View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4015_low_13 (Length: 328)

Name: NF4015_low_13
Description: NF4015
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4015_low_13
NF4015_low_13
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (16-313)||(15506428-15506723)
chr7 (18-313)||(20991706-20992000)
chr7 (17-296)||(29545855-29546133)
chr7 (16-313)||(16207582-16207877)
chr7 (16-313)||(4458902-4459197)
chr7 (168-306)||(15438410-15438548)
chr7 (16-305)||(11999042-11999332)
chr7 (18-313)||(12325978-12326269)
chr7 (16-161)||(15436209-15436355)
chr7 (16-313)||(16436936-16437233)
chr7 (16-305)||(645296-645584)
chr7 (16-313)||(11588627-11588921)
chr7 (17-313)||(14165329-14165623)
chr7 (16-299)||(10661025-10661307)
chr7 (17-304)||(10279977-10280259)
chr7 (16-313)||(11521115-11521406)
chr7 (84-209)||(20924913-20925037)
chr7 (17-70)||(42636410-42636463)
chr7 (84-210)||(14926877-14927002)
chr7 (84-210)||(15350343-15350468)
[»] scaffold0226 (3 HSPs)
scaffold0226 (16-313)||(7240-7537)
scaffold0226 (16-308)||(17832-18124)
scaffold0226 (16-308)||(27226-27518)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (16-313)||(15162186-15162485)
chr4 (16-313)||(10724421-10724719)
chr4 (16-313)||(10938190-10938488)
chr4 (15-303)||(10191048-10191333)
chr4 (17-143)||(10722146-10722271)
chr4 (17-143)||(10935915-10936040)
chr4 (16-143)||(21478270-21478396)
chr4 (20-313)||(16384057-16384347)
chr4 (16-313)||(28019467-28019759)
chr4 (17-299)||(9069108-9069389)
chr4 (16-140)||(25116988-25117113)
chr4 (179-303)||(15700047-15700169)
chr4 (16-82)||(8163947-8164013)
chr4 (17-104)||(33746126-33746211)
chr4 (16-313)||(19183385-19183678)
chr4 (16-74)||(18618054-18618113)
chr4 (85-140)||(23400067-23400124)
chr4 (103-303)||(18601372-18601566)
chr4 (17-120)||(33898881-33898984)
chr4 (260-304)||(19659844-19659887)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (16-303)||(17864137-17864422)
chr6 (27-313)||(12039410-12039695)
chr6 (16-313)||(8465373-8465669)
chr6 (17-306)||(20989472-20989761)
chr6 (15-313)||(19171577-19171874)
chr6 (16-283)||(25805615-25805882)
chr6 (17-140)||(20558465-20558588)
chr6 (17-313)||(17234755-17235052)
chr6 (158-311)||(20465598-20465751)
chr6 (16-313)||(21723108-21723405)
chr6 (16-313)||(14259073-14259374)
chr6 (16-313)||(13195486-13195782)
chr6 (16-305)||(19100061-19100348)
chr6 (16-313)||(9281410-9281705)
chr6 (18-235)||(15897453-15897669)
chr6 (16-140)||(19894494-19894619)
chr6 (17-313)||(33665957-33666249)
chr6 (17-242)||(17855358-17855585)
chr6 (16-313)||(25964857-25965151)
chr6 (16-313)||(25969504-25969798)
chr6 (16-313)||(25973944-25974238)
chr6 (15-313)||(17527587-17527882)
chr6 (153-313)||(29253383-29253542)
chr6 (17-143)||(34657018-34657147)
chr6 (17-106)||(20470110-20470199)
chr6 (16-149)||(21706210-21706344)
chr6 (84-313)||(23882399-23882627)
chr6 (99-303)||(23879133-23879333)
chr6 (16-136)||(13870276-13870397)
chr6 (260-313)||(19077548-19077601)
chr6 (16-103)||(29254825-29254913)
chr6 (212-242)||(20558646-20558676)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (16-312)||(13515298-13515592)
chr3 (18-313)||(19634044-19634338)
chr3 (17-313)||(18063909-18064201)
chr3 (16-303)||(18034608-18034892)
chr3 (31-305)||(44452659-44452933)
chr3 (20-140)||(20748036-20748156)
chr3 (16-143)||(11656184-11656311)
chr3 (16-288)||(295622-295885)
chr3 (17-303)||(28051299-28051585)
chr3 (16-313)||(18547811-18548106)
chr3 (16-313)||(24195686-24195981)
chr3 (20-143)||(18477095-18477217)
chr3 (16-303)||(17042464-17042750)
chr3 (16-314)||(15635572-15635869)
chr3 (16-313)||(13790842-13791134)
chr3 (20-313)||(17135847-17136136)
chr3 (16-313)||(18483075-18483367)
chr3 (16-313)||(17702569-17702864)
chr3 (16-143)||(8224998-8225122)
chr3 (16-313)||(23954261-23954553)
chr3 (30-299)||(6579263-6579531)
chr3 (16-148)||(1919107-1919239)
chr3 (263-313)||(7028774-7028824)
chr3 (71-210)||(286703-286839)
chr3 (219-313)||(1918947-1919038)
chr3 (84-143)||(13914019-13914079)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (15-267)||(11667607-11667860)
chr1 (17-313)||(24986163-24986440)
chr1 (16-313)||(20840965-20841261)
chr1 (18-313)||(4246200-4246494)
chr1 (16-312)||(13165557-13165850)
chr1 (16-306)||(23477644-23477931)
chr1 (16-313)||(26972102-26972395)
chr1 (15-303)||(12753222-12753509)
chr1 (16-313)||(17851077-17851369)
chr1 (84-313)||(15803812-15804040)
chr1 (17-313)||(14745487-14745778)
chr1 (84-143)||(47941212-47941272)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (16-313)||(27925153-27925443)
chr8 (16-313)||(45136277-45136569)
chr8 (16-313)||(13660074-13660369)
chr8 (16-313)||(13718717-13719012)
chr8 (17-304)||(33977221-33977506)
chr8 (24-304)||(33961909-33962187)
chr8 (16-313)||(24092119-24092415)
chr8 (18-313)||(23541108-23541405)
chr8 (16-313)||(22485296-22485590)
chr8 (17-210)||(9996662-9996853)
chr8 (16-148)||(22476393-22476525)
chr8 (16-70)||(11221214-11221269)
chr8 (262-304)||(25240768-25240809)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (16-313)||(16322-16621)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (17-304)||(30605402-30605687)
chr5 (16-305)||(9422224-9422514)
chr5 (16-313)||(23420258-23420558)
chr5 (138-313)||(23757958-23758132)
chr5 (138-313)||(23823414-23823588)
chr5 (16-215)||(26036972-26037173)
chr5 (16-313)||(22404464-22404758)
chr5 (84-303)||(26328926-26329143)
chr5 (16-313)||(24190025-24190319)
chr5 (17-304)||(23624040-23624324)
chr5 (153-313)||(18221408-18221567)
chr5 (192-312)||(38405698-38405818)
chr5 (119-313)||(22082391-22082583)
chr5 (17-149)||(22246215-22246347)
chr5 (18-140)||(22251914-22252036)
chr5 (84-242)||(13338818-13338975)
chr5 (260-304)||(26037184-26037228)
chr5 (85-303)||(25105157-25105371)
chr5 (85-303)||(25164250-25164464)
chr5 (85-136)||(20714618-20714669)
chr5 (18-66)||(20845740-20845789)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (17-300)||(16992-17274)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (116-313)||(8282-8479)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (17-140)||(16088-16209)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (16-143)||(36398664-36398791)
chr2 (16-313)||(24789862-24790155)
chr2 (16-302)||(22611055-22611336)
chr2 (16-313)||(12910652-12910949)
chr2 (16-303)||(23758788-23759070)
chr2 (17-143)||(26860163-26860292)
chr2 (84-304)||(19444830-19445049)
chr2 (84-313)||(21530611-21530839)
chr2 (18-210)||(19466330-19466518)
chr2 (16-120)||(15328481-15328585)
chr2 (260-313)||(19466226-19466278)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (16-313)||(26566-26863)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (16-285)||(12240-12507)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (134-313)||(6186-6365)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (31-313)||(2070-2344)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (16-143)||(40497-40624)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (16-313)||(109962-110253)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (31-313)||(36771-37048)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (16-140)||(37168-37292)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (16-313)||(25380-25670)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (16-125)||(87898-88008)
[»] scaffold0059 (2 HSPs)
scaffold0059 (17-140)||(48217-48340)
scaffold0059 (16-61)||(61424-61470)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (213-313)||(2278-2376)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (263-313)||(356998-357046)
scaffold0004 (111-196)||(357118-357202)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (84-143)||(11416-11476)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 15506428 - 15506723
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaa-caactagcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15506428 ccatctcactatcctatggtcagtcacaacccctgtgacctatcagacctaaactcaaacacaaaagttgaagttaccttcaaacaaaacaactagcacc 15506527  T
Q  115 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15506528 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattaaactcaacacacagtcctaaacatgtatcacaaacgatacaagaaagactcacaataaaggtt 15506627  T
Q  215 ctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  15506628 ctagacttgcatcacaaacgatacaagaatgaagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttt---gtatgacggcttgaataagcaattag 15506723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 313
Target Start/End: Original strand, 20991706 - 20992000
Alignment:
Q  18 atctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacctt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20991706 atctcactatcctaatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaattcaaag-ttgaagttaccttcaaacaaacaactaacacctt 20991804  T
Q  117 gtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttct 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||| | |||||    
T  20991805 gtttcacaacttcagtgtagtacacaagagtatcaaactca-cacacagtcctaaacaagtatcacaaatgatacaagaaaggatcacaatatatgttct 20991903  T
Q  217 agacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20991904 aaacttgcatcacaaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggattgaatgatcaattag 20992000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29546133 - 29545855
Alignment:
Q  17 catctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacctt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29546133 catctcactatcctatggccagtcacagcctctgtgacctatcagacctaaacacaaacttaaagat-gaagttaccttcaaacaaacaactagcacctt 29546035  T
Q  117 gtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttct 216  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29546034 gttacacaacttcggtgtagtatacaagagtatcaaactcaacacacagtcctaaacatgtatcacaaacgatacaagaaaggctcacaataaaggttct 29545935  T
Q  217 agacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacgg 296  Q
    | ||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29545934 aaacttgcatcacaatcaatacaagagtagagcacatgtagactcaaaactctaaaaatctaaactttttagaatgacgg 29545855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16207877 - 16207582
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||   |||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  16207877 ccatctcactatcctaatggccagtcacaacccctgtgacctatcagacctcaa-acaaacacaagg-ttgaagttaccttcaaacacaaacaactaaca 16207780  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaagg 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||  ||||    
T  16207779 cattgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatcaaactca-cacacaatcctaaacaaatatcacagacgatacaagaaaggctcacaa--aagg 16207683  T
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatta 312  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16207682 ttctaaacttacatcacaaacgatacaagaatagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgatggcttgaataaacaatta 16207583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 4458902 - 4459197
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||| ||    
T  4458902 ccatctcactatcctaatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaaccaaac-acaaagat-gaagttacctttaaacacaaacaactaaca 4458999  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactca-acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaag 211  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||| |||||||| || ||||||   ||||  |||||||||    
T  4459000 ccttatttcacaactttggtgtagtacacaagagtatcaaactcacacacacagtcttaaacaagtatcacatacgatacaa---aggcatacaataaag 4459096  T
Q  212 gttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatt 311  Q
     ||||| |||| ||||| | | |||||||||   ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  4459097 attctaaactttcatca-acatgatacaagagcagaatacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgagcaatt 4459195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 306
Target Start/End: Original strand, 15438410 - 15438548
Alignment:
Q  168 ctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaacc 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15438410 ctaaacatgtatcacaaacgatacaagaaaggctcacaataaaggttctagacttgcaacacaaacgatacaagaatggagcacatgtagactcaaaatc 15438509  T
Q  268 ctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15438510 ctaaaaatctaaactttttagtatgacgggttgaataat 15438548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 305
Target Start/End: Original strand, 11999042 - 11999332
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  11999042 ccatctcattatcctaatggtcagtcacagcccttgcgacctatcagacctaaaccaaaacacaaagat-gaagttaccttcaaacataaacaactaaca 11999140  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactca-acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  ||||    ||    
T  11999141 ccttgtttcacaacttcggtgtagtgcacaagagtatcaaactcacacaaacagttctaaacaagtatcacagacgatacaagaga-gaacacatagtag 11999239  T
Q  212 gttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataa 305  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11999240 attctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaactttttagaatgacgacttgaataa 11999332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 313
Target Start/End: Original strand, 12325978 - 12326269
Alignment:
Q  18 atctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaat-tgaagttaccttcaaaca--aacaactagcac 113  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    |||  |||| |||||||||| || ||||  |||||||| |||    
T  12325978 atctcactatcctaatggtcagccacaacccctgtgacctatcagacataaaca----gactcaaatatgaagttaccatcgaacacaaacaactaacac 12326073  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggt 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || || ||| ||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||  ||||||  ||||    
T  12326074 cttgtttcacaactttggtgtagtacacaagagtatcaaactc-acgcatagtcctatacaagtatcaaaaactatacaag-aaggaacacaat--aggt 12326169  T
Q  214 tctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaat-aatcaatta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  12326170 tctagacttgcatcacaaacgatacaagaatagagcacatg-agactcaaaaccctaaaaacctaaactttttagtatgacaacttgaatgaatcaatta 12326268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 161
Target Start/End: Original strand, 15436209 - 15436355
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaac-aaacaactagcacc 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15436209 ccatctcgctatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaactcaaacacagaagttgaagttaccttcaaacaaaacaactagcacc 15436308  T
Q  115 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacac 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15436309 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattaaactcaacac 15436355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 16436936 - 16437233
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagaccta-aacaa-aaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcac 113  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  16436936 ccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatcagactaacaacaacaaacacaaagat-gaagttaccttcaaacaaa-aactacaac 16437033  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaat-aaagg 212  Q
    |||| || | | ||| || |||| |||||||||| |   |||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  16437034 cttgcttaaaagctttggcgtagaacacaagagtttccaactctacacacagtcctaaacatgtatcacatacgatacaagaaaggctcgcaataaaagg 16437133  T
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatta 312  Q
    | ||| |||||||||| | | ||||||||||| || |||||| ||| | ||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16437134 tactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgaagacttaaaaccctaaaagctaaaactttttagaatgatggcttgaataatcaatta 16437232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 305
Target Start/End: Original strand, 645296 - 645584
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||  |||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  645296 ccatctcactatcgtaatggtcggtcacaaccactgtgacctatcagacataaaccaaaa--caaagatagaagttaccttccaacacaaacaactagca 645393  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | |||||  | ||||| || |||| ||||||||  | |||||||||| |  ||||    |    
T  645394 ccttgtttcacaacttcggtgtagtaca-aagagtaatcaatactcacaaaacagtcct-aacaagtatcacatgcgatacaagaaa-gaacacatacta 645490  T
Q  211 ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataa 305  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  645491 gattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataa 645584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 11588627 - 11588921
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || | |   |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11588627 ccatctcactatcttaatggtcagtaactgccctagtgacctatcagacctaaaccaacaca---aaatagaagttaccttccaacacaaacaactagca 11588723  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaagg-ctcacaataa 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |  | ||||| |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||  | |||| ||     
T  11588724 ccttgtttcacaacttcggcgtaataca-aagagtaatcaatactca-cacacagtcctaa-caagtatcacaaacgatacaagaaagaacacacagtag 11588820  T
Q  210 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaa 309  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  11588821 a--ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaactttttagtaagacggcttgaatgaacaa 11588917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Original strand, 14165329 - 14165623
Alignment:
Q  17 catctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagcac 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| | || |   |||||||||||| ||||  |||||||| |||    
T  14165329 catctcactatcctaatggtcagtcactgccccagtgacctatcagacctaaaccaaaacataata---gaagttaccttccaacacaaacaactaacac 14165425  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtat-tacactca-acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaag 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||  | ||||||| ||||| |||| |||||    
T  14165426 cttgtttcacaacttcgatgtagtaca-aagagtatcaatactcacacacacaatcctaaacaagtatcacaggcgatacaagtaaggcacacattaaag 14165524  T
Q  212 gttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatt 311  Q
     ||||| |||||||||| | | |||||||||    |  ||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||    
T  14165525 attctaaacttgcatca-acatgatacaagagcataatacacgaagactc-aaaccctaaaaatctaaac-ttttagaatgacggcttgaatgaacaatt 14165621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 299
Target Start/End: Original strand, 10661025 - 10661307
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaac-aactagcacc 114  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  10661025 ccatctcactatcttatagtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacacaa--acaaacagtgaagttaccttcaaacaaactacctaacacc 10661122  T
Q  115 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattac-actcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa--g 211  Q
     || |||||||||| ||||||||  |||  ||| |||| |||||||| ||||| || | ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||       
T  10661123 gtgcttcacaactttggtgtagtgtacacaagt-ttacaactcaacaaacagtccttagcatgtatca-agatgatacaagaaaggctcacaataaaaca 10661220  T
Q  212 gttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaa-ctttttagtatgacggctt 299  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||| | || ||||   ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10661221 ggactaaacttgcatca-acacgatacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctaaaaa-ctaaacctttttagtttgacggctt 10661307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 304
Target Start/End: Original strand, 10279977 - 10280259
Alignment:
Q  17 catctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacctt 116  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||| ||||| |||||||||  ||||| ||| ||| |   |||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  10279977 catctcattatcccatagtcaatcccagccc-tgtgatctatcagactaaaacacaaacacaga---tgaagttaccttcaaacagacaactacaacctt 10280072  T
Q  117 gtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattaca-ctcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaat-aaaggtt 214  Q
      || ||| ||| || |||| ||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  10280073 acttaacagctttggcgtagcacacaagtgt-ttacaacccaacacacagtcctaaacatttatcacaaacgatacaagaaaggctcacaataaaaggta 10280171  T
Q  215 ctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaata 304  Q
    ||| |||||||||| | | ||||||||||| || |||||| ||| || |||| |  |||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10280172 ctaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgaagactc-aaactcgtaaaagctaaactttttagaataacggcttgaata 10280259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11521406 - 11521115
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||    ||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11521406 ccatctcactatcctaatggtcagtcactaccctagtgacctgtcagacctaaaccaaaa----aaagtagaagttaccttccaacacaaacaactagca 11521311  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagta--ttacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataa 209  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||  | | |||| ||| ||||| || || | |||||||| || |||||||||||  | ||||||      
T  11521310 ccttgtttcaccacttcggtgcagtaca-aagagtaattaatactc-acaaacagtcct-aagaagtatcacagacgatacaagaaagaacacacaat-- 11521216  T
Q  210 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaa 309  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11521215 agattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatataa--cttttagaatgacggcttgaataatcaa 11521119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20925037 - 20924913
Alignment:
Q  84 tgaagttaccttcaaacaaacaactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattaca-ctcaacacacagttctaaacatgtatcac 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||   | ||| ||||||| |||||||| |  |||| ||||| ||||| | || | ||||||||||    
T  20925037 tgaagttaccttcaaacaaacagctacaaccttgcttataagctttggtgtagcacacaagatt--tacaactcaatacacaatccttagcatgtatcac 20924940  T
Q  183 aaacaatacaagaaaggctcacaataa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20924939 aaacaatacaagaaaggctcacaataa 20924913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Original strand, 42636410 - 42636463
Alignment:
Q  17 catctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaaca 70  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42636410 catctcactatcctagggtcaatcacagcccctgtgatctatcagacctaaaca 42636463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Original strand, 14926877 - 14927002
Alignment:
Q  84 tgaagttaccttcaaacaaacaactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattac-actcaacacacagttctaaacatgtatcac 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  || | | ||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||     
T  14926877 tgaagttaccttcaaacaaacaactacaacctttcttaaaagctttggcgtagcacagaagagt-ttacaactcaacacacagtccttaacatgtatca- 14926974  T
Q  183 aaacaatacaagaaaggctcacaataaa 210  Q
    ||   | ||||| |||||||||||||||    
T  14926975 aattgaaacaaggaaggctcacaataaa 14927002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Original strand, 15350343 - 15350468
Alignment:
Q  84 tgaagttaccttcaaacaaacaactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattac-actcaacacacagttctaaacatgtatcac 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  || | | ||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||     
T  15350343 tgaagttaccttcaaacaaacaactacaacctttcttaaaagctttggcgtagcacagaagagt-ttacaactcaacacacagtccttaacatgtatca- 15350440  T
Q  183 aaacaatacaagaaaggctcacaataaa 210  Q
    ||   | ||||| |||||||||||||||    
T  15350441 aattgaaacaaggaaggctcacaataaa 15350468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 3)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7537 - 7240
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7537 ccatctcactatcctatggtcagtcacaacccctgtgacctatcagacctaaacacaaactcaaaagttgaagttaccttcaaacaaacaactaacacct 7438  T
Q  116 tgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttc 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7437 tgtttaacaacttcggtgtagtacacaagagtatcaaactcaacacacagtcctaaacatgtatcacagacgatacaagaaaggctcacaatataggttc 7338  T
Q  216 tagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  7337 taaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttattagaatggcggcttgaatgatcaattag 7240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18124 - 17832
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacct 115  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18124 ccatcacactatcttatggtcagtcacaacccctgtgacctatcagaactaaacacaaactcaaaagttgaagttaccttcaaacaaacaactaacacct 18025  T
Q  116 tgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18024 tgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatcaaactcaacacacagtcctaaacatgtatcacggacgatacaagaaaggctcacaatataggttc 17925  T
Q  216 tagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatca 308  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  17924 taaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaagtctaaactttttagaatgacgacttgaatgatca 17832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27518 - 27226
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacct 115  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27518 ccatcacactatcttatggtcagtcacaacccctgtgacctatcagaactaaacacaaactcaaaagttgaagttaccttcaaacaaacaactaacacct 27419  T
Q  116 tgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27418 tgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatcaaactcaacacacagtcctaaacatgtatcacggacgatacaagaaaggctcacaatataggttc 27319  T
Q  216 tagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatca 308  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  27318 taaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaagtctaaactttttagaatgacgacttgaatgatca 27226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15162485 - 15162186
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacct-aaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaa-caactagcac 113  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15162485 ccatctcaatatcctttggtcagtcacaacccctgtgacctatcagacctcaaacacaaacacaaaagttgaagttaccttcaaacaaaacaactagcac 15162386  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  15162385 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatcaaactcaacacacagtcctaagcatgtatcacaaacgatacaagaaaggatcacactaaaggt 15162286  T
Q  214 tctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  15162285 tctaaacttgcatcataaacgatacaagagtagagcacatgtagacttaaaactctaaaaatctaaactttttagaatgatggcttgaataatcaattag 15162186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 10724421 - 10724719
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacct-aaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaa-caactagcac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||   |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  10724421 ccatctcactatcctatggtcagtcacaacccctgtgacctatcagacctcaaacacaaaca-aaacggtgaagttttcttcaaacaaaacaactagcac 10724519  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggt 213  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  10724520 ctggtttcacaacttcagtgtagtacacaagagtatcaaactcaacacacagtcctaaatatgtatcacaaatgatgcaagaaaggctcactataaaggt 10724619  T
Q  214 tctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| |||||||||    
T  10724620 cctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctacacttttcagaatgacggcttaaatgatcaattag 10724719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 10938190 - 10938488
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacct-aaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaa-caactagcac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||   |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  10938190 ccatctcactatcctatggtcagtcacaacccctgtgacctatcagacctcaaacacaaaca-aaacggtgaagttttcttcaaacaaaacaactagcac 10938288  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggt 213  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  10938289 ctggtttcacaacttcagtgtagtacacaagagtatcaaactcaacacacagtcctaaatatgtatcacaaatgatgcaagaaaggctcactataaaggt 10938388  T
Q  214 tctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| |||||||||    
T  10938389 cctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctacacttttcagaatgacggcttaaatgatcaattag 10938488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Original strand, 10191048 - 10191333
Alignment:
Q  15 tccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagc 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  10191048 tccatctcactatcctaatggtcagccacagcccctgttacctatcagacctaaaccaaaa--caaagatagaagttaccttccaacacaaacaactagc 10191145  T
Q  112 accttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaata 208  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||||| || |||| |||||||| || |||||||||||  | ||||||     
T  10191146 acctagtttctcaacttcggtgtagtaca-aagagtaatcaatactc-acacacagtcct-aacaagtatcacagacgatacaagaaagaacacacaat- 10191241  T
Q  209 aaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaat 303  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  10191242 -agattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaac-ttttagaatgacggcttgaat 10191333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 143
Target Start/End: Original strand, 10722146 - 10722271
Alignment:
Q  17 catctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10722146 catctcactatcctatggtgattcacagccactatgacctatcagacctaaacacaaactcaataat-gaagttaccttcaaacaaacaactagcacctt 10722244  T
Q  117 gtttcacaacttcggtgtagtacacaa 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10722245 gtttcacaactttggtgtagtacacaa 10722271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 143
Target Start/End: Original strand, 10935915 - 10936040
Alignment:
Q  17 catctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10935915 catctcactatcctatggtgattcacagccactatgacctatcagacctaaacacaaactcaataat-gaagttaccttcaaacaaacaactagcacctt 10936013  T
Q  117 gtttcacaacttcggtgtagtacacaa 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10936014 gtttcacaactttggtgtagtacacaa 10936040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Original strand, 21478270 - 21478396
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21478270 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacacaaactcaatga-tgaagttaacttcaaacaaacaaatagcacct 21478368  T
Q  116 tgtttcacaacttcggtgtagtacacaa 143  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||    
T  21478369 tgtttcgcaactttggtgtagtgcacaa 21478396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 313
Target Start/End: Original strand, 16384057 - 16384347
Alignment:
Q  20 ctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttc--aaacaaacaactagcacctt 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    ||| | ||||||||||||  | ||||||||||| |||| |    
T  16384057 ctcactatcctaatggtcagtcacagtctctgtgacctatcagacctaaaccaaaa---caaagtagaagttaccttccaacacaaacaactatcaccgt 16384153  T
Q  117 gtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataaaggt 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||| |  | |||| ||||||||| || |||| |||||||| || |||||||||||  | ||||||  || |    
T  16384154 gtttcacaactttggtgtagtacaaaggagtaatcaatactc-acacacagtcct-aacaagtatcacagacgatacaagaaagaacacacaat--agat 16384249  T
Q  214 tctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16384250 tctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagagt-taaaccctaaaaatctaaac-ttttagaatgatggcttgaataatcaattag 16384347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 28019467 - 28019759
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| |||| |   || | |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  28019467 ccatctcattatcctaatggtcagttattgccccagtgacctatcagacctaaaccaaaata---aagtagaagttaccttccaacacaaacaactagca 28019563  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | |||||  | |||| ||| |||| |||||||| || |||||||||   | |||| |  |    
T  28019564 ccttgtttcacaacttcggtgtagtaca-aagagtaatcaatactcacaaaacag-tcttaacaagtatcacagacgatacaagaagaacacacact--a 28019659  T
Q  211 ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaat 310  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28019660 gattctaaacttgcatcacaaacgagacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaa--cttttagaatgacggcttgaataaacaat 28019756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 299
Target Start/End: Original strand, 9069108 - 9069389
Alignment:
Q  17 catctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaac-aactagcacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  |||||   | |||| ||||| |||||||| | ||| ||||     
T  9069108 catctcactatcctatggtcagtcacaacctctgtgacctatcagacctaaacacaa--acaaacggtaaagtaaccttaaaacaaactacctaacaccg 9069205  T
Q  116 tgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattac-actcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa--gg 212  Q
    || |||||||||| ||||||||  ||| |||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||   |    
T  9069206 tgcttcacaactttggtgtagtgtacacgagt-ttacaactcaacaaacagttcttagcatgtatca-agatgatacaagaaaggctcacaataaaacag 9069303  T
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaa-ctttttagtatgacggctt 299  Q
      ||| |||||||||| | ||||||||||| | || | ||   ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  9069304 gactaaacttgcatca-acacgatacaagagtagaacgcacaaagactcaaaaccctaaaaa-ctaaacctttttagtttgacggctt 9069389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Original strand, 25116988 - 25117113
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| | | | ||  ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  25116988 ccatctcactatcctaatggtcagtcacaacccctgtgacctatcagatctaaaccaaaataaagatat--aagttaccttccaacacaaacaactagca 25117085  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtaca 140  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25117086 ccgtgtttcacaactttggtgtagtaca 25117113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15700169 - 15700047
Alignment:
Q  179 tcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatcta 278  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  15700169 tcacaaacgatacaagaaaggctcacaataagggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgtagactcaaaaccct-aaaagcta 15700072  T
Q  279 aactttttagtatgacggcttgaat 303  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||    
T  15700071 aactttttagaatgacagattgaat 15700047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 82
Target Start/End: Original strand, 8163947 - 8164013
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaa 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  8163947 ccatctcactatcctatggtcagtcacaacccctgtgacctattagacctaaacaaaaacacaaaaa 8164013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Original strand, 33746126 - 33746211
Alignment:
Q  17 catctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||||   |||||||||||||||||||||    
T  33746126 catctcactatcctatggtcagtcacaacccgtgtgacctatcaaacctaaacacaa--acaaacggtgaagttaccttcaaacaaac 33746211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19183678 - 19183385
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacct 115  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||  |||||||| |||| | | | |||||   ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19183678 ccatctcactatcctacggtcaaccacagcccttgtgat-tatcagac-taaaaacacaaacaaatggtgaagttaccttcaaacaaacaactacgacct 19183581  T
Q  116 tgtttcacaac-ttcggtgtagtacacaagagtattaca-ctcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaag-- 211  Q
    || || ||||  |||| ||||| ||| | |||| ||||| ||||||| ||||| || | ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||       
T  19183580 tgctt-acaagattcgatgtagcaca-acgagt-ttacaactcaacaaacagtccttagcatgtatca-agatgatacaagaaaggctcacaataaaaca 19183485  T
Q  212 gttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatt 311  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||| || ||||   |||  |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  19183484 gaactaaacttgcatca-acacgatacaagaatagaacacacaaagacacaaaaccctacaaa-ctaaactttttagaatgacgtcttgaatgatcaatt 19183387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18618113 - 18618054
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaa 74  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18618113 ccatctcactatcctaatggtcagtcacaacccctgtgaactatcagacctaaaccaaaa 18618054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23400124 - 23400067
Alignment:
Q  85 gaagttaccttcaaaca--aacaactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtaca 140  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23400124 gaagttaccttccaacacaaacaactagcaccttgtttcacaatttcggtgtagtaca 23400067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18601566 - 18601372
Alignment:
Q  103 acaactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggc 200  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |  | ||||| |||||||| ||||  | |||||||| || |||||||||   |    
T  18601566 acaactaacaccttgttttacaacttcggtgtagtaaa-aagagtaatcaatactca-cacacagtcctaacta-gtatcacagacgatacaagaagaac 18601470  T
Q  201 tcacaataaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttg 300  Q
     ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  18601469 acacaataga--ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaa--cttttagaatgacggcttg 18601375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 33898984 - 33898881
Alignment:
Q  17 catctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttc--aaacaaacaactagcac 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||    ||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  33898984 catctcactatcctaatggtcagtcacatcccctgtgacttattagacctaaaccaaaa---caaagtagaagttaccttccaacacaaacaactagcac 33898888  T
Q  114 cttgttt 120  Q
     ||||||    
T  33898887 tttgttt 33898881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 304
Target Start/End: Original strand, 19659844 - 19659887
Alignment:
Q  260 tcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaata 304  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19659844 tcaaaaccctaaaaa-ctaaactttttagaatgacggcttgaata 19659887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17864422 - 17864137
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacct 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17864422 ccatctcactatcctatggtaagtcacaacccctgtgacctatcagacctaaacacaaactcaaagat-gaagttaccttcaaacaaacaactcacacct 17864324  T
Q  116 tgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttc 215  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17864323 tgttttacaactttggtgtagtacacaagagtatcaaactcaacacacagtcctaaacatgtatcacagacgatacaagaaaggctcacaataaaggttc 17864224  T
Q  216 tagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaat 303  Q
    || |||||||||| | | ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17864223 taaacttgcatca-acatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccccaaaaatctaaactttatagaatgacggcttgaat 17864137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12039695 - 12039410
Alignment:
Q  27 tcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaa-caactagcaccttgtttcacaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  12039695 tcctatggtcagtcacagcccttgtgacctatcagacctaaacacaaactcaaag-ttgaagctaccttcaaccaaaacaactaacaccttgtttcacaa 12039597  T
Q  126 cttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttctagacttgca 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||    
T  12039596 cttcagtgtagtacacaagagtatcaaactca-cacacagtcctaaacaagtatcacaaacaatacaagaaaggatcacaaaataggttctaaacttgca 12039498  T
Q  226 tcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  12039497 tcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacgactttaatgaccaattag 12039410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8465669 - 8465373
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacc 114  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8465669 ccatctcactatcttaatggtcagtcacaacccctgtgacctatcagacctaaacacaaactcaaaggt-gaagttaccttcaaacaaacaactaacacc 8465571  T
Q  115 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggtt 214  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||    
T  8465570 ttctttcacaacttcggtgtagtacacaagactatcaaacgca-cacacagtcctaaacaagtatcacagacgatacaagaaagaatcacaatataggtt 8465472  T
Q  215 ctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8465471 ctaaacttgcatcataaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccttaaaaatctaaactttttagtgtgacggcttgaatgatcaattag 8465373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20989761 - 20989472
Alignment:
Q  17 catctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagcac 113  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   || | |||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  20989761 catctcactatcctaatggtcaatcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaacaca---aagtagaagttaccttcaaacacaaacaactaacac 20989665  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattac-actca-acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaag 211  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||| ||| | ||| ||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||||  |||    
T  20989664 cctgtttcacaacttcgatgtagtacacgagagtatcaatactcatacaaatagtcctaaacaagtatcacggacgatataagaaaggctcacaa--aag 20989567  T
Q  212 gttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataat 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20989566 gttctagacttgcatcacaaccgatacaagattagaggacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacagcttgagtaat 20989472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 313
Target Start/End: Original strand, 19171577 - 19171874
Alignment:
Q  15 tccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagc 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||  | |||||||||||| ||||  |||||||| |    
T  19171577 tccatctcactatcctaatggtcagtcacagcccatgtgacctatcagacctaaacaaaca-acaaag-tagaagttaccttccaacacaaacaactaac 19171674  T
Q  112 accttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattac-actcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||   |||||  ||    
T  19171675 acattgtttcacaacttcggtgtagtacagaagagtatcaatactca-cacactgtcctaa-caagtatcataaacaatacaagaaagaa-cacaaagaa 19171771  T
Q  211 ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaat 310  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||||   ||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19171772 gattctaaacttacatcacaaacgatacaagagcagaatacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaat 19171871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 25805615 - 25805882
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25805615 ccatctcactatcccaatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctacacaaaca--caaaggttgaagttaccttcaaacacaaacaactagca 25805712  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataa-ag 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || | |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||| || ||||  |||| ||| ||    
T  25805713 ccttgtttaacaacttcggtgtagtacacatgagcatcaaactc-acacatagtcctaaataagtatcacaaacgatacgag-aaggaacacagtaagag 25805810  T
Q  212 gttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactt 283  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25805811 gttctaaactttcatcacaaccgatacaagagtagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatcaaaactt 25805882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Original strand, 20558465 - 20558588
Alignment:
Q  17 catctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacctt 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20558465 catctcactatcttatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacacaaacacaaaaattaaagttaccttgaaacaaacaactagcacctt 20558564  T
Q  117 gtttcacaacttcggtgtagtaca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20558565 gtttcacaacttcggtgtagtaca 20558588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Original strand, 17234755 - 17235052
Alignment:
Q  17 catctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagcac 113  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||  | |||||||||||| ||||  || ||||| |||    
T  17234755 catcttactatcctaatggtcagtctcagcccctgtgtcctatcagaccgaaaccaaaatacaaag-tagaagttaccttccaacacaaataactaacac 17234853  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataaa 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  | |||| |  |    
T  17234854 cttatttcacaacttcggtgtagtacaaaagagtattcaatactc-acacacagtcctaaacaagtatcacaaacgatacaagaaagaacacacatt--a 17234950  T
Q  211 ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaat 310  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  17234951 gattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagact-aaaaccctaaagatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaacaat 17235049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20465751 - 20465598
Alignment:
Q  158 acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtag 257  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  20465751 acacacagtcctaaacaagtatcacaaacgatacaagaaaggttcacaatataggttctaaacttgcatcacaaaagataaaagaatagagcacatgtag 20465652  T
Q  258 attcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatt 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  20465651 actcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacaacttgaatgatcaatt 20465598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21723405 - 21723108
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||  ||||| | |||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  21723405 ccatctcactatcctactggtcagtcacagcctttgtgacctatcaaacctaaaccaaaa--caaaagtagaagttaccttccaacacaaacaactaaca 21723308  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactca-acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaag 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||| |||||    
T  21723307 ccttgtttcacaacctcggtgtagtgcacaaaagtatcaaactcacacaaacagtcctaaacaagtatcacagccgatacaagaaaggcacacagtaaag 21723208  T
Q  212 gttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatt 311  Q
     ||||| || ||||||| ||| ||||||||    ||  ||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  21723207 attctaaacctgcatcaaaaatgatacaagtgcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaac-ttttagaatgacggcatgaataaacaatt 21723110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 14259073 - 14259374
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttc--aaacaaacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  14259073 ccatctcactatcctaatggtcagtcacaacccatgtgacctatcagacctgaacacaaacacaaaggttgaagttaccttcaaaaacaaacaactaaca 14259172  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtat-tacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaat-acaagaaag-gctcacaataa 209  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | |||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||  || | |||||||  | |||| |||    
T  14259173 cattgtttgacaacttcggtgtaatacacaagagtatcaatact-tacacacagtcctaaacaagtatcactaatgataaaaagaaagaacacacagtaa 14259271  T
Q  210 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaa 309  Q
    || || || |||||||||| | | ||||||||| | ||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  14259272 agattttaaacttgcatca-acatgatacaagagtagaatacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttaatatgacgacttgaatgatcaa 14259370  T
Q  310 ttag 313  Q
    ||||    
T  14259371 ttag 14259374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 13195486 - 13195782
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  13195486 ccatctcactatcctaatggtcagtcacagccc-tgtgacctataagacctaaaccaaaa--caaaagtagaagttaccttccaacacaaacaactaaca 13195582  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataa 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||    |||| |      
T  13195583 ccttgtttcataacttcggtgtagtacaaaagagtattcaatactc-acacacagtcctaaacaagtatcacagacgatccaagaaagaaaacacagt-- 13195679  T
Q  210 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaa 309  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| || |    |  ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13195680 agattctaaacttgcatcacaaacgataaaatagcataatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaactttttagtataacggcttgaataaacaa 13195778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 305
Target Start/End: Original strand, 19100061 - 19100348
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagac-aaaaattgaagttaccttcaa--acaaacaactagc 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||  ||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  19100061 ccatctcactatcctaatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaac----agactcaaagtagaagttaccttcaaacacaaacaactaac 19100156  T
Q  112 accttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaata 208  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  | |||| ||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||  | |||| |     
T  19100157 aacttgtttcacaactttgatgtagtacacaagagtattcaatactc-acacacaatcctaaacaagtatcacagacgatacaagaaagaacacacagt- 19100254  T
Q  209 aaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataa 305  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19100255 -agattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccct-aaaatctaaacttgttactatgacggcttgaataa 19100348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9281705 - 9281410
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttc--aaacaaacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  9281705 ccatctcactatcctaatggtcagtcactgccccagtgacctatcagacctaaaccaaaa-acagaa-tagaagttaccttccaaaacaaacaactaaca 9281608  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  | |||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||      
T  9281607 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacaaaggagtaatcaatactc-acacacagtcct-aacaagtatcacaaacgatacaagaaagaacacacaat-- 9281512  T
Q  210 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaa 309  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||   ||  ||||| ||| || |||||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||||||| | |||    
T  9281511 agattctaaacttgcatcacaaatgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctacaaatttaaac-ttttagaatgactgcttgaatgaacaa 9281414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15897669 - 15897453
Alignment:
Q  18 atctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaatt-gaagttaccttcaaaca--aacaactagcac 113  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |    |||  ||| | |||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  15897669 atctcactatcctaatggtctgtcacaacccctgtgacctatcggacctaagta----gactcaaagtagaagttaccttcaaacacaaacaactaacac 15897574  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactca-acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaagg 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||| | || |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  15897573 cttgtttcacaactttggtgtagtacacaagagtatcaagctcacacaaacaatcctgaacaagtaacacaaacaatacaagaaaggctcgca--aaagg 15897476  T
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15897475 ttctagacttgcatcacaaacga 15897453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19894619 - 19894494
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19894619 ccatctcactatcctaatgctcagtcacagcccttgtgacctatcagacctaaaccaaaa--caaagatagaagttaccttccaacacaaacaactagca 19894522  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtaca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19894521 ccttgtttcacaacttcggtgtagtaca 19894494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Original strand, 33665957 - 33666249
Alignment:
Q  17 catctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagcac 113  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |   || | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  33665957 catctcactatcctaatgatcagtcaaagcccctatgacctatcagacctaaaccaaaaca---aagtagaagttacattccaacacaaacaactagcac 33666053  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtat-tacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||| ||||||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||  | ||| ||| |     
T  33666054 cttgtttcacaacttcggtgtagtacaaaggagtatcaatactc-acacacaatcct-aacaagtatcacaaacgatacaagaaagaacacacgatata- 33666150  T
Q  212 gttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatt 311  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||||    |  ||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  33666151 -ttctaaacttgcatcacaagcgatacaagagcataatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaac-ttttagaatgatggcttgaataaacaatt 33666247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Original strand, 17855358 - 17855585
Alignment:
Q  17 catctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttc--aaacaaacaactagcac 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||  | |||||||| ||||||    
T  17855358 catctcactatcctaatggtcagtcacagccgctgtgacctatcagacctaaaccaaa--acaaagatagaagttaccttccaacacaaacaattagcac 17855455  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactca---acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaata 208  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |  | |||||   ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||   | ||||||     
T  17855456 cgtgtttcacaactttggtgtagtaga-aagagtaatcaatactcactcacacacagtcct-aacaagtatcacaaacgatacaagaagaacacacaat- 17855552  T
Q  209 aaggttctagacttgcatcacaaacgatacaaga 242  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17855553 -agattctaaacttgcatcacaaacgatacaaga 17855585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 25964857 - 25965151
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  25964857 ccatatcactatcctaatggtcagtcacaacccttgtgacctatcagacctaaactaaaa--caaagatagaagttaccttccaacacaaacaactaaca 25964954  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactc-aacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataaa 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |  |  |  ||||| ||| || |||| |||||| | || ||| |||||||  | |||| |  |    
T  25964955 ccttgtttcaaaacttcggtgtagtaca-aggagtaatcaatacgtacacaaagtcct-aacaagtatcatagacgataaaagaaagaacacacagt--a 25965050  T
Q  211 ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaat 310  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  25965051 gattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaacacatgaagactc-aaaccctaaaaatct-aactttttagtatgacggcttgaatgaacaat 25965148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 25969504 - 25969798
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  25969504 ccatatcactatcctaatggtcagtcacaacccttgtgacctatcagacctaaactaaaa--caaagatagaagttaccttccaacacaaacaactaaca 25969601  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactc-aacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataaa 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |  |  |  ||||| ||| || |||| |||||| | || ||| |||||||  | |||| |  |    
T  25969602 ccttgtttcaaaacttcggtgtagtaca-aggagtaatcaatacgtacacaaagtcct-aacaagtatcatagacgataaaagaaagaacacacagt--a 25969697  T
Q  211 ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaat 310  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  25969698 gattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaacacatgaagactc-aaaccctaaaaatct-aactttttagtatgacggcttgaatgaacaat 25969795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 25973944 - 25974238
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  25973944 ccatatcactatcctaatggtcagtcacaacccttgtgacctatcagacctaaactaaaa--caaagatagaagttaccttccaacacaaacaactaaca 25974041  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactc-aacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataaa 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |  |  |  ||||| ||| || |||| |||||| | || ||| |||||||  | |||| |  |    
T  25974042 ccttgtttcaaaacttcggtgtagtaca-aggagtaatcaatacgtacacaaagtcct-aacaagtatcatagacgataaaagaaagaacacacagt--a 25974137  T
Q  211 ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaat 310  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  25974138 gattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaacacatgaagactc-aaaccctaaaaatct-aactttttagtatgacggcttgaatgaacaat 25974235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17527882 - 17527587
Alignment:
Q  15 tccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagc 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| | || |   |||||||||||| ||||  |||||||| |    
T  17527882 tccatctcactatcctaatggtcagtcactgccctagtgacctatcagacctaaaccaaaacataata---gaagttaccttccaacacaaacaactaac 17527786  T
Q  112 accttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaa-cacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaagg-ctcacaataa 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |  |  ||| |||| ||| |||| || |||||| | || ||| |||||||  | |||| ||     
T  17527785 accttgtttcaaaacttcggtgtagtaca-aagaataatcaatacaaacacaaagtcctaa-caagtatcaaagacgataaaagaaagaacacacagtag 17527688  T
Q  210 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaa 309  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17527687 a--ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaattctaaactttttagtatgacggcttgaatgagcaa 17527591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29253542 - 29253383
Alignment:
Q  153 actcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaat-aaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcac 251  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||| || |||    
T  29253542 actctacacacagtcctaaacatgtatcacaaatgatacaagaaaggctcacaataaaaggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacac 29253444  T
Q  252 atgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    ||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||    
T  29253443 atgaagactcaaaatcct-aaaagctaaactttttagaatgatggcttggatgatcaattag 29253383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 34657147 - 34657018
Alignment:
Q  17 catctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaa--acaaac-aactagca 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | ||| | ||||||||||||||  |||||| | ||| ||    
T  34657147 catctcactatcctaatggtcagtcacagccactgtgacctatcagacctaaacacaaactc-aaagtagaagttaccttcaaacacaaactacctaaca 34657049  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34657048 ccttgtttcacaacttcggtgtagtgcacaa 34657018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 20470199 - 20470110
Alignment:
Q  17 catctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaa 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20470199 catctcactatcctaatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacacaaacac-aaagttgaagttaccttaaaacaaacaa 20470110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21706344 - 21706210
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttc--aaacaaacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||||||  | |||||||||||  |    
T  21706344 ccatctcactatcctactggtcagtcacagcccctatgacatatcagacctaaaccaaa--acaaaagtagaagttaccttccaacacaaacaactaaaa 21706247  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtat 149  Q
     ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  21706246 acttgtttcataacttcggtgtaatgcacaagagtat 21706210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23882627 - 23882399
Alignment:
Q  84 tgaagttaccttcaaacaaacaactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcaca 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||| || |||| |||||||||| |   |||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  23882627 tgaatttaccttcaaacaaacaactgcaaccttgcttaacaactttggcgtagcacacaagagtttataactcaacacacagtccttaacatgtatca-a 23882529  T
Q  184 aacaatacaagaaaggctcacaataaa--ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaac 281  Q
    |   |||||||||||||||||||||||   |  ||| ||||| |||| | ||||||||||| | || ||||   ||| |||||||||| |||||||||||    
T  23882528 actgatacaagaaaggctcacaataaaacaggactaaacttgaatca-acacgatacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccct-aaaatctaaac 23882431  T
Q  282 tttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    ||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  23882430 tttatataatgacggcttgaatgatcaattag 23882399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 303
Target Start/End: Original strand, 23879133 - 23879333
Alignment:
Q  99 acaaacaactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||||| || |||| ||||||||||| ||  |||||    
T  23879133 acaaacaactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtaca-aagagtaatcaatactc-acacacagtcct-aacaagtatcacaaacgatgtaagaa 23879229  T
Q  197 ag-gctcacaataaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacg 295  Q
    ||  | |||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || |||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  23879230 agaacacacagt--agattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaacccgaaaaatctaaac-ttttagaatgacg 23879325  T
Q  296 gcttgaat 303  Q
    ||||||||    
T  23879326 gcttgaat 23879333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13870397 - 13870276
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagtta-ccttcaa-acaaacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||| | ||||| ||||||||||| ||    
T  13870397 ccatctcactatcctaatggtcagtcacagccctagtgacctatcagacctaaaccaaa--acaaaagtagaagttatctttcaacacaaacaactaaca 13870300  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtag 136  Q
     |||||||||||||||||| ||||    
T  13870299 gcttgtttcacaacttcggcgtag 13870276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 313
Target Start/End: Original strand, 19077548 - 19077601
Alignment:
Q  260 tcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  19077548 tcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtattacggcttgaatgaacaattag 19077601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 29254913 - 29254825
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagac-ctaaacaa-aaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaa 103  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29254913 ccatctcactatcctatagtcaatcacagcccatgtgatctatcagactaaaaacaacaaacacaaaga-tgaagttaccttcaaacaaa 29254825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 242
Target Start/End: Original strand, 20558646 - 20558676
Alignment:
Q  212 gttctagacttgcatcacaaacgatacaaga 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20558646 gttctagacttgcatcacaaacgatacaaga 20558676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13515592 - 13515298
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaatt-gaagttaccttcaaaca--aacaactagc 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||  ||| | |||||||||||||||||  |||||||| |    
T  13515592 ccatctcactatcctaatggtcagtcacaacccctgtgacctatcagacctagc-----agactcaaagtagaagttaccttcaaacacaaacaactaac 13515498  T
Q  112 accttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  13515497 accttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattcaatactca-cacacagtcctaaacaagtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaa--a 13515401  T
Q  210 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13515400 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgataaa 13515301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 313
Target Start/End: Original strand, 19634044 - 19634338
Alignment:
Q  18 atctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaatt-gaagttaccttcaaaca--aacaactagcac 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||  ||| | |||||||||||||||||  |||||||| ||     
T  19634044 atctcactatcctaatggtcagtcacagcccctgtgacttatcagacctaaaca----gactcaaagtagaagttaccttcaaacacaaacaactaacat 19634139  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactca-acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaagg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||| |||||    ||||||| || |||||||||||||||||||  ||||    
T  19634140 cttgtttcacaacttcagtgtagtacacaagagtatcaacctcacacaaacagtcctaaaagaatatcacagacgatacaagaaaggctcacaa--aagg 19634237  T
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatta 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19634238 ttctagacttgcatcataaacgatacaagaatagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaattaacaatta 19634337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18064201 - 18063909
Alignment:
Q  17 catctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacctt 116  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  18064201 catctcactatctaatggtcagtcacagcccctgcgacctataagacctaaacaaacaca---aagttgaagttaccttcgaacaaacaactaacaccgt 18064105  T
Q  117 gtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataa-aggttc 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| |||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  18064104 gtttcacaactttggtgtagtacacatgagtatcaaactca-cacacaatcctaaacaagtagcacaaacgatacaagaa-ggaacacaataagaggttc 18064007  T
Q  216 tagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18064006 taaacttgcatcacaaacgatacatgagtagagcacataaagactcaaaaccgtaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaacaattag 18063909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18034892 - 18034608
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacc 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18034892 ccatctcactatcctaatggtcagtcacaacccctgcgacctatcagacctaaacaaacaca---aagttgaagttaccttcaaacaaacaactaacacc 18034796  T
Q  115 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataa-aggt 213  Q
     ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  || | ||| ||||    
T  18034795 gtgtttcataacgttggtgtagtacacatgagtatcaaactc-acacacactcctaaacaagtatcacaaacgatacaag-aaggaacatagtaagaggt 18034698  T
Q  214 tctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaat 303  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18034697 tctaaacttgcatcacaaacaatacaagagtagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaat 18034608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 305
Target Start/End: Original strand, 44452659 - 44452933
Alignment:
Q  31 atggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagcaccttgtttcacaactt 128  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  44452659 atggtcagtcacaacccctatgacctatcagacctaaaccaaaacacaaagat-gaagttaccttcaaacacaaacaactaacaccttgtttcacaactt 44452757  T
Q  129 cggtgtagtacacaagagtattacactca-acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataaaggttctagacttgcat 226  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||  | |||| |  || ||||| |||||| |    
T  44452758 cggtgtagtacacaagagtatcaaactcacacaaacaattctaaacaagtatcacagacgatacaagagagaacacacagt--agattctaaacttgctt 44452855  T
Q  227 cacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataa 305  Q
    ||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44452856 cacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaactttttagaatgacggcttgaataa 44452933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20748156 - 20748036
Alignment:
Q  20 ctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcaccttgtt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20748156 ctcactatcctatggtcagtcacaacccctgtgatctatcagacctaaacacaaacacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacattgtt 20748057  T
Q  120 tcacaacttcggtgtagtaca 140  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20748056 tcacaacttcggtgtagtaca 20748036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Original strand, 11656184 - 11656311
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11656184 ccatctcactatcctatggccagtcacagccactgtgacctatcagacctaaacacaaactcaaacaatgaagttaccttcaaacaaacaactagcacct 11656283  T
Q  116 tgtttcacaacttcggtgtagtacacaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11656284 tgtttcacaactttggtgtagtacacaa 11656311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 288
Target Start/End: Original strand, 295622 - 295885
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacct 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||| | | | || ||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  295622 ccatctcactatcctatagtcagtcacagcccttgtgatctatcagac-taaaaacaaacaaacagat-gaatttaccttcaaacaaacaagtagtacct 295719  T
Q  116 tgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaat-aaaggtt 214  Q
    |  |||||||||| ||||||||| ||| ||       |||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||    
T  295720 tacttcacaactttggtgtagtaaacatga-------actcaacacacagtccttaacatgtatcacaaacgacacaacaaaggctcacaataaaaggtt 295812  T
Q  215 ctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttag 288  Q
    ||| |||| ||||| | | |||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  295813 ctaaacttacatca-acatgatataagagtagagcacatgtagaatcaaaatcctaaaaatctaaaatttttag 295885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 303
Target Start/End: Original strand, 28051299 - 28051585
Alignment:
Q  17 catctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaa-caa-aaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacc 114  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  28051299 catctcactatcctatagttagtcacaacccctgtgatctatcagactaaaaacaacaaacacaaagat-gaagttaccttcaaacaaacaactacaacc 28051397  T
Q  115 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaat-aaaggt 213  Q
     |  |||| | |||  | |||||||||| ||||||   |||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  28051398 gtacttcagagcttttgagtagtacacatgagtatacaactcaacacacagtccttaacatgtatcacaaacgacacaagaaaggctcacaataaaaggt 28051497  T
Q  214 tctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaat 303  Q
      || |||||||||| | | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| || | ||||||||||| | |||||| |||||||    
T  28051498 aataaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgtagactcaaaaccct-aacagctaaacttttttgaatgacgtcttgaat 28051585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 18547811 - 18548106
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | ||  ||||| | |||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  18547811 ccatcttactatcctaatggtcagtcacaacccctatgacctaacagacctaaaccagaa--caaaagtagaagttaccttccaacacaaacaactaaca 18547908  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtat-tacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaag 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | |||| ||||||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||  | |||    ||    
T  18547909 ccttgtttctcaacttcggtgtagtacaaaggagtatcaatactc-acacacaatcct-aacacgtatcacaaacgatacaagaaagaat-acatagtag 18548005  T
Q  212 gttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatt 311  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  18548006 attctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccttaaaaatctaaactttttagaatgacggcttgaatgaacaatt 18548104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 24195686 - 24195981
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||| |   || | |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24195686 ccatctcactatcctaatgggcagtaactgccctagtgacctatcagacctaaaccaaaaca---aagtagaagttaccttccaacacaaacaactagca 24195782  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaa-caatacaagaaagg-ctcacaata 208  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | ||||| |||||||| |||| || |||||||||| | |||||||||||  | |||| ||    
T  24195783 ccgtgtttcacaactttggtgtagtaca-aagagtaatcaatactca-cacacagtcctaa-caagtatcacaaaacgatacaagaaagaacacacagta 24195879  T
Q  209 aaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatca 308  Q
     |  ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  24195880 ga--ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagacgaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaaca 24195976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 18477095 - 18477217
Alignment:
Q  20 ctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcaccttgtt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18477095 ctcactatcctatggtcagtcacagccattgtgacctatcagacctaaacacaaactcaatgat-gaagttaccttcaaacaaacaactagcacattgtt 18477193  T
Q  120 tcacaacttcggtgtagtacacaa 143  Q
    || |||||| ||||||||||||||    
T  18477194 tcgcaactttggtgtagtacacaa 18477217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17042750 - 17042464
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaac-aactagcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||   ||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  17042750 ccatctcactatcctatggtcagtgacagcccctgtgacctatcagacctaaacacaa--acaaacggtgaagttaccttcaaacaaactacctaacacc 17042653  T
Q  115 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattac-actcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa--g 211  Q
     || |||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| |||||||| ||||| || | ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||       
T  17042652 gtgcttcacagctttggtgtagtgtacacgagt-ttacaactcaacaaacagtccttagcatgtatca-agatgatacaagaaaggctcacaataaaata 17042555  T
Q  212 gttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaat 303  Q
    |  ||| |||||||||| | ||| ||||||| | || ||||   ||| ||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  17042554 gaactaaacttgcatca-acacgttacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctacaaactaaaactttttagtttgacggcttgaat 17042464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15635869 - 15635572
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||| || ||    
T  15635869 ccatcacactatcctaatggtcaatcacagctcctgtcacctatcagacctaaaccaaaa--caaagatagaagttaccttccaacacaaacaattaaca 15635772  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaagg-ctcacaataa 209  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |  | ||||| |||||||| |||| || ||||||||  | ||||||| |||  | |||| ||     
T  15635771 ctgtgtttcacaactttggtgtagtacaaaggagtaatcaatactca-cacacagtcctaa-caagtatcacaggcgatacaagcaagaacacacagtag 15635674  T
Q  210 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaa 309  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15635673 a--ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaacaa 15635577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 13790842 - 13791134
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttc--aaacaaacaactagca 112  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||  |||||||||||  | |||||||| |||||    
T  13790842 ccatctcactattctaatgatcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaaccaaaa---caaaataaaagttaccttccaacacaaacaattagca 13790938  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaagg 212  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |   |  ||||||||| || |||| || ||||| || |||||||||| |  ||||    ||     
T  13790939 ccgtgtttcaaaactttggtgtagtacaaaagagtatcaatattcacacacagtcct-aacaagtgtcacagacgatacaagaaa-gaacacagagtaga 13791036  T
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatta 312  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13791037 ttctaaacatgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaa--cttttagaatgacggcttgaataatcaatta 13791133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17136136 - 17135847
Alignment:
Q  20 ctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttc--aaacaaacaactagcacctt 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||| |    
T  17136136 ctcactatcctaatggtcagtcactgccccagtgacctatcagacctaaaccaaa--acaaaagtagaagttaccttccaacacaaacaactagcaccgt 17136039  T
Q  117 gtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataaaggt 213  Q
     |||||| |||| ||||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||  | |||| |  || |    
T  17136038 atttcaccactttggtgtagtaca-aagagtaatcaatactc-acacacagtcct-aacaagtatcacaaacgatacaagaaagaacacacagt--agat 17135944  T
Q  214 tctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  17135943 tctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaa--cttttagaatgatggcttgaatgaacaattag 17135847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18483367 - 18483075
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcct-atggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |   || | |||||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  18483367 ccatctcactatcctgatggtcagtcacaacccctgtgacctatcagaccgaaaccaaaaca---aagtagaagttaccttccaacacaaacaa-tagca 18483272  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataa 209  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||    
T  18483271 ccgtgtttcacaactttggtgtagtaca-aagagtaatcaatactc-acacacagtcct-aacaagtatcacagacaatacaagaaagaacacacaataa 18483175  T
Q  210 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaa 309  Q
    |  ||||| |||||||||||||| |||||||||    |  ||||  ||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| | |||    
T  18483174 a--ttctaaacttgcatcacaaatgatacaagagcataatacataaagactc-aaaccctaaaaatctaaac-ttttagaatgacgacttgaatgaacaa 18483079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 17702569 - 17702864
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||| |   || | |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17702569 ccatctcactatcctaatgggcagtaactgccctagtgacctatcagacctaaaccaaaaca---aagtagaagttaccttccaacacaaacaactagca 17702665  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaa-caatacaagaaagg-ctcacaata 208  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | | ||| |||||| | |||| || |||||||||| | |||||| ||||  | |||| ||    
T  17702666 ccgtgtttcacaactttggtgtagtaca-aagagtaatcaatagtca-cacacaatcctaa-caagtatcacaaaacgatacaaaaaagaacacacagta 17702762  T
Q  209 aaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatca 308  Q
     |  ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  17702763 ga--ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagacgagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaactttttagtatgatggcttgaatgaaca 17702859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Original strand, 8224998 - 8225122
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaac-aactagcac 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||      ||   ||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  8224998 ccatctcactatcctaatggtcagtcacaaccactgtgacctatcagacctaaacaaa-----caactgtgaagttaccttcaaacaaactacctaacac 8225092  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8225093 cttgtttcacaacttcggtgtagtgcacaa 8225122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23954553 - 23954261
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttc--aaacaaacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    ||| | ||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  23954553 ccatctcactatcctaatggtcagtcactgccccagtgacctatcagacctaaaccaaaa---caaagtagaagttaccttccaacacaaacaattagca 23954457  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa 210  Q
    |  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |  | |||| ||||||||| || |||| |||||||| || |||||||||   | ||||||  |    
T  23954456 ctatgtttcacaactttggtatagtaca-aagagtaatcaatactc-acacacagtcct-aacaagtatcacatacgatacaagaagaacacacaat--a 23954362  T
Q  211 ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaat 310  Q
    | || || |||||||||||||||||||||| |   ||  ||||| ||| || ||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||    
T  23954361 gattttaaacttgcatcacaaacgatacaaaagcagaatacatgaagactc-aaaccttgaaaatctaaac-ttttagaatgacggcttgaatgaacaat 23954264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6579531 - 6579263
Alignment:
Q  30 tatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaac-aactagcaccttgtttcacaactt 128  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  |||||   ||||||||||||||||||||| | ||| || | || |||||| |||    
T  6579531 tatggtcagtcacagcccatgtaacctatcagacctaaacacaa--acaaacggtgaagttaccttcaaacaaactacctaacatcgtgcttcacagctt 6579434  T
Q  129 cggtgtagtacacaagagtattac-actcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa--ggttctagacttgca 225  Q
     ||||||||  ||| |||| |||| |||||||| ||| | || | ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||   |  ||| |||||||    
T  6579433 tggtgtagtgtacacgagt-ttacaactcaacaaacaatccttagcatgtatca-agatgatacaagaaaggctcacaataaaacaggactaaacttgca 6579336  T
Q  226 tcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaa-ctttttagtatgacggctt 299  Q
    ||| | ||||||||||| | || ||||   ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  6579335 tca-acacgatacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctaaaaa-ctaaacctttttagtttgacggctt 6579263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1919239 - 1919107
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaa--caaacaactagca 112  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |   |  | |||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  1919239 ccatctcactatgctaatggtcagtcactgccccagtgacctatcaaacctaaaccaaaaca---aggtagaagttaccttccaagacaaacaactagca 1919143  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagta 148  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  1919142 ccgtgtttcacaactttggtgtagtatagaagagta 1919107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7028824 - 7028774
Alignment:
Q  263 aaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  7028824 aaaccctaaaaatctaaactttttaatatgacggcttaaataaacaattag 7028774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 286839 - 286703
Alignment:
Q  71 aaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattaca-ctcaacacacagttct 169  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | | ||| ||||||| ||| | || |  |||| ||||||||||||| ||    
T  286839 aaaacacaaaagatgaagttaccttcaaacaaacaactacaaccttgcttaaaagctttggtgtagcaca-atgact--tacaactcaacacacagtcct 286743  T
Q  170 aaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa 210  Q
     |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||    
T  286742 taacatgtatcaagaaga-tacaagaaaggctcacaataaa 286703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1919038 - 1918947
Alignment:
Q  219 acttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  1919038 acttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaa--cttttagaatgacggcttgaatgaacaattag 1918947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 143
Target Start/End: Original strand, 13914019 - 13914079
Alignment:
Q  84 tgaagttaccttcaaacaaac-aactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||| || |||||| ||| ||||||||||||||    
T  13914019 tgaagttaccttcaaacaaactacctaacaccgtgcttcacagctttggtgtagtacacaa 13914079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11667860 - 11667607
Alignment:
Q  15 tccatctcactatcctat--ggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagca 112  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| || |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  11667860 tccatctcactatcctatatggtcagtcacaacccctgtgacctatcagacctaaacacaaactcaaatat-gaagttacattcaaacaaacaactaaca 11667762  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaagg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11667761 ccttgtttcataacttcggtgtagtacacaagagtatcaaactcaacacacagtccttaacatgtatcacaaacgatacaagaaaggatcacaataaagg 11667662  T
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaacc 267  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| | | || |||||||||| ||||||||    
T  11667661 ttctaaacttgaatcacaaacgatacaaaagtagaacacatgtagactcaaaacc 11667607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Original strand, 24986163 - 24986440
Alignment:
Q  17 catctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||  |||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  24986163 catctcactatcctatggtcagtcacaactcctgtaacctatcaaacctaaacacaaactcaaagat-gaagttaccttcaaa-aaacaaccaacacctt 24986260  T
Q  117 gtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24986261 gtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatcaaactcaacacacagtcctaaacatgtatcacaaacgatacaagtaaggctcacaataaaggttct 24986360  T
Q  217 agacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    | ||||||||||||||||                 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  24986361 aaacttgcatcacaaacg-----------------atgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagaatgacggcttgaatgatctattag 24986440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20841261 - 20840965
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaatt-gaagttaccttcaaaca--aacaactagc 111  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||  ||| | |||||||||||||||||  |||||||| |    
T  20841261 ccatctcactatcctaatggttagtcacatcccctgtgacctatcagacctaaaca----gactcaaagtagaagttaccttcaaacacaaacaactaac 20841166  T
Q  112 accttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactca-acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| | ||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||    
T  20841165 accttgttttacaacttcggtgtagtgcataagagtatcaaactcacacaaatagtgctaaacaagtatcacaaatgatataagaaaggctcacaa--aa 20841068  T
Q  211 ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaat 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20841067 ggttatagacttgcatcacaaacgatacaagaatatagcacataaagactcaaaacactaaaaatctaaactttttagtatgacggcttaaatgatcaat 20840968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 313
Target Start/End: Original strand, 4246200 - 4246494
Alignment:
Q  18 atctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttc--aaacaaacaactagcacc 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||  | ||||||||||| ||||    
T  4246200 atctcactatcctaatggtcagtcacagcccctctgacctatcagacctaaaccaaaacac-aaagtagaagttaccttccaacacaaacaactaacacc 4246298  T
Q  115 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataaag 211  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||  ||||||| || |||||||||||  | ||||||  ||    
T  4246299 ttatttcacaacttcggtgtagt--acaagagtattcaatactc-acacacagtcctaaacaaatatcacatacgatacaagaaagaacacacaat--ag 4246393  T
Q  212 gttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatt 311  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||    |  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  4246394 attctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcaaaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaactttttagtatggcggcttgaatgaacaatt 4246492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 312
Target Start/End: Original strand, 13165557 - 13165850
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13165557 ccatctcactatcctaatggtcagtcactgccgcaatgacctatcagacctaaaccaaaa--caaaagtagaagttaccttctaacacaaacaactagca 13165654  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||||| || |||| |||||||| || |||||||||   | |||| |  |    
T  13165655 ccttgtttcacaacttcggtgtagtaca-aagagtaatcaatactc-acacacagtcct-aacacgtatcacagacgatacaagaagaacacacagt--a 13165749  T
Q  211 ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaat 310  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||  ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  13165750 gattctaaacttgcatcacaaccgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacgacttgaatgaacaat 13165848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23477931 - 23477644
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacct 115  Q
    ||||||||  ||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  23477931 ccatctcagaatcctctagtcaatcatagcccctgtgatctatcaaacttaaacacaaacacaaagat-gaagttaccttcaaataaacaactacaacct 23477833  T
Q  116 tgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattaca-ctcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaat-aaaggt 213  Q
       || ||| ||| || |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23477832 aacttaacagctttggcgtagcacacaagagt-ttacaactcaacacacaattctaaacatgaatcacaaaagatacaagaaaggatcacaataaaaggt 23477734  T
Q  214 tctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataat 306  Q
     ||| |||||||||||  | ||||||||||| || |||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23477733 actaaacttgcatcac--atgatacaagaatagaacacatgaagactcaaaaccct-aaaagataaactttttagaatgacggcttgaataat 23477644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26972395 - 26972102
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaa--caaacaactagca 112  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |   |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  26972395 ccatctcactatcttaatggtcagtcactgccccagtgacc-atcagacctaaaccaaaaca---aaatagaagttaccttccaatacaaacaactagca 26972300  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||||| || |||| |||||||| || |||||||||||  | ||||||      
T  26972299 ccttgtttcacaacttcggtgtagtaca-aagagtaatcaatactc-acacacagtcct-aacaagtatcacagacgatacaagaaagaacacacaat-- 26972205  T
Q  210 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaa 309  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  26972204 agattctaaacttgaatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaactatttagtatgacggcttgaatcaacaa 26972106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Original strand, 12753222 - 12753509
Alignment:
Q  15 tccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaac-aactagcac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||   ||||||||||||||||||||| | ||| ||     
T  12753222 tccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacatatcagacctaaacataa--acaaacgatgaagttaccttcaaacaaactacctaacat 12753319  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattac-actcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa-- 210  Q
    | || |||| | |||  |||||||  ||| |||| |||| |||||||| ||||| || | ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||      
T  12753320 cgtgcttcatagctttagtgtagtgtacatgagt-ttacaactcaacaaacagtccttagcatgtatca-agatgatacaagaaaggctcacaataaaac 12753417  T
Q  211 ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaac-tttttagtatgacggcttgaat 303  Q
     |  ||| |||||||||| | ||||||||||| | || ||||   ||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12753418 agaactaaacttgcatca-acacgatacaagagtagaacacacaaagactaaaaaccctaaaaa-ctaaacttttttagtttgacggcttgaat 12753509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17851369 - 17851077
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacct 115  Q
    |||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||   |||   ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  17851369 ccatctcactatcccacagtcaatcacagcccctgtgat-tatcagacttaaaacaaaa---aaacggtgaagttaccttcaaacaaacaactacaacct 17851274  T
Q  116 tgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattac-actcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa--gg 212  Q
    || || | |  || || |||| |||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||   |    
T  17851273 tgcttaatagttttggcgtagcacacaagagt-ttacaactcaacacacagtccttaacatgtatca-aactgatacaagaaaggctcacaataaaacag 17851176  T
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatta 312  Q
      ||| |||||||||| |  |||||||||| | || ||||   ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17851175 gactaaacttgcatca-acgcgatacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctaaaaa-ctacactttttagaatgacggcttgaataatcaatta 17851078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15804040 - 15803812
Alignment:
Q  84 tgaagttaccttcaaacaaacaactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattac-actcaacacacagttctaaacatgtatcac 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  || | | ||| || |||| |||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||||||||     
T  15804040 tgaagttaccttcaaacaaacaactacaaccttacttaaaagctttggcgtagcacacaagagt-ttacaactcaacacacaatccttaacatgtatca- 15803943  T
Q  183 aaacaatacaagaaaggctcacaataaa--ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaa 280  Q
    ||   |||||||||||||||| ||||||   |  ||| |||||||||| | ||||||||||| | || ||||   | | |||||| ||| |||||||| |    
T  15803942 aactgatacaagaaaggctcataataaaacagaactaaacttgcatca-acacgatacaagagtagaacacacaaatactcaaaatcct-aaaatctaga 15803845  T
Q  281 ctttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15803844 ctttttagaatgacggcttgaataatcaattag 15803812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14745778 - 14745487
Alignment:
Q  17 catctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttc--aaacaaacaactagcac 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    |||   ||||||||||||  | |||||||| ||||||    
T  14745778 catctcactatcctaatggtcagtcacagtcccagtgatctatcagacctaaaccaaaa---caaagcagaagttaccttccaacacaaacaattagcac 14745682  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaa-ggctcacaataaa 210  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||| || |||||| || |||| |||||||| || ||||||||||   | ||||||  |    
T  14745681 cgtgtttcacaactttggtgtagtaca-aagagtaatcaatactc-acgcacagtcct-aacaagtatcacagacgatacaagaaataacacacaat--a 14745587  T
Q  211 ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaat 310  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||   ||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| | ||||    
T  14745586 gattctaaacttgcatcacaaatgatacaagagaagaatacatgaagactc-aaaccctaaaattctaa--cttttagaatgacggcttgaatgaacaat 14745490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 47941272 - 47941212
Alignment:
Q  84 tgaagttaccttcaaacaaac-aactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||| || |||||| ||| ||||||||||||||    
T  47941272 tgaagttaccttcaaacaaactacctaacaccgtgcttcacagctttggtgtagtacacaa 47941212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27925443 - 27925153
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctat-ggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  27925443 ccatctcactatcctaaaggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctgaacacaaag-------ttgaagttaccttcaaacacaaacaactaaca 27925351  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaagg 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||   |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  27925350 ccttgtttcacaacttcagtgtagtacacaagagtatcaaactca---cacagtcctaaacaagtatcacaaacgatacaagaaaggatcacaatatagg 27925254  T
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatta 312  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  27925253 ttctaaacttgcatcacaaatgataaaagaatagaacacatgtagactcaaaatcctaaaaatctaacctttttagtatgccagcttgaatgatcaatta 27925154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 45136277 - 45136569
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |   || | |||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  45136277 ccatctcactatcctaatggtcagtcacagcccctgtgacctctcagacctaaacaaactca---aagtagaagttaccttcaaacacaaacaactaaca 45136373  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaagg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |   |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||  ||    
T  45136374 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtat--caatactcacacagtcctaaacaagtatcacaaacgatacaagaa-ggaacacaata--gg 45136468  T
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45136469 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatagagctcataaagactcaaaaccctaaaaatctatactttttagtatgacggcttgaataatcaatta 45136568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13660369 - 13660074
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacc 114  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||| | | ||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13660369 ccatctcactctcctaatggtcggtcatagcccatgtgacctatcagacctaaacacaaactcaacagt-gaaattatcttcaaacaaacaactaacacc 13660271  T
Q  115 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  13660270 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaaaagtatcaaactca-catacagttctaaacaagtatcacatatgatacaagaaagtatcacaataaaggtt 13660172  T
Q  215 ctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  13660171 ctaaacttgcatcacaaacgatacaagaatagagcacatgtagactcaaaactct-aaaatttaaattttttagtataacgacttgaatgatcaattag 13660074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13719012 - 13718717
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacc 114  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||| | | ||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13719012 ccatctcactctcctaatggtcggtcatagcccatgtgacctatcagacctaaacacaaactcaacagt-gaaattatcttcaaacaaacaactaacacc 13718914  T
Q  115 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  13718913 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaaaagtatcaaactca-catacagttctaaacaagtatcacatatgatacaagaaagtatcacaataaaggtt 13718815  T
Q  215 ctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  13718814 ctaaacttgcatcacaaacgatacaagaatagagcacatgtagactcaaaactct-aaaatttaaattttttagtataacgacttgaatgatcaattag 13718717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 304
Target Start/End: Original strand, 33977221 - 33977506
Alignment:
Q  17 catctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca-aacaactagcacct 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  33977221 catctcactatcatatggtcagtcagagcccctatgacctatcagacttaaacacaaactcaaggat-gaagttaccttcaaacacaacaagtaacacct 33977319  T
Q  116 tgtttcacaa-cttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggtt 214  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  33977320 tgctt-acaagctttggtgtagtacacaagagtatcaaactcaacacacagtcctaaacatgtatcacagacgatacgagaaaggctcacaataaagatt 33977418  T
Q  215 ctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaata 304  Q
    ||| ||||| |||| | | ||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  33977419 ctaaacttgaatca-acatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccttaaaaatctaaac-ttttagaatgacggcttgaata 33977506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 304
Target Start/End: Original strand, 33961909 - 33962187
Alignment:
Q  24 ctatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca-aacaactagcaccttgtttca 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||  || ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| || |    
T  33961909 ctatcttatgttcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaagcacaaactcaaggat-gaagttatctttaaacacaacaactaacaccttgctt-a 33962006  T
Q  123 caac-ttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttctagact 221  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33962007 caaggtttggtgtagtacacaaaagtatcaaactcaacacacagtcctaaacatgtatcacagacgatacgagaaaggctcacaataaaggttctaaact 33962106  T
Q  222 tgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaata 304  Q
    |||||||   | ||||||||| | ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  33962107 tgcatca-gcaggatacaagagtagagcacatgtagactcaaaatcttaaaaatctaaac-ttttagaatgacggcttgaata 33962187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 24092119 - 24092415
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacct 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||   |||| | |  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24092119 ccatctcactatcctatagtcagtcacagcccctgcgagctatcagactagaacacagactcaaacggtgaagttaccttcaaacaaacaactagcacct 24092218  T
Q  116 tgtttcacaa-cttcggtgtagtacacaagagtattaca-ctcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaat-aaagg 212  Q
    || || |||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24092219 tgctt-acaagctttggtgtagtactcaagagt-ttacaactcaacacacaatcctaaacatgtatcaaaaacgatacaagaaaggctcacaataaaagg 24092316  T
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatta 312  Q
    | ||| || ||||||| | | ||||||||  | |  |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24092317 tactaaacctgcatca-acatgatacaagcctagcacacatgtagactcaaacccct-aaaatctaaactttttagaatgacggcttgaatactcaatta 24092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23541405 - 23541108
Alignment:
Q  18 atctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagcacc 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |  ||||||   ||||    
T  23541405 atctcactatcctaatggtcagtcacaacccctgtaacctattaaacctgaacacaaacacaaag-ttgaagttaccttcaaatagaaacaacatacacc 23541307  T
Q  115 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtat-tacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaa-ggctcacaataaagg 212  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||     |||| |||||     
T  23541306 ttgtttcacaactttggtgaagtacacaagagtatcaatactc-acacacaatcctaaacaagtatcacaaacgatacaagaaataagacacagtaaaga 23541208  T
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatta 312  Q
    ||||| |||||||||| | | |||| ||||   ||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  23541207 ttctaaacttgcatca-acatgataaaagagcagaatacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacgacttgaatgattaatta 23541109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 22485296 - 22485590
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||  |||||||||||||||||||  |||| |   || | |||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  22485296 ccatctcactatcctaatggtcagtcactaccctagtgacctatcagacctaaatcaaaaca---aagtagaagttaccttcaaacacaaacaactaaca 22485392  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa 210  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | ||||| |||||||| |||| || |||||||| || |||||||||   |  ||| || |    
T  22485393 ccgtatttcacaactttggtgtagtacaaaagagtaattaatactca-cacacagtcctaa-caagtatcacagacgatacaagaagaacatacactaga 22485490  T
Q  211 ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaat 310  Q
      ||||| |||||||||||||| |||||||||   ||  ||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  22485491 --ttctaaacttgcatcacaaatgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaacccaaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaacaat 22485587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 9996662 - 9996853
Alignment:
Q  17 catctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaac-aactagcacct 115  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||     
T  9996662 catctcactatcctatagccagtcacaacccatgtgacctatcagacctaaacacaa--acaagcggtgaagttaccttcaaacaaactacctaacaccg 9996759  T
Q  116 tgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattac-actcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa 210  Q
    || |||||||||| ||||||||  ||| |||| |||| |||||||| | ||| || | ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  9996760 tgcttcacaactttggtgtagtgtacacgagt-ttacaactcaacaaatagtccttagcatgtatca-agatgatacaagaaaggctcacaataaa 9996853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 148
Target Start/End: Original strand, 22476393 - 22476525
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttc--aaacaaacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||    ||| | ||||||||||||  | ||||||||||| ||    
T  22476393 ccatctcactatcctaatggtcagtcactgccctagtgacctatcagacctaaatcaaaa---caaagtagaagttaccttccaacacaaacaactaaca 22476489  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagta 148  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22476490 tcgtgtttcacaactttggtgtagtacaaaagagta 22476525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 11221269 - 11221214
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaaca 70  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11221269 ccatctcactatcctaatgatcagtcacaacccttgtgacctatcagacctaaaca 11221214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 304
Target Start/End: Original strand, 25240768 - 25240809
Alignment:
Q  262 aaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaata 304  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25240768 aaaaccctaaaag-ctaaactttttagtatgacggcttgaata 25240809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16621 - 16322
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccc-tgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagc 111  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |    
T  16621 ccatctcactatcttaatggtcaatcacagccccctatgacctatcagacctgaacacaaacacaaagat-gaagttaccttcaaacataaacaactaac 16523  T
Q  112 accttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactca-acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||    
T  16522 accttgtttcactacttcggtgtagtacacaagagtatcaaacttacacaaacattcctaaacaagtatcacaaacgatacaagaaaggatcacaa--aa 16425  T
Q  211 ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaat 310  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  16424 ggttctaaactcgcatcacaaacgatacaagaatagagcacatgtaaattcaaaaccctaaaaatctaaactttttaatatgacggcttgaatgaacaat 16325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30605687 - 30605402
Alignment:
Q  17 catctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||  | || || ||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30605687 catctcactatcctatggtcaatcacaacccatgtgacctatcagacctaaaacacaa-actaacggtgaagttaccttcaaacatacaactaacacctt 30605589  T
Q  117 gtttcacaa-cttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttc 215  Q
    | || |||| ||| ||||||||||||||| | ||   ||| |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  30605588 gctt-acaagctttggtgtagtacacaagtgaatacaacttaacacacagtccttaacatgtatcacaaacgacacaagaaaggctcacaataaaggtac 30605490  T
Q  216 tagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaata 304  Q
    || |||||||||| | | ||||||||| | || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  30605489 taaacttgcatca-acatgatacaagagtagaacacatgtatactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagaattacggcttgaata 30605402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9422514 - 9422224
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| || ||||||| |||||||||  |||||||| ||    
T  9422514 ccatctcactatcctaatggtcagtcatagcccctgtgacctattagacctaaaccaaaacacaaagat-gaagttagcttcaaacacaaacaactaaca 9422416  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactca-acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  ||||    ||    
T  9422415 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatcaaactcacacaaatagttctaaacaagtatcacatacgatacaagaga-gaacacatagtag 9422317  T
Q  212 gttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataa 305  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||||||    |  ||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9422316 attctaaacttgcatcacagacgatacaagagcataatacatgaagactc-aatccctaaaaatctaaactttttagaatgacggcttgaataa 9422224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23420558 - 23420258
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  | |||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  23420558 ccatctcactatcctaatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaca-acaaag-tagaagttaccttccaacacaaacaactaaca 23420461  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattac-actca-acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaagg-ctcacaataa 209  Q
      |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  ||||| ||||||| | |||| || ||||||||||| |||||| ||||  | |||| |||    
T  23420460 tattgtttcacaacttcggtgtagtacaaaggagtatcaatactcacacacacactcctaa-caagtatcacaaacgatacaataaagaacacacagtaa 23420362  T
Q  210 -aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatca 308  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  23420361 gagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgagca 23420263  T
Q  309 attag 313  Q
    |||||    
T  23420262 attag 23420258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 138 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23758132 - 23757958
Alignment:
Q  138 acacaagagtattacactca-acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttctagacttgcatcacaaacgat 236  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23758132 acacaagagtatcaaactcacacaaacagtcctaaacaagtatcacagacgatacaagaaagactcacaa--aaggttctagacttgcatcacaaacgat 23758035  T
Q  237 acaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23758034 acaagaatagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacagcttgaatgatcaattag 23757958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 138 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23823588 - 23823414
Alignment:
Q  138 acacaagagtattacactca-acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttctagacttgcatcacaaacgat 236  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23823588 acacaagagtatcaaactcacacaaacagtcctaaacaagtatcacagacgatacaagaaagactcacaa--aaggttctagacttgcatcacaaacgat 23823491  T
Q  237 acaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23823490 acaagaatagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacagcttgaatgatcaattag 23823414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Original strand, 26036972 - 26037173
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacct-aaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca-aacaactagcac 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    |||  |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  26036972 ccatttcactatcatatggtcagtcacagcccctgtgacctattagaccttaaacaacaatcttaaagatgaagttaccttcaaacacaacaactaacac 26037071  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggt 213  Q
    ||||  | | | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26037072 cttgcgtaaaatcttcggtgtagtacccaagagtataaaactcaacacacagtcctaaacatgtatcaaagacgatacaagaaaggctcacaataaaggt 26037171  T
Q  214 tc 215  Q
    ||    
T  26037172 tc 26037173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22404758 - 22404464
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttc--aaacaaacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  22404758 ccatctcactatcctaatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaaccaaa--acaaagatagaagttaccttccaacacaaaaaactagca 22404661  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa 210  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |  | | || ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||| |  ||||    |    
T  22404660 ccgtgtttcacaactttggtttagtaca-aagagtagtcaataatc-acacacagtcct-aacaagtatcacaaacgatacaagaaa-gaacacatagta 22404565  T
Q  211 ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaat 310  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||    |  | ||| ||| || ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22404564 gattctaaacttgcatcacaaatgatacaagagcataataaatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaa-attttagaatgacggcttgaataatcaat 22404467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26329143 - 26328926
Alignment:
Q  84 tgaagttaccttcaaacaaacaactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattaca-ctcaacacacagttctaaacatgtatcac 182  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||  |||||| || | | ||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  26329143 tgaagttaccatcaaacaaa-aactacaaccttgcttaaaagctttggtgtagaacacaagtgt-ttacaactcaacacacagtcctaaacatgtatccc 26329046  T
Q  183 aaacaatacaagaaaggctcacaat-aaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaac 281  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||| || |||||||| | |||||||||| |||| ||||||    
T  26329045 aaacgatacaagaaaggctcacaataaaaggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgtatactcaaaaccct-aaaagctaaac 26328948  T
Q  282 tttttagtatgacggcttgaat 303  Q
    | ||||| ||||||||||||||    
T  26328947 tctttagaatgacggcttgaat 26328926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 24190025 - 24190319
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| |   |||| |||||||||||| ||||  ||||||||  |    
T  24190025 ccatctcactatcctaatagtcagtcactgccctagtgacctatcagacctaaaccaaaaca---aaatagaagttaccttccaacacaaacaactaaaa 24190121  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataa 209  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |  | |||| ||||| ||| || |||| ||||||||||| |||  ||||||  | ||||||      
T  24190122 ccttgtttcataaattcggtgtagtaca-aagagtaatcaatactc-acacagagtcct-aacaagtatcacaaacgatatgagaaagaacacacaat-- 24190216  T
Q  210 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaa 309  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| |   ||  ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24190217 agattctaaacttgcatcacaaacgatacaaaagcagaatacatgaagact-aaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaacaa 24190315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 304
Target Start/End: Original strand, 23624040 - 23624324
Alignment:
Q  17 catctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagaccta-aacaa-aaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacc 114  Q
    ||||||||| |||||| || | ||||| ||||||||| |||||||||  | ||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  23624040 catctcactttcctatagttaatcacaacccctgtgatctatcagactaacaacaacaaacacaaagat-gaagttaccttcaaacaaa-aactacaacc 23624137  T
Q  115 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattaca-ctcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaat-aaagg 212  Q
    ||| || | | |||    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23624138 ttgcttaaaagctttttcgtagaacacaagagt-ttacaactctacacacagtccttagcatgtatcacaaacgatacaagaaaggctcacaataaaagg 23624236  T
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaata 304  Q
    | |||||||||||||| | | ||||||||||| || ||||||||||  |  |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23624237 tactagacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgtaga--cccaaccct-aaaagctaaactttttagaatgacggcttgaata 23624324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 153 - 313
Target Start/End: Original strand, 18221408 - 18221567
Alignment:
Q  153 actcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaat-aaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcac 251  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||| || |||    
T  18221408 actctacacacagtcctaaacatgtatcgcaaatgatacaagaaagactcacaataaaaggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacac 18221506  T
Q  252 atgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  18221507 atgaagactcaaaaccct-aaaagctaaactttttagaatgtccgcttgaatgatcaattag 18221567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 192 - 312
Target Start/End: Original strand, 38405698 - 38405818
Alignment:
Q  192 aagaaaggctcacaataaa-ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagta 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| | | ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  38405698 aagaaaggctcacaataaaaggttataaacttgcatca-acatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaacactaaaaatctaaactttttagaa 38405796  T
Q  291 tgacggcttgaataatcaatta 312  Q
    ||| |||||||||| |||||||    
T  38405797 tgaaggcttgaatactcaatta 38405818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22082583 - 22082391
Alignment:
Q  119 ttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattaca-ctcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttcta 217  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  22082583 ttcacagctttggtgtagtacacatgagt-ttacaactcaacatacagtcattaacatgtatcacaaacgacacaagaaaggttcataataaaggtacta 22082485  T
Q  218 gacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
     | |||||||| | | ||||||| ||| || |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||    
T  22082484 aatttgcatca-acatgatacaaaaatagaacacatgtagactcaaaactct-aaaagctaaactttttagaatgacagcttgaatgctcaattag 22082391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22246347 - 22246215
Alignment:
Q  17 catctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttc--aaacaaacaactagcac 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||   || ||| ||||||||||||  | ||||||||||| |||    
T  22246347 catctcactatcctaatggtcagtcactgccccagtgacctatcagacctaaaccaaaa---aagaatagaagttaccttccaacacaaacaactaacac 22246251  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtat 149  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  22246250 cttgtttcataacttcagtgtagtacaaaggagtat 22246215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22252036 - 22251914
Alignment:
Q  18 atctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagcacc 114  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| | || |   |||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  22252036 atctcattatcctaatggtcagtcactgccccagtgacctatcagacctaaaccaaaacagaata---gaagttaccttccaacacaaacaactaacacc 22251940  T
Q  115 ttgtttcacaacttcggtgtagtaca 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  22251939 ttgtttcataacttcggtgtagtaca 22251914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Original strand, 13338818 - 13338975
Alignment:
Q  84 tgaagttaccttcaaacaaacaactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattac-actcaacacacagttctaaacatgtatcac 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  || ||| ||| || |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||| || |||||||||||     
T  13338818 tgaagttaccttcaaacaaacaactacaaccttacttaacagctttggcgtagcacacaagagt-ttacaactcaaaacacagtccttaacatgtatca- 13338915  T
Q  183 aaacaatacaagaaaggctcacaat-aaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaaga 242  Q
    ||   ||| ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| | |||||||||||    
T  13338916 aactgatataagaaagactcacaataaaaggtactaaacttgcatca-acacgatacaaga 13338975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 304
Target Start/End: Original strand, 26037184 - 26037228
Alignment:
Q  260 tcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaata 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26037184 tcaaaaccctaaaaatctaaactttttagaatgacggcttgaata 26037228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25105371 - 25105157
Alignment:
Q  85 gaagttaccttc--aaacaaacaactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatc 180  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | ||||| |||||||| |||| || |||||    
T  25105371 gaagttaccttccaaaacaaacaactaacatcgtgtttcacaactttggtgtagtaca-aagagtaatcaatactca-cacacagtcctaa-caagtatc 25105275  T
Q  181 acaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaa 280  Q
    | | || |||||||||   | |||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||     
T  25105274 aaagacgatacaagaagaacacacagtaga--ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaa- 25105179  T
Q  281 ctttttagtatgacggcttgaat 303  Q
      |||||| |||| |||||||||    
T  25105178 -cttttagaatgatggcttgaat 25105157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25164464 - 25164250
Alignment:
Q  85 gaagttaccttc--aaacaaacaactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatc 180  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | ||||| |||||||| |||| || |||||    
T  25164464 gaagttaccttccaaaacaaacaactaacatcgtgtttcacaactttggtgtagtaca-aagagtaatcaatactca-cacacagtcctaa-caagtatc 25164368  T
Q  181 acaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaa 280  Q
    | | || |||||||||   | |||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||     
T  25164367 aaagacgatacaagaagaacacacagtaga--ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaa- 25164272  T
Q  281 ctttttagtatgacggcttgaat 303  Q
      |||||| |||| |||||||||    
T  25164271 -cttttagaatgatggcttgaat 25164250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20714669 - 20714618
Alignment:
Q  85 gaagttaccttcaaacaaacaactagcaccttgtttcacaacttcggtgtag 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||| |||||||    
T  20714669 gaagttaccttcaaacaaacaactacaaccttgcttaacaactttggtgtag 20714618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 20845789 - 20845740
Alignment:
Q  18 atctcactatcctatggtcagtcac-agcccctgtgacctatcagaccta 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  20845789 atctcactatcctatggtgagtcacaaccccctgtgatctatcagaccta 20845740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17274 - 16992
Alignment:
Q  17 catctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaatt-gaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||      |||  ||| | |||||||||||||||||  || ||||| ||    
T  17274 catctcactatcttaatggtcagtcacagcccatgtgacctatcaaacctaaatt----gactcaaagtagaagttaccttcaaacacaaataactaaca 17179  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactca-acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||  |||    
T  17178 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatcaaactaacacaaacagtcctaaacaagtatcacagacaatacaagaaagtctcaaaa--aag 17081  T
Q  212 gttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttg 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17080 gttctagacctgcatcacaaacgatacaagaataaagcacataaagactcaaaaaccaataaatctaaactttttagtatgacagcttg 16992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 116 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8479 - 8282
Alignment:
Q  116 tgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8479 tgtttcacaacttcggtgtagtacacatgagtatcaaactcaacatacagtcctaaacatgtatcacagacgatacgagaaaggctctcaataaaggttc 8380  T
Q  216 tagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    || |||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| | |||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  8379 taaacttgcatcacaaatgataaaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaacccaaacctcttagaatgtcggcttgaatgatcaattag 8282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16209 - 16088
Alignment:
Q  17 catctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacctt 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16209 catctcactgtcctatggtcagtcacagcccctgtgagctatcagacctaaacaaaca--caaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacctt 16112  T
Q  117 gtttcacaacttcggtgtagtaca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16111 gtttcacaacttcggtgtagtaca 16088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36398791 - 36398664
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaaca-aaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36398791 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacacaaaacac-aaagttgaagttaccttcaaacaaacaactagcacc 36398693  T
Q  115 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaa 143  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  36398692 ttgtttcacaaccttggtgtagtacacaa 36398664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24790155 - 24789862
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24790155 ccatatcactatcctaatggtcagtcactgcccaagtgacccatcagacctaaaccaaaa---aaaaatagaagttaccttccaacacaaacaactagca 24790059  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataa 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | |||| ||| ||||| || |||| |||||||| || |||||||| ||  | |||| |      
T  24790058 tcttgtttcacaacttcggtgtagtaca-aagagtaatcaatactc-acaaacagtcct-aacaagtatcacagacgatacaagacagaacacacact-- 24789964  T
Q  210 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaa 309  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||    
T  24789963 agattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagaatacacgaagactc-aaaccctaaaaatctaaac-ttttagaatgacggcttgaatgaacaa 24789866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Original strand, 22611055 - 22611336
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||| |  ||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22611055 ccatctcactatcctaatggtc-gtcactgccctagtgacctatcaaacctaaaccaaaata--aaagtagaagttaccttccaacacaaacaactagca 22611151  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||      
T  22611152 ccttgtttcacaacttcggtgtagtaca-aagagtaatcaatactc-acacacagttct-aacaagtatcacaaacgatacaagaaagaacacacaat-- 22611246  T
Q  210 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaa 302  Q
    || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||  ||||| ||| || ||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  22611247 agattctaaacttgcataacaaacggtacaagaacagaatacatgaagactc-aaaccgtaaaaatctaa--cttttagaatgacggcttgaa 22611336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 12910652 - 12910949
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||  |||| || |||||||| ||| ||||  |||||||| ||    
T  12910652 ccatctcactatcctaatgatcagtcacaatccatgtgacctatcagacctaaaccaaaa--caaagatagaagttacattccaacacaaacaactaaca 12910749  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt-----acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaa 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |     | |||| ||||||| | || |||| |||||||| || |||||||||||  | ||||     
T  12910750 ccttgtttcacaacatcggtgtagtaca-aagagtaatgatcaatactc-acacacaatcct-aacaagtatcacagacgatacaagaaagaacacacac 12910846  T
Q  207 taaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataat 306  Q
    |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||     
T  12910847 t--agattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaac-ttttataatgacggcttgaataaa 12910942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 303
Target Start/End: Original strand, 23758788 - 23759070
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |   |||| |||||||| ||| ||||  |||||||| ||    
T  23758788 ccatctcactatcgtaatggtcagtcactgccccagtgacctatcagacctaaaccaaaaca---aaatagaagttactttccaacacaaacaactaaca 23758884  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggct-cacaataa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | |||| ||| ||||| || |||| ||| |||| || |||||||||||  | |||| |      
T  23758885 ccttgtttcacaacttcggtgtagtaca-aagagtaatcaatactc-acaaacagtcct-aacaagtaccacagacgatacaagaaagaatacacagt-- 23758979  T
Q  210 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaat 303  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  23758980 agattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaa--cttttagaatgacggcttgaat 23759070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26860292 - 26860163
Alignment:
Q  17 catctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttc--aaacaaac-aactagca 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||  | ||| | ||||||||||||  | |||||| | ||| ||    
T  26860292 catctcactatcctaatggtcagtcacagccactgtgacctatcatacctaaacacaaactc-aaagtagaagttaccttccaacacaaactacctaaca 26860194  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26860193 ccttgtttcacaacttcggtgtagtgcacaa 26860163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 304
Target Start/End: Original strand, 19444830 - 19445049
Alignment:
Q  84 tgaagttaccttcaaacaaacaactagcaccttgtttcacaa-cttcggtgtagtacacaagagtattac-actcaacacacagttctaaacatgtatca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||| ||||||||||| | |||||||| |||| |||||||| ||||| || | |||||||||    
T  19444830 tgaagttaccttcaaacaaacaactacgaccttgctt-acaagcttcggtgtagcatacaagagt-ttacaactcaacaaacagtccttagcatgtatca 19444927  T
Q  182 caaacaatacaagaaaggctcacaataaa--ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcaca-tgtagattcaaaaccctaaaaatcta 278  Q
     | |  |||||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||| | ||||||||||| | || || |    ||| ||||||||||||||| |||    
T  19444928 -agatgatacaagaaaggctcacaataaaacagtactaaacttgcatca-acacgatacaagagtaga-catacaaaagactcaaaaccctaaaaa-cta 19445023  T
Q  279 aactttttagtatgacggcttgaata 304  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||    
T  19445024 aactttttagaatgacggctagaata 19445049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 313
Target Start/End: Original strand, 21530611 - 21530839
Alignment:
Q  84 tgaagttaccttcaaacaaacaactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattaca-ctcaacacacagttctaaacatgtatcac 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  | |||| || | | ||| || |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | || |||||||||||     
T  21530611 tgaagttaccttcaaacaaccaactacaatcttgcttaaaagctttggcgtagcacacaagagt-ttacaactcaacacacattccttaacatgtatca- 21530708  T
Q  183 aaacaatacaagaaaggctcacaataaa--ggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaa 280  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||   |  ||| || ||||||| | || |||||||| | || ||||   | | ||||||||||||||| |||||    
T  21530709 aactgatacaagaaaggctcacaataaaacaggactaaacctgcatca-acacaatacaagagtagaacacacaaaaactcaaaaccctaaaaa-ctaaa 21530806  T
Q  281 ctttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  21530807 ctttttagaatgacagcttgaatattcaattag 21530839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19466518 - 19466330
Alignment:
Q  18 atctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcaccttg 117  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  19466518 atctcactatcctacagtcaaccacaacccctgtgat-tatcagacttaaacacaaaaacaatgat-gaagttaccttcaaacaaacaactacaatcttg 19466421  T
Q  118 tttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattac-actcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaa 210  Q
     |  | ||||| || |||| |||||  ||| |||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  19466420 ctcaaaaacttaggcgtagcacaca--agtgttacaactcaacacacaatccttaacatgtatca-aagagatacaagaaaggctcacaataaa 19466330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 120
Target Start/End: Original strand, 15328481 - 15328585
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagac-ctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaac-aaacaactagcac 113  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| |  |||||   ||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  15328481 ccatctcactatcctatagtcaatcacaacccctgtgatctatcagactcaaaacaata--acaaatggtgaagttaccttcaaactaaacaactacgac 15328578  T
Q  114 cttgttt 120  Q
    |||||||    
T  15328579 cttgttt 15328585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19466278 - 19466226
Alignment:
Q  260 tcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19466278 tcaaaaccctaaaag-ctagactttttagaatgacggcttgaatgatcaattag 19466226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Original strand, 26566 - 26863
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagaccta-aacaa-aaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcac 113  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  26566 ccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatcagactaacaacaacaaacacaaagat-gaagttaccttcaaacaaa-aactacaac 26663  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaat-aaagg 212  Q
    |||| || | | ||| || |||| |||||||||| |   |||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  26664 cttgcttaaaagctttggcgtagaacacaagagtttccaactctacacacagtcctaaacatgtatcacatacgatacaagaaaggctcgcaataaaagg 26763  T
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatta 312  Q
    | ||| |||||||||| | | ||||||||||| || |||||| ||| | ||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26764 tactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgaagacttaaaaccctaaaagctaaaactttttagaatgatggcttgaataatcaatta 26862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12507 - 12240
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  12507 ccatctcactatcctaatggtcagtcacaacccatgtgacttatcagacctaaaccaaaa--caaaaatagaagttaccttctaacagaaacaactaaca 12410  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  | |||| |||||||||||  |||| ||||||||  | |||||||||||  | |||| |      
T  12409 ccttgtttcacaacttcggtgtagcaca-aagagtaatcaatactc-acacacagttc-gaacaagtatcacaggcgatacaagaaagaacacacagt-- 12315  T
Q  210 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttt 285  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12314 agattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaactttt 12240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 313
Target Start/End: Original strand, 6186 - 6365
Alignment:
Q  134 tagtacacaagagtattacactca-acacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttctagacttgcatcacaaa 232  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| | |    
T  6186 tagtgcacaagagtatcaaactcacacacacagtcctaaacaagtatcacaggcgatacaagtaaggcacacagtaaagattctaaacttgcatca-aca 6284  T
Q  233 cgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
     ||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  6285 tgatacaagaacagaatacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaattttttagtatgacggcttaaatgagcaattag 6365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2344 - 2070
Alignment:
Q  31 atggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcaccttgtttcacaacttcg 130  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||| |||| |   || | |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2344 atggtcagtcacaatccatgtgacctatcggacctaaaccaaaaca---aagtagaagttaccttccaacaca-aactaacaccttgtttcacaacttcg 2249  T
Q  131 gtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaag-gctcacaataaaggttctagacttgcatc 227  Q
    |||||||||| ||||||| |  | |||| ||||||||| || |||| ||||| || || |||||||||||  | |||| |  || ||||| |||||||||    
T  2248 gtgtagtaca-aagagtaatcaatactc-acacacagtcct-aacaagtatcccagacgatacaagaaagaacacacagt--agattctaaacttgcatc 2154  T
Q  228 acaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    |||||||||||||||   ||  ||||| ||| || ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2153 acaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccttgaaaatctaaac-ttttagaatgacggcttgaataatcaattag 2070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Original strand, 40497 - 40624
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaac-aactagcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | |||||||||||||||| |||| | ||| ||||    
T  40497 ccatctcactatcctatggtcagtcacaacccctgtgacctatcagacctaaacacaaactcaaaga-tgaagttaccttcaaaaaaactacctaacacc 40595  T
Q  115 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaa 143  Q
     || |||||  ||| ||||||||||||||    
T  40596 gtgcttcaccgctttggtgtagtacacaa 40624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 110253 - 109962
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaacaaacaactagcacc 114  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||   |||||||||||||||||||  ||| |   |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  110253 ccatctcactatcctaatgaacagtcactgccctaatgacctatcagacctaaaccgaaaca---aaatagaagttaccttccaacaaacaactaacacc 110157  T
Q  115 ttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtatt--acactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaagg 212  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |  | |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||   | ||||| | ||     
T  110156 gtgtttcacaactttggtatagtaca-aagagtaatcaatactc-acacacagttct-aacaagtatcacagacgttacaagaagaacacacaa-ataga 110061  T
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatta 312  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||  ||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  110060 ttctaaactttcatcacaaacgatacaaaaacagaatacatgaagactc-aaaccctaataatctaaac-ttttagaatgacggtttgaatgaacaatta 109963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Original strand, 36771 - 37048
Alignment:
Q  31 atggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagcaccttgtttcacaactt 128  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||  |  ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||    
T  36771 atggtcagtcacatcct-tgtgacctatcagacctaaaccaaaa--caaagttataagttaccttccaacataaacaactaacaccttgtgtcacaactt 36867  T
Q  129 cggtgtagtacacaagagt-attacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaaggttctagacttgcatc 227  Q
    |||||||||||| | |||| || | |||| ||||||| | || ||||  ||||||| || ||||||||||    ||||  | || ||||| |||||||||    
T  36868 cggtgtagtacaaaggagtaatcatactc-acacacaatcct-aacaaatatcacagacgatacaagaaa-taacacataatagattctaaacttgcatc 36964  T
Q  228 acaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    |||||||||||||||   ||  ||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | |||||||    
T  36965 acaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaaac-ttttagaatgacagcttgaatgaacaattag 37048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Original strand, 37168 - 37292
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||| | || |   |||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  37168 ccatctcactatcctaatggtcagtcattgcctcagtgacctatcagacctaaaccaaaacagaata---gaagttaccttccaacacaaacaactaaca 37264  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtaca 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37265 ccttgtttcacgacttcggtgtagtaca 37292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25670 - 25380
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||  ||||||||| |||| |   |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  25670 ccatctcactatcctaatggtcagccactgccctagtgacctatatgacctaaaccaaaata---aaatagaagttaccttccaacacaaacaactagca 25574  T
Q  113 ccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagtattacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaaaggctcacaataaagg 212  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | || |   ||||||   ||||| | ||||||||||| |||||||||| |  || |    ||     
T  25573 ctgtgtttcacaactttggtgtagtacaaaggagtaat-caatactcacaca---ctaaa-aagtatcacaaacgatacaagaaa-gaacatatagtaga 25480  T
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatta 312  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| || | ||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  25479 ttctaaacgtgcatcacaaacgatacacgagtagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaacctttttagtatgacgacttgaatgaacaatta 25381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 87898 - 88008
Alignment:
Q  16 ccatctcactatcctatgg-tcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttc--aaacaaacaactagca 112  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| | ||||||||||||  | ||||||||||| ||    
T  87898 ccatctcactatcctacgggtcagtcatagcccctgtgacctatcagacctaaaccaaa--ataaaagtagaagttaccttccaacacaaacaactaaca 87995  T
Q  113 ccttgtttcacaa 125  Q
     ||||||||||||    
T  87996 tcttgtttcacaa 88008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 48340 - 48217
Alignment:
Q  17 catctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcagacctaaacaaaaagacaaaaattgaagttaccttcaaaca--aacaactagcac 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||| |   |||| ||||||| |||| ||||  |||||||| |||    
T  48340 catctcactatcctaatggtcagtcactgccccagtgtcctatcaaacctaaaccaaaaca---aaatagaagttatcttccaacacaaacaactaccac 48244  T
Q  114 cttgtttcacaacttcggtgtagtaca 140  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  48243 cgtgtttcacaactttggtgtagtaca 48217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 61470 - 61424
Alignment:
Q  16 ccatctcactatccta-tggtcagtcacagcccctgtgacctatcag 61  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  61470 ccatctcactatcctaatggtcagtcactgccccagtgacctatcag 61424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Original strand, 2278 - 2376
Alignment:
Q  213 ttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatggagcacatgtagattcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaatta 312  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||   ||  ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  2278 ttctaaacttgcgtcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagacttaaa-ccctaaaaatctaaac-ttttagaatgacggcttgaatgaacaatta 2375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 263 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 357046 - 356998
Alignment:
Q  263 aaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataatcaattag 313  Q
    |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  357046 aaaccctaaaaatctaac--ttttagaatgacggcttgaataatcaattag 356998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 357202 - 357118
Alignment:
Q  111 caccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaagagt-attacactcaacacacagttctaaacatgtatcacaaacaatacaagaa 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| || | |||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  357202 caccttgtttcacaactttggtgtagtacaaaggagtaatcaaactc-acacacagtcct-aacaagtatcacaaacgatacaagaa 357118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 143
Target Start/End: Original strand, 11416 - 11476
Alignment:
Q  84 tgaagttaccttcaaacaaac-aactagcaccttgtttcacaacttcggtgtagtacacaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  11416 tgaagttaccttcaaacaaactacctaacatcttgcttcacagctttggtgtagtacacaa 11476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University