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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4038_high_1 (Length: 934)

Name: NF4038_high_1
Description: NF4038
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4038_high_1
NF4038_high_1
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (22-889)||(29295417-29296281)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 652; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 652; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 889
Target Start/End: Original strand, 29295417 - 29296281
Alignment:
Q  22 gtaacattgggtttattctatttgaaatgagttagaataaaacaga---gtgtaacaaaaaataactacgaataatattatcgtatactttttaagccaa 118  Q
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T  29295417 gtaacattggatttattcaatttaaaatgagttagaataaaacagaagagtgtaacaaaaaataactacgaataatattatcgtatactttttaagccaa 29295516  T
Q  119 gtgaaagagatggctgtagatagatatcaacatcatctaaa-gttattgttaactttttaaatttaaatttgaatctcgtaatttatttataaaatttat 217  Q
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T  29295517 gtgaaagagatggctgtagatagatatcaacatcatctaaaagttattgt-aactttttcaatttaaatttgaatctcgtaatttatttataaaaatttt 29295615  T
Q  218 tactcagtatattagtttcttgtaatgtctttctaaa-tatttgccaattagaactttaccaattaaacaaaccaaaacttcaaaatgcacctgaaatgc 316  Q
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T  29295616 tactcggtatattagtttcttgtaatatctttctaaaatatttgcaaattagaactttaccaattaaacaaaccaaaacttcaaaatgcacctgaaatgc 29295715  T
Q  317 atttaagatacaactaccatatattctttatgatgttcatcaaatacttgtgaaccaaataatgttctgacagactatattgtaagaaatggactgcacg 416  Q
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T  29295716 atttaagatacaactaccatatattctttatgatgttcatcaaatactcgtgaatcaaataatgttctgacagactatattgtaagaaatggactgcacg 29295815  T
Q  417 tttttgcaccatgagggaannnnnnnncattttcaatataacgaatagcatatgatatgccgcacaaacactaaataattagtcataattcaactcattc 516  Q
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T  29295816 tttttgcaccatcagggaattttttttcattttcaatataacgaatagcatatgatatgctgcacaaacactaaataattagtcataattcaactcatta 29295915  T
Q  517 aattnnnnnnnctttaataaagattaattatctacaaattacttaatatttttgcatcaattttaatatttttagcatgtgtgtctttcaaattcaaaca 616  Q
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T  29295916 aattaaaaaaactttaataaagattaattatctacaaattacttaatatttttgcatcaattttaatatttttagcatgtgtgcttttcaaattcaaaca 29296015  T
Q  617 gctagcggttttgtttatatatttttatagacaaatgttaatggttaatttgttaagaagagagaaaatcgttaagtaaaagagaacgcatctaacctct 716  Q
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T  29296016 gctagcagttttgtttatatatttttatagacaaatgttgatggttaatttgttaggaagagagaaaatctttaagtaaaagagaatgcatctgaac--- 29296112  T
Q  717 tgtataatatattaatatttcttcagtattttaactcataccactgaactaacattgacaagttgggtcctaattcagaatcttagttataagcttaatc 816  Q
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T  29296113 ----taatatattaatatttcttcagtatttcaactcataccattgaactaacattggcaagttgggtcctaattcagaatcttagttttaagtttaatc 29296208  T
Q  817 ttaaacaaaatattacatagaaggctaaaatgatttgtggaagaatgtgtttaacatgcatgtgcaaaatagc 889  Q
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T  29296209 ttaaacaaaatattacatagaaggctaaaatgatttgtggaagaatgtgtttaacatgcatgtgcaaaatagc 29296281  T

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