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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4060_high_3 (Length: 556)

Name: NF4060_high_3
Description: NF4060
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4060_high_3
NF4060_high_3
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (1-190)||(4751352-4751541)
chr8 (1-190)||(2404167-2404356)
chr8 (1-190)||(2409406-2409595)
chr8 (1-190)||(4746327-4746516)
chr8 (1-190)||(18346973-18347162)
chr8 (1-190)||(18342930-18343119)
chr8 (1-190)||(36962776-36962975)
chr8 (1-190)||(36959004-36959178)
chr8 (60-186)||(15695220-15695346)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (1-190)||(29884786-29884975)
chr2 (1-190)||(29889791-29889980)
chr2 (1-188)||(901484-901671)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (1-190)||(39544890-39545079)
chr4 (25-190)||(39571395-39571560)
chr4 (1-154)||(9406108-9406261)
chr4 (263-307)||(18683761-18683805)
[»] chr1 (2 HSPs)
chr1 (1-192)||(52891032-52891223)
chr1 (101-190)||(26415334-26415423)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (1-187)||(34042135-34042321)
chr7 (1-187)||(34047141-34047327)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (1-184)||(34531133-34531316)
chr3 (1-190)||(36394225-36394414)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (263-306)||(27669601-27669644)
chr6 (263-306)||(26847983-26848026)
chr6 (360-412)||(26810132-26810184)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (263-305)||(5548-5590)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4751541 - 4751352
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4751541 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 4751442  T
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttcaata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4751441 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatatgatttcttatatgtttttcaata 4751352  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2404356 - 2404167
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2404356 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 2404257  T
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttcaata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2404256 ttatatataaacagtcttggactgcataaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatatgatttcttatatgtttttcaata 2404167  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2409595 - 2409406
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2409595 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattattcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 2409496  T
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttcaata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2409495 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatatgatttcttatatgtttttcaata 2409406  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4746516 - 4746327
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4746516 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 4746417  T
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttcaata 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4746416 ttatatataaacaatcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatatgatttcttatatgtttttcaata 4746327  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18347162 - 18346973
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18347162 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccatcattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 18347063  T
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttcaata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18347062 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctctcatatgatttcttatatgtttttcaata 18346973  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18343119 - 18342930
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18343119 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagttatgataagacattatttatcattatgtttattgtaattccttt 18343020  T
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttcaata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18343019 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctctcatatgatttcttatatgtttttcaata 18342930  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36962975 - 36962776
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttatt---------gt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||    
T  36962975 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattatgtttattgt 36962876  T
Q  92 aattccttttta-tatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttcaata 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36962875 aattcctttttaatatataaacagtcttggaccgcataaataaaataagaaagaatcatttctctaatctcttatatgatttcttatatgtttttcaata 36962776  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36959178 - 36959004
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36959178 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagt----------------ttgtcattatgtttattgtaattccttt 36959095  T
Q  101 tta-tatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttcaata 190  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36959094 ttaatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctgatctcttatatgatttcttatatatttttcaata 36959004  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 186
Target Start/End: Original strand, 15695220 - 15695346
Alignment:
Q  60 gataagacattatttgtcattatgtttattgtaattcctttttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15695220 gataagaaattatttgtcattatgtttactgtaattcctttttctatataaacagtcttggactgtagaaataaaatatgaaagaattattcctctaatc 15695319  T
Q  160 tcttatacgatttcttatatgtttttc 186  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15695320 tctcatatgatttcttatatgtttttc 15695346  T

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Target: chr2 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29884975 - 29884786
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29884975 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 29884876  T
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttcaata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29884875 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatatgatttcttatatgtttttcaata 29884786  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29889980 - 29889791
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29889980 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 29889881  T
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttcaata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29889880 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatatgatttcttatatgtttttcaata 29889791  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 901484 - 901671
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  901484 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 901583  T
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttcaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  901584 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctctcatatgatttcttatatgtttttcaa 901671  T

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Target: chr4 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 39544890 - 39545079
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39544890 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 39544989  T
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttcaata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39544990 ttatatataaacagtcttggactgcataaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatatgatttcttatatgtttttcaata 39545079  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 39571395 - 39571560
Alignment:
Q  25 tcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattcctttttatatataaacagtcttggactg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39571395 tcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattcctttttatatataaacagtcttggactg 39571494  T
Q  125 cagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttcaata 190  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39571495 cataaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatatgatttcttatatgtttttcaata 39571560  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9406261 - 9406108
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9406261 agaaaagtcaaatgatattattggtcattatttgaatatattatgccattatttgtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 9406162  T
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctc 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9406161 ttatatataaacagtcttggactgtagaaataaaataagaaagagtcattcctc 9406108  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 307
Target Start/End: Original strand, 18683761 - 18683805
Alignment:
Q  263 ttttatttggctctacacttttaccaagtgagaaacttccttccc 307  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18683761 ttttatatggttctacacttttaccaagtgggaaacttccttccc 18683805  T

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Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 52891032 - 52891223
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52891032 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 52891131  T
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttcaatact 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52891132 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaaaaaaaaagaatcattcctctaaactcttatatgatttcttatatgtttttcaatact 52891223  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26415423 - 26415334
Alignment:
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttcaata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26415423 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctctcatatgatttcttatatgtttttcaata 26415334  T

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Target: chr7 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 34042135 - 34042321
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34042135 agaaaagtcaaatgatattatcggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 34042234  T
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34042235 ttatatataaacagtcttggactgaagaaataaaataagaaagaatcattcctctaaactcttatatgatttcttatatgtttttca 34042321  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 34047141 - 34047327
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34047141 agaaaagtcaaatgatattatcggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 34047240  T
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34047241 ttatatataaacagtcttggactgaagaaataaaataagaaagaatcattcctctaaactcttatatgatttcttatatgtttttca 34047327  T

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Target: chr3 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34531316 - 34531133
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34531316 agaaaagtcaaatgatattattggtcgttattagaatatattatgccattattagtcatgataaaacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 34531217  T
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttt 184  Q
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T  34531216 tcctatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcttctaatctctcatatgatttcttatatgtttt 34531133  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 36394225 - 36394414
Alignment:
Q  1 agaaaagtcaaatgatattattggtcattattagaatatattatgccattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 100  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36394225 agaaaagtcagaggatattattgatcattattagaatatattatgtcattattagtcatgataagacattatttgtcattatgtttattgtaattccttt 36394324  T
Q  101 ttatatataaacagtcttggactgcagaaataaaataagaaagaatcattcctctaatctcttatacgatttcttatatgtttttcaata 190  Q
    |  |||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36394325 tcctataaaaacagtcttggactgtaaaaataaaatatgaaaaaattattcctctaatcttgcatatgatttcttatatgtttttcaata 36394414  T

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Target: chr6 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 306
Target Start/End: Original strand, 27669601 - 27669644
Alignment:
Q  263 ttttatttggctctacacttttaccaagtgagaaacttccttcc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27669601 ttttatttggctctacacttttaccatgtaagaaacttccttcc 27669644  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26848026 - 26847983
Alignment:
Q  263 ttttatttggctctacacttttaccaagtgagaaacttccttcc 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26848026 ttttgtttggctctacacttttactatgtgagaaacttccttcc 26847983  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 360 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 26810184 - 26810132
Alignment:
Q  360 aaaaatcacatagcttaaaaccagtaaataaagggataaaaaagttgtgatat 412  Q
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T  26810184 aaaaatcatatggcttaaaaacactaaataaagggaccaaaaagttgtgatat 26810132  T

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Target: scaffold0277 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 305
Target Start/End: Original strand, 5548 - 5590
Alignment:
Q  263 ttttatttggctctacacttttaccaagtgagaaacttccttc 305  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5548 ttttatttggttttacacttttaccaagtgggaaacttccttc 5590  T

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