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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF4029_low_9 (Length: 232)
Name: NF4029_low_9
Description: NF4029
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF4029_low_9 |
 | |
|
| [»] chr7 (214 HSPs) |
| |
|
| [»] chr4 (236 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0444 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] chr6 (144 HSPs) |
| |
|
| [»] chr5 (182 HSPs) |
| |
|
| [»] chr3 (218 HSPs) |
| |
|
| [»] chr2 (208 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0166 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] chr8 (211 HSPs) |
| |
|
| [»] chr1 (246 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0074 (3 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0459 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0366 (2 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0130 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0262 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0011 (3 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0189 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0236 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0533 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0037 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0172 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0160 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0427 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0239 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0768 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0330 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0983 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0264 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold1515 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0380 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0154 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0060 (3 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0789 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold1335 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0654 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0308 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0734 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0027 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0015 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0007 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0140 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0475 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0005 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0187 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0010 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0001 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0496 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0057 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0268 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0024 (1 HSPs) |
| |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 214)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 31466049 - 31466280
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31466049 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
31466148 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31466149 |
attatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
31466248 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31466249 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
31466280 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Original strand, 21177214 - 21177443
Alignment:
| Q |
3 |
tccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctat |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21177214 |
tccctccgtcccaaattttatgtcgctttggaaaaaaaatttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctat |
21177313 |
T |
|
| Q |
103 |
tatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21177314 |
tatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactaataattt |
21177413 |
T |
|
| Q |
203 |
ctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21177414 |
ctcttccccacacaatattaattacatttc |
21177443 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 28703544 - 28703775
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28703544 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcct |
28703643 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28703644 |
attatatccttaactattaattactatctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
28703743 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28703744 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
28703775 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17611543 - 17611354
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17611543 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatactaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
17611444 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17611443 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
17611354 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32827385 - 32827153
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaatt-ataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcc |
99 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
32827385 |
actctctccgtctcaaattgtatgtcgctttgggaaaaaaatttgtcccaaatttatatgtctctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcc |
32827286 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32827285 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
32827186 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32827185 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
32827153 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 7978994 - 7979225
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7978994 |
actccctccgtcccaaattgtatgttactttggaaaaaagatttgtcctaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
7979093 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7979094 |
attatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttctataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
7979193 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
7979194 |
ttcacttccccacactatattaattacatttc |
7979225 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 17832955 - 17833145
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17832955 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatattacttttcctattatatccttaactattaattagtctctcttctttcaatt |
17833054 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17833055 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaaaattaattacatttc |
17833145 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12263651 - 12263882
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12263651 |
actccttccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcctaaattatatgtcgctttacaagaccaatgaaatattaatgttacttttcct |
12263750 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12263751 |
attatatccttaactattaattactccccattctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
12263850 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12263851 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
12263882 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 29669273 - 29669504
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
29669273 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtccaaaattatatgtcgctttacaataacaatgaaatattaatgttactttttct |
29669372 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29669373 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattttatttatcttttccataccatttattaggaataattttgtaaaacaactcataat |
29669472 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29669473 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
29669504 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 32467808 - 32468039
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
32467808 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcct |
32467907 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32467908 |
attatatccttgactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttcccatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
32468007 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32468008 |
ttcttttccccacacaatattaattatatttc |
32468039 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 40704390 - 40704620
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
40704390 |
actccctccgtcccaaattgtatatcgctttggaaaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaa-tattaatgttatttttcct |
40704488 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40704489 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattacatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
40704588 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40704589 |
ttctcttccccacacaatattaattatatttc |
40704620 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3458613 - 3458382
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3458613 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcct |
3458514 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3458513 |
attatatccttaactattaattattctctattctttcaattatttcatttatcttttctataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
3458414 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3458413 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
3458382 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 33616379 - 33616610
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Q |
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33616379 |
actccctccatcccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttataataccaatgaaatatttatgttactttttct |
33616478 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
33616479 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
33616578 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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| T |
33616579 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 39430082 - 39430313
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1 |
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Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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actccttccgtcccaaattgtatgtcactttggaaaatttttttgtcccaaattatatgtcgcttgacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
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39430282 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47604761 - 47604530
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Q |
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T |
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| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
47604661 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
47604562 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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47604561 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
47604530 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40537061 - 40536834
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100 |
Q |
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T |
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| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
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attatatccttaagtattaattactctctcttcttttaattat----tttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
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ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
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Target Start/End: Complemental strand, 43884399 - 43884175
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8 |
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107 |
Q |
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43884300 |
T |
|
| Q |
108 |
ccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
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|
| T |
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ccttaactattaattactctatcttctttcaattatatcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactgataatttctctt |
43884200 |
T |
|
| Q |
208 |
ccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
43884199 |
ccccaaacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27116693 - 27116462
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
27116494 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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| T |
27116493 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36669808 - 36669578
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100 |
Q |
| |
|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
36669708 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttat-tttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36669609 |
ttctcttccccatgcaatattaattgcatttc |
36669578 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40353869 - 40353683
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| Q |
43 |
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142 |
Q |
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|
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|
|
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T |
|
| Q |
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 48339448 - 48339678
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100 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
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|
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actcccttcgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtcgttttacaataccgatgaaatattaatgttatttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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attatatccttaactattaattactatcgcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataat |
48339646 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48339647 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
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|
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|
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ccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatattacttttcctatt |
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T |
|
| Q |
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atatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttc |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30803388 |
atatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttc |
30803487 |
T |
|
| Q |
204 |
tcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30803488 |
actctcccacgcaatattaatta |
30803510 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 43 - 224
Target Start/End: Original strand, 37277727 - 37277908
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| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
|
| Q |
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaat |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37277827 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcctcacacaatattaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 50 - 232
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Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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aaattatatgtcgctttacaaaaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatt |
4503762 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaa-ggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4503761 |
tatcttttccataccatttattaagggataattttgtaaatcaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 23709561 - 23709791
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatta-tctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23709660 |
attatatccttaactattaattactctctcatctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagagataattttgtaaaacaactcataat |
23709759 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23709760 |
ttctcttccccacgcaatattaattatatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Original strand, 42940934 - 42941121
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144 |
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| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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gtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatt |
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T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43576779 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctattctttcaatt |
43576878 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
43576879 |
attttatttatcttttccataccatttattagggataattttataaaacaactcataatttctcttccccaagcaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 24161635 - 24161866
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
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| T |
24161735 |
attatatccttaattattaattattctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
24161834 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
24161835 |
ttctcttcctcacacaatattaattatatttc |
24161866 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42808484 - 42808293
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141 |
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T |
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142 |
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232 |
Q |
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| T |
42808384 |
atttcatttatcttttccataccatttattaagggataattttgtaaaacaattcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27059819 - 27059592
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100 |
Q |
| |
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27059720 |
T |
|
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
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attatatcattaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac--tatattaagg--aattttgtaaaataactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||||||||||| |
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| T |
27059623 |
ttctcttccccgcacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32466397 - 32466206
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140 |
Q |
| |
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| T |
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32466298 |
T |
|
| Q |
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tatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
32466297 |
tatttcatttatctttctcataccatttattaaggataattttataaaacaactcataatttctctttcccacacaatattaattatatttc |
32466206 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 46774151 - 46774341
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
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| T |
46774151 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaatt |
46774250 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
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ctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacagtattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 38074544 - 38074733
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| Q |
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142 |
Q |
| |
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ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccctaactatttattattctttctcctttcaatta |
38074643 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
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tttcatttatcttttccataacatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 44480987 - 44481218
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44481086 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
44481087 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
44481186 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
44481187 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
44481218 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44894854 - 44894623
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100 |
Q |
| |
|
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcacaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
44894754 |
attatatcattaactatttattactctctcttctttcaattcattcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
44894655 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
44894654 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
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Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 8611818 - 8612044
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Q |
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cctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctatta |
8611917 |
T |
|
| Q |
105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
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| T |
8611918 |
tatccttaactatttattactctctcttctttcaattcctttatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaacttataatatct |
8612017 |
T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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| T |
8612018 |
ctttcccacacaatattaattacattt |
8612044 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 37115774 - 37115964
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141 |
Q |
| |
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tttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
37115874 |
ccttcatttatctttcacatataatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
37115964 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 23059071 - 23059303
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgt-aaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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| T |
23059171 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaaacaactcataa |
23059270 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| |||||| || ||||||||||||||||||||| |
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| T |
23059271 |
tatctctttcctacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24685708 - 24685477
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100 |
Q |
| |
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24685708 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcct |
24685609 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
24685608 |
attatatctttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttccaatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
24685509 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
24685508 |
atctctttcccacactatattaattacatttc |
24685477 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 46373283 - 46373052
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| Q |
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100 |
Q |
| |
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|
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
46373183 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttattgagaacaattttgtaaaacaattcataat |
46373084 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
46373083 |
atctttttcccacacaatattaattacatttc |
46373052 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 38589467 - 38589657
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
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T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
| T |
38589567 |
ccttcatttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
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| |
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| T |
39199088 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttcttttaatt |
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T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
39199188 |
ctttcatttatctttcttatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
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| |
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|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
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|
| T |
1643786 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcct |
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|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
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| |
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| T |
1643686 |
attatatccttaactatttattactctttcttctttcaattttttcatttatctttctcatatcatttattaaggatagttttgtaaaacaattcataat |
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T |
|
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ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
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1643586 |
atctctttcccacacagtattaattacatttc |
1643555 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
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Target Start/End: Complemental strand, 29986050 - 29985819
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Q |
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29986050 |
actccctccgtcccaaattgtatgccactttgaaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcct |
29985951 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
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| T |
29985950 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataat |
29985851 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
29985850 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
29985819 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35144367 - 35144136
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
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T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
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35144167 |
atctttttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 44186883 - 44187114
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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attatatccttaactatttattactcttttttttttcaattctttcatttatctttcccatgtcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
44187082 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44187083 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 36916708 - 36916898
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
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| T |
36916708 |
tttgtcccaaattataaatcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcatattatattcttaactatttattactctatcttctttcaatt |
36916807 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
36916808 |
ccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttc |
36916898 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 37798090 - 37798280
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
37798090 |
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37798189 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37798190 |
ccttcatttatttttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccttacaatattaattacatttc |
37798280 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43468513 - 43468323
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
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|
|
| T |
43468513 |
tttgtccaaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctctcttctttcaatt |
43468414 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
43468413 |
ccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
43468323 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6696859 - 6696670
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| Q |
43 |
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142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
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ttgtcccaaattatatttcgttttacaataccaatgaaacattaatgttattttttttattatatccttaattatttattactctttcttctttcaatta |
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T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttc |
6696670 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 2648901 - 2649132
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
2648901 |
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2649000 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
2649001 |
attatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcatatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
2649100 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
2649101 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
2649132 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4513640 - 4513409
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaatactaatgaaaaattaatgttatttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4513540 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatagaggacaatttagtaaaacaactcataat |
4513441 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4513440 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42688806 - 42688575
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
42688806 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttggaataaatatttatcctaaattgtatctcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttctt |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattgatgacaattttgtaaaataactcataat |
42688607 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42688606 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
42688575 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
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Q |
| |
|
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|
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
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ctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
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|
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33938354 |
tcttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatttttttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
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Target Start/End: Original strand, 35542010 - 35542192
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| |
|
||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
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aaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaataaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctctcttctttcaattacttcatt |
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T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tattttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
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Query Start/End: Original strand, 4 - 232
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103 |
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| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |
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|
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23726653 |
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T |
|
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104 |
atatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |
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|
| T |
23726553 |
atatccttaactatttattactctctcttatttcaattccttaatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatc |
23726454 |
T |
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204 |
tcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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23726453 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
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Q |
| |
|
|||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34275594 |
ccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 30264427 - 30264652
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| |
|
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|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcc |
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| |
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|
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Q |
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tatctccttttcacacaatattaatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 22369504 - 22369736
Alignment:
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Q |
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T |
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199 |
Q |
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22369604 |
tattgtaaccttagttatttattactctctcttttttcaattctttcatttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaataactcataa |
22369703 |
T |
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| Q |
200 |
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232 |
Q |
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22369704 |
aatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29155731 - 29155543
Alignment:
| Q |
44 |
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143 |
Q |
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29155632 |
T |
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| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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ttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 25428221 - 25428412
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| Q |
42 |
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140 |
Q |
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tttgtcccaaattgtatgtcactttataataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttctttttttcaat |
25428320 |
T |
|
| Q |
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tatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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25428321 |
tctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtacaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattatatttc |
25428412 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12118859 - 12118669
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| Q |
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141 |
Q |
| |
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tttgtcccaaactgtatgtcattttagaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaaat |
12118760 |
T |
|
| Q |
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232 |
Q |
| |
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| T |
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ctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
12118669 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28234377 - 28234191
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| Q |
45 |
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144 |
Q |
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28234278 |
T |
|
| Q |
145 |
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231 |
Q |
| |
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| T |
28234277 |
tcatttatctttctcatatcatttagtaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacattt |
28234191 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40768753 - 40768540
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| Q |
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Q |
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cctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctatta |
40768654 |
T |
|
| Q |
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204 |
Q |
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| T |
40768653 |
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40768554 |
T |
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| Q |
205 |
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218 |
Q |
| |
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| T |
40768553 |
ctttcccatacaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22326807 - 22326575
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
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| T |
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22326708 |
T |
|
| Q |
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tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
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| T |
22326707 |
tattgtaaccttagttatttattactctctcttttttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
22326608 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
22326607 |
aatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
22326575 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 25756387 - 25756575
Alignment:
| Q |
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142 |
Q |
| |
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ttgtctcaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaacgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
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T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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tttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttctcacacaatactaattacattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26838254 - 26838022
Alignment:
| Q |
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99 |
Q |
| |
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26838254 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgatttagggaaatttttttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatacaacattaatgttacttttcc |
26838155 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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| T |
26838154 |
tattataaccttagctatttattactatcacttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttataaaacaactcataa |
26838055 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
26838054 |
tacctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32827857 - 32827669
Alignment:
| Q |
44 |
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143 |
Q |
| |
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tgtcacaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttcttttaattct |
32827758 |
T |
|
| Q |
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ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
32827757 |
ttcatttatatttcccatgacatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataaaatctatttctcacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9417883 - 9417652
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100 |
Q |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
9417783 |
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9417684 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
9417683 |
atctctttcccacacaaaattaattacatttc |
9417652 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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Q |
| |
|
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
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| T |
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attatatccttcactatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
19866357 |
atctctttcccacacaaaattaattacatttc |
19866326 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 31502809 - 31503040
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Q |
| |
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T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
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attataaccttagctatttattactctcttttctttcaattctttaatttatctttcccatgttatttgttaaggacaattttgtaaaacaacttataat |
31503008 |
T |
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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atctcttttctacacaatattaattgcatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #73
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Query Start/End: Original strand, 5 - 231
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| |
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|
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tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
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tatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttctcatatcatttattgaggacaatttcgtaaaacaactcatgatatct |
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T |
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cttccccacacaatattaattacattt |
231 |
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cttttccacacaatattaattacattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 18975981 - 18976170
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|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 224
Target Start/End: Original strand, 29409368 - 29409550
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29409368 |
tttgttccaaattatacgtcgctttacaatacaaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattgctctctcttctttcaatt |
29409467 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaat |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29409468 |
ccttcatttatctttctcatataatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttccacacaatattaat |
29409550 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 35497698 - 35497888
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35497698 |
tttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatctttaaccatttattactctctcttctatcaatt |
35497797 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35497798 |
ccttcatttatcttttctatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttccaacacaatattaattacatttc |
35497888 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 41877742 - 41877932
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41877742 |
tttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaactatttattattatctcttctttcaatt |
41877841 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
41877842 |
ctttcatttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaatattaaatgcatttc |
41877932 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38510148 - 38509959
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
38510148 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaataaaagattaatgttacttttcctattatattcttaacaatttattacactctcttctttcaattc |
38510049 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38510048 |
cttcatttatcttttccatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcacaatatctctttcccacataatattaattatatttc |
38509959 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42584614 - 42584389
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
42584614 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaaattgtcctaaattatatgtcgcttaacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcc |
42584515 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42584514 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattctttaatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacatctcataa |
42584415 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
42584414 |
tatcttttttccacacaatattaatt |
42584389 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45823239 - 45823009
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
45823239 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattacttttcct |
45823140 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt-tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
45823139 |
attatatccttaactatttatta--ctctcttctttcaattctttcattgtatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
45823042 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||| | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45823041 |
tatctctttcttacacaatattaattatatttc |
45823009 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 3225483 - 3225667
Alignment:
| Q |
48 |
ccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3225483 |
ccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatatattactcttttttctttcaattccttca |
3225582 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3225583 |
tttatctttctcatgtcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
3225667 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 6882841 - 6883072
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttt-cc |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |
|
|
| T |
6882841 |
actccctccgtcccaaattgtatatcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgtcattttttcc |
6882940 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
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|
| T |
6882941 |
tattatatccttaactatttattattctctcttctttcaattcattcatttatctttctcatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataa |
6883040 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
| ||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6883041 |
tatcttttttccacacaatattaattacattt |
6883072 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 10316592 - 10316784
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10316592 |
ttgtcccaaattatatttcgttttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattt |
10316691 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccata----caatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10316692 |
tttcatttatctttcccctattatttatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccgcacaagattaattacattt |
10316784 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29410366 - 29410135
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29410366 |
actccttccgtcccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcattttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcca |
29410267 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29410266 |
attataaccttaactatttattattatctcttctttcaattctttcatttatcttacccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
29410167 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29410166 |
atcttttttccacacaatattaattgcatttc |
29410135 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 42121943 - 42122134
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
42121943 |
tttgtctcaaattatatgtcactttacaataccaatgaaacattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactttttcttctttcaatt |
42122042 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacac-aatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42122043 |
ctttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaatagctcataatatctcttttccacacaaatattaattacatttc |
42122134 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 22624356 - 22624546
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| || ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||| |
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|
| T |
22624356 |
tttgtcctaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactcttttctttttcaatt |
22624455 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22624456 |
ctttcatttatctttcccatatcatttaataaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
22624546 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47578919 - 47578729
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || |
|
|
| T |
47578919 |
tttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctattttctttcattt |
47578820 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47578819 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttataaaacaactcataatatatttttcccacacaatattaattacatttc |
47578729 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2850008 - 2849822
Alignment:
| Q |
44 |
tgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattat |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
2850008 |
tgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataatcttaattatttattactctct--tctttcaattct |
2849911 |
T |
|
| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2849910 |
tttatttatctttcctatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
2849822 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 9818132 - 9818321
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
9818132 |
ttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcttattatatccttaagtatttattactctatcttctttcacttc |
9818231 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9818232 |
cttcatttatctttctcatatcatttattaaagacaattttgtaaaataactcataatatctatttcccacacaatatcaattacatttc |
9818321 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 10720057 - 10720246
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43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| || |
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|
| T |
10720057 |
ttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcttattatatccttaagtatttattactctatcttctttcacttc |
10720156 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10720157 |
cttcatttatctttctcatatcatttattaaagacaattttgtaaaataactcataatatctatttcccacacaatatcaattacatttc |
10720246 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28472306 - 28472118
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |
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|
| T |
28472306 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatac-aatgaaacattaatgttacttttcctattacatccttaactatttattactctttcttcttttaattc |
28472208 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
28472207 |
tttcatttatatttcccatgacatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataaaatctattttccacacaatattaattacatttc |
28472118 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10453188 - 10452960
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
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10453188 |
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10453090 |
T |
|
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
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10452992 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||| || || ||||||||||||||||||||| |
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| T |
10452991 |
atctttttcctacacaatattaattacatttc |
10452960 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
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Target Start/End: Original strand, 28586936 - 28587166
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1 |
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
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| T |
28587036 |
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28587134 |
T |
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201 |
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232 |
Q |
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| T |
28587135 |
atctattttctacacaatattaattgcatttc |
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T |
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Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
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Target Start/End: Complemental strand, 584614 - 584432
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142 |
Q |
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| T |
584614 |
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584515 |
T |
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| Q |
143 |
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225 |
Q |
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| T |
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tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatctcttatccacacaatattaatt |
584432 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #95
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Target Start/End: Complemental strand, 24302826 - 24302640
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145 |
Q |
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| T |
24302826 |
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24302727 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
24302726 |
catttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgcatttc |
24302640 |
T |
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Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39403935 - 39403749
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| Q |
46 |
tcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattt |
145 |
Q |
| |
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| T |
39403935 |
tcccaaattgtatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttt |
39403836 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
39403835 |
tatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcgcacaatattaattacatttc |
39403749 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45780930 - 45780711
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100 |
Q |
| |
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| T |
45780930 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacgataccaatgaaaaattaatgttacttttcct |
45780831 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
45780830 |
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T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47834391 - 47834201
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| Q |
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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| T |
47834391 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactttctcttatttcaatt |
47834292 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
47834291 |
ccttcatttttctttcccatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaatatcaattacatttc |
47834201 |
T |
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Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27119066 - 27118897
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ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
162 |
Q |
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| T |
27119066 |
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27118967 |
T |
|
| Q |
163 |
caatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
27118966 |
tcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaatattaattatatttc |
27118897 |
T |
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Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32267767 - 32267578
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ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
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| T |
32267767 |
ttgtctcaaattatacgtcattttaaaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaattatttattactctatcttctttcaattc |
32267668 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
| T |
32267667 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
32267578 |
T |
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Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
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Target Start/End: Complemental strand, 5114097 - 5113912
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144 |
Q |
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5114097 |
gtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattattccctcttctttcaattctt |
5113998 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||| |||||| |||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| |
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|
| T |
5113997 |
tcattcatctttcgcatatca--tagtaagggtaattttgcaaaacaactcataatatctctttcccacaaaaaattaattacatttc |
5113912 |
T |
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Target: chr7; HSP #102
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Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25547944 - 25547760
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147 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |
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| T |
25547944 |
ccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaagttaatattacttttcatattatatccttaactatttattactctctcttctatcagttccttcg |
25547845 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||||||||||||| |
|
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| T |
25547844 |
tttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatatttttcccacataatattaattacatttc |
25547760 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10439437 - 10439250
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141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
10439437 |
tttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttactttttctattatatccttaaccatttgttactctct--tctttcaatt |
10439341 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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| T |
10439340 |
ccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcctacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
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149 |
Q |
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aaattatatgtcgctttacaataccagtgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttatttcaattatttcatt |
16875795 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttc-tcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
16875794 |
tatttttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
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100 |
Q |
| |
|
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| T |
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actccctccgtcctaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttaaaatatcaaggcaatattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
41887751 |
attataactttaattatttattactctct--tctttcaattctttcatttatatttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaatttataat |
41887654 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
41887653 |
atctcttttccacacaatattaattacattt |
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| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |
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|
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actccctccgtcccaaattgtaggtcgctttaggagaaaaaatttgtcctaaattatatgtcactttacaatacccatgcaacattaatgttacttttcc |
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T |
|
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tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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aattataactttaattaattattactccctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
47988286 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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| ||| || |||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
47988285 |
tatctattttccacacaatattaattgcattt |
47988254 |
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Target: chr7; HSP #107
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Q |
| |
|
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| T |
32328080 |
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32327981 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
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tttcatttatttttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaatt |
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T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #108
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| |
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|
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143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
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42912349 |
ttccatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaaaaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
42912260 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43074012 - 43073796
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Q |
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| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgttgctttaggggaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcc |
43073913 |
T |
|
| Q |
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tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
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| T |
43073912 |
tattataaccttaactatttattaccctctcttct---------ttcatttatctttctcatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
43073822 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
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| ||| || |||||||||||||||| |
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43073821 |
tatctattttccacacaatattaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #110
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Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Original strand, 3945175 - 3945363
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| Q |
44 |
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143 |
Q |
| |
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| T |
3945175 |
tgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttattttttctattataaccttaactatttattactatcttttctttcaattct |
3945274 |
T |
|
| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||| |
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|
| T |
3945275 |
ttcatttatctttctcatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccatacaatattaattgcatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39983498 - 39983311
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| Q |
45 |
gtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatt |
144 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| || |
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| T |
39983498 |
gtcccaaattatatgtcgctttaaaatactaatacaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctatcttctttcaattctt |
39983399 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
39983398 |
tcatttatatttctcatattatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatatcttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26913831 - 26913651
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| Q |
42 |
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137 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |
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tttgtcccaaattatatgtcgctttgcaatatataccaataaaatattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctct--tctttc |
26913734 |
T |
|
| Q |
138 |
aattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatat |
220 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26913733 |
aattccttcatttatctttctcatatcatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatat |
26913651 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 44452188 - 44452409
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| Q |
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99 |
Q |
| |
|
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|
| T |
44452188 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaatttttttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatg-----------ttacttttcc |
44452276 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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| T |
44452277 |
tattataaccttagttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
44452376 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| || ||||||||| |||||| |
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| T |
44452377 |
tatctcttttccatacgatattaattgcatttc |
44452409 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 2887296 - 2887485
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
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| T |
2887296 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttaaaatatcaatgcaacattgatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattc |
2887395 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||||||| || || |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2887396 |
tttcatttatctttcccgtattatttattaaggacaaatttgtaaaacgacttataatatctcttttccatacaatattaattgcatttc |
2887485 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 208
Target Start/End: Original strand, 8670413 - 8670578
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
8670413 |
ttgtctcaaattatacgtcgctttacaatacaaataaaatattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactatctcttctttcaattc |
8670512 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttc |
208 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8670513 |
cttcatttatttttccgatataattttttaaggacaattttgtaaaaaaaatcataatatctcttc |
8670578 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22707002 - 22706813
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||| ||| | |
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|
| T |
22707002 |
ttgtgccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttatttttcctattatatccttcactatttattgccttctctacttccaagtc |
22706903 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22706902 |
attcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaaaattaattacatttc |
22706813 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 22918174 - 22918394
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
22918174 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttataataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
22918273 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22918274 |
attataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttctcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataat |
22918362 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22918363 |
atttcttttccacacaatattaattacatttc |
22918394 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35421895 - 35421734
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35421895 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcct |
35421796 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35421795 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatcttttccata |
35421734 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10657263 - 10657033
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10657263 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagcgaaatttttttgtcttaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcc |
10657164 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgt-aaaacaactcata |
198 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |
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| T |
10657163 |
tattataaccttaactatttattactccctcttctttcaattatttcatttatttttcccat---attatttaaggataattttgtaaaaataactcata |
10657067 |
T |
|
| Q |
199 |
atttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| | |||| |||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10657066 |
atatatcttttccacgtaatattaattgcatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11910712 - 11910484
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| Q |
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11910712 |
actccccccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgccgttttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcct |
11910613 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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| T |
11910612 |
attatatccttaactatttatt--gttctcttctttcaattccttcatttatttttcccatatcatatattgaagacaattttgtaaaacaactcaaaat |
11910515 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11910514 |
atctctttcccacacaatattaattatattt |
11910484 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 45042017 - 45042206
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| Q |
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142 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | ||||| ||| ||| | |
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|
| T |
45042017 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttagaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatcattcactatttattgccttctctacttccaagtc |
45042116 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
45042117 |
attcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctatttcccacacaaaattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
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Target Start/End: Complemental strand, 5680441 - 5680262
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141 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
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|
| T |
5680441 |
tttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
5680342 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5680341 |
tttttatttatcttttccat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatcccttttccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #123
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
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| T |
5705493 |
tttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
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T |
|
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142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
5705393 |
tttttatttatcttttccat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatcccttttccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
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163 |
Q |
| |
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| T |
9603876 |
tttacgatatcaatgaaacattaattttactttttttattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatat |
9603777 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
9603776 |
tatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattatatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9831447 - 9831279
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Q |
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| T |
9831447 |
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9831348 |
T |
|
| Q |
164 |
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232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
9831347 |
tatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattatatttc |
9831279 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #126
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 39938597 - 39938820
Alignment:
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99 |
Q |
| |
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39938597 |
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39938696 |
T |
|
| Q |
100 |
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199 |
Q |
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| T |
39938697 |
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39938787 |
T |
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| Q |
200 |
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232 |
Q |
| |
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| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |
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| T |
39938788 |
tatctcttttccatacaatattaattgcatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #127
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Query Start/End: Original strand, 69 - 232
Target Start/End: Original strand, 3264413 - 3264575
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69 |
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168 |
Q |
| |
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| T |
3264413 |
aataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatc-ttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcaaatcattt |
3264511 |
T |
|
| Q |
169 |
attaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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| T |
3264512 |
attaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacgcaatattaattatatttc |
3264575 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 19293045 - 19293278
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99 |
Q |
| |
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19293045 |
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19293144 |
T |
|
| Q |
100 |
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198 |
Q |
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| T |
19293145 |
ttattatatccttaactatttactactttctcttcttccaagtcattcatttatctttctcatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaattcata |
19293244 |
T |
|
| Q |
199 |
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232 |
Q |
| |
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|| | ||| ||||||||| |||||||||||||| |
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| T |
19293245 |
atattcctttcccacacaaaattaattacatttc |
19293278 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19785801 - 19785628
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63 |
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158 |
Q |
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| T |
19785801 |
ctttagaataccaatgaaacattaatattatttttcctattatatccttaactatttattactttttttttttcttttcaattctttcaattatctttcc |
19785702 |
T |
|
| Q |
159 |
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232 |
Q |
| |
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| T |
19785701 |
catatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattatatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 13439318 - 13439469
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100 |
Q |
| |
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| T |
13439318 |
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13439417 |
T |
|
| Q |
101 |
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152 |
Q |
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| T |
13439418 |
attatatccttaattatttattactatctcttctttcaattccttcatttat |
13439469 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28537041 - 28536886
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
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| T |
28537041 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcct |
28536942 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttt |
156 |
Q |
| |
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| T |
28536941 |
attatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatcttt |
28536886 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27131549 - 27131367
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| Q |
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149 |
Q |
| |
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| T |
27131549 |
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27131450 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
27131449 |
tatctttctcatactatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaaaattaattatatttc |
27131367 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 40020344 - 40020533
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
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| T |
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T |
|
| Q |
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232 |
Q |
| |
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| T |
40020444 |
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40020533 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26941420 - 26941263
Alignment:
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142 |
Q |
| |
|
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| T |
26941420 |
ttgtccaaaattatacgtcgctttacactatcaataaaacattaattttacttttcctattatatctttaactatttattactttatcttctttcaatta |
26941321 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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||| ||||||||||| | || |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26941320 |
tttaatttatcttttacttatcatttattaaggacaactttgtaaaacaacttataat |
26941263 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 232
Target Start/End: Original strand, 32777853 - 32778038
Alignment:
| Q |
47 |
cccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttc |
146 |
Q |
| |
|
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| T |
32777853 |
cccaaattataagtcgctttacaactccaatgaagcactaatgctatttttcttattatatccttaactaattaatactctctctactttcaattcttta |
32777952 |
T |
|
| Q |
147 |
atttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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|
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| T |
32777953 |
atttatccttcccataccatttatgatggacgattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacataattaattacatttc |
32778038 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42149830 - 42149654
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| Q |
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142 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
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| T |
42149830 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaatagcaatgcaacattaatgctacttttcctat-------------atttattactctctcttctttcaattc |
42149744 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
42149743 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
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143 |
Q |
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| T |
39003937 |
gtcccaaattataagccgttttacaataccaatgaaacttaaataatacttttcctattatacccttaactattttattactttctcttatttcaattct |
39004036 |
T |
|
| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
39004037 |
ttaatttatctttcccataccatttattaaagacaattttgtaaaacaagtcatagtatct-tttcccatacaaaattaattacatttc |
39004124 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
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141 |
Q |
| |
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| T |
46578657 |
tttgtcccaa-ttatatgtcgcattacaatactcatgcaacattaatgttactttttcaattataaccttaattaattattactccttcttctttcaatt |
46578755 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
46578756 |
ctttcatttatctttcccata-tatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
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43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta---tatccttaactattaattactctctcttctttcaa |
139 |
Q |
| |
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| T |
21849887 |
ttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactatttctattagtataaccttaactatttattactatctcttctatcaa |
21849788 |
T |
|
| Q |
140 |
ttatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||| |||||| |
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|
| T |
21849787 |
tactttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaattttaattgcatttc |
21849695 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31582215 - 31582029
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145 |
Q |
| |
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| T |
31582215 |
tcccaaattgtatgtcgttttacaatatcaatgaatcattaatgttacttttcttattatatccttcactatttattgccttctctactcccaaatcatt |
31582116 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31582115 |
catttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaaaattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #141
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49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttcttt----caattatt |
144 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | | || ||| ||||| | |
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|
| T |
37411120 |
caaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattgtttttttttttttttttcaattcat |
37411219 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37411220 |
tcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcgtctccacacaatattaattgcatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #142
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Target Start/End: Complemental strand, 24924452 - 24924297
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |
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| T |
24924452 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaatttgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttattttttct |
24924353 |
T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttt |
156 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24924352 |
attatatccttaactatttattactttctcttctttcaattccttcatttatcttt |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #143
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43 |
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142 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
46342777 |
ttgtcacaaattataagtcgctttacaataccattgaaacagtaatgttactttttctattataaccttgactatttattgttctattttctttcaattc |
46342876 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaa |
192 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
46342877 |
tttaatttatcttttccacaacatttattaaggacaattttttaaaacaa |
46342926 |
T |
|
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Target: chr7; HSP #144
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24729732 |
ttgtcccaacttatatgttgttttacaataccagtgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctctcttctttcaatt |
24729634 |
T |
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Target: chr7; HSP #145
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94 |
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192 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
46944677 |
ttttcctattatatctttaactatttattactcattctttttttcaattctttcatttatatttcccatatcatttattaaggacaattttataaaacaa |
46944578 |
T |
|
| Q |
193 |
ctcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
46944577 |
ctcataatatctctttcccacacaatattaattatattt |
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T |
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47 |
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146 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
42259173 |
cccaaattacatgtcgttttataatatcaatgaaatattaat-ttatttttcttattatatctttaactatttattacttcttcttctttcaattctttc |
42259271 |
T |
|
| Q |
147 |
atttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| || || ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42259272 |
ttttatctttctcgtatcatttattaaggacaattttgtaaaacgacttataatatctgtttcctacacaatattaattaaatttc |
42259357 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #147
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68 |
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167 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||| || | |||| |
|
|
| T |
6202914 |
caataccaatgaaatatgaatgttacttttcttattatatctttaactatttattactttattttctttcaattctttcgtttatctttttcacataatt |
6203013 |
T |
|
| Q |
168 |
tattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6203014 |
tattaaggacacttttttaaagcaactcataat |
6203046 |
T |
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Target: chr7; HSP #148
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42 |
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141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30440635 |
tttgtcacaaattatatgttgctttacaatactaatgcaatattaatgttattttttcttttataccattaactatttattattctctcttctttcaatt |
30440536 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
30440535 |
ctttcattta---ttctcatgttatttattatggacaattttgtaaaacaactcgtaatatctcttttccatgcaatattaattgcatttc |
30440448 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #149
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Target Start/End: Original strand, 8251700 - 8251877
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50 |
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149 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| ||| ||| |
|
|
| T |
8251700 |
aaattataagtcactttacaatagcaataaaatat-aatgttacttttactattac--ccttagctatttat-actctctcctctttcgattctttaatt |
8251795 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
8251796 |
tactttttccataccatttgttaaggataattttgtaaaacaactcataatatctccgtcccatacaaaattaattatattt |
8251877 |
T |
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Target: chr7; HSP #150
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| Q |
43 |
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137 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39961122 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaatacttatgcaacattaatgttttttttttttttctattataaccttaactatttattactctctcttctttt |
39961023 |
T |
|
| Q |
138 |
aattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39961022 |
aattcttt-atttatctttctcatattatttattaagaataattttgtaaaacatctcataatatcttttttccacgcaatattaattatatttc |
39960929 |
T |
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Target: chr7; HSP #151
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| Q |
68 |
caataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatt |
167 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6186519 |
caataccaatgaagtatgagtgttacttttcttattatatctttaactatttattacattattttctttcaattttttcatttatctttttcacatgatt |
6186618 |
T |
|
| Q |
168 |
tattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6186619 |
tattaaggacaattttttaaaacaactcataat |
6186651 |
T |
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Target: chr7; HSP #152
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| Q |
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caataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatt |
167 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||| || | ||| |
|
|
| T |
6193035 |
caataccaatgaagtatgagtgttacttttcttattatatctttaactatttattacattattttctttcaattttttcatttatctttttcacatgatt |
6193134 |
T |
|
| Q |
168 |
tattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6193135 |
tattaaggacaattttttaaaacaactcataat |
6193167 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #153
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142 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | |||||| | |||||| | ||||||||| ||||| || | ||||||||| | |
|
|
| T |
7170702 |
ttgttccaaattataagtcgtattacaatatccatgaaatattaatatcactttttcaattatacctttaactatttattaccctatattctttcaactc |
7170801 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| || ||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
7170802 |
tttaatatatctttctcataccatttattaatgacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccatacaaaattaattatattt |
7170890 |
T |
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Target: chr7; HSP #154
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| Q |
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141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42520123 |
caaattataagtcgctttacaatatcattgaaacattaatgttacttttcctataatacccttaactatttattactctttcttctttcaatt |
42520215 |
T |
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167 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
22603880 |
aatgaaatattaatgttactttttttattatatctttgactatttgttagttattactctcttttctttcagttttttcatttatcttttccatatcact |
22603979 |
T |
|
| Q |
168 |
tattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22603980 |
tattaaggataattttataaaacaactcataatacatatttcccccacaaaattaattacatttc |
22604044 |
T |
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Target: chr7; HSP #156
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tatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
4089644 |
tatattcttaactatttattactatctcttcattcaattcttttatttttctttttcatactatttattaacgataattttgcaaaacaactcataatat |
4089743 |
T |
|
| Q |
203 |
ctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| || ||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4089744 |
cttttttccatacaaaattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #157
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143 |
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| |
|
|||||||||| || |||||||| | || | |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | || ||| ||| || |
|
|
| T |
27045097 |
gtcccaaattgtatatcgctttatactatcgatgaaacattaattttacttttaatattatatccttagctatttattactctattttttttttattcat |
27045196 |
T |
|
| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27045197 |
ttattttatctttctcgtatcatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatcgctttcccacacaatattaattatatttc |
27045285 |
T |
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Target: chr7; HSP #158
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142 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8566000 |
ttgtcctaaattatatgtcgttttacaatatcaatgcataattaatgttattttttctattataattttagccgtttattactctct--tctttcaattc |
8565903 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
8565902 |
tttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactaataatatatcttttctacacaatattaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #159
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttc |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
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41820904 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #160
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aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
24166844 |
aaattaaaagtcactttacaataccaatgcaacattaatgttacttttctcattctaatcttaactatttattattctctcttctttcaattctttcatt |
24166745 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||||| |||| || | |||| | |||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24166744 |
tgtctttctcatatttttcactaagaacaattttgtaaaataacttataatatcttgttttcacacaatattaattgcatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #161
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caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactc-tctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | || |||||||| ||| | |
|
|
| T |
12848251 |
caaattatatgtcaatttacaatatcaataaaacattaatattatttttcctattatatctctaactatttattactctttttttttttcaattctttaa |
12848350 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12848351 |
tttatctttctcataccatttgttaatgataattttgtaaaacaattcataat |
12848403 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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caatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaa |
173 |
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| |
|
||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| |
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|
| T |
18517184 |
caatgaagtattaatgttaatttttctattatatcattaattatttattactttatcttctttgaattctttcatttatcgttttcatatcgtttattaa |
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T |
|
| Q |
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ggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||||| ||||| |
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| T |
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ggacaattttataaaacaactcacaattt |
18517312 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Original strand, 21443132 - 21443263
Alignment:
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
21443132 |
tattatatccttaactatttattactttatcttatttcaattctttaatttatctttctcgtatcatttattaaagataattttgtaaaactacttataa |
21443231 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21443232 |
catctctttcccatacaaaattaattacattt |
21443263 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #164
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Query Start/End: Original strand, 127 - 231
Target Start/End: Original strand, 17230809 - 17230913
Alignment:
| Q |
127 |
tctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || | |||||| |||||||| |
|
|
| T |
17230809 |
tctcttctttcaattttttaatttatttttcccatacaatttagtaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctttttcgaacacaaaattaatta |
17230908 |
T |
|
| Q |
227 |
cattt |
231 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
17230909 |
cattt |
17230913 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22369075 - 22368987
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| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22369075 |
ttcatttatttttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatttctttcccacacaatattaattacatttc |
22368987 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
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Target Start/End: Original strand, 42521416 - 42521520
Alignment:
| Q |
85 |
taatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttg |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| | || | ||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
42521416 |
taatgttacttttcctataatacccttaactatttattactctttcttctttcaattctttaatttatttttcctatgccattaatgaaggataattttg |
42521515 |
T |
|
| Q |
185 |
taaaa |
189 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
42521516 |
taaaa |
42521520 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24923492 - 24923425
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| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24923492 |
atttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
24923425 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25651110 - 25651007
Alignment:
| Q |
129 |
tcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25651110 |
tcttcttttaattctttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatcttttttctacacaatattaattaca |
25651011 |
T |
|
| Q |
229 |
tttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
25651010 |
tttc |
25651007 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28536748 - 28536681
Alignment:
| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28536748 |
atttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
28536681 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
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Target Start/End: Complemental strand, 25651267 - 25651149
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| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25651267 |
actccctccgtcctaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttgcaataccaatgaaacattaattttacttttcct |
25651168 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactatta |
119 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25651167 |
attatatctttaactatta |
25651149 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 232
Target Start/End: Original strand, 13446134 - 13446199
Alignment:
| Q |
167 |
ttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13446134 |
ttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
13446199 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Original strand, 20250202 - 20250386
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaa-tgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
20250202 |
ttgtctcaaattatgagtcgttttacaatacaaatgaagcattaaatcctactttttctactatatcctcaactatttattactaccacttctttcaatt |
20250301 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttc-catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| | || |||| |||||||| |
|
|
| T |
20250302 |
-tttaatttatcttttcacatatcattaatgaaggataattttgtaaaattacttagaatttctctttcgcagacaacattaatta |
20250386 |
T |
|
Back To:
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Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
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Target Start/End: Complemental strand, 40011405 - 40011255
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttc-aatt |
141 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
40011405 |
ttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccattgaagtattaatgtaactttttctattatatctttaaatatttatta--ctatcttctttcaaatt |
40011308 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaact |
194 |
Q |
| |
|
||| |||| || || | ||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
40011307 |
ctttaatttgtcattctcgtaccatttattaaggacaattttctaaaacaact |
40011255 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48841251 - 48841080
Alignment:
| Q |
64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaa---ttactctctcttctttcaattatttcatttatcttttcca |
160 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| | || |||||||| ||| |||||||||| || |
|
|
| T |
48841251 |
tttacaatatcaatgaagcattaatgttaattttcttattatatccttaattatttagtattactctatattatttcaattctttaatttatctttcaca |
48841152 |
T |
|
| Q |
161 |
tacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| | |||| | | || |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
48841151 |
taccatttattagggacaatttaaaaaaacaactcatagtatctcattctcatacaaaattaattacatttc |
48841080 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 192
Target Start/End: Original strand, 44526404 - 44526512
Alignment:
| Q |
84 |
ttaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataatttt |
183 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
44526404 |
ttaatattactttttctattatatacttaattatttattactttcttttttttcaattatttaatttatcttttcaatatcatttaataaggatggtttt |
44526503 |
T |
|
| Q |
184 |
gtaaaacaa |
192 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
44526504 |
gtaaaacaa |
44526512 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
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Target Start/End: Complemental strand, 7560471 - 7560327
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| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc-- |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
7560471 |
actccctccgtcctaaattataggtcgctttagaatataaatttgttccaaattataagtcgttttacaataccaatgaaattttaatgttacttttcaa |
7560372 |
T |
|
| Q |
99 |
------ctattatatccttaactattaattactctctcttctttc |
137 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7560371 |
cattaactattataccattaactatttattattctctcttctttc |
7560327 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #177
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Query Start/End: Original strand, 121 - 232
Target Start/End: Original strand, 9140693 - 9140804
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| Q |
121 |
ttactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatat |
220 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
9140693 |
ttactctctcttcttccaattccttcatttatctttctaatttcatttattaaggacaattttataaaacaaatcataatatctctttaccacataatat |
9140792 |
T |
|
| Q |
221 |
taattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
9140793 |
taattacatttc |
9140804 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
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Target Start/End: Original strand, 12804424 - 12804603
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
12804424 |
tttgtcctaaattatatgtcactttacaatactcatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaattatttattactccatcttctttcattt |
12804523 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| || ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12804524 |
attt---------ttcccatattatttattaaggacagttttgtaaaacagctcataatatctattttc--cacaatattaatttcatttc |
12804603 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #179
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Target Start/End: Complemental strand, 21747002 - 21746836
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| Q |
64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || | || |||||||| | |||||||||| | |||| |
|
|
| T |
21747002 |
tttacaataccaatgaatcattaatgctacttttcttattatacttttaactatttattac-cttttttatttcaatttgataatttatctttcctatac |
21746904 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21746903 |
cattaattaaagacaattttgtaaaataactcataatatcttttttccatacaaaattaattacattt |
21746836 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 206
Target Start/End: Original strand, 29478314 - 29478448
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| Q |
72 |
accaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca-tttatcttttccatacaatttat |
170 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||| |
|
|
| T |
29478314 |
accaataaaatattaatgttaatttac-tattataccattaactatttattactcttttttctttcaattattttaatttagctttctaataacatttat |
29478412 |
T |
|
| Q |
171 |
taaggataattttgtaaaacaactcataatttctct |
206 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29478413 |
taaagaaaattttgtaaaacaactcataatatctct |
29478448 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
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| Q |
110 |
ttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27299737 |
ttaactatgtattactctctcttcttttaattatttaatttatctttctcgtaccatttattaaagacacttttgtaaaacaactcataat |
27299827 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
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| Q |
94 |
ttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaac |
193 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
28696295 |
tttttctattatattattaactatttattactttcttctttttcaattatttaatttatctttctgataccatttcttaaggacaattttgtaaaacaac |
28696196 |
T |
|
| Q |
194 |
tcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
28696195 |
tcataat |
28696189 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #183
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| Q |
99 |
ctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcata |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| || | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
553872 |
ctattatactcttaactatttattactctatcatcttttaaatctttaatttagcttttccatgtcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcata |
553971 |
T |
|
| Q |
199 |
at |
200 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
553972 |
at |
553973 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
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Target Start/End: Original strand, 4089299 - 4089360
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43 |
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Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4089299 |
ttgtcccaaattatatgtagctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatta |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #185
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Target Start/End: Original strand, 10543854 - 10543977
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67 |
acaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaat |
166 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| || ||| ||||||| || ||||| || |
|
|
| T |
10543854 |
acaatatcaatgaagtattaatgttatatttt-tattatatctttaattatttattactctttcttctttcatttttttaatttatcattctcataccat |
10543952 |
T |
|
| Q |
167 |
ttattaaggataattttgtaaaaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
10543953 |
ttattaagaacaattttgtaaaaca |
10543977 |
T |
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| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
39693923 |
atttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcacacaatattaattgcatttc |
39693856 |
T |
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tctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
3340757 |
tctcttatttaaattatttaatttatctttcacataccatttattaagaacaattttgtaaaacaatacataatatctctttcccatacaa-attaatta |
3340659 |
T |
|
| Q |
227 |
catttc |
232 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
3340658 |
tatttc |
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T |
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9140636 |
ttgtcccaaattatatgtcattttacaataccaataaaatattaatgttacttttcct |
9140693 |
T |
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taccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttat |
170 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||| |||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
17288784 |
taccaataaaatattaatgttgttttttctagtatatcttcaactatttattactcttt--tctttcaattttttaatttatatttcttatataatttat |
17288687 |
T |
|
| Q |
171 |
taaggataattttgtaaaacaactcataatttc |
203 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||| | |||||| |
|
|
| T |
17288686 |
taagtataattttgtaagacaactgacaatttc |
17288654 |
T |
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aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcct |
110 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10200539 |
aaattatatgttgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcct |
10200479 |
T |
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43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| | ||| || |||||||||| |||| | ||||||||| | || |
|
|
| T |
21106227 |
ttgtctcaaatcataagtcgttttataatatcaatgaaacattgatgttactttttcaattgtactcttaactatttattagacactcttcttttagttc |
21106128 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatct---tttccatacaatttattaagg--ataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
||| |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21106127 |
tttaatttatctacccatacatacaatttattaaggacatttttttgtaaaacaactcataatatctctt |
21106058 |
T |
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aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
23824406 |
aaattatacgccgctttacaatactaataaaatattaatggta-tttttctattatatttttaactatttattact-ttttttcttt-aattctttcatt |
23824502 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcata |
198 |
Q |
| |
|
||| ||| |||| |||||||||||| ||| | |||||| |||||||| |
|
|
| T |
23824503 |
tatatttctcatatcatttattaaggacaatatcgtaaaataactcata |
23824551 |
T |
|
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| Q |
47 |
cccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactat----taattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| ||| |||| | |||||||| | |||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33746110 |
cccaaattataagtagttttacaataccagtgaaacattcatgttaatttttctagtatacctttaactatttaattattattctatcttctttcaatta |
33746209 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttt |
156 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |
|
|
| T |
33746210 |
tttaatttatcttt |
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T |
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| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
31542488 |
atttattaaggaaaattttataaaacaattcataatatctctttcccacacaaaattaattatatttc |
31542555 |
T |
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| Q |
110 |
ttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcc |
209 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| || ||||||||||||| | ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| | |
|
|
| T |
35432308 |
ttaattatttattactctatcgactttcaattatttaaattaattttttcataccatctattaaggataattttgtaaaacaaattataatatctctttc |
35432407 |
T |
|
| Q |
210 |
ccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |
|
|
| T |
35432408 |
acatacaaaattaatt |
35432423 |
T |
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ccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| | |||| || |||| | |||| |||| |||| || |||||||| ||| ||| | |
|
|
| T |
3231617 |
ccaaattataaatcgttttacaatatcaataaaacattaatgttgcatttcataatataacgttaagtatttatta---tcccttctttccattttttaa |
3231521 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
3231520 |
tttatcattatcataccatttattatggacaattttataaaacaacttataa |
3231469 |
T |
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136 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| | |||||| |
|
|
| T |
9658626 |
ttgtcccaaattatatgtggctttacaatactaatgaaaacttattgttactttttgtattatatgtttaaatatttattactctattttcttt |
9658719 |
T |
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| Q |
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tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
163 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||| || | ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
14314632 |
tttacaatatcaatgaaatattaatgttattttttctattatactcataactatttatga--ctcccttctttcaattctttaatttattttttctataa |
14314729 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaa |
192 |
Q |
| |
|
|||| |||| | |||||| |||||||| |
|
|
| T |
14314730 |
tattttttaatgtcaattttttaaaacaa |
14314758 |
T |
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tatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| || |||||||||||| ||||| ||| | ||||| |
|
|
| T |
20268663 |
tatatcctcaactatttattactcccacttctttcaattttttaatttatctttcacatatcattaataaaggataattttataaaattacttagaattt |
20268762 |
T |
|
| Q |
203 |
ctctt |
207 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
20268763 |
ctctt |
20268767 |
T |
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140 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
23070131 |
tttgtcacaaattataaatcgttttacaataccaactaaacattaaatatcacttttcctattata--ctaaacaatttattgttctct--tcttttaat |
23070036 |
T |
|
| Q |
141 |
tatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
23070035 |
tctttaatttatcttttttataccattaatgaaagataattttgtaaaataacttataatttttctt |
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T |
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tttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| | || |||||||||||||| |
|
|
| T |
40065543 |
tttcaattctttaatttatttttctcatactatttagtaaggacaattttgtaaaacaattcataatatctttttcccata-aaaattaattacatttc |
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T |
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Q |
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|
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41844418 |
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T |
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aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactct |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14200506 |
aaattataagtcattttataataacaataaaatattaatgttatttttcctattttacttttaactatttattactct |
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T |
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Q |
| |
|
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|
|
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Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| |||| |||||||||| || || | |
|
|
| T |
21553446 |
attaatgttattttttatattatatcattaattatttattattctct--tctttaaattatataatttatcgttttcatatcatttattaagaatgatat |
21553543 |
T |
|
| Q |
183 |
tgtaaaacaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
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tgtaaaacaa |
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Q |
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|
|
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ctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaagga |
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| |
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|||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
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| |
|
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|
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tgaaacattaatgttatttttttaattatatttttaactatttattattttttccttttttcaattctttaacttattttttcttataccatttagtaag |
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| Q |
175 |
gataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||| ||| ||| || | || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3783779 |
aacaattttataaaacaactcaaaatatctatttctcatacaatattaattacatttc |
3783836 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 200
Target Start/End: Original strand, 19495967 - 19496040
Alignment:
| Q |
127 |
tctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19495967 |
tctcttttttcaattctttattttatatttctcatacaatttaataaggacaattttctaaaacaacttataat |
19496040 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #210
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Query Start/End: Original strand, 69 - 157
Target Start/End: Original strand, 23186555 - 23186643
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| Q |
69 |
aataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctct-tctttcaattatttcatttatctttt |
157 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23186555 |
aatacccataaaatattaatgtttcttttccttttatacacttaactatttactactctctatctcttt-aattctttaatttatctttt |
23186643 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
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Target Start/End: Complemental strand, 27689278 - 27689207
Alignment:
| Q |
120 |
attactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaac |
193 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
27689278 |
attactttctcttctt-caattctttaatttatctttttcacacaatttattaaagacaa-tttgtaaaacaac |
27689207 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 152
Target Start/End: Original strand, 39199313 - 39199354
Alignment:
| Q |
111 |
taactattaattactctctcttctttcaattatttcatttat |
152 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39199313 |
taactatttattactctttcttctttcaattctttcatttat |
39199354 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 127
Target Start/End: Original strand, 8096508 - 8096576
Alignment:
| Q |
59 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactct |
127 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||| ||||| | || ||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8096508 |
gtcgcttgacaatatcaatgaagtattagttttgtttttcttattatagccctaactattaattactct |
8096576 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 106
Target Start/End: Original strand, 19488512 - 19488568
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattata |
106 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19488512 |
aaattatgagtcgcttcacagtatcaatgaagcattaatgttacatttcctattata |
19488568 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 236)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 56235150 - 56235381
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
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|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
56235249 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56235250 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
56235349 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56235350 |
ttcacttccccacacaatattaattacatttc |
56235381 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10125761 - 10125530
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10125761 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcct |
10125662 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10125661 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
10125562 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10125561 |
ttctcttccccacacaatattaattatatttc |
10125530 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 22100916 - 22101147
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22100916 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaatgttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcct |
22101015 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22101016 |
attatatccttaactattaattactatctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
22101115 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22101116 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
22101147 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37175450 - 37175219
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37175450 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcct |
37175351 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37175350 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
37175251 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37175250 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
37175219 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27851168 - 27851398
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27851168 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttatcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
27851267 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27851268 |
attatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
27851367 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27851368 |
ttcactttcccacacaatattaattacattt |
27851398 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Original strand, 13800334 - 13800562
Alignment:
| Q |
3 |
tccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctat |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13800334 |
tccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaatt-tatgtcgctttacgataccaatgaaatattaatgttacttttcctat |
13800432 |
T |
|
| Q |
103 |
tatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13800433 |
tatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
13800532 |
T |
|
| Q |
203 |
ctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13800533 |
ctcttccccacacaatattaattacatttc |
13800562 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 288345 - 288576
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
288345 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattattgttacttttcct |
288444 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
288445 |
attatatcattaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
288544 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
288545 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
288576 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 22842906 - 22843137
Alignment:
| Q |
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22842906 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcct |
22843005 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22843006 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
22843105 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22843106 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
22843137 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 56513735 - 56513504
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtccctttggaaaaaaaatttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56513635 |
attatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcgtttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
56513536 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56513535 |
ttcacttccccgcacaatattaattacatttc |
56513504 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22320529 - 22320760
Alignment:
| Q |
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnn-tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcc |
99 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22320529 |
actccctctgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcc |
22320628 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22320629 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaacaattcataa |
22320728 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22320729 |
tttctcttccccacacaatattaattacattt |
22320760 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
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Target Start/End: Original strand, 23138037 - 23138267
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
23138037 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcat |
23138135 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23138136 |
attatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
23138235 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23138236 |
ttctcttctccacacaatattaattacatttc |
23138267 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 16032291 - 16032522
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
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T |
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200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccctaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatgccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
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Q |
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ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr4; HSP #13
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Target Start/End: Original strand, 28002515 - 28002746
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T |
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200 |
Q |
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28002615 |
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28002714 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||||||||||| || ||||||||||||||| |
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ttctcttccccacgcagtattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 43050166 - 43050397
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Q |
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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ttctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 52183856 - 52184087
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
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| T |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||||||||||| |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38852876 - 38852686
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42 |
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141 |
Q |
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T |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 39417800 - 39418031
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Q |
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39418000 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
39418031 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 53690281 - 53690470
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|
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|
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T |
|
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
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Target Start/End: Original strand, 16605188 - 16605419
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T |
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| Q |
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200 |
Q |
| |
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T |
|
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ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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|
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25063890 - 25063659
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
| T |
25063790 |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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| T |
25063690 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 34002172 - 34002403
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| Q |
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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attatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
34002371 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34002372 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
34002403 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 55925662 - 55925889
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Q |
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|
|||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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attatatccttaactattaattactccttattctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
55925861 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
Q |
| |
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|
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55925862 |
ttctcttccccacacaatattaattaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29753195 - 29753005
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| |
|
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|
|
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T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
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|
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattatggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
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Q |
| |
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T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
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|
|
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atttcatttatcttttccatgctatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 43 - 232
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| |
|
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|
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T |
|
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
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|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 45 - 232
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| |
|
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gtcccaaattatatgtcgctttagaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattagtctctcttctttcaattatt |
30418848 |
T |
|
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145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
30418849 |
tcatttatcttttccataccatttattaaggataattttataaaacaactcataatttctcttccacccacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 30609280 - 30609462
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|
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|
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tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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1 |
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100 |
Q |
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54270770 |
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54270869 |
T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
54270870 |
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54270969 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
54270970 |
ttatcttccccacagaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41414305 - 41414115
Alignment:
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Q |
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ttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
|
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232 |
Q |
| |
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|
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tttcatttatctttttcataccatttattaaggataattttgtaaaataactcataatttctcttccccacacgaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 50098214 - 50098403
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43 |
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142 |
Q |
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ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
|
| Q |
143 |
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232 |
Q |
| |
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tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccctatgcaatattaataacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44622497 - 44622267
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100 |
Q |
| |
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actccctccgtcccaaattatatatcgctttggaacaaaaatttgtccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
44622398 |
T |
|
| Q |
101 |
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199 |
Q |
| |
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44622300 |
T |
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| Q |
200 |
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232 |
Q |
| |
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tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30649825 - 30649635
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| Q |
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141 |
Q |
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T |
|
| Q |
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232 |
Q |
| |
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| T |
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attttatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
30649635 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33245008 - 33244818
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| Q |
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141 |
Q |
| |
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|
| T |
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33244909 |
T |
|
| Q |
142 |
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232 |
Q |
| |
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| T |
33244908 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52397930 - 52397742
Alignment:
| Q |
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142 |
Q |
| |
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| T |
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ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttatttttcttattatatcattaactattaattactttctcttctttcaatta |
52397831 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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|
| T |
52397830 |
tttcatttatcattttcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacattt |
52397742 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 34447633 - 34447865
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100 |
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| |
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34447732 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccaca-caatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
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atctctttcccacaccaatattaattacatttc |
34447865 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 37787878 - 37788107
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Q |
| |
|
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T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaattattaattactct--cttctttcaattatttcatttatcctttccataccatttattagggataattttgtaaaataactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
37788076 |
ttctctttcccacacaatattaattatatttc |
37788107 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4294209 - 4293978
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Q |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
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attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacatctcataat |
4294010 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
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4294009 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
4293978 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 13880452 - 13880683
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| |
|
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|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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13880552 |
attatatccttaactatttattactctcttttctttcaattccttcatttatctttcccatatcaattattgaggataattttgtaaaacaactcataat |
13880651 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
13880652 |
atctttttcccacacaatattaattacatttc |
13880683 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29495043 - 29494812
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|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attatatccttaactatttattactctctcttctttcaataccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
29494844 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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atctctttcccacacaatattaattacatttc |
29494812 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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| |
|
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T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
30088778 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
30088679 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
30088678 |
atatctttcccacacaatattaattacatttc |
30088647 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 45250071 - 45250302
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Q |
| |
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|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcattcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
45250270 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
45250271 |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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100 |
Q |
| |
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|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19877854 |
attatatccttaactatttattactctctattctttcaattatttaatttatctttcccatacaacttattaaggacaattttgtaaaataactcataat |
19877953 |
T |
|
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||| |||||||| ||||| |
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| T |
19877954 |
atctatttcccacacaaaattaattatatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 81 - 232
Target Start/End: Original strand, 23138298 - 23138449
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Q |
| |
|
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|
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atattaatgttacttttcatattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
23138397 |
T |
|
| Q |
181 |
tttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23138398 |
tttgtaaaacaactcataatttctcttctccacacaatattaattacatttc |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
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Target Start/End: Original strand, 48380574 - 48380805
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttattttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
48380773 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
48380774 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11248987 - 11248797
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42 |
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141 |
Q |
| |
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
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ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17609213 - 17609027
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46 |
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145 |
Q |
| |
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|
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tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattattt |
17609114 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
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catttatctttcacatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47869280 - 47869090
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
47869180 |
ccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttc |
47869090 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 22019091 - 22019322
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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| T |
22019091 |
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22019190 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
22019191 |
attatatccttaactatttattactctctcttttttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaattcataat |
22019290 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
22019291 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
22019322 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 34246798 - 34246987
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| Q |
43 |
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142 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |
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| T |
34246798 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctataatatccttaactatttattactctttcttttttcaatta |
34246897 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34246898 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Original strand, 23137729 - 23137917
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44 |
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143 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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tgtcccaaattgtaggtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcc |
23137828 |
T |
|
| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttcatttatctttccaatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
23137917 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29832347 - 29832115
Alignment:
| Q |
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99 |
Q |
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|
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|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagagaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttactttttc |
29832248 |
T |
|
| Q |
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tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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|
|
| T |
29832247 |
tattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataa |
29832148 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
29832147 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25771258 - 25771027
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100 |
Q |
| |
|
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|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
25771158 |
attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatttttttcatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
25771059 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| |||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
25771058 |
atttctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31648614 - 31648383
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| |
|
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|
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
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attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttcccatatcatttattgaggacaattgtgtaaaacaactcataat |
31648415 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
31648414 |
atctttttcccacacaatattaattacatttc |
31648383 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42629862 - 42629631
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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actccctccgtcccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
42629762 |
attatatctttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatataatttattaaggataattttgtaaaacaatccataat |
42629663 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
42629662 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 56038696 - 56038465
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100 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |
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|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
56038596 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttataaaacaactcataat |
56038497 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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| T |
56038496 |
atctctttcccacataatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
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| |
|
||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |
|
|
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T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
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ctttcatttatcttttccataacatctattaaggataattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
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| |
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|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
|
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|
| T |
26740356 |
cctttatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
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|
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tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
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2409841 |
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199 |
Q |
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T |
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232 |
Q |
| |
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| | |||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
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tatatcttttccacacaatattaattacatttc |
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T |
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T |
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200 |
Q |
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T |
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201 |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42507816 - 42507585
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100 |
Q |
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T |
|
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Q |
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42507617 |
T |
|
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232 |
Q |
| |
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| T |
42507616 |
atctcttttccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
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Q |
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T |
|
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232 |
Q |
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T |
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Target: chr4; HSP #63
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Q |
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| T |
20180409 |
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20180508 |
T |
|
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Q |
| |
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| T |
20180509 |
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20180599 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #64
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Q |
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| T |
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T |
|
| Q |
99 |
ctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcata |
198 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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199 |
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232 |
Q |
| |
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T |
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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
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Q |
| |
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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T |
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Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
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Target Start/End: Complemental strand, 49236039 - 49235809
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Q |
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|
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T |
|
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200 |
Q |
| |
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attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcattcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
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49235839 |
atctattttccacacaatattaattatattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 51234951 - 51234761
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| Q |
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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T |
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Back To:
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Q |
| |
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T |
|
| Q |
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232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
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tttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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144 |
Q |
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T |
|
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145 |
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Q |
| |
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|
| T |
26882868 |
tcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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|
||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |
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caaattatacgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcagttccttcat |
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T |
|
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149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
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|
| T |
36871381 |
ttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
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100 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |
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|
| T |
38615337 |
actccctccgttccaaattgtatgtcgctttaggaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaatacaaatgtaacattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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attataaccttaactatttattaatctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatgttatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
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| T |
38615137 |
atctcttttctacacaatattaattgcatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
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49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
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41858762 |
caaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttcttttaattccttcat |
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T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
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|||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #73
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|
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|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |
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attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaatgataattttgtaaaataaatcataat |
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|
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ttctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
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| |
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|||||| |||||||||||||||||||| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #74
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Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |
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tcccaaattatatgttgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcccattatatccttaactatttattactctctcttatttcaattcttt |
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catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
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|
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aatttatctttctcatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaaaattaattatatttc |
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Back To:
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Q |
| |
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20540492 |
tttgttccaaattatatgtcgttttataatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
20540393 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
| T |
20540392 |
tcttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaatattaattacatttc |
20540302 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20788375 - 20788185
Alignment:
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141 |
Q |
| |
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|
| T |
20788375 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctatcttctttcaatt |
20788276 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | || ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20788275 |
atttcatttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttcatttcctcacaatattaattgcatttc |
20788185 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27383714 - 27383484
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |
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| T |
27383714 |
actccctccgtcccaaattgtatgtaactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttatttttcct |
27383615 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
27383614 |
attataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
27383515 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27383514 |
atctcttttccacacaatattaattacattt |
27383484 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29832782 - 29832592
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
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|
| T |
29832782 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatgtccttaactatttattactatttcttttttcaatt |
29832683 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29832682 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttc |
29832592 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 32402722 - 32402912
Alignment:
| Q |
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142 |
Q |
| |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaatta |
32402821 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttc-tcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
32402822 |
tttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttccacacaatattaattgcatttc |
32402912 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Original strand, 37669962 - 37670148
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| Q |
46 |
tcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattt |
145 |
Q |
| |
|
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| T |
37669962 |
tcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattcttt |
37670061 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37670062 |
catttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcacaatatctctttcccacacaatattaattatatttc |
37670148 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 37912489 - 37912675
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37912489 |
tttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
37912588 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37912589 |
ctttcatttatctttctcatattatttattaaggataattttgtaaaac----cataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
37912675 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Original strand, 6628919 - 6629102
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| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||| |
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|
| T |
6628919 |
caaattatatgtcactttagaatatcaattaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcctttttcaattctttcat |
6629018 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttatctttctcatataatttaataaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
6629102 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7258189 - 7257958
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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|
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttactttttct |
7258090 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7258089 |
attatatccttagctatttattactctttcttctttcaattctttcatttatttttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
7257990 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7257989 |
atctctttccgacactgtattaattatatttc |
7257958 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13252396 - 13252216
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
13252396 |
tttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactatctcttctttcattt |
13252297 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13252296 |
at----------ttttccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
13252216 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 23222472 - 23222703
Alignment:
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Q |
| |
|
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|
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23222472 |
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23222571 |
T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23222572 |
gttatatccttaactatctattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcgtatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataat |
23222671 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23222672 |
atctattttccacacaatattaattatatttc |
23222703 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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Q |
| |
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|
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actccctccgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25367424 |
attataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
25367325 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| | ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25367324 |
atctcttttctacataatattaattacatttc |
25367293 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29290391 - 29290160
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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29290391 |
actccctccgtctcaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaatactaatgaaatattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
29290291 |
attatattcttaattatttattactctttattttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
29290192 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29290191 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
29290160 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41458932 - 41458744
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
41458932 |
tttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttatta--ctctcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41458834 |
cattcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 52920864 - 52920633
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100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52920864 |
actccctccatcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
52920765 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| | | |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
52920764 |
attatatccttaactatttattattgtttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
52920665 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52920664 |
atctctttcccacgcaatattaattacatttc |
52920633 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 55968542 - 55968769
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55968542 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
55968641 |
T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
55968642 |
attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaatgataattttgtaaaataaatcataat |
55968741 |
T |
|
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ttctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
55968742 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 36937240 - 36937430
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42 |
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| |
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|
| T |
36937240 |
tttgtcccaaattatatgtctctttacaataccaataaaaaattaatattactttttctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
36937339 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36937340 |
ccttcatttatctttcacatatcatttattgaagataattttgtaaaacaactcataatatatttttcccacacaatattaattacatttc |
36937430 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42133836 - 42133607
Alignment:
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5 |
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104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
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| T |
42133836 |
cctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaatatttatctcagattatatgtcgctttaaaataccaatgaaacattaatgttacttttcccatta |
42133737 |
T |
|
| Q |
105 |
tatccttaactattaattactctctct--tctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
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||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
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| T |
42133736 |
tatccttaattatttattactctctctcttctttcaattctttaatttatcttttccatacaatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
42133637 |
T |
|
| Q |
203 |
ctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|| || ||||||| |||||||| ||||| |
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|
| T |
42133636 |
ctatttttcacacaaaattaattaaatttc |
42133607 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 225
Target Start/End: Original strand, 52808863 - 52809044
Alignment:
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45 |
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144 |
Q |
| |
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|||||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52808863 |
gtcccaaattgtacgtcactttacaataccaatgcaacattaacgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattatt |
52808962 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgt-aaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
52808963 |
tcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaaacaactcataatatctcttttccacataatattaatt |
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T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 31486855 - 31487085
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||||||| || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
31486855 |
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31486954 |
T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
31486955 |
attatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccattc-atttattaatgataattttgtaaaacaactcataat |
31487053 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||| ||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
31487054 |
atctctttcccacacggtattaattacatttc |
31487085 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 42168278 - 42168509
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |
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| T |
42168278 |
actcgctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaacgttatttttcct |
42168377 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
42168378 |
attatatctttaactatttattactctttcttttttcaaatctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
42168477 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42168478 |
atctcttttccacacaatattaattacatttc |
42168509 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 18052717 - 18052948
Alignment:
| Q |
5 |
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104 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
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| T |
18052717 |
cctccgtcctaaattgtatgtcgctttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgatttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctatta |
18052816 |
T |
|
| Q |
105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt-- |
202 |
Q |
| |
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|
|
| T |
18052817 |
tatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatat |
18052916 |
T |
|
| Q |
203 |
--ctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|| || |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
18052917 |
atctttttcccacacaatattaattacatttc |
18052948 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Original strand, 21634615 - 21634800
Alignment:
| Q |
46 |
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145 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| || |
|
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| T |
21634615 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttacttttcctattatatccttaatcatttattactctatcttctttcaattcatt |
21634713 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21634714 |
catttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcctacacaatattaattacatttc |
21634800 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 43587707 - 43587897
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| Q |
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
43587707 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaatacaaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaatt |
43587806 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
43587807 |
cttttatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaaacaatattaactacatttc |
43587897 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 56299727 - 56299917
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
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| T |
56299727 |
tttgttccaaattatatgtcgttttacaatacaaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattaatctctcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56299827 |
tcttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatttttttcccacataatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1788874 - 1788645
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1788874 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccgataaaacattaatgttacttttcct |
1788775 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
1788774 |
attatatcgttaattatctattactctctcttctttcaattctttcatttatctatctcatatcatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
1788675 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatt |
230 |
Q |
| |
|
|| ||| || ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1788674 |
atcactttccagcacaaaattaattacatt |
1788645 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 13494146 - 13494335
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| || ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
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| T |
13494146 |
ttgttccaaattgtatgtctctttataataccattgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattc |
13494245 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13494246 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
13494335 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
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| Q |
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ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
23662569 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaatactaatgaaatattaatgttacttttcctaatatatcattaattatttattactctttcttctttcaattc |
23662668 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23662669 |
tttcatttat-ttttccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaatattaattatatttc |
23662757 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33600023 - 33599834
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| Q |
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
33600023 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttataataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactttttcttctttcaatt |
33599924 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33599923 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaataacttataatatctttttccaacacaatattaattacattt |
33599834 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
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ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16833842 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttacttttcctattacataattaactattaattactctctcttctttctattc |
16833743 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | || | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16833742 |
attcatttatttttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcaaataatattaattacattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #105
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Query Start/End: Original strand, 43 - 159
Target Start/End: Original strand, 44570836 - 44570952
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| Q |
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ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44570836 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactatctcttctttcaatta |
44570935 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttcc |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44570936 |
tttcatttatcttttcc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 53 - 232
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ttataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttat |
152 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
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|
| T |
26707394 |
ttatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgctacttttcctattataaccttagctatttattactctctcttatttcaattctttcatttat |
26707295 |
T |
|
| Q |
153 |
cttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26707294 |
ctttcccatattatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
26707215 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34491959 - 34491732
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
34491959 |
cctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctatta |
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T |
|
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105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
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||| |||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
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| T |
34491859 |
tattcttaactatttattactctttcgtttttcaattctttcatttatttttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatct |
34491760 |
T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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|
| T |
34491759 |
ctttcccccacaatattaattacatttc |
34491732 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Original strand, 35836101 - 35836284
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49 |
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148 |
Q |
| |
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| T |
35836101 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattattctctcttctttcaaatcttttat |
35836200 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
35836201 |
ttatctttccaatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
35836284 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41608861 - 41608674
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45 |
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144 |
Q |
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| T |
41608861 |
gtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctctcttatttcaattctt |
41608762 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
41608761 |
tcatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
41608674 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #110
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Query Start/End: Original strand, 66 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8591904 - 8591738
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66 |
tacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaa |
165 |
Q |
| |
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| T |
8591904 |
tacaataccaatgaaatatcaatgttacctttcctattatatccttagctatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatca |
8591805 |
T |
|
| Q |
166 |
tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
8591804 |
tttattaaagataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaatatttattacatttc |
8591738 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26483226 - 26483036
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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| T |
26483226 |
tttgtcccaaattgtatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttaccttttctattatatacttaactatttattactatctcttctttcaatt |
26483127 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
26483126 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacagtattaattacatttc |
26483036 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33924951 - 33924761
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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| T |
33924951 |
tttgtcccagattatatgtcactttacaattccaataaaacattaatgttacttttcctattatatctttaattatttattactctttcttctttcaatt |
33924852 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
33924851 |
cttttatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacataatattaattacatttc |
33924761 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 232
Target Start/End: Original strand, 26855402 - 26855551
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182 |
Q |
| |
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| T |
26855402 |
attaatgttacttttcctgttatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttaatttatctttcccatacaatttattaaggacaattt |
26855501 |
T |
|
| Q |
183 |
tgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
| T |
26855502 |
tgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaaaattaattatatttc |
26855551 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19807059 - 19806883
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| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
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|
| T |
19807059 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaattattttat |
19806960 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
19806959 |
ttatctttctcatattatttattaaagacaattttgtaaaacatctcataatatttcttttccacacaatattaatt |
19806883 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 596367 - 596200
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64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |
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|
| T |
596367 |
tttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctatcttctttcaattccttcatttatctttctcatat |
596268 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
596267 |
catttattgagaacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacattt |
596200 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Original strand, 6284026 - 6284213
Alignment:
| Q |
45 |
gtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatt |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| || |
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|
| T |
6284026 |
gtcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcatattatgtccttaactatttattattatctcttctttcaattctt |
6284125 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | || |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6284126 |
taatttatcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaagcaactcataatatctatgtctcatacaaaattaattacatttc |
6284213 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1607029 - 1606847
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
1607029 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattgtaaccttaacgatttattactctcttttttttcaatta |
1606930 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1606929 |
tttcatttatctttttcatattatttatttaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacgatattaatt |
1606847 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 26799386 - 26799576
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| Q |
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141 |
Q |
| |
|
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|
| T |
26799386 |
tttgtcccaaattatatgtcattttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaattatttattactccctcttctttcaatt |
26799485 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26799486 |
ctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttattttccacacaatattaattacatttc |
26799576 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37730993 - 37730803
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37730993 |
tttgtctcaaattatatgtcgctttacagtaccaatgcaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattagtctctcttcttccaatt |
37730894 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37730893 |
ctttcatttatctttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
37730803 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38794037 - 38793870
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| Q |
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ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
162 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38794037 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttatgtttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
38793938 |
T |
|
| Q |
163 |
caatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
38793937 |
tcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacac--tattaattacatttc |
38793870 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #121
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Query Start/End: Original strand, 7 - 205
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tccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattata |
106 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
39915777 |
tccgtcctaaattgtatgtcgctttggagaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttccaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
39915876 |
T |
|
| Q |
107 |
tccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctc |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39915877 |
tccttaactatttattactttctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaagatcaattttataaaacaactcataatatctc |
39915975 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 53334138 - 53333916
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99 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
53334138 |
actccctcggtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattgatgttactttttc |
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T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
53334038 |
tattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatatttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
53333939 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatatta |
222 |
Q |
| |
|
| ||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
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tatcttttttccacacaatatta |
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T |
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Target: chr4; HSP #123
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Query Start/End: Original strand, 43 - 232
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ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
44197291 |
ttgtcctaaattatacgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcttattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattc |
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T |
|
| Q |
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcata--atttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44197391 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggaaaattttgtaaaacaactcataatatattttttttccacacaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #124
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Q |
| |
|
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cctccgtcccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttacattaccaatgcaacattaatgttacttttccaattg |
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T |
|
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tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |
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| T |
48510812 |
taaccttaactatttatttttatctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatattt |
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T |
|
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cttccccacacaatattaatt |
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Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
48510712 |
tttttccacacaatattaatt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #125
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Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9542601 - 9542414
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| T |
9542601 |
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9542502 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||| |
|
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| T |
9542501 |
tcatttaacttttccatatcatttattaagaacaatttagtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatatcaattatatttc |
9542414 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #126
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35877123 - 35876892
Alignment:
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100 |
Q |
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| T |
35877123 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaataatttgtcccaaattgtatgtcactttccaatactaatgaaacattaatgttattttttct |
35877024 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
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| T |
35877023 |
attatatccttaactatttattactctttcttgtttcaattcttttatttaattttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
35876924 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
35876923 |
atctctttctcacccaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47477212 - 47477029
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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| T |
47477212 |
tttgtcccaaattgtatgttgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaatt |
47477113 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
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||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
47477112 |
cttttatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatcccttttccacacaatattaatt |
47477029 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
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Target Start/End: Complemental strand, 50690649 - 50690467
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| Q |
50 |
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148 |
Q |
| |
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||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| | |
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| T |
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aaattgtatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatt |
50690550 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
50690549 |
ttatcattcccataacattta-taaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattacttacatttc |
50690467 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Original strand, 7770495 - 7770683
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaatta--ctctctcttctttcaa |
139 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |
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|
| T |
7770495 |
tttgtctcaaattatatgtcactttacaatac-aaggaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttactgttctctctcttctttcaa |
7770593 |
T |
|
| Q |
140 |
ttatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacat |
229 |
Q |
| |
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|| ||||||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
7770594 |
ttccttcatttatctttcccatatcatttattgagaacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacat |
7770683 |
T |
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Target: chr4; HSP #130
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Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 388086 - 388275
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| Q |
43 |
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142 |
Q |
| |
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| T |
388086 |
ttgtctcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattagtgttacttttcctattatatccttcactatttattgcattctctacttccaagtc |
388185 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
388186 |
attcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttc |
388275 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8178203 - 8178014
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
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|||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |
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| T |
8178203 |
ttgtcccacattatatgttgctttacaataccaataaaacattaatgtaatttttcatattatatcctttactatttattactctctcttatttcaattc |
8178104 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
| T |
8178103 |
tttcatttatctttcccatataatttattgaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttcctatactacattaattacatttc |
8178014 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36878722 - 36878497
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99 |
Q |
| |
|
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| T |
36878722 |
actccctccgttccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcctaaattgtacgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttactttttc |
36878623 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
36878622 |
tattataaccttaactatttattactctctcttatttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
36878523 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
| || ||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
36878522 |
tatccctttttcatacaatattaatt |
36878497 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #133
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Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 34735920 - 34736144
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||| || ||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
34735920 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttaaaatatcaatgcaacattaatgatatttttcct |
34736019 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
| T |
34736020 |
attataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatttttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
34736119 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||| || |||| ||||||||||| |
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|
| T |
34736120 |
atctattttccacgcaatattaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 51779575 - 51779765
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
51779575 |
tttgtcctaaattatatatcgttttacaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattattctctcttcttttaatt |
51779674 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
51779675 |
ccttcatttaattttctcatatcatttattaaggacgattttgtaaaacaactcataatatctttttcctacacaatattaattgcatttc |
51779765 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 232
Target Start/End: Original strand, 37390570 - 37390727
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| Q |
75 |
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174 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37390570 |
aatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcttttatctttcccatatcatttattaag |
37390669 |
T |
|
| Q |
175 |
gataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37390670 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaatattaattatatttc |
37390727 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Original strand, 43609327 - 43609491
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| Q |
64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
43609327 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactatatgttactctttc----ttcaattctttcatttatttttcccatat |
43609422 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43609423 |
tatttattaaggacaattttgtaaaacaactcaaaatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
43609491 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51817224 - 51817001
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| || |
|
|
| T |
51817224 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttattttttct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||| ||| |||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
51817124 |
attatatcattaactatttattactcttttttttttcaattcttttatttatctttcccagatcatttataaaggataattttgtaaaacaactcataat |
51817025 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaat |
224 |
Q |
| |
|
|||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
51817024 |
atctctttctcatacaatattaat |
51817001 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #138
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Query Start/End: Original strand, 45 - 207
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| Q |
45 |
gtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatt |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | || |
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|
| T |
33501366 |
gtcccaaattggatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaagtctt |
33501465 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
33501466 |
ttatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctt |
33501528 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
||||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
3506060 |
aaattgtatgtcactttacaatacaaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaattattttttactctctcttctttcaagtcttttatt |
3506159 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3506160 |
tatctttcccatattatttattaatgacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcatataatattaattacattt |
3506241 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #140
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6920604 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttataaaaaatatttatcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
6920703 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
6920704 |
attataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttccat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataat |
6920792 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6920793 |
atctcttttccacacaatatcaattacatttc |
6920824 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42179729 - 42179509
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| Q |
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
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| |
|
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|
|
| T |
42179729 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattgatgttacttttcct |
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
42179629 |
attataaccttaactattcattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttcccat-----------agaacaattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
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|||||| | ||||||||||||||||||||| |
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| T |
42179540 |
atctcttttctacacaatattaattacatttc |
42179509 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 54315096 - 54315285
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142 |
Q |
| |
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| T |
54315096 |
ttgtctcaaattgtatgtcgcattacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgctttctctacttccaagtc |
54315195 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
54315196 |
attcatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattatatttc |
54315285 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #143
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Query Start/End: Original strand, 70 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 49226610 - 49226457
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70 |
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169 |
Q |
| |
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|
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| T |
49226610 |
ataccaatgcaatattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctct--tctttcaattctttcatttatttttcccatattattta |
49226513 |
T |
|
| Q |
170 |
ttaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
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|
| T |
49226512 |
ttaaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaatt |
49226457 |
T |
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Target: chr4; HSP #144
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Target Start/End: Original strand, 22128769 - 22128952
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
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| T |
22128769 |
caaattatatatcgttttacaataccaatgaaacattaatgttatcttttctattatatcattaactatttattactctattttcttttaattctttcat |
22128868 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22128869 |
ttatctttccggtatcatttattaaggacaattttgtaaaacaagtcataatttctcttttccatacaatattaattatatttc |
22128952 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #145
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Target Start/End: Complemental strand, 41947804 - 41947613
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgtt-acttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
140 |
Q |
| |
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| T |
41947804 |
tttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaataattaatgtttacttttcctattatatccttcactatttattgccttctctactctcaag |
41947705 |
T |
|
| Q |
141 |
tatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41947704 |
tcattcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttccaacacaaaattaattacatttc |
41947613 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #146
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Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 23153709 - 23153887
Alignment:
| Q |
54 |
tataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatc |
153 |
Q |
| |
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|||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |
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| T |
23153709 |
tatatgtcactttataataccaatgaaatattaatgttactttttctgttatgtcattaactatttattactctctcgtctttcaattctttaatttatc |
23153808 |
T |
|
| Q |
154 |
ttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
| T |
23153809 |
tttctcatactatttactaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttttacacaaaattaattatatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 43566039 - 43566226
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
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| T |
43566039 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttactttttctattataaccttaactatttatta--ctctcttatttcaattc |
43566136 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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| T |
43566137 |
tttcatttatttttcacatattatttattaaggacaattttgtagaacaattcataatatctcttttccacacaaaattaattgcatttc |
43566226 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Original strand, 17678575 - 17678758
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| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaat-attaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17678575 |
caaattgtatgtcactttacaatactaatgaaaacattaatgttatttttcatattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattttttca |
17678674 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17678675 |
tttatcattctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcgtaatatct-ttttccacacaatattaattacatttc |
17678758 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30035574 - 30035355
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| Q |
5 |
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104 |
Q |
| |
|
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| T |
30035574 |
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30035475 |
T |
|
| Q |
105 |
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204 |
Q |
| |
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|| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | | |
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| T |
30035474 |
taaccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttat-ttttccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatat |
30035376 |
T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30035375 |
tttttccacacaatattaatt |
30035355 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 49651087 - 49650899
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| Q |
43 |
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142 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
49651087 |
ttgtctcaaattatttgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattcttatctcttctttcaattc |
49650988 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||| | | || |||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49650987 |
tttcatttatctttctcatattatttattaagaacagttctgtaaaacaattcataacatcttttttccacacaatattaattacattt |
49650899 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #151
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Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 14965338 - 14965529
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14965338 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcgctttgcaatactaatgaagcattaatgttatttttcct |
14965437 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14965438 |
attatatccttaactatttactactttctcttcttccaagtcattcatttatctttcccatatcatttactaaagataattttgtaaaacaa |
14965529 |
T |
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Target: chr4; HSP #152
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Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9583786 - 9583607
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| Q |
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149 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
9583786 |
aaattatatgtcgctttacgatactaataaaatattagtgttacttttcccattatatctttaactatttagtactctct--tctttcaatttttttatt |
9583689 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
9583688 |
tatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactaataatatccctttcccacacataagtaattacattt |
9583607 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9589481 - 9589302
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
9589481 |
aaattatatgtcgctttacgatactaataaaatattagtgttacttttcccattatatctttaactatttagtactctct--tctttcaatttttttatt |
9589384 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
9589383 |
tatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactaataatatccctttcccacacataagtaattacattt |
9589302 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #154
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Target Start/End: Complemental strand, 32385562 - 32385409
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gaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggat |
177 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32385562 |
gaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttatta-tctctcttctttcaattctttaatttatctttctcataccatttattaaggaa |
32385464 |
T |
|
| Q |
178 |
aattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
32385463 |
aattttgtaaaataattcataatatctatttcccacacaaaattaattatatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #155
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| Q |
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aattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcattt |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
32397500 |
aattatatgtcgttttacaatacctatgtaacattaatgttattttttctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaattcttttattt |
32397401 |
T |
|
| Q |
151 |
atcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32397400 |
atttttcccatattatttattaaggacaattttttaaaacatttcataatatttcttttccacacaatattaattatatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #156
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attaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattt |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34018754 |
attaatgttaatttttgtattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattt |
34018853 |
T |
|
| Q |
183 |
tgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34018854 |
tgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaatattaactacatttc |
34018903 |
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Target: chr4; HSP #157
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attaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattt |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||| |
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|
| T |
13394531 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaagacaattt |
13394432 |
T |
|
| Q |
183 |
tgtaaaacaactcataatttctcttccccacac |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
13394431 |
tgtaaaacaactcataatatctctttcccacac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #158
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attaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattt |
182 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||| |
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|
| T |
13397670 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaagacaattt |
13397571 |
T |
|
| Q |
183 |
tgtaaaacaactcataatttctcttccccacac |
215 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
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| T |
13397570 |
tgtaaaacaactcataatatctctttcccacac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #159
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| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |
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|
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50174407 |
tcccaaattataattcgctttacaataccaatgaagtattaaatgttacttttcctactataccctcaactatttattactgtct--tctttcaattatt |
50174504 |
T |
|
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tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
Q |
| |
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| |||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| |
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50174505 |
taatttatctttcctataccgttaatgaaggataattttgtaaaatgacttataatttctctttcccatgcaacattaattaca |
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T |
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Target: chr4; HSP #160
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Target Start/End: Original strand, 29832823 - 29832950
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204 |
Q |
| |
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|
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tatcattaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcctatatcatttattaaggattattttgtaaaacaactcataatatct |
29832922 |
T |
|
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205 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
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29832923 |
ctttcccacacagtattaattacatttc |
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T |
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142 |
Q |
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T |
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
36507463 |
attcatttatcttttccatatcatttattaatgacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaaacaaaattaatta |
36507380 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #162
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Target Start/End: Original strand, 10754463 - 10754640
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148 |
Q |
| |
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T |
|
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ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
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|||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| |||| |||||||| |
|
|
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ttatctttcgcatggtatttattaaggaaaattttgtaaaacaattcataatatttcttttccatacaaaattaatta |
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T |
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148 |
Q |
| |
|
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|
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caaattataagtcggtttaaaataccaatgaagaattaatgttactttttctattatacctttaactaatcattactctctattctttcaattctttaat |
10968331 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| |||| |||||||| |
|
|
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10968332 |
ttatctttcgcatggtatttattaaggaaaattttgtaaaacaattcataatatttcttttccatacaaaattaatta |
10968409 |
T |
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Target: chr4; HSP #164
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142 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||| | |
|
|
| T |
22496699 |
ttgtcccaaattgtatgtgtctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcgctatttattgcattctctacttccaagtc |
22496600 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
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22496599 |
atttatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacgactcataatatatctttcccacataaaattaattacatttc |
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T |
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Target: chr4; HSP #165
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171 |
Q |
| |
|
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|
| T |
15986582 |
accaatgcaacattaatgttactttttcaattgtaaccttaactatttattattattttttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttatt |
15986483 |
T |
|
| Q |
172 |
aaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15986482 |
aaggataattttgtaaaacaactcataatatctttcttccacacaatattaattgcatttc |
15986422 |
T |
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Target: chr4; HSP #166
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| |
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23621738 |
attatatccttaatcatttattactctcttttctttcaattccttcatttctctttccca---------------aaaattttgtaaaataactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23621823 |
atctttttcccacacaatattaattacattt |
23621853 |
T |
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Target: chr4; HSP #167
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Target Start/End: Original strand, 14604248 - 14604399
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | |||| |||| |||||||| ||| ||| || |
|
|
| T |
14604248 |
caaattatatgtcgctttacaataccaacgaaacattaatgtaacttttcctattataactttaactagttattattctcgcttctttccattctttaat |
14604347 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
14604348 |
ttatcattctcataccatttattaaggataattttgtaaaataacacataat |
14604399 |
T |
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Q |
| |
|
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|
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27956021 |
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27955922 |
T |
|
| Q |
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caactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
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caactcataatatcccttttccacacaatattaattgcatttc |
27955879 |
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Target: chr4; HSP #169
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32860899 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
32860800 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32860799 |
attatatttttaactatttattactctttcttctttcaattctttca |
32860753 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39603470 - 39603299
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| Q |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
39603470 |
attataagtcgcattacaataccaatgaa--------gctacttttcctattatacccttaactatttattactttttcttctttcaattttttaattta |
39603379 |
T |
|
| Q |
152 |
tcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
39603378 |
tctttcccataccatttattaaggacaattttgtaaagcaactcagaatatctctttcgcatgcaaaattaattacattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #171
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142 |
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| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |
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|
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51487785 |
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T |
|
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| | ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| |
|
|
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51487685 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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168 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
51624917 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctcttttctttcaggtcttttatttatcttttccat------- |
51625009 |
T |
|
| Q |
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attaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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51625010 |
----aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
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| |
|
|||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
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T |
|
| Q |
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attt-catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||| |
|
|
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29977132 |
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T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
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Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29977038 |
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Target: chr4; HSP #175
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Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| |||||| || ||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
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T |
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| Q |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
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ggataattttgtaaaacaactcataatatctctt |
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| |
|
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|
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|
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| |
|
|||| ||| | ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |
|
|
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| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||| | |
|
|
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|
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-tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
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| |
|
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|
|
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Target: chr4; HSP #178
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Target Start/End: Complemental strand, 10699438 - 10699286
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caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc-ctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
10699438 |
caaattataagtcggtttaaaataccaatgaagaattaatgttatttttttctattataccattaattatttattactctctcttctttcaattctttaa |
10699339 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
10699338 |
tttatctttcgcatagtatttattaaggacaattttgtaaaataattcataat |
10699286 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #179
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Query Start/End: Original strand, 49 - 200
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| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc-ctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
10913208 |
caaattataagtcggtttaaaataccaatgaagaattaatgttatttttttctattataccattaattatttattactctctcttctttcaattctttaa |
10913109 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
10913108 |
tttatctttcgcatagtatttattaaggacaattttgtaaaataattcataat |
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T |
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Target: chr4; HSP #180
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Target Start/End: Complemental strand, 19721332 - 19721205
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| Q |
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200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19721332 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttaatttatctttcttataccatttattaaggacaaatttgtaaaacaactcataat |
19721233 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
Q |
| |
|
| | || | ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19721232 |
atttatttctcacacaaaattaattaca |
19721205 |
T |
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Target: chr4; HSP #181
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| Q |
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149 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
29462739 |
aaattataagtctctttacaataccaatgaaac-ttaatgttacttttcctat-atacccttaactatttattactttaacttttttcaattttttaatt |
29462642 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |||||| | || | || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
29462641 |
tatctttcctatatcatttattaaagacaattttgtagaataactcataatatctctttctcatagaaaattaattagatttc |
29462559 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #182
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141 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32882163 |
tttgttccaaattatatatcgctttataataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaatt |
32882262 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttt |
156 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |
|
|
| T |
32882263 |
cttttatttatcttt |
32882277 |
T |
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Target: chr4; HSP #183
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| Q |
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cttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttc |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
6893231 |
cttaactatttat-actctttcttctttcaattatttcatttatctttccaatatcatttattaagtataattttgtaaaacaactcataatatctattt |
6893329 |
T |
|
| Q |
209 |
cccacacaatattaattacat |
229 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6893330 |
accacataatattaattacat |
6893350 |
T |
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Target: chr4; HSP #184
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Target Start/End: Original strand, 33517370 - 33517521
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| Q |
50 |
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149 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
33517370 |
aaattatatatcgttttacaatatcaatgagatattaatgttgttttttctattatatcattaactagttattactctaacttcttttaattctttaatt |
33517469 |
T |
|
| Q |
150 |
tatc-ttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33517470 |
tatcttttttcatacattttattaaagagaattttgtaaaacaactcataat |
33517521 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #185
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| Q |
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gctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaa--ttactctctcttctttcaattatttcatttatcttttcc |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| | |
|
|
| T |
6154199 |
gctttacaatatcaatgaaacattaatgttaattttcctattataccattaactatttacgttactctttcttctttcaattttttaatttatttttcgc |
6154100 |
T |
|
| Q |
160 |
atacaatttattaaggataattttgt-aaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
6154099 |
ataccatttattaaggacaattttgtgaacacaactcataat |
6154058 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #186
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| Q |
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116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50533811 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaacta |
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T |
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Target: chr4; HSP #187
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Target Start/End: Original strand, 20978092 - 20978221
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| Q |
104 |
atatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgt-aaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20978092 |
atatctttaactatttattactctatcttatttcaattctttcatttatctttttcatatcatttattaaggatagttttgtaaaaacaactcataatat |
20978191 |
T |
|
| Q |
203 |
ctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| | |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
20978192 |
ttctttctcacataaaattaattacatttc |
20978221 |
T |
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Target: chr4; HSP #188
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Target Start/End: Original strand, 34498208 - 34498304
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| Q |
136 |
tcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34498208 |
tcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatataatattaattacatttc |
34498304 |
T |
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Target: chr4; HSP #189
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18872493 |
actccctccgtcctaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtttcaaattatatgtcgttttataataccaataaaacattaatgttatttttcct |
18872394 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
140 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
18872393 |
attatatccttaactatttattactttatcttctttcaat |
18872354 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
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| Q |
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136 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
22493921 |
ttgtcctaaattataagtcgttttacaatatcaatattaatgaaatattaatttcaccttttctattatactcttaactatttattactttctctacttt |
22493822 |
T |
|
| Q |
137 |
caattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
||||| ||| || | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
22493821 |
caattctttaatgtttcttttcgatatcatttattaaggataattttataaaacaactcacaatatctctt |
22493751 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #191
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Query Start/End: Original strand, 49 - 232
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caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatat----ccttaactattaattactctctcttctttcaattatt |
144 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
23949769 |
caaattatatgtcgctttacaatataaatgcaacattaatgttattttttctattatatataaccttaactatttatcactctcttttcttttaattatt |
23949670 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23949669 |
tcttttatctttctaatattatttattaagaacaattttttaaaacaactcatgatatctctttttaaaacaatattaattgcatttc |
23949582 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
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| Q |
48 |
ccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
46481652 |
ccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacgttaatgttatttttcttattgtaaccttaacgatttattactctctcttttttcaattatttca |
46481553 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
46481552 |
t------------------ttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
46481486 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #193
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||| || | | |||| | | ||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
35340648 |
aaattataaatcgttttacaataccaatgaaacattaataatattttttctattatacccttgacaaattattattttatcttctttcaattctttaatt |
35340747 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| | | |||| |||||||||| |
|
|
| T |
35340748 |
tatctttcttataccatttatcaagaacaattttgtaaaacaattcataatatctctttcatatacaaaattaattaca |
35340826 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #194
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Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 6328202 - 6328389
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| Q |
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gtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatt |
144 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||| || ||||||||| || || |
|
|
| T |
6328202 |
gtcctaaattataactcgctttacaatac-aatgaatcattaatgctattttttatattataccattaactatttattactttcccttctttcagttttt |
6328300 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaag--gataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||| | | || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6328301 |
tactttatctttctcataccatttattaagaggacaattttataaaataactcataatatctcattctcatacaaaattaattacattt |
6328389 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #195
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| Q |
51 |
aattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcattt |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||| |||| | ||| ||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
49877653 |
aattataagtcgttttacaatatcaatgaagtattaatgttaatttttctattatacacataactatttattattgtctattcttcgaattttttaattt |
49877752 |
T |
|
| Q |
151 |
atcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| || || | |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
49877753 |
atctttctcatacaatttactatagacagttttataaaacaactcataat |
49877802 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 117
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| Q |
51 |
aattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18316820 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #197
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156 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
11116547 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #198
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Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Original strand, 25200170 - 25200275
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| |
|
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|
|
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25200170 |
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25200269 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcat |
148 |
Q |
| |
|
|||||| |
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25200270 |
tttcat |
25200275 |
T |
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Target: chr4; HSP #199
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Target Start/End: Complemental strand, 32859919 - 32859830
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143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32859919 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctattttctacataatattaattacatttc |
32859830 |
T |
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Target: chr4; HSP #200
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115 |
tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccaca |
214 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| | | || ||||| |
|
|
| T |
50534180 |
tatttattactttctcttctttcaattccttcatttatctttctcatattatttattgaggacaattttgtaatacaactcataatatat-ttttccaca |
50534278 |
T |
|
| Q |
215 |
caatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50534279 |
caatattaattacatttc |
50534296 |
T |
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Target: chr4; HSP #201
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104 |
atatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttc |
203 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
19625216 |
atattcttaactatttatcactttctcttctttcaattattttttttatctttctcatatcatttattaaagacaaatttgtaaaacaattcataatatc |
19625117 |
T |
|
| Q |
204 |
tcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| | |||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
19625116 |
tctttctcacaaaaaattaattatatttc |
19625088 |
T |
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Target: chr4; HSP #202
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69 |
aataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaattt |
168 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
53988255 |
aataccaataaaacattaatgttctttttgctattatacatttaactatttattaccctctctt-tttaaatattttaatttatctttttcataccattt |
53988353 |
T |
|
| Q |
169 |
attaaggataattttgtaaaacaactcataatttctc |
205 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |
|
|
| T |
53988354 |
attaaggacaattttgtaaaataattcataatatctc |
53988390 |
T |
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Target: chr4; HSP #203
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaatta |
123 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
37041149 |
tttgtcccagattatatgtcgctttacaataccactgaagcattaatgttacttttcctattatgccctcaactattcatta |
37041068 |
T |
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Target: chr4; HSP #204
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattata |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29832478 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
29832541 |
T |
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Target: chr4; HSP #205
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| Q |
47 |
cccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttc |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||| | |||| || ||||| ||||||| || |
|
|
| T |
51747601 |
cccaaattataagctgtttgacaatatcaatgaaacattaatattatttttcttattatacctttaactacttattattcactctttcttcaattgatta |
51747502 |
T |
|
| Q |
147 |
atttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctc |
205 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
51747501 |
atttatttttctcataccattaattgagaataattttataaaacaactcatgatttctc |
51747443 |
T |
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43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||||||| | | | |||| |||||| |||||| | ||| || |
|
|
| T |
8137893 |
ttgtctcaaattataagtcgttttacaatatcaatgaattattaatgataatttttctattataccatcgattatttattactttctcttttatcatttc |
8137992 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaa |
188 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8137993 |
tttaatttat-ttttttatagcatttattaaggacaattttgtaaa |
8138037 |
T |
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactct |
127 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24323238 |
aaattatatgtcgttttacaataccaataaaaaattaatgttatttttcctattat-tctttaactatttattactct |
24323314 |
T |
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Target: chr4; HSP #208
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Target Start/End: Complemental strand, 34323460 - 34323295
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||| | | |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| | | || |||||||||| ||| |
|
|
| T |
34323460 |
tttgtcgcaacttataaattgatttacattaccattgaagcattaatgttgtttttcatatcatacccttaactattcaccattccctcttctttcgatt |
34323361 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
34323360 |
ctttattttattttttccatataaaaaatgaaggataattttgtaaaataactcataacttctctt |
34323295 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #209
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| Q |
115 |
tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactca |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||| ||| || |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41855118 |
tattaattactctctcttctttcaattctttaatttatttttctcataaaatttactaaagacaattttataaaacaactca |
41855199 |
T |
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| Q |
94 |
ttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaac |
193 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| || |||||| ||| |||| ||| |||| | | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
31372552 |
tttttctattatacctttaactatttattattctcttttccttcaattcttaaatttatatttcttataccattcattatgaacaattttgtaaaacaac |
31372453 |
T |
|
| Q |
194 |
tcataatttctcttccccacacaatattaattacat |
229 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31372452 |
tcataatatctcttttccatacaaaattaattacat |
31372417 |
T |
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| Q |
64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatat-ccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
13967728 |
tttacaataccaatgaaacatcaatgttacttttcttattacataccttaagtatttattactctttattctttcaatt |
13967806 |
T |
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattat |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
32295403 |
ttgtcccaaattatacgtcgccttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcttattat |
32295341 |
T |
|
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttcttt |
136 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| | |||||| |
|
|
| T |
13529650 |
ttgtcccaaattatatgtggctttacaatactaatgaaaacttattgttactttttgtattatatgtttaaatatttattactctattttcttt |
13529743 |
T |
|
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| Q |
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aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactc---tctcttctttcaattatttc |
146 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||| ||| || |||| || |||||||| | |||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| || || |
|
|
| T |
39717370 |
aaattataaatcgttttacaatactaataaagtatttatattactttttcaattatacccttaactatttattattctcttctcttcttttggttcattg |
39717469 |
T |
|
| Q |
147 |
atttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || ||| | || |||| |||||||| |
|
|
| T |
39717470 |
atttatctttctcttaccttttataaaggacaattttttaaaacaactcataatatcactttcacatacaaaattaatta |
39717549 |
T |
|
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| Q |
91 |
tacttttcctattatatccttaa-ctattaattactctctcttctttcaa |
139 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42885146 |
tacttttcctattatatccttaaactatttattactctctcttctttcaa |
42885097 |
T |
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52 |
attataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgtta-cttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcattt |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
3727199 |
attataagtcattttacaataccaattaaacattaatgttatttttttctattatatctttacctatttattactcttccttatttaaattttttaattt |
3727100 |
T |
|
| Q |
151 |
atc |
153 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
3727099 |
atc |
3727097 |
T |
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caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc-ctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10672729 |
caaattataagtcggtttaaaatacaaatgatgaattaatgttatttttttctattataccattaattatttattattctctcttctttcaatt |
10672822 |
T |
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| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc-ctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10886369 |
caaattataagtcggtttaaaatacaaatgatgaattaatgttatttttttctattataccattaattatttattattctctcttctttcaatt |
10886462 |
T |
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaa |
87 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13398025 |
tttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaa |
13397980 |
T |
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159 |
catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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catactatttattaaggaaaattttgtaaaacaactcataat |
53484202 |
T |
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgtt |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
55852220 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgcaaaattaatgtt |
55852171 |
T |
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aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattata |
106 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27719559 |
aaattaaaagtcgatttataatactaattaaatattaatgttacttttcgtattata |
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T |
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aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattata |
106 |
Q |
| |
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|
|
| T |
41855038 |
aaattataagtcgttttacaatataaatgaaacattaatgttattttttctattata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #224
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Target Start/End: Complemental strand, 986357 - 986279
Alignment:
| Q |
110 |
ttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaa |
189 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||| || ||||| | | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
986357 |
ttaactatttattactctatctttttccaattttataatttatcttt-ccataccgtttattaaggagaattttgtaaaa |
986279 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 116
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Alignment:
| Q |
69 |
aataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaacta |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3761807 |
aataccaatgaaacattaatgttattttttctattatgtccttaacta |
3761854 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #226
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| Q |
94 |
ttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattt-catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaa |
188 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| | |||| | | ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
29200950 |
ttttcctattataccctttattatttaatgctctctcttctctcaattatttaaatttctctttcccataccattaattaatgataatcttgtaaa |
29201045 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #227
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Target Start/End: Complemental strand, 38052418 - 38052383
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| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38052418 |
atttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
38052383 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #228
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Target Start/End: Original strand, 44902571 - 44902677
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| Q |
83 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattt |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | |||| || | ||| |||| ||| |||||||||| ||||| || |||||| || ||||| |
|
|
| T |
44902571 |
attaatgttacttttcctataatatacttaattatttagtactatc---ttttttaattctttaatttatctttctcataccatctattaaagacaattt |
44902667 |
T |
|
| Q |
183 |
tgtaaaacaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
44902668 |
tgtaaaacaa |
44902677 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #229
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Target Start/End: Complemental strand, 30152936 - 30152886
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| Q |
175 |
gataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30152936 |
gataattttgtaaaacaattcacaatatctcttttccacacaatattaatt |
30152886 |
T |
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Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Original strand, 31263181 - 31263308
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||| || |||| |||||| | ||||||| || |||| | | |||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
31263181 |
aaattataagttgttttataatatcaatgaaacattaat--tattttttctattacagtcttaactttttattattttatcttctttcaatcatttaatt |
31263278 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataa |
179 |
Q |
| |
|
||||||| | | || |||||||||| |||| |
|
|
| T |
31263279 |
tatctttcctaaactatttattaagaataa |
31263308 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #231
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| Q |
159 |
catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
7555216 |
catacaataaatgaaggatagttttataaaacaactcatcatttctcttttccatacaaaattaattatatttc |
7555289 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #232
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Original strand, 19467941 - 19467990
Alignment:
| Q |
64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaa |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
19467941 |
tttacaataccaataaaatattaatattatttttcttattgtatccttaa |
19467990 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #233
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5907839 - 5907787
Alignment:
| Q |
180 |
ttttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5907839 |
ttttgtaaaacaactcataatatatcttttacacacaaaattaattacatttc |
5907787 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #234
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 30609229 - 30609261
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttgg |
33 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30609229 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttgg |
30609261 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #235
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44572247 - 44572072
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| | | ||||||||||||| ||| | ||| | || |||| |||||||||| ||| ||||| |||||| | | ||||||| ||| ||| ||| |
|
|
| T |
44572247 |
aaattataaattgttttacaataccaacaaaacactaacgataatttttctattatatcattacctatttattactgtttattctttctattctttaatt |
44572148 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttat-taaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
44572147 |
tat-ttttctataacattaatgaaaggataattttgtaaagtaacacataatttcttttttccacagaaaattaatt |
44572072 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #236
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 47929656 - 47929696
Alignment:
| Q |
138 |
aattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggata |
178 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47929656 |
aattctttaatttatctttttcatacaatttattaaggata |
47929696 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0444 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:
Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 7596 - 7827
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7596 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
7695 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7696 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
7795 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7796 |
ttttcttccccacacaatattaattacatttc |
7827 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 144)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16524798 - 16524567
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16524798 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
16524699 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16524698 |
attatatccttaactattaattactctctattctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
16524599 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16524598 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
16524567 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 34283344 - 34283575
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34283344 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
34283443 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34283444 |
attatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
34283543 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34283544 |
ttcacttccccacacaatattaattacatttc |
34283575 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10629597 - 10629366
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
10629597 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttct |
10629498 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10629497 |
attatatccttaactattaattactttatcttctttcaattatttcatttatctttttcatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
10629398 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10629397 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
10629366 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 24178238 - 24178459
Alignment:
| Q |
11 |
tcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcct |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24178238 |
tcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttatcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcct |
24178337 |
T |
|
| Q |
111 |
taactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24178338 |
taactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccc |
24178437 |
T |
|
| Q |
211 |
cacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24178438 |
cacacaatattaattacatttc |
24178459 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 3819604 - 3819834
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3819604 |
actccctccggcccaaattgtaagtcgctttggaaaaaaaatt-gttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
3819702 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3819703 |
attatatccttaactattaattactccatcttctttcaattatttcatttatcttttccatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
3819802 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3819803 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
3819834 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16466442 - 16466211
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16466442 |
actccctccgtcctaaattgtatgccgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
16466343 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16466342 |
attatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttatcaaggataattttgtaaaacaactcataat |
16466243 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16466242 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
16466211 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31022666 - 31022436
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31022666 |
actccctccgtcctaaattgtatgtcgctttggaaaaaaa-tttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcct |
31022568 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31022567 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaatgataattttgtaaaacaactcataat |
31022468 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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31022467 |
ttctattccccacacaatattaattatatttc |
31022436 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 29017028 - 29017250
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
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| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
29017128 |
actatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
29017227 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaa |
223 |
Q |
| |
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| T |
29017228 |
ttctcttccccatacaatattaa |
29017250 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14600714 - 14600484
Alignment:
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100 |
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
14600614 |
attatatccttaactattaattactttctcttctttcaattatttcatttattttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
14600515 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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ttctcttcccc-cacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24053225 - 24052996
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100 |
Q |
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
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attatatccttaactattaattattatctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaaaaactcataat |
24053027 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24053026 |
ttatcttccccacacaatattaattacattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21140032 - 21139803
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100 |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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| T |
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attatatccttaactattaattactctct--tctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaataactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
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ttctcttccccacgcaatattaattagatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 9961316 - 9961547
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| Q |
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Q |
| |
|
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|
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcctatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
9961515 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
9961516 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
9961547 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 11172886 - 11173117
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
| T |
11172986 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataat |
11173085 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
11173086 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 1352472 - 1352703
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| Q |
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T |
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| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
1352572 |
attatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
1352671 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| |||| |||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
1352672 |
atatctttcccatacaatattaattacatttc |
1352703 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8415284 - 8415053
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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|
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actccatccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccatattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
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attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
8415085 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||||| |
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| T |
8415084 |
atctctttcccacacaatattaattgcatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 59 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6334942 - 6334770
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|
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|
|
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gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttc |
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T |
|
| Q |
159 |
catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cataccatttattagagataattttgtaaaacaactcataattt-tttttgtcacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9660503 - 9660275
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Q |
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|
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|
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ccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcttatt |
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T |
|
| Q |
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atatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
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|
| T |
9660403 |
atatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatc |
9660304 |
T |
|
| Q |
204 |
tcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
9660303 |
tctttcccacacaatattaattacatttc |
9660275 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 6835713 - 6835944
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Q |
| |
|
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|
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaatattaatgttatttttcct |
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6835813 |
attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
6835912 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6835913 |
atctctttcccacacaatatcaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2010349 - 2010119
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2010349 |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2010249 |
attatatccttaactatttattactttctcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
2010150 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
2010149 |
atctcttttccacacaaaatatattacattt |
2010119 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 4130894 - 4131084
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| |
|
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|
|
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tttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctaatatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
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T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ctttcatttatcttttccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatttatctttcccatacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32393701 - 32393519
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143 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32393701 |
tgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcc |
32393602 |
T |
|
| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32393601 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 31492923 - 31493112
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
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| |
|
|||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31492923 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattc |
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T |
|
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143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 31498312 - 31498501
Alignment:
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43 |
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142 |
Q |
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| T |
31498312 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattc |
31498411 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31498412 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttc |
31498501 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 11615353 - 11615585
Alignment:
| Q |
1 |
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Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt-tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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| T |
11615453 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcattgtatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
11615552 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
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| T |
11615553 |
tatctctttcccacataatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 26409048 - 26409279
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
26409048 |
actccctccgccccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacattaccaatgaaacattaatgttacttttcct |
26409147 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
26409148 |
attatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
26409247 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26409248 |
atctctttcccatacaatattaattacatttc |
26409279 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13631302 - 13631112
Alignment:
| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13631302 |
tttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaatt |
13631203 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
13631202 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
13631112 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 6612375 - 6612607
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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| T |
6612375 |
actccctctgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtacgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttctt |
6612474 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt-tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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| T |
6612475 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcattgtatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
6612574 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
6612575 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttc |
6612607 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 3787093 - 3787324
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| || |
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|
| T |
3787093 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttattttttct |
3787192 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3787193 |
attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
3787292 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
3787293 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
3787324 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9038486 - 9038297
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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|
|
| T |
9038486 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaaaatta-tgttacttttcctattatatccttaaccatttattactctctcttctttcaatt |
9038388 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9038387 |
ccttcatttatctttttcatataatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttc |
9038297 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 14304388 - 14304578
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14304388 |
tttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaattatttattactctctcttctttcaatt |
14304487 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
14304488 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
14304578 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 14499150 - 14499340
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14499150 |
tttgttccaaattatatgtcgctttacaataccattgaaacattaacgttatttttcctattatatccttaaatatttattactctctcttctttcaatt |
14499249 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14499250 |
ctttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
14499340 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31949380 - 31949190
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31949380 |
tttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttatttcaatt |
31949281 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31949280 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
31949190 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 15497842 - 15498074
Alignment:
| Q |
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15497842 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcc |
15497941 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15497942 |
tattatatccggaactatttattgctctctcttcattcaatttcttcatttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
15498041 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15498042 |
tatctctttctcacacaatattaattacatttc |
15498074 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 8201461 - 8201692
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8201461 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttctt |
8201560 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
8201561 |
attatatccttaacaatttattactttctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
8201660 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
8201661 |
atctctttcccacacaatattaattatatttc |
8201692 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12499751 - 12499520
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
12499651 |
attatatccttaactatttaatactctctcttttttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
12499552 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12499551 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
12499520 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12509150 - 12509381
Alignment:
| Q |
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| |
|
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|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
12509250 |
attatatccttaactatttaatactctctcttttttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
12509349 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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| T |
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atctctttcccacacaatattaattacatttc |
12509381 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 32609793 - 32610024
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| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
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|
| T |
32609793 |
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32609892 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
32609893 |
attataaccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaaaaactcataat |
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T |
|
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
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||| || |||||||||||||||| |||||| |
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| T |
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atcttttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 1778865 - 1779054
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||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
1778865 |
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1778963 |
T |
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232 |
Q |
| |
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| T |
1778964 |
cattcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
1779054 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 232
Target Start/End: Original strand, 21858589 - 21858758
Alignment:
| Q |
63 |
ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
162 |
Q |
| |
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| T |
21858589 |
ctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctattctttcaattccttcatttatctttcccata |
21858688 |
T |
|
| Q |
163 |
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232 |
Q |
| |
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| T |
21858689 |
tcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
21858758 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8493678 - 8493447
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100 |
Q |
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| T |
8493678 |
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8493579 |
T |
|
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
8493578 |
attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcattcatctttcccatatgatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
8493479 |
T |
|
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232 |
Q |
| |
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|||||| |||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
8493478 |
atctctttcccacaaaatattaattacatttc |
8493447 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 9461616 - 9461806
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
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9461616 |
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9461715 |
T |
|
| Q |
142 |
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232 |
Q |
| |
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| T |
9461716 |
tatttatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactaataatatatctttctcacacaatattaattatatttc |
9461806 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 24430191 - 24430381
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
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| T |
24430191 |
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24430290 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
24430291 |
ctttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttc |
24430381 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25526892 - 25526702
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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| T |
25526892 |
tttgtcctaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
25526793 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
25526792 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttc |
25526702 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 33254376 - 33254566
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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| T |
33254376 |
tttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacatttcatattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaatt |
33254475 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
33254476 |
catttatttatctttcccatattatttattgaggataattttgtaaaacaactcgtaatatctctttctcacacaatattaattacatttc |
33254566 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4981375 - 4981186
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
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| T |
4981375 |
ttgtcgcaaattatatgtcgctttacaatactaataaaatattaatgttactttttctattatgtctttaactatttattactctcttttctttcaattc |
4981276 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4981275 |
attcatttatctttctcatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaatattaattacatttc |
4981186 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 3888566 - 3888794
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| Q |
4 |
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103 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
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| T |
3888566 |
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3888665 |
T |
|
| Q |
104 |
atatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
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| T |
3888666 |
atatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcgtttatctttcacatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatc |
3888765 |
T |
|
| Q |
204 |
tcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| || |||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
3888766 |
tatttcccacacaatattaattatatttc |
3888794 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1228282 - 1228055
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Q |
| |
|
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| T |
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actccctccgtcctaaattgtatgtcactttagaagaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgaaaaattaatgttactttttct |
1228183 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
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| T |
1228182 |
attatatctttaactatttattactatctcttctttcaattccttcatttatctttctcatattatttattgaggataattttataaaacaactcataat |
1228083 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
Q |
| |
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| |||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
1228082 |
atatctttcccacacaatattaattaca |
1228055 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2603676 - 2603445
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100 |
Q |
| |
|
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|
| T |
2603676 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgtaactttttct |
2603577 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||| | || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2603576 |
attatatccttaactatttattattcttttttttttcaattcttacatttatcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
2603477 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
2603476 |
atctctttcccacacaatattaattatatttc |
2603445 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12507080 - 12506849
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||| |||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12507080 |
actccctccgtcctaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcct |
12506981 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
12506980 |
attatatccttaactatttatttctttttcttttttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
12506881 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
12506880 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
12506849 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 17941609 - 17941839
Alignment:
| Q |
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17941609 |
actccctccgtcccaaattgtatatcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaataaaa-attaatgttacttttcct |
17941707 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
17941708 |
attatattcttaactatttattactatctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttgttaaggacaattttataaaacaattcataat |
17941807 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
17941808 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
17941839 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 20605570 - 20605801
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
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| T |
20605570 |
actccctccgtcccaaattgtatttcgttttaggaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcct |
20605669 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
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| T |
20605670 |
attataaccttaactatttattaatctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatgttatttattaaggataattttataaaacaactcataat |
20605769 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||| |
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| T |
20605770 |
atctcttttctacacaatattaattgcatttc |
20605801 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Original strand, 12058572 - 12058799
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3 |
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102 |
Q |
| |
|
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| T |
12058572 |
tccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctat |
12058671 |
T |
|
| Q |
103 |
tatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
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| T |
12058672 |
tatatccttaattatttatt--tctctcttctttcaattctttcatttatctatctcatatcatttattaaggacaactttgtaaaacaactcataatat |
12058769 |
T |
|
| Q |
203 |
ctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| ||| || |||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
12058770 |
cactttccaacacaaaattaattacatttc |
12058799 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #53
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| |
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| T |
14311006 |
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14310907 |
T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
14310906 |
ctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattatatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
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Target Start/End: Complemental strand, 15989828 - 15989638
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42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
15989828 |
tttgtcccaaattgtatgtcattttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattaatctttcttatttcaatt |
15989729 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15989728 |
ctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacatagtattaattacatttc |
15989638 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 17360641 - 17360831
Alignment:
| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
17360641 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcatattatatccttaactatctattactctttcttttttcaatt |
17360740 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17360741 |
ctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctctttctcacacaatattaattacatttc |
17360831 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30739391 - 30739201
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
30739391 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgatacattaatattatttttcctattatattcttaactatttattactctttcttttttcaatt |
30739292 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30739291 |
ctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
30739201 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 6850053 - 6850242
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6850053 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaatactaatgcagcattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaatta |
6850152 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6850153 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacaaaatattaattgcatttc |
6850242 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 29901195 - 29901427
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| Q |
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| | |
|
|
| T |
29901195 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttaggagaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattattgttactttttc |
29901294 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29901295 |
aattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaatgcataa |
29901394 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29901395 |
tatctattttccacacaatattaattgcatttc |
29901427 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 31003946 - 31004136
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
31003946 |
tttgtcccaaattatatgtcattttacaatagcaatgaaacattaatgttactttttcgattatatcattaagtatttattactctttcttccttcaatt |
31004045 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31004046 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttctcacacaatattaattacatttc |
31004136 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 32142376 - 32142605
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
32142376 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcct |
32142475 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32142476 |
attatatccttaactatttattactctatctt-tttcatttccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
32142574 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
| | || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32142575 |
atatttttcccacacaatattaattacattt |
32142605 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 76 - 232
Target Start/End: Original strand, 31503923 - 31504079
Alignment:
| Q |
76 |
atgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaagg |
175 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31503923 |
atgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaagg |
31504022 |
T |
|
| Q |
176 |
ataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31504023 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattatatttc |
31504079 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 19098561 - 19098750
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19098561 |
tttgttccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattgctctctcttcattcaatt |
19098660 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19098661 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaac-cataatatctctttcccatacaatattaattacatttc |
19098750 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 29344018 - 29344207
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29344018 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactttctcttctttcaatt |
29344117 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29344118 |
ctttcatttatctttccca-attattcattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttc |
29344207 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 51 - 232
Target Start/End: Original strand, 5489633 - 5489814
Alignment:
| Q |
51 |
aattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcattt |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5489633 |
aattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaactatttattactttatcttctttcaattatttcattt |
5489732 |
T |
|
| Q |
151 |
atcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5489733 |
atctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacaaaatattaattgcatttc |
5489814 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 225
Target Start/End: Original strand, 16970461 - 16970642
Alignment:
| Q |
44 |
tgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattat |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
16970461 |
tgtcccaaatgatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctgttataaccttaaatatttattactctctcttctttcagttct |
16970560 |
T |
|
| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16970561 |
ttcatttatctttctcatattatttattaaggataattttgtaaaccaactcataatatctcttttccacacaatattaatt |
16970642 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28075253 - 28075069
Alignment:
| Q |
48 |
ccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
28075253 |
ccaaattatatgtcgctttacaatacctatgcaacattaatattacttttcctattataaccttaaatatttattactctctcttctttcaattctttta |
28075154 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
28075153 |
ttgatcttttccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatatttattgcatttc |
28075069 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Original strand, 1228444 - 1228627
Alignment:
| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
1228444 |
caaattgtatgtcactttacaatatcaataaaacattaatgttatttttccgattatatccttaagtatttattactctttcttccttcaattctttcat |
1228543 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1228544 |
ttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataacatctctttcccacacaatattaattacatttc |
1228627 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6792013 - 6791822
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
6792013 |
tttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatatcttctttcaatt |
6791914 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct-cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6791913 |
ctttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttttcacacaatattaattgcatttc |
6791822 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30511035 - 30510804
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| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30511035 |
actctctccgtcccaaattgtatgtcactttggaaaaaaattttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcct |
30510936 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30510935 |
attatatccttcactatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctttcccatttcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
30510836 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30510835 |
atctctttcccatacaaaattaattacatttc |
30510804 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 3337423 - 3337604
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
3337423 |
tttgtctcaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttc-------- |
3337514 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
3337515 |
-tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacagtattaattacatttc |
3337604 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 11000411 - 11000598
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
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| T |
11000411 |
ttgtcccaaattatatatcgctttacaataccaatgcaacaataatgttactttttctattataaccttaattatttattactctttattctttcaatta |
11000510 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11000511 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacatctcataatatctttt--ccacacaatattaattgcatttc |
11000598 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27080572 - 27080383
Alignment:
| Q |
43 |
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142 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |
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| T |
27080572 |
ttgtcctaaattatatgtcactttgcaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcactaactattcattactctctcttcttttaattc |
27080473 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
27080472 |
tttcatttatctttcacatatcatttattaagaacaattttgtaaaacaactcatattatctttttcccacacaaaattaattacatttc |
27080383 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 30240249 - 30240438
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
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| T |
30240249 |
ttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatttccttcactatttattaccttctctactctcaagtc |
30240348 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30240349 |
attcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttc |
30240438 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Original strand, 7358515 - 7358698
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| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
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||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
7358515 |
caaattatatgtcactttacaatatcaatcaaacattaatgttactttttttattatattcttaattatttattactttttcttctttcaattctttcat |
7358614 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7358615 |
ttatttttcccatatcatttattaaggaaaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatataaattacatttc |
7358698 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 129 - 232
Target Start/End: Original strand, 14386592 - 14386695
Alignment:
| Q |
129 |
tcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14386592 |
tcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattaca |
14386691 |
T |
|
| Q |
229 |
tttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
14386692 |
tttc |
14386695 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35040115 - 35039884
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35040115 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttgaaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacatttcct |
35040016 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
35040015 |
attatatccttcactatttattgcattctctacttccaagtcattcatttatctttcacatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
35039916 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35039915 |
atttctttcccacacaaaattaattacatttc |
35039884 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 232
Target Start/End: Original strand, 200118 - 200272
Alignment:
| Q |
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177 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||| | ||||||||||| |
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| T |
200118 |
gaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattattctttcttttttcaattctttcattcatctttctcatatcaattattaaggat |
200217 |
T |
|
| Q |
178 |
aattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
200218 |
aattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
200272 |
T |
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Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 232
Target Start/End: Original strand, 4657877 - 4658034
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| Q |
74 |
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173 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
4657877 |
caataaaacattaacgttacttt-cctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatcttttctatatcatttattaa |
4657975 |
T |
|
| Q |
174 |
ggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4657976 |
ggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttc |
4658034 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6335181 - 6335003
Alignment:
| Q |
45 |
gtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatt |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
6335181 |
gtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttatta--ctctcttatttcaattctt |
6335084 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6335083 |
tcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcccttttccacacaatattaatt |
6335003 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 11130157 - 11130346
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
11130157 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttattttgcttattataaccttaactatttattactttatcttctttcaattc |
11130256 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11130257 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttttaatatcttttttccacgcaatattaattgcatttc |
11130346 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 29818226 - 29818415
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29818226 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttagaatatcaatgcaacattaatcttactttttctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattc |
29818325 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29818326 |
tttcatttatttttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttc |
29818415 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7245924 - 7245744
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| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7245924 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatcttatttttcctattatatctttaactatttatt--gctctcttctttcaattcattcat |
7245827 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7245826 |
ttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaacttataatatctctt-atcacacaatattaattacatttc |
7245744 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 185
Target Start/End: Original strand, 6833788 - 6833931
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6833788 |
tttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattattatctcttctttcaatt |
6833887 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgt |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6833888 |
atttcatttatcttttccatgttatttattaaggacaattttgt |
6833931 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 8550168 - 8550394
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| Q |
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgcttt-ggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgcttt-acaataccaatgaaatattaatgttacttttc |
98 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8550168 |
actccctctgtcccaaattgtatgtcgctttaggagaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgcttttataatacccatgcaatattaatgttacttttc |
8550267 |
T |
|
| Q |
99 |
ctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcata |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8550268 |
caattataaccttaattatttattactccttcttctttcaattctttcatttttctttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcata |
8550367 |
T |
|
| Q |
199 |
atttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8550368 |
atatctattttccacacaatattaatt |
8550394 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Original strand, 32588679 - 32588908
Alignment:
| Q |
3 |
tccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctat |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
32588679 |
tccctccgtcctaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaagctttaatgttattttttctat |
32588778 |
T |
|
| Q |
103 |
tatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||| ||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
32588779 |
tatatccttaactatttactactttctcttcttccaagtcattcatttatctttcctatatcatttactaatgacaattttgtaaaacaattcataatat |
32588878 |
T |
|
| Q |
203 |
ctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
32588879 |
ccctttcccacacaaaattaattacatttc |
32588908 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 78387 - 78224
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| Q |
69 |
aataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaattt |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
78387 |
aataccaatgcaacattaatgtcacttttccgattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattattt |
78288 |
T |
|
| Q |
169 |
attaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
78287 |
attaaggacaattttgtaaaacaacccataatatcttttttccacacaatattaattgcatttc |
78224 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10364709 - 10364502
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
10364709 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaatt |
10364610 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatctttt-----------------ccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaat |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10364609 |
ctttcatttatctttttctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaat |
10364510 |
T |
|
| Q |
225 |
tacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
10364509 |
tacatttc |
10364502 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17275476 - 17275301
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
17275476 |
aaattatatgtcgctttacaatatcagtgcaacattaatgttatttttcctattataactttaactatttattactctctcttcttttaattctttcatt |
17275377 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
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|
|
| T |
17275376 |
tatgtttcccatataatttattaaggacaagtttgtaaaacaactaataatatctattttccacacaatattaatt |
17275301 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 30238810 - 30239041
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| |||| |||| ||||| |||| || |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
30238810 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaattgttccaaattatatgtcgttttaaaatactaatgcaacattaatgttatttttcct |
30238909 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||| |||| |
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| T |
30238910 |
attataaccttaattatttattactctctcttttttcaattttttcatttatcttttccatattatttattaagaacaaatttgtaaaacaactcttaat |
30239009 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
30239010 |
atctctttttcacgcaaaattaattaaatttc |
30239041 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5609522 - 5609335
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43 |
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142 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| | |
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| T |
5609522 |
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T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
5609424 |
tttcatttatttttcccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatcattttcccacataaatttaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 18105679 - 18105855
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| Q |
54 |
tataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatc |
153 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||| |
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| T |
18105679 |
tatacgtcgctttacaatacta-tgaaatattaatgatattttttctattatatccttcactatttattactctttttt-tttcaattccatcatttatc |
18105776 |
T |
|
| Q |
154 |
ttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18105777 |
tttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaaatacatttc |
18105855 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 16465858 - 16466046
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
16465858 |
tttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaatattaatgttattttttctattataaccttagtaatttattactctatcttctttcaatt |
16465957 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa-tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16465958 |
ctttcatttattttttctat---atttattaaagacaattttataaaacaactcataagtatctcttttccacacaatattaattacatttc |
16466046 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 10133724 - 10133905
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| Q |
50 |
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149 |
Q |
| |
|
||||| || ||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||| |
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|
| T |
10133724 |
aaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacaatcatgttactttttctattacatccttaactatttattactctttctt-tttcaattctttcatt |
10133822 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10133823 |
tatctttcttatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatttctttcccacacaatatcaattacatttc |
10133905 |
T |
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Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 29455394 - 29455574
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| Q |
43 |
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142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
29455394 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcagcattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactttctcttc--------- |
29455484 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29455485 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaactactcataatatctctttttcacacaatattaattgcatttc |
29455574 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7885318 - 7885150
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| Q |
64 |
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163 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
7885318 |
tttacaataataataaaacattaatgttactttttctattatatcattagctatttattactctctcttctttcaattatttaatttatctttcttatac |
7885219 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
7885218 |
tatttattaaggacaattttgtaaaataactaataatatctcttttccatacaaaatgaattacatttc |
7885150 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1114594 - 1114443
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1114594 |
actccctccgtcccaaattgtacgtgactttagaaaaaatatttgtcccaaattatacgtcgctttacaattccaatgaaacattaatgttatttttcct |
1114495 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttat |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1114494 |
attatatccttaactatttattactctctcttttttcaattccttcatttat |
1114443 |
T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 232
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| Q |
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183 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19687924 |
ttaacgttacttttcctattagatccttaactatttaata----ctcttcttttaattttttcatttatttttcccatataatttattaaggataatttt |
19687829 |
T |
|
| Q |
184 |
gtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19687828 |
gtaaaacaactcataatatctttttccaacacaatattaattacatttc |
19687780 |
T |
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Target: chr6; HSP #98
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Query Start/End: Original strand, 43 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4148309 - 4148191
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142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4148309 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatacgaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttatta--ctctcttctttcaattc |
4148212 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatac |
163 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4148211 |
ttttatttatcttttccatac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21072207 - 21072050
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| Q |
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142 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
21072207 |
ttgtcctaaatcatatgtcattttgcaataccaatgaagaattaatattactttttctattatatccgtagctatttattactctctcttctttcaaatc |
21072108 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21072107 |
tttaatttatctttctcataccatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
21072050 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
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Target Start/End: Original strand, 290387 - 290537
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caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |
|
|
| T |
290387 |
caaataatatgtcgctttacaataccaatgaac-attaattttattttttatattatatctttaactatttattactctctcttctttcaactctttaat |
290485 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
290486 |
ttttctttttcataccatttattaaggacgattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31872818 - 31872661
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44 |
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143 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
31872818 |
tgtcccaaattatactttgctttaaaatatcaatgaagcattaatgctatttttcttattatattcttaactatttataactcactcttctttcaatttt |
31872719 |
T |
|
| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatt |
201 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31872718 |
tttatttatctttctcataccatttattaaagataattttgtaaaataactcataatt |
31872661 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #102
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cttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttc |
208 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
17441915 |
cttaattatttattactatctcttctttcaattatttcttttatcattcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatctcttt |
17442014 |
T |
|
| Q |
209 |
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232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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cccacacaatattaattatatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #103
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caataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatt |
167 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
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caataccaatgaagaattaatattattttttctattatatccgtagctatttattactctcacttctttcaaatctttaatttatctttctcataccatt |
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T |
|
| Q |
168 |
tattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21047362 |
tattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #104
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108 |
ccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | | || |
|
|
| T |
10027874 |
ccttaactatttattactctctcttctttcgattctttcatttatcttttccatattatttattaagaataattttgtaaaacaattcataatatttttt |
10027973 |
T |
|
| Q |
208 |
ccccacacaatattaatt |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
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Target: chr6; HSP #105
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158 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || | |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| | ||||||||||||| | |
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|
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34219132 |
gtcgttttacaataccaatgaatcattaatattatttcttctattatatccttaactatttattactttatctcctttcatgtgattcatttatcttt-c |
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T |
|
| Q |
159 |
catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
34219033 |
catatcatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttctcacacaaaagtaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #106
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| |
|
|||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |
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|
| T |
690499 |
tttgtcccaaattatatgttactttataataccaatgaaacattaatgttactttt-ctattataaccttaactatttattactctcttttctttcaagt |
690401 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
690400 |
tttttatttatctttttaat-----------aggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattatatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
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|
| T |
33841290 |
caaattatatatcgctttacaatac----gaaacattaatattactttttctattatattcttaactatttattactttttttt--ttcaattctttaat |
33841383 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
33841384 |
ttatctttctcgtaccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatttctttcccacacaaaattaattatatttc |
33841467 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13587102 - 13586944
Alignment:
| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||| ||| | ||||||| | |
|
|
| T |
13587102 |
tttgtcccaaattataaatcactttacaaaaccagtgaaatagtaatgttgatttttctattataacctaaactatttattactttctatcctttcaaat |
13587003 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13587002 |
ctttaatttatctttctcataatatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataat |
13586944 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 31858246 - 31858436
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |
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|
| T |
31858246 |
tttgtcccaaattatatatcgtattaaaatatcaatgaaatattaatgttattttttttattatatccttaactatttattactacctcttcattcaatt |
31858345 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| || ||||||||||| |||| |||| |||| ||||| |||||| || |||| ||||||| |||||| |
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| T |
31858346 |
atttaatttatctttctcatatcatctattaaggatagttttttaaagcaacatataatatctcttattcatacaaaattaattgcatttc |
31858436 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11213617 - 11213504
Alignment:
| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11213617 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataactttagttatttattactctcttttctttcaattctttcat |
11213518 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccata |
162 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |
|
|
| T |
11213517 |
ttatctttcccata |
11213504 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9225650 - 9225462
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| | |
|
|
| T |
9225650 |
ttgtcccaaattgtgtgtcgctttacaataccaatgaagcattaatgttatttttcatattatatccttaactatttactactttctcttcttccaagtc |
9225551 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccata-caatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9225550 |
attaatttatctttctcatatcaatt--ctaaggacaattttgtaaaacagttcataatatccattttccacacaaaattaattacatttc |
9225462 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 232
Target Start/End: Original strand, 11173321 - 11173464
Alignment:
| Q |
89 |
gttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaa |
188 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
11173321 |
gttactttttctattataaccttaactatttattactctatcttatttcaattcttacatttatttttctcatattatttattaagtacaagtttgtaaa |
11173420 |
T |
|
| Q |
189 |
acaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
11173421 |
acaactcataatatctcttttccacacaaaattaattatatttc |
11173464 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Original strand, 32614634 - 32614787
Alignment:
| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||| | ||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
32614634 |
caaattataagtcattttacaataccgatgaaatactaatgatattttttttcttacacccttaactttttattaatctctcttctttcaattctttaat |
32614733 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32614734 |
ttatctttctcttatcatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataattt |
32614787 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 200
Target Start/End: Original strand, 35030388 - 35030545
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
35030388 |
ttgtcccaaattaaaagctgttttacaattccaatgaaatatcaatgttacttttcctattataccattaattatttattactctctttactttcaattc |
35030487 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||| |||||||| | ||||| || |||||| || ||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35030488 |
tttaatttatctctcacataccatgtattaatgaaaatttcataaaataactcataat |
35030545 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7897009 - 7896836
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
7897009 |
tttgttccaaattatatgt-gctttgcaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttct------- |
7896918 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | || ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7896917 |
--ttcatttatatttctcatattatttattaaggaaaattttgtaaaacaacccataatatattttttccacataatattaatt |
7896836 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 3331776 - 3331957
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| || |||||| |||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
3331776 |
aaattatatatcgttttaaaataccaataaaaatttaatgttattttttctattatattattacctatttctttctctcttttcttttaatt-tttaatt |
3331874 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3331875 |
tacctttttcataccatttattaaagataactttgtaaaacaactcataatatctattttccatacaaaattaattacatttc |
3331957 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 7595903 - 7596089
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| Q |
44 |
tgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattat |
143 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||| || |||||| ||||| ||||||||| | || |||| |||| | | ||||||||||||| | |
|
|
| T |
7595903 |
tgtcctaaattatatgtcactttacaatatcaataaaacatcaatgttttttttc-tattatatcttgaattatttattattatatcttctttcaattct |
7596001 |
T |
|
| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| | | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7596002 |
ttaatttatctttccgacaccatttattaaggaaaattgtgtaaaacaactcataatatttctttatcatacaaaattaattacattt |
7596089 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22816335 - 22816185
Alignment:
| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattact---ctctcttctttcaattattt |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | |||| ||| ||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
22816335 |
caaattataattcgctttacaataccaatgagacattagtattacatttttaattatattcttaattagttattactgatctctcttctttcacttcttt |
22816236 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactca |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22816235 |
aatttatcttttccatatcgtttattaagaacaattttgtaaaacaactca |
22816185 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31712746 - 31712564
Alignment:
| Q |
51 |
aattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcattt |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||| || ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
31712746 |
aattataagtcgctttaaaatatcaatggaacattaattttactttttctcttatacttttagctatttattactctatcttctttcaattctttaattc |
31712647 |
T |
|
| Q |
151 |
a-tcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| | |||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||| | || | | |||||||||||||| |
|
|
| T |
31712646 |
atttttttgcataacatttattaagaatagttttgtaaaacatttcataatatctctttctcatatacaattaattacatttc |
31712564 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 118
Target Start/End: Original strand, 17441698 - 17441774
Alignment:
| Q |
42 |
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118 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
17441698 |
tttgtctcaaattatatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatattcttaattatt |
17441774 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25509950 - 25509846
Alignment:
| Q |
127 |
tctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| | || |||| |||||||| |
|
|
| T |
25509950 |
tctcttcttttaattctttaatttatctttctcataccatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataacatgtctttctcatacaaaattaatta |
25509851 |
T |
|
| Q |
227 |
cattt |
231 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
25509850 |
cattt |
25509846 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12278579 - 12278476
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| Q |
129 |
tcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| || | |
|
|
| T |
12278579 |
tcttctttcaattctttcgtttatctttctcatatcatttattatggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccatacaatattaagtata |
12278480 |
T |
|
| Q |
229 |
tttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
12278479 |
tttc |
12278476 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 126
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| Q |
63 |
ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactc |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12278968 |
ctttacaataccaatgaaacattaattttacttttcctattatatctttaactatttattactc |
12278905 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30662476 - 30662363
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| Q |
89 |
gttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt--atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgta |
186 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30662476 |
gttatttttcctatcatatctttaactatttattactctctcctcttttaattttatttattttatctttcgtatgtcatttattaaggataattttgta |
30662377 |
T |
|
| Q |
187 |
aaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
30662376 |
aaacaactcataat |
30662363 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #125
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Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Original strand, 290824 - 290896
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| Q |
159 |
catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | || | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
290824 |
catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcgtaatatatttttctcacacaaaattaattacattt |
290896 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26046345 - 26046241
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127 |
tctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| | || |||| |||||||| |
|
|
| T |
26046345 |
tctcttcttttaattctttaatttatcattctcataccatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataacatgtctttctcatacaaaattaatta |
26046246 |
T |
|
| Q |
227 |
cattt |
231 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
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cattt |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31560504 - 31560328
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| Q |
49 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31560504 |
caaattatatgtcgatttgcaataccaatgaagaattaattttactttt-ctattatatcttcaactat---ttattctctcttctttcaattttttcat |
31560409 |
T |
|
| Q |
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ttatcttttccata---caatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
|
||||| || |||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | | || |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31560408 |
ttatcgttaacatattttcatttattaaggacaaatttgtaaaacaacgtataatatattttttccacacaaaattaatta |
31560328 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2452091 - 2451980
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
2452091 |
aaattataagtcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttactttt--ttctacaccattaactatttattacattctcttccttcaatt-tttaatt |
2451995 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccataca |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
2451994 |
tatcttttccataca |
2451980 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 32243205 - 32243386
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaa-tgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||| ||| |||| || |||||| || ||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
32243205 |
aaattataagtcg-tttgcaataccaatgaagtattaaatactactttttctactataccctcaactgtttattactatcatttctttcaattctttaat |
32243303 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| | | |||||||||||| || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32243304 |
ttatctttcatgtaccattaatgaaggataattttgtaaaattatttataatttctctttttcatacaacattaattacattt |
32243386 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 132
Target Start/End: Original strand, 24718320 - 24718409
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctctt |
132 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
24718320 |
ttgtcctaaattatatgtcattttacaatatcaataaaacattattgttacttttcttattatacccttaactatttactactctctctt |
24718409 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Original strand, 2311582 - 2311653
Alignment:
| Q |
136 |
tcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2311582 |
tcaataatttcacttatatttcacatataatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctctt |
2311653 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4147928 - 4147860
Alignment:
| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaa-ctcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4147928 |
atttattaaggacaattttgtaaaaaaaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
4147860 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 213
Target Start/End: Original strand, 2309499 - 2309553
Alignment:
| Q |
159 |
catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccac |
213 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
2309499 |
catataatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccac |
2309553 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 192
Target Start/End: Original strand, 24719644 - 24719710
Alignment:
| Q |
126 |
ctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24719644 |
ctctcttctttcaattgtttaatttatgtcttcgatactatttattaaggacgattttgtaaaacaa |
24719710 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6087137 - 6087084
Alignment:
| Q |
147 |
atttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6087137 |
atttatttttttcatacaaattaataaggacaattttgtaaaacaactcataat |
6087084 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 125
Target Start/End: Original strand, 290737 - 290813
Alignment:
| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattact |
125 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||| |
|
|
| T |
290737 |
caaattatatgtttctttacaatatcaatgaagcattaatgttacttttcatattatataattaattatttattact |
290813 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 78566 - 78531
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatg |
78 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
78566 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatg |
78531 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1114438 - 1114399
Alignment:
| Q |
193 |
ctcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1114438 |
ctcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
1114399 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 200
Target Start/End: Original strand, 22529896 - 22530045
Alignment:
| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||| |||| |||| ||||| |||||| |||| |||| ||| || | ||| |||| ||| || |
|
|
| T |
22529896 |
caaattataagtcactttaaaatatcaataaaacattaatattacctttctcattatgcccttaattatttattattctatcct-ttttaattctttaat |
22529994 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
22529995 |
ttat-ttttacataacttttattaaggacaattttgtaaaacaccttataat |
22530045 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 3982867 - 3982961
Alignment:
| Q |
132 |
tctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||||| |
|
|
| T |
3982867 |
tctttcaattatttaatttatcttttctatattatcaatgaagaataattgtataaaataacttataatttctctttctcttacaatattaatta |
3982961 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 232
Target Start/End: Original strand, 24660184 - 24660317
Alignment:
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaat--tatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcata |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| || ||||||| | | ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
24660184 |
attatatccttaactatttattaatttctcttctttcaattctttttaatttatctttcttatatcatatattaagtacagttttgtaaaacaattcaga |
24660283 |
T |
|
| Q |
199 |
atttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| |||||| || |||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
24660284 |
atatctctttaacatacaaaattacttacatttc |
24660317 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 6087337 - 6087276
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta |
104 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6087337 |
ttgtctcatattataaatcgttttacaatatcaataaaacattaatgttacttttcatatta |
6087276 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 84
Target Start/End: Original strand, 31503699 - 31503740
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatat |
84 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31503699 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatat |
31503740 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 6335244 - 6335212
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttgg |
33 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6335244 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttgg |
6335212 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 182)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 19712487 - 19712714
Alignment:
| Q |
5 |
cctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19712487 |
cctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcctaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta |
19712586 |
T |
|
| Q |
105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19712587 |
tatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
19712686 |
T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19712687 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
19712714 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 2914425 - 2914655
Alignment:
| Q |
2 |
ctccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttccta |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2914425 |
ctccctccgtcccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttccta |
2914524 |
T |
|
| Q |
102 |
ttatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2914525 |
ttatatccttaactattaattaccctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatt |
2914624 |
T |
|
| Q |
202 |
tctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2914625 |
tctcttccccacacaatattaattacatttc |
2914655 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 9641024 - 9641251
Alignment:
| Q |
5 |
cctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta |
104 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9641024 |
cctctgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta |
9641123 |
T |
|
| Q |
105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9641124 |
tatctttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttca |
9641223 |
T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9641224 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
9641251 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 22510401 - 22510632
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22510401 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcat |
22510500 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22510501 |
attatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
22510600 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22510601 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
22510632 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24781245 - 24781014
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24781245 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
24781146 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24781145 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
24781046 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24781045 |
ttctcttccccgcacaatattaattaaatttc |
24781014 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 32706732 - 32706963
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32706732 |
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32706831 |
T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
32706832 |
attatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccatgccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
32706931 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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T |
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Target: chr5; HSP #7
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Target Start/End: Complemental strand, 38394407 - 38394176
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T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
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Target Start/End: Original strand, 39527432 - 39527663
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Q |
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T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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attatatccttaactattaattactctcccttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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39527632 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr5; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21195316 - 21195086
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Q |
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T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 18048617 - 18048806
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Q |
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T |
|
| Q |
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
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Target: chr5; HSP #11
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Q |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
4431712 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
4431713 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
4431744 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 29665315 - 29665546
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| |
|
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|
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29665415 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataat |
29665514 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
29665515 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34900239 - 34900050
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T |
|
| Q |
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
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T |
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Target: chr5; HSP #14
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11248019 |
T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11248120 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
11248151 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18026180 - 18025949
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| Q |
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| |
|
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|
|
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18026081 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attctatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttacataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
18025981 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18025980 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
18025949 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 8035785 - 8035975
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Q |
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|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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8035884 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
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8035885 |
atttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatacaatattaattacatttc |
8035975 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 32833565 - 32833795
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Q |
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
32833665 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
32833764 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32833765 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
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104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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cctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta |
440022 |
T |
|
| Q |
105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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tatctttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatatcatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttct |
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T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
439921 |
cttccccacgtaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 7458577 - 7458808
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Q |
| |
|
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|
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7458677 |
attatatctttaactattaattaccctattttctttcaattatttcatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
7458776 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7458777 |
ttatcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcttaaattatatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
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T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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attatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
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ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
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| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
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T |
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Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9577709 - 9577523
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144 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9577709 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctattctttcaattatt |
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T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
9577609 |
tcatttatcttttccatac-atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
9577523 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 40555070 - 40555301
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Q |
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T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaactattaattactctctcttttttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
40555269 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
40555270 |
ttctcttcctcacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 5070780 - 5071015
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
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5070879 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac----aatttattaaggataattttgtaaaacaactca |
196 |
Q |
| |
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|
| T |
5070880 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttaatttatcttttccataccatttatttattaaggataattttgtaaaacaactca |
5070979 |
T |
|
| Q |
197 |
taatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
5070980 |
taatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr5; HSP #24
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Target Start/End: Original strand, 32292454 - 32292685
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Q |
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
32292554 |
attatattcttaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
32292653 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
32292654 |
ttctcttctccacacaatattaattatatttc |
32292685 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 39932812 - 39933042
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| Q |
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100 |
Q |
| |
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| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcct |
39932910 |
T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttgactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttctcataccatttattaaggataattttgtaaaataactcataat |
39933010 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
39933011 |
ttctcttccccacacaatattaattatatttc |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5847085 - 5846856
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Q |
| |
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|
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5847085 |
actccctccgtcctaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgttttataatactaatgaaatattaatgttacttttcct |
5846986 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
5846985 |
attatatccttaactattaattactctct--tctttcaattattttatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
5846888 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
5846887 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
5846856 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33630010 - 33629776
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| Q |
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97 |
Q |
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| T |
33630010 |
actccctcagtcccaaattgtatgtcgttctggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataataccaataaaatattaatgttactttt |
33629911 |
T |
|
| Q |
98 |
cctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcat |
197 |
Q |
| |
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| T |
33629910 |
cctattatatccttaactattaattactctctattctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcat |
33629811 |
T |
|
| Q |
198 |
aatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
33629810 |
aatttctcttccccacacaatattaatttcatttc |
33629776 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40365572 - 40365341
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |
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|
| T |
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actccctccgttccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcat |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
40365472 |
attatatccttaattattaattactctctcttcttttaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
40365373 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
40365372 |
ttctcttccccatacaatattaattacatttc |
40365341 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 4744706 - 4744936
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| Q |
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100 |
Q |
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|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4744706 |
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4744804 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4744805 |
attatatctttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttcctataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
4744904 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
4744905 |
ttattttccccacacaatattaatgacatttc |
4744936 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27535094 - 27534866
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100 |
Q |
| |
|
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|
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27534995 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27534994 |
attatatcattaactattaattactctctcttcttttaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
27534895 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacat |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
27534894 |
ttctcttccccacgcaatattaattacat |
27534866 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35584994 - 35584758
Alignment:
| Q |
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95 |
Q |
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|
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|
|
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaataaaatatttatgttactt |
35584895 |
T |
|
| Q |
96 |
ttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactc |
195 |
Q |
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| T |
35584894 |
ttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactc |
35584795 |
T |
|
| Q |
196 |
ataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
35584794 |
ataatttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
35584758 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10934989 - 10934802
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144 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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gtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaactattaattactccctcttctttcaattatt |
10934890 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10934889 |
tcatttattttttccatatcatttattagggataattttgtaatacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2620280 - 2620090
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142 |
Q |
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|
||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
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2620280 |
ttgtcacaaattatatgtcgctttacaaaaccaatgaaatattaacgttacttttcctattatatgcttaactattaattacttcctcttctttcaatta |
2620181 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttatt-aaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
2620180 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctaccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24520613 - 24520422
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| Q |
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142 |
Q |
| |
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24520613 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttataataccaattaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctcccttctttcaatta |
24520514 |
T |
|
| Q |
143 |
ttt---catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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|
| T |
24520513 |
ttttttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 4456394 - 4456625
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
4456394 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
4456493 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
4456494 |
attatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
4456593 |
T |
|
| Q |
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ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
4456594 |
atctctttcccatacaatattaattacatttc |
4456625 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14640237 - 14640050
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| |
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| T |
14640237 |
ttgtcctaaattatatgttgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctct--tctttcaatta |
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T |
|
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143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
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| T |
14640139 |
tttcacttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttctccacgcaatattaattacatttc |
14640050 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 39630555 - 39630744
Alignment:
| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39630555 |
tttgtcctaaattatatgtcgttttacgatactaatgaaatattgatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttcttataatt |
39630654 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39630655 |
atttaatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt-cccacacaatattaattacatttc |
39630744 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 18652252 - 18652436
Alignment:
| Q |
48 |
ccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18652252 |
ccaaatgatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatctccttgactattaattaccctctcttctttcaattatttca |
18652351 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18652352 |
tttatctttctcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcatgatttctcttccccatacaatattaattatatttc |
18652436 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36302539 - 36302308
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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actccctctgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcct |
36302440 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36302439 |
attatatccttaactatttattactctcttttctttcaattccttcatttatttttcccatataatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
36302340 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36302339 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
36302308 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21582753 - 21582567
Alignment:
| Q |
46 |
tcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattt |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21582753 |
tcccaaattatatattgttttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatcattaattattaattactccctcttctttcaattattt |
21582654 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21582653 |
catttatcttttccataccatttattaagcataattttgtaaaacaactcctaatttctcttccccacacaatattaattatatttc |
21582567 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39729800 - 39729610
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39729800 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctcttttctttcaatt |
39729701 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39729700 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
39729610 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5378246 - 5378015
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5378246 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcct |
5378147 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5378146 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcctatattatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
5378047 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5378046 |
atctatttcccacacaatattaattacatttc |
5378015 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7363378 - 7363147
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7363378 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctatacaataccaatgaaaatttaatgttatttttcct |
7363279 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7363278 |
attatatctttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataat |
7363179 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7363178 |
atctctttcccacacaatattaattacttttc |
7363147 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12360788 - 12361019
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
12360788 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttctt |
12360887 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12360888 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
12360987 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12360988 |
attactttcccacacaatattaattacatttc |
12361019 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 29816205 - 29816436
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
29816205 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcct |
29816304 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29816305 |
attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
29816404 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29816405 |
atctctttccaacacaatattaattacatttc |
29816436 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 20495479 - 20495669
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
20495479 |
tttgtcccaaattatatgtcactttagaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactttttcttttttcaatt |
20495578 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20495579 |
ctttcatttatcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatctttcccacacaatattaattacatttc |
20495669 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Original strand, 35288157 - 35288346
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35288157 |
tttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaatt |
35288256 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35288257 |
atttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcattt |
35288346 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 35189178 - 35189407
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcct |
35189277 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attatatccttaactatttattactct--cttctttcaattcattcatttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
35189375 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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Alignment:
| Q |
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99 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaaatgaaaaattaatgttacttttcc |
35870029 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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tattatatgcttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
35870129 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35870130 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttc |
35870162 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27187493 - 27187262
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
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actccctccgtcctaaattgtatgtcactttggaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
27187393 |
attatatccttaactatttattgatctctcttctttcaaatccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
27187294 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27187293 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
27187262 |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27293579 - 27293348
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100 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27293479 |
attatatccttaacaatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27293379 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34607076 - 34606845
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Q |
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34606977 |
T |
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101 |
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200 |
Q |
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34606976 |
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34606877 |
T |
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201 |
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232 |
Q |
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| T |
34606876 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr5; HSP #53
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Target Start/End: Complemental strand, 36347487 - 36347256
Alignment:
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Q |
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T |
|
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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| Q |
201 |
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232 |
Q |
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atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4047842 - 4047652
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Q |
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T |
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| Q |
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232 |
Q |
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tcttcatttatctttccaatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 43359694 - 43359884
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Q |
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T |
|
| Q |
142 |
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232 |
Q |
| |
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| T |
43359794 |
ccttcatttatctttctcatattatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacgatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #56
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Target Start/End: Complemental strand, 19282722 - 19282492
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Q |
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T |
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199 |
Q |
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T |
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| Q |
200 |
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232 |
Q |
| |
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tatctcttttccacataatattaattgcatttc |
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Target: chr5; HSP #57
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36302877 |
T |
|
| Q |
100 |
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199 |
Q |
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| T |
36302876 |
tattataaccttaactatttattactctatcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
36302777 |
T |
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| Q |
200 |
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225 |
Q |
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36302776 |
tatctcttttccacacaatattaatt |
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T |
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Target: chr5; HSP #58
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttt-tccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
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10370747 |
T |
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| Q |
200 |
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232 |
Q |
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| T |
10370748 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttc |
10370780 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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T |
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200 |
Q |
| |
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attatatccttaactatttattactctct--tctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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| Q |
201 |
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232 |
Q |
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| T |
27807823 |
atctcttttccacacaatattaattacatttc |
27807792 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 34163123 - 34163355
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100 |
Q |
| |
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34163123 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
34163222 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaagg-ataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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| T |
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34163322 |
T |
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| Q |
200 |
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232 |
Q |
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34163323 |
tatctctttaccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr5; HSP #61
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Q |
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T |
|
| Q |
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204 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
205 |
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232 |
Q |
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| T |
9246230 |
cttttccgcacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #62
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| |
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T |
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| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
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9461558 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
9461559 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #63
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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Q |
| |
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actccctccgtcccaaattgtatgttactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
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| T |
11130252 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
11130351 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
11130352 |
atctttttcccacacaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #64
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7414657 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaattatacttttcctattatattcttaactatttattactctttcttttttcaatt |
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
7414757 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #65
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145 |
Q |
| |
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| T |
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tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttgttttttctattatatccttaattatttattactctctcttctttcaattcttt |
15268410 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
15268409 |
aatttattttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttcccatacaaaattaattacatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
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| T |
42940808 |
tttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaataatttattactctatcttctttcaatt |
42940907 |
T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
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| T |
42940908 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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99 |
Q |
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| T |
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T |
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199 |
Q |
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8050587 |
T |
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200 |
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232 |
Q |
| |
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| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |
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T |
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Target: chr5; HSP #68
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Target Start/End: Original strand, 8542761 - 8542992
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T |
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200 |
Q |
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T |
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| Q |
201 |
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232 |
Q |
| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 13987547 - 13987778
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Q |
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T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
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T |
|
| Q |
201 |
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232 |
Q |
| |
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| |||| ||| |||||||||||| |||||| |
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atatcttttccatacaatattaattgcatttc |
13987778 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14153777 - 14153546
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T |
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200 |
Q |
| |
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14153578 |
T |
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| Q |
201 |
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232 |
Q |
| |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Original strand, 26256348 - 26256531
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148 |
Q |
| |
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T |
|
| Q |
149 |
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232 |
Q |
| |
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T |
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Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
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Target Start/End: Complemental strand, 27366514 - 27366283
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Q |
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T |
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| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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Q |
| |
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T |
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| Q |
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232 |
Q |
| |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34382102 - 34381871
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T |
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200 |
Q |
| |
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34381903 |
T |
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| Q |
201 |
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| |
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| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2606653 - 2606471
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| Q |
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148 |
Q |
| |
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caaattatatctcgctttacaatacaaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcgt |
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T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
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|
|
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Target: chr5; HSP #75
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Target Start/End: Original strand, 25538040 - 25538272
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Q |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgttctaaattatatgtcgttttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcc |
25538139 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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tattataaccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
25538239 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
|
| |||||| || |||||||||||| |||||| |
|
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25538240 |
tatctctttttcatacaatattaattgcatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34381608 - 34381420
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T |
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ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
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ttcatttatcttttccataacatttattaaggatcgttttgtaaaacaactcataatatatctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
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Target Start/End: Complemental strand, 33935 - 33704
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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Q |
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T |
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
33735 |
atctttttcccacacaaaattaattatatttc |
33704 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #78
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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Q |
| |
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attatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaataattctttat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||| | |||||||||||||||||||||| |
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9201330 |
atctctttctcacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #79
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Q |
| |
|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
29619398 |
attatatccttaactatttattactttctcttttttcaattccttcatttatctttcccttatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
29619299 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| | ||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
29619298 |
atctcatttccacataatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40915693 - 40915463
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| Q |
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| || ||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |
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|
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actccctccgtcccaaattgtatgtca-tttggaaaaaatatttgtcttaaattgtatgtcactttagaatactaatgaaacattaatgttactttttct |
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
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attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
40915495 |
T |
|
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
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| T |
40915494 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #81
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141 |
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| |
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T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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ctttcatttatctttcccatatcatttatgaaggataattttgtaaaaaaactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #82
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| T |
39896039 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattactgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaatt |
39895940 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
39895939 |
ctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
39895849 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #83
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Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 10164719 - 10164908
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142 |
Q |
| |
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| T |
10164719 |
ttgtctcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccctaactatttattactctttctcctttcaattt |
10164818 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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10164819 |
tttcatttatcttttctatgacatttattaagaacaatcttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37881712 - 37881482
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99 |
Q |
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|
|
| T |
37881712 |
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T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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| T |
37881612 |
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37881515 |
T |
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| Q |
200 |
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232 |
Q |
| |
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| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
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| T |
37881514 |
tatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6517646 - 6517459
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144 |
Q |
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| T |
6517646 |
gtcccaaattgtatgtcatttgacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctt |
6517547 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |
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ttatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgcaaaacaactcataatatctctttcccacacagtattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 53 - 232
Target Start/End: Original strand, 21486683 - 21486862
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| Q |
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152 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
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| T |
21486683 |
ttatatgtcgctttacaataccaataaaacattaatgttactttttctgttatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttaatttat |
21486782 |
T |
|
| Q |
153 |
cttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
21486783 |
cttttccataacatttattaaggaaaattttgtaaaacagcttacaatatctcttccccatacaaaattaattacatttc |
21486862 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 15856343 - 15856533
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
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| T |
15856343 |
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15856442 |
T |
|
| Q |
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232 |
Q |
| |
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| T |
15856443 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttc |
15856533 |
T |
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Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35809466 - 35809276
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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| T |
35809466 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaatacctatgcaatattaatgttatttttccaattataaccttaattatttattactccctcttctttcaatt |
35809367 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
35809366 |
ctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgcatttc |
35809276 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20656539 - 20656322
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
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20656440 |
T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
20656439 |
attatatccttaactatttattacactctcttctttcaattcctttatttatctttccaatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
20656340 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaat |
218 |
Q |
| |
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||| || |||||||||| |
|
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| T |
20656339 |
atctttttcccacacaat |
20656322 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43403514 - 43403285
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43403514 |
actccctccgtcacaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgcattacaataccaatgaaaaattaatattacttttcct |
43403415 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
43403414 |
attatatccttaactatttatta--ctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
43403317 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
43403316 |
atctttttcccacacaattttaattacatttc |
43403285 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 53 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23320522 - 23320343
Alignment:
| Q |
53 |
ttataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttat |
152 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23320522 |
ttatatgtcactttaaaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttat |
23320423 |
T |
|
| Q |
153 |
cttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23320422 |
ctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
23320343 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39410651 - 39410468
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ccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
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| T |
39410651 |
ccaaattgtatgtcactttagaatactaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctttcttttttcaattctttca |
39410552 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39410551 |
tttatctttcccgtatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattatattt |
39410468 |
T |
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Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 11312995 - 11313177
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| Q |
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149 |
Q |
| |
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|
|
| T |
11312995 |
aaattatatgtcgttttacaataccaatgaaagattaatgtttcttttcctattatatccttaactatttattacactctcttctttcagtttcttcatt |
11313094 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
11313095 |
tatctttctcatatcatttactaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacaaaatattaattacatttc |
11313177 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21772875 - 21772697
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| Q |
54 |
tataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatc |
153 |
Q |
| |
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|||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
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| T |
21772875 |
tatatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatc |
21772776 |
T |
|
| Q |
154 |
ttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21772775 |
tttcttatatcatttattaaggataattttgtaaaataattcataatatctctttcccacacagtattaattacatttc |
21772697 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8042588 - 8042410
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| Q |
48 |
ccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8042588 |
ccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactttctcttctttcaattccttca |
8042489 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8042488 |
tttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatat------cccacacaatattaattacatttc |
8042410 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 8225612 - 8225845
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103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
8225612 |
ccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaataattaatgttacttttcctatt |
8225711 |
T |
|
| Q |
104 |
atatccttaactattaattactctctcttctttc-----aattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcata |
198 |
Q |
| |
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| T |
8225712 |
atatccttaacaatttattactctctcttctttcaatataatttcttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcata |
8225811 |
T |
|
| Q |
199 |
atttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|| | | || || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8225812 |
atatttttttcctacacaatattaattacatttc |
8225845 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 232
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ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
162 |
Q |
| |
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| T |
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29000835 |
T |
|
| Q |
163 |
caatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
29000834 |
tcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10602072 - 10601879
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactc---tctcttctttca |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||| |
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| T |
10602072 |
tttgtcccaaattatatgtagctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttttttttttttca |
10601973 |
T |
|
| Q |
139 |
attatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
10601972 |
attcctttatttatcttttccatatcatttattaaggacaattttataaaataactcataatatctatttctcacataatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
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Target Start/End: Complemental strand, 18473224 - 18473036
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42 |
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141 |
Q |
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| T |
18473224 |
tttgtcccaaattgtatttcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctactatatccttaactatt--ttactttttcttctttcaatt |
18473127 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || | |||||||||||||||||||||| |
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| T |
18473126 |
ctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaagcaactcataatatttgtttctcacacaatattaattacatttc |
18473036 |
T |
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Target: chr5; HSP #100
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145 |
Q |
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| T |
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tcccaaattatatgtcactttataataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatctttaactatttattactttttcttctttcaattcttt |
22801823 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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|
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| T |
22801822 |
catttatctttctcatatcatttattaaggataattttataaaataactcataatatctttttccaacac-atattaattacatttc |
22801737 |
T |
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Target: chr5; HSP #101
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168 |
Q |
| |
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12503914 |
aataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcattt |
12504013 |
T |
|
| Q |
169 |
attaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
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12504014 |
attaaagataattttgtaaaacaactcataa--tatttttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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145 |
Q |
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tcccaaattgtatgtcactttacaatactaatgaaacattaacgttatttttccaattatatctttaactatttattactattttttctttcaactcttt |
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T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
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catttatcttttccatatcatttattaatgataattttgtaaaacaactcataatatctatttcctacacaatattaattacatttc |
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T |
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141 |
Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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|
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| T |
9591496 |
ctttcatttatttttcccatattatttattaaggacagttttgtaaaacaactcacaatatctcttttccacacaatattaattgcattt |
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T |
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141 |
Q |
| |
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| T |
35080308 |
tttgtctcaaattgtatgtcattttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaaat |
35080407 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
35080408 |
ctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttcccatacaatattgatta |
35080492 |
T |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||| | | || ||||||| |
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|
| T |
28377679 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacgataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatattcttaattatttattactttttttt--ttcaatt |
28377776 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28377777 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacagtattaattacatttc |
28377867 |
T |
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50 |
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149 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |
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40040948 |
aaattgtatgtcgctttacaatatcaatgcaactttaatgttactttttctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaattctttcatt |
40041047 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatatt |
221 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
40041048 |
tatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatatt |
40041119 |
T |
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142 |
Q |
| |
|
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|
| T |
12659050 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctaatataaccttaaatatttattactctctc--ccctcaattc |
12659147 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
12659148 |
ttttatttatctttcccatgtaatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaatattaattacatttc |
12659237 |
T |
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42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||||| |
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|
| T |
13662451 |
tttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttattttttctattataactttaactatttattactctct--tatttcaatt |
13662354 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
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ctttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcattt |
13662264 |
T |
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Target: chr5; HSP #109
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tcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattt |
145 |
Q |
| |
|
||||||||| || | | |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |
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|
| T |
18094716 |
tcccaaattgtacgacactttacaatatcaataaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattcttt |
18094617 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18094616 |
catttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatatttcccacactatattaattatatttc |
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T |
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Q |
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|
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|
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28024563 |
actccctacgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaattgtctcaaattatatgtcgttttaaaataccaatgcaacattaatgatactttttct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
28024663 |
attataactttaattatttattactctatcttctttcaattctttcatttat-ttttccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
28024761 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaa |
223 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
28024762 |
atctattttccacacaatattaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #111
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141 |
Q |
| |
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||||| ||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |
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| T |
39990440 |
tttgttccaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcattaactatt-attattcttttttctttcaatt |
39990342 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39990341 |
ctttcatttatctttt-catatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatatttcccacacaatattaattatatttc |
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T |
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Target: chr5; HSP #112
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| |
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| T |
2123895 |
agtcgttttacaataccgatgaaacattaatattatttttcttattatatcattaactatttattattctctcttctttcatttctttaatttatctttc |
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T |
|
| Q |
158 |
ccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
2123795 |
tcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaaaattaattatattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #113
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142 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||| | |
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|
| T |
40275419 |
ttgtcccaaattgtatgttgctttacaataccaatgaatcattaatgttactttttctattatatccttcactatttattgccttctctactctcaagtc |
40275320 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
40275319 |
attcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaaaattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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141 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |
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|
| T |
937834 |
tttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattgtaaccttagttatttattactctatctt-tttcaatt |
937932 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttcc-----atacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
937933 |
ctttcatttatctttcccatattatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccgcacaatattaattacatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #115
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145 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
8883244 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccgatgaaaaattaatattatttttcctattatattattaactatttattgctct--cttctttcaattcctt |
8883341 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8883342 |
catttatctttccaatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaatattaattatatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #116
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Query Start/End: Original strand, 5 - 232
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104 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
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|
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41349010 |
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T |
|
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105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
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| T |
41348910 |
tatccttaactatttattactttctcttct---------ttcatttatctttcccatatcatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatct |
41348820 |
T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| |||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
41348819 |
cttttccacacaaaatatattacatttc |
41348792 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30077373 - 30077185
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142 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |
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ttgtctcaaattatatgttgctttataatactaatacaatattaatgttgtttttcctattataaccctaactatttattactctctcttctttcaattc |
30077274 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30077273 |
tttcatttatttttctcatattatttatcaa-gataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacagaatattaattacatttc |
30077185 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 16626287 - 16626477
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| Q |
43 |
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140 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| |
|
|
| T |
16626287 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaataaatattattaatgttactttttctattatatccttaactatttattattttctctcatttcaag |
16626386 |
T |
|
| Q |
141 |
tatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16626387 |
tcattcatttatctttttcat-gtctttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttc |
16626477 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #119
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Query Start/End: Original strand, 63 - 232
Target Start/End: Original strand, 6923076 - 6923239
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63 |
ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
6923076 |
ctttacaatactaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactcttttttctttcaattctttcatttat------cata |
6923169 |
T |
|
| Q |
163 |
caatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6923170 |
tcatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatctatttctcacacaatattaattacatttc |
6923239 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31196334 - 31196104
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31196334 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttggaaattttttttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaataaatcattaatgttacttttcct |
31196235 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
31196234 |
attatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagtcattcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaataattcataat |
31196135 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| || |||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
31196134 |
atctatttcccacataaaattaattacattt |
31196104 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #121
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Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 6334994 - 6335174
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
6334994 |
ttgtcccaaattatatgttactttacaataccaatgaaacattaatattacttttcctattatatccttaattatttattaccccttcttctttc----- |
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T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6335089 |
----atttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacgcaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr5; HSP #122
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Target Start/End: Original strand, 37410708 - 37410865
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174 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
37410708 |
aatgaaacattaattttacttttcttattatatccttaactatttattactttttcttcttttaattctttcatttatctttctcatatcatttattaag |
37410807 |
T |
|
| Q |
175 |
gataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37410808 |
gataattttgtaaaataactcataatatctttttttcacacaatattaattacatttc |
37410865 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #123
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 37337067 - 37337246
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
37337067 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaatacaaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaagt |
37337166 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37337167 |
cttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacataatattaattacatttc |
37337246 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 231
Target Start/End: Original strand, 26630433 - 26630603
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| Q |
60 |
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159 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |
|
|
| T |
26630433 |
tcgctttaaaatatcaat-aaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattcttttatttatctttcct |
26630531 |
T |
|
| Q |
160 |
atacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26630532 |
atattatttattaaggacaattttgtaaaacaactaataatatcttttttccacacgatattaattgcattt |
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T |
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Target: chr5; HSP #125
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Target Start/End: Original strand, 2881866 - 2882020
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46 |
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145 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
2881866 |
tcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgcaacattaatattatttttcctattataacattaactatttattactatctcttctttcaattcttt |
2881965 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2881966 |
catttatattttccatattatttattaaggacaattttataaaacaattcataat |
2882020 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #126
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| Q |
120 |
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219 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1122502 |
attactctttcttttttcaattatttcatttgtctttcccatataatttattaaggataattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaata |
1122601 |
T |
|
| Q |
220 |
ttaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
1122602 |
ttaattacattt |
1122613 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
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| Q |
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141 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
13978464 |
tttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctctcttctttcaagt |
13978365 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13978364 |
cttttatttatctttctcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattatattt |
13978286 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
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Target Start/End: Complemental strand, 15251405 - 15251219
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
15251405 |
actccctccgtcccaaattataagtcacttcgggaaaaagatttgtcccaaattataagttgctttacaataccaatgaaacattgatgttatttttcct |
15251306 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaa |
188 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15251305 |
tttata-ccataactatttattactctcttttctttcaattctttaatttatcttttcaataccattaacgaaggataatattgtaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
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141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
14341794 |
tttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaacactaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttc-------- |
14341885 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
14341886 |
-tttcatttatatttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttatgtcccacacaacattaattatatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #130
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175 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31747847 |
atgaagtattaatgttacttttcctgttatatccttaattatttattactctctattctttcgattctttaatttatattttccatactatttattaagg |
31747946 |
T |
|
| Q |
176 |
ataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31747947 |
acaattttgtaaaacaactaataat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #131
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1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
1313205 |
actccctccatcccaaattttaagttgctttgagaaaaaaatttgtcccaaattgtaagtcactttacaataccaatgaaacatcaatattatttttcct |
1313304 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactca |
196 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||| ||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1313305 |
attatacacttaactatttattactctctcttctttcaattctctaatttatgttttcaataacattaatgaagggtaattttgtaaaataactca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #132
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141 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| | |
|
|
| T |
13090107 |
tttgtcctaaattctacgtcgctttacaataccaatgaagcattaatattatttttcttattatatccttaactatttactactttctcttcttccaagt |
13090008 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13090007 |
cattcatttatttttcctatatcatttactaaggacaattttataaaacaattcataatatccctttccaacacaaaattaattacatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #133
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141 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || || ||||||| ||| |||| || ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22635777 |
tttgtcacaaattgtatgttgctttacgatataaatgcaactttaatgtcactttttctattataacattaactatttattactctctcttatttcaatt |
22635678 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22635677 |
cttttatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttc |
22635587 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #134
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Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||| | |
|
|
| T |
36487325 |
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T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36487425 |
cattcatttatctttcccatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaattcataat |
36487483 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
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Target Start/End: Original strand, 15251405 - 15251578
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155 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
15251405 |
taagtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctactataccataaactgtttattactctctcttctttcaattcttt-atttatctt |
15251503 |
T |
|
| Q |
156 |
ttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15251504 |
tctcataccgttaatgaaggataattttgtaaaata--gcataatttctctttcctatacaaaattaattacatttc |
15251578 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #136
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Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 16745349 - 16745520
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| Q |
50 |
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149 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16745349 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttt-cctattatat----------ttatcactctctcttctttcaattccttcatt |
16745437 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16745438 |
tatcattctcatatcatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttccaaacaatattaattacatttc |
16745520 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
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Target Start/End: Original strand, 23991754 - 23991869
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
23991754 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattaatttctcttctttcaatcc |
23991853 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttc |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23991854 |
tttcatttatattttc |
23991869 |
T |
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Target: chr5; HSP #138
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219 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
10832757 |
attactctctcttctttcaattttttcatttatcttttccatattatttataatggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacataata |
10832658 |
T |
|
| Q |
220 |
ttaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
10832657 |
ttaatt |
10832652 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28119150 |
ctccctccgtcccaaattataagtcgctttggaaaaaaaaattgtcctaaattataaaccgttttacaataccaatgaaacattaatgttacttttccta |
28119051 |
T |
|
| Q |
102 |
ttatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaa |
192 |
Q |
| |
|
||| | |||||||| || |||||||||| |||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
28119050 |
ttaca-ccttaactgtttattactctctattctttca--------atatatctttcccataccatttattaaggacaaatttgtaaaacaa |
28118969 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #140
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Query Start/End: Original strand, 137 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4890092 - 4889997
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| Q |
137 |
caattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4890092 |
caattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaatattaattacatttc |
4889997 |
T |
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Target: chr5; HSP #141
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Target Start/End: Complemental strand, 42550858 - 42550724
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| Q |
64 |
tttacaataccaatgaaat-attaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| | | |
|
|
| T |
42550858 |
tttacaataccaatgaaattattaatgtcatttttcctattatacctttaaatatttatta-tctcttttctttcaattatttaatttattttttctaca |
42550760 |
T |
|
| Q |
163 |
caatttattaaggataattttgtaaaacaactcata |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42550759 |
ccatttatcaaggacaattttataaaacaactcata |
42550724 |
T |
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Target: chr5; HSP #142
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Query Start/End: Original strand, 50 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 3099268 - 3099166
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| Q |
50 |
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149 |
Q |
| |
|
||||| || ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3099268 |
aaattgtatgtcactttacgataccaattaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactcattcttctttcaattctttcatt |
3099169 |
T |
|
| Q |
150 |
tat |
152 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
3099168 |
tat |
3099166 |
T |
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Target: chr5; HSP #143
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Target Start/End: Original strand, 5288846 - 5288994
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| | |
|
|
| T |
5288846 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgttttaggggaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttattttttc |
5288945 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5288946 |
tattataattttaattatttattactatctcttctttcaattctttcat |
5288994 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
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Target Start/End: Complemental strand, 1887358 - 1887202
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| |||| || || |
|
|
| T |
1887358 |
tttgtcccaaattataagtcgttttagaatatcaaagaaatattaatgtttcttttcctaccataccctttactatctattactctct--tcttccattt |
1887261 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1887260 |
--ttaatttctctttctcataccattaatgaaggataattttgtaaaataactcataattt |
1887202 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 197
Target Start/End: Original strand, 24806805 - 24806948
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| Q |
52 |
attataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcattta |
151 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| || || ||||||||| |||| ||| || |||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
24806805 |
attataggtagctttacaatatcaatgaaaaattaatgttaatttttctatgatgtctttaactatttattattcttcctccttttaattctttcattta |
24806904 |
T |
|
| Q |
152 |
tcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcat |
197 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24806905 |
tctttttcat--atcttattaaagataattttgtaaaacaactcat |
24806948 |
T |
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Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37148227 - 37148101
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| Q |
74 |
caatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaa |
173 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37148227 |
caataaaacattaatgttatttttctttttatatccttaactatttattactctctcttctttcacttctttaatttatttttctcatactatttattaa |
37148128 |
T |
|
| Q |
174 |
ggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37148127 |
aagcaattttgtaaaacaactcgtaat |
37148101 |
T |
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Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
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Target Start/End: Original strand, 37410447 - 37410556
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| Q |
75 |
aatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaag |
174 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
37410447 |
aatgaaacattaattttacttttcttattatatccttagctatttattaccttttcttcttttaattctttcatttatctttctcatatcatttattaag |
37410546 |
T |
|
| Q |
175 |
gataattttg |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
37410547 |
gataattttg |
37410556 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
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Target Start/End: Original strand, 40871391 - 40871490
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| Q |
126 |
ctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
40871391 |
ctctcttctttcaattatttaatttatttttcacataccctttattaaggataattttgtaaaacaactaataatatctttttctcacacaacattaatt |
40871490 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
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Target Start/End: Complemental strand, 9375306 - 9375237
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| Q |
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caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatt |
118 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9375306 |
caaattatatgtcgttttacaatacaaatgaaatattaatgttaattttgctattatatccttaactatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
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Target Start/End: Original strand, 21780532 - 21780756
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| Q |
3 |
tccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatatt-aatgttacttttccta |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21780532 |
tccctccgtcccaaattataagtcattttggagaaaaaatttgtcccaaattataagtcgcactacaataccgatgaagcattaaatgctacttttccta |
21780631 |
T |
|
| Q |
102 |
ttatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatt |
201 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| | | |||||||||||||||| ||| |||||| ||| || | ||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
21780632 |
ctataccctcaactatttacaa--ctctcttctttcaattctttaatttatatttcatatgccattagtgaaggataattttgtaaaatgacttataatt |
21780729 |
T |
|
| Q |
202 |
tctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
Q |
| |
|
|| | |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21780730 |
tcatgttcccatacaatattaattaca |
21780756 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #151
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gaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggat |
177 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||| |||| ||||||||| | |
|
|
| T |
2993259 |
gaaacattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattactctatcttcttcgaattctttcatttttttttctcatatcttttattaagaac |
2993160 |
T |
|
| Q |
178 |
aattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || ||||| || ||||||| | |||| | || ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2993159 |
aatcttataaaataagtcataatatttctttctcatacaatattaattaaatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
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aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||| || | | || |||||||| | |||||| || | || ||| |
|
|
| T |
8077283 |
aaattgtaagtcgttttacaatatcaataaaatattaatgttattttttctattatatcttttattgtttattactcttttttctttaaaaaaattaatt |
8077382 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||| | || |||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
8077383 |
tatatttctaatatcatttattaaggataactttataaaataattcataatttttctttctcatacaaaattatttacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4911624 - 4911475
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attataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta-tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcattt |
150 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| |||| |||| | | ||||| |||| |||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
4911624 |
attatatgtcgttttataatatcaataatacattaacgttattttttctattactataattaactatttattattctctcttctttcaattgtttaattt |
4911525 |
T |
|
| Q |
151 |
atcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|| ||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4911524 |
atatttatcatagcatttattaaggacaattttataaaacaacacataat |
4911475 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13510657 - 13510431
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5 |
cctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatatt-aatgttacttttcctatt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
13510657 |
cctccgtcccaaattataagtcattttggagaaaaaatttgtcccaaattataagtcacactacaataccgatgaagcattaaatgctacttttcctact |
13510558 |
T |
|
| Q |
104 |
atatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttc |
203 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||| ||| || | || | |||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
13510557 |
ataccctcaactatttacta--ctctcttctttcaattctttaatttatatttcatatgccatcagtgaaggataattttgtaaaatgacctataatttc |
13510460 |
T |
|
| Q |
204 |
tcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| | |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13510459 |
acgttcccatacaatattaattacatttc |
13510431 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 86699 - 86640
Alignment:
| Q |
173 |
aggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
86699 |
aggagaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttc |
86640 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 156
Target Start/End: Original strand, 13032971 - 13033046
Alignment:
| Q |
81 |
atattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttt |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13032971 |
atattaatgttattctttctattataaccttaactatttattaatctttcttctttcaattctttcatttatcttt |
13033046 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 156
Target Start/End: Original strand, 13102944 - 13103019
Alignment:
| Q |
81 |
atattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttt |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13102944 |
atattaatgttattctttctattataaccttaactatttattaatctttcttctttcaattctttcatttatcttt |
13103019 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
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Target Start/End: Complemental strand, 3098310 - 3098248
Alignment:
| Q |
170 |
ttaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
3098310 |
ttaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctatacagtattaattacatttc |
3098248 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
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Target Start/End: Complemental strand, 6436156 - 6435998
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca-t |
148 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||| | | |
|
|
| T |
6436156 |
aaattataaatcgttttacaatactaattaaatattaatgttattttttctattatacccttaactatttattttgctttcttcttttaattctttaact |
6436057 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
|| | | | | ||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6436056 |
ttttatgtccaatattattaataaaggataattttgtataattactcataatttctctt |
6435998 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26332222 - 26332140
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattact |
125 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
26332222 |
ttgtctcaaattataagtcgttttacaatactagtgaaatattaatgttatttttcttattatactcttaactgtttattact |
26332140 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26091916 - 26091751
Alignment:
| Q |
60 |
tcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttcc |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || ||||||||| |||| |||| ||||||| ||| |||| ||| | |||| | || | |
|
|
| T |
26091916 |
tcgctttacaatattgatgaaatatcaatgttatttt-----ttctatccttaattatttatta--ctctcttattttaattctttaaattatttatttc |
26091824 |
T |
|
| Q |
160 |
atacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26091823 |
ataccatttattaaggacaattttgtaaaacacctcataatatctttttcccattcaaaattaattacatttc |
26091751 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 200
Target Start/End: Original strand, 4211820 - 4211975
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| Q |
44 |
tgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattat |
143 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||| ||| | | |||||||| | |
|
|
| T |
4211820 |
tgtcccaacttataagtcggtttacaatttcgatgaaatattaatgtt-gtttttctattataatcttaaatatttattattctttttattttcaatttt |
4211918 |
T |
|
| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
4211919 |
ttaatttatctttctcatattatttgttaaagatatttttgtataacaacttataat |
4211975 |
T |
|
Back To:
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Target: chr5; HSP #163
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Target Start/End: Complemental strand, 4890169 - 4890113
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattata |
106 |
Q |
| |
|
||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4890169 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
4890113 |
T |
|
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Target: chr5; HSP #164
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Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16284930 - 16284870
Alignment:
| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16284930 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaatattaatt |
16284870 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 108
Target Start/End: Original strand, 37706378 - 37706436
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatc |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37706378 |
aaattataagtcgctttataataccaatgaaactataattttacttttcctattatatc |
37706436 |
T |
|
Back To:
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Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 4060855 - 4060766
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgt |
90 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4060855 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttggaaattttttttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaatcattaatgt |
4060766 |
T |
|
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Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 590377 - 590278
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||| ||| |
|
|
| T |
590377 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttagaatcccaatacaactttaatgttacttttcctattataacctt-actatctattactatttcttctttcattta |
590279 |
T |
|
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Target: chr5; HSP #168
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Target Start/End: Original strand, 39049731 - 39049847
Alignment:
| Q |
110 |
ttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcc |
209 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||| ||| || |
|
|
| T |
39049731 |
ttaactattcattagtctcttttttttcaattttttaatttatctttttaatactatttattaaagacaattttataagacaattcataatatcttttta |
39049830 |
T |
|
| Q |
210 |
ccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
39049831 |
ccacgcaaaattaatta |
39049847 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 198
Target Start/End: Original strand, 822615 - 822741
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| Q |
69 |
aataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaattt |
168 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||| |||| ||||| |||| | |||||||| ||| |||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
822615 |
aataccaacgaagtattaatatttctttt---attatattcttaattatttattaccctctttcctttcaatactttaatttatcttttccaaaccgttt |
822711 |
T |
|
| Q |
169 |
attaaggataattttgtaaaacaactcata |
198 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
822712 |
attagggacaattttgtaaaataattcata |
822741 |
T |
|
Back To:
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Target: chr5; HSP #170
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Query Start/End: Original strand, 125 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4911017 - 4910942
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| Q |
125 |
tctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4911017 |
tctctattctttcaatcatttaatttatctttaccataacatttgttatggacaattttgtaaaacaattcataat |
4910942 |
T |
|
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Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6496823 - 6496744
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| Q |
128 |
ctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6496823 |
ctcttttttcaattctttaatttatctttttcataacattaatgaaggataattttctaaaataacacataatttctctt |
6496744 |
T |
|
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Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 200
Target Start/End: Original strand, 4745543 - 4745632
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| Q |
110 |
ttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| |||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4745543 |
ttaactatttattactttttcttcttttaattttttaatttatttttttcataccatttgttaaggc-aattttgtaaaacaacttataat |
4745632 |
T |
|
Back To:
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Target: chr5; HSP #173
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Query Start/End: Original strand, 147 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40029674 - 40029621
Alignment:
| Q |
147 |
atttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
40029674 |
atttatctttctcatactatttattaaggacaattttataaaacaactcataat |
40029621 |
T |
|
Back To:
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Target: chr5; HSP #174
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Alignment:
| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13033184 |
atttattaaggacaattttgtaaatcaattcataatatctcttttgcacacaatattaatt |
13033244 |
T |
|
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Target: chr5; HSP #175
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Alignment:
| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13103157 |
atttattaaggacaattttgtaaatcaattcataatatctcttttgcacacaatattaatt |
13103217 |
T |
|
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Target: chr5; HSP #176
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| Q |
46 |
tcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatt |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40485035 |
tcccaaattataaaccgttttacaatatcaatgaaacattattgttattttttatattatagccttaactatt |
40485107 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #177
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Query Start/End: Original strand, 42 - 97
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttt |
97 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
24253652 |
tttgtctcaaattataagtcgttttataataccaatgaattattaatattattttt |
24253597 |
T |
|
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Target: chr5; HSP #178
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| Q |
65 |
ttacaataccaatgaaatattaatgtta-cttttcctattatatccttaactatt |
118 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4911403 |
ttacaatacaaatgaaatattaatgttatttttttctattatatccttaagtatt |
4911349 |
T |
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Target: chr5; HSP #179
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| Q |
89 |
gttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaa |
188 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||| || |||||||| |||||| |||| | ||| |||| ||| ||||||||||| |||| || || ||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
20145638 |
gttactttttctataatacccataactatttattactttctcgt-tttgaattctttaatttatcttttacatatcatctactaaagacaatttggtaaa |
20145736 |
T |
|
| Q |
189 |
acaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
20145737 |
acaactcgtaatatctctt |
20145755 |
T |
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Target: chr5; HSP #180
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| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |
|
|
| T |
31196036 |
tttatctttctcatatcatttattaaggacaattt-gtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
31195968 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #181
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgtt |
91 |
Q |
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| T |
31333190 |
aaattataagtcgttttacaataccaatcaaatgttaatgtt |
31333149 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24253355 - 24253287
Alignment:
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194 |
Q |
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ctcttttcttttaattttttaatttatcattctcataccatttatttaggataattttgtaatacaact |
24253287 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 218)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47109343 - 47109112
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Q |
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T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
47109243 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttctcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
47109144 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
47109143 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
47109112 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 22926037 - 22926268
Alignment:
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100 |
Q |
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22926136 |
T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaattattaattattccttcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
22926236 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| |
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22926237 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
22926268 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 43185345 - 43185576
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
43185445 |
attatatccttaactattaattactcccaattctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
43185544 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
43185545 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
43185576 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34817185 - 34816954
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttgtcct |
34817086 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
34816986 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
34816985 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 43109593 - 43109824
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
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| T |
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43109692 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
43109693 |
attatatccttaactattaattactctttcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
43109792 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
43109793 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
43109824 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47498185 - 47497954
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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47498086 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacagctcataat |
47497986 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
47497985 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
47497954 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 52870718 - 52870487
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
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|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
52870618 |
attatatccttaattcttaattactccctattctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaattcataat |
52870519 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
52870518 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
52870487 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Original strand, 12569334 - 12569523
Alignment:
| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12569334 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttaattttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
12569433 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12569434 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatataaattacattt |
12569523 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Original strand, 13545798 - 13545987
Alignment:
| Q |
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141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13545798 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttaattttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
13545897 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13545898 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatataaattacattt |
13545987 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 41265512 - 41265743
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
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|
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|
| T |
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41265611 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
41265612 |
attatatccttaactattaattactccatcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
41265711 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
41265712 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
41265743 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 29674901 - 29675091
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29674901 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttatctattaattactctctcttctttcaatt |
29675000 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29675001 |
atttcatttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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| |
|
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|
|
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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attatatccttcactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
48962649 |
ttatcttccccacacaatattaattacatttc |
48962618 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49610227 - 49609996
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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49610028 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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| T |
49610027 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29517494 - 29517263
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| |
|
||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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attatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
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| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29517294 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46741183 - 46740995
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43 |
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142 |
Q |
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| T |
46741183 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattaccctctcttctttcaatta |
46741084 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
46741083 |
tttcatttatctttcccataccatttattaacgataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
46740995 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
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Target Start/End: Original strand, 8724280 - 8724511
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100 |
Q |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttataaaataactcataat |
8724479 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|| |||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8724480 |
ttatcttccccacgcaatattaattatatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 9076167 - 9076398
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttataaaataactcataat |
9076366 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9076367 |
ttatcttccccacgcaatattaattatatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 51380305 - 51380078
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100 |
Q |
| |
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|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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attatatccttgactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
51380110 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
51380109 |
ttctcttccccacacaatattaattatatttc |
51380078 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49780466 - 49780276
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
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|
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tttgtcccaaattatatgccgctttacaaaaccaatgaaatattaatgttaattttcctattatattcttaactattaattactccctcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
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atttcatttatcttttctataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttatcttccccacacaatattaattacatttc |
49780276 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 38808130 - 38808319
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Q |
| |
|
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|
| T |
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T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
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tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaataactaataatttttcttccccacacaatattaattatatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
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Target Start/End: Original strand, 44976365 - 44976528
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163 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
44976365 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattacattctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
44976464 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattac |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44976465 |
catttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattac |
44976528 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
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Target Start/End: Complemental strand, 31171621 - 31171439
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149 |
Q |
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|
|
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aaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttactttttctattatatcattaactattaattactctatcttctttcaattatttcatt |
31171522 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31171521 |
tatcttttccatactatttattaaggataattttgtaaaacaactaataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31289364 - 31289133
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Q |
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T |
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| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
| T |
31289264 |
attatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccatatcatttattaagaataattttgtaaaacaactcataat |
31289165 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31289164 |
ttctcttttccacacaatattaattacatttc |
31289133 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 49102476 - 49102665
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| Q |
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142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
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49102476 |
ttgtcccaaattatatatcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactctatcttttttcaatta |
49102575 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49102576 |
tttcatttatctttttcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccctacataatattaattacatttc |
49102665 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 52060552 - 52060321
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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attatatccttaactatttattactccctcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
52060352 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
52060321 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 10659243 - 10659432
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142 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttgtctcaaattatacgtcgcttaacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
10659342 |
T |
|
| Q |
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
10659343 |
tttcatttatctttcccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattaaatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
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Target Start/End: Original strand, 14780973 - 14781125
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Q |
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T |
|
| Q |
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ttttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14781073 |
ttttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
14781125 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
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attatatctttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcctatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
23609315 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23609314 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
23609283 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 24089329 - 24089560
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Q |
| |
|
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtccgaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcct |
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T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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| T |
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attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttttaaaacaactcataat |
24089528 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24089529 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38783722 - 38783491
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgagaacaattttgtaaaacaactcataat |
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|
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ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
|
||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
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38783522 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38483613 - 38483382
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| |
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T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
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| T |
38483513 |
attatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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atctatttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr3; HSP #32
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Target Start/End: Original strand, 41751102 - 41751333
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T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
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attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcctttatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
41751302 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 51865690 - 51865921
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Q |
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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T |
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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51865890 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr3; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 48333711 - 48333940
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Q |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaactatttattactctat--tctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
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atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr3; HSP #35
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Target Start/End: Original strand, 34663431 - 34663662
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Q |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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attatatccttaactatttattactctcttttctttcaattccttcatttatttttcccatatcatttattgagaataattttgtaaaacaattcataat |
34663630 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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atttctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr3; HSP #36
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Target Start/End: Complemental strand, 42939852 - 42939625
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104 |
Q |
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cctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcactttacaataccaatgaagcattaatgttacttttcctatta |
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T |
|
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tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
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42939752 |
tatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatct |
42939653 |
T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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42939652 |
ctttcccacacaatattaattatatttc |
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T |
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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 43175735 - 43175966
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Q |
| |
|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
| T |
43175835 |
attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
43175934 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4047358 - 4047128
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2 |
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Q |
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ctccctccgtcccaaattgtatgtcgctttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgttgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttccta |
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T |
|
| Q |
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ttatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatt |
201 |
Q |
| |
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| T |
4047258 |
ttatatccttaactatttattactctttcttatttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataata |
4047159 |
T |
|
| Q |
202 |
tctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
4047158 |
tctctttcccacacaatattaattacatttc |
4047128 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 30744894 - 30745084
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Q |
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tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctttcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
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Target: chr3; HSP #40
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Target Start/End: Original strand, 31786837 - 31787027
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Q |
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|
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|
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
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ctttcatttatctttcctatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacagtattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
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Q |
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|
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|
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T |
|
| Q |
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ttatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatt |
201 |
Q |
| |
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ttataaccttaactatttattactccatcttctttcaattatttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataata |
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T |
|
| Q |
202 |
tctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||| | |||||||||||||||| |||||| |
|
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| T |
33610170 |
tctcatttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
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T |
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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attatatccttaactatttattactttatcttctttcaattccttcatttatctttctcatataatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
35084418 |
atctattccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
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Q |
| |
|
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
40710693 |
attataaccttaactatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatgttatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
40710594 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
40710593 |
atctcttttctacacaatattaattgcatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45824166 - 45823936
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Q |
| |
|
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |
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|
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attatatccttaaccatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgagaacaattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45823967 |
atctttttcccacacaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 47053997 - 47054228
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| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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| |
|
|||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attatatccttaactatttattactttatcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
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ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47054197 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
47054228 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2510265 - 2510075
Alignment:
| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2510265 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactttctcttctttcaatt |
2510166 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2510165 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
2510075 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9508744 - 9508554
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9508744 |
tttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgtaatattaatgttactttttctattatattcttaactatttattactctctcttctttcaatt |
9508645 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9508644 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtagaaaaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
9508554 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9516719 - 9516529
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9516719 |
tttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgtaatattaatgttactttttctattatattcttaactatttattactctctcttctttcaatt |
9516620 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9516619 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtagaaaaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
9516529 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 17378213 - 17378403
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17378213 |
tttgtcgcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
17378312 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17378313 |
ccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
17378403 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25904189 - 25903959
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
25904189 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttctt |
25904090 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25904089 |
gttatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
25903990 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25903989 |
atctctttcccacacaatattaattacattt |
25903959 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 30190365 - 30190555
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30190365 |
tttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattaccctctcttctttcaatt |
30190464 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30190465 |
ccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
30190555 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 31725664 - 31725854
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31725664 |
tttgttccaaattatatttcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattattctctcttctttcaatt |
31725763 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31725764 |
ccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
31725854 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 54677615 - 54677845
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
54677615 |
actccctccgtctcaaattgtaagtcactttataaaataattttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatattatttttcct |
54677714 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54677715 |
attatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattatggacaattttgtaaaacaactcataat |
54677814 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54677815 |
atctcttccctacacaatattaattacattt |
54677845 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 46195904 - 46195679
Alignment:
| Q |
5 |
cctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||| | ||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46195904 |
cctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttatcctaaattatatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctatta |
46195805 |
T |
|
| Q |
105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
46195804 |
tatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccaatataatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatct |
46195705 |
T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacatt |
230 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
46195704 |
ctttcccacataatattaattacatt |
46195679 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48584165 - 48583933
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48584165 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
48584066 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgt-aaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
48584065 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaaataactcataa |
48583966 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| | |||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48583965 |
tatatctttcccatacaatattaattacatttc |
48583933 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3645986 - 3645755
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3645986 |
actccttccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcct |
3645887 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3645886 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccatcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaacccataat |
3645787 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3645786 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
3645755 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19961106 - 19960875
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19961106 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcacaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcct |
19961007 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19961006 |
attatatccttaactatttattactctctcttcttttaattccttcatttatctttctcatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
19960907 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19960906 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
19960875 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27848922 - 27848735
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| Q |
45 |
gtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatt |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || |
|
|
| T |
27848922 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctt |
27848823 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27848822 |
tcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
27848735 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28226972 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttaggataccaatgaaacattaatgttatttttcct |
28227071 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
28227072 |
attatatctttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcacatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
28227171 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28227172 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
28227203 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 43599571 - 43599801
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
43599571 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tattacttttcct |
43599669 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43599670 |
attatatccttaaccatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcacatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
43599769 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43599770 |
atctttttcccacacaatattaattacatttc |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 52915028 - 52915255
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5 |
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Q |
| |
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|||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
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| T |
52915028 |
cctccgtcccaaattgtatgtcactttggaataaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctatta |
52915127 |
T |
|
| Q |
105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
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| T |
52915128 |
tatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaataactcataatatct |
52915227 |
T |
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| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
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| T |
52915228 |
ctttcccacaaaatattaattacatttc |
52915255 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 29343244 - 29343434
Alignment:
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42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
29343244 |
tttgtcccaaattgtatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctctcttctttcaatt |
29343343 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
29343344 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
29343434 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52040530 - 52040300
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
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| T |
52040530 |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
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| T |
52040430 |
attatatccttaactatttattaccctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaataactcataat |
52040331 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52040330 |
atctctttcccacacaatattaattacattt |
52040300 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
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Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1672979 - 1672754
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99 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattatatgtcgctttagggaaaaatatttgtcctaaattatacgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcc |
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T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1672879 |
tattataaccttagctatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
1672780 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||| |
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| T |
1672779 |
tatctcttttccacacaatattaatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 49384492 - 49384304
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
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| T |
49384492 |
tttgtcccaaattgtatgtcg-tttacaataccaatgaaatattattgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctctgctttcaatt |
49384394 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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|
| T |
49384393 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacattt |
49384304 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41637122 - 41636931
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctctt--ctttcaat |
140 |
Q |
| |
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| T |
41637122 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttacttttcctattatgtccttaactatttattacttttttttttctttcaat |
41637023 |
T |
|
| Q |
141 |
tatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
41637022 |
tccttcatttatctttcccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattatatttc |
41636931 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 51166516 - 51166332
Alignment:
| Q |
48 |
ccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
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|
|
| T |
51166516 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttca |
51166417 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51166416 |
tttatctttcccatatcatttattaaggacaattttataaaataactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32100362 - 32100131
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||| |||| | |||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
32100362 |
actccctccgtcccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtacgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcct |
32100263 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
| T |
32100262 |
attatatccttaactatttattactctttcgtttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
32100163 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
32100162 |
atctctttctcacacaatattaattacatttc |
32100131 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 47241163 - 47241394
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || | | |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |
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|
| T |
47241163 |
actccctccgtcctaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgccactttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcct |
47241262 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
47241263 |
attatatctttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataat |
47241362 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47241363 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
47241394 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 8108477 - 8108667
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8108477 |
tttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaagttaatgttacctttcctattatatccctaactatttattactctctcttctttcaatt |
8108576 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8108577 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
8108667 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 15019828 - 15020010
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Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15019828 |
aaattatatgtcgctttacaataccaacgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatt |
15019927 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15019928 |
tatctttctcatatcatttattgaggtcaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttc |
15020010 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29227410 - 29227220
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141 |
Q |
| |
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| T |
29227410 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacataaatgttactttttctattatatccttaattatttattactctttcttatttcaatt |
29227311 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
29227310 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaatattaattacatttc |
29227220 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Original strand, 30358760 - 30358947
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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|
|
| T |
30358858 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacattt |
30358947 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 36669190 - 36669380
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36669190 |
tttgttccaaattgtatgttgctttacaatatcaatgaaaaattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
36669290 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 49818320 - 49818510
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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| T |
49818320 |
tttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaatt |
49818419 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
49818420 |
ctttcatttctctttaccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatttcttttccacacaatattaattgcatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
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Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 8104231 - 8104456
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100 |
Q |
| |
|
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| T |
8104231 |
actccatccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
8104331 |
attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
8104430 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
8104431 |
atctctttcccacacaatattaatta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Original strand, 43408309 - 43408498
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43408309 |
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|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
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| T |
43408409 |
atttcatttatctttcccatattatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacacaatattaattgcattt |
43408498 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 51571752 - 51571985
Alignment:
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99 |
Q |
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51571752 |
actccctccgtcctaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatggtacttttcc |
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T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
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| T |
51571852 |
tattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattatttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
51571951 |
T |
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200 |
tttc-tcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
51571952 |
tatctttttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5137711 - 5137527
Alignment:
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42 |
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141 |
Q |
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| T |
5137711 |
tttgttccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaatt |
5137612 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
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| T |
5137611 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaatattaatta |
5137527 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 44048099 - 44048331
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaata-ttaatgttacttttcc |
99 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |
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| T |
44048099 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatactaatgaaaaaattaatgttatttttcc |
44048198 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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| T |
44048199 |
tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
44048298 |
T |
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| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| | |||| |||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
44048299 |
tatatctttcccacataatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 53655199 - 53655016
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| Q |
49 |
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148 |
Q |
| |
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53655199 |
caaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattaccctctcttctttcaattccttcat |
53655100 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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53655099 |
ttatctttcccatatcatttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
53655016 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28686402 - 28686212
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141 |
Q |
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| T |
28686402 |
tttgtcccaaattgtacgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttaaatt |
28686303 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
28686302 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcaaacaaaatattaattacatttc |
28686212 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 50622741 - 50622551
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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| T |
50622741 |
tttgtcccaaattatatgtcgttttacgataccaatgaaaaaataatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
50622642 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
50622641 |
tctttatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttcgacataatattaattacatttc |
50622551 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 52679827 - 52679637
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||||| |
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| T |
52679827 |
tttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaattatttattactcttttttctttcaatt |
52679728 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
52679727 |
ctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatataatattaattacatttc |
52679637 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Original strand, 32078061 - 32078250
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| Q |
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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| T |
32078061 |
tttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttcactatttattactctatcttatttcaatt |
32078160 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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| T |
32078161 |
ctttaatttatctttctcatacaatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaaaattaattatattt |
32078250 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 32758511 - 32758700
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| Q |
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Q |
| |
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| T |
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ttgttccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctttattctttcaattc |
32758610 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
32758611 |
atttatttatctttctaatatcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacataatattaattacatttc |
32758700 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 38550917 - 38551106
Alignment:
| Q |
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ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
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38550917 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttataataccaatgcaatattaatgttatttttcctattataaccttaactgtttattactctctcttctttcaattt |
38551016 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
| T |
38551017 |
tttcatttatttttcccatataatttattaaggattattttgtaaaacaactcataatatctcttttttacacaatattaattgcatttc |
38551106 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 41935951 - 41936140
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
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||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||| | |
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|
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41935951 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttaattttcctattatatccttcactatttattgccttctctactctcaagtc |
41936050 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41936051 |
attcatttatcttttccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttc |
41936140 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 335972 - 335741
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Q |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttatgaaaaatatttgtcataaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attataaccttagctatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatataatttatcgaggacaattttgtaaaacaattcataat |
335773 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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335772 |
atctttttcccacacaatattaattgcatttc |
335741 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 23782066 - 23782297
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100 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
23782166 |
attatatccttaattatttattactctttcttcttttaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
23782265 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23782266 |
atctatttcccatacaatattaattacatttc |
23782297 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 45218759 - 45218946
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
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||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
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|
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45218759 |
tttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttatta--ctctcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |
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45218857 |
ccttcatttatc-tttccatatcatttattgatgacaattttgtaaaacaacttataatatctttttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2929921 - 2929739
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149 |
Q |
| |
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2929921 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattactctttcttttttcaattctttcatt |
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T |
|
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tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
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|
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tatctttctcatataatttattaaggataattttgtaaaacaactgataatatctctttcccacacaatataaattacatttc |
2929739 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4392608 - 4392377
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104 |
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| |
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||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
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| T |
4392608 |
cctccgtcctaaattgtatgtcgctttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgatttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctatta |
4392509 |
T |
|
| Q |
105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt-- |
202 |
Q |
| |
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|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |
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| T |
4392508 |
tatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatat |
4392409 |
T |
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203 |
--ctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|| || |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
4392408 |
atctttttcccacacaatattaattacatttc |
4392377 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15999058 - 15998869
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42 |
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141 |
Q |
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| T |
15999058 |
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15998960 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
15998959 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgagtacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttc |
15998869 |
T |
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Target: chr3; HSP #95
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149 |
Q |
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aaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacattttctattatatccttaactatttattactctctcttatttcaattctttcatt |
38096178 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
38096179 |
tatctttctcatatcatttattgatgacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
38096261 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 41979917 - 41980106
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
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| T |
41979917 |
tttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttatttttcctatcatatccttaaccatttattactctctcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
41980016 |
cattcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacataatattaattacatttc |
41980106 |
T |
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Target: chr3; HSP #97
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Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Original strand, 19602213 - 19602402
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141 |
Q |
| |
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19602312 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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|
| T |
19602313 |
cttttatttattttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataacatctcttttccacacaatattaattacattt |
19602402 |
T |
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Target: chr3; HSP #98
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Target Start/End: Complemental strand, 45347235 - 45347050
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46 |
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145 |
Q |
| |
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| T |
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45347136 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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|
| T |
45347135 |
catttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcgtaatatctctttaccacataatattaattacattt |
45347050 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 52262267 - 52262456
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| Q |
43 |
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142 |
Q |
| |
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| T |
52262267 |
ttgtcccaaattatacgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatacccttaactatttattactctctcttctttcatttc |
52262366 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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52262367 |
tttaatttatctttctcatatcatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatccttttctcacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29756759 - 29756571
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143 |
Q |
| |
|
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29756759 |
tgtcccaaattatatgtcgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattct |
29756660 |
T |
|
| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
29756659 |
ttcatttatctttctcgtattatttattaaggacaaatttgtaaaacgactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
29756571 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #101
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Target Start/End: Complemental strand, 21216947 - 21216716
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100 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
21216847 |
attatatcattaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttaactttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
21216748 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
| T |
21216747 |
atctatttcccatacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 24978830 - 24979061
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100 |
Q |
| |
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24978830 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
24978930 |
attatatccttaactatttattactcttttttttttcaattctttcatttatctttcctatatcatttattaagaataattttgtagaacaactcataat |
24979029 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24979030 |
atctctttctcacacaatattaattatatttc |
24979061 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 43600872 - 43601099
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| Q |
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103 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43600872 |
cctccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttttatatt |
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T |
|
| Q |
104 |
atatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttc |
203 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
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|
| T |
43600972 |
ataaccttagctatttattactctctattcttttaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatc |
43601071 |
T |
|
| Q |
204 |
tcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
| || ||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43601072 |
ttttttccatacaatattaattgcattt |
43601099 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 40643358 - 40643548
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |
|
|
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tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttattttttcaatt |
40643457 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40643458 |
ttttcatttatctttccgatatcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatatctttcatacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
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Target Start/End: Original strand, 5925301 - 5925522
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |
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|
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5925301 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaatttgtcc-aaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcct |
5925399 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |
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|
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5925400 |
attataaccttaactatttattactct--cttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaaggataattttgtaaaataattcataat |
5925497 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
5925498 |
atctcttttccacacaatattaatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
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139 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || |||||| |
|
|
| T |
33840040 |
tttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactcttttttttttttcaa |
33839941 |
T |
|
| Q |
140 |
ttatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33839940 |
ttccttcatttatctttcctatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatatatttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 232
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gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttc |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
48574865 |
gtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatattattttttctattatatctttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcc |
48574766 |
T |
|
| Q |
159 |
catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48574765 |
catattatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
48574692 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #108
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || | |||||||||| |||| || ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
23307777 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttaggggaaaaaattgtcccaaattatatgttgttttacaatactaatgtaacattaatgttactttttct |
23307876 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
23307877 |
attataactttaactatttattgctctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaatcacaattttgtaaaacaactcataat |
23307976 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23307977 |
atctattttccacacaatattaattgcatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #109
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
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Q |
| |
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||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |
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|
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T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33193103 |
ccttcatttatatttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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| |
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| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacat |
229 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| || | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52804824 |
ccttcatttatttttcccatataatttattaaggacaattttgtaaaataattcataatatctttttcaaacacaatattaattacat |
52804737 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 54080391 - 54080160
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatatcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
54080292 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54080291 |
attatatccttaactatttattattctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattagagataattttgtaaaacaactcataat |
54080192 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54080191 |
atctttttttcacacaatattaattacatttc |
54080160 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Original strand, 9795271 - 9795385
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| Q |
118 |
taattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
9795271 |
taattactctctattctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacataa |
9795370 |
T |
|
| Q |
218 |
tattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
9795371 |
tattaattacatttc |
9795385 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 47916053 - 47915903
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
47916053 |
aaattatatgtcgttttataataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctcttttctttcaattatttaatt |
47915954 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47915953 |
tatctttctcatacaatttattaaggataattttataaaacaactaataat |
47915903 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48910579 - 48910387
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttcttt--caa |
139 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
48910579 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatcattaactatttattactctttcttttttttcaa |
48910480 |
T |
|
| Q |
140 |
ttatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48910479 |
ttatttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaccaactcataatatatttttcccacacaatattaattacatttc |
48910387 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Original strand, 47142265 - 47142433
Alignment:
| Q |
64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
47142265 |
tttacaataccaatgcaacattaacgttactttttctattataaccttaactatttattactctattttctttcaattctttcatttatctttctcatat |
47142364 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47142365 |
tatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
47142433 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13759919 - 13759688
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13759919 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttaggaaaaatatttatcccaaattatatgtcactttacgataccaatgcaacattaatgttacttttcct |
13759820 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
13759819 |
attataactttaactatttattactcttttttttttcaattctttcatttatctttctcatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
13759720 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || | |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13759719 |
atctattttctacacaatattaattgcatttc |
13759688 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 39259263 - 39259490
Alignment:
| Q |
5 |
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104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39259263 |
cctccgtcccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctatta |
39259362 |
T |
|
| Q |
105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |
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|
| T |
39259363 |
taaccttagctatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccaagttatttgttaaggacaattttgtaaaacaacttataatatct |
39259462 |
T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
39259463 |
cttttatacacaatattaattgcatttc |
39259490 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 44035142 - 44035373
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgcttt-ggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcc |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
44035142 |
actccctccgtcccaaattgtacgtcgctttaggagaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatattacttttcc |
44035241 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
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|
| T |
44035242 |
aattataactttaattaattattactccatcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
44035341 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
| ||| || |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
44035342 |
tatctattttccacacaatattaattacattt |
44035373 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 54241106 - 54240875
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||||||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
54241106 |
actccctccgtcccagattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtccgaaattgtatgtcgttttacaataccgatgaaaaataaatgttacttttcct |
54241007 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || || |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
54241006 |
attatatccttaattatttatcaccctctattctttcaattacttcatttatctttctcatatcatttattgagaacaattttgtaaaacaactcataat |
54240907 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54240906 |
atctctttcccacataatattaattacatttc |
54240875 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 32048036 - 32048225
Alignment:
| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
32048036 |
tttgtcccaaattatatatcgctttacaataccaatgcaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactc-ctcttctttcgatt |
32048134 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
32048135 |
ctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatcttttttccacacaatattaattgcatttc |
32048225 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 38999486 - 38999676
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||| | |
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|
| T |
38999486 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattatatcattaattatttattactctttcttttttcaaat |
38999585 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38999586 |
ctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccatacaatattaattacatttc |
38999676 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29361567 - 29361378
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
29361567 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatactaatgcaactttaatgttatttttcttattataaccttaactatttattactctcttttatttcaattc |
29361468 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29361467 |
tttaatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
29361378 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50106292 - 50106106
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
50106292 |
ttgtcctaaattatacgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattttatccttaactatttatcactctct--tctttcaattc |
50106195 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
50106194 |
tttaatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctatttcccacacaaaattaattatattt |
50106106 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 21272629 - 21272853
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21272629 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaatttgtctcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcct |
21272728 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
21272729 |
attataactttaactatttattactctcttttatttcaattctttcatttatttttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataat |
21272828 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21272829 |
atccattttccacacaatattaatt |
21272853 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
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48 |
ccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||| | |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
37331422 |
ccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttattttttcaattataacattaactatttattatgatctcttctttcaattctttca |
37331323 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37331322 |
tttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
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49 |
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148 |
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| |
|
|||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||| |
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|
| T |
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caaattgtatgtcactttagaatattaatgaaatattagtgttatcttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcat |
1540798 |
T |
|
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149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1540799 |
ttatttttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaccaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4822911 - 4822737
Alignment:
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50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4822911 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacat-aatgttacttttcctattataaccttagttatttattactttcttttctttcaattctttcatt |
4822813 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
4822812 |
tatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctcttttctacacaatattaatt |
4822737 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20394272 - 20394041
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20394272 |
actccatccgtcccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaatttgttccaaattgtacgtcgctttacaataccgatgaatcattaatgttacttttcct |
20394173 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||| | || || ||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20394172 |
attatatccttcactatttattgccttccctacttccaagttattcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
20394073 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20394072 |
atctctttcccacacaaaattaattacatttc |
20394041 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 54747988 - 54747760
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |
|
|
| T |
54747988 |
actccttccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttattttttct |
54747889 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54747888 |
attatatccttaattgtttatt--gctatcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
54747791 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
54747790 |
atctctttctcacacaatattaattatattt |
54747760 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33593191 - 33593001
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33593191 |
tttgtctcaaaatttatgtcgttttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttaattatttattactctctcttctttcaatt |
33593092 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
33593091 |
ctttcatttatttttctcatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
33593001 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33600322 - 33600132
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33600322 |
tttgtctcaaaatttatgtcgttttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttaattatttattactctctcttctttcaatt |
33600223 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
33600222 |
ctttcatttatttttctcatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
33600132 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8096843 - 8096663
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
8096843 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaatagcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttc--------- |
8096753 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8096752 |
tttcatttatctttcacatatcatttattaaggataattttgtaaaacaacgcgtaatatctctttctcaaacaatattaattacatttc |
8096663 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Original strand, 11363095 - 11363277
Alignment:
| Q |
46 |
tcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattt |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
11363095 |
tcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactct----tctttcaattcttt |
11363190 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11363191 |
catttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacagaatattaattgcatttc |
11363277 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 200
Target Start/End: Original strand, 53722199 - 53722356
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
53722199 |
ttgttccaaattatatatcgctttacaacaccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatatcttctttcaatta |
53722298 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53722299 |
tttcatttatctttcccatgttatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
53722356 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3671661 - 3671430
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3671661 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcacgttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcca |
3671562 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| |||||||| | ||| ||||||| |||||||||| ||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
3671561 |
attatatcattatgtatttattactctttattccttcaattctttcatttatatttcctatatcatttagtaaagataattttgtaaaactacttgtaat |
3671462 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3671461 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
3671430 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8333673 - 8333498
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||| |||| || |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
8333673 |
aaattatatgttgttttacaatactaatgcaacattaatattactttttctattataaccttaactatttattactctctcttcttttaattctttcatt |
8333574 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8333573 |
tatttttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactgataatatctcttttccacacaatatcaatt |
8333498 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42662739 - 42662508
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
42662739 |
actccctccgccccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaatttgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttactttttct |
42662640 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42662639 |
attatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagtcattcatttatctttcacatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
42662540 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42662539 |
atctcttttccacacaaaattaattacatttc |
42662508 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9783239 - 9783089
Alignment:
| Q |
82 |
tattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataatt |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || | |||| |
|
|
| T |
9783239 |
tattaatgttacttttcctaatatatccttaactatttattattctctcttctttcaattccttcctttatcttttccatatcatttattgagaacaatt |
9783140 |
T |
|
| Q |
182 |
ttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9783139 |
ttgtaaaacaactcataatatctctttcccgcacaatattagttacatttc |
9783089 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 232
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Alignment:
| Q |
83 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattt |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
49893162 |
attaatgttactttttctattataaccttagctatttattactctctattctttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattt |
49893063 |
T |
|
| Q |
183 |
tgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
49893062 |
tgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
49893013 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #140
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| Q |
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gtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatt |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
54103985 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
54103886 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54103885 |
ttatttatctttttcat-----------aggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
54103809 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 207
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ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3429083 |
ttgtctcaaattatttgtcgttttacaataccaatgaagtattaatgttatttttcttattatatcct-aattatttattactctctcttctttcaattc |
3428985 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
3428984 |
tttaatttatcattttcataccatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctt |
3428920 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||| |
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|
| T |
16661509 |
tttgtctcaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacatttattttactttttctattatatctttaactatttattaccttttcttcttttaatt |
16661410 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16661409 |
ctttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaataattcataatatcttttttccacacaatattaattacatttc |
16661319 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 29651994 - 29652230
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| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc-- |
98 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29651994 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttctt |
29652093 |
T |
|
| Q |
99 |
----ctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaact |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
29652094 |
attactattatatccttaactatttattattctttcttttttcaattctttcatttatctttcacatatcatttattaaggacaa-tttgtaaaacaact |
29652192 |
T |
|
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195 |
cataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
|
|||||| | |||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29652193 |
cataatatttcttttccgtacaatattaattacatttc |
29652230 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 240713 - 240524
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
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||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||||| | | |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |
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|
| T |
240713 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaatactaatgaaacattaatatcattttttctattataaccttaactatttattactctcttttctttcaagt |
240614 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
240613 |
cttttatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatatcttttccatacaatattaattatattt |
240524 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23513173 - 23512943
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23513173 |
actccctccgttccaaattgtatgtcgctttaggagaaaaattttgtctcaaattatatgtcgttttataacacccatgcaacattaatgttgctttttc |
23513074 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
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| T |
23513073 |
aattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgt--aacaactcataa |
23512976 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23512975 |
tatctattttccacacaatattaattgcatttc |
23512943 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 31170427 - 31170616
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| | ||||| ||| ||| | |
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| T |
31170427 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcattatttattgccttctctacttccaagtc |
31170526 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| || ||||| |
|
|
| T |
31170527 |
attcatttatttttctcatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatctttcccacacaaaattaagtatatttc |
31170616 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39144638 - 39144457
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
39144638 |
aaattatatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattactctctcttatttcaattctttaatt |
39144539 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| | || |||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
39144538 |
tatctttctcatatcacttatcaaggacaattttgtaaaacaactctaaatatctctttctcatacaaaattaattatattt |
39144457 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 390809 - 390577
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
390809 |
actccctccgttccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaatttgttccaaattgtatgtcgctttacaatacccaatgaatcattaatgttactttttc |
390710 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
390709 |
tattatatccttcactatttattgtcttctctactttcaagtcattcatttatctttcacatatcatttattaaagacaattttataaaacaactcataa |
390610 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
390609 |
tatctcttctccacacaaaattaattacatttc |
390577 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 225
Target Start/End: Original strand, 23656314 - 23656456
Alignment:
| Q |
83 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattt |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23656314 |
attaatgttacttttcctattataaccataattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaaagataattt |
23656413 |
T |
|
| Q |
183 |
tgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23656414 |
tgtaagacaactcataatatctcttttccacacattattaatt |
23656456 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32852205 - 32852052
Alignment:
| Q |
44 |
tgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactc--tctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | | || |||||||| |
|
|
| T |
32852205 |
tgtcctaaattataagtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttccaattatgcccttaactatttattactctattttttttttcaatt |
32852106 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactc |
195 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32852105 |
atttaatttatctttctcataccatttattgaggacaattttgtaaaacaactc |
32852052 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 37056659 - 37056846
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |
|
|
| T |
37056659 |
ttgtccaaaattgtatgtcgctttacaataccaatacaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattagtctct--tatttcaattc |
37056756 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37056757 |
tttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatattttccacacaatattaattgcatttc |
37056846 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6466508 - 6466383
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| Q |
107 |
tccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctct |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
6466508 |
tccttaactatttattgctctctcttctttcaattctttcatttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttt |
6466409 |
T |
|
| Q |
207 |
tccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6466408 |
ttcccacacaatattaattatatttc |
6466383 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 39290537 - 39290704
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39290537 |
actccctccgtcccaaattgtatctcgctttggaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttctc |
39290636 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaattt |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
39290637 |
attatatccttaactatttattactctatcttctttcaattccttaatttatatttactatacaattt |
39290704 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3442861 - 3442669
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaa---tattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaa |
139 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
3442861 |
ttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaaatattaatgttatttttcctattatatcatcaactatctattactctatcttatttcaa |
3442762 |
T |
|
| Q |
140 |
ttatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | | || |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3442761 |
ttcattcatttatctttctaacaccatttattaaggaccattttataaaacaacacataatatatttttcccacacaatattaataacatttc |
3442669 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27039114 - 27038942
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| Q |
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caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |
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|
| T |
27039114 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttat |
27039015 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27039014 |
ttatctttctcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43190728 - 43190539
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| Q |
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142 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||| | |
|
|
| T |
43190728 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaagcattaatgttatttttcatattatatcattaactatttactactttctcttcttccaagtc |
43190629 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43190628 |
attcatttatctttccgatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaattcataatatccattttccacacaaaattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #157
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
27942295 |
actccctccgtcctaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcat |
27942196 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27942195 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #158
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
35958090 |
tttgtcccaaattataagtagctttaaaatacc---gaagcattaatgctacttttcctattatacccttaactatttattactttctcttttttcaatt |
35957994 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35957993 |
ttttattttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
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gtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatt |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
46336741 |
gtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttatttttcttattataacc------atttattactctctcttcttccaattctt |
46336834 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
46336835 |
tcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctttttttcacacaatattaattgcatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #160
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104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42490046 |
cctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcttatta |
42490145 |
T |
|
| Q |
105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttt |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
42490146 |
tatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
42490197 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #161
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |
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|
| T |
4756351 |
tttgtctcaaattatatgtcgctttaagataccaatgaaacattaatattatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaatt |
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|
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142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
4756451 |
ctttaatttatcttttcaat-ttatttaataaggacaattttgtaaaataactcgtaat |
4756508 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Original strand, 27834358 - 27834511
Alignment:
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64 |
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163 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
27834358 |
tttacaatattaataaaacattaatgttatttttcctatcatatccttaattatttattactctctcttcttttaattctttcatttatctatcacatat |
27834457 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||| |
|
|
| T |
27834458 |
catttagtaaggataattttgtaaaacaactcataatatcactttccaacacaa |
27834511 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7674187 - 7673956
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaaattgtcctaaattgtatttcgttttacaatatcaatgaatcattaatgttgcttttcct |
7674088 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||| ||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7674087 |
attatatcattcactatttattgtcttctctacttccaagtcattcatttatctttctcatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataat |
7673988 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7673987 |
atctatttcccacacaaaattaattacatttc |
7673956 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18019683 - 18019509
Alignment:
| Q |
48 |
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147 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
18019683 |
ccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaaaattaattttacttttcctattacaaccttaaccatttattactctct---------attttttca |
18019593 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18019592 |
tttatctttcccatattatttattaaggacaattttgttaaataactcataatatctcttttccacacaatattaattgcattt |
18019509 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 9794475 - 9794591
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
9794475 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaa--ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttct |
9794572 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactatta |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9794573 |
attatatccttaactatta |
9794591 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40164189 - 40164092
Alignment:
| Q |
135 |
ttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40164189 |
ttcaattctttcatttatcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttttcacacaatattaattacatttc |
40164092 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 29040469 - 29040628
Alignment:
| Q |
47 |
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146 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
29040469 |
cccaaattatacgtcgctttacaatagcaatgaagcattaacgttacttttt-tattatgtctttaactatttattaccatctcttttttcaattttttt |
29040567 |
T |
|
| Q |
147 |
atttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
29040568 |
atttatctttcacatatcatttattaaggataattttgtaaaacatgtcataatctctctt |
29040628 |
T |
|
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Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 156
Target Start/End: Original strand, 23781946 - 23782060
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23781946 |
tttgtcccagattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaattttatttttcctattatatctttaactatttattactctatcttctttcaatt |
23782045 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttt |
156 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |
|
|
| T |
23782046 |
cctttatttatcttt |
23782060 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26367414 - 26367250
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| || | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | || |||||| | |||||||| |||| |
|
|
| T |
26367414 |
ttgtccaaaattatatgttgttttacaatactaataaaatattaatgttactttttctattatat-cttaattgtttattactttatcttctttgaattc |
26367316 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgt-aaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26367315 |
cttcatttatctttcccatataatttattaagaacaatttggtaaaaacaactcataatatctctt |
26367250 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48897220 - 48897089
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| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaa-caactcataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
48897220 |
attatatccttaactatttattactct-tcatctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaatttcgtaaaaacaactcataa |
48897122 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||| || | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48897121 |
tatctatttctcacacaatattaattacatttc |
48897089 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 132
Target Start/End: Original strand, 3835300 - 3835382
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctctt |
132 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
3835300 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactttctctt |
3835382 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40501041 - 40500890
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| Q |
85 |
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180 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
40501041 |
taatgttattttttctattataaccttaactatttattactatatcttctttcaattttttcatttatctttctcatattattaatttattaaggagaat |
40500942 |
T |
|
| Q |
181 |
tttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40500941 |
tttgaaaaacaactcataatatctctttttcagataatattaattacatttc |
40500890 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 199
Target Start/End: Original strand, 42938006 - 42938162
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| || |||| ||||||| || |||| |||||||||| |||| | |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42938006 |
tttgtcctaaattatatgttgcttcacaatac-aacgaaacattaatgttattttttccattatatcattgactatttgttactctctcatctttcaatt |
42938104 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttc-catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
42938105 |
ctttcattta-cttttcacatatcatttattaaggataattttataaaacaactcataa |
42938162 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Original strand, 49384130 - 49384239
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| || |||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
49384130 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatacaatattaatgttatttttcctattataactttaactttttattactttatcttctttcaattc |
49384229 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttat |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
49384230 |
tttcatttat |
49384239 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21817575 - 21817467
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49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |
|
|
| T |
21817575 |
caaattatatgtcgttttaccataccaatgaaacattaatgttatttttcccgttatattcttaactatttattactctctcttccttcaattctttctt |
21817476 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatctttt |
157 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
21817475 |
ttatctttt |
21817467 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
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Target Start/End: Complemental strand, 7554642 - 7554503
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| Q |
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ttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaa |
189 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7554642 |
ttactttttctattatactcttaactatttattactttctgttcttttaattctttaatttatttttctcataccatttattaaggataattatgtaaaa |
7554543 |
T |
|
| Q |
190 |
caactcataatttctcttccccacacaatattaattacat |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7554542 |
caactcataatatatcttttccatacaaaattaattacat |
7554503 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #177
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49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| || |||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23005742 |
caaattatatgtcattttacaatactaatgaagcattgatattacttttccaattacatctttaactattttttactctctcttctttcaattctttcat |
23005841 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaa |
188 |
Q |
| |
|
|||| ||| | || ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23005842 |
ttatttttctcgtataatttattaaggacaattttgtaaa |
23005881 |
T |
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Target: chr3; HSP #178
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126 |
ctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45674275 |
ctctcttctttcaattcctttatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaatattaatt |
45674176 |
T |
|
| Q |
226 |
acatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
45674175 |
acatttc |
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T |
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Target: chr3; HSP #179
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattata---tccttaactattaattactctctcttctttca |
138 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| || |||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
19562765 |
tttgtcccaaattatacgtctctttaaaatatcaataaagcattaatgtcaattttcctattacaccatccttaactatttattacttactcttctttta |
19562864 |
T |
|
| Q |
139 |
attatttcatttatcttttccatacaattt----attaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
| | ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19562865 |
actctttaatttatctttcccataccatttattaattaaggataattttgtaaaacaactcaaaattt |
19562932 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
30767872 |
ctatcatatcattaattatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaagacaattttgtaaaattactcata |
30767773 |
T |
|
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199 |
atttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|| |||||| || |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
30767772 |
atatctctttcctacacaaaattaattacattt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #181
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| |
|
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|
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9151415 |
aaattatatgtcattttacaatatcaatgcaacatcaatgatacttttactattataatcttagttatttattactctctcttctttcaattctttaatt |
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T |
|
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150 |
tatcttttcca-----tacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
9151315 |
tatctttctcatggtgtattatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatatcttttccacacaatattaagtgcatttc |
9151228 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Original strand, 42490461 - 42490528
Alignment:
| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42490461 |
atttattaaggataattttgtaaaacgactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
42490528 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 32151407 - 32151282
Alignment:
| Q |
79 |
aaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaattt----attaag |
174 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
32151407 |
aaatattaatgacatttttcctattatttcattaactatttattactctttcttctttcaattctttaatttattttttccataccatttgttaattaag |
32151308 |
T |
|
| Q |
175 |
gataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32151307 |
gacaattttataaaacaacttataat |
32151282 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4493426 - 4493360
Alignment:
| Q |
51 |
aattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4493426 |
aattataagtcgctttacaatattaatgaaacattaatgttacttttcctattatacccttaactat |
4493360 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 232
Target Start/End: Original strand, 35846951 - 35847045
Alignment:
| Q |
138 |
aattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35846951 |
aattctttcatttatctttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
35847045 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43190990 - 43190832
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| | |||||| | |||||||| ||| |
|
|
| T |
43190990 |
tttgtctcaaattatatatcattttacaatatcagtgaaacattaacgttattttttctattatatcattaactacttattactttatcttcttttcatt |
43190891 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43190890 |
ctttaatttatctttctcataccatttacaaaggacaattttgtaaaacaacttataat |
43190832 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 231
Target Start/End: Original strand, 49615375 - 49615527
Alignment:
| Q |
75 |
aatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaag |
174 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | || || || | |||| ||||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
49615375 |
aatgaaacattaatgttacttt-cctattatatccttaactatttattactctattttttt--aactctttcttttatctttctcgtatcatttattaag |
49615471 |
T |
|
| Q |
175 |
gataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
49615472 |
gataatttctcaaaacaactcataatatct-ttcttcacacaaaattaattacattt |
49615527 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21815904 - 21815836
Alignment:
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21815904 |
aatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattatatttc |
21815836 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25134751 - 25134656
Alignment:
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactca |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25134751 |
tattatatctttaactatttattactctctcttcttttaattctttattttatctttctcatac-atttattaagaacaattttgtaaaacaactca |
25134656 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18480074 - 18479908
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattata---tccttaactattaattactctctcttctttcaa |
139 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
18480074 |
ttgtccctaattatacgtctctttacaatatcaataaagcattcatgtcaattttcctattacacaatccttaactatttattactttctcttcttttaa |
18479975 |
T |
|
| Q |
140 |
ttatttcatttatcttttccatacaattt----attaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18479974 |
ctctttaatttatctttctcgtaccatttattaattaaggataattttgtaaaacaactcacaattt |
18479908 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30744089 - 30743951
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||| ||| ||| ||| |
|
|
| T |
30744089 |
aaattataagtcgcat-acaatatcaatgaaatattaattttacttttcttattatactcttagctatttattactctatattctttcgattctttaatt |
30743991 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaa |
189 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30743990 |
tatttttctcatacaattatggaaggacaattttgtaaaa |
30743951 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 45207737 - 45207585
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || |||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| || | |
|
|
| T |
45207737 |
tttgtcccaaattgtatgttgctttacaatactaatgaatt------gttacttttcatattatatccttcactatttattaccttctctacttctaagt |
45207644 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45207643 |
cattcatttatttttcccatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataat |
45207585 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Original strand, 3835381 - 3835447
Alignment:
| Q |
166 |
tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3835381 |
tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttc |
3835447 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Original strand, 23782352 - 23782419
Alignment:
| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23782352 |
atttattgaggacaattttgtaaaacaattcataatatctctttccaacacaatattaattacatttc |
23782419 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 125
Target Start/End: Original strand, 47895181 - 47895256
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattact |
125 |
Q |
| |
|
||||| || |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47895181 |
aaattgtatgtcgttttacaatatcaatgaataattaatgttactttttctattatatccttaactatttattact |
47895256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5355522 - 5355444
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| Q |
129 |
tcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5355522 |
tcttctttcaattctttaatttatttttttcatgccatttattaaggataaatttgttaaacaactcataatatctctt |
5355444 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14343909 - 14343811
Alignment:
| Q |
134 |
tttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14343909 |
tttcaattctttaatttatccttctcatataatttattaaggacaatattgtaaaacaactcataatatctctttttcatacaaaattaattacatttc |
14343811 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| | |||||||| ||| |
|
|
| T |
24552695 |
ttgtctcaaattattagtcgttttacattcacgatgaaatattaatattactttttctattatacccataattatttattactcaattttctttcagtta |
24552794 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataatt |
181 |
Q |
| |
|
||| || ||||||| |||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24552795 |
ttttatctatctttctcatattatttattaaggacaatt |
24552833 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 181
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| | |||||||| ||| |
|
|
| T |
24555780 |
ttgtctcaaattattagtcgttttacattcacgatgaaatattaatattactttttctattatacccataattatttattactcaattttctttcagtta |
24555879 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataatt |
181 |
Q |
| |
|
||| || ||||||| |||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24555880 |
ttttatatatctttctcatattatttattaaggacaatt |
24555918 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #200
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| | |||||||| ||| |
|
|
| T |
24558834 |
ttgtctcaaattattagtcgttttacattcacgatgaaatattaatattactttttctattatacccataattatttattactcaattttctttcagtta |
24558933 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataatt |
181 |
Q |
| |
|
||| || ||||||| |||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24558934 |
ttttatctatctttctcatattatttattaaggacaatt |
24558972 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #201
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| Q |
167 |
ttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27942147 |
ttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatttttttcccaaacaatattaattacatttc |
27942082 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #202
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aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||| || |||| |||||||| | |||| || | | |||| | |||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
54769201 |
aaattatatgtcattttacaatacatataaaacattaatggtattttttctattatagcattaaatacttactactttatcttatttcaattatttaatt |
54769102 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactc |
195 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54769101 |
tatctttcgtataccatttattatggacaattttgtaaaacaactc |
54769056 |
T |
|
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Target: chr3; HSP #203
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ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctc---ttctttcaa |
139 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| | ||| | ||| ||||||| |||| | | | ||||||||| |
|
|
| T |
292456 |
ttgttccaaattataagt-gctttacaacatcaatgaaacattgatgttacttttcttgttaaaccctcaactatttattattattttattttctttcaa |
292358 |
T |
|
| Q |
140 |
ttatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaa |
189 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
292357 |
tcctttaatttatcttttctatattttttattaaggataattttgtaaaa |
292308 |
T |
|
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Target: chr3; HSP #204
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttt |
97 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3349022 |
tttgtcctaaattataagtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttattttt |
3348967 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #205
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| Q |
109 |
cttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| | ||||||||||||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30696463 |
cttatctatttattaatgtctcttctttcaatttttac-tttatctttcatatactatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
30696553 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #206
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Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44697269 - 44697202
Alignment:
| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
44697269 |
atttattaagaacaattttgaaaaacaactcataaaatctctttcccacacaaaattaattacatttc |
44697202 |
T |
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Target: chr3; HSP #207
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43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatc--cttaactattaattactctctcttctttcaat |
140 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| | | |||||||||| |||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
19538457 |
ttgtcacaaattatatgtccatttacaataccaatgaaacattaatgtcactctttctattacaccatcttaactatttattactctttcttcttttaat |
19538556 |
T |
|
| Q |
141 |
tatttc |
146 |
Q |
| |
|
| |||| |
|
|
| T |
19538557 |
tctttc |
19538562 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #208
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Query Start/End: Original strand, 46 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 29852164 - 29852106
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| Q |
46 |
tcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29852164 |
tcccaaattataagtcgctttacaaatacaatgaaacattaatgttatttttcctatta |
29852106 |
T |
|
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Target: chr3; HSP #209
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Query Start/End: Original strand, 165 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31229656 - 31229590
Alignment:
| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
31229656 |
atttatttaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttctcacacaaaattaattaaattt |
31229590 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
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Target Start/End: Complemental strand, 40164263 - 40164201
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta |
104 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40164263 |
tttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctatta |
40164201 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 50106108 - 50106057
Alignment:
| Q |
181 |
tttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
50106108 |
tttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
50106057 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 173
Target Start/End: Original strand, 19547157 - 19547287
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatc--cttaactattaattactctctcttctttcaat |
140 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| | |||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
19547157 |
ttgtcccaaattatatgtatatttacaatatcaatgaagcactaattacactttttctattatatcatcttaactatttattactct--cttcttttaat |
19547254 |
T |
|
| Q |
141 |
tatttcatttatcttttccatacaatttattaa |
173 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
19547255 |
tctttaatttatctttcccgtaccatttattaa |
19547287 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 35300602 - 35300546
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattata |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
35300602 |
aaattataagtcgctttacattacaaataaaatattgatgttacttcttctattata |
35300546 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 9196813 - 9196854
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| Q |
159 |
catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9196813 |
cataccatttattaagtacaattttgtaaaacaactcataat |
9196854 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34246927 - 34246882
Alignment:
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaac |
193 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34246927 |
tttaacttttccattctatttattaagcataattttgtaaaacaac |
34246882 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 232
Target Start/End: Original strand, 47895595 - 47895656
Alignment:
| Q |
171 |
taaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||| || |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
47895595 |
taaggacaattttgtaaagcaactcataatatattttcctcatacaaaattaattacatttc |
47895656 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 207
Target Start/End: Original strand, 118785 - 118845
Alignment:
| Q |
147 |
atttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
118785 |
atttatgtttaccataccattaattaatgatatttttgtaaaataactcataattactctt |
118845 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 141
Target Start/End: Original strand, 21653238 - 21653330
Alignment:
| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
21653238 |
caaattataaaccgctttacaatactaataaatcattaatgttattttttttatcatacccttaacgatttaatactctcgcttatttcaatt |
21653330 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 208)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 11216593 - 11216824
Alignment:
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100 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
11216593 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcct |
11216692 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11216693 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaacaactcataat |
11216792 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11216793 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
11216824 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 38959736 - 38959967
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38959736 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcct |
38959835 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38959836 |
attatatccttaactattaattactctctctcctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
38959935 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38959936 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
38959967 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43521673 - 43521443
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43521673 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatt-gtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
43521575 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43521574 |
attatatccttcactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
43521475 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43521474 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
43521443 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22154293 - 22154062
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22154293 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
22154194 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22154193 |
attatatccttaactattaattactcactcttctttcaattatttcatttattttttccataccatttattagggataattttgtaatacaactcataat |
22154094 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22154093 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
22154062 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2048236 - 2048047
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2048236 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaactattaattactctctcttctttcaatta |
2048137 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2048136 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatacaatattaattacatttc |
2048047 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 36845821 - 36846050
Alignment:
| Q |
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36845821 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttgggaaaaaa--ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
36845918 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
36845919 |
attatatccttaactattaattactctttcttctttcaattatttcatttatattttccatacaatttattaaggataattttgtaaatcaactcataat |
36846018 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36846019 |
ttctcttctccacccaatattaattacatttc |
36846050 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 37985525 - 37985755
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37985525 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaa-tttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcct |
37985623 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37985624 |
attatatccttaactattaattactttttcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
37985723 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37985724 |
ttctcttccccacacaatattaattatatttc |
37985755 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40483675 - 40483445
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
40483675 |
actccctccgtcccaaattgtacgtcgctttggaaaaaaa-tttgtcccaaattatatgtcgttttacaatacaaatgaaatattaatgttatttttcct |
40483577 |
T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40483576 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttattatggataattttgtaaaacaactcataat |
40483477 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40483476 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
40483445 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41285884 - 41285654
Alignment:
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Q |
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|
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| T |
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41285785 |
T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41285784 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttaatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
41285685 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41285684 |
ttctcttccctacacaatattaattacattt |
41285654 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6027130 - 6026901
Alignment:
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100 |
Q |
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| T |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagagatacttttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6026932 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14309185 - 14308954
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| Q |
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100 |
Q |
| |
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| T |
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14309086 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14309085 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
14308986 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14308985 |
ttttctttcccacgcaatattaattacatttc |
14308954 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 16198393 - 16198624
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
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|
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16198492 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16198493 |
attatatccttaactattatttactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaacccataat |
16198592 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16198593 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
16198624 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30549850 - 30549619
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
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|
| T |
30549850 |
actccctccgtccccaattgtatgtcgttttggaaaaaaaaattgttccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcct |
30549751 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30549750 |
attatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
30549651 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30549650 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
30549619 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37111282 - 37111051
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37111282 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttgggaaaaaaaattgtctcaaattacatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcct |
37111183 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37111182 |
attatatccttaactattaattactccatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
37111083 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37111082 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
37111051 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 9527494 - 9527683
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| Q |
43 |
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142 |
Q |
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|
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|
|
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9527494 |
ttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaataataatgttacttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaatta |
9527593 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9527594 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaaaattaattacatttc |
9527683 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Original strand, 35669689 - 35669918
Alignment:
| Q |
3 |
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102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
35669689 |
tccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctat |
35669788 |
T |
|
| Q |
103 |
tatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35669789 |
tatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataattt |
35669888 |
T |
|
| Q |
203 |
ctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35669889 |
ctcttccccatgcaatattaattacatttc |
35669918 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8444278 - 8444066
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
8444278 |
actccctccgtcccaaattgtatgttgctttggaaaataaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttactttttct |
8444179 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8444178 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
8444079 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccac |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
8444078 |
ttctcttccccac |
8444066 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32068497 - 32068265
Alignment:
| Q |
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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32068398 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
32068397 |
tattatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaacttataa |
32068298 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32068297 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
32068265 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22375299 - 22375068
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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22375200 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22375199 |
attatatccttaactattaattacttcatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaagataattttgtaaaacaactcataat |
22375100 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22375099 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
22375068 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27863081 - 27862850
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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27862982 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27862981 |
attatatcctttattattaattactctcttttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaattcataat |
27862882 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27862881 |
ttctcttccctacgcaatattaattacatttc |
27862850 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31072696 - 31072465
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31072696 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaattttttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31072596 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
31072497 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31072496 |
ttcttttccccacgcaatattaattacatttc |
31072465 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22050706 - 22050517
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43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
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| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22050706 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
22050607 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22050606 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaatacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
22050517 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 8495279 - 8495510
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| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |
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|
| T |
8495279 |
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8495378 |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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| |
|
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|
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8495379 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
8495478 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8495479 |
ttctcttcctcacacaatattaattacatttc |
8495510 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 17399762 - 17399992
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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17399860 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
17399861 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaatttataat |
17399960 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17399961 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
17399992 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14780942 - 14780752
Alignment:
| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttgtcccaaattatatgtccctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctttcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14780842 |
atttcatttattttttccataccatttattatggataattttgtaaaacaactcataatttcttttccccacacaatattaattacatttc |
14780752 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30564218 - 30564034
Alignment:
| Q |
48 |
ccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
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30564218 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaagtattaattactccctcttctttcaattatatca |
30564119 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30564118 |
tttatcgtttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 21288852 - 21289083
Alignment:
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100 |
Q |
| |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21288952 |
attatatccttaagtattaattactctctcttcttttaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
21289051 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21289052 |
ttcttttctccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 38993529 - 38993717
Alignment:
| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
38993529 |
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38993626 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38993627 |
atttcatttatattttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatacaatattaattacatttc |
38993717 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 43446535 - 43446765
Alignment:
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
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43446633 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43446634 |
attatatccttaactattaattattctctcttatttcaattatatcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactgataat |
43446733 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43446734 |
ttctcttccctaaacaatattaattacatttc |
43446765 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29432963 - 29432732
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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29432864 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29432863 |
attatatccttaactattaattactatctcttcttttaattatttcatttatcttttccatatcatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
29432764 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29432763 |
ttttcttccccatgcaatattaattacatttc |
29432732 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 36173957 - 36174187
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
36173957 |
actcccttcgttccaaattgtatgtcgctttggaaaaagaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcat |
36174056 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36174057 |
att-tatccttaactattaattactctaccttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
36174155 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36174156 |
ttctcttccccacacaatattaattatatttc |
36174187 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39958400 - 39958211
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
39958400 |
tttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatattacttttcctattatatccttaactattaattactttatcttctttcaatt |
39958301 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39958300 |
atatcatttattttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
39958211 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 29411826 - 29412062
Alignment:
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29411826 |
actccatccgttccaaattgtatgtcactttggaaaaattttttgtcccaaattatatgtcattttacaataccaatgaaatgaaatattaatgttactt |
29411925 |
T |
|
| Q |
96 |
ttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactc |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29411926 |
ttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttttataccatttattagggataattttgtaaaacaactc |
29412025 |
T |
|
| Q |
196 |
ataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29412026 |
ataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
29412062 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36598856 - 36598629
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104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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cctccgtcccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaaattgttccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatatttatgttacttttcctatta |
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T |
|
| Q |
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tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36598756 |
tatccttaactattaaatactctctcttctttcaattatttcatttatattttccatactatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttct |
36598657 |
T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
36598656 |
cttccccatgctatattaattacatttc |
36598629 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28206688 - 28206457
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
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|
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28206589 |
T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28206588 |
attatatccttaactatttattactctcccttctttcaatttcttcatttatcttttccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataat |
28206489 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28206488 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
28206457 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 325412 - 325181
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100 |
Q |
| |
|
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|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
325312 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataat |
325213 |
T |
|
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
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atcgctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 19002906 - 19003137
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100 |
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| |
|
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|
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T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19003006 |
attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatataatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
19003105 |
T |
|
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19003106 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28787004 - 28786773
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| Q |
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
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| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |
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|
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28787004 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaataaaaaattaatgttacttttcct |
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|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28786904 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
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atctctttcccacacaatattaattacatttc |
28786773 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 34504342 - 34504553
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100 |
Q |
| |
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| T |
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34504441 |
T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
34504442 |
attatatccttaattattaattactctattttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataac |
34504541 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttcccca |
212 |
Q |
| |
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|| ||||||||| |
|
|
| T |
34504542 |
ttttcttcccca |
34504553 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 41095926 - 41096157
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100 |
Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
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| T |
41096026 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttttcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
41096125 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41096126 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 14885060 - 14885250
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
14885159 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14885160 |
atttcatttatctttcccatataatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttc |
14885250 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 34036140 - 34036330
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
34036239 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34036240 |
tcttcatttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaactacatttc |
34036330 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 14527750 - 14527981
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100 |
Q |
| |
|
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| T |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
14527850 |
attatatccttaactatttattactctttattttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
14527949 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14527950 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
14527981 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 22060980 - 22061211
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22060980 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
22061079 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22061080 |
attatatccttaattatttattattctttcttctttcaattatttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttataaaacaactcataat |
22061179 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22061180 |
atctttttcccatacaatattaattacatttc |
22061211 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40171818 - 40171587
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
40171818 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
40171719 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40171718 |
attatattcttaactatttattactttttcttctttcaattctttcatttattttttccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
40171619 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
40171618 |
atctcttacccacacagtattaattacatttc |
40171587 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28181727 - 28181538
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28181727 |
tttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttgctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
28181628 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28181627 |
ccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacattt |
28181538 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26850103 - 26849872
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26850103 |
actccctccttcccaaattgtatgtcactttagaaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
26850004 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26850003 |
attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
26849904 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26849903 |
atctcttttccacacaatattaattacatttc |
26849872 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24000364 - 24000174
Alignment:
| Q |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24000364 |
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24000264 |
ctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttc |
24000174 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8247376 - 8247187
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8247376 |
ttgtcccaaattatatatcgctttacaataccaataaaaaattaatgttactttttctattatatcattaactatttattactctctcttctttcaattc |
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T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8247276 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Original strand, 14834053 - 14834224
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| Q |
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gctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatc--ttttcc |
159 |
Q |
| |
|
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|
| T |
14834053 |
gctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttttcc |
14834152 |
T |
|
| Q |
160 |
atacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14834153 |
ataccatttattaaggataattttgt-aaacaactcataattaatcttcgccacacaatattaattacatttc |
14834224 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 207
Target Start/End: Original strand, 37988223 - 37988388
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37988223 |
tttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctcttttctttcaatt |
37988322 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37988323 |
atttcatttatctttttcataccatttattaggtataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
37988388 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7491691 - 7491507
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| Q |
44 |
tgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattat |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
7491691 |
tgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaaccatttattactatctcttctttcaattcc |
7491592 |
T |
|
| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7491591 |
ttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattaca |
7491507 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 9053576 - 9053752
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aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
9053576 |
aaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttattttttctattttatccttaactattaattactctctcttctttcaattaatttatt |
9053675 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9053676 |
tatcttttccataccatttattagggataattctgtaaaacaactcataatttttcttccccacgcaatattaatta |
9053752 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 10877308 - 10877536
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4 |
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103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10877308 |
ccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttatcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctatt |
10877407 |
T |
|
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104 |
atatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
10877408 |
atatccttaactatttattactctctcttcttttaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatc |
10877507 |
T |
|
| Q |
204 |
tcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
10877508 |
tctttcccacacaatattaattacatttc |
10877536 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31909814 - 31909626
Alignment:
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43 |
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142 |
Q |
| |
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|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
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| T |
31909814 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgatatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaatta |
31909715 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31909714 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctatttcccaaacaatattaattacattt |
31909626 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 12192448 - 12192639
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12192448 |
tttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaatt |
12192547 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatc-ttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
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| T |
12192548 |
ctttcatttatcttttttcatatcatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaatattaattatatttc |
12192639 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14943544 - 14943313
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14943444 |
attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
14943345 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14943344 |
atctatttcccacacaatattaattacatttc |
14943313 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 36443514 - 36443745
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
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36443514 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttattttttct |
36443613 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
36443614 |
attatatccttaattatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataac |
36443713 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36443714 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
36443745 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39927771 - 39927540
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39927771 |
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39927672 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
39927671 |
attataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttcccataatatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
39927572 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
39927571 |
atctcttttccacacaatattagttacatttc |
39927540 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 19576088 - 19576278
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19576088 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctatcttctttcaatt |
19576187 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19576188 |
ccttcatttatttttcccatgtcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
19576278 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 23498038 - 23498267
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23498038 |
actccctccgtcccaaaatgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttata-taccaatgaaaaattaatgttacttttcct |
23498136 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23498137 |
attatatccttaactatttattactctttcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
23498236 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23498237 |
atctctttcccacacaatattaattacattt |
23498267 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 28330786 - 28330976
Alignment:
| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28330786 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctttcttctttcaatt |
28330885 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28330886 |
cattcatttatctttcctatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacagtattaattacatttc |
28330976 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41787125 - 41786935
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| Q |
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141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41787125 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
41787026 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
41787025 |
ctttcatttatctttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatcttttttccacacaatattaattacatttc |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1667040 - 1666808
Alignment:
| Q |
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Q |
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T |
|
| Q |
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tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1666940 |
tattataaccttagctatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataa |
1666841 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||| | |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1666840 |
tatctcatttccacacaatattaattgcatttc |
1666808 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3873692 - 3873460
Alignment:
| Q |
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3873692 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcc |
3873593 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
3873592 |
tattataacctttgctatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaataactcataa |
3873493 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3873492 |
tatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
3873460 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5005302 - 5005072
Alignment:
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Q |
| |
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|
|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5005203 |
attataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatcttttccatattatttattaatgacaattttgtaaaacaactcataat |
5005104 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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atctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 9110689 - 9110863
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| Q |
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ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
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Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
|
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143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9110789 |
tttcatttatcttttcc---------------gataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 13375312 - 13375543
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| |
|
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|
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
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attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
13375511 |
T |
|
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || | |||||||||||||||||||||| |
|
|
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13375512 |
atctatttctcacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 40833469 - 40833700
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| |
|
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|
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|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
40833569 |
attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttatcatatcatttattaaggataattttgtaaaataactcataat |
40833668 |
T |
|
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
|
|||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 42056037 - 42056268
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| Q |
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| |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttattccaaattatatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatgtttcct |
42056136 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
42056137 |
attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttataaaacaactcataat |
42056236 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
42056237 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
42056268 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #71
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Target Start/End: Complemental strand, 5669246 - 5669056
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141 |
Q |
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tttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactatctcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
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5669146 |
ccttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatccctttcccacacaatattaattatatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9047478 - 9047288
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141 |
Q |
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T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
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ctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacgcaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #73
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 36068146 - 36068336
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141 |
Q |
| |
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T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
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ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacataatattaattacatttc |
36068336 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 41186824 - 41187013
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Q |
| |
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tttgtcccaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctctcttctttcaa-t |
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T |
|
| Q |
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232 |
Q |
| |
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ccttcatttatttttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaacttaaaatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr2; HSP #75
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Target Start/End: Original strand, 27183101 - 27183283
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145 |
Q |
| |
|
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|
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T |
|
| Q |
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catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatt |
230 |
Q |
| |
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|
|
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catttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcgtaatatctctttcccacacaatattaattacatt |
27183283 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #76
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Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Original strand, 27832643 - 27832825
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| Q |
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145 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttatta--ctctcttctttcaattcctt |
27832740 |
T |
|
| Q |
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catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatt |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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27832741 |
catttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcgtaatatctctttcccacacaatattaattacatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #77
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Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Original strand, 14723837 - 14724031
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|
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gtcccaaattgtatgtcgctttataataccaatgaaatattaatgttactccctcttctttcaattatttcattaactattaattactccctcttctttc |
14723936 |
T |
|
| Q |
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aattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
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aattatttcatttatcttttcaatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40425242 - 40425010
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T |
|
| Q |
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tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
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tatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #79
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13849504 - 13849314
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| |
|
||||||| ||||| || ||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |
|
|
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13849405 |
T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ctttcatttatctttcccatataatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
13849314 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #80
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Target Start/End: Original strand, 518465 - 518695
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T |
|
| Q |
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tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
518565 |
tattataaccttagctatttattactct--cttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
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T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |
|
|
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tatctcttttccatacaatattaattgcatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 29026969 - 29027201
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
|
| Q |
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tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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aattataaccttaattaattattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
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T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||| || ||||||||| |||||| |||||| |
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|
| T |
29027169 |
tatctattttccacacaatgttaattgcatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5421434 - 5421665
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatc-cttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
5421534 |
attatatttcttaactatttattactctctctcctttcaattccttcctttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataa |
5421633 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
5421634 |
tatctctttcccacgcaatattaattacattt |
5421665 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 6596508 - 6596698
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
6596508 |
tttgtctcaaattgtatgtcattttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatatccttaactatttattactttttcttctttcaatt |
6596607 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
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tcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattt |
145 |
Q |
| |
|
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|
|
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32674627 |
tcccaaattgtatatcgctttacgataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcttt |
32674528 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32674527 |
catttatctttctcatatca-ttattgaggacagttttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
32674442 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #85
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Query Start/End: Original strand, 42 - 231
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141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2443519 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattgtaaccttagttatttattactctctcttctttcaatt |
2443420 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2443419 |
ctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcattt |
2443330 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10198099 - 10197870
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| |
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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| |
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|
| T |
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attatacccttgactatttattactttatcttctttcaattctttaatttatctttcccataacatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
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ttctcttccccacacaatattaattacatt |
230 |
Q |
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| T |
10197899 |
atctctttcccatacaaaattaattacatt |
10197870 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #87
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Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Original strand, 3870805 - 3870988
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| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
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| T |
3870805 |
caaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctttgctatttattactctcttttctttcaattctttcat |
3870904 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
3870905 |
ttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
3870988 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Original strand, 12467674 - 12467861
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45 |
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144 |
Q |
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| T |
12467674 |
gtcccaaattgtatgtcactctagaataccaatgaaacattaatgctattttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctt |
12467773 |
T |
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| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
12467774 |
tcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
12467861 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Original strand, 27244931 - 27245118
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| Q |
45 |
gtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatt |
144 |
Q |
| |
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| T |
27244931 |
gtcccaaattgtatgtcacttttgaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctt |
27245030 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
27245031 |
tcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacataatattaattatatttc |
27245118 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 39407777 - 39408008
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100 |
Q |
| |
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| T |
39407777 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccactgaaacattaatgttatttttcct |
39407876 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
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| T |
39407877 |
attatattcttaactatttattactctttcttttttcaattctttcgtttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
39407976 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
39407977 |
atctctttcgcacacaatattaattacatttc |
39408008 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #91
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1420905 - 1420715
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
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| T |
1420905 |
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1420806 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
1420805 |
ccttaatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
1420715 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Original strand, 6579742 - 6579932
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| Q |
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttcttt-caat |
140 |
Q |
| |
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| T |
6579742 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaataaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactgtttattactctttctttttttcaat |
6579841 |
T |
|
| Q |
141 |
tatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
6579842 |
tctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttgcccacacaatattaattacattt |
6579932 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19240854 - 19240664
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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| T |
19240854 |
tttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataatcttaactatttattactctctcttctttcaaat |
19240755 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
19240754 |
cttttatttatatttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttccacacaatattaattacatttc |
19240664 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19275181 - 19274992
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| Q |
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141 |
Q |
| |
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| T |
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tttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcatctttcaatt |
19275082 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
19275081 |
ctttcatttatctttcccatatca-ttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatcttttctacacagtattaattacatttc |
19274992 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21134646 - 21134456
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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| T |
21134646 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattattctctcttctttcaatt |
21134547 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |
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| T |
21134546 |
ctttcatttatatttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaataattcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttc |
21134456 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39235205 - 39235032
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| Q |
59 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttc |
158 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
39235205 |
gtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattccttaatttatctttcc |
39235106 |
T |
|
| Q |
159 |
catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
39235105 |
tatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
39235032 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 225
Target Start/End: Original strand, 28248499 - 28248680
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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|
|
| T |
28248499 |
tttgtcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaactttaatgttactttttctattatatccttaactatttattactct--cttctttcaatt |
28248596 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
28248597 |
ctttaatttatcttttccataccatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccaaacaaaattaatt |
28248680 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 44421576 - 44421808
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99 |
Q |
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44421576 |
actccctccgtcccaaattgtatgttgctttaggagaaaaaatttgtcccgaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatgttacttttcc |
44421675 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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|
|
| T |
44421676 |
aattataaccttaattaattattactctctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
44421775 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| ||| || |||||||||||||||| |||||| |
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| T |
44421776 |
tatcttttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #99
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4646673 - 4646442
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtgactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatatcactttataataccaataaaacattaatgttacttttcct |
4646574 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
4646573 |
attatatccttaaccatttattactctttcttctttcaattctttcatttatttttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
4646474 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
4646473 |
atctcttccccatactgtattaattatatttc |
4646442 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 16062529 - 16062760
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||||| || ||| || || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
16062629 |
attatatccttaactatttattactttttcttttttcaattctttcatttatctttcccgtataatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
16062728 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
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| T |
16062729 |
atctctttagcacataatattaattacatttc |
16062760 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #101
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Query Start/End: Original strand, 45 - 232
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45 |
gtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatt |
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Q |
| |
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gtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcatgttgtatccttaactatttattaccctctcttctttcaattcct |
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T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38448257 |
tcatttatctttcccatatcatttattgatgacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccgcacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 1204954 - 1205144
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42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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| T |
1204954 |
tttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcttattatatccttaactatttattactctttcatttttcaatt |
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T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
1205054 |
ctttcatttatctttctcatatcatttaataaggataattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #103
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Query Start/End: Original strand, 50 - 232
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| |
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5443893 |
aaattatatgtcgttttacaatatcaatgtaatattaatgttattttttctattatatctttaactatttattactatctattctttcaattctttcatt |
5443794 |
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| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5443793 |
tatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttc |
5443711 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 6713928 - 6714118
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42 |
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141 |
Q |
| |
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| T |
6713928 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaattaattattactctatcttctttcaatt |
6714027 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
6714028 |
ctttcatttatatttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgcatttc |
6714118 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29843877 - 29843711
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66 |
tacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaa |
165 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |
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| T |
29843877 |
tacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattccttcatttatctttctcatatca |
29843778 |
T |
|
| Q |
166 |
tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
29843777 |
tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccgcacaatattaattacatttc |
29843711 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8341699 - 8341530
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| Q |
63 |
ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
162 |
Q |
| |
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| T |
8341699 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcata |
8341600 |
T |
|
| Q |
163 |
caatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
8341599 |
tcatttattaaggataattttataaaacaactcataatatctctttcccacataatattaattacatttc |
8341530 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27341825 - 27341637
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
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||||| |||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
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| T |
27341825 |
ttgtctcaaattgtatgtcacttttcaataccaatgaaacattaatgttt-ttttcctattatatcattaactatttattactctttcttctttcaattc |
27341727 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
| T |
27341726 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttc |
27341637 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19166402 - 19166231
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| Q |
61 |
cgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttcca |
160 |
Q |
| |
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|
|
| T |
19166402 |
cgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttccca |
19166303 |
T |
|
| Q |
161 |
tacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
19166302 |
tatcatttattgaggacaattttgtaaaacaacccataatatcttttttccacacaatattaattacatttc |
19166231 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Original strand, 38150568 - 38150735
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| Q |
50 |
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149 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38150568 |
aaattatatctcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatt |
38150667 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
217 |
Q |
| |
|
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|
| T |
38150668 |
tatctttcacatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccagacaa |
38150735 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 40649053 - 40649283
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
40649053 |
actccctccgtctcaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatt-gtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcct |
40649151 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
40649152 |
attatatccttcactatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
40649251 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||| |
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| T |
40649252 |
atctctttcccacacaaaattaattacatttc |
40649283 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 25899001 - 25899230
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
25899001 |
actccatccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttct |
25899100 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
25899101 |
attatatcattaactatttattaccatttcttttttcaattctt-catttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
25899199 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25899200 |
atctctttcccacgcaatattaattacattt |
25899230 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 29360790 - 29360980
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29360790 |
tttgtcccaaattaccggtcgctttacaataccaatgaaacattaattttactttttctattatatctttaactatttattactctctattctttcaatt |
29360889 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | ||| ||||||||||| ||||| |
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|
| T |
29360890 |
ttttcttttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttctacataatattaattaaatttc |
29360980 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1684375 - 1684184
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt- |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
1684375 |
ttgtcccaaattgtatgtcattttacaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatctttaattatttattactctttcttctttcaattc |
1684276 |
T |
|
| Q |
142 |
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232 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
1684275 |
aattttatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaaaattaattacatttc |
1684184 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Original strand, 44195607 - 44195795
Alignment:
| Q |
45 |
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143 |
Q |
| |
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|
| T |
44195607 |
gtcccaaattatatgtcgcttttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaaccatttattactatctcttctttcaattct |
44195706 |
T |
|
| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
44195707 |
ttcatttatatttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaatattaattgcatttc |
44195795 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 15848626 - 15848857
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
15848626 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaaattgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttactttttct |
15848725 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
15848726 |
attatatccttcactatttattgccttctctactctcaagtcattcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttataaaacaactcataat |
15848825 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
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| T |
15848826 |
atctctttcccacacaaaattaattacatttc |
15848857 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #116
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Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 4826341 - 4826523
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| Q |
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aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
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| T |
4826341 |
aaattatacgtcgctttataatatcaataaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattattctctcttgtttcaattcatttatt |
4826440 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| | || |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4826441 |
taaccttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
4826523 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5748676 - 5748507
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| Q |
63 |
ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
162 |
Q |
| |
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| T |
5748676 |
ctttacgataccaatgaaacattaacgttatttttcctattatattcttaactatttattactcttttttttttcaattctttcatttatctttctcgta |
5748577 |
T |
|
| Q |
163 |
caatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
5748576 |
tcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
5748507 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44710071 - 44709890
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44 |
tgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattat |
143 |
Q |
| |
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| T |
44710071 |
tgtcccaaattatatgtccctttataataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatcctcaactatttattactttctcttctttcaattcc |
44709972 |
T |
|
| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| || |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
44709971 |
ttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcacaatatctttttcccatgcaatattaatt |
44709890 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18450210 - 18449979
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18450210 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttgaaaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatattacttttcct |
18450111 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
18450110 |
attatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagtcattaatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
18450011 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18450010 |
atctctttcccacacaaaattaattacatttc |
18449979 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3376663 - 3376482
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50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
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| |
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3376663 |
aaattgtatgtcgttttacaatatcgacgaaaaattaatgttattttttctattatatccttaacaatttattactctctcttctttcaatttcttcatt |
3376564 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3376563 |
tatctttcccatattatttattgaggataatttt-taaaacaactcataatatctctttctcacacaatattaattacatttc |
3376482 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 232
Target Start/End: Original strand, 25556927 - 25557076
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83 |
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182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25556927 |
attaatgttactttttctattataaccttaattatttattactttctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaaggataattt |
25557026 |
T |
|
| Q |
183 |
tgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
25557027 |
tgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
25557076 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3628603 - 3628435
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64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
163 |
Q |
| |
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|
|
| T |
3628603 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaattatttattagtctctcttctttcaagtcttttatttatctttcctatat |
3628504 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
3628503 |
tatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaatattaattacatttc |
3628435 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 34213169 - 34213348
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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| T |
34213169 |
tttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
34213268 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34213269 |
cttttatttatcttttccat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
34213348 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11154471 - 11154296
Alignment:
| Q |
50 |
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149 |
Q |
| |
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|||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
11154471 |
aaattatatgtcactttacaataccaatacaacattaatgttactttttctgttataatcttaattatttattaccctctcttctttcaattctttcatt |
11154372 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
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||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |
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|
| T |
11154371 |
tatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccagacaatattaatt |
11154296 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12208378 - 12208195
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttt-cctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| || |||||| || |||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
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| T |
12208378 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttaaaatgccaatgcaacgttaatgatattttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaatt |
12208279 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12208278 |
cttttatttatctttctcatatcatttattaaggatatttttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaatt |
12208195 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12363621 - 12363852
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgcatgtcactttggaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcct |
12363720 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|||||| |||| |||||| ||| | | ||| ||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
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| T |
12363721 |
attatacccttcactatttattgccttatctacttccaagtcattcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttataaaacaactcataat |
12363820 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12363821 |
atctatttcccacacaaaattaattacatttc |
12363852 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 30780057 - 30780239
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30780057 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttacaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcct |
30780156 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataatttt |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
30780157 |
attatatccttaactatttattactttctcttctttcaattccttcatttttctttcccatatcatttattgaggacaatttt |
30780239 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1221319 - 1221099
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1221319 |
actccctccgtcccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
1221220 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1221219 |
attataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttcccat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataat |
1221131 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1221130 |
atctcttttccacacaatattaattaaatttc |
1221099 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 40171933 - 40172114
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
40171933 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgacacattaatgttactttttctattatatctttaattatttattactct---ttcttt----- |
40172024 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40172025 |
-tttcatttatcttacccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaatattaattacatttc |
40172114 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43257479 - 43257322
Alignment:
| Q |
75 |
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174 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43257479 |
aatgaaatattaatgttacttttcttattatatcattaattatttattactttttcttctttcaattcttttatttatttttcccatataatttattaag |
43257380 |
T |
|
| Q |
175 |
gataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43257379 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatatttttcccacacaatattaattatatttc |
43257322 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33677409 - 33677182
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33677409 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttgcaaaaaaa--ttggcctaaattatatgtcgctttacaatactgatgaaacattaatgttacttttcct |
33677312 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33677311 |
attatatccttaattatttatta--ctctcttctttcaatgctttaatttatctttctcataccatttataaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
33677214 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| | || ||||||||| |||| ||| ||||| |
|
|
| T |
33677213 |
atatatttcccacacaaaattatttatatttc |
33677182 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2893961 - 2893796
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| Q |
63 |
ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||| | ||||||||||||| | || |
|
|
| T |
2893961 |
ctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttacta--ctctcttctttcaa-tccttcatttatctttcctgta |
2893865 |
T |
|
| Q |
163 |
caatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2893864 |
c-atttattagggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttc |
2893796 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 23494484 - 23494674
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |
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|
| T |
23494484 |
tttgtcccaaattatatgtcactttacaatactaatgcaacattaatgttactttttcaattgtaaccttaactatttattattatctcttctttcaatt |
23494583 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | | || ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23494584 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaatttataatatttttttttcacacaatattaattgcatttc |
23494674 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 15269551 - 15269731
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| Q |
52 |
attataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta-tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcattt |
150 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15269551 |
attatatgtcgttttacaataccaaaaaaacattaatgttacttttcatattactatccttagctatttattactctatcttctttcaattctttcattt |
15269650 |
T |
|
| Q |
151 |
atcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | || |||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
15269651 |
ctctttctcataccattttttaaggagaaatttgtaaaacaactcataatatctctttctcatacaaaattaatgacattt |
15269731 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20925978 - 20925747
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| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
20925978 |
actccctcagtcccaaattgtacgtcactttgggaaaaaaaattatcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaacgttatttttcct |
20925879 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
20925878 |
attatattcttaactatttattactttctctcattccaaatcattcatttatttttcccatgtcatttattaattacaattttgtaaaacaactcataat |
20925779 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20925778 |
atttctttcccacacaaaattaattacatttc |
20925747 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Original strand, 29513411 - 29513592
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ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||| |
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| T |
29513411 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgatactttttctattataaccttaattatttattaccctttcttctttcaattc |
29513510 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29513511 |
tttcatttatttttctcatatcatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatct-tttttcacacaatattaatt |
29513592 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 8059854 - 8060043
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| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
8059854 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaatacagatgcaacaacaatgttacttttcttattataaccttaattatttattactctctcttttttcaattc |
8059953 |
T |
|
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143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8059954 |
tttcatttatttttcccatattatttattaatgacaattttgtaaaacaattcataatatctgtttttcacataatattaattgcatttc |
8060043 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #138
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Target Start/End: Complemental strand, 12123107 - 12122951
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43 |
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142 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| |||| |||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
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| T |
12123107 |
ttgtcctaaattatacgtcgttttataatatcaataaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctccattctttcaatt- |
12123009 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12123008 |
tttaatttatctttcacataccatttattaaagataattttgtagaacaactcataat |
12122951 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
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43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30803480 |
ttgtcacaaattgttagtcactttacaataccaatgaaacattaatattactttttctattatatctttaactatttattactcgttcttctttc----- |
30803574 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | | || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30803575 |
----atttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatttatttcccacacaatattaattatatttc |
30803660 |
T |
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Target: chr2; HSP #140
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199 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4898162 |
tattataaccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatcctttacatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataa |
4898063 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4898062 |
tatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
4898030 |
T |
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Target: chr2; HSP #141
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tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4945556 |
tattataaccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatcctttacatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataa |
4945457 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4945456 |
tatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
4945424 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #142
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158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||| | ||||||||| ||| |
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| T |
22060706 |
gtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcttattatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagtcattcatttatatttct |
22060805 |
T |
|
| Q |
159 |
catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
22060806 |
catattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacataaaattaattatatttc |
22060879 |
T |
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Target: chr2; HSP #143
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| Q |
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142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | | ||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
27525006 |
ttgtcccaaattatatggggattttcaatatcaatcaagcattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttcttttaattc |
27525105 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| | ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
27525106 |
tttaaattatcctttccata----tcattaaggataattttgtaaaacagcccataatatctctttaccatacaaaatttattacatttc |
27525191 |
T |
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Target: chr2; HSP #144
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Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19505872 - 19505714
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | |
|
|
| T |
19505872 |
tttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaacgaagcattaatgttatttttcctattatatccttaactattttctactttctcttcttccaaat |
19505773 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19505772 |
cattcatttatctttcctatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaattcataat |
19505714 |
T |
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Target: chr2; HSP #145
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||| || |
|
|
| T |
1780331 |
tttgtcccaaatcatatgtcgctttaaaatactaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattattatctc---------tt |
1780421 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1780422 |
atttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttataaaacaacttataatatcttttttccacacaatattaattgcattt |
1780511 |
T |
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209 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
4079799 |
ttaactatttattactctctcttctttcaattcatttatctgtcttttccatatcatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatatctctttc |
4079898 |
T |
|
| Q |
210 |
ccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4079899 |
ccacataatattaattatattt |
4079920 |
T |
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Target: chr2; HSP #147
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gctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc-ctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttcca |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||||| | |||||||| ||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
45383561 |
gctttacaataccaatgaagcattaatgttacttttttctattatatccttaattatttattgccctctcatatttcaattctttaatttatctttttca |
45383462 |
T |
|
| Q |
161 |
tacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
45383461 |
tactatttattgaggacaattttgtaaatcaactcataat |
45383422 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #148
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| Q |
134 |
tttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36602175 |
tttcaattctttaatttatctttttcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
36602077 |
T |
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175 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
21884345 |
atgaaacattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattagtctctcttctttcaattctttcttttat-ttttccatatcatttatgaagg |
21884443 |
T |
|
| Q |
176 |
ataattttgtaaaacaactcat |
197 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21884444 |
acaattttgtaaaataactcat |
21884465 |
T |
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133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| || |
|
|
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8983447 |
gtcccaaattatatgttgctttacaataccaacaaaaaattaatgttatttttcatattatatccttatttattatttaactatttattatgctctatta |
8983546 |
T |
|
| Q |
134 |
tttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8983547 |
tttcaattcttcaatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaataactcataat |
8983613 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #151
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tatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27863081 |
tataaccttaactatttattgctatctcttctttcaattctttcatttatctttctcatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
27863180 |
T |
|
| Q |
203 |
ctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27863181 |
cttttttccacacaatattaattgcattt |
27863209 |
T |
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Target: chr2; HSP #152
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ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | ||| ||| ||| | |
|
|
| T |
44987758 |
ttgtctcaaattgtatgtcacattacaataccaatgaatcattaatgttactttttttattatatccttcactatttattgtcttttctgcttccaagtc |
44987857 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44987858 |
attcatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcatattatctctttcccacacaaaattaattacattt |
44987946 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #153
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || | | | | || |||||||| |
|
|
| T |
39293388 |
tttgtctcaaattataaatcgttttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttatcattatatattttttcaatt |
39293487 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttat---taaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| |||||||| | |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
39293488 |
ctttaatttatctctctcataacatttataactatagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcatacaaaattaattacatttc |
39293581 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #154
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aatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgt |
185 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
15041156 |
aatgatacttttcatattatatcattaactatttattactctctcttctttcaattctttgatttatctttctgataccatttattaaggacaatattgt |
15041057 |
T |
|
| Q |
186 |
aaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15041056 |
aaaacaacttataat |
15041042 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc-ctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttt |
157 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| || |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43681116 |
gtcgttttacaataccaatataacattagtgttatttttttctattataaccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttc |
43681215 |
T |
|
| Q |
158 |
ccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaat |
224 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
43681216 |
ccatgttatttattaaggataattttataaaataac-aataatacctcttttccacacaatattaat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #156
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142 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||| || |||| |||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
45423278 |
ttgtctcaaattatatgtctctttacaataccaataaaacattaatgttacttttcttgttatctcctcaattatttattaatcttttttctttcaattc |
45423377 |
T |
|
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143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45423378 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaaaacaattttataaaacaacttataat |
45423435 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 225
Target Start/End: Original strand, 625932 - 626112
Alignment:
| Q |
45 |
gtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatt |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| | || ||| | || ||||| |||| | ||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
625932 |
gtcccaaattataaatcgctttaaaataccaatgaagcattaatgttgttttttccataataactctacctatttattagtatctctcctttcaattctt |
626031 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||| ||| || || |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
626032 |
taatttatctttctcataccattaataaatgataattttgtaaaacaattcataatttttctttcccatacaaaattaatt |
626112 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36174595 - 36174425
Alignment:
| Q |
45 |
gtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatt |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
36174595 |
gtcccaaattgtatgtcgctttacaatactaatgaaacatta-tgttatttttcctattatatccttaattatttattaccctctcttct---------t |
36174506 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |||| |||||| |||| | |||||||||| |
|
|
| T |
36174505 |
tcatttatctttttcatgtcatttattaaggaaaactttgtaaatcaactcgtaatatctctttcccataaaatattaatt |
36174425 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 207
Target Start/End: Original strand, 42695616 - 42695780
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
42695616 |
ttgtccaaaattataaatcattttacaataacattgaaacattaatgttattttttatattatatcattaactatttattactcaatccattttcaatta |
42695715 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
42695716 |
tttaatttatctttctcataacatttattaaggacatttatgtaaaacaactcataatatctctt |
42695780 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 200
Target Start/End: Original strand, 13196408 - 13196560
Alignment:
| Q |
46 |
tcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattt |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||| || |||||||| | | |
|
|
| T |
13196408 |
tcccaaattatatatcattttacaataccaatgaaacattaatattattttttctattatatgcttaattatttatta--ctcttttatttcaattctat |
13196505 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13196506 |
aatttatctttttcataccatttattatggacaattttgtaaaacaacccataat |
13196560 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 37742705 - 37742872
Alignment:
| Q |
64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
163 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||| | || ||||||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37742705 |
tttacaatattaatgaagaattaatgttattgtttatattatacaattaattatttattactttctcttctatcaattatttaatttatctttctcatac |
37742804 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | | |||| | || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37742805 |
catttattaaggacaattttgtaaaacaattcatagtatatctttctcatacaaaattaattacattt |
37742872 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 231
Target Start/End: Original strand, 810856 - 811034
Alignment:
| Q |
53 |
ttataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttat |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| || | || | ||| | | | |||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
810856 |
ttataagtcgctttaaaataacaatgaaatattaatgatactttttcttgtgtaccattacccaattattaatcttttttctttcaattatttaatttat |
810955 |
T |
|
| Q |
153 |
cttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| || |||||| ||| | |||||||||| | |||| | || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
810956 |
tatttccataccatttattaaagacaattttataatataactcataatatttctttcacatacaaaattaattacattt |
811034 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9936795 - 9936637
Alignment:
| Q |
60 |
tcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttcc |
159 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| || || | ||||||||||||| || |
|
|
| T |
9936795 |
tcgcttaacaatatgaatgaaatattaatgttacttttcagattatatccttaactatttattactttctctttttctaagtcattcatttatctttccc |
9936696 |
T |
|
| Q |
160 |
atacaatttattaag-gataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
217 |
Q |
| |
|
||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||| |
|
|
| T |
9936695 |
atatcatttatcgtgtgacaattttgtaaaacaattcataatatctatttcccacacaa |
9936637 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 118
Target Start/End: Original strand, 44019766 - 44019840
Alignment:
| Q |
44 |
tgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatt |
118 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
44019766 |
tgtccaaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatctttaactatt |
44019840 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 175
Target Start/End: Original strand, 4553363 - 4553495
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4553363 |
ttgtcacaaattatatgtcattttacaataccattgaaacaataatgttgcttttcttattatatccttaattatttattattctctcttctttcaattc |
4553462 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaagg |
175 |
Q |
| |
|
||| || ||| ||| ||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
4553463 |
tttaatatatttttcacataccatttatcaagg |
4553495 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13197105 - 13196949
Alignment:
| Q |
44 |
tgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattat |
143 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
13197105 |
tgtctcaaattatatatcgctttacaataccaattaaacattaatgatattttttttattatattattaattatttattactctctcttcttttaatttt |
13197006 |
T |
|
| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|| || |||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13197005 |
ttaatatatctttttcgtaccatttattaaaagcaattttctaaaacaacttataat |
13196949 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 129
Target Start/End: Original strand, 28464197 - 28464276
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctct |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28464197 |
aaattataagtcgctttacaatatcaatgaagtattaatgttatttttcatattattttcttaactatttattactctct |
28464276 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 40346478 - 40346401
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaa |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
40346478 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttataataccaatgaaatattaatattactttttctattatatacttaaatattaa |
40346401 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Original strand, 7669758 - 7669878
Alignment:
| Q |
111 |
taactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
7669758 |
taactatttattactttttcttctttcaattctttcattcttatttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttt |
7669857 |
T |
|
| Q |
211 |
cacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7669858 |
tacacaatattaaatacattt |
7669878 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Original strand, 32864019 - 32864202
Alignment:
| Q |
49 |
caaattataa-gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | || |||| ||||| |||| || |||||||| |||||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
32864019 |
caaattataatgtcgcgttacaatatcaatgatgtattaatgttattctttctatcatatcattaatcatatattactctatcttcttttaattctttaa |
32864118 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||| |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
32864119 |
tttatctttctcatactattt-ttaaagacaattttgtaaaactactcataatatctctttgtcatacaaaattaattatatttc |
32864202 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 141
Target Start/End: Original strand, 12598269 - 12598367
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12598269 |
tttgtcacaaattatatatcactttacaataccaataaaatattaatgtta-tttttctatcatatatttaactgtttattactctctcttctttcaatt |
12598367 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 231
Target Start/End: Original strand, 20212899 - 20213001
Alignment:
| Q |
128 |
ctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattac |
227 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20212899 |
ctctttttttaattcttttatttatctttttcataccaattattaatgacaattttgtaaa-caactcataatatctctttcccacataatattaattac |
20212997 |
T |
|
| Q |
228 |
attt |
231 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
20212998 |
attt |
20213001 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42801141 - 42800991
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
42801141 |
ttgtcccaaattattttttgctttgtaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattata-actttactatttattactctatcttatttcaatcc |
42801043 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaact |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42801042 |
tttcatttatctatcatatatcatttattaaaaacaattttgtaaaacaact |
42800991 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 44653709 - 44653614
Alignment:
| Q |
3 |
tccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc |
98 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44653709 |
tccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatattgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc |
44653614 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 232
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| Q |
60 |
tcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttcc |
159 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |
|
|
| T |
4978998 |
tcgctttataatatcaattaaatatta-tgttattttttctattatatctttaactatttattattctctcttctttcagtt-cttcatctatctttttt |
4979095 |
T |
|
| Q |
160 |
atacaatttattaaggataa-ttttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||| || |||||||||||| |||||||| |||||| | | |||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
4979096 |
atatcatttgttaaggccaatttttgtaaaacagctcataatatctctttcttaaacaaaattaattatatttc |
4979169 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactct |
127 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || ||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6312260 |
ttgtctcaaattgtatgtcactttacaataccgatgaaacattaatgttatttttgttattatatccttaactatttattactct |
6312344 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
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| Q |
115 |
tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17910746 |
tatttattacgctcccttctttcaattctttaatttatctttaccatacaacttattaaggacaattttgtaaaaca |
17910670 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #178
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| Q |
51 |
aattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaacta-ttaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| | | || || | |||||| |||| |||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
35155759 |
aattatatgtcactttacaataccaatgacgcataattgttacttttccaattatatcccttattagtttactactctatcttttttcaattctttaatt |
35155660 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaa |
189 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35155659 |
tatctttcccataacatttattatggacaattttgtaaaa |
35155620 |
T |
|
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Target: chr2; HSP #179
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| Q |
44 |
tgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctct |
129 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
33713652 |
tgtctcaaattatatgtcgttttacaataccagtgaagaattaatgttactttttctattaaatcgttaactatttattattctct |
33713567 |
T |
|
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| Q |
86 |
aatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgt |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||| | ||| || ||||||| |||||| |
|
|
| T |
38766233 |
aatgttacttttcctattatacccctaactatttattgatctc--ttctttcaattctttaatttatttttcccatgccattaatgaaggatagttttgt |
38766330 |
T |
|
| Q |
186 |
aaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
38766331 |
aaaataacttataattt |
38766347 |
T |
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Target: chr2; HSP #181
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| Q |
83 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcattta |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13995448 |
attaatgttatttttcctattatattattaactatttattactcgctcatctttcaattctttcattta |
13995380 |
T |
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Target: chr2; HSP #182
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| Q |
1 |
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98 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4898409 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaagtatttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgcaactttaatgttatttttc |
4898311 |
T |
|
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Target: chr2; HSP #183
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| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgcttt-ggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc |
98 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4945803 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaagtatttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgcaactttaatgttatttttc |
4945705 |
T |
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Target: chr2; HSP #184
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| Q |
60 |
tcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct-attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttc |
158 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||| |||||||| ||||| |||| || |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |
|
|
| T |
4996906 |
tcgctttataatatcaattaaatatta-tgttattttttcttattatatctttaactatttattattctctcttctttcagtt-cttcatctatcttttt |
4997003 |
T |
|
| Q |
159 |
catacaatttattaaggataa-ttttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||| || |||||||||||| |||||||| |||||| | | |||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
4997004 |
tatatcatttgttaaggccaatttttgtaaaacagctcataatatctctttcttaaacaaaattaattatatttc |
4997078 |
T |
|
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Target: chr2; HSP #185
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| Q |
63 |
ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta---tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttcc |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||| || |||| ||| |||| | ||| | |
|
|
| T |
15257555 |
ctttacaatatcactgaagcattaatgttactttttctattagtatatcattaactatttactactcactctttttaaaattctttgatttttgtttcct |
15257654 |
T |
|
| Q |
160 |
atacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15257655 |
atatcagttattaaggacaattctgtaaaccaactcaaaatatctctttcccatgcaaaattaattacattt |
15257726 |
T |
|
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Target: chr2; HSP #186
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttt |
96 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
23848343 |
ttgtcacaaattataagtcgttttacaataccaatgaaagattaatattacttt |
23848290 |
T |
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Target: chr2; HSP #187
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| Q |
106 |
atccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctc |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| | ||||| |||| |
|
|
| T |
31839060 |
atcctaaactatttattagtctctcttctttcaactctttaatttatctttctcataccattta-aaaagataattttgtaaaacaatttataatatctc |
31839158 |
T |
|
| Q |
206 |
tt |
207 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
31839159 |
tt |
31839160 |
T |
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Target: chr2; HSP #188
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| Q |
63 |
ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctt |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35020353 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatatcctt |
35020305 |
T |
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Target: chr2; HSP #189
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttt |
97 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
42251049 |
aaattataagtcgctttacaatagcaataaaacattaatgttactttt |
42251096 |
T |
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Target: chr2; HSP #190
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| Q |
109 |
cttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||| ||| || || ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25625557 |
cttaactatttgttagtctattttctttcaattttttaatttatccttttcacactattaatgaaggataatttttaaaaataactcataatttctctt |
25625655 |
T |
|
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| || | ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
43428452 |
ttgtcacaaattatatgttgttttacgataataataaaatattaatgttt-ttttcttattatatccttaactattttttactatttcttctttcaatt |
43428549 |
T |
|
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Target: chr2; HSP #192
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatat |
107 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7669677 |
aaattatatgtcgttttacaatatcgatgaaacattaatgctacttttcctattatat |
7669734 |
T |
|
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Target: chr2; HSP #193
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11825487 |
tttgtcccaaatt-taagtcgctttacaatttcaatgaagcattaatgttacttttcttatt |
11825547 |
T |
|
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Target: chr2; HSP #194
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| Q |
147 |
atttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||||| || |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15913177 |
atttatcttttccatatcatttattaaagataattttgtaaagtaatttataatatctctttatcatacaaaattaattacatttc |
15913262 |
T |
|
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Target: chr2; HSP #195
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Target Start/End: Complemental strand, 32859720 - 32859647
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| Q |
127 |
tctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
32859720 |
tctcttatttcaattgtttaatttatatttcccataccaattattaatgacaattttgtaaaataactcataat |
32859647 |
T |
|
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Target: chr2; HSP #196
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| Q |
53 |
ttataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttt |
97 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
801147 |
ttataagtcgctttaaaataacaatgaaatattaatgatactttt |
801191 |
T |
|
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Target: chr2; HSP #197
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Query Start/End: Original strand, 143 - 207
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| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5274579 |
tttcatttatttttctcatactatttattaaagacaattttataaaacaactcataatatctctt |
5274515 |
T |
|
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| Q |
173 |
aggataattttgtaaaacaactcataatttctc |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37988396 |
aggataattttgtaaaacaactcataatttctc |
37988428 |
T |
|
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| Q |
172 |
aaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
18262315 |
aaggataattttataaaataactcataatttctctttctcatacaaaattacttacattt |
18262256 |
T |
|
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175 |
gataattttgtaaaacaactcataatttctct |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37988476 |
gataattttgtaaaacaactcataatttctct |
37988507 |
T |
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| Q |
107 |
tccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11825753 |
tccttacctatttattactctctatt--ttcaattctgcaatttatctttcacataccacttattaaggacaattttgtaaaacaacgcataat |
11825844 |
T |
|
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| Q |
182 |
ttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15242838 |
ttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaaaattaattacatttc |
15242888 |
T |
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102 |
ttatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| ||| || ||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
16268090 |
ttatatcattaactatttattagtctttattctttcaattttttcatttatttttgtcatatcatttactaaagacgattttgtaaaataattcataat |
16268188 |
T |
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ttgtcccaaattataagtcgcttt---acaataccaatgaaatattaatgttacttt |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
27862735 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaacaataccaatgcaacattaatgttacttt |
27862791 |
T |
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50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatc |
108 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31838952 |
aaattatatttcgctttacaatatcaatgaagtattgacgttacttttcatattatatc |
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T |
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74 |
caatgaaatattaatgttacttttcctattatat |
107 |
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| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4079753 |
caatgaaatattaatgttactttttctattatat |
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| Q |
131 |
ttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||| ||| | |||| || || |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
42141919 |
ttctttcaattccttaatttatatttcctataccgttaatgaaggataattttgtaaaatgacttataatttatcttttccatacaatattaattaca |
42141822 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 98
Target Start/End: Original strand, 5249608 - 5249656
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5249608 |
aaattataagtcgttttacactatcaataaaatattaatgttatttttc |
5249656 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0166 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:
Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23628 - 23397
Alignment:
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23628 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
23529 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
23528 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
23429 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
23428 |
ttctcttccccgcacaatattaattaaatttc |
23397 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 211)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 28868723 - 28868953
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28868723 |
actccctccgtcccaaattgtatgt-gctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
28868821 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
28868822 |
attatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatttcatctatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
28868921 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28868922 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
28868953 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Original strand, 28848959 - 28849188
Alignment:
| Q |
3 |
tccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctat |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28848959 |
tccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctat |
28849058 |
T |
|
| Q |
103 |
tatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28849059 |
tatatccttaactattaattaccatctcttctttcaattatttcatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataattt |
28849158 |
T |
|
| Q |
203 |
ctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28849159 |
ctcttccccacacaatattaattacatttc |
28849188 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 1953273 - 1953504
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
1953273 |
actccctctgtcccaaattgtatatcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
1953372 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
1953373 |
attatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaattcataat |
1953472 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1953473 |
ttctcttcctcacacaatattaattacatttc |
1953504 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16862029 - 16861798
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16862029 |
actccctccgtcccaaattgtatgttgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
16861930 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16861929 |
attatattcttgactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
16861830 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16861829 |
ttctcttccccacacaatattaattatatttc |
16861798 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 33012064 - 33012295
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33012064 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaatttggccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcct |
33012163 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33012164 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
33012263 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33012264 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
33012295 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40325599 - 40325372
Alignment:
| Q |
5 |
cctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40325599 |
cctccgtcccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaatttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta |
40325500 |
T |
|
| Q |
105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
40325499 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatatcatttattagggataattttgtaaaacaactcgtaatttct |
40325400 |
T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
40325399 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
40325372 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 1366756 - 1366978
Alignment:
| Q |
10 |
gtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcc |
109 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1366756 |
gtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattataagtcgctttacaataccagtgaaatattaatgttacttttcctattatatcc |
1366855 |
T |
|
| Q |
110 |
ttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcc |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1366856 |
ttaactattaattattccttcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttttcttcc |
1366955 |
T |
|
| Q |
210 |
ccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1366956 |
ccacacaatattaattacatttc |
1366978 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 31692735 - 31692965
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31692735 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaa-tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcct |
31692833 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31692834 |
attatatccttatctattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
31692933 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31692934 |
ttctcttccccatgcaatattaattacatttc |
31692965 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38194747 - 38194516
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgtaacttttcct |
38194648 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38194647 |
attatatccttaactattaattactcttttttctttcaattattttatttatcctttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataat |
38194548 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38194547 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
38194516 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41256481 - 41256250
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
41256481 |
actccatccgtcctaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcct |
41256382 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41256381 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttaatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
41256282 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41256281 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
41256250 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44023686 - 44023455
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
44023686 |
actccctccgtctcaaattgtacgtcgctttagaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcct |
44023587 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44023586 |
attatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
44023487 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44023486 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
44023455 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5665672 - 5665894
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
5665672 |
actctctccgtcccaaattatatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccgatgaaatattaatgttacttttact |
5665771 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5665772 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
5665871 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaa |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5665872 |
ttctcttccccacgcaatattaa |
5665894 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14584844 - 14584662
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14584844 |
aaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctcttttctttcaattatttcatt |
14584745 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
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| T |
14584744 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
14584662 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
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Target Start/End: Complemental strand, 7884569 - 7884338
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100 |
Q |
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| T |
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actccctccgtcctaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttct |
7884470 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
7884469 |
attatatccttaactattaattactttcttttcttttaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
7884370 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7884369 |
ttatcttccccacacaatattaattacatttc |
7884338 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 15225841 - 15226072
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1 |
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100 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaa-tttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attaaatcattaactattaattactctctcttgtttcaattatttcatttatattttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctctt-ccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
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ttctcttcccccacacaatattaattacatttc |
15226072 |
T |
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Target: chr8; HSP #16
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Target Start/End: Original strand, 23897685 - 23897912
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5 |
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104 |
Q |
| |
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|
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cctccgtcctaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgttccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctatta |
23897784 |
T |
|
| Q |
105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
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|
| T |
23897785 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
23897884 |
T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
23897885 |
cttccccatacaatatcaattacatttc |
23897912 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37163814 - 37163583
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100 |
Q |
| |
|
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|
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaaattgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
37163714 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaacaactcaaaat |
37163615 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
37163614 |
ttctcttccccatgcaatattaattacatttc |
37163583 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 38044915 - 38045146
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| Q |
1 |
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Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
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| T |
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actccctccgtcctaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcct |
38045014 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
38045015 |
attatatccttaactattaattactctattttctttcaattatttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
38045114 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
38045115 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
38045146 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17524852 - 17524622
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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ctccctccgttccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttacgataccaatgaaatattaatgttacttttcata |
17524753 |
T |
|
| Q |
102 |
ttatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatt |
201 |
Q |
| |
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|
| T |
17524752 |
ttatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttattagagataattttgtaaaacaactcataatt |
17524653 |
T |
|
| Q |
202 |
tctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
17524652 |
tctcttccccacacaatattaattacatttc |
17524622 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 18526334 - 18526564
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcct |
18526433 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18526434 |
attatatcattaactattaattactctatcttctttcaattatatcatttatcttttccatacca-ttattaaggataattttgtaaaacaacttataat |
18526532 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
18526533 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
18526564 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 45186962 - 45187144
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| Q |
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149 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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45186962 |
aaattatatgtcgctttacagtaccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatt |
45187061 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
45187062 |
tatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
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Target Start/End: Original strand, 4174581 - 4174767
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
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tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatactaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaaatattt |
4174680 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4174681 |
catttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaatagctcataatttctcttccctacacaatattaattacatttc |
4174767 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Original strand, 43564593 - 43564803
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106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaa-tttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaataaaatattaatgttacttttcctattata |
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T |
|
| Q |
107 |
tccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctct |
206 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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tccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatttctct |
43564791 |
T |
|
| Q |
207 |
tccccacacaat |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
43564792 |
tccccacacaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
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Q |
| |
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|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaagcaactcataat |
26513888 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| | |||||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
26513889 |
ttttgttccccacgcaatattaattacatttc |
26513920 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 38450955 - 38451186
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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actccctccgtccaaaattgtatgtcgctttagaaaaaaagattgtcttaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
38451055 |
attatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatatattagggataattttgtaaaacaattcataat |
38451154 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38451155 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
38451186 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 4393930 - 4394120
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42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
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4393930 |
tttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatattacttttcttattatatccttaactattaattcctctctcttctttcgatt |
4394029 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4394030 |
atttcatttatctttctcatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttcttttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
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142 |
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| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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ttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccgatgaaatattaatgttatttttcctattatattcttaactattaattactctcgcttctttcaatta |
37954309 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaataacttataatttctcttccccacataatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
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Target Start/End: Complemental strand, 43537046 - 43536857
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| |
|
|||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttgttccaaattatatgtagctttacaataccaatgaaatatttatgttatttttccgattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
|
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143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
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Target Start/End: Original strand, 45439514 - 45439747
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T |
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attatatccttaactattaatt---actctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcat |
197 |
Q |
| |
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|
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attatatccttaactattaatttttactctctcttctttcaattatttcatttatctttctcatatcattcattaaggataattttgtaaaacaactcat |
45439712 |
T |
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aatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
45439713 |
aatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
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Q |
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T |
|
| Q |
162 |
acaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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accatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
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T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #31
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Target Start/End: Complemental strand, 14433429 - 14433198
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T |
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200 |
Q |
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T |
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
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|
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T |
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Target: chr8; HSP #32
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Target Start/End: Original strand, 22578206 - 22578435
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T |
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200 |
Q |
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T |
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ttctcttccccacacaatattaattacatt |
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T |
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Target: chr8; HSP #33
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T |
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Q |
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| T |
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T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9268083 - 9267852
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T |
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| |
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T |
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 23606184 - 23606415
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Q |
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
23606384 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31873700 - 31873469
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200 |
Q |
| |
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T |
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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atctctttctcatacaatattaattacgtttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39169070 - 39168839
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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attatattcttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatttatcttttccatataatttattgaggacaatcttgtaaaacaactcataat |
39168871 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
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Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
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ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
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|
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ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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|
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Target: chr8; HSP #42
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|
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200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
|
| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
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attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgattataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
6878713 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
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Target Start/End: Original strand, 29938291 - 29938522
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Q |
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T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |
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| T |
29938391 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcctatattatttattgaggacaattttgtaaaacaacccataat |
29938490 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
29938491 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
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100 |
Q |
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T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
30087908 |
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30087809 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||||||||||| |
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| T |
30087808 |
atctctttctcacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 39284197 - 39284428
Alignment:
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100 |
Q |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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attatatcattaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcctatataatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataat |
39284396 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
39284397 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14810117 - 14809927
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| Q |
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141 |
Q |
| |
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|
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||| |
|
|
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T |
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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
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Target Start/End: Complemental strand, 22453550 - 22453364
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145 |
Q |
| |
|
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| T |
22453550 |
tcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgagaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttatttcaattcctt |
22453451 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22453450 |
catttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
22453364 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 30526199 - 30526389
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30526199 |
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30526298 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30526299 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
30526389 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34141657 - 34141467
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
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||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |
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|
| T |
34141657 |
tttgtccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttgtttttcctattatatccttaactatttattactctttattctttcaatt |
34141558 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34141557 |
atttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattacatttc |
34141467 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 9724584 - 9724816
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Q |
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|
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9724683 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9724684 |
tattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
9724783 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
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| T |
9724784 |
tatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24422590 - 24422361
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24422590 |
actccctccgtcccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattacttttcct |
24422491 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attatatccttaactatttattactctctc--ctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataat |
24422393 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24422392 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
24422361 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 19715228 - 19715459
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19715328 |
attatatccttaattatttattactatttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
19715427 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||| |||| ||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
19715428 |
atttctttcccatacaatattaattatatttc |
19715459 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
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ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaata-------aatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactcaatattctttcaatta |
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T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaccaactcataatttctcttccccacccaatattaattatatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
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141 |
Q |
| |
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|
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27667510 |
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T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacat |
229 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27667610 |
ctttcatttatctttcccatataatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacat |
27667697 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
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42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttcttt-caat |
140 |
Q |
| |
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| T |
34908722 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttctttttttcaat |
34908821 |
T |
|
| Q |
141 |
tatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
34908822 |
tctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #57
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
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Q |
| |
|
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|
| T |
2099203 |
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
2099103 |
ccttcatttatctttccc-----atttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
2099018 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
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Q |
| |
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| T |
13429110 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcttattatatccttaactatttattactctttcttttttcaatt |
13429209 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
13429210 |
ctttcatttatctttcccatatcatatattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattccatttc |
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Target: chr8; HSP #59
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| |
|
||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
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|
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36652476 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacatttatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaatt |
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T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
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36652576 |
cttttacttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaatattaattacatttc |
36652666 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 6247658 - 6247847
Alignment:
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43 |
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142 |
Q |
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|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||||| |
|
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6247658 |
ttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttacttttcctattatgtccttaactatttattacttttttttctttcaattc |
6247757 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6247758 |
cttcatttatctttcccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttc |
6247847 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16872598 - 16872409
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
16872598 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattc |
16872499 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16872498 |
tttcatttatctttcacatatcatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttc |
16872409 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12988263 - 12988031
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
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|
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12988164 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12988163 |
tattataaccttagctatttattactctctcttctttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
12988064 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12988063 |
tatcttttttccacacaatattaattgcatttc |
12988031 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 18673369 - 18673597
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
18673469 |
attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactaataat |
18673568 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacat |
229 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18673569 |
atatctttcccacacaatattaattacat |
18673597 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 600331 - 600100
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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attatatccttaactatttattactccatcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
600131 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
600100 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25838753 - 25838522
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25838753 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcct |
25838654 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
25838653 |
attataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
25838554 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||||| |
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| T |
25838553 |
atctcttttccacacgatattaattacatttc |
25838522 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31602995 - 31602761
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgcttt-ggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcc |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31602995 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcc |
31602896 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31602895 |
tattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattatttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
31602796 |
T |
|
| Q |
200 |
tttc--tcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| || | || |||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
31602795 |
tatcttttttttccacacaatattaattgcatttc |
31602761 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35544273 - 35544042
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcct |
35544174 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35544173 |
attatttccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
35544074 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35544073 |
atctctttcccatacaatattaattatatttc |
35544042 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38896739 - 38896508
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
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38896739 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcct |
38896640 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
38896639 |
attatatccttaactatttattactctttattttttcaattctttcatttatctttcctatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
38896540 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38896539 |
atctctttcccacacaatattaattatatttc |
38896508 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42946700 - 42946470
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| Q |
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42946700 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcct |
42946601 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42946600 |
attatatccttaactatttattactctttcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaa-aactcataat |
42946502 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42946501 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
42946470 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 37505000 - 37505186
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| |
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37505000 |
gtcccaaattgtatgtcactttataatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctt |
37505099 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37505100 |
tcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacattt |
37505186 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 42981243 - 42981425
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Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
42981243 |
aaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatt |
42981342 |
T |
|
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150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42981343 |
tatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 21545255 - 21545488
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99 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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actccctccgtcctaaattgtacgtcgctttagggggaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcc |
21545354 |
T |
|
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100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
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| T |
21545355 |
tattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattatttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
21545454 |
T |
|
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200 |
tttc-tcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
| || | || |||||||||||||||| |||||| |
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| T |
21545455 |
tatctttttttccacacaatattaattgcatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #73
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| |
|
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|
|
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|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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attataaccttaactatttattactctcttttctttcaattctttcatttatttttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
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ttctcttccccacacaatattaattacatt |
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| |
|
| |||| | |||||||||||||| |||| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26394101 - 26393869
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| |
|
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|
|
| T |
26394101 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttaggggaaaatttttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcc |
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tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
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| |
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||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
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26394001 |
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200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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tatcttttttcaacacaatattaattgcatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 39628842 - 39629074
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Q |
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T |
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199 |
Q |
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tattataactttagttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaataactcataa |
39629041 |
T |
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200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
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39629042 |
tatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 39638392 - 39638624
Alignment:
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99 |
Q |
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T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
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tattataactttagttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaataactcataa |
39638591 |
T |
|
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200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
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39638592 |
tatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39645989 - 39645760
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T |
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| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttcccatatcatttattgaggataa--ttgtaaaacaactcataat |
39645792 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||| | |||||||||||||||||||||| |
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| T |
39645791 |
atctctttctcacacaatattaattacatttc |
39645760 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 9470808 - 9471039
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100 |
Q |
| |
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| T |
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9470907 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
9470908 |
attataaccttaattatttattaccctctcttctttcaattctttcatttatctttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
9471007 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
9471008 |
atctcttttccatacaatattaattgcatttc |
9471039 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30597279 - 30597097
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149 |
Q |
| |
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||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
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| T |
30597279 |
aaattgtatgtcgctttacaataccagtgaaatattaatgttacttttcatattatatccttaactatttattactctgtcttctttcaattccttcatt |
30597180 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30597179 |
tatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
30597097 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8378327 - 8378138
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142 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |
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8378327 |
ttgtctcaaattatacgccgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatattcttaactatttattactctttcttttttcaatta |
8378228 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8378227 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatatatttctcacacaatattaattacatttc |
8378138 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26805105 - 26804876
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26805105 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgttttagggaaaaaatttatcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcct |
26805006 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
26805005 |
attataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
26804906 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || |||||| |||||||| |||||| |
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|
| T |
26804905 |
atcttttttccacac--tattaattgcatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #82
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 11714439 - 11714670
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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| T |
11714439 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcct |
11714538 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |
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| T |
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attatatccttcactatttattactttatcttatttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaataactcataat |
11714638 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
11714639 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
11714670 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 24616558 - 24616746
Alignment:
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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| T |
24616558 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatattacttttcctattgtatccttaactatttattactttct--tctttcaatt |
24616655 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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ctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattaaatttc |
24616746 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
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Target Start/End: Original strand, 30852016 - 30852202
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141 |
Q |
| |
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||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
30852016 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttaatctttcaatt |
30852115 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
30852116 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatttctttcccacacagtattaattaca |
30852202 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 42927157 - 42927347
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| Q |
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |
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|
| T |
42927157 |
tttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaatt |
42927256 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
42927257 |
ctttcatttatctttctcatttcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttc |
42927347 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37965055 - 37964886
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| Q |
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ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
162 |
Q |
| |
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| T |
37965055 |
ctttacaatactaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttcccata |
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T |
|
| Q |
163 |
caatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
37964955 |
tcatttattaaggataattttgtaaaacaactcatgatatctctttcctacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
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| |
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|
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttctt |
42373188 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
42373187 |
attatatccttaactatttatta--ctctcttatttcaattcattcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataat |
42373090 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||| ||||| |
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|
| T |
42373089 |
atctctttcccacgcaatattaattatatttc |
42373058 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44263388 - 44263156
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgcttt-ggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcc |
99 |
Q |
| |
|
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|
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T |
|
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100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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| T |
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tattataaccttcactatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataa |
44263189 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
44263188 |
tatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
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ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
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| |
|
||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
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ttgtctcaaattatatgtcgctttacggtaccaatgaaatattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactccttcttctttcaatta |
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|
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143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgt-aaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
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18203200 |
T |
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200 |
Q |
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| T |
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T |
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Q |
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Target: chr8; HSP #91
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Target Start/End: Original strand, 29867258 - 29867489
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T |
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200 |
Q |
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29867358 |
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29867457 |
T |
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232 |
Q |
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29867458 |
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Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
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T |
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200 |
Q |
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attatatccttaattatttattactctattttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacagttttgtaaaacaactcataat |
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T |
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
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32395117 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42192465 - 42192274
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T |
|
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232 |
Q |
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T |
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Target: chr8; HSP #94
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Target Start/End: Complemental strand, 1513563 - 1513373
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Q |
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T |
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Q |
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Target: chr8; HSP #95
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Q |
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T |
|
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Q |
| |
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| T |
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T |
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Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37954717 - 37954527
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| Q |
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141 |
Q |
| |
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37954618 |
T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
37954617 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttctcatacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 28719725 - 28719914
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T |
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
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Target Start/End: Complemental strand, 42827766 - 42827536
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T |
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199 |
Q |
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T |
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200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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42827568 |
tatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 226
Target Start/End: Original strand, 5371582 - 5371766
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|
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226 |
Q |
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cttttatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaatta |
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T |
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Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5449583 - 5449351
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|
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T |
|
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tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
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Q |
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tattataatcttaactatttattactctctcttcttccaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataa |
5449384 |
T |
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200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| | | || |||||||||||||||| |||||| |
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tatttattttccacacaatattaattgcatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
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T |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
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Target: chr8; HSP #102
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| |
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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T |
|
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ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
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T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
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cttttatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattacatttc |
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| |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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|
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ccttcatttatctttctcatatcaattattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatttttttcccacacaatattaattacattt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
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T |
|
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28074442 |
attataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttccat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataat |
28074354 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28074353 |
atctcttttccacacaatattaattacatttc |
28074322 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #107
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Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 44052915 - 44053104
Alignment:
| Q |
43 |
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142 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44052915 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaatgtaacattaatgttactttttctattataaccttagttatttattactctctcttctttcaattc |
44053014 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44053015 |
tttcatttatctttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttc |
44053104 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6010352 - 6010164
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||| | |
|
|
| T |
6010352 |
ttgtcccaaattgtatgtcgttttagaataccaataaatcattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactttctctccttccaagtc |
6010253 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6010252 |
attcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacattt |
6010164 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 899639 - 899412
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| Q |
5 |
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104 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
899639 |
cctccgtcctaaattgtatgtcgctttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgttttacagtaccaatgaaaaattaatgttatttttcttatta |
899540 |
T |
|
| Q |
105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | | |
|
|
| T |
899539 |
tatcattaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccttatcatttatagaggacaattttgtaaaacagctcataatattt |
899440 |
T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
899439 |
ctttcccacataatattaattacatttc |
899412 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2031629 - 2031446
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2031629 |
tttgttccaaattatatgtcgctttacaatatccatgcaatattaatgttacttttcctattataacattaatcatttattattctctcttctttcaatt |
2031530 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2031529 |
ttttcatttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatcttttttccacacaatattaatt |
2031446 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27919706 - 27919475
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27919706 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttggaaattttttttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcct |
27919607 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||| ||| | ||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27919606 |
attatatcattcattatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctttcacatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
27919507 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27919506 |
atctctttcccacacaaaattaattacatttc |
27919475 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32629825 - 32629642
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttcttt-caattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
||||| || ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
32629825 |
aaattgtatgtcactttagaataccaataaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttctttttttcaattctttcat |
32629726 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32629725 |
ttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
32629642 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 26746870 - 26747060
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | | || || ||||| |
|
|
| T |
26746870 |
tttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatattattttttctattatatccttaactatttattactttttttttttccaatt |
26746969 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26746970 |
ccttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
26747060 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5733378 - 5733198
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
5733378 |
aaattatatatcgttttacaataccaacgaaatattaatgttattttttctattatatctttaactattcattactctcgattcttttaattctttcatt |
5733279 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5733278 |
tatc-tttctatataatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacattt |
5733198 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42159232 - 42159059
Alignment:
| Q |
59 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttc |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
42159232 |
gtcgctttacaatatcaataaaacattaatgttattttttctattatatccttaattatttattagtctttcttctttcaattttttcatttatctttcc |
42159133 |
T |
|
| Q |
159 |
catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
42159132 |
catataatttattacggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacgatactaattagatttc |
42159059 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37664953 - 37664785
Alignment:
| Q |
63 |
ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37664953 |
ctttacaatattaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattttttcatttatctttctcata |
37664854 |
T |
|
| Q |
163 |
caatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37664853 |
tcatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctattttccacacaatattaataacattt |
37664785 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Original strand, 1042416 - 1042600
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| Q |
46 |
tcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattt |
145 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
1042416 |
tcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctgttatatccttaactatttattactctttcttttttcaattcttt |
1042515 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1042516 |
catttatctttccaatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcacaatatctctttcccacac--tattaattacatttc |
1042600 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #118
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2120499 - 2120309
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141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || | |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2120499 |
tttgtcccaaattatacgttgttttacaatgtcaatgcaacattaatgttacttttcctattataatcttaactgtttattactctctcttctttcaatt |
2120400 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2120399 |
ctttcatttatctttcacatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccatacaatattaattgcatttc |
2120309 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41541219 - 41541029
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42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
41541219 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacataaatgttaaatttcatattatatcattaactatttattactctttcttttttcaatt |
41541120 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41541119 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaagataattttgtaaagcaactcataatatctctttcccatacaatattaattatatttc |
41541029 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #120
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attaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattt |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
548222 |
attaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaattatttcatttatctttcccatattatttattaagaacaattt |
548123 |
T |
|
| Q |
183 |
tgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
548122 |
tgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
548073 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #121
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Query Start/End: Original strand, 43 - 232
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ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
6796143 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcatattatatctttaactatttattactctttcttttttcaattc |
6796242 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6796243 |
tttcatttatatttcccatatcatttattaagaacaatttagtaaaataactcataacatctatttcccacataatattaataacatttc |
6796332 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #122
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Query Start/End: Original strand, 43 - 232
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43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28712378 |
ttgtcccaaattatatgttgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttgattatttattactctctcttctttcaattc |
28712477 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28712478 |
tttcatttatctttcccatattatttaataagaacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattaaatttc |
28712567 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #123
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 24612844 - 24613076
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| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttac-ttttcc |
99 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||| |||| | ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24612844 |
actccctctgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttca |
24612943 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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|
| T |
24612944 |
tattatatcattaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttcttatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaatccataa |
24613043 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
24613044 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttc |
24613076 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #124
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Target Start/End: Complemental strand, 13779811 - 13779625
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141 |
Q |
| |
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tttgtctcaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctat---atcattaactattttttactctttcttctttcaatt |
13779715 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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|||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
13779714 |
ctttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcatcatttcttttttccacacaatattaattacattt |
13779625 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #125
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 16421861 - 16422092
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100 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
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| T |
16421861 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaatcattaatgttactttttct |
16421960 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
16421961 |
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16422060 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||| |||||||||||||| |
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| T |
16422061 |
atctctttcccacacaaaattaattacatttc |
16422092 |
T |
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Target: chr8; HSP #126
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 4135729 - 4135919
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141 |
Q |
| |
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||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||| |
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4135729 |
tttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccagtgaaacattaatgttattttttctattatatcattaattatttattactctttcttttttcaatt |
4135828 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||| |
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4135829 |
cttttatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcatgatatctctttcacacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr8; HSP #127
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 4924447 - 4924637
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| Q |
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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| T |
4924447 |
tttgtcctaaattatatgtcactttacaataccaatgcaacattaatgttatttttccaattataactttaactatttattattatctcttctttcaatt |
4924546 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4924547 |
ttttcatttatctttctcatattatttattaagggcaattttgtaaaacaactcataatatcttttttctacacaatattaattacatttc |
4924637 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12000481 - 12000724
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100 |
Q |
| |
|
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| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcat |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttc------------atttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaa |
188 |
Q |
| |
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attatatcattaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaa |
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T |
|
| Q |
189 |
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232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12000681 |
acaactcataatatctctttcccatacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr8; HSP #129
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Target Start/End: Original strand, 28727367 - 28727556
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142 |
Q |
| |
|
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| T |
28727367 |
ttgtcccaaattatatgttgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttgattatttattactctctcttctttcaattc |
28727466 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28727467 |
tttcatttatctttcccatattatttaataagaacaattttataaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattaaatttc |
28727556 |
T |
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Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37390961 - 37390787
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| Q |
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158 |
Q |
| |
|
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|
|
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37390961 |
ctttacaataccaatgaaacattaacgttactttttctattatatatatccttaactatttattactcttttttctttcaattatttcatttatctttct |
37390862 |
T |
|
| Q |
159 |
catacaatttattaaggataa-ttttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
| T |
37390861 |
catatcatttatgaaggataatttttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttc |
37390787 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38367675 - 38367488
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144 |
Q |
| |
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|||| ||||| || ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||| |||||||| || |
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|
| T |
38367675 |
gtcctaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactttttcttttttcaattctt |
38367576 |
T |
|
| Q |
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tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
38367575 |
tcatttatctttcctatatcattttttaaggataattttgtaaaacaatttataatatctttttctcacacaatattaattacatttc |
38367488 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 232
Target Start/End: Original strand, 40488186 - 40488369
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| Q |
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146 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
40488186 |
cccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaacgatttattactct--cttctttcaattctttc |
40488283 |
T |
|
| Q |
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atttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
40488284 |
atttatctttctcataatatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcctacaatattaattgcatttc |
40488369 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
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| Q |
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149 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||| |
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|
| T |
3310852 |
aaattatatgtcattttacattaccaatgcaatattaatgttactttttctattataaccttagttatttattagtctctcttcttttaattctttcatt |
3310951 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3310952 |
tatctttcccatattattttttagggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacacaatattaattacattt |
3311033 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10709381 - 10709156
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||| |
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|
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10709282 |
T |
|
| Q |
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tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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|||| | |||||| || | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
10709281 |
aattacaaccttaattaattattactccctcttctttcaattctttcatttatcttccccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
10709182 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
| | | || |||||||||||||||| |
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|
| T |
10709181 |
tatatattttccacacaatattaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 543813 - 543629
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140 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || |||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
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tttgtaccaaattatatgtcgctttacaatacccatgtaacattaatgttactttttccaattataacattaattatttattactccctcttctttcaat |
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T |
|
| Q |
141 |
tatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
543713 |
tctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatattttccacacaatattaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #136
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tatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16999294 |
tatatccttaactatttattactctctattctttcaattccttcatttatcttttctatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatat |
16999393 |
T |
|
| Q |
203 |
ctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16999394 |
ctctttcccacacaatattaattacattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #137
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141 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||| |
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|
| T |
12113578 |
tttgtctcaaattgtatgtcgctttacaatatcagtgaaaaattaatgttacttttcctattatatcct-----atttattactctttttt--ttcaatt |
12113486 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12113485 |
ccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #138
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ttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataca |
164 |
Q |
| |
|
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| T |
17911022 |
ttacaataccaatgaaacattaatgttaatttttctattatattcttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatc |
17911121 |
T |
|
| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17911122 |
atttattaaggacaatttagtaagacaactcataa-ttctttttcccacacaatattaattatatttc |
17911188 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31231155 - 31231000
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| Q |
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
31231155 |
actccctccgtccaaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcgt |
31231056 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttt |
156 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31231055 |
attatatccttaactatttattactctcttttctttcaattccttcatttatcttt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #140
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
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Q |
| |
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||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| | ||||| ||||||| | |
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|
| T |
8738015 |
tttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttgcttttcctattatatcttttactatttattgccttctctactttcaagt |
8738114 |
T |
|
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142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
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| T |
8738115 |
catttatttatcttttccatatcatttattaaagacaattttgtaaaataactcataatatttcttttccacacaaaattaattacatttc |
8738205 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #141
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Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 6806716 - 6806904
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142 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||| |
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| T |
6806716 |
ttgtcacaaattatatgtcgttatacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatattcttaact-tttattactctatcttctttcaattc |
6806814 |
T |
|
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143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| || || ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6806815 |
tttcatttatcattctaatataatttattaaggatagttttgtaaaaccactcatgatatctatttatcatacaatattaattatatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 24450567 - 24450748
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50 |
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149 |
Q |
| |
|
||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24450567 |
aaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttcgattatatccttaagtatttattactctttcttccttcaattctttcatt |
24450666 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24450667 |
tatttttctcgaatcatttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctttttctcacacaatattaattacattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
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Target Start/End: Original strand, 27421222 - 27421395
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100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27421222 |
actccctccatcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaagctgtcccaaattatatgccgctttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttctt |
27421321 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaag |
174 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27421322 |
attatatctttaactatttattactctatcttatttcaattatttaatttatctttttcataccatttattaag |
27421395 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #144
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Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 34865667 - 34865856
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| Q |
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142 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
34865667 |
ttgtcccaaattgtatgtagctttacaatatcaatgaatcattaatgttattttttctattatatctttaactatttattactctctctcattccaagtc |
34865766 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
34865767 |
attcatttattttttcaatgtcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttc |
34865856 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #145
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Query Start/End: Original strand, 63 - 232
Target Start/End: Original strand, 36514172 - 36514341
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| Q |
63 |
ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
162 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
36514172 |
ctttacaattacaatgaaacattaatttttcttttcttattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatatttctcata |
36514271 |
T |
|
| Q |
163 |
caatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
36514272 |
tcatttattaaggaaatttttttaaaacaactcacaatatctctttcccacacaatattgattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 232
Target Start/End: Original strand, 44053137 - 44053286
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| Q |
83 |
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182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
44053137 |
attaatgttactttttctattataaccttagttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaagaacaattt |
44053236 |
T |
|
| Q |
183 |
tgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
44053237 |
tgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttc |
44053286 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22553239 - 22553097
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| Q |
83 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattt |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22553239 |
attaatgttactttttctattataaccttaactatttattactctcccttctttcaattctttcatttatcttactcatattatttattaaggacaattt |
22553140 |
T |
|
| Q |
183 |
tgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22553139 |
tgtaaaacaactcataatatctcttttccacacattattaatt |
22553097 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 17833952 - 17834132
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142 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| |
|
|
| T |
17833952 |
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T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17834043 |
tttcatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
17834132 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40734979 - 40734745
Alignment:
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
40734979 |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttcttt----caattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactca |
196 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| | | | || ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
40734879 |
attataaccttaactatttattgtttttttttttttttttcaattcattcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactca |
40734780 |
T |
|
| Q |
197 |
taatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40734779 |
taatatctcttttccacacaatattaattgcattt |
40734745 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3562556 - 3562327
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || |
|
|
| T |
3562556 |
actccctccgtcccaaattataagtctctttggggaaaaaaatcatcccaaattataagtcgttttacaataccgatgaaccattaatgttattttttct |
3562457 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||| || |||||| | | | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
3562456 |
attatacccttaactgtttatta--ctctcttctttcaattcttcaatttatttctctcgtaccatttattaaggacaattttgtaaaacaactcaaaat |
3562359 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3562358 |
gtctctttcccatacaaaattaattacatttc |
3562327 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9792307 - 9792124
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
9792307 |
tttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatattactttttctattatatccttaaatatttattactctatcttctttcaact |
9792208 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9792207 |
ccttcatttatctttcttgtatcctttattaatgacaattttataaaattgctcataatatctctttcccacacaatattaatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
29440865 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaagcattaatattatttttcct |
29440964 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
29440965 |
attatatccttaaccattttctactttctcttcttccaagtcattcatttatctttcctatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaatttataat |
29441064 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
29441065 |
atcccttttccacacaaaattaattagatttc |
29441096 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
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141 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
4631178 |
tttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttatttttcttattatatcattaactatttattactctatcttctttctttt |
4631079 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
4631078 |
catttatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctctttcccatataatataaattatatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #154
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | | || |||||||| |
|
|
| T |
32642637 |
tttgtcccaaattatatatcattttccaataccaataaaacatttatgttacttttcc-attatatcctttactatttattaaaatatgttttttcaatt |
32642539 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32642538 |
ctttcatttatcttatccatactatttattaaggacaatttt-taaaataactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #155
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Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
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|
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T |
|
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143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |
|
|
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15286498 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #156
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43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15466967 |
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T |
|
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143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
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| |
|
|||| |||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
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Target: chr8; HSP #157
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| |
|
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|
|
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20091256 |
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20091157 |
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|
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| |
|
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|
|
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attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattttttcatttatctttcccata |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #158
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44 |
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141 |
Q |
| |
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36821853 |
tgtcccaaattatatgtcgttttacaataccactaaaaaattaatgttacatttcctattatatcctcaactatttattacttttttttttctttcaatt |
36821952 |
T |
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| Q |
142 |
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224 |
Q |
| |
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| T |
36821953 |
ctttaatttatcttttccatgccaattattgaggacaactttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaaaattaat |
36822035 |
T |
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Target: chr8; HSP #159
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149 |
Q |
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| T |
30157626 |
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T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
30157526 |
tatcttt-ccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaatattaattacatttc |
30157445 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #160
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50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
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| T |
9267686 |
aaattatatgtcactttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatt |
9267785 |
T |
|
| Q |
150 |
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162 |
Q |
| |
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||||||| ||||| |
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9267786 |
tatctttcccata |
9267798 |
T |
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Target: chr8; HSP #161
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142 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
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| T |
11589032 |
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11588933 |
T |
|
| Q |
143 |
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151 |
Q |
| |
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||||||||| |
|
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| T |
11588932 |
tttcattta |
11588924 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #162
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Target Start/End: Original strand, 23550714 - 23550882
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63 |
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162 |
Q |
| |
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| T |
23550714 |
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23550813 |
T |
|
| Q |
163 |
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231 |
Q |
| |
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| || |||||| || |||||||||||||||||| |||| | | || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
23550814 |
ctatctattaaagacaattttgtaaaacaactcgtaatatttatttcccacacaaaattaattatattt |
23550882 |
T |
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Target: chr8; HSP #163
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152 |
Q |
| |
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| T |
44012263 |
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44012362 |
T |
|
| Q |
153 |
cttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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| T |
44012363 |
ctttctcataccatttattgaggataatgttgtaaaacaactcataat |
44012410 |
T |
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Target: chr8; HSP #164
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147 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| | |
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| T |
24523984 |
ccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacgttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactttatcttctttcaattctttta |
24524083 |
T |
|
| Q |
148 |
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162 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
24524084 |
tttatcttttccata |
24524098 |
T |
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Target: chr8; HSP #165
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137 |
Q |
| |
|
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|
| T |
14762379 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatatttatcctattatatccttaattatttattattacttcatcttatttc |
14762478 |
T |
|
| Q |
138 |
aattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
| T |
14762479 |
aattctttaatttatctttctcataccatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatttcttttccatacaaaattaattatatttc |
14762573 |
T |
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Target: chr8; HSP #166
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tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
163 |
Q |
| |
|
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| T |
35455468 |
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35455565 |
T |
|
| Q |
164 |
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200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35455566 |
catttattaaggataattttgtaaaccaactcataat |
35455602 |
T |
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Target: chr8; HSP #167
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ttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataca |
164 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| | ||| |
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|
| T |
5062338 |
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T |
|
| Q |
165 |
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231 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
5062240 |
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5062174 |
T |
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Target: chr8; HSP #168
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Query Start/End: Original strand, 63 - 200
Target Start/End: Original strand, 17505143 - 17505281
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| Q |
63 |
ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttc-cat |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || |
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|
| T |
17505143 |
ctttacaatatcaatgaagcattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattactctctattctttcaattctttgatttaatttttctaat |
17505242 |
T |
|
| Q |
162 |
acaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17505243 |
atattttattaaggacaattttgtaaaacaagtcataat |
17505281 |
T |
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| Q |
43 |
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142 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | || | |||| ||||||||| || |||||| || |
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|
| T |
28482079 |
ttgtcccaaattataagttgttttacaatttcaatgaagcattaatgttactttttctattatacctttcattatttattactctccctactttcagttc |
28481980 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28481979 |
tttaatttgtctttcttatatcgtttattaaagatatttttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaaaattaattacattt |
28481891 |
T |
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ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| |
|
|
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40483790 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataatcttaactatttattactctatcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
40483889 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 15595507 - 15595629
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183 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
15595507 |
ttaatattactttccctattataatcttaactatttataactttcttttctttcaattctttcatttatttttctcatattatttattaaggataatttt |
15595606 |
T |
|
| Q |
184 |
gtaaaacaactcataatttctct |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15595607 |
gtaaaacaactcataatatctct |
15595629 |
T |
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149 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||| |||||| | |||||||| | || ||| ||| |
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| T |
18185426 |
aaattataggtcgctttacaataacaataaagtattaatgttacttttcttattataactttaattatttattactttatcttcttttagttctttaatt |
18185525 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaa |
192 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18185526 |
tatttttctcataccatttattaaagacaattttgtaaaacaa |
18185568 |
T |
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149 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||| |
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|
| T |
19713070 |
aaattataagtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttattaatataatcttaactatttataactctctctgctttcaattatttaatt |
19713169 |
T |
|
| Q |
150 |
tat |
152 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
19713170 |
tat |
19713172 |
T |
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taccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttat |
170 |
Q |
| |
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|||||||| || |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||| | || ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |
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|
| T |
11018490 |
taccaatgcaacattaatgttaatttttctattataatcttaattatttcttattatcccttttttcaattctttcatttatcttt-ccatattatttat |
11018588 |
T |
|
| Q |
171 |
taaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11018589 |
taaagaaaattttgtaaaacaattcataatatcttttttccacacaatattaattgcattt |
11018649 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #175
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64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |
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|
| T |
38832843 |
tttacaataccaatgaagcattaatcttacgttttctattataacat-aactatttattaccttctcttctttcaatttcttaatttatctttctcatac |
38832745 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| || | || |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38832744 |
catatattaaagataatgttgtaaaacaactcataatatct-tttcacatacaaaattaattacatttc |
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T |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||| || |
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|
| T |
16863984 |
caaattataagttgttttacaattccaacgaagcattaatgttatttttttgattatattcttaactacttattactctatctactttcaattctttaat |
16864083 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16864084 |
ttatctttcatataccattaattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
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||||| || ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |
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| T |
167348 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatataaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaatt-cttca |
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T |
|
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tttatcttt |
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Q |
| |
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tttatcttt |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11587897 - 11587808
Alignment:
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11587897 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaatattaattatatttc |
11587808 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31230612 - 31230528
Alignment:
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31230612 |
tttatctttcccatatcatgtatagaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
31230528 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33987494 - 33987364
Alignment:
| Q |
64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
163 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
33987494 |
tttataataccaataaaacattaatgttatttttgatattatatccttaactatttattattttctgttttttcaattttttaatttatcttttccatat |
33987395 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttat---taaggataattttgtaaaaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33987394 |
catttattaataaggacaattttgtaaaaca |
33987364 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 43414057 - 43413990
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcc |
109 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
43414057 |
tttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcc |
43413990 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38503188 - 38503102
Alignment:
| Q |
70 |
ataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttt |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38503188 |
ataccaatgaaacattaatgttacttcttctattatatccataatgatttattactctatcttctttcaattttttcatttatcttt |
38503102 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 198
Target Start/End: Original strand, 15715620 - 15715734
Alignment:
| Q |
83 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattt |
182 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||| |
|
|
| T |
15715620 |
attaatattactttttctattatatctttaactatttattcatttcttttctt-caattctttaatttatctttttcattcagttaattaaagataattt |
15715718 |
T |
|
| Q |
183 |
tgtaaaacaactcata |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
15715719 |
tgtaaaacaactcata |
15715734 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Original strand, 38870231 - 38870407
Alignment:
| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta---tatccttaactattaattactctctcttctttcaattattt |
145 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| | ||||||| ||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
38870231 |
caaattatatgtcgttttacaataccaataaaatattaatgttattttttctattaatatatcttaaactatttatt----------ctttcaattcttt |
38870320 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | | || ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38870321 |
catttatttttctcgtataatttattaaggacaattttgtaaaataactcatatcatatttttcccacacaaaattaattacatttc |
38870407 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 42351531 - 42351430
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||| || | |||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
42351531 |
tttgtcctaaatcatatgttgttttataatatcaataaaatattaatgttactttttctattatatccttaagtatttgttactctctcctctttcattt |
42351432 |
T |
|
| Q |
142 |
at |
143 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
42351431 |
at |
42351430 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6900096 - 6899962
Alignment:
| Q |
64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || | | | ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||| |
|
|
| T |
6900096 |
tttacaataccaacgaaacattaatgttaattttcctataatatcct-aactatttatcattttttcttctttcaattctttcatatattttttt-atat |
6899999 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
6899998 |
cttttattaaggacaattttgcaaaacatctcataat |
6899962 |
T |
|
Back To:
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Target: chr8; HSP #187
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Original strand, 9634906 - 9634996
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| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9634906 |
attataccattaactatatattagtctctcttctttcaattctttaatttatttttctcataccatttattaaggacaattttgtaaaaca |
9634996 |
T |
|
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Target: chr8; HSP #188
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
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Target Start/End: Original strand, 4407965 - 4408111
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| Q |
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||| || ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
4407965 |
actccctccgtcccaaattatacgttgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgttgcgttacaataccaatacaacattaatgttactttttct |
4408064 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatc |
153 |
Q |
| |
|
|| | |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
4408065 |
atga------taactatttattactctctctcctttcaagttattcatttatc |
4408111 |
T |
|
Back To:
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Target: chr8; HSP #189
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| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||| | |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
167740 |
atttattaatgataattttgtaaaacaattcataatatttctttctcacacagtattaattacatttc |
167807 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #190
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
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Target Start/End: Original strand, 23597262 - 23597353
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgtta |
92 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23597262 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttatcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgtta |
23597353 |
T |
|
Back To:
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Target: chr8; HSP #191
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
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Target Start/End: Complemental strand, 42821054 - 42820975
Alignment:
| Q |
83 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||| | ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
42821054 |
attaatgttactttttcaattacacacttaaatatttattactcattcttctttcaattatttaatttatcttttccata |
42820975 |
T |
|
Back To:
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Target: chr8; HSP #192
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 104
Target Start/End: Original strand, 16998935 - 16998997
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta |
104 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16998935 |
tttgtcctaaattatatgtcactttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcatatta |
16998997 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #193
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
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Target Start/End: Original strand, 36648591 - 36648647
Alignment:
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttt |
156 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
36648591 |
tattatatcattaactatttattactgtctcttctttcaattttttaatttatcttt |
36648647 |
T |
|
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Target: chr8; HSP #194
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Query Start/End: Original strand, 165 - 232
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| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9268084 |
atttattaaggacaattttataaaataactcataatatctcttttccacataatattaattgcatttc |
9268151 |
T |
|
Back To:
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Target: chr8; HSP #195
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||| ||| || ||||| |||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
5374522 |
tttgttccaaattatatgtcattttacaatatcattgaatcattaatgtttattttcttattacgtcccta-ctatttattactttatcttttttcaatt |
5374620 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcattt-atcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactc |
195 |
Q |
| |
|
|||| |||| || ||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5374621 |
attttattttatgttttccatatcattaataaatgatatttttgtaaaacaactc |
5374675 |
T |
|
Back To:
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Target: chr8; HSP #196
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattat |
143 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
3360243 |
aaattatatgtccttttacaatattaatgaaacattaatattacttttgttattatatccttaactctttgttactctcttttattttaattat |
3360336 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #197
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| Q |
129 |
tcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
38777351 |
tcttctttcaattttttaatttattttttccatattattaattaatgataattttctaaattaactcataattt |
38777424 |
T |
|
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| Q |
84 |
ttaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca-tttatcttttccatacaatttattaaggataattt |
182 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| || | |||| | |||||| | |||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||| |
|
|
| T |
40439864 |
ttaatgttaattttcctattatgccccttactacttattactttatctttttccaattcttttaatttatgttttccataccattagtgaaggatatttt |
40439765 |
T |
|
| Q |
183 |
tgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| | | |||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
40439764 |
tgtaaaacaactcacaattactcttttctatacaacattaactacatttc |
40439715 |
T |
|
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Target: chr8; HSP #199
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| Q |
160 |
atacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcccca |
212 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
38502000 |
ataccatttattaaagataattttgtaaaataactcataatatctctttccca |
38502052 |
T |
|
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Target: chr8; HSP #200
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| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
24524347 |
atttattaaagacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccatacaatactaattgcatttc |
24524414 |
T |
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aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||| | ||| | | |||| |||||||| ||| || |
|
|
| T |
35795137 |
aaattataagttgttttacaatacaaattaaatattaatgttattttttcttttatacaattaactaatgatttatatatcttatttcaattctttattt |
35795038 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaattta |
169 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
35795037 |
tatctttttcataccattta |
35795018 |
T |
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Target: chr8; HSP #202
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| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
36466893 |
ttatctttctcataccatttattaaagataattttgtaaatcaactcataat |
36466842 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #203
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
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| T |
40824242 |
aaattatatatcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcttattatct--ttaactatttatta----------tttcaattttttaatt |
40824155 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||| ||||| | |||| | || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
40824154 |
tatctttctcataccgtcaattaagaataattttgtaaaataacttataatatttctttctcaaacaaaattaattacattt |
40824073 |
T |
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Target: chr8; HSP #204
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tattaattactctctcttctttcaattatttca-tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactca |
196 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| |||||| |||| ||| | ||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
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4523358 |
tatttattactctcttttctttaaatttttttaatttgtcttattcataccatttattaagaataattttgtaaatcaactca |
4523440 |
T |
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Target: chr8; HSP #205
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Target Start/End: Original strand, 17854413 - 17854479
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200 |
Q |
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tttcaattctttaattaatattttcaatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataat |
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T |
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Target: chr8; HSP #206
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Target Start/End: Complemental strand, 8567051 - 8566998
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147 |
atttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
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atttatctttttcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaacttataat |
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T |
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Target: chr8; HSP #207
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189 |
Q |
| |
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attactctctcatttttggattcttttatttatatttttcatataatttattaaggataattttgcaaaa |
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T |
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Target: chr8; HSP #208
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Target Start/End: Original strand, 40483894 - 40483947
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| Q |
178 |
aattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
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Q |
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aattttgtaaaataactcataatatattttttccacacaatattaattacattt |
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T |
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Target: chr8; HSP #209
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Target Start/End: Complemental strand, 6073110 - 6072970
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50 |
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148 |
Q |
| |
|
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aaattataagtcactttacaatatcaagaaaacattaatgatacttttttccattatacccttatccatttattacattctcttatttcaattcttcaat |
6073011 |
T |
|
| Q |
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ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaa |
189 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| ||| || |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6073010 |
ttatttttcacataacattaataaaggataactttgtaaaa |
6072970 |
T |
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Target: chr8; HSP #210
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Target Start/End: Original strand, 11094246 - 11094318
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| Q |
159 |
catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |
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|
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cataccattgatgaaggttaattttgtaaaataactaataatttctcttttcaatacaaaattaattacattt |
11094318 |
T |
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Target: chr8; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 28072041 - 28071968
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| Q |
43 |
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118 |
Q |
| |
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ttgtctcaaattaaacgtcgttttacaataataatgaaacattaatgttatttttcgt--tatatccttaactatt |
28071968 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 246)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
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Target Start/End: Complemental strand, 33488182 - 33487951
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Q |
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33488083 |
T |
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| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
33488082 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
33487983 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
33487982 |
ttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42219867 - 42219636
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Q |
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|
| T |
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actccctccgtcctaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
42219768 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
42219767 |
attatatccttaactattaattactccctattctttcaattatttcatttatctttttcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
42219668 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
42219667 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 2458489 - 2458720
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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2458588 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
2458688 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2458689 |
ttctcttccccacacaaaattaattacatttc |
2458720 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35379752 - 35379563
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| Q |
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Q |
| |
|
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|
| T |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
35379652 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target Start/End: Complemental strand, 6540744 - 6540513
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Q |
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|
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6540644 |
attatatccttaactattaattactccctcttctttcaattgtttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
6540545 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6540544 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr1; HSP #6
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Target Start/End: Complemental strand, 7318857 - 7318626
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100 |
Q |
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|
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
7318757 |
attatatctttaactactaattactctctcttctttcaattatttaatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
7318658 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
7318657 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
7318626 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 51905877 - 51905646
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|
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatcattaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
51905678 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
51905677 |
atcacatcaccacacaatattaattacatttc |
51905646 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
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Target Start/End: Original strand, 1395684 - 1395911
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104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgttttacaaaaccaatgaaatattaatgttacttttcctatta |
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T |
|
| Q |
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tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tatccttaactattaattactacctcttctttcaattatttcatttatcttttccatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
1395883 |
T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
1395884 |
cttccctacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 2733842 - 2734073
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
2733942 |
attatatcattaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
2734041 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2734042 |
ttctcgtccccacacaatattaattacatttc |
2734073 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 13387526 - 13387757
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaatttatcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
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|
| T |
13387626 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
13387725 |
T |
|
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
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13387726 |
ttctcttccctatgcaatattaattacatttc |
13387757 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
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Q |
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T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23825182 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
23825083 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaa |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23825082 |
ttctcttccccacacaa |
23825066 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
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Q |
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T |
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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31809670 |
T |
|
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ttctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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31809671 |
ttctcttccccacacaatattaattaca |
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T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #13
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Q |
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T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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48363451 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 51417647 - 51417416
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100 |
Q |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attatatccttaactattaattactctcttttctttcaattattttatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
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| T |
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ttctcttccccacataatattaattatatttc |
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T |
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Target: chr1; HSP #15
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Target Start/End: Complemental strand, 31583369 - 31583139
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1 |
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Q |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attatatccttaactattaattactctctcttcttttaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31583169 |
ttctcttccccacgcaatattaattacattt |
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T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35369674 - 35369441
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Q |
| |
|
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|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatc--ttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcata |
198 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcata |
35369475 |
T |
|
| Q |
199 |
atttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35369474 |
atttctcttccctacacaatattaattatatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 43 - 232
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Q |
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|
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T |
|
| Q |
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
52688281 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacagctcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
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144 |
Q |
| |
|
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|
|
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T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10656708 |
tcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
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| Q |
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
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|
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|
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46436464 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta-tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attatatccttaactattgattactctctcttctttcaattattttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
46436364 |
T |
|
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200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
46436363 |
tttctcttccccacacaatattaattatatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23549384 |
attatatccttatctattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
23549285 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23549284 |
ttcttttcctcatgcaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
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Q |
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|
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|
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T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8768588 |
atttcatttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaataactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
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| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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31500765 |
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T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31500665 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttttcttccccacgcaatattaattgcatttc |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
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Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
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39673736 |
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T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39673636 |
tttcatttattttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttttctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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| |
|
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|
|
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T |
|
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tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatc--ttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcat |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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tattatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatctttttttcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcat |
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T |
|
| Q |
198 |
aatttctctt-ccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15170146 |
aatttctcttcccccacacaatattaattatatttc |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
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|
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| |
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41457884 |
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41457785 |
T |
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201 |
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232 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
41457784 |
ttctgttctccacacaatattaattacatttc |
41457753 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
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Target Start/End: Complemental strand, 41621010 - 41620828
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149 |
Q |
| |
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| T |
41621010 |
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41620911 |
T |
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232 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
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Target Start/End: Complemental strand, 45269180 - 45269022
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74 |
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173 |
Q |
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45269180 |
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45269081 |
T |
|
| Q |
174 |
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232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
45269080 |
ggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Original strand, 3788093 - 3788279
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46 |
tcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattt |
145 |
Q |
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tcccaaattatatgtcattttacaatacaaatgcaatattaatgttacttttcctattatatccttaactcttaattactccctattctttcaattattt |
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T |
|
| Q |
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232 |
Q |
| |
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| T |
3788193 |
catttttcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
3788279 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
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Target Start/End: Complemental strand, 50309943 - 50309755
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141 |
Q |
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50309846 |
T |
|
| Q |
142 |
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232 |
Q |
| |
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| T |
50309845 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 16010917 - 16011148
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Q |
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16010917 |
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16011016 |
T |
|
| Q |
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200 |
Q |
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| T |
16011017 |
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16011116 |
T |
|
| Q |
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232 |
Q |
| |
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| T |
16011117 |
atctctttcctacacaatattaattacatttc |
16011148 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 24589499 - 24589730
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100 |
Q |
| |
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| T |
24589499 |
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24589598 |
T |
|
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
24589599 |
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24589698 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
24589699 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
24589730 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 26834829 - 26835060
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
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| T |
26834829 |
actccctccatcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
26834929 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataat |
26835028 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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||| || |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
26835029 |
atctatttcccacacaatattaattacatttc |
26835060 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26541261 - 26541071
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tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
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tttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
26541162 |
T |
|
| Q |
142 |
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232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26541161 |
ccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
26541071 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31925306 - 31925116
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
31925306 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctcccttctttcaatt |
31925207 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
31925206 |
ccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
31925116 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
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Target Start/End: Original strand, 42643110 - 42643340
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
42643110 |
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42643209 |
T |
|
| Q |
102 |
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201 |
Q |
| |
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| T |
42643210 |
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42643309 |
T |
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| Q |
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232 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
42643310 |
tctctttcccacacaatattaattatatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
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102 |
Q |
| |
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| T |
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| Q |
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202 |
Q |
| |
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| T |
16011540 |
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16011441 |
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| Q |
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232 |
Q |
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| T |
16011440 |
ctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
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102 |
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| |
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34347274 |
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T |
|
| Q |
103 |
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202 |
Q |
| |
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| T |
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34347473 |
T |
|
| Q |
203 |
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232 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
34347474 |
ctctttcccacacaatattaattacatttc |
34347503 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 18127335 - 18127567
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Q |
| |
|
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actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttatttttcct |
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcattt-atcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaactatttattactctctcttcttttaattccttcatttaatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
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T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
18127535 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttc |
18127567 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
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T |
|
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200 |
Q |
| |
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attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
8711958 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
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|
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|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
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| |
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| T |
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attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
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Target Start/End: Complemental strand, 16630093 - 16629903
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42 |
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Q |
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tttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
16629994 |
T |
|
| Q |
142 |
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232 |
Q |
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| T |
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tcttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr1; HSP #43
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Target Start/End: Original strand, 20793380 - 20793568
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T |
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231 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
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T |
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T |
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201 |
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232 |
Q |
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atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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Target: chr1; HSP #45
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T |
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200 |
Q |
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T |
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Q |
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atatatttcccacacaaaattaattatatttc |
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T |
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Target: chr1; HSP #46
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Q |
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T |
|
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
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atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr1; HSP #47
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T |
|
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Q |
| |
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T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
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| |
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T |
|
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Q |
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T |
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201 |
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232 |
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| |
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atctctttcccacacagtattaattacatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
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T |
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200 |
Q |
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T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
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| T |
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attatatcctcaactatttattactttctcttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
32145553 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
32145554 |
atcattttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
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Target Start/End: Original strand, 39282533 - 39282764
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaactatttattactgtttcttttttcaaatctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataat |
39282732 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
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| T |
39282733 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
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|
| T |
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ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
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Target Start/End: Original strand, 27952649 - 27952830
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|
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|
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T |
|
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaat |
224 |
Q |
| |
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||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| |
|
|
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27952749 |
tttaatttatctttctcataccatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacactaaattaat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
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Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
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38816989 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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|| |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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tctttatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #55
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Q |
| |
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataca-----------------atttattaaggataatttt |
183 |
Q |
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| T |
290452 |
attatatccttaactattaattactatctcttctttcaattattccatttatcttttccatacatttatcttttccatatcatttattagggataatttt |
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T |
|
| Q |
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gtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
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gtaaaacaactcataatttttcttccccatgcaatattaattacatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #56
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| |
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|||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |
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T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
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attatatccttaactatttattactctctc--ctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
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|||||| || ||||||||||||||||||||| |
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|
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atctctttcctacacaatattaattacatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #57
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Target Start/End: Original strand, 21362446 - 21362678
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99 |
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T |
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T |
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T |
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Target: chr1; HSP #59
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Q |
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Target: chr1; HSP #60
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #61
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Target Start/End: Complemental strand, 26333523 - 26333333
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T |
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T |
|
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T |
|
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47393621 - 47393431
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T |
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Target: chr1; HSP #65
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Target Start/End: Original strand, 52666854 - 52667044
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T |
|
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232 |
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| |
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Target: chr1; HSP #66
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Target Start/End: Original strand, 42379233 - 42379422
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T |
|
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Q |
| |
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T |
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tatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
|
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tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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tattataaccttagctatttattactctctcttcttttaattctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
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T |
|
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232 |
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| |
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| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
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tatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #69
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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attatatctttaactatttattactctctcttttttcaatttcttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
34967411 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #70
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| |
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T |
|
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ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
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Back To:
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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| |
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|||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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T |
|
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
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||| || | |||||||||||||| |||||| |
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| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #73
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Target Start/End: Complemental strand, 15824355 - 15824165
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141 |
Q |
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15824355 |
tttgttccaaattgtatgtcgctttacaatactaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
15824256 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15824255 |
cttttatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
15824165 |
T |
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Target: chr1; HSP #74
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Q |
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35096662 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattgtatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatt |
35096761 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
Q |
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35096762 |
tatctttcccatataatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaatattaattaca |
35096840 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #75
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141 |
Q |
| |
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tttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattgtatctttaactatttattaccctctcttctttcaatt |
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T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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ccttcatttatctttcccatataatttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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161 |
Q |
| |
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| T |
42728279 |
gctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatatcttccat |
42728378 |
T |
|
| Q |
162 |
acaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
42728379 |
atcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcgttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #77
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
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141 |
Q |
| |
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| T |
49419600 |
tttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaatt |
49419501 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
49419500 |
ccttcatttatctttcccatatcatttatcgaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctt-tccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr1; HSP #78
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Target Start/End: Complemental strand, 15575082 - 15574913
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162 |
Q |
| |
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ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatcatatcttcaactatttattactctttcttctttaaattatttcatttatcttttccata |
15574983 |
T |
|
| Q |
163 |
caatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
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tcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #79
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99 |
Q |
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| T |
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T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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| T |
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tcttataaccttaactatttattactctctcttatttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
16051730 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
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tatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
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Target: chr1; HSP #80
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100 |
Q |
| |
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| T |
3552840 |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
3552740 |
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3552641 |
T |
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| Q |
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Q |
| |
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| T |
3552640 |
atctctttcccacacaatattaatcacatttc |
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T |
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Target: chr1; HSP #81
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|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
29672404 |
attatatccttaattatttattactgt-tcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
29672502 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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atctcttttccatacaatattaattacatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #82
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Target Start/End: Original strand, 30679274 - 30679505
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| |
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actccctccgtcccaaaatgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgttgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttctt |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
30679374 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttcccatatcatttattgaggacagttttgtaaaacaactcataat |
30679473 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
30679474 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
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Target Start/End: Complemental strand, 42334490 - 42334307
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Q |
| |
|
|||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||| |
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|
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42334490 |
caaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcat |
42334391 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
42334390 |
ttatctttcccatatcatttattaatgataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #84
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Q |
| |
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tttgtcctaaattatatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcccattatatccttaactatttattactctctattctttcaatt |
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||| ||||| |
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|
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5467034 |
ctttaatttatcattctcatacaacttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaaaattaattatatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #85
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Q |
| |
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8462520 |
tttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
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ccttcatttattattctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacataatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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140 |
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| |
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T |
|
| Q |
141 |
tatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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|
| T |
13985409 |
tccttcatttatttttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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ctttcgtttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #88
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145 |
Q |
| |
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tcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaattatttattactctatcttctttcaattcctt |
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T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
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catttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatatttttcccacacaatattaattacatttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #89
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 51560788 - 51560978
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| |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #90
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Target Start/End: Complemental strand, 52001248 - 52001058
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Q |
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T |
|
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232 |
Q |
| |
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52001148 |
atttcatttatctttcacatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatattttttttccacacaatattaattgcatttc |
52001058 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #91
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 52833641 - 52833831
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141 |
Q |
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|
|
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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52833741 |
cattcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcgtaatatctctttccctcataatattaattatatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #92
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Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 16436099 - 16436288
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142 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
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T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
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cttcatctatcttttccatatcatttattaaggataattttataaaacagctcataatatctctttctcatacaatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24322758 - 24322569
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141 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||| |
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|
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24322758 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaaccttaatgttatttttcctattataaccttagctatttattactctctttactttcaatt |
24322659 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |
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|
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24322658 |
ctttcatttatctttcccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcattt |
24322569 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #94
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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99 |
Q |
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T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tattataaccttaactatttattactct--cttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
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T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |
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tatctctt-tccatacaatattaattgcatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #95
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Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Original strand, 12966942 - 12967130
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Q |
| |
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T |
|
| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
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T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
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Target Start/End: Original strand, 19010778 - 19011007
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
|
| Q |
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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19010878 |
attatatccttaactatttattgctct--cttctttcaattccttcatttatctttcacatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
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201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
19010976 |
atctcattcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
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Q |
| |
|
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|
| T |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
28011168 |
attataaccttaactacttattactctctcttatttcaattctttcatttatttttcccatattatttattacggacaattttgtaaaacaactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
28011268 |
atcccttttccacacaatattaatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
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Alignment:
| Q |
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99 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
49872499 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaaatagtcccaaattatatgtcgctttaaaatatcaatgcaacattaatggtacttttcc |
49872598 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49872599 |
tattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
49872698 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
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49872699 |
tatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31045623 - 31045392
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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31045623 |
actccctccgtcccaaattttatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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attatatccttaactatttattactctcttttcttttaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaattcataat |
31045424 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31045423 |
atctctttaacacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #100
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
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| Q |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |
|
|
| T |
14202974 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttctttttccaatt |
14203073 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
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14203074 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #101
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| |
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|||||| |||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
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|
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T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||| |
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|
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #102
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Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
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T |
|
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaa |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
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tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #103
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Q |
| |
|
||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |
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|
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|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacaca |
216 |
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| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
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| |
|
||||| |||||||||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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51984040 |
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T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt-tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcata- |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
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attatatccttaactatttattattctctcttctttcaattccttcattgtatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
51983841 |
T |
|
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199 |
-atttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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Target: chr1; HSP #105
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Query Start/End: Original strand, 43 - 232
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| |
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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|
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|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #106
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Target Start/End: Original strand, 3549989 - 3550221
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Q |
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3549989 |
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T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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3550188 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatatt-aattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3550189 |
atctctttcccacacaatattaaattacatttc |
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T |
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Target: chr1; HSP #107
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100 |
Q |
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T |
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197 |
Q |
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12959477 |
attataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattattaaggacaattttgtaaaataactcat |
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T |
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198 |
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232 |
Q |
| |
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T |
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Target: chr1; HSP #108
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Target Start/End: Complemental strand, 7572586 - 7572355
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1 |
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99 |
Q |
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T |
|
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100 |
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199 |
Q |
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| T |
7572486 |
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7572387 |
T |
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| Q |
200 |
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231 |
Q |
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| || ||| ||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
7572386 |
tatcgctttcccacacaaaattaattacattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 41529110 - 41529341
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100 |
Q |
| |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaactatttattactttttcttttttcaattctttcatttatatttcctatatcattcattaaggacaattttgtaaaataactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
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232 |
Q |
| |
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| T |
41529310 |
atctctttcccacacaatgttaattacatttc |
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T |
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Target: chr1; HSP #110
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Query Start/End: Original strand, 43 - 225
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Q |
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8330183 |
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T |
|
| Q |
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
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| T |
8330283 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaatt |
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T |
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Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Original strand, 8878805 - 8878987
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142 |
Q |
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T |
|
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143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
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|
| T |
8878905 |
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T |
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Target: chr1; HSP #112
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141 |
Q |
| |
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| T |
23624885 |
ttgttccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttttttttttcaatt |
23624984 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
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ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr1; HSP #113
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142 |
Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
38680022 |
ctttatttatctttctcatatcgtttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: chr1; HSP #114
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| |
|
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|
|
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39655395 |
tttgtcccaaattatatgtcgttttacaatgtcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatatttattactctctcttctttcaa |
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T |
|
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ttatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
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|
| T |
50942763 |
ctttcatttatttttctcattttatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacattt |
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T |
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Target: chr1; HSP #116
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Q |
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|
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|
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tttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatcattaactatttattactctcttttctttcaattccttcatttatctttcccatat |
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T |
|
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232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39501847 |
catttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccatacaatatcaattacatttc |
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|
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|
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T |
|
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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attgtatccttaactatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttcccatgtcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataat |
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T |
|
| Q |
201 |
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225 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||| |
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|
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49251645 |
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|
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T |
|
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catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacat |
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Q |
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|
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|
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|
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caaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattatatcattaactatttattactttttcttctttcaattttttcat |
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T |
|
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ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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| |
|
|||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||| |
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|
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|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #121
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| |
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|
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catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| |||| |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #122
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attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
42709776 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataac |
42709875 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42709876 |
atatcttttccacacaatattaattatatttc |
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T |
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Target: chr1; HSP #123
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Target Start/End: Complemental strand, 1037741 - 1037508
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Q |
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T |
|
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101 |
attatatccttaactattaattactct--ctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcata |
198 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaactatttattactctctctcttctttcaatttctttatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttataaaacaactcata |
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T |
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| Q |
199 |
atttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
1037541 |
atatctcttttccatattatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1044647 - 1044414
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100 |
Q |
| |
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|
|
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactct--ctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcata |
198 |
Q |
| |
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| T |
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attatatccttaactatttattactctctctcttctttcaatttctttatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttataaaacaactcata |
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T |
|
| Q |
199 |
atttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|
| T |
1044447 |
atatctcttttccatattatattaattacatttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 3163176 - 3163405
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99 |
Q |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttaggagaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatgttacttttcc |
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T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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|
| T |
3163276 |
aattataaccttaattaattattactccctctt---tcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
3163372 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3163373 |
tatctattttccacacaatattaattgcatttc |
3163405 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 8307828 - 8308018
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42 |
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141 |
Q |
| |
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8307828 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatattatttttcttattataaccttaattatttattactctctcttctttcaatt |
8307927 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
8307928 |
ctttcatttatctttcccttattatttattaaagacaattttgtaaaacaacttataatatttcttttccacacaatattaattgcatttc |
8308018 |
T |
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Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
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Target Start/End: Complemental strand, 14795150 - 14794969
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149 |
Q |
| |
|
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| T |
14795150 |
aaattatatgtcgctttacgataccaataaaatattaatgttacttttcctattatgtcattaactatttattactctcttttcttttaattccttcgtt |
14795051 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14795050 |
tatctttcccatttaa-ttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaatattaattacatttc |
14794969 |
T |
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Target: chr1; HSP #128
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Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 48355793 - 48355983
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| | |
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|
| T |
48355793 |
tttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccgatgaaacattaatgttacttttcatattataacattaactatttattcctctctcttctttcaagt |
48355892 |
T |
|
| Q |
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48355893 |
cttttatttatctttcccatattatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatcttttttccatacaatattaattacatttc |
48355983 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26061900 - 26061711
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| Q |
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142 |
Q |
| |
|
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| T |
26061900 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcatattataaccttaactatttattactatatcttttttcaattc |
26061801 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26061800 |
tttcatttatattttccatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttc |
26061711 |
T |
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Target: chr1; HSP #130
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Target Start/End: Original strand, 45430053 - 45430230
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147 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45430053 |
ccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattgtatccttagttatttattactctctcttctttcaattctttca |
45430152 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
45430153 |
tttatctttcctatattatttattaaggacaaatttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaatt |
45430230 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 52703412 - 52703601
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142 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || |||| | |
|
|
| T |
52703412 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgtcttctctactctcaagtc |
52703511 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
52703512 |
attcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaaaattaattacatttc |
52703601 |
T |
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Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28359864 - 28359693
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| Q |
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159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
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tcgctttacaataccaataaaaaatta-tgttacttttcctattatatccttaatcatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttccc |
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T |
|
| Q |
160 |
atacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28359765 |
atatcatttattgaggaaaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 39674018 - 39674242
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100 |
Q |
| |
|
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|
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actccctccatcccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaattgtcgcaaattatacgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcct |
39674117 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
39674118 |
attataaccttaattatctattaccctctcttctttcaattctttaatttatctttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
39674217 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
39674218 |
atttcttttccacacaatattaatt |
39674242 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 40132270 - 40132458
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142 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttgtcacaaattatttgtcgctttacgatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctctcttctttcaattt |
40132369 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
40132370 |
tttaatttatctttctcataccatatattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatttttcccacacaaaattatttatattt |
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T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #135
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Query Start/End: Original strand, 1 - 220
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||| |||| | ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |
|
|
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actccctccgtcccaaaatgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttagttttcat |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50324928 |
attatatccttaactatttattactacctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacagttttgtaaaacaactcataat |
50325027 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatat |
220 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
50325028 |
atctatttcccacacaatat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #136
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59 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttc |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| | |
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|
| T |
10426571 |
gtcgctttacaatagcaatgcaacattaatgttacttttcctattataacattaactatttattactccatcttctttcaattacttcatttatatttcc |
10426670 |
T |
|
| Q |
159 |
catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10426671 |
catattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcatttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #137
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gtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatt |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
23827375 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
23827474 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23827475 |
ttatttatctttcccat-----------atgacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #138
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Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47038529 - 47038361
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64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
163 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
47038529 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatattcgtaactatttattactatttcttttttcaattctttcatttatctttctcatat |
47038430 |
T |
|
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164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47038429 |
catttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatccttttcccacacaatattaattacatttc |
47038361 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13896603 - 13896413
Alignment:
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42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
13896603 |
tttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccattgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactagttattactctttcttctttcaatt |
13896504 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13896503 |
ctttcatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttttcacacaatattaattgcatttc |
13896413 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32049572 - 32049391
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
32049572 |
tttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgt-atttttccttttatatccttaactattcattactctttcttttttcaatt |
32049474 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaat |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
32049473 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaataacttataatatctcttttccacacaatattaat |
32049391 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45467295 - 45467105
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || |||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
45467295 |
tttgtcccaaattgtatgttactttacaatatcaatgaaacattaatgctatttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaatt |
45467196 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45467195 |
ctttcatttatctttcacatatcatttattaaggataatttcttaaaacaactcataacacctctttcccgtacaatattaattacatttc |
45467105 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31023828 - 31023639
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
31023828 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttacattttctattatacccttaactatttattattctctcttctttcatttc |
31023729 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || | | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31023728 |
tttaatctatctttttcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatttttcttatacaatattaattacatttc |
31023639 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 46398599 - 46398831
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
46398599 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttaggagaaaaaatttgtctcaaattatatgttgctttacaatacccatgcaacattaatgttgctttttc |
46398698 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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|||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46398699 |
aattataaccttaattaattattactccctcttcttttagttctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
46398798 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
46398799 |
tatctattttccacacaatattaattgcatttc |
46398831 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 28646150 - 28646381
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28646150 |
actccctccgtctcaaattgcatgtcgctttagaaaaaatatttgtcttaaattatatgttgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcct |
28646249 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28646250 |
attataactttagctatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatgttatttgttaaggacaattttgtaaaacaacttataat |
28646349 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28646350 |
atctcttttctacacaatattaattgcatttc |
28646381 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 10085753 - 10085943
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| | |
|
|
| T |
10085753 |
tttgtcccaaattgtatgtcgctttacactaccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactttctctcattccaagt |
10085852 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10085853 |
cattcatttattttttcaatgtcatttattaaatacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttc |
10085943 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 46272976 - 46272794
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
46272976 |
aaattatatatcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttttattatatccttaactatttattgtcatctcttctttcaattccttcatt |
46272877 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46272876 |
tatctttctcatatcttttattgaggacaattttgtaaaacaacgcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
46272794 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2619627 - 2619402
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgcttt-ggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcc |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| |||||||| |||| || |||||| ||||| || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2619627 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgttttagggtaaaaaatttgtcttaaattatatgtcgattaacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcc |
2619528 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2619527 |
tattataaccttaactatttattactccctcttctttcaattctttaatttatctttctcatattatttattaaggatcattttgtaaaacatctcataa |
2619428 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2619427 |
tatcttttttccacacaatattaatt |
2619402 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 4226240 - 4226460
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4226240 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcct |
4226339 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4226340 |
attataaccttaactatttattactctctcttctttcaaatcttttatttatctttctcat-----------aggacaattttgtaaaacagctcataat |
4226428 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4226429 |
atcttttttccacacaatattaattacatttc |
4226460 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16128782 - 16128625
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16128782 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataactttaactatttattactatctcttctttcaattc |
16128683 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16128682 |
tttcatttatctttctcatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
16128625 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32871480 - 32871318
Alignment:
| Q |
68 |
caataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatt |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | || ||| |
|
|
| T |
32871480 |
caataccaattaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttcttttaattctttcatttatctttcctgtatcatt |
32871381 |
T |
|
| Q |
168 |
tattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32871380 |
tattaaggacaattttgtaaaacaactcataaaatctct--cacacacaatattaattacatttc |
32871318 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| ||| || | |
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|
| T |
49367477 |
ttgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattcatgttacttttcctattatatccttcactatttattgctttctctacttctaagtc |
49367378 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
49367377 |
attcatttatcttttttatatcatttattaaggtcaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttc |
49367288 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19316610 - 19316442
Alignment:
| Q |
64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
163 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
19316610 |
tttacaatatcaataaaataataaagttattttttctattatatccttcattatttattactctttcttctttcaattctttcattcatcttttccatat |
19316511 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19316510 |
tatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatatatttcccacacaatattaattacatttc |
19316442 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 50776212 - 50776393
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| Q |
50 |
aaattataagtcgcttt-acaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||| |||||| |
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|
| T |
50776212 |
aaattatatgtcgcttttacaatacccatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaatcatttattactctat--tctttcaattctttcat |
50776309 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
50776310 |
ttatctttcccatattatttattaagcacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 200
Target Start/End: Original strand, 4953572 - 4953721
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| Q |
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aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4953572 |
aaattataagtcgtttcacaataccaatcaaacattaatgttgttttttctattatatccttaactatta-ttactctttcttctttcaattatttcatt |
4953670 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4953671 |
catctttctcatatcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataat |
4953721 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 232
Target Start/End: Original strand, 39739449 - 39739607
Alignment:
| Q |
75 |
aatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaag |
174 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39739449 |
aatgaaatattaatgctactttttctattatatccttaattatttattactctctcttttttcaattctttaatttatcttttccataccatttattaag |
39739548 |
T |
|
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gataattttgtaaaacaactcat-aatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
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Q |
| |
|
| |||||||||||| |||| || ||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
39739549 |
aacaattttgtaaaataacttataaatatctttttcccacacaaaattaattacatttc |
39739607 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26551710 - 26551521
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||| ||| | |
|
|
| T |
26551710 |
ttgtctcaaattgtatatcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgccttctctacttccaagtc |
26551611 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
26551610 |
attcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctcattcccacacaaaattaattatatttc |
26551521 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46569159 - 46568974
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
46569159 |
ttgtaccaaattatatgtcgttttataatac-aattaaacattaatgttatttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaatac |
46569061 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46569060 |
tttcatttatc-tttccata-tatttgttaaggacaattttgtaaaacaacttatattatctctttcacacacaatattaattacattt |
46568974 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17179547 - 17179316
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17179547 |
actccctccgtcttaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattgtatgttactttacaataccaatgaagaattaatgttatttttcct |
17179448 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||| ||||||||| || | ||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17179447 |
attatatccttaactatttactactttctcttcttctaagtcattcatttatctttcatatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaattcataat |
17179348 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17179347 |
atccttttcccacacaaaattaattacatttc |
17179316 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9265024 - 9264843
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
9265024 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttattttttcaattataaccttaactatttattattatctcttctttcaatt |
9264925 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9264924 |
ctttcatttatctttctcat--attatattaaggacaattttgtaaaacaactcataatattttttttccagacaatattaatt |
9264843 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 200
Target Start/End: Original strand, 11030084 - 11030238
Alignment:
| Q |
46 |
tcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattt |
145 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11030084 |
tcccaaattataagtcgttttacaatacgtatgaaaaattaatgttacttttcttattatacccttgactatttattattctctcttctttcaatttttt |
11030183 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11030184 |
aatttatctttcacataccatttattagagacaattttataatacaactcataat |
11030238 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 232
Target Start/End: Original strand, 32472750 - 32472932
Alignment:
| Q |
51 |
aattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactct---ctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||| | ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
32472750 |
aattataagtcgttttacaataacaatgaaacattaatgt-acttttcctaatatacctttaactatttattattattatctcttctttcaattatttaa |
32472848 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| | || |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
32472849 |
tttatcttttc-atataatttattaaggacaattttgtaaaataactcaaaatatctctttctcatacaaaattaattacatttc |
32472932 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 83186 - 83063
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
83186 |
actccctccgtcctaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatt-gtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
83088 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattact |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
83087 |
attatatccttaactattaattact |
83063 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 27999671 - 27999852
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
27999671 |
aaattatatgtcactttacaatactaatgtaacgttaatgttacttttcctattataactttaattatttattactccctcttctttcaattcttttatt |
27999770 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| || | ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27999771 |
tatctttcccatattattt-ttaaggacaattttgttaagctacttataatatctctttcgcacacaatattaattgcatttc |
27999852 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31681772 - 31681583
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
31681772 |
ttgttccaaattgtatgccgctttacaataccaaagaaacattaatgttatttttactattatatccttaactatttattactttctcttctttcaagtc |
31681673 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| || | ||||| || || ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31681672 |
attcatttatctttcttatgtcatttactaaggacaattttgtaaaataattaataatatccatttcccacacaaaattaattacatttc |
31681583 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 36633304 - 36633176
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36633304 |
tttgtctcaaattatatgttgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttacttttcatattatatccttaaccatttattactctctcttctttcaatt |
36633206 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttatt |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
36633205 |
ccttcatttatctttcccatatcatttatt |
36633176 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10977912 - 10977801
Alignment:
| Q |
46 |
tcccaaattataagtcgcttt-acaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatt |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
10977912 |
tcccaaattataagtcgtttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatacccttaactatttattattctctcttctttcgattttt |
10977813 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttt |
156 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |
|
|
| T |
10977812 |
taatttatcttt |
10977801 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 220
Target Start/End: Original strand, 46762159 - 46762327
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| |
|
|
| T |
46762159 |
ttgtcccaaattatacgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcttattataaccttaactatttattactatattttctttcaatta |
46762258 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatat |
220 |
Q |
| |
|
| |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||| |
|
|
| T |
46762259 |
t---------ctttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatgttttttttccacacaatat |
46762327 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5432311 - 5432185
Alignment:
| Q |
105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
5432311 |
tatccttaattatttattactcttttct-tttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaagtataattttgtaaaacaactcataatatct |
5432213 |
T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5432212 |
ctttcccacacaatattaattacatttc |
5432185 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35150232 - 35150089
Alignment:
| Q |
64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
163 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||| | | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
35150232 |
tttacgatatcaatgaaactttaatgttattttttctattatacctttaattgcttattactttctcttctttcaattatttaatttatctttctcatat |
35150133 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35150132 |
aatttattaaggataattttataaaacaactcataatatctctt |
35150089 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 207
Target Start/End: Original strand, 6049742 - 6049903
Alignment:
| Q |
45 |
gtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatt |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6049742 |
gtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaagaattaatattatttttc-tattattttcttaactatttattactctctcttcttttaattatt |
6049840 |
T |
|
| Q |
145 |
tcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||| || ||||||| | |||||| |||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
6049841 |
taatttatctttcatatatcatctattaagaacaattttataaaacaaatcataatatctctt |
6049903 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34186498 - 34186312
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
34186498 |
ttgttccaaattataatatgctttacaatatcaatgaaacattaatattactttttctattataaccttaattatgtattactctatctttttttaattt |
34186399 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacat |
229 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
34186398 |
tttaatttatatttctcatactatttattaaagataattttgtaaaacaacttataatatttctttcgtatacaaaattaattacat |
34186312 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 39782464 - 39782646
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
39782464 |
aaattatatgtcgttttacaatatcaatgcaacattgacgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttacttcaattcttttatt |
39782563 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| ||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | | || || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39782564 |
tatatttctcatattatttattaaaaacaattttgtaaaacaattcataatatttatttttcatacaatattaattacatttc |
39782646 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 48509747 - 48509927
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||| |||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
48509747 |
aaattatatgtcgttttataatagcaatgaaacattt-tgttattttttctattataattttaactatttattacttactcttctttcaatttttt-att |
48509844 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
48509845 |
tatcttttccatattatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttctacataatattaattgcatttc |
48509927 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 52177826 - 52178015
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
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| T |
52177826 |
ttgtctcaaattgtatgtctctttacaataccaatgaatcattaatattacttttcctattatatcattcactatttatttcattttctacttccaagtc |
52177925 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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|| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
52177926 |
atttatttatctttctcatatcatttattaagaacaattttgcaaaacgactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttc |
52178015 |
T |
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Target: chr1; HSP #175
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Target Start/End: Complemental strand, 8012610 - 8012498
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219 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8012610 |
attactctctcttctttcaagtcttttatttatttttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaata |
8012511 |
T |
|
| Q |
220 |
ttaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
8012510 |
ttaattacatttc |
8012498 |
T |
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Target: chr1; HSP #176
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42 |
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140 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26448266 |
tttgtcccaatttatatgtctttttaaaaaaccaatgaaaaattaatgttatttttttctattatatcattaactatttattactccatcttctttcaat |
26448167 |
T |
|
| Q |
141 |
tatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| || ||| | || |||||||||||||| |
|
|
| T |
26448166 |
tctttaatttatctttcacatttcatttattaaggacaattttgtaacacaactcacaatatcttttttccatataaaattaattacatttc |
26448075 |
T |
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Target: chr1; HSP #177
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50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||| || |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| || ||| ||| |
|
|
| T |
6596897 |
aaattatgtgtcgctttacgatactaaagaaacattaatgttaatttttctattatattcttaac-atttattactatctcttctttcgcttctttaatt |
6596995 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaa |
192 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6596996 |
tatctttcccataccatttattaaggacaattttgtaaaacaa |
6597038 |
T |
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Target: chr1; HSP #178
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Target Start/End: Original strand, 17772950 - 17773088
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || |
|
|
| T |
17772950 |
caaattataagtcatttcacaatacaaataaaacattaatgttatttttcttattatacccttaactatttattactctctcatttttcaattttttaat |
17773049 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaa |
187 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17773050 |
ttatctttttcaaatcatttattaagtataattttgtaa |
17773088 |
T |
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Target: chr1; HSP #179
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24583830 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
24583929 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactatt |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24583930 |
attatatccttaactatt |
24583947 |
T |
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Target: chr1; HSP #180
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| Q |
51 |
aattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatta---attactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
20711116 |
aattataaatcattttacaataccaatgaaacattaatattacttttc-tattatactctcaactagtatttattattctctcgtctttcaattatttaa |
20711018 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaact |
194 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20711017 |
tttattttttccataccatttattaaggacaattttgttaaacaact |
20710971 |
T |
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Target Start/End: Complemental strand, 28979803 - 28979683
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aataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaattt |
168 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
28979803 |
aatatcaataaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactgtttattgctctctcttctttcaattctattatttatctttctcatactattt |
28979704 |
T |
|
| Q |
169 |
attaaggataattttgtaaaa |
189 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28979703 |
atcaaggataattttataaaa |
28979683 |
T |
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Target: chr1; HSP #182
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctct |
131 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
38606216 |
ttgtcctaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat-tttaactatttattactctctct |
38606129 |
T |
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| Q |
103 |
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202 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
10758805 |
tatatcattaactatctattactctatcttctttcaattatttcattcatcatttccatatcatttattaaagacgattttgtaaaacaactcataatat |
10758706 |
T |
|
| Q |
203 |
ctcttccccacacaa |
217 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |
|
|
| T |
10758705 |
ttctttcccacacaa |
10758691 |
T |
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Target: chr1; HSP #184
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Target Start/End: Original strand, 25792206 - 25792379
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149 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | || |||||| || ||||||| |
|
|
| T |
25792206 |
aaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttagttatttactaatctctc---------ttgtttcatt |
25792296 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
25792297 |
tatcattcgcatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatcttttttccacacaaaattaattatatttc |
25792379 |
T |
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Target: chr1; HSP #185
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Target Start/End: Complemental strand, 6519761 - 6519634
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| Q |
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tttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaact |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6519761 |
tttcctattatatcatgaactatttattactcttccttctttcaattctttaatttatttttctcatatcatttattaaagataattttgtaaaacaact |
6519662 |
T |
|
| Q |
195 |
cataatttctcttccccacacaatatta |
222 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| | ||||||| |||| |
|
|
| T |
6519661 |
cataatatttctttctcacacaaaatta |
6519634 |
T |
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Target: chr1; HSP #186
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Target Start/End: Original strand, 24583949 - 24584016
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| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24583949 |
atttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttc |
24584016 |
T |
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Target Start/End: Complemental strand, 3281077 - 3280910
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| Q |
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ttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcattta-tcttttccatac |
163 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
3281077 |
ttacaatattaatgaaccattaatactacttttccatttataacattacctatttattaccctctcttctttcaat-atttgatttacttttttccatac |
3280979 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||| | || |||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
3280978 |
tatttattaaggaaaaatttgtaaaataactcataatatctctttctcagacaaaattaattatatttc |
3280910 |
T |
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Target: chr1; HSP #188
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Target Start/End: Complemental strand, 26060731 - 26060619
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50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| | | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| |
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|
| T |
26060731 |
aaattataagtcgttttacaatatcaatgaagcattaatgttatttttcatattacacctttaactatttattactatctcttctttcaattctttaatt |
26060632 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccata |
162 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||| |
|
|
| T |
26060631 |
tatatttcccata |
26060619 |
T |
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Target: chr1; HSP #189
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| Q |
69 |
aataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttt |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
30455424 |
aataccaatgaaatattaatgataattttcttattatatcattaactatatattactttctcttcattcaattatttaatttatctttt |
30455336 |
T |
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| Q |
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acttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgt-aaaac |
190 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| |||| | | | |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36317678 |
acttttcctattataatcttaactatttattattttatattctttcaattatttcattttattttcccatattatttattaaggataattttgtaaaaac |
36317777 |
T |
|
| Q |
191 |
aactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36317778 |
aactcataatatctctt |
36317794 |
T |
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Target: chr1; HSP #191
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54 |
tataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatc |
153 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
52551826 |
tatacgtcgttttacaatatcaatgattcattaatattatttttcttattacatccttaactatttaatactctctcttctttcaattctttcatttatc |
52551727 |
T |
|
| Q |
154 |
ttttccata |
162 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
52551726 |
tttttcata |
52551718 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #192
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| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
41617652 |
caaattataaatcgttttacaataccagtgaaacattaatgttactttttctattatacttttaactatttattactattttttctttcaattctttaat |
41617553 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttt |
156 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
41617552 |
ttatcttt |
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T |
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Target: chr1; HSP #193
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86 |
aatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgt |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||| |||||| ||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1938664 |
aatgttacttttcctattatacccttaactgtttattattctttcttctctcaattttttaatttgatattcccatacaattgattaaggataattttat |
1938763 |
T |
|
| Q |
186 |
aaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
1938764 |
aaaataattcataatttct |
1938782 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #194
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115 |
tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccaca |
214 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | |||| |||| | |
|
|
| T |
9411047 |
tatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttcctatatcatttattaaggacaattttgtaaaataacttataatatatctttcccaaa |
9410948 |
T |
|
| Q |
215 |
caatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
9410947 |
caatattaatt |
9410937 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||| ||| |||| ||||| |||||| | | || || | ||||| ||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
35370340 |
aaattataagtcactttacaacatcagtgaaacattaatattattttttatattaaatccttgattgtttatcattctcttttctttcaattctttaatt |
35370439 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaa |
192 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
35370440 |
tatattttcaataccatttattaaggataattttataaaacaa |
35370482 |
T |
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Target: chr1; HSP #196
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232 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| |
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| T |
36633177 |
tttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatatgaattacatttc |
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T |
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185 |
Q |
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|
||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||||| |
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|
| T |
52551701 |
aatgttatttttcttactacatccttaactattaaatactctatcttctttcaattcttatatttatctttttcatatcatttatcaagaacaattttgt |
52551602 |
T |
|
| Q |
186 |
aaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | | || | | ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
52551601 |
aaaacaacttatagtatttccttctcacacaaaattaattatatttc |
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T |
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232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31181318 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataacatctctttcccacacaaaattaattacatttc |
31181407 |
T |
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || || |||||| ||||||||||| || || |
|
|
| T |
487509 |
caaattataaatcgttttatgataccaatgaaacattaatgtttttttt--tattataaccttaaccatctcttcctctcttttctttcaatttttaaat |
487606 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
487607 |
ttatctttatcgtataatttattaaggaaaattttgtaaaacgtgtcatgatttcttttttccacataaaattaattacatttc |
487690 |
T |
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Target: chr1; HSP #200
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50 |
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149 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| |||| | | |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
3875687 |
aaattataaatcgttttaaaatatccgttaaatattaatattacttttccaattatactattaactatttattactttatcttctttcaattcttttatt |
3875786 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataattt |
202 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
3875787 |
tatctttctcatatcattaatgaaggataattttgtaaaattacttataattt |
3875839 |
T |
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Target: chr1; HSP #201
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147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
9414371 |
caaattataagtcgttttaccatatgaatgaagtattaaatgttatttttcttactatatcatcaactatttattactcttacttctttcaattatttaa |
9414272 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| ||| || | ||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
9414271 |
tttatctcttttataccattaatgatagataattttgtaaaattacttataatttct |
9414215 |
T |
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Target: chr1; HSP #202
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| Q |
144 |
ttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35610577 |
ttcatttatcctttccatatcatttatcaatgacaattttgtaaaacagctcataatatctctttctcacacaatattaattacatttc |
35610665 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 39387508 - 39387669
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42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta---actattaattactctctcttctttca |
138 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||| | | |||||||| |
|
|
| T |
39387508 |
tttgtcccaatttatatgacgctttgcaataccaataaaatattaatgttactttttctattatattcttaatgatgatttattact-tattttctttca |
39387606 |
T |
|
| Q |
139 |
attatttca-tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||| || |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
39387607 |
attatttaattttatctatttcatatcatttactaaggacaattttctaaaacaacccataat |
39387669 |
T |
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64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
163 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| || ||| || |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17633654 |
tttacgatacgaatgaaacattaatgttatattt---attatacccttaactatttatttctgtcttttttttcaattctttaatttatctttttcatac |
17633750 |
T |
|
| Q |
164 |
aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17633751 |
tatttattaatgacacttttgtaaaataactcataat |
17633787 |
T |
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Target: chr1; HSP #205
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
48110897 |
tttgtctcaaattatatgtcgttttacaatatgaatgaaacattaacgttgcatttc-tattatatcattaactatttaatactctatcttctttca--- |
48110802 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48110801 |
------tttatctttcccatatcatttatcaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
48110749 |
T |
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182 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| ||| || |
|
|
| T |
14149400 |
attaatgtcactattcttattatctctttaactatttattaatatctcttctttcaattctttaatttatctttcacatataatttattaattatagttc |
14149301 |
T |
|
| Q |
183 |
tgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14149300 |
t-aaaaaaaactcataatatctctttcccatgcaaaattaattacatttc |
14149252 |
T |
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attaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattt |
182 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| | |||||| ||| ||| |||||| ||| ||| || | |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16689366 |
attaatgctattttttctattgtattcttaactatttattactcttt--tctttctattctttaatttatttttcccacaccaattattaaggacaattt |
16689269 |
T |
|
| Q |
183 |
tgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
16689268 |
tgtaaaacaa-tcataatatctctttcccatacaaaatttattacattt |
16689221 |
T |
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tatatccttaactattaattactctctcttct-ttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatt |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50972898 |
tatatccttaactatttattatatttttttctattcaattctttaatttatctttcacataca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatt |
50972996 |
T |
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119 |
Q |
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|
|||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
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5432400 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaattaaacattaatgttacttttcctattatatctttaattatta |
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T |
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aaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggata |
178 |
Q |
| |
|
|||||| | ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||| || | |
|
|
| T |
9875901 |
aaatataattgtcacttttcttattatatctttaactatttattatcatctctt-tttcaattctttcatttatcttttctatatctattagtaaagaca |
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T |
|
| Q |
179 |
attttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9876000 |
cttttgtaaaacaactcataatatctctt |
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T |
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atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatt |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
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atttattaaggataattttataaaacaactcataatttatctttcccatacaaaattaatt |
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T |
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atgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgta |
186 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| ||||| ||||| |||| | |||| | |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
47945842 |
atgtcactttttctactatatacttaattatttactactttttcttgttttaattctttcatttatcttttttatattatttattaaggacaattttata |
47945941 |
T |
|
| Q |
187 |
aaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| ||| || | ||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
47945942 |
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158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
16966709 |
gtcgctttacaataacaatgaaacattaatattatttttcatattatatctttacatatttattactctcacttct--------tttaatttatctttct |
16966800 |
T |
|
| Q |
159 |
catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16966801 |
catatcatttattaagaacaattttgtaaaataactcataa |
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175 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||| | |
|
|
| T |
25163224 |
atgaaacattaatgttacatttcctattatactcttgactatttattactttct--tctttcaattctttagtttatctttttcctagtatttattaaag |
25163127 |
T |
|
| Q |
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ataattttgtaaaacaact |
194 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25163126 |
actattttgtaaaacaact |
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141 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||| | || || |||| | |||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
15240624 |
ttgttccaaattataaatcactttacagtattaatgaaatattaattttattttttctattataccttttaaatatttaatactctatcttcttttaatt |
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T |
|
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atttcatttatct-tttc------catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
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Q |
| |
|
||| || ||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15240724 |
ctttaatgtatatatttctcatatcatttaatttattaaggataattttgtcaaacaactcataatttttctt |
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| |
|
||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||| |||||||| |||| |
|
|
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25279527 |
ttgtctcaaattataagtcgttttacaatatcaataaagtattaatgttacattttctattatacttttaacaatgtattactccttcttctttgaattc |
25279428 |
T |
|
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tttcatttatcttt |
156 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |
|
|
| T |
25279427 |
tttattttatcttt |
25279414 |
T |
|
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Target: chr1; HSP #217
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| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaa |
189 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| |||| |||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
40332529 |
tattataacattaattatttattactctatcttttttcaattcttttatttatttttttcataccatttaataaggacaattttgtaaaa |
40332618 |
T |
|
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| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| | |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
49927980 |
tttcatttatctttctcatatcgtttattaaagataattttgtaaaacaattgataatatctctttcacacataaaattaattacatttc |
49927891 |
T |
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| Q |
127 |
tctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
10895138 |
tctcttgtttcaattttttaatttatctttctcataccataaatgaaggataattttgtaaaataattcataatttctctt |
10895058 |
T |
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactc |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
35691738 |
aaattataagtcattttacaataccaataaaacattaattttactttttatattatacccttaattatttattactc |
35691662 |
T |
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| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
49324994 |
tttgtctcgaattataagtcgctttacattattgatgaaatattaatattattttt--tattatactcttaactatttattattatctcttctttcaatt |
49325091 |
T |
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| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7038087 |
atttattaaggacaatattgtaaaacaattcttaatatctcttttccatacaatattaattacatttc |
7038020 |
T |
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| Q |
64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattat |
143 |
Q |
| |
|
||||||||| | | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42334575 |
tttacaatatcgacgaagtattaatgttattttttttattatatccttaattatt-attactatctcttctttcaattat |
42334653 |
T |
|
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Target: chr1; HSP #224
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| Q |
189 |
acaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52701881 |
acaactcataatttatctttcccacacaatattaattacatttc |
52701838 |
T |
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| Q |
110 |
ttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcc |
209 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| || ||| |||| ||| |||||| ||||| ||| ||| || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || |
|
|
| T |
3533353 |
ttaactatttattactctcattttttt-aattctttaatttatattttctctaccattaatgaagggtaattttgtaaaattacttataatttctttttt |
3533451 |
T |
|
| Q |
210 |
ccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3533452 |
ccatacaatattaattacatttc |
3533474 |
T |
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Target: chr1; HSP #226
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| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgcttt-ggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgt |
90 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |
|
|
| T |
34022453 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaatttttttgtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgt |
34022363 |
T |
|
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| Q |
64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgtta-cttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| |||||| || | | |||||||||||| || | |
|
|
| T |
48070512 |
tttacaataccaatgaaattttaatgttattttttcatattatgaccttaactatttatta--ctcttttcttttaactttatcatttatctttcgcaca |
48070415 |
T |
|
| Q |
163 |
caatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
| ||| || || |||||||| ||||| |||| ||||| | |||| |||| |||| ||| |||| |||| |
|
|
| T |
48070414 |
ccattaatgtagaataattttataaaataacttataatctttctttcccatacaaaatttattatattt |
48070346 |
T |
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Target: chr1; HSP #228
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| Q |
44 |
tgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctatta |
104 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
6260507 |
tgtctcaaattataagtcgttttacaatatcaatgaatcattaatgctactttttctatta |
6260567 |
T |
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| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaa |
192 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| | |||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
47562541 |
tattatactcttaactatttactactattacttctttcaattctttaatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttataaaacaa |
47562633 |
T |
|
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttt |
97 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13183412 |
aaattataagttgctttacaatactagtgaaatattaatattactttt |
13183365 |
T |
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Target: chr1; HSP #231
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| Q |
59 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatt |
118 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43901428 |
gtcgttttataataccaatgtaatattaatattacttttaatattataaccttaactatt |
43901487 |
T |
|
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Target: chr1; HSP #232
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| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
46288098 |
atttattaaggataattttataaaacaactcataat |
46288133 |
T |
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Target: chr1; HSP #233
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12046182 |
aaattataagttgttttacaataccaataaaacattaatgttatttttcct |
12046232 |
T |
|
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| Q |
147 |
atttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatt |
201 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12967294 |
atttatgttttccataccattaataaaggatatttttgtaaaacaactcacaatt |
12967348 |
T |
|
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Target: chr1; HSP #235
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| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||| ||||||| || | ||||| || || || |
|
|
| T |
13109631 |
caaattataagttgttttacgataccagtgaaatattaatattattttttctattatacatttaaatatttgttactctttcgtttttcagtttattaat |
13109730 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaa |
187 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| | ||||||| || | |||||||| |
|
|
| T |
13109731 |
ttatctttttcatatcagttattaaagacagttttgtaa |
13109769 |
T |
|
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Target: chr1; HSP #236
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| Q |
64 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatt |
118 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
46529980 |
tttataataccaataaaacattaacgttatttttcctattatatcattaactatt |
46530034 |
T |
|
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| Q |
127 |
tctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatta |
226 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| ||||||||||| || ||| || |||||||||| |||| || || |||||||||||||| | || |||| |||||||| |
|
|
| T |
24681041 |
tctcatctttcaattctttaatttatctttttaatgtcattgatgaaggataattgtgtacaataattcataatttctctttctcaaacaaaattaatta |
24681140 |
T |
|
| Q |
227 |
ca |
228 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
24681141 |
ca |
24681142 |
T |
|
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| Q |
127 |
tctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
27327264 |
tctctactttcaatactttaatttatatttctcatacaatttattaaagataattttataaaataattcataat |
27327337 |
T |
|
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| Q |
45 |
gtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
31181264 |
gtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaagcattaacgttccttttc |
31181317 |
T |
|
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| Q |
136 |
tcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaa |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43317253 |
tcaattatttgatttatcttttttataccattaataaaggataattttgtaaaa |
43317306 |
T |
|
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| Q |
159 |
catacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
51797136 |
cataccatttattaaggataattttgtaaaataattcataat |
51797095 |
T |
|
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| Q |
172 |
aaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcccca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12068669 |
aaggataattttgtaaaataacacataatttctctttccca |
12068709 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
147 |
atttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctt |
207 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||| || || ||||||||| | |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26755756 |
atttctctttttcatacaattaatgaaagataattttatgaaacaactgataatttctctt |
26755816 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctat |
102 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27422685 |
aaattatatgtcgttatagaataccaatgcaatattaatgttactttttctat |
27422737 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
53 |
ttataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttat |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || |||||| | ||||||| | ||||| ||| |||| |||| |||| |||||| | |||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
44464173 |
ttataagtcgttttactgtagcaatgagacattaatgcaatttttc-tatcatatatttaattatttattactttatcttctgataattatttaatttat |
44464271 |
T |
|
| Q |
153 |
cttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaa |
189 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
44464272 |
ctttcacataccatttattaagtagaattttgtaaaa |
44464308 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #246
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
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Target Start/End: Complemental strand, 51690961 - 51690909
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224 |
Q |
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|
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51690909 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Description:
Target: scaffold0074; HSP #1
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Q |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaatttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttccct |
17558 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17559 |
attatatccttaactattaattactccatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataatttggtaaaacaactcataat |
17658 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17659 |
ttcacttccccacacaatattaattacatttc |
17690 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 232
Target Start/End: Original strand, 45819 - 45931
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219 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
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45819 |
attactctctcttctttcaattatttcatttatctttcacatattatttattaaggacaattttgtaaaacagctcataatatctcttttccacgtaata |
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T |
|
| Q |
220 |
ttaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |
|
|
| T |
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ttaattgcatttc |
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T |
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Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 45582 - 45706
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgtgttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcct |
45681 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattact |
125 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| |||||| |
|
|
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attataacattaactatttattact |
45706 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0459 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:
Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11777 - 11545
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99 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11777 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcc |
11678 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11677 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataa |
11578 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11577 |
tttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
11545 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0366 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0366
Description:
Target: scaffold0366; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13084 - 12852
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcc |
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T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12984 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataa |
12885 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12884 |
tttctcttccccacgcaatattaattacatttc |
12852 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0366; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 292 - 135
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142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
292 |
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193 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
192 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
135 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0130 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:
Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23158 - 22927
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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23059 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23058 |
attatatccttaactactaattattctctcttgtttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
22959 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22958 |
ttctcttacccacacaatattaattacatttc |
22927 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 8438 - 8668
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
8438 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaa-tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaattttatttttcct |
8536 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8537 |
attatatccttaactattaattattctctcttctttcaattatttcatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
8636 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8637 |
ttctcttccacacacaatattaattacatttc |
8668 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0262 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:
Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 3759 - 3990
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3759 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaaattgttctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
3858 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
3859 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatatcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtataacaactgataat |
3958 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3959 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
3990 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 1243 - 1474
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1243 |
actccctccgtctcaaattgtatgtcgctttcgaaaaaaaaattgtcccaagttatatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
1342 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1343 |
attatatccttaactattgattactctctcttctttcaaatatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
1442 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1443 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
1474 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13914 - 13725
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| Q |
43 |
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142 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
13914 |
ttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaataataatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccccattctttcaatta |
13815 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
13814 |
tttcatttatcttttccatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccctacacaaaattaattatatttc |
13725 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Original strand, 63386 - 63575
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
63386 |
tttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
63485 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
63486 |
ccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacagttttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacattt |
63575 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0189 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:
Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
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Target Start/End: Original strand, 13359 - 13539
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148 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13359 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattata--cttaactattaattactctctcttcttttaattatttcat |
13456 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13457 |
ttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
13539 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0236 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:
Target: scaffold0236; HSP #1
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145 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20318 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttactttttctattatatcctta-ctattaactactctcttttctttcaattattt |
20416 |
T |
|
| Q |
146 |
catttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20417 |
catttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcctcacacaatattaattacatttc |
20503 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0533 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:
Target: scaffold0533; HSP #1
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Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7250 |
ttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcattaactattaattactctctcttctttctatta |
7349 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
7350 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaaatcataatttctcttccccacacagtattaattacatttc |
7439 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
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Target: scaffold0037; HSP #1
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1 |
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100 |
Q |
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| T |
98863 |
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98962 |
T |
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101 |
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200 |
Q |
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| T |
98963 |
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99062 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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| T |
99063 |
atctcttttccacacaatattaattacatttc |
99094 |
T |
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Target: scaffold0172; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 18473 - 18242
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100 |
Q |
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18473 |
actccctccgtcccaaattatatgtcactttggaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcct |
18374 |
T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
18373 |
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18274 |
T |
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| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
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18273 |
atcactttcccacacaatattaattacatttc |
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T |
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Target: scaffold0160 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
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Target: scaffold0160; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 26041 - 25810
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100 |
Q |
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| T |
26041 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcct |
25942 |
T |
|
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
25941 |
attatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
25842 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
25841 |
atctctttcccacacaatattaattacatttc |
25810 |
T |
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Target: scaffold0427 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:
Target: scaffold0427; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 5273 - 5463
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Q |
| |
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T |
|
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232 |
Q |
| |
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| T |
5373 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaatattaattatatttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0239 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:
Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1474 - 1292
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142 |
Q |
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ttgtcccaacttatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
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T |
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| Q |
143 |
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225 |
Q |
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| T |
1374 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaatt |
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T |
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Target: scaffold0239; HSP #2
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Target Start/End: Complemental strand, 15970 - 15789
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Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
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223 |
Q |
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| T |
15870 |
ctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaa |
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T |
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Target: scaffold0018 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 151640 - 151865
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Q |
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| T |
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T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
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| T |
151740 |
tattataaccttaagcatttattactccatcttctttcaattatttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
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T |
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| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
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| T |
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tatctcttttccacacaatattaatt |
151865 |
T |
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Target: scaffold0768 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0768
Description:
Target: scaffold0768; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
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Target Start/End: Complemental strand, 6140 - 5949
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Q |
| |
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tttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattattatctcttctttcaatt |
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T |
|
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atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttc-tcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6040 |
atttcatttatcttttccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttccacacaatattaattgcatttc |
5949 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0330 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0330; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 13939 - 13751
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141 |
Q |
| |
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|
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13939 |
tttgtcctaaattgtatgtcactttacaatacaaatgaaacgttaatgttacttttcctattatatccttaactatt--ttactctttcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13841 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaagcaactcataatatcactttcccacacaatattaattacatttc |
13751 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0983 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0983
Description:
Target: scaffold0983; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 1351 - 1119
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99 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1351 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgcttcacaatatcaatgcaacattaatattacttttcc |
1252 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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| T |
1251 |
tattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatatttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
1152 |
T |
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| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| ||| || | |||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
1151 |
tatcttttttcgacacaatattaattgcatttc |
1119 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0264 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
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Target: scaffold0264; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 18960 - 18728
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99 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18960 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttagggaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtctctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcc |
18861 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
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|
| T |
18860 |
tattataaccttaactatttattactttctcttatttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
18761 |
T |
|
| Q |
200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18760 |
tatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
18728 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1515 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1515
Description:
Target: scaffold1515; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 1450 - 1677
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104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1450 |
cctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttaattttcctatta |
1549 |
T |
|
| Q |
105 |
tatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttct |
204 |
Q |
| |
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||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
| T |
1550 |
tattcttaactatttattactttgtcttctttcaattccttcatttatctttcccatattatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatct |
1649 |
T |
|
| Q |
205 |
cttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
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| T |
1650 |
cttttccacataatattaattacatttc |
1677 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0380 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0380
Description:
Target: scaffold0380; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 16234 - 16052
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149 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16234 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttatctatttattactctcttttctttcaattctttcatt |
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T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16134 |
tatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacacaatattaattgcatttc |
16052 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0154 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:
Target: scaffold0154; HSP #1
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actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6567 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgttttagagaatttttttattccaaattatatgtcgctttataataccaatgcaacattaatgctacttttcct |
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T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
6667 |
attataaccttagctatttattactctctcttatttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttataaaacaactcataat |
6766 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
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| T |
6767 |
atctcttttccacacaatattaattgcattt |
6797 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0154; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4261 - 4029
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99 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4261 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaaattgtttcaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttc |
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T |
|
| Q |
100 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
199 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4161 |
tattatattcttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttgtcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
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T |
|
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200 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| ||| || ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4061 |
tatctattttccacacaatattaattatatttc |
4029 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0060 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 3)
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Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21658 - 21477
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21658 |
aaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattttttactctttcttctttcaattctttcatt |
21559 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21558 |
tattttccccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatttcttttttccacacaatattaattacattt |
21477 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28107 - 27917
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaa---tattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttca |
138 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | | ||||| || ||||| |
|
|
| T |
28107 |
tttgtctcaaattatatgtcgctttataatatcaatgaaacattattaatgttactttttcttttatacttttaactatttagt--tctcttttttttca |
28010 |
T |
|
| Q |
139 |
attatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| | | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28009 |
attctttaatttattttttccctatgatttattaaggacaattttgtaagacaactcataatatctcattctcgtacaaaattaattacattt |
27917 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0060; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 71923 - 71733
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaa---tattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttca |
138 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || || | || ||||| |
|
|
| T |
71923 |
tttgtctcaaattataagtcgctttataatatcaatgaaacattattaatgttactttttcttttatacttttaactatttagta--ctattttttttca |
71826 |
T |
|
| Q |
139 |
attatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
231 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| | | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
71825 |
attctttaatttattttttccctatgatttattaaggacaattttgtaagacaactcataatatctcattctcgtacaaaattaattacattt |
71733 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0789 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:
Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Original strand, 3313 - 3536
Alignment:
| Q |
2 |
ctccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttccta |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3313 |
ctccctccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttaaaataccaatgcaacattaatgatacttttccta |
3412 |
T |
|
| Q |
102 |
ttatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatt |
201 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3413 |
ttataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatttttcccatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaactcataata |
3512 |
T |
|
| Q |
202 |
tctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3513 |
tctattttccacacaatattaatt |
3536 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1335 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1335
Description:
Target: scaffold1335; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1400 - 1218
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
1400 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgtaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttcttccaattctttcatt |
1301 |
T |
|
| Q |
150 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1300 |
tatctttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttc |
1218 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0654 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0654
Description:
Target: scaffold0654; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3068 - 2878
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaata---ttaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttca |
138 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3068 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaataatattaatgctactttttccattataaccttaactatttattactctctcttctttca |
2969 |
T |
|
| Q |
139 |
attatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2968 |
attctttcatttatctttcccatattatttactaaggactattttgtaaaacaactcataatatctctt---cacacaatattaattacatttc |
2878 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0308 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:
Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 20711 - 20897
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20711 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaatattaatgctactttttctattataaccttaactatttattaccctctcttctttcaattc |
20810 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20811 |
tttcagttatctttcccatattatttactaaggacgattttgtaaaacaactcataatatctctt---caaacaatattaattacatttc |
20897 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0734 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0734
Description:
Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Original strand, 6309 - 6499
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6309 |
tttgtctcaatttatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttagctatttattactctcttttctttcaatt |
6408 |
T |
|
| Q |
142 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6409 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatcaattccacacaatattaattgcatttc |
6499 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0027 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:
Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11274 - 11047
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11274 |
actccctccgtcctaaattgtatgtcgttttgaaatttttttttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaatcattaatgttacttttcct |
11175 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11174 |
attatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagtcattcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataat |
11075 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaattaca |
228 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11074 |
atctctttcccacacaaaattaattaca |
11047 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0015 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:
Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 20500 - 20688
Alignment:
| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20500 |
ttgtcctaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaattattaatgttaccttttctattatatcttta-ctatttattactttctcttcttccaattc |
20598 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20599 |
attcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttcccaaacaaaattaattacatttc |
20688 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0007 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:
Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 2925 - 3147
Alignment:
| Q |
1 |
actccctccgtcccaaattgtaagtcgctttggnnnnnnnntttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || || | | ||||||||||||| |
|
|
| T |
2925 |
actccctcagtcccaaattgtacgtcgcttcagggaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccattgcaacaat--tgttacttttcct |
3022 |
T |
|
| Q |
101 |
attatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3023 |
attataaccttaactatttattactctctctcctttcaattctttcgtttatttttcccatattatttattaaggacaattttataaaacaactcataat |
3122 |
T |
|
| Q |
201 |
ttctcttccccacacaatattaatt |
225 |
Q |
| |
|
||| || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3123 |
atctattttgcactcaatattaatt |
3147 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0140 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:
Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18364 - 18172
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgtt-acttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttc-aa |
139 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||| || |
|
|
| T |
18364 |
tttgtctcaaattgtatgtcactttataataccaatgaaatattaatgtttattttttctattatatccttaattatttatttctctttcttttttttaa |
18265 |
T |
|
| Q |
140 |
ttatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18264 |
ttcttttatttatttttcctatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttc |
18172 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0475 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:
Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 232
Target Start/End: Original strand, 5173 - 5329
Alignment:
| Q |
74 |
caatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata-caatttatta |
172 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
5173 |
caataaaacattaacgttacttt-cctattatatccttaactatttattactctttcttctt-caattctttcatttattctttctatatctatttatta |
5270 |
T |
|
| Q |
173 |
aggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5271 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatct-tttcccacacaatattaattacatttc |
5329 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:
Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 213130 - 212979
Alignment:
| Q |
49 |
caaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | |||| |||| |||||||| ||| ||| || |
|
|
| T |
213130 |
caaattatatgtcgctttacaataccaacgaaacattaatgtaacttttcctattataactttaactagttattattctcgcttctttccattctttaat |
213031 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
213030 |
ttatcattctcataccatttattaaggataattttgtaaaataacacataat |
212979 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
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Target Start/End: Complemental strand, 188827 - 188718
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| Q |
43 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
188827 |
ttgtcccaaattatatgtcgatttacaataccaatgcaacattaatattatttttcctattataaccttaactatttattactgtctcttctttcaattc |
188728 |
T |
|
| Q |
143 |
tttcatttat |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
188727 |
tttcatttat |
188718 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0187 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0187
Description:
Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10524 - 10372
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| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatta--attactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |
|
|
| T |
10524 |
aaattataagtagctttacaatatcaataaaatattaatgttactttttctattataatcttagttatctctattactctctcttctatcaattctttaa |
10425 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10424 |
tttatcattctcataccatttattaagggcaattttgtaaaacaactcataat |
10372 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20852 - 20700
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50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatta--attactctctcttctttcaattatttca |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |
|
|
| T |
20852 |
aaattataagtagctttacaatatcaataaaatattaatgttactttttctattataatcttagttatctctattactctctcttctatcaattctttaa |
20753 |
T |
|
| Q |
148 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
200 |
Q |
| |
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|||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20752 |
tttatcattctcataccatttattaagggcaattttgtaaaacaactcataat |
20700 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:
Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 133899 - 134082
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc-ctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcat |
148 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | || | |||| ||||||||| || |||||||| ||| || |
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|
| T |
133899 |
aaattataagtcgttttacaatagcaatgaaatattaatgttatttttttctatcataccatttattatttattactctcactaatttcaattctttaat |
133998 |
T |
|
| Q |
149 |
ttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| || | || |||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
133999 |
ttatctttctcgtacaatttattaaggacaaatttgtaaaataactcataatatctttttctcatacaaaattaattatatttc |
134082 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 124
Target Start/End: Original strand, 524333 - 524415
Alignment:
| Q |
42 |
tttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattac |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
524333 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacaataatgttacttttcctattatatccttaactatttattac |
524415 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0496 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:
Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12756 - 12689
Alignment:
| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12756 |
atttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttc |
12689 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0057 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:
Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 232
Target Start/End: Original strand, 39824 - 40001
Alignment:
| Q |
60 |
tcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttc-----aattatttcatttatct |
154 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||| |||||| | | || ||| |||| ||| |||||||| |
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|
| T |
39824 |
tcgctttataatatcaatgaaacattaatgttattttttctgttatacttttaactatttattacttttttttttttttttttaattctttaatttatct |
39923 |
T |
|
| Q |
155 |
tttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
39924 |
atccaatacaaattattaaggacaattttgtaaaacaattcatagcatctttttaccatacaaaattaattacatttc |
40001 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0268 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:
Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 110
Target Start/End: Original strand, 20383 - 20443
Alignment:
| Q |
50 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcct |
110 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20383 |
aaattatatgttactttacaatatcaatgaaacataaatgttatttttcctattatatcct |
20443 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0024 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:
Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Original strand, 42701 - 42768
Alignment:
| Q |
165 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttc |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || | || |||||||||||||| |
|
|
| T |
42701 |
atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttacatataaaattaattacatttc |
42768 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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