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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4012_high_2 (Length: 681)

Name: NF4012_high_2
Description: NF4012
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4012_high_2
NF4012_high_2
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (1-666)||(2541363-2542028)
chr4 (104-568)||(647408-647873)
chr4 (1-593)||(26062792-26063387)
chr4 (106-596)||(26060135-26060626)
chr4 (104-568)||(650680-651146)
chr4 (140-568)||(12171558-12171988)
chr4 (587-667)||(7395279-7395359)
chr4 (253-357)||(16926982-16927085)
chr4 (253-357)||(6031536-6031640)
chr4 (106-169)||(11649440-11649503)
chr4 (590-665)||(22093481-22093556)
chr4 (24-77)||(12172041-12172093)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (1-578)||(3862006-3862575)
chr7 (104-568)||(17863299-17863764)
chr7 (104-568)||(17866558-17867023)
chr7 (1-601)||(36843036-36843641)
chr7 (104-568)||(6966723-6967188)
chr7 (66-568)||(46846478-46846979)
chr7 (24-568)||(11279068-11279612)
chr7 (104-568)||(24782981-24783449)
chr7 (104-568)||(294440-294905)
chr7 (24-568)||(23759732-23760278)
chr7 (106-568)||(33312570-33313033)
chr7 (104-580)||(9765361-9765842)
chr7 (1-580)||(23107554-23108132)
chr7 (24-514)||(36222433-36222918)
chr7 (1-310)||(23313361-23313671)
chr7 (390-580)||(23313692-23313883)
chr7 (586-667)||(26809172-26809253)
chr7 (253-357)||(2719331-2719435)
chr7 (253-344)||(27796634-27796726)
chr7 (485-580)||(35773117-35773213)
chr7 (1-42)||(22083300-22083341)
chr7 (245-345)||(26075710-26075810)
chr7 (245-345)||(26099497-26099597)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (104-568)||(13492838-13493303)
chr1 (1-580)||(34065908-34066489)
chr1 (104-568)||(13495563-13496028)
chr1 (104-568)||(27282312-27282777)
chr1 (51-568)||(32506005-32506523)
chr1 (1-359)||(39546028-39546388)
chr1 (1-580)||(16190279-16190858)
chr1 (5-580)||(1936191-1936770)
chr1 (105-413)||(21152987-21153295)
chr1 (172-405)||(23990361-23990594)
chr1 (179-408)||(22453415-22453644)
chr1 (106-418)||(22456699-22457009)
chr1 (105-417)||(15297060-15297371)
chr1 (104-233)||(10764831-10764960)
chr1 (211-417)||(22104683-22104887)
chr1 (266-355)||(4204979-4205068)
chr1 (1-88)||(23990235-23990322)
chr1 (1-78)||(8435303-8435380)
chr1 (106-218)||(49147825-49147936)
chr1 (450-568)||(10759697-10759816)
chr1 (445-565)||(23990633-23990754)
chr1 (255-344)||(14546740-14546829)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (104-568)||(14790194-14790659)
chr6 (104-568)||(14795222-14795687)
chr6 (5-588)||(20527266-20527852)
chr6 (104-568)||(32704459-32704923)
chr6 (1-580)||(19664766-19665346)
chr6 (1-579)||(16883241-16883820)
chr6 (104-580)||(1838037-1838514)
chr6 (24-568)||(13017313-13017859)
chr6 (106-418)||(12983586-12983897)
chr6 (106-418)||(12980699-12981010)
chr6 (63-568)||(22221300-22221807)
chr6 (1-278)||(15534923-15535200)
chr6 (63-568)||(22247135-22247642)
chr6 (105-361)||(7769594-7769857)
chr6 (208-326)||(15538040-15538158)
chr6 (24-238)||(30978335-30978551)
chr6 (253-568)||(32426944-32427258)
chr6 (586-658)||(20189867-20189939)
chr6 (586-658)||(22146052-22146124)
chr6 (586-667)||(16730976-16731057)
chr6 (1-137)||(15540578-15540714)
chr6 (485-580)||(15534652-15534748)
chr6 (488-580)||(15537847-15537940)
chr6 (154-204)||(15540529-15540579)
chr6 (104-170)||(27649077-27649143)
chr6 (5-168)||(32427278-32427441)
chr6 (1-78)||(11183937-11184014)
chr6 (1-42)||(28118053-28118094)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (1-580)||(12575400-12575981)
chr8 (86-580)||(13096594-13097081)
chr8 (5-359)||(41778847-41779194)
chr8 (1-159)||(14418451-14418609)
chr8 (105-359)||(44008087-44008335)
chr8 (106-169)||(41836429-41836492)
chr8 (298-338)||(14418355-14418395)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (1-548)||(23673445-23673994)
chr2 (24-494)||(16294550-16295019)
chr2 (48-568)||(13709647-13710169)
chr2 (5-568)||(36326500-36327067)
chr2 (24-568)||(31527965-31528511)
chr2 (106-411)||(31626283-31626588)
chr2 (24-568)||(40017553-40018099)
chr2 (98-580)||(32575885-32576367)
chr2 (288-361)||(8426781-8426854)
chr2 (586-655)||(11059410-11059479)
chr2 (586-654)||(13517919-13517987)
chr2 (109-229)||(8427141-8427260)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (104-568)||(34405424-34405889)
chr5 (104-568)||(14616633-14617098)
chr5 (24-568)||(33574664-33575210)
chr5 (105-580)||(22159307-22159784)
chr5 (24-568)||(15532324-15532870)
chr5 (106-544)||(26712549-26712991)
chr5 (106-544)||(26982287-26982729)
chr5 (24-568)||(15542506-15543052)
chr5 (104-568)||(7650146-7650610)
chr5 (253-559)||(11989171-11989478)
chr5 (9-159)||(11988974-11989127)
chr5 (586-654)||(28562795-28562863)
chr5 (586-654)||(28566363-28566431)
chr5 (582-665)||(42062548-42062628)
chr5 (314-357)||(23993447-23993490)
chr5 (192-344)||(13371859-13372011)
chr5 (1-42)||(17944841-17944882)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (86-580)||(5995-6491)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (26-400)||(9607-9982)
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (24-568)||(22626436-22626982)
chr3 (24-508)||(39563634-39564118)
chr3 (24-568)||(11138694-11139238)
chr3 (104-358)||(13979273-13979527)
chr3 (105-494)||(35366028-35366415)
chr3 (86-248)||(46731391-46731555)
chr3 (105-517)||(47411819-47412222)
chr3 (586-654)||(2783736-2783804)
chr3 (582-665)||(18645107-18645187)
chr3 (586-665)||(35412227-35412303)
chr3 (521-580)||(13979054-13979113)
chr3 (1-78)||(50096848-50096925)
chr3 (540-580)||(31878312-31878352)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (106-568)||(7199-7662)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (55-417)||(24337-24701)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (106-568)||(2267-2732)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (256-568)||(1-314)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (104-386)||(2808-3090)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (1-159)||(109-267)
scaffold0363 (298-338)||(323-363)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-42)||(7457-7498)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 578; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 2542028 - 2541363
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2542028 aaaggatgtattaaattcaatggtgccctaggcagttgagtttattcttgtaacataaacggattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaa 2541929  T
101 gaggtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaa 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2541928 gaggtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcttatggtaatttgtactcctatttcaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaa 2541829  T
201 gtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgt 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
2541828 gtaattttatccaatctcttgacctaaaattcttctcggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcaaaaccattgaaggttttaacagtccgt 2541729  T
301 taatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtca 400  Q
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2541728 taatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagttcagagttaaaagccggtgttagtggtca 2541629  T
401 atcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
2541628 atcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacatacgaaaatcattaaacacaagataatatgaataaaaac 2541529  T
501 tagacttttattgatatgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaaccaaaagagaaattagctagaca 600  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
2541528 tagacttttattgatatgaaaggaattcaacaaattagagttcccataagattacattagattcatctaagtctcaaccaatagagaaattagctaaaca 2541429  T
601 tagaaatataaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgttcctcatttctc 666  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2541428 tagaaatacaaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgttcctcatttctc 2541363  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Original strand, 647408 - 647873
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
647408 gtatggttaagatcttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 647507  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||    
647508 attctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaa 647607  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||| | ||||| ||||||| | |||||||| || |     
647608 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggccattt 647707  T
404 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactag 503  Q
    ||  |||||||||||  |||| | | || ||||||||  | ||||||||| |||||||||  ||||  || ||||||||  |||||||||| ||||||||    
647708 aatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactag 647807  T
504 acttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||||| | ||||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
647808 actttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 647873  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 593
Target Start/End: Original strand, 26062792 - 26063387
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  ||  |  |||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||  |||||||| |    
26062792 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggtagttggattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggtttta-gaaaattaga 26062890  T
101 gag----gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaa 196  Q
    |||    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||    
26062891 gagagatgtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaa 26062990  T
197 caaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagt 296  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
26062991 caaagtaactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaacaga 26063090  T
297 ccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaac-attccacctagtttagagttaaaagccggtgttagt 395  Q
     |||| |||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| | |||  |||||| | ||||| ||||||| | ||||||    
26063091 acgtttatccatatgtcataacctaataatgatcaatctctagcttgattacttaggttaacctatt--acctagatcagagtcaaaagccagggttagt 26063188  T
396 ggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaac-ataagaaaattattaaacataagataatatgaat 494  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||   |||| | | || ||||||||  |  ||||| || |||||| |||  ||||  |||||||| ||  ||||||||||    
26063189 ggtcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaagctagggttattagtcgatgataaacaatacaaaaagcattaaacacaaagtaatatgaat 26063288  T
495 aaaaactagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaaccaaaagagaaattag 593  Q
    |||||||||||||| ||||| | | | |||| |||||||||| || ||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||||    
26063289 aaaaactagactttcattgacattcaaaggagttcaacaaatcagggttcccatatgattacattagattcatctcagtctcaaccacaa-agaaattag 26063387  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 106 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 26060626 - 26060135
Alignment:
106 atggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||     
26060626 atggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagcttcccgatagattaacaaagtaac 26060527  T
206 tttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatc 305  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||    
26060526 tctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaaataacaaccccttaatgtcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaatagaacgttaatc 26060427  T
306 cctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaa 405  Q
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26060426 cctatgtcataacctaataatggtctatctctagcttgattacttaagttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcatggttagtggtcattcaa 26060327  T
406 gttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagac 505  Q
      ||||||||||   || | | | || ||||||||  | |||||| || |||||||||  ||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
26060326 tctctaagatcaatttgtatattcatgaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaataaaatctagac 26060227  T
506 ttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaaccaaaagagaaattagcta 596  Q
    ||||||||||| | | | || ||||||||| |||  ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
26060226 ttttattgatattcaaaagagttcaacaaactaggattctcatacaattatatcatattcatctaagtctcaaccaattgaaaaattagcta 26060135  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Original strand, 650680 - 651146
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
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650680 gtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 650779  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||    
650780 attctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaa 650879  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||| | ||||| ||||||| | |||||||| || |     
650880 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggccattt 650979  T
404 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactag 503  Q
    ||  |||||||||||  |||| | | || ||| ||||  | | |  |||| |||||||||  ||||  || ||||||||  |||||||||| ||||||||    
650980 aatctctaagatcagtttgcatattcataaagttagggttaggaaacaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactag 651079  T
504 acttttattgata-tgataggaattcaacaaatta-gagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||||| | ||||| | | |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
651080 actttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattaggggttcccataggattacatcagattcatct 651146  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 140 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 12171988 - 12171558
Alignment:
140 tatggtaatttgcactcctatttt-aagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccg 238  Q
    ||||||||||||||||||||  |  || |||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
12171988 tatggtaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctacaattctccccg 12171889  T
239 gaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctcta 338  Q
     || | |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
12171888 caagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctcta 12171789  T
339 gcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagcta 438  Q
    |||| |||||||||||||||| |   ||||| || ||| ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||   |||| | | || ||||||    
12171788 gcttgattacttaggttaaacctattacctaattaagaattaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagcta 12171689  T
439 ggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgat-atgataggaattcaacaaatta 537  Q
    ||  |  ||||| || |||||||||   ||   |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||  | | |||| |||||||||||     
12171688 gggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattt 12171589  T
538 gagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    | ||||| ||| | |||||||| ||||||||    
12171588 gggttccaatagggttacatcagattcatct 12171558  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 587 - 667
Target Start/End: Original strand, 7395279 - 7395359
Alignment:
587 aaattagctagacatagaaatataaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgttcctcatttctct 667  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||    
7395279 aaattaactagacatagagatacaaataaatagcatgaaaaataaaattaaccacaaaaacatgttgttcctcaattctct 7395359  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 357
Target Start/End: Original strand, 16926982 - 16927085
Alignment:
253 ttaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttag 352  Q
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16926982 ttaatctcttaagtgaattagaa-ccgttggaggttttaatagtttgttaatctctagatcataacctaataattgttcatctctaatttaattacttag 16927080  T
353 gttaa 357  Q
    |||||    
16927081 gttaa 16927085  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6031640 - 6031536
Alignment:
253 ttaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggtttt-aacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattactta 351  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || || | ||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||    
6031640 ttaatctcttaagtgaattcgaaaccattagaggtttttaaaagacagttac-ccctaaatcataacttaacaattgtctatctcttgcttagttaatta 6031542  T
352 ggttaa 357  Q
     |||||    
6031541 agttaa 6031536  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 169
Target Start/End: Original strand, 11649440 - 11649503
Alignment:
106 atggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaa 169  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||| |||||    
11649440 atggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcataattttagcaa 11649503  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 590 - 665
Target Start/End: Original strand, 22093481 - 22093556
Alignment:
590 ttagctagacatagaaatataaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgttcctcatttct 665  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||    
22093481 ttagctacacatagagatacaaataaatatcttggaaaataaaattaaccatgtcatcatcttgttcctcaattct 22093556  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 12172093 - 12172041
Alignment:
24 tgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaa 77  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
12172093 tgccctaggcagttgagttgatt-tagtaacataaactgattaaaaacaataaa 12172041  T

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Target: chr7 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 3862006 - 3862575
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattctt-gtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa 99  Q
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3862006 aaaggatgtattaaattcaatgatgccctaggcagttcaattgattttttgtaacataaactgattaaaaacaataaaagattggttttat-aaaattag 3862104  T
100 agag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaac 197  Q
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3862105 agagaagtatgattaagaccttcgaatccttcgaagttctcctatg--------cactcctaattcaagaaatgattatctagttcaacgacagattaac 3862196  T
198 aaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatcc----attaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaac 293  Q
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3862197 aaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaattaatgtcttaagtgaattcaaaactgttggaagttttaac 3862296  T
294 agtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgtta 393  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| | ||||    
3862297 cgtcctttaatccctatatcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaacacaccacctagttcagagtttaaagccagggtta 3862396  T
394 gtggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaa 493  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||       || || |||||||||||||||||||   |||  |||||| | ||||| |||| ||    
3862397 gtggtcaattaagttctaagaccagtctgcaaatttat-------gggctagtagtcaataataaacatacacaaagcattaaaaacaagatgatataaa 3862489  T
494 taaaaactagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaac 578  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
3862490 taaaaactagactttcattgatatttaaaggagttcaacaaattagggttctcataagattacattagattcaactaagtctcaac 3862575  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Original strand, 17863299 - 17863764
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
17863299 gtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 17863398  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||    
17863399 attctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaa 17863498  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||| |     
17863499 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattt 17863598  T
404 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactag 503  Q
    ||  |||||||||||  |||| | | || ||||||||  | ||||||||| |||||||||  ||||  || ||||||||  |||||||||| ||||||||    
17863599 aatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactag 17863698  T
504 acttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||||| | ||||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
17863699 actttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 17863764  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Original strand, 17866558 - 17867023
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
17866558 gtatggtttagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 17866657  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||    
17866658 attctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaa 17866757  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||| |     
17866758 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattt 17866857  T
404 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactag 503  Q
    ||  |||||||||||  |||| | | || ||||||||  | ||||||||| |||||||||  ||||  || ||||||||  |||||||||| ||||||||    
17866858 aatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactag 17866957  T
504 acttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||||| | ||||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
17866958 actttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 17867023  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 601
Target Start/End: Original strand, 36843036 - 36843641
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatg--ttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaatta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||  || || |||  |||||  |   ||||||||||||  | |||||| |||| ||||    
36843036 aaaggatgtattaaattcaatggtttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaacgtaaataaaacaataaaagtt-ggttttatgaatatta 36843134  T
99 aagag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaa 196  Q
     ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||    
36843135 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattcgcactcctacttcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaa 36843234  T
197 caaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagt 296  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
36843235 caaattaactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaacaga 36843334  T
297 ccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtg 396  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||| | ||||| ||||||| |  ||||||    
36843335 acgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccaggattagtg 36843434  T
397 gtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaac-ataagaaaattattaaacataagataatatgaata 495  Q
    |||| ||||  ||||| ||||   |||| | | || ||||||||  | ||||||||| |||||| |||  ||||  |||||||| ||  |||||||||||    
36843435 gtcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacaatataaaaagcattaaacacaaagtaatatgaata 36843534  T
496 aaaactagacttttattgatatgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca-aaagagaaattagc 594  Q
    ||||||||||||| ||||| ||   | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||     
36843535 aaaactagactttcattgacattcaaagagttcaacaaattagagttcccacaagattacatcaaattcatctaagtctcagccacaaagaaaatttagg 36843634  T
595 tagacat 601  Q
    |||||||    
36843635 tagacat 36843641  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 6967188 - 6966723
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
6967188 gtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgatagattaacaaagta 6967089  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |  | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||    
6967088 attctacccaatctcttaacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaa 6966989  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||| |     
6966988 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattt 6966889  T
404 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactag 503  Q
    ||  |||||||||||  || | | | || ||||||||  | ||||||||| |||||||||  ||||  || ||||||||  |||||||||| ||||||||    
6966888 aatctctaagatcagtttgaatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactag 6966789  T
504 acttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||||| | ||||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
6966788 actttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 6966723  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 568
Target Start/End: Original strand, 46846478 - 46846979
Alignment:
66 aaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa-agaggtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctatttta 164  Q
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46846478 aaaaacaataaaagattggtttttagaaaattgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttcttctatggtaatttgcactcctagttca 46846577  T
165 agcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaa 264  Q
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46846578 atcaatgattatttagtttcacgacagattaacctaataattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaa 46846677  T
265 atgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattcc 364  Q
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46846678 ctgaattcgaaaacgttggaggttttaaaagatcgttaatccctatgtcataacctaataataatctatctctaacttgattacttaggttaaacctatt 46846777  T
365 acctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataa 464  Q
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46846778 acttagttcagagttaaaagtcagggttagtgatcattcaatttccatgatcaatatgca---tgttcaagctagggttaatagtcgatgataaacatac 46846874  T
465 gaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatatt 563  Q
     ||||  |||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||    
46846875 aaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagggttacatcagatt 46846974  T
564 catct 568  Q
    |||||    
46846975 catct 46846979  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 11279612 - 11279068
Alignment:
24 tgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa-agaggtatggttaagacattcga 122  Q
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11279612 tgccctaggcagttgagttgatt-ttgtaacataaactgattaaaaacgaataaagattggtttttagaagattgagagaagtatggttaagtccttcga 11279514  T
123 atcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttga 222  Q
    ||| |  ||||||||  | |||||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
11279513 atctttcgaagttctcctctggtaatttgcactcctagttcaataaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctcttga 11279414  T
223 cctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaa 322  Q
    ||||| ||||| |||| || | |||| || |||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||  |  |||||||| |||| |||||||||||    
11279413 cctaggattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatctgaaaccgttggaggtattaa-tgaacgttaatctctatgtcataacctaa 11279315  T
323 taattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctg 422  Q
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11279314 taatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatg 11279215  T
423 caaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgata-tgata 521  Q
    ||   | || ||||||||  | |||||| || |||||||||  ||||  ||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| | | |    
11279214 catgttcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaagcacaaggtaatatgaataaagactaaactttcattgatattcaaa 11279115  T
522 ggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
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11279114 ggagttcaacaaattagggttcccatagggttacatcagattcatct 11279068  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 24783449 - 24782981
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
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24783449 gtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaattttcattcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgagagattaacaaagta 24783350  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
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24783349 attatacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggagattttaacagaacgttaa 24783250  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagct---taattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtca 400  Q
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24783249 tccctatgtcataacctaataatgatatatctctagcttgattattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtca 24783150  T
401 atcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaac 500  Q
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24783149 ttcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctatggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcatcaaacataaagtaatatggattaaaac 24783050  T
501 tagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    |||||||| ||||||| | | |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||    
24783049 tagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaactacggttcccataggattacatcagattcatct 24782981  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 294905 - 294440
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
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294905 gtatggttaagtctttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatgcaatcaatgattatctaattcaacgacagattaacaaagta 294806  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||  || | |||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||   ||||||    
294805 attatacccaatctcttgaactagaattctccccataagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaactgttggatgttttaacaaaacgttaa 294706  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 403  Q
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294705 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattc 294606  T
404 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactag 503  Q
    ||  ||||||||||   |||| | | || || ||||   |  ||||  || |||||||||  | ||  |||||||||||  |||||||||| |||| ||     
294605 aatctctaagatcaatttgcatattcataaaactagagttaatagttcatgataaacatacaataagcattaaacataaagtaatatgaattaaaattat 294506  T
504 acttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||||| ||||||| | | |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
294505 actttcattgatattcaaaggagttcaacaaactagggttcccataggattacatcagattcatct 294440  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 568
Target Start/End: Original strand, 23759732 - 23760278
Alignment:
24 tgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggtttttt-gaaaattaa-agaggtatggttaagacattcg 121  Q
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23759732 tgccctaggcagttgagttgatt-tagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaatcgagagaagtatggttaagtccttcg 23759830  T
122 aatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctatttta-agcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctctt 220  Q
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23759831 aatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctctt 23759930  T
221 gacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacct 320  Q
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23759931 gccctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaaccattggaggtattaac-gaacgttaatccctatatcataacct 23760029  T
321 aataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcc 420  Q
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23760030 aataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcggagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaata 23760129  T
421 tgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgat-atga 519  Q
    |||| | | |  | ||||||| |  ||||| || |||||| ||   ||  || ||| || ||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||  | |    
23760130 tgcatattcacgacgctaggattaatagtctatcataaacgtacataaggtactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcattaatgttca 23760229  T
520 taggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
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23760230 aaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 23760278  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 106 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 33313033 - 33312570
Alignment:
106 atggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaat 205  Q
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33313033 atggttaagtccttcgaatcctctgaagctctcctatggtaatttgctttcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacgaattaacttagtaat 33312934  T
206 tttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatc 305  Q
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33312933 tctacccaatcttttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaaatgaattcgaaaccggcggaggtattaaaagaacgttaatc 33312834  T
306 cctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaa 405  Q
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33312833 catatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacatattacctagttcagagttaaaagtcagggttagtggtcattcaa 33312734  T
406 gttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagac 505  Q
     ||||| |||||   |||| | | || ||||||||  |  ||||| || |||||||||   ||   |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |     
33312733 tttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcgatgataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaat 33312634  T
506 ttttattgat-atgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||| ||| ||  | |  ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||    
33312633 tttcattaatgttcaatggagttcaacaaattagggttcccgtaggattacatcagattcatct 33312570  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 104 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 9765842 - 9765361
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacga---------cagatt 194  Q
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9765842 gtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttcacgagtttcacggcagatt 9765743  T
195 aacaaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaaca 294  Q
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9765742 aacaaagtaactctacccaatctcttgacctataattctccctgcaagtaaaatacccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattagaggttttaaca 9765643  T
295 gtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttag 394  Q
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9765642 aaacattagtccttatgtcataacctaataatcatctatctctagcttgattacttaagttaaacttattacctagaccagagtcaaaagtcagggttag 9765543  T
395 tggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaat 494  Q
    |||||| ||||  ||   |||||   |||| |   || ||||||||  |  ||||| ||  |||||||   |||   |||||||||||  ||||||||||    
9765542 tggtcattcaa--tc---gatcaatttgcatatccataaagctagggttaatagtcgatggtaaacatgcaaaacgcattaaacataaagtaatatgaat 9765448  T
495 aaaaactagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | || | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
9765447 aaaaactagacttttattcatattcaaagaagttcaacaaattagggttctcataggattacatcatattcatctaagtctcaacca 9765361  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 23108132 - 23107554
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaa 100  Q
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23108132 aaaggatgtatttaattcaaggatgtcctagacagttgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggtttta-gaaaattaga 23108034  T
101 gaggtatg--gttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaaca 198  Q
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23108033 gagaaatgtggttaagaccttcgaatcatccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagttcaaacaatgattatttagtttcacaacagattaact 23107934  T
199 aagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtcc 298  Q
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23107933 tagtaactctacccaattccttgagctataattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaattgtttgaggtattaaaagaac 23107834  T
299 gttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggt 398  Q
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23107833 gttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagtcaaaagtctgggtcagtggt 23107734  T
399 caatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaa 498  Q
    || ||||  ||||  ||||   |||| | | || | | ||||  |  ||||| || ||||||||   ||||  |||||||| ||  |||||||||||||     
23107733 cattcaatctctactatcaatttgcatattcataacgttagggttaatagtcgatgataaacatgcaaaaagcattaaacaaaaagtaatatgaataaag 23107634  T
499 actagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
    |||| ||||| ||||| | | | |||| ||||||||   || ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
23107633 actaaactttcattgaaattcaaaggagttcaacaa---agggtttctataagattacatcaaattcatctaagtctcaacca 23107554  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 514
Target Start/End: Original strand, 36222433 - 36222918
Alignment:
24 tgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa-agaggtatggttaagacattcga 122  Q
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36222433 tgccctaggcagttgagttgatt-ttctaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattgagagaagtatggttaagtccttcga 36222531  T
123 atcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttga 222  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||  || ||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||    
36222532 atcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctagttcaatcaatgattatttagtttcactacaaattaacttagtaattttacctaatctcttga 36222631  T
223 cctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaa 322  Q
    ||||||||||| |     | | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || | ||  |||||||| |||| |||||||||||    
36222632 cctagaattctcc-----agtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacgttaatctctatgtcataacctaa 36222725  T
323 taattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctg 422  Q
    ||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||  |   | |||||| ||||||||||||  | ||||||||||| |||| ||| | |||||   ||    
36222726 taatgatctatctctaacttgattacttaggttaaatctattagctagttcagagttaaaagcgagggttagtggtcattcaatttccatgatcaatatg 36222825  T
423 caaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaa-taaaaactagacttttattga 514  Q
    ||   | || |||||||| || |||||| || |||||||||  ||||  |||||||| ||| ||||||||| |||| |||| ||||| |||||    
36222826 catgttcataaagctagggctagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaattaaagactaaactttcattga 36222918  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 23313361 - 23313671
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||| || ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||  |||||||| |    
23313361 aaaggatgtattaaattcaagggtgccctaggtagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagaatggtttta-gaaaattaga 23313459  T
101 gag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaaca 198  Q
    |||  ||||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| |  || ||| |||||||    
23313460 gagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctaggttcacaacatattaaca 23313559  T
199 aagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtcc 298  Q
      |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| || |   || || |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||  |    
23313560 ctgtaactctacccaatctcttggcctagaattctccccgcaagtggaaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggttttaacagaac 23313659  T
299 gttaatccctat 310  Q
    ||||| ||||||    
23313660 gttaacccctat 23313671  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 390 - 580
Target Start/End: Original strand, 23313692 - 23313883
Alignment:
390 gttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataata 489  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||   |||| | | || ||||||||  |||||||| || |||||||||  ||||  |||||||||||  ||| |    
23313692 gttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggtttgtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaaca 23313791  T
490 tgaataaaaactagacttttattgatatg-ataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
23313792 tgaataaagactagactttcattgatattcaaaggagtttaacaaattagagttcccataagattacatcggattcatctaagtctcaacca 23313883  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 586 - 667
Target Start/End: Original strand, 26809172 - 26809253
Alignment:
586 gaaattagctagacatagaaatataaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgttcctcatttctct 667  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
26809172 gaaattagctagacatagagatacaaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaacaggttgttcctcaattctct 26809253  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2719435 - 2719331
Alignment:
253 ttaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttag 352  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | ||  ||||||||  || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||     
2719435 ttaatctcttaagtgaattcaaaaccgttggaggtttttatagatcgttaatctataaatcataacttaacaattgtctatctctagcttaattaattaa 2719336  T
353 gttaa 357  Q
    |||||    
2719335 gttaa 2719331  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27796726 - 27796634
Alignment:
253 ttaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgt--taatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaa 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || || |  ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
27796726 ttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaa-agaccattataatcgctaaatcataacttaacaattgtctatctctagcttaa 27796634  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 580
Target Start/End: Original strand, 35773117 - 35773213
Alignment:
485 taatatgaataaaaactagacttttattgatatg-ataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  | | || ||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||    
35773117 taatatgaataaaaactaaactttcattgacattcaaatgagttcaacaaattagagttcttataggattacataagattcatctcagtctcaacca 35773213  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 22083300 - 22083341
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtt 42  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
22083300 aaaggatatattaaattcaatggtgccctaggcagttgagtt 22083341  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 345
Target Start/End: Original strand, 26075710 - 26075810
Alignment:
245 acaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaa 344  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || |||| ||  ||||| ||   || ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
26075710 acaatacattaatctcttaagtgcatccgtaaccgttaaaggttatagttgtgcgttaattcctatatcataactcaataattttctatctctaacttaa 26075809  T
345 t 345  Q
    |    
26075810 t 26075810  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 345
Target Start/End: Original strand, 26099497 - 26099597
Alignment:
245 acaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaa 344  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || |||| ||  ||||| ||   || ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
26099497 acaatacattaatctcttaagtgcatccgtaaccgttaaaggttatagttgtgcgttaattcctatatcataactcaataattttctatctctaacttaa 26099596  T
345 t 345  Q
    |    
26099597 t 26099597  T

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Target: chr1 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 13493303 - 13492838
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
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13493303 gtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 13493204  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
13493203 attctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacagaacgttaa 13493104  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 403  Q
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13493103 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattc 13493004  T
404 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactag 503  Q
    ||  ||||||||||   |||| | | || ||||||||  | |||||| || |||||||||  ||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||    
13493003 aatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactag 13492904  T
504 acttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||||| ||||||| | | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
13492903 actttcattgatattcaaaggagttcaacaaactagggttcccataagattacatcaaatttatct 13492838  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 34066489 - 34065908
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||  |||||||| |    
34066489 aaaggatgtattaaattcaagggtgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggtttta-gaaaattaga 34066391  T
101 gag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaaca 198  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
34066390 gagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgatagattaaca 34066291  T
199 aagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtcc 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| || | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
34066290 aagtaattctacccaatctcttgaccttgaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacagaac 34066191  T
299 gttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggt 398  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| |   |||||| | ||||| ||||||| | |||||||||    
34066190 gttaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacttattacctaggtcagagtcaaaagccagggttagtggt 34066091  T
399 caatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaa 498  Q
    || | ||  ||||||||||   |||| | | || ||||||||  | |||||| || |||||| ||  ||||  |||||||||||  |||||||||| |||    
34066090 catttaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacgtacaaaaagcattaaacataacgtaatatgaattaaa 34065991  T
499 actagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
    |||||| ||| ||||||| | | |  | |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||    
34065990 actagattttcattgatattcaaaaaagttcaacaaattaggattcccataagattacatcaagttcatcaaagtcttaacca 34065908  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 13496028 - 13495563
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
13496028 gtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctactttaacgacagattaagaaagta 13495929  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||    
13495928 attatatccaatctcttgacctagaattctacccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttagcagaacgttaa 13495829  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||| | ||||| ||||||  | ||||||||||| ||    
13495828 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagctagggttagtggtcattc 13495729  T
404 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactag 503  Q
    ||  ||||||||||   |||| | | || ||||||||  | |||||| || |||||||||  ||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||    
13495728 aatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactag 13495629  T
504 acttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||||| ||||||| | | |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
13495628 actttcattgatattcaaaggagttcaacaaactagggttcccataggattacatcatatttatct 13495563  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Original strand, 27282312 - 27282777
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
27282312 gtatggttaagactttcgaattctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagttcaacgaccgattaacaaagta 27282411  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| || |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||  ||||||    
27282412 attctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggttttaaaagaacgttaa 27282511  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||| | ||||| |||| || | ||||||||||| ||    
27282512 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaatccagggttagtggtcattc 27282611  T
404 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactag 503  Q
    ||  ||||||||||   | || | | || ||||||||  | |||||| || ||||| |||  ||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||    
27282612 aatctctaagatcaattttcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaagatacaaaaaggattaaacataaagtaatatgaattaaaactag 27282711  T
504 acttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||||| ||||||| | | |||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||    
27282712 actttcattgatattcaaaggtgttcaacaaattagggttcccataggattatatcagattcatct 27282777  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 51 - 568
Target Start/End: Original strand, 32506005 - 32506523
Alignment:
51 taacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaagag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaat 148  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| ||||  || |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||    
32506005 taacataaacgaattaaaaacaataaaagtt-ggttttaagaatattatagagaagtgtggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaat 32506103  T
149 ttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaa 248  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||    
32506104 ttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaa 32506203  T
249 tccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattac 348  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
32506204 ccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaacagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgacctatctctagcttgattac 32506303  T
349 ttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtag 448  Q
    ||| ||||||| |   |||||| | ||||| ||||| | | ||||||||||| ||||  |||||||||    |||| | | || ||||||||  | ||||    
32506304 ttaagttaaacttattacctagatcagagtcaaaagtcagggttagtggtcattcaatctctaagatcgatttgcatattcataaagctagggttagtag 32506403  T
449 tcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgatat---gataggaattcaacaaattagagttccc 545  Q
    || || |||||||||  ||||  |||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| ||||||||    | |||| ||||||||| ||| ||||||    
32506404 tcgatgataaacatacaaaaaacattaaacataaagtaatat---ttaaaactagactttcattgatattcaaaaaggagttcaacaaactagggttccc 32506500  T
546 ataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||| |||||||||| ||||||||    
32506501 ataggattacatcagattcatct 32506523  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39546388 - 39546028
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaat-gttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||  || ||||||| |||||  |   ||||||||||||  | ||||||   || ||||     
39546388 aaaggatgtattaaattcaattgttgccctaggcagttggattggtttttgtaacgtaaacgcaaataaaacaataaaagtt-ggttttaaaaatattag 39546290  T
100 agag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaac 197  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
39546289 agagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttcacgacagattaac 39546190  T
198 aaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtc 297  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| || |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||      
39546189 aaagtaactctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaatcgttggaggttttaatagaa 39546090  T
298 cgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaac 359  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||    
39546089 cgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaagttaaac 39546028  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 580
Target Start/End: Original strand, 16190279 - 16190858
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaa 100  Q
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16190279 aaaggatgtattaaattcaatggtgccctaggaaattgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataaag-attggtttta-gaaaattaaa 16190376  T
101 gag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaaca 198  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
16190377 gagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcttaattcaagcaatgattatctagtttaacgacaaattaaca 16190476  T
199 aagtaat-tttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatcc----attaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaac 293  Q
    || |||| | ||||||||||||||||| | |||||| |||   | | |||| ||    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||         
16190477 aaataatatatacccaatctcttgacccataattctccccacgagtgacaaccccttaattaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtt----- 16190571  T
294 agtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgtta 393  Q
          ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||| |   |||||| | |||||||||||||   ||||    
16190572 ------ttaatccctatgtcataacctaatattgatctatctctaacttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagttaaaagccaaggtta 16190665  T
394 gtggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaa 493  Q
    |||||||  |||  |||| |||||   |||| | | || |||||| |  | |||||| || |||||||||  ||||  |||||||||||  |||||| ||    
16190666 gtggtcatccaatctctaggatcaatttgcatattcataaagctaaggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatataaa 16190765  T
494 taaaaactagacttttattgat------atgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
    | ||||||||||||| ||||||      || | |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
16190766 ttaaaactagactttcattgatattcaaattaaaggagttcaacaaattagggttcctataagattacatcagattcatctaagactcaacca 16190858  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 1936770 - 1936191
Alignment:
5 gatgtattaaattcaatg--ttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacaga-ttaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaag 101  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||  |||||| | ||||||  |||||||| ||    
1936770 gatgtattaaattcaatgggttgacctaggcagttgagttgattgttgtatcataaactgaattaaaaacggtaaaattttggtttta-gaaaattagag 1936672  T
102 ag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaa 199  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
1936671 agaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatctagcttcacgaaagattaacaa 1936572  T
200 agtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccg 299  Q
    ||||| | |||| ||||||||||  || | |||| |||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| | || |||||||||| ||   |    
1936571 agtaactctaccaaatctcttgatttatagttctccccgcaagtaacaatcccttaatctcttaagtgaatttgaaa-cgtttgaggttttaaaagaatg 1936473  T
300 ttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtc 399  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||| |   |||| | | | | |  ||||||   ||||||||||    
1936472 ttattccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcatgattacttaggttaaacttattacctggatcaaattcgaaagccatggttagtggtc 1936373  T
400 aatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaa 499  Q
    | | ||  ||||||||||   | || | | || ||| ||||  | |||||| || |||||||||  ||||  |||||||||||  |||||||||| ||||    
1936372 atttaatctctaagatcaattttcatattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaa 1936273  T
500 ctagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
    ||||||||  ||||||| | | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
1936272 ctagacttccattgatattcaaaggagttcaacaaattatggttcccataagattacatgagattcatctaagtctcaacca 1936191  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 105 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21153295 - 21152987
Alignment:
105 tatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaa 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || | |||   |||||||||||||| || | || || ||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||||    
21153295 tatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttaaatggtaatttgcacccccaattcaatcaatgttcatttagtttaacgacagattaacacagtaa 21153196  T
205 ttttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaat 304  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||  ||| || | |||| || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
21153195 ttctactcaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatttgaaacctttggaggttttaatagtccgttaat 21153096  T
305 ccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatca 404  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||| | ||||| ||||| | | | ||||||||| |||    
21153095 ccctaaatcataacctaataactgtctatctctagcttaattacttaggttaaatatattccctagatcagagtcaaaagtcagggctagtggtcattca 21152996  T
405 agttctaag 413  Q
    |||||||||    
21152995 agttctaag 21152987  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 405
Target Start/End: Original strand, 23990361 - 23990594
Alignment:
172 attatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaatt 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || | |||| || |||| ||||||| ||||||    
23990361 attatctagttcaacgacagattaacaaagtaattctacccaatcacttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaaactcttaagtgaatt 23990460  T
272 cgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagt 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||     
23990461 cgaaaccgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatcaatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctaga 23990560  T
372 ttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaa 405  Q
    | ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||    
23990561 tcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaa 23990594  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 408
Target Start/End: Original strand, 22453415 - 22453644
Alignment:
179 agttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaacc 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| || | |||| || |||||||||||| ||||||||||||     
22453415 agtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaact 22453514  T
279 attggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagt 378  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||  | |||||    
22453515 gttggaggttttaacagtccgttaatccatgagtcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaacctattacctaaatcagagt 22453614  T
379 taaaagccggtgttagtggtcaatcaagtt 408  Q
     ||||||| | | ||||||||| |||||||    
22453615 caaaagccagggctagtggtcattcaagtt 22453644  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 418
Target Start/End: Original strand, 22456699 - 22457009
Alignment:
106 atggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaat 205  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||| || ||||||  || ||||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
22456699 atggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtacccctattc-aatcaatgttcgtctagtttaacgacagactaacaaagtaat 22456797  T
206 tttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatc 305  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||  | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
22456798 tctacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaactc-ttaatctcttaagtgaattcgaaactgttggaggttttaacagtccgttaatc 22456896  T
306 cctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaa 405  Q
    | |   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |   |||||    ||||| ||||| | | | ||||||||| ||||    
22456897 catgagtcataacctaataattttctatctcttgcttaattacttaggttaaacctattacctaaaacagagtcaaaagtcagggctagtggtcattcaa 22456996  T
406 gttctaagatcag 418  Q
    |||||||||||||    
22456997 gttctaagatcag 22457009  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 105 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 15297371 - 15297060
Alignment:
105 tatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaa 204  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| || |||||   | |||||||||||| || |||  || ||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
15297371 tatgattaagaccttcgaatcctccgatgttcttccacggtaatttgcaccccaattc-aatcaatattcatctagtttaacgacagattaacaaagtaa 15297273  T
205 ttttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaat 304  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  | | || | |||| || | |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
15297272 ttctacccaatctcttgacctagaattctctctgcaagtgacaacccttaaatctcttaagtgaatttgaaactgttggaggttttaacagtccgttaat 15297173  T
305 ccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatca 404  Q
    || |   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |   |||||| | ||| | ||||||| | | ||||||||| |||    
15297172 ccatgagtcataacctaataattttctatctctaacttaattacttaggttaaaactattacctagatcagattcaaaagccagagctagtggtcattca 15297073  T
405 agttctaagatca 417  Q
    |||||||||||||    
15297072 agttctaagatca 15297060  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10764960 - 10764831
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
10764960 gtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaacttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 10764861  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattct 233  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
10764860 attctacccaatctcttgacctagaattct 10764831  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 211 - 417
Target Start/End: Original strand, 22104683 - 22104887
Alignment:
211 ccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || | |||  || |||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||| ||  |||||||||||||    
22104683 ccaatctcttgacctagaattctccccgtaagtgacagacc-ttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggtattaa-agaacgttaatccctat 22104780  T
311 atcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttct 410  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   || ||||| |||||||||| || |  |||||||||| |||| ||||    
22104781 gtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacatagttcagagttaaaaaccagaattagtggtcattcaatttct 22104880  T
411 aagatca 417  Q
    | |||||    
22104881 atgatca 22104887  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 266 - 355
Target Start/End: Original strand, 4204979 - 4205068
Alignment:
266 tgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggtt 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||    
4204979 tgaattcgaaaccgttggaggttttaatagtccgttaatccctaaactataacctagcaattgtctatctctagcttaattgattaggtt 4205068  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 23990235 - 23990322
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggtttt 88  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
23990235 aaaggatgtattaaattcagtaatgctctaggcagttgagttaatttttgtaacatatacggattaaaaacaataaaagataggtttt 23990322  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 8435380 - 8435303
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaa 78  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
8435380 aaaggatgtattaaattcaagagtgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacataataaaaacaataaaa 8435303  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 49147936 - 49147825
Alignment:
106 atggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaat 205  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||| || ||||||  || ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
49147936 atggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtacccctattc-aatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaat 49147838  T
206 tttacccaatctc 218  Q
    | |||||||||||    
49147837 tctacccaatctc 49147825  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 10759816 - 10759697
Alignment:
450 caataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgatatg-ataggaattcaacaaattagagttcccata 548  Q
    |||| |||||||||  ||||  || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||    
10759816 caatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccata 10759717  T
549 agattacatcatattcatct 568  Q
     |||||||||| ||||||||    
10759716 ggattacatcagattcatct 10759697  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 565
Target Start/End: Original strand, 23990633 - 23990754
Alignment:
445 gtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgatatg-ataggaattcaacaaattagagttc 543  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||  ||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||  |  ||||  | |||| ||||||||||||| ||||    
23990633 gtagtcaatgataaacatacaaaaaacattgaagataatataatgtgaattaaaactagactttcttaaatattcagaggagttcaacaaattagtgttc 23990732  T
544 ccataagattacatcatattca 565  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
23990733 ccataagattaaatcagattca 23990754  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 344
Target Start/End: Original strand, 14546740 - 14546829
Alignment:
255 aatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||  | |||||||||| ||| |||||||  ||| |||| || ||| |||||||||    
14546740 aatctcttaaatgagttcgaaatatttggaggttttagtattccgttaatctctaaatcataatttaacaattatccatcactagcttaa 14546829  T

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Target: chr6 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 14790659 - 14790194
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
14790659 gtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 14790560  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
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14790559 attctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaa 14790460  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 403  Q
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14790459 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattt 14790360  T
404 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactag 503  Q
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14790359 aatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactag 14790260  T
504 acttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
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14790259 actttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 14790194  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 14795687 - 14795222
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
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14795687 gtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 14795588  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
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14795587 attctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaa 14795488  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 403  Q
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14795487 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattt 14795388  T
404 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactag 503  Q
    ||  |||||||||||  |||| | | || ||||||||  | ||||||||| |||||||||  ||||  || ||||||||  |||||||||| ||||||||    
14795387 aatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactag 14795288  T
504 acttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||||| | ||||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
14795287 actttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 14795222  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 588
Target Start/End: Original strand, 20527266 - 20527852
Alignment:
5 gatgtattaaattcaatg-ttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagat-taaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaaga 102  Q
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20527266 gatgtattaaattcaaaggttgccctaggcagttgaattgatttttgtaacgtaaacataaataaaaacaataaaagtt-ggttttaagaatattagaga 20527364  T
103 g--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaa 200  Q
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20527365 gaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctaacttcacgacagattaacaaa 20527464  T
201 gtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgt 300  Q
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20527465 ttaactttacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtaacaa-cccttaatctcttaagtgaatttgaaaccgttggaggttttaacagaacgt 20527563  T
301 taatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtca 400  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||    
20527564 taatccctatgtcataatctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcagagtcaaaagccagggttagtggtca 20527663  T
401 atcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaac 500  Q
     ||||  ||||| ||||   |||| | | || ||||||||  | | |||| || |||||||||  ||||  |||||| ||||  ||||||||||||| |     
20527664 ttcaatctctaaaatcaatttgcatattcataaagctagggttaggagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaatataaagtaatatgaataaagat 20527763  T
501 tagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaaccaaaagagaa 588  Q
    |||||||| ||||||| | | |||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
20527764 tagactttcattgatattcaaaggagttcaacacattaaggttcccataaaattacatcagattcatctaggtctcaaccaaaaaagaa 20527852  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Original strand, 32704459 - 32704923
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
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32704459 gtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacagagta 32704558  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
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32704559 attctacccaatctcttgaaatagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaa 32704658  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 403  Q
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32704659 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctatcttgattacttaggttaaacttattacttagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattt 32704758  T
404 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactag 503  Q
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32704759 aatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaaacattaaacataaagtaat-tgacttaaaactag 32704857  T
504 acttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
32704858 actttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 32704923  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 580
Target Start/End: Original strand, 19664766 - 19665346
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaa 100  Q
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19664766 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggtttaa-gaaaattaga 19664864  T
101 gag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaaca 198  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | |||||||||||||    
19664865 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagttca-cgacagattaaca 19664963  T
199 aagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtcc 298  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||| || |||||  || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||  |    
19664964 aagtaactctacccaatatcttgacctagagttctccccgcaagtaacatccccttaatctcttaagtgaattcgaaatcattggagattttaatagaac 19665063  T
299 gttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggt 398  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| |   |||||| | ||| ||||||| | | ||||||| |    
19665064 gttaatccctatgtcataacctaat-atgatctatctctatcttgattacttaggttaaacctattacctagatcagaattaaaagtcagggttagtgat 19665162  T
399 caatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaac-ataagaaaattattaaacataagataatatgaataaa 497  Q
    || ||||  ||||| ||||   |||| | | || ||||||||  | |||||| || |||||| |||  ||||  ||| |||| ||  |||||||||||||    
19665163 cattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaa 19665262  T
498 aactagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
    ||||||||||| ||||| | | | | || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
19665263 aactagactttcattgacattcaaatgagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcagtctcaacca 19665346  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 16883820 - 16883241
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaa 100  Q
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16883820 aaaggatgtattaaattcaagggttccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggtttta-gaaaattaga 16883722  T
101 gag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaaca 198  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||  |  |||| |||||||||    
16883721 gagaagtatggttaagacattcgaatccttcgaagttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctatgttcacgaaagattaaca 16883622  T
199 aagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtcc 298  Q
     | |||   |||||||||||||||||||||||||| |||  || |  ||| || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |    
16883621 caataaccctacccaatctcttgacctagaattctccccacaagtggcaaccccttaatctcttatgtgaattcaaaaccgttggaggttttaacagaac 16883522  T
299 gttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggt 398  Q
     |||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||| ||||| |||||   | |||||||||    
16883521 attaatccctat-gcatcacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcagagtcaaaagtgagggttagtggt 16883423  T
399 caatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaa 498  Q
    || ||||  ||||||||||   |||| | | || ||||||||  | |||||| || |||||||||  ||||  |||||| ||||  ||| |||||||||     
16883422 cattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaagataaagtaacatgaataaag 16883323  T
499 actagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacc 579  Q
    |||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||    
16883322 actagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttctcataaaattacatcagattcatttaagtcttaacc 16883241  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 104 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 1838514 - 1838037
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
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1838514 gtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatg-taattcgcactcctagttcaatcaacgattatttagttcaacgacagattaacaaagta 1838416  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||  | |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||    
1838415 actctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaactccttaatctcttaagtgaatttgaaaccattggagattttaacataacgttaa 1838316  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||| | ||||| ||||| | | ||||||||||| ||    
1838315 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaagtcagggttagtggtcattc 1838216  T
404 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaac-ataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaacta 502  Q
    ||  ||||| ||||   |||| | | || ||| ||||  | |||||| || |||||| |||  ||||  ||| |||| ||  ||||||||||||||||||    
1838215 aatctctaacatcaatttgcatattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaacta 1838116  T
503 gacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
    |||||| ||||| | | | |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
1838115 gactttcattgacattcaaaggagttcaataaattagggttcccataggattacatcagattcatctcagtctcaacca 1838037  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 568
Target Start/End: Original strand, 13017313 - 13017859
Alignment:
24 tgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggtttttt-gaaaattaa-agaggtatggttaagacattcg 121  Q
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13017313 tgccctaggcagttgagttgatt-tagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttcagaaaattgagagaagtatggttaagtccttcg 13017411  T
122 aatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattt-taagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctctt 220  Q
    |||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||  | | | |||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    
13017412 aatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatatgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctctt 13017511  T
221 gacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacct 320  Q
    ||||||||||||| |||| || | |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
13017512 gacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaac-gaacgttaatccctatatcataacct 13017610  T
321 aataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcc 420  Q
    ||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| |   ||||| || |||||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||       
13017611 aataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaagagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaata 13017710  T
421 tgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgat-atga 519  Q
    |||| | | || | ||||||  |  ||||| || |||||| ||   ||   ||||| || ||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||  | |    
13017711 tgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcatttatgttca 13017810  T
520 taggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
13017811 aaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 13017859  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 106 - 418
Target Start/End: Original strand, 12983586 - 12983897
Alignment:
106 atggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaat 205  Q
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12983586 atggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatctgtacccctattc-aatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaat 12983684  T
206 tttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatc 305  Q
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12983685 tctacccaatctcttgaccttgaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacagtccgttaatc 12983784  T
306 cctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaa 405  Q
    | | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||| ||||| | | | ||||||||| ||||    
12983785 catgtgtcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcagggctagtggtcattcaa 12983884  T
406 gttctaagatcag 418  Q
    |||||||||||||    
12983885 gttctaagatcag 12983897  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 418
Target Start/End: Original strand, 12980699 - 12981010
Alignment:
106 atggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaat 205  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||  |||||| || ||||||  || ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
12980699 atggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatttgtacccctattc-aatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaat 12980797  T
206 tttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatc 305  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||| || | |||| |  |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
12980798 tctacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccgcttaatctcttaagtgaattcgaaattgttggaggttttaacagtccgttaatc 12980897  T
306 cctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaa 405  Q
    | |   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||| ||||| | | | ||||||||| ||||    
12980898 catgagtcataacctaatacttttctatctctagcttaattacttaggttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcagggctagtggtcattcaa 12980997  T
406 gttctaagatcag 418  Q
    |||||||||||||    
12980998 gttctaagatcag 12981010  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 63 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 22221807 - 22221300
Alignment:
63 attaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa-agaggtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctatt 161  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| ||||||| | ||| | ||||||||| | ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||      
22221807 attaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaa 22221708  T
162 tt-aagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctc 260  Q
    |  || |||||||||| ||||   ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| || ||||||||    
22221707 tacaatcaatgattatttagtatcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctc 22221608  T
261 ttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaaca 360  Q
    | || |||||||||||||||| ||||  ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||     
22221607 tcaagtgaattcgaaaccattagaggaattaaacaaacgttaatccatatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacc 22221508  T
361 ttccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaac 460  Q
    |   ||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||   |||| | | || ||||||||  |  ||||| || ||||||    
22221507 tattaccttttttagatttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaac 22221408  T
461 ataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgat-atgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatca 559  Q
    |||   ||   |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||  | | | || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
22221407 atacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaagagttcaacaaattagggtt-ccataggattacatca 22221309  T
560 tattcatct 568  Q
     ||||||||    
22221308 gattcatct 22221300  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15535200 - 15534923
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||  | ||||||   |||||||||    
15535200 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttgagttgatt-ttgtaaaacaaatagattaaaaacaataaaagtttggttttac-aaaattaaa 15535103  T
101 gag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaaca 198  Q
    | |  ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
15535102 gtgatgtatggttaagaccttcaaatcctccgaagttttcctatggtaatttgcattcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaaca 15535003  T
199 aagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaacc 278  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
15535002 aagtaactctaaccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaacctcttaatctcttaagtgaattcgaaacc 15534923  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 63 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 22247642 - 22247135
Alignment:
63 attaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa-agaggtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctatt 161  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| ||||||| | ||| | ||||||||| | ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||      
22247642 attaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaa 22247543  T
162 tt-aagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctc 260  Q
    |  || |||||||||| ||||   ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| || ||||||||    
22247542 tacaatcaatgattatttagtatcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctc 22247443  T
261 ttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaaca 360  Q
    | || |||||||||||||||| ||||  ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||     
22247442 tcaagtgaattcgaaaccattagaggaattaaacaaacgttaatccatatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacc 22247343  T
361 ttccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaac 460  Q
    |   |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||   |||| | | || |||||| |  |  ||||| || ||||||    
22247342 tattacctggttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctatggttaatagtctatcataaac 22247243  T
461 ataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgat-atgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatca 559  Q
    |||   ||   |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||  | | | || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
22247242 atacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaaccaaactttcattgatgttcaaaagagttcaacaaattagggtt-ccataggattacatca 22247144  T
560 tattcatct 568  Q
     ||||||||    
22247143 gattcatct 22247135  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 361
Target Start/End: Original strand, 7769594 - 7769857
Alignment:
105 tatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaa 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || | |||  ||||||||||||||| |  | || || ||||| | || ||||| ||||||| |||||||||||||    
7769594 tatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttatatggtaatttgcaccctcaattcaatcaatgttcatttagtttaacgacatattaacaaagtaa 7769693  T
205 ttttacccaatctcttgacctag----aattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaa---atgaattcgaaaccattggaggttttaacagtc 297  Q
    || ||| |||||| |||||||||    ||||||  | | || |   || || |||||||||| |   |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
7769694 ttctactcaatcttttgacctagctataattctctctgcaagtgctaaccccttaatctcttcagtgatgaattcgaaatctttggaggttttaacagtc 7769793  T
298 cgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacat 361  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
7769794 cgttaatccctaaatcataacctaataattgtctatctctaacttaattacttaggttaaacat 7769857  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15538158 - 15538040
Alignment:
208 tacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccc 307  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
15538158 tacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaacaccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaacagaacgttaatccc 15538059  T
308 tatatcataacctaataat 326  Q
    ||| ||||||| |||||||    
15538058 tatgtcataacttaataat 15538040  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Original strand, 30978335 - 30978551
Alignment:
24 tgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggtttttt-gaaaattaa-agaggtatggttaagacattcg 121  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||  ||||||| | ||| ||||||||||| | ||||    
30978335 tgccctaggcagttgagttgatt-tagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattgagagaagtatggttaagtccttcg 30978433  T
122 aatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcct-attttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctctt 220  Q
    |||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||| | |   | |||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    
30978434 aatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctctt 30978533  T
221 gacctagaattcttcccg 238  Q
    ||||||||||||| ||||    
30978534 gacctagaattctccccg 30978551  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 253 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 32427258 - 32426944
Alignment:
253 ttaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttag 352  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| || |||||||||    
32427258 ttaatctcttaagtgaattcaaaaccgttggaggtattaacagaatgttaatccctatgtcataacataataatgatctatctctagattgattacttag 32427159  T
353 gttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaa 452  Q
    ||||||| |   |||||| |   ||| |||| || | ||||||||||| ||||  |||||||||    |||| |||  | |||| |||  | || ||| |    
32427158 gttaaacttattacctagat--cagtcaaaatccagagttagtggtcattcaatctctaagatcgatttgcatactcctaaagccagggttagtggtcga 32427061  T
453 taataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataaga 551  Q
    | |||||||||  ||||  |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||| ||| |||| |||| ||    
32427060 tgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatataaattaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaactagggttctcatagga 32426961  T
552 ttacatcatattcatct 568  Q
    ||| |||||||||||||    
32426960 ttatatcatattcatct 32426944  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 586 - 658
Target Start/End: Original strand, 20189867 - 20189939
Alignment:
586 gaaattagctagacatagaaatataaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgttcct 658  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20189867 gaaattagctagacatagagatacacataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgttcct 20189939  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 586 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 22146124 - 22146052
Alignment:
586 gaaattagctagacatagaaatataaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgttcct 658  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22146124 gaaattagctagacatagagatacacataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgttcct 22146052  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 586 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 16731057 - 16730976
Alignment:
586 gaaattagctagacatagaaatataaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgttcctcatttctct 667  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
16731057 gaaattagctagacatagagatacaaataaatagcatgaaaactaaaattaaccatgaaaacatgttgttcctcaattctct 16730976  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15540714 - 15540578
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaa-tataggttttttgaaaattaa 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| || ||| |||||  ||||||||||||||||| | |||  |||| |||||||||    
15540714 aaaggatgtattaaattcaaggtttccctaggcagttgagttgatt-ttctaaaataaagggattaaaaacaataaaagtttag--ttttagaaaattaa 15540618  T
100 agag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttct 137  Q
    ||||   |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
15540617 agagatttatggttaagaccttcgaatcctccgaagttct 15540578  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 485 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 15534748 - 15534652
Alignment:
485 taatatgaataaaaactagacttttattgatatg-ataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||    
15534748 taatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaatctcaacca 15534652  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 488 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 15537940 - 15537847
Alignment:
488 tatgaataaaaactagacttttattgatatg-ataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
15537940 tatgaataaaaattagactttcattgacattcaaaggagttcaacaaattagggttcccatatgattacatcaaattcatctcagtctcaacca 15537847  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15540579 - 15540529
Alignment:
154 ctcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaa 204  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
15540579 ctcctaatttaatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagtaa 15540529  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 27649143 - 27649077
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaat 170  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||    
27649143 gtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcacttctaattcaagcaat 27649077  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32427441 - 32427278
Alignment:
5 gatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaagag- 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||  ||  |  |||||| ||||||  |||||||||||| |||  | ||||||  |||||||| ||||     
32427441 gatgtattaaattcaaggttgccctag-cagttggattggtatttgtaaaataaacgaattaaaaacaatgaaagtttggtttta-gaaaattagagaga 32427344  T
104 -gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagca 168  Q
     || || ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||    
32427343 tgtttgattaagacctttgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagca 32427278  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 11183937 - 11184014
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaa 78  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||||||    
11183937 aaaggatgtattaaattcaagagttccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacgtaataaaaacaataaaa 11184014  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 28118094 - 28118053
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtt 42  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
28118094 aaaggatatattaaattcaatggtgccctaggcagttgagtt 28118053  T

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Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 580
Target Start/End: Original strand, 12575400 - 12575981
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| |    
12575400 aaaggatgtattaaattcaatggtgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaattgattaaaaacaataaaagattggtttta-gaaaattaga 12575498  T
101 gag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaaca 198  Q
    |||  |||||||||||||  | |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
12575499 gagaagtatggttaagaccattgaatcctccgaagttttcttatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgataatctagtttaacgacagattaaca 12575598  T
199 aagtaattttacccaatctctt-gacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtc 297  Q
    |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||| |||| || |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |     
12575599 aagtaattctacctaatctcttaaacctagaattctccccgcaagtaacaa-cccttaatctcttaagtgaattagaaaccattggaggttttaacaata 12575697  T
298 cgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtgg 397  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||| |   |||| | | | ||| |||||||   |||||| |    
12575698 cgttaatccttatatcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttatgttaaacctattaccttgatcaaagtcaaaagccaaggttagtag 12575797  T
398 tcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaa 497  Q
    ||| ||||  ||||||||||   |||| | | || ||| |||| || || ||  || ||||| |||  ||||   || |||| ||  |||||||||||||    
12575798 tcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggctagttgttgatgataaagatacaaaaagcgttgaacacaaagtaatatgaataaa 12575897  T
498 aactagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
    ||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
12575898 aactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcctataggattacatcagattcatctaagtctcaacca 12575981  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 86 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 13097081 - 13096594
Alignment:
86 tttttgaaaattaaagag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagtta 183  Q
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13097081 ttttagaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttatcctatg-taatttgcactcctaatttaagcaatgattatctagttc 13096983  T
184 aacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattgg 283  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| || | |||| || ||||| |||||| |||||| |||||| | ||    
13096982 aatgaaagattaacaaagtaattctacccaatctcttggcctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatgtcttaagtgaatttgaaaccgtggg 13096883  T
284 aggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaa 383  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||| |   |||||| | ||||||||||    
13096882 aggttttaacagaacgtaaatccctatgtcataatctaataatgatctatctctagcttgattacttagcttaaacttattacctaggtcagagttaaaa 13096783  T
384 g--ccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacata 481  Q
    |  | || ||||||| ||| ||||  ||||||||||   |||| | | || ||||||||  | |||||| || |||||||| | ||||  |||||||       
13096782 ggccaggagttagtgatcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggatagtagtcgatgataaacat-acaaaagcattaaac--- 13096687  T
482 agataatatgaataaaaactagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
           || ||| ||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
13096686 -------atcaattaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaataaatcagggttcccataggattacatcaggttcatctaagtctcaacca 13096594  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Original strand, 41778847 - 41779194
Alignment:
5 gatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaagag- 103  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| || | |||   ||| |||||||||     
41778847 gatgtattaaattcaagggtgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattgattta--gaagattaaagaga 41778944  T
104 -gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagt 202  Q
     ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||  |||| |||||||||||  || || || |||||||||||||| |  |||||||||||||| | |    
41778945 agtatggttaagaccttcaaatcttccgaagttctcctatgctaatttgcactagtaattcaaacaatgattatctaggttcacgacagattaacacaat 41779044  T
203 aattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgtta 302  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||    | |||     | |  || |    
41779045 aactctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtggcaaccccttaatatcttaagtgaattcaaaacca--aaatgtt-----attatgtca 41779137  T
303 atccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaac 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
41779138 atccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaac 41779194  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14418609 - 14418451
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatg-ttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa 99  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||  |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||  ||| ||||     
14418609 aaaggatatgttaaattcaatggttgccctaggcagttgagttggttttt--aacataaacaaattaaaaacaataaaagtt-ggttttaagaatattag 14418513  T
100 agag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactccta 159  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||    
14418512 agagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaatttctcctatgataatttgcactccta 14418451  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 44008335 - 44008087
Alignment:
105 tatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaa 204  Q
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44008335 tatggttatgaccttcgaatcctccgaagctcgcctttggtaatctgcactcctagttcaaacaatgattatttagtttcacgatagatta-----gtaa 44008241  T
205 ttttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaat 304  Q
     | |||| |||| || ||||||||||||| |||| || | ||||  | |||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |||| ||  |||||||    
44008240 ctctaccaaatccctcgacctagaattct-cccgcaagtgacaactccttaatctcataagtgaatttgaaatcgttggaggtattaaaagaacgttaat 44008142  T
305 ccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaac 359  Q
    |||| | || |||||||| |||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
44008141 ccctgtgtcgtaacctaacaatgatctatttctagcttgattagttaggttaaac 44008087  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 169
Target Start/End: Original strand, 41836429 - 41836492
Alignment:
106 atggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaa 169  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||| |||||    
41836429 atggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcataattttagcaa 41836492  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14418395 - 14418355
Alignment:
298 cgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctcta 338  Q
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14418395 cgttaatccctatatcataatctaataatgatctatctcta 14418355  T

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Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 548
Target Start/End: Original strand, 23673445 - 23673994
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||     |||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||  |||||||| |    
23673445 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggtttta-gaaaattaga 23673543  T
101 gag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaaca 198  Q
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23673544 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgacaaattaaca 23673643  T
199 aagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtcc 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  | |||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |    
23673644 aagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaacagttggaggttttaacagaac 23673743  T
299 gttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggt 398  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||| | ||||| ||||| | | | |||||||    
23673744 gttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagtcagggatagtggt 23673843  T
399 caatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaa 498  Q
    || ||||  ||||||||||   |||| | | || ||| ||||  | |||||| || |||||||||  ||||  |||||||||||  |||||||||| |||    
23673844 cattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaa 23673943  T
499 actagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccata 548  Q
    |||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||  |||||||||    
23673944 actagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattaaggttcccata 23673994  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 16295019 - 16294550
Alignment:
24 tgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa-agaggtatggttaagacattcga 122  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||  |||||  ||||||| | ||| ||||||||||| | |||||    
16295019 tgccctaggcagttgagttgatt-ttgtatcataaaccgattaaaaacaaataaagattagttttcagaaaattgagagaagtatggttaagtccttcga 16294921  T
123 atcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttga 222  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
16294920 atcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagtttaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctcttga 16294821  T
223 cctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaa 322  Q
    ||||||||||| |||| || | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||||||||||    
16294820 cctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaa-agaacgttaatccctatgtcataacctaa 16294722  T
323 taattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctg 422  Q
    ||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| |   || ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||   ||    
16294721 taatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacatagttcagagttaaaagccagagttagtggtcattcaatttctatgatcaatatg 16294622  T
423 caaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaat 494  Q
    || | | || ||||||||  | |||||| || |||||||||   |||  |||||||| ||| ||||||||||    
16294621 catattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacacaaagcattaaacacaaggtaatatgaat 16294550  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 48 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 13710169 - 13709647
Alignment:
48 ttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaagag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaa-gttctattatgg 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||  ||||  ||||||||||||| ||| |||| |||||| | |||  ||||     
13710169 ttgtaacataaacggattaaaaacaataaaagattggtttta-gaaaatttgagagaagtatggttaagaccttcaaatcatctgaaagctctcctatga 13710071  T
145 taatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaata 244  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| |||  || |     
13710070 taatttgcactcctaatttaggcaatgattatctagttcaacaacagattaacaaagtaattctacccgatctcttgacccataattctcccctcaagtg 13709971  T
245 acaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaa 344  Q
    |||| ||  ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| |    
13709970 acaaccccataatctctttagtgaattcgaaatcgttggaggttttaacaaaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatatctagcttga 13709871  T
345 ttacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggactt 444  Q
    |||||| |||||||| |  ||||||| | ||||| |||| || | ||||||||||| ||||  ||||||||||   | || | | || ||||||||  |     
13709870 ttacttgggttaaacttatcacctaggtcagagtcaaaatccagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttacatattcataaagctagggtta 13709771  T
445 gtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgatatgataggaattcaacaaattagagttcc 544  Q
    |||||| || |||||||||  ||||  |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||||||  | | | ||||||||||||| ||||     
13709770 gtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaattagactttcattgatattcttgaagttcaacaaattagggttca 13709671  T
545 cataagattacatcatattcatct 568  Q
    |||| |||||||||| ||||||||    
13709670 cataggattacatcagattcatct 13709647  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 36327067 - 36326500
Alignment:
5 gatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaagag- 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||   ||  |  |||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||  |||||||| ||||     
36327067 gatgtattaaattcaaagttgccctaggaagttagattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggtttta-gaaaattagagaga 36326969  T
104 -gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagt 202  Q
     ||||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
36326968 tgtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctaatttaacgatagattaacaaagt 36326869  T
203 aattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattc----gaaaccattggaggttttaacagtcc 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || | || | ||||  | |||||||||||| ||||||     |||||  |||||||| |||||||  |    
36326868 aattctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaagtgacaactccttaatctcttaagtgaattaatttgaaactgttggaggtattaacagaac 36326769  T
299 gttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggt 398  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||| | | ||| ||||||| | |||||||||    
36326768 gttaatccctgtgtcatagcctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcaaagtcaaaagccagggttagtggt 36326669  T
399 caatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaa 498  Q
    || ||||  |||||||||    |||| | | || ||||||||  | |||||| || ||||||| |  ||||  |||||||||||  |||||||||| |||    
36326668 cattcaatctctaagatcgatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacaca--aaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaa 36326571  T
499 actagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    |||||||||| ||||||| | | | || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
36326570 actagactttcattgatattcaaatgagttcaacaaactagggttcccataggattacatcagattcatct 36326500  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 31528511 - 31527965
Alignment:
24 tgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggtttttt-gaaaattaa-agaggtatggttaagacattcg 121  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||  ||||||| | ||| ||||||||||| | ||||    
31528511 tgccctaggcagttgagttgatt-tagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattgagagaagtatggttaagtccttcg 31528413  T
122 aatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctatttta-agcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctctt 220  Q
    |||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||||  |   | |||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
31528412 aatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctctt 31528313  T
221 gacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacct 320  Q
    ||||||||||||| |||| || | |||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
31528312 gacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtattaac-gaacgttaatccctatatcataacct 31528214  T
321 aataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcc 420  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||       
31528213 aataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaata 31528114  T
421 tgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgat-atga 519  Q
    |||| | | || | ||||||  |  ||||| || |||||| ||   ||   ||||| || ||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||  | |    
31528113 tgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataaaaactaaactttcattgatgttca 31528014  T
520 taggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
31528013 aaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 31527965  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 106 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31626588 - 31626283
Alignment:
106 atggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaat 205  Q
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31626588 atggttaagtcattcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaattattatttagtttcacgacagattaacttagtaat 31626489  T
206 tttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatc 305  Q
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31626488 tctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaatcgttggaggtattaaaagaacgttaatc 31626389  T
306 cctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaa 405  Q
    | ||| | |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
31626388 cttatgttataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaa 31626289  T
406 gttcta 411  Q
     |||||    
31626288 tttcta 31626283  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 40018099 - 40017553
Alignment:
24 tgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa-agaggtatggttaagacattcga 122  Q
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40018099 tgccctaggcagttgagttgatt--tgtaacataaacggattaaaaacaataagagactggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcga 40018002  T
123 atcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatcta---gttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctct 219  Q
    |||||| |||  |||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||   |||  |||||||||||||  |||| || | |||||||  |    
40018001 atcctccgaaactctcctatggtaatttgcactcctaattcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcctt 40017902  T
220 tgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacc 319  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||| || ||| |||||||| ||||||||||||  |||||||| |||| ||  ||||||| | ||| |||| |||    
40017901 tgacctagaattctccccgcaagtgacaaccc-ttattctcttaagtgaattcgaaactgttggaggtattaaaagaacgttaattcatatgtcatgacc 40017803  T
320 taataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagc 419  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||| | ||| ||||||| | || |||||||| ||||  |||| |||||      
40017802 taataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcaaagtcaaaagccagggtcagtggtcattcaatctctacgatcaat 40017703  T
420 ctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgata-tg 518  Q
     |||| | | || ||| ||||    |||||| || |||||||||  ||||  |||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| | |     
40017702 ttgcatattcataaagatagggtcagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactttcattgaaattc 40017603  T
519 ataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
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40017602 aaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcatattcatct 40017553  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 98 - 580
Target Start/End: Original strand, 32575885 - 32576367
Alignment:
98 aaagaggtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaac 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||  |||||||||||||    
32575885 aaagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagctctcctatgataatttgcactcctagttcaaaaaatgattatttagtttcacgacagattaac 32575984  T
198 aaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtc 297  Q
      ||||| | |||| |||| |||||||||||||||| |||  || | |||| || |||||||||| | |||||||||||   |||||||| |||| ||      
32575985 ttagtaactctaccaaatcccttgacctagaattctccccacaagtgacaaccccttaatctcttgactgaattcgaaattgttggaggtattaaaagaa 32576084  T
298 cgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtgg 397  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||   ||||||| |||||| |||| |||||||||||||   |||||||| | ||| ||||| | | || ||||     
32576085 cgttaatccctatgtcgtaacctaataaagatctatctttagcttgattatttaggttaaacatattacctagttcatagtcaaaagacagggtcagtga 32576184  T
398 tcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaa 497  Q
    ||| ||||  | || |||||   |||| | | || ||| |||||   ||||||||| ||||||||   ||||  ||| |||| ||  ||||||| |||||    
32576185 tcattcaatctatacgatcaatttgcatattcataaagttaggatcagtagtcaatgataaacatgcaaaaagcatt-aacaaaaagtaatatggataaa 32576283  T
498 aactagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
     |||| ||||| ||||| | | | |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
32576284 gactaaactttcattgaaattcaaaggagttcaacaaattagggttcctataggattacatcatattcatctaagtctcaacca 32576367  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 288 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8426854 - 8426781
Alignment:
288 tttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacat 361  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
8426854 tttaacaatccgttaatccctaaatcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaacat 8426781  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 586 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 11059479 - 11059410
Alignment:
586 gaaattagctagacatagaaatataaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgtt 655  Q
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11059479 gaaattagctagacatagagatacaaataaatagcatgggaaataaaattaaccatgaaaccatgttgtt 11059410  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 586 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 13517987 - 13517919
Alignment:
586 gaaattagctagacatagaaatataaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgt 654  Q
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13517987 gaaattagctagacatagagatacaaataaatagcatgggaaataaaattaaccatgaaaccatgttgt 13517919  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8427260 - 8427141
Alignment:
109 gttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaatttt 208  Q
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8427260 gttaagacattcgaatcatccgatgttcttatttggtaatttgcacccctgttc-aatcaatgtctttctagtttaacaacagattaataaaatggttct 8427162  T
209 acccaatctcttgacctagaa 229  Q
    || ||||||||||||||||||    
8427161 actcaatctcttgacctagaa 8427141  T

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Target: chr5 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 34405889 - 34405424
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
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34405889 gtatggttaagaccttcaaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 34405790  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
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34405789 attctacccaatctcttgacctagaattctcctcgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaa 34405690  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| |   |||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||| |     
34405689 tccctatctcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaagttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattt 34405590  T
404 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactag 503  Q
    ||  |||||||||||  |||| | | || ||||||||  | ||||||||| |||||||||  ||||  || ||||||||  |||||||||| ||||||||    
34405589 aatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactag 34405490  T
504 acttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||||| | ||||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
34405489 actttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 34405424  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Original strand, 14616633 - 14617098
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
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14616633 gtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 14616732  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| || | |||| || |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||    
14616733 attctacccaatctcttgacctataattctccccgcaagtgacaagcccttaatctcttgagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacaaaacgttaa 14616832  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 403  Q
    ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||| | ||||| |||||||   ||||||||||| ||    
14616833 tccatatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccatggttagtggtcattc 14616932  T
404 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactag 503  Q
    ||  ||||||||||   |||| | | || ||| ||||  | ||| || || |||||||||  ||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||    
14616933 aatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggttagtattcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactag 14617032  T
504 acttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||||| ||||||| | | |||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
14617033 actttcattgatatttaaaggagttcaacaaactagggttctcataggattacatcatattcatct 14617098  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 33575210 - 33574664
Alignment:
24 tgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa-agaggtatggttaagacattcga 122  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| | ||| ||||||||||| | |||||    
33575210 tgccctaggcagttgagttgatt-tagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatggttaagtccttcga 33575112  T
123 atcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctatttt-aagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttg 221  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||  || |||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
33575111 atcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttg 33575012  T
222 acctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataaccta 321  Q
    | |||||||||| |||| || | |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |   |||||||||||||||||||||||    
33575011 atctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaatgttaatccctatatcataaccta 33574912  T
322 ataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcct 421  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||| || |||||||||||   | ||||||||||| |||| ||||| |||||   |    
33574911 ataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagttagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatat 33574812  T
422 gcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgat-atgat 520  Q
    ||| | | || ||||||||  |  ||||| || |||||||||   ||   |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||  | |     
33574811 gcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaa 33574712  T
521 aggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||    
33574711 aggagttcaacaaattagggttcccatagggttacatcagattcatct 33574664  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 105 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 22159784 - 22159307
Alignment:
105 tatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaa 204  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||| || || |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
22159784 tatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaaatcgcactcctagttcaatcaatgactatctagttcaacgatagattaacaaagtaa 22159685  T
205 ttttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaat 304  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
22159684 ctctacccaatctcttgacctagagttctccccacaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaacagaacgttaat 22159585  T
305 ccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatca 404  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||||| | ||||| ||||||| | |||| |||||| |||    
22159584 ccctatgtcataacctaataatgatctatctctagtttgattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaagccagggttaatggtcattca 22159485  T
405 agttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaac-ataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactag 503  Q
    |  ||||| ||||   || | | | || |||||| |  | |||||| || |||||| |||  ||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
22159484 atctctaacatcaatttgtatattcataaagctatggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcattaaacacaaagtaatatgaataaaaactag 22159385  T
504 acttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
    ||||| ||||| | | | |||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||  |||||||| | |||||||||    
22159384 actttcattgacattcaaaggagttcaacaaattagggttcccgtaggattacatcggattcatctcattctcaacca 22159307  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 568
Target Start/End: Original strand, 15532324 - 15532870
Alignment:
24 tgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggtttttt-gaaaattaa-agaggtatggttaagacattcg 121  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||  ||||||| | ||| ||||||||||| | ||||    
15532324 tgccctaggcagttgagttgatt-tagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattgagagaagtatggttaagtccttcg 15532422  T
122 aatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctatttta-agcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctctt 220  Q
    |||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||||  |   | |||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
15532423 aatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctctt 15532522  T
221 gacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacct 320  Q
    ||||||||||||| |||| || | |||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
15532523 gacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtattaac-gaacgttaatccctatatcataacct 15532621  T
321 aataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcc 420  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||       
15532622 aataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaata 15532721  T
421 tgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgatatg-a 519  Q
    |||| | | || | ||||||  |  ||||| || |||||| ||   ||   ||||| || ||  ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |  |    
15532722 tgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataaaaactaaactttcattgatgttca 15532821  T
520 taggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||    
15532822 aaggagttcaacaaattagggttcccatagggttacatcagattcatct 15532870  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 106 - 544
Target Start/End: Original strand, 26712549 - 26712991
Alignment:
106 atggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaat 205  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || | |||  |||| ||||||||||||||| || || |||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||    
26712549 atggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaat 26712648  T
206 tttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatc 305  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||    
26712649 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaagaacgttaatc 26712748  T
306 cctatatcataacctaataat--tg-tctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaat 402  Q
    ||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |    
26712749 cctatgtcataacctaataatgatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcatt 26712848  T
403 caagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaacta 502  Q
    ||| ||||| |||||   |||| | | || ||||||||  |  |||||||| |||||||||   |||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
26712849 caatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcaatgataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 26712948  T
503 gacttttattgat-atgataggaattcaacaaattagagttcc 544  Q
     ||||| ||||||  | | |||| ||||||||||||| |||||    
26712949 aactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcc 26712991  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 106 - 544
Target Start/End: Original strand, 26982287 - 26982729
Alignment:
106 atggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaat 205  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || | |||  |||| ||||||||||||||| || || |||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||    
26982287 atggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaat 26982386  T
206 tttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatc 305  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||    
26982387 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaagaacgttaatc 26982486  T
306 cctatatcataacctaataat--tg-tctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaat 402  Q
    ||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |    
26982487 cctatgtcataacctaataatgatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcatt 26982586  T
403 caagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaacta 502  Q
    ||| ||||| |||||   |||| | | || ||||||||  |  |||||||| |||||||||   |||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
26982587 caatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcaatgataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 26982686  T
503 gacttttattgat-atgataggaattcaacaaattagagttcc 544  Q
     ||||| ||||||  | | |||| ||||||||||||| |||||    
26982687 aactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcc 26982729  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 568
Target Start/End: Original strand, 15542506 - 15543052
Alignment:
24 tgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggtttttt-gaaaattaa-agaggtatggttaagacattcg 121  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||  ||||||| | ||| ||||||||||| | ||||    
15542506 tgccctaggcagttgagttgatt-tagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattgagagaagtatggttaagtccttcg 15542604  T
122 aatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctatttta-agcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctctt 220  Q
    |||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||||  |   | |||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
15542605 aatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctctt 15542704  T
221 gacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacct 320  Q
    ||||||||||||| |||| || | |||| || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
15542705 gacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttgatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtattaac-gaacgttaatccctatatcataacct 15542803  T
321 aataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcc 420  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||       
15542804 aataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaata 15542903  T
421 tgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgatatg-a 519  Q
    |||| | | || | ||||||  |  ||||| || |||||| ||   ||   ||||| || ||  ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |  |    
15542904 tgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataaaaactaaactttcattgatgttca 15543003  T
520 taggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
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15543004 aaggagttcaacaaattagggttcccatagggttacatcagattcatct 15543052  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 104 - 568
Target Start/End: Original strand, 7650146 - 7650610
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
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7650146 gtatggttaagacatttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaaagatagattaacaaggta 7650245  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||| || | |||| || |||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||| ||   |||||    
7650246 attctactcaatctctttacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttgagtgaattcgaaatcgctggaggttttaatagaaggttaa 7650345  T
304 tccctatatc---------ataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttag 394  Q
    ||||||| ||         |||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||||| |   ||||||||  |||| ||||||    |||||    
7650346 tccctatgtcataacctaaataacctaataatgatctatctctagcttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagc---ggttag 7650442  T
395 tggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaat 494  Q
    |||| | ||||  ||||||||||   |||| | | || ||| ||||  | |||||| || |||||||||  ||||  |||||||||||  ||| ||||||    
7650443 tggttattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaaacattaaacataaagtaacatgaat 7650542  T
495 aaaaactagacttttattgatatgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||| |||||||||| ||||||||  |||   ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||    
7650543 aaagactagactttcattgatat--tag---ttcaacaaattagggtt-ccataaaattacatcaaattcatct 7650610  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 253 - 559
Target Start/End: Original strand, 11989171 - 11989478
Alignment:
253 ttaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttag 352  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||| | | |||||||||||  |||||||||| ||| ||||| |||    
11989171 ttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaatagaacgttaatctctatgttaaaacctaataatgatctatctctaacttgattacatag 11989270  T
353 gttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaa 452  Q
    ||||||| |   |||||| | ||||| ||||||    ||||||||||| ||||  ||||||||||   || | | | || ||||||||  | |||||| |    
11989271 gttaaacctaatacctagatcagagtcaaaagcgaaggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgtatattcataaagctagggttagtagtcga 11989370  T
453 taataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataaga 551  Q
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11989371 tgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaataaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataaaa 11989470  T
552 ttacatca 559  Q
    ||||||||    
11989471 ttacatca 11989478  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 11988974 - 11989127
Alignment:
9 tattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaagag--gta 106  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | |||| |||||||| ||||  |||    
11988974 tattaaattcaatggtcccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacagattaaaaacgataaaagat-tgattttagaaaattagagagaagta 11989072  T
107 tggttaagacattcgaatcctctgaagttct--attatggtaatttgcactccta 159  Q
     ||||||||| |||||||||||  |||||||    ||||||||||||||||||||    
11989073 aggttaagaccttcgaatcctccaaagttctcctatatggtaatttgcactccta 11989127  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 586 - 654
Target Start/End: Original strand, 28562795 - 28562863
Alignment:
586 gaaattagctagacatagaaatataaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgt 654  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
28562795 gaaattagctagacatagagatacaaattaatagcatgggaaataaaattaaccatgaaaccatgttgt 28562863  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 586 - 654
Target Start/End: Original strand, 28566363 - 28566431
Alignment:
586 gaaattagctagacatagaaatataaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgt 654  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
28566363 gaaattagctagacatagagatacaaattaatagcatgggaaataaaattaaccatgaaaccatgttgt 28566431  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 582 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 42062628 - 42062548
Alignment:
582 aagagaaattagctagacatagaaatataaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgttcctcatttct 665  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
42062628 aagagaaattagctagacatagagatacaaataaagagcgt-gaaaataaaattaaccatg--accatgttgttcctcaattct 42062548  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 357
Target Start/End: Original strand, 23993447 - 23993490
Alignment:
314 ataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaa 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
23993447 ataacctaataattgtctatctctagcttaatttcttaggttaa 23993490  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13372011 - 13371859
Alignment:
192 attaacaaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggtttta 291  Q
    |||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||| ||| |||  || | ||||||| |||||||||||| ||||||  |||   ||||||||||||    
13372011 attaacaaagtagtttaaatcaatctcttgacttagaactctcccctaaagtcacaatcccttaatctcttaagtgaattaaaaaatgttggaggtttta 13371912  T
292 acagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaa 344  Q
       || ||||||||  || |||||||| ||| | |||||||||| ||||||||    
13371911 gtcgttcgttaatctataaatcataacttaagagttgtctatctatagcttaa 13371859  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 17944882 - 17944841
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtt 42  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
17944882 aaaggatatattaaattcaatggtgccctaggcagttgagtt 17944841  T

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Target: scaffold0567 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 86 - 580
Target Start/End: Original strand, 5995 - 6491
Alignment:
86 tttttgaaaattaaagag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagtta 183  Q
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5995 ttttagaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaggttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctaggtt 6094  T
184 aacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattgg 283  Q
     |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |  ||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
6095 cacgacagattaacacaataactctacccaatctcttgatctagaattctccccgcaagtggcaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcattgg 6194  T
284 aggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaa 383  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||| |   |||||||| ||||| ||||    
6195 aggttttaacagaacgttaaaccctatgtcataacctaataatgatctatctctaggttgattacttagattaaacttattacctagttcagagtcaaaa 6294  T
384 gccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataag 483  Q
    | | | ||||||||||| ||||  ||||||||||   |||| | | || ||||||||  | |||||| || |||||||||  ||||  |||||||||||     
6295 gtcagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaa 6394  T
484 ataatatgaataaaaactagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
     ||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
6395 gtaacatgaataaacact-gactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattaaggttcccataagattacatcagattcatctaaatctcaacca 6491  T

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Target: scaffold0440 (Bit Score: 145; Significance: 6e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 9982 - 9607
Alignment:
26 ccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa-agaggtatggttaagacattcgaat 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| | ||| ||||||||||| | |||||||    
9982 ccctaggcagttgagttgatt-tagtaacataaactgattaaaaacaataaataattggtttttagaaaattgagagaagtatggttaagtccttcgaat 9884  T
125 cctctgaagttctattatggtaatttgcactcctatttt-aagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttgac 223  Q
    |||| |||| |||  ||||| ||||||||||||||  |  || |||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
9883 cctccgaagctctcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgac 9784  T
224 ctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaat 323  Q
    |||||||||| |||| || | |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||    
9783 ctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaat 9684  T
324 aattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtca 400  Q
    |||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| |   ||||| || ||||||||||||| | |||||||||||    
9683 aatgatctatctttagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtca 9607  T

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Target: chr3 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 568
Target Start/End: Original strand, 22626436 - 22626982
Alignment:
24 tgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa-agaggtatggttaagacattcga 122  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  || || |||  ||||||| | ||| ||||||||||| | |||||    
22626436 tgccctaggcagttgagttgatt-tagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggattta-gaaaattgagagaagtatggttaagtccttcga 22626533  T
123 atcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctatttta-agcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttg 221  Q
    ||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||  |   | |||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||| || |||||||||||    
22626534 atcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctatccaatctcttg 22626633  T
222 acctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataaccta 321  Q
    |||||||||||| |||| || | |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
22626634 acctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataaccta 22626733  T
322 ataattgtc-tatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcc 420  Q
    |||||  || |||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||       
22626734 ataatgatcttatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaata 22626833  T
421 tgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgat-atga 519  Q
    |||| | | || | ||||||  |  ||||| || |||||||||   ||   ||||| || ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||  | |    
22626834 tgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttca 22626933  T
520 taggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
22626934 aaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 22626982  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 508
Target Start/End: Original strand, 39563634 - 39564118
Alignment:
24 tgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacaga-ttaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaaagag--gtatggttaagacattc 120  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||| || ||||||  ||||||   ||||  | ||||||||| | |||    
39563634 tgccctaggcagttgagttgatt-ttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggtttta-gaaaatctgagagaagaatggttaagtccttc 39563731  T
121 gaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctctt 220  Q
    |||||||| || | |||  |||| ||||||||||||||| || || ||||| |||| |||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
39563732 gaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatggttatttagtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctctt 39563831  T
221 gacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacct 320  Q
    ||||||||||||| |||| || | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||||||||    
39563832 gacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaagaacgttaatccctatgtcataacct 39563931  T
321 aataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcc 420  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||| ||| ||||||| | | ||||||||||| |||| ||||| |||||       
39563932 aataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcaga-ttaaaagtcagggttagtggtcattcaatttctatgatcaata 39564030  T
421 tgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttt 508  Q
    |||| | | || ||||||||  |  |||||||| |||||||||   |||  |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||    
39564031 tgcatattcataaagctagggttaatagtcaatgataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaacttt 39564118  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 568
Target Start/End: Original strand, 11138694 - 11139238
Alignment:
24 tgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa-agaggtatggttaagacattcga 122  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| |  || || ||   ||||||| | ||| ||||||||||| | |||||    
11138694 tgccctaggcagttgagttgatt-tagtaacataaactgattaaaaacaatatagaattggattca-gaaaattgagagaagtatggttaagtccttcga 11138791  T
123 atcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctatttta-agcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttg 221  Q
    ||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||  |   | |||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||| || |||||||||||    
11138792 atcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctatccaatctcttg 11138891  T
222 acctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataaccta 321  Q
    |||||||||||| |||| || | ||||  | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
11138892 acctagaattctccccgcaagtgacaactccttaatctcttaagtgaattcgaaaccataggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataaccta 11138991  T
322 ataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcct 421  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| |   | ||| || ||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||| |||||   |    
11138992 ataatgatctatctctagcttgattactgaggttaaacctatta-ctatttcagagttaaaagccagggttagtggccattcaatttctatgatcaatat 11139090  T
422 gcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgat-atgat 520  Q
    ||| | | || | ||||||  |  ||||  || |||||||||   ||   ||||| || ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||  | |     
11139091 gcatattcataacgctagggttaatagtttatcataaacatacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaa 11139190  T
521 aggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
11139191 aggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 11139238  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13979527 - 13979273
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||  | |||||||||||  ||||    
13979527 gtatggttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactccaagttcaaacaatgattatttagtttcatgacagattaacttagta 13979428  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||| |||| || | |||| |  |||||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| ||  ||||||    
13979427 actctatccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaacctcttaatctcttaagtgaattcgaaatcgttcgaggtattaaaagaacgttaa 13979328  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaa 358  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||| ||||||    
13979327 tccctatgtcataacctaataatgatctatctccaacttgattacttaagttaaa 13979273  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 35366415 - 35366028
Alignment:
105 tatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaa 204  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| | |||||  || |||||||||||| || |||  || ||||| | || || || ||||||| ||||||||  |||    
35366415 tatggttaagatcttcaaatcctctaatgttcttctacggtaatttgcaccccaattc-aatcaatgttcatataatttaacgacaaattaacaagataa 35366317  T
205 ttttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaat 304  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||  |||  | | ||||||| |||||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
35366316 ttctactcaatctcttgacctagaactctctccgcgagtgacaatcccttaatctcttaagtgaattcaagactcttggaggttttaacagtccgttaat 35366217  T
305 ccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatca 404  Q
    || |   ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||| | ||||| |||||||   | ||||||||| |||    
35366216 ccatgagtcatagcctaataattttctatctctaacttaattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaagccaaggctagtggtcattca 35366117  T
405 agttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaat 494  Q
    |||| ||||||||   |||| | | |  | |||||  || |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||| ||||||||||    
35366116 agttttaagatcaatttgcacattcacgatgctagtgctagtagtcaataataaacataa-aacaacattaaacacaaggtaatatgaat 35366028  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 46731555 - 46731391
Alignment:
86 tttttgaaaattaaagag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagtta 183  Q
    |||| |||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||     
46731555 ttttagaaaattagagagatgtaaggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagttc 46731456  T
184 aacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaa 248  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||| |||| || ||||||    
46731455 aacgacatattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctggagttctccccgcaagtaacaa 46731391  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 47412222 - 47411819
Alignment:
105 tatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaa 204  Q
    |||| ||||||| || ||||||||| | |||||  || |||||||||||| |  | || || ||||| | ||||| || ||| |||||||||||   |||    
47412222 tatgattaagacctttgaatcctctaatgttcttctacggtaatttgcacccacaattcaatcaatgttcatctaatttaacaacagattaacacgataa 47412123  T
205 ttttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaat 304  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||        |||||| ||||||||  || ||| ||| ||||||||||| ||||||    
47412122 ttctactcaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaatc--------tcttaagtgaattcgggactattagagattttaacagtctgttaat 47412031  T
305 ccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatca 404  Q
    | ||   ||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||| | ||||| ||||| | |   ||||| ||| |||    
47412030 ctctgagtcacaatctaataattttctatctctaacttaattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaaggcaggactagtgatcattca 47411931  T
405 agttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactaga 504  Q
    |||||||||||||   | || | | |  ||| |||  || |||||||||||||||||||  || |  |||||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
47411930 agttctaagatcaattttcatattcaagaagttagtgctagtagtcaataataaacatacaaacaacattaaacacaaggtaatatgaat-taaactaga 47411832  T
505 cttttattgatat 517  Q
    |||| ||||||||    
47411831 ctttcattgatat 47411819  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 586 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 2783804 - 2783736
Alignment:
586 gaaattagctagacatagaaatataaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgt 654  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
2783804 gaaattagctagacatagagatacaaattaatagcatgggaaataaaattaaccatgaaaccatgttgt 2783736  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 582 - 665
Target Start/End: Original strand, 18645107 - 18645187
Alignment:
582 aagagaaattagctagacatagaaatataaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgttcctcatttct 665  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||    
18645107 aagagaaattagctagacatagagatacaaataaagagcgt-gaaaataaaattaaccatg--accgtgttgttcctcaattct 18645187  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 35412303 - 35412227
Alignment:
586 gaaattagctagacatagaaatataaataaatagcatggaaaataaaattaaccatgaaaccatgttgttcctcatttct 665  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
35412303 gaaattagctagacatagagatacaaataaagagcgt-gaaaataaaattaaccatg--accatgttgttcctcaattct 35412227  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 521 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 13979113 - 13979054
Alignment:
521 aggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||    
13979113 aggagttcaacaaattagggttcccataagattacctcagattcgtctaagtcttaacca 13979054  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 50096925 - 50096848
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaa 78  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||    
50096925 aaaggatgtattaaattcaagagtgccctaagcagttgagttgatttttgtaacataaacgtaataaaaacagtaaaa 50096848  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 540 - 580
Target Start/End: Original strand, 31878312 - 31878352
Alignment:
540 gttcccataagattacatcatattcatctaagtctcaacca 580  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
31878312 gttctcataagattatatcagattcatctaagtctcaacca 31878352  T

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Target: scaffold0063 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 106 - 568
Target Start/End: Original strand, 7199 - 7662
Alignment:
106 atggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaat 205  Q
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7199 atggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaatttgtactcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaat 7298  T
206 tttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatc 305  Q
    | ||  |||||||||||| ||||||||| |||| || | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||    
7299 tctattcaatctcttgacttagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaagaacgttaatc 7398  T
306 cctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaa 405  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||    
7399 cctatgtcataacctaataatgatctatctctagctttattacttaggttaaacctattacctagttctgagtaaaaagccagggttagtggtcaatcaa 7498  T
406 gttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagac 505  Q
     ||||| |||||   |||| | | || ||||||||  |  ||||| || |||||||||   |||  |||||||  ||  |||||||||||||||||| ||    
7499 attctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcgatgataaacatacataaagcattaaactcaaagtaatatgaataaaaactaaac 7598  T
506 ttttattgat-atgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
    ||| ||| ||  | | |||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||    
7599 tttcatttatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccgtaggattacatcagattcatct 7662  T

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Target: scaffold0264 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 417
Target Start/End: Original strand, 24337 - 24701
Alignment:
55 ataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa-agaggtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgca 153  Q
    |||||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| | ||| | ||||||||| | ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||    
24337 ataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgca 24436  T
154 ctcctatttt-aagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatcca 252  Q
    ||||||  |  ||  ||||||||| ||||   ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| ||     
24437 ctcctaaatacaataaatgattatttagtatcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaacccc 24536  T
253 ttaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttag 352  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||    
24537 ttaatctcttatgtgaattcgaaaccattggaggaattaaataaacgttaatccctatatcataacctaataatgatatatctctagcttgattacttag 24636  T
353 gttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatca 417  Q
    ||||||| |   |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||    
24637 gttaaacctattacctggttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatca 24701  T

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Target: scaffold0500 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2267
Alignment:
106 atggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaat 205  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||   |||  |||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||    
2732 atggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaacttgcactcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaat 2633  T
206 ttt--acccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
     ||  || |||||||||||||||||||||| |||| || | |||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||| |    
2632 attctactcaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaacccctaaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaagaacgttga 2533  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| |   |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |     
2532 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggtcaaacctattacctagttcagagtaaaaagccagggttagtggtcattt 2433  T
404 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactag 503  Q
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2432 attttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagttgatgataaacatacataaagcattaaacacaaagtaatatgaataaagactaa 2333  T
504 acttttattg-atatgataggaattcaacaaattagagttcccataagattacatcatattcatct 568  Q
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2332 actttcattgaagttcaaaggagttcaacaaattagggttcccgtaggattacatcagattcatct 2267  T

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Target: scaffold0665 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 256 - 568
Target Start/End: Original strand, 1 - 314
Alignment:
256 atctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggtt 355  Q
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1 atctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggtt 100  T
356 aaacattccacctagtttagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataa 455  Q
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101 aaacttattacctagatcagagtcaaaaaccagggttagtagtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatga 200  T
456 taaacataagaaaattattaaacataagataatatgaataaaaactagacttttattgata-tgataggaattcaacaaattagagttcccataagatta 554  Q
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201 taaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggatta 300  T
555 catcatattcatct 568  Q
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301 catcagattcatct 314  T

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Target: scaffold0352 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 104 - 386
Target Start/End: Original strand, 2808 - 3090
Alignment:
104 gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactcctattttaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 203  Q
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2808 gtatcgttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatatagtttcacgaaagattaaggtagta 2907  T
204 attttacccaatctcttgacctagaattcttcccggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcgaaaccattggaggttttaacagtccgttaa 303  Q
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2908 attctaccaaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaactattggaggtattaaaagaacgttaa 3007  T
304 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagtttagagttaaaagcc 386  Q
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3008 tccttgtgtcataatctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacgtattacctagttcagagttgaaagcc 3090  T

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Target: scaffold0363 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 109 - 267
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatg-ttgccctaggcaattgagtttattcttgtaacataaacagattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa 99  Q
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109 aaaggatatgttaaattcaatggttgccctaggcagttgagttggttttt--aacataaacaaattaaaaacaataaaagtt-ggttttaagaatattag 205  T
100 agag--gtatggttaagacattcgaatcctctgaagttctattatggtaatttgcactccta 159  Q
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206 agagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaatttctcctatgataatttgcactccta 267  T

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Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 338
Target Start/End: Original strand, 323 - 363
Alignment:
298 cgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctcta 338  Q
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323 cgttaatccctatatcataatctaataatgatctatctcta 363  T

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Target: scaffold0134 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 7498 - 7457
Alignment:
1 aaaggatgtattaaattcaatgttgccctaggcaattgagtt 42  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
7498 aaaggatatattaaattcaatggtgccctaggcagttgagtt 7457  T

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