta-ttctagactgaagaa 14262460  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  14262461 gagcatgcagagcatctgaagattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagtt 14262560  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttct 468  Q
    |||| ||| || ||||||||    
T  14262561 ttcttggccatattatttct 14262580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 14140029 - 14139585
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  14140029 ttgaacaaagttacaattaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagctggtgggtgcaaaggtttttagtaatattgacttga 14139930  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  14139929 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 14139830  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  14139829 tgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattttgatt 14139730  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| |||||||| || ||||| || |    
T  14139729 tattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagtttt 14139630  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    || | |  ||||||||||| || ||  || ||||||||| |||||    
T  14139629 ggctaagtgaagtaagtttccttggtcatattatttctggtgatg 14139585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 49154655 - 49154227
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  | || || |||||||||    
T  49154655 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatatttagtaagattgat 49154556  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  49154555 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 49154456  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  49154455 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggggtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 49154356  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  49154355 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 49154256  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  49154255 ttctggttaaatgaagtaagttttctggg 49154227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13675806 - 13675399
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  13675806 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacataatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcaacaagattgac 13675707  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| || || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  13675706 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 13675607  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   || || || || ||||| || || ||| |    
T  13675606 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgacattct 13675507  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  13675506 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtattgaatgagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 13675407  T
Q  427 ttctggtt 434  Q
    ||||||||    
T  13675406 ttctggtt 13675399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Original strand, 11301108 - 11301536
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  | || || |||||||||    
T  11301108 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatatttagtaagattgat 11301207  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  11301208 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 11301307  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  11301308 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 11301407  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| ||||| || |||||     
T  11301408 aatttattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 11301507  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
     ||||||| || |||||||||||||||||    
T  11301508 atctggttaaatgaagtaagttttctggg 11301536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 13023711 - 13023283
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||||||     
T  13023711 tcagttgaacaaagttacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaattggtgggtgcgaaggtgtttagcaagattgac 13023612  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  13023611 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaatgatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 13023512  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||||| | |||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||||||||| || |||| |||    
T  13023511 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatgtattatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgataattt 13023412  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||  ||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  13023411 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgag 13023312  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    || ||||| |  ||||| |||||||||||    
T  13023311 ttgtggttaagtgaagtgagttttctggg 13023283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 19149541 - 19149123
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    | || || || ||||||||||| ||| | || |   |||    
T  19149541 aagaataggtatccacttccaagaattgacgatttaatggatcggttagtgggtgcacgtatgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccta-aga 19149443  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  19149442 ttaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 19149344  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||||||||||||| | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||    
T  19149343 tgtgtttatggagtatatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgatgaa 19149244  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | | ||  || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  19149243 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtgtgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 19149144  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| || |||||||||    
T  19149143 ttcttggccatattatttctg 19149123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 11386324 - 11386766
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||||||     
T  11386324 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaagattgac 11386423  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  || || || |||| |||||| || ||||| || || |||||||    
T  11386424 ttgaggtcaggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggactttaggacacgttgtggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 11386523  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| || || || ||||||||||||| |||  | || || ||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11386524 tcggtgttactaatgcgccaggtgtatttatggagtataagaacagaatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatatttt 11386623  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||   ||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||||    
T  11386624 aatttattctaagactgaagaagagcatgccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaa 11386723  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  11386724 ttctggttaagtgaagtgagttttctcggccacattatttctg 11386766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 57 - 469
Target Start/End: Original strand, 16070222 - 16070632
Alignment:
Q  57 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    ||  | || || ||||||||||| ||| | || || |||||||| |||    
T  16070222 gtatccacttccgagaattgatgacttgatggaccagttagtgggtgctcgtgtgcttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtg 16070321  T
Q  157 aaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgttta 256  Q
    || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||  ||||||||    
T  16070322 aaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcct--agtgttta 16070419  T
Q  257 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgc 356  Q
    |||||||||||||  | || |||||||  | | |||||   || || || |||||||| || |||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  16070420 tggagtatatgaacagaattttccatgtctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctcatttattctaagactgaagaagagcatgc 16070519  T
Q  357 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggc 456  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||     
T  16070520 agagtatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttctgggt 16070619  T
Q  457 gatgttatttctg 469  Q
     || |||||||||    
T  16070620 catattatttctg 16070632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 392
Target Start/End: Original strand, 23503769 - 23504130
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  23503769 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 23503868  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  23503869 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 23503968  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||    
T  23503969 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 23504068  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaaga 392  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| | ||||||    
T  23504069 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaaga 23504130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 12458994 - 12458566
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  12458994 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgaggattgatgacctaatggatcagttagtaggtgcgaaagtgttcagtaagatcgat 12458895  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  12458894 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 12458795  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||| ||||    ||||||||||| ||| |||||   ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  12458794 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatttgaacataatcttccatgcttttctggataatttcgttgttgtgtttattgatgatatttt 12458695  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  12458694 aatctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 12458595  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  12458594 ttctggttaagtgaagtgagatttctggg 12458566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 20748940 - 20748522
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    | || || || ||||||||||| ||| | || |   |||    
T  20748940 aagaataggtatccacttccaagaattgacgatttaatggatcggttagtgggtgcacgtatgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccta-aga 20748842  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  20748841 ttaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 20748743  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||    
T  20748742 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgatgaa 20748643  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | | ||  || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  20748642 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtgtgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 20748543  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| || |||||||||    
T  20748542 ttcttggccatattatttctg 20748522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 307 - 469
Target Start/End: Original strand, 11770438 - 11770600
Alignment:
Q  307 gtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatg 406  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  11770438 gtgttcatcgatgatattttgatatactccaagtctgagggagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatg 11770537  T
Q  407 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11770538 ttaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctg 11770600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15342785 - 15342343
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||     
T  15342785 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgctttcgaggatttatgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattttcagtaagattgac 15342686  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  15342685 ttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 15342586  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||  ||| |||||  ||| || || || || || ||||||||  |    
T  15342585 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggttgtattcattgacgatatcct 15342486  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||||| | || || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||||    
T  15342485 aatttattctaagactaaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaa 15342386  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  15342385 ttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 15342343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 392
Target Start/End: Original strand, 18051852 - 18052213
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  18051852 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 18051951  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  18051952 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 18052051  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || || || || || || || ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || || ||| |||||    
T  18052052 tgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatt 18052151  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaaga 392  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| | ||||||    
T  18052152 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaaga 18052213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 7826252 - 7825831
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  7826252 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 7826153  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  7826152 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 7826053  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  7826052 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 7825953  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  7825952 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 7825853  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  7825852 tttggttgaaggaagtgagttt 7825831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Original strand, 27105692 - 27106113
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  27105692 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 27105791  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  27105792 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 27105891  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  27105892 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 27105991  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  27105992 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 27106091  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  27106092 tttggttgaaggaagtgagttt 27106113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27172633 - 27172212
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  27172633 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 27172534  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  27172533 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 27172434  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  27172433 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 27172334  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  27172333 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 27172234  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  27172233 tttggttgaaggaagtgagttt 27172212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 19615029 - 19614587
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || |||||     
T  19615029 tcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgac 19614930  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  19614929 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 19614830  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||   || || || || || || || || |||||    
T  19614829 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacatttt 19614730  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||| || || |  ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| ||     
T  19614729 gatctattcgagaactgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgag 19614630  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    || ||||| |  ||||| |||||||| ||| || |||||||||    
T  19614629 ttttggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctg 19614587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 376 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 14213678 - 14213579
Alignment:
Q  376 ttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  14213678 ttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 14213579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 14284271 - 14284713
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||||| ||  |||||||  |||| || || || ||     
T  14284271 tcagttgaacaaagttgcgataaagaacaggtatccgcttccgaagattggcgacttgatggatcagttggtttgtgcaaagatttttagtaatatcgac 14284370  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| |   | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || |||||| |||| || |||||||| || |||||||    
T  14284371 ttgaggtatggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttattgtcattacgaatataaggtgatgcctt 14284470  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || ||||| ||  |||||  ||| || || || || || || || |||||    
T  14284471 tcggtgttactaatgcgcctggcgtgttcatggagtatataaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggttgtattcattgatgacatttt 14284570  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| || || ||| | || ||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||     
T  14284571 gatttattctaagactgaagaggagcatacagaacatctgaggattatattgcaagtattgaaagagaagaagctgtatgctaagttgtcgaaatgtgag 14284670  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| |  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  14284671 ttctagttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 14284713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 390 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 8200618 - 8200533
Alignment:
Q  390 agagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  8200618 agagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 8200533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Original strand, 11770320 - 11770426
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || || ||||||||| |||    
T  11770320 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattaatt 11770419  T
Q  128 tgagatc 134  Q
    |||||||    
T  11770420 tgagatc 11770426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 87
Target Start/End: Original strand, 16727300 - 16727360
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatg 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16727300 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttctgagaattgatgatttgatg 16727360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 87
Target Start/End: Original strand, 17704372 - 17704432
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatg 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17704372 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttctgagaattgatgatttgatg 17704432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 4442280 - 4442157
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||  |||| || || ||||||||||    
T  4442280 cagttgaagaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatt 4442181  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagatta 151  Q
    |||||||| | ||||| |||||||    
T  4442180 tgagatcaggatatcatcagatta 4442157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13379235 - 13379105
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  13379235 cagttgaacaaggtgactattaagaatctttatcctcttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 13379136  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    |||||||| | ||||| ||||| | ||||||    
T  13379135 tgagatcaggatatcatcagatcagagtgaa 13379105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17926001 - 17925872
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    ||||||||||||| || || ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | || ||||   |||| || || || ||||||||    
T  17926001 agttgaacaaggtgacgattaagaatcagtatccgcttccgaggattgatgatttgagggatcagctggttggtgtggaagtatttagtaaaattgattt 17925902  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  17925901 gagatcaagatatcatcagattagagtgaa 17925872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 356
Target Start/End: Original strand, 39210 - 39392
Alignment:
Q  174 gaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgc 273  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||   || |||||||| || ||| |||| || || ||||| |||||||||||||||||  |     
T  39210 gaagactgccttcagaacccgttatggtcattatgagtattcggtgatgccttttggagtgtccaacgcgccaggagtttttatggagtatatgaacaga 39309  T
Q  274 atcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgc 356  Q
    || |||||| ||| ||| |||| |||||| || || || || || ||||||||| | ||||| ||  | ||||| ||||||||    
T  39310 attttccatccatatttagatcagttcgttgtagtattcattgatgatattttggtgtactctaaatcagaggaggaacatgc 39392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 422 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 13688022 - 13687969
Alignment:
Q  422 gtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  13688022 gtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 13687969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 379
Target Start/End: Original strand, 17143422 - 17143545
Alignment:
Q  256 atggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatg 355  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||| | | |||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||| | || || ||| | ||||| || ||||    
T  17143422 atggaatatatgaatagaatcttccatccttatttggatcagtttgtggtggtgtttatagacgatatcttggtgtattcgaagtcagaggaggatcatg 17143521  T
Q  356 ctgagcatctgaagattgtcttgc 379  Q
    | |||||| ||| |||||| ||||    
T  17143522 cggagcatatgaggattgtgttgc 17143545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13458387 - 13458257
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||| | ||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||  | || |||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  13458387 cagttaaacaaggcaacgattaagaatcgatatccgcttcaaaggattgatgatttgatggaccaactggttggtgcggaagtgttcagtaagattgatt 13458288  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    | |||||| | |||||  |||||| ||||||    
T  13458287 tcagatcaggatatcattagattagagtgaa 13458257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Original strand, 15716825 - 15716942
Alignment:
Q  32 tgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgag 131  Q
    |||||||||| || || ||||||  |||| | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||    
T  15716825 tgaacaaggtgacgattaagaatcagtattcgctcccgaggattgaggatatgatggatcagttggttggtgcggaagtgttcagtaagattgatttaag 15716924  T
Q  132 atcaaggtatcaccagat 149  Q
     ||| | ||||| |||||    
T  15716925 gtcacgatatcagcagat 15716942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 9486210 - 9485763
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9486210 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 9486111  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9486110 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 9486011  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9486010 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 9485911  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9485910 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 9485811  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  9485810 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 9485763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 24712027 - 24711581
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24712027 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgattt 24711928  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711927 gagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 24711828  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  24711827 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcattttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttga 24711728  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711727 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 24711628  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  24711627 ctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 24711581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 44384019 - 44384458
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44384019 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 44384118  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384119 tgagattaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 44384218  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  44384219 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 44384318  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384319 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 44384418  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  44384419 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 44384458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 16927354 - 16926915
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16927354 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16927255  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927254 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16927155  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16927154 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 16927055  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927054 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 16926955  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||| ||||||||||    
T  16926954 tctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttc 16926915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 17000994 - 17000555
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17000994 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 17000895  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000894 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 17000795  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17000794 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 17000695  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000694 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 17000595  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||| ||||||||||    
T  17000594 tctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttc 17000555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 21143490 - 21143937
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21143490 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcaacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 21143589  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143590 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatacagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 21143689  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21143690 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 21143789  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  21143790 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 21143889  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  21143890 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 21143937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 27220010 - 27219571
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27220010 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 27219911  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27219910 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgatatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27219811  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27219810 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 27219711  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27219710 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27219611  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  27219610 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 27219571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 10870844 - 10870405
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  10870844 cagttgaacaaggtaactatcaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggagcacgagttttcagcaagattgatt 10870745  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10870744 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 10870645  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  10870644 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 10870545  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10870544 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 10870445  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  10870444 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 10870405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 41606834 - 41607274
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  41606834 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 41606933  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41606934 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 41607033  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  41607034 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 41607133  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41607134 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 41607233  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  41607234 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttct 41607274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 24264364 - 24263917
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24264364 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 24264265  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264264 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 24264165  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||    
T  24264164 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 24264065  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264064 atttactccaagactgaagaggaacatgttgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 24263965  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  24263964 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 24263917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 27373263 - 27372816
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  27373263 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 27373164  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373163 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27373064  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27373063 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggaatatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 27372964  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372963 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27372864  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  27372863 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 27372816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 23189879 - 23189466
Alignment:
Q  61 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaag 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | |||||| |||||||||| ||||    
T  23189879 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcggttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgacttgaggttaggttatcactagattaaagtaaaag 23189780  T
Q  161 atgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgga 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23189779 atgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgga 23189680  T
Q  261 gtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgag 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23189679 gtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatagacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgag 23189580  T
Q  361 catctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  23189579 catctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtg-attctggttgaagaaagtaagttttctgggccatg 23189481  T
Q  461 ttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||| |||||    
T  23189480 ttatttctggtgatg 23189466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 24677484 - 24677036
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24677484 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagatttcagcaagattgat 24677385  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24677384 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctt 24677285  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||    
T  24677284 tcggtgttacgaatgcacctgtagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggtttttttcatcgatgatatttt 24677185  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  24677184 aatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgag 24677085  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24677084 ttctggttgaaagaggtaagttttctgggccatgttatttctggtgatg 24677036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 24875199 - 24875646
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24875199 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcgattagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 24875298  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24875299 tgaggtcaggttatcatcagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 24875398  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  24875399 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcattgatgatattttg 24875498  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24875499 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 24875598  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  24875599 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 24875646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 24705931 - 24706378
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24705931 cagttgaacaaggtaactatcaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcgaaagttttcagcaagattgatt 24706030  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706031 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaaaaagaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 24706130  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |  || || || || |||||||||    
T  24706131 tggtgttaccaatgtacctggagtgtttatggagtacatgaatcatatctttcacgcatttttggatcggttcgtggctgttttcattgatgatattttg 24706230  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  24706231 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaaatgtgagt 24706330  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  24706331 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 24706378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 21323715 - 21324156
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21323715 cagttaaacaaggtaactatcaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 21323814  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21323815 tgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggccactatgagtataaagttatgccttt 21323914  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||    
T  21323915 tggtgttaccaatacacctggagtatttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggttcgtagttgttttcatcgacgatattttg 21324014  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  21324015 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaggagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagt 21324114  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  21324115 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttctg 21324156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 28 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9337576 - 9337206
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9337576 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 9337477  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9337476 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 9337377  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  9337376 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 9337277  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaa 398  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9337276 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaa 9337206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 23106177 - 23106618
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23106177 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 23106276  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23106277 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 23106376  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || || || || || |||||||||    
T  23106377 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcagttcgtggttgttttcattgatgatattttg 23106476  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23106477 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 23106576  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  23106577 tatggttaaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 23106618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 31 - 469
Target Start/End: Original strand, 22734226 - 22734664
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||    
T  22734226 ttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtacaagtgttttcaacaagatagatttga 22734325  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    ||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  22734326 gatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcgg 22734425  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||    
T  22734426 tgttataaatgcacctggagtatttatgtagtacatgaatcgcatctttcatgaatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatt 22734525  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22734526 tactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtaaattct 22734625  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  22734626 ggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 22734664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 23073857 - 23073416
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||     
T  23073857 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtattttcagcaagatagatc 23073758  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  23073757 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggccattatgaatacaaagttatgccttt 23073658  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| || || || || || |||||||||    
T  23073657 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaaccgcatctttcatgcatttttggaatgtttcgtggttgttttcattgatgatattttg 23073558  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||   ||| ||||| | || || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23073557 atttactccaagtctgaagaagaacatactagccatttgaagttggttttccaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 23073458  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  23073457 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 23073416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 24818679 - 24819120
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  24818679 cagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtattcagcaagattgatt 24818778  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  24818779 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 24818878  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | || ||||| || || |||||||||    
T  24818879 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttg 24818978  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||     
T  24818979 atatactctaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaac 24819078  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24819079 tctggttgaatgaagtaagttttcttggccatgttatttctg 24819120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 23112712 - 23112290
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat---ttgagatcaaggtatcacc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||   ||||| ||  | || || |    
T  23112712 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcatattcagcaagattgatgatttgaggtcgggttaccatc 23112613  T
Q  146 agattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacc 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| || || || || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||    
T  23112612 agattaaggtgaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttaggacgcgatatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgcc 23112513  T
Q  246 tggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgag 345  Q
    | | |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | | |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  23112512 tagtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggatcagtttgtagttgtgtttattgatgatatcttgatttattctaagactgaa 23112413  T
Q  346 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaa 445  Q
    ||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||| || |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  |||||||    
T  23112412 gaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaa 23112313  T
Q  446 gttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    ||||||| ||| || ||||||||    
T  23112312 gttttcttggccatattatttct 23112290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 1065746 - 1065318
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  1065746 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 1065647  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  1065646 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 1065547  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  1065546 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatatttt 1065447  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  1065446 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 1065347  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||    
T  1065346 ttctgattaaatgaagtaagttttctggg 1065318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 19650498 - 19650940
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  19650498 tcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 19650597  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||  ||| | || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || || || || |||||||| || || || || || |||||||    
T  19650598 ttgaagtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctt 19650697  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||   || || || |||||||| || |||||| |    
T  19650698 tcggtgtcactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttttttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 19650797  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  | |||||||| ||||| || |||||     
T  19650798 aatttattctaagaccgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 19650897  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| |  |||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  19650898 ttctagttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 19650940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 23098466 - 23098908
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||||||     
T  23098466 tcagttgaacaaagtgacgataaagaacaggtatccgcttctgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaagattgac 23098565  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  23098566 ttgaggtcaggataccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatagaaggtgatgcctt 23098665  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||| | || || ||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23098666 tcggtgttactaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaataggatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatatttt 23098765  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||   ||||||||| |   | |||||||| ||||| || ||||||    
T  23098766 aatttattctaagactgaagaagagcatgccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaatgttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaa 23098865  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  23098866 ttctggttaagtgaagtgagttttctcggccacattatttctg 23098908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 307 - 475
Target Start/End: Original strand, 22323584 - 22323752
Alignment:
Q  307 gtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatg 406  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22323584 gtgtttatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatg 22323683  T
Q  407 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||    
T  22323684 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttgtttctggtgatg 22323752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 31832653 - 31832225
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  31832653 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatttttagtaagattgat 31832554  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || || |||||||    
T  31832553 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaggtgatgcctt 31832454  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  31832453 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 31832354  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  31832353 aatttattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgag 31832254  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  31832253 ttctggttaagtgaagtaagttttctggg 31832225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27789731 - 27789337
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  27789731 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 27789632  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27789631 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 27789532  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||    
T  27789531 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 27789432  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||    
T  27789431 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtga 27789337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 23278771 - 23278346
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  23278771 tcagttgaacaaagttacaatcaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 23278672  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||  ||| | || || || ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||  | || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  23278671 ttgaagtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggacaaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 23278572  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| | | |||||   ||||| || || ||||| || || ||| |    
T  23278571 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataatttcgtggttgtttttattgatgacattct 23278472  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||| ||     
T  23278471 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgag 23278372  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  23278371 ttctggttaagtgaagtgagttttct 23278346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12576344 - 12575983
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  12576344 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 12576245  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  12576244 ggtcaggttaccaccaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 12576145  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || || || || || || || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||   ||||| ||||| ||||| || || ||| |||||    
T  12576144 tgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatt 12576045  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaaga 392  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| | ||||||    
T  12576044 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaaga 12575983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25255914 - 25255657
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||    
T  25255914 tcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagcaaaattgat 25255815  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  25255814 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 25255715  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgc 284  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  25255714 tcggtgttactaatgcgcttggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgc 25255657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 19717465 - 19717907
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||     
T  19717465 tcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttctgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttaacaagattgac 19717564  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || ||||| ||  |||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  19717565 ttgaggtcaggttaccatcagatcaagttgaaggatgaggatatgcacaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 19717664  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||    || |||||||| || |||||| |    
T  19717665 tcggtgttactaaagcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattttgggttgtgtttattgatgatattct 19717764  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||     
T  19717765 aatttattctaagactgaagatcagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagctgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 19717864  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||    
T  19717865 ttctggttaagtgaagtaagatttctaggccacattatttctg 19717907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Original strand, 30010654 - 30011074
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||    || ||||| || || || || |||| | | ||||||||||    
T  30010654 aagaataagtatccacttccgaggatcgacgatttgatggatccgttagtgggtgcgcgtgtgttcagtaaaatggacttaagattaggctatcaccaga 30010753  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||  | || || || ||||| || || || ||||||   || ||||||||| |||| || ||||| || ||    
T  30010754 ttaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattctgtgatgcctttcagtgttactaatgcgccagg 30010853  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || || ||| | | | ||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||     
T  30010854 agtgtttatgaaatatatgaatcgtatttttcatacttatctggatcgttttgttgtcgtgtttatagatgatattttgatatactccaagtccgaggag 30010953  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    |||||||  |||||| |||  ||||| |||||||||  | ||||||||||  | ||||| || || || | ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30010954 gaacatgtcgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgcaagagaagaagttatatgccaagttatcgatgtgcgaattctggttgaacgaagtgagtt 30011053  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||  || |||||||||    
T  30011054 ttctcggtcatattatttctg 30011074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 452
Target Start/End: Original strand, 30209387 - 30209790
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    || ||||| || ||||| || || ||| | ||||||||||    
T  30209387 aagaataagtatccacttccgaggatcgaagatttgatggatcagttagtgggtgcgcgtgtgttcagtaaaattgagttaaggtcaggctatcaccaga 30209486  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||  | || ||  |||||   || |||||||||||||| || ||||| |  ||    
T  30209487 tcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacagacattacaaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctggg 30209586  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || || ||| | | | ||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||     
T  30209587 agtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatacttatctggatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattttgatatactccaagtccgaggag 30209686  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    |||||||  || ||| |||  ||||| || ||||||  ||||||||||||  | | ||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30209687 gaacatgtcgaacatttgagaattgtttttcaagtgctgaaagagaagaagttatctgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagtt 30209786  T
Q  449 ttct 452  Q
    ||||    
T  30209787 ttct 30209790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24950503 - 24950178
Alignment:
Q  109 gttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatg 208  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||| | || || |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || |    
T  24950503 gtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacg 24950404  T
Q  209 aatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggt 308  Q
    |||| || || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   || |  || ||    
T  24950403 aatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgcggttgt 24950304  T
Q  309 gtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgct 408  Q
     ||| | || |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||  | ||||||    
T  24950303 atttgttgatgatattctgatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgct 24950204  T
Q  409 aaattgtctaagtgtgaattctggtt 434  Q
    || ||||| |||||||| || |||||    
T  24950203 aagttgtcgaagtgtgagttatggtt 24950178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23611134 - 23611069
Alignment:
Q  61 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23611134 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcggttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 23611069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 469
Target Start/End: Original strand, 27208802 - 27209062
Alignment:
Q  209 aatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggt 308  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| || || || ||| | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||    
T  27208802 aatacaaagtgatgtctttcggtgttactaaagcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggt 27208901  T
Q  309 gtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgc 407  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || |||||    
T  27208902 gtttatagatgatattttgatttattctaagactgaagaggtgcatgcagagcacctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgc 27209000  T
Q  408 taaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     || ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  27209001 caacttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacgttatttctg 27209062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 307 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 25264769 - 25264607
Alignment:
Q  307 gtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatg 406  Q
    |||||||| || || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  | ||||    
T  25264769 gtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatg 25264670  T
Q  407 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    | || ||||| || ||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  25264669 ccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 25264607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Original strand, 24829637 - 24830058
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  24829637 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24829736  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
     |||||||   ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||  ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  24829737 agagatcagaatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 24829836  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  24829837 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 24829936  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||| | | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  24829937 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgcggagcatttgaggattgtgttgcaattcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 24830036  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | ||||| |||||||| |||||    
T  24830037 tttggttcaaggaagtgagttt 24830058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22280096 - 22279993
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || |||||||||||||    
T  22280096 ttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatttga 22279997  T
Q  131 gatc 134  Q
    ||||    
T  22279996 gatc 22279993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 23295631 - 23295501
Alignment:
Q  326 tgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||    
T  23295631 tgatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtga 23295532  T
Q  426 attctggttgaaggaagtaagttttctgggc 456  Q
     |||||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  23295531 gttctggttaattgaagtgagttttctgggc 23295501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 25130603 - 25130473
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||| |||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  | || |||||  |||| || || ||||||||||    
T  25130603 cagttgaactaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgattttatggatcaactggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatt 25130504  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  25130503 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 25130473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22279775 - 22279678
Alignment:
Q  352 catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22279775 catgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagttt 22279678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 158
Target Start/End: Original strand, 22760039 - 22760148
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||  | || |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  22760039 aagaatcggtacccgcttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgcttagtaagattgatttgagatcaagatatcatcata 22760138  T
Q  149 ttaaagtgaa 158  Q
    ||| ||||||    
T  22760139 ttagagtgaa 22760148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23204309 - 23204273
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23204309 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 23204273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 45534613 - 45534493
Alignment:
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||  ||||||||||||  | ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  45534613 gaacatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagtt 45534514  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||  || |||||||||    
T  45534513 ttctcggtcatattatttctg 45534493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Original strand, 24568117 - 24568247
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| || || || |||||| ||||||  ||||| || ||||||||||| |||||| || | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  24568117 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatctgcttccaaggattgatgatttaatggattagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24568216  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    |||||||| | ||||| || |||| ||||||    
T  24568217 tgagatcaggatatcatcatattagagtgaa 24568247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 380
Target Start/End: Original strand, 10037982 - 10038133
Alignment:
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    |||||||| ||||| | ||| || || ||||| || |||||| | ||||||||| | | |||||||| |||  | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  10037982 ggtgtgactaatgcgcttggtgtcttcatggaatacatgaatagaatcttccatccttatttggatcagtttatggtggtgtttatagacgatatcttga 10038081  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgca 380  Q
    | || || ||| | ||||| || ||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  10038082 tgtattcgaagtcagaggaggagcatgcagagcatctaaggattgtgttgca 10038133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 380
Target Start/End: Original strand, 10098367 - 10098518
Alignment:
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    |||||||| ||||| | ||| || || ||||| || |||||| | ||||||||| | | |||||||| |||  | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  10098367 ggtgtgactaatgcgcttggtgtcttcatggaatacatgaatagaatcttccatccttatttggatcagtttatggtggtgtttatagacgatatcttga 10098466  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgca 380  Q
    | || || ||| | ||||| || ||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  10098467 tgtattcgaagtcagaggaggagcatgcggagcatctaaggattgtgttgca 10098518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 449
Target Start/End: Original strand, 12639059 - 12639103
Alignment:
Q  405 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  12639059 tgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttt 12639103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 58410 - 57962
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  58410 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaagtttttagcaagattgat 58311  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58310 ttgaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 58211  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  58210 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggattatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtagttgtgtttatcgatgacatttt 58111  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58110 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgtgcatctgaagattgtcttccaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 58011  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  58010 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 57962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Original strand, 17975 - 18426
Alignment:
Q  25 catcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattg 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17975 catcagttgaacaaagtaactatcaaaaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattg 18074  T
Q  125 atttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc 224  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18075 atttgagatcatgttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagatatctttcagtacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc 18174  T
Q  225 tttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || || || |||    
T  18175 tttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgtagtacatgaatcgcatcttccaagcatttttggagcggttcgtggttgttttcattgatgacatt 18274  T
Q  325 ttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatct-gaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgt 423  Q
    || ||||||||||||  | | |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18275 tt-atttactccaagtattaagaagaacatgctgaacatctaaaaaattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgt 18373  T
Q  424 gaattctggttgaaggaagtaa-gttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    || ||||||||||| || |||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  18374 gagttctggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttctggtgatg 18426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 73 - 469
Target Start/End: Original strand, 195444 - 195840
Alignment:
Q  73 attgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  195444 attgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaagataaatgatgaagatatgc 195543  T
Q  173 agaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcg 272  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  195544 agaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcaccagaagtatttatggagtatatgaatcg 195643  T
Q  273 catcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagatt 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || || || || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  195644 catcttccatgcatttctggatcgttttgtggttgtctttatcgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatctgaaggtt 195743  T
Q  373 gtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  195744 gtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttctg 195840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 9332 - 8885
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  9332 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 9233  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9232 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 9133  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  9132 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 9033  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9032 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 8933  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  8932 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 8885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 107723 - 108164
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  107723 cagttgaacaagataactatcaagaataggtatccacttccgagaatggatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagagttttcagcaagattgatt 107822  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107823 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgtagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 107922  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  107923 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgagtcgcatcttccatgcgtttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 108022  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  108023 atttactccaagattgaagaggaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 108122  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  108123 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctg 108164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 267
Target Start/End: Original strand, 94805 - 95045
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||     
T  94805 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagcaagattgac 94904  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  94905 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcactacgaatacaaagtgatgcctt 95004  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatg 267  Q
    ||||||| || || || || || ||||| ||||||||||||    
T  95005 tcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatg 95045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 114956 - 114512
Alignment:
Q  25 catcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattg 124  Q
    ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||    
T  114956 catcagttgaataaagttacgataaagaacagatatcctcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattg 114857  T
Q  125 atttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc 224  Q
    | ||| | ||| | || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||    
T  114856 acttgtggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcc 114757  T
Q  225 tttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatt 324  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| | || || ||||| |   |||||   || || || || || || || || |||    
T  114756 tttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaatatatgaatagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacatt 114657  T
Q  325 ttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtg 424  Q
    ||||| || || |  ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| |    
T  114656 ttgatctattcaagaactgaggaagagcatgcagaacatctgatgattgtattgcaagtattgaaagagaagaaattgtatgccaaattgtcgaagtgcg 114557  T
Q  425 aattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||| || |||||||||    
T  114556 agttctggttaaatgaagtgagttttcttggccatattatttctg 114512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 9760 - 9313
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  9760 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatctgatggatcagttagtgggtacacgtgttttcagcaagattgatt 9661  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9660 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 9561  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  9560 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttt 9461  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9460 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 9361  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9360 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 9313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Original strand, 22828409 - 22828856
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  22828409 cagttgaataaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 22828508  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828509 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagataaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 22828608  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  22828609 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgcgttcatcgatgatattttg 22828708  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22828709 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 22828808  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22828809 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 22828856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 468
Target Start/End: Original strand, 24293837 - 24294276
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  24293837 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgattt 24293936  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24293937 gaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 24294036  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  24294037 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttga 24294136  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24294137 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 24294236  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  24294237 ctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttct 24294276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 28261251 - 28261690
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28261251 cagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 28261350  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28261351 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 28261450  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28261451 cgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 28261550  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28261551 atttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 28261650  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||||||    
T  28261651 tctggttgaaagaagtgagtttccctggccatgttatttc 28261690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 28284665 - 28284226
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28284665 cagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 28284566  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28284565 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 28284466  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28284465 cgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 28284366  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28284365 atttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 28284266  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||||||    
T  28284265 tctggttgaaagaagtgagtttccctggccatgttatttc 28284226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 28340000 - 28340439
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28340000 cagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 28340099  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28340100 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 28340199  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28340200 cgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 28340299  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28340300 atttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 28340399  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||||||    
T  28340400 tctggttgaaagaagtgagtttccctggccatgttatttc 28340439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Original strand, 27563886 - 27564334
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27563886 tcagttgaacaaagttactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 27563985  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    || |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27563986 ttaagatcaggttatcaccaaattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaggcagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 27564085  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  27564086 tcggtgtgaccattgcacctaaagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtgttcatcgatgaaatttt 27564185  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27564186 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaa 27564285  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  27564286 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 27564334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 27189663 - 27189224
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27189663 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 27189564  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27189563 tgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgccttt 27189464  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |||    
T  27189463 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtattcatcgacgatatcttg 27189364  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27189363 atttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtccaagtgtgaat 27189264  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  27189263 tctggttgaaagaagtgagtttccttggccatgttatttc 27189224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 27259577 - 27260016
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27259577 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 27259676  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27259677 tgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgccttt 27259776  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |||    
T  27259777 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtattcatcgacgatatcttg 27259876  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27259877 atttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtccaagtgtgaat 27259976  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  27259977 tctggttgaaagaagtgagtttccttggccatgttatttc 27260016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 16961537 - 16961977
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16961537 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtcggtgcgaaagtttttagcaagattgattt 16961636  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16961637 gaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgtcgttc 16961736  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||    
T  16961737 ggtgtgaccaatgcacctgaagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgacgatattttga 16961836  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  16961837 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaagtcatctaagtgtgaatt 16961936  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  16961937 ctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttctg 16961977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 2872857 - 2873296
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  2872857 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 2872956  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872957 tgaggtcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 2873056  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  2873057 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttatgtttatcgacgatattttg 2873156  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2873157 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaggagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 2873256  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  2873257 tttggttgaaagaagtgagtttccttggccatgttatttc 2873296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 19866915 - 19866467
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19866915 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 19866816  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    || |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19866815 ttaagatcaggttatcacgagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 19866716  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| ||||||||    
T  19866715 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtttttatcgatgatatttt 19866616  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||     
T  19866615 gatttactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagcgtgag 19866516  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  19866515 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 19866467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 16925692 - 16926133
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16925692 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatctacttc-gagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttttagcaagattgat 16925790  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16925791 ttgaggtaaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataatgttatgccgt 16925890  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||    
T  16925891 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttttggagtatatgaagcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcatcgatgatatttt 16925990  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  16925991 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaagttatctaagtgtgaa 16926090  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  16926091 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttctg 16926133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 25114779 - 25114340
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  25114779 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 25114680  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    || |  || | ||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25114679 tggggccaggttatcatcagattaaagtaaaggttgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactgtgaatataaagttatgccttt 25114580  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  25114579 tggtgttaccaatacacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttttgttcatcgatgatattttg 25114480  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  25114479 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgtcaaattatctaagtgtgaat 25114380  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  25114379 tctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 25114340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22436097 - 22435649
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  22436097 tcagttaaacaaagtaactatcaataataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcatgtgttttcagcaagattgat 22435998  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22435997 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgtgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctt 22435898  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  22435897 ttggtgttaccaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatatttt 22435798  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  22435797 aatttactccaagactaaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattatctaagtgtgag 22435698  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22435697 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 22435649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 5837272 - 5837714
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  5837272 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcttttgttttcagcaagattgat 5837371  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  5837372 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagaccgctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgcctt 5837471  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| ||| |    
T  5837472 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtcttcattgacgacattct 5837571  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||     
T  5837572 gatttattccaagactgaggaagaacatgttgagcatctgaagactgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctttatgccaagttgtctaagtgtgag 5837671  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  5837672 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccacgttatttctg 5837714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 20633994 - 20634435
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20633994 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 20634093  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  20634094 tgagatctggttatcaccagattaaagtagaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgccttt 20634193  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||    
T  20634194 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttg 20634293  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20634294 atttactccaagtctaaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 20634393  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  20634394 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 20634435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 43 - 469
Target Start/End: Original strand, 25763297 - 25763723
Alignment:
Q  43 actatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatc 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  25763297 actatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcaggttatc 25763396  T
Q  143 accagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgc 242  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25763397 accagaaaaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactatgagtataaagttatgcctttcggtgttacaaatgc 25763496  T
Q  243 acctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagact 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  25763497 acctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccttgcatttttggatcgctttatggttgtctttattgatgacattttaatttactccaagact 25763596  T
Q  343 gaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaag 442  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  25763597 gaaggagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagataaaaatgtatgctaaattatctaattgtgaattctggttgaaagagg 25763696  T
Q  443 taagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  25763697 taagttttcttggccatgtcatttctg 25763723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 23 - 466
Target Start/End: Original strand, 22760504 - 22760947
Alignment:
Q  23 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 122  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  22760504 atcaacagttgaacaatgtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcacgtgttgtcagcaagat 22760603  T
Q  123 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 222  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  22760604 tgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcacaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaagttatg 22760703  T
Q  223 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgata 322  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  | ||||    
T  22760704 cctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattaatgata 22760803  T
Q  323 ttttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 422  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| | || ||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22760804 ttttgatttactccaagtctgaagaagagcatgctgagcatttgaagctggttttgtaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtg 22760903  T
Q  423 tgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 466  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||    
T  22760904 tgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttattt 22760947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 469
Target Start/End: Original strand, 25607918 - 25608356
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  25607918 ttgaacaaggtgactataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatgtgttttcagcaagatagatttga 25608017  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || || ||||  |||||    
T  25608018 gatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagacatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaggtaatgctgttcgg 25608117  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  25608118 tgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaattgcatctttcatgcatttttggatcgattcgtagttgtttttattgatgatattttgatt 25608217  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25608218 tactccaagtctgaagaagaagatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattct 25608317  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25608318 ggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctg 25608356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 109 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22444413 - 22444047
Alignment:
Q  109 gttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22444413 gttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcataacgtgttatggtcactatg 22444314  T
Q  209 aatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggt 308  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22444313 aatacaaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgt 22444214  T
Q  309 gtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgct 408  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22444213 ttttatcgatgatattttaatttactccaagactaaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatcct 22444114  T
Q  409 aaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22444113 aaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 22444047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 18405998 - 18406439
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  18405998 cagttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacctccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 18406097  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  18406098 tgagatcgggtcatcaccagattaaagtgaaagattaagatatgcagaagacagccttcagaacgtattatggacattatgagtataaggtgatgccgtt 18406197  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||||    
T  18406198 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttg 18406297  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18406298 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaaactggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactatatgctaaattgtttaagtgtgaat 18406397  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  18406398 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 18406439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16574117 - 16573879
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  16574117 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 16574018  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574017 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16573918  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 266  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16573917 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 16573879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Original strand, 16621263 - 16621501
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  16621263 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 16621362  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621363 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16621462  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 266  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621463 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 16621501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 164 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23080560 - 23080258
Alignment:
Q  164 aagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagta 263  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23080560 aagatatgcagaagacggattttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagta 23080461  T
Q  264 tatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcat 363  Q
     ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23080460 catgaatcgcatttttcatgcatttctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagtctgaggaagaacatgctgagcat 23080361  T
Q  364 ctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgtta 463  Q
     |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||| ||||||    
T  23080360 ttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtttgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgtta 23080261  T
Q  464 ttt 466  Q
    |||    
T  23080260 ttt 23080258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 410
Target Start/End: Original strand, 23085825 - 23086207
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||| |    
T  23085825 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtattcccttccaagaattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgact 23085924  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||  | || || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || || || || |||||||| || |||||||||  ||| ||||||||    
T  23085925 tgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatctagaagacggcctttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgccttt 23086024  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  23086025 cggtgttacaaatgcgccgggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 23086124  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaa 410  Q
    || ||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||||| |||||||||||    
T  23086125 atatactctaagtatgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctggaggagaagaagctttatgctaa 23086207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 270
Target Start/End: Original strand, 18183422 - 18183663
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   || || ||||||||||||||    
T  18183422 agttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatgcatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 18183521  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  18183522 gaggtccggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgtcttttagcacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttc 18183621  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaat 270  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  18183622 ggtgttacaaatgcgcctggtgtgtttatggtgtacatgaat 18183663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 471
Target Start/End: Original strand, 10466902 - 10467346
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  10466902 tcagttgaacaaagttacagtaaagaacaggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgac 10467001  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  |||| || ||||| ||||| |||||||    
T  10467002 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgataaagtcattacgaatacaaagtgatgcctt 10467101  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || |||||| |    
T  10467102 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttatggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattct 10467201  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| ||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  10467202 aatctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 10467301  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgat 471  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||  |  |||||||||||    
T  10467302 ttctggttaagcgaagtgagttttctgggtcacattatttctgat 10467346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Original strand, 14377991 - 14378411
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || || || |    
T  14377991 aagaacaggtatccacttcctaggatttatgacttgttggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgaattgagatcaggttaccatcaaa 14378090  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  14378091 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 14378190  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||   || || || || ||||| || |||| | ||||||| || |||||||| ||     
T  14378191 tgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattctaagactgaagag 14378290  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||    
T  14378291 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagtt 14378390  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| |  |||||||||    
T  14378391 ttcttggccacattatttctg 14378411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Original strand, 14379541 - 14379961
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || || || |    
T  14379541 aagaacaggtatccacttcctaggatttatgacttgttggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgaattgagatcaggttaccatcaaa 14379640  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  14379641 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 14379740  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||   || || || || ||||| || |||| | ||||||| || |||||||| ||     
T  14379741 tgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattctaagactgaagag 14379840  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||    
T  14379841 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagtt 14379940  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| |  |||||||||    
T  14379941 ttcttggccacattatttctg 14379961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21755160 - 21755002
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||    
T  21755160 tcagttgaacaag-taactatcaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatttgttttcagcaagatagat 21755062  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttc 186  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21755061 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttc 21755002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15461563 - 15461122
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  15461563 cagttgaacaaagttacaatcaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagcaagattgact 15461464  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  15461463 tgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcaaaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgccttt 15461364  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| | |||   || || ||||||||||| || |||||| ||    
T  15461363 cggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctagataaatttgtggtggtgtttatagatgatattctg 15461264  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||||| || || ||||| || ||||| || || ||  |||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||     
T  15461263 atttattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgat 15461165  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  15461164 ttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacgttatttctg 15461122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 271
Target Start/End: Original strand, 18963142 - 18963385
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  18963142 cagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatgtatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 18963241  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  18963242 tgagatcgggctatcaccagattaaagtgaaagatgacgatatgcagaagacgacttttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 18963341  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatc 271  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  18963342 cggtgttactaatgcaccaggtgtatttatggagtacatgaatc 18963385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 25770072 - 25769630
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||    
T  25770072 tcagttgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtattcagcaaaattgat 25769973  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  || || || || || ||||| || ||||| ||||| || ||| |||    
T  25769972 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaatgatgaggatatgcagaaaatggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctt 25769873  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| | |  ||||   || || || |||||||| || |||||  |    
T  25769872 tcggtgttactaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatccggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcct 25769773  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | | |||  | |||||||| ||||| || ||||||    
T  25769772 aatttattctaagtatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaataaatgaagttgtatgctaagttgtccaaatgtgaa 25769673  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  |||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  25769672 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 25769630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 24366640 - 24366212
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  24366640 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 24366541  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  24366540 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 24366441  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||  || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  24366440 tcggtgttactaatgtgccaggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 24366341  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  24366340 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcacctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaagtgtgag 24366241  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  24366240 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 24366212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 19881501 - 19881084
Alignment:
Q  52 aataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagatta 151  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||| | || || ||||| |    
T  19881501 aatagatatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagatca 19881402  T
Q  152 aagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagt 251  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  19881401 aggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgt 19881302  T
Q  252 gtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaa 351  Q
    ||| ||||||||||||||| | || || ||||| |   |||||   || || || ||||| || || || |||||||| || || |  |||||||||||     
T  19881301 gttcatggagtatatgaataggatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtgttcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagag 19881202  T
Q  352 catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttc 451  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||||    
T  19881201 catgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaaactgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttc 19881102  T
Q  452 tgggcgatgttatttctg 469  Q
    | ||| || |||||||||    
T  19881101 ttggccatattatttctg 19881084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 392
Target Start/End: Original strand, 28280870 - 28281231
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  28280870 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctggtaggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 28280969  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28280970 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 28281069  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || || ||| |||||    
T  28281070 tgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatt 28281169  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaaga 392  Q
    || || |||||||| | ||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| | ||||||    
T  28281170 tattcgaagactgaaggagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaaga 28281231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 19455251 - 19454827
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || | ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||   || || || |||||| |     
T  19455251 tcagttgaacaaagttacgataacgaacaggaatccact-ccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtatttagtaagatttac 19455153  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || ||| |||    
T  19455152 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgtagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctt 19455053  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |  ||||||   || || || || ||||| || || || ||    
T  19455052 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaatttgtggttgtatttattgatgacatctt 19454953  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  19454952 gatttattcaaagactaaagaagagcatgcagagcatctgaagatagtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgag 19454853  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  19454852 ttctggttaagtgaagtgagttttct 19454827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 233
Target Start/End: Original strand, 24516461 - 24516667
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  24516461 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 24516560  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  24516561 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 24516660  T
Q  227 tcggtgt 233  Q
    |||||||    
T  24516661 tcggtgt 24516667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 18796896 - 18796494
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  18796896 aagaacaggtatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggctaccatcaga 18796797  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||  |||||    
T  18796796 tcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgtgcctgg 18796697  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||   || || || || || || ||  | |||||||| || || |  ||||| |||    
T  18796696 tgtgttcatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtattcattgataacattttgatctattctagaactgaagaa 18796597  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  18796596 gagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaaatgaagtgagtt 18796497  T
Q  449 ttc 451  Q
    |||    
T  18796496 ttc 18796494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 19437230 - 19436788
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||     
T  19437230 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggatttatgacttgatggatcagttggtgggtgcagaggtttttagtaagattgac 19437131  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  19437130 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 19437031  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |  || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || ||| |    
T  19437030 tcggtgttactaatgcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattct 19436931  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||| || || |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |    ||||||||  |  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  19436930 gatctattctagaactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattctaaaagagaaagagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 19436831  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||| || |  ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  19436830 ttctgcttaagtgaagtgagttttctgggccacattatttctg 19436788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Original strand, 16380427 - 16380848
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  16380427 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 16380526  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  16380527 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 16380626  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  16380627 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 16380726  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  16380727 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 16380826  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  16380827 tttggttgaaggaagtgagttt 16380848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 182
Target Start/End: Original strand, 30679061 - 30679215
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || || |||||||||||||    
T  30679061 cagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatctacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtacacgtgtgtttagcaagattgatt 30679160  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagc 182  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  30679161 tgagatcaggctatcatcagattaaagtgacggatgaggatatgcagaagacagc 30679215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 34643639 - 34644081
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || || |||||     
T  34643639 tcagttgaataaagttacgataaagaacagatatcctcttccgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagatttttagtaaaattgac 34643738  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  34643739 ttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 34643838  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||| | || || ||||| | | |||||   || || || ||||  || || || |||||    
T  34643839 tcggtgttactaacgcgcctggggtgttcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttatctggataaatttgtggttgtgtacattgatgacatttt 34643938  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||| || || |  || |||||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||     
T  34643939 gatctattcgacaacggaggaagagcatgcagaacatctaagaattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgag 34644038  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||||||||||| || ||| || |||||||||    
T  34644039 ttctggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttctg 34644081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Original strand, 16648023 - 16648444
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  16648023 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcaaaggtgtttagtaagattgatt 16648122  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  16648123 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 16648222  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  16648223 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 16648322  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | |  || || |||||||||||||| |    
T  16648323 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagt 16648422  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  16648423 tttggttgaaggaagtgagttt 16648444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 21473828 - 21473404
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    || |||| ||| ||||||    
T  21473828 tcagttgaataaagtgacgataaagaacatgtatcgacttcctagaattgatgatttaatgaatcagttagtgggtgctcgtgtgttcaacaaaattgat 21473729  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| || ||| |||    
T  21473728 ttgaggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctt 21473629  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||| ||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| | | |||||   || || || ||||||||  | |||||  |    
T  21473628 tcgatgttactaatgc-gctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttatttatgatatcct 21473530  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||| ||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||  | ||||  || ||||| || ||||||    
T  21473529 aatttattctaagaatgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaggaagttgtatgtcaagttgtccaaatgtgaa 21473430  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  21473429 ttctggttaagtgaagtaagttttct 21473404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 265 - 469
Target Start/End: Original strand, 18196024 - 18196228
Alignment:
Q  265 atgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatc 364  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||  | ||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||||| |||||     
T  18196024 atgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatttatgatattttgatatactccaagtccgaagaagagcatgctaagcatt 18196123  T
Q  365 tgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttat 464  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || || | |||||| ||| |||||||    
T  18196124 tgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtatgaattttggttgaaagatgtgaattttcttggccatgttat 18196223  T
Q  465 ttctg 469  Q
    |||||    
T  18196224 ttctg 18196228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 21568046 - 21568486
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||  | ||||||||  |||| || |||||||| ||    
T  21568046 agttgaacaaagtgacgataaagaacaggtatccgctgccgaggattgacgacttgatggatcaattgtttggtgcaaagatttttagtaagattgactt 21568145  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||| ||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  21568146 gaggtcaggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacactttatggtcattacgaatacaaagtgatgtctttc 21568245  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    ||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||   ||  | || || ||||| || |||||| |||    
T  21568246 ggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttatggttgtatttattgatgatattctga 21568345  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    |||| || ||||| || || || ||||  || ||||||| |||||  ||  | || | |||||| |||||  | |||||||| ||||| || ||||||||    
T  21568346 tttattctaagaccgaagaggagcatgtagaacatctgaggattgaattataggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaatt 21568445  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| | |  |||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  21568446 ctggctaattgaagtaagttttctcggccacattatttctg 21568486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23998475 - 23998352
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  23998475 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagcaagattgatt 23998376  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagatta 151  Q
    |||||||| | ||||| |||||||    
T  23998375 tgagatcaggatatcatcagatta 23998352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Original strand, 1646868 - 1647289
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  1646868 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgctgaggtgtttagtaagattgatt 1646967  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  1646968 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 1647067  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || || ||||||    
T  1647068 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgacattttg 1647167  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || |||  ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||| ||     | | ||| || |||||||||||||| |    
T  1647168 gtgtattcgaagtttgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 1647267  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  1647268 tttggttgaaggaagtgagttt 1647289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 152
Target Start/End: Original strand, 8761805 - 8761930
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| |  || || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8761805 tcagttgaacaaaggtacaataaagaacaagtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcgaaagttttcagcaagattgac 8761904  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaa 152  Q
    ||||| ||| | || || ||||||||    
T  8761905 ttgaggtcaggttaccatcagattaa 8761930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14130696 - 14130566
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| || || || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||  |||| || |||||||||||||    
T  14130696 cagttgaacaaagtgacgattaaaaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagcaagattgatt 14130597  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  14130596 tgaggtcaagatatcatcagattagagtgaa 14130566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16100242 - 16100112
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  16100242 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccactaccaaggattgatgatttgatggatcaactagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 16100143  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  16100142 tgagatcaggatatcatcagattatagtgaa 16100112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 319 - 469
Target Start/End: Original strand, 18965640 - 18965790
Alignment:
Q  319 gatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtcta 418  Q
    ||||||||||| ||  | ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||||  | |||||||| ||||| |    
T  18965640 gatattttgatatatgctaagtctgaagaagaacattctgagcatttgaagattgtttttcaagtgatgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaa 18965739  T
Q  419 agtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| || ||| || |||||||||    
T  18965740 agtgtgaattctggttgaatgaggtgagtttccttggccatattatttctg 18965790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 469
Target Start/End: Original strand, 19487528 - 19487767
Alignment:
Q  220 atgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacg 319  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||          |||| | |||||||||||| || || || ||||| || |    
T  19487528 atgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaat----------atgcttatttggatcggtttgtggttgtttttattgatg 19487617  T
Q  320 atattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaa 419  Q
    | || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||| |  |||||  | ||||| || ||||| ||    
T  19487618 acatcttgatttattctaagtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggtaaagaagttgtatgccaagttgtccaa 19487717  T
Q  420 gtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  19487718 atgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctg 19487767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Original strand, 23025800 - 23025930
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||   | || || || ||||||||||    
T  23025800 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgtggaggtgtttagtaagattgatt 23025899  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  23025900 tgaggtcaagatatcatcagattagagtgaa 23025930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23080650 - 23080573
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 105  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23080650 cagttgaataaagtaacgataaagaatagatattcacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 23080573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16100011 - 16099821
Alignment:
Q  253 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaac 352  Q
    |||||||||||||||||| | || || ||| ||| |||||| || || || ||||||||||| || |||| |||| | || || ||| || |||| || |    
T  16100011 tttatggagtatatgaatagaatatttcatccatatttggaccgttttgtggtggtgtttatagatgataatttggtgtattcgaagtctaaggaggagc 16099912  T
Q  353 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagt 443  Q
    | ||||||||| | | |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | |||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  16099911 acgctgagcatttaaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcaggaagt 16099821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 28311857 - 28311819
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactt 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28311857 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactt 28311819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 63
Target Start/End: Original strand, 23496245 - 23496281
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23496245 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 23496281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16234878 - 16234815
Alignment:
Q  405 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||  |||| ||||||    
T  16234878 tgctaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagggagtttcctgggtcatgtgatttct 16234815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18450702 - 18450579
Alignment:
Q  56 ggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagt 155  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||    || ||||| || ||||| || || ||  | |||||| |||| |||||    
T  18450702 ggtatccacttccgaggatcaacgatttgatggatcaattagtgggtgcgcttgtgttcagtaaaattgacttaagctcgggctatcactagatcaaagt 18450603  T
Q  156 gaaagatgaagatatgcagaagac 179  Q
    |||||| || ||||| ||||||||    
T  18450602 gaaagaagaggatattcagaagac 18450579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 439
Target Start/End: Original strand, 18836275 - 18836373
Alignment:
Q  341 ctgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 439  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | | |||||||  |  | | |||||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  18836275 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttggaagagaaccagttatgtgctaagttatctaagtgtgagttttggttgaagg 18836373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 341 - 397
Target Start/End: Original strand, 5295573 - 5295629
Alignment:
Q  341 ctgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaaga 397  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  5295573 ctgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaaga 5295629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18578095 - 18578015
Alignment:
Q  369 gattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||  || | | |||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  18578095 gattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccaattatgtgctaagttgtctaagtatgagttttggttgaaggaagtgagttt 18578015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Original strand, 37731 - 38179
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37731 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcacatgttttcagcaagattgat 37830  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37831 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 37930  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || || ||||| ||||||||    
T  37931 tcggtgttacgaatgcacctggagtgtttatggagtatataaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgcggttgttttcatcgatgatatttt 38030  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  38031 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgag 38130  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  38131 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 38179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23099 - 22661
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    | || |||||||||||||    
T  23099 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaatagatgatttgatggatcagttagtgggtgaatgtctgtttagcaagattgatt 23000  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||   || ||||||||    
T  22999 tgagatcgggctaccaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcggtgatgccttt 22900  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    || ||| || | ||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||||||||  ||||| || ||||| ||| | |||||||||    
T  22899 cgttgttacaactgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcacttcgtggttgtgttcatcaatgatattttg 22800  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || ||||| ||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| || |||||  | ||||| || ||||| |||||||| |    
T  22799 atatactctaagtctgaagaagaacacactgagcatttgaagattgttttgcaagtgccgaaggaaaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgagt 22700  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 466  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  22699 tctggttgaatgaggtaagttttcttggccatgttattt 22661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 35891 - 35442
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  35891 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 35792  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 35692  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||    
T  35691 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttctcatcgatgatatttt 35592  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  35591 aatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgag 35492  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaa-gttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  35491 ttctggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttctggtgatg 35442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 113 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28408 - 28222
Alignment:
Q  113 tcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28408 tcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 28309  T
Q  213 taaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtt 299  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28308 caaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtt 28222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 3111 - 2669
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||   || || || || ||||||    
T  3111 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgacgattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgat 3012  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || ||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||  | ||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  3011 ttgaggtcaggttaccatcagattaagtcgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacatgatatggacattacgaatataaagtgatgcctt 2912  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   ||||| || |||||||| || || || ||    
T  2911 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 2812  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||     
T  2811 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgag 2712  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  |||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  2711 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 2669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 28475 - 28405
Alignment:
Q  23 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 93  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28475 atcatcagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 28405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 6)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 29 - 464
Target Start/End: Original strand, 85709 - 86144
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  85709 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttacgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagtaagattgattt 85808  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  85809 gagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 85908  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| || |||||||    
T  85909 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatagagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgttttcatcgatgacattttga 86008  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  86009 tttactccaagactgaagaagaacatattgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaggagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaatt 86108  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttat 464  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||    
T  86109 ctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttat 86144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 85142 - 85581
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  85142 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttacgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtacaaaagttttcagcaagatagatt 85241  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  85242 tgagataaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 85341  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||     
T  85342 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttagatcggttcgtggttgtttttattgatgatatttta 85441  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  85442 atttcctccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagcttgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 85541  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  85542 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 85581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Original strand, 132401 - 132543
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||  | || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  132401 cagttgaacaaagtggcgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 132500  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatat 170  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || | |||||||||    
T  132501 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggctgaagatat 132543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 449
Target Start/End: Original strand, 132715 - 132822
Alignment:
Q  342 tgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaa 441  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  132715 tgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaa 132814  T
Q  442 gtaagttt 449  Q
    || |||||    
T  132815 gtgagttt 132822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 26162 - 26031
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||  || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | || |||||| | || || || |||||||||    
T  26162 tcagttgaacattgtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatgtatcatcttgttggtgcagaggtgtttagtaagattgat 26063  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    ||||||||| | ||||| | ||||| ||||||    
T  26062 ttgagatcaggatatcatccgattagagtgaa 26031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 25907 - 25799
Alignment:
Q  341 ctgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||  | ||| |||||  | || | |||||| ||  |||||||||| || |||||| ||||    
T  25907 ctgaggaagaacatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagatttgaaggagaaccagctatgtgctaagtttcctaagtgtgagttttggttgcagga 25808  T
Q  441 agtaagttt 449  Q
    |||||||||    
T  25807 agtaagttt 25799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 31 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 10865 - 10428
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  10865 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcgacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttga 10766  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10765 ggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacgactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 10666  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  10665 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatt 10566  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10565 tactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctaaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttct 10466  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    ||||||  ||||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  10465 ggttgagagaagtgagtttccttggccatgttatttct 10428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 31 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17327 - 16890
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17327 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcgacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttga 17228  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17227 ggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 17128  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  17127 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggattggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatt 17028  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17027 tactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttct 16928  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    ||||||  ||||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  16927 ggttgagagaagtgagtttccttggccatgttatttct 16890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 32 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 45541 - 45106
Alignment:
Q  32 tgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgag 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  45541 tgaacaaggtaactatcaagaataggtatccgcttccaagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgag 45442  T
Q  132 atcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggt 231  Q
     ||| | |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45441 gtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggt 45342  T
Q  232 gtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgattt 331  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  45341 gttaccaatgcacctagagtatttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgattt 45242  T
Q  332 actccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctg 431  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45241 actccaagactgaagaagaacatgctgatcatctgaagattgtcttgcaagtattgaaagagaaaaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctg 45142  T
Q  432 gttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  45141 gttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 45106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Original strand, 48447 - 48867
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  48447 aagaatagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaga 48546  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  48547 tcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttagcacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 48646  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||   || || || || || || || || |||||||| || || |  |||||||||    
T  48647 tgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaa 48746  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||    
T  48747 gagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagtt 48846  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| || |||||||||    
T  48847 ttcttggccatattatttctg 48867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 27 - 475
Target Start/End: Original strand, 54902 - 55350
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  54902 tcagttgaacaaagtaactatcaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 55001  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55002 ttgagatcaggttataaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgatatggtcactatgaatataaagttatgcctt 55101  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  || || || || ||| | || ||||||||    
T  55102 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtaattgaatcgcatcttccatgcatttttggatccctttgtggttgtttttctggatgatatttt 55201  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  55202 tatttactccaatactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtttaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgag 55301  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  55302 ttctggttgaaaaaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 55350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 110023 - 109584
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    ||||||||| ||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   || || || || ||||||||    
T  110023 agttgaacatggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgattt 109924  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  109923 gaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttc 109824  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    ||||| || ||||  ||| | ||||||||||||| |||||| || || |||||||| | | | |||   || || || |||||||| || || ||  |||    
T  109823 ggtgttactaatgtgcctagtgtgtttatggagtctatgaaccgaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcgtga 109724  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| || || || ||    
T  109723 tttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgcgagtt 109624  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    |||||| |  |||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  109623 ctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttct 109584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 31 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 36417 - 35973
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  36417 ttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattaatgatttgatggatcagttagtgggttgaaaagttttcagcaagatagatttga 36318  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36317 gatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtataaagttatgcctttcgg 36218  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||| |||    
T  36217 tgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatgatattttaatt 36118  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36117 tactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaatagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttct 36018  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    || |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  36017 ggatgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 35973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 31 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 20993 - 20549
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  20993 ttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattaatgatttgatggatcagttagtgggttgaaaagttttcagcaagatagatttga 20894  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  20893 gatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagatatgcctttcgg 20794  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||| |||    
T  20793 tgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatgatattttaatt 20694  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20693 tactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaagagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttct 20594  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    || |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  20593 ggatgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 20549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 17035 - 16594
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17035 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 16936  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16935 tgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaaggtgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcattatgagtacaaagttatgccttt 16836  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  16835 cggtgttacaaatgcaccaggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcggttcgtggtggtttttatcgatgatattttg 16736  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  16735 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgtaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaattgcgaat 16636  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  16635 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 16594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 12167 - 11746
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattga-tttgagatcaaggtatcaccag 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   || || || || ||||| |||||| ||| | || || |||    
T  12167 aagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgaatttgaggtcaggttaccatcag 12068  T
Q  148 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctg 247  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  12067 attaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctg 11968  T
Q  248 gagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgagga 347  Q
    | ||||||||||||||||||||  | || || ||||| | | |||||   || || || |||||||| || |||||  | ||||| || |||| ||| ||    
T  11967 gtgtgtttatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaaga 11868  T
Q  348 agaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagt 447  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||||||||||||||||  ||| |||||    
T  11867 agagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttgagtgaattaagt 11768  T
Q  448 tttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||| ||| || |||||||||    
T  11767 tttcttggccatattatttctg 11746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 24857 - 25298
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  24857 cagttgaacaaaataacgataaagaataggtatccacttccgataattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagattgact 24956  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  24957 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacaatatgaatataaagtgatgccttt 25056  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||||    
T  25057 cggtgttacaaatgcacctgaagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttctttttattgacgatattttg 25156  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25157 atttactccaagattgaggaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagataagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaat 25256  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| ||  ||||||||||||    
T  25257 tctggttgaaagaattgagttttcttggatatgttatttctg 25298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 105 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 8331 - 7961
Alignment:
Q  105 aaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcac 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8331 aaaagttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccatattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgctttatggtcac 8232  T
Q  205 tatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtag 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  8231 tatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcctttttggatcggttcattg 8132  T
Q  305 tggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaacttta 404  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8131 ttgtgtttatcgacgatattttgatttacttcaaaactgaggaggaacatgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaacttta 8032  T
Q  405 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  8031 tgctaaattatctaaatgtgagttctggttgaaagaggtaagttttatgggccatgttatttctggtgatg 7961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 29 - 437
Target Start/End: Original strand, 51258 - 51666
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  51258 agttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgattt 51357  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  51358 gagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagtcatgcctttt 51457  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || || || || || ||||| || |||||||    
T  51458 ggtgttaccaatgcacctcgagtatttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcactttgtggttgttttcatcgatgacattttga 51557  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  51558 tttactccaagactgaagaagaagatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagtt 51657  T
Q  429 ctggttgaa 437  Q
    || ||||||    
T  51658 ctagttgaa 51666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 42091 - 41650
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || || || || ||||||    
T  42091 tcagttgaataaagtgacgattaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagtaaaattgat 41992  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  41991 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaatacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctt 41892  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || || ||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || ||    
T  41891 tcggagttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttgcatgcttatatggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 41792  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||  | ||||  ||  |||| |||||||||    
T  41791 aatttattctaagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttg-aagaaaagaagttgtatgacaagctgtccaagtgtgaa 41693  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||    |||||||||||||| ||| || |||| ||||    
T  41692 ttctggttacgcgaagtaagttttcttggccatattatatctg 41650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 151504 - 151063
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  151504 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 151405  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  151404 tgagatctggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 151305  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| |  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||  |||||||     
T  151304 cggtgttatgaatgcacttggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgataatatttta 151205  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  151204 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggtgttgcaagtgttgaaagagaataagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 151105  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  |||| |||||||    
T  151104 tctggttgaaagaagtgagctttctaggacatgtaatttctg 151063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 2417 - 2857
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  2417 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatgaattagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 2516  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||     
T  2517 tgagatccggttatcaccatattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgccttc 2616  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| || || || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||    
T  2617 tggtgttacaaacgcgcttggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttg 2716  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2717 atttactccaagtctgaggaagaacatgctgagcatttgaagactagtttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaat 2816  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    |||||||||| ||  | |||||||| ||| |||||||||||    
T  2817 tctggttgaaagagatgagttttcttggccatgttatttct 2857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 87078 - 86722
Alignment:
Q  112 ttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaat 211  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || ||||| || || ||  |||    
T  87078 ttcagtaagattgatttaagatcgggctatcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacggacattacaaat 86979  T
Q  212 ataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtt 311  Q
    ||    | |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||| | |||| |||| || || ||  ||||    
T  86978 attcgatgatgcctttcggtgttactaacgcccctggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttgaatcgatttgttgttatgtt 86879  T
Q  312 tatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaa 411  Q
    ||| || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||  ||| ||||| ||  | |||||  |     
T  86878 tatagatgagattctaatatactctaagaccgaggaggaacatgccgagcattt-aagaatgttttgcaagtgctgaaggagaataagttatatgcctag 86780  T
Q  412 ttgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  86779 ttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtaagttttcttggccatattatttctg 86722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 28 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21639 - 21296
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  21639 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 21540  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21539 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatggagagatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggttactatgaatataaagttatgccttt 21440  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  21439 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 21340  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagat 371  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21339 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagat 21296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 7571 - 8012
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7571 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccactttcaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaatgttttcagcaagatagatt 7670  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  7671 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgctttcagaacgggttatggacattatgagtacaaagttatgccttt 7770  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||    
T  7771 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcatagttgtttttattgatgatattttg 7870  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7871 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtatgaat 7970  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| | ||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  7971 tctggttgaaaggagtgagctttcttggacatgttatttctg 8012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3293 - 2884
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  3293 cagttgaataaagtgacgataaagaataggtacccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 3194  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || || || ||||| || || ||  |||||  ||| ||||||||    
T  3193 tgagatcgggctatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgccttt 3094  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  3093 cggtgttactaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 2994  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || || || ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||  ||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||    
T  2993 atataatctaagtctgaagaagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctcaattgtcaaagtgtgaat 2894  T
Q  428 tctggttgaa 437  Q
    ||||||||||    
T  2893 tctggttgaa 2884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 3826 - 3385
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||     
T  3826 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccactttcgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatc 3727  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  3726 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggacattatgagtataaagttatgccttt 3627  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||||    
T  3626 cggtgttactaattcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttg 3527  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3526 atttactccaactctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaattgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaat 3427  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  3426 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctg 3385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1157 - 719
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1157 agttgaacaaggtgacaatcaagaataggtatccacttccgagtattgatgatttgatggatcagttggtgggtgcaaaagttttcagcaagatagattt 1058  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||    
T  1057 gagatc--gttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggccattatgagtataaggtgatgccgttc 960  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  959 ggtgttacaaatgcgcctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttga 860  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  859 tttacttcaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaacctttatgcgaaattgtctaagggtgaatt 760  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  759 ctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 8443 - 8002
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8443 cagttgaacaaggtgtcaataaagaataggtatccactttcgaggattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 8344  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8343 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 8244  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  | || || || || |||||||||    
T  8243 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtgcttgttttcattgatgatattttg 8144  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8143 atttactccaagtttgaggaagaatatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 8044  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  8043 tctggttgaaagaagtgagctttcttggatatgttatttctg 8002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 17639 - 17198
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17639 cagttgaacaaggtgtcaataaagaataggtatccactttcgaggattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 17540  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17539 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 17440  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  | || || || || |||||||||    
T  17439 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcttgcttgttttcattgatgatattttg 17340  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| ||  ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17339 atttactccaagtttgatgaagaatattttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 17240  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  17239 tctggttgaaagaagtgagctttcttggatatgttatttctg 17198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 139 - 469
Target Start/End: Original strand, 23097 - 23427
Alignment:
Q  139 tatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgacca 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  23097 tatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcgttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacca 23196  T
Q  239 atgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaa 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23197 atgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaa 23296  T
Q  339 gactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaag 438  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  23297 aactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaactgtctaagtgtgaattctggttgaaa 23396  T
Q  439 gaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  23397 gaagtgagttttcttggccatgttatttctg 23427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 453 - 12
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  453 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaacttccaaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 354  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  353 tgagatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagccttcagaacgcggtatgctcactatgagtacaaggttatgccttt 254  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || || |||||||||    
T  253 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgattcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatattttg 154  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  153 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattatctaagtgtgaat 54  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  53 tctggttaaaagaagtgagctttcttgggcatgttatttctg 12  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 8765 - 8326
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8765 cagttgaaaaaggtgacaataaagaataggtattcacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttt-cagcaagatagatt 8667  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8666 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacatctttcataacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 8567  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||    
T  8566 cggtgttacgaatgcacctgtagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgatgatattttg 8467  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||| |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  8466 atttactccaagtctaaggaagaacattctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagaaaagaagcattatgcgaaattgtctaagtgcgaat 8367  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||||    
T  8366 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttct 8326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20632 - 20223
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  20632 cagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgctagtgttttcagcaagattgact 20533  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  20532 tgagatcaggttatcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgccgtt 20433  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||    
T  20432 cggtgttacaaatgcacctagagtgtttatggagtacatgaatcatatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttg 20333  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 20233  T
Q  428 tctggttgaa 437  Q
    ||||||||||    
T  20232 tctggttgaa 20223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 7615 - 7174
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  7615 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgctaatgttttcagcaagattgact 7516  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||||| || ||| | ||    
T  7515 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcgttcagaacgtggtatggacattatgagtataaggtgatgtcgtt 7416  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||||    
T  7415 cggtgttacaaatgcacctagagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttagatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttg 7316  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7315 atttactccaagaccgaggaagaacatgttgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 7216  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| ||  ||||||||||||    
T  7215 tctggttaaaagaagtgagttttcttggacatgttatttctg 7174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 725 - 1162
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  725 cagttgaaaaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 824  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||   | ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  825 tgaga---aagtg-cagaagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgaatataaagtgatgccttt 920  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || || || || || || | |||||||    
T  921 cggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgttttcatagatggtattttg 1020  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1021 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattatctaagtgtgaat 1120  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||||    
T  1121 tctggttgaaagaggtgagttttcttggacatgttatttctg 1162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 41026 - 40588
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  41026 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaagaactgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 40927  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  40926 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgccttt 40827  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  | || || || || |||||     
T  40826 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtttttttcattgatgacatttta 40727  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40726 atttactccaagaccgaggaagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaat 40627  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 466  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| |||||||||    
T  40626 tctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttattt 40588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 74746 - 74308
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  74746 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaagaactgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 74647  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  74646 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgccttt 74547  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  | || || || || |||||     
T  74546 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtttttttcattgatgacatttta 74447  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  74446 atttactccaagaccgaggaagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaat 74347  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 466  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| |||||||||    
T  74346 tctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttattt 74308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 56128 - 55708
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || | ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  56128 aagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttaacaagattgatttgagatcgggttatcaccaga 56029  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  56028 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcccctgg 55929  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  55928 agtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcattttttgatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgaggaa 55829  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  55828 gaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagtt 55729  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||  ||||||||||||    
T  55728 ttcttggacatgttatttctg 55708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Original strand, 8738 - 9159
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  8738 cagttgaacaatttgactattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgctgaggtgtttagtaagattgatt 8837  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |  || || |  ||||||||    || || || ||  ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  8838 tgagatcaggatatcatcagataagggtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 8937  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||  || |||||| | || || ||| | | | ||||||| || ||  ||||||| || || |||||||||    
T  8938 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatgggatacatgaatagaatatttcatccttatctggatcgttttgtgatggtgttcatagatgatattttg 9037  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | || ||| || ||||||||||| |    
T  9038 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaactagttatgtgttaagttatctaagtgtgagt 9137  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  9138 tttggttgaaggaagtgagttt 9159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 6999 - 7440
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  6999 cagttaaacaaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 7098  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| | ||    
T  7099 tgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatggagatatgcagaagacaacttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgtcgtt 7198  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || || || ||||| || ||||||    
T  7199 cggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgaatctttcatgcatttttggatcgtttcatggttgtattcatcgatgacattttg 7298  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7299 gtttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaat 7398  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  7399 tctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttctg 7440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 8414 - 7973
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  8414 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 8315  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||| ||||| || ||||| ||    
T  8314 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggagattatgagtataaggtgatgccgtt 8215  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||||    
T  8214 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttg 8115  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8114 atttactccatgtctgaagaagaacatgctaagcatttgaagctagttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 8015  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  8014 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 7973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 24570 - 24440
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  24570 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaaggattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24471  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    | |||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  24470 taagatcaggatatcatcagattagagtgaa 24440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Original strand, 691 - 1126
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  691 cagttgaataaggtaacaataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgaacgtgttttcagcaagattgatt 790  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  791 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaggtgatgccgtt 890  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||    
T  891 cggtgttacaaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttg 990  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  991 atttactccaagtct---gaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 1087  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 466  Q
    |||||||||  ||||| || ||||| ||  |||||||||    
T  1088 tctggttgagagaagtgagctttcttggacatgttattt 1126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 50 - 469
Target Start/End: Original strand, 1 - 420
Alignment:
Q  50 agaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagat 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  1 agaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagat 100  T
Q  150 taaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||     
T  101 taaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgtgttatggacattatgagtataacgtgatgccgttcggtgttacaaatgcacctggt 200  T
Q  250 gtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaag 349  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || || || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  201 gtgttgatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgaggaag 300  T
Q  350 aacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  301 aacatgctgagcatttgaagactgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttt 400  T
Q  450 tctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  401 tcttggccatgttatttctg 420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Original strand, 18253 - 18691
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18253 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttctgaggattgatgatttgatggatcagttagtgagtgcaaaagttttcagcaagatagatt 18352  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  18353 tgagatcaggttatcactagattatagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatgatcactatgagtacaaagttatgccttt 18452  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||    
T  18453 cggtgttacgaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtggttgtttttatcgatgatattttg 18552  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18553 atttaccccaagtttgaagaagaacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgttaaaagagatgaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 18652  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 466  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||    
T  18653 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttattt 18691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22273 - 22002
Alignment:
Q  23 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 122  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||||    
T  22273 atcatcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgggtgaaaaagtttttagtaagat 22174  T
Q  123 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 222  Q
     || ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| ||||| || || || |||    
T  22173 cgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgagtacaaggtgatg 22074  T
Q  223 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 294  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  22073 cctttcggtgttactaacgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 22002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 39447 - 39307
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  39447 ttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttcatggaccagttggtgggtgcaaaagtttttagtaagatcgacttga 39348  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatg 171  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  39347 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatg 39307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 3974 - 3534
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  3974 agttgaacaaagtaacgataaaaaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagatagattt 3875  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3874 gagatcgggttatcaccatattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacactatgaatataaagtgatgcctttc 3775  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || || || || |||||||    
T  3774 ggtgttacaaatgcacctgctgtgtttatggagtacgtgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttga 3675  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3674 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatttgaagactgttttggaagtgttgaaagagaaaaagttttatgctaaattgtcaaagtgtgaatt 3575  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     |||||||| || || ||||||||  |  ||||||||||||    
T  3574 atggttgaaagaggtgagttttcttagacatgttatttctg 3534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 1294 - 1735
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  1294 cagttaaacaaggtgacaataaagaaaaggtatccacttccgaggattgatgattttatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagctt 1393  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  1394 tgagatcgggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggccattatgagtacaaagttatgccttt 1493  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| | || || || || || |||||||||    
T  1494 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggattggttcatggttgttttcattgatgatattttg 1593  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1594 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 1693  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |   ||||||||||||    
T  1694 tctggttgaaagaagtgagctttcttgtacatgttatttctg 1735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 24445 - 24885
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  24445 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgacttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 24544  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  24545 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 24644  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  24645 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggaacgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 24744  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  24745 atatactcgaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatgctaaattatcaaagtgtgaat 24844  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24845 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttct 24885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 150964 - 150522
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||   || || || ||||||||     
T  150964 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtatttagtaagattgac 150865  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  150864 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacactatgaatataaagtgatgcctt 150765  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   ||| | || |  ||||| || || |||||    
T  150764 tcggtgttactaatgcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcatggttgaatttattgatgacatttt 150665  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| || ||||| |||||||||    
T  150664 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgaa 150565  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  || ||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  150564 ttctggttaagtgaggtaagttttcttggccacattatttctg 150522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 181941 - 181897
Alignment:
Q  405 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  181941 tgctaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagttt 181897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 40 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 4296 - 3867
Alignment:
Q  40 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggt 139  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||   || || |||||||||||||| |||||  | |    
T  4296 gtaacgataaagaataggtatccgcttccaagaattgatgatttgatggatcattttgtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatttaagatcgggtt 4197  T
Q  140 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||    
T  4196 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatagacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaa 4097  T
Q  240 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 339  Q
    | | || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4096 tacgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaag 3997  T
Q  340 actgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 439  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3996 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtattgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaag 3897  T
Q  440 aagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    | || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  3896 aggtgagttttcttggcaatgttatttctg 3867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Original strand, 40244 - 40672
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  | || || |||||||||    
T  40244 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatatttagtaagattgat 40343  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  40344 ttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 40443  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  40444 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 40543  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  40544 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 40643  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  40644 ttctggttaaatgaagtaagttttctggg 40672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 269
Target Start/End: Original strand, 45342 - 45580
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  45342 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgacttga 45441  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    | ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||    
T  45442 ggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattaagaataaaaggtgatgcctttcgg 45541  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 269  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45542 tgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaa 45580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 45645 - 45752
Alignment:
Q  361 catctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatg 460  Q
    |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||| |      
T  45645 catctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaagaagttgtatgctaa-ttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccaca 45743  T
Q  461 ttatttctg 469  Q
    |||||||||    
T  45744 ttatttctg 45752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 93 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 31274 - 30898
Alignment:
Q  93 gttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacg 192  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31274 gttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatctgagatcgagttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacg 31175  T
Q  193 cgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttgg 292  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31174 cggtatggccactatgaatataaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctagagtatttatggagtgcatgaatcgcatctttcatgcatttttgg 31075  T
Q  293 atcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaaga 392  Q
    |||||||| | || || ||||| || ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  31074 atcggttcatggttgtttttattgatgatattttgatttactccaagtcttaataagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaaga 30975  T
Q  393 gaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  30974 gaagaagctttatgttaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 30898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 51183 - 50763
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    || || || || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  51183 aagaataggtatccactttcgagaattgaagatttaatggatcagttagtgggtgctcttgtatttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 51084  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| |||||| || || || || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  51083 ttaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 50984  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||||||||||||| | || || ||||| | | |||||   ||  | || |||||||| || || || || ||||| || | |||||| |||    
T  50983 tgtgtttatggagtatatgaatagaatttttcatgcctatctggataaatttttggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctatgactgaagaa 50884  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  50883 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagataagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattcttgttaagtgaagtaagtt 50784  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| || |||||||||    
T  50783 ttcttggccatattatttctg 50763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 80 - 425
Target Start/End: Original strand, 28446 - 28772
Alignment:
Q  80 atttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagac 179  Q
    |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28446 atttaatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 28545  T
Q  180 agctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28546 agctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgc-------------------acctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttc 28626  T
Q  280 catgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgc 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28627 catgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgc 28726  T
Q  380 aagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28727 aagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtga 28772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 319 - 475
Target Start/End: Original strand, 28774 - 28930
Alignment:
Q  319 gatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtcta 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28774 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcta 28873  T
Q  419 agtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||| | || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  28874 agtgtaagttatggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 28930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 31 - 469
Target Start/End: Original strand, 14394 - 14832
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    ||||| || ||||| || |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  14394 ttgaataaagtaacgataaagaataaatatccacttccaagaattaatgattttatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagcaagattgatttga 14493  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  14494 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgg 14593  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  14594 tgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatagtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgata 14693  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14694 tactccaagattgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattct 14793  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     |||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  14794 agttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctg 14832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 142 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 4474 - 4141
Alignment:
Q  142 caccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatg 241  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4474 caccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatg 4375  T
Q  242 cacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagac 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || || || ||||| || |||||| ||||||||| |||||     
T  4374 cacttggagtgtttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatggctttgtggttgtttttattgatgatattctgatttacttcaagaa 4275  T
Q  342 tgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaa 441  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  4274 tgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagag 4175  T
Q  442 gtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| || |||||    
T  4174 gtaagttttcttggccatgttatttttggtgatg 4141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 13123 - 13564
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  || ||||    
T  13123 cagttgaacaaagtaacgataaagaataagtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagaagaatagatt 13222  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13223 tgagatcgggttatctccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacacggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 13322  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || |  || |||||||||    
T  13323 tggtgttacgaatgcacgtggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgatttaaaagatgatattttg 13422  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13423 atttactccaagtctgaagaagaacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 13522  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  13523 tctggttaaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 13564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 18042 - 17607
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| ||||    
T  18042 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaataattgatgacttgatggatcagttggtgggtg-acgtgttttcagcaagatagatt 17944  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  17943 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgccttt 17844  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |  || ||     ||    
T  17843 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcaatgatga-----tg 17749  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17748 atttacttcaatactgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaatctttatgctaaattatctaagtgtgaat 17649  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  17648 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctg 17607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 103618 - 103186
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  103618 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatg--------gatcaattagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgattt 103527  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  103526 gagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatggattttagaacgcgttatggacactatgagtataaagtgatgcctttc 103427  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    |||||  | ||||| || || |||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  103426 ggtgttgcaaatgcgccaggtgtgtttatggagtgcatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtagtattcatcgatgatattttga 103327  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  103326 tttactccaagtctgaggaagaacatgccgaacatttgaagactgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctttatgctaaattatcaaagtgtgaatt 103227  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  103226 ctgattgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctg 103186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 10653 - 11094
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  10653 cagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtattcagcaagattgatt 10752  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  10753 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 10852  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | || ||||| || || |||||||||    
T  10853 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttg 10952  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||     
T  10953 atatactctaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaac 11052  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11053 tctggttgaatgaagtaagttttcttggccatgttatttctg 11094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 24210 - 24651
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||| |    
T  24210 cagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgact 24309  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    ||||||   | |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||  ||| ||||||||    
T  24310 tgagattgggttatcactagattaaagtaaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttattgacactataaatattcagtgatgccttt 24409  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || || || ||  | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | | | ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  24410 cggtgttacaaacgcgccaagtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcgtatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgacattttg 24509  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || ||||| |||||||| ||||||| || || |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||  | |||||||| ||||| || |||||||    
T  24510 atatactctaagactgaagaagaacttgttgcgcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaaatgtgaat 24609  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  24610 tctggttgaatgaggtgagttttctaggccatgttatttctg 24651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 141 - 469
Target Start/End: Original strand, 16958 - 17286
Alignment:
Q  141 tcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaat 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||  ||| |||||||||||||| || |||    
T  16958 tcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaat 17057  T
Q  241 gcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaaga 340  Q
    || || || ||||||||||||||  ||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||    
T  17058 gcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaaga 17157  T
Q  341 ctgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagga 440  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  17158 ctgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatga 17257  T
Q  441 agtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17258 agtaagttttcttggccatgttatttctg 17286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 40 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 832 - 405
Alignment:
Q  40 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggt 139  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||||| |||||||||||  | |    
T  832 gtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgataacttgatggatcagttagtgagtgcacgtgttttccgcaagatagatttgagatcgggtt 733  T
Q  140 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||  ||||| || ||||| ||||| || ||||||||| || | || ||    
T  732 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatgtccagaagacagcttttagaatgcagtatggacattatgagtataaggtaatgcctttcagttttactaa 633  T
Q  240 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 339  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | ||||||||||||||||| |||    
T  632 tgcacctggagtatttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtagttgtttttatttatgatattttgatttactctaag 533  T
Q  340 actgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 439  Q
     |||| |||||||||  ||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |    
T  532 tctgaagaagaacat-atgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaagttatctaactgtgaattttggttgaaag 434  T
Q  440 aagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  433 aggtaagttttcttggccatgttatttct 405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 28 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 495412 - 494978
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   || || ||||| ||| |||    
T  495412 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggttcacgtgtgtttagcaatatttatt 495313  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  495312 tgagatctggttatcacctgattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 495213  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||    
T  495212 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttattgagtacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatattttg 495113  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |    
T  495112 atatactcgaagtctgaagaagaacatgctgagtatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtctgagt 495013  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgtt 462  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  495012 tctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgtt 494978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Original strand, 453146 - 453566
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||| ||  | || || ||||    
T  453146 aagaataggtatccacttccgaggatcgatgatttaatggatcagttagtgggtgctagtgtattcagcaaaattgatttgaggtcgggttaccatcaga 453245  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |  || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  453246 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 453345  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||| |||||||| || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || |||||||| |  |||||||| |||    
T  453346 tgtgtttatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttatttgaagactgaagaa 453445  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| || |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||  | ||||  || ||||| || ||||| |||||||| |  |||||||| |    
T  453446 gagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagagaagaagttgtatgtcaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagat 453545  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| |  |||||||||    
T  453546 ttcttggccacattatttctg 453566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Original strand, 515264 - 515692
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||||||     
T  515264 tcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccgcttcctagaattgatgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgac 515363  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || || || ||||| |||||||    
T  515364 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgattacaaagtgatgcctt 515463  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || |||||||| || ||||| ||    
T  515464 tcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtcgttgtgtttattgatgatatctt 515563  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  515564 aatttattccaagaatgaagaggaacacgcagagcatctgagaattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 515663  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  515664 ttctggttaagtgaagtgagttttctggg 515692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 139 - 443
Target Start/End: Original strand, 6354 - 6658
Alignment:
Q  139 tatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgacca 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |    
T  6354 tatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttttgcctttcggtgttacga 6453  T
Q  239 atgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaa 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6454 atgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcgtttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttgatttactccaa 6553  T
Q  339 gactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaag 438  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  6554 gtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttgaaa 6653  T
Q  439 gaagt 443  Q
    |||||    
T  6654 gaagt 6658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 299
Target Start/End: Original strand, 29828 - 30098
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29828 agttgaacaaagttagtatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgcacaagttttcagcaagattgattt 29927  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29928 gagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagacatgtagaagacagctttcaaaacccgatatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 30027  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtt 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ggtgttaccaatgcacctggagtaattatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtt 30098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 49 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 14841 - 14423
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   || || ||||| ||  ||||||||||| | ||||||| ||    
T  14841 aagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtacacgtgtgtttagcaacatcaatttgagatcaggttatcacccga 14742  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||||    
T  14741 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgacttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgatgttacaaaggcacctgg 14642  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | || |||    
T  14641 tgtgtttatggaatacatgaatcgaatttttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcgaagtccgaagaa 14542  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||    
T  14541 gagcatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatattctaaattgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggttagtt 14442  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  14441 ttcttggccatgttatttc 14423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 17270 - 16830
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || || || |||||| |||    
T  17270 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaagattaatt 17171  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||  ||| || |||||    
T  17170 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacattatgaatattcagtgat-ccttt 17072  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  17071 cggtgttaccaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttg 16972  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||| |||    
T  16971 atatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatgccaaattgtcaaagtgtcaat 16872  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||||| || || ||| || | ||| ||||||||||||    
T  16871 tctgattgaaagaggtgagtgtttttggcaatgttatttctg 16830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 469
Target Start/End: Original strand, 111775 - 111841
Alignment:
Q  403 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| || |||||||||    
T  111775 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggccatattatttctg 111841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Original strand, 15135 - 15574
Alignment:
Q  30 gttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttg 129  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |||||||||| ||||    
T  15135 gttgaagaaagtaacaataaagaataggtatacacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgctttg 15234  T
Q  130 agatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcg 229  Q
    |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| | || |||||||||||||| || |||||||    
T  15235 agatcgggttatcatcggattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacttgttatagacattatgaatataaagtgattcctttcg 15334  T
Q  230 gtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgat 329  Q
    |||| || ||||| || ||  | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  15335 gtgttacaaatgcgccaggtatctttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtgattgtgttcatcgacgatattttgat 15434  T
Q  330 ttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattc 429  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15435 atactccaagactgaagaagaacaagctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctaaaagagaaaaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattc 15534  T
Q  430 tggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    | |||||| || || |||||||| ||| |||| |||||||    
T  15535 tagttgaaagaggtgagttttcttggccatgtaatttctg 15574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6264 - 5825
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||   || || ||||||||||||||    
T  6264 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgttggatcagttagtgagtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 6165  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||    
T  6164 gagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttc 6065  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  6064 ggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttga 5965  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    | ||||| ||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||  |||||| ||||    
T  5964 tatactcgaagtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaactgttaaagtgtaaatt 5865  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  5864 ctggttgaaagaggtaagttttcttggccacgttatttct 5825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13394 - 12955
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||   || || ||||||||||||||    
T  13394 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgttggatcagttagtgagtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 13295  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||    
T  13294 gagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttc 13195  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  13194 ggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttga 13095  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    | ||||| ||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||  |||||| ||||    
T  13094 tatactcgaagtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaactgttaaagtgtaaatt 12995  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  12994 ctggttgaaagaggtaagttttcttggccacgttatttct 12955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 183 - 475
Target Start/End: Original strand, 407 - 699
Alignment:
Q  183 tttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccat 282  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  407 tttcagaacacggtatggtcactattaatataaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatcttccat 506  T
Q  283 gcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaag 382  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  507 gcatttttggatcggttcttagttgtgttcatcgatgataatttgattgactccaagactaaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtcctgcaag 606  T
Q  383 tgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  607 tgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgagttctggctgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 5504 - 5065
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||    
T  5504 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttcctataattgatgatttgttggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 5405  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    |||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  |||||||||  ||| |||||||||    
T  5404 gagattgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgttatgggctttatgaatattcagtgatgcctttc 5305  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| | ||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||    
T  5304 ggtgttacgaatgcgccaggtgtgttcat-gagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgctttgtggttgtgttcattgacgatattttga 5206  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||  | ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  5205 tatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgcaaagttgtcaaagtgtgagtt 5106  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  5105 ctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttctg 5065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 11486 - 11172
Alignment:
Q  57 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtg 156  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| | || || | |||||| |||    
T  11486 gtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatctgattaaggtg 11387  T
Q  157 aaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgttta 256  Q
    || ||| | |||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  11386 aaggattaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttca 11287  T
Q  257 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgc 356  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| | |||||||   || || || |||||||| || |||||| | ||||| || |||||||| || || |||||    
T  11286 tggagtatatgaaccgaattttccatgcttctttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagactgaagaggagcatgc 11187  T
Q  357 tgagcatctgaagat 371  Q
     || |||||||||||    
T  11186 agaacatctgaagat 11172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2993 - 2623
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| ||||    
T  2993 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccatgaattgatgacttgatggatcagttagtggatgcacgtgttttcatcaagatagatt 2894  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  2893 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatccagaagacaccttttagaacgcgatatggacactatgaataaaaagtgatgccgtt 2794  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    | |||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || || ||||| || |||||||||    
T  2793 cagtgttacaaatgcacctcgagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttgaatcatttcgtggttgtttttattgatgatattttg 2694  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaa 398  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||  || ||||||||    
T  2693 atttactgcaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttaaaggagaagaa 2623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 469
Target Start/End: Original strand, 217335 - 217773
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||||||||||||||    
T  217335 ttgaacaaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttttgcaagattgatttga 217434  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  217435 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacgtcctttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgg 217534  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||  || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| | || || |||||||||||     
T  217535 tgttacaaatgccccaggtgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcgttttttgatcgtttcgtggttgtgatcattgatgatattttgata 217634  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    ||||| |||   || |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  217635 tactcgaagttcgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgttaaattgtcaaagtgtgagttct 217734  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     |||||| || || |||||||| ||| | ||||||||||    
T  217735 agttgaatgaggtgagttttcttggccacgttatttctg 217773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Original strand, 15906 - 16128
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  15906 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 16005  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagt-gaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  16006 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcattatgaatataaggttatgcgtt 16105  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctgga 249  Q
    | ||||| |||||||||||||||    
T  16106 ttggtgttaccaatgcacctgga 16128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 15890 - 16330
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  15890 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcacatgtgttcagcaagattgatt 15989  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| ||||  |||||||| || ||||| |||  ||| ||||||||    
T  15990 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaggatatgcagaagatggcttttagaaaacgttatggacattatgagtattcagtgatgccttt 16089  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     ||||| || || || || || ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| | | | ||||| ||||| ||  | || ||||| |||||||||    
T  16090 gggtgttacaaacgcgccaggtgtgtttatgtagtacatgaatcgcatttttcatgcgtatctagatcgtttcgtggttatattcatcgatgatattttg 16189  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || ||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||  || ||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  16190 atatactctaagactgaagaggaatatgctgagcatttgaagatt-ttttgcaagtgttcaaggagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaat 16288  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| || ||||||||||| | |  |||||||||||    
T  16289 tctggttgaatgaggtaagttttcttgaccgtgttatttctg 16330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 218 - 1
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  218 ttgaacaatgtgactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtttgtgggtgcacgcgttttcagcaagattgatttga 119  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  118 gatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagatttcagaacacggtatggtcactatgtatataaagttatgccttttgg 19  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  18 tgttaccaatgcacctgg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 452
Target Start/End: Original strand, 5262 - 5686
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    || |||||||||||||||    
T  5262 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgctcgtgtattcagcaagattgat 5361  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  5362 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcactatgaatataaggtgatgcatt 5461  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || |||||  || | |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || ||    
T  5462 tcggtgttactaatgcgact-gcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 5560  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  5561 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgag 5660  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  5661 ttctggttaagtgaagtaagttttct 5686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 452
Target Start/End: Original strand, 9693 - 10117
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    || |||||||||||||||    
T  9693 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgctcgtgtattcagcaagattgat 9792  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  9793 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcactatgaatataaggtgatgcatt 9892  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || |||||  || | |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || ||    
T  9893 tcggtgttactaatgcgact-gcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 9991  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  9992 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgag 10091  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  10092 ttctggttaagtgaagtaagttttct 10117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 469
Target Start/End: Original strand, 5804 - 6242
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||   || || ||||||||||| ||||    
T  5804 ttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgacttgatggaccagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgacttga 5903  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 230  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||| || || ||||||   || |||||||||||    
T  5904 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaggacgacaatatgcaaaagacggcttttagaacacgacatggacattaggaatattcggtgatgcctttcgg 6003  T
Q  231 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 330  Q
    ||| || || || || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  6004 tgttacaaacgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtattttccatgcatatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgata 6103  T
Q  331 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 430  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6104 tactctaaggctgaagaagaacatgctgagcaattgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattct 6203  T
Q  431 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||| || || | |||||| ||  ||||||||||||    
T  6204 ggttgaatgaggtcatttttcttggtcatgttatttctg 6242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 469
Target Start/End: Original strand, 8958 - 9387
Alignment:
Q  40 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggt 139  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||  | |    
T  8958 gtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagcaagattgatttgagatcgggtt 9057  T
Q  140 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 239  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||| || ||    
T  9058 atcaccagattaaggtgaaagacggggatatggagaagacggcttttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaa 9157  T
Q  240 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 339  Q
    ||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  9158 tgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgtttcgtggttgtgttcatggatgatattttgatatactctaag 9257  T
Q  340 actgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 439  Q
     |||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||  | ||||| ||  |||| |||||||||||||||||| | |    
T  9258 tctgaagaagaacatgttgagcatttgaggattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagctgtcaaagtgtgaattctggttggatg 9357  T
Q  440 aagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    | || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  9358 aggtgagttttcttggccatgttatttctg 9387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1414 - 1324
Alignment:
Q  40 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||    
T  1414 gtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagcaagattgatttga 1324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6718 - 6628
Alignment:
Q  40 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||    
T  6718 gtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagcaagattgatttga 6628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 74 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10514 - 10284
Alignment:
Q  74 ttgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgca 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10514 ttgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatgtgttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgca 10415  T
Q  174 gaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgc 273  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10414 gaagacagcttttagaacgcgggatggtcattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgc 10315  T
Q  274 atcttccatgcatttttggatcggttcgtag 304  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10314 atctttcaagcatttttggatcggttcgtag 10284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 469
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1898
Alignment:
Q  67 ccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaag 166  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||| ||| | || || ||||| || ||||| ||| | |    
T  1496 ccgaggattgatgacttgatggatcagctagtgggtgcgagggttttcagtaagattgacttgaggtcaggctaccatcagatcaaggtgaaggataagg 1595  T
Q  167 atatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 266  Q
    ||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || ||| |||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  1596 atatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgtctttcgttgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatat 1695  T
Q  267 gaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctg 366  Q
    |||  | || || ||||| |   |||||   || || ||  | || || || || ||| ||||| | || | ||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  1696 gaacagaatttttcatgcctacctggataaatttgtggttctattcattgatgacattctgattaattcaaggacagaagaagagcatgcagaacatctg 1795  T
Q  367 aagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 466  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |  ||||||    
T  1796 aagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattattt 1895  T
Q  467 ctg 469  Q
    |||    
T  1896 ctg 1898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24609 - 24167
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||     
T  24609 tcagttaaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaagggtgttcagtaagattgac 24510  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  24509 ttgaggtcaagttaccaccagattaaggtgaaggatgacgatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 24410  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || |||||| |    
T  24409 tcggtgttactaatgcgcctggggtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttctctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 24310  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  24309 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 24210  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  |||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  24209 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 24167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 452
Target Start/End: Original strand, 44350 - 44753
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    || ||||| || ||||||||||| ||  | || || ||||    
T  44350 aagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcgggttaccatcaga 44449  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| ||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  44450 ttaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 44549  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||||||||||||    || |||||||||| | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| || |||||| | |||    
T  44550 tgtgtttatggagtatatgaaaaaaattttccatgcatatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactaaagaa 44649  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||| |  | |||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||  | ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  44650 gagcatacaaaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaataagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagtt 44749  T
Q  449 ttct 452  Q
    ||||    
T  44750 ttct 44753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 275 - 1
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||| |||    
T  275 tcagttgaaaaaagtaactataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatccgttagtgggtgcgcgtgttttcaacaagatagat 176  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||     
T  175 ttgagatcgggttatcactagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcggtatggacattatgagtataaagttttgcctc 76  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcg 301  Q
    || |||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  75 tcagtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 11223 - 10781
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||| |||||||||     
T  11223 tcagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcaacaagattgac 11124  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || |||||||||||||||||  ||||||||||||| || || || |  || || || || || |||||||||||||| |||||||    
T  11123 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaagaaaaagatatgcagaaaacggcctttaagacacgatacgggcattatgaatataaagtgatgcctt 11024  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | ||||||||  || ||||| |||||||| || || || ||    
T  11023 tcggtgttaccaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcaatttgtagttgtgtttattgatgacatctt 10924  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||| | |||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||||||    
T  10923 gatttattctaagactgaagaagagcatacagagcatttaaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaa 10824  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  |||||||||||||| ||| || | |||||||    
T  10823 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccatatcatttctg 10781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 201379 - 201821
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||    
T  201379 tcagttgaataaagtgacgataaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtacacgagtgtttagcaagattgat 201478  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || || ||||||  ||| |||||||    
T  201479 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctt 201578  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||  | || || |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | |||||||||||| || || |||||||| || ||||||||    
T  201579 tcggtgttactaacacgccgggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgatatttt 201678  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||| ||| || ||||| || ||||| |||| ||| || ||||||    
T  201679 gatatactctaagactgaagaagaacatgcagaacatttgaaggttgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagctgtatgccaaatggtccaaatgtgaa 201778  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||||||| |||||| ||| || |||||||||    
T  201779 ttctggttaagtgaagtaaattttcttggccatattatttctg 201821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 325069 - 324657
Alignment:
Q  57 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtg 156  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||| | || || |||||||| |||    
T  325069 gtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcgaaggtttttagtaagattgacttaaggtcaggttaccatcagattaaggtg 324970  T
Q  157 aaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgttta 256  Q
    || |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  324969 aaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttca 324870  T
Q  257 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgc 356  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| | | |||||   ||||| || || ||||| || || ||| |||| || || | |||||| ||||| ||||     
T  324869 tggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacattctgatctattcaaggactgaagaagagcatgt 324770  T
Q  357 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggc 456  Q
     || |||||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||  | |||||||| | ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||    
T  324769 agaacatctgaagattgtattgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagtcgtcgaagtgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggc 324670  T
Q  457 gatgttatttctg 469  Q
     |  |||||||||    
T  324669 cacattatttctg 324657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 267 - 475
Target Start/End: Original strand, 7844 - 8052
Alignment:
Q  267 gaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctg 366  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7844 gaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttgtcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctg 7943  T
Q  367 aagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 466  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||    
T  7944 aagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttgcccatgttattt 8043  T
Q  467 ctgatgatg 475  Q
    ||| |||||    
T  8044 ctggtgatg 8052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 9969 - 10410
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  9969 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagcaagattgac 10068  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    || || || ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||  | || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  10069 ttaaggtc-aggtaccatcagattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttgggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 10167  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   | |||   ||||| || |||||||| || || || ||    
T  10168 tcggtgttactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctagataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 10267  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||  || ||||| ||||||||     
T  10268 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgtcaagttgtcaaagtgtgag 10367  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  |||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  10368 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctg 10410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 268 - 469
Target Start/End: Original strand, 44795 - 44996
Alignment:
Q  268 aatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44795 aatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgaattaatcgaagatattttgatatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctga 44894  T
Q  368 agattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 467  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  44895 agattgtcttgcaaatgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgacttctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 44994  T
Q  468 tg 469  Q
    ||    
T  44995 tg 44996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 182
Target Start/End: Original strand, 4822 - 4955
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||| | | | || || | ||    
T  4822 aagaatagatatccacttctgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaatttatttgaggttaggttaccatctga 4921  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagc 182  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4922 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaaaacagc 4955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 434
Target Start/End: Original strand, 8888 - 9126
Alignment:
Q  196 tatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 295  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||    || |||||||| | | |||||     
T  8888 tatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtacatgaacttaattttccatgcttatctggata 8987  T
Q  296 ggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaa 395  Q
      || || || |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| ||    
T  8988 aatttgtggtcgtgtttattgatgatatctttatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaa 9087  T
Q  396 gaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtt 434  Q
    |||  | ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  9088 gaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggtt 9126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 251015 - 250587
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  251015 tcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcaattggtgggtgcaaaggtgttcagcaagattgac 250916  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  250915 ttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 250816  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || |||||||| || || || ||    
T  250815 tcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgacatctt 250716  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| ||||| || |||||     
T  250715 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcgaaatgtgag 250616  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  250615 ttctggttaagtgaagtgagttttctggg 250587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 2892 - 3271
Alignment:
Q  55 aggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaag 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | || || |||||||| |    
T  2892 aggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaagg 2991  T
Q  155 tgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtt 254  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  2992 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 3091  T
Q  255 tatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacat 354  Q
     |||||||||||||| || || |||||||| | | |||||   ||||| || |||||||| || || ||  | ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  3092 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcctaatttattcaaagactgaagaagagcat 3191  T
Q  355 gctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtt 434  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  3192 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 69765 - 69323
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| || || |||||     
T  69765 tcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccaattggtaggtgcaaaagtttttagtaaaattgac 69666  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  69665 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 69566  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  69565 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatatttt 69466  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||| || |   |||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||    
T  69465 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacgcttgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 69367  T
Q  426 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     |||| ||| |  ||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  69366 gttcttgttaagtgaagtgagttttctaggccacgttatttctg 69323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 29016 - 28594
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    || |||| ||| |||||||    
T  29016 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtattcaacaaaattgatt 28917  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  28916 tgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgccttt 28817  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   || || || |||||||| || || || |||    
T  28816 cggtgttactaatgcgcctggtgtgcttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttg 28717  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||  | | ||| || ||||| || ||||| |    
T  28716 atttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagatcgtcttgaaagtgttgaaagaaaagaagttgtctgcgaagttgtcaaaatgtgagt 28617  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagtttt 450  Q
    |||||||  | ||||||||||||    
T  28616 tctggttagatgaagtaagtttt 28594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 422
Target Start/End: Original strand, 50113 - 50486
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | || || || |    
T  50113 aagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaa 50212  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||  | || ||    
T  50213 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccgg 50312  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||   ||||| || || || || || |||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  50313 tgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaa 50412  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 422  Q
    || ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||    
T  50413 gagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtg 50486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 422
Target Start/End: Original strand, 59147 - 59520
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | || || || |    
T  59147 aagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaa 59246  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||  | || ||    
T  59247 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccgg 59346  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||   ||||| || || || || || |||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  59347 tgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaa 59446  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 422  Q
    || ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||    
T  59447 gagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtg 59520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 422
Target Start/End: Original strand, 65535 - 65908
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | || || || |    
T  65535 aagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaa 65634  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||  | || ||    
T  65635 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccgg 65734  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||   ||||| || || || || || |||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  65735 tgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaa 65834  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 422  Q
    || ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||    
T  65835 gagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtg 65908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 238 - 469
Target Start/End: Original strand, 38070 - 38301
Alignment:
Q  238 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactcca 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||| ||    
T  38070 aatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactaca 38169  T
Q  338 agactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 437  Q
    || |||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38170 agtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 38269  T
Q  438 ggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  38270 agaagtgagctttcttggacatgttatttctg 38301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 93
Target Start/End: Original strand, 41417 - 41482
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 93  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41417 cagttgaacaaggtgaccataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 41482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 452
Target Start/End: Original strand, 2183 - 2608
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||| ||| ||||||    
T  2183 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcttgtgtattcaacaaaattgat 2282  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  2283 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctt 2382  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||||||   || || || |||||||| || |||||| |    
T  2383 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 2482  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||  | ||||| || |||||||| ||||||    
T  2483 aatttattctaagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattttgttgcaagtgtttaaagaaaggaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgaa 2582  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  2583 ttctggttaagtgaagtaagttttct 2608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 196
Target Start/End: Original strand, 8657 - 8822
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  8657 ttgaagaaggtaactatcaagaataggaatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttga 8756  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgtt 196  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8757 ggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacatctttcagaacgcgtt 8822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 251
Target Start/End: Original strand, 10914 - 10975
Alignment:
Q  190 acgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagt 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10914 acgcgttatggtcactatgagtataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagt 10975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 452
Target Start/End: Original strand, 29196 - 29621
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||| ||| ||||||    
T  29196 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcttgtgtattcaacaaaattgat 29295  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  29296 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctt 29395  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||||||   || || || |||||||| || |||||| |    
T  29396 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 29495  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||  | ||||| || |||||||| ||||||    
T  29496 aatttattctaagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattttgttgcaagtgtttaaagaaaggaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgaa 29595  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  29596 ttctggttaagtgaagtaagttttct 29621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 19725 - 19305
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||    || |||||||||||||||||||| ||| | || || ||||    
T  19725 aagaataggtatccacttccgaggattgatgatctaatggatcaattagtgggtgctcgtgtgttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcaga 19626  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  19625 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 19526  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||||||||| ||    || |||||||| | | | |||   || || ||  ||||||| || || || || ||||| || ||||| || ||     
T  19525 tgtgtttatggagtatataaacaaaattttccatgcttatctagataaatttgtggttatgtttattgatgacatcttaatttattctaagaccgaagag 19426  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  19425 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagataagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 19326  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| |  |||||||||    
T  19325 ttcttggccacattatttctg 19305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 2264 - 1822
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   || || || || ||||||    
T  2264 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgat 2165  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2164 ttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctt 2065  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||  || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||    | || || |||||||| || || || ||    
T  2064 tcggtgctactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaaattgtggttgtgtttattgatgacatctt 1965  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  | ||||| || ||||| || ||||||    
T  1964 aatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaataagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaa 1865  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    || ||||| |  |||||||||||||| | | || |||||||||    
T  1864 ttttggttaagtgaagtaagttttcttgaccatattatttctg 1822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 5143 - 4702
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   || || || || ||||| |    
T  5143 cagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgact 5044  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| || || ||  | ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  5043 tgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggtcacgttatggttactatgaatataaggtgatgccttt 4944  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   |||||||| |||||||| || || ||| ||    
T  4943 cggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtagttgtgtttattgatgacattctg 4844  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||  | |||||||| ||||| || ||||| |    
T  4843 atttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaattgtgagt 4744  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||| |  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  4743 tctggttaagtgaagtcagttttcttggccacattatttctg 4702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 452
Target Start/End: Original strand, 42019 - 42443
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||   || |||   |||||||| |    
T  42019 cagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttctgaggatcgacgatttgatggatcagttagtgggtgcatttgtgttctttaagattgact 42118  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| || || || || | ||| |  || || ||||||   || ||||||||    
T  42119 taagatcaggctatcaccagatcaaagtgaaagatggggatattcagaagacggcctttaggacacattacgaacattacgaatattcggtgatgccttt 42218  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || || || |  |||||||||||||| ||||||||||  || || ||||| | ||||||||| || ||  | |||||||| || |||||| ||    
T  42219 cggtgttactaacgcgcaaggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttggatcgatttgtttttgtgtttatagatgatattctg 42318  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||   |||| |||||||||  ||| ||||||||  | ||||| |  || || ||||| ||||    
T  42319 atatactccaagaccgaggaggaacatgccgagcatttgagatttgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccagtttatcgaagtgcgaat 42418  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||    
T  42419 tctggttgaacgaagtgagttttct 42443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 4552 - 4142
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||   || || || || ||||||||||| ||  | || || ||||    
T  4552 aagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagtttgtgggtgcacctgtgtttagtaaaattgatttgaggtccggttaccatcaga 4453  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaat---ataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacc 245  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||||   |||| || |||||||||||||| || ||||| ||    
T  4452 ttaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcc 4353  T
Q  246 tggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgag 345  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| ||  | || |||||||| |  ||||||||     
T  4352 tggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttgatttattataagactgaa 4253  T
Q  346 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaa 445  Q
    ||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  |||||||    
T  4252 gaagagcatgcataacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaa 4153  T
Q  446 gttttctgggc 456  Q
    |||||||||||    
T  4152 gttttctgggc 4142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 25508 - 25066
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||     
T  25508 tcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgagatttgatgacttgatggaccagttggtgggtgcaaaagtttttagtaaaattgac 25409  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |  |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  25408 ttgaggtctggttaccatcaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 25309  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  25308 tcggtgttattaacgcgcctggcgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctggataaattcgtggtggtatttatagatgatatttt 25209  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||    
T  25208 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagagcacttgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtggga 25110  T
Q  426 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     |||||||| |  ||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  25109 gttctggttaactgaagtgagttttctaggccacgttatttctg 25066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 49477 - 49074
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  49477 aagattaggtatccacttctgaggatcgatggtttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtattcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 49378  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  49377 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctgg 49278  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||||||||||||    || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || |||||||| || |||||||| |||    
T  49277 tgtgtttatggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaa 49178  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |   |||||||||    
T  49177 gagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtcaagtaagtt 49078  T
Q  449 ttct 452  Q
    ||||    
T  49077 ttct 49074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 455
Target Start/End: Original strand, 31252 - 31658
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  | || || ||||    
T  31252 aagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttgaggtctggttaccatcaga 31351  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || || ||||| ||  | ||||||||| |||| || ||||| |||||    
T  31352 taaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggagacgatatggacattacgaatacaagttgatgcctttcagtgttactaatgcgcctgg 31451  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||| |   || || ||||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||| ||     
T  31452 ggtatttatggaatatatgaaccgaattttccatgcttttctggttaaatttgtggtggtgtttattgatgatattctgatttattctaagactgaagag 31551  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||| |||||  | ||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||||    
T  31552 gagcatgcagagcatctgaagattatattgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagctgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagtt 31651  T
Q  449 ttctggg 455  Q
    |||||||    
T  31652 ttctggg 31658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 319 - 475
Target Start/End: Original strand, 3556 - 3712
Alignment:
Q  319 gatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtcta 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3556 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattatcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcta 3655  T
Q  419 agtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  3656 agtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 3712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Original strand, 49808 - 50228
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    || ||| |||||||||||||||| ||| | || ||  |||    
T  49808 aagaacaggtatctactttcgagaattgacgatttcatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttctgcaagattgatttgaggtcaggttaccattaga 49907  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  49908 ttaaggtgaatgatgaggatatgcagaatacgccctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcgatgttactaatgcgcctgg 50007  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||    
T  50008 tgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaa 50107  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  50108 gagcatgcagagcatctgaagattgtgtttcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattcttgttaagtgaagtaagtt 50207  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| || |||||||||    
T  50208 ttcttggccatattatttctg 50228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 766 - 1207
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  766 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgc-aaaggtttcagcaagattgac 864  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  865 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctt 964  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   ||||| || | |||||| || || || ||    
T  965 tcggtgttactaatgcgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgagtttattgatgacatctt 1064  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||  | ||||| || ||||| |||||||||    
T  1065 gatttattctaagaatgaagaagagaatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattaaaggagaagaagttgtatgccaagttgtcgaagtgtgaa 1164  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    || ||||| |  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  1165 ttttggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 1207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 13247 - 13689
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||||||||    || || ||||||||||||    
T  13247 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgataacttcatggatcatttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattgat 13346  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  13347 ttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctt 13446  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | | |||||   || || || |||||||| || || || ||    
T  13447 tcggtcttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 13546  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||     
T  13547 gatttattcgaagacagaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgcaaaattgtcaaaatgtgag 13646  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  |||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  13647 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 13689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 21426 - 21868
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||||||||    || || ||||||||||||    
T  21426 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgataacttcatggatcatttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattgat 21525  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  21526 ttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctt 21625  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | | |||||   || || || |||||||| || || || ||    
T  21626 tcggtcttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 21725  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  21726 gatttattcgaagacagaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgag 21825  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  |||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  21826 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 21868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16485 - 16068
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    || || || || ||| ||||||| ||| | || || ||||    
T  16485 aagaacaggtatccagttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcttgtgtgtttagtaaaatttatttgaggtcaggttaccatcaga 16386  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16385 ttaaggtgaaggatgaggatttgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 16286  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| || | |||||| |||    
T  16285 tgtgtttatggagtatatgaacggaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctacgactgaagaa 16186  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||   | ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  16185 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagtt 16086  T
Q  449 ttctgggcgatgttattt 466  Q
    |||| ||| || ||||||    
T  16085 ttcttggccatattattt 16068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 449
Target Start/End: Original strand, 7768 - 8194
Alignment:
Q  23 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 122  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||  | || |||||| | || || || |||||    
T  7768 atcaacagttgaacaaggtgacgattaagaatcgatatccacttccacggattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagat 7867  T
Q  123 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 222  Q
    ||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||| || |   |||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || |||    
T  7868 tgatttgaggtcaggatatcatcagattagagtaaaggcgaaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatg 7967  T
Q  223 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgata 322  Q
    || || || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || ||  | ||||||||||| || ||||    
T  7968 ccatttggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttttggtggtgtttatagatgata 8067  T
Q  323 ttttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 422  Q
    ||||  | || || ||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | |||||| |||||||||||    
T  8068 ttttagtgtattcgaagtcggaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtg 8167  T
Q  423 tgaattctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||    
T  8168 tgtgttttggttgaaggaagtgagttt 8194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 22099 - 22538
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||    
T  22099 agttgaacaaagtgacaataaagaatagttatccacttccaagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 22198  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| || || ||  |||||  ||| |||||||||    
T  22199 gagatcgagctatcatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgcctttc 22298  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
     |||| || |||||||| || || |||| ||| || |||||| |||| |  ||||| | ||| |||||  | || || ||||| || || ||||||||||    
T  22299 -gtgttactaatgcaccgggtgtatttacggaatacatgaattgcatttctcatgcttatttagatcgcattgttgttgtgttcattgatgatattttga 22397  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    | ||||| ||| |||| |||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||| |   | ||||| || ||||| |||||||||||    
T  22398 tatactctaagtctgaagaagaacacgccaagcatttgaagattgttttgcaagtgctgcaagagaaaacgttatatgccaagttgtcaaagtgtgaatt 22497  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||| || || |||||| | ||| || |||||||||    
T  22498 ctggttgaatgaggtgagtttttttggccatattatttctg 22538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 383
Target Start/End: Original strand, 19545 - 19901
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19545 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 19644  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  19645 ttgaggtcgggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctt 19744  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    || |||| || |||||  |||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| |  ||||||   ||||| || |||||||| || || || ||    
T  19745 tcagtgttactaatgcgtctgacgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 19844  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 383  Q
    |||||| || |||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  19845 gatttattctaagaatgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagt 19901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 304 - 449
Target Start/End: Original strand, 26454 - 26599
Alignment:
Q  304 gtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaacttt 403  Q
    |||||||| || || ||||||||| | || || ||| |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | |    
T  26454 gtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgaacatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttat 26553  T
Q  404 atgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
     |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  26554 gtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttt 26599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 621 - 215
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || |||||  |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  621 tcagttgaacaaagttacaataaagaacgggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagcaagattgac 522  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| |||   || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||    
T  521 ttgaggtcagcttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaagaatacaaagtgatgcctt 422  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||| | | |||||   ||| | || || ||||| || || |||||    
T  421 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcatggttgtatttattgatgacatttt 322  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    || ||| |  | |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| || ||||| ||||||||     
T  321 ga-ttattttaggactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgat 223  T
Q  427 ttctggtt 434  Q
    ||||||||    
T  222 ttctggtt 215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 99473 - 99915
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  99473 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttagtaagattgaa 99572  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  99573 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 99672  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || ||| |    
T  99673 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattct 99772  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||| || || |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |    |||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  99773 gatctattctagaactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattctaaaagagaaaaagttatatgctaagttgtcgaagtgtgag 99872  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  99873 ttctggttaagtgaagtgagttttctgggccacattatttctg 99915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 310 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 1164 - 999
Alignment:
Q  310 tttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgcta 409  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1164 tttattgatgatattctgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaaactttatgcta 1065  T
Q  410 aattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgatgatg 475  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  1064 aactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 38043 - 37636
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  38043 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 37944  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  37943 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 37844  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
     |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   || || || |  ||||| || || ||| |    
T  37843 acggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgaatttattgatgacattct 37744  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||  |||| | |||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  37743 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattagaagtattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgag 37644  T
Q  427 ttctggtt 434  Q
    || |||||    
T  37643 ttttggtt 37636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 33730 - 33287
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaa-gaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattga 125  Q
    ||||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||   || || | |||||||||    
T  33730 tcagttgaacaaggttaccattaaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttaacaagattga 33631  T
Q  126 tttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcct 225  Q
     ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || || |||||||| || ||||||    
T  33630 cttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcct 33531  T
Q  226 ttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattt 325  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| | |||||||   ||||| || ||||| || || || || |    
T  33530 ttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatttggataaattcgtggttgtgttcattgatgacatct 33431  T
Q  326 tgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||  | ||||| || ||||  || |||||    
T  33430 tgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctaaagattgtattacaggtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgttaaaatgtga 33331  T
Q  426 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     |||| ||| |  |||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  33330 gttctagttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 33287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 269003 - 268561
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  269003 tcagttgaacaaagttacaataaagaataggtatccactcccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 268904  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || | |||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  268903 ttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatgtggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 268804  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  268803 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccagattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtgtttatagatgatatttt 268704  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    |||||| || || ||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||    
T  268703 gatttattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 268605  T
Q  426 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
     |||||||| |  ||||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  268604 gttctggttaagtgaagtgagtttcctaggccatgttatttctg 268561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 437
Target Start/End: Original strand, 84432 - 84840
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||    || ||||  || ||||| |    
T  84432 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatcgacttccgaggattaacgatttgatggat-agttagtgggtgcgcgtgtgttcaataaaattgact 84530  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | || || || ||||| || || || ||||||   || ||||||||    
T  84531 tgagatcgggctatcaccggatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattttgtgatgccttt 84630  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||| |   |||| |||||||| ||||||||||| || || ||| | | | | ||||| || || || |||||||| || |||||| ||    
T  84631 cggtgttactaatgcgctgagagtatttatggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattatg 84730  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || ||||| |||||  |||| || ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||  ||||||||||||  | ||||| || || || ||||| ||||    
T  84731 atatactctaagaccaaggaggagcatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcaaagtgcgaat 84830  T
Q  428 tctggttgaa 437  Q
    ||||||||||    
T  84831 tctggttgaa 84840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1364 - 950
Alignment:
Q  55 aggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaag 154  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||  |  |||||||||| ||||    
T  1364 aggtatccacttccgaggatcgacaatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagtaagattgatttaagatcgggccatcaccagatcaaag 1265  T
Q  155 tgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtt 254  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||  | || ||  |||||   || |||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  1264 tgaaagatgaggatattcataagacagcctttaggacacgttacagacattacaaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggagtgtt 1165  T
Q  255 tatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacat 354  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||| | |||||||| ||| || || |||||||| || |||||| |||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  1164 tatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcagtttgttgttgtgtttatagatgatattatgatatactctaagaccgaagaggaacat 1065  T
Q  355 gctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgg 454  Q
    || |||||| |||  ||||| ||||||||   ||| ||||||||  | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |    
T  1064 gcggagcatttgagaattgttttgcaagtactgaaggagaagaagttatatgccaaattatcgaagtgtgaattctggttgaacgaagtgacttttcttg 965  T
Q  455 gcgatgttatttctg 469  Q
    || || | |||||||    
T  964 gccatatcatttctg 950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 466
Target Start/End: Original strand, 5022 - 5439
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||  | ||||||||||| ||| | || || || |    
T  5022 aagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagacaaattgatttgaggtcaggttaccatcaaa 5121  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| |||||  | ||| |||||||||| || ||||| |||||    
T  5122 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataagatgatgtctttcggtgttactaatgcgcctgg 5221  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || |||||  | ||||| || |||| ||| |||    
T  5222 tgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaa 5321  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  | ||||||||    
T  5322 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtggagtaagtt 5421  T
Q  449 ttctgggcgatgttattt 466  Q
    |||| ||| || ||||||    
T  5422 ttcttggccatattattt 5439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1038 - 599
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||  |||| || || |||||     
T  1038 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgag--caaagttttttagtaatattgac 941  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  940 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 841  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||| ||| |||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||||||||| || || ||| |    
T  840 tcggtgttactaatgcgccgggtgtgttcatgtagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgacattct 741  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||| || |||||     
T  740 aatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcgaaatgtgag 641  T
Q  427 ttctggttgaag-gaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    || ||||  ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  640 ttttggt--aagtgaagtaagttttctgggccacattatttctg 599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8007 - 7809
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  | |||||  |||| || || |||||     
T  8007 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggt--gagcaaagttttttagtaatattgac 7910  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  7909 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 7810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 28898 - 28481
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   || ||||| || ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  28898 aagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatagatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaga 28799  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || || || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  28798 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 28699  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     || |||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || |||||  | ||||| || | || ||| |||    
T  28698 tgtatttatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaggaatgaagaa 28599  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
     | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  28598 aagcatgcagagcatctgatgattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaaattgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 28499  T
Q  449 ttctgggcgatgttattt 466  Q
    |||| ||| || ||||||    
T  28498 ttcttggccatattattt 28481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 14601 - 14153
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||   || || || ||||||||     
T  14601 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaagattgac 14502  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcac------tatgaatataaagtta 220  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||      ||||||||||| || |    
T  14501 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatatatatgaatataaggtga 14402  T
Q  221 tgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacga 320  Q
    || |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   || ||   ||||| || |||| ||| || ||    
T  14401 tgtctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctgaataaattcgtggttgtgtctattgatga 14302  T
Q  321 tattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaag 420  Q
     ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||  | |||||||| ||||| |||    
T  14301 cattctaatttattataagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaag 14202  T
Q  421 tgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  14201 tgtgagttctggttaattgaagtgagttttcttggccacattatttctg 14153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Original strand, 5718 - 6141
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  5718 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 5817  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  5818 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 5917  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggag-tatatgaatc-gcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattt 325  Q
     || ||  | ||||| || || || ||||| ||  || ||||||  | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||    
T  5918 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttattgaaatacatgaataagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattt 6017  T
Q  326 tgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
    || | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || ||||||||||||||    
T  6018 tggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtga 6117  T
Q  426 attctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
     || |||||||||||||| |||||    
T  6118 gttttggttgaaggaagtgagttt 6141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 466
Target Start/End: Original strand, 176277 - 176694
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || || |||| |||||||||||| ||  | || ||  |||    
T  176277 aagaataggtatccacttccgcgaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagcatgattgatttgaggtcgggttaccattaga 176376  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||  | || || || || ||||| || || ||||||  ||| ||  |||||||||| || ||||| |||||    
T  176377 ttaaagtaaaagatgaagatatgcataaaacgacctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatatctttcggtgttactaatgcgcctgg 176476  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | |||||||||||| || || || ||||| || || || |||||||| || ||| |||| |||    
T  176477 tgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgttgttgtatttattgatgacatcttgatttattctaagtctgaagaa 176576  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| |||||| | |||||||| ||| |||||| ||| || |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||| ||    
T  176577 gagcatgcagagcatttaaagattgtgttgtaagtgttgaatgaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaaatt 176676  T
Q  449 ttctgggcgatgttattt 466  Q
    |||| ||| || ||||||    
T  176677 ttcttggccatattattt 176694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 895 - 653
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || || ||||| |||| |    
T  895 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatcaacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagcaaaattggt 796  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  795 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgccat 696  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 269  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  695 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaa 653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 9456 - 9014
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||     
T  9456 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtggatgcaaaggtttttagtaagattgac 9357  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| | || || || ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || ||| |||    
T  9356 ttgagatcaggttaccatcaaattaaggtgaaggacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctt 9257  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| |  || |||||||| | | |||||   || || || || ||||| || || || ||    
T  9256 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtatttattgatgacatctt 9157  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||  | | |||||| ||||| ||||||||     
T  9156 aatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaaagttgtgtgctaagttgtcgaagtgtgag 9057  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| |  ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  9056 ttctagttaagtgaagtgagttttctgggccacattatttctg 9014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 269
Target Start/End: Original strand, 1400 - 1642
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  1400 tcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaagtttttagtaagattgac 1499  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| || || ||||| |||||| ||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  1500 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtaaaggatgaggatatgaagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 1599  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 269  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  1600 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaggatatgaa 1642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 43311 - 42887
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| |||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  43311 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactttcgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 43212  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||  || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  43211 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgagggtatgcagaagagggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 43112  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||| |||| |   |||||   || || || |||||||| || |||||| |    
T  43111 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatcgagtatatgaaccgaat-ttctatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 43013  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  43012 gatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaaaattgtgttgcaaatattgaaagagaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 42913  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    |||||||| |  |||||||| |||||    
T  42912 ttctggttaagtgaagtaagctttct 42887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 452
Target Start/End: Original strand, 1418 - 1821
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    || |  || || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  1418 aagaacaggtatccatttccgaggattgatgatttaatggatcagtcagtgggtgctcgtgtgtatagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 1517  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || || ||||  |||||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| |||||    
T  1518 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggtctttaggacacgatatgaacactatgaatataaggtgatatctttcggtgttactaatgcgcctgg 1617  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||||||||||| || || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || |||||||| || |||||||| |||    
T  1618 tgtgtttatggagtatataaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaa 1717  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  1718 gagcatgcagaagatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaaatgaagttagtt 1817  T
Q  449 ttct 452  Q
    ||||    
T  1818 ttct 1821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 79742 - 80181
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||     
T  79742 tcagttgaacaaagttaccataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattttcagtaagattgac 79841  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  79842 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 79941  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||  |||||  ||| || || || || || || ||||||||    
T  79942 tcggtgttactaatgcgcttggtgtgttcatggagtatatgaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggtagtattcattgatgatatttt 80041  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||||||| || || |||||  ||||||||| |||||| || || || | |||||| |||||  | |||||||||||||| || || ||     
T  80042 aatttattctaagactgaagaggagcatgcaaagcatctgaggattgtattacaggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcaaaatgcgag 80141  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 466  Q
    || ||||| |  ||||||||||| || ||| || ||||||    
T  80142 ttttggttaagtgaagtaagtttccttggccatattattt 80181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 262619 - 262177
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||     
T  262619 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgctttcgaggatttatgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattttcagtaagattgac 262520  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  262519 ttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 262420  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||  ||| |||||  ||| || || || || || ||||||||  |    
T  262419 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggttgtattcattgacgatatcct 262320  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||||| | || || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||||    
T  262319 aatttattctaagactaaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaa 262220  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  262219 ttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 262177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 449
Target Start/End: Original strand, 10697 - 11119
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||  |||| ||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||     
T  10697 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatctgcttctgaagattgatgacttgatggatcagttggttggtgcaaatatttttagtaagatcgac 10796  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  10797 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 10896  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||  |||||   ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  10897 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgctttcctggataaattcgtagtggtatttattgatgatatttt 10996  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| |  |||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||     
T  10997 aatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtatttaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgag 11096  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    || ||| | |  |||||||||||    
T  11097 ttttggctaagtgaagtaagttt 11119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 21515 - 21127
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  21515 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttggtggatcaagtggtgggtgcaaaagtttttagtaagattgac 21416  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||  | ||||| |||||||| || || || ||||    
T  21415 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgacacggtcattatgaatagaaggtgatacctt 21316  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||   || ||||| || ||| | || |||||| |    
T  21315 tcggtgttactaatgcgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtagttgtatttcttgatgatattct 21216  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgt 415  Q
     ||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||  | |||||||||||||    
T  21215 aatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaataagttgtatgctaaattgt 21127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 437
Target Start/End: Original strand, 27160 - 27569
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||| || ||||| |    
T  27160 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgaggatcaatgatttgatgtatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagtaaaattgact 27259  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    | |||||  | ||||||| ||| ||| |||||||||| || || |||||||  |  || || |  ||||| ||  | |||||||||   || ||||||||    
T  27260 taagatcgggctatcaccggatcaaactgaaagatgaggacattcagaagatggactttaggatacgttacggaaattatgaatattctgtgatgccttt 27359  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||| | | | | ||||| || || || |||||||| || |||||  ||    
T  27360 cggtgttactaatgcgccgggagtatttgtggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatatcctg 27459  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
    || ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||  ||||||||||||  | ||||| || || || ||||| ||||    
T  27460 atatactctaagtctgaggaggaacatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcaaagtgagaat 27559  T
Q  428 tctggttgaa 437  Q
    ||||||||||    
T  27560 tctggttgaa 27569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 7090 - 6703
Alignment:
Q  82 ttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacag 181  Q
    |||||||||| ||||||||||||    || ||| | |||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  7090 ttgatggatcggttagtgggtgctcgtgtattccgtaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacgg 6991  T
Q  182 ctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttcca 281  Q
    | || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  6990 cctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgatgtgtttatagagtatatgaaccgaatttttca 6891  T
Q  282 tgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 381  Q
    ||| ||| ||  |   || || || |||||||| || || || |||||||| || |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  6890 tgcttttctgattaaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaggaagagcatgtagaacatctgaagattgtattgcaa 6791  T
Q  382 gtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    || | ||||||||||||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  6790 gtattgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 6703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 53440 - 52998
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  53440 tcagttgaataaagttacaataaagaacagatatccactttctaggattgatgacttgatggatcaattagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 53341  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || || || || || || || ||||    
T  53340 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaaggtgatacctt 53241  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||| ||| || ||||  |||||  |||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   || || || || ||||| || |||||| |    
T  53240 tcgatgttactaatgtgcctggtttgttcatggagtatatgaaccggattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgatattct 53141  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||  | |||| ||| ||||| ||||||||     
T  53140 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgttaagttgtcgaagtgtgag 53041  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  53040 ttctggttaagtgaagtgagttttctgggccacattatttctg 52998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 452
Target Start/End: Original strand, 64452 - 64844
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || ||||||||||||| |||    || |||||||||||||||||||| ||  | || || ||||    
T  64452 aagaataggtatccacttacgaggattgatggtttaattgatcagttagtggatgctcgtgtgttcagcaagattgatttgaggtccggttaccatcaga 64551  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |           |||||    
T  64552 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgtcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgccgttcggcg-----------cctgg 64640  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||    
T  64641 tgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattcaaagactgaagaa 64740  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  64741 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaaaagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 64840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 114950 - 115155
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  114950 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 115049  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  || || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  115050 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatccagaagatggcctttaggacacgttatggacattacgaatattgagtgatgccttt 115149  T
Q  228 cggtgt 233  Q
    ||||||    
T  115150 cggtgt 115155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 307 - 469
Target Start/End: Original strand, 115172 - 115334
Alignment:
Q  307 gtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatg 406  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |  | ||||    
T  115172 gtgttcatcgatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagtagttatatg 115271  T
Q  407 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  115272 ccaagttgtcaaagtgtgaattttggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctg 115334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 469
Target Start/End: Original strand, 46967 - 47387
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||   || || || || ||||||| ||| ||  | || || ||||    
T  46967 aagaataggtatccacttccgagaattaacgatttaatggatcagctagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgattggaggtccggttaccatcaga 47066  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  47067 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 47166  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     ||||||||| |||||||||| |  || |||||||| | | | |||   || || || |||||||| || |||||  | ||||| |  |||| ||| ||     
T  47167 tgtgtttatgaagtatatgaaccaaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattttaagaatgaagat 47266  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| || ||  | ||||| |  ||||| || |||||||| ||||| |  |||||| |||    
T  47267 gagcatgcagagcatctgcagattgtattgcaagtgttgaaagaaaaaaagttgtatgcgacgttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaggtt 47366  T
Q  449 ttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||| ||| || |||||||||    
T  47367 ttcttggccatattatttctg 47387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 452
Target Start/End: Original strand, 55780 - 56183
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||  ||||||  |||||||| ||||| ||| | || || || |    
T  55780 aagaacagatatccgcttccgaggattgacgacttgatggaccagttggtcggtgcaaagattttcaataagattgacttgaggtcaggttaccatcaaa 55879  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  55880 ttcaggtgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaattgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 55979  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 348  Q
     || || |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||  |||  | || || || || || || ||  | ||||| ||||||||||| ||     
T  55980 tgtattcatggagtatatgaaccgtatttttcatgcttttctggataagtttatggttgtattcattgatgacatcctaatttattccaagactgaagag 56079  T
Q  349 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 448  Q
    || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||    
T  56080 gagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagtt 56179  T
Q  449 ttct 452  Q
    ||||    
T  56180 ttct 56183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Original strand, 31588 - 32030
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || |||||     
T  31588 tcagttgaataaagttacaataaagaaaagatatccacttccgagaattgacgacatgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgac 31687  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  31688 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 31787  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||   || || || || || || || || |||||    
T  31788 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacatttt 31887  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||| || || |  ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| ||     
T  31888 gatctattcgagaactgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgag 31987  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    || ||||| |  ||||| |||||||| ||| || |||||||||    
T  31988 ttttggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctg 32030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 233
Target Start/End: Original strand, 54322 - 54528
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  54322 tcagttgaacaaagttacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgac 54421  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  54422 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 54521  T
Q  227 tcggtgt 233  Q
    |||||||    
T  54522 tcggtgt 54528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 42652 - 42231
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  42652 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcataggtgtttagtaagattgatt 42553  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  42552 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattttgtgatgccatt 42453  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | ||||| |  || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  42452 tggagtatctaatgcgctaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 42353  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  42352 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 42253  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  42252 tttggttgaaggaagtgagttt 42231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 469
Target Start/End: Original strand, 55034 - 55253
Alignment:
Q  250 gtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaag 349  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| | | |   ||||| ||||| ||||| || |||||| | || || || |||||||| || |    
T  55034 gtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctagttaaattcgtggtggtatttattgatgatattctaatctattctaagactgaagagg 55133  T
Q  350 aacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  | |||||||| ||||| || |  || || ||||| |  |||||||||||    
T  55134 agcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaaataagagttttggttaagtgaagtaagttt 55233  T
Q  450 tctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||| ||| |  |||||||||    
T  55234 tcttggccacattatttctg 55253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 270
Target Start/End: Original strand, 520 - 741
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||  | || ||  | |    
T  520 aagaacagatatccgcttccgagaactgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaaagtttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatgaaa 619  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  620 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctgg 719  T
Q  249 agtgtttatggagtatatgaat 270  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  720 tgtgttcatggagtatatgaat 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 25788 - 25367
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  25788 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 25689  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  25688 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 25589  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  25588 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 25489  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  25488 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 25389  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  25388 tttggttgaaggaagtgagttt 25367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 34479 - 34058
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  34479 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatgcacttccgaggattgatgatttgatggatcagctggtcggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 34380  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  |||||||| |  || || || ||  ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  34379 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatacccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 34280  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  ||||||| || || || || ||||||||||||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  34279 tggagtatccaatgcgccaggtgtcttcatggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 34180  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || ||||||||||||||||    
T  34179 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaat 34080  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||| |||||||||||||    
T  34079 tttggttggaggaagtaagttt 34058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15302 - 14881
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  15302 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 15203  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  15202 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 15103  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  15102 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 15003  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  15002 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 14903  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  14902 tttggttgaaggaagtgagttt 14881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Original strand, 11089 - 11216
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    |||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | || ||| || | || ||||| |||||||||||||    
T  11089 ttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcaactggttggttcagaggtgttcagtaagattgatttga 11188  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    ||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  11189 gatcaggatatcatcagattagagtgaa 11216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Original strand, 11067 - 11189
Alignment:
Q  25 catcagttgaacaag-gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatt 123  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  11067 catcagttgaacaaaagtaactattaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacatgttttcagcaagata 11166  T
Q  124 gatttgagatcaaggtatcacca 146  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  11167 gatttgagatcaggttatcacca 11189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 167 - 469
Target Start/End: Original strand, 1900 - 2202
Alignment:
Q  167 atatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 266  Q
    ||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||    
T  1900 atatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatatgcagtgatggctttcggtgttactaatgcgccgggtgtgtttatggagtacat 1999  T
Q  267 gaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctg 366  Q
    |||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || | |||||||||| ||||||| ||    
T  2000 gaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagtctcaagaagaacatgttgagcatttg 2099  T
Q  367 aagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 466  Q
    |||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |  |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  |||||||||    
T  2100 aagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttaaatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggtcatgttattt 2199  T
Q  467 ctg 469  Q
    |||    
T  2200 ctg 2202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21244 - 20802
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || || |||||     
T  21244 tcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgatgacttgatggaccagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgac 21145  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || ||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| || |||| ||    
T  21144 ttgaggtcaggttaccattagattaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcactacgaatataaggtgatgcttt 21045  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||   || || ||||| || || || || |||||    
T  21044 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctacctggataaatttgtggtggtattcattgatgacatttt 20945  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    ||| || || |  | ||||||||| ||||| || ||||||| || ||| |||||||| |  | |||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||     
T  20944 gatctattctagaaatgaggaagagcatgcagaacatctgaggactgtattgcaagtattcatagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgag 20845  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||| ||| || |||||||||    
T  20844 ttctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctg 20802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 233
Target Start/End: Original strand, 18394 - 18600
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||     
T  18394 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacatccgaggattgatgacttgatggaccaattggtgggtgcaaaagtttttagtaagatcgac 18493  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  18494 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 18593  T
Q  227 tcggtgt 233  Q
    |||||||    
T  18594 tcggtgt 18600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 269
Target Start/End: Original strand, 9831 - 10027
Alignment:
Q  73 attgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgc 172  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  9831 attgatgacttgatggaccagttggtgggtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgc 9930  T
Q  173 agaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 269  Q
    ||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  9931 agaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaggtgtgttcatggagtatatgaa 10027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 113
Target Start/End: Original strand, 5760 - 5846
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttt 113  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5760 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgggtgcaaaagtttt 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 284
Target Start/End: Original strand, 9372 - 9629
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |  | |||||     
T  9372 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgatgacttgacggatcagctagtgggtgcaaaggttttttgttaaattgac 9471  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  9472 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 9571  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgc 284  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  9572 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 9629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 284
Target Start/End: Original strand, 19586 - 19843
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |  | |||||     
T  19586 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgatgacttgacggatcagctagtgggtgcaaaggttttttgttaaattgac 19685  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  19686 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 19785  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgc 284  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  19786 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 19843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 747 - 1187
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||| || || || |||||  ||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||| ||    
T  747 agttgaacaaagttacgataaagaaccggtatctgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgactt 846  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  847 gaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttc 946  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||  ||| |||||   || || || || || || ||||||||||| |    
T  947 ggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccaaattttccatgattttctggataaatttgttgttgtattcattgacgatattttaa 1046  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    | || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| ||||   | ||||| || ||||| || ||||| ||    
T  1047 tctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagtt 1146  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||| |  ||||| |||||||||||  || |||||||||    
T  1147 ctggttaagtgaagtgagttttctgggtcatattatttctg 1187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 29327 - 28900
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |   ||||||| ||||||||     
T  29327 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcaattggttggtgctaggattttcagtaagattgac 29228  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| |   | || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || || || || || |||||||| || || || ||||| |||||||    
T  29227 ttgaggtttggttaccatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 29128  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||| |||||||||| |  || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  29127 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatgtagtatatgaacctaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 29028  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || || |||| ||| | ||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| | |||||| ||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  29027 aatctattctaagaatgaag-agagcatgcagagcacctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgag 28929  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  28928 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 28900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 606 - 184
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | || |||||| | || || || |||||||||    
T  606 tcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatctgctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgat 507  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||| | |    
T  506 ttgagatcaggatatcaccagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgtcat 407  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    | || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || ||||||||||| || ||||||||    
T  406 ttggagtatctaatgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatatttt 307  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    | | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | |||||| || |||||||||||     
T  306 ggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttttctaagtgtgag 207  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    || |||||||||||||| |||||    
T  206 ttttggttgaaggaagtgagttt 184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 7548 - 7126
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | || |||||| | || || || |||||||||    
T  7548 tcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatatgatggatcagctggttggtgcataggtgtttagtaagattgat 7449  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||| | |    
T  7448 ttgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgtcat 7349  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    | || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || ||||||||||| || ||||||||    
T  7348 ttggagtatctaatgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatatttt 7249  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
    | | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | |||||| ||||||||||||||     
T  7248 ggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgag 7149  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    || |||||||||||||| |||||    
T  7148 ttttggttgaaggaagtgagttt 7126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 1347 - 919
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||| ||     
T  1347 tcagttgaacaaggttacgataaagaacatatatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagatcgac 1248  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||| || || || ||||| |||||||    
T  1247 ttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtaatgcctt 1148  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||    || || || || ||||| || ||||||||    
T  1147 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggacaaatttgttgttgtatttattgatgatatttt 1048  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     ||||| || |||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| |||| | | ||||| ||  |||| || |||||     
T  1047 aatttattctaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagagattgtatgcaaagctgtcaaaatgtgag 948  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    |||| ||| |  ||||| |||||||||||    
T  947 ttctagttaagtgaagtgagttttctggg 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 154 - 469
Target Start/End: Original strand, 39 - 354
Alignment:
Q  154 gtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgt 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  39 gtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgt 138  T
Q  254 ttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaaca 353  Q
    | ||||||||||||||| | || || ||||| | | |||||   || || || ||||  || || || |||||||| || || |  || |||||||| ||    
T  139 tcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttatctggataaatttgtggtagtgtacattgatgacattttgatctattcgacaacggaggaagagca 238  T
Q  354 tgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctg 453  Q
    ||| || |||||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||     
T  239 tgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagtttcctt 338  T
Q  454 ggcgatgttatttctg 469  Q
    ||| || |||||||||    
T  339 ggccatattatttctg 354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 357 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9290 - 9215
Alignment:
Q  357 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctgg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9290 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctgg 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Original strand, 6056 - 6484
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 126  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||     
T  6056 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttctgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaagatcgac 6155  T
Q  127 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 226  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  6156 ttgaggtctggttaccatcagataaaggggaaggatgaagacatgcagaagacggcctttaggacacgaaatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 6255  T
Q  227 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 326  Q
    ||||||| || || || | ||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||  |||||   ||| | ||||| ||||| || ||||||||    
T  6256 tcggtgttactaacgcgcatggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctttcctggataaattcatggtggtatttattgatgatatttt 6355  T
Q  327 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 426  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| || |||||||  ||||| ||||| || | |||||| |||||  | ||||| || ||||  || |||||     
T  6356 aatctattccaagaatgaagaggagcatgcagaacatctgagaattgtattgcacgttttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagttgttaaaatgtgag 6455  T
Q  427 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 455  Q
    || ||||| |  ||||| |||||||||||    
T  6456 ttatggttaagtgaagtgagttttctggg 6484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 12267 - 12335
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12267 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtt 12335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11331 - 11201
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  11331 aagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 11232  T
Q  149 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagac 179  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11231 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 11201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 385
Target Start/End: Original strand, 14790 - 14982
Alignment:
Q  193 cgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttgg 292  Q
    ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||    
T  14790 cgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatctaatcttccatgcttttctgg 14889  T
Q  293 atcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 385  Q
    ||  ||| || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  14890 ataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgt 14982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 350 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 3998 - 3896
Alignment:
Q  350 aacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    |||||||||||||| ||||| |  | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3998 aacatgctgagcatttgaaggtgattttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctatgtgtgaattctggttaaaagaagtaagttt 3899  T
Q  450 tct 452  Q
    |||    
T  3898 tct 3896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 449
Target Start/End: Original strand, 715 - 1135
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  || | || || ||||||||||    
T  715 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgattccgaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgcggaaatgtttagtaagattgatt 814  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || |  ||| ||||| | ||||  |||||||| |||   || ||||| ||    
T  815 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactgtgttccgaacgaggtatgaacactatgagtattctgtgatgccatt 914  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  ||||||| || |  || || ||||| ||||||||| | || || ||| | | |||||| |  || || ||||||||||| || |||| ||||    
T  915 tggagtatccaatgcgccagttgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccattttgtggtggtgtttatagatgata-tttg 1013  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 427  Q
     | || || ||| ||||||| || |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | |||||| ||||| ||||||||||    
T  1014 gtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtcgaagtgtgaat 1113  T
Q  428 tctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    | |||||| ||||||| |||||    
T  1114 tttggttgcaggaagtgagttt 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 158
Target Start/End: Original strand, 859 - 988
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    ||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| || || |||||||||||    
T  859 agttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaagtgtttagtaagattgattt 958  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    ||||||  | ||||| ||||||| ||||||    
T  959 gagatcgggatatcatcagattagagtgaa 988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 425
Target Start/End: Original strand, 1134 - 1255
Alignment:
Q  304 gtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaacttt 403  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | || || ||| ||||||| || |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||| |||||  || | |    
T  1134 gtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccaattat 1233  T
Q  404 atgctaaattgtctaagtgtga 425  Q
     |||||||||||| ||||||||    
T  1234 gtgctaaattgtcgaagtgtga 1255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 1865 - 2285
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| || || |||||||||||    
T  1865 agttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaagtgtttagtaagattgattt 1964  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 228  Q
    ||||||  | ||||| || |||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||| | |||||||| |||   || ||||| ||     
T  1965 gagatcgggatatcatcaaattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgcattccgaacgaggtatagacactatgagtattctgtgatgccattt 2064  T
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| |  || || |||||||| || || |||||||||     
T  2065 ggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaataaatgaatagaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttaatagatgatattttgg 2164  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 428  Q
    | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||| || | |||||||||  |  | | |||||| |||||||||||||| ||    
T  2165 tgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattatgttgcaggtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagtt 2264  T
Q  429 ctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
     |||||| ||||||| |||||    
T  2265 ttggttggaggaagtgagttt 2285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26721 - 26621
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||  |  | ||||||||||||||||    
T  26721 cagttgaacatggtgactataaagaattggtatccgcttccgaggattgattatttgatggatcagttagttagtgcggagatattcagcaagattgatt 26622  T
Q  128 t 128  Q
    |    
T  26621 t 26621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 151
Target Start/End: Original strand, 1797 - 1919
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    |||||||||| || || || | |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| | || || ||||||||||||||    
T  1797 agttgaacaaagtgacgattatgaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgcagaggtgtttagcaagattgattt 1896  T
Q  129 gagatcaaggtatcaccagatta 151  Q
    ||||||| | ||||| |||||||    
T  1897 gagatcaggatatcatcagatta 1919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16451 - 16345
Alignment:
Q  29 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 128  Q
    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||  |||| || || |||||||||||    
T  16451 agttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgattt 16352  T
Q  129 gagatca 135  Q
    |||||||    
T  16351 gagatca 16345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 244 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1172 - 947
Alignment:
Q  244 cctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactg 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || |||||||| || |||||||    
T  1172 cctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactg 1073  T
Q  344 aggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagt 443  Q
    | ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||||| |||| ||| || |||||    
T  1072 aagaagagcatgcagaacatctgaatattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctagttaaatgaagt 973  T
Q  444 aagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||    
T  972 aagttttcttggccatattatttctg 947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Original strand, 13537 - 13667
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| || || || ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || |||||||| |    
T  13537 cagttgaacaaagtgacgattaagaatgagtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgaat 13636  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  13637 tgagatcaggatatcatcagattacagtgaa 13667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 456
Target Start/End: Original strand, 12349 - 12639
Alignment:
Q  166 gatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 265  Q
    |||||||||||||| || || || || |  |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  12349 gatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 12448  T
Q  266 tgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatct 365  Q
     ||| || || |||||||| |  |||||    || || || || ||||| ||  ||||| |||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  12449 cgaaccgaattttccatgcttacttggaaaaatttgtggttgtatttattgataatattctgatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatct 12548  T
Q  366 gaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggc 456  Q
    ||||||||| |||||| | | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||| | |||||||  |  ||||| ||||||||||||    
T  12549 gaagattgtgttgcaattattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtaagttctggtaaagtgaagtgagttttctgggc 12639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 455
Target Start/End: Original strand, 8920 - 9122
Alignment:
Q  253 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaac 352  Q
    ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||| |||||| || |    
T  8920 tttatggagtacatgaaccaaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatattaatatattccaagaatgaggaggagc 9019  T
Q  353 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  9020 atgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttct 9119  T
Q  453 ggg 455  Q
    |||    
T  9120 ggg 9122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7135 - 7015
Alignment:
Q  31 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 130  Q
    ||||||||||| || || || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || |||||||||||||    
T  7135 ttgaacaaggtgacgattaaaaatcggtatccacttcagaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatttga 7036  T
Q  131 gatcaaggtatcaccagatta 151  Q
    ||||| | ||||| |||||||    
T  7035 gatcaggatatcatcagatta 7015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 383
Target Start/End: Original strand, 1533 - 1888
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| | || || || ||||||||||    
T  1533 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 1632  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 227  Q
    |||  | | | ||||| ||||||| |||||| |  |||||| |    || || || ||| ||||  | |||||  ||||||| |||   || ||||| ||    
T  1633 tgaagttaggatatcatcagattagagtgaaggcagaagatgtatccaaaaccgcgttccgaacaaggtatggaaactatgagtattccgtaatgccatt 1732  T
Q  228 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 327  Q
     || ||  ||||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || ||||||||||| || |||||||||    
T  1733 tggagtttccaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttg 1832  T
Q  328 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 383  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  1833 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 1888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 471
Target Start/End: Original strand, 33914 - 34108
Alignment:
Q  277 ttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtct 376  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||| || || ||||| || || ||||||||||| || | | |||| ||||| ||||| |||||| | |||||| | |    
T  33914 ttccatgcttatttggattggttcgtggttgtatttattgatgacattttgatttattctaggtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagattatgt 34013  T
Q  377 tgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctgat 471  Q
    |||||||||  || || |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  34014 tgcaagtgttaaaggaaaagaagatgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctgat 34108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 469
Target Start/End: Original strand, 16229 - 16502
Alignment:
Q  196 tatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 295  Q
    |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || || || ||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||| |   |||||     
T  16229 tatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcctagagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggata 16328  T
Q  296 ggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaa 395  Q
      ||||| || |||||||| || |||||| ||||||| || ||||||||  |||  ||||  || ||||||||||| || |||||| | | ||| || ||    
T  16329 aattcgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattcaaagactgaaaaagtgcatgtagaacatctgaagatagtattgcaaatattgaaggaaaa 16428  T
Q  396 gaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  16429 gaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 16502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 89873 - 89764
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 148  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || |||||  |||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  89873 aagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttcatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcaga 89774  T
Q  149 ttaaagtgaa 158  Q
    ||| ||||||    
T  89773 ttagagtgaa 89764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7549 - 7445
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||||||||||||| || || |||||| | ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| | || ||| || | || || ||||| |||||||    
T  7549 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcgatatccgcttccaaggactgatgatttgatggatcagctggttggtacagaggtgtttagcaaaattgatt 7450  T
Q  128 tgaga 132  Q
    |||||    
T  7449 tgaga 7445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 44985 - 44753
Alignment:
Q  220 atgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacg 319  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || |||||||| || |    
T  44985 atgcctttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatg 44886  T
Q  320 atattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaa 419  Q
    | || |||||||| ||||||| ||| || || |||||  | |||||||  ||| | |||||||||| ||| || ||||   | ||||||||  |||| ||    
T  44885 acatcttgatttattccaagaatgaagaggagcatgcaaaacatctgagaattatattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagctgtcaaa 44786  T
Q  420 gtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 452  Q
     ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  44785 atgtgagttctggttaagtgaagtgagttttct 44753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 469
Target Start/End: Original strand, 6939 - 7006
Alignment:
Q  402 ttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  6939 ttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttaaaagaagtaatttttcttggacatgttatttctg 7006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Original strand, 6917 - 7047
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    |||| ||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| || | || |||||  |||| || || ||||||||||    
T  6917 cagtcgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatggtttgatggattagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatt 7016  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 158  Q
    |||||||| | ||||| || |||| ||||||    
T  7017 tgagatcaggatatcatcatattagagtgaa 7047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 104
Target Start/End: Original strand, 9865 - 9942
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgc 104  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  9865 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcacttagtgggtgc 9942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 104
Target Start/End: Original strand, 17532 - 17609
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgc 104  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  17532 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcacttagtgggtgc 17609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1521 - 1277
Alignment:
Q  225 tttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatt 324  Q
    ||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||   ||||| || || || || || ||||||    
T  1521 tttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtagtattcattgatgatatt 1422  T
Q  325 ttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtg 424  Q
    || ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||||| |||||| || || || | |||||| |||||  | |||||||||||||| || || |    
T  1421 ttaatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattacaggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcaaaatgcg 1322  T
Q  425 aattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    | || ||||| |  ||||||||||| || ||| || |||||||||    
T  1321 agttttggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttctg 1277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Original strand, 4838 - 4905
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtt 95  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4838 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatctgcttccgaggattgatgatttgatggatcagtt 4905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 449
Target Start/End: Original strand, 6932 - 7262
Alignment:
Q  119 agattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagt 218  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || ||||| ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   ||    
T  6932 agattgatttgagatcaggatatcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaacagcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgt 7031  T
Q  219 tatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgac 318  Q
     ||||| || || ||  |||||||||| || || || || ||||||||||||   || || ||| | | | |||| || ||  | |||||||||||  |     
T  7032 gatgccatttggagtatccaatgcaccaggtgtcttcattgagtatatgaataaaatatttcatccttatctggaccgttttatggtggtgtttataaat 7131  T
Q  319 gatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtcta 418  Q
    ||||||||| | || |  ||| ||||||| || |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||| |||||  |  | | |||||| |||||||    
T  7132 gatattttggtgtatttgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtcta 7231  T
Q  419 agtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 449  Q
    ||||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  7232 agtgtgagttttggttgcaggaagtgagttt 7262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 151
Target Start/End: Original strand, 7152 - 7275
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| || || || |||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  7152 cagttgaacaaagtgacaattaagaatcggtatccgcttccaaggatttatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 7251  T
Q  128 tgagatcaaggtatcaccagatta 151  Q
    | |||||| | ||||| |||||||    
T  7252 taagatcaggatatcatcagatta 7275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 486 - 380
Alignment:
Q  28 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 127  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | || |||||| | || || || ||||| ||||    
T  486 cagttgaacaaagtaacgattaagaatcggaatccacttccgaagattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagatagatt 387  T
Q  128 tgagatc 134  Q
    |||||||    
T  386 tgagatc 380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2218
Alignment:
Q  405 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttct 468  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  2281 tgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttttcttggtcatgttatttct 2218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 270
Target Start/End: Original strand, 1748 - 1843
Alignment:
Q  175 aagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaat 270  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||    
T  1748 aagactgcttttaggacccgatatggtcactacgaatatttggttatgccttttggggtgactaatgcaccaggagtgttcatggagcacatgaat 1843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0827 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0827
Description:

Target: scaffold0827; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5354 - 5259
Alignment:
Q  174 gaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 269  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||| ||||| |||   || |||||||| || ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  5354 gaagactgccttcagaagccgttatggtcattatgagtattcggtgatgccttttggagtgtccaacgcgccaggagtgtttatggagtatatgaa 5259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 9088 - 8937
Alignment:
Q  229 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 328  Q
    |||||||| ||||| | ||| || || ||||| || |||||| | ||||||||| | | |||||||| |||  | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  9088 ggtgtgactaatgcgcttggtgtcttcatggaatacatgaatagaatcttccatccttatttggatcagtttatggtggtgtttatagacgatatcttga 8989  T
Q  329 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgca 380  Q
    | || || ||| | ||||| || ||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  8988 tgtattcgaagtcagaggaggagcatgcagagcatctaaggattgtgttgca 8937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 62
Target Start/End: Original strand, 2838 - 2873
Alignment:
Q  27 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcc 62  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2838 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatcc 2873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 36168 - 36069
Alignment:
Q  367 aagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 466  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||| || ||||||    
T  36168 aagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattattt 36069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 469
Target Start/End: Original strand, 23339 - 23432
Alignment:
Q  376 ttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttctg 469  Q
    |||||||||| ||| || |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  23339 ttgcaagtgttgaaggaaaagaaggtgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctg 23432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 195310 - 195193
Alignment:
Q  352 catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttc 451  Q
    ||||| || ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  195310 catgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttc 195211  T
Q  452 tgggcgatgttatttctg 469  Q
    | ||| |  |||||||||    
T  195210 ttggccacattatttctg 195193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 2311 - 2267
Alignment:
Q  49 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 93  Q
    |||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  2311 aagaatcggtatccactcccaaggattgatgatttgatggatcag 2267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University