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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF4027_low_6 (Length: 295)
Name: NF4027_low_6
Description: NF4027
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF4027_low_6 |
 | |
|
| [»] chr6 (9 HSPs) |
| |
|
| [»] chr1 (5 HSPs) |
| |
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| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] chr5 (3 HSPs) |
| |
|
| [»] chr4 (2 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold1838 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32450478 - 32450203
Alignment:
| Q |
20 |
tactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttat |
119 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
32450478 |
tactaggattgtgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaattttaactttttat |
32450379 |
T |
|
| Q |
120 |
aaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctatgcatatatgtttttgtggt |
219 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32450378 |
aaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctatgcatatatgtttttgtggt |
32450279 |
T |
|
| Q |
220 |
attgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaataaatgaaaatataaaaatatgagttttatgaaaatat |
295 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32450278 |
attgttaaagaagtgttagactttgttgataaactaaataaatgaaaatatagaaatatgagttttatgaaaatat |
32450203 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23260812 - 23260519
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23260812 |
cccatacgttcttactaagtattaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctcttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
23260713 |
T |
|
| Q |
101 |
gtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23260712 |
gtaaaatttagccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtttgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctat |
23260613 |
T |
|
| Q |
201 |
gcatatatgtttttgtggtattgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaataaatgaaaatataaaaatatgagttttatgaaaatat |
295 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23260612 |
tcatatatgtttttgtggtattgttaaagaagtgttaga-tttgctgataaactaaataaatgaaaatatagaaatatgagttttatgaaaatat |
23260519 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 25005160 - 25005430
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25005160 |
cccatacgttcttactaagtactaagattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaataagaattcatatg |
25005259 |
T |
|
| Q |
101 |
gtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25005260 |
gtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataattttatgtggaatgacatttattttatttttctat |
25005359 |
T |
|
| Q |
201 |
gcatatatgtttttgtggtattgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaataaatgaaaatata |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25005360 |
tcatatatgtttttgtggtattgttaaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaatata |
25005430 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 34636203 - 34636457
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34636203 |
cccatacgttcttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
34636302 |
T |
|
| Q |
101 |
gtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
34636303 |
gtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggcatgacat--------tttttctat |
34636394 |
T |
|
| Q |
201 |
gcatatatgtttttgtggtattgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaataaatgaaaatat |
270 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34636395 |
tcatatatgtttttgtggtat-------taagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaatat |
34636457 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 158 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10751637 - 10751527
Alignment:
| Q |
158 |
tatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctatgcatatatgtttttgtggtattgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaa |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10751637 |
tatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgtttttgtggtattg-taaagaagtgttagactttgctgataaactaaa |
10751539 |
T |
|
| Q |
258 |
taaatgaaaata |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
10751538 |
taaatgaaaata |
10751527 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 26182685 - 26182602
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaa |
85 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26182685 |
cccatatgtccatactaagtattaggatgatgttatgaattagagttagagattcttgtatgttgagaagaa-aaaacaactaaa |
26182602 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 150
Target Start/End: Original strand, 24992443 - 24992578
Alignment:
| Q |
12 |
atattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaa |
111 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| || | |||||||||||| |
|
|
| T |
24992443 |
atattaagtactagggatatgttatgaattataagtagaaattcttgt-ttttgaaaaga--aaaacaattaaaatatttctttacgtggtaaaatttat |
24992539 |
T |
|
| Q |
112 |
ccttttataaaagttattagtttaattatattttatatg |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24992540 |
tcttttataaaactgattattttaattaagttttatatg |
24992578 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 13777323 - 13777247
Alignment:
| Q |
11 |
catattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatat |
89 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13777323 |
cataataaatactaggatgatgttgtgaattagaagtacaaattcttatcttttggaaaga--aaaacaactaaaatat |
13777247 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26182608 - 26182570
Alignment:
| Q |
251 |
aactaaataaatgaaaatataaaaatatgagttttatga |
289 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26182608 |
aactaaataaatgaaaatatagaaatatgagttctatga |
26182570 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35762286 - 35761990
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
100 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35762286 |
cccatacgtccatactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtatgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaatttatatg |
35762187 |
T |
|
| Q |
101 |
gtaaaatttaaccttttataaaa--gttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttct |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35762186 |
gtaaaatttaaccttttataaaaaagttattagtttaactatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttct |
35762087 |
T |
|
| Q |
199 |
atgcatatatgtttttgtggtattgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaataaatgaaaatataaaaatatgagttttatgaaaatat |
295 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
35762086 |
atgcatatatgtttttgtggtattgttaatgaagtgttagactttgtagataaactaaataaatgaaaatatagaaatatgtgttttatgaaaatat |
35761990 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9537569 - 9537377
Alignment:
| Q |
20 |
tactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttat |
119 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9537569 |
tactaggatgatgttatgaattagaggtatagattcttgtctgttgagaagaa--aaacaagtaaaatataaatttatattgtaaaatttaaccttttat |
9537472 |
T |
|
| Q |
120 |
aaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctatgcatatatgttttt |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9537471 |
aaaagttattagtttaattatattttatatgatgtttgtatgataatgttatgtagaatgacatttatttcatgttgctatgcgtatatgttttt |
9537377 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37667271 - 37667144
Alignment:
| Q |
142 |
ttttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctatgcatatatgtttttgtggtattgttaaataagtgttagact |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37667271 |
ttttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacttttattttatttttctattcatatatgtttttgtggtattg-taaagaagtgttagact |
37667173 |
T |
|
| Q |
242 |
ttgttgataaactaaataaatgaaaatat |
270 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37667172 |
ttgctgataaactaaataaatgaaaatat |
37667144 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 37667384 - 37667265
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37667384 |
cccatacgttcttactaagtaataggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
37667285 |
T |
|
| Q |
101 |
gtaaaatttaaccttttata |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37667284 |
ataaaatttaaccttttata |
37667265 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 16074726 - 16075013
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatg---ttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcat |
97 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||| |||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16074726 |
cccatacgttcatactaagtactgggatgatgatattatgaattagagatagagatttttgtccgttaaaaagaa--aaacaattaaaatatgaattcat |
16074823 |
T |
|
| Q |
98 |
atggtaaaatttaaccttttataaaagttattag-tttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttattttt |
196 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16074824 |
atgttaaaatttaatcttttataaaagttattagatttaattatatttta-----------tatgataatgtaatgtagaatgacatttattttatttgg |
16074912 |
T |
|
| Q |
197 |
ctatgcatatatg-tttttgtggtattgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaataaatg-aaaatataaaaatatgagttttatgaaaata |
294 |
Q |
| |
|
|||| |||| | ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16074913 |
ctatctttataggtttttttttatattgggaaagaagtgttagattttttttataaactaaagaaatgaaaaatatgaaaatgtgagtttcatgaaaata |
16075012 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5004954 - 5004687
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5004954 |
cccatacgttcttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtcttttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaatttatatg |
5004855 |
T |
|
| Q |
101 |
gtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctat |
200 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5004854 |
gtgaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctat |
5004755 |
T |
|
| Q |
201 |
gcatatatgtttttgtggtattgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaataaatgaaaata |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5004754 |
tcatatatgtttttgtggtattg-taaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaata |
5004687 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 46404796 - 46404537
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46404796 |
cccatacgttcttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
46404697 |
T |
|
| Q |
101 |
gtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
46404696 |
gtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatatctgtatgataatgttttgtggaatggc---------atttttctat |
46404606 |
T |
|
| Q |
201 |
gcatatatgtttttgtggtattgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaataaatgaaaatat |
270 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46404605 |
tcatatatgtttttgtggtattg-taaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaatat |
46404537 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 181
Target Start/End: Original strand, 16975289 - 16975450
Alignment:
| Q |
20 |
tactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttat |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16975289 |
tactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtttgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttat |
16975388 |
T |
|
| Q |
120 |
aaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgac |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16975389 |
aaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataattttatgtggaatgac |
16975450 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11968053 - 11967862
Alignment:
| Q |
72 |
acaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttat |
171 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
11968053 |
acaaaaaatctaaaatatgaatttatatggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatacgatgtgtgtat-aaaatgttcc |
11967955 |
T |
|
| Q |
172 |
gtggaatgacatttattttatttttctatgcatatatg--tttttgtggtattgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaataaatga |
264 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11967954 |
gtagaatgacatttattttattttgatatgcatatatgtttttttgtggtattgggaaagaagtgtt--attttgttgataaactaaagaaatga |
11967862 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 208 - 295
Target Start/End: Original strand, 16975453 - 16975540
Alignment:
| Q |
208 |
tgtttttgtggtattgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaataaatgaaaatataaaaatatgagttttatgaaaatat |
295 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16975453 |
tgtttttgtggtattgttaaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaatatagaaatatgagttttatgaaaatat |
16975540 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 16475294 - 16475381
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaata |
88 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16475294 |
cccatacgttcttactaagtactaagattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaata |
16475381 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Original strand, 8730913 - 8730966
Alignment:
| Q |
100 |
ggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtt-taattatattttatatgat |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8730913 |
ggtaaaatttaatcttttataaaagttattaattctcattatgttttatatgat |
8730966 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Original strand, 9082800 - 9082853
Alignment:
| Q |
100 |
ggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtt-taattatattttatatgat |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9082800 |
ggtaaaatttaatcttttataaaagttattaattctcattatgttttatatgat |
9082853 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:
Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 8856 - 9125
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
8856 |
cccatacgttcttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtataaattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcacatg |
8955 |
T |
|
| Q |
101 |
gtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttatttta-tttttcta |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
8956 |
gtaaaatttaaccttttataacagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttattttttcta |
9055 |
T |
|
| Q |
200 |
tgcatatatgtttttgtggtattgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaataaatgaaaatat |
270 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9056 |
ttcatatatgtttttgtggtattg-taaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaatat |
9125 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15874171 - 15873911
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15874171 |
cccatacgttcttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtatgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
15874072 |
T |
|
| Q |
101 |
gtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
15874071 |
gtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatatctgtatgataatgttttgtggaatggcat--------tttttctat |
15873980 |
T |
|
| Q |
201 |
gcatatatgtttttgtggtattgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaataaatgaaaatat |
270 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15873979 |
tcatatatgtttttgtggtattg-taaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaatat |
15873911 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21491732 - 21491434
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaa--caaaacaactaaaatatgaattcata |
98 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
21491732 |
cccatacgtccatactaagtactaggatgatgttatgaattagaggtagagattcttgtcggttgaaaagaagacaaaaaaactaaaatatgaatttata |
21491633 |
T |
|
| Q |
99 |
tggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttct |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
21491632 |
tggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgcat-aaaatgttatgtagaatgacatttattttattttgat |
21491534 |
T |
|
| Q |
199 |
atgcatatatg---tttttgtggtattgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaataaatgaaaatataaaaatatgagttttatgaaaatat |
295 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21491533 |
atgcatatatgttttttttgtggtattgggaaagaagtgttggattttgttgataaactaaagaaatgaaaatatagtaatatgagttttatgaaaatat |
21491434 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22077649 - 22077860
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
100 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
22077649 |
cccatatgttcatactaagtactaggatgatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttaagaagaa--aaacaactaaaatataaatttatatg |
22077746 |
T |
|
| Q |
101 |
gtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22077747 |
gtaaaatttaaccatttcaaaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtagaatgacatttgctttattttcctat |
22077846 |
T |
|
| Q |
201 |
gcatatatgttttt |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
22077847 |
gcatatatgttttt |
22077860 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18367540 - 18367268
Alignment:
| Q |
21 |
actaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaac-aaaac--aactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaacctttt |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18367540 |
actaggacgatgttatgaattaaaggtagagattcttgtttgttgaaaagaaagaaaaccaaattaaaatatgaatttatatggtaaaatttaacctttt |
18367441 |
T |
|
| Q |
118 |
ataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctatgcatatatg--tttttg |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18367440 |
ataaaagttattagtttaattatatttta-at------tatattaaaatgttacgtagaatgacatttattttattttgatatgcatatatgtttttttg |
18367348 |
T |
|
| Q |
216 |
tggtattgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaataaatgaaaatataaaaatatgagttttatgaaaatat |
295 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
18367347 |
tggtattgggaaagaagtgttggattttgttgataaactaaagaaatgaaaatatagaaatatgagatttataaaaatat |
18367268 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 48576348 - 48576540
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
100 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48576348 |
cccatacgtccatactaagtactgggataatgttatgaattagaggtagagattcttatccgttaaaaagaa---aataattaaaatatgaatttatatg |
48576444 |
T |
|
| Q |
101 |
gtaaaatttaaccttttataaaagttattagttt-aattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttt |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
48576445 |
gtaaaatttaatatcttattaaagttattagttttaattatatattatatgatgtgtgtatgataatgtgatgcagaatgacatttattctatttt |
48576540 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 48654462 - 48654339
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
100 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||| | || |
|
|
| T |
48654462 |
cccatacgtccatactaagtactaggatgatgttgtgaattagaagtacaaattcttgtcttttggaaagaa--aaacaactaaaatatatatttaggtg |
48654365 |
T |
|
| Q |
101 |
gtaaaatttaaccttttataaaagtt |
126 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
48654364 |
gtaatatttaacagtttacaaaagtt |
48654339 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 121
Target Start/End: Original strand, 9993358 - 9993427
Alignment:
| Q |
52 |
attcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttataa |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
9993358 |
attcttgtcttttgaaaagaagaaaacaattaaaatatttatttatatggtaaaatctaatattttataa |
9993427 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4558185 - 4557910
Alignment:
| Q |
23 |
taggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaaga-acaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttataa |
121 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4558185 |
taggatgatgttatgatttagaggtagagattcttgtctgttgagaagagagaaaaaaactaaaatatgaatttatatggtaaaatttaaccttttataa |
4558086 |
T |
|
| Q |
122 |
aagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctatgcatatatgt--ttttgtggt |
219 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4558085 |
aagttattagtttaatcatattttatataatgtgtgtataataatgttacgtagaatgacttttattttattttgatatgcatatatgtttttttgtggt |
4557986 |
T |
|
| Q |
220 |
attgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaataaatgaaaatataaaaatatgagttttatgaaaatat |
295 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4557985 |
attgagaaagaagtgttggattttgttgataaactaaagaaatgaaaatatataaatatgagttttatgaaaatat |
4557910 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 66 - 270
Target Start/End: Original strand, 536895 - 537090
Alignment:
| Q |
66 |
aaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataa |
165 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
536895 |
aaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataa |
536994 |
T |
|
| Q |
166 |
tgttatgtggaatgacatttattttatttttctatgcatatatgtttttgtggtattgttaaataagtgttagactttgttgataaactaaataaatgaa |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
536995 |
tgttatgtggaatggcat--------tttttctattcatatatgtttttgtggtattg-taaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaa |
537085 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 536746 - 536891
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
536746 |
cccatacgttcttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
536845 |
T |
|
| Q |
101 |
gtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatatttta |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
536846 |
gtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatatttta |
536891 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 295
Target Start/End: Original strand, 49499047 - 49499322
Alignment:
| Q |
20 |
tactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttat |
119 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49499047 |
tactaggatcatgttatgaattagaggtggagattcttgtctgttgagaagaaaaaaaaaactaaaatatgaatttatatagtaaaatttaaccttttat |
49499146 |
T |
|
| Q |
120 |
aaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctatgcatatatg-tttttgtgg |
218 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
49499147 |
aaaaattattagtttaattatattttatataatgtgtgtat-aagatgttacgtagaatgacatttattttattttgatatgcatatatgttttttgtgg |
49499245 |
T |
|
| Q |
219 |
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295 |
Q |
| |
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||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
49499246 |
tattgggaaagaagtgttggattttgttgataaactaaagaaatgaaaatatagaaatatgagttttatgaaaatat |
49499322 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28969405 - 28969204
Alignment:
| Q |
11 |
catattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28969405 |
catactaagtactaggatgatgttatgaattagaggtagaaattcttgtctgttgagaagaa--aaacaactaaaatattaatttatatggtaaaattta |
28969308 |
T |
|
| Q |
111 |
accttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctatgcatatatgt |
210 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28969307 |
acattttataaaagttattagtttaattatattctatatgatgtgtgtatgataattttatgtagaatgacatttattttattttgctatgcatatatgt |
28969208 |
T |
|
| Q |
211 |
tttt |
214 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
28969207 |
tttt |
28969204 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1838 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1838
Description:
Target: scaffold1838; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 208
Target Start/End: Original strand, 221 - 397
Alignment:
| Q |
30 |
atgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttataaaagttatt |
129 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
221 |
atgttatgaattagagatagagattcttgtttgttaaaaagaa--aaataattaaaatataaatctatatggtaaaatttaaccttttataaaagttatt |
318 |
T |
|
| Q |
130 |
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208 |
Q |
| |
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| T |
319 |
agtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtagaatgccatttattttattttgccatgcatatat |
397 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32735526 - 32735391
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatg |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
32735526 |
cccatacgttcttactaagtgctaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgcattcatatg |
32735427 |
T |
|
| Q |
101 |
gtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaa |
136 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
32735426 |
gtgaaatttaaccttttataaaagatattagtttaa |
32735391 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 178
Target Start/End: Original strand, 29270702 - 29270827
Alignment:
| Q |
52 |
attcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatg- |
150 |
Q |
| |
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| T |
29270702 |
attcttgtcttttgaaaagaa--aaacaattaaaatatgtagttacatagtaaaatttaatattttataaaaattattattttaattata-tttatttga |
29270798 |
T |
|
| Q |
151 |
-atgtgtgtatgataatgttatgtggaat |
178 |
Q |
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| T |
29270799 |
tatttgtgtatgagaatgtgatgtggaat |
29270827 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 217
Target Start/End: Original strand, 1193665 - 1193831
Alignment:
| Q |
52 |
attcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatga |
151 |
Q |
| |
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| T |
1193665 |
attcttgtcttttgaaaagaagaaaacaattaaaatatttatttacatggtaaagtctaatattttataagagtgattattttaattgagttttatatga |
1193764 |
T |
|
| Q |
152 |
t--gtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatt--tattttatttttctatgcatatatgtttttgtg |
217 |
Q |
| |
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| T |
1193765 |
tagttgtgtatg---atgtgatgcggaatgatattggtattttattttattatgtttatatgtttttgtg |
1193831 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 28267778 - 28267692
Alignment:
| Q |
1 |
cccataagttcatattaaatactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatat |
89 |
Q |
| |
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| T |
28267778 |
cccatacgtccatactaagtactaggatgatgttgtgaattagaagtacaaattcttatcttttgaaaagaa--aaacaactaaaatat |
28267692 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 152
Target Start/End: Original strand, 35839168 - 35839268
Alignment:
| Q |
52 |
attcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatga |
151 |
Q |
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| T |
35839168 |
attcttgtcttttgaaaagaagaaaacaattaaaatatttatttacatggtaaaatctaatattttataagagtgattattttaattgagttttatatga |
35839267 |
T |
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| Q |
152 |
t |
152 |
Q |
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| T |
35839268 |
t |
35839268 |
T |
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Back To:
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