View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4065_high_11 (Length: 360)

Name: NF4065_high_11
Description: NF4065
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4065_high_11
NF4065_high_11
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (6-360)||(35015009-35015366)
chr6 (6-360)||(19983144-19983500)
chr6 (6-342)||(18583381-18583720)
chr6 (54-348)||(23994981-23995279)
chr6 (54-348)||(26089793-26090091)
chr6 (54-348)||(18002395-18002693)
chr6 (54-348)||(15742120-15742417)
chr6 (55-255)||(4991225-4991427)
chr6 (48-316)||(15889599-15889871)
chr6 (48-316)||(22585439-22585711)
chr6 (48-316)||(22590270-22590542)
chr6 (48-317)||(15004801-15005072)
chr6 (54-282)||(25640456-25640686)
chr6 (284-360)||(25744338-25744414)
chr6 (272-360)||(22440980-22441068)
chr6 (272-360)||(32898836-32898924)
chr6 (272-340)||(13014822-13014890)
chr6 (272-332)||(18570353-18570413)
chr6 (272-348)||(18777204-18777280)
chr6 (272-342)||(31628332-31628402)
chr6 (272-332)||(18432717-18432777)
chr6 (272-330)||(16106592-16106650)
chr6 (53-86)||(1650020-1650053)
chr6 (54-86)||(16232199-16232231)
chr6 (54-86)||(19610325-19610357)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (6-357)||(79913-80267)
scaffold0034 (272-342)||(46229-46299)
scaffold0034 (272-360)||(40704-40792)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (6-360)||(31132-31489)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (6-360)||(41355-41712)
scaffold0078 (54-86)||(36980-37012)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (6-360)||(22274768-22275125)
chr2 (6-360)||(22284001-22284358)
chr2 (54-332)||(9652796-9653077)
chr2 (54-348)||(21273949-21274246)
chr2 (6-293)||(15633327-15633617)
chr2 (55-255)||(25213201-25213403)
chr2 (272-360)||(23836818-23836906)
chr2 (6-86)||(20627190-20627270)
chr2 (272-360)||(25876032-25876120)
chr2 (6-86)||(19794581-19794661)
chr2 (6-86)||(43642833-43642913)
chr2 (49-282)||(7321641-7321877)
chr2 (272-360)||(32465904-32465992)
chr2 (276-360)||(6879483-6879567)
chr2 (247-342)||(271234-271330)
chr2 (272-342)||(36890798-36890868)
chr2 (272-342)||(25602088-25602158)
chr2 (272-360)||(28974095-28974183)
chr2 (48-91)||(19666843-19666886)
chr2 (272-342)||(4448246-4448316)
chr2 (53-86)||(19689314-19689347)
chr2 (54-86)||(463043-463075)
chr2 (54-86)||(3798520-3798552)
chr2 (54-86)||(8944153-8944185)
chr2 (54-86)||(12635785-12635817)
chr2 (54-86)||(12641559-12641591)
chr2 (54-86)||(12728699-12728731)
chr2 (54-86)||(14906354-14906386)
chr2 (54-86)||(16935900-16935932)
chr2 (54-86)||(17006560-17006592)
chr2 (54-86)||(22863235-22863267)
chr2 (54-86)||(23820388-23820420)
chr2 (54-86)||(36982364-36982396)
chr2 (54-86)||(42177886-42177918)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (6-360)||(21860057-21860414)
chr1 (12-357)||(44034829-44035177)
chr1 (55-360)||(15861327-15861633)
chr1 (131-360)||(22367065-22367296)
chr1 (6-147)||(41218667-41218808)
chr1 (4-86)||(41394527-41394609)
chr1 (272-348)||(41212130-41212206)
chr1 (272-360)||(22403223-22403311)
chr1 (272-360)||(49967696-49967784)
chr1 (272-342)||(35522432-35522502)
chr1 (272-348)||(27329868-27329944)
chr1 (272-348)||(35054814-35054890)
chr1 (272-342)||(21718292-21718362)
chr1 (13-84)||(27675120-27675191)
chr1 (53-86)||(45051726-45051759)
chr1 (272-342)||(9784177-9784244)
chr1 (54-86)||(37844374-37844406)
chr1 (54-86)||(46523695-46523727)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (12-360)||(5941-6292)
scaffold0686 (12-198)||(5735-5923)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (6-357)||(32493898-32494252)
chr7 (6-356)||(126465-126818)
chr7 (6-357)||(111121-111475)
chr7 (6-316)||(1936869-1937177)
chr7 (54-358)||(42056188-42056496)
chr7 (54-341)||(2028986-2029276)
chr7 (54-332)||(2190085-2190367)
chr7 (54-348)||(3049641-3049937)
chr7 (58-191)||(15516765-15516901)
chr7 (102-290)||(39291457-39291648)
chr7 (276-360)||(39046740-39046824)
chr7 (13-86)||(3060271-3060344)
chr7 (56-293)||(13352065-13352306)
chr7 (6-85)||(7283908-7283987)
chr7 (272-360)||(35094863-35094950)
chr7 (272-348)||(44865288-44865364)
chr7 (272-343)||(143702-143773)
chr7 (272-348)||(3895083-3895159)
chr7 (272-360)||(12759033-12759121)
chr7 (272-355)||(47289832-47289915)
chr7 (272-360)||(11287463-11287551)
chr7 (272-342)||(15822544-15822614)
chr7 (272-342)||(7284173-7284243)
chr7 (272-342)||(12369953-12370023)
chr7 (272-342)||(26070377-26070447)
chr7 (272-342)||(26094164-26094234)
chr7 (298-342)||(45452305-45452349)
chr7 (272-342)||(12248233-12248304)
chr7 (13-88)||(13377849-13377924)
chr7 (177-251)||(15977866-15977940)
chr7 (54-91)||(25124445-25124482)
chr7 (324-360)||(1937173-1937209)
chr7 (54-86)||(7293333-7293365)
chr7 (54-86)||(11516544-11516576)
chr7 (54-86)||(13758677-13758709)
chr7 (54-86)||(14113903-14113935)
chr7 (54-86)||(15441478-15441510)
chr7 (54-86)||(15862226-15862258)
chr7 (54-86)||(15927875-15927907)
chr7 (54-86)||(16212071-16212103)
chr7 (54-86)||(18979938-18979970)
chr7 (54-86)||(30262043-30262075)
chr7 (54-86)||(36052971-36053003)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (6-360)||(25119059-25119416)
chr4 (6-360)||(5682380-5682736)
chr4 (54-360)||(14951808-14952117)
chr4 (54-348)||(15272211-15272509)
chr4 (48-283)||(19559482-19559721)
chr4 (54-152)||(15135907-15136006)
chr4 (272-360)||(53704846-53704934)
chr4 (6-86)||(54118120-54118200)
chr4 (272-348)||(8872584-8872660)
chr4 (272-355)||(30457954-30458037)
chr4 (272-342)||(820029-820099)
chr4 (272-360)||(21959576-21959664)
chr4 (272-352)||(44346881-44346961)
chr4 (272-342)||(34395321-34395391)
chr4 (272-342)||(53907812-53907882)
chr4 (272-360)||(44055961-44056049)
chr4 (276-348)||(55376714-55376786)
chr4 (13-293)||(34177502-34177781)
chr4 (276-360)||(23270051-23270135)
chr4 (102-252)||(49071842-49071994)
chr4 (272-332)||(16732243-16732303)
chr4 (272-348)||(30232609-30232685)
chr4 (272-348)||(12837313-12837389)
chr4 (177-235)||(12133626-12133684)
chr4 (178-234)||(21417480-21417536)
chr4 (272-342)||(45458968-45459038)
chr4 (53-86)||(14996445-14996478)
chr4 (54-86)||(7131982-7132014)
chr4 (54-86)||(13246737-13246769)
chr4 (182-293)||(14500246-14500358)
chr4 (54-86)||(15287162-15287194)
chr4 (54-86)||(15294271-15294303)
chr4 (54-86)||(16327840-16327872)
chr4 (54-86)||(16609013-16609045)
chr4 (54-86)||(17145574-17145606)
chr4 (54-86)||(20001030-20001062)
chr4 (54-86)||(26680517-26680549)
chr4 (272-359)||(52265620-52265708)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (12-360)||(162036-162388)
scaffold0016 (6-342)||(166116-166455)
scaffold0016 (272-360)||(164261-164349)
scaffold0016 (13-88)||(116410-116485)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (6-360)||(17955832-17956193)
chr3 (6-357)||(7854031-7854385)
chr3 (6-357)||(54037976-54038330)
chr3 (6-357)||(45581680-45582034)
chr3 (6-348)||(3992608-3992953)
chr3 (54-360)||(30152988-30153297)
chr3 (6-348)||(2844249-2844594)
chr3 (55-357)||(54685202-54685507)
chr3 (54-357)||(33341930-33342236)
chr3 (54-348)||(53771099-53771397)
chr3 (54-348)||(16261511-16261809)
chr3 (54-348)||(23492431-23492728)
chr3 (6-270)||(55513006-55513273)
chr3 (54-348)||(38167972-38168269)
chr3 (54-306)||(28558271-28558526)
chr3 (48-293)||(18970034-18970283)
chr3 (21-282)||(15550722-15550986)
chr3 (272-360)||(16996172-16996260)
chr3 (272-360)||(317621-317709)
chr3 (49-293)||(48421690-48421935)
chr3 (272-360)||(6154444-6154532)
chr3 (6-86)||(19232089-19232169)
chr3 (272-360)||(19570801-19570889)
chr3 (272-360)||(50112164-50112252)
chr3 (272-360)||(12349843-12349931)
chr3 (11-86)||(15857120-15857195)
chr3 (4-86)||(16743991-16744073)
chr3 (272-348)||(22144385-22144461)
chr3 (272-342)||(13817576-13817646)
chr3 (272-360)||(6146859-6146947)
chr3 (272-346)||(54424072-54424146)
chr3 (279-360)||(16182065-16182146)
chr3 (272-342)||(12349652-12349722)
chr3 (267-329)||(34439451-34439513)
chr3 (272-345)||(14298482-14298555)
chr3 (272-345)||(14304109-14304182)
chr3 (272-332)||(17100727-17100787)
chr3 (272-332)||(17101412-17101472)
chr3 (272-348)||(19260952-19261028)
chr3 (272-332)||(53898568-53898628)
chr3 (272-342)||(35123760-35123830)
chr3 (13-91)||(13301323-13301401)
chr3 (13-91)||(13311979-13312057)
chr3 (272-342)||(17523002-17523072)
chr3 (285-342)||(12560362-12560419)
chr3 (172-247)||(14177030-14177105)
chr3 (53-86)||(15615137-15615170)
chr3 (54-91)||(51961031-51961068)
chr3 (54-86)||(2050115-2050147)
chr3 (54-86)||(2449152-2449184)
chr3 (54-86)||(8268650-8268682)
chr3 (54-86)||(8275750-8275782)
chr3 (54-86)||(14842487-14842519)
chr3 (54-86)||(16933869-16933901)
chr3 (54-86)||(17912398-17912430)
chr3 (54-86)||(18911300-18911332)
chr3 (54-86)||(19260749-19260781)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (6-360)||(24716714-24717071)
chr8 (6-357)||(39115324-39115678)
chr8 (6-348)||(274501-274846)
chr8 (6-348)||(641003-641348)
chr8 (6-348)||(826809-827154)
chr8 (54-360)||(41506709-41507018)
chr8 (54-313)||(24385652-24385914)
chr8 (187-348)||(16038916-16039078)
chr8 (48-293)||(17502274-17502523)
chr8 (151-292)||(22321444-22321587)
chr8 (49-282)||(21259386-21259622)
chr8 (78-293)||(23217990-23218208)
chr8 (102-293)||(4233968-4234162)
chr8 (272-360)||(22234916-22235004)
chr8 (6-86)||(16404852-16404932)
chr8 (272-360)||(19993167-19993255)
chr8 (272-360)||(41246704-41246792)
chr8 (272-355)||(37611719-37611802)
chr8 (272-360)||(20481651-20481739)
chr8 (272-342)||(20573305-20573375)
chr8 (268-332)||(20561740-20561804)
chr8 (268-332)||(20647938-20648002)
chr8 (272-332)||(20654018-20654078)
chr8 (6-88)||(31194169-31194251)
chr8 (54-86)||(5238404-5238436)
chr8 (54-86)||(13662182-13662214)
chr8 (54-86)||(13720845-13720877)
chr8 (54-86)||(16872968-16873000)
chr8 (287-343)||(21681065-21681121)
chr8 (54-86)||(22907128-22907160)
chr8 (54-86)||(24661162-24661194)
chr8 (54-86)||(43373392-43373424)
chr8 (54-86)||(43685863-43685895)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (55-360)||(11342730-11343039)
chr5 (54-360)||(2031856-2032165)
chr5 (67-348)||(21204984-21205268)
chr5 (54-348)||(21650753-21651050)
chr5 (54-255)||(16105796-16105999)
chr5 (58-293)||(25004929-25005165)
chr5 (272-348)||(21397150-21397226)
chr5 (132-281)||(22662653-22662805)
chr5 (272-355)||(28261572-28261655)
chr5 (272-355)||(21646852-21646935)
chr5 (272-357)||(11584100-11584188)
chr5 (272-360)||(4865309-4865397)
chr5 (272-360)||(1168317-1168405)
chr5 (272-360)||(20712122-20712210)
chr5 (272-342)||(24475644-24475712)
chr5 (11-85)||(11584374-11584448)
chr5 (272-332)||(24183245-24183305)
chr5 (272-355)||(11337299-11337382)
chr5 (272-342)||(21906781-21906851)
chr5 (272-342)||(3673926-3673997)
chr5 (272-332)||(19405611-19405672)
chr5 (54-86)||(7425631-7425663)
chr5 (54-86)||(20623286-20623318)
chr5 (54-86)||(21233442-21233474)
chr5 (54-86)||(23507270-23507302)
chr5 (54-86)||(25900320-25900352)
chr5 (54-86)||(35791015-35791047)
chr5 (54-86)||(37053061-37053093)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (6-360)||(304-660)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (6-360)||(30137-30497)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (54-357)||(12418-12726)
scaffold0039 (299-357)||(19049-19107)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (54-348)||(55639-55936)
scaffold0032 (54-152)||(108075-108174)
scaffold0032 (13-91)||(104477-104555)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (54-348)||(13285-13583)
scaffold0251 (224-348)||(21432-21557)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (54-348)||(878-1175)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (54-348)||(17304-17601)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (54-332)||(6443-6724)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (53-348)||(193396-193684)
scaffold0004 (186-348)||(186560-186722)
[»] scaffold0303 (2 HSPs)
scaffold0303 (54-297)||(4346-4593)
scaffold0303 (131-332)||(5-209)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (54-348)||(9882-10163)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (122-348)||(15007-15236)
scaffold0175 (54-86)||(882-914)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (6-193)||(42568-42754)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (55-255)||(130709-130911)
scaffold0028 (268-342)||(89578-89652)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (182-348)||(9537-9704)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (48-316)||(44007-44279)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (182-342)||(95039-95204)
scaffold0037 (272-348)||(24841-24917)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (21-293)||(1371-1643)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (131-293)||(219-384)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (272-360)||(32249-32337)
scaffold0091 (272-360)||(41966-42054)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (272-348)||(15584-15660)
scaffold0077 (6-85)||(15319-15398)
scaffold0077 (53-86)||(36836-36869)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (272-342)||(14938-15008)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (48-291)||(3730-3981)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (272-348)||(6958-7034)
scaffold0673 (272-342)||(935-1005)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (272-360)||(132363-132451)
scaffold0021 (272-332)||(88349-88409)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (272-360)||(70735-70823)
scaffold0001 (279-342)||(60870-60933)
scaffold0001 (54-86)||(172210-172242)
scaffold0001 (54-86)||(177913-177945)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (161-282)||(6007-6129)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (272-360)||(5359-5447)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (272-360)||(38344-38432)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (272-360)||(22737-22825)
scaffold0008 (54-86)||(128095-128127)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (6-85)||(1701-1780)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (6-85)||(19802-19881)
scaffold0122 (6-85)||(24106-24185)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (272-342)||(11767-11837)
scaffold0359 (272-342)||(1381-1451)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (272-342)||(254927-254997)
scaffold0011 (272-342)||(261533-261603)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (272-360)||(11821-11909)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (272-360)||(7615-7703)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (272-348)||(146659-146735)
scaffold0025 (54-86)||(146906-146938)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (272-360)||(253102-253190)
scaffold0012 (54-86)||(247366-247398)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (6-85)||(20493-20572)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (15-85)||(94-164)
[»] scaffold0310 (3 HSPs)
scaffold0310 (11-85)||(6261-6335)
scaffold0310 (272-346)||(6521-6595)
scaffold0310 (272-342)||(227-297)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (272-340)||(4351-4419)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (272-360)||(85378-85466)
scaffold0014 (268-342)||(159363-159438)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (272-342)||(208-278)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (272-342)||(10001-10071)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (272-360)||(689-777)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (272-360)||(112658-112746)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (272-342)||(631-701)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (272-342)||(85-155)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (272-342)||(25022-25092)
scaffold0158 (272-342)||(25275-25345)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (267-332)||(48221-48286)
scaffold0068 (267-332)||(61669-61734)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (279-360)||(109582-109663)
scaffold0035 (272-360)||(118076-118164)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (272-328)||(21590-21646)
scaffold0120 (272-332)||(31285-31345)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (268-360)||(33708-33800)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (272-360)||(4987-5075)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (285-342)||(70677-70734)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (298-342)||(3363-3407)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (272-360)||(9033-9121)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (272-332)||(11681-11741)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (54-88)||(5990-6024)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (54-88)||(57392-57426)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (54-86)||(1431-1463)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (54-86)||(1492-1524)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (54-86)||(9183-9215)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (54-86)||(2700-2732)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (54-86)||(12418-12450)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (54-86)||(1430-1462)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (182-293)||(17812-17924)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (54-86)||(26340-26372)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (54-86)||(22857-22889)
scaffold0141 (54-86)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (54-86)||(1496-1528)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (54-86)||(48903-48935)
scaffold0023 (54-86)||(153924-153956)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (54-86)||(272330-272362)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Original strand, 35015009 - 35015366
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015009 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 35015108  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35015109 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 35015208  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35015209 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 35015308  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35015309 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgt 35015366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Original strand, 19983144 - 19983500
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983144 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 19983243  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19983244 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 19983343  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19983344 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagttt-aaaactatgctcaattagtgaattatgcatgattgt 19983442  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19983443 tgatgaattgtgatatgtttcatggttagtggttgttgttgttgtttagtcatattgt 19983500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18583720 - 18583381
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583720 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctc 18583621  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18583620 ctgttctatgcatcattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatt 18583521  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18583520 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 18583421  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18583420 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgtt 18583381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23995279 - 23994981
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995279 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 23995180  T
Q  153 -aatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgta 250  Q
     ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23995179 caatatttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 23995080  T
Q  251 tgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  23995079 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 23994981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26090091 - 26089793
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090091 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 26089992  T
Q  153 -aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgta 250  Q
     |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  26089991 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcataatgta 26089892  T
Q  251 tgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  26089891 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 26089793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Original strand, 18002395 - 18002693
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18002395 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgggcataagtgattatcatgaacc 18002494  T
Q  153 -aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgta 250  Q
     |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18002495 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttcatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 18002594  T
Q  251 tgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  18002595 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 18002693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Original strand, 15742120 - 15742417
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc- 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15742120 taaggtaagggggttagtctttatcataatcctttggttaattctttttctcttgttc-atgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 15742218  T
Q  153 aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg-ttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgta 250  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15742219 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgattatgttaatttgatgattaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 15742318  T
Q  251 tgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  15742319 tgaaaatgggtaatttgtatattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 15742417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991225
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-cc 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgtttaattctttttctcttgattttatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 4991328  T
Q  153 aatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || |||||| ||||||    
T  4991327 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgtt-atttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtat 4991229  T
Q  252 gaaa 255  Q
    ||||    
T  4991228 gaaa 4991225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 316
Target Start/End: Original strand, 15889599 - 15889871
Alignment:
Q  48 gctaattaaggtaagggggttagttttta-tcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatca 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||      
T  15889599 gctaattgaggtaagggggttagatttcaatcataatcacttagttaatttcttctctctttttctatgcataagtgtttatttgaatacgtgattattg 15889698  T
Q  147 tgaacc-aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcat 244  Q
    |||||| || ||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||| | ||||||    
T  15889699 tgaacccaacctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgatttgttgatgatgaaattgcatgttcat 15889798  T
Q  245 gatgtat-gaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgat 316  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15889799 gatgtatataaatgggtagtttgtgaattatgttcaactgatgaattatgacat-gttgttgatgaattgtgat 15889871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 316
Target Start/End: Original strand, 22585439 - 22585711
Alignment:
Q  48 gctaattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatca 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||      
T  22585439 gctaattgaggtaagggggttagatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattt 22585538  T
Q  147 tgaacc-aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcat 244  Q
    |||||| |||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| | ||||||    
T  22585539 tgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtattttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcat 22585638  T
Q  245 gatgtat-gaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgat 316  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  22585639 gatgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgaagaattatgacat-gttgttgttgaattgtgat 22585711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 316
Target Start/End: Original strand, 22590270 - 22590542
Alignment:
Q  48 gctaattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatca 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||      
T  22590270 gctaattgaggtaagggggttagatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattt 22590369  T
Q  147 tgaacc-aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcat 244  Q
    |||||| |||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| | ||||||    
T  22590370 tgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtattttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcat 22590469  T
Q  245 gatgtat-gaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgat 316  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  22590470 gatgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgaagaattatgacat-gttgttgttgaattgtgat 22590542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 317
Target Start/End: Original strand, 15004801 - 15005072
Alignment:
Q  48 gctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 147  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||  | |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||| ||||||  |    
T  15004801 gctaattgaggtaaggggttaaatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagagattattgt 15004900  T
Q  148 gaacc-aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatg 245  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||| | ||| |||    
T  15004901 gaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgt-aatttgatgttgattgaattgttgatgaggaaattgcatgtttatg 15004999  T
Q  246 atgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgata 317  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  15005000 atgtatataaatgggtagtttgtgaattatgttcaattgatgaattatgacat-gttgttgttgaattgtgata 15005072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 282
Target Start/End: Original strand, 25640456 - 25640686
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacca 153  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||  |  |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||||||     
T  25640456 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttaggtaatttctactctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaaccc 25640555  T
Q  154 atctttg--aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgta- 250  Q
    | ||||   |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  || |||||||||||| | ||||||||||||     
T  25640556 aacttttgaaattcgtgctcatgttgtag-gatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtag 25640654  T
Q  251 tgaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatt 282  Q
      ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25640655 ataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaatt 25640686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 284 - 360
Target Start/End: Original strand, 25744338 - 25744414
Alignment:
Q  284 gtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25744338 gtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgt 25744414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22441068 - 22440980
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22441068 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgt 22440980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 32898924 - 32898836
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||    
T  32898924 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttgttgtttagtcatgttgt 32898836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 340
Target Start/End: Original strand, 13014822 - 13014890
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttg 340  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  13014822 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttg 13014890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18570413 - 18570353
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18570413 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 18570353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18777280 - 18777204
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    |||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18777280 tatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgttgttgtt 18777204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31628402 - 31628332
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||||| |||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  31628402 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 31628332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18432777 - 18432717
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    |||||| |||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18432777 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 18432717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16106650 - 16106592
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatca 330  Q
    |||||| |||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16106650 tatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatca 16106592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Original strand, 1650020 - 1650053
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1650020 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1650053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16232231 - 16232199
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16232231 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 16232199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19610357 - 19610325
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19610357 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 19610325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 80267 - 79913
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80267 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctc 80168  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80167 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 80068  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  80067 tgatgttaaataaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgt 79968  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  79967 tgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatat 79913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 46299 - 46229
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46299 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgtt 46229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 40792 - 40704
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||    |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||    
T  40792 tatgctcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatattgt 40704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Original strand, 31132 - 31489
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31132 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcatttagttaattcattttctc 31231  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  31232 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagacatgtgtttgaatatgttaatt 31331  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31332 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 31431  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31432 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgt 31489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41712 - 41355
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  41712 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcatttagttaattcattttctc 41613  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  41612 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagacatgtgtttgaatatgttaatt 41513  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41512 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 41413  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41412 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgt 41355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 36980 - 37012
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36980 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22275125 - 22274768
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275125 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcatttagttaattctttttctc 22275026  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275025 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 22274926  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22274925 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggttgtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 22274826  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22274825 tgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgt 22274768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22284358 - 22284001
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284358 agaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctc 22284259  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaac-caatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284258 ttgttctatgcatatttgattatgagaataagtgattatcatgaactcaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 22284159  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22284158 taatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgaatagttagtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 22284059  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  22284058 tgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatcgttgtttttgatgtttagtcttattgt 22284001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 9652796 - 9653077
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-cc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  9652796 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttttcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 9652895  T
Q  153 aatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9652896 aatctttgaaattcgtggttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 9652995  T
Q  252 g-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9652996 gaaaatgggtagtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgatcaat 9653077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Original strand, 21273949 - 21274246
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21273949 taaggtaagggg-ttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 21274047  T
Q  153 -aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgta 250  Q
     |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21274048 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 21274147  T
Q  251 tgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  21274148 tgaaaatgggtagtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 21274246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15633617 - 15633327
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15633617 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatcacttagttaattctttttctc 15633518  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc-aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||| |||||  |||  | | |||| |||||| ||||||||||    
T  15633517 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattataatgaacccaattcttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaatt 15633418  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatg 293  Q
      ||| ||||||||| |||  |||||||||   | |||||| |||| ||||| |||||||||   |||||||||| ||||  |||||||||    
T  15633417 gaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtttgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 15633327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213201
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-cc 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 25213304  T
Q  153 aatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  || |||||| ||||||    
T  25213303 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtat 25213205  T
Q  252 gaaa 255  Q
    ||||    
T  25213204 gaaa 25213201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 23836818 - 23836906
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23836818 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcattttgt 23836906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 20627190 - 20627270
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20627190 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcat 20627270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 25876032 - 25876120
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25876032 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgttattgtttagtcatgttgt 25876120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 19794581 - 19794661
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19794581 agaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19794661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 43642833 - 43642913
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  43642833 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcat 43642913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7321877 - 7321641
Alignment:
Q  49 ctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 148  Q
    |||| |||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||  |  |||||| | |||||||||  || ||||  |||||||||| |||  ||    
T  7321877 ctaactaaggtaagggggttagaattcattataatcacttagttaatttctactctcttttcctatgcatacgtgcttatttgaataagtgactattgtg 7321778  T
Q  149 aaccaatctttg--aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatga 246  Q
    |||| | ||||   |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  || |||||||||||  | ||| ||||    
T  7321777 aacccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattttttatgatgaaatttcatgtttatga 7321678  T
Q  247 tgtat-gaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatt 282  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7321677 tgtatataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaatt 7321641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 32465992 - 32465904
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||    
T  32465992 tatgctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgt 32465904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 276 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6879567 - 6879483
Alignment:
Q  276 ctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||    
T  6879567 ctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaattgttgttgttgttatttagtcatgttgt 6879483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 271330 - 271234
Alignment:
Q  247 tgtatgaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  271330 tgtatgaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 271234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 36890798 - 36890868
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||||| |||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36890798 tatgcttaattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 36890868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25602158 - 25602088
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| |||| ||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  25602158 tatgctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 25602088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28974183 - 28974095
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||| || | |||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||| ||||    
T  28974183 tatgctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgt 28974095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 19666886 - 19666843
Alignment:
Q  48 gctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  19666886 gctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 19666843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 4448246 - 4448316
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||| |||||| |||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  4448246 tatgttcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 4448316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Original strand, 19689314 - 19689347
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19689314 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 463043
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 463043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 3798520 - 3798552
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3798520 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 3798552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 8944185 - 8944153
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8944185 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 8944153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 12635785 - 12635817
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12635785 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 12635817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 12641559 - 12641591
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12641559 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 12641591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 12728731 - 12728699
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12728731 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 12728699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 14906354 - 14906386
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14906354 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16935932 - 16935900
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16935932 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 16935900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17006592 - 17006560
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17006592 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 17006560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863235
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22863235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23820420 - 23820388
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23820420 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982396
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 36982396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 42177886 - 42177918
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42177886 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 42177918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21860414 - 21860057
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21860414 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctc 21860315  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21860314 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtacttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 21860215  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21860214 tgatgttaaatgaattgttaatgatgaaattgcaagttcatgatgaatgaaaatgagtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 21860115  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21860114 tgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatattgt 21860057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 357
Target Start/End: Original strand, 44034829 - 44035177
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44034829 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttc 44034928  T
Q  112 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44034929 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcttgtttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgt 44035028  T
Q  210 taaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatga 308  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  44035029 ttaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatga 44035128  T
Q  309 attgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44035129 attgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatat 44035177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 55 - 360
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861633
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-cca 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccca 15861426  T
Q  154 atctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg 252  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15861427 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 15861526  T
Q  253 -aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttag 351  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15861527 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgt--ttgtttag 15861624  T
Q  352 tcatattgt 360  Q
    |||||||||    
T  15861625 tcatattgt 15861633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 131 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22367296 - 22367065
Alignment:
Q  131 gaataagtgattatcatgaacc-aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22367296 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 22367197  T
Q  229 gaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367196 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgagtagtttgtaaattatgctcaattggtgaa-tatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 22367098  T
Q  328 tcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22367097 tcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgt 22367065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 41218808 - 41218667
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41218808 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatcatttagttaattctttttctc 41218709  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41218708 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattctcat 41218667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 41394609 - 41394527
Alignment:
Q  4 ggagaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41394609 ggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 41394527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 41212206 - 41212130
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41212206 tatgctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtt 41212130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 22403223 - 22403311
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22403223 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttgttgttaagtcatgttgt 22403311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 49967784 - 49967696
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  49967784 tatgctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgt 49967696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 35522432 - 35522502
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  35522432 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 35522502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Original strand, 27329868 - 27329944
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27329868 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgtt 27329944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 35054890 - 35054814
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  35054890 tatgctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgtt 35054814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21718362 - 21718292
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  21718362 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 21718292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 27675191 - 27675120
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatc 84  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||  | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27675191 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggggttagaatttatcataatc 27675120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45051759 - 45051726
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45051759 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 45051726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 9784177 - 9784244
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||||| |||| ||||||||||| | ||||||||   ||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  9784177 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttga---attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 9784244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844406
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37844406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 46523727 - 46523695
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46523727 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 46523695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 12 - 360
Target Start/End: Original strand, 5941 - 6292
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5941 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatatagttaattctttttctcttgttc 6040  T
Q  112 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6041 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatgt 6140  T
Q  210 taaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatga 308  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6141 taaatgatttgttaatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatga 6240  T
Q  309 attgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6241 attgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtaatattgt 6292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Original strand, 5735 - 5923
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5735 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatatagttaattctttttctcttgttc 5834  T
Q  112 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  5835 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttctgttgtagagatgtgtttgaatatgt 5923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Original strand, 32493898 - 32494252
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32493898 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 32493997  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32493998 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgtttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 32494097  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32494098 tgatgttaaataaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 32494197  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32494198 tgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatat 32494252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 6 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 126818 - 126465
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  126818 agaatcataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttcta 126719  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  126718 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgcagagatatgtttgaatatgttaatt 126619  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  126618 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 126519  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcata 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  126518 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcata 126465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Original strand, 111121 - 111475
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111121 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctc 111220  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  111221 ttgttctatgcataattgattatgaaaataagtgattatcatgaacccaatatttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 111320  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  111321 tgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 111420  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  111421 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatat 111475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 316
Target Start/End: Original strand, 1936869 - 1937177
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1936869 agaatcatagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 1936968  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc-aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1936969 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 1937068  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatgaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgtt 303  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1937069 tgatgttaaatgaattgttcatgatgaaattgcaagttcatgata----aaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgtatggttgtt 1937164  T
Q  304 gatgaattgtgat 316  Q
    |||||||| ||||    
T  1937165 gatgaattatgat 1937177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 54 - 358
Target Start/End: Original strand, 42056188 - 42056496
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056188 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 42056287  T
Q  153 -aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgta 250  Q
     |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  42056288 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 42056387  T
Q  251 tgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgttt 349  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||     
T  42056388 tgaaaatgggtagtttgtgaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 42056487  T
Q  350 agtcatatt 358  Q
    ||| |||||    
T  42056488 agtgatatt 42056496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2029276 - 2028986
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-cc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2029276 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattttttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 2029177  T
Q  153 aatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  2029176 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtac 2029077  T
Q  252 g-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgt 341  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  2029076 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgt 2028986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 2190085 - 2190367
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2190085 taaggtaaggcggttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgtacc 2190184  T
Q  153 -aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgta 250  Q
     |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2190185 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 2190284  T
Q  251 tgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2190285 tgaaaatggatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 2190367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3049937 - 3049641
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-cc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3049937 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 3049838  T
Q  153 aatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||| |||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3049837 aatctttgaaattcgtgtttatattgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattg-ggatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 3049739  T
Q  252 gaa-atgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  3049738 gaatatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 3049641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 191
Target Start/End: Original strand, 15516765 - 15516901
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaat 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15516765 gtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 15516864  T
Q  156 ctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttg 191  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15516865 ctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttg 15516901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 290
Target Start/End: Original strand, 39291457 - 39291648
Alignment:
Q  102 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccaatctttg--aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgtt 199  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||  |||||| | ||||   |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  39291457 tctctttttctatgcataagtacttatttgaataagtgattattgtgaacctaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgtt 39291556  T
Q  200 aatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat-gaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaatt 290  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39291557 aatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttgatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattggtgaatt 39291648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 276 - 360
Target Start/End: Original strand, 39046740 - 39046824
Alignment:
Q  276 ctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  39046740 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgt 39046824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3060344 - 3060271
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3060344 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcat 3060271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13352306 - 13352065
Alignment:
Q  56 aggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc-a 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||| ||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||| |    
T  13352306 aggtaagggggttagatttcaagcataatcacttaattagtttcttctctctttttctatgcataagtgtttatttgaataagtgattattgtgaaccca 13352207  T
Q  154 atctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat- 251  Q
    | | ||||| || ||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||| | ||| ||| |||||||| | |||||||||||||     
T  13352206 acccttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttcagtatgttaatttgatgatatttgatttgttgatggtgaaattgcatgttcatgatgtata 13352107  T
Q  252 gaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatg 293  Q
     ||||||||||| | | ||||||||||||||  |||||||||    
T  13352106 taaatgggtagtattttaattatgctcaattgatgaattatg 13352065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 7283908 - 7283987
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7283908 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7283987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 35094950 - 35094863
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||    
T  35094950 tatgctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaat-gttgctgttgttgtttagtcatgttgt 35094863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44865364 - 44865288
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  44865364 tatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgttgttgtt 44865288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 143773 - 143702
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtta 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  143773 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgtta 143702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3895159 - 3895083
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  3895159 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 3895083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12759121 - 12759033
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  12759121 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgt 12759033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 47289915 - 47289832
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcat 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||    
T  47289915 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgctgttaagtcat 47289832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11287551 - 11287463
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||| ||| | |||||| ||||    
T  11287551 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgt 11287463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 15822544 - 15822614
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  15822544 tatgctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 15822614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 7284173 - 7284243
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||||| |||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  7284173 tatgcttaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 7284243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 12369953 - 12370023
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||    
T  12369953 tatgctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgtt 12370023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 26070377 - 26070447
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||||| |||| ||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  26070377 tatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 26070447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 26094164 - 26094234
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||||| |||| ||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  26094164 tatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 26094234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 342
Target Start/End: Original strand, 45452305 - 45452349
Alignment:
Q  298 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  45452305 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgtt 45452349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 12248233 - 12248304
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  12248233 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgtt 12248304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 13377924 - 13377849
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 88  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||  | |||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  13377924 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt 13377849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 251
Target Start/End: Original strand, 15977866 - 15977940
Alignment:
Q  177 gtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||| | ||||||| |||||    
T  15977866 gtagtgatatgtttgagtatgttaatttgttgataattgaattattgatgatgaaattgcatgttcatggtgtat 15977940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124445
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 91  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagt 25124445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 360
Target Start/End: Original strand, 1937173 - 1937209
Alignment:
Q  324 atgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1937173 atgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgt 1937209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 7293365 - 7293333
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7293365 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11516576 - 11516544
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11516576 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13758709 - 13758677
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13758709 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 13758677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 14113903 - 14113935
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14113903 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 15441478 - 15441510
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15441478 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15862258 - 15862226
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15862258 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15862226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15927907 - 15927875
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15927907 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15927875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16212071
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16212071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 18979938 - 18979970
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18979938 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 18979970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 30262043 - 30262075
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30262043 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052971
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 36052971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Original strand, 25119059 - 25119416
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25119059 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctc 25119158  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctt-tgaatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25119159 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatcttgaaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 25119258  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  25119259 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggatagtttgtaaattatgatcaattggtgaattatgcatggtttt 25119358  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25119359 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgt 25119416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Original strand, 5682380 - 5682736
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  5682380 agaatcataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcatttagttaatt-ttttcctc 5682478  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc-aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682479 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 5682578  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatgaaat-gggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5682579 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaattgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 5682678  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  5682679 tgatgaattgtgatatgtttcatgattattggttgttgttgttttttattcatattgt 5682736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 54 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14952117 - 14951808
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc- 152  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14952117 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 14952018  T
Q  153 aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14952017 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 14951918  T
Q  252 gaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgttta 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  14951917 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttattta 14951818  T
Q  351 gtcatattgt 360  Q
    ||||||||||    
T  14951817 gtcatattgt 14951808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Original strand, 15272211 - 15272509
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272211 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 15272310  T
Q  153 -aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgta 250  Q
     |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15272311 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaacgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 15272410  T
Q  251 tgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||    
T  15272411 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgttgttgtt 15272509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19559721 - 19559482
Alignment:
Q  48 gctaattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatca 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |    
T  19559721 gctaattgaggtaagggggttagatttcaagcataatcaattagttaatttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattatta 19559622  T
Q  147 tgaaccaatctttg--aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcat 244  Q
    || ||| | ||||   ||||  |||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| | ||||||    
T  19559621 tgtacccaacttttgaaattcctgctcatgttgtagtgatatgtttgagcatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcat 19559522  T
Q  245 gatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaattt 283  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19559521 gatgtatgtaaatgggtagtttgtgaattatgctcaattt 19559482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 15135907 - 15136006
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135907 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 15136006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 53704846 - 53704934
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  53704846 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgt 53704934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 54118120 - 54118200
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  54118120 agaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 54118200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Original strand, 8872584 - 8872660
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8872584 tatgctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtt 8872660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30458037 - 30457954
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcat 355  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  30458037 tatgctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcat 30457954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 820029 - 820099
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  820029 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 820099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 21959576 - 21959664
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||    
T  21959576 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgt 21959664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 44346961 - 44346881
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagt 352  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  44346961 tatgctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagt 44346881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34395391 - 34395321
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  34395391 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 34395321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 53907812 - 53907882
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  53907812 tatgcccaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaattgttgttgtt 53907882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 44056049 - 44055961
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||| ||||    
T  44056049 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtggtttagccatgttgt 44055961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 348
Target Start/End: Original strand, 55376714 - 55376786
Alignment:
Q  276 ctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  55376714 ctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtt 55376786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 293
Target Start/End: Original strand, 34177502 - 34177781
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt-taattctttttctcttgttc 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||     | || |||| |||||||||||| ||||  || |||||||||||||||| |||||   ||||  |||||     
T  34177502 taggagctaaagtgaagctagagctagggaattgatctaactaaggtaagggg-ttagaattcatcataatcatttagtgtaatt---tttcatttgttg 34177597  T
Q  112 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 209  Q
    |||| |||| || |||   ||||||||||||||  |||| ||||||||  || || ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||  |||     
T  34177598 tatgaataagtgcttaattgaataagtgattattgtgaatccaatcttgaaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaattacatga 34177697  T
Q  210 taaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat-gaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatg 293  Q
    ||| ||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  34177698 taattgaattgttgatgataaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtag-ttgagaattatgttcaattggtgaattatg 34177781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 360
Target Start/End: Original strand, 23270051 - 23270135
Alignment:
Q  276 ctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  23270051 ctcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgt 23270135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 49071994 - 49071842
Alignment:
Q  102 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc-aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgtt 199  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  |||||| || | ||||| || ||||| || | |||| ||||||||||| ||||||    
T  49071994 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgatcattgtgaacccaaccgttgaaattcgtgctcatattgtagtgatatgtttgagtatgtt 49071895  T
Q  200 aatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg 252  Q
    ||||||||||||| |||||  || |||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  49071894 aatttgatgttaattgaattattgatgatgaaattgcatgttcatgatatatg 49071842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16732303 - 16732243
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16732303 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 16732243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Original strand, 30232609 - 30232685
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30232609 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgtt 30232685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Original strand, 12837313 - 12837389
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  12837313 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgtt 12837389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 235
Target Start/End: Original strand, 12133626 - 12133684
Alignment:
Q  177 gtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattg 235  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12133626 gtagtgatatgtttgggtatgttaatttgttgttaattgaattgttaatgatgaaattg 12133684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21417536 - 21417480
Alignment:
Q  178 tagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaatt 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| ||| |||||||||||    
T  21417536 tagagatatgtttgaatatgtgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaatt 21417480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 45458968 - 45459038
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||| |||||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  45458968 tatgttcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgtt 45459038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14996478 - 14996445
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14996478 ttaaggtaagggggttagttattatcataatcat 14996445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 7131982 - 7132014
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7131982 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 7132014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246737
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13246737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 293
Target Start/End: Original strand, 14500246 - 14500358
Alignment:
Q  182 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 280  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||  |||||||||   | |||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||| ||    
T  14500246 gataagtttgagtatgttaatttaatgataaatgaattattggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaa 14500345  T
Q  281 tttgtgaattatg 293  Q
    ||  |||||||||    
T  14500346 ttgatgaattatg 14500358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 15287162 - 15287194
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15287162 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15287194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 15294271 - 15294303
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15294271 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15294303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16327840 - 16327872
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16327840 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16609013 - 16609045
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16609013 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 17145574 - 17145606
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17145574 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 17145606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20001062 - 20001030
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20001062 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 20001030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26680549 - 26680517
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26680549 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 359
Target Start/End: Original strand, 52265620 - 52265708
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattg 359  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||| ||| | ||| ||||||    
T  52265620 tatgctcaaattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattg 52265708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 360
Target Start/End: Original strand, 162036 - 162388
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  162036 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatctagttaattctttttctcttgttc 162135  T
Q  112 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  162136 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatat 162235  T
Q  210 taaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatga 308  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  162236 taaatgatttgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgtaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatga 162335  T
Q  309 attgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt-attgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  162336 attgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgt 162388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Original strand, 166116 - 166455
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  166116 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatctagttaattctttttctc 166215  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  166216 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatt 166315  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    |||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  166316 tgatattaaatgatttgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgtaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgt 166415  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166416 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 166455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 164349 - 164261
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  164349 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgt 164261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Original strand, 116410 - 116485
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 88  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||  | |||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  116410 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcattt 116485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Original strand, 17955832 - 17956193
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctag----agctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955832 agaatcataggagcaaaagtgaagctaggtagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttt 17955931  T
Q  102 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgtt 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17955932 tctcttgttctatgcataatcgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtctgaatatgtt 17956031  T
Q  200 aatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatgg 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  17956032 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgagtagtttgtaaattatactcaattggtgtattatgcatgg 17956131  T
Q  299 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17956132 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgt 17956193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7854385 - 7854031
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7854385 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctc 7854286  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7854285 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 7854186  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  7854185 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggataattggtaaattatgttcaattggtgaattatgcatgattgt 7854086  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7854085 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatat 7854031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Original strand, 54037976 - 54038330
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54037976 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 54038075  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaac-caatctttga-atttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  54038076 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaactcaatgtttgacattcgtgcttatattgtagatatatgtttgaatatgttaatt 54038175  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  54038176 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctaaattggtgaattatgcatggttgt 54038275  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatat 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54038276 tgatgaaatgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatat 54038330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 45582034 - 45581680
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaaggggg-ttagtttttatcataatcatttagttaattctttttct 104  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45582034 agaatcataggagaaaaa-tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttct 45581936  T
Q  105 cttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc-aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45581935 cttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaat 45581836  T
Q  203 ttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttg 301  Q
    |||||| | ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  45581835 ttgatgattaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattg 45581736  T
Q  302 ttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45581735 ttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatat 45581680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 6 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3992953 - 3992608
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3992953 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 3992854  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaac-caatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3992853 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtaattatcatgaactcaacctttgaaatccgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 3992754  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3992753 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaggttcatgatgtaggaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 3992654  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  3992653 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 3992608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 54 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30153297 - 30152988
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc- 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30153297 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttaattaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 30153198  T
Q  153 aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  30153197 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 30153098  T
Q  252 gaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgttta 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30153097 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 30152998  T
Q  351 gtcatattgt 360  Q
    ||||||||||    
T  30152997 gtcatattgt 30152988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2844594 - 2844249
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2844594 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttgattctttttctc 2844495  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||    
T  2844494 ttattctatgcataattgattatgggaataagcgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagatttttgttttaatatgttaatt 2844395  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  2844394 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttct 2844295  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  2844294 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 2844249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 55 - 357
Target Start/End: Original strand, 54685202 - 54685507
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc-a 153  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54685202 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 54685301  T
Q  154 atctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg 252  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54685302 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 54685401  T
Q  253 aaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttag 351  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54685402 aaaatgggtagttggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttag 54685501  T
Q  352 tcatat 357  Q
    ||||||    
T  54685502 tcatat 54685507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33342236 - 33341930
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc- 152  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  33342236 taaggtaagagggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 33342137  T
Q  153 aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33342136 aatctttgaaattcgtgctaatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgtttaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 33342037  T
Q  252 gaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgttta 350  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33342036 gaaaatgggtagttggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 33341937  T
Q  351 gtcatat 357  Q
    |||||||    
T  33341936 gtcatat 33341930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 53771397 - 53771099
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771397 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 53771298  T
Q  153 -aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgta 250  Q
     |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  53771297 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 53771198  T
Q  251 tgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  53771197 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 53771099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16261809 - 16261511
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261809 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcgtaattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 16261710  T
Q  153 -aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgta 250  Q
     |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16261709 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 16261610  T
Q  251 tgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  16261609 cgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 16261511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23492728 - 23492431
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-cc 152  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23492728 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 23492629  T
Q  153 aatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  23492628 aatctttgaaattcttgcttatgttgtagagatatgtttgaatgtgttaatttgatgttaaatgaattgttgattatgaaattgcaagttcatgatgtat 23492529  T
Q  252 g-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  23492528 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 23492431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 55513273 - 55513006
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55513273 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 55513174  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55513173 ttgttctatgcataattgattatggaaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 55513074  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaa 270  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55513073 cgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttaatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaa 55513006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 38168269 - 38167972
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-cc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  38168269 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 38168170  T
Q  153 aatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  38168169 aatctttgaaattcgtacttatgttgtagaaatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 38168070  T
Q  252 g-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  38168069 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 38167972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28558526 - 28558271
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc- 152  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28558526 taaggtaagagggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttccatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacct 28558427  T
Q  153 aatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28558426 aatctttgaaattcgtgcttatgtgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgataaataaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 28558327  T
Q  252 g-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgat 306  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28558326 gaaaatgggtagtttgtaaatgatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 28558271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18970283 - 18970034
Alignment:
Q  48 gctaattaaggtaagggggttagttttta-tcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatca 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  18970283 gctaactaaggtaagggggttagatttcaatcataaccacttagttagtttcttttctctttttctatgcataagtgattatttgaataagtgattatta 18970184  T
Q  147 tgaacc-aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcat 244  Q
    |||||| |||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  | ||||||    
T  18970183 tgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttaagtatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaatttcatgttcat 18970084  T
Q  245 gatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatg 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  18970083 gatgtatgtaaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgatgaattatg 18970034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15550986 - 15550722
Alignment:
Q  21 aaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataa 120  Q
    ||||||||||| | ||||  | |||| | |||||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  |  |||||  || |||||||||    
T  15550986 aaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttagaattcatcataatcacttagttaatttctactctctctttttatgcataa 15550887  T
Q  121 ttgattatgagaataagtgattatcatgaaccaatctttg--aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaat 218  Q
     || | ||  ||||||||||||||  |||||| | ||||   |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  15550886 gtgctaatttgaataagtgattattgtgaacccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaat 15550787  T
Q  219 cgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat-gaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatt 282  Q
      || |||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15550786 ttttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaatt 15550722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 16996172 - 16996260
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16996172 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgt 16996260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 317621 - 317709
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  317621 tatgctaaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgt 317709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 48421935 - 48421690
Alignment:
Q  49 ctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt-taattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 147  Q
    |||| ||||||||| | |||||  || |||||||||||||||| |||||   ||||  ||||| |||| |||| || |||   ||||||||||||||  |    
T  48421935 ctaactaaggtaagagagttagaattcatcataatcatttagtgtaatt---tttcatttgttgtatgaataagtgcttaattgaataagtgattattgt 48421839  T
Q  148 gaacc-aatctttgaatttg-tgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatg 245  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||||||| | |||||||    
T  48421838 gaacccaatctttgaaattcatgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttggtgatgaaattgcatgttcatg 48421739  T
Q  246 atgtat-gaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatg 293  Q
    ||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  48421738 atgtatataaatgggtagtttgagaattatgttcaattggtgaattatg 48421690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 6154444 - 6154532
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6154444 tatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttaagtcatgttgt 6154532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19232169 - 19232089
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19232169 agaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcat 19232089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 19570801 - 19570889
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19570801 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgt 19570889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 50112164 - 50112252
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||    
T  50112164 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgt 50112252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 12349843 - 12349931
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  12349843 tatgctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgt 12349931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 15857120 - 15857195
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15857120 cataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 15857195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Original strand, 16743991 - 16744073
Alignment:
Q  4 ggagaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  16743991 ggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcat 16744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Original strand, 22144385 - 22144461
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22144385 tatgctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtt 22144461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13817646 - 13817576
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13817646 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 13817576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 6146859 - 6146947
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||    
T  6146859 tatgctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttgttgttaagtcatgttgt 6146947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 54424146 - 54424072
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattg 346  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  54424146 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattg 54424072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 360
Target Start/End: Original strand, 16182065 - 16182146
Alignment:
Q  279 aatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||    
T  16182065 aattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgttgttttttagtcatgttgt 16182146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 12349652 - 12349722
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  12349652 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 12349722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 329
Target Start/End: Original strand, 34439451 - 34439513
Alignment:
Q  267 taaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatc 329  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34439451 taaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatgatc 34439513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 272 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14298555 - 14298482
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttatt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  14298555 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttatt 14298482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 272 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14304182 - 14304109
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttatt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  14304182 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttatt 14304109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17100787 - 17100727
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17100787 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 17100727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17101472 - 17101412
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17101472 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 17101412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Original strand, 19260952 - 19261028
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  19260952 tatgctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 19261028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 53898568 - 53898628
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  53898568 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaat 53898628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35123830 - 35123760
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  35123830 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 35123760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Original strand, 13301323 - 13301401
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 91  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||  | || | |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13301323 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 13301401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Original strand, 13311979 - 13312057
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 91  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||  | || | |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13311979 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 13312057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 17523002 - 17523072
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  17523002 tatgctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgtt 17523072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 342
Target Start/End: Original strand, 12560362 - 12560419
Alignment:
Q  285 tgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12560362 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgtt 12560419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 247
Target Start/End: Original strand, 14177030 - 14177105
Alignment:
Q  172 atgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgat 247  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  14177030 atgttgtagtgatatgtttcagtatgttcatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgat 14177105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15615170 - 15615137
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15615170 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15615137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 91
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961068
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 91  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagt 51961068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2050115
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2050115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 2449152 - 2449184
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2449152 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 8268650 - 8268682
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8268650 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 8268682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 8275750 - 8275782
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8275750 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 8275782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842519
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14842519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16933869 - 16933901
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16933869 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 17912398 - 17912430
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17912398 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18911332 - 18911300
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18911332 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 18911300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260781
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19260781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Original strand, 24716714 - 24717071
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716714 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctc 24716813  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716814 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccgatctttgaaattcgtggttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatt 24716913  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24716914 tgatgttaaatgaattgttgataatgaaattgcaagttcacgatgtatgaaaatggatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 24717013  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24717014 tgatgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgt 24717071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 39115678 - 39115324
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39115678 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctc 39115579  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttga-atttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  39115578 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgacattcgtgcttatgttgtaaagatatgtttgaatatgttaatt 39115479  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39115478 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtaatttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatagttgt 39115379  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatat 357  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39115378 tgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatat 39115324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 274846 - 274501
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  274846 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctc 274747  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  274746 ttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 274647  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  274646 tgatgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgt 274547  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  274546 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgtt 274501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 348
Target Start/End: Original strand, 641003 - 641348
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  641003 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctc 641102  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  641103 ttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 641202  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  641203 tgatgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgt 641302  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  641303 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgtt 641348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 348
Target Start/End: Original strand, 826809 - 827154
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  826809 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctc 826908  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826909 ttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 827008  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  827009 tgatgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgt 827108  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  827109 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgtt 827154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 54 - 360
Target Start/End: Original strand, 41506709 - 41507018
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc- 152  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  41506709 taaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 41506808  T
Q  153 aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  41506809 aatctttgaaatccgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 41506908  T
Q  252 gaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgttta 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41506909 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 41507008  T
Q  351 gtcatattgt 360  Q
    ||||||||||    
T  41507009 gtcatattgt 41507018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 313
Target Start/End: Original strand, 24385652 - 24385914
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-cc 152  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24385652 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattccttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattattatgaaccc 24385751  T
Q  153 aatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24385752 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgataatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 24385851  T
Q  252 g-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgt 313  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24385852 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattaagcattgttgttgatgaattgt 24385914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 187 - 348
Target Start/End: Original strand, 16038916 - 16039078
Alignment:
Q  187 gtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgt 285  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16038916 gtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattagt 16039015  T
Q  286 gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  16039016 gaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 16039078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17502523 - 17502274
Alignment:
Q  48 gctaattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatca 146  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |    
T  17502523 gctaattgagataagggggttagatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattatta 17502424  T
Q  147 tgaacc-aatctttgaa-tttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcat 244  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  17502423 tgaacccaatctttgaaatttgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttcat 17502324  T
Q  245 gatgtat-gaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatg 293  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  17502323 gatgtatataaaagggtagtttgtgaattatgttcaattgatgaattatg 17502274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 151 - 292
Target Start/End: Original strand, 22321444 - 22321587
Alignment:
Q  151 ccaatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgt 249  Q
    |||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  22321444 ccaatctttgaaattcgtgctcaggttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgacgt 22321543  T
Q  250 atg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattat 292  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22321544 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 22321587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 282
Target Start/End: Original strand, 21259386 - 21259622
Alignment:
Q  49 ctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 148  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  |  |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||    
T  21259386 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttagttaatttctactctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtg 21259485  T
Q  149 aaccaatctttg--aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatga 246  Q
    |||| | ||||   |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  || |||||||||||| | ||||||||    
T  21259486 aacccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatga 21259585  T
Q  247 tgtat-gaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatt 282  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21259586 tgtatataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaatt 21259622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23218208 - 23217990
Alignment:
Q  78 cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccaatctttg--aatttgtgcttatgt 175  Q
    |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||| | ||||   |||| ||||||||||    
T  23218208 cataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaacttttgaaattcgtgcttatgt 23218109  T
Q  176 ggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat-gaaatgggtagtttgtaaattat 274  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||    
T  23218108 ggtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttaatgatgtatataaatggctagtttgtgaattat 23218009  T
Q  275 gctcaatttgtgaattatg 293  Q
    | ||||||  |||||||||    
T  23218008 gttcaattgatgaattatg 23217990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4234162 - 4233968
Alignment:
Q  102 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc-aatctttgaa-tttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgtt 199  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| |||| | || ||||||||||| ||||||    
T  4234162 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaatttgtgctcatgttgcagtgatatgtttgagtatgtt 4234063  T
Q  200 aatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat-gaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatg 293  Q
    ||||||||| | | ||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||    
T  4234062 aatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgtttatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattattttcaattgatgaattatg 4233968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 22234916 - 22235004
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22234916 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgt 22235004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 16404852 - 16404932
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16404852 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16404932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 19993167 - 19993255
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19993167 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgt 19993255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41246792 - 41246704
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  41246792 tatgcttaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgt 41246704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37611802 - 37611719
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcat 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  37611802 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcat 37611719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20481739 - 20481651
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  20481739 tatgctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgt 20481651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 20573305 - 20573375
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  20573305 tatgctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 20573375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 332
Target Start/End: Original strand, 20561740 - 20561804
Alignment:
Q  268 aaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20561740 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 20561804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 332
Target Start/End: Original strand, 20647938 - 20648002
Alignment:
Q  268 aaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20647938 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 20648002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 20654018 - 20654078
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    |||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20654018 tatgcttaattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 20654078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 88
Target Start/End: Original strand, 31194169 - 31194251
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 88  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |   |  | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31194169 agaatcataggagcaaaagtgaagcttaagctagtgaattaatctaactaaggtaagggggttagttttcatcataatcattt 31194251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5238436 - 5238404
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5238436 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 13662182 - 13662214
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13662182 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 13662214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 13720845 - 13720877
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13720845 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 13720877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16872968 - 16873000
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16872968 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 16873000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21681121 - 21681065
Alignment:
Q  287 aattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtta 343  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||    
T  21681121 aattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgtta 21681065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 22907128 - 22907160
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22907128 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 24661162 - 24661194
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24661162 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373424
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43373424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 43685895 - 43685863
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43685895 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 55 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11343039 - 11342730
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-cca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11343039 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 11342940  T
Q  154 atctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg 252  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11342939 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 11342840  T
Q  253 -aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt-attgttta 350  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11342839 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgttta 11342740  T
Q  351 gtcatattgt 360  Q
    ||||||||||    
T  11342739 gtcatattgt 11342730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 54 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2032165 - 2031856
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc- 152  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  2032165 taaggtaagggggttagttttcatcataatcgtttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 2032066  T
Q  153 aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2032065 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 2031966  T
Q  252 gaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgttta 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2031965 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 2031866  T
Q  351 gtcatattgt 360  Q
    ||||||||||    
T  2031865 gtcatattgt 2031856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 67 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21205268 - 21204984
Alignment:
Q  67 ttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc-aatctttgaattt 165  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  21205268 ttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaatt 21205169  T
Q  166 -gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatgaaa-tgggtagt 263  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21205168 cgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagt 21205069  T
Q  264 ttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  21205068 ttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatatttgttgttgttgtt 21204984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21651050 - 21650753
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc- 152  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21651050 taaggtaagggggttaatatttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctgtgcatagttgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 21650951  T
Q  153 aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21650950 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 21650851  T
Q  252 g-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  21650850 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 21650753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16105999 - 16105796
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-c 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16105999 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 16105900  T
Q  152 caatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgta 250  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  || |||||| |||||    
T  16105899 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgta 16105801  T
Q  251 tgaaa 255  Q
    |||||    
T  16105800 tgaaa 16105796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25005165 - 25004929
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc-aatc 156  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |  |||||  ||||| |||| |||| || | |   ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  25005165 gtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtttagt--ttttcaattgttgtatgaataagtgctcaattgaataagtgattattgtgaacccaatc 25005068  T
Q  157 tttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aa 254  Q
    |||||| || ||||| |||| | || ||||||||||| | ||||||||| | | ||| ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  25005067 tttgaaattcgtgctcatgttgaagtgatatgtttgagtgtgttaatttaaggataattgaattgttaattatgaaattgcatgttcatgatgtatgtaa 25004968  T
Q  255 atgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatg 293  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  25004967 atgggtagtttgagaattatgctcaattggtgatttatg 25004929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21397226 - 21397150
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21397226 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgtt 21397150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 281
Target Start/End: Original strand, 22662653 - 22662805
Alignment:
Q  132 aataagtgattatcatgaacc-aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatg 229  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||| || ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  22662653 aataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatatttgaatatgttaatttgatgataattgaattgttgatgatg 22662752  T
Q  230 aaattgtaagttcatgatgtat-gaaatgggtagtttgtaaattatgctcaat 281  Q
    |||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  22662753 aaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgagaattatgttcaat 22662805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 272 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28261655 - 28261572
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcat 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28261655 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcat 28261572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 355
Target Start/End: Original strand, 21646852 - 21646935
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcat 355  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  21646852 tatgttcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgctgttgttgtttagtcat 21646935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 272 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11584188 - 11584100
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgc---atggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatat 357  Q
    ||||||||||| |||||||||||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11584188 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatat 11584100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4865397 - 4865309
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||| ||||    
T  4865397 tatgctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttatggttgtttattcatgttgt 4865309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 1168317 - 1168405
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||| ||||    
T  1168317 tatgctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgt 1168405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20712210 - 20712122
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  20712210 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgt 20712122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24475712 - 24475644
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24475712 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatgtttcatgatcaattgttgttgtt 24475644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 11584448 - 11584374
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  11584448 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatca 11584374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 24183245 - 24183305
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  24183245 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaat 24183305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 355
Target Start/End: Original strand, 11337299 - 11337382
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcat 355  Q
    |||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||    
T  11337299 tatgctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcat 11337382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21906851 - 21906781
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||| ||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  21906851 tatgttcaattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 21906781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3673997 - 3673926
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||| |||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  3673997 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 3673926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19405672 - 19405611
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19405672 tatgctcaattagttgaattatgattcgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 19405611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 7425663 - 7425631
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7425663 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 7425631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20623318 - 20623286
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20623318 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 21233442 - 21233474
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21233442 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23507270
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23507270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 25900320 - 25900352
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25900320 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 35791015 - 35791047
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35791015 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 35791047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 37053093 - 37053061
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37053093 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Original strand, 304 - 660
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  304 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatctagttaattctttt-ctc 402  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc-aatctttgaa-tttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  403 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatatttgaaatttgtgcttatgttgtagagatatatttgaatatgttaatt 502  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  503 tgatgttaaatgaattgtagatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgaatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 602  T
Q  303 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||    
T  603 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgatatttactcatattgt 660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30497 - 30137
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30497 agaatcatagaagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttatttttcatcataatcatttagttaattatttttctc 30398  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30397 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccctatctttgaaattcatgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 30298  T
Q  204 tgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatt----tgtgaattatgcatgg 298  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    | |||| | || ||||    
T  30297 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgttgtttgaaat-tgtatgg 30199  T
Q  299 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30198 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgt 30137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12726
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc- 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  12418 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttcttttgttctatgcataattgattatgggaataagttattatcatgaaccc 12517  T
Q  153 aatctttgaa-tttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatg--aatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgt 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12518 aatctttgaaatttgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgattaatgtgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgt 12617  T
Q  250 atgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12618 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtt 12717  T
Q  349 tagtcatat 357  Q
    |||||||||    
T  12718 tagtcatat 12726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 299 - 357
Target Start/End: Original strand, 19049 - 19107
Alignment:
Q  299 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19049 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatat 19107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 55936 - 55639
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-cc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55936 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 55837  T
Q  153 aatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  55836 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtag 55737  T
Q  252 g-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  55736 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 55639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 108075 - 108174
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctctt-gttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttcattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 108174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Original strand, 104477 - 104555
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 91  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||| | || | ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  104477 taggagctaaagtgaagcttgggctaagaatttgtgctaattaaggtaagtgggttagaattcatcataatcatttagt 104555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Original strand, 13285 - 13583
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13285 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 13384  T
Q  153 -aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgta 250  Q
     |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13385 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 13484  T
Q  251 tgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  13485 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 13583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 224 - 348
Target Start/End: Original strand, 21432 - 21557
Alignment:
Q  224 atgatgaaattgtaagttcatgatgtatgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttt 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21432 atgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttt 21531  T
Q  323 catgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||    
T  21532 catgatcaatagatgttgttgttgtt 21557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Original strand, 878 - 1175
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-cc 152  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  878 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 977  T
Q  153 aatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  978 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagaggtttgttttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 1077  T
Q  252 g-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  1078 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 1175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Original strand, 17304 - 17601
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-cc 152  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  17304 taaggtaagcgggttagtctttatcataatcatttaggtaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataattgattatcatgaaccc 17403  T
Q  153 aatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17404 aatctttgaaattagtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgattttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 17503  T
Q  252 g-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  17504 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 17601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 332
Target Start/End: Original strand, 6443 - 6724
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-cc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||    
T  6443 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgataataggtgcttatcatgaaccc 6542  T
Q  153 aatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6543 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgtcaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 6642  T
Q  252 g-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6643 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaat 6724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 53 - 348
Target Start/End: Original strand, 193396 - 193684
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 152  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193396 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 193495  T
Q  153 -aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgta 250  Q
     |||| ||||| || ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  193496 caatcattgaaattcgtgc---------agagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 193586  T
Q  251 tg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  193587 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 193684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 186 - 348
Target Start/End: Original strand, 186560 - 186722
Alignment:
Q  186 tgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttg 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  186560 tgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgg 186659  T
Q  285 tgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  186660 tgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 186722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 297
Target Start/End: Original strand, 4346 - 4593
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4346 taaggtaagggggttagactttatcataatcatttggttaattctttttctcttcattctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacc 4445  T
Q  153 -aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgta 250  Q
     |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4446 caatctttgaaattagtgcttatgttgtagagatatgtttaaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 4545  T
Q  251 tg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatg 297  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4546 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatg 4593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 131 - 332
Target Start/End: Original strand, 5 - 209
Alignment:
Q  131 gaataagtgattatcatgaacc-aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 104  T
Q  229 gaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  105 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcataataattgatgaattatgataagtttcatga 204  T
Q  328 tcaat 332  Q
    |||||    
T  205 tcaat 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Original strand, 9882 - 10163
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataa-ttgattatgagaataagtgattatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataaattgattatgaaaataagtgattatcatgaacc 9981  T
Q  153 -aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgta 250  Q
     |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9982 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 10081  T
Q  251 tg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    || |||||||||                 |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10082 tgaaaatgggta-----------------aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgtt 10163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15236 - 15007
Alignment:
Q  122 tgattatgagaataagtgattatcatgaacc-aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatc 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15236 tgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtcgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatt 15137  T
Q  220 gttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatat 318  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15136 gttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtttattttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatat 15037  T
Q  319 gtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  15036 gtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 15007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 882 - 914
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42754 - 42568
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42754 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataa---aggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 42658  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-ccaatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  42657 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatggttgaa 42568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130709
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaa-cc 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 130812  T
Q  153 aatctttg-aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat 251  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  || |||||| ||||||    
T  130811 aatctttgaaattcgtgctcatgttgtagagatatgtttggatacgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtat 130713  T
Q  252 gaaa 255  Q
    ||||    
T  130712 gaaa 130709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 342
Target Start/End: Original strand, 89578 - 89652
Alignment:
Q  268 aaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  89578 aaattgtgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgtt 89652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 182 - 348
Target Start/End: Original strand, 9537 - 9704
Alignment:
Q  182 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaa 280  Q
    |||| |||||| ||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9537 gataagtttgagtatgttaattgattgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagtttatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 9636  T
Q  281 tttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  9637 ttagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 9704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 316
Target Start/End: Original strand, 44007 - 44279
Alignment:
Q  48 gctaattaaggtaagggggttagttttta-tcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatca 146  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||||      
T  44007 gctaattgaggtaacggggttagatttcaatcataatcacttagttaatttcttctctcttttgctatgcataagtgattatttgaataagtgattattg 44106  T
Q  147 tgaacc-aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcat 244  Q
    |||||| |||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| | ||||||    
T  44107 tgaacctaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatggtaattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcat 44206  T
Q  245 gatgtatg-aaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgat 316  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| | ||||||||||||   |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  44207 gatgtatgtaaataagtagtttgtgagttatgctcaattgacgaattatgacat-gttgttgttgaattgtgat 44279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 182 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 95204 - 95039
Alignment:
Q  182 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatgaaa-tgggtagttt----gtaaattatgc 276  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||    |||||||||||    
T  95204 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatagatagtttatttgtaaattatgc 95105  T
Q  277 tcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  95104 tcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 95039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Original strand, 24841 - 24917
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  24841 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 24917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Original strand, 1371 - 1643
Alignment:
Q  21 aaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataa 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | |||| | ||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||  | |   ||||  ||||| |||| ||||    
T  1371 aaagtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtagt---tttcatttgttgtatgaataa 1467  T
Q  121 ttgattatgagaataagtgattatcatgaacc-aatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaat 218  Q
     || |||   |||||| |||||||  |||||| |||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  1468 gtgcttaattgaataaatgattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaat 1567  T
Q  219 cgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtat-gaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatg 293  Q
     ||| |||||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  1568 tgttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgagtagtttgagaattatgctcaattgatgaattatg 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 384 - 219
Alignment:
Q  131 gaataagtgattatcatgaacc-aatctttgaatttgt-gcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgat 228  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||| || | ||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  384 gaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcttgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttgatgat 285  T
Q  229 gaaattgtaagttcatgatgtat-gaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaattatg 293  Q
    ||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  284 gaaattgcatgttcatgatgtatataaatgtgtagtttgtgaattatgctcaattgttgaattatg 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 32337 - 32249
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  32337 tatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgt 32249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 41966 - 42054
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41966 tatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgt 42054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Original strand, 15584 - 15660
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15584 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtt 15660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 15319 - 15398
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  15319 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcattcatcataatca 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Original strand, 36836 - 36869
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 36869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15008 - 14938
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15008 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgtt 14938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 291
Target Start/End: Original strand, 3730 - 3981
Alignment:
Q  48 gctaattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatca 146  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||      
T  3730 gctaattgaggtaaaggggttagatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattg 3829  T
Q  147 tgaa-ccaatctttgaattt-gtgcttatgtggtagagatat----gtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagt 240  Q
    |||| ||||  |||||| || ||||| |||| |||| |||||    |||||| ||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||| | ||    
T  3830 tgaaaccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgt 3929  T
Q  241 tcatgatgtat-gaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatttgtgaatta 291  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  3930 tcatgatatatataaatgggtagtttgtgaattatgttcaattgatgaatta 3981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Original strand, 6958 - 7034
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6958 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtt 7034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 935 - 1005
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  935 tatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 1005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 132363 - 132451
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  132363 tatgctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgt 132451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 88409 - 88349
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    |||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  88409 tatgatcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 88349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 70735 - 70823
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  70735 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcattggatgttgttgttgtttagtcatgttgt 70823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 60933 - 60870
Alignment:
Q  279 aatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  60933 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 60870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 172210
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 172210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177913
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 177913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6129 - 6007
Alignment:
Q  161 aatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatg-aaatggg 259  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| || | |||||||    
T  6129 aatttgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaaattgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgatataagtaaatggg 6030  T
Q  260 tagtttgtaaattatgctcaatt 282  Q
    |||||||| |||| |||||||||    
T  6029 tagtttgtgaattgtgctcaatt 6007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 5359 - 5447
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||| ||||    
T  5359 tatgctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgt 5447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 38432 - 38344
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||    
T  38432 tatgctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttgttgtttagtcatgttgt 38344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22825 - 22737
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22825 tatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttttgtcatgttgt 22737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128127
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 128127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 1780 - 1701
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1780 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 1701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 19802 - 19881
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19802 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 19881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 24106 - 24185
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24106 agaatcataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 24185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 11767 - 11837
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  11767 tatgctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgtt 11837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1451 - 1381
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||||| |||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  1451 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 1381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 254927 - 254997
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  254927 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 254997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 261533 - 261603
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  261533 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 261603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 11821 - 11909
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||| ||||    
T  11821 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgt 11909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7703 - 7615
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  7703 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgt 7615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 146735 - 146659
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtt 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  146735 tatgctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 146659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146906
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 253102 - 253190
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  253102 tatgctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtttttgttaagtcatgttgt 253190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247398
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 247398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20572 - 20493
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20572 agaatcataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 94
Alignment:
Q  15 ggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  164 ggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 6261 - 6335
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagctaattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6261 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 346
Target Start/End: Original strand, 6521 - 6595
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattg 346  Q
    |||||| |||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  6521 tatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttattg 6595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 227 - 297
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||||| |||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  227 tatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgtt 297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4419 - 4351
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttg 340  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  4419 tatgttcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgatcaattgttgttg 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 85466 - 85378
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||| ||||    
T  85466 tatgcttaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgt 85378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 159438 - 159363
Alignment:
Q  268 aaattatgctcaatttgt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   |||| || |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  159438 aaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 159363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 208
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  278 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10071 - 10001
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  10071 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 10001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 689 - 777
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||| ||||    
T  689 tatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgt 777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 112658 - 112746
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  112658 tatgctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttgttgttaagtcatgttgt 112746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 631 - 701
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  631 tatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 85
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  155 tatgctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 85  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25092 - 25022
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  25092 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgtt 25022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25345 - 25275
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  25345 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgtt 25275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48286 - 48221
Alignment:
Q  267 taaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  48286 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaat 48221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 61734 - 61669
Alignment:
Q  267 taaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  61734 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaat 61669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 360
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109663
Alignment:
Q  279 aatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||| ||||    
T  109582 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgt 109663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 118076 - 118164
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||| ||| | |||||| ||||    
T  118076 tatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgt 118164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21646 - 21590
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21646 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 21590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31345 - 31285
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    ||||||||||| || |||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31345 tatgctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaat 31285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 33800 - 33708
Alignment:
Q  268 aaattatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| | ||| |||||||    
T  33800 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgt 33708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5075 - 4987
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    |||||| |||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||| ||||    
T  5075 tatgcttaattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgt 4987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 70734 - 70677
Alignment:
Q  285 tgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  70734 tgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 70677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3363
Alignment:
Q  298 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  3407 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 3363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9121 - 9033
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttattgtttagtcatattgt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | | ||||||| ||| | |||||| ||||    
T  9121 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttgttgctaagtcatgttgt 9033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 11681 - 11741
Alignment:
Q  272 tatgctcaatttgtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 332  Q
    |||||| |||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  11681 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaat 11741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 88
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6024
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 88  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattt 6024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 88
Target Start/End: Original strand, 57392 - 57426
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 88  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  57392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattt 57426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 1431 - 1463
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1431 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 1463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 1492 - 1524
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1492 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 1524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 9183
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2700
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2732 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 2700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12418
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1430
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17924 - 17812
Alignment:
Q  182 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatcgttaatgatgaaattgtaagttcatgatgtatgaaa-tgggtagtttgtaaattatgctcaa 280  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||  |||||||||   | |||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||| ||    
T  17924 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaa 17825  T
Q  281 tttgtgaattatg 293  Q
    ||  |||||||||    
T  17824 ttgatgaattatg 17812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26372
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22889 - 22857
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22889 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27144 - 27112
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27144 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1528
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1496 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48903
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 48903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 153924 - 153956
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  153924 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 153956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272330
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 272330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University