View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4030_high_49 (Length: 245)

Name: NF4030_high_49
Description: NF4030
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4030_high_49
NF4030_high_49
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (1-228)||(6098441-6098676)
chr8 (8-228)||(36694889-36695117)
chr8 (8-228)||(12876148-12876377)
chr8 (2-215)||(43643531-43643752)
chr8 (5-218)||(1204963-1205184)
chr8 (1-218)||(10555137-10555360)
chr8 (1-218)||(37970452-37970677)
chr8 (1-228)||(9864180-9864415)
chr8 (1-218)||(23854364-23854589)
chr8 (1-228)||(30654506-30654741)
chr8 (10-228)||(16446798-16447024)
chr8 (5-228)||(13307659-13307889)
chr8 (5-228)||(16222899-16223130)
chr8 (1-224)||(31933813-31934044)
chr8 (29-228)||(1149555-1149762)
chr8 (5-228)||(27082761-27082992)
chr8 (1-228)||(8803740-8803968)
chr8 (93-228)||(4132609-4132743)
chr8 (5-228)||(40862455-40862686)
chr8 (1-228)||(11727056-11727291)
chr8 (8-228)||(5299869-5300097)
chr8 (93-228)||(7890880-7891015)
chr8 (5-228)||(465878-466099)
chr8 (1-228)||(38644010-38644245)
chr8 (8-226)||(34895006-34895227)
chr8 (93-228)||(33906344-33906479)
chr8 (93-220)||(41910919-41911046)
chr8 (1-166)||(1150090-1150263)
chr8 (93-228)||(43025834-43025969)
chr8 (93-228)||(1953911-1954047)
chr8 (93-218)||(35459644-35459769)
chr8 (93-228)||(39099042-39099177)
chr8 (1-98)||(41362550-41362644)
chr8 (157-228)||(1149843-1149910)
chr8 (5-98)||(34952092-34952185)
chr8 (1-92)||(4133077-4133166)
chr8 (1-228)||(44869528-44869764)
chr8 (187-228)||(35859160-35859201)
chr8 (161-228)||(7998478-7998545)
chr8 (111-176)||(18259233-18259298)
chr8 (196-228)||(34951980-34952012)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (1-226)||(15752058-15752291)
chr1 (1-228)||(238425-238659)
chr1 (1-217)||(42721068-42721292)
chr1 (1-218)||(10922756-10922981)
chr1 (1-224)||(10181924-10182155)
chr1 (5-228)||(32216088-32216319)
chr1 (5-172)||(1547320-1547487)
chr1 (1-228)||(9902966-9903201)
chr1 (1-228)||(18422680-18422915)
chr1 (1-228)||(27563817-27564052)
chr1 (5-228)||(38823247-38823478)
chr1 (1-228)||(27267112-27267344)
chr1 (1-224)||(41926192-41926417)
chr1 (1-228)||(19899681-19899916)
chr1 (1-224)||(32267063-32267294)
chr1 (1-228)||(37451315-37451549)
chr1 (1-228)||(51128888-51129123)
chr1 (1-228)||(47682406-47682640)
chr1 (8-228)||(2959784-2960012)
chr1 (5-228)||(16415678-16415910)
chr1 (1-228)||(15382962-15383197)
chr1 (1-228)||(23999376-23999611)
chr1 (5-228)||(27532893-27533123)
chr1 (1-228)||(30326864-30327099)
chr1 (1-224)||(47279218-47279449)
chr1 (93-228)||(8222257-8222392)
chr1 (52-228)||(27227397-27227581)
chr1 (1-228)||(28564695-28564928)
chr1 (1-228)||(30254453-30254687)
chr1 (7-226)||(48620672-48620890)
chr1 (95-228)||(4330412-4330545)
chr1 (7-228)||(3534967-3535187)
chr1 (1-228)||(7078975-7079221)
chr1 (93-228)||(15168225-15168360)
chr1 (93-228)||(22170840-22170975)
chr1 (8-228)||(34012294-34012517)
chr1 (1-228)||(46931440-46931673)
chr1 (1-228)||(27763223-27763457)
chr1 (55-228)||(25160715-25160896)
chr1 (1-228)||(28769682-28769917)
chr1 (93-228)||(33725512-33725647)
chr1 (5-221)||(40884846-40885070)
chr1 (5-228)||(14758074-14758296)
chr1 (1-228)||(37618813-37619043)
chr1 (8-228)||(39393419-39393648)
chr1 (93-216)||(38759662-38759785)
chr1 (5-228)||(3309181-3309417)
chr1 (157-228)||(1359847-1359918)
chr1 (26-98)||(21289726-21289798)
chr1 (5-153)||(11742338-11742493)
chr1 (7-214)||(31621480-31621694)
chr1 (152-228)||(48353731-48353806)
chr1 (8-107)||(1359924-1360022)
chr1 (196-228)||(21289832-21289864)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (5-228)||(7703554-7703777)
chr4 (1-224)||(47253782-47254004)
chr4 (8-228)||(17173330-17173558)
chr4 (1-228)||(36493632-36493866)
chr4 (2-215)||(25184147-25184368)
chr4 (8-228)||(17167753-17167981)
chr4 (5-228)||(35020978-35021209)
chr4 (1-228)||(25700999-25701235)
chr4 (1-228)||(50697275-50697510)
chr4 (5-228)||(4934145-4934375)
chr4 (1-228)||(55477834-55478073)
chr4 (1-218)||(879501-879726)
chr4 (5-228)||(35025539-35025762)
chr4 (5-228)||(30002584-30002798)
chr4 (1-228)||(37663684-37663917)
chr4 (1-228)||(19089396-19089631)
chr4 (1-228)||(19440591-19440826)
chr4 (5-228)||(28002929-28003160)
chr4 (7-228)||(55241048-55241276)
chr4 (1-228)||(37287767-37287996)
chr4 (1-228)||(34361435-34361669)
chr4 (5-224)||(38011891-38012118)
chr4 (1-180)||(9139280-9139465)
chr4 (93-228)||(33341531-33341666)
chr4 (8-228)||(46888101-46888328)
chr4 (1-228)||(6864068-6864303)
chr4 (1-228)||(42199762-42199997)
chr4 (10-228)||(23761114-23761339)
chr4 (93-228)||(1815434-1815569)
chr4 (1-172)||(37775702-37775879)
chr4 (5-228)||(27396653-27396884)
chr4 (1-228)||(32912523-32912758)
chr4 (93-228)||(3042752-3042887)
chr4 (1-172)||(32592126-32592305)
chr4 (9-228)||(34948038-34948267)
chr4 (5-166)||(39397955-39398115)
chr4 (5-228)||(49376004-49376235)
chr4 (5-224)||(5047913-5048139)
chr4 (93-228)||(32579579-32579714)
chr4 (5-228)||(4598030-4598250)
chr4 (157-228)||(33816459-33816530)
chr4 (1-98)||(50764765-50764860)
chr4 (5-218)||(29584153-29584372)
chr4 (1-80)||(3042644-3042723)
chr4 (93-218)||(17272097-17272222)
chr4 (156-228)||(7152147-7152219)
chr4 (5-228)||(54499181-54499413)
chr4 (1-48)||(53124320-53124367)
chr4 (8-73)||(4205156-4205221)
chr4 (196-228)||(4205220-4205252)
chr4 (196-228)||(9139465-9139497)
chr4 (196-228)||(39400244-39400276)
chr4 (1-48)||(4396359-4396406)
chr4 (9-80)||(23518402-23518473)
chr4 (95-168)||(33816536-33816609)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (57-228)||(46481047-46481218)
chr7 (1-228)||(38258553-38258788)
chr7 (1-218)||(18797337-18797560)
chr7 (1-228)||(32820971-32821206)
chr7 (1-228)||(30055535-30055770)
chr7 (1-228)||(37347030-37347264)
chr7 (2-228)||(9355744-9355978)
chr7 (5-228)||(23111202-23111435)
chr7 (1-217)||(11071214-11071438)
chr7 (5-228)||(21991648-21991879)
chr7 (54-228)||(37703416-37703590)
chr7 (1-228)||(37109880-37110117)
chr7 (1-228)||(27283752-27283987)
chr7 (1-228)||(43686049-43686283)
chr7 (5-227)||(4582931-4583161)
chr7 (7-228)||(5657399-5657628)
chr7 (8-224)||(10481619-10481844)
chr7 (1-228)||(17842502-17842739)
chr7 (93-228)||(15612677-15612812)
chr7 (29-228)||(32432488-32432695)
chr7 (93-227)||(41764997-41765131)
chr7 (5-228)||(48928482-48928712)
chr7 (62-228)||(44598735-44598909)
chr7 (1-218)||(7334802-7335026)
chr7 (95-215)||(37704267-37704387)
chr7 (93-228)||(15672680-15672815)
chr7 (1-213)||(27421313-27421532)
chr7 (1-228)||(24211749-24211984)
chr7 (1-130)||(38053494-38053623)
chr7 (5-227)||(48928216-48928445)
chr7 (8-177)||(22687254-22687431)
chr7 (1-228)||(31578982-31579222)
chr7 (9-228)||(8861301-8861528)
chr7 (7-228)||(6546533-6546762)
chr7 (1-228)||(43925114-43925344)
chr7 (1-228)||(31520659-31520876)
chr7 (93-228)||(10359132-10359268)
chr7 (1-154)||(12390622-12390783)
chr7 (93-228)||(25691462-25691597)
chr7 (5-228)||(12165764-12165986)
chr7 (8-174)||(44413351-44413525)
chr7 (5-98)||(29173552-29173645)
chr7 (10-228)||(33688180-33688406)
chr7 (5-154)||(26980335-26980492)
chr7 (161-228)||(29173699-29173765)
chr7 (7-66)||(44598378-44598437)
chr7 (5-98)||(26524383-26524476)
chr7 (111-204)||(26588026-26588119)
chr7 (183-228)||(44411458-44411503)
chr7 (161-225)||(32593127-32593191)
chr7 (140-228)||(35353263-35353351)
chr7 (161-228)||(26980482-26980549)
chr7 (161-224)||(38053637-38053700)
chr7 (190-228)||(37704387-37704425)
chr7 (183-228)||(12390567-12390612)
chr7 (10-74)||(34362228-34362292)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (5-228)||(22980830-22981061)
chr5 (8-228)||(699190-699418)
chr5 (1-228)||(5829930-5830160)
chr5 (5-228)||(27318394-27318625)
chr5 (1-228)||(35826393-35826625)
chr5 (5-228)||(36866799-36867030)
chr5 (1-224)||(12910383-12910619)
chr5 (1-228)||(7208771-7209005)
chr5 (1-224)||(14919439-14919670)
chr5 (1-228)||(31705519-31705753)
chr5 (1-228)||(31786553-31786788)
chr5 (1-218)||(22973999-22974224)
chr5 (5-228)||(36860460-36860692)
chr5 (1-228)||(21088673-21088907)
chr5 (26-228)||(23954697-23954907)
chr5 (5-224)||(30969235-30969462)
chr5 (5-226)||(5837592-5837821)
chr5 (1-228)||(22255214-22255450)
chr5 (8-228)||(23116129-23116357)
chr5 (1-228)||(17157938-17158172)
chr5 (5-228)||(19119896-19120127)
chr5 (5-228)||(40133422-40133653)
chr5 (5-228)||(33908270-33908501)
chr5 (1-98)||(5112358-5112455)
chr5 (93-228)||(35504498-35504633)
chr5 (10-172)||(39572861-39573031)
chr5 (7-172)||(28416490-28416663)
chr5 (2-154)||(1429126-1429286)
chr5 (93-228)||(25500833-25500968)
chr5 (8-228)||(32563189-32563408)
chr5 (8-228)||(35511389-35511612)
chr5 (8-228)||(38528144-38528371)
chr5 (5-228)||(26268111-26268342)
chr5 (1-228)||(8436999-8437233)
chr5 (1-154)||(24886137-24886298)
chr5 (93-228)||(13956269-13956404)
chr5 (52-228)||(15992447-15992631)
chr5 (5-228)||(9200270-9200492)
chr5 (1-224)||(15724523-15724752)
chr5 (38-219)||(6824396-6824586)
chr5 (5-228)||(7693267-7693489)
chr5 (5-228)||(22019669-22019891)
chr5 (5-218)||(27330343-27330562)
chr5 (10-228)||(42342775-42342989)
chr5 (5-228)||(8741792-8742025)
chr5 (93-224)||(35934028-35934160)
chr5 (161-228)||(1429069-1429136)
chr5 (109-228)||(2888352-2888471)
chr5 (5-154)||(8466782-8466938)
chr5 (5-98)||(25668687-25668779)
chr5 (93-152)||(14409310-14409369)
chr5 (174-224)||(25889584-25889634)
chr5 (183-224)||(24886310-24886351)
chr5 (183-228)||(25669799-25669844)
chr5 (184-228)||(14409248-14409292)
chr5 (39-98)||(11898073-11898132)
chr5 (1-48)||(26317779-26317826)
chr5 (1-177)||(43308610-43308793)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (5-228)||(46297679-46297910)
chr3 (1-228)||(26941177-26941412)
chr3 (1-228)||(34132959-34133194)
chr3 (5-228)||(25579767-25579998)
chr3 (1-228)||(40552176-40552411)
chr3 (1-224)||(24488883-24489114)
chr3 (5-218)||(48354969-48355190)
chr3 (1-228)||(7327399-7327635)
chr3 (1-228)||(37203091-37203327)
chr3 (1-228)||(3655119-3655354)
chr3 (1-228)||(3362277-3362514)
chr3 (1-218)||(4761575-4761801)
chr3 (1-228)||(37157732-37157967)
chr3 (1-228)||(47481546-47481781)
chr3 (14-228)||(42505992-42506214)
chr3 (93-228)||(53229069-53229204)
chr3 (1-228)||(45174527-45174765)
chr3 (8-228)||(2007964-2008191)
chr3 (38-226)||(11466885-11467081)
chr3 (5-224)||(35844354-35844581)
chr3 (93-228)||(52040839-52040974)
chr3 (5-228)||(29099383-29099605)
chr3 (1-228)||(22445982-22446216)
chr3 (93-228)||(22622635-22622770)
chr3 (93-228)||(33698277-33698412)
chr3 (95-228)||(44891623-44891756)
chr3 (7-228)||(33378702-33378931)
chr3 (93-224)||(39282776-39282907)
chr3 (93-228)||(24708032-24708169)
chr3 (1-171)||(51212955-51213133)
chr3 (1-228)||(54505832-54506066)
chr3 (8-225)||(4015491-4015715)
chr3 (93-228)||(32373594-32373729)
chr3 (93-228)||(43348381-43348516)
chr3 (1-228)||(21009719-21009954)
chr3 (1-154)||(44186492-44186653)
chr3 (5-228)||(11357298-11357513)
chr3 (95-228)||(1089819-1089953)
chr3 (1-224)||(54828622-54828852)
chr3 (5-218)||(21193634-21193856)
chr3 (60-218)||(46994588-46994754)
chr3 (1-154)||(27480370-27480531)
chr3 (93-228)||(38591822-38591957)
chr3 (160-228)||(20373161-20373229)
chr3 (93-228)||(29163942-29164068)
chr3 (5-224)||(22450996-22451223)
chr3 (1-98)||(20373351-20373448)
chr3 (93-172)||(14586643-14586722)
chr3 (93-223)||(53176178-53176308)
chr3 (95-210)||(11835562-11835678)
chr3 (161-228)||(40936165-40936232)
chr3 (8-172)||(43975861-43976033)
chr3 (93-228)||(36012261-36012398)
chr3 (5-97)||(40936019-40936111)
chr3 (157-228)||(11357067-11357138)
chr3 (183-218)||(51212698-51212733)
chr3 (161-228)||(27480279-27480350)
chr3 (183-228)||(44186434-44186479)
chr3 (196-228)||(14586596-14586628)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (7-228)||(2325313-2325534)
chr2 (1-228)||(29242073-29242308)
chr2 (36-228)||(4763699-4763899)
chr2 (1-228)||(37905741-37905978)
chr2 (1-228)||(33550922-33551156)
chr2 (5-228)||(4166959-4167190)
chr2 (93-228)||(17071672-17071807)
chr2 (8-224)||(3176979-3177203)
chr2 (93-228)||(41960973-41961108)
chr2 (5-228)||(33709167-33709398)
chr2 (1-228)||(43648180-43648415)
chr2 (1-218)||(19289268-19289493)
chr2 (7-228)||(44913700-44913932)
chr2 (93-228)||(17054031-17054166)
chr2 (5-228)||(31570669-31570900)
chr2 (1-228)||(41463785-41464020)
chr2 (5-224)||(4264015-4264243)
chr2 (1-228)||(4478402-4478633)
chr2 (93-228)||(44286082-44286217)
chr2 (93-228)||(45327853-45327988)
chr2 (1-228)||(35958942-35959164)
chr2 (1-224)||(43770787-43771009)
chr2 (93-214)||(31861985-31862106)
chr2 (5-213)||(33902105-33902319)
chr2 (93-228)||(41465634-41465769)
chr2 (5-218)||(19424573-19424794)
chr2 (8-228)||(26357617-26357845)
chr2 (1-172)||(27349930-27350108)
chr2 (52-228)||(36642070-36642256)
chr2 (1-228)||(11366316-11366551)
chr2 (101-228)||(18258222-18258349)
chr2 (1-228)||(39167304-39167533)
chr2 (10-171)||(33660360-33660529)
chr2 (161-228)||(7006873-7006940)
chr2 (93-228)||(18494216-18494350)
chr2 (5-228)||(19313889-19314112)
chr2 (5-228)||(13711501-13711727)
chr2 (38-98)||(5881609-5881669)
chr2 (1-75)||(17054192-17054266)
chr2 (157-228)||(19500850-19500921)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (5-228)||(171-402)
scaffold0002 (93-228)||(408346-408481)
scaffold0002 (8-194)||(94334-94528)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (5-228)||(3879855-3880086)
chr6 (1-228)||(21017028-21017263)
chr6 (1-228)||(1945867-1946102)
chr6 (1-227)||(4318739-4318974)
chr6 (1-228)||(5627424-5627659)
chr6 (1-228)||(6091098-6091333)
chr6 (1-219)||(7055140-7055366)
chr6 (6-228)||(7234951-7235180)
chr6 (8-228)||(29182203-29182432)
chr6 (5-228)||(8513270-8513496)
chr6 (7-228)||(15491654-15491883)
chr6 (93-228)||(20768217-20768350)
chr6 (93-228)||(30353274-30353409)
chr6 (5-98)||(6088945-6089038)
chr6 (1-172)||(33892975-33893153)
chr6 (158-228)||(6089101-6089171)
chr6 (5-98)||(18498470-18498564)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (1-228)||(7920-8155)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-228)||(145933-146168)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (1-228)||(43990-44224)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-228)||(154563-154797)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (16-228)||(267331-267553)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (93-228)||(12042-12177)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (183-227)||(100950-100994)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6098676 - 6098441
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatc------ 94  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          
6098676 tttttggtgaagttaatactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcgtcaat 6098577  T
95 --atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
      ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||  || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
6098576 tcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 6098477  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
6098476 atcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 6098441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36695117 - 36694889
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------g 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||        |    
36695117 tgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcag 36695018  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    | ||| || | |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||    
36695017 actaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 36694918  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
36694917 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 36694889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 12876148 - 12876377
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat--------cag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||        |||    
12876148 tgaagttaacactataatataaaaaatgttgtgagtaacacccaactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcag 12876247  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacactt-aagataattacataatatcattaac 198  Q
    ||||| ||   |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    
12876248 attaagaaggatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaac 12876347  T
199 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
12876348 tctgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 12876377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43643752 - 43643531
Alignment:
2 ttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--- 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||       
43643752 ttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaatgacatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaact 43643653  T
99 -----gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatca 193  Q
         ||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |    
43643652 catcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatta 43643553  T
194 ttaactctgtttgcatgttaaa 215  Q
    | ||||||||||||||||||||    
43643552 tcaactctgtttgcatgttaaa 43643531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 1204963 - 1205184
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag----- 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||         
1204963 tggtgaagttaacactataacataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 1205062  T
100 ---attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
       |||||||| | |||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |    
1205063 catattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatca 1205162  T
197 actctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||    
1205163 actctgtttgcatgttaaagat 1205184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10555360 - 10555137
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatc------ 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||          
10555360 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaat 10555261  T
95 --atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
      ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || |||||| ||||| |||||||  |||||||||  ||  || ||||||||||    
10555260 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgcaacacctcacaaaacgtaacactt--gactatcacataatatc 10555163  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    || |||| ||||||||||||||||||    
10555162 atcaactttgtttgcatgttaaagat 10555137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37970677 - 37970452
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||||||||      
37970677 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgccatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 37970578  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || |||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
37970577 tcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 37970478  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
37970477 atcaactctgtttgcatgttaaagat 37970452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 9864180 - 9864415
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||      
9864180 tttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaat 9864279  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          || ||| || | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
9864280 tcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 9864379  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||||||||    
9864380 atcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgata 9864415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23854589 - 23854364
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatc--- 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||       
23854589 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacacccaactgtttgtgcaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaac 23854490  T
98 -----agattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
         |||||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||| |  || |||| |||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
23854489 tcattagattaacaatactacaattaatctaattttatcttacctagttataagtgtaacaccgcataaagtgtaacacttaagacaatcacataatatc 23854390  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    || ||||||| |||||||||||||||    
23854389 atcaactctgcttgcatgttaaagat 23854364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30654741 - 30654506
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | |||||||||  | ||||||||||| ||||  |  |||||||||||||      
30654741 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgttgaatgacatcaaaagttcagccttcatagtatcatcact 30654642  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          | ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
30654641 tcatcaggttaacaagactacacttaatttaattttaccatacattgttttaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 30654542  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||    
30654541 ataaactctatttgcatgttaaaaatttcaacgata 30654506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16447024 - 16446798
Alignment:
10 aagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------gat 101  Q
    ||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||| | |||||||||| | || |||||||| || | |||||||| ||||||||        |||    
16447024 aagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtataatggcatcaaaagtttagtccccatactatcatcaattcatcagat 16446925  T
102 taacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactct 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||| |||||||  ||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| || |||    
16446924 taacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatct 16446825  T
202 gtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
16446824 gtttgcatgttaaagatgccaatgata 16446798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 13307659 - 13307889
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtat--------cat 96  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||        |||    
13307659 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactatttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcat 13307758  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||  |    
13307759 cagattagcaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaaca 13307858  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
13307859 actctgtttgcatgttaaa-atgtcaacgata 13307889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 16222899 - 16223130
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   | | || ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||          
16222899 tggtgaatttaacactataacataaaaaatatagtgagtagttccccacagtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcat 16222998  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
      ||||||||| |||||||||||| ||||||||| || | || |||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||  || |||||||||||| |    
16222999 ccgattaacaagactacacttaatctaattttatccttccttgttttaaacgtaacaccccaaaaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcatca 16223098  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
16223099 actttgtttgcattttaaagattccaatgata 16223130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31934044 - 31933813
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||   ||||||||||||      
31934044 tttttggtgaagttaacactatgatatcaaaaatataatgagtaacaccccactctttatacaatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcatcaat 31933945  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
31933944 tcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcataataccgcacaaagtgtaacacttaaaattatcacataatatc 31933845  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    || || |||||||||||||||| ||| |||||    
31933844 atcaagtctgtttgcatgttaaggattccaac 31933813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1149762 - 1149555
Alignment:
29 aaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------gattaacaaaactacacttaat 120  Q
    |||||| || |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||    
1149762 aaaaatgtaatgagtaacaacccactgtttgtacaatgacatcaaaagttctgtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaat 1149663  T
121 ttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgc 220  Q
     |||||||||  ||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |    
1149662 ctaattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactttgtttgcatgttaaagattc 1149563  T
221 caacgata 228  Q
    ||||||||    
1149562 caacgata 1149555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27082992 - 27082761
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag----- 99  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||| |||||||||||||          
27082992 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccccactgtttgtgcagtggcattaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcat 27082893  T
100 ---attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
       |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||  | |||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||  || |||||||||||| |    
27082892 caaattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccatgttttaagtctaacaccccgcaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataa 27082793  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
27082792 actatgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 27082761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8803968 - 8803740
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccc-catagtatcatcag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||  |   |||    | |||||    
8803968 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagcctatcatcaatttatcag 8803869  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||||||||||   | |||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||||    
8803868 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctaaaaagtgtaacacttaatactatcacataatatcatcaact 8803769  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||    
8803768 ctatttgcatgttaaagattccaacgata 8803740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4132743 - 4132609
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||    
4132743 tcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttt-aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacataagactatcacataatatc 4132645  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
4132644 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgata 4132609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 40862455 - 40862686
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatat-aaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcagatt- 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||| || | || |||||||||  ||     
40862455 tggtgaagttaacactataatatcaaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtctc-atggtatcatcaatttt 40862553  T
103 -------aacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatt 195  Q
           ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || || |||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||     
40862554 tcatactaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttctaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatc 40862653  T
196 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
40862654 aactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgata 40862686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 11727056 - 11727291
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| | | || |||||||| | ||| |||||| |||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||      
11727056 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttgtatagtggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaat 11727155  T
100 -------attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
           |||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
11727156 tcatcaaattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacatgatatc 11727255  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |  |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
11727256 aacaactttgtttgaatgttaaagatgccaacgata 11727291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5300097 - 5299869
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------g 99  Q
    ||||||||||||||||  || |||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||        |    
5300097 tgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtaagtagcactctactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccttatagtatcatcaattcatcag 5299998  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||| | || || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || | || ||||||  || |    
5299997 attaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagattatcaaatgatatcagcaatt 5299898  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||    
5299897 ttgtttgcatgttaaagataacaacgata 5299869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7891015 - 7890880
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||  ||| || || ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
7891015 tcatcagattaacaagactacactcaatctagttttatcttactttgttataagcgtaacaccccacaacgtgtaacacttaagattatcacataatatc 7890916  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
7890915 atcaactctggttgcatgttaaagattccaacgata 7890880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 465878 - 466099
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||          
465878 tggtgaagttaacacgataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaaattcagtccccttagtatcatcaattcat 465977  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
      ||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||| |         |||| |||||  |    
465978 cagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------cata-tatcagca 466067  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
466068 actctgtttgcatgttaaagatgccaatgata 466099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 38644010 - 38644245
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||| |||| || ||||||||||||        
38644010 tttttggtcaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtctagtggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaat 38644109  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||  || | || |||||    
38644110 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccataaagtgtaacactcaagactatcatatgatatc 38644209  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
38644210 agcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgata 38644245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 34895006 - 34895227
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcatcag 99  Q
    ||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||  |||| ||        |||||||    
34895006 tgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcag 34895105  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| | || || ||| ||| |||||||  |||||| ||||||||     |  || |||||||||||| || |    
34895106 attaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaat 34895200  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacga 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
34895201 ctgtttgcatgttaaagatgccaacga 34895227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 33906344 - 33906479
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||| || ||||||| ||||||   || ||||||||||||||||||  ||  |||||||||    
33906344 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaagggtaacattccaaaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatc 33906443  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
33906444 atcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 33906479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41911046 - 41910919
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  || |||| |||||    
41911046 tcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaatactatcacatgatatc 41910947  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgc 220  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
41910946 accaactctgtttgcatgttaaagatgc 41910919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1150263 - 1150090
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||| || |||||||||  | ||||||||||||  |||||||||| |||| ||  |||||||||||||      
1150263 tttttggtgaagttaacgctataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccactgtttgtacaacgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaac 1150164  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgt 166  Q
          ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||||||||  ||||||||||    
1150163 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgt 1150090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 43025834 - 43025969
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||||||| ||| || | |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||  |||||| |||||||||||| |  || ||||||||||    
43025834 tcatcagactaagaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaactgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaactatcacataatatc 43025933  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
43025934 atcaactctgattgcatgttaaagatgtcaacgata 43025969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1954047 - 1953911
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaaca-catcacaaagtgtaacacttaagataattacataatat 191  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||  ||| || ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||  || |||||| ||    
1954047 tcatcagattaatatgactacactaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacat 1953948  T
192 cattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
1953947 catcaactctgtttgcatgttaaagttgtcaacgata 1953911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35459769 - 35459644
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || |||  ||||||   |||| | | ||||||||||||  |||||||||||||    
35459769 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctactttgttataaatgtaacatcccacagattataacacttaagactattacataatatc 35459670  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    || || |||||||| |||||||||||    
35459669 atcaattctgtttgtatgttaaagat 35459644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39099177 - 39099042
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||  | ||||||| ||||||   |||||||| | ||||||||||  ||  ||| |||||    
39099177 tcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcttaccctgttttaagtgtaacatcccacaaagtatcacacttaagactatcgcatgatatc 39099078  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
39099077 agcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgata 39099042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 41362550 - 41362644
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca 98  Q
    |||||||||||||||||||||  |||   ||||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||  || |||||||||||||    
41362550 tttttggtgaagttaacactagcata---aaaatgtagtgagtaacaccccactatttgtatagtgacatcaaaagttcagacctcatagtatcatca 41362644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1149910 - 1149843
Alignment:
157 cacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
1149910 cacaaagtgtaacacttaaga----cacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgata 1149843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 34952185 - 34952092
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca 98  Q
    |||| ||||||||||||||  || |||| | | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
34952185 tggtcaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacagcccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccctttagtatcatca 34952092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 4133166 - 4133077
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta 92  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||    
4133166 tttttggtgaagttaacactagcata--aaaaagatagtgagtaatacctgactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagta 4133077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 44869528 - 44869764
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatata--gtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| |||   |||||| |  | | |||||||| ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
44869528 tttttggtgaagttaacactataacattaaaagtattttgtgagtgatcccc-actgtttgcacaatgacatcaaaagttcaatcgtcatagtatcatca 44869626  T
99 --------gattaacaaaactacacttaatttaatttt-attctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataat 189  Q
            ||||||||| | |||||||||| ||||||| || |||| || ||||||| ||    |  |||||||||||||||||||||  || | || ||    
44869627 atttatcagattaacaataatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgttgtccc-cacaaagtgtaacacttaagactatcaaatgat 44869725  T
190 atcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
44869726 atcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacgata 44869764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 35859160 - 35859201
Alignment:
187 aatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
35859160 aatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 35859201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 228
Target Start/End: Original strand, 7998478 - 7998545
Alignment:
161 aagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
7998478 aagtgtaacacttaatactatcacataatatcaacaactctgtttctatattaaagatgccaacgata 7998545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 176
Target Start/End: Original strand, 18259233 - 18259298
Alignment:
111 tacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaag 176  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||||    
18259233 tacatttaatttaattttatcataccttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacctaag 18259298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34952012 - 34951980
Alignment:
196 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
34952012 aactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 34951980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 15752058 - 15752291
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||| |||| ||| |||||||||||        
15752058 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatatagtgagtaacacctcactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 15752157  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||  || ||||||||||    
15752158 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccataaagtgtaacacttaagagtatcacataatatc 15752257  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacga 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
15752258 attaactctgtttgcatgttaaaaattccaacga 15752291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 238659 - 238425
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatca----- 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||         
238659 tttttggtgaagttaacactatagtattaaaaatgttgtgagtaaca-tccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaat 238561  T
96 ---tcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
       ||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
238560 taatcagactaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 238461  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
238460 atcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgata 238425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 42721068 - 42721292
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta-------- 92  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||            
42721068 tttttggtgaagttagccctatatcataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtaacatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaat 42721167  T
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||||| || || |||||||    
42721168 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtataacacttaagattatcacgtaatatc 42721267  T
193 attaactctgtttgcatgttaaaga 217  Q
    || |||| |||||||||||||||||    
42721268 atcaactttgtttgcatgttaaaga 42721292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 10922756 - 10922981
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||        
10922756 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaagaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaac 10922855  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||||||||||| |||||||||||| | |||||||  ||| || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||    
10922856 tcatcagattaacaagactacacttaatcttattttatcataccttgttataagggtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactgtcacataatatc 10922955  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
10922956 atcaactctgtttgcatgttaaagat 10922981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10182155 - 10181924
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatc------ 94  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||          
10182155 tttttggtgaagttaaaactgtaacataaaaaatatagtgcgtaacacgccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaat 10182056  T
95 --atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
      ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
10182055 tcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 10181956  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||| ||||    
10181955 atcaactctggttgtatgttaaagatgacaac 10181924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 32216088 - 32216319
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||| |||| ||| | |||||||||||          
32216088 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcgtcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcat 32216187  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
      |||||||||||||| |||||||  |||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |    
32216188 tagattaacaaaactaaacttaatcaaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataa 32216287  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
32216288 actctgtttgcatgttaaagattccaacgata 32216319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 172
Target Start/End: Original strand, 1547320 - 1547487
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcagattaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||    
1547320 tggtgaagttaacactataacataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcagattaa 1547419  T
105 caaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacact 172  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
1547420 caaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 1547487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9903201 - 9902966
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag- 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||      
9903201 tttttgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacaccccgctgtttgtacagtgacatcaaaagttcaatccacatactatcatcaat 9903102  T
100 -------attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
           |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||| ||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||    
9903101 tcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttacattgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatc 9903002  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || || | ||||||||||||||||||| ||||||||    
9903001 atcaaatttgtttgcatgttaaagatgacaacgata 9902966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18422680 - 18422915
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| ||||||        
18422680 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataacgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaat 18422779  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || || || |||||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
18422780 tcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttatatgcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 18422879  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || | ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
18422880 atcacctccgtttgcatgttaaagattccaacgata 18422915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27564052 - 27563817
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtat------- 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | || ||| |||           
27564052 tttttagtgaagttaacactataactttaaaaatatagtgagtaacactccactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagttccgataatattatcaat 27563953  T
94 -catcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||  ||| ||  ||||||| | |||||||||||  || | ||||| ||    
27563952 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtataataccccacaaagaggaacacttaagactatcatataatttc 27563853  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
27563852 atcaactctgtttgcatgttaaagatgcaaacgata 27563817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 38823247 - 38823478
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat-------- 96  Q
    |||| ||||||||||||||  || |||| | | | ||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||            
38823247 tggttaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtgtcatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcat 38823346  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||  || |||| ||||||  |    
38823347 cagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaagtgtaacacccaacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagca 38823446  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
38823447 actctgtttgcatgttagagatgccaacgata 38823478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27267344 - 27267112
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||| || ||||||||||||||      
27267344 tttttggtgaagttaacactagcata--aaaaatgtagtgagtgacaccccactgtttgtacagtggcattaaaagttcagtctccatagtatcatcaat 27267247  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| |||||||||||| |||||| || |||| || |||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||    
27267246 tcatcagattaacaagactacacttaatctaatttaat-ctaccttgttttgagtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatc 27267148  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
27267147 atcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 27267112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 41926192 - 41926417
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta-------- 92  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||||            
41926192 tttttgatgaagttaatactataacatcaaaaatatagtgagtaatatcccactgtttgtacagtggcatcacaagttcagtccctatagtatcatcaat 41926291  T
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||      |||| ||||||||    
41926292 tcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacactt------attaaataatatc 41926385  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
41926386 atcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 41926417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19899916 - 19899681
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||   |||||||||| | || |||||||| ||||| || |||||||||||||      
19899916 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacacctcactgtttgtagaatggcatcaaaagttcaaccctcatagtatcatcaat 19899817  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          | ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
19899816 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatacattgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 19899717  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |  |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
19899716 accaactctatttgcatgttaaagattccaacgata 19899681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 32267063 - 32267294
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatc--- 97  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||       
32267063 ttttttgtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcactcctcatattatcatcaac 32267162  T
98 -----agattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
         |||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
32267163 ccatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacactccacaaagtgtaacactcaagactatcacataatatc 32267262  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    || |||| ||||||||||||||| || |||||    
32267263 atcaactttgtttgcatgttaaatattccaac 32267294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 37451315 - 37451549
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag- 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||| || | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||||||      
37451315 tttttggtaaagttaacactataacatcaaaaatgtaataagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaat 37451413  T
100 -------attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
           |||||||| |||||||||||| |||||||||   || || || |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||    
37451414 ttatcatattaacaagactacacttaatctaattttatctgaccttgttataagtgtaacacctcaaaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 37451513  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
37451514 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgata 37451549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 51128888 - 51129123
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag- 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| ||   ||||||||||||      
51128888 tttttagtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcatcaat 51128987  T
100 -------attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
           |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || || |||| |||||||  |||||||||||||| |||| |  || ||||||||||    
51128988 tcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacaattaaaactatcacataatatc 51129087  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
51129088 atcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgata 51129123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47682640 - 47682406
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactct-actgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca- 98  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  |||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||     
47682640 tttttggtgaagttaacactagcata--aaaaatgttgtgagtaacactcccactgcttgtacagtggtatcaaaagttcattcctcatagtatcatcaa 47682543  T
99 -------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatat 191  Q
           ||||||||| |||||| ||||  |||||||||||| | || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | |||||||    
47682542 ttcatcagattaacaagactacatttaaactaattttattctgccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatat 47682443  T
192 cattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
47682442 catcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 47682406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 2959784 - 2960012
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat--------cag 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | |||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||        |||    
2959784 tgaagttaacactataacatcaaaactgtagtaagtaacatcccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtgtcatcaattcatcag 2959883  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||| ||||||   |||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| || |    
2959884 attaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccacaaattgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaat 2959983  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
2959984 atgtttgcatgttaaagatgccaacgata 2960012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 16415678 - 16415910
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctac-tgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca----- 98  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||  |  |||||||||||||         
16415678 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccctaaatgtttgtacagtggcatcaaaagttcagccatcatagtatcatcaattca 16415777  T
99 ---gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatt 195  Q
       ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||| ||  |||| | ||||| ||||||||  || ||||||||||||     
16415778 ttagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacatattgtaatacttaagactatcacataatatcatc 16415877  T
196 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
16415878 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 16415910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15382962 - 15383197
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||| || |||||||||  | || ||||||||| || |||||||| |||| ||  | |||||||||        
15382962 tttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccaccgtttgtacaatgtcatcaaaagttcagtcatcgtagtatcatcaat 15383061  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
15383062 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 15383161  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
15383162 atcaactatgtatgcatgttaaagattccaacgata 15383197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 23999376 - 23999611
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtat------- 93  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||| ||||  || ||||||||           
23999376 tttttggtgaagttaacactacaacataaaaaatataacgagtaacaccccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatagtattatcaat 23999475  T
94 -catcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
23999476 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 23999575  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
23999576 atcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgata 23999611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27533123 - 27532893
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| ||| ||| ||||||  | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||          
27533123 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtattgtgggtaacaacccactctttgtacagtggcatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcat 27533024  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
      ||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||| ||||||  |    
27533023 cagattaacaagaatacacttaatc-aattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcagca 27532925  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||    
27532924 attctgtttgcaagttaaagatgccaacgata 27532893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30327099 - 30326864
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| || |||||| || ||||||| || | || ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||||||||      
30327099 ttttttgtgaatttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaatacccaaccgtttgtacaatagcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaat 30327000  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
30326999 tcatcagattaacaaaactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 30326900  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
30326899 atcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgata 30326864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 47279218 - 47279449
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||        
47279218 tttttggtgaagttaacattatactatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcgaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 47279317  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||  ||||||   || ||||||||||||||||||  || |||| |||||    
47279318 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaattgtaacatcccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 47279417  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
47279418 aacaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 47279449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 8222257 - 8222392
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
8222257 tcatcatattaacaagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 8222356  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
8222357 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgata 8222392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27227581 - 27227397
Alignment:
52 actgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattatttt 143  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||        ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||    
27227581 actgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgtttt 27227482  T
144 aagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| |||||||  ||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
27227481 aagtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatcacatgatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 27227397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28564928 - 28564695
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatc------ 94  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||          
28564928 tttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccttactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 28564829  T
95 --atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
      |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  | | || || ||||| ||||||  |  |||||||||||||||  |  || ||||||||||    
28564828 tcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcatgccttgttataagcataacaccccgtaaagtgtaacactta--actatcacataatatc 28564731  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
28564730 atcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgata 28564695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 30254453 - 30254687
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| || ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||        
30254453 tttttgttgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaatacac-actgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcaat 30254551  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| || || ||||| ||||||   | ||||||||||||||||||   | |||||||| |    
30254552 tcatcagattaacaagactagacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacaccctataaagtgtaacacttaagactgtcacataataac 30254651  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
30254652 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgata 30254687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 48620672 - 48620890
Alignment:
7 gtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcatca 98  Q
    |||||||||||| ||||| || |||| | | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||        ||||||    
48620672 gtgaagttaacaatataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatca 48620771  T
99 gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaac 198  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||         | |||| ||||||  |||    
48620772 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaac 48620862  T
199 tctgtttgcatgttaaagatgccaacga 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
48620863 tctgtttgcatgttaaagatgccaacga 48620890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 228
Target Start/End: Original strand, 4330412 - 4330545
Alignment:
95 atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcat 194  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||    
4330412 atcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcat 4330511  T
195 taactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
4330512 caactctttttgcatgttaaagatgtcaaagata 4330545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 3534967 - 3535187
Alignment:
7 gtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcatca 98  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||        ||||||    
3534967 gtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactgtttgtgcagtgacatcaaaagttcagtccccttaatattatcaattcatca 3535066  T
99 gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaac 198  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||||||||| || | || ||||||| |||||||  |||||||||||||||         |||||| ||||||  |||    
3535067 gattaacaagaatacatttaatctaattttatcctgccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------ttacatgatatcagcaac 3535157  T
199 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
3535158 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 3535187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7079221 - 7078975
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactc-----------tactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccata 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| |            |||||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||    
7079221 tttttggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactaacacctcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcatcata 7079122  T
90 gta--------tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataat 181  Q
    |||        |||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||||  ||    
7079121 gtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtataagacttaagactat 7079022  T
182 tacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
     |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
7079021 cacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 7078975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 15168225 - 15168360
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||   ||  |||||||||    
15168225 tcatcagattaacaagactgcagttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacttaaggctatcgcataatatc 15168324  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
15168325 atcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 15168360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 22170840 - 22170975
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||| |||||| || |||| || ||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
22170840 tcattagattaataacactacacttaatctaatttcatcctaccttgtttcaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 22170939  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
22170940 atcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 22170975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34012517 - 34012294
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcatcag 99  Q
    ||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||  |||| ||        |||||||    
34012517 tgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcag 34012418  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||| | || || ||| ||| |||||||  |||||| ||||||||     |  || |||||||||||| || |    
34012417 attaacaagattacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaat 34012323  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
34012322 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 34012294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 46931440 - 46931673
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||| || | |||||||||| |  | |||||||||||||  || |||| ||||||||      
46931440 ttttttgtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccactgtttgtagaacggcatcaaaaattcagccctcataatatcatcaat 46931539  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          | ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
46931540 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttc--agcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 46931637  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
46931638 atcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgata 46931673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27763457 - 27763223
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||| | |  ||||||| | ||||||||||| | ||  || |||||||||||||      
27763457 ttttttgtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccc-atagtttgtagaatgacatcaaaagtccagccctcatagtatcatcaat 27763359  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          | ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| |  || ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  || |||||||||     
27763358 ttatcaggttaacaagactacacttaatctaattttatcatacctagttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacataatata 27763259  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
27763258 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgata 27763223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 228
Target Start/End: Original strand, 25160715 - 25160896
Alignment:
55 gtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaag 146  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| ||| |||||||||||||        |||||| || |||||||||||| | ||||||| |||| || || ||||    
25160715 gtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagattaataagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataag 25160814  T
147 cgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
     |||||||  |||||||| |||||||||| |  || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
25160815 tgtaacaccccacaaagtataacacttaaaactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgata 25160896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 28769682 - 28769917
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag- 99  Q
    ||||| |||||||||||||||| | || |||||| || |||||||||| | || ||||||||| || |||||||  |||  ||| |||||||||||||      
28769682 ttttttgtgaagttaacactatgacatcaaaaatgtaatgagtaacaccc-accgtttgtacaatggcatcaaaggttcggtcctcatagtatcatcaat 28769780  T
100 -------attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatc-acaaagtgtaacacttaagataattacataatat 191  Q
           |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || || ||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||  || |||||||||    
28769781 tcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataaacgtaacacccccacaaagtgtaacgcttaagactatcacataatat 28769880  T
192 cattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||    
28769881 catcacctctgtttgcatgttaaagatttcaacgata 28769917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33725647 - 33725512
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||  ||  |||||||||    
33725647 tcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacatttaagactatcgcataatatc 33725548  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
33725547 atcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 33725512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 40884846 - 40885070
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatc--------at 96  Q
    ||||||||| ||||| |||| || |||| | ||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||| ||||||||        ||    
40884846 tggtgaagtcaacaccataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcttcaattcat 40884945  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || |||||| |||  || ||||||| ||||||   |  ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |    
40884946 cagattaacaagattgcacttaatctagttttatcctatcttgttttaagtgtaacattccgaaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatca 40885045  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgcc 221  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
40885046 actatgtttgcatgttaaagatgcc 40885070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 14758074 - 14758296
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatc------- 97  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| | ||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| |||||           
14758074 tggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcacacaactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtccccatagtttcatcaattcat 14758173  T
98 -agattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
     |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  || |||         ||||||  ||  ||||||||||| |    
14758174 tagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaa---------ttaagactatcgcataatatcatca 14758264  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
14758265 actatgtttgcatgttaaagatgccaacgata 14758296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37619043 - 37618813
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaa--cactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtat----- 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||  ||| | |||||||||| | ||||||||||| |||| | | ||||||||         
37619043 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatttaatgagtaaaacaccccactgtttgtaaaatgacatcaaaagttcagttctcatagtatatcat 37618944  T
94 -----catcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataa 188  Q
         |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||| |||||   || ||||||||||||| |          ||||    
37618943 caattcatcagattaacaatactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacatcccataaagtgtaacactcat---------ataa 37618853  T
189 tatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
37618852 tatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgata 37618813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 39393419 - 39393648
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat--------cag 99  Q
    ||||||||||||||||  || |||| | | |||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||        |||    
39393419 tgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaatacttcattgtttgtacagtggcatcaaaagtttaatccccatagtatcataaattcatcag 39393518  T
100 attaacaaaactacacttaatttaatttt-attctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaac 198  Q
    |||||||| | ||||||| || ||||||| || |||| || ||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  || | || |||| |  |||    
39393519 attaacaagaatacacttcatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacatcctacaaagtgtaacacttaagactatcatatgatattagcaac 39393618  T
199 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
39393619 tctgtttccatgttaaagatgccaatgata 39393648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 216
Target Start/End: Original strand, 38759662 - 38759785
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||  || | ||||||||    
38759662 tcatcatattaataaaactacatttaatttaattttatcatatcttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttgagactatcagataatatc 38759761  T
193 attaactctgtttgcatgttaaag 216  Q
    |  |||| ||||||||||||||||    
38759762 accaactatgtttgcatgttaaag 38759785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 3309181 - 3309417
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcat 96  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||        ||||    
3309181 tggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccc-actgtttgtacagtggtatcaaaagttcaatcttcatagtatcatcaattcat 3309279  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaa-ttttattctacattattttaagcgtaacacat-----cacaaagtgtaacacttaagataattacataata 190  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| |||||  |||| || ||||||  ||||||| |     ||| |||||||||||||||||  || | || |||    
3309280 cagattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaaatgtaacacctcactacactaagtgtaacacttaagactatcaaatgata 3309379  T
191 tcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
3309380 tcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgata 3309417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1359918 - 1359847
Alignment:
157 cacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
1359918 cacaaagtgtaacacttaagattatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgata 1359847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 98
Target Start/End: Original strand, 21289726 - 21289798
Alignment:
26 ataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||    
21289726 ataaaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcatca 21289798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11742493 - 11742338
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| | | || |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||          
11742493 tggtgaagttaacactatattatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagt-cccataatatcatcaattcat 11742395  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaaca 153  Q
      ||||||||| | |||||||||| |||||||||  ||| || ||||||| ||||||    
11742394 cggattaacaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaaca 11742338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31621694 - 31621480
Alignment:
7 gtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatc--------atca 98  Q
    ||||||| |||||||||| || |||  | || |||||| ||| |  || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||        ||||    
31621694 gtgaagtcaacactataacatcaaaggtgtattgagtagcaccccgctatttgtacggtggcatcaaaaattcagtccccatagtatcatcaattcatca 31621595  T
99 gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaac 198  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||||| | || ||  ||  |||||| ||||||||||  ||  ||||||||||  |||    
31621594 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgcaatacccca-gaagtgtgacacttaagactatcgcataatatcaacaac 31621496  T
199 tctgtttgcatgttaa 214  Q
    | ||||||||||||||    
31621495 tatgtttgcatgttaa 31621480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Original strand, 48353731 - 48353806
Alignment:
152 cacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||  || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
48353731 cacaccacaaagtgtaacact-aagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 48353806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1360022 - 1359924
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcagattaacaa 107  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| | |  | |||||||| | ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
1360022 tgaagttaatactataacattaaaaatatagtga-taatatttcagtgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcagattaacaa 1359924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 228
Target Start/End: Original strand, 21289832 - 21289864
Alignment:
196 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
21289832 aactctgtttgcatattaaagatgccaacgata 21289864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 7703554 - 7703777
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcagattaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | | || |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
7703554 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtcagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcagattaa 7703653  T
105 caaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtt 204  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||  |||||||||    
7703654 caagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtt 7703753  T
205 tgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
7703754 tgcacgttaaagatgccaacgata 7703777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 47253782 - 47254004
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||| | | ||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
47253782 tttttggtgaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacaccc-attgtttatacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaga 47253880  T
101 ttaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactc 200  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||  |||||    
47253881 ttaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactc 47253980  T
201 tgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
47253981 tgtttgcatgttaaagatgccaac 47254004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 17173330 - 17173558
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat--------cag 99  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||    
17173330 tgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatctccatagtatcattaattcatcag 17173429  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    | ||| || | |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||    
17173430 actaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 17173529  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
17173530 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 17173558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36493866 - 36493632
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag- 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||      
36493866 tttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacaccccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaat 36493767  T
100 -------attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
           |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||    
36493766 tcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatc 36493668  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
36493667 atcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 36493632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 25184147 - 25184368
Alignment:
2 ttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat----- 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||         
25184147 ttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaatgacatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaact 25184246  T
97 ---cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatca 193  Q
       ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |    
25184247 catcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatta 25184346  T
194 ttaactctgtttgcatgttaaa 215  Q
    | ||||||||||||||||||||    
25184347 tcaactctgtttgcatgttaaa 25184368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 17167753 - 17167981
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat--------cag 99  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||        |||    
17167753 tgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcattctccatagtatcattaattcatcag 17167852  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    | ||| || | |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||    
17167853 actaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 17167952  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
17167953 ctatttgcatgttaaagatgccaacgata 17167981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35021209 - 35020978
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||| ||   ||| | |||||||||||          
35021209 tggtgaagttaacattataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacattggcgtcaaaagtttcgtcctcgtagtatcatcaattcat 35021110  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |    
35021109 tagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 35021010  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
35021009 actctgtttgcatgttaaagattccaacgata 35020978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25701235 - 25700999
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||      
25701235 tttttggtaaagttaacattataacatcaaaagtgtagtgagtaacaccctactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 25701136  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaaca-catcacaaagtgtaacacttaagataattacataatat 191  Q
          ||||||||  |||||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
25701135 tcatcagattaacaggactacactaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataacat 25701036  T
192 cattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
25701035 catcaactttgtttgcatgttaaagaagtcaacgata 25700999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 50697275 - 50697510
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||        
50697275 tttttagtgaagtaaacactataacataaaaaatataacgagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctc-tagtatcatcaat 50697373  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||    
50697374 tcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagcgtaacaccacacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatc 50697473  T
193 attaactctgtttgc-atgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
50697474 atcaactctgtttgcaatgttaaagattccaacgata 50697510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4934375 - 4934145
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactct-actgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca----- 98  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||         
4934375 tggtgaagttaacactag--tataaaaaatgtagtgagtaacacccccattgtttgtacactggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcatttca 4934278  T
99 ---gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatt 195  Q
       ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||     
4934277 tcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtccaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatc 4934178  T
196 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
4934177 aactatgtttgcatgttaaagatgacaacgata 4934145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 55478073 - 55477834
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgt----acagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||| |||||||||    ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
55478073 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacactccactgtttgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcat 55477974  T
97 ca--------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataa 188  Q
    ||        ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||  || || |||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||  || ||||||    
55477973 caattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgttataagtgtaacaccccacaacgtgtaacactgaagactatcacataa 55477874  T
189 tatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
55477873 tatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgata 55477834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 879726 - 879501
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||| || ||||||||||   | |||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||      
879726 tttttggtgaagtaaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcattgtttgtacaatgacatcaaaagtttaatcttcatagtatcatcaac 879627  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| || || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||    
879626 tcatcagattaacaagactacacataatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacatttaagactatcacataatatc 879527  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    || |||| ||||||||||||||||||    
879526 atcaactttgtttgcatgttaaagat 879501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35025762 - 35025539
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcagattaa 104  Q
    ||||||||| |||||||||  || |||| | ||||||||| ||| | ||||||| |||  ||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||    
35025762 tggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatacgttgacatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcagattaa 35025663  T
105 caaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtt 204  Q
    ||| ||| || ||||| ||||||||| |||  || ||||||| || ||||  || ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||| ||||    
35025662 caagactgcatttaatataattttatcctatcttgttttaagtgtcacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtt 35025563  T
205 tgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
35025562 tgcatgttaaagatgccaacgata 35025539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30002798 - 30002584
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcagattaa 104  Q
    |||||||||||||||| ||  || |||| | | |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||    
30002798 tggtgaagttaacactgtagcatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttcttagtatcatcagattaa 30002699  T
105 caaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtt 204  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||         | |||| ||||||  |||||||||    
30002698 caagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtt 30002608  T
205 tgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
30002607 tgcatgttaaagatgtcaacgata 30002584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37663917 - 37663684
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||| ||||||||||||||  | || |||| | || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||      
37663917 tttttgatgaagttaacacta--acattaaaactgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 37663820  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
37663819 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 37663720  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
37663719 atcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgata 37663684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19089631 - 19089396
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| | |||||||||| | ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||      
19089631 tttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 19089532  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||  | || |||||||||   ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
19089531 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctatatgcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 19089432  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||  |||| |||||||||||||  ||||||||    
19089431 atcaacgttgttcgcatgttaaagatttcaacgata 19089396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19440826 - 19440591
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||| || ||| |||||||| || ||||||||| || |||||||| |||| ||| |||| ||||||||      
19440826 tttttggtgatgttaacactataacatcaaaaatgtaatgattaacactccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaat 19440727  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||  || || ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| | || ||||||||||    
19440726 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttagcttgttataagcgtaacaccccacaacgtgtaacccttaagtttataacataatatc 19440627  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
19440626 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaatgata 19440591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28003160 - 28002929
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    ||||||||| |||||||||  || |||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||          
28003160 tggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtcagtagtactccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcat 28003061  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
      ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  || |||||||||||||||| |  || |||||||||||| |    
28003060 cggattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatca 28002961  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
28002960 actatgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 28002929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 55241276 - 55241048
Alignment:
7 gtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcagattaaca 106  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| | | | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||    
55241276 gtgaagttaatactatattatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaatttatca 55241177  T
107 aa-------actacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
     |       | |||||||||| |||||||||  ||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| || |||  ||||    
55241176 gataagaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatgtcagcaact 55241077  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
55241076 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 55241048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 37287767 - 37287996
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcaga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |||    
37287767 tttttggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatcctcataatatcataaga 37287866  T
101 ttaacaaaactacacttaatttaatttt-attctacattattttaagcgtaacacatc-acaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaac 198  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||| |  |||| || ||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||||||  |  |||| ||||||  |||    
37287867 ttaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaagtgtaacgcccccacaaaatgtaacacttaagactagcacatgatatcagcaac 37287966  T
199 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||    
37287967 tttgtttgcatgttgaagatgccaacgata 37287996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34361669 - 34361435
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | |||||||||| | |||||| |||| ||||  || |||| ||||||||      
34361669 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaatgacattaaaagttcag-cctcataatatcatcaat 34361571  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          | ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| || || ||||||||||||   ||||||||||||||||||    || ||||||||||    
34361570 tcatccggttaacaaaattacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaagctatcacataatatc 34361471  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
34361470 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgata 34361435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 38011891 - 38012118
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtat--------cat 96  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| | |||||| || ||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||        |||    
38011891 tggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgaatagcaccccactgtttgtacggtgccatcaaaagttcagtccccataatattatcaattcat 38011990  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||   || |||||||||| |||||||  || |||||||||||| |    
38011991 cagattaacaagactacacttaatttaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccagaaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatca 38012090  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||    
38012091 actatgtttgcacgttaaaaatgccaac 38012118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 9139280 - 9139465
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta-------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||            
9139280 tttttggtgaagttaacgttatagcataaaaaata--gtgagtaacaccccaccgtttgtacagtgacataaaaagttcaatccccatagtatcatcaac 9139377  T
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataa 180  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||    
9139378 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaactgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagataa 9139465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 33341531 - 33341666
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| |||||    
33341531 tcatcagattaacaagaatatacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 33341630  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
33341631 agcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 33341666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46888328 - 46888101
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatc--------atcag 99  Q
    ||||||||| ||||||| || |||| | |||||||||| || | ||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||||| ||||        |||||    
46888328 tgaagttaatactataacatcaaaattgtagtgagtaataccccactatttgtacagcggcatcaaaagttcagtccccatactatcgttaattcatcag 46888229  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||| |||||||  ||||||  ||||||||| |||  || |||||||||||| || |    
46888228 attaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaacgtaacactt-agactatcacataatatcatcaaat 46888130  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
46888129 cggtttgcatgttaaagatgccaacgata 46888101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 6864068 - 6864303
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||| || ||| |||||  | ||| |||||||| |  |||||||| | || ||| |||||||||||||      
6864068 tttttggtgaagttatcactataacatcaaaaatttaatgaataacatccaactttttgtacaatagcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaat 6864167  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| || || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||    
6864168 ttatcagattaacaagactacatttaatttaattttatcataccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatc 6864267  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
6864268 atcaactttgtttgcatgttaaagattacaacgata 6864303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 42199762 - 42199997
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||| || ||||||| || | | | |||||| | |||||| |||| ||||  || |||||||||||        
42199762 tttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccattatttgtagaatgacataaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 42199861  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
42199862 tcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 42199961  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
42199962 ataaactctatttgcatgttaaagattccaacgata 42199997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 23761114 - 23761339
Alignment:
10 aagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------gat 101  Q
    ||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||        |||    
23761114 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagat 23761213  T
102 taacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactct 201  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||  ||  ||| ||||||  ||||||    
23761214 taacaagaatacacttaatctaattttat-ctaccttgttttaagtgtaacacctcataaagtgtcacatttaagactatcgcatgatatcagcaactct 23761312  T
202 gtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||    
23761313 gtttgcacgttaaagataccaacgata 23761339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 1815434 - 1815569
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
1815434 tcatcatattaacaagactacatttactctaattttatcctaccttgttttaagggtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 1815533  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
1815534 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgata 1815569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 37775702 - 37775879
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||   |||| |||||||||        
37775702 tttttggtgaagttagcactataatattaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcc--ccccttagtatcatcaat 37775799  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacact 172  Q
        ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
37775800 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 37775879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 27396653 - 27396884
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat-------- 96  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||| | |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||   ||| |||||||||||            
27396653 tggtgaagttaacattatagcattaaaagtgttatgagtaacaccctactgtttgtacaatgacatcaaaagtttcgtcctcatagtatcatcaattcat 27396752  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||   || ||||||| ||||||||||  ||  ||| ||||||  |    
27396753 cagattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtcacacttaagaccatcgcatgatatcagca 27396852  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||    
27396853 acgctgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 27396884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32912758 - 32912523
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||| ||| | |||||| | ||| ||||||| ||||   | |||| ||||||||      
32912758 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctagtatttgtagaatgatatcaaaagttcagcactcataatatcatcaat 32912659  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          | ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
32912658 ttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 32912559  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||| |||| |||||||||||  ||||||||    
32912558 atcaactctatttgtatgttaaagatttcaacgata 32912523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 3042752 - 3042887
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
3042752 tcatcatattaacaagattacacttaatataattttatcataccttattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 3042851  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||    
3042852 atcaactttgtttgcttgttaaagatttcaacgata 3042887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 32592126 - 32592305
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta-------- 92  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| |||| | | | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||            
32592126 tttttgatgaagttaacactacagtatcaaaagtgttgagagtaacactccactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaat 32592225  T
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacact 172  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
32592226 tcatcagattaacaagaatacatttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 32592305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34948267 - 34948038
Alignment:
9 gaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag--------a 100  Q
    |||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||         |    
34948267 gaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcata 34948168  T
101 ttaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaac--acttaagataattacataatatcattaac 198  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||| |||  || ||| ||| | |||||  |||||||||||||  ||||||||  || |||| ||||||  |||    
34948167 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgtttaaagtgcaacaccccacaaagtgtaacgtacttaagactatcacatgatatcaacaac 34948068  T
199 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
34948067 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 34948038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Original strand, 39397955 - 39398115
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcagattaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||| ||  |  |||||||||| |||||    
39397955 tggtgaagttaacactataacattaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttctcagtatcatca-attaa 39398053  T
105 caaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgt 166  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||  ||||||||||    
39398054 caagaatacacttaatctaattttatcctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgt 39398115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 49376004 - 49376235
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||| | | ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||          
49376004 tggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtcgtgagtaacaccccactgcttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcat 49376103  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
      ||||||||| | ||| ||| || |||||||||||| | ||  ||||||    ||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |    
49376104 cagattaacaagattacgcttgatctaattttattctgccttgatttaagttatacaccccacaatgtgtaacacttaagattatcacataatatcatca 49376203  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
49376204 actttgtttggatgttaaagatgtcaacgata 49376235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5048139 - 5047913
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    ||||||||| ||| |||||| || |||| | |||||||||  ||   |||||||||||  ||| ||||||| |||| | |||||||||||||||          
5048139 tggtgaagtcaactctataacatcaaaagtgtagtgagtaggaccacactgtttgtacgatgatatcaaaagttcagttcccatagtatcatcaattcat 5048040  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
      ||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||| ||  | |||| ||||||||||||||  || |||| ||||||| |    
5048039 gagattaacaagactgcatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacc-cgcaaaatgtaacacttaagactatcacatgatatcataa 5047941  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
5047940 actatgtttgcatgttaaagatgccaac 5047913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 32579579 - 32579714
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||| || ||| |||||||||| |||||||  ||   ||||||||    
32579579 tcatcagattaacatgactgtacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaagacctcagaaagtgtaactcttaagactatcttataatatc 32579678  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
32579679 atcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgata 32579714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 4598030 - 4598250
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag----- 99  Q
    |||||||||||||||||||| || |||  | | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||  ||||||          
4598030 tggtgaagttaacactataacatcaaag-tgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccttagactcatcaattcat 4598128  T
100 ---attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
       |||||||| | |||||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||||  |||||||||||||||         | |||| ||||||  |    
4598129 catattaacaagaatacacttaatttaattttatcctgc-ttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagca 4598218  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
4598219 actctgttttcatgttaaagatgccaacgata 4598250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33816530 - 33816459
Alignment:
157 cacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
33816530 cacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 33816459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 50764765 - 50764860
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca 98  Q
    |||||| ||||||||||||||  | || |||| | | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
50764765 tttttgatgaagttaacacta--acatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatca 50764860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29584372 - 29584153
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |  ||||||||||   |||||||||||| || |||||||| |||| ||  |||||||||||||          
29584372 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgt--tgagtaacacctcactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcat 29584275  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
      ||||||  | | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||  ||  |||||| ||||||||||  ||  ||| ||||||  |    
29584274 cagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgttacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagca 29584175  T
197 actctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
29584174 actctatttgcatgttaaagat 29584153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 3042644 - 3042723
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattca 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| || | || |||| |||| ||||||||||||||||    
3042644 tttttggtgaagttaacactataacatacaaaatgtaatgagtaataccccaccgtttatacaatgacatcaaaaattca 3042723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 218
Target Start/End: Original strand, 17272097 - 17272222
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||  ||  |||||| ||||||||||  ||  ||| |||||    
17272097 tcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatc 17272196  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    |  |||||| ||||||| ||||||||    
17272197 agcaactctatttgcatattaaagat 17272222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7152219 - 7152147
Alignment:
156 tcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||| |||||||||| |  || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
7152219 tcacaaagtataacacttaatactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgata 7152147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54499413 - 54499181
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtac-agtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag---- 99  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| | | ||||||||||| | || |||||||| | ||||||||||| |||| || | ||||||||||||         
54499413 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccaccgtttgtactaatgacatcaaaagttcagtctctatagtatcatcaattca 54499314  T
100 ----attaacaaaactacacttaatttaattttattc-tacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcat 194  Q
        |||||||| | || ||||||| |||||||  || ||| || ||||||| |||||||   ||||||||||||  ||||||  || |||| |||| |     
54499313 tcatattaacaagaatatacttaatctaatttttatcataccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacttttaagactatcacatgatattag 54499214  T
195 taactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
54499213 taactctgtttccatgttaaa-atgccaacgata 54499181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 53124320 - 53124367
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacac 48  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
53124320 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataatgagtaacac 53124367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 73
Target Start/End: Original strand, 4205156 - 4205221
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaa 73  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||| | |||||||||||| |||||||||    
4205156 tgaagttaacactataatatcaaaaatgttctgaataacaccccactgtttgtacaatgacatcaa 4205221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 228
Target Start/End: Original strand, 4205220 - 4205252
Alignment:
196 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
4205220 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 4205252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 228
Target Start/End: Original strand, 9139465 - 9139497
Alignment:
196 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
9139465 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 9139497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 228
Target Start/End: Original strand, 39400244 - 39400276
Alignment:
196 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
39400244 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 39400276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 4396359 - 4396406
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacac 48  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
4396359 tttttagtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacac 4396406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 23518473 - 23518402
Alignment:
9 gaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattca 80  Q
    |||||||||||||||| || |||| | |||||| |||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||    
23518473 gaagttaacactataacattaaaactgtagtgactaacaccccactgttaatacagtggcatcaaaaattca 23518402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33816609 - 33816536
Alignment:
95 atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaa 168  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  || |||||||||    
33816609 atcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaa 33816536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46481218 - 46481047
Alignment:
57 ttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacat 156  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |    
46481218 ttgtacaatgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcagattaacaagactatacttgatgtaattttattctacattgttttaagtgtaacatct 46481119  T
157 cacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
46481118 cataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcattaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 46481047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 38258553 - 38258788
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||        
38258553 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaat 38258652  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
38258653 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 38258752  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
38258753 atcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgata 38258788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 18797337 - 18797560
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||        
18797337 tttttggtgaagttaacacta--acataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaac 18797434  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
18797435 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 18797534  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
18797535 atcaactctgtttgcatgttaaagat 18797560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32821206 - 32820971
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||| ||| | |||||||||||      
32821206 tttttggtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaat 32821107  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||  ||  |||||||||    
32821106 tcattagattaacaagactacagttaatttagttttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcgcataatatc 32821007  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
32821006 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgata 32820971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 30055535 - 30055770
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||        
30055535 tttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcattaat 30055634  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||  | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
30055635 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 30055734  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
30055735 atcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgata 30055770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 37347030 - 37347264
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag- 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||      
37347030 tttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 37347129  T
100 -------attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
           |||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||    
37347130 ttattaaattaacaggactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatc 37347228  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
37347229 atcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgata 37347264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9355978 - 9355744
Alignment:
2 ttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatc------- 94  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| || | | | |||| ||||           
9355978 ttttggtgaatttaacactatagcataaaaaatgtagtgagcaataccccactgtttgtacagtgacatcaaaagtttagttctcatattatcgttaatt 9355879  T
95 -atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatca 193  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||    
9355878 catcagattaacaagactacacttaatctaatttcatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatca 9355779  T
194 ttaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
9355778 tcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgata 9355744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 23111202 - 23111435
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||| |  | |||||||||||          
23111202 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatattgtgagtaacacaccactatttgtacaatggcatcaaaagttcaaccatcgtagtatcatcaattcat 23111301  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttat-tc-tacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcat 194  Q
      ||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
23111302 tagattaacaagactacacttaatctaattttatatcatactttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcat 23111401  T
195 taactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
23111402 caactctgtttgcatgttaaagataacaacgata 23111435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 11071214 - 11071438
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    |||||||| ||||||  ||||||  || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||        
11071214 tttttggtaaagttagtactatatcatcaaaaatatagcgagtaacactccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaat 11071313  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
11071314 tcatcagattaacaacactacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatc 11071413  T
193 attaactctgtttgcatgttaaaga 217  Q
    || |||| |||| ||||||||||||    
11071414 atcaactttgttcgcatgttaaaga 11071438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 21991648 - 21991879
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat-------- 96  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| | | | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||            
21991648 tggtgaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtacagtgtcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcat 21991747  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||  |    
21991748 cagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagca 21991847  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
21991848 actttgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 21991879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37703590 - 37703416
Alignment:
54 tgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaaca 153  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||| ||||||    
37703590 tgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtctccatagtatcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcatatcttattttaagtgtaaca 37703491  T
154 catcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
       ||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
37703490 tcccacaaagtgtaccacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 37703416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 37109880 - 37110117
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||| ||   ||| ||||||||      
37109880 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcattataatatcatcaat 37109979  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctaca--ttattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataata 190  Q
          ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |  || || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |  ||||||||    
37109980 tcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactaccacataata 37110079  T
191 tcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
37110080 tcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgata 37110117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27283752 - 27283987
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||      
27283752 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatgaaatcaaaagttcagtcctcatagtattatcaat 27283851  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| || || |||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||||     
27283852 ttatcagattaacaagactatacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatt 27283951  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
27283952 atcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgata 27283987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 43686049 - 43686283
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatca----- 95  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||         
43686049 ttttgggtgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccc-actgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtccctatagtatcaacaat 43686147  T
96 ---tcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
       ||||| |||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
43686148 tcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 43686247  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
43686248 atcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgata 43686283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Original strand, 4582931 - 4583161
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatca--------t 96  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||        |    
4582931 tggtgaagttaatactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcat 4583030  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    |||| |||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| |    
4583031 cagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatca 4583130  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgat 227  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||||    
4583131 actatgtttgtatgttaaagatgtcaacgat 4583161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5657628 - 5657399
Alignment:
7 gtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag------- 99  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||            
5657628 gtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatca 5657529  T
100 -attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaac 198  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||  ||  ||| ||||||  |||    
5657528 tattaacaaaaatacacttaatttaattttatcctactttgttttaagtgtaacagcccacaaagtgtaatacttaagactatcgcatgatatcagcaac 5657429  T
199 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
5657428 tatgtttgcatgttaaagatgccaacgata 5657399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 10481619 - 10481844
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactct-actgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat--------ca 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||        ||    
10481619 tgaagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacacccccactgtttgtacaatgacatcaaaaattcagtctttatagtatcatcaattcatca 10481718  T
99 gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaac 198  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||  ||| || || |||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||    
10481719 gattaacaagactacgcttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 10481818  T
199 tctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||    
10481819 tctctttgcatgtcaaagattccaac 10481844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17842739 - 17842502
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||  ||| ||   ||| ||||||||      
17842739 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagctcagtcattataatatcatcaat 17842640  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctaca--ttattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataata 190  Q
          ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |  || || |||||||||||   |||||||||||||||||||||  |  ||||||||    
17842639 tcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactaccacataata 17842540  T
191 tcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
17842539 tcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgata 17842502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15612812 - 15612677
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||| |||||    
15612812 tcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 15612713  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
15612712 agcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgata 15612677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 228
Target Start/End: Original strand, 32432488 - 32432695
Alignment:
29 aaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------gattaacaaaactacacttaat 120  Q
    |||||| | ||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||        || |||||| | |||| |||||    
32432488 aaaaatgttgtgagtaacaccccattgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacagttaat 32432587  T
121 ttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgc 220  Q
     ||||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
32432588 ataattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacactgtttgcatattaaagatgc 32432687  T
221 caacgata 228  Q
    ||||||||    
32432688 caacgata 32432695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41765131 - 41764997
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||  || ||||||||||    
41765131 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttactctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 41765032  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgat 227  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
41765031 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgat 41764997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48928712 - 48928482
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtat--------cat 96  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| | ||||||||| ||| | ||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||| |||||||        |||    
48928712 tggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtacggtgccatcaaaagttcagtccc-atagtattatcaattcat 48928614  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||  ||  ||||||||||| |    
48928613 cagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattattttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatca 48928514  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
48928513 actatgtttgcatgttaaaaatgccaacgata 48928482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Original strand, 44598735 - 44598909
Alignment:
62 cagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat--------cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaaca 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||    
44598735 cagtggcatcaaaaattcaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaaca 44598834  T
154 catcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |  ||||||||||||||| |||||  || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
44598835 ccccacaaagtgtaacacctaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgata 44598909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 7334802 - 7335026
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta-------- 92  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||            
7334802 tttttgatgaagttaacactataacataaaatatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaac 7334901  T
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || |||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||||||||    
7334902 tcatcagcttaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacagagtgtaacacttaagattatcagataatatc 7335001  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    || ||||  ||||| |||||||||||    
7335002 atcaact-agtttgaatgttaaagat 7335026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 37704267 - 37704387
Alignment:
95 atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcat 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
37704267 atcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcat 37704366  T
195 taactctgtttgcatgttaaa 215  Q
     ||||||||||||||||||||    
37704367 caactctgtttgcatgttaaa 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15672815 - 15672680
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
15672815 tcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 15672716  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
15672715 atcaactctatttgaatgttaaagatgccaacgata 15672680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27421532 - 27421313
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||  ||| ||||||        
27421532 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcct-ataatatcataaat 27421434  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||  ||   || |||||    
27421433 ttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcgtatgatatc 27421334  T
193 attaactctgtttgcatgtta 213  Q
    |  ||||||||||||||||||    
27421333 agcaactctgtttgcatgtta 27421313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 24211749 - 24211984
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||  || |||||||||||||      
24211749 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctactgtttatagaatggcatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 24211848  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          | ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || || |||| ||||||    |||||||||||||| |||||  || ||||||||||    
24211849 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacatcctacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatc 24211948  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| | |||||||||||||||| |||||||||    
24211949 atcaactttatttgcatgttaaagattccaacgata 24211984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 38053494 - 38053623
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcaga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||| |||||| |    
38053494 tttttggtgaagttaatactataacataaaaaatgtaatgagtaaaaccctactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatagtgtcatcaaa 38053593  T
101 ttaacaaaactacacttaatttaattttat 130  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||    
38053594 ttaacaagactacacttaatctaattttat 38053623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48928445 - 48928216
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtat--------cat 96  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| | ||||||||| ||| | ||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||| |||||||        |||    
48928445 tggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtacggtgccatcaaaagttcagtccc-atagtattatcaattcat 48928347  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| | | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||  ||  ||||||||||| |    
48928346 cagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatca 48928247  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgat 227  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
48928246 actatgtttgcatgttaaaaatgccaacgat 48928216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Original strand, 22687254 - 22687431
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcatcag 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||        |||||||    
22687254 tgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtggtatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcag 22687353  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaaga 177  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||    
22687354 attaacaataatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaga 22687431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31579222 - 31578982
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttg-----tacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatca 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||| | |||||||      |||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||    
31579222 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttaatttatacaatgacatcaaaagttcagtcttcatagtatca 31579123  T
96 tca--------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacata 187  Q
    |||        ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||  ||||||   | ||||||||||||||||||  || |||||    
31579122 tcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacaccctataaagtgtaacacttaagactatcacata 31579023  T
188 atatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||    
31579022 atatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgata 31578982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 8861301 - 8861528
Alignment:
9 gaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------ga 100  Q
    |||||||||||||||  || |||| | |  ||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||        ||    
8861301 gaagttaacactatagcatcaaaagtgttatgaataacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttaagtccccatagtatcatcaattaatcaga 8861400  T
101 ttaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactc 200  Q
    ||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||  | |||||||||||||| ||||  || |||| ||||||  |||||    
8861401 ttaacaacaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccgcaaagtgtaacactcaagaccatcacatgatatcagcaactc 8861500  T
201 tgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||    
8861501 tctttgcatgttaaagataccaacgata 8861528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 6546533 - 6546762
Alignment:
7 gtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat--------ca 98  Q
    |||||||||||||||||  || |||| | | | ||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| || | |  ||||||||||||        ||    
6546533 gtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtaacatcaaaagtttactatccatagtatcatcaattcatca 6546632  T
99 gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaac 198  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||| || || |||| ||||||  |||    
6546633 gattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtataacacttaatattatcacatgatatcagcaac 6546732  T
199 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
6546733 tctgtttgtatgttaaagatgccaacgata 6546762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 43925114 - 43925344
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||| | |||||||||||   |||||    ||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||      
43925114 tttttagtgaagttaacattgtagtataaaaaatgttgtgagtaacacctcactgt----acaatgacatcaaaagttcagtctacatagtatcatcaac 43925209  T
99 -----gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatca 193  Q
         || |||||| | |||||||||| |||||||||  ||| || ||||||| | ||||| |||||| || ||| |||||| | ||| |||||||||||    
43925210 tatcagactaacaataatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgcaacacctcacaacgtttaatacttaatacaatcacataatatca 43925309  T
194 ttaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
43925310 tcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 43925344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31520876 - 31520659
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatc--- 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||       
31520876 tttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacactccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagt-cccatagtatcatcaat 31520778  T
98 -----agattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
         | |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || ||||                 |||||||||||||||||  || ||||||||||    
31520777 tcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatcacataatatc 31520695  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
31520694 atcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgata 31520659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10359268 - 10359132
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatt-taattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatat 191  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||  ||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||| |     
10359268 tcatcagatcaacaagactacacttaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacaa 10359169  T
192 cattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
10359168 catcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 10359132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12390783 - 12390622
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtat------- 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| | || |||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||           
12390783 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgtaatgagtaacatcccactgtttgtgcagtgacatcaaaagttatgtccccatagtattatcaat 12390684  T
94 -catcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacac 154  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
12390683 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttcttttaagtgtaacac 12390622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25691597 - 25691462
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||  || |||| |||||    
25691597 tcatcatattaacaaaaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcacatgatatc 25691498  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
25691497 agcaactctgtttgcacgttaaagatgttaacgata 25691462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 12165764 - 12165986
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat-------- 96  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || | ||||   ||||||||            
12165764 tggtgaagttaacactatagcatccaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttaagtcccttaagtatcatcaattcat 12165863  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||         | |||||||||||  |    
12165864 cagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacataatatcagca 12165954  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
12165955 actctgtttgcatgttaaagatgacaacgata 12165986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 44413525 - 44413351
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcatcag 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||| |||  || ||||||||        ||||||     
44413525 tgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacaccccaatgtttgtacactgaaatcaaaagttcggtctccatagtatcttcaattcatcaa 44413426  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacactta 174  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
44413425 attaacaaggctacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 44413351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 98
Target Start/End: Original strand, 29173552 - 29173645
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca 98  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||| | | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
29173552 tggtgaagttaacactgtagtatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatca 29173645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33688406 - 33688180
Alignment:
10 aagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------gat 101  Q
    ||||||||||||||| || |||| | |  |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||| || | ||||||||||||        |||    
33688406 aagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacatcctactgtttgtccagtggcatcaaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagat 33688307  T
102 taacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactct 201  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||  ||| || ||||||| |||||||  || ||||||||||| | ||||  || | || ||||||  ||||||    
33688306 taacaagaatacacttaatctaattttatcatactttgttttaagtgtaacactccataaagtgtaacattcaagactatcatatgatatcagcaactct 33688207  T
202 gtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||    
33688206 gtttgcaagttaaagatgtcaatgata 33688180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Original strand, 26980335 - 26980492
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcat 96  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||| | | ||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||        ||||    
26980335 tggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacggtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcat 26980434  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacac 154  Q
    || |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
26980435 caaattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacac 26980492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 228
Target Start/End: Original strand, 29173699 - 29173765
Alignment:
161 aagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
29173699 aagtgttacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa-atgccaacgata 29173765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 66
Target Start/End: Original strand, 44598378 - 44598437
Alignment:
7 gtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtg 66  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
44598378 gtgaagttaatactataatatcaaaaatgttgtgagtaacactctactgtttggacagtg 44598437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26524476 - 26524383
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca 98  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||| | |||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||| | || ||| |||||||||||||    
26524476 tggtgatgttaacactataacatcaaaaatgttgtgactaacactccattgtttgtgcagtggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatca 26524383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26588119 - 26588026
Alignment:
111 tacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtt 204  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||  || |||| ||||||  |||||||||    
26588119 tacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcaacaactctgtt 26588026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44411503 - 44411458
Alignment:
183 acataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
44411503 acataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgata 44411458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32593191 - 32593127
Alignment:
161 aagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacg 225  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
32593191 aagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacg 32593127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Original strand, 35353263 - 35353351
Alignment:
140 ttttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
35353263 ttttaagtgtaacaccccagaaaatgtaacacttaagactatctcataatatcatcaactatatttgcatgttaaagatgtcaacgata 35353351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 228
Target Start/End: Original strand, 26980482 - 26980549
Alignment:
161 aagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
26980482 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgata 26980549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Original strand, 38053637 - 38053700
Alignment:
161 aagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
38053637 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaaagattccaac 38053700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 228
Target Start/End: Original strand, 37704387 - 37704425
Alignment:
190 atcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
37704387 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgata 37704425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12390612 - 12390567
Alignment:
183 acataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
12390612 acataatatcatcaactcagcttgcatgttaaagatgccaatgata 12390567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 34362292 - 34362228
Alignment:
10 aagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaa 74  Q
    ||||||||||||||  || |||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
34362292 aagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaa 34362228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 22980830 - 22981061
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat-------- 96  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||  || ||||||||||| |||| |||||||||||||||            
22980830 tggtgaagttaacactatagtatcaaaaatacagtgagtaataccccactgtttgagcaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcat 22980929  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| |    
22980930 cagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcataa 22981029  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
22981030 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 22981061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 699190 - 699418
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat--------cag 99  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||        |||    
699190 tgaagttaacactatagcataaaaaatctagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcag 699289  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| ||||    
699290 attaacaagactacacttaatctaattttatcataccttattttaagtgtaacactccacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaact 699389  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
699390 atgtttgcatgttaaagatgccaacgata 699418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 5829930 - 5830160
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataat----ataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    ||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||    
5829930 tttttggtgaagttaacattataattaacataaaaaatgtaatgagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagtttagtcctcatagtatcat 5830029  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    || |||||||| |||||||||||| | |||||||  ||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| |    
5830030 ca-attaacaagactacacttaatctcattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatca 5830128  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
5830129 actctgtttgcatgttaaagattccaacgata 5830160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27318625 - 27318394
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag----- 99  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || | | | || ||||||||||          
27318625 tggtgaagttaacactaaaacataaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatgacatcaaaagtttagttctcacagtatcatcaattcat 27318526  T
100 ---attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
       |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |    
27318525 catattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 27318426  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
27318425 actctgtttgcatgttaaagatttcaacgata 27318394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35826625 - 35826393
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag- 99  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || |||||| || |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||     
35826625 ttttttgtgaagttaatactataacatcaaaaatgtactgagtaacacttcattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagt 35826526  T
100 ------attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatca 193  Q
          |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
35826525 tcatagattaacaataccacatttaatctaattttattctacattgttttaagcgtaacactccacaaagtgtaacccttaagattat--cataatatca 35826428  T
194 ttaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
35826427 tcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgata 35826393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 36866799 - 36867030
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatca--------t 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||        |    
36866799 tggtgaagttaacactataatatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcccgatagtatcaacaattcat 36866898  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    |||| |||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| |    
36866899 cagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatca 36866998  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
36866999 actatgtttgtatgttaaagatgtcaacgata 36867030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 12910383 - 12910619
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagt-----gacatcaaaaattcaatccccatagtatc- 94  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||     |||||||||| |||| ||| |||||||||     
12910383 tttttggtgaagttaaaactataacatcaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtacagtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcg 12910482  T
95 -------atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacata 187  Q
           ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||  || |||||    
12910483 tcaattcatcagattaacatgactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacata 12910582  T
188 atatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
12910583 atatcatcaactctggttgtatgttaaagatgccaac 12910619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7209005 - 7208771
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||||||      
7209005 tttttggtgaagttaacattgtaacataaaaaatgcaacgagtaacaccctaccgtttgtacattgacatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaat 7208907  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||     
7208906 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataaacgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatt 7208807  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
7208806 ttcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgata 7208771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14919670 - 14919439
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag- 99  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| || ||||||||||   ||||||| || | ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||      
14919670 tttttgatgaagttaacattataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttatataatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaac 14919571  T
100 -------attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
           ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||  || ||||||||||    
14919570 tcatcatattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacacctcacaaattgtaatacttaagactatcacataatatc 14919471  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||    
14919470 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 14919439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31705753 - 31705519
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | || ||| | |||||||||||      
31705753 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagtccagtcctc-tagtatcatcaat 31705655  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||    
31705654 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcgtaacatctcacaaaatgtaacacttaagaccatcacataatatc 31705555  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
31705554 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaaagata 31705519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31786788 - 31786553
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| |   | | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||      
31786788 tttttggtgaagttaacactatagcatgaaaaatgtagtgagcactgccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaat 31786689  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||  || ||||||| |||||||   |||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
31786688 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 31786589  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
31786588 atcaactctgattgcatgttaaagatgccaacgata 31786553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22974224 - 22973999
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  || |||||||||  | |||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||| ||||||||      
22974224 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaaagtaatgagtaacatcccactgtttgtacaataacatcaaaagttcaattctcatattatcatcaac 22974125  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          || |||||| |||||||||||| ||||||||| |||  || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||     
22974124 tcatcagaataacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgttataagcgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactattacataatatt 22974025  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
22974024 atcaactctgtttgcatgttaaagat 22973999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 36860460 - 36860692
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcat 96  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||        ||||    
36860460 tggtgaagttaacactatagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcat 36860559  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattcta-cattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatt 195  Q
    || | |||||| | |||| ||||| ||||||||| ||| | || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||     
36860560 catactaacaagagtacatttaatctaattttatcctaccttttttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatc 36860659  T
196 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
36860660 aactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgata 36860692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21088907 - 21088673
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatca----- 95  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||         
21088907 tttttggtgaagttaa-actgtagtataaaaaatgttgtgagtgacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaat 21088809  T
96 ---tcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
       ||| | |||||| | |||| ||||| ||| ||||| |||| || ||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
21088808 tcatcatactaacaagaatacatttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatc 21088709  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
21088708 atcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgata 21088673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23954907 - 23954697
Alignment:
26 ataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtac-agtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag--------attaacaaaactacact 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||         |||||||| ||||||||    
23954907 ataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttttactagtggcatcaaaagttcagtttccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacact 23954808  T
117 taatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaag 216  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
23954807 taatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa- 23954709  T
217 atgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||    
23954708 atgccaacgata 23954697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30969462 - 30969235
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| | ||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||          
30969462 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttatacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcat 30969363  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
      ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||  |    
30969362 cagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagca 30969263  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||    
30969262 actttgtttgcatgttaaagatgtcaac 30969235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Original strand, 5837592 - 5837821
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag----- 99  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||| | | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||          
5837592 tggtgaaggtaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaatttcagtctccatagtatcatcaattcat 5837691  T
100 ---attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
       |||||||| | |||||||||| |||||| || ||||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||  |    
5837692 catattaacaagaatacacttaatctaatttaatcctacattgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagca 5837791  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacga 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
5837792 actctctttgcatgttaaagatgacaacga 5837821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22255214 - 22255450
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatat-aaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat--- 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || |||||||||| | || ||||||||| || |||||||| |||| | | |||| ||||||       
22255214 tttttggtgaagttaacattataacatcaaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcagttctcatattatcatcaa 22255313  T
97 -----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatat 191  Q
         ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||  || || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
22255314 ttcatcagattaacaagactacacttaatctaattttagcctattttgttataagcgtaacaccacacaaagtgtaacacttaaaactattacataatat 22255413  T
192 cattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||    
22255414 catcaactatgtttgcatgttaaatattccaacgata 22255450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23116357 - 23116129
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------g 99  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||| |||| |   |||||||||||||        |    
23116357 tgaagttaacattataacatcaaaactgtagtgagtagcaccccactgtttgtacagtggaatcaaaagttcagtttacatagtatcatcaattcatcag 23116258  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |    
23116257 attaacaatattacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaat 23116158  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
23116157 ctgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 23116129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17158172 - 17157938
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||  ||   ||||||||||        
17158172 ttttttgtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcg-tcattatagtatcattaat 17158074  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||  ||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||     
17158073 tcatcagattaacaagactacacttagtataattgtatcttaccttattataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagaccatcacataatatt 17157974  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
17157973 atcaactctgtttgcatgataaagatttcaacgata 17157938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 19119896 - 19120127
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat-------- 96  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| | | |  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||            
19119896 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgctagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtgtcatcaattcat 19119995  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| | || ||||| | ||||||||| |||| || |||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||  |    
19119996 cagattaacaagaataaacttactctaattttatcctaccttgttttaagtataacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagca 19120095  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
19120096 actccgtttgcatgttaaagatgccaacgata 19120127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 40133422 - 40133653
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatca--------t 96  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||| |||||        |    
40133422 tggtgaagttaacattatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatggcatcaaaagttcagtccccataatatcaacaattcat 40133521  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    |||| |||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| |    
40133522 cagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatca 40133621  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
40133622 actatgtttgtatgttaaagatgtcaacgata 40133653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 33908270 - 33908501
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    ||||||||| |||||||||  || |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||          
33908270 tggtgaagtcaacactatatcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattatt 33908369  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
      ||||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||| || ||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||  ||  ||||||||| | |    
33908370 cagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcgtca 33908469  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
33908470 actatgtttgtatgttaaagatgccaacgata 33908501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 5112455 - 5112358
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
5112455 tttttggtgaagttaatactataacataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatca 5112358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 35504498 - 35504633
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||     
35504498 tcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcctaccatattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatt 35504597  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || || ||||||||||||||||||||  ||||||||    
35504598 atcaaatctgtttgcatgttaaagatttcaacgata 35504633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 39572861 - 39573031
Alignment:
10 aagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcatcagat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||        |||||||||    
39572861 aagttaatactataatataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtgacatcaaaagttcagttctcatagtatcataaattcatcagat 39572960  T
102 taacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacact 172  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||   ||||||||||||||||    
39572961 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacact 39573031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28416663 - 28416490
Alignment:
7 gtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-------- 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||| ||||||| || || ||||||||            
28416663 gtgaagttaacactataatatcaaaagtattgtgagtaacatcccactgtttgtacagtggaatcaaaagttcaatctccttaatatcatcaattcatca 28416564  T
99 gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacact 172  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
28416563 gattaacaagaatacacttaatctaattttattctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 28416490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1429286 - 1429126
Alignment:
2 ttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatc------- 94  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||           
1429286 ttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacactggcatcaaaaattcagtctccatagtatcatcaatt 1429187  T
95 -atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacac 154  Q
     |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||    
1429186 catcaaattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 1429126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25500968 - 25500833
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
25500968 tcatcagattaacaagaataaacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagatcatcacatgatatc 25500869  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |  |||| | |||  |||||||||||||||||||||    
25500868 agcaactttctttagatgttaaagatgccaacgata 25500833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 32563189 - 32563408
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcatcag 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||        |||||||    
32563189 tgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtctgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcag 32563288  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||   |||||||||||||||         | |||| ||||||  ||||    
32563289 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacagcccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaact 32563379  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
32563380 ctgtttgcatgttatagatgccaacgata 32563408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35511612 - 35511389
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatca--------tcag 99  Q
    ||||||||||| ||||| || || | | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||| |||||        ||||    
35511612 tgaagttaacattataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagtcatcatactatcaccaattcatcag 35511513  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| | || || ||| ||| |||||||  |||||| ||||||||     |  || |||||||||||| || |    
35511512 attaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaat 35511418  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
35511417 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 35511389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38528371 - 38528144
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------g 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | || |||||||||| | | ||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||        |    
38528371 tgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccattgtttatacagtgacatcaaaagttcagtctc-atagtatcatcaattcatcag 38528273  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||| || ||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |    
38528272 attaacaagactgcacttaatctaattttatcttaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaat 38528173  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||| ||||||||||||  ||||||||    
38528172 ctatttacatgttaaagatatcaacgata 38528144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 26268111 - 26268342
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat-------- 96  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| | |  |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||            
26268111 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttttgagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagtttagtccacatagtatcatcaattcat 26268210  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| | |||| |||||  ||||||||  ||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||  |    
26268211 cagattaacaagaatacaattaatcaaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccgcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagca 26268310  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
26268311 actatgtttgcatgttaaagatgtcaaggata 26268342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 8436999 - 8437233
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |  ||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||      
8436999 tttttggtgaaattaacactatagcttccaaagtgtagtgagtaacatcccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcattatatcatcaac 8437098  T
99 -----gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatca 193  Q
         |||| |||||||||  |||||| ||||||||| || | || |||||||    ||||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |    
8437099 catcagatttacaaaactatgcttaatctaattttatcctgccttgttttaagttatacaccccacaatgtgtaacacttaagattatcacataatatga 8437198  T
194 ttaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
8437199 tcaactctgtttgaatgttaaagatgccaacgata 8437233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 24886137 - 24886298
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta-------- 92  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||            
24886137 tttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaac 24886236  T
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacac 154  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||    
24886237 tcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacac 24886298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13956404 - 13956269
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  || ||| ||| |||||||   |||||| |||||||||||||  || | ||||||||    
13956404 tcatcagattaacaaaacttcacttaatctaattttattttatcttgtttcaagtgtaacaccctacaaagcgtaacacttaagactatcatataatatc 13956305  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||||||||    
13956304 atcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgata 13956269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15992631 - 15992447
Alignment:
52 actgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattatttt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||        ||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| ||  |||    
15992631 actgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttgatctaattttattctaccttgattt 15992532  T
144 aagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
     || | |||||  |||||||||| ||||||||||  ||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
15992531 gagtgcaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcaggaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 15992447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 9200270 - 9200492
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcat 96  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || | ||| | |||||        ||||    
9200270 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtacagtgacatcaaaagtttagtcctcttagtatcatcaattcat 9200369  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    || |||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||   |||||||||||||||         | |||| ||||||  |    
9200370 catattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacattccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagca 9200460  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
9200461 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 9200492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 15724523 - 15724752
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||      
15724523 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagttttgtgagtaacaccccactgtttatacaatgacatcaaag-ttcagtccc-ataatatcatcaat 15724620  T
100 -------attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
           |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  | ||||||||| || ||||||  || | || |||||    
15724621 tcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttattttaagtataacacgccccaaagtgtatcaattaagactatcatatgatatc 15724720  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    |  |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
15724721 aacaactttgtttacatgttaaagatgtcaac 15724752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6824586 - 6824396
Alignment:
38 gtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaat--tcaatccccatagtatcatca--------gattaacaaaactacacttaatttaattt 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||  |||||||||||||        ||||||||| | |||||||||| ||||||    
6824586 gtgagtaacactccactgtttgtacagtgacatcaaaagtgttcagtcttcatagtatcatcaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattt 6824487  T
128 tattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatg 219  Q
    |||  ||| || ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||  |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
6824486 tatcataccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacaagatat-agcaactctgtttgcatgttaaagatg 6824396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 7693267 - 7693489
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||          
7693267 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatcctcttagtatcatcaattcat 7693366  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
      ||||||||  | ||| |||||| |||||||||  ||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||| |         ||| |||| |  |    
7693367 tagattaacatgaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------catgatattagca 7693457  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
7693458 actctgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 7693489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 22019669 - 22019891
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcat 96  Q
    |||||||||||| ||||||  || |||| | | ||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||| || | ||||| |||||        ||||    
22019669 tggtgaagttaaaactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtatagtgacatcaaaagttaagtccccttagtatcatcacttcat 22019768  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    || |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||         | |||| ||||||  |    
22019769 catattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtataacac---------tcacatgatatcagca 22019859  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
22019860 actctatttgcatgttaaagatgccaacgata 22019891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 27330343 - 27330562
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat-------- 96  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |  ||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||| ||  |||||||||||            
27330343 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgt--tgagtaacaccttactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcat 27330440  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||  ||  |||||| ||||||||||  ||  ||| ||||||  |    
27330441 cagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagca 27330540  T
197 actctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
27330541 actctatttgcatgttaaagat 27330562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 42342775 - 42342989
Alignment:
10 aagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat--------cagat 101  Q
    ||||||| ||||||| || |||||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||        |||||    
42342775 aagttaatactataacatcaaaaatgttgtgagtaataccccactgtttatacagtgacatcaaaaaatt--tccccttagtatcatcaattcatcagat 42342872  T
102 taacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactct 201  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||  ||| || ||||||| |||| ||| |||||||||||||||         | |||| ||||||| ||||||    
42342873 taacaagaatacacttaatctaattttatcttac-ttgttttaagtgtaatacaccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcatcaactct 42342962  T
202 gtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
42342963 gtttgcatgttaaagatgtcaacgata 42342989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8742025 - 8741792
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactct-actgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatc--------a 95  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| | | ||||||||||| |  | |||||||||| || |||||||| |||| || ||||||||||        |    
8742025 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattca 8741926  T
96 tcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacat-aatatcat 194  Q
    ||| |||||||| | |||| ||||| ||||||| |  ||| || ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||  || |||| | ||| |     
8741925 tcaaattaacaagaatacaattaatctaattttgtcataccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgattatgag 8741826  T
195 taactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
8741825 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 8741792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 224
Target Start/End: Original strand, 35934028 - 35934160
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaatttt-attctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatat 191  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || |||| || |||| || ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||  || |||| ||||    
35934028 tcatcagattaacaagaatacacttaatctagtttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatat 35934127  T
192 cattaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    ||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
35934128 cagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaac 35934160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1429136 - 1429069
Alignment:
161 aagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
1429136 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactttatttgcatgttaaagatgccaacgata 1429069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2888471 - 2888352
Alignment:
109 actacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgca 208  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| || ||| |||  |||||   || ||||||||||||||||||  || | |||||||||| || | ||||||||    
2888471 actacacttaatctaattttattttaccttgtttcaagtttaacattccataaagtgtaacacttaagactatcagataatatcatcaaatatgtttgca 2888372  T
209 tgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
2888371 tgttaaagatgtcaacgata 2888352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Original strand, 8466782 - 8466938
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcat 96  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| | | |||| |||||| |  || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||        ||||    
8466782 tggtgaagttaacactgtaacatcaaaagtgttgtgaataacacccc-ctctttgtacagtggtatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcat 8466880  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacac 154  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||    
8466881 caaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaaatgtaacac 8466938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 98
Target Start/End: Original strand, 25668687 - 25668779
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca 98  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| | | ||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||    
25668687 tggtgaagttaacact-taacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgaacagtggcatcaaaagttcagtccccttagtatcatca 25668779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 14409369 - 14409310
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaac 152  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
14409369 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaac 14409310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 224
Target Start/End: Original strand, 25889584 - 25889634
Alignment:
174 aagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
25889584 aagattatgacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaac 25889634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 224
Target Start/End: Original strand, 24886310 - 24886351
Alignment:
183 acataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
24886310 acataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 24886351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 228
Target Start/End: Original strand, 25669799 - 25669844
Alignment:
183 acataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
25669799 acatgatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 25669844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14409292 - 14409248
Alignment:
184 cataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
14409292 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 14409248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 98
Target Start/End: Original strand, 11898073 - 11898132
Alignment:
39 tgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca 98  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
11898073 tgagtaacaccctactagttgtacagtgacatcaaaagtttagtcctcatagtatcatca 11898132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 26317826 - 26317779
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacac 48  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||    
26317826 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataacgagtaacac 26317779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 43308793 - 43308610
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatc------ 94  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| || |||||| || ||| |||||| | |||||| ||||| || |||||||| |||| ||| |||||||||          
43308793 tttttagtaaagttaacattataacatcaaaaatgtaatgaataacaccc-actgttcgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaac 43308695  T
95 --atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaaga 177  Q
      ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| || || |||| |||||||     ||||||||||||||||||    
43308694 tcatcagcttaacaaaactatacttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccctgaaaagtgtaacacttaaga 43308610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46297910 - 46297679
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||| |||| ||||| |||||||||||          
46297910 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcgtcaaaagttcagtccccgtagtatcatcaattcat 46297811  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
      ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |    
46297810 tagattaacaaaactacacttaatcaaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 46297711  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
46297710 actctgtttgcatgttaaagattccaacgata 46297679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26941412 - 26941177
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||| | |||||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||        
26941412 tttttggtgaagttaacactataaaatcaaaattataatgagtaacaccccactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcctcatggtatcattaat 26941313  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||||| || ||| |||||||||||||||| |  || | ||||||||    
26941312 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaatacctcataaagtgtaacacttaaaactatcatataatatc 26941213  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
26941212 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgata 26941177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 34132959 - 34133194
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||      
34132959 tttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaat 34133058  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          || ||| || | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
34133059 tcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 34133158  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||||||||    
34133159 atcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgata 34133194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 25579767 - 25579998
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag----- 99  Q
    |||||||||||| ||||||  || |||| | | |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||         
25579767 tggtgaagttaatactatagcatcaaaagtgttgtgaataacattctactatttatacagtgacatcaaaagttcagtccccatattatcatcagtttat 25579866  T
100 ---attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
       |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || |||| || |||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |    
25579867 tagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttttagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactattacatgatatcagca 25579966  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
25579967 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 25579998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40552411 - 40552176
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||      
40552411 tttttggagaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaat 40552312  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  || || |||||||||||   ||||| |||||||||||| |||  | ||||||||||    
40552311 tcatcagattaacaacactacacttaatttaattttatcttagcttgttataagcgtaacatcccacaacgtgtaacacttaggattgtcacataatatc 40552212  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
40552211 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgata 40552176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24489114 - 24488883
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| | |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||      
24489114 ttttttgtgaagttaagactatagtattaaaaatgttgtgagtaacattccactgtttgcacaatgacatcaaaagttcagtccccatattatcatcaat 24489015  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          || |||||| | |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  || ||| ||||||    
24489014 tcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacacctcacaaggtgtaacacttaagactatcacacaatatc 24488915  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||    
24488914 atcaactctatttgcatgttaaagatgccaac 24488883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 48354969 - 48355190
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat-------- 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| | | |||||||||| || |||||||| |||| | | |||||||||||            
48354969 tggtgaagttaacactataatattaaaaatgtaatgagtaacaccccattgtttgtacaatggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcat 48355068  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||| || || |||  |||||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |    
48355069 cagattaacaagactacacttagtctaattttatcctaccttgttataaatgtaacataccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 48355168  T
197 actctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||    
48355169 actctgtttgcatgttaaagat 48355190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7327635 - 7327399
Alignment:
1 tttttggtgaagttaa-cactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca- 98  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || |||| | | ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     
7327635 tttttagtgaagttaaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattatttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaa 7327536  T
99 -------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatat 191  Q
           ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| || |||  || |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||| ||||    
7327535 ttcatcggattaacaagaatacacttaatttatttttatcctaccttctttctagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatat 7327436  T
192 cattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
7327435 caacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgata 7327399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 37203091 - 37203327
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatc--- 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||       
37203091 tttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 37203190  T
98 -----agattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
         |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
37203191 tcataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttttagtgtatcaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 37203290  T
193 attaact-ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || || |  |||||| |||||||||||| ||| ||||    
37203291 atcaaatattgtttgtatgttaaagatgtcaatgata 37203327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3655354 - 3655119
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||      
3655354 tttttgataaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 3655255  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| |  || |||| |||||    
3655254 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttagaagcgtaacacaccacaaaatgtaacacttaaaactatcacatgatatc 3655155  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || | ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
3655154 atcagctctgtttgcatgttaaagattccatcgata 3655119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 3362277 - 3362514
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||      
3362277 tttttggtgaagttaacactatagcatcagaaatatagtgagtaacatcccactatttgtacagtggcatcaaaagttcactcctcatggtatcatcaat 3362376  T
101 t--------taacaaaactacact--taatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataata 190  Q
    |        |||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||  || |||||| |    
3362377 tcatcatgttaacaagactacactattaatctaattttatcctaccttattttaagtgaaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataaca 3362476  T
191 tcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
3362477 tcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 3362514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4761801 - 4761575
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||      
4761801 tttttggtgaagttaatactataatatcaaaaatgtaatgagtaacacttcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaac 4761702  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaaca-catcacaaagtgtaacacttaagataattacataatat 191  Q
          ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||  ||||| |  |||||||| ||||||||||||  || |||||||||    
4761701 tcatctgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacacccccacaaagtataacacttaagactatcacataatat 4761602  T
192 cattaactctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||    
4761601 catcaactatatttgcatgttaaagat 4761575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 37157732 - 37157967
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||      
37157732 tttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtt-gtacagtggcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaat 37157830  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
37157831 ttataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 37157930  T
193 attaact-ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || || |  |||||| |||||||||||||||| ||||    
37157931 atcaaatattgtttgtatgttaaagatgccaatgata 37157967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 47481546 - 47481781
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||| | |||||||||| | ||||||||||| || |  || |||||||||||||      
47481546 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaatgacatcaaaagtttagccctcatagtatcatcaat 47481645  T
101 t--------taacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |        |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
47481646 tcatcatgttaacaagactacacttaatataattttattataccttattctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 47481745  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
47481746 ataaactctatttgcatattaaagatttcaacgata 47481781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42506214 - 42505992
Alignment:
14 taacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------gattaac 105  Q
    ||||||||||| || |||| | || ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||        |||||||    
42506214 taacactataacatcaaaattgtaatgagtaataccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaac 42506115  T
106 aaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgttt 205  Q
    || |||||||||||| ||||||||| |||| ||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||  ||||     
42506114 aagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttc 42506015  T
206 gcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
42506014 gcatgttaaagattccaacgata 42505992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 53229204 - 53229069
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||  || ||||| ||||    
53229204 tcatcagattaacaagactacagttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaactccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatagtatc 53229105  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
53229104 atcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgata 53229069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 45174527 - 45174765
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtg--agtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| | | |||  |||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||    
45174527 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgtgagtaacacttcactgtttgtacagtagcatcaaaagttcagtccccatagtatcatca 45174626  T
99 --------gattaacaaaactacacttaatttaatttt-attctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataat 189  Q
            ||||||||| | |||| ||||||||||||| || |||| || ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||  || | || ||    
45174627 attcatcagattaacaagaatacatttaatttaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacactctacaaagtgtaacacttaagactataatatgat 45174726  T
190 atcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
45174727 atcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgata 45174765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 2007964 - 2008191
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------g 99  Q
    ||||||||||||||||   | |||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||        |    
2007964 tgaagttaacactatagcgttaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatccccatagcatcatcaattcatcag 2008063  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    |||||||| | || ||||||| ||||||||| |||| |  ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||  ||||    
2008064 attaacaagaatatacttaatctaattttatcctacctcgttttaagtgta-cactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaact 2008162  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
2008163 ctgtttgcatgttaaagatgacaacgata 2008191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Original strand, 11466885 - 11467081
Alignment:
38 gtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat--------cagattaacaaaactacacttaatttaatttta 129  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||        ||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
11466885 gtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttta 11466984  T
130 ttctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacga 226  Q
    | |||| || ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
11466985 tcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgtttaagataccaacga 11467081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 35844354 - 35844581
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcat 96  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||        ||||    
35844354 tggtgaagttaacactataacaacaaaaatgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtgacatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcat 35844453  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaa-ttttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatt 195  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| |||| |  ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |    
35844454 cagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctacctagttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagat-atcacatgatatcagt 35844552  T
196 aactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
35844553 aactttgtttccatgttaaagatgtcaac 35844581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52040974 - 52040839
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
52040974 tcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacatagtgtaacacttaagactatcacataatatc 52040875  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
52040874 atcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 52040839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 29099383 - 29099605
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcat 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||        ||||    
29099383 tggtgaagttaacactataacataaaaaatgtcgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatctaaagttcagtccccttagtatcatcaattcat 29099482  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||||||||  | | |||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||       | |||| ||||||  |    
29099483 catattaacaagaatacacttaatttaattttatcgtgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgta--actt-------tcacatgatatcagca 29099573  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
29099574 actctgtttgcatgttaaagatgctaacgata 29099605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22446216 - 22445982
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccc-catagtatcatcag 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||     
22446216 tttttggtgaagttaacattatatcatcaaaaatatagtgagtaacaccccact-tttgtacagtggcatcaaaagttcaaaccctcatagtatcatcaa 22446118  T
100 --------attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatat 191  Q
            || || || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||  || | |||||||    
22446117 ttcatcatataaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac-tcacaatgtataacactcaagactatcatataatat 22446019  T
192 cattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||||    
22446018 catcaactatttttgcatattaaagataccaacgata 22445982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22622770 - 22622635
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || ||| ||| |||||||  ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
22622770 tcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatcacataatatc 22622671  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
22622670 atcaaatctgtttggatgttaaagatgtcaacgata 22622635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 33698277 - 33698412
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||    
33698277 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcatgatatc 33698376  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
33698377 ggcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 33698412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 228
Target Start/End: Original strand, 44891623 - 44891756
Alignment:
95 atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcat 194  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||     
44891623 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcag 44891722  T
195 taactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
44891723 caactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgata 44891756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33378931 - 33378702
Alignment:
7 gtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtat--------catca 98  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||  || | | | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||        |||||    
33378931 gtgaagtcaacactatagtatcaaaagtgtagtgagtagtaccccaatatttgtacggtgacatcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatca 33378832  T
99 gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaac 198  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  ||  |||||||| ||||||||  ||  |||||| |||| |||    
33378831 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaagaagtgtaatacttaagactatcgcataatctcatcaac 33378732  T
199 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||    
33378731 tatgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 33378702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 224
Target Start/End: Original strand, 39282776 - 39282907
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
39282776 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 39282875  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    || || | ||||||| ||||||||||| ||||    
39282876 atcaaatatgtttgcctgttaaagatgtcaac 39282907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24708169 - 24708032
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacactta--atttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataata 190  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||| |||| || ||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
24708169 tcatcagattaacaagactacacttttgatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaacaatcacataata 24708070  T
191 tcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
24708069 tcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgata 24708032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 51213133 - 51212955
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatc------ 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || | ||| |||||||||          
51213133 tttttggtgaagttaacactgtaacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatggcatcaaaagttgagtcctcatagtatcatcaac 51213034  T
95 --atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacac 171  Q
      ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || |||| |||||||  |||||||||||||||    
51213033 tcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacac 51212955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 54505832 - 54506066
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||| | | | ||| || | ||||||||||||||||  || ||||||||||| |      
54505832 tttttgttgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttatagaatgacatcaaaaattcag-cctcatagtatcataaat 54505930  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          | ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
54505931 acatcgggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 54506030  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
54506031 atctactttatttgcatgttaaagattccaacgata 54506066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Original strand, 4015491 - 4015715
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcatcag 99  Q
    ||||||||||||||||  || |||| | | ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||        ||||||     
4015491 tgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtagagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcat 4015590  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    |||||||| | || | ||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||  ||  |||  |||||  ||||    
4015591 attaacaagaatataattagtctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcattgtatcaacaact 4015690  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacg 225  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
4015691 -tgtttgcatgttaaagatgccaacg 4015715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 32373594 - 32373729
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||  || |||| |||||    
32373594 tcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtgacacttaagactatcacatgatatc 32373693  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
32373694 agcaactctgtttgcatattaaagatgtcaacgata 32373729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 43348381 - 43348516
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||   || ||||||| ||||||||||  || |||| |||||    
43348381 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtgacacttaagactatcacatgatatc 43348480  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
43348481 aacaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgata 43348516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21009954 - 21009719
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| || |||||| || |||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||| ||||  || |||| ||||||||      
21009954 ttttttgtgaatttgacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatattatcatcaat 21009855  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          | ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||  || || ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
21009854 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataacttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 21009755  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||  | |||||||||||||||| |||||||||    
21009754 atcaacaatatttgcatgttaaagattccaacgata 21009719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 44186653 - 44186492
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatc------ 94  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||| | | ||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||          
44186653 tttttggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccgctgtttatacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaat 44186554  T
95 --atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacac 154  Q
      |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||  |||||||    
44186553 tcatcaaattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacac 44186492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11357513 - 11357298
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactct-actgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca----- 98  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||| |||| ||  |||||||||||||         
11357513 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtatagtgagtaacacccccactgtttgtacagttgcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattca 11357414  T
99 ---gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatt 195  Q
       ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||                 ||||||||||||||  || ||||||||||||     
11357413 tcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttattttaag-----------------tgtaacacttaagactatcacataatatcatc 11357331  T
196 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
11357330 aactctgtttgcatgttaaagataccaacgata 11357298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 228
Target Start/End: Original strand, 1089819 - 1089953
Alignment:
95 atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaaca-catcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatca 193  Q
    ||||||| ||||  |||||| | ||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
1089819 atcagatcaacaggactacattaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatca 1089918  T
194 ttaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
1089919 acaactctatttgcatgttaaagatgccaacgata 1089953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54828852 - 54828622
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag- 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||| | || ||||  |||  ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||      
54828852 tttttggtaaagttaacactataacataaaaa-tgtaatgagtaacaccccaccgtttaaacaacgacatcaaaaattcattcttcatagcatcatcaat 54828754  T
100 -------attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
           || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||||||   ||||||||||||||||||| |  || | ||||||||    
54828753 tcatcatatgaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaaactatcaaataatatc 54828654  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    || |||| |||||| |||||||| || |||||    
54828653 atcaactatgtttgtatgttaaaaattccaac 54828622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 21193634 - 21193856
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat-------- 96  Q
    |||||||||||||||| |   || |||| | | ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||            
21193634 tggtgaagttaacactgttgaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtagagtgacatcaaaagttcagtccccatggtatcattaattcat 21193733  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacactt-aagataattacataatatcatt 195  Q
    ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  || ||||  |||||||| ||||  || | || ||||||      
21193734 cagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccataaaggataacacttaaagactatcatatgatatcagc 21193833  T
196 aactctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||    
21193834 aactctgtttgcatgttaaagat 21193856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 46994754 - 46994588
Alignment:
60 tacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaa 151  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||        ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || |||| ||||    
46994754 tacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaa 46994655  T
152 cacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    | |  |||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| || | |||||||||| |||||||    
46994654 cgccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattatgtttgcatgctaaagat 46994588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 27480531 - 27480370
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatc------ 94  Q
    |||||||| |||| |||||||||| || |||| |||| |||||| ||  | | ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||          
27480531 tttttggtaaagtcaacactataacatcaaaagtataatgagtagcatccaattgtttgtacggtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaat 27480432  T
95 --atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacac 154  Q
      |||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
27480431 tcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 27480370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 38591822 - 38591957
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||  || ||| ||| |||| ||  ||||||  || ||||||||||  || ||||||||||    
38591822 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtttcaagtgtaataccccacaaaacgtgacacttaagactatcacataatatc 38591921  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || || ||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
38591922 atcaaatctatttgcatgtcaaagatgacaacgata 38591957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20373229 - 20373161
Alignment:
160 aaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
20373229 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgata 20373161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 29163942 - 29164068
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||         | |||| |||||    
29163942 tcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatc 29164032  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
29164033 agcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgata 29164068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 22450996 - 22451223
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag----- 99  Q
    ||||||||| |||||||||  || |||| | ||||||||| |||   ||||||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||          
22450996 tggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctcactgtttgtatggtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcat 22451095  T
100 ---attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
       |||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||| |||||||  ||  |||||||||| |||| |  ||   |||||||||| |    
22451096 catattaacaagactgcacttaatctaattttaccttaccttgttttaagtgtaacaccccagtaagtgtaacatttaacactatcgtataatatcatca 22451195  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||    
22451196 actatgtttgcatgttaaagatgtcaac 22451223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 20373448 - 20373351
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||  ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||| |||||||||    
20373448 tttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatggtatcatca 20373351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14586722 - 14586643
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacact 172  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
14586722 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 14586643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 223
Target Start/End: Original strand, 53176178 - 53176308
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | || | |||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||  || |||| |||||    
53176178 tcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaacctcattttaaatataacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 53176277  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaa 223  Q
    |  |||||| ||| ||| |  ||||||||||    
53176278 agcaactctatttacatatacaagatgccaa 53176308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11835678 - 11835562
Alignment:
95 atcagattaacaaaactacacttaatttaat-tttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatca 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||| || ||||||| ||||||    ||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||    
11835678 atcatattaacaaaaatacacttaatctaatatttatcctaccttgttttaagtgtaacaacctacaaagtgtaacaattaagactatcacatgatatca 11835579  T
194 ttaactctgtttgcatg 210  Q
    | |||||| ||||||||    
11835578 tcaactctatttgcatg 11835562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 228
Target Start/End: Original strand, 40936165 - 40936232
Alignment:
161 aagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
40936165 aagtgtaacacttaagactatcacatgatattagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgata 40936232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 43976033 - 43975861
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------g 99  Q
    |||||| |||||||||  || |||| | ||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||        |    
43976033 tgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactatttgtacgatgacatcaaaagtttaatcctcataatatcatcaattcatcag 43975934  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacact 172  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||  ||  || ||||||| |||||||  || |||||||||||||    
43975933 attaacaaaattgcacttaatctaattttatcttatcttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacact 43975861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 36012261 - 36012398
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaatttt-attctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatat 191  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||| || |||| || |||| || ||||||   |||||| ||||||||||||||  || | || ||||    
36012261 tcatcagatgaacaagaatacacctaatctaatttttatcctaccttgttttcagtgtaacatcccacaaaatgtaacacttaagactatcaaatgatat 36012360  T
192 cattaactct-gtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
36012361 cagcaactcttgtttccatgttaaagatgccaacgata 36012398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Original strand, 40936019 - 40936111
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatc 97  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| | | | |||||||||   | ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
40936019 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctcattgtttatacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 40936111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11357138 - 11357067
Alignment:
157 cacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||| ||||  || | |||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||    
11357138 cacaaagtgtaacactcaagactatcatataatatcatcaactctggttgtatgttaaatatgccaatgata 11357067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 51212733 - 51212698
Alignment:
183 acataatatcattaactctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
51212733 acataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 51212698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27480350 - 27480279
Alignment:
161 aagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactct----gtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||| |    |||||||||||||||||||||||||||    
27480350 aagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatatatgtttgcatgttaaagatgccaacgata 27480279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44186479 - 44186434
Alignment:
183 acataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
44186479 acatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgata 44186434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14586628 - 14586596
Alignment:
196 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
14586628 aactatgtttgcatgttaaagatgccaacgata 14586596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2325534 - 2325313
Alignment:
7 gtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcagattaaca 106  Q
    |||||||||||| ||||| || | |||| || |||||||||| | | |||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||    
2325534 gtgaagttaacaatataacatcataaatgtattgagtaacaccccattgtttgtacactggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaaattaaca 2325435  T
107 aaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttg 206  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || | ||||||    
2325434 agactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttg 2325335  T
207 catgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
2325334 catgttaaagattacaacgata 2325313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29242308 - 29242073
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||| ||  |||||||||||||      
29242308 tttttggtgaagttaaaactataacataaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtacagtggtatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaat 29242209  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||    
29242208 tcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatc 29242109  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
29242108 atcaactctggttgtatgttaaagatgtcaacgata 29242073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 228
Target Start/End: Original strand, 4763699 - 4763899
Alignment:
36 tagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtat--------catcagattaacaaaactacacttaatttaattt 127  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
4763699 tagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagttcccatagtataatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattt 4763798  T
128 tattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgat 227  Q
    |||||||| || ||| ||| ||| |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||    
4763799 tattctaccttgtttcaagtgtagcaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattctttttgcatgttaaagatgctaacgat 4763898  T
228 a 228  Q
    |    
4763899 a 4763899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 37905741 - 37905978
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||      
37905741 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaacgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 37905840  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatc--acaaagtgtaacacttaagataattacataata 190  Q
          ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |  ||  |||||||    
37905841 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccccacaaagtgtaacacttaaaactatcgcataata 37905940  T
191 tcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
37905941 tcattaactctgtttgcatgttaaagattccaatgata 37905978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33551156 - 33550922
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  ||  |||||||||||||      
33551156 tttttagtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcggtcttcatagtatcatcaat 33551057  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaaga-taattacataatat 191  Q
          ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |  |||||||    
33551056 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacgttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactacgt--ataatat 33550959  T
192 cattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
33550958 catcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgata 33550922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 4166959 - 4167190
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatca--------t 96  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||        |    
4166959 tggtgaagttaacattatagtatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcat 4167058  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    |||| |||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| |    
4167059 cagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatca 4167158  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
4167159 actatgtttgtatgttaaagatgtcaacgata 4167190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17071807 - 17071672
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
17071807 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 17071708  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || || | |||||||||||||||||| |||||||||    
17071707 atcaaatttgtttgcatgttaaagattccaacgata 17071672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 3176979 - 3177203
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------g 99  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||        |    
3176979 tgaagttaatactataatatcaaaaatgttttgagtaacacgcaactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcag 3177078  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    | ||| || | |||||||||| |||||||||  ||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||    
3177079 actaagaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 3177178  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
     ||||||||||||||||||| ||||    
3177179 atgtttgcatgttaaagatgtcaac 3177203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 41960973 - 41961108
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
41960973 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatc 41961072  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || || || |||||||||||||||||||||||||||    
41961073 atcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgata 41961108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33709398 - 33709167
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatca--------t 96  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | | | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||        |    
33709398 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgcgagtaacactccactgttagtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaaatatt 33709299  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||  ||  ||| ||||||  |    
33709298 cagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagca 33709199  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
33709198 actctgtttgcatgttaaagatgtcaatgata 33709167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43648415 - 43648180
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||   |||||||||| | ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||      
43648415 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaac 43648316  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || || |||| |||||||  |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||    
43648315 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagtgtaacaccacacaaagtataacacttaagactatcacataatatc 43648216  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||  ||||||||    
43648215 atcaactttgtttccatgttaaagatttcaacgata 43648180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19289493 - 19289268
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| | | |||||||||| ||||||||||| || | | | || ||||||||||      
19289493 tttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtacaatgacatcaaaagttaagttctcacagtatcatcaac 19289394  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          |||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||  ||||||   |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
19289393 tcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttataaatgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 19289294  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    || |||||||| ||||||||||||||    
19289293 atcaactctgtgtgcatgttaaagat 19289268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 44913700 - 44913932
Alignment:
7 gtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctact-gtttgtacagtgacatcaaaaattcaatcccc-atagtatcatca------ 98  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| | |||||||||||   ||| ||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||          
44913700 gtgaagttaacactgtagtatcaaaaatgttgtgagtaacacctcacttgtttgtaaaatgacataaaaagttcaatcccccatagtatcatcaattcat 44913799  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatc-acaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatt 195  Q
      || |||||| | |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||     
44913800 cagactaacaagaatacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaacacccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatc 44913899  T
196 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
44913900 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 44913932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17054166 - 17054031
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
17054166 tcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaanactatcacataatatc 17054067  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || || | |||||||||||||||| | |||||||||    
17054066 atcaaatttgtttgcatgttaaaggttccaacgata 17054031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31570900 - 31570669
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat-------- 96  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||| | | || |||||||| | ||| ||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||            
31570900 tggtgaaattaacactataacattaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttttatagtgacatcaaaagttcagtccacatagtatcatgaattcat 31570801  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||   | |||| ||||||  |    
31570800 cagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactgtcacatgatatcaaca 31570701  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
31570700 actctgtttacatgttaaagatgccaacgata 31570669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41464020 - 41463785
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatc------ 94  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| | | |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||          
41464020 tttttggtgaagttaatactataaaatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaat 41463921  T
95 --atcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
      |||| |||||||| | |||  ||||| |||||||||  ||| || ||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||  || |||| |||||    
41463920 tcatcatattaacaagaatacttttaatataattttatcatactttgttttaattgtaacacctcacaaaatgtaacatttaagactatcacatgatatc 41463821  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
41463820 aacaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 41463785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4264243 - 4264015
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtat--------cat 96  Q
    |||| ||||||||||||||  || |||| | | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||        |||    
4264243 tggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtctccatagtattatcaattcat 4264144  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaaga-taattacataatatcatt 195  Q
    || ||||| || | |||||||||| ||||||||| |||| || |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||      
4264143 catattaagaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtttaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaacatgatatcagc 4264044  T
196 aactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
4264043 aactctgtttgcatgttaaagatgccaac 4264015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4478402 - 4478633
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta-------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||            
4478402 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattgtttgtacagtggcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaat 4478501  T
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaa-ttttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatat 191  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||| ||||     ||||||||||||||||||||   || |||| ||||    
4478502 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaa-----cacaaagtgtaacacttaagtctatcacatgatat 4478596  T
192 cattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
4478597 caccaactctgtttccatgttaaagatgccaatgata 4478633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 44286082 - 44286217
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||| |||||    
44286082 tcatcagattaacaataatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 44286181  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
44286182 aacaactttgtttgcatgttaaatatgctaacgata 44286217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 45327853 - 45327988
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||  ||  |||||||||    
45327853 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacataagactatcgcataatatc 45327952  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
45327953 ataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 45327988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 35958942 - 35959164
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcaga 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || |||| ||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||    | ||    |||||| |    
35958942 tttttggtgaagttgccactataacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatgacattaaaagttcagcatcaat----tcatcata 35959037  T
101 ttaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactc 200  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||| || |||| || || ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||  || |||||||||||| ||||     
35959038 ttaacaagactgcacttaatataattt-atcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacagttaagactatcacataatatcatcaacta 35959136  T
201 tgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||    
35959137 tgtttgcatgttaaagatttcaacgata 35959164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43771009 - 43770787
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta-------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| || ||            
43771009 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttatacagtggcatcaaaagttcagtccccttaatatcatcaat 43770910  T
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||         | |||| |||||    
43770909 tcatcagattaacaagaatatacttaatttaattttatcctgccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacac---------tcacatgatatc 43770819  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 224  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||    
43770818 agcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 43770787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 214
Target Start/End: Original strand, 31861985 - 31862106
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
31861985 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttaacatacattgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaattatcacataatatc 31862084  T
193 attaactctgtttgcatgttaa 214  Q
    || || ||||||||||||||||    
31862085 atcaagtctgtttgcatgttaa 31862106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 33902105 - 33902319
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat-------- 96  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| || | |||||||||| | ||||||||||| |||| ||| || ||||||||            
33902105 tggtgaagttaacacta--acataaaaaatgtagtgagtaataccccactgtttgtaaaatgacatcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcagttcat 33902202  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| |||| | |||||  |||||||| |||| || ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
33902203 cagattaacaagactatatttaatcgaattttatcctaccttgttttaagggtagcaccccacaaagtgtaacacttaatagtatcacataatatcatta 33902302  T
197 actctgtttgcatgtta 213  Q
    ||||||||| |||||||    
33902303 actctgtttccatgtta 33902319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 41465634 - 41465769
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||| ||||| |||| |||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||||    
41465634 tcattagattcacaagactgaacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatc 41465733  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||||||||    
41465734 atcaattatgtttgcatgttaaagatgccaacgata 41465769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19424794 - 19424573
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| | | ||||| || |||| |||||||| || | ||| |||||||||||||          
19424794 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttatatagtggcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcat 19424695  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
      ||||||||| | ||| |||||| |||||||||  ||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||  |    
19424694 cagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacatttaagactatcacatgatatcagca 19424595  T
197 actctgtttgcatgttaaagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||    
19424594 actctgtttgcatgttaaagat 19424573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 26357617 - 26357845
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatag---tatca-----tcag 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||   |||||     |||     
26357617 tgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacatcccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagttcttatagagttatcaattcatcat 26357716  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaact 199  Q
    |||||||| |  ||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||| ||||||   |||||| |||||||||||| |  || ||||||||| || || |    
26357717 attaacaagatcacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccacaaattgtaacacttaaaactatcacataatattatcaaat 26357816  T
200 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
26357817 gtgtttgcatgttaaagatgccaacgata 26357845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27350108 - 27349930
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta-------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||            
27350108 tttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatgttgtgagtaacaccacactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagt-cccttagtatcatcaat 27350010  T
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacact 172  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | || || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
27350009 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 27349930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 36642070 - 36642256
Alignment:
52 actgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag--------attaacaaaactacacttaatttaatttt--attctacattatt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||         |||||||| | |||||||||| |||||||  || |||| || ||    
36642070 actgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttttatcctaccttgtt 36642169  T
142 ttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
36642170 ttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgataccagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgata 36642256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11366551 - 11366316
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactct-actgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca- 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||  || |||||||||||||     
11366551 tttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaaca-tctcactatttgtataatgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaa 11366453  T
99 -------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatat 191  Q
           | ||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||  || || ||| | ||||||   ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
11366452 ttcatcaggttaacaagactacatttaatataattttatcatatcttgttctaaacataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 11366353  T
192 cattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
11366352 catcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgata 11366316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18258349 - 18258222
Alignment:
101 ttaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactc 200  Q
    ||||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||  || |||| ||||||  |||||    
18258349 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctacatttttttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactc 18258250  T
201 tgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||    
18258249 tctttgcatgttaaagatcccaacgata 18258222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39167533 - 39167304
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatc--- 97  Q
    |||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||| |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||       
39167533 tttttgatgaagttaacagaatagtatcaaaagtattgtgagtaacacctcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 39167434  T
98 -----agattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
         ||| |||||| | |||||||| | |||||||||| ||| || ||||||| ||||||   ||||||||||||||      |  || ||||||||||    
39167433 tcattagagtaacaagaatacacttattctaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaaca------actatcacataatatc 39167340  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
39167339 atcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgata 39167304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 33660529 - 33660360
Alignment:
10 aagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatc--------agat 101  Q
    ||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||||        ||||    
33660529 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcattagat 33660430  T
102 taacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacac 171  Q
    |||||  | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||    
33660429 taacaggaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac 33660360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7006940 - 7006873
Alignment:
161 aagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
7006940 aagtgtaacacttaagaatatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 7006873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18494350 - 18494216
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||||||||| || | | ||||||| || ||||||||| |||| || | ||||| |||| || |||||||| || ||||||||||  || |||| |||||    
18494350 tcatcagattcactagaatacacttgatctaattttatcctaccttgtattaagtgtaa-acctcacaaagagtcacacttaagactatcacatgatatc 18494252  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
18494251 aacgactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 18494216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 19313889 - 19314112
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat-------- 96  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||| | | |||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||            
19313889 tggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactatttatacagtgacatcaaaagttcagtcct-atagtatcatcaattcat 19313987  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  |||||||  |||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||       || |||| ||||||  |    
19313988 cagattaacaagaatacacttaatcgaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact-------atcacatgatatcagca 19314080  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
19314081 actatgtttgcatgttaaagatgtcagcgata 19314112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 13711501 - 13711727
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcat 96  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||| | | ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || | ||| ||| |||        ||||    
13711501 tggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtacagtgacatcaaaagtttagtccacatggtatcatcaattcat 13711600  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
    ||||||||||| | |||| ||||| |||||||||    || | ||||||| |||||||  || ||||| ||| | ||||||  || |||| ||||||  |    
13711601 cagattaacaagaatacatttaatctaattttat----ca-tgttttaagtgtaacaccccataaagtataatagttaagactatgacatgatatcagca 13711695  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
13711696 actctgtatgcatgttaaagatgccagcgata 13711727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 98
Target Start/End: Original strand, 5881609 - 5881669
Alignment:
38 gtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca 98  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||    
5881609 gtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttgagtccccttagtatcatca 5881669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 17054266 - 17054192
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaaca-ctctactgtttgtacagtgacatcaaaa 75  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||    
17054266 tttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtagtaagtaacatctc-attgtttgtacaatgacatcaaaa 17054192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19500921 - 19500850
Alignment:
157 cacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||| ||||||||||||||  || ||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||  |||||||    
19500921 cacaaaatgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctatttacatgttaaagatgttaacgata 19500850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 171 - 402
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||| |||||||||||||          
171 tggtgaagttaacactgtagtataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcat 270  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
      || |||||| | |||| ||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||  || |||||||||||| |    
271 cagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctatcttattttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 370  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
371 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 408481 - 408346
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||    
408481 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtggaacacttaagactatcacacaatatc 408382  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
408381 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgata 408346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 94528 - 94334
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------g 99  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||| ||||||||        |    
94528 tgaagttaacattataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagtttggtccccatactatcatcaattcatgag 94429  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcat 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
94428 attaacaagactacacttaatttaattttattctagcttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactattacataatatcat 94334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3880086 - 3879855
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca------ 98  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||| | | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||          
3880086 tggtgaagttaacattatagtatcaaaagtgttgtgagtaacaccctactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcat 3879987  T
99 --gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatta 196  Q
      || |||||| | || ||||| | ||||||||| |||| || ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |    
3879986 cagactaacaagaatatacttattctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 3879887  T
197 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
3879886 actctgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 3879855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21017263 - 21017028
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||| | | | |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||      
21017263 tttttggtgaagttaacattgtagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccattatttgtacaatggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaat 21017164  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          || |||||| | || ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
21017163 tcatcagactaacaagaataaacttaatctaattttatcctacgttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 21017064  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
21017063 atcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgata 21017028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 1945867 - 1946102
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat---- 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||| | |||||||||| | ||||||||||| ||||  || |||||||||||        
1945867 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatgaat 1945966  T
97 ----cagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
        ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
1945967 tcatcaagttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 1946066  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
1946067 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgata 1946102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4318974 - 4318739
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatc--- 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| | |  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||       
4318974 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcaacccccatagtatcatcaat 4318875  T
98 -----agattaacaaaactacacttaatttaa-ttttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatat 191  Q
         |||||||||| | |||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||| |||||||   | ||||||||||||||||||  || |||| ||||    
4318874 tcattagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctataaagtgtaacacttaagactatcacatgatat 4318775  T
192 cattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgat 227  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
4318774 cagcaactctgttttcatgttaaagatgtcaacgat 4318739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 5627424 - 5627659
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtat------- 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||| ||||  || ||||||||           
5627424 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacaccccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatagtattatcaat 5627523  T
94 -catcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||    
5627524 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatc 5627623  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
5627624 atcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgata 5627659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6091333 - 6091098
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||| || |||||||| |||| | | | |||||||||||      
6091333 tttttggtaaagttaaca-tgtaacataaaaaatgtagtgagtaacacaccattgtttgtacaatgccatcaaaagttcagtactcgtagtatcatcaat 6091235  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacactt-aagataattacataatat 191  Q
          |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||  || |||||||||    
6091234 tcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagcgtaacacccaacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatat 6091135  T
192 cattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||    
6091134 catcaactctgtttgcatattaaagattcaaacgata 6091098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7055366 - 7055140
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||   ||| |||||| | ||||||||||| ||||  || |||||||||||||      
7055366 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataattagtaacacctcactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 7055267  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          | ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || || |||| |||||||   |||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
7055266 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacacgctacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 7055167  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatg 219  Q
    || |||||| |||| ||||||||||||    
7055166 atcaactctatttggatgttaaagatg 7055140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7235180 - 7234951
Alignment:
6 ggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtat--------catc 97  Q
    |||||||| |||||||||| || |||| | ||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||| || | |||||||        ||||    
7235180 ggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtgccatcaaaagttcagtctc-atagtattatcaattcatc 7235082  T
98 agattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaa 197  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||  || |||||||||| |||||||  ||  ||||||||||| ||    
7235081 agattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacgcttaagactatcgcataatatcatcaa 7234982  T
198 ctctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||    
7234981 ctatgtttgcatgttaaaaatgccaacgata 7234951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 29182203 - 29182432
Alignment:
8 tgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------g 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||||||        |    
29182203 tgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttatacagtgtcatcaaaagttcagtctccatattatcatcaattcatcag 29182302  T
100 attaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatc-acaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaac 198  Q
    ||||| || | |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||  || |||| ||||||  |||    
29182303 attaataagaatacacttaatctaattttatcctaccatattttaagtgtaacacccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaac 29182402  T
199 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||    
29182403 tctatttgcaggttaaagatgccaacgata 29182432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 8513270 - 8513496
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagta--------tcat 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||        ||||    
8513270 tggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcat 8513369  T
97 cagattaacaaaactacacttaatttaa-ttttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcatt 195  Q
    || |||||||| | ||||||| || ||| |||||| |||| || |||      ||||||   ||||||||||||||||||||  || |||| ||||||      
8513370 catattaacaagaatacacttgatctaatttttatcctaccttgttt------taacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagc 8513463  T
196 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
8513464 aactctgtttccatgttaaagatgccaatgata 8513496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 15491654 - 15491883
Alignment:
7 gtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcat--------ca 98  Q
    |||||||||||| | ||| || |||| | | ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||||||        ||    
15491654 gtgaagttaacattgtaacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacagtggcatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatca 15491753  T
99 gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaac 198  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||| |  || |||| ||||||  ||     
15491754 gattaacaagaatgcacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaaatatcacatgatatcagcaat 15491853  T
199 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||    
15491854 tctgtttggatgttaaagatgctaacgata 15491883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 20768217 - 20768350
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||   || ||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
20768217 tcatcagattaacaagattac--ttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtaacacttaagatcatcgcataatatc 20768314  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || || | ||||||||||||||||||| ||||||||    
20768315 atcaattatgtttgcatgttaaagatgtcaacgata 20768350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30353409 - 30353274
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||  | | || ||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||  || |||| |||||    
30353409 tcatcatataaacaagaatacacttaatctaattttatcatgccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 30353310  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
30353309 agcaactctgtttgcatgttaaaaatgtcaacgata 30353274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 98
Target Start/End: Original strand, 6088945 - 6089038
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| | | ||||||||| | | |||||||||| |||| |||||||| |||| || ||||||||||||||    
6088945 tggtgaagttaacactatagtatcaaaagtgttgtgagtaacgccccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtcaccatagtatcatca 6089038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 33893153 - 33892975
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| | ||| |||||||| ||| || |||| |||| ||||  |||||||||||      
33893153 tttttagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatgatattaaaagttcagtccct-tagtatcatcaat 33893055  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacact 172  Q
          ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |  ||||||  ||||||||||||||||    
33893054 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttatgtataacaccccacaaagtgtaacact 33892975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 228
Target Start/End: Original strand, 6089101 - 6089171
Alignment:
158 acaaagtgtaacacttaagataattacataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||| || ||||||||||||  || |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
6089101 acaaggtataacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgata 6089171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 98
Target Start/End: Original strand, 18498470 - 18498564
Alignment:
5 tggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactct-actgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca 98  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||| | ||||||| ||||| |  || |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
18498470 tggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtagtgagcaacacccccacagtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatca 18498564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 7920 - 8155
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||| | || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||      
7920 tttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 8019  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||  ||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
8020 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 8119  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
8120 atcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgata 8155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 146168 - 145933
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| | | | |||||| | ||||||||||| ||||  |  |||||||||||||      
146168 tttttggttaagttaacattataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttgtagaatgacatcaaaagttcagccttcatagtatcatcaat 146069  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          | ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
146068 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 145969  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
145968 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgata 145933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 43990 - 44224
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| |   |||||||||| || ||| |||| |||| ||| |||||||||||||      
43990 tttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggcataaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 44089  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          |||||| || |||||| ||||| |||||||||  ||  || || ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
44090 tcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaaagtgtaacacttaagcta-tcacataatatc 44188  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
44189 atcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgata 44224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 154797 - 154563
Alignment:
1 tttttggtgaagttaacactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgtttgtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca-- 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| |   |||||||||| || ||| |||| |||| ||| |||||||||||||      
154797 tttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggcataaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 154698  T
99 ------gattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
          |||||| || |||||| ||||| |||||||||  ||  || || ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
154697 tcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaaagtgtaacacttaagcta-tcacataatatc 154599  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
154598 atcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgata 154563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 267331 - 267553
Alignment:
16 acactataatataaaaaatatagtgagtaacactctactgttt-gtacagtgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------gattaaca 106  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| |||||||| |||| || | ||| ||||||||        ||||| ||    
267331 acactatagcatcaaaaatatagtgagtaacatccaactgttttgtacagtgtcatcaaaagttcagtctctataatatcatcaattcattagattagca 267430  T
107 aaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaa-gataattacataatatcattaactctgttt 205  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||  ||||||   ||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||| |||| |||||    
267431 agactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactttgttt 267530  T
206 gcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |||||||||||||||||||||||    
267531 gcatgttaaagatgccaacgata 267553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 12042 - 12177
Alignment:
93 tcatcagattaacaaaactacacttaatttaattttattctacattattttaagcgtaacacatcacaaagtgtaacacttaagataattacataatatc 192  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||  || ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||  ||  ||| |||||    
12042 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatc 12141  T
193 attaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 228  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
12142 agcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgata 12177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 100950 - 100994
Alignment:
183 acataatatcattaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgat 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
100950 acataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgat 100994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University