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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4017-Insertion-4 (Length: 1002)

Name: NF4017-Insertion-4
Description: NF4017
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4017-Insertion-4
NF4017-Insertion-4
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (20-840)||(3816644-3817466)
chr7 (22-203)||(339377-339561)
chr7 (20-189)||(3811152-3811324)
chr7 (8-190)||(42767276-42767462)
chr7 (20-190)||(351790-351963)
chr7 (20-190)||(20238955-20239128)
chr7 (20-189)||(28420942-28421114)
chr7 (30-190)||(12804014-12804177)
chr7 (20-189)||(35147986-35148160)
chr7 (13-189)||(5979156-5979336)
chr7 (20-189)||(5849529-5849702)
chr7 (20-230)||(43539989-43540193)
chr7 (30-190)||(22741900-22742068)
chr7 (32-189)||(26383642-26383806)
chr7 (20-138)||(30219283-30219401)
chr7 (48-124)||(18666547-18666622)
chr7 (91-230)||(26381144-26381284)
chr7 (20-57)||(15843951-15843988)
chr7 (20-57)||(15861060-15861097)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (467-958)||(31052194-31052684)
chr1 (20-212)||(25387464-25387659)
chr1 (16-189)||(25381518-25381694)
chr1 (7-230)||(31051536-31051766)
chr1 (16-190)||(1078224-1078401)
chr1 (31-185)||(34740001-34740158)
chr1 (20-189)||(50306194-50306365)
chr1 (8-190)||(31058037-31058221)
chr1 (19-189)||(44410015-44410186)
chr1 (31-203)||(24963671-24963846)
chr1 (31-190)||(24926737-24926898)
chr1 (10-189)||(12183562-12183748)
chr1 (13-134)||(8092887-8093008)
chr1 (20-189)||(27955171-27955336)
chr1 (31-212)||(38151935-38152113)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (20-231)||(32890893-32891107)
chr8 (20-189)||(14417945-14418114)
chr8 (8-203)||(42992972-42993170)
chr8 (20-189)||(9935283-9935455)
chr8 (20-189)||(32897017-32897189)
chr8 (8-190)||(7771225-7771409)
chr8 (20-189)||(5542143-5542315)
chr8 (30-189)||(14799399-14799560)
chr8 (14-189)||(36818970-36819147)
chr8 (30-198)||(1882725-1882898)
chr8 (25-206)||(39735514-39735702)
chr8 (30-182)||(22219706-22219862)
chr8 (8-190)||(10705830-10706021)
chr8 (30-190)||(39727299-39727456)
chr8 (8-114)||(10700022-10700127)
chr8 (87-190)||(24250174-24250279)
chr8 (139-200)||(10700135-10700197)
chr8 (19-86)||(1171350-1171415)
chr8 (107-184)||(1171414-1171493)
chr8 (93-162)||(31399047-31399119)
chr8 (139-189)||(39689788-39689838)
chr8 (116-189)||(42033856-42033930)
chr8 (179-229)||(31373510-31373560)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (20-231)||(28531423-28531637)
chr5 (20-230)||(12692223-12692436)
chr5 (20-205)||(24054338-24054528)
chr5 (20-229)||(32096903-32097115)
chr5 (20-189)||(28525369-28525541)
chr5 (14-189)||(7389531-7389708)
chr5 (20-189)||(12686162-12686334)
chr5 (33-210)||(19066069-19066249)
chr5 (28-189)||(41297289-41297453)
chr5 (20-189)||(32094142-32094314)
chr5 (20-190)||(30384358-30384532)
chr5 (40-189)||(16215157-16215309)
chr5 (19-192)||(30772286-30772463)
chr5 (30-190)||(19059746-19059909)
chr5 (51-183)||(14610184-14610321)
chr5 (19-109)||(20500141-20500231)
chr5 (35-179)||(26509871-26510013)
chr5 (47-114)||(28542269-28542336)
chr5 (45-182)||(26316782-26316922)
chr5 (50-137)||(37896336-37896423)
chr5 (139-183)||(8706454-8706498)
chr5 (31-65)||(8706532-8706566)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (20-231)||(49151616-49151830)
chr3 (20-212)||(10244294-10244489)
chr3 (16-222)||(11846013-11846222)
chr3 (20-232)||(42197102-42197317)
chr3 (20-231)||(38455493-38455705)
chr3 (20-203)||(10766840-10767026)
chr3 (20-189)||(17055775-17055948)
chr3 (20-189)||(11839708-11839880)
chr3 (20-189)||(10238195-10238367)
chr3 (20-189)||(10760633-10760805)
chr3 (20-189)||(30051085-30051257)
chr3 (20-189)||(49157683-49157855)
chr3 (20-189)||(8331791-8331963)
chr3 (20-190)||(42191202-42191375)
chr3 (20-186)||(55003398-55003567)
chr3 (20-189)||(38449048-38449218)
chr3 (20-204)||(17593249-17593437)
chr3 (58-190)||(28964910-28965043)
chr3 (20-183)||(53069043-53069210)
chr3 (42-189)||(48128030-48128180)
chr3 (31-128)||(34300512-34300609)
chr3 (32-189)||(13445077-13445227)
chr3 (31-179)||(46656699-46656850)
chr3 (31-126)||(12108716-12108811)
chr3 (92-191)||(24643532-24643635)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (16-203)||(48160960-48161146)
chr4 (20-212)||(24287991-24288184)
chr4 (16-189)||(48167179-48167351)
chr4 (20-203)||(10739308-10739494)
chr4 (20-203)||(10953077-10953263)
chr4 (19-212)||(26963301-26963495)
chr4 (20-189)||(33458249-33458422)
chr4 (20-189)||(10733229-10733401)
chr4 (20-189)||(10946998-10947170)
chr4 (8-190)||(6257187-6257372)
chr4 (33-230)||(49976607-49976804)
chr4 (30-189)||(50168608-50168769)
chr4 (8-209)||(33461361-33461559)
chr4 (75-189)||(26956812-26956929)
chr4 (98-190)||(4632869-4632964)
chr4 (34-156)||(3769586-3769710)
chr4 (86-184)||(55473133-55473231)
chr4 (32-129)||(44831658-44831755)
chr4 (20-107)||(4632396-4632482)
chr4 (30-142)||(50427382-50427501)
chr4 (34-159)||(19686341-19686469)
chr4 (55-138)||(9237402-9237485)
chr4 (49-205)||(50155990-50156137)
chr4 (102-184)||(34308060-34308144)
chr4 (63-138)||(35177806-35177881)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (20-189)||(605-774)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (20-231)||(35090591-35090804)
chr2 (20-232)||(13456104-13456319)
chr2 (8-226)||(31002369-31002591)
chr2 (20-189)||(28682928-28683100)
chr2 (20-189)||(36750419-36750591)
chr2 (13-190)||(44716786-44716967)
chr2 (8-194)||(31008347-31008537)
chr2 (20-183)||(35084665-35084831)
chr2 (20-189)||(13462045-13462217)
chr2 (8-184)||(13149674-13149851)
chr2 (8-189)||(30965320-30965505)
chr2 (19-189)||(11048536-11048709)
chr2 (34-189)||(23343579-23343737)
chr2 (68-189)||(35438693-35438816)
chr2 (30-226)||(29833224-29833421)
chr2 (75-114)||(31651664-31651703)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (34-231)||(8662722-8662922)
chr6 (8-189)||(4580304-4580488)
chr6 (20-190)||(8650785-8650958)
chr6 (20-189)||(32035269-32035441)
chr6 (20-192)||(21782733-21782908)
chr6 (20-189)||(21190849-21191021)
chr6 (19-231)||(21196962-21197175)
chr6 (8-189)||(25354204-25354388)
chr6 (7-229)||(25343616-25343845)
chr6 (20-189)||(31756196-31756370)
chr6 (20-190)||(18778587-18778761)
chr6 (20-184)||(17581639-17581797)
chr6 (19-134)||(21783350-21783463)
chr6 (19-134)||(21789573-21789686)
chr6 (19-183)||(21770546-21770712)
chr6 (34-212)||(6097999-6098181)
chr6 (48-138)||(34603368-34603457)
chr6 (48-138)||(34724645-34724734)
chr6 (87-188)||(6102694-6102803)
chr6 (32-96)||(1106229-1106294)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (20-231)||(172831-173045)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (20-190)||(5539-5712)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (20-189)||(1176-1349)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (20-212)||(6527-6722)
scaffold0208 (20-190)||(12400-12573)
[»] scaffold1114 (1 HSPs)
scaffold1114 (20-189)||(1092-1261)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (20-185)||(38434-38600)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (37-134)||(5945-6041)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 667; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 667; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 3817466 - 3816644
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817466 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 3817367  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatattt 216  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  3817366 cttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtgtttatgttt 3817267  T
Q  217 catctattgggattatgatttgatttgttgtggcttgatatatatgtatccgatgactattagtcatcgatgcctattctgttttttcgaagnnnnnnnn 316  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||            
T  3817266 gatctattggaattatgatttgatttgttgtggcttgatatatatgtatccgatgactattagtcatcgatgcctattctgttttt-cgaagtttttttt 3817168  T
Q  317 gttctaaacctacatgtgaatttgttttttcggttatcgatgtcgtttgcaaattttcgtttatccatatgccgtttgcaaatctttggttatcgattgc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3817167 gttctaaacctacatgtgaatttgttttt-cggttattgatgtcgtttgtaaattttcgtttatccatgtgccgtttgcaaatctttggtcatcgattgc 3817069  T
Q  417 ctatttgcctctaatttatccatgcttttgttttctttaatattgaagtgacaaacatttgtgcatttaatttcggtcctcgatgtccatcgtgattaaa 516  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3817068 ctatttgactctaatttatccatgcttttgttttctttaatattgaagtgacaaacatttgtgcatttaatttcagtcctcgatgtccatcctgattaaa 3816969  T
Q  517 tattgagtttgcatactttgacttttggaattgatgtgcctgtgtttattgttattttgttcgataaaacttgagaaaattatttgctttgtgtcgtatt 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3816968 tattgagtttgcatactttgacttttggaattgatgtgcctgtgtttattgtgattgtgttcgataaaacttgagaaaattatttgctttgcgtcgtatt 3816869  T
Q  617 tggtt-ttttccgacacgtatttgtcttggacagtattaattaatttagtttatcatcataaataaatatttttcgattgttgatagtggatcgatgatg 715  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3816868 tggtttttttccaacacgtatttgtcttggacagtattaattaatttagtttatcatcataaataaatattttgcgattgttgatagtggatcgatgatg 3816769  T
Q  716 attcagcttgcctttataaattaaatagtgacatactgtcaatttttccttcacttaatccagcaatttcaaaggtagatatatatttataaattaaaat 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3816768 attcagcttgcctttataaattaaatagtgacatactgtcaatttttccttcacttgatccagcaatttcaaaggtagatatatatttataaattaaaat 3816669  T
Q  816 cgtgtattggctttcaacatttttt 840  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  3816668 cgtgtattggctttctacatttttt 3816644  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 203
Target Start/End: Original strand, 339377 - 339561
Alignment:
Q  22 agctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgct 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339377 agctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgct 339476  T
Q  122 tccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagc 203  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  339477 tccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctctttatattaagagctaaatttccaacaagtggtatcagagc 339561  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3811324 - 3811152
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811324 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 3811225  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3811224 cttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctacatttccaaca 3811152  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42767462 - 42767276
Alignment:
Q  8 agggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42767462 agggctgctacaaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaatatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 42767363  T
Q  108 atgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42767362 atattttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaacaa 42767276  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Original strand, 351790 - 351963
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351790 aaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 351889  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    |||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  351890 cttccgctgttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagagctaaatttccaacaa 351963  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Original strand, 20238955 - 20239128
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20238955 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 20239054  T
Q  120 cttccgctattgat---tcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    ||||||||||||||   | || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20239055 cttccgctattgatgtatgattgttgaacatgttttatgaaatttgtttatattaagacctaaatttccaacaa 20239128  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28421114 - 28420942
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28421114 aaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 28421015  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  28421014 cttccgctattgatttataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatatcaagagctaaatttccaaca 28420942  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 190
Target Start/End: Original strand, 12804014 - 12804177
Alignment:
Q  30 ccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctat 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12804014 ccaggtattcttaataccctaattcttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatgttcatgttcaatgttttgcttgcttccgctat 12804113  T
Q  130 tgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    |||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12804114 tgattcataatcgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 12804177  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35148160 - 35147986
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgttt 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148160 aaagctttatccaggtattcctaatacccctaattcttaatatccttgataaatcaaacgtgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgttt 35148061  T
Q  119 gcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacct-aaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||| |||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35148060 gcttccgctatcgatttataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacataaaatttccaaca 35147986  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5979336 - 5979156
Alignment:
Q  13 tgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgtt 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |    
T  5979336 tgctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaacatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccaatcataatcatgttcaatagt 5979237  T
Q  113 ttgtttgcttccgctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||| |||||||||||    || ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  5979236 ttgtttgctttcgctattgatttacgattgttcaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaattttcaaca 5979156  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 5849529 - 5849702
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||    
T  5849529 aaagcttcatccaggtattcctaatatcctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttggttg 5849628  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacat-attttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5849629 cttccgctattgattcataatcattgaacataattttataaaatttgtttttattaagacctaaatttgcaaca 5849702  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Original strand, 43539989 - 43540193
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  43539989 aaagcttcatccaggtattcataataccctaatttttaatattcttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatattttattta 43540088  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatattt 216  Q
     ||||||||||||||||||    |||||||| || |||||||||||||||||||||||          ||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  43540089 attccgctattgattcataattattgaacatgttctatgaaatctgtttttattaaga---------tcaaaaggtggtatcagagcggtcttcatgttt 43540179  T
Q  217 catctattgggatt 230  Q
    ||||||||| ||||    
T  43540180 catctattgagatt 43540193  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22742068 - 22741900
Alignment:
Q  30 ccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctat 129  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22742068 ccaggtattcctaatacc-taatcctcaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttcagtttgcttccgctat 22741971  T
Q  130 tg-------attcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    ||       |||||||   ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22741970 tgttgattcattcataattgttgaacatgttttatgaaacctgttcttattgagacctaaatttccaacaa 22741900  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 189
Target Start/End: Original strand, 26383642 - 26383806
Alignment:
Q  32 aggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| | | |||    
T  26383642 aggtattcctaataccctaattcttagtatgcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcatgatcatgttcaatattttgtttgtttctgttgttg 26383741  T
Q  132 attcata---gttgaacatattttatgaaatctgt----ttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||   ||||||||| | ||||||||||| |    ||||||| |||| |||||||||||||    
T  26383742 attcataattgttgaacatgtcttatgaaatctattctgttttatttagacttaaatttccaaca 26383806  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30219401 - 30219283
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30219401 aaagctttatccagatattcctaataccataattcttaatatctttaataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatattcatgttcaacgttttgtttg 30219302  T
Q  120 cttccgctattgattcata 138  Q
     |||||||| |||||||||    
T  30219301 attccgctaatgattcata 30219283  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18666622 - 18666547
Alignment:
Q  48 ctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcc 124  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18666622 ctaattattaatatcattgctaaatcaaacatgtcgtaa-tctgatcataatcaagttcaatgttttgtttgcttcc 18666547  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 230
Target Start/End: Original strand, 26381144 - 26381284
Alignment:
Q  91 gatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaa 187  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||| || | |  ||||||||||   ||||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||    
T  26381144 gatcatgatcatgttcaatattgtgtttgttttcccccttgattcataattgttgaacatgtcttatgaaatctatttt-atttagacctaaatttctaa 26381242  T
Q  188 caagtggtatcagagcggtcttcatatttcatctattgggatt 230  Q
      |||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||||||    
T  26381243 tgagtgatatcagagc-gtgttcatatttgatttattgggatt 26381284  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 15843951 - 15843988
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattctta 57  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15843951 aaagcttgatccaggtattcctaataccctaattctta 15843988  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 15861060 - 15861097
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattctta 57  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861060 aaagcttgatccaggtattcctaataccctaattctta 15861097  T

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Target: chr1 (Bit Score: 319; Significance: 1e-179; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 467 - 958
Target Start/End: Original strand, 31052194 - 31052684
Alignment:
Q  467 acaaacatttgtgcatttaatttcggtcctcgatgtccatcgtgattaaatattgagtttgcatactttgacttttggaattgatgtgcctgtgtttatt 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31052194 acaaacatttgtgcatttaatttcggtcctcgatgtccatcttgattaaatattgagtttccatactttgacttttggaat--atgtgcctgtgtttatt 31052291  T
Q  567 gttattt-----tgttcgataaaacttgagaaaattatttgctttgtgtcgtatttggttttttccgacacgtatttgtcttggacagtattaattaatt 661  Q
    |||||||     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31052292 gttatttacttttgttcgataaaaattgagaaaattatttgctttgtgtcgtatttggtttttgccggcacgtatttgtcttggacagtattaattaatt 31052391  T
Q  662 tagtttatcatcataaataaatatttttcgattgttgatagtggatcgatgatgattcagcttgcctttataaattaaatagtgacatactgtcaatttt 761  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||    | ||||||||||||||    
T  31052392 tagtttatcatcataaataaatattttgcgactgttgatactggattgatgatgattcagcttgcctttat-agtaacat----atatactgtcaatttt 31052486  T
Q  762 tccttcacttaatccagcaatttcaaag-gtagatatatatttataaattaaaatcgtgtattggctttcaac-attttttgttatggaatttgtactac 859  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  31052487 tccttcacttgatccagcaatttcaaggtatatatatatatttataaatcaaaatcgtgtattggttttctacttttttttgttatggaatttgtgctac 31052586  T
Q  860 cttatctgttgcttcgattgatctcaatttggtgtgattctgaagtatatttcatagcatataatataacatatatttaggccaaaattttatcttatt 958  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31052587 tttatctgttgcttcgattaatctcaatttggtgtgattatgaagtatatttcatagcatataatataacatatatttaggcc-aaattttatcttatt 31052684  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25387659 - 25387464
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25387659 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 25387560  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25387559 cttccgctattgattcatatttgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagatctatatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcat 25387464  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25381694 - 25381518
Alignment:
Q  16 tacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttg 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25381694 tacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatttcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttg 25381595  T
Q  116 tttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25381594 tttgcttccgctattgattcatagttgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctatatttccaaca 25381518  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Original strand, 31051536 - 31051766
Alignment:
Q  7 aagggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31051536 aagggttgctacaaaagttttatccaggtattcttaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccaatcataatcatgttc 31051634  T
Q  107 aatgttttgtttgcttccgctattgatt---catagttgaaca-----tattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||     |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31051635 aatgttttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgatatgaaatctgtttatattaagacctaaattcctaacaagtggtatc 31051734  T
Q  199 agagcggtcttcatatttcatctattgggatt 230  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  31051735 agagcggtcttcatgtttgatctattgagatt 31051766  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 1078224 - 1078401
Alignment:
Q  16 tacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttg 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1078224 tacaaaagctttatccaggtattcttaataccctaattcttaatattcttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttg 1078323  T
Q  116 tttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    ||||||||||||||||||| |||   ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1078324 tttgcttccgctattgattaataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaacaa 1078401  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 185
Target Start/End: Original strand, 34740001 - 34740158
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34740001 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatt 34740100  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttcc 185  Q
    ||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34740101 gattcataattgatgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagacctaaatttcc 34740158  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 50306194 - 50306365
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50306194 aaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgattataatcatgttcaatgttttgtttg 50306292  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50306293 cttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaaca 50306365  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Original strand, 31058037 - 31058221
Alignment:
Q  8 agggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31058037 agggttgctacaaaagttttatccaagtattcttaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 31058135  T
Q  108 atgttttgtttgcttccgctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31058136 atgttttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttctaacaa 31058221  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Original strand, 44410015 - 44410186
Alignment:
Q  19 aaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgttt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  44410015 aaaagctttatccaggtattcctaatac--taattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgttt 44410112  T
Q  119 gcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44410113 gcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatgaaatctgtttttagtaagacctaaatttccaaca 44410186  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24963846 - 24963671
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatt 130  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24963846 caggtattcctaatactttaattcttactattcttgataaatcaaacatggcgtagatccgttcatattcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatt 24963747  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagc 203  Q
    ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||    
T  24963746 gattcatattcgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagatctaaattttcaacaaatggtattagagc 24963671  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24926898 - 24926737
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatt 130  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24926898 caggtattcctaatacgttaattcttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatattaatgttcaatgttttggttgcttccgctatt 24926799  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    ||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24926798 gattcataatcgttgaacatgttttatg-aatctgtttttattaagacctaaattttcaacaa 24926737  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12183748 - 12183562
Alignment:
Q  10 ggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaat 109  Q
    ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  12183748 ggttgctatgaaagctttattcaggtattcctaatactcaaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccaatcataattatgttcaat 12183650  T
Q  110 gttttgtttgcttccgctattgattcata--------gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12183649 attttgtttgcttccactattgattcataattatattgttgaacatattttatgaaatctatttttattaagaactaaatttccaaca 12183562  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8093008 - 8092887
Alignment:
Q  13 tgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgtt 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8093008 tgctacaaaagctttatccaggtattcctcatacccaaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcatagatccgatcataatcatgttcaatgtt 8092909  T
Q  113 ttgtttgcttccgctattgatt 134  Q
    || |||||||| ||||||||||    
T  8092908 ttatttgcttctgctattgatt 8092887  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 27955171 - 27955336
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||||     ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27955171 aaagctttatccaggtcttcctaatacctta-ttatttatatcctt-----atcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 27955264  T
Q  120 cttccgctattgat--tcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||||||  | ||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27955265 cttccgctattgattatgattattaaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttctaaca 27955336  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38152113 - 38151935
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||      ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  38152113 caggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat------gttcaatattttgtttgcttccgctgtt 38152020  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcg-gtcttcat 212  Q
    |||| |||   ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38152019 gattaataattgttgaacatgttttatgaaatct-attttattaagacttggatttctaacaagtggtatcagagcgagtcttcat 38151935  T

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Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 1e-87; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 32890893 - 32891107
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890893 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 32890992  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatattt 216  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32890993 cttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatgttt 32891092  T
Q  217 catctattgggatta 231  Q
     || |||||||||||    
T  32891093 gatttattgggatta 32891107  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 14417945 - 14418114
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14417945 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 14418044  T
Q  120 cttccgctattgattcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14418045 cttccgctattgattcatagttaaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 14418114  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42993170 - 42992972
Alignment:
Q  8 agggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42993170 agggtggctacaaaagctttatcaaggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 42993072  T
Q  108 atgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42993071 atgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccatcaagtggtatcagagc 42992972  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 9935283 - 9935455
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9935283 aaagatttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttg 9935382  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9935383 cttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 9935455  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 32897017 - 32897189
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32897017 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 32897116  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32897117 cttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaaca 32897189  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Original strand, 7771225 - 7771409
Alignment:
Q  8 agggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7771225 agggttgctacaaaagctt-atccaggtattcttaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 7771323  T
Q  108 atgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7771324 atgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaacaa 7771409  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5542315 - 5542143
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542315 aaagctttatctaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 5542216  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5542215 cttccgctattgattcataattgttgaacatgtattataaaatctatttatattaaaacctaaatttccaaca 5542143  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14799560 - 14799399
Alignment:
Q  30 ccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14799560 ccaggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctat 14799462  T
Q  130 tgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||   ||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14799461 tgattcataattgttgaacatgtattatgaaatttgtttatattaagacctaaatttccaaca 14799399  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 36818970 - 36819147
Alignment:
Q  14 gctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36818970 gctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttt 36819068  T
Q  114 tgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36819069 tgtttgcttccactattgattcataattgttgaacatgtattatgagatttgtttatattaagacctaaatttccaaca 36819147  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1882898 - 1882725
Alignment:
Q  30 ccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtc-gtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgcta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1882898 ccaggtattcctaataccctaattcttaacatccttgataaatcaaacatgtcattagatccgttcatattcatgttcaatgttttgtttgcttccgcta 1882799  T
Q  129 ttgattc---atagttgaacatattttatgaaatctgtttt-tattaagacctaaatttccaacaagtggtatc 198  Q
    |||||||   || ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1882798 ttgattcttaattgttgaacatgttctatgaaatctgttttatattaagacctaaatttccaacaagtggtatc 1882725  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39735702 - 39735514
Alignment:
Q  25 tttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcc 124  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  39735702 tttatccaggtattccttataccctagttcttaatatctttgataaatcaaacatgtcgtagatacaatcataatcatgttcaatattttatttacttcc 39735603  T
Q  125 gctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttatt----aagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggt 206  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39735602 gctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctatttttattattaaaaacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggt 39735514  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22219862 - 22219706
Alignment:
Q  30 ccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgtttt-gtttgcttccgcta 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||| ||||    
T  22219862 ccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaaagttttctttttcttctgcta 22219763  T
Q  129 ttgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatt 182  Q
    ||||||||||    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22219762 ttgattcataactattgaacatgttttatgaaatctctttttattaagacctaaatt 22219706  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Original strand, 10705830 - 10706021
Alignment:
Q  8 agggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccg------atcataatca 101  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||    
T  10705830 agggctgctacaaaagctttatccaggtaatcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcataatca 10705928  T
Q  102 tgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    || ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10705929 tgttcaatgttttgtttgcttacgctattgatttacgattgttaaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaacaa 10706021  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39727456 - 39727299
Alignment:
Q  30 ccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctat 129  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39727456 ccaggtatttcttataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgt---------gatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgttat 39727366  T
Q  130 tgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgttt---ttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    |||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  39727365 tgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctatttttattattaagacctaaatttccaacaa 39727299  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Original strand, 10700022 - 10700127
Alignment:
Q  8 agggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10700022 agggctgctacaaaagttttatccagatattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 10700120  T
Q  108 atgtttt 114  Q
    |||||||    
T  10700121 atgtttt 10700127  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 190
Target Start/End: Original strand, 24250174 - 24250279
Alignment:
Q  87 atccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaattt 183  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24250174 atccgatcataataatgttcaatattttgtttgtttccgctattgattcatatttgttcaacatgttttatgaaatatgttttt-ttaagacctaaattt 24250272  T
Q  184 ccaacaa 190  Q
     ||||||    
T  24250273 tcaacaa 24250279  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 10700135 - 10700197
Alignment:
Q  139 gttgaacatattttatgaaatctgttttta-ttaagacctaaatttccaacaagtggtatcag 200  Q
    ||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10700135 gttaaacatgtattatgaaatatgtttttaattaagacctaaatttccaacaagtggtatcag 10700197  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 1171350 - 1171415
Alignment:
Q  19 aaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaa 86  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1171350 aaaagctttaaccaggtattcctaata-cctaattcttgttat-cttgataaatcaaatatgtcgtaa 1171415  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 184
Target Start/End: Original strand, 1171414 - 1171493
Alignment:
Q  107 aatgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttc 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||   |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1171414 aatgttttgtttgcttccgcggttgaatcataattgttgaatatgtttcatgaaatctgtttt-attaagacctaaatttc 1171493  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31399119 - 31399047
Alignment:
Q  93 tcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctg 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    |||||||||| |||| |||||||    
T  31399119 tcataatcatgttcaatgtattgtttgcctccactattgattcataattattgaacatatgttattaaatctg 31399047  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 189
Target Start/End: Original strand, 39689788 - 39689838
Alignment:
Q  139 gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  39689788 gttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaaaacctaagtctccaaca 39689838  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 42033856 - 42033930
Alignment:
Q  116 tttgcttccgctattgattcatagttgaaca-tattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||   | | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42033856 tttgcttctgctattgattcattgttgttgaatgttttatgaaatctatttttagtaagacctaaatttccaaca 42033930  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31373560 - 31373510
Alignment:
Q  179 aatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatatttcatctattgggat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||    
T  31373560 aatttctaacaagtggtatcagaacggtcttcatgtttgatttattgggat 31373510  T

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Target: chr5 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28531637 - 28531423
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531637 aaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 28531538  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatattt 216  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28531537 cttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatgttt 28531438  T
Q  217 catctattgggatta 231  Q
     || |||||||||||    
T  28531437 gatttattgggatta 28531423  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12692436 - 12692223
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692436 aaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 12692337  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatattt 216  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  12692336 cttccgctattgatttataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatatcaagagctaaatttccaacaagtggtatcagagccgtcttcatgttt 12692237  T
Q  217 catctattgggatt 230  Q
     || |||| |||||    
T  12692236 gatttattaggatt 12692223  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Original strand, 24054338 - 24054528
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaata-ccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgttt 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24054338 aaagctttatccaggtattcctaatatcccaaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgttt 24054437  T
Q  119 gcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacct-aaatttccaacaagtggtatcagagcgg 205  Q
    ||||||||||| |||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24054438 gcttccgctatagatttataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaaattttcaacaagtggtatcagagcgg 24054528  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32097115 - 32096903
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097115 aaagctttattcaggtaatcctaatacc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatcctatcataatcatgttcaatgttttgtttg 32097017  T
Q  120 cttccgctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatatt 215  Q
    |||||||||||||||    || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  32097016 cttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaacaaatggtatcagagcggtcttcatgtt 32096917  T
Q  216 tcatctattgggat 229  Q
    | || |||||||||    
T  32096916 tgatttattgggat 32096903  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28525541 - 28525369
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28525541 aaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 28525442  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28525441 cttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaaca 28525369  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7389708 - 7389531
Alignment:
Q  14 gctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7389708 gctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtggatccgatcataatcatgttcaatgttt 7389610  T
Q  114 tgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7389609 tgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatttgtttatattaagacctaaatttccaaca 7389531  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12686334 - 12686162
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686334 aaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 12686235  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  12686234 cttccgctattgatttataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatatcaagagctaaatttccaaca 12686162  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19066249 - 19066069
Alignment:
Q  33 ggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattga 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  19066249 ggtattcctaataccataattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatattcatgcttaatgttttgtttgcttccgctaatga 19066150  T
Q  133 ttcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttc 210  Q
    || |||   |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19066149 tttataatcgttgaacatggtttatgaaatatgtttttattaagacttaaatttccaactagtggtatcagagcggtcttc 19066069  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 189
Target Start/End: Original strand, 41297289 - 41297453
Alignment:
Q  28 agccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgct 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41297289 agccaggtattcctaataccctaattctttatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataattatgttcaatgttttgtttgcttctgct 41297388  T
Q  128 attgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||   ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41297389 attgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctctttatattaagacccaaatttccaaca 41297453  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32094314 - 32094142
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32094314 aaagctttattcaggtattcctaatacc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatcctatcataatcatgttcaatgttttgtttg 32094216  T
Q  120 cttccgctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||    || ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32094215 cttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattataaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 32094142  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30384532 - 30384358
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30384532 aaagcttcatccaggtattcttaatacccttattcttaatatccttgataaatcagacatgtc-tagatccgatcataatcgtgttcaatgttttgtttg 30384434  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctg--tttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  30384433 cttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttttattaaaacctaaatttccaacaa 30384358  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16215309 - 16215157
Alignment:
Q  40 ctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata- 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16215309 ctaataccctaatttttaatatccttgataaatcaaacatttcgtagatccaatcataatcatgttaaatgttttgtttgcttccgctattgattcataa 16215210  T
Q  139 --gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
      |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16215209 ttgttgaatatgtgttatgaaatctgtttttataaagacctaaatttctaaca 16215157  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 30772286 - 30772463
Alignment:
Q  19 aaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatg-ttttgtt 117  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  30772286 aaaaactttatccaggtaatcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgttgtcgatccgatcataatcatgttcattgtttttgtt 30772385  T
Q  118 tgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagt 192  Q
    ||||||| || || |||||||    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30772386 tgcttccactgtttattcataattattgaacatgttttatgaaatttatttttattaagaactaaatttccaacaagt 30772463  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19059909 - 19059746
Alignment:
Q  30 ccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctat 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||     
T  19059909 ccaggtatttctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgtttatattcatgtttaatattttgtttgcttcccctaa 19059810  T
Q  130 tgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    ||||| |||   |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19059809 tgatttataatcgttgaatacgttttatgaaatatgtttttattaagacctaaatttccaacaa 19059746  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Original strand, 14610184 - 14610321
Alignment:
Q  51 attcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  14610184 attcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatggtttatttgcttccgctattaattcataattgttgaacat 14610283  T
Q  148 attttatgaaatctg--tttttattaagacctaaattt 183  Q
     ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  14610284 gttttatgaaatctgtttttttgttaagacctaaattt 14610321  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Original strand, 20500141 - 20500231
Alignment:
Q  19 aaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaat 109  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20500141 aaaagttttatccaggtatttctaatactctaattcttagtatccttgataaatcaagtatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaat 20500231  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 179
Target Start/End: Original strand, 26509871 - 26510013
Alignment:
Q  35 tattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatt 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |   |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |    
T  26509871 tattcctaatacc-taattcttaatatc-ttgatgaatcaaatatgtcgtagtttatatcataattatgttcaatgttttgtttgcttccactatttcat 26509968  T
Q  135 catagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaa 179  Q
     ||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26509969 aatgattgaacatgttttatgaaatctgtttttatttaggcctaa 26510013  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 114
Target Start/End: Original strand, 28542269 - 28542336
Alignment:
Q  47 cctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgtttt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  28542269 cctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagtttcgatcataatcatgttcaatgtttt 28542336  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26316922 - 26316782
Alignment:
Q  45 accctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatt---catagtt 141  Q
    ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    ||  ||    
T  26316922 accctaattattaataccgtagataaatcaaacatgtcctagatccaatcatattaatgttcaatgttttttttgcttccactattaatttaaaattatt 26316823  T
Q  142 gaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatt 182  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  26316822 gaacatgttttatgaaatatgtttttatgtagacctaaatt 26316782  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 37896423 - 37896336
Alignment:
Q  50 aattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcat 137  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||| |||||||||    
T  37896423 aattattaatattcttgataaatcaatcatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaacattttatttacttctgctgttgattcat 37896336  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8706498 - 8706454
Alignment:
Q  139 gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaattt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8706498 gttgaacatattttatgaaatctatttttattaagacctaaattt 8706454  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 8706566 - 8706532
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8706566 caggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 8706532  T

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Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 49151616 - 49151830
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49151616 aaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 49151715  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatattt 216  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49151716 cttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatgttt 49151815  T
Q  217 catctattgggatta 231  Q
     || |||||||||||    
T  49151816 gatttattgggatta 49151830  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10244489 - 10244294
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244489 aaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 10244390  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244389 cttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagagctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcat 10244294  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11846222 - 11846013
Alignment:
Q  16 tacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttg 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11846222 tacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatacttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttg 11846123  T
Q  116 tttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||   ||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11846122 tttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgtattataaaatctgttttaattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcat 11846023  T
Q  213 atttcatcta 222  Q
     ||| |||||    
T  11846022 gtttgatcta 11846013  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42197317 - 42197102
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42197317 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatacccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttg 42197218  T
Q  120 cttccgctattgattc---atagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatattt 216  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42197217 cttccgctattgattcacaattgttgaacatgtattatgaaatctatttatattaagacctatatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatgttt 42197118  T
Q  217 catctattgggattat 232  Q
     || |||| |||||||    
T  42197117 gatttattaggattat 42197102  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38455705 - 38455493
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38455705 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 38455606  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatattt 216  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  38455605 cttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatgaaatc--tttatattaagaccgaaatttccaacaaatggtatcagagcggtcttcatgttt 38455508  T
Q  217 catctattgggatta 231  Q
     || |||| ||||||    
T  38455507 gatttattaggatta 38455493  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10767026 - 10766840
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10767026 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccggtcataatcatgttcaatgttttgtttg 10766927  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagc 203  Q
    |||||||| |||||| |||   ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10766926 cttccgctgttgatttataattgttgaacatgtattatgaaatttgtttttaataagacctaaatttccaacaagtggtatcagagc 10766840  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17055948 - 17055775
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17055948 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 17055849  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctg-tttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17055848 cttccgctattgattcataattgttgaacatattttatgaaaactgttttttattaagacctaaatttcgaaca 17055775  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11839880 - 11839708
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11839880 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 11839781  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11839780 cttccgctattgattcataattgttgaacatgtatcatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaaca 11839708  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10238367 - 10238195
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238367 aaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 10238268  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10238267 cttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagagctaaatttccaaca 10238195  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10760805 - 10760633
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10760805 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttg 10760706  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10760705 cttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaataagacctaaatttccaaca 10760633  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30051257 - 30051085
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30051257 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatctgattataatcatgttcaatattttgtttg 30051158  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30051157 cttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaattttcaaca 30051085  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 49157683 - 49157855
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157683 aaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 49157782  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49157783 cttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaaca 49157855  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 8331791 - 8331963
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331791 aaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 8331890  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8331891 cttccgctattgatttataattgttgaacatgttttataaaatctatttatattaagagctaaatttccaaca 8331963  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42191375 - 42191202
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42191375 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatacccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttg 42191276  T
Q  120 cttccgctattgattc---atagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  42191275 cttccgctattgattcacaattgttgaacatgtattatgaaatctatttatattaagacctatatttccaacaa 42191202  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 55003567 - 55003398
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55003567 aaagctttatccagatatttctaataccctaattcttaatatacttgataaattaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttg 55003468  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttcca 186  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55003467 cttctgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttcca 55003398  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38449218 - 38449048
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449218 aaagttttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 38449119  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38449118 cttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatgaaatc--tttatattaagaccgaaatttccaaca 38449048  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17593437 - 17593249
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17593437 aaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatattcttgataaattaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 17593338  T
Q  120 cttccgctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcg 204  Q
    ||||||| |||||||    || ||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17593337 cttccgcgattgatttacgattgttgaacatctattatgaaatatatttttaattaagacctaaatttcctacaagtgttatcagagcg 17593249  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 190
Target Start/End: Original strand, 28964910 - 28965043
Alignment:
Q  58 atatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcatagttgaacatattttatgaa 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28964910 atatctttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcattgttgaacatgttttatgaa 28965009  T
Q  158 atctgttttt-attaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28965010 atctgtttttaattaagacctaaatttccaacaa 28965043  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 53069210 - 53069043
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgttt 118  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53069210 aaagttttatccaggtattcttaatacccctgattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcatagatccgatcataatcatgttcaatgttttgttt 53069111  T
Q  119 gcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaattt 183  Q
    ||||||||||| |||| |||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53069110 gcttccgctatcgatttataattgttgaacatgttttataaaatctgtttttattaagacctaaattt 53069043  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 48128180 - 48128030
Alignment:
Q  42 aataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata--- 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       
T  48128180 aataccctaattcttaatattcttaataaatcaaacatgtcgtagaaccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgtttccgctattgattcataatt 48128081  T
Q  139 gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48128080 gttgaacatgtttcatgaaatctgtttttattgagacctaaatttccaaca 48128030  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 128
Target Start/End: Original strand, 34300512 - 34300609
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgcta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34300512 caggtattcctaataccctaattcttaatatcctttataaatcaaatatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgcta 34300609  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 189
Target Start/End: Original strand, 13445077 - 13445227
Alignment:
Q  32 aggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||          |||||||| ||||||||||||||||    
T  13445077 aggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat----------aatgttttatttgcttccgctattg 13445166  T
Q  132 attcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||| |||   ||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13445167 atttataattgttgaacatgttctatcaaatctatttttatttagacctaaatttctaaca 13445227  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Original strand, 46656699 - 46656850
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatt 130  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||| |||| ||||||    
T  46656699 caggtatttctaataccctcattctcaatatcattgataaatcaaacatatcgtagatccgatcataattatattgaatgttttatttacttcagctatt 46656798  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaa 179  Q
     |||||||    |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  46656799 aattcatatttattgaacatgttttatgaaatatgtttttatttagacctaa 46656850  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12108811 - 12108716
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttg-tttgcttccgc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12108811 caggtattcttaatacc-taattgttaatatccttgataaatcaaacatgtcttagatcaaatcataatcatattcaatgttttgatttgcttccgc 12108716  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24643635 - 24643532
Alignment:
Q  92 atcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattt--tatgaaatctgtttttattaagacctaaatttcca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||  |||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  24643635 atcataatcatgttcaatgttttatttacttccgctattgattcataaatgttgaacatgttttatatgaagtttg-ttttattaagacctaaatttcca 24643537  T
Q  187 acaag 191  Q
    |||||    
T  24643536 acaag 24643532  T

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Target: chr4 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 48160960 - 48161146
Alignment:
Q  16 tacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttg 115  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48160960 tacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataattatgttcaatgttttg 48161058  T
Q  116 tttgcttccgctattgattcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48161059 tttgcttccgctattgattcatagttgaacatattttatgaaatctatttttattaagacctaaatttctaacaagtggtatcagagc 48161146  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 24287991 - 24288184
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24287991 aaagttttatccaggtattcctaataccctaattcttaataaccttgataaatcaaacatgtcgtagatacgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 24288090  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24288091 cttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatc--tatttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcat 24288184  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 189
Target Start/End: Original strand, 48167179 - 48167351
Alignment:
Q  16 tacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttg 115  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48167179 tacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataattatgttcaatgttttg 48167277  T
Q  116 tttgcttccgctattgattcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48167278 tttgcttccgctattgattcatagttgaacatattttatgaaatctatttttattaagacctaaatttctaaca 48167351  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10739494 - 10739308
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10739494 aaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 10739395  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagc 203  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10739394 cttctgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatgttaagagctaaatgtccaacaagtggtatcagagc 10739308  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10953263 - 10953077
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953263 aaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 10953164  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagc 203  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10953163 cttctgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatgttaagagctaaatgtccaacaagtggtatcagagc 10953077  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26963495 - 26963301
Alignment:
Q  19 aaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgttt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  26963495 aaaagctttatccaggtattcctaatac--taattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatacttatgttcaatgttttgttt 26963398  T
Q  119 gcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26963397 gcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatgaaatttgtttttattaagacctaaatttccaacaagtagtatcagagcggtcttcat 26963301  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33458422 - 33458249
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33458422 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttg 33458323  T
Q  120 cttccgctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33458322 cttccgctattgatttacgattgttgaacatatattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 33458249  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10733401 - 10733229
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10733401 aaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttg 10733302  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||    
T  10733301 cttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatgttaagagctaaatgtccaaca 10733229  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10947170 - 10946998
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10947170 aaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttg 10947071  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||    
T  10947070 cttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatgttaagagctaaatgtccaaca 10946998  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6257372 - 6257187
Alignment:
Q  8 agggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6257372 agggctgctacgaaagctttatccaggtattcctaatatcctaattcttaacatccttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttca 6257273  T
Q  108 atgttttgtttgcttccgctattgat---tcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   | || ||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6257272 atgttttgtttgcttccgctgttgatttatgattgttgaacatgtattatgaaatctatttatattaagacctaaatttccaacaa 6257187  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 230
Target Start/End: Original strand, 49976607 - 49976804
Alignment:
Q  33 ggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattga 132  Q
    |||||||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  49976607 ggtattcctaatactctaattatta---tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgctttcgctatcga 49976703  T
Q  133 ttcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatatttcatctattgggat 229  Q
    ||||||   |||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||    
T  49976704 ttcataattgttgaatatgttttatgaaatttgtttttattaaaatctaaatttctaacaagtggtatcagagtggtcttcatgtttgatttattgggat 49976803  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Original strand, 50168608 - 50168769
Alignment:
Q  30 ccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctat 129  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50168608 ccaggtattccttatacc-taattgttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtatattcgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctat 50168706  T
Q  130 tgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||   ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50168707 tgattcataattgttgaacgtgttttatgtaatctggttttattaagacctaaatttccaaca 50168769  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33461559 - 33461361
Alignment:
Q  8 agggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33461559 agggctgctgcaaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgaccataatcatgttca 33461461  T
Q  108 atgttttgtttgcttccgctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagc 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    || ||||||||     ||| |||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33461460 atgttttgtttgcttccactattgatttacgattgttgaaca-----tataaaatatgtttttaattaagatttaaatttctaacaa-tggtatcagagc 33461367  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26956929 - 26956812
Alignment:
Q  75 aacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttatta 171  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26956929 aacatgtcgtagatccgttcatacttatgttcaatgttttatttgcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatgaaatctgtttttatta 26956830  T
Q  172 agacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26956829 agacctaaatttccaaca 26956812  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 190
Target Start/End: Original strand, 4632869 - 4632964
Alignment:
Q  98 atcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4632869 atcatgttcaatgttttgtttgcttccgctgttgattaataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 4632964  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 156
Target Start/End: Original strand, 3769586 - 3769710
Alignment:
Q  34 gtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgat 133  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  3769586 gtattcctaatacc-taattattaatatccttgattaatgaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttaaattattgat 3769684  T
Q  134 tcata---gttgaacatattttatga 156  Q
    |||||    |||||||||||||||||    
T  3769685 tcataattattgaacatattttatga 3769710  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 55473231 - 55473133
Alignment:
Q  86 aatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttc 184  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  55473231 aatccaatcataatcatattcaatattttatttgcttccgctattgatttattattgaacatattttatgaaatttgtttctattaagacctaaatttc 55473133  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 44831755 - 44831658
Alignment:
Q  32 aggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctat 129  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  44831755 aggtattcttaataccctagttcttaatatccttgataaattaaacatgtcgtagattcgatcatattcatgttcaatgattaatttgcttccgctat 44831658  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Original strand, 4632396 - 4632482
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4632396 aaagctttatccaagtatttctgataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 4632482  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Original strand, 50427382 - 50427501
Alignment:
Q  30 ccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaa--------acatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgct 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  50427382 ccaggtattcctaataccctaattcttaatcttcttgataaatcaataaattaaacatgtcgtacatccgatcataatcat-ttcaatgttttgattgct 50427480  T
Q  122 tccgctattgattcatagttg 142  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  50427481 tccactattaattcatagttg 50427501  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19686469 - 19686341
Alignment:
Q  34 gtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgat 133  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19686469 gtattcataatacccgaattcttaatatgcttgattaatcaagcatgttgtagatccgatgataattacgttcaatattttgtttgcttccgttattgat 19686370  T
Q  134 tcatag---ttgaacatattttatgaaat 159  Q
    | ||||   |||||||| |||||||||||    
T  19686369 ttatagttattgaacatgttttatgaaat 19686341  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 138
Target Start/End: Original strand, 9237402 - 9237485
Alignment:
Q  55 ttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  9237402 ttaatatacttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgagcataatcatattcaatgttctgtttgcttcgactattcattcata 9237485  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 50155990 - 50156137
Alignment:
Q  49 taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaac 145  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||            || ||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  50155990 taattgttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtatatccgatcttaa------------ttatgtttacttccgctattgattcataattgttgaac 50156077  T
Q  146 atattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcgg 205  Q
    || ||||||  |||||| ||||||||| |  |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  50156078 atgttttatataatctggttttattaacaattaaatttttaacaagtgatatcagagcgg 50156137  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34308144 - 34308060
Alignment:
Q  102 tgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttc 184  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  34308144 tgttcaatattttgtatgcttccgctattgattcataattattgaacatgttttataaaatctg-ttttattaagacgtaaatttc 34308060  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 138
Target Start/End: Original strand, 35177806 - 35177881
Alignment:
Q  63 cttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata 138  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  35177806 cttgataaatctaatatgttgtatatccgattataatcatatttaatgttttgtttttttcagctattaattcata 35177881  T

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Target: scaffold0363 (Bit Score: 154; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 774 - 605
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  774 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 675  T
Q  120 cttccgctattgattcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  674 cttccgctattgattcatagttaaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 605  T

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Target: chr2 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35090804 - 35090591
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35090804 aaagctttatccaggtattcctaatacactaattgttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 35090705  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatattt 216  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35090704 cttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagacctaaattt-caacaagtggtatcagagcggtcttcatgttt 35090606  T
Q  217 catctattgggatta 231  Q
     || ||||| |||||    
T  35090605 gatttattgagatta 35090591  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 13456104 - 13456319
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13456104 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatacccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttg 13456203  T
Q  120 cttccgctattgattc---atagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatattt 216  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13456204 cttccgctattgattcacaattgttgaacatgtattatgaaatctatttatattaagacctatatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatgttt 13456303  T
Q  217 catctattgggattat 232  Q
     || |||| |||||||    
T  13456304 gatttattaggattat 13456319  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 31002369 - 31002591
Alignment:
Q  8 agggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31002369 agggctgctacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttgatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 31002468  T
Q  108 atgttttgtttgcttccgctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagc 203  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31002469 atattttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagc 31002568  T
Q  204 ggtcttcatatttcatctattgg 226  Q
    ||||||||| ||| || ||||||    
T  31002569 ggtcttcatgtttgatttattgg 31002591  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28683100 - 28682928
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28683100 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaataaccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 28683001  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28683000 cttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaaca 28682928  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 36750419 - 36750591
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36750419 aaagttttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 36750518  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36750519 cttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacttaaatttccaaca 36750591  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44716967 - 44716786
Alignment:
Q  13 tgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgtt 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44716967 tgctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtt 44716868  T
Q  113 tt-gtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44716867 ttcttttgcttccgctattgattgataaccgttgaacatgttttatgatatctgtttttattaagacctaaatttctaacaa 44716786  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 31008347 - 31008537
Alignment:
Q  8 agggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31008347 agggctgctacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttgatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 31008446  T
Q  108 atgttttgtttgcttccgctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaacaagtgg 194  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    || ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31008447 atattttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaacaggtgg 31008537  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35084831 - 35084665
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35084831 aaagctttatccaggtattcctaatacactaattgttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcattttcaatgttttgtttg 35084732  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaattt 183  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35084731 cttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagacctaaattt 35084665  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 13462045 - 13462217
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13462045 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatacccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttg 13462144  T
Q  120 cttccgctattgattc---atagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13462145 cttccgctattgattcacaattgttgaacatgtattatgaaatctatttatattaagacctatatttccaaca 13462217  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13149851 - 13149674
Alignment:
Q  8 agggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    |||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13149851 agggctgctacaaaagttttatc-aggtattcttaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 13149754  T
Q  108 atgttttgtttgcttccgctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttc 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13149753 atgttttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttc 13149674  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Original strand, 30965320 - 30965505
Alignment:
Q  8 agggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30965320 agggctgctacaaaagatttatacaggtattcctaataccctaattcttaaaataattgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 30965419  T
Q  108 atgttttgtttgcttccgctattgat---tcatagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 189  Q
    || |||||||||||||||||||||||   | || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30965420 atattttgtttgcttccgctattgatttatgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttctaaca 30965505  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11048709 - 11048536
Alignment:
Q  19 aaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgttt 118  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11048709 aaaagctttatccaagtattcctagtgccctaattcttaatatccttggtacatcaaacatgacgtatatccaatcataatcatgttcaatgttttgttt 11048610  T
Q  119 gcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11048609 gcttcagctattgattcataattgttggacatgttttatgaaatttatttttaataagacctaaatttccaaca 11048536  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 23343579 - 23343737
Alignment:
Q  34 gtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgat 133  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23343579 gtattcctaataccccaactcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagattcgttcatattcatgttcaatgttttgtttgcttccgctgttgat 23343678  T
Q  134 tc---atagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||   || ||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||    
T  23343679 tcgtaatcgttgaacatgttttatgaaatctcttcttatcaagatctaaatttcaaaca 23343737  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35438816 - 35438693
Alignment:
Q  68 taaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtt 164  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| || |    
T  35438816 taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttccgctattgattcataactgttgaacatgttttatgaaatttg-t 35438718  T
Q  165 tttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  35438717 tttattaaggcctaaatttccaaca 35438693  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 226
Target Start/End: Original strand, 29833224 - 29833421
Alignment:
Q  30 ccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctat 129  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| |||    
T  29833224 ccaggtattcttaatacc-taattattgttatc-ttgataaatcaaacatgttgtcgatccgatcataattatgttcaatattttatttgtttccgttat 29833321  T
Q  130 tgattc---atagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatatttcatctattgg 226  Q
    ||||||   ||  || ||||| | ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  29833322 tgattcacaattattaaacatgtattatgaaatctctttatatttatacctaaatttctaacaagtagtatcagagcagtcttcatgtttgatttattgg 29833421  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 114
Target Start/End: Original strand, 31651664 - 31651703
Alignment:
Q  75 aacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgtttt 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31651664 aacatgtcataaatccgatcataatcatgttcaatgtttt 31651703  T

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Target: chr6 (Bit Score: 147; Significance: 5e-77; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8662922 - 8662722
Alignment:
Q  34 gtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgat 133  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8662922 gtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgat 8662823  T
Q  134 tcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatatttcatctattgggatt 230  Q
    |||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||    
T  8662822 tcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagagctaaatttacaacaagtggtatcagagcggtctttatgtttgatttattgggatt 8662723  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  8662722 a 8662722  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4580488 - 4580304
Alignment:
Q  8 agggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4580488 agggttgttacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 4580389  T
Q  108 atgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4580388 atgttttgtttgcttccgctattgattcatagttgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaaca 4580304  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8650958 - 8650785
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8650958 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 8650859  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  8650858 cttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagagctaaatttacaacaa 8650785  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32035441 - 32035269
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32035441 aaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaataaccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 32035342  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32035341 cttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaaca 32035269  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21782908 - 21782733
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21782908 aaagctttatccagctattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 21782809  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagt 192  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21782808 cttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttctaacaagt 21782733  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21191021 - 21190849
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21191021 aaagctttatccaggtatttctaataccctaattcttaatatctttgataaatcaaatatatcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 21190922  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21190921 cttccgctattgattcataattgttgaacatattttatgaaatctgtttataataagacctaaatttccaaca 21190849  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21197175 - 21196962
Alignment:
Q  19 aaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgttt 118  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  21197175 aaaagatttatccaggtattcataatac--taattcttgatatccttgataaatcaaacatgttgtagatccgttcatacttatgttcaatgttttgttt 21197078  T
Q  119 gcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  21197077 gcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatgaaatctgtttttactatgacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtctttatgtt 21196978  T
Q  216 tcatctattgggatta 231  Q
    | || |||| ||||||    
T  21196977 tgatttattaggatta 21196962  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Original strand, 25354204 - 25354388
Alignment:
Q  8 agggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25354204 agggctgctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 25354302  T
Q  108 atgttttgtttgcttccgctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25354303 atgctttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagatctaaatttccaaca 25354388  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 25343616 - 25343845
Alignment:
Q  7 aagggttgctacaaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25343616 aagggctgctacaaaagctttatctaggtattcctaatactctaattcttaatatc-ttgataaatcaaaaatgtcgtagatccgatcataatcatgttc 25343714  T
Q  107 aatgttttgtttgcttccgctattgatt---catagttgaa----catattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaacaagtggtatc 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    || ||||||    ||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25343715 aatgttttgtttgcttctgctattgatttacgattgttgaacatgcatgtattatgaaatttgtttttaattaagatataaatttccaacaagtggtatc 25343814  T
Q  199 agagcggtcttcatatttcatctattgggat 229  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  25343815 agagcggtcttcatgtttgatttattgggat 25343845  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31756370 - 31756196
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31756370 aaagctctatccagatattcataataccctaattcttaatatccttgataattcaaacatgtcgtagatccgattataatcatgttcaatgttttatttg 31756271  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctg--tttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||| | ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31756270 cttccgttgttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttttattaagacctaaatttccaaca 31756196  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Original strand, 18778587 - 18778761
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgttt 118  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18778587 aaagttttatccaggtattcctaaaacccctaattcttaatata-ttgataaatcaaatacgtcgtagatccgatcataattatgttcaacgttttgttt 18778685  T
Q  119 gcttccgctattgattcata---gttgaacat-attttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18778686 gcttccgctattgattcataattattgaacatgtttttatgaaatttgttttaattaagacctaaatttccaacaa 18778761  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Original strand, 17581639 - 17581797
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17581639 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattctt---------ggtaaatcaaacatgtcgtagatcctataataatcatgttcaatgttttgtttg 17581729  T
Q  120 cttccgctattgattc---atagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttc 184  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||    
T  17581730 cttccgctatcgattcataatagttgaacatgttttatgaattatgtttttatttagatctaaatttc 17581797  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21783463 - 21783350
Alignment:
Q  19 aaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgttt 118  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  21783463 aaaagctttattcaggtattcctaatac--taattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgttt 21783366  T
Q  119 gcttccgctattgatt 134  Q
    ||||||||||||||||    
T  21783365 gcttccgctattgatt 21783350  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21789686 - 21789573
Alignment:
Q  19 aaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgttt 118  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  21789686 aaaagctttattcaggtattcctaatac--taattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgttt 21789589  T
Q  119 gcttccgctattgatt 134  Q
    ||||||||||||||||    
T  21789588 gcttccgctattgatt 21789573  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21770712 - 21770546
Alignment:
Q  19 aaaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgttt 118  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  21770712 aaaagctttattcagatattcctaatac--taattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgttt 21770615  T
Q  119 gcttccgctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaattt 183  Q
     ||||| ||||| |||    || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21770614 acttcctctattaatttacgattgttgatcatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaattt 21770546  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Original strand, 6097999 - 6098181
Alignment:
Q  34 gtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgcta-ttga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  6097999 gtattcctaataccctaattcttaacat-cttgataaatcaaacacgtcgtagatccgttc---ttcatgttcaatgttttgtctacttccgctatttga 6098094  T
Q  133 ttcata------gttgaacatattttatgaaatctg-tttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    ||||||      ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  6098095 ttcataattgttgttgaacatgttttatgaaatttgttttttattaagacctaagttttcaacaagtggtatgagagcaatcttcat 6098181  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34603457 - 34603368
Alignment:
Q  48 ctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata 138  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34603457 ctaattgttaatatccttgataaatcaaacatgccatagatccgatcataattatgttcaatgctttgtttgctt-cgctatttattcata 34603368  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34724734 - 34724645
Alignment:
Q  48 ctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata 138  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34724734 ctaattgttaatatccttgataaatcaaacatgccatagatccgatcataattatgttcaatgctttgtttgctt-cgctatttattcata 34724645  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 188
Target Start/End: Original strand, 6102694 - 6102803
Alignment:
Q  87 atccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatt-gattcata------gttgaacatattttatgaaatctg-tttttattaagaccta 178  Q
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T  6102694 atccgttcatattgatgttcaatgttttgtctgcttccgctatttgattcatgattgttgttgaacatattttatgaaatatgttttttatgaagaccta 6102793  T
Q  179 aatttccaac 188  Q
    ||||||||||    
T  6102794 aatttccaac 6102803  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 96
Target Start/End: Original strand, 1106229 - 1106294
Alignment:
Q  32 aggtattcctaataccct-aattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcat 96  Q
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T  1106229 aggtattcctaataccttgaattattaatattcttgatgaatcaaacatgttgtagatccgatcat 1106294  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 173045 - 172831
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
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T  173045 aaagctttatccatgtattcctaatatcctaattcttaatatccttgataaattaaacatgtcgtagatccgatcataatcattttcaatgttttgtttg 172946  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatattt 216  Q
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T  172945 cttccgctattgattcataattgtagaacatgttttatgaaacctgtttatattaagacctaaattttcaacaagtagtatcagagcggtcttcatgttt 172846  T
Q  217 catctattgggatta 231  Q
     || |||||||||||    
T  172845 gatttattgggatta 172831  T

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Target: scaffold0236 (Bit Score: 132; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Original strand, 5539 - 5712
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
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T  5539 aaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 5638  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
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T  5639 cttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatatcaagagctaaatttccaacaa 5712  T

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Target: scaffold0440 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1349 - 1176
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
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T  1349 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatatcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 1250  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||  ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1249 cttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 1176  T

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Target: scaffold0208 (Bit Score: 124; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 6527 - 6722
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6527 aaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgttgtagattcagtcataatcatgttcaatgttttgtttg 6626  T
Q  120 cttccgctattgattcata----gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6627 cttccgctattgattcataaattgttgaacatggtttatgaaat-tgtttatattaagagctaaatttccaacaagtggtatcagagccgtcttcat 6722  T

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Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Original strand, 12400 - 12573
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
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T  12400 aaagctttatccagatattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagattcgatcataattatgttcaatgttttatttg 12499  T
Q  120 cttccgctattgattcata----gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||    |||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12500 cttccgctattgattcataaattgttgaatatggtttatgaaat-tgtttatattaagagctaaatttccaacaa 12573  T

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Target: scaffold1114 (Bit Score: 65; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 1092 - 1261
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    |||| |||| |||| |||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||    |||||||    
T  1092 aaagttttatccagatatttctaatactctaattgttaatatgcatgataagtcaaacatgtcgttgatccgatcataatcatatctaaa---ttgtttg 1188  T
Q  120 cttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1189 ctttcgatattgattcataatggttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagatctgaatttccaaca 1261  T

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Target: scaffold0085 (Bit Score: 63; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Original strand, 38434 - 38600
Alignment:
Q  20 aaagctttagccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38434 aaagcttcatccaggtattcctaatacc-taattattaatattcttgataaa-caaacatgttgtagatccgatcataactatgttcaatgttttgtttg 38531  T
Q  120 cttccgctattgat---tcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttcc 185  Q
    ||||| || |||||   | ||  |||||||| | |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  38532 cttccactgttgatttctaatgattgaacatgtcttatgaaatctggttttatttaatcctaaatttcc 38600  T

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Target: scaffold0185 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 134
Target Start/End: Original strand, 5945 - 6041
Alignment:
Q  37 ttcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatt 134  Q
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T  5945 ttcctaatacc-taattaataatatttttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcatattcatgttcaatgttttgtttaatgccgctattgatt 6041  T

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