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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF4071_low_2 (Length: 431)
Name: NF4071_low_2
Description: NF4071
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF4071_low_2 |
 |  |
|
| [»] scaffold0310 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr7 (54 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1867 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1164 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0120 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] chr5 (42 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0673 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0396 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0035 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0190 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0338 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0021 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0480 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0160 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0014 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0359 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0117 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0158 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0240 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0083 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0610 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0044 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0016 (7 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0068 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0447 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0037 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0383 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0554 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0103 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0031 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0740 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0122 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0833 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0034 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0342 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0150 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0816 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0876 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0195 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0091 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0032 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0686 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0234 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0184 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0597 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0251 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0706 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0589 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0574 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0039 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0465 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0010 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0004 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1272 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0080 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0303 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0456 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0389 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0020 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0521 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0409 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0970 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0231 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0165 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0670 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0138 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0017 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0387 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0090 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1734 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0244 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0367 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0253 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0023 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0335 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0151 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: scaffold0310 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0310
Description:
Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 430 - 4
Alignment:
| Q |
5 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
430 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaaaagctcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
331 |
T |
 |
| Q |
105 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |
|
|
| T |
330 |
tatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaag |
231 |
T |
 |
| Q |
205 |
catattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcat |
304 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
230 |
catattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcat |
131 |
T |
 |
| Q |
305 |
aaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatg |
404 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
130 |
aaatatagcacgaatttcatcatttattaacatttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatg |
31 |
T |
 |
| Q |
405 |
aacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30 |
aacactaacccccttaccttaattatc |
4 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 117 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6612 - 6298
Alignment:
| Q |
117 |
tcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaac |
216 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6612 |
tcaacaacaagacatatcaataacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaagcatattttcaac |
6513 |
T |
 |
| Q |
217 |
atataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacg |
316 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6512 |
atataccaacttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatatagcacg |
6413 |
T |
 |
| Q |
317 |
aatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccc |
416 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6412 |
aatttcatcatttatgaacagttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccc |
6313 |
T |
 |
| Q |
417 |
cttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
6312 |
cttaccttaattatc |
6298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 6679 - 6603
Alignment:
| Q |
5 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa |
81 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6679 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaagaacaactcaattctcaacaacaa |
6603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 7284376 - 7283950
Alignment:
| Q |
5 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
104 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7284376 |
acatcgtcaaaatcaaacttctccattatcaacccatttaacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaactcaagc |
7284277 |
T |
 |
| Q |
105 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |
|
|
| T |
7284276 |
catgaattattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattaag |
7284177 |
T |
 |
| Q |
205 |
catattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcat |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7284176 |
catattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatacaattcaactaataacaattcaatcatccataacttcacacatctaaacatgtcatcat |
7284077 |
T |
 |
| Q |
305 |
aaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatg |
404 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7284076 |
aattagagtacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatataaataattgaaaattacaaaagtgattatgatg |
7283977 |
T |
 |
| Q |
405 |
aacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7283976 |
aaaactaacccccttaccttaattatc |
7283950 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 48 - 425
Target Start/End: Original strand, 11287390 - 11287768
Alignment:
| Q |
48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
146 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
11287390 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc |
11287489 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
246 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11287490 |
aactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
11287589 |
T |
 |
| Q |
247 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaat |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11287590 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaacataatcagagcactaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
11287689 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11287690 |
tcacccaattaaacacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11287768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15822701 - 15822327
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15822701 |
caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
15822602 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15822601 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccatttgagcatattttcaacatataccattttcatacattttgaacatgtaatt |
15822502 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15822501 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatc-caacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcac |
15822403 |
T |
 |
| Q |
351 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15822402 |
ccaattaagcacttttcatacaaataactgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
15822327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 45452435 - 45452063
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattg |
151 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
45452435 |
caccaacaacatctcatttctccacacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacgacaattg |
45452336 |
T |
 |
| Q |
152 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45452335 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcatg--tcacaaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
45452238 |
T |
 |
| Q |
252 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
45452237 |
aactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacc |
45452138 |
T |
 |
| Q |
352 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45452137 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
45452063 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #5
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Q |
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|
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3894998 |
aaaccaacaacaacaacttattttacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc |
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T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||| |
|
|
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tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgc |
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T |
 |
| Q |
247 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaat |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3895198 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatttcatcagaattagagcatgaatttcatcaattatgaacaattaatcaat |
3895297 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3895298 |
tcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 39046893 - 39046523
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Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |
|
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caccaacaacatctcatttctcaacaacagatcaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
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T |
 |
| Q |
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gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||| |||||||| |||| |
|
|
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39046793 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag-atattttca-catatactcatttttcaa---ttgaacatacaatt |
39046699 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
39046698 |
caactaacaataattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcat |
39046599 |
T |
 |
| Q |
351 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39046598 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaataacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
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Target Start/End: Original strand, 35094794 - 35095166
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| Q |
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150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||| || || || |
|
|
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caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacatgactaaacaacaacagcaaca-tt |
35094892 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatactttgaacatgtaat |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || | |||||||||||||||||| |
|
|
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gatcatgaaacatttaacaattcatcaacaacagtgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcatatactttgaacatgtaat |
35094991 |
T |
 |
| Q |
250 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
35094992 |
tcaactaaca-caattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgttatcacaattagagcatgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattca |
35095090 |
T |
 |
| Q |
350 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35095091 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
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Target Start/End: Original strand, 44865204 - 44865582
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| Q |
52 |
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148 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
44865204 |
caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcataaactacatgacttaacaacaacaacaacaac |
44865302 |
T |
 |
| Q |
149 |
--ttgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacat |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
44865303 |
aattaatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacat |
44865401 |
T |
 |
| Q |
245 |
gtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatca |
344 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
44865402 |
gtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatca |
44865501 |
T |
 |
| Q |
345 |
attcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44865502 |
attcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaa-tctaacccccttacctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
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Target Start/End: Complemental strand, 12370127 - 12369735
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133 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| | || |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||| || || |
|
|
| T |
12370127 |
acccattttcaccaaaccaacaactacaacttatttctcaataacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaataattatgcacaacatcacttag |
12370028 |
T |
 |
| Q |
134 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat |
233 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| |
|
|
| T |
12370027 |
caacaacaacatcaattaatcatgaaagttatcacaattcaacaacaacaaggcataattcaccaattgagcatattttcaacagatacccatttttcat |
12369928 |
T |
 |
| Q |
234 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
12369927 |
actttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccgtaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttaatcatttatga |
12369828 |
T |
 |
| Q |
334 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12369827 |
acaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgataatgatgaaatctaacccccttacctta |
12369735 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
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Target Start/End: Original strand, 12758965 - 12759340
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Q |
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|
|||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||||| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12759065 |
atcatgaaacttatcataattcaccaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccctttttcacattttgaacatgtaattc |
12759164 |
T |
 |
| Q |
252 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
351 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
12759165 |
aaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattggagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
12759264 |
T |
 |
| Q |
352 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12759265 |
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T |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #11
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || || ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26070529 |
acaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatca |
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T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaact |
255 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26070429 |
tgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattcaact |
26070330 |
T |
 |
| Q |
256 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
355 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
26070329 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt-acacaat |
26070231 |
T |
 |
| Q |
356 |
taagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26070230 |
taagcacttattcatac-cataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || || ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26094316 |
acaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatca |
26094217 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaact |
255 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26094216 |
tgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattcaact |
26094117 |
T |
 |
| Q |
256 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
355 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
26094116 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt-acacaat |
26094018 |
T |
 |
| Q |
356 |
taagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26094017 |
taagcacttattcatac-cataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
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ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || || ||| || |
|
|
| T |
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ttttaccaaaacacccacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaa |
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T |
 |
| Q |
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caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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caacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctcatacttt |
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T |
 |
| Q |
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gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaat |
338 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
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gaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagcaaa |
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T |
 |
| Q |
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taatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
424 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
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ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
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Q |
| |
|
|||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || || ||| || |
|
|
| T |
16595375 |
ttttaccaaaacacccacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaa |
16595474 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16595475 |
caacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctcatacttt |
16595574 |
T |
 |
| Q |
239 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaat |
338 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
16595575 |
gaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagcaaa |
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T |
 |
| Q |
339 |
taatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
424 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16595675 |
taatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattttaacccccttacctt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 48 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12248395 - 12248015
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146 |
Q |
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| T |
12248395 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagtcatgcattatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatc |
12248296 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
245 |
Q |
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| T |
12248295 |
cattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatatactattttctcatactttaaacatg |
12248196 |
T |
 |
| Q |
246 |
taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
345 |
Q |
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| T |
12248195 |
aaattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaagtaatcaa |
12248096 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttacaaaag-tgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
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| T |
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tt-atccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
12248015 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
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Target Start/End: Original strand, 143622 - 143991
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Q |
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T |
 |
| Q |
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tgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgta |
247 |
Q |
| |
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|||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||| |
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T |
 |
| Q |
248 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaatt |
347 |
Q |
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| T |
143814 |
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143912 |
T |
 |
| Q |
348 |
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425 |
Q |
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| T |
143913 |
catccaattaagcactttttatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
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Target Start/End: Original strand, 47289758 - 47290138
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Q |
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T |
 |
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247 |
Q |
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tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgta |
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T |
 |
| Q |
248 |
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347 |
Q |
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| T |
47289956 |
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T |
 |
| Q |
348 |
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429 |
Q |
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|
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47290055 |
catccaattaagcatttttcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttaatta |
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T |
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Target: chr7; HSP #18
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Target Start/End: Complemental strand, 13863154 - 13862828
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195 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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295 |
Q |
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| T |
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ccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaaca |
13862955 |
T |
 |
| Q |
296 |
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394 |
Q |
| |
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| T |
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13862859 |
T |
 |
| Q |
395 |
gattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
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T |
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Target: chr7; HSP #19
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Target Start/End: Complemental strand, 49047955 - 49047569
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Q |
| |
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T |
 |
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238 |
Q |
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| T |
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caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcaaccaattgagcata-tttcaacatataccactctctcatacttt |
49047757 |
T |
 |
| Q |
239 |
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338 |
Q |
| |
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| T |
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49047657 |
T |
 |
| Q |
339 |
taatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
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| T |
49047656 |
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T |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #20
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Target Start/End: Complemental strand, 17224220 - 17223824
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
237 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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acaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagtataatt-caacatatatcactttctcatactt |
17224022 |
T |
 |
| Q |
238 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
337 |
Q |
| |
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|
| T |
17224021 |
tgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaa |
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T |
 |
| Q |
338 |
ttaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattac---aaaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
17223921 |
ttaat-tatttactcaattaagcacttaatcata-aaataattgaaaaattacactaaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
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Target Start/End: Original strand, 13274753 - 13275129
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Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||| || |
|
|
| T |
13274753 |
ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaa |
13274852 |
T |
 |
| Q |
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caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13274853 |
caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgag-----------catataccactttctcatacttt |
13274941 |
T |
 |
| Q |
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gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaat |
338 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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gaacatgaaattttactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
13275041 |
T |
 |
| Q |
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taatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13275042 |
taatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 431
Target Start/End: Original strand, 13377485 - 13377889
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|
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T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagtata-attcaacatatatcacttt |
13377683 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca |
328 |
Q |
| |
|
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| T |
13377684 |
ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaat |
13377783 |
T |
 |
| Q |
329 |
tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacct |
423 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||| | |||| || |||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
13377784 |
tatgaacaattaatcgatt-actcaatgaatcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacct |
13377881 |
T |
 |
| Q |
424 |
taattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
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taattatc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | |
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|
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T |
 |
| Q |
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atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
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Q |
| |
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| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||| | || ||||||| ||||||||||| || ||| |
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|
| T |
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agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacgtttagagcata-attcaacatataacactttca |
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T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
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| T |
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catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta |
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T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa |
384 |
Q |
| |
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|
| T |
16914918 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Original strand, 48356602 - 48357001
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Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
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| |
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||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| | || || |
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|
| T |
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T |
 |
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tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaat |
427 |
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| |
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tgaacaattaatcactt-actcaattaagcatttaatcatacaacgaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat |
48356999 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
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Target Start/End: Original strand, 126366 - 126549
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27 |
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124 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
126366 |
tcataatcaacccattttctccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacagt |
126465 |
T |
 |
| Q |
125 |
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208 |
Q |
| |
|
||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
126466 |
atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
126549 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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147 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | |
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|
| T |
111550 |
aaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaatttgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaacc |
111451 |
T |
 |
| Q |
148 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
111450 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
111390 |
T |
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Target: chr7; HSP #27
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155 |
Q |
| |
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||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||| |
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|
| T |
3049565 |
acaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatca |
3049664 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata |
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T |
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131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||| |||||| | ||| | ||| ||| ||||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
9838838 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaactttcatcatcaaatcatgatttatgaacacc-aagtcatgaatcatcaacaacaatatcactt |
9838936 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |
|
|
| T |
9838937 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttca |
9839035 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
9839036 |
catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta |
9839135 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa |
426 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| | | ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9839136 |
tgaacaattaatcacgt-actcaattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaa |
9839233 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
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48 |
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145 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||| |
|
|
| T |
2028893 |
aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagtcatgaattagcatccataacatcacttaacaacgacaacat |
2028992 |
T |
 |
| Q |
146 |
caattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2028993 |
ctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
2029055 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2190460 |
acaacaacttacttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacatcaacatctattgatc |
2190361 |
T |
 |
| Q |
155 |
atgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2190360 |
atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
2190307 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32494341 - 32494167
Alignment:
| Q |
36 |
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133 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| | ||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
32494341 |
acccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacacaagccatgaattatcatcaatcatatgactaaa |
32494242 |
T |
 |
| Q |
134 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32494241 |
caacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
32494167 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42056563 - 42056410
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| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatc |
154 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || || || ||| ||||||||| ||||||| |
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|
| T |
42056563 |
acaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataatatcacttaacaacaacaacatctattgatc |
42056464 |
T |
 |
| Q |
155 |
atgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42056463 |
atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
42056410 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Original strand, 9611266 - 9611665
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| Q |
33 |
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131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||| |||||| | ||| | ||| ||| ||||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
9611266 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaactttcatcatcaaatcatgatttatgaacacc-aagtcatgaatcatcaacaacaatatcactt |
9611364 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattg--agcatattttcaacatataccaacttc |
229 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||| || ||||||||| || ||| |
|
|
| T |
9611365 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagaagcataatt-caacatataacactttc |
9611463 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || | |
|
|
| T |
9611464 |
acatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaact |
9611563 |
T |
 |
| Q |
330 |
atgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | | ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9611564 |
atgaacaattaatcacgt-actcaattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccctcttacctta |
9611661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14272203 - 14271787
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103 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||| ||| | || |||| |
|
|
| T |
14272203 |
acatcattaaaataaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcatctaatcatgaattatgaacactcaag |
14272104 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-g |
202 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||| |||| | ||| ||||| | |
|
|
| T |
14272103 |
ccatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaacaacaacatcaattgaacatgattctt-------------aataacatagcatgaatcaacaattgg |
14272017 |
T |
 |
| Q |
203 |
agcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatc |
302 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||| | || ||||| ||| |||||| ||| | |
|
|
| T |
14272016 |
agcata-gttcaacatatatcattttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcacc |
14271918 |
T |
 |
| Q |
303 |
ataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgatt |
398 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
14271917 |
ataattagagcacgaatttga-caactatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgatt |
14271821 |
T |
 |
| Q |
399 |
atga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14271820 |
atgattgaattctaattcccttaccttaattatc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
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Target Start/End: Original strand, 31501179 - 31501526
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80 |
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179 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
31501179 |
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T |
 |
| Q |
180 |
aacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataa |
278 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| ||| |||||||| | |||| ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| || || ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
31501279 |
aacatagcacaattcaacaatttgagcat-tattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaa |
31501377 |
T |
 |
| Q |
279 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataa |
377 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
31501378 |
tttcatgtatttaaacatatcttcataattagatcactaatttcatcaactatgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaa |
31501476 |
T |
 |
| Q |
378 |
ttgaaaattacaa--aagtgatta-tgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31501477 |
-tgaaaattacaactaattgattattgttgaattctaacccccttacctta |
31501526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34241477 - 34241326
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tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||| || ||| |||||| | ||| | || |||||||||||| |||| |||||| | || | |
|
|
| T |
34241477 |
tcaaccctttttacaaaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatgtcactt |
34241378 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34241377 |
atcaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaaca |
34241326 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
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Target Start/End: Original strand, 16919598 - 16919758
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113 |
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211 |
Q |
| |
|
|||| |||||| || || || ||| ||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |
|
|
| T |
16919598 |
atcaacaacaatattacttagcaacaacaacatcaattaaacacgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-at |
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T |
 |
| Q |
212 |
tcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| || || |||||||| |||||| |
|
|
| T |
16919697 |
tcaacatatatcactttctcatattttgaacatgaaatttcaccaataacaattcgattatc |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 273
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129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||| | |||||||| |||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
4484683 |
atcaacccatttttacaaaaccaagcacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
4484782 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||||| || || |
|
|
| T |
4484783 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacaatttgagcata-attcacaatatatcatttt |
4484881 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc |
273 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4484882 |
cacatacaatgaacatgcaatttctccaacaacaattcaattatc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
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164 |
atcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
262 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| || || ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| || ||||||| |
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|
| T |
28722200 |
atcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaaca |
28722298 |
T |
 |
| Q |
263 |
attcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
28722299 |
attcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttca |
28722359 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #40
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Target Start/End: Original strand, 4446168 - 4446340
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32 |
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128 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| | ||| || || ||| |
|
|
| T |
4446168 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcacatcatcaattcatgatttatgaacacccaagccatgaatcattcaacatcagcatct |
4446267 |
T |
 |
| Q |
129 |
catatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattg |
202 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
4446268 |
cttatcaacaacaacatcaatt-aacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattg |
4446340 |
T |
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Target: chr7; HSP #41
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Target Start/End: Original strand, 14935319 - 14935609
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129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| |||||| | ||| | |||||| |||||||| ||| |||||| || | |
|
|
| T |
14935319 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactgatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcttcaacaacaatatctc |
14935418 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| || | |||| || |||| ||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||| || || ||||| || || |
|
|
| T |
14935419 |
ttaacaa---caacatcatttaaaaatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcatttt |
14935514 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
323 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14935515 |
cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaatttca |
14935609 |
T |
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Target: chr7; HSP #42
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Target Start/End: Original strand, 15362912 - 15363202
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32 |
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129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| |||||| | ||| | |||||| |||||||| ||| |||||| || | |
|
|
| T |
15362912 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactgatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcttcaacaacaatatctc |
15363011 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| || | |||| || |||| ||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||| || || ||||| || || |
|
|
| T |
15363012 |
ttaacaa---caacatcatttaaaaatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcatttt |
15363107 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
323 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15363108 |
cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaatttca |
15363202 |
T |
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Target: chr7; HSP #43
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155 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | || |
|
|
| T |
20583819 |
acaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaattaaaca |
20583720 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaac |
254 |
Q |
| |
|
||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| | |
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|
| T |
20583719 |
tgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcata-attcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcat |
20583621 |
T |
 |
| Q |
255 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaa |
354 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| || ||||| || |||||| || |||||| ||| ||| ||||||| || ||||| ||| |||||| || || ||| |
|
|
| T |
20583620 |
caacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcttcataattagggcaaaaatttcaacaactatgaacaaataatcactt-attcaa |
20583522 |
T |
 |
| Q |
355 |
ttaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20583521 |
ttaggcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttacctta |
20583447 |
T |
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129 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1937290 |
atttcacaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgac |
1937200 |
T |
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190 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| | || ||| || |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
13321033 |
tgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaa |
13321132 |
T |
 |
| Q |
191 |
attcaccaattgagca |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
13321133 |
attcaccaattgagca |
13321148 |
T |
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Q |
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||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
111200 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
111163 |
T |
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211 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
310 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| || |
|
|
| T |
34241317 |
ttcaacatatattactttcacatacttttaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacataacatcataattat |
34241218 |
T |
 |
| Q |
311 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaac |
407 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||| ||||| |||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
34241217 |
aacacgaattttatcaactatgaacaattaatcactt-actcaattaatcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaat |
34241119 |
T |
 |
| Q |
408 |
actaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34241118 |
tctaacccccttacctta |
34241101 |
T |
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184 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| || | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25124153 |
acccatgccatgaatcatcaacaacaacatctcatatcaacaacaacatcaattaagcatg-aattcatcacaa-tcaacaacaacaa |
25124238 |
T |
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425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25124407 |
caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
25124482 |
T |
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Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
126739 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
126776 |
T |
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394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32493977 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
32493940 |
T |
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199 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |
|
|
| T |
46474027 |
caagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaa |
46474126 |
T |
 |
| Q |
200 |
tt |
201 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
46474127 |
tt |
46474128 |
T |
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Target: chr7; HSP #53
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acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcac |
196 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| ||| || || | || ||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
9724031 |
acccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa |
9723932 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatt |
201 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
9723931 |
caatt |
9723927 |
T |
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Target: chr7; HSP #54
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acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcac |
196 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
17947816 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa |
17947717 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatt |
201 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
17947716 |
caatt |
17947712 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1867 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:
Target: scaffold1867; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
75 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcagcaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
174 |
T |
 |
| Q |
105 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
175 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgag |
274 |
T |
 |
| Q |
205 |
catattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcat |
304 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
275 |
catattttcaacatatacccttttcatacacttgaaacatgaatttcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcat |
374 |
T |
 |
| Q |
305 |
aaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgat |
403 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
375 |
aattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgat |
474 |
T |
 |
| Q |
404 |
gaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
475 |
taattctaacccccttacctta |
496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1164 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:
Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 431
Target Start/End: Original strand, 1332 - 1738
Alignment:
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27 |
tcattatcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
124 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1332 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaac |
1431 |
T |
 |
| Q |
125 |
atgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacca |
224 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1432 |
atgacatagcaacagcaacatttattgatcatgaaacttatcacaattcatcaatcacataacataattcaacaattgagcatattttcaacatatacca |
1531 |
T |
 |
| Q |
225 |
acttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcat |
324 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1532 |
atttctcatactttgaacatataattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcat |
1631 |
T |
 |
| Q |
325 |
cacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
424 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1632 |
cacataggaacaattaatcaattcacccaattaagcacttatcatccaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
1731 |
T |
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| Q |
425 |
aattatc |
431 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
1732 |
aattatc |
1738 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 5 - 425
Target Start/End: Original strand, 21442 - 21862
Alignment:
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5 |
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103 |
Q |
| |
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|
| T |
21442 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaag |
21541 |
T |
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| Q |
104 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattga |
203 |
Q |
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| T |
21542 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaaataatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga |
21641 |
T |
 |
| Q |
204 |
gcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
303 |
Q |
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| T |
21642 |
gcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattat-cataacttcatacatccaaacatgtcatca |
21740 |
T |
 |
| Q |
304 |
taaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatga |
402 |
Q |
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| T |
21741 |
taattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcctttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatga |
21839 |
T |
 |
| Q |
403 |
tgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||| |
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| T |
21840 |
tgaattataacccccttacctta |
21862 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 5 - 425
Target Start/End: Original strand, 31141 - 31561
Alignment:
| Q |
5 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaag |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31141 |
acatcatcaaaatcaaactttttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaag |
31240 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattga |
203 |
Q |
| |
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|
|
| T |
31241 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaaaaacatcaattgataatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagtataatttaccaattga |
31340 |
T |
 |
| Q |
204 |
gcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
303 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31341 |
gcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatttaattcaactaacaacaatccaattat-cataacttcatacatccaaacatgtcatca |
31439 |
T |
 |
| Q |
304 |
taaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatga |
402 |
Q |
| |
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||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||| |
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| T |
31440 |
taattagatcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatga |
31538 |
T |
 |
| Q |
403 |
tgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31539 |
tgaattctaacccccttacctta |
31561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 47554 - 47445
Alignment:
| Q |
316 |
gaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacc |
414 |
Q |
| |
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| T |
47554 |
gaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacc |
47456 |
T |
 |
| Q |
415 |
cccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
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| T |
47455 |
cccttacctta |
47445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 431
Target Start/End: Original strand, 11583982 - 11584411
Alignment:
| Q |
6 |
catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgc-aaacccaagc |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11583982 |
catcatcaaaaacaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccacgaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaaacccaagc |
11584081 |
T |
 |
| Q |
105 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaatt---caacaacaacaatgcataattcaccaatt |
201 |
Q |
| |
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|
| T |
11584082 |
catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcaacaacaacaacaaagcataattcaccaatt |
11584181 |
T |
 |
| Q |
202 |
gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcat |
301 |
Q |
| |
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|
|
| T |
11584182 |
gagcatattttcaacatatacccttttcatacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaatatgtcat |
11584281 |
T |
 |
| Q |
302 |
cataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatg |
401 |
Q |
| |
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| T |
11584282 |
cataaatagagcacgaatttcaccactcatgaacaattaattaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatg |
11584381 |
T |
 |
| Q |
402 |
atgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
11584382 |
atgaattctaacccccttaccttaattatc |
11584411 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 27 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1168500 - 1168100
Alignment:
| Q |
27 |
tcattatcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
124 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1168500 |
tcataatcaacccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
1168401 |
T |
 |
| Q |
125 |
atgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacca |
224 |
Q |
| |
|
||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
1168400 |
atgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatca |
1168301 |
T |
 |
| Q |
225 |
acttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcat |
324 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1168300 |
ttttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaccattctattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcat |
1168201 |
T |
 |
| Q |
325 |
cacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacct |
423 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
1168200 |
catttatgaacaattaatcaattcaccaaaataagcatttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtga-tatgatgaattctaacccccttacct |
1168102 |
T |
 |
| Q |
424 |
ta |
425 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
1168101 |
ta |
1168100 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 425
Target Start/End: Original strand, 21397073 - 21397444
Alignment:
| Q |
59 |
aacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa---caacatcaattgatc |
154 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21397073 |
aacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaataacaacaacaattgatc |
21397172 |
T |
 |
| Q |
155 |
atgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaattca |
252 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21397173 |
atgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaattca |
21397271 |
T |
 |
| Q |
253 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
352 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21397272 |
actaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatcc |
21397370 |
T |
 |
| Q |
353 |
aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21397371 |
aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
21397444 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11337455 - 11337081
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattg |
151 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11337455 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaatcatgaatcatgtaaactcaagccatgaattatcatcaacgacatgacttagcaacaacaacatcaattg |
11337356 |
T |
 |
| Q |
152 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11337355 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaaatgagcatattttcaacatttaccatattctcatactttgaacatgtaattc |
11337256 |
T |
 |
| Q |
252 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11337255 |
aactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaaccaattcatc |
11337156 |
T |
 |
| Q |
352 |
caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11337155 |
caattaagcacttattcatac-aataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11337081 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Original strand, 28261498 - 28261867
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
28261498 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcagcaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
28261597 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-acatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
249 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
28261598 |
gatcataaaacatatcacaatttatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcacacatat------ttttcatactttgaacatacaat |
28261691 |
T |
 |
| Q |
250 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28261692 |
tcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataactagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattca |
28261791 |
T |
 |
| Q |
350 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28261792 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
28261867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 36 - 425
Target Start/End: Original strand, 20712036 - 20712428
Alignment:
| Q |
36 |
acccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20712036 |
acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaa |
20712135 |
T |
 |
| Q |
134 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat |
233 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || |||| |
|
|
| T |
20712136 |
caacaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattatcaacacatacccatttttcat |
20712235 |
T |
 |
| Q |
234 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20712236 |
actttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcagttatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca-ttatga |
20712334 |
T |
 |
| Q |
334 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20712335 |
acaattaatcaattcactcaattaagcacttttcatacaagtaattgaaaattgcaaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
20712428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 80 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24183370 - 24183027
Alignment:
| Q |
80 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaac |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24183370 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaaca---tgacatatcaacaacaccatcaattgatcatgaaactcatcacaattcaacaac |
24183274 |
T |
 |
| Q |
180 |
aacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataac |
279 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24183273 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcatacactttgaacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccatgac |
24183174 |
T |
 |
| Q |
280 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataatt |
379 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24183173 |
ttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataatt |
24183074 |
T |
 |
| Q |
380 |
g-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24183073 |
gaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
24183027 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
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Target Start/End: Original strand, 4865239 - 4865613
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149 |
Q |
| |
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|||| |||||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | |||| |||| |
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| T |
4865239 |
caccaacaacacctcatctctcaacaacaattcaagaattatgcaaacccaagccatgaaattatcatcaacaacatgaataaacaaccataacaacaat |
4865338 |
T |
 |
| Q |
150 |
tgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
249 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4865339 |
tgatcatgaaacatatcacaattcatcaaccacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaccc-atacccatttttcatactttgaacatacaat |
4865437 |
T |
 |
| Q |
250 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
349 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |
|
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| T |
4865438 |
tcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccatttatgaacaattaatcaattca |
4865537 |
T |
 |
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350 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
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|
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| T |
4865538 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
4865613 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 19405503 - 19405891
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Q |
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|
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|
|
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19405503 |
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T |
 |
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140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcacc-aattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
238 |
Q |
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|
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| T |
19405603 |
caatatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacgaatcataattcaactaattgagcatattttcaacatatacccttttctcatacttt |
19405702 |
T |
 |
| Q |
239 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaat |
338 |
Q |
| |
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19405703 |
gaacatgaaattcaactaacaataattcaattatccataacttcatacattcaaatatgtcatcataattagagcataaatttcatcatttatgaacaat |
19405802 |
T |
 |
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339 |
taatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
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|
|
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19405803 |
taatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
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Target Start/End: Complemental strand, 21647009 - 21646636
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150 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-acatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
249 |
Q |
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21646909 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacgatacataattcaccaattgaacatattttcatacatac-ccattttcatacacttttaacatgtaat |
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T |
 |
| Q |
250 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
349 |
Q |
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| T |
21646810 |
tcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcacatatgaacatttaatcaattca |
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T |
 |
| Q |
350 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
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|
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21646711 |
cccaaataagcacttttcatacaaataattg-aaattgcaataagtgattatgatgaattttaacccccttacctta |
21646636 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
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Query Start/End: Original strand, 52 - 358
Target Start/End: Original strand, 24475560 - 24475861
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150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||| |
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T |
 |
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gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaa |
248 |
Q |
| |
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gatcatgaaacata--acaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaa |
24475752 |
T |
 |
| Q |
249 |
ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattc |
348 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
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24475753 |
ttcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattc |
24475851 |
T |
 |
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349 |
atccaattaa |
358 |
Q |
| |
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|||||||||| |
|
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24475852 |
atccaattaa |
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T |
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Target: chr5; HSP #12
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Q |
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21906825 |
T |
 |
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282 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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21906907 |
T |
 |
| Q |
283 |
atacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
382 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
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| T |
21906908 |
atatgtctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaa |
21907007 |
T |
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Target: chr5; HSP #13
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Target Start/End: Original strand, 3673818 - 3674215
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129 |
Q |
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|
||||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||||||| || ||| || ||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||| || | | |
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|
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T |
 |
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atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
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ttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatataccacttt |
3674016 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca |
328 |
Q |
| |
|
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|
| T |
3674017 |
ctcatactttgatcatgaaatttccctaacaacaattcaattatcaacaacttaatgtattcaaacatatcatcataatttgagcacgaattctaacaat |
3674116 |
T |
 |
| Q |
329 |
tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
424 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3674117 |
tatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #14
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147 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||| ||| || || || || ||| |||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
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attgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
246 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19862283 |
attgcacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatga |
19862381 |
T |
 |
| Q |
247 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaat |
346 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
19862382 |
aatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcact |
19862481 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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19862482 |
t-actcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
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| |
|
|||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
7728378 |
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7728477 |
T |
 |
| Q |
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atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
7728478 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttct |
7728576 |
T |
 |
| Q |
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catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||| || | |||||| | ||| ||||||| | || || |
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|
| T |
7728577 |
catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatccattcaaatataacttcataattggagtacgaattctaacaatta |
7728676 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta---caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7728677 |
tgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaatttacaccaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
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Target Start/End: Original strand, 23493875 - 23494272
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129 |
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| |
|
|||||| |||||| || |||||| | ||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || |
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|
| T |
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23493974 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
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|
| T |
23493975 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttcgcata-tctcaacatatacctattc |
23494073 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| | || |
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|
| T |
23494074 |
ttcatactttgaacataaaattccactaataacaattcaattttccacaacttcatgcattcgaacatgtcatcatagttggagcacgaattctaacaat |
23494173 |
T |
 |
| Q |
329 |
tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
424 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
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23494174 |
tatgaacaattaattgatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgatttctaacccccttacctt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
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| |
|
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|
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T |
 |
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caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttg |
239 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |||||| || | || ||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
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16595574 |
ctacatcaattgaacatgaatctcaacataattcaacatcaacataacataattcacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttg |
16595672 |
T |
 |
| Q |
240 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatt |
339 |
Q |
| |
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|||||| |||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||| |
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aacatgaaatttctctatcaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaatt |
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T |
 |
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aatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
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Q |
| |
|
| |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
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| |
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2031783 |
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2031882 |
T |
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208 |
Q |
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2031883 |
cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
2031944 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
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Target Start/End: Complemental strand, 5451134 - 5450731
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Q |
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T |
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228 |
Q |
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T |
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328 |
Q |
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5450836 |
T |
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329 |
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423 |
Q |
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5450738 |
T |
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424 |
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430 |
Q |
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taattat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23981806 - 23981433
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Q |
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T |
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229 |
Q |
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23981706 |
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T |
 |
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329 |
Q |
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| T |
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23981508 |
T |
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403 |
Q |
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23981507 |
atgaacaattaatcaatgcactaaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 208
Target Start/End: Original strand, 11342635 - 11342819
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Q |
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11342635 |
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T |
 |
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208 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
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Target Start/End: Original strand, 21616974 - 21617374
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T |
 |
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230 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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329 |
Q |
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| T |
21617173 |
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T |
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425 |
Q |
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| T |
21617273 |
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21617370 |
T |
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| Q |
426 |
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429 |
Q |
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21617371 |
atta |
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Target: chr5; HSP #23
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Q |
| |
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T |
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| Q |
147 |
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208 |
Q |
| |
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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
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Q |
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caccaacaacatatcattcctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaactatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaatt |
23466533 |
T |
 |
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249 |
Q |
| |
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T |
 |
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tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
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Q |
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23466710 |
T |
 |
| Q |
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425 |
Q |
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|
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cacaattaatcacttattcatac-aataattgaaaattgcaataattgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 32 - 425
Target Start/End: Original strand, 432419 - 432815
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129 |
Q |
| |
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432419 |
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T |
 |
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228 |
Q |
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| T |
432519 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcatttt |
432617 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca |
328 |
Q |
| |
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| T |
432618 |
ctcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactacatgcattcaaacatatcatcataattggagcgcgaattttaacaat |
432717 |
T |
 |
| Q |
329 |
tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
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| T |
432718 |
tatgatcaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatgc-aacaattgaaaaattgcagtaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 431
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| |
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tcaacccttttcacaaaaccaataacaacaactgaattctcatcatcaagtcatgatttatgaacactcaatccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
21222798 |
T |
 |
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atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
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| T |
21222797 |
agcaacaacaacattaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattaaacatttagagcata-attcaacatataacactttca |
21222699 |
T |
 |
| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
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| T |
21222698 |
tatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaacta |
21222599 |
T |
 |
| Q |
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tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa |
426 |
Q |
| |
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| T |
21222598 |
tgaacaattaatcaat--actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaataattatgattgaactctaacccccataccttaa |
21222502 |
T |
 |
| Q |
427 |
ttatc |
431 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
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21222501 |
ttatc |
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Target: chr5; HSP #27
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 |
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ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
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Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
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| |
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ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
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 |
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attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
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Q |
| |
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Target: chr5; HSP #29
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T |
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caattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
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Target: chr5; HSP #30
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| Q |
5 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
109158 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctctatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag |
109059 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
152 |
Q |
| |
|
|||| | | || ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
109058 |
ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga |
109010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Original strand, 16105573 - 16105721
Alignment:
| Q |
5 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| |
|
|
| T |
16105573 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacctaag |
16105672 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
152 |
Q |
| |
|
|||| | | || ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16105673 |
ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga |
16105721 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 425
Target Start/End: Original strand, 37983325 - 37983717
Alignment:
| Q |
33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| || ||| | ||| | |||||||| |||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
37983325 |
tcaacccattttacaaaacca---acaacaactcatttttcatcatcaaatcctgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcactt |
37983421 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||| |||| ||| |||||| || || ||||||| |||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
37983422 |
aacaacaacaacatcaattaaacatgattctcattacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcata-attcacaatatatcactttca |
37983520 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| || ||| |||| ||||||||| ||||| | || || |
|
|
| T |
37983521 |
catactttgaatatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagatagagcacaaattttaacaacta |
37983620 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37983621 |
tgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
37983717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 21310819 - 21310603
Alignment:
| Q |
211 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
310 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| || |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
21310819 |
ttcaacatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttag |
21310720 |
T |
 |
| Q |
311 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaac |
407 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || ||||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21310719 |
agcacgaattttaacatttatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgatgaat |
21310621 |
T |
 |
| Q |
408 |
actaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
21310620 |
tttaacccccttacctta |
21310603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 390
Target Start/End: Original strand, 6456580 - 6456937
Alignment:
| Q |
32 |
atcaacccattt-tacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||| || | ||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||| | || | |
|
|
| T |
6456580 |
atcaacccgtttgtacaaaaacaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacgatatctc |
6456679 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |||| ||||| || || |
|
|
| T |
6456680 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagcata-attcacaatatatcatttt |
6456778 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca |
328 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||| || |||| | || |||||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6456779 |
cacatactatgaacatgcaatttcac---caacaattcaattatcgccaatttcatgtattcaaacgtatcttcataattagagcacgaatttcaacaac |
6456875 |
T |
 |
| Q |
329 |
tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa |
390 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
6456876 |
tatgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaa |
6456937 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 323
Target Start/End: Original strand, 29917931 - 29918214
Alignment:
| Q |
41 |
ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||| || |
|
|
| T |
29917931 |
ttttacaaaaccaacgacaataatttatttctcaacatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaa |
29918030 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||| || || ||||||| |||| ||||| | ||| |||||| | |
|
|
| T |
29918031 |
caacatcagttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcata-attcacaatatatcctgttcacatactat |
29918129 |
T |
 |
| Q |
239 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
323 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
29918130 |
gaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaatttca |
29918214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 21297285 - 21297069
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| Q |
211 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
310 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| || |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| | | |||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
21297285 |
ttcaacatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttag |
21297186 |
T |
 |
| Q |
311 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaac |
407 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | || ||||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
21297185 |
aggacgaattttaacatttatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaataattatgatgaat |
21297087 |
T |
 |
| Q |
408 |
actaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21297086 |
tctaacccccttacctta |
21297069 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 32966436 - 32966343
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| Q |
33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaa-caatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaca |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
32966436 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaaccaattatgaattatgcacgctcaagccatgaattatcaataacaaca |
32966343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 24225634 - 24225596
Alignment:
| Q |
6 |
catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt |
44 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24225634 |
catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt |
24225596 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 365
Target Start/End: Original strand, 22885799 - 22885932
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| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
22885799 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattaaagcacgaatttcaacaacca |
22885898 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta |
365 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
22885899 |
tgaacaaattatcaatt-attcaattaagcactta |
22885932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22054028 - 22053963
Alignment:
| Q |
141 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22054028 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
22053963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18531262 - 18531200
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| Q |
141 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattga |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18531262 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattga |
18531200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16835521 - 16835437
Alignment:
| Q |
99 |
ccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||| ||||||||| | || ||| |||||||| |||| | |||||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16835521 |
ccaagctatgaatcatcaacaacaacatctcttaacaacaacaacattaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaaca |
16835437 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:
Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1092 - 717
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
1092 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacaacaatt |
993 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
992 |
gatcatgaaacttatcacaaatcatcaataacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactcatacccatttttcatactttgaacatgtaatt |
893 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
892 |
catctaacaacaatccaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatcaatcaattcac |
793 |
T |
 |
| Q |
351 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
792 |
tcaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 52 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 7118 - 6749
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac---atatcaaaaacaacatca |
147 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| || |
|
|
| T |
7118 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaaca |
7019 |
T |
 |
| Q |
148 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatg |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| | |||||||| |
|
|
| T |
7018 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacactctgaacatg |
6921 |
T |
 |
| Q |
246 |
taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
345 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6920 |
taattcaaccaacaacaattcaactattcataacttcatacatctaaacatgtcctcgtaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaa |
6821 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccc |
416 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6820 |
ttcacccaattaagcactgatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc |
6749 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Original strand, 22668 - 23043
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22668 |
caccaacaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacaaaacaacaacaacatcaatt |
22767 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22768 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaatt |
22867 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22868 |
caactaacaacaattcaattattcaaaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcat |
22967 |
T |
 |
| Q |
351 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22968 |
ccaattaagcacttttgatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
23043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20573461 - 20573087
Alignment:
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151 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20573461 |
caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg |
20573362 |
T |
 |
| Q |
152 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20573361 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccttttcatacactttgaacatgtaattc |
20573262 |
T |
 |
| Q |
252 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20573261 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
20573162 |
T |
 |
| Q |
352 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20573161 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
20573087 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Original strand, 41246635 - 41247009
Alignment:
| Q |
52 |
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150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41246635 |
caccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt |
41246734 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | || || |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
41246735 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattaagcatattt-catcatatacccatttttcctacttttaacatgtaatt |
41246833 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41246834 |
caaccaacaacaatttaattattcataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaattaatcaattcat |
41246933 |
T |
 |
| Q |
351 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41246934 |
ccaattaagcacttttcatacaactaattgaaaattacaataagtgattatgatgaactctaacccccttacctta |
41247009 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 57 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22235068 - 22234700
Alignment:
| Q |
57 |
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155 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | ||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22235068 |
acaacatctcaatcctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaatccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatca |
22234969 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaattcaa |
253 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22234968 |
tgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacactttgagcatgtaattcaa |
22234871 |
T |
 |
| Q |
254 |
ctaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcca |
353 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22234870 |
ctaaca-caattaaattattcataacttcatacatctaaacacgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcattca |
22234772 |
T |
 |
| Q |
354 |
attaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22234771 |
attaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22234700 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
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Target Start/End: Original strand, 37611675 - 37612020
Alignment:
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179 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
37611675 |
aatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaac |
37611773 |
T |
 |
| Q |
180 |
aacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccata |
277 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
37611774 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattatttata |
37611871 |
T |
 |
| Q |
278 |
acttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataa |
377 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37611872 |
acttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatctaattaagcacttttcatacaaataa |
37611971 |
T |
 |
| Q |
378 |
ttgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37611972 |
ttgaaaattataataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
37612020 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 36 - 425
Target Start/End: Original strand, 20481565 - 20481955
Alignment:
| Q |
36 |
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133 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20481565 |
acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaa |
20481664 |
T |
 |
| Q |
134 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat |
233 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | || |||| |
|
|
| T |
20481665 |
caacaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagtataattcaccaattgagcatattatcaacacatatccatttttcat |
20481764 |
T |
 |
| Q |
234 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20481765 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatga |
20481864 |
T |
 |
| Q |
334 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20481865 |
acaaataatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-attaattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattttaacccccttacctta |
20481955 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19993324 - 19992952
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
19993324 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaaccctagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
19993225 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaa |
248 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
19993224 |
gatgatgaaatttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacaagtaa |
19993127 |
T |
 |
| Q |
249 |
ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattc |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19993126 |
ttcaactaaca-caattcaattattcataacttcgtacatctaaacatgtcatcataattagagtacggatttcatcatttatgaacaattaatcaattc |
19993028 |
T |
 |
| Q |
349 |
atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19993027 |
atccaattaagcacttttcatacaaataattg-aaattacaaaagtgattatgatgaattataacccccttacctta |
19992952 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 142 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20561810 - 20561526
Alignment:
| Q |
142 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaa |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20561810 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaa |
20561711 |
T |
 |
| Q |
242 |
catgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaa |
341 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
20561710 |
catgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaa |
20561611 |
T |
 |
| Q |
342 |
tcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20561610 |
tcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
20561526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 57 - 425
Target Start/End: Original strand, 21680984 - 21681356
Alignment:
| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatca |
155 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21680984 |
acaacatcttatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaacatcaattgatca |
21681083 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataa-ttcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaac |
254 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
21681084 |
tgaaactaatcacaattcaacaacaacaaagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatatacccttctctcatactttaaacatgaaattcaac |
21681183 |
T |
 |
| Q |
255 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaa |
354 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
21681184 |
taacaataattcaattatccataaacttatacattcaaatatgtcatcataattagatcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattcaacaaa |
21681283 |
T |
 |
| Q |
355 |
ttaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21681284 |
ttaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
21681356 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 64 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20654163 - 20653944
Alignment:
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64 |
ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaact |
162 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20654163 |
ctcacttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagcaatgaattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaaact |
20654064 |
T |
 |
| Q |
163 |
tatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20654063 |
tatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaattaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
20653964 |
T |
 |
| Q |
263 |
attcaattatccataacttc |
282 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20653963 |
attcaattatccataacttc |
20653944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 39447046 - 39446660
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41 |
ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| || |
|
|
| T |
39447046 |
ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaa |
39446948 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttc-tcatactt |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |
|
|
| T |
39446947 |
caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcata-tttcaacatataac-acttcttcatactt |
39446850 |
T |
 |
| Q |
238 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
337 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| | || ||||| ||| |
|
|
| T |
39446849 |
taaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaa |
39446750 |
T |
 |
| Q |
338 |
ttaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39446749 |
ttaatcaatt-actcaattaagcatttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
39446660 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 431
Target Start/End: Original strand, 23837163 - 23837558
Alignment:
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40 |
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138 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| | |
|
|
| T |
23837163 |
atttcacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca |
23837262 |
T |
 |
| Q |
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acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
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Q |
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| T |
23837263 |
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23837361 |
T |
 |
| Q |
238 |
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337 |
Q |
| |
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| T |
23837362 |
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23837461 |
T |
 |
| Q |
338 |
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431 |
Q |
| |
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| T |
23837462 |
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23837558 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21198434 - 21198040
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138 |
Q |
| |
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| T |
21198434 |
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21198335 |
T |
 |
| Q |
139 |
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237 |
Q |
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| T |
21198334 |
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21198236 |
T |
 |
| Q |
238 |
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337 |
Q |
| |
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| T |
21198235 |
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21198136 |
T |
 |
| Q |
338 |
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431 |
Q |
| |
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| T |
21198135 |
ttaatcaatt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattataatgaattctaacccccttatcttaattatc |
21198040 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20648087 - 20647882
Alignment:
| Q |
64 |
ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaact |
162 |
Q |
| |
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| T |
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ctcacttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaaact |
20647988 |
T |
 |
| Q |
163 |
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262 |
Q |
| |
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| T |
20647987 |
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20647888 |
T |
 |
| Q |
263 |
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268 |
Q |
| |
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|||||| |
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|
| T |
20647887 |
attcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 33 - 320
Target Start/End: Original strand, 38533607 - 38533895
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131 |
Q |
| |
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| T |
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tcaacccattttacaaagtctccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacct |
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T |
 |
| Q |
132 |
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230 |
Q |
| |
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| T |
38533707 |
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38533805 |
T |
 |
| Q |
231 |
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320 |
Q |
| |
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| T |
38533806 |
catactttgaacatgagatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaatt |
38533895 |
T |
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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 250 - 425
Target Start/End: Original strand, 25122618 - 25122793
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349 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |
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| T |
25122618 |
tcaactagcaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattggagcacgaatttgatcatttatgaacaattaatcaattca |
25122717 |
T |
 |
| Q |
350 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
25122718 |
tccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattataataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25122793 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41507091 - 41506930
Alignment:
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48 |
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146 |
Q |
| |
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| T |
41507091 |
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41506992 |
T |
 |
| Q |
147 |
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208 |
Q |
| |
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|
| T |
41506991 |
cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
41506930 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Original strand, 26011452 - 26011848
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| Q |
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131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || | |
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|
| T |
26011452 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
26011551 |
T |
 |
| Q |
132 |
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230 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |
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| T |
26011552 |
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26011650 |
T |
 |
| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
26011651 |
catactttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta |
26011750 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa |
426 |
Q |
| |
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||| |||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
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| T |
26011751 |
tgaacaattaatcactt-actcaattaaacacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaa---taacccccttaccttaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 425
Target Start/End: Original strand, 22981351 - 22981622
Alignment:
| Q |
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250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22981351 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacatgaaatt |
22981449 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
22981450 |
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22981546 |
T |
 |
| Q |
351 |
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425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22981547 |
ccaattaagcacttattcatacaa--aattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22981622 |
T |
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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Original strand, 5854572 - 5854971
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131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || | |
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|
| T |
5854572 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
5854671 |
T |
 |
| Q |
132 |
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230 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||| || ||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
5854672 |
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5854770 |
T |
 |
| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
5854771 |
tatactttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta |
5854870 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa |
426 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |
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|
| T |
5854871 |
tgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacctccttaccttaa |
5854968 |
T |
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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 321 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 7000624 - 7000524
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Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
421 |
c |
421 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
7000524 |
c |
7000524 |
T |
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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| | ||| |||||| | | | ||||||||||||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
15933256 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcttcaaatcatgatttacaaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
15933355 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||| || || ||||||| || |||||| || || ||| |
|
|
| T |
15933356 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataatt-caacatttaacactttca |
15933454 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| | || || |
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| T |
15933455 |
catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaacta |
15933554 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgatg-aacactaacccccttaccttaa |
426 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15933555 |
tgaacaattaatcacttactc-aattaagcacttaatcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgatttaattctaacccccttaccttaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
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146 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
274416 |
aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatc |
274515 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
274516 |
tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacata |
274577 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
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Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |
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| T |
641433 |
aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatc |
641334 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
641333 |
tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacata |
641272 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 827239 - 827078
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Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |
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|
| T |
827239 |
aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatc |
827140 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
827139 |
tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacata |
827078 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
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Target Start/End: Complemental strand, 24717152 - 24716983
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40 |
attttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
138 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | || | |
|
|
| T |
24717152 |
attttacaaaaccaccaacaacaatccatttatcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatca |
24717053 |
T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24717052 |
acaacaaccattgaacatgaaacaaatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
24716983 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 208
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36 |
acccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| | ||||| || || |
|
|
| T |
16039176 |
acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatatccaagccataaattagcatccataacatcacttaa |
16039077 |
T |
 |
| Q |
134 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16039076 |
caacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcata |
16039002 |
T |
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Target: chr8; HSP #27
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Target Start/End: Complemental strand, 20567427 - 20567329
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| Q |
52 |
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150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20567427 |
caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
20567329 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20573620 - 20573522
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| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20573620 |
caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
20573522 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
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Target Start/End: Complemental strand, 22736127 - 22735839
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33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | | |
|
|
| T |
22736127 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttttcatcaacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattaacaacaacaacatcagtt |
22736028 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatatacca-acttc |
229 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| || || |
|
|
| T |
22736027 |
agcaagaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatttgatcata-attcaacatatatcatttttt |
22735929 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
320 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| | || || |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| | ||||| | ||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
22735928 |
ttatactttgaacatgaagttttaccaacaacaactcaattatcaaccacttcatgcat-tcaacatattatcataattggagcacgaatt |
22735839 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
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211 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
310 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||| | | |
|
|
| T |
17285341 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattgg |
17285440 |
T |
 |
| Q |
311 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatga-tg |
404 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || ||||| |||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||| || |
|
|
| T |
17285441 |
agcacgaattctaacaattatgaacaattattcaatt-attcaattaagcacttaatcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgattg |
17285538 |
T |
 |
| Q |
405 |
aacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17285539 |
aattctaacccccttaccttaattatc |
17285565 |
T |
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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
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Target Start/End: Complemental strand, 20567268 - 20567184
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| Q |
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136 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20567268 |
caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaa |
20567184 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
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Target Start/End: Original strand, 39115267 - 39115409
Alignment:
| Q |
67 |
atttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttat |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
39115267 |
atttctcaacaataaattatgaatcatgcatacacaagtcatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatat |
39115366 |
T |
 |
| Q |
166 |
cacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39115367 |
cacgattcatcaacaactatgcataattcaccaattgagcata |
39115409 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 425
Target Start/End: Original strand, 33528383 - 33528778
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| Q |
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atcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgaca |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| ||| || || | |
|
|
| T |
33528383 |
atcaacccattttacaaaatcaacaacaacaacccatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaa-aatatctct |
33528481 |
T |
 |
| Q |
131 |
tatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttc |
229 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||| | ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
33528482 |
tagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcaca-attcaacatatatcattttc |
33528580 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat |
329 |
Q |
| |
|
||||| ||| || |||| | |||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||| || | |
|
|
| T |
33528581 |
atatactaagaagatacaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacggaattcaacatct |
33528680 |
T |
 |
| Q |
330 |
atgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
| || |||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33528681 |
aagaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
33528778 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20529839 - 20529748
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| Q |
335 |
caattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20529839 |
caattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattataacccccttacctta |
20529748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 429
Target Start/End: Original strand, 29306450 - 29306776
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| Q |
107 |
tgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagc |
205 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
29306450 |
tgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagc |
29306549 |
T |
 |
| Q |
206 |
atattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcata |
305 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| || ||| || ||||||||||| || | || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
29306550 |
ata-attcaacatatatcattttcacaaactttgaacatacaaattcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattagaacatatcatcata |
29306648 |
T |
 |
| Q |
306 |
aatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatga |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | | || ||||| |||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
29306649 |
gttagagcacgaatattaacatctatgaacaatcaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatga |
29306747 |
T |
 |
| Q |
403 |
-tgaacactaacccc-cttaccttaatta |
429 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29306748 |
ttgaattctaacccctcttaccttaatta |
29306776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
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| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaat |
149 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| || |
|
|
| T |
25122513 |
caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatctat |
25122611 |
T |
 |
| Q |
150 |
tgatcat |
156 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
25122612 |
tgatcat |
25122618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
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Target Start/End: Complemental strand, 18261762 - 18261469
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| Q |
32 |
atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||| || ||| |||||| | ||| | |||||||| |||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
18261762 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
18261663 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||| ||||| || || |
|
|
| T |
18261662 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcaca-attcacaatatatcatttt |
18261564 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
323 |
Q |
| |
|
| |||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18261563 |
cacatactatgaagatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataactagagcacgaatttca |
18261469 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 38635913 - 38635541
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57 |
acaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatca |
155 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | || |
|
|
| T |
38635913 |
acaacaacttgtttctcatcaacaaattatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaaca |
38635814 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaac |
254 |
Q |
| |
|
||| || |||| ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||| |||| ||||| || ||| |||| | |||||||| |||| || |
|
|
| T |
38635813 |
tgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagtata-attcacaatatatcattttcgcatattatgaacatgcaatttcac |
38635715 |
T |
 |
| Q |
255 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaa |
354 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| || || ||| |
|
|
| T |
38635714 |
caacaacaattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatgataactagagcacgaatttcaacaactatgaacaaagattcactt-attcaa |
38635616 |
T |
 |
| Q |
355 |
ttaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38635615 |
ttaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttacctta |
38635541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 176
Target Start/End: Original strand, 15969796 - 15969920
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| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattg |
151 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| || || ||| ||| ||| |||||| |
|
|
| T |
15969796 |
caccaacaacaactcatttctcctctacaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaatagcaacatcacttaacaacaactacaccaattg |
15969895 |
T |
 |
| Q |
152 |
atcatgaaacttatcacaattcaac |
176 |
Q |
| |
|
| |||||| || | || |||||||| |
|
|
| T |
15969896 |
aacatgaatctcagcataattcaac |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
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27 |
tcattatcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
124 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
29759893 |
tcataatcaacccatttacaccaaaacaccaacaacaaaccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat |
29759992 |
T |
 |
| Q |
125 |
atgac |
129 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
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atgac |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23226368 - 23226214
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| Q |
32 |
atcaacccattt--tacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatga |
128 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||| | ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
23226368 |
atcaacccatttcttacaaaaccaacaacaacaatccatttctcataatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatca |
23226269 |
T |
 |
| Q |
129 |
catatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
| || ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23226268 |
cttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca |
23226214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27233348 - 27233205
Alignment:
| Q |
41 |
ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||| || |
|
|
| T |
27233348 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcattatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaa |
27233249 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27233248 |
caacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaaca |
27233205 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 429
Target Start/End: Original strand, 22742717 - 22743122
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| Q |
32 |
atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | | || | ||| | |||||||||| |||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
22742717 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcaacaaaccaagatttatgaacacccaagccacgaatcatcaacaacaatattcc |
22742816 |
T |
 |
| Q |
130 |
---atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaa |
225 |
Q |
| |
|
| | ||| ||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||| | || || ||||| || |
|
|
| T |
22742817 |
tcaacaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaatt-cacaatatatcat |
22742915 |
T |
 |
| Q |
226 |
cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc |
325 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| ||||| | ||||||||||||| | |
|
|
| T |
22742916 |
tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcactcaaacatatcaccataatcaaagcacgaatttcaac |
22743015 |
T |
 |
| Q |
326 |
acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttac |
421 |
Q |
| |
|
| ||||| ||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22743016 |
aactatgaacaaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttac |
22743114 |
T |
 |
| Q |
422 |
cttaatta |
429 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
22743115 |
cttaatta |
22743122 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
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Target Start/End: Original strand, 23149736 - 23150078
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| Q |
32 |
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128 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||| | |
|
|
| T |
23149736 |
atcaacccatttcttacaaaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcaacaacaacatca |
23149835 |
T |
 |
| Q |
129 |
catatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaact |
227 |
Q |
| |
|
| || ||| || |||| | ||||| ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| | |
|
|
| T |
23149836 |
cttagcaacaaaaacaactattgaacatgattctcatcataatt---caacaacttagcataattcaaccaattgagcata-attcataccataccactt |
23149931 |
T |
 |
| Q |
228 |
tctcatactttgaa-catgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca |
326 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| |||| |||| || |||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||||||||| | || |
|
|
| T |
23149932 |
tcacatattttgaatcatgaaatttcaccaacaacaattcatttatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattttaaca |
23150031 |
T |
 |
| Q |
327 |
catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaa |
373 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23150032 |
attatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttactcatacaa |
23150078 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #45
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| Q |
84 |
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183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || || || || ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24385988 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataaaatcacttaacaacaacaacatctattgatcatta---------caattcatcaacaaca |
24385898 |
T |
 |
| Q |
184 |
atgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24385897 |
atgcttaattcaccaattgagcata |
24385873 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #46
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41 |
ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || ||||| || ||| |||||| | ||| | || |||||||||||| |||| |||||| || || || ||| || |
|
|
| T |
33611334 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatatctcatcatcaaatcatgatttatgaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaa |
33611235 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||| || | |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33611234 |
caacatcaattaaacatggttctcaacacaattcaacaacaacatagcataattca |
33611179 |
T |
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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
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Target Start/End: Complemental strand, 45559161 - 45558935
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97 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcac |
196 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
45559161 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
45559062 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaaca |
295 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | |||| ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| |
|
|
| T |
45559061 |
caattagagcaca-attcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtactcaaaca |
45558963 |
T |
 |
| Q |
296 |
tgtcatcataaatagagcacgaatttca |
323 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
45558962 |
tatcatcataacaagagcatgaatttca |
45558935 |
T |
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Target: chr8; HSP #48
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138 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||| || | || ||| | |
|
|
| T |
31194606 |
attttacaaagtcaccaacaacaactcatttttcaccaacaaatcatgaatcatgtgcacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaaca |
31194507 |
T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatg |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
31194506 |
acaacatcaattgaacatg |
31194488 |
T |
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Target: chr8; HSP #49
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40 |
attttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat |
126 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
17285232 |
attttgcaaaactaccaacaacaactcatttctcatcctcaagtcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacat |
17285319 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #50
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| Q |
82 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaa |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||| |||| |||||||||| || | || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23152072 |
tcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacatagcaacaacagcatcaattgaacacggttctcatcataattcaacaacaa |
23151973 |
T |
 |
| Q |
182 |
caatgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataact |
280 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||||| ||| | |||| |||||| ||| | | |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
23151972 |
catatcataattcaaccaattgggca-aaattcacttcataccactttcatacaatttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcactagtt |
23151874 |
T |
 |
| Q |
281 |
tcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatca |
344 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| || ||||||||| | || ||||||||| | || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23151873 |
tcatgcattcaaatatatcatcataattggaacacgaattttaacaaatatgaacaattaatca |
23151810 |
T |
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Target: chr8; HSP #51
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32 |
atcaacccattt--tacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatga |
128 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
23158118 |
atcaacccatttcgtacaaaaccaacaagaacaactcatttttcattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatga---atcatcaacaacatca |
23158214 |
T |
 |
| Q |
129 |
catatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
| || || ||||||| | ||||| |||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23158215 |
cttaggaacaacaacaactattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcaaccaattgagcata |
23158295 |
T |
 |
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394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16404931 |
tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatc |
16404894 |
T |
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tatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt |
201 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
22497399 |
tatcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaatt |
22497329 |
T |
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
24929087 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaat-atgcatacccaagcaatga |
24929018 |
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| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
274767 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
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T |
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394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
641082 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
641045 |
T |
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394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
826888 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
826851 |
T |
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attttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| || | |||||||||| | | ||| || |
|
|
| T |
3431570 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaacaa |
3431471 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaat |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
3431470 |
caacatcaat |
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T |
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32 |
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129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| || || || |||||| | ||| | ||| |||| |||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
18041823 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcataaactcatgatttatgaacacctaagctatgaatcatcaacaacaatatatc |
18041724 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18041723 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaaca |
18041670 |
T |
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Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31194253 |
aaaaatgattatgatgaaaactaacccccttacctta |
31194217 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
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Target Start/End: Original strand, 39115599 - 39115635
Alignment:
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394 |
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430 |
Q |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 27 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 55376893 - 55376494
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124 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55376893 |
tcataatcaacccattttcatcaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
55376794 |
T |
 |
| Q |
125 |
atgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacca |
224 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
55376793 |
ataatttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgagtatattttca-cacataccc |
55376695 |
T |
 |
| Q |
225 |
acttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcat |
324 |
Q |
| |
|
| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55376694 |
atttttcatacttagaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcat |
55376595 |
T |
 |
| Q |
325 |
cacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
424 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55376594 |
cacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatttcaaaagtgattatgatgaagactaacccccttacctt |
55376495 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Original strand, 16732146 - 16732520
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
16732146 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacgacatcaatt |
16732245 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16732246 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
16732345 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16732346 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcac |
16732445 |
T |
 |
| Q |
351 |
ccaattaagcacttatcatacaaataatt-gaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||| | |||||||| |
|
|
| T |
16732446 |
ccaattaagcacttttcatac-actaattaaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacctctttacctta |
16732520 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Original strand, 44055892 - 44056266
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | ||||||||||||| |
|
|
| T |
44055892 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatggctaaaccacaacaacatcaatt |
44055991 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44055992 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatattcatttttcatactttgaacatgtaatt |
44056091 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44056092 |
caactaacaacaattcaaa-attcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcat |
44056190 |
T |
 |
| Q |
351 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44056191 |
ccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
44056266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
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Target Start/End: Complemental strand, 23270204 - 23269829
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| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23270204 |
caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt |
23270105 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaa |
248 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23270104 |
gatcatgatacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcatcaattgagtatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaa |
23270006 |
T |
 |
| Q |
249 |
ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattc |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23270005 |
ttcaactaac-acaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattc |
23269907 |
T |
 |
| Q |
349 |
atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23269906 |
atccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
23269829 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 40 - 425
Target Start/End: Original strand, 34395222 - 34395609
Alignment:
| Q |
40 |
attttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
138 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
34395222 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatagcaaca |
34395321 |
T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--act |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||| |
|
|
| T |
34395322 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacact |
34395420 |
T |
 |
| Q |
237 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
336 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
34395421 |
ttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcattacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaaca |
34395519 |
T |
 |
| Q |
337 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34395520 |
attaatcagttcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgataatgatgaattctaacccccttacctta |
34395609 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 53705003 - 53704629
Alignment:
| Q |
52 |
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150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
53705003 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
53704904 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
53704903 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatactttgaacatacaatt |
53704805 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
53704804 |
caactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcat |
53704705 |
T |
 |
| Q |
351 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53704704 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaataacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
53704629 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 80 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 45459096 - 45458769
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179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45459096 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcttcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcaacaac |
45458997 |
T |
 |
| Q |
180 |
aacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataac |
279 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
45458996 |
agcaaagcataattcaccaattgaacatatctttaacatatacaaacttctcatattttgagcatgtaattcaactaacaacaattcaattatctatcac |
45458897 |
T |
 |
| Q |
280 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataatt |
379 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
45458896 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataatt |
45458797 |
T |
 |
| Q |
380 |
gaaaattacaa-aagtgattatgatgaa |
406 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
45458796 |
gaaaattgcaataaatgattatgatgaa |
45458769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Original strand, 30457880 - 30458255
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| Q |
52 |
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149 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||| | ||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
30457880 |
caccaacaacatctcatttctctataacaaaataatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaat |
30457978 |
T |
 |
| Q |
150 |
tgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcgtaattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttacatactttgaacatgtaat |
30458078 |
T |
 |
| Q |
250 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
349 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
30458079 |
tcaaccaacaacaatttaattatccataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
30458178 |
T |
 |
| Q |
350 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30458179 |
tccaattaagcacttttcatacaaataattcaaaattacaataagtaattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 57 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12837464 - 12837096
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57 |
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155 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
12837464 |
acaacaacttatttctca-caacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgacca |
12837366 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaact |
255 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12837365 |
tgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaact |
12837266 |
T |
 |
| Q |
256 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
355 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12837265 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatatcatcatttatggacaattaatcaattcacccaat |
12837166 |
T |
 |
| Q |
356 |
taagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12837165 |
taagcacttttcattcaaa-aattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
12837096 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 64 - 425
Target Start/End: Original strand, 44346816 - 44347177
Alignment:
| Q |
64 |
ctcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaact |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
44346816 |
ctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacgacatcactaaacaacaacaacaacatttgatcatgaaaca |
44346915 |
T |
 |
| Q |
163 |
tatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaac |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || || | |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
44346916 |
tatcacaattcatgaacaacaatgtataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcttacactttgaacatgtaattcaactaaca-c |
44347013 |
T |
 |
| Q |
262 |
aattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagca |
361 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44347014 |
aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagca |
44347113 |
T |
 |
| Q |
362 |
cttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
44347114 |
cttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaactcccttacctta |
44347177 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 96 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8872699 - 8872372
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96 |
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192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8872699 |
aacccaagccatgagttatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaacgcataat |
8872600 |
T |
 |
| Q |
193 |
tcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaa |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8872599 |
tcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacacttcaatcattcatagcttcatacatctaa |
8872501 |
T |
 |
| Q |
293 |
acatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaa |
392 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8872500 |
acatgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaa |
8872401 |
T |
 |
| Q |
393 |
gtgattatgatgaacactaacccccttac |
421 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8872400 |
gtgattatgatgaattctaacccccttac |
8872372 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 67 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 21959718 - 21959359
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165 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21959718 |
atttctcaaccacaaactatgaatcatgcaagcccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttat |
21959619 |
T |
 |
| Q |
166 |
cacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatt |
265 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21959618 |
cacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttg-agatgtaattcaatcaacaacaatt |
21959520 |
T |
 |
| Q |
266 |
caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta |
365 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
21959519 |
caaatatccataacttcatacatttaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatcaattaattcacccaaataagcacttt |
21959420 |
T |
 |
| Q |
366 |
tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21959419 |
tcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
21959359 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
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Target Start/End: Complemental strand, 53907966 - 53907604
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150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
53907966 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaatcaacaacaaca---att |
53907870 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
53907869 |
gatcatgaaacatttcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgggcatattttca-cacatacccatttttcatactttgaacatacaatc |
53907771 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
53907770 |
caactaataacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatta--------at |
53907679 |
T |
 |
| Q |
351 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53907678 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaactacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
53907604 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
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Target Start/End: Complemental strand, 820177 - 819826
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58 |
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155 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
820177 |
caacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaaca---attgatca |
820082 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaact |
255 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| | ||| |||| |
|
|
| T |
820081 |
tgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacacattt-tcaca-----aac--------caac- |
819997 |
T |
 |
| Q |
256 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
355 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
819996 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaat |
819897 |
T |
 |
| Q |
356 |
taagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
819896 |
taagcatttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13809775 - 13809405
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155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13809775 |
acaacatctcatttctcaacaaccaatcatgaatcatgcatatccaagccatgaattatcatcaacaacatcaattagcaacaacaacatcaattgatca |
13809676 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcacc-aattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaac |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
13809675 |
tgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaactaattgagcatattt-caacatataccattttctcatactttgaacatgaaatctcac |
13809577 |
T |
 |
| Q |
255 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaa |
354 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| || || |
|
|
| T |
13809576 |
caacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc-aa |
13809478 |
T |
 |
| Q |
355 |
ttaagcacttat-catacaaataattgaaaatta-caa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13809477 |
ttaagcacttattcatacaa-taattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
13809405 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 210 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20813658 - 20813442
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309 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20813658 |
tttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataatta |
20813559 |
T |
 |
| Q |
310 |
gagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaaca |
408 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20813558 |
gagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcatttttcatacaaataatttaaaattgcaataagtgattatgatgaatt |
20813459 |
T |
 |
| Q |
409 |
ctaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20813458 |
ctaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
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Target Start/End: Original strand, 27960938 - 27961324
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139 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| || |
|
|
| T |
27960938 |
ttttaccaaactaccaacaatatctcatttctcaacaataaatcat-aatcatgcatacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttaacaacaa |
27961036 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttc-tcatactt |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
27961037 |
caacatcaattgatcatgaatcttataacaattcaacaacaatataacataattcaaccaatttagcata-tttcaacatatacc-acttcttcatactt |
27961134 |
T |
 |
| Q |
238 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
337 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| | || ||||| ||| |
|
|
| T |
27961135 |
tgaacatgaaattccactaacaacaattcaattattcataacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacggattctaacaattatgaacaa |
27961234 |
T |
 |
| Q |
338 |
ttaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27961235 |
ttaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaacaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
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Target Start/End: Complemental strand, 52265749 - 52265403
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179 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| || ||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52265749 |
aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaac |
52265650 |
T |
 |
| Q |
180 |
aacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataa |
278 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
52265649 |
aacattgcataattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacataaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaa |
52265551 |
T |
 |
| Q |
279 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataa |
377 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
52265550 |
cttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaatt-acccaattaaacacttattcatac-aataa |
52265453 |
T |
 |
| Q |
378 |
ttg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52265452 |
ttgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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Target: chr4; HSP #19
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Target Start/End: Complemental strand, 18494602 - 18494224
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146 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| || || ||| |||| || | |
|
|
| T |
18494602 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccatgagttaccatcaacaacatcacttaacaacaacagcaac |
18494503 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacatatacca-acttctcatactttgaacat |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18494502 |
aattgatcatgaatcttaacacaattcaacaacaacatagcatcatccaaccaattgagcaca-tttcaacatataccatttttctcatactttgatcat |
18494404 |
T |
 |
| Q |
245 |
gtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatca |
344 |
Q |
| |
|
| | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
18494403 |
gaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattgatca |
18494305 |
T |
 |
| Q |
345 |
attcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18494304 |
att-acacaattaagcacctattcatac-cataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
18494224 |
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Target: chr4; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 57 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30232761 - 30232391
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Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||| |
|
|
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T |
 |
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tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac--ttctcatactttgaacatgtaattcaa |
253 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||| |||| | || | |
|
|
| T |
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tgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatactttgatcatgaagtttca |
30232564 |
T |
 |
| Q |
254 |
ctaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcca |
353 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | || |
|
|
| T |
30232563 |
ccaacaacaattcaattat-cataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-acaca |
30232466 |
T |
 |
| Q |
354 |
attaagcactta-tcatacaaataattg--aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30232465 |
attaagcacttattcatac-cataattgaaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccctcttacctta |
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Target: chr4; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 32 - 425
Target Start/End: Original strand, 15044784 - 15045181
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32 |
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Q |
| |
|
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15044784 |
atcaacccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcac |
15044883 |
T |
 |
| Q |
130 |
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228 |
Q |
| |
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| T |
15044884 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcacttt |
15044982 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca |
328 |
Q |
| |
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| T |
15044983 |
ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaat |
15045082 |
T |
 |
| Q |
329 |
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424 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
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| T |
15045083 |
tatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacccccttacctt |
15045180 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 7186159 - 7185735
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102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||| | || | |||||| |
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|
| T |
7186159 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaaca---acaacaactcatatctcatcatcaaatcatgatttataaacacccaa |
7186063 |
T |
 |
| Q |
103 |
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201 |
Q |
| |
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| T |
7186062 |
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7185963 |
T |
 |
| Q |
202 |
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301 |
Q |
| |
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| ||| | ||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||| |
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| T |
7185962 |
gtgcaca-attcaacatatatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcat |
7185864 |
T |
 |
| Q |
302 |
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399 |
Q |
| |
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| T |
7185863 |
cataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgatta |
7185765 |
T |
 |
| Q |
400 |
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429 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7185764 |
tgatgaattctaacctccttaccttaatta |
7185735 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15109640 - 15109243
Alignment:
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32 |
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129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| || | ||||||| | |||||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||| || || |
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| T |
15109540 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttatcaatttgagtata-attcaacatatatcacttt |
15109442 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca |
328 |
Q |
| |
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| T |
15109441 |
ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaactat |
15109342 |
T |
 |
| Q |
329 |
tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
424 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
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| T |
15109341 |
tatgaataattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacccccttacctt |
15109244 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41166228 - 41165983
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138 |
Q |
| |
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| T |
41166228 |
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41166129 |
T |
 |
| Q |
139 |
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237 |
Q |
| |
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| T |
41166128 |
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T |
 |
| Q |
238 |
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284 |
Q |
| |
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|||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |
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|
| T |
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tgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcat |
41165983 |
T |
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Target: chr4; HSP #25
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Target Start/End: Original strand, 14951713 - 14951896
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
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| T |
14951713 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat |
14951812 |
T |
 |
| Q |
125 |
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208 |
Q |
| |
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||||| | || ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
14951813 |
atgactaaataacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
14951896 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25119498 - 25119328
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137 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | ||| |
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| T |
25119498 |
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25119399 |
T |
 |
| Q |
138 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25119398 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaaaaccatgcataattcaccaattgatcata |
25119328 |
T |
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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 47535254 - 47535042
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230 |
Q |
| |
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||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||| |
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| T |
47535254 |
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47535156 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
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| T |
47535155 |
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47535056 |
T |
 |
| Q |
331 |
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344 |
Q |
| |
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||| |||||||||| |
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| T |
47535055 |
tgaacaattaatca |
47535042 |
T |
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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 425
Target Start/End: Original strand, 14901197 - 14901584
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138 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||| ||||| ||| || || ||| | |
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|
| T |
14901197 |
attttacaaaaccaccaacaacaacccatttctcatcatcaattcatgaattatgcacacccatgtcatgaatcatcaacaacagcatcacttagcaaca |
14901296 |
T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcacca-attgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
237 |
Q |
| |
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|
| T |
14901297 |
acaacatcaattgaatatgattcttaccacaattcaataataacatatcataattcaacattttgagcata-tttaaacatatatcactttctcatactt |
14901395 |
T |
 |
| Q |
238 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
337 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || |||||||| |||||| || | || ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| | || |||||| ||| |
|
|
| T |
14901396 |
caaacatgaaatttcaccaacaacaa-tcaattttcaacaatttcatacattcaaacatattgtcataattagagcacgaattataacaaatatgaacaa |
14901494 |
T |
 |
| Q |
338 |
ttaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
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|||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14901495 |
ttaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaaatgattatgatgaaatttaacccccttacctta |
14901584 |
T |
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Target: chr4; HSP #29
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40 |
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137 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
5682817 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatatatcatcatcaacaatatga-ataaaaaac |
5682719 |
T |
 |
| Q |
138 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||| | | | |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5682718 |
aacaacaaccaataatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15272586 - 15272433
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acaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatc |
154 |
Q |
| |
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||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||| |
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| T |
15272586 |
acaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatc |
15272487 |
T |
 |
| Q |
155 |
atgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15272486 |
atggaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15272433 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 425
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131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | |||||||| | ||| | || |||||||||||| |||| |||||| || || | |
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|
| T |
7965000 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
7964901 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
| ||| ||||| ||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |
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|
| T |
7964900 |
agcaacaacaaaatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttca |
7964802 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||| |||| | || || |
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| T |
7964801 |
catac-ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattttaacaacta |
7964703 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
7964702 |
tgaacaattactcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 41256660 - 41256263
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32 |
atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| || ||| |||||| | ||| | |||||| |||||||| |||| |||||| || | |
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|
| T |
41256660 |
atcaacccatttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatctc |
41256561 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
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|| ||| ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| || || ||||| || || |
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| T |
41256560 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatggttctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcatttt |
41256462 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca |
328 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |
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| T |
41256461 |
cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-tcaacatttcatcataattagagcacgaatttcaacaac |
41256363 |
T |
 |
| Q |
329 |
tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctt |
424 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| || || ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
41256362 |
tatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Original strand, 16522748 - 16522896
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
16522748 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag |
16522847 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
152 |
Q |
| |
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| T |
16522848 |
ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga |
16522896 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 384
Target Start/End: Original strand, 18276392 - 18276743
Alignment:
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33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||| | ||| |||||| | ||| | ||||||||||| ||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
18276392 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaatactcatcgtcaaatcatgatttatgaacacccaagccatcaatcatcaacaacaatatcactt |
18276491 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | ||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
18276492 |
tgcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttca |
18276590 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
18276591 |
catgctttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaacta |
18276690 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa |
384 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18276691 |
tgaacaattaatcacat-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaa |
18276743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Original strand, 9295624 - 9295772
Alignment:
| Q |
5 |
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103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
9295624 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaactcattttacataaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag |
9295723 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
152 |
Q |
| |
|
|||| | | || ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
9295724 |
ccataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga |
9295772 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15013573 - 15013177
Alignment:
| Q |
32 |
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129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| | | ||||||| |||||||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
15013573 |
atcaacccatttttataaaacaaacaacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctc |
15013474 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||| ||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| || || |||| || || |
|
|
| T |
15013473 |
ttaacaacaacaatatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatgtcatttt |
15013375 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca |
328 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |
|
|
| T |
15013374 |
cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcat-tcaacatatcatcataattagagcacgaatttaaacaac |
15013276 |
T |
 |
| Q |
329 |
tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctt |
424 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| || || ||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15013275 |
tatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatac-aacaaatgaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctt |
15013178 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19822065 - 19821914
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| Q |
33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
19822065 |
tcaactcattttacaaagtcaccaaaaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacat |
19821966 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
19821965 |
agcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaataaca |
19821914 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37957314 - 37957163
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| Q |
33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || | |
|
|
| T |
37957314 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccgtgaattatcaataacaacatcactt |
37957215 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
| || ||| ||||||||||| |||||| || | || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37957214 |
agcagcaaccacatcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatcaaca |
37957163 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Original strand, 38764715 - 38765066
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80 |
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179 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || |||| |||| |||||| |
|
|
| T |
38764715 |
aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattgaacaac |
38764814 |
T |
 |
| Q |
180 |
aacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataa |
278 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||| || ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
38764815 |
aacatcgcataattcaacaatttgagcaca-attcacaatataacattttcacatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa |
38764913 |
T |
 |
| Q |
279 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcac-ttatcatacaaataa |
377 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| || ||||| || ||||||||||||| || ||||| || ||||||||| || ||| ||||||| ||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
38764914 |
tttcattcattcaaacatatccccataattaaagcacgaatttcaacaactatga-aaaataatcaatt-attcaactaagcactttatcatgcaattaa |
38765011 |
T |
 |
| Q |
378 |
ttgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttaccttaatta |
429 |
Q |
| |
|
| |||||||||| || ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38765012 |
tgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaaccctcttaccttaatta |
38765066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40905214 - 40904932
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| Q |
41 |
ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| |||||| | ||| | |||||||||| || | |||| |||||| || | || ||| || |
|
|
| T |
40905214 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccacgagtcatcaacaacaatatctcttagcaacaa |
40905115 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| | | |||| || | || ||| |||||| | |
|
|
| T |
40905114 |
caacatcaattaa-catgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattggagtaca-attcacaatgcatcattttcacatactat |
40905017 |
T |
 |
| Q |
239 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
323 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
40905016 |
gaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcagcaatttcatgtattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttca |
40904932 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
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Target Start/End: Complemental strand, 18238381 - 18238155
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| Q |
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196 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
18238381 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
18238282 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaaca |
295 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | |||| ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || |||| || ||||| |
|
|
| T |
18238281 |
caattagagcaca-attcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaaca |
18238183 |
T |
 |
| Q |
296 |
tgtcatcataaatagagcacgaatttca |
323 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18238182 |
tatcatcataacaagagcacgaatttca |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #42
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Target Start/End: Complemental strand, 10104454 - 10104380
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132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
206 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10104454 |
atcaacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
10104380 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #43
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acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcac |
196 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | |||| ||||||||| | || ||| || |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
15675328 |
acccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcac |
15675229 |
T |
 |
| Q |
197 |
caattgagca |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
15675228 |
caattgagca |
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T |
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Target: chr4; HSP #44
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97 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcac |
196 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | |||| ||||||||| | || ||| || |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| | | ||||||| |
|
|
| T |
31115653 |
acccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcac |
31115752 |
T |
 |
| Q |
197 |
caattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
31115753 |
caattgagcata |
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T |
 |
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Target: chr4; HSP #45
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| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca |
214 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40885758 |
atcaacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataatttca |
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T |
 |
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Target: chr4; HSP #46
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394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
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Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54118199 |
tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatc |
54118162 |
T |
 |
Back To:
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| Q |
40 |
attttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
47535328 |
attttacaaaaccatcaacaacaactcatttctcattaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaat |
47535256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
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97 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
54398406 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaaca |
54398492 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
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97 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcac |
196 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| ||| || || | || ||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
13590298 |
acccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa |
13590199 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatt |
201 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
13590198 |
caatt |
13590194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:
Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 59 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11970 - 11603
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Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11970 |
aacatctcatttctcaacaccaatcatgaaccatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatga |
11871 |
T |
 |
| Q |
159 |
aacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaac |
258 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
11870 |
aacttatcaaaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactaatacccatttttcatactttgaacatgtaattcatccaac |
11771 |
T |
 |
| Q |
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aacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaa |
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Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11770 |
aacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacaaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaa |
11671 |
T |
 |
| Q |
359 |
gcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11670 |
gcacttatcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttagctta |
11603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:
Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 48 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 118237 - 117857
Alignment:
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146 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
118237 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaccccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc |
118138 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
246 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
118137 |
aactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaacatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
118038 |
T |
 |
| Q |
247 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaat |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
118037 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
117938 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcatccaattaagcacttatcatacaaataattg---aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
117937 |
tcagccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
117857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 48 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 109736 - 109356
Alignment:
| Q |
48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
146 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
109736 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaatcccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc |
109637 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
109636 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaatttatcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgt |
109537 |
T |
 |
| Q |
247 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaat |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
109536 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
109437 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcatccaattaagcacttatcatacaaataattg---aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
109436 |
tcagccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
109356 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 87)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 64 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 50112309 - 50111946
Alignment:
| Q |
64 |
ctcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaact |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50112309 |
ctcatttctcaaaaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaact |
50112210 |
T |
 |
| Q |
163 |
tatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
50112209 |
tatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaaca |
50112110 |
T |
 |
| Q |
263 |
attcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcac |
362 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50112109 |
attcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcac |
50112010 |
T |
 |
| Q |
363 |
ttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50112009 |
ttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
50111946 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 57 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12349809 - 12349434
Alignment:
| Q |
57 |
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150 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| || ||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12349809 |
acaacaacttatttctcatcatcaaattatgaatcatgcaaaccatggccaagccatgatttatcatctacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
12349710 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12349709 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataacaacttctcacactttgaacatgtaatt |
12349610 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
12349609 |
caactaacaacaattcaattatccataaatttatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaattaattcac |
12349510 |
T |
 |
| Q |
351 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12349509 |
ccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
12349434 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 85 - 425
Target Start/End: Original strand, 8631801 - 8632142
Alignment:
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85 |
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184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8631801 |
tgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatttgttatgaaacttatcacaatccaacaacaacaa |
8631900 |
T |
 |
| Q |
185 |
tgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcat |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8631901 |
agcataattcactaaataagcatattttcaacatataccaacttctcaaactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcat |
8632000 |
T |
 |
| Q |
285 |
acatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
384 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8632001 |
acatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttaagaacaattaattaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaa |
8632100 |
T |
 |
| Q |
385 |
ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8632101 |
ttgcaataagtgattatgatgaatcctaacccccttacctta |
8632142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Original strand, 14298399 - 14298773
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
14298399 |
caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaataacaacatcaattg |
14298498 |
T |
 |
| Q |
152 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | || | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14298499 |
atcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactttgaacatgtaattc |
14298598 |
T |
 |
| Q |
252 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
351 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
14298599 |
aactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
14298698 |
T |
 |
| Q |
352 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14298699 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
14298773 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Original strand, 14304026 - 14304400
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| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattg |
151 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
14304026 |
caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaataacaacatcaattg |
14304125 |
T |
 |
| Q |
152 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | || | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14304126 |
atcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactttgaacatgtaattc |
14304225 |
T |
 |
| Q |
252 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
351 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
14304226 |
aactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
14304325 |
T |
 |
| Q |
352 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14304326 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
14304400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
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Target Start/End: Original strand, 54423986 - 54424364
Alignment:
| Q |
48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatca |
147 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| | || || ||| |||||||||| |
|
|
| T |
54423986 |
aaaccaacaacaacaacttatttctcataacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacgtcacttagcaataacaacatca |
54424085 |
T |
 |
| Q |
148 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgta |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54424086 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcaatttctcatactttgaacatgta |
54424185 |
T |
 |
| Q |
248 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaatt |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
54424186 |
attcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt |
54424285 |
T |
 |
| Q |
348 |
catccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt-acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54424286 |
cacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgaaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Original strand, 13817492 - 13817862
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caccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
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caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac---taaacaacaacaacaatt |
13817588 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaa |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13817589 |
gatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttcca-catatacccattt-tcatacactttgaacatgtaa |
13817686 |
T |
 |
| Q |
249 |
ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattc |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13817687 |
ttcaactaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgtacaattaatcaattc |
13817785 |
T |
 |
| Q |
349 |
atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13817786 |
atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
13817862 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 317778 - 317405
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Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||| ||||||| | | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
317778 |
caccaacaacatctcatttctccacaacaaaccaagaattatacaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
317679 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
317678 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatttagcatattttca-cacatacccatttttcatactttgaacatacaatt |
317580 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
317579 |
caactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcatacttagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcat |
317480 |
T |
 |
| Q |
351 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
317479 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
317405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 60 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16996321 - 16995956
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60 |
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158 |
Q |
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16996222 |
T |
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| Q |
159 |
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258 |
Q |
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| T |
16996221 |
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16996123 |
T |
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259 |
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358 |
Q |
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| T |
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16996023 |
T |
 |
| Q |
359 |
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425 |
Q |
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T |
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250 |
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T |
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T |
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Q |
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T |
 |
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254 |
Q |
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T |
 |
| Q |
255 |
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354 |
Q |
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| T |
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T |
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355 |
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Q |
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T |
 |
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248 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
249 |
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348 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
349 |
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425 |
Q |
| |
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T |
 |
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350 |
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35123971 |
T |
 |
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T |
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gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
249 |
Q |
| |
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T |
 |
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349 |
Q |
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T |
 |
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Q |
| |
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T |
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Q |
| |
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T |
 |
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Q |
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| T |
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T |
 |
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aagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
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Q |
| |
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T |
 |
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gaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaacta |
256 |
Q |
| |
|
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| T |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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T |
 |
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aagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
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| |
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|||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
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Q |
| |
|
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|
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T |
 |
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ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattc |
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Q |
| |
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T |
 |
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atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
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T |
 |
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| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |
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|
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T |
 |
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tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
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| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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| |
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 |
| Q |
134 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat |
233 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |
|
|
| T |
17523076 |
caacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcatcaataacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccattttgttat |
17522977 |
T |
 |
| Q |
234 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
333 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17522976 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccacatcttcatacatccaaaactgtcatcataattagagcacgaagttcatcatttatga |
17522877 |
T |
 |
| Q |
334 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattat |
430 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
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| T |
17522876 |
acaaataatcaattcacccaaataagcacttctcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttat |
17522780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 82 - 425
Target Start/End: Original strand, 17938582 - 17938925
Alignment:
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82 |
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181 |
Q |
| |
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|
|
| T |
17938582 |
tcatgaatcatgtaaacccaagccatgaatgattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaaataaccacaatccaacaacaa |
17938681 |
T |
 |
| Q |
182 |
caatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataactt |
281 |
Q |
| |
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| T |
17938682 |
caaagcataattcatcaattaagcatattttcaacatatatcaacttctcatactttgaacatgcaattcaactaacaacaattcgcttaaccat-gctt |
17938780 |
T |
 |
| Q |
282 |
catacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattga |
381 |
Q |
| |
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| T |
17938781 |
tatacatccaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcactcaagaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattga |
17938880 |
T |
 |
| Q |
382 |
aaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17938881 |
aaattgcaataagtgattatgatgaaccctaacccccttatctta |
17938925 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 48 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 55441123 - 55440803
Alignment:
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146 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||| |
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|
| T |
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aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaaaaaatcatgaattatgcatacccaagtcatgaattatcatcaacaacatcacttagcatcaacaacatc |
55441024 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
245 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
55441023 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaaccacaacatagtataattcaaccagttgagcatattttcatcatatatcattttctcatactttgaacatg |
55440924 |
T |
 |
| Q |
246 |
taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
345 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
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|
| T |
55440923 |
aaattccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaa |
55440824 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcatccaattaagcacttat |
366 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
55440823 |
ttcacccaattaagcacttat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 57 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 53898719 - 53898450
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156 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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53898620 |
T |
 |
| Q |
157 |
gaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaattcaac |
254 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
53898619 |
gaaacttatcacaatgcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatttaatgcaac |
53898521 |
T |
 |
| Q |
255 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca |
326 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53898520 |
taac-acaattcaattattcataacttcatagatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca |
53898450 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 151 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 34439513 - 34439237
Alignment:
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250 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34439513 |
gatcatgaaacttatcataattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttaaacacatacccattttacatactttgaacatgtaatt |
34439414 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatc-taaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
349 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
34439413 |
caaccaacaacaattcatttatccataacttcatacctcataaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
34439314 |
T |
 |
| Q |
350 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||| |
|
|
| T |
34439313 |
tccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaatctccttacctta |
34439237 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 425
Target Start/End: Original strand, 3578057 - 3578440
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41 |
ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| | || | |||||||||||||| || ||| || |
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|
| T |
3578057 |
ttttaccaaaacaccaacaacctctcattcctccacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagcca--atttttaatcaacaacatgacttagcaacaa |
3578154 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
238 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
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|
| T |
3578155 |
caa-atcaattgatcatgaaacttatcgcaattcaaccacaacatagcgtaattcaaccagttgagcatattttcaacatatactattttctcatacttt |
3578253 |
T |
 |
| Q |
239 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaat |
338 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
3578254 |
gaacatgaaattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacat-tcaacatgtcatcataattagagaatgaatatcatcatttatgaacaat |
3578352 |
T |
 |
| Q |
339 |
taatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3578353 |
taatcaatttacccaattaagcacttattcctac-aataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccgcttacctta |
3578440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19261104 - 19260839
Alignment:
| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatca |
155 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| | || ||| ||||||||| |||||||| |
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|
| T |
19261104 |
acaacaacttatttcataacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacattcataacatcatttaacaacaacaacatctattgatca |
19261005 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaact |
255 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19261004 |
tgaaacttatcacaattcatcaacaacttagtataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaact |
19260905 |
T |
 |
| Q |
256 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaattt |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19260904 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
19260839 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 425
Target Start/End: Original strand, 17139474 - 17139861
Alignment:
| Q |
41 |
ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |
|
|
| T |
17139474 |
ttttaccaaactaccaacaacatctcatttcgcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaa |
17139573 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
17139574 |
caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcata-tttcaacatataccattttctcatagttt |
17139672 |
T |
 |
| Q |
239 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaat |
338 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||| || | |
|
|
| T |
17139673 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacact |
17139772 |
T |
 |
| Q |
339 |
taatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17139773 |
taatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaagaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
17139861 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11329235 - 11328859
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48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
146 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |
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|
| T |
11329235 |
aaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc |
11329136 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11329135 |
aattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatataccactttctcatactttgaacatg |
11329037 |
T |
 |
| Q |
246 |
taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11329036 |
aaatttcactaacaacaattcaattattaacaactttatgc-----aacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaa |
11328942 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11328941 |
tt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11328859 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 33341812 - 33342015
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acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
104 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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acataatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
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T |
 |
| Q |
105 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33341912 |
catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcataattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag |
33342011 |
T |
 |
| Q |
205 |
cata |
208 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
33342012 |
cata |
33342015 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 186 - 425
Target Start/End: Original strand, 38527841 - 38528079
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283 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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gcataattcaccaattgagcatattttcc-cacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttca |
38527937 |
T |
 |
| Q |
284 |
tacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
383 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
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|
| T |
38527938 |
tacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaatagttgaaa |
38528037 |
T |
 |
| Q |
384 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38528038 |
attacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
38528079 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 7853913 - 7854116
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
7853913 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgattcatgcaaacccaagc |
7854012 |
T |
 |
| Q |
105 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
7854013 |
catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgaa |
7854112 |
T |
 |
| Q |
205 |
cata |
208 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
7854113 |
cata |
7854116 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 54685625 - 54685422
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| Q |
5 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
54685625 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaacagcaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaatccaagc |
54685526 |
T |
 |
| Q |
105 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54685525 |
catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag |
54685426 |
T |
 |
| Q |
205 |
cata |
208 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
54685425 |
cata |
54685422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 80 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11061247 - 11060902
Alignment:
| Q |
80 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaac |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11061247 |
aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaccaacaacatcaattgaacatgactattatcacaattcaacaac |
11061148 |
T |
 |
| Q |
180 |
aacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataa |
278 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
11061147 |
aacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacctgaaattcaactaacaacaatccaattattcataa |
11061048 |
T |
 |
| Q |
279 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataa |
377 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| || | ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
11061047 |
cttcatacatttaaaaat-tgatcataattagagcacgaatttcatcatccattaacaaataattaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataa |
11060951 |
T |
 |
| Q |
378 |
ttg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11060950 |
ttgaaaaattgcaattatgattatgatgaattccaacccccttacctta |
11060902 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6147015 - 6146764
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52 |
caccgacaacaactcatttctcaaca-acaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||| | | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||| || ||||| |
|
|
| T |
6147015 |
caccaacaacatctcatttctccatacaaaatcatgaatcatg-aaacccaagccatgaattattatcaacaacatgacttaacaacaacagcaacaatt |
6146917 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaa |
248 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6146916 |
gaccatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatgattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaa |
6146818 |
T |
 |
| Q |
249 |
ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
303 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6146817 |
ttcaactaa-tacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatca |
6146764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Original strand, 19946629 - 19946776
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| Q |
5 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19946629 |
acatcatcaaaatcaaacttctatattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
19946728 |
T |
 |
| Q |
105 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
152 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19946729 |
catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga |
19946776 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 14059478 - 14059112
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| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaaca-atcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatca |
155 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| || |
|
|
| T |
14059478 |
acaacatctcatttctcatcaacagatcatgaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatagcaacaataacatcaattgaaca |
14059379 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaac |
254 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
14059378 |
tgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaaattgagcata-tttcaacatatgtcattttctcatactttgaacatgaaatttctc |
14059280 |
T |
 |
| Q |
255 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaa |
354 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || |||| |||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
14059279 |
taaaaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattagtcaatt-agtcaa |
14059181 |
T |
 |
| Q |
355 |
ttaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt--acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttac |
421 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14059180 |
ttaagcacttattcatac-aataattgaaaattgcactaaaatgattatgatgaattataacccccttac |
14059112 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 48 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12560510 - 12560131
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| Q |
48 |
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146 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||| || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
12560510 |
aaactaccaacaacatctcatttctcaacatcaaatcatgaatcatgcatacccaagccaggaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatc |
12560411 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12560410 |
cattgatcatgaatcatatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccagttgggcatattttc-acatataccactttctcatactttgaacatg |
12560312 |
T |
 |
| Q |
246 |
taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| || ||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12560311 |
aaatttctctaacaaaaattcaagtatcaataacttcaagcattcaatcataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaa |
12560212 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12560211 |
tt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattttaacccccttacctta |
12560131 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 82 - 425
Target Start/End: Original strand, 16880131 - 16880477
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| Q |
82 |
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181 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16880131 |
tcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatccacaacatcacttagcaacaataacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaa |
16880230 |
T |
 |
| Q |
182 |
caatgcataa-ttcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataact |
280 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
16880231 |
catagcataatttcacaaattgagcatattct-aacatataccactttctcatactttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaact |
16880329 |
T |
 |
| Q |
281 |
tcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataatt |
379 |
Q |
| |
|
|| | ||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| || |||| |
|
|
| T |
16880330 |
tcttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaattcaaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaaacacttgttcatac-aacaatt |
16880427 |
T |
 |
| Q |
380 |
gaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16880428 |
gaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16880477 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12489017 - 12488727
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| Q |
32 |
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129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||| | ||||||||| ||||| || || || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12489017 |
atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcccatcattaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcac |
12488918 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || || |
|
|
| T |
12488917 |
ttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcacttt |
12488819 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
320 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
12488818 |
ctcatactttgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatccaaacacaatatcataattagagcatgaatt |
12488727 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14528286 - 14528118
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| Q |
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aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
146 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
14528286 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcattcatacccaagccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc |
14528187 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttca |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14528186 |
aattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatattttca |
14528118 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 47785064 - 47784767
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| Q |
5 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
47785064 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacagaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaag |
47784965 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattga |
203 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||| || || ||| ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47784964 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataa------------ |
47784877 |
T |
 |
| Q |
204 |
gcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
47784876 |
-------ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatca |
47784784 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12349970 - 12349834
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179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12349970 |
aatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaac |
12349872 |
T |
 |
| Q |
180 |
aacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaaca |
217 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12349871 |
tacgatgcataattcaccaattgagcatattatcaaca |
12349834 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
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42 |
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140 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| | | |
|
|
| T |
17191511 |
tttacaaaaccacc---aacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacattacttagcaacagc |
17191607 |
T |
 |
| Q |
141 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttg |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| | || ||||||||||||| |
|
|
| T |
17191608 |
aacatcaattaaacatgattcttatcacaattcagcaacaacataacataattcatcaatttgagcataatt-caacataaatcactttctcatactttg |
17191706 |
T |
 |
| Q |
240 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatt |
339 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || ||||||||||| |||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
17191707 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaatt |
17191806 |
T |
 |
| Q |
340 |
aatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||| ||| | |||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17191807 |
aatc-atttactcaattaagcaattgttcatac-aacaattgaaaaattacactaaaatgattgtgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
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Target Start/End: Original strand, 30152893 - 30153076
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27 |
tcattatcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
124 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
30152893 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat |
30152992 |
T |
 |
| Q |
125 |
atgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30152993 |
atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
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Query Start/End: Original strand, 57 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3576703 - 3576325
Alignment:
| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatca |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| | |||| || || || ||| |||||||||||| | || |
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|
| T |
3576703 |
acaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatcaatcaaaca |
3576604 |
T |
 |
| Q |
156 |
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254 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| || ||| ||||| || ||||||||| ||||||||| |||| || |
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|
| T |
3576603 |
tgactcttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatttgagcataatt-caatatatatcactttctcatacattgaacatgaaatttcac |
3576505 |
T |
 |
| Q |
255 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaa |
354 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| | || | ||| ||||||||| ||| | ||| |
|
|
| T |
3576504 |
caacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaa |
3576406 |
T |
 |
| Q |
355 |
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431 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3576405 |
ttaagcacttattcgtac-aacaattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
3576325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Original strand, 3992522 - 3992684
Alignment:
| Q |
48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacat |
145 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| |||||||| |
|
|
| T |
3992522 |
aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat |
3992621 |
T |
 |
| Q |
146 |
caattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3992622 |
ctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
3992684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17956274 - 17956109
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| Q |
40 |
attttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
138 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| | ||| | |
|
|
| T |
17956274 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
17956175 |
T |
 |
| Q |
139 |
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204 |
Q |
| |
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|||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17956174 |
acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataatacaccaattgag |
17956109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 366
Target Start/End: Original strand, 39656492 - 39656817
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| Q |
41 |
ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| | || || |||||||| |||| |||||| || || || ||| || |
|
|
| T |
39656492 |
tttttcaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacccctaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaa |
39656591 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
238 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
39656592 |
ccacatcaattgaacatgaatcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatacttt |
39656690 |
T |
 |
| Q |
239 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaat |
338 |
Q |
| |
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||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||| |||||||| | ||||||| |||| | || ||||| |||| |
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|
| T |
39656691 |
gaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaccaatttcataaattcaaacataacatcataattggagcacggattttaacaattatgaacaat |
39656790 |
T |
 |
| Q |
339 |
taatcaattcatccaattaagcacttat |
366 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
39656791 |
taatc-atttactcaattaagcacttat |
39656817 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 347
Target Start/End: Original strand, 15876034 - 15876341
Alignment:
| Q |
41 |
ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
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|||||| |||| ||| ||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||| || |
|
|
| T |
15876034 |
ttttaccaaactaccaacaccaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaatacctaagccatgaatcatcattaacaacatcacttaccaacaa |
15876133 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaac-aatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
237 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |
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|
| T |
15876134 |
caacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacttatg-ataatccaacaatttgagtat-cattcaagatatatcactttctcatactt |
15876231 |
T |
 |
| Q |
238 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
337 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | |||||||||||| ||||| | ||| |||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
15876232 |
ggaacataaaatttcatcaacaacaattcagttatcaacaacatcatgcatttaaacatattatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaa |
15876331 |
T |
 |
| Q |
338 |
ttaatcaatt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
15876332 |
ttaatcaatt |
15876341 |
T |
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Target: chr3; HSP #49
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Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Original strand, 38167896 - 38168048
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| Q |
57 |
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155 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||| |
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|
| T |
38167896 |
acaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatca |
38167995 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38167996 |
tgaaacttattacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata |
38168048 |
T |
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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Original strand, 2844172 - 2844325
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| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatc |
154 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2844172 |
acaacaacttacttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatc |
2844271 |
T |
 |
| Q |
155 |
atgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2844272 |
atgaaacttatcacaattcatcaagaaccatgcataattcaccaattgagcata |
2844325 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 208
Target Start/End: Original strand, 45581591 - 45581765
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| Q |
36 |
acccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| | ||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
45581591 |
acccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaa |
45581690 |
T |
 |
| Q |
134 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45581691 |
caacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
45581765 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #52
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Target Start/End: Original strand, 53771022 - 53771175
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| Q |
57 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
53771022 |
acaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatc |
53771121 |
T |
 |
| Q |
155 |
atgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53771122 |
atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
53771175 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
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tcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccctt |
419 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6146769 |
tcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccctt |
6146670 |
T |
 |
| Q |
420 |
acctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
6146669 |
acctta |
6146664 |
T |
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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
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aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
146 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
23492346 |
aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaactatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc |
23492445 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23492446 |
tattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatccataattcaccatttgagcata |
23492507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
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183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16261463 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc |
16261562 |
T |
 |
| Q |
184 |
atgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16261563 |
atgcataattcaccaattgagcata |
16261587 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
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caacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatcc |
274 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11196457 |
caacaacaaatcataattcaaccaattaagcatattttcaacatataccattttctca--------acataaaattcaactaacaacaattcaattatcc |
11196366 |
T |
 |
| Q |
275 |
ataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11196365 |
ataacttcatacattcaaacatatcatcattattagagcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaattca |
11196291 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
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Query Start/End: Original strand, 48 - 208
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48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
146 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||| | |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | |
|
|
| T |
54038406 |
aaaccaacaacaacaatttatttcttaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaactatatgactaaacaacaacaacaac |
54038307 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
54038306 |
cattaatcatgaaacatatcacatttcatcaacaaccatgcataattcaccaatttagcata |
54038245 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
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Query Start/End: Original strand, 27 - 320
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27 |
tcattatcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
124 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
12952915 |
tcataatcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaat |
12953014 |
T |
 |
| Q |
125 |
atgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatacc |
223 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
12953015 |
atctcttagcaacaacaacatcaattaaacataaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataac |
12953113 |
T |
 |
| Q |
224 |
aacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
320 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
12953114 |
actttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagaacacgaatt |
12953210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 291 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 14528110 - 14527975
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aaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattaca |
389 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || |
|
|
| T |
14528110 |
aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacctaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgca |
14528012 |
T |
 |
| Q |
390 |
a-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14528011 |
ataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
14527975 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
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139 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||| |||||| || || || ||| || |
|
|
| T |
9591035 |
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9590936 |
T |
 |
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140 |
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238 |
Q |
| |
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| T |
9590935 |
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9590837 |
T |
 |
| Q |
239 |
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338 |
Q |
| |
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| T |
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9590737 |
T |
 |
| Q |
339 |
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425 |
Q |
| |
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||| || || || ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
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| T |
9590736 |
taaccactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaatttgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaatccccttacctta |
9590648 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
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Target Start/End: Complemental strand, 38811297 - 38811146
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131 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |
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| T |
38811297 |
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38811198 |
T |
 |
| Q |
132 |
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183 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||||||| |||||| || | || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38811197 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatcaaca |
38811146 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 9303425 - 9303343
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| Q |
5 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactca-tttctcaacaacaatcatg |
86 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9303425 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccgttttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatg |
9303343 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 431
Target Start/End: Original strand, 17204667 - 17205041
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| Q |
42 |
tttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaac |
140 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||| |
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| T |
17204667 |
tttacaaaaccactaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattacttagcaacaac |
17204766 |
T |
 |
| Q |
141 |
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240 |
Q |
| |
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|||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
17204767 |
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17204847 |
T |
 |
| Q |
241 |
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340 |
Q |
| |
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||||| |||| || ||||||||||| |||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| |
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| T |
17204848 |
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17204947 |
T |
 |
| Q |
341 |
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431 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17204948 |
atc-atttactcaattaagcacttgttcgtac-cacaattgaaaaattacactaaaatgattatgatggaattctaacccccttaccttaattatc |
17205041 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 425
Target Start/End: Original strand, 30207280 - 30207570
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| Q |
138 |
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236 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||| || ||||||||| || |||||||||| |
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| T |
30207280 |
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30207378 |
T |
 |
| Q |
237 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
336 |
Q |
| |
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||||||||| | || || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | | ||||| | |
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| T |
30207379 |
ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaccagtatgaata |
30207478 |
T |
 |
| Q |
337 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30207479 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattataacccccttacctta |
30207570 |
T |
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Target: chr3; HSP #65
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Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Original strand, 34559857 - 34560098
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33 |
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131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| || ||| | |||| | ||| | || |||||||||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
34559857 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaattatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
34559956 |
T |
 |
| Q |
132 |
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230 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||||| ||| ||||||||| | || ||||||| |||||||| || || ||| |
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|
| T |
34559957 |
agcaacaacaacatcaatcgaacatgaatctcatcataattcaacaactacataacataattcaaaatttagagcata-attcaacatgtaacacattca |
34560055 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc |
273 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34560056 |
catattttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
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T |
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Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 14815030 - 14814658
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| Q |
57 |
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155 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| || ||| | |||| ||||| | || || |||||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | || |
|
|
| T |
14815030 |
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14814931 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaac |
254 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | || || ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| || |
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|
| T |
14814930 |
tgattcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcacaatt-cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcac |
14814832 |
T |
 |
| Q |
255 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaa |
354 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| ||||| || ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| || || ||| |
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|
| T |
14814831 |
caacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaactatgagcaaataatcactt-attcaa |
14814733 |
T |
 |
| Q |
355 |
ttaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14814732 |
ttaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttacctta |
14814658 |
T |
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Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
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Target Start/End: Original strand, 1990759 - 1990937
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129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||| | ||| | || ||||||||||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
1990759 |
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1990858 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||| || | ||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
1990859 |
ttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcacagttcaacaacaacataacacaattcacaatttgagcata |
1990937 |
T |
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Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
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Target Start/End: Original strand, 14080491 - 14080863
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||| | ||| |||| ||||||||| || | ||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
14080491 |
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14080590 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttct-catactttgaacatgtaattcaa |
253 |
Q |
| |
|
|| || |||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||| | || | |||| | ||||||||||||||| || | | |
|
|
| T |
14080591 |
tggttctcatcataattcaacaacaatatagcacaattcacccaattgagcata-attcataagttagc-acttatacatactttgaacatgcaaattca |
14080688 |
T |
 |
| Q |
254 |
ctaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcca |
353 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||||| | || |||| ||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
14080689 |
ctaaccacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattttaacatctatgcacaattaatc-atttatcca |
14080787 |
T |
 |
| Q |
354 |
attaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14080788 |
attaaacacttattcatac-catagttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr3; HSP #69
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Query Start/End: Original strand, 32 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6228916 - 6228625
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atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
6228916 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatttc |
6228817 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | ||||| | |||| ||||| ||||||||| ||| |||||| || || ||||| | |||| ||||| || || |
|
|
| T |
6228816 |
ttagcaacaacaacatcaattaaacatgatccacatcataattcgacaacaacatagcacaattcaacatttagagcaca-attcacaatatatcatttt |
6228718 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaattt |
321 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6228717 |
cacatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt |
6228625 |
T |
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Target: chr3; HSP #70
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tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| || | |
|
|
| T |
17960602 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagtcatgaattattaataacaacatcactt |
17960503 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
| || || ||||||||||| ||||| || | || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17960502 |
agcagcaaacacatcaattgaatatgaatctcagcataattcaacatcaaca |
17960451 |
T |
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acaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaac |
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Q |
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||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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|
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28558188 |
acaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaac |
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T |
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||| || | |||||||||| | | ||| || |
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|
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16934263 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaatcatgatttatgaatacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaacaa |
16934164 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattga |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
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caacatcaattga |
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Q |
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7854306 |
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394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
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|
|
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
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tgaaacttatcacaattcaacaacaacaa |
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| |
|
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|
|
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352 |
caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51961106 |
caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
51961031 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #77
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| Q |
32 |
atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||| ||| |||||| || | |
|
|
| T |
33369199 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcgtcaacaacaatattcc |
33369100 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcac |
196 |
Q |
| |
|
|| ||| || |||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
33369099 |
ttaacaacaaaaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcac |
33369033 |
T |
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394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
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|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
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2844515 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
2844552 |
T |
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| Q |
394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3992874 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
3992911 |
T |
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| Q |
394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
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|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17955915 |
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T |
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| Q |
394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
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|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54038055 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
54038018 |
T |
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Target: chr3; HSP #82
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| Q |
394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55513194 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
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T |
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Target: chr3; HSP #83
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8 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt |
44 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8901257 |
tcatcaaaatcaaacttctccattttcaacccatttt |
8901293 |
T |
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299 |
catcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtga |
396 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||| |||| || || || ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
11882240 |
catcataattagagcatgaaattcaacatctaagaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaattaaaagttacactaaatga |
11882142 |
T |
 |
| Q |
397 |
ttatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11882141 |
ttatgatgaattctaacccccttacctta |
11882113 |
T |
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| Q |
391 |
aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaattatc |
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T |
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Target: chr3; HSP #86
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| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
323 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31412423 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttca |
31412331 |
T |
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Target: chr3; HSP #87
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Target Start/End: Original strand, 50313344 - 50313436
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| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
323 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
50313344 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcactcaaacatatcattataacaagagcacgaatttca |
50313436 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0190 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:
Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
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Target Start/End: Original strand, 9903 - 10289
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41 |
ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
9903 |
ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaataatcatcaacaacatgacatatcaacaa |
10002 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcata--ctt |
237 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |
|
|
| T |
10003 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacc--cttttcatactctt |
10100 |
T |
 |
| Q |
238 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| |
|
|
| T |
10101 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
10200 |
T |
 |
| Q |
338 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa-ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10201 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaagaattgaaaatttgcaataatgattattatgaattctaacccccttacctta |
10289 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 64 - 425
Target Start/End: Original strand, 32898779 - 32899142
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| Q |
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ctcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaact |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32898779 |
ctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacttcaattgatcatgaaact |
32898878 |
T |
 |
| Q |
163 |
tatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32898879 |
tatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
32898978 |
T |
 |
| Q |
263 |
attcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcac |
362 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
32898979 |
attcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccaaattaagcac |
32899078 |
T |
 |
| Q |
363 |
ttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32899079 |
ttttcataccaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
32899142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 58 - 425
Target Start/End: Original strand, 16086001 - 16086369
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58 |
caacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatg |
157 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16086001 |
caacatctcatttctccacataaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatg |
16086100 |
T |
 |
| Q |
158 |
aaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaa |
257 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | || || |||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
16086101 |
aaacttatcataattcaacaacaacaaggtataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccatttttcgtactttgaacatgtaattcaacaaa |
16086200 |
T |
 |
| Q |
258 |
caacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaatta |
357 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
16086201 |
caacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaatta |
16086300 |
T |
 |
| Q |
358 |
agcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16086301 |
agcacttttcatacaattaattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16086369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 52 - 358
Target Start/End: Original strand, 31628245 - 31628552
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31628245 |
caccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
31628344 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31628345 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
31628444 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31628445 |
caactaacaacaattcaattatcaataacttcatacatctaaacatgtaatcataattcgaatacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcac |
31628544 |
T |
 |
| Q |
351 |
ccaattaa |
358 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
31628545 |
ccaattaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 67 - 425
Target Start/End: Original strand, 18570271 - 18570630
Alignment:
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67 |
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165 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||| || || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570271 |
atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaggccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaactacttctattgatcatgaaacttat |
18570370 |
T |
 |
| Q |
166 |
cacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatt |
265 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
18570371 |
cacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaatttaactaataacaatt |
18570470 |
T |
 |
| Q |
266 |
caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570471 |
caattatccataacatcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta |
18570570 |
T |
 |
| Q |
366 |
tcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570571 |
tcatacaaataattgaaaattacaaaattgattatgatgaattctaacccccttacctta |
18570630 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
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Target Start/End: Original strand, 22440911 - 22441285
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caccgacaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaat |
149 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
22440911 |
caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaat |
22441009 |
T |
 |
| Q |
150 |
tgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22441010 |
tgatcatgaaacttatcacaaatcatgaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactcatacccatttttcatacttttaacatgtaat |
22441109 |
T |
 |
| Q |
250 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
349 |
Q |
| |
|
||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22441110 |
tcaccccatcacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattca |
22441209 |
T |
 |
| Q |
350 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22441210 |
ctcaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattgcaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Original strand, 16106499 - 16106868
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Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
16106499 |
caccaacaacatctcatttctccacataaatcatgaatcatgcaaa-----gtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatg |
16106593 |
T |
 |
| Q |
152 |
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251 |
Q |
| |
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| T |
16106594 |
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16106693 |
T |
 |
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252 |
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351 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || || |||||||| |||||| |
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| T |
16106694 |
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16106793 |
T |
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| Q |
352 |
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425 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16106794 |
caattaagcacttttcatacaattaattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr6; HSP #7
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Target Start/End: Original strand, 18432626 - 18432994
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Q |
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T |
 |
| Q |
157 |
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256 |
Q |
| |
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| T |
18432726 |
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T |
 |
| Q |
257 |
acaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaatt |
356 |
Q |
| |
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| T |
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18432925 |
T |
 |
| Q |
357 |
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425 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| |||||||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
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aagctcttttcatac-aataattgaaaatttgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
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Target Start/End: Complemental strand, 13014979 - 13014603
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Q |
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T |
 |
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tgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
249 |
Q |
| |
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tgatcttgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttccaactcatacccatttttcatacttc-aacatacaat |
13014782 |
T |
 |
| Q |
250 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
349 |
Q |
| |
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| T |
13014781 |
tcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattaaagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
13014682 |
T |
 |
| Q |
350 |
tccaattaagcacttatcatacaa--ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cccaatttagcacttttcatacaaacataattgaaaattacaataagtgattatgataaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr6; HSP #9
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146 |
Q |
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|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| |||||||| |
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|
| T |
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18777218 |
T |
 |
| Q |
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246 |
Q |
| |
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| T |
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cattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaacatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgt |
18777318 |
T |
 |
| Q |
247 |
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346 |
Q |
| |
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|
| T |
18777319 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcttttatga------------- |
18777405 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18777406 |
----acaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattccaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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Target: chr6; HSP #10
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Target Start/End: Original strand, 18398890 - 18399290
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18398989 |
T |
 |
| Q |
126 |
tgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatatacca |
224 |
Q |
| |
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| || || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |
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| T |
18398990 |
tcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatacta |
18399088 |
T |
 |
| Q |
225 |
acttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcat |
324 |
Q |
| |
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| T |
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18399188 |
T |
 |
| Q |
325 |
cacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttac |
421 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |
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|
| T |
18399189 |
caattatgaacaattagtcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaatttacactaaaatgattatgaagaattctaacccccttac |
18399286 |
T |
 |
| Q |
422 |
ctta |
425 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
18399287 |
ctta |
18399290 |
T |
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Target: chr6; HSP #11
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
| Q |
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catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
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Target: chr6; HSP #12
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||| || |
|
|
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25367403 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaac |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | |
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|
| T |
25367402 |
tgaatcttatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagcata-tttcaacataaaccactttctcatactttgaacatgaaatttctc |
25367304 |
T |
 |
| Q |
255 |
taacaacaattcaattatc-cataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcca |
353 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | || |
|
|
| T |
25367303 |
taacaacaattccattatcaaaaaacttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattgct-ca |
25367205 |
T |
 |
| Q |
354 |
attaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25367204 |
attaagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaagccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
18823613 |
T |
 |
| Q |
105 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
152 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18823612 |
catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga |
18823565 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
22362054 |
tcaacccattttacaaaactaacaacaacaactcaattctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
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T |
 |
| Q |
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atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| || |||| |
|
|
| T |
22361954 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacttatgtcactttct |
22361856 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| || |
|
|
| T |
22361855 |
catactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatcatcta |
22361756 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaat |
427 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || | |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22361755 |
tgaacaattaatcatttgct-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaaattactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat |
22361658 |
T |
 |
| Q |
428 |
tatc |
431 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
22361657 |
tatc |
22361654 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
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5 |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18839567 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttttcaactcattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
18839468 |
T |
 |
| Q |
105 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
152 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18839467 |
catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga |
18839420 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| | |
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|
| T |
18381965 |
atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca |
18381866 |
T |
 |
| Q |
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acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
18381865 |
acaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatttaagcata-attcaacatatatcactttctcatactt |
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T |
 |
| Q |
238 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
320 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || |||||| ||||||||||| | |||||||| || ||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
18381766 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 40 - 431
Target Start/End: Original strand, 21623133 - 21623528
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Q |
| |
|
||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||| | ||||||||||||| | || | || |||||| || || ||| | |
|
|
| T |
21623133 |
attttaccaaactaccaacaacaactcatttttcatccacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatcacttagcaaca |
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T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
237 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21623233 |
acaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactt |
21623331 |
T |
 |
| Q |
238 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
337 |
Q |
| |
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|
| T |
21623332 |
tgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaattctaacatttatgaacaa |
21623431 |
T |
 |
| Q |
338 |
ttaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattga-aaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21623432 |
ttaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgagaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
21623528 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
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Target Start/End: Complemental strand, 28195367 - 28195108
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48 |
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146 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| ||| | |
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|
| T |
28195367 |
aaactaccaacaacatctcatttctcaacaataaatcat-aattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaaccacaac |
28195269 |
T |
 |
| Q |
147 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| || ||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28195268 |
aattgatcataaaatctcatcacaattcaacaacatcatggcataattcaactaattgagcacattt-catcatataccattttctcatactatgaacat |
28195170 |
T |
 |
| Q |
245 |
gtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
306 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28195169 |
gaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcatacattcaaacatatcatcataa |
28195108 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35015447 - 35015278
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40 |
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138 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| | |
|
|
| T |
35015447 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
35015348 |
T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35015347 |
acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
35015278 |
T |
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Target: chr6; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Original strand, 26089718 - 26089869
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| Q |
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156 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
26089718 |
acaacaacttatttcacaacaacaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcat |
26089817 |
T |
 |
| Q |
157 |
gaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26089818 |
gaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
26089869 |
T |
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Target: chr6; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 52 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25744483 - 25744331
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150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || || |
|
|
| T |
25744483 |
caccaacaacatctcatttctctacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacattt |
25744384 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattga |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25744383 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccacttga |
25744331 |
T |
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Target: chr6; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18002777 - 18002617
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147 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| | || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
18002777 |
aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaagtatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaacaacaacaacatct |
18002678 |
T |
 |
| Q |
148 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18002677 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcatcaattgagcata |
18002617 |
T |
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Target: chr6; HSP #23
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Target Start/End: Original strand, 23994904 - 23995057
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| Q |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||| |
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|
| T |
23994904 |
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23995003 |
T |
 |
| Q |
155 |
atgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23995004 |
atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
23995057 |
T |
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Target: chr6; HSP #24
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Target Start/End: Complemental strand, 19983581 - 19983412
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40 |
attttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
138 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| | |
|
|
| T |
19983581 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
19983482 |
T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|||||| | | | | |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19983481 |
acaacaaccactaaccatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcactaattgagcata |
19983412 |
T |
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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15742505 - 15742341
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| Q |
48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac---atatcaaaaacaac |
143 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| || | | ||| |||||| |
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|
| T |
15742505 |
aaaccagcaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacaac |
15742406 |
T |
 |
| Q |
144 |
atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15742405 |
atctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15742341 |
T |
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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 425
Target Start/End: Original strand, 33324675 - 33325046
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| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatca |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
33324675 |
acaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaaca |
33324774 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttct-catactttgaacatgtaattcaa |
253 |
Q |
| |
|
|| || |||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| | || | |||| | || |||||||||||| || | | |
|
|
| T |
33324775 |
tggttctcatcataattcaaccacaatatagcataattcatccaattgagcata-attcataagttagc-acttatacacactttgaacatgcaaattca |
33324872 |
T |
 |
| Q |
254 |
ctaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcca |
353 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33324873 |
c-aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atcca |
33324970 |
T |
 |
| Q |
354 |
attaagcactta-tcatacaaataattgaa--aattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33324971 |
attaatcacttattcatac-attaattgaaataattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
33325046 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 142 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 21411228 - 21410944
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acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaa |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || | || ||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21411228 |
acatcaattgcacatgaatctcagcataatccaacatcaacatagcataattcacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaa |
21411130 |
T |
 |
| Q |
242 |
catgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaa |
341 |
Q |
| |
|
|||| |||| | ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||| | |||||| |||| | | ||||| |||||| |
|
|
| T |
21411129 |
catgaaatttatttaacaaccattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaattag |
21411030 |
T |
 |
| Q |
342 |
tcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21411029 |
tcaattcct-caattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
21410944 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Original strand, 4991002 - 4991150
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acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
4991002 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag |
4991101 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
152 |
Q |
| |
|
||| | | || ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4991102 |
ccaaaattcatgatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga |
4991150 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 273
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36 |
acccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || |
|
|
| T |
25651197 |
acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatccaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
25651296 |
T |
 |
| Q |
134 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctca |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| || |
|
|
| T |
25651297 |
caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcaca |
25651395 |
T |
 |
| Q |
233 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25651396 |
tactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
25651436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 5 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17083496 - 17083093
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5 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaa |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||| | || | |||||||| | ||| | |||||| |
|
|
| T |
17083496 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaacaacaacaacaactcatttctaatcatcaaatcatgatttatgaacacccaa |
17083397 |
T |
 |
| Q |
103 |
gccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt- |
201 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| || || |
|
|
| T |
17083396 |
gccatga---atcatcaac----------------aacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacattta |
17083316 |
T |
 |
| Q |
202 |
gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcat |
301 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| || | ||||| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
17083315 |
gagcaca-attcaacatatatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattat-caccaattcatgcattcaaacatatcat |
17083218 |
T |
 |
| Q |
302 |
cataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgatta |
399 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | | || ||||| |||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
17083217 |
cataattagagcacgaatattaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgatta |
17083119 |
T |
 |
| Q |
400 |
tgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17083118 |
aaatgaattctaacccccttacctta |
17083093 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 18629892 - 18629502
Alignment:
| Q |
41 |
ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| |||||| | ||| | |||||| |||||||| |||| |||||| || || || ||| || |
|
|
| T |
18629892 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaa |
18629793 |
T |
 |
| Q |
140 |
caaca---tcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatac |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||||| || | ||||||| || || |||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
18629792 |
caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacattcagagcataatt-cacaatataccactttcacatac |
18629694 |
T |
 |
| Q |
236 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
335 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| | |
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|
| T |
18629693 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac |
18629594 |
T |
 |
| Q |
336 |
aattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
18629593 |
aattaatcactt-attcaattaaacacttaatcatacaacaaataaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
18629502 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 35136277 - 35135906
Alignment:
| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatca |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
35136277 |
acaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaaca |
35136178 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttct-catactttgaacatgtaattcaa |
253 |
Q |
| |
|
|| || |||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| | || | |||| | || |||||||||||| || | | |
|
|
| T |
35136177 |
tggttctcatcataattcaaccacaatatagcataattcatccaattgagcata-attcacaagttagc-acttatacacactttgaacatgcaaattca |
35136080 |
T |
 |
| Q |
254 |
ctaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcca |
353 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
35136079 |
c-aacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atcta |
35135982 |
T |
 |
| Q |
354 |
attaagcactta-tcatacaaataattg--aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35135981 |
attaatcacttattcatac-aataattgaaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
35135906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 183
Target Start/End: Original strand, 25919571 - 25919722
Alignment:
| Q |
33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| | || |
|
|
| T |
25919571 |
tcaactcattttacaaagtcaccaacaataactcatttttcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcatat |
25919670 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25919671 |
agcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca |
25919722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17557127 - 17556909
Alignment:
| Q |
211 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
310 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
17557127 |
ttcaacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatc-aaacatatcatcataattag |
17557029 |
T |
 |
| Q |
311 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaaaag-tgattatga-tgaac |
407 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| || || ||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
17557028 |
agcacgaattt-aacaactatgaacaaataatcaatt-attcaattaagcacttaataatgcaattaatgaaaaattacactagatgattatgattgaat |
17556931 |
T |
 |
| Q |
408 |
actaacccccttaccttaatta |
429 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17556930 |
tctaacccccttaccttaatta |
17556909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 365
Target Start/End: Original strand, 29605406 - 29605739
Alignment:
| Q |
32 |
atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||| | |||| ||||| | ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
29605406 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaagaacaacttatttctcattatcaattcatgatttatgcacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatttc |
29605505 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||| | || || |||| || || |
|
|
| T |
29605506 |
ttagcaacaacaacatcaattaagcatgattcacatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacattttgagcacaatt-cacaatatttcatttt |
29605604 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca |
328 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
29605605 |
cacatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaa-ttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaac |
29605703 |
T |
 |
| Q |
329 |
tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta |
365 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| || || |||||||||||||| |
|
|
| T |
29605704 |
tatgaacaaataatcactt-attcaattaagcactta |
29605739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 33538647 - 33538264
Alignment:
| Q |
44 |
tacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaa |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||| || ||| |||||| | ||| | || |||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||| |
|
|
| T |
33538647 |
tacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaataacaa |
33538548 |
T |
 |
| Q |
143 |
catcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcat-attttcaacatataccaacttctcatactttga |
240 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||| || ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| | |||||| ||| |||||||| || ||| |||||||||| |
|
|
| T |
33538547 |
catcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacctttagagcataattcacaacatat--cactttcacatactttga |
33538450 |
T |
 |
| Q |
241 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatta |
340 |
Q |
| |
|
||||| |||| || ||||||||||||||| || || ||||| ||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| | || ||||| |||||| |
|
|
| T |
33538449 |
acatgcaatttcaccaacaacaattcaatt-tcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagttagagcacgaattttaacaactatgaacaatta |
33538351 |
T |
 |
| Q |
341 |
atcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33538350 |
atcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
33538264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16888057 - 16887685
Alignment:
| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatca |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
16888057 |
acaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgtatacccaagccatgaatcattaacaataacatcacatagtgacaacaaaatcaattgaaca |
16887958 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttct-catactttgaacatgtaattcaa |
253 |
Q |
| |
|
|| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || | |||| | || |||||||||||| || | | |
|
|
| T |
16887957 |
tggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcacccaattgagcata-attcacaagttagc-acttatacacactttgaacatgcaaattca |
16887860 |
T |
 |
| Q |
254 |
ctaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcca |
353 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
16887859 |
ccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttattca |
16887761 |
T |
 |
| Q |
354 |
attaagcactta-tcatacaaataattg-aaaatta---caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16887760 |
attaatcacttattcatac-aataattgaaaaattatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16887685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35009692 - 35009569
Alignment:
| Q |
82 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaa |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35009692 |
tcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaa |
35009594 |
T |
 |
| Q |
182 |
caatgcataattcaccaattgagca |
206 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35009593 |
catagcaaaattcaccaattgagca |
35009569 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 201
Target Start/End: Original strand, 34966823 - 34966994
Alignment:
| Q |
32 |
atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| || || || |||||| | ||| | |||||||| |||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
34966823 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacgaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
34966922 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt |
201 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34966923 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
34966994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15079932 - 15079820
Alignment:
| Q |
97 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca- |
195 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| ||||||||| || || ||| ||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
15079932 |
acccaaaccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaatatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaatatagcataattcac |
15079833 |
T |
 |
| Q |
196 |
ccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
15079832 |
ccaattgagcata |
15079820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 183
Target Start/End: Original strand, 19854137 - 19854264
Alignment:
| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatca |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| ||||| | ||| | |||||||| |||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | || |
|
|
| T |
19854137 |
acaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattaaaca |
19854236 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19854237 |
tgattctcatcacaattcaacaataaca |
19854264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 114
Target Start/End: Original strand, 15740211 - 15740269
Alignment:
| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattat |
114 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15740211 |
acaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaaaccatgaattat |
15740269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
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Query Start/End: Original strand, 394 - 431
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Alignment:
| Q |
394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18583641 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
18583678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
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Query Start/End: Original strand, 234 - 425
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Alignment:
| Q |
234 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
15079795 |
actttgaacatgcaatttcac-aacaacaattcaattatcctcaacttcatgcat-acaacatatcatcctagttagagcacgaattt-aacatctatga |
15079699 |
T |
 |
| Q |
334 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15079698 |
ataattaatcaatt-atccaattaatcccttattcata-aaataattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
15079606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
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Query Start/End: Original strand, 57 - 214
Target Start/End: Original strand, 19629314 - 19629471
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| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt-gatca |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| || | |||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19629314 |
acaacaactcatttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaatct |
19629412 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca |
214 |
Q |
| |
|
||| || | | |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
19629413 |
tgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttca |
19629471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 365
Target Start/End: Original strand, 22848172 - 22848304
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| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||| | ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| || || |
|
|
| T |
22848172 |
catactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgcatttaaacatatcatcataattaatgcacgaatttcaacaacta |
22848271 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta |
365 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||| || ||| |||||||||| |
|
|
| T |
22848272 |
tgaacaa-taatcaatt-attcaactaagcactta |
22848304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 204
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Alignment:
| Q |
138 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| | |||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29665938 |
aacaacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgag |
29666004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19983223 - 19983186
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| Q |
394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19983223 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
19983186 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
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Target Start/End: Complemental strand, 35015088 - 35015051
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394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
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|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35015088 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
35015051 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 27740907 - 27740971
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| Q |
142 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27740907 |
acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacgacttagcaaaattcaccaattgagca |
27740971 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0338 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:
Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
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48 |
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146 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
8960 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcaagcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc |
9059 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
246 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9060 |
aagtgatcttgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
9159 |
T |
 |
| Q |
247 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaat |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9160 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaattaatcaat |
9259 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcatccaattaagcacttatcatacaaataattg--aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9260 |
tcactcaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaattgcaataatgattatgataaattctaacccccttacctta |
9339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 52 - 384
Target Start/End: Original strand, 21718206 - 21718537
Alignment:
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52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattg |
151 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21718206 |
caccaacaacatctcatttctcaagaacaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg |
21718305 |
T |
 |
| Q |
152 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21718306 |
atcatgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttgaacacataccaatttctcatactttgaacatgtaattc |
21718405 |
T |
 |
| Q |
252 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
21718406 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcacc |
21718505 |
T |
 |
| Q |
352 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
384 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21718506 |
caattaagcacttttcatac-aataattgaaaa |
21718537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
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Target Start/End: Original strand, 49967628 - 49968002
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| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattg |
151 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
49967628 |
caccaacaacatctcattcctcaacaacaaccatgaatcatgcaaaccgaagcaatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattg |
49967727 |
T |
 |
| Q |
152 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || | ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
49967728 |
atcatgaaacgtatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttttataatttgaacatgtaattc |
49967827 |
T |
 |
| Q |
252 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49967828 |
aactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatgatttttgaacaattaatcaattcatc |
49967927 |
T |
 |
| Q |
352 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49967928 |
caattaagcacttttcatgcaaataattgaaaattacaataagtgattacgatgaattctaacccccttacctta |
49968002 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
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Target Start/End: Complemental strand, 22403375 - 22403005
Alignment:
| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatc |
154 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || || ||| |
|
|
| T |
22403375 |
acaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatg-aaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacagttaatc |
22403277 |
T |
 |
| Q |
155 |
atgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaattca |
252 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22403276 |
atgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaattca |
22403178 |
T |
 |
| Q |
253 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
352 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22403177 |
actaaca-caatttaattattcataacttcatacatctagacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcaccc |
22403079 |
T |
 |
| Q |
353 |
aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22403078 |
aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22403005 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
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Target Start/End: Original strand, 41212046 - 41212415
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| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac---atatcaaaaacaacatca |
147 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| || |
|
|
| T |
41212046 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaaca |
41212145 |
T |
 |
| Q |
148 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgta |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| | || ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
41212146 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacagtgcataattcactaattgagcatattttta-cacatacccatttttcatactttgaacataca |
41212244 |
T |
 |
| Q |
248 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaatt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41212245 |
gttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacctctaaacaggtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt |
41212344 |
T |
 |
| Q |
348 |
catccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
418 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41212345 |
catccaattaaacacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaaccccct |
41212415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
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Target Start/End: Original strand, 35054716 - 35055108
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| Q |
36 |
acccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| | ||||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || |
|
|
| T |
35054716 |
acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattccacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaa |
35054815 |
T |
 |
| Q |
134 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat |
233 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| |
|
|
| T |
35054816 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacagttcatcaactacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcat |
35054915 |
T |
 |
| Q |
234 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
35054916 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaattaaatcatttatga |
35055015 |
T |
 |
| Q |
334 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaat-tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
35055016 |
acaattaaccaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatagaaataagtgattatgatgaattttaacccccttacctta |
35055108 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 133 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9784249 - 9783959
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| Q |
133 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9784249 |
tcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaa---gcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctca |
9784153 |
T |
 |
| Q |
233 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatg |
332 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9784152 |
tactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatg |
9784053 |
T |
 |
| Q |
333 |
accaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9784052 |
aacaatttatcaattcacccaattaagcacttttcataccaataattgaaaattgcagtaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
9783959 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
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caccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattg |
151 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35522588 |
caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacgtatcaacaacaacatcaattg |
35522489 |
T |
 |
| Q |
152 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35522488 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
35522432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
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41 |
ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||| || |
|
|
| T |
51627945 |
ttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacagcaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacatcatcacttagcaacaa |
51627846 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
51627845 |
caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaccatatcataattcaaccaattgaacata-tttcaacatataccattttctcatacttt |
51627747 |
T |
 |
| Q |
239 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaat |
338 |
Q |
| |
|
||||||| | || ||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||| || ||| ||||||||| | |||||| |||| | | ||||| ||| |
|
|
| T |
51627746 |
gaacatgaagtttcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcatcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaaa |
51627647 |
T |
 |
| Q |
339 |
taatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||| |||| | || |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51627646 |
taatcaatt-actcaattaagcacttattcatgc-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
51627558 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 241 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 35522432 - 35522247
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241 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatta |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
35522432 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatta |
35522333 |
T |
 |
| Q |
341 |
atcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35522332 |
atcaattcacccaattaagcccttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaactcccttacctta |
35522247 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 40 - 431
Target Start/End: Original strand, 20177140 - 20177535
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40 |
attttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
138 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | | ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| | |
|
|
| T |
20177140 |
atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca |
20177239 |
T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
20177240 |
acaacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactt |
20177338 |
T |
 |
| Q |
238 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
337 |
Q |
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| T |
20177339 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaa |
20177438 |
T |
 |
| Q |
338 |
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431 |
Q |
| |
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| T |
20177439 |
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20177535 |
T |
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Q |
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T |
 |
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245 |
Q |
| |
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27329928 |
attgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatactttgatcatg |
27329831 |
T |
 |
| Q |
246 |
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320 |
Q |
| |
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| || || ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| |
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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9784241 |
aaca |
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T |
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T |
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208 |
Q |
| |
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15861628 |
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T |
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124 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |
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22366970 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaat |
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T |
 |
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125 |
atgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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208 |
Q |
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Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
237 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
336 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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337 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
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| T |
16646175 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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Q |
| |
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||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||| || ||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||| |||| |||||| || || | |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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230 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |
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|
| T |
37234049 |
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37233951 |
T |
 |
| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
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|
|
| T |
37233950 |
tatactttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactaaagcacgaattctaacaacta |
37233851 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa |
426 |
Q |
| |
|
| | |||||| ||| || | ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
37233850 |
ttaacaattactcactt-actcaattaagcacttaataatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaa |
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T |
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Q |
| |
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|||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |
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|
| T |
16656702 |
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16656800 |
T |
 |
| Q |
237 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
336 |
Q |
| |
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||||||| | | || || |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| || |
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|
| T |
16656801 |
ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
16656900 |
T |
 |
| Q |
337 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16656901 |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||| | ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
132 |
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230 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |
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|
| T |
17608986 |
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17609084 |
T |
 |
| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| || ||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| | || || |
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|
| T |
17609085 |
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17609184 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
17609185 |
tgatcaactaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
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Q |
| |
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||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||| | ||||| | ||| |||||| |
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|
| T |
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acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaactcaagccatta-tcatcatcaactatatgactaaacaacaacaac |
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T |
 |
| Q |
144 |
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208 |
Q |
| |
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| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
44035156 |
aaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaaatgagcata |
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T |
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ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
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Q |
| |
|
||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||| || |
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|
| T |
21194980 |
ttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaa |
21195079 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
238 |
Q |
| |
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|
| T |
21195080 |
caacattaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcata-attcacaatatatcattttcacatactat |
21195178 |
T |
 |
| Q |
239 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaat |
338 |
Q |
| |
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| T |
21195179 |
gaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattttaacaactatgaacaat |
21195278 |
T |
 |
| Q |
339 |
taatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |
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| T |
21195279 |
taatcactt-attcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaaaccccttacctta |
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Q |
| |
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| T |
27674755 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaaaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcactta |
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T |
 |
| Q |
133 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaac |
176 |
Q |
| |
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||| ||| ||| ||||||| |||||| || | || |||||||| |
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| T |
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acaacaactacaccaattgaacatgaatctcagcataattcaac |
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Q |
| |
|
|||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| | || |||||||||||| | |||||||||||| || || ||| | |
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| T |
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atttcacaaaaccgccaacaacaattcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcaacatcaacaacatcacttagcaaca |
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T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttct-catactt |
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Q |
| |
|
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|
| T |
13377022 |
acaacatcaattgagcatgactttcaccataattcaacaacaacataacataattca-------------------acatatacca-cttcttcatactt |
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T |
 |
| Q |
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tgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca |
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Q |
| |
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| T |
13376942 |
tgaacatgaaatttcaacga-caacaatttaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgattctcatcatctatgaaca |
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T |
 |
| Q |
337 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
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| T |
13376843 |
attaatcaatt-actaaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
13376746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22143602 - 22143256
Alignment:
| Q |
80 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaac |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || || ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22143602 |
aatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattgagcatggttctcatcataattcaacaac |
22143503 |
T |
 |
| Q |
180 |
aacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataa |
278 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| ||||||||| || || | || || | ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22143502 |
aacatagcataattcaaccatttgagcataatt-cataagttaacatttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcacaaa |
22143404 |
T |
 |
| Q |
279 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataa |
377 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
22143403 |
tttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaattaagcacttattcatac-aataa |
22143306 |
T |
 |
| Q |
378 |
ttg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22143305 |
ttgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
22143256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22829712 - 22829629
Alignment:
| Q |
34 |
caacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22829712 |
caacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatca |
22829629 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 425
Target Start/End: Original strand, 19603055 - 19603449
Alignment:
| Q |
33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||| |||| || | |
|
|
| T |
19603055 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattattcacacccaagtcatgaattatcaataaccacatcactt |
19603154 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataa-ttcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
| || ||| ||||||||||| |||||| | | || ||||||||| ||||| || || | || | ||||||| | | ||||||| || ||| |
|
|
| T |
19603155 |
agcagcaactacatcaattgaacatgaatttcagcataattcaacatcaacatatcacaagatgacatttagagcataatat-gacatatatcattttca |
19603253 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| | || || |
|
|
| T |
19603254 |
tatactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattttaacaatta |
19603353 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19603354 |
tgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttgcactaaa-tgattatgatgaattctagcccccttacctta |
19603449 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38033962 - 38033818
Alignment:
| Q |
33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacata |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| || || |
|
|
| T |
38033962 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaacttatttctcatcaacaatcgtgaactatgcacacccaagccatgaattaacaacagcaacatcactta |
38033863 |
T |
 |
| Q |
133 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaaca |
177 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||| |||||| || | || ||||||||| |
|
|
| T |
38033862 |
gcagcaatcacatcaattgaacatgaatctcaacataattcaaca |
38033818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41229221 - 41229102
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| Q |
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attttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
138 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| | || |||||||||||| || | ||||||||| || || ||| | |
|
|
| T |
41229221 |
attttaccaaactaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaaca |
41229122 |
T |
 |
| Q |
139 |
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158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41229121 |
acaacatcaattgaacatga |
41229102 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36356557 - 36356455
Alignment:
| Q |
58 |
caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcat |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
36356557 |
caacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccataaatcatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgaacat |
36356458 |
T |
 |
| Q |
157 |
gaa |
159 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
36356457 |
gaa |
36356455 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20955728 - 20955601
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| Q |
33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||| |||| || || ||| |||||||||||||||| |||||||| || | |
|
|
| T |
20955728 |
tcaaccccttttacaaagtcacccacaacaactcatttcacaccaacaattcacgaattattcacaccgaagccatgaattatcaataacaacatcactt |
20955629 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaa |
159 |
Q |
| |
|
| || ||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20955628 |
agcagcaactacatcaattgaacatgaa |
20955601 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 8538200 - 8537803
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| Q |
32 |
atcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgaca |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| || || ||| |||| | | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
8538200 |
atcaacccatttttacaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattcct |
8538101 |
T |
 |
| Q |
131 |
tatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattga-gcatattttcaacatataccaacttc |
229 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||| | | |||| ||||| | ||| | || || ||||| || ||| |
|
|
| T |
8538100 |
taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataagacatttcaacaatttaagcacaatt-cacaatataacattttc |
8538002 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat |
329 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| || |
|
|
| T |
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acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaacc |
8537902 |
T |
 |
| Q |
330 |
atgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||| | | ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8537901 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 8603439 - 8603042
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| Q |
32 |
atcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgaca |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| || || ||| |||| | | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
8603439 |
atcaacccatttttacaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattcct |
8603340 |
T |
 |
| Q |
131 |
tatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattga-gcatattttcaacatataccaacttc |
229 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||| | | |||| ||||| | ||| | || || ||||| || ||| |
|
|
| T |
8603339 |
taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataagacatttcaacaatttaagcacaatt-cacaatataacattttc |
8603241 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat |
329 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| || |
|
|
| T |
8603240 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaacc |
8603141 |
T |
 |
| Q |
330 |
atgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||| | | ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8603140 |
atgaacgaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactcccttacctta |
8603042 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 206
Target Start/End: Original strand, 20445747 - 20445812
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| Q |
141 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20445747 |
aacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
20445812 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 206
Target Start/End: Original strand, 20531512 - 20531577
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| Q |
141 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
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20531512 |
aacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
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139 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| || | |||||||||| | | ||| || |
|
|
| T |
21650329 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcaacaacaa |
21650230 |
T |
 |
| Q |
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caacatcaattga |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
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caacatcaattga |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
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| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || |||||| || |||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||| || | |
|
|
| T |
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catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcaccataactagggcacaaatttcaacaatca |
49997272 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatg-atgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49997271 |
tgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgtttgaattctaacccccttacctta |
49997174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
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| Q |
394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21860335 |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Query Start/End: Original strand, 394 - 431
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| Q |
394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
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| Q |
394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41394528 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
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| Q |
394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44034902 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Original strand, 60784 - 61159
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| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattg |
151 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
60784 |
caccaacaacatctcatttctccacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg |
60883 |
T |
 |
| Q |
152 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
60884 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagtatatttttaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
60983 |
T |
 |
| Q |
252 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
351 |
Q |
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| T |
60984 |
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61083 |
T |
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| Q |
352 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
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| T |
61084 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
61159 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 52 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 70892 - 70552
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
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70892 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatccaat |
70793 |
T |
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| Q |
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250 |
Q |
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| T |
70792 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacctacttttcatactttgaacatgtaatt |
70693 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatcca-taacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
349 |
Q |
| |
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| T |
70692 |
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70593 |
T |
 |
| Q |
350 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa |
390 |
Q |
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| T |
70592 |
tccaaataagcacttttcttacaaataattgaaaattacaa |
70552 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 286 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 79925 - 79785
Alignment:
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286 |
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385 |
Q |
| |
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catctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaat |
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T |
 |
| Q |
386 |
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425 |
Q |
| |
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| T |
79825 |
tacaatgagtgattatgatcaattctaacccccttagctta |
79785 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 255084 - 254710
Alignment:
| Q |
52 |
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150 |
Q |
| |
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|||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
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caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
254985 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaa |
248 |
Q |
| |
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| T |
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gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaa |
254886 |
T |
 |
| Q |
249 |
ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattc |
348 |
Q |
| |
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| T |
254885 |
ttcaact-acaacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattc |
254787 |
T |
 |
| Q |
349 |
atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
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| T |
254786 |
atccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaattatatcccccttacctta |
254710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 261690 - 261316
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
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|
| T |
261690 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
261591 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaa |
248 |
Q |
| |
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|
|
| T |
261590 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaa |
261492 |
T |
 |
| Q |
249 |
ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattc |
348 |
Q |
| |
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| T |
261491 |
ttcaact-actacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattc |
261393 |
T |
 |
| Q |
349 |
atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
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| T |
261392 |
atccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaattatatcccccttacctta |
261316 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 132520 - 132144
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52 |
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Q |
| |
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| T |
132520 |
caccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt |
132421 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
250 |
Q |
| |
|
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| T |
132420 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacgatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatataatt |
132321 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
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| T |
132320 |
caacaaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcac |
132221 |
T |
 |
| Q |
351 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
132220 |
ccaattaagcacttttcatagaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattccaacccccttacctta |
132144 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 48 - 425
Target Start/End: Original strand, 11660 - 12041
Alignment:
| Q |
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146 |
Q |
| |
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|||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
11660 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataaccaagccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacatc |
11759 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
245 |
Q |
| |
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| T |
11760 |
aattgatcatgaaacttatcacaattctacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatgttttcaactcatatctttttctcatactttgaacatg |
11859 |
T |
 |
| Q |
246 |
taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
345 |
Q |
| |
|
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| T |
11860 |
aaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattgaaacatgtcatcataattagagcacgaaattcatcatttatgaacaattaatcaa |
11959 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
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| T |
11960 |
ttgacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaattgcaccaaaaatgattatgatgaattctaaccaccttacctta |
12041 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
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Target Start/End: Original strand, 88289 - 88631
Alignment:
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187 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
88289 |
atcatgcatacccaagccaagaattagcatccataacatcacttaacaacagcaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagc |
88388 |
T |
 |
| Q |
188 |
ataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcataca |
287 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
88389 |
ataattcaccaattgatcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacattttaattattcataacttcataca |
88488 |
T |
 |
| Q |
288 |
tctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatta |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
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| T |
88489 |
tctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaatag |
88588 |
T |
 |
| Q |
388 |
caa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
429 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
88589 |
caataagtgattatgatgaattctaacccccttacctttatta |
88631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 425
Target Start/End: Original strand, 16022 - 16253
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caattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat |
296 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16022 |
caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacat |
16121 |
T |
 |
| Q |
297 |
gtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatg-accaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaat--tacaaaa |
392 |
Q |
| |
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| T |
16122 |
gtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatac-aataattgaaattgcaccaaaa |
16220 |
T |
 |
| Q |
393 |
gtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
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| T |
16221 |
atgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 425
Target Start/End: Original strand, 25553 - 25784
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caattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat |
296 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattaaaacat |
25652 |
T |
 |
| Q |
297 |
gtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatg-accaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaat--tacaaaa |
392 |
Q |
| |
|
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| T |
25653 |
gtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatac-aataattgaaattgcaccaaaa |
25751 |
T |
 |
| Q |
393 |
gtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25752 |
atgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25784 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 40 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 253271 - 252903
Alignment:
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40 |
attttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
138 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |
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| T |
253271 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcaagaaatcatgaatcatgcaaacccaagccttgaattatcatcaacaacatgacttaacaaaa |
253172 |
T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
238 |
Q |
| |
|
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|
| T |
253171 |
acaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcatgattcaccaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatacttt |
253072 |
T |
 |
| Q |
239 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaat |
338 |
Q |
| |
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| T |
253071 |
gaaaatgtaattcaactaacaacaattcaattatccctaacttcatacatccaaacatgtcatcataatcaaagcacgaattttatcatttatgcacaat |
252972 |
T |
 |
| Q |
339 |
taatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaa |
406 |
Q |
| |
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|
| T |
252971 |
taatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaa |
252903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Original strand, 271148 - 271521
Alignment:
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52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattg |
151 |
Q |
| |
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|||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
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| T |
271148 |
caccaacaacatctcattcctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg |
271247 |
T |
 |
| Q |
152 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
251 |
Q |
| |
|
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|
| T |
271248 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttcatacactttgaacatgtaattc |
271347 |
T |
 |
| Q |
252 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
351 |
Q |
| |
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| T |
271348 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcttcatttatgaataattaatcaattcacc |
271447 |
T |
 |
| Q |
352 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
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| T |
271448 |
caattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
271521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
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T |
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atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
251 |
Q |
| |
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T |
 |
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351 |
Q |
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| T |
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4448103 |
T |
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352 |
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425 |
Q |
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caattaagcacttttcatataaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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Q |
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T |
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350 |
Q |
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T |
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ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
238 |
Q |
| |
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T |
 |
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338 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
339 |
taatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
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T |
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gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaa |
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Q |
| |
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T |
 |
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249 |
ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattc |
348 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
349 |
atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
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Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
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T |
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T |
 |
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Q |
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|
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T |
 |
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ccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
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T |
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|
||| ||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||| |
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T |
 |
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ac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatat |
331 |
Q |
| |
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|| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |
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|
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T |
 |
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| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
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T |
 |
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|
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |
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T |
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Q |
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|
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|
| T |
36890772 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgccatcacaattagagcacgaatttcatcatttatga |
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T |
 |
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ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
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gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
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| |
|
||||||||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
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caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
| Q |
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ccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
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Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
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T |
 |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || |
|
|
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caacatcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattgagcatattt-caacatatatcattttctcatacctt |
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T |
 |
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gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaat |
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Q |
| |
|
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T |
 |
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taatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaa-attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
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Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| |
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|
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|
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 |
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| |
|
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| |
|
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 |
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| |
|
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Target: chr2; HSP #12
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36 |
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133 |
Q |
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| T |
67952 |
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68051 |
T |
 |
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134 |
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232 |
Q |
| |
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| T |
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68150 |
T |
 |
| Q |
233 |
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332 |
Q |
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| T |
68151 |
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T |
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| Q |
333 |
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427 |
Q |
| |
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| T |
68251 |
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68348 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 431
Target Start/End: Original strand, 43645824 - 43646254
Alignment:
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5 |
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104 |
Q |
| |
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| T |
43645824 |
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43645923 |
T |
 |
| Q |
105 |
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203 |
Q |
| |
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| T |
43645924 |
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43646023 |
T |
 |
| Q |
204 |
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303 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||| || ||||||||| |||||||| | |||||||| ||| |||||| ||| || |
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| T |
43646024 |
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43646122 |
T |
 |
| Q |
304 |
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399 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| | || | ||| ||||||||| ||| | ||||||| |||||| |||||||| | | |||| |||| |||| |||||| |
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| T |
43646123 |
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43646221 |
T |
 |
| Q |
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431 |
Q |
| |
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||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43646222 |
tgactgaattctaacccccttaccttaattatc |
43646254 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19433649 - 19433452
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103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
19433649 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaag |
19433550 |
T |
 |
| Q |
104 |
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201 |
Q |
| |
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|||||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |
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| T |
19433549 |
ccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttacaacaattcaataacaacatagcataattcaacaatt |
19433452 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31146450 - 31146073
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150 |
Q |
| |
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|||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| || || ||| | |||||||||| |
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| T |
31146450 |
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31146351 |
T |
 |
| Q |
151 |
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249 |
Q |
| |
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|| || ||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |
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| T |
31146350 |
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31146253 |
T |
 |
| Q |
250 |
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349 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | || |||||||| | || |||| ||||||||||||| | |
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|
| T |
31146252 |
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31146154 |
T |
 |
| Q |
350 |
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425 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31146153 |
ctcagttaagcacttattcatacaacaatttgaaaatttacacaaaagatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
31146073 |
T |
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Target: chr2; HSP #16
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Target Start/End: Original strand, 22274688 - 22274856
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138 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| | || | |
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|
| T |
22274688 |
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22274786 |
T |
 |
| Q |
139 |
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208 |
Q |
| |
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|
| T |
22274787 |
acaacaaccattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
22274856 |
T |
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Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Original strand, 22283921 - 22284089
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attttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
138 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | ||| | || | |
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|
| T |
22283921 |
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22284019 |
T |
 |
| Q |
139 |
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208 |
Q |
| |
|
| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22284020 |
aaaacaacgattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
22284089 |
T |
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Target: chr2; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 33 - 177
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33 |
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132 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || || |
|
|
| T |
3529 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatctacaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactta |
3430 |
T |
 |
| Q |
133 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaaca |
177 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||||| || | || ||||||||| |
|
|
| T |
3429 |
gcaacaacaacatcaattgaacatgaacctaagcataattcaaca |
3385 |
T |
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150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| ||||||||||||| | | |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
6879414 |
caccaacaacatctcaattctcaacaacaaaccaagaattatttaaacccaagacatgtattatcatcaacaacatgactaaataacaacaacaacaatt |
6879513 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca |
214 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6879514 |
gatcattaaacatatcacaattcatcaataacaatgcataattcaccaattgagtatattttca |
6879577 |
T |
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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
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145 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| | |||||| |
|
|
| T |
9653179 |
aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacatcaacat |
9653080 |
T |
 |
| Q |
146 |
caattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag |
204 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9653079 |
ctattgatcatgaaaaatatcgcaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 25305416 - 25305622
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46 |
caaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaaca |
144 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||| || || | | ||||||| |
|
|
| T |
25305416 |
caaaactaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttagccacaacaaca |
25305515 |
T |
 |
| Q |
145 |
tcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaa-caacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaac |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| |
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|
| T |
25305516 |
tcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatcaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacacatatcactttctcatactttgaac |
25305614 |
T |
 |
| Q |
243 |
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250 |
Q |
| |
|
||| |||| |
|
|
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25305615 |
atgaaatt |
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Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||| |
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|
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acaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcta-cccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatg |
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T |
 |
| Q |
158 |
aaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag |
204 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaacatattacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag |
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Q |
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|
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||| |
|
|
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acatcatcaaaatcaaatttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaa |
25213076 |
T |
 |
| Q |
103 |
gccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
152 |
Q |
| |
|
||||| | | || ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25213077 |
gccataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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24827044 |
acatcatcaatatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacagctcattttctcaacaacaatcatga |
24826961 |
T |
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atcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgaca |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | |||||||| | ||| | ||||||| ||||||| |||| |||||| || |
|
|
| T |
24884643 |
atcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcctcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctat |
24884742 |
T |
 |
| Q |
131 |
tatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttc |
229 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||||| || || ||||||| ||| ||||| || ||| |
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|
| T |
24884743 |
tagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcata-actcacaatatatcactttc |
24884841 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24884842 |
acatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
24884885 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 429
Target Start/End: Original strand, 19666495 - 19666884
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tttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaac |
140 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||| ||||||||| || ||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| | |||| || || || ||| ||| |
|
|
| T |
19666495 |
tttacaaaaccaacaacaacaatccatttctcatcatcaaaacatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaac |
19666594 |
T |
 |
| Q |
141 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttct-catacttt |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || || | || || ||| | |||||||| |
|
|
| T |
19666595 |
aacatcaattgaacatggttctcatcataattcaataacaacatagcataattcaaccatttgagcataatt-cataagttaaca-cttatacatacttt |
19666692 |
T |
 |
| Q |
239 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaat |
338 |
Q |
| |
|
||||||| || | || || ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||| | || ||||| |||| |
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|
| T |
19666693 |
gaacatgcaaattcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattttaacaactatgaacaat |
19666792 |
T |
 |
| Q |
339 |
taatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
429 |
Q |
| |
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| T |
19666793 |
taatcactt-attcaattaagcatttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaatta |
19666884 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
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Target Start/End: Complemental strand, 22775393 - 22775206
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133 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctc |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||| || | ||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
22775393 |
tcaacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacaca-attcaacatatataactttctc |
22775295 |
T |
 |
| Q |
232 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
22775294 |
atactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22775206 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 320
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| Q |
133 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctc |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||| || | ||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
22780771 |
tcaacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacaca-attcaacatatataactttctc |
22780673 |
T |
 |
| Q |
232 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
22780672 |
atactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22780584 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 183
Target Start/End: Original strand, 722353 - 722504
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33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | |
|
|
| T |
722353 |
tcaaccaattttacaaagtcaccaacaacaactcatatctcatcaataaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcactt |
722452 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
| || ||| || |||||||| |||||| || | || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
722453 |
agcagcaactacttcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatcaaca |
722504 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
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Target Start/End: Complemental strand, 23821892 - 23821743
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36 |
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133 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| || || ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||| || || || |
|
|
| T |
23821892 |
acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
23821793 |
T |
 |
| Q |
134 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
23821792 |
caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataaca |
23821743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23830971 - 23830822
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| Q |
36 |
acccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| || || ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||| || || || |
|
|
| T |
23830971 |
acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
23830872 |
T |
 |
| Q |
134 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
23830871 |
caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataaca |
23830822 |
T |
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Target: chr2; HSP #32
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || || | ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||| || || ||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
19669374 |
acaacaactcatttttcatcatcagttcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattgaaca |
19669275 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaac |
254 |
Q |
| |
|
|| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| | || || | | ||||||| ||||||| |||| || |
|
|
| T |
19669274 |
tggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcat-gattcacaagttaacacttacacatacttagaacatgcaatttcac |
19669176 |
T |
 |
| Q |
255 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaa |
354 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||| | |||| | || ||||| ||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
19669175 |
caacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcaccatagttagagcatggattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaa |
19669077 |
T |
 |
| Q |
355 |
ttaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19669076 |
ttaatcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaaccccgttacctta |
19669003 |
T |
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Target: chr2; HSP #33
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Target Start/End: Original strand, 9636701 - 9636944
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129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||||| || || || |||||| | ||| | |||||| | |||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
9636701 |
atcaacccattttaacaaaaccaacaacaacaagttatttcacatcacaaactcatgatttatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctc |
9636800 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||| ||||| || || |
|
|
| T |
9636801 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcata-attcacaatatatcatttt |
9636899 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc |
273 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9636900 |
cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
9636944 |
T |
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Target: chr2; HSP #34
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tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaa |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||| | || | ||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25265643 |
tcatgaat-atgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaa |
25265545 |
T |
 |
| Q |
182 |
caatgcataattcaccaattgagca |
206 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25265544 |
catagcaaaattcaccaattgagca |
25265520 |
T |
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Target: chr2; HSP #35
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179 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||| ||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| || | || ||||||||| | |
|
|
| T |
24294764 |
aatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatc |
24294665 |
T |
 |
| Q |
180 |
aaca |
183 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
24294664 |
aaca |
24294661 |
T |
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Target: chr2; HSP #36
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taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23821714 |
taattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac |
23821615 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23821614 |
tt-actcaattaagcacttaagcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttacctta |
23821534 |
T |
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Target: chr2; HSP #37
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Target Start/End: Complemental strand, 23830793 - 23830613
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246 |
taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23830793 |
taattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac |
23830694 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23830693 |
tt-actcaattaagcacttaagcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttacctta |
23830613 |
T |
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tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
19794660 |
tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatc |
19794623 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #39
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141 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24341584 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
24341519 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #40
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catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || || |
|
|
| T |
19660037 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtatacgaacatatcatcataattagagcacgaaattcaacatcta |
19660136 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaat |
427 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| || || | ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19660137 |
agaacaaataatcactt-attccattaaacacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaagtgattatgatgaattctaa-ccccttaccttaat |
19660234 |
T |
 |
| Q |
428 |
tatc |
431 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
19660235 |
tatc |
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T |
 |
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97 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||| | |||||| || | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24560955 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaaca |
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T |
 |
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tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22284279 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc |
22284316 |
T |
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aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15633535 |
aagtgattatgataaagactaacctccttaccttaattatc |
15633575 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
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| Q |
82 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaa |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| | |||| | |||| ||||||||| | || ||| || |||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |
|
|
| T |
36982694 |
tcatgaat-atgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaa |
36982596 |
T |
 |
| Q |
182 |
caatgcataattcaccaattgagca |
206 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36982595 |
cttggcaaaattcaccaattgagca |
36982571 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:
Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
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150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5516 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt |
5417 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaa |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5416 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcctaattcaccaattgagcatattttcg-cacatacctattt-tcatacactttgaacatgtaa |
5319 |
T |
 |
| Q |
249 |
ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattc |
348 |
Q |
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5318 |
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5220 |
T |
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| Q |
349 |
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425 |
Q |
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| T |
5219 |
atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattagaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
5143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 48 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9156 - 8776
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146 |
Q |
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| T |
9156 |
aaaccaccgacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc |
9057 |
T |
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| Q |
147 |
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245 |
Q |
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| T |
9056 |
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8958 |
T |
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| Q |
246 |
taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
345 |
Q |
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| T |
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8858 |
T |
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| Q |
346 |
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425 |
Q |
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| T |
8857 |
ttttcccaattaagcacttattcatac-aataattgaaattgcaccaaaaatgattatgatgaactctaacccccttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 57 - 425
Target Start/End: Original strand, 3 - 370
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| Q |
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155 |
Q |
| |
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| T |
3 |
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102 |
T |
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| Q |
156 |
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255 |
Q |
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| T |
103 |
tgaaacttatcacaattcatcaaccacgtagcataattcacgaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgcaattcaacc |
202 |
T |
 |
| Q |
256 |
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355 |
Q |
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| T |
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299 |
T |
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| Q |
356 |
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425 |
Q |
| |
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| T |
300 |
taagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttacctta |
370 |
T |
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Target: scaffold0160; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 3492 - 3593
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146 |
Q |
| |
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| T |
3492 |
aaaccaccaacaacattccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatc |
3591 |
T |
 |
| Q |
147 |
aa |
148 |
Q |
| |
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|| |
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|
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3592 |
aa |
3593 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
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Target Start/End: Original strand, 85321 - 85683
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162 |
Q |
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| T |
85321 |
ctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaact |
85420 |
T |
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| Q |
163 |
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262 |
Q |
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| T |
85421 |
tatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
85520 |
T |
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| Q |
263 |
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362 |
Q |
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| T |
85521 |
attcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttataaacaattaatcaattcacccaattaagcac |
85620 |
T |
 |
| Q |
363 |
ttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
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| T |
85621 |
ttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
85683 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 48 - 425
Target Start/End: Original strand, 159275 - 159651
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| Q |
48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
146 |
Q |
| |
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| T |
159275 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccaaaaattatcatcaacatca---cttagcaacaacaacatc |
159371 |
T |
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| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
245 |
Q |
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| T |
159372 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcataatttcaactcatatcattttctcatactttgaacatg |
159471 |
T |
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| Q |
246 |
taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
345 |
Q |
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| T |
159472 |
aaattcaactaacaacaatgccattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaa |
159571 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
159572 |
ttcacccaattaagcacttttcgtac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
159651 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:
Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
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Target Start/End: Original strand, 1300 - 1667
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58 |
caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcat |
156 |
Q |
| |
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|
| T |
1300 |
caacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcat |
1399 |
T |
 |
| Q |
157 |
gaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaacta |
256 |
Q |
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| T |
1400 |
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1499 |
T |
 |
| Q |
257 |
acaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaatt |
356 |
Q |
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| T |
1500 |
ccaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcatgattagagcacgaatttcatcatttatacacaattaatcaattcattcaatt |
1599 |
T |
 |
| Q |
357 |
aagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
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| T |
1600 |
aaccacttttcatacaaataattg--aattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttgcctta |
1667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11921 - 11548
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| Q |
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149 |
Q |
| |
|
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|
| T |
11921 |
caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgagttatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaaca---at |
11826 |
T |
 |
| Q |
150 |
tgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgta |
247 |
Q |
| |
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| T |
11825 |
tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaatgcataattcactaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgta |
11727 |
T |
 |
| Q |
248 |
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347 |
Q |
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| T |
11726 |
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11627 |
T |
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425 |
Q |
| |
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| T |
11626 |
catccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0117 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
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Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
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Target Start/End: Complemental strand, 11837 - 11464
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caccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattg |
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Q |
| |
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| T |
11837 |
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11738 |
T |
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| Q |
152 |
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251 |
Q |
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| T |
11737 |
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11638 |
T |
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| Q |
252 |
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351 |
Q |
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| T |
11637 |
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11539 |
T |
 |
| Q |
352 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
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||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
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|
| T |
11538 |
caattaaacacttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccatacctta |
11464 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:
Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 74 - 425
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
25212 |
aacaacaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattc |
25310 |
T |
 |
| Q |
174 |
aacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc |
273 |
Q |
| |
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| T |
25311 |
aacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattatt |
25410 |
T |
 |
| Q |
274 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa |
373 |
Q |
| |
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| T |
25411 |
cataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaa |
25510 |
T |
 |
| Q |
374 |
ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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| T |
25511 |
ataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttacctta |
25563 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 326
Target Start/End: Original strand, 24890 - 25210
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104 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24890 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaa-cccaagc |
24988 |
T |
 |
| Q |
105 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag |
204 |
Q |
| |
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| T |
24989 |
catgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgag |
25088 |
T |
 |
| Q |
205 |
catattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcat |
304 |
Q |
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| T |
25089 |
catattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcat |
25188 |
T |
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| Q |
305 |
aaatagagcacgaatttcatca |
326 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||| |
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| T |
25189 |
aaatagagcacaaatttcatca |
25210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0240 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 59 - 425
Target Start/End: Original strand, 7556 - 7922
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59 |
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| |
|
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| T |
7556 |
aacatctcatttctcaacaaccaac--gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatga |
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T |
 |
| Q |
159 |
aacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaac |
258 |
Q |
| |
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| T |
7654 |
aacttatcataatttatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcatcatatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaac |
7753 |
T |
 |
| Q |
259 |
aacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat-gtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaatta |
357 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7754 |
aacaattcaattatttataacttcatacatctaaacataggcatcataattagatcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaatta |
7853 |
T |
 |
| Q |
358 |
agcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7854 |
agcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtaattatgatgaattctaacccccttacctta |
7922 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
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Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 112812 - 112441
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52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
112812 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca---acaacatgacttaacaacaacaacataaatt |
112716 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
112715 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataattcactaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaatt |
112616 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
112615 |
caactaacaacaattcaattgttcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcac |
112516 |
T |
 |
| Q |
351 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
112515 |
ccaaataagtacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
112441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 103211 - 102815
Alignment:
| Q |
33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
103211 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcactt |
103112 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
| || || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| || || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
103111 |
agaaacaataacatcaattgaacatgaatgttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaaatttagcata-ttccaccatataccactttct |
103013 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| | || || |
|
|
| T |
103012 |
catactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaatta |
102913 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
102912 |
tgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacacaaaaaatgattatgatgaattataaaccccttacctta |
102815 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 305
Target Start/End: Original strand, 109556 - 109821
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| Q |
41 |
ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |
|
|
| T |
109556 |
ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcgtgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaa |
109655 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
238 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
109656 |
caacatcaactgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcaaaattcaacaatttgagcata-tttcaacatataccactttctcatacttt |
109754 |
T |
 |
| Q |
239 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcata |
305 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||| |||||||| |
|
|
| T |
109755 |
aaacatgaaatttcattaacaacaattcaattatcaacaacttcatggattcaaacatatcatcata |
109821 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0083 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:
Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Original strand, 14854 - 15224
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| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatcat-gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
14854 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac---taaacaacaacaacaatt |
14950 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaa |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14951 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaa |
15048 |
T |
 |
| Q |
249 |
ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattc |
348 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15049 |
tctaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattc |
15147 |
T |
 |
| Q |
349 |
atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15148 |
atccaattaagcacttatcatacatataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
15224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 129
Target Start/End: Original strand, 14194 - 14272
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatcat-gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14194 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
14272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 36 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15761 - 15361
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| Q |
36 |
acccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac---a |
130 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| | ||||||| | |||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||| | |
|
|
| T |
15761 |
acccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatctataacatgactaaa |
15662 |
T |
 |
| Q |
131 |
tatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || | |
|
|
| T |
15661 |
caacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttt |
15563 |
T |
 |
| Q |
231 |
c-atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
15562 |
ttatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattgtccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccactt |
15463 |
T |
 |
| Q |
330 |
atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
429 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15462 |
atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataatttaaaattacaaaagtgattatgatgaatgctaacccccttaccttaatta |
15363 |
T |
 |
| Q |
430 |
tc |
431 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
15362 |
tc |
15361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 389
Target Start/End: Original strand, 6500 - 6859
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| Q |
32 |
atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| |||||| | ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
6500 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacctaagccatgaatcatcaacaacaatatctc |
6599 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| ||| |||| |||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||| || || |
|
|
| T |
6600 |
ttagcaacaacatcatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagtata-actcacaatatatcatttt |
6698 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca |
328 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||| |||| || || ||||||||||||||| || | ||| || ||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
6699 |
cacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaattccatgtatttaaacatatcaccataattagaacacaaatttcatcaac |
6798 |
T |
 |
| Q |
329 |
tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca |
389 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
6799 |
tatgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattaca |
6859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0610 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:
Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 52 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 846 - 471
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| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
846 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt |
747 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
746 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaatt |
647 |
T |
 |
| Q |
251 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
350 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
646 |
caattaacaacaattctattatccataatttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcac |
547 |
T |
 |
| Q |
351 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta-caa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
546 |
ccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaatagcaataaatga-tatgatgaattctaacccccttacctta |
471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 64 - 425
Target Start/End: Original strand, 38287 - 38650
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| Q |
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ctcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaact |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38287 |
ctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagttatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacgtcaattgatcatgaaact |
38386 |
T |
 |
| Q |
163 |
tatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
38387 |
tatcacaattcatcaacaacaatgcataattcgccaattgagcatattttcaacatatacccatttctcttcctttgaacatgtaattcaaccaacaaaa |
38486 |
T |
 |
| Q |
263 |
attcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcac |
362 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
38487 |
attcaattattcataaattcataaatctaaacatgtcatcataattagagcgcgtatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcac |
38586 |
T |
 |
| Q |
363 |
ttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38587 |
ttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
38650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0075 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:
Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 40 - 364
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| Q |
40 |
attttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
138 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
4906 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcagcaaatcatgaattatgaacaaccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaaca |
5005 |
T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
5006 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactgt |
5105 |
T |
 |
| Q |
239 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaat |
338 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
5106 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaat |
5205 |
T |
 |
| Q |
339 |
taatcaattcatccaattaagcactt |
364 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5206 |
taattaattcacccaattaagcactt |
5231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 7)
Name: scaffold0016
Description:
Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 64 - 425
Target Start/End: Original strand, 164204 - 164565
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| Q |
64 |
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162 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
164204 |
ctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattaccatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacatttgatcatgaaaca |
164303 |
T |
 |
| Q |
163 |
tatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaa |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
164304 |
tatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatcttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaactaaca- |
164400 |
T |
 |
| Q |
261 |
caattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagc |
360 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
164401 |
caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatgaaaaattaatcaattcatccaattaagc |
164500 |
T |
 |
| Q |
361 |
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425 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
164501 |
acttaccatacaattaattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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137 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |
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| T |
162469 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaacaaac |
162370 |
T |
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| Q |
138 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
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aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcata |
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T |
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Target: scaffold0016; HSP #3
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138 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || | |
|
|
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atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttttcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaa-------tattaaca |
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T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
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|||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcata |
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T |
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40 |
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138 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| | |
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116795 |
attttacaaaaccaccaacaacaatccatttttcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaaca |
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T |
 |
| Q |
139 |
acaacatca |
147 |
Q |
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|
|
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116695 |
acaacatca |
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T |
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T |
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tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
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tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||| | || ||||| | | |||||| |||||||| | |
|
|
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tttcaacatatatcattttctcatactttgaacatgaaaacccac-----acaattcaattatcaacaatttcatgccttcaaacataacatcataattg |
116570 |
T |
 |
| Q |
310 |
gagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaattaca---aaagtgattatgatga |
405 |
Q |
| |
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| T |
116569 |
gagcacgaattctaacaattatgagcaattaat-aatttactcaattaagcacttattcatacaaccattcaaaatttacactaaaaatgattatgatga |
116471 |
T |
 |
| Q |
406 |
acactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
116470 |
aatctaacccccttaccttaattatc |
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T |
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Target: scaffold0068; HSP #1
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149 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || || | |||| |
|
|
| T |
48124 |
caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaat |
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T |
 |
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tgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
249 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
48223 |
tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacataaaat |
48321 |
T |
 |
| Q |
250 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
349 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
48322 |
tcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
48421 |
T |
 |
| Q |
350 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
48422 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgataaattctaa-ccccttacctta |
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T |
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Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
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Target Start/End: Original strand, 61572 - 61944
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Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || || | |||| |
|
|
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caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaat |
61670 |
T |
 |
| Q |
150 |
tgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
249 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
61671 |
tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacataaaat |
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T |
 |
| Q |
250 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
61770 |
tcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
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T |
 |
| Q |
350 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
61870 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgataaattctaa-ccccttacctta |
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T |
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Target: scaffold0447 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
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Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
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Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| || || ||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
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aaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc |
4635 |
T |
 |
| Q |
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aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4636 |
aattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatg |
4735 |
T |
 |
| Q |
246 |
taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
345 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4736 |
taattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaa |
4835 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4836 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
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Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| || || ||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
9150 |
aaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc |
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T |
 |
| Q |
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aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9250 |
aattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatg |
9349 |
T |
 |
| Q |
246 |
taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
345 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9350 |
taattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaa |
9449 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9450 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: scaffold0037 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
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Target: scaffold0037; HSP #1
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Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
25002 |
aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgaatacccaagccaagaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatc |
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T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24902 |
tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatatgttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgt |
24803 |
T |
 |
| Q |
247 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaat |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24802 |
aattcaactaacaacaatttaattatcaataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatggacaattaatcaat |
24703 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24702 |
tcacctaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatttcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
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Target Start/End: Original strand, 94948 - 95109
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Q |
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|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||| || |||||| ||||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
95048 |
tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcata |
95109 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0383; HSP #1
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|
|||||| | ||||||||| ||||| || || ||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
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aaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc |
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T |
 |
| Q |
147 |
-aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacat |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
7244 |
caattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacat |
7343 |
T |
 |
| Q |
245 |
gtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatca |
344 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7344 |
gtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatca |
7443 |
T |
 |
| Q |
345 |
attcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7444 |
attcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0554 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
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Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
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Target Start/End: Original strand, 1889 - 2263
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Q |
| |
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| T |
1889 |
aaaccactaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatactcaagccaagaattatcatcatcaacatgacttagcaacaacaacatc |
1988 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1989 |
aattgatcatgaatcttataacaaatcaacaaca-catagcataattcaaccaattgagcatattttcatcatataccattttcgcatactttgaacatg |
2087 |
T |
 |
| Q |
246 |
taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2088 |
aaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgagcaattaatcaa |
2187 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttac |
421 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2188 |
ttcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttac |
2263 |
T |
 |
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Target: scaffold0049; HSP #1
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Q |
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|
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20274 |
caacaacaaagcataattaaccaattgagcatattttcaacatatatcta-ttttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattatt |
20372 |
T |
 |
| Q |
274 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20373 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa |
20472 |
T |
 |
| Q |
374 |
ataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20473 |
ataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
20530 |
T |
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Q |
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|||||||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||| || || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
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| T |
33668 |
aatcatgaattatgaacaccctagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaac |
33767 |
T |
 |
| Q |
180 |
aacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataac |
279 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33768 |
aacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatctataac |
33867 |
T |
 |
| Q |
280 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataat |
378 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |
|
|
| T |
33868 |
ttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttacgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttaatcatac-agtaat |
33966 |
T |
 |
| Q |
379 |
tgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33967 |
tgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaatccccttacctta |
34014 |
T |
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Target: scaffold0031; HSP #1
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ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| || |
|
|
| T |
31010 |
ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccataaattatcatcaaaaacctcacatatcagcaa |
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T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataa-ttcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
31110 |
caacatcaattaatcatgaaacttatcacaattcaacaactacaaa-cataacttaacaaattgagcatattttcaacatataccattttcttatacttt |
31208 |
T |
 |
| Q |
239 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaat |
338 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| |
|
|
| T |
31209 |
gaacatg-aattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaaa |
31307 |
T |
 |
| Q |
339 |
taatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
384 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
31308 |
taatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaa |
31352 |
T |
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Target: scaffold0031; HSP #2
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
70654 |
catcaacaacatcatatatcagcaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaaccaattaagcatattttc |
70753 |
T |
 |
| Q |
214 |
aacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagc |
313 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
70754 |
aacatattccattttctcatactttgaacatg-aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgacatcataattagagc |
70852 |
T |
 |
| Q |
314 |
acgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaa |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | | |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
70853 |
acgaatttcatcatttataaactattaattaattcacccaattaagcacttttcatac-aataactgaaaattacaataaatgattatgatgaattctaa |
70951 |
T |
 |
| Q |
413 |
cccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
70952 |
cccccttacctta |
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T |
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Target: scaffold0031; HSP #3
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131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||| ||| || || | | |
|
|
| T |
97487 |
tcaacccattttacaaaaccaataacaacaactcaattcttatcatcaaatcatgatttatgaaaacccaaggcatgaatcatcaacaataatatcaatt |
97388 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
| || ||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |
|
|
| T |
97387 |
agtaacaacaatatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaccaacatagcataattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttca |
97289 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || || || ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | | || || |
|
|
| T |
97288 |
catactttgaacatgcaattccaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatcttaacaacta |
97189 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgat-gaacactaacccccttaccttaa |
426 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| | || ||||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
97188 |
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T |
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Target: scaffold0740; HSP #1
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | || |||||| || |
|
|
| T |
4351 |
caacaacaattgatcataaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgaacatattttca-cacatacccattt-tcatacactt |
4448 |
T |
 |
| Q |
238 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
4449 |
tgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataatttgatacatctaaacatgtcattataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaa |
4547 |
T |
 |
| Q |
338 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4548 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaacgtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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125 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4284 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaaca |
4358 |
T |
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Target: scaffold0122 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 3)
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Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
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333 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20041 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
19942 |
T |
 |
| Q |
334 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19941 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
19844 |
T |
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actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24345 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
24246 |
T |
 |
| Q |
334 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24245 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
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T |
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Target: scaffold0122; HSP #3
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146 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |
|
|
| T |
24471 |
aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaacaacaac |
24372 |
T |
 |
| Q |
147 |
aatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
24371 |
aatt |
24368 |
T |
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Target: scaffold0833 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
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Target: scaffold0833; HSP #1
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104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3230 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
3329 |
T |
 |
| Q |
105 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaac |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3330 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac |
3407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
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Target: scaffold0034; HSP #1
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179 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
46171 |
aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagaaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaac |
46270 |
T |
 |
| Q |
180 |
aacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca--tactttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaattatccat |
276 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46271 |
aacatagcataattcaccaattgagcatattttca-cata-acccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatccat |
46368 |
T |
 |
| Q |
277 |
aacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaata |
376 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
46369 |
aacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aata |
46467 |
T |
 |
| Q |
377 |
attgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
429 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
46468 |
attaaaaattgcaataaatgattatgatgaattataaccctcttaccttaatta |
46521 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 425
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaac |
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Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
40664 |
aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatgtaacaac |
40763 |
T |
 |
| Q |
180 |
aacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca--tactttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaattatccat |
276 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40764 |
aatatagcataattcaccaattgagcatattttca-cata-acccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatccat |
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T |
 |
| Q |
277 |
aacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaata |
376 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
40862 |
aacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactattcatac-aata |
40960 |
T |
 |
| Q |
377 |
attgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
40961 |
attaaaaattgcaataaatgattatgatgaattataacccccttacctta |
41010 |
T |
 |
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Target: scaffold0034; HSP #3
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155 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | ||| |||| |
|
|
| T |
79846 |
acaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattaatca |
79945 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
79946 |
tgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
79998 |
T |
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Target: scaffold0034; HSP #4
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394 |
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431 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
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80188 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc |
80225 |
T |
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Target: scaffold0025 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
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Target: scaffold0025; HSP #1
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36 |
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133 |
Q |
| |
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||||||||| || |||||| | ||||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| || || |
|
|
| T |
146561 |
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146660 |
T |
 |
| Q |
134 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat |
233 |
Q |
| |
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||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| |
|
|
| T |
146661 |
caacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcat |
146760 |
T |
 |
| Q |
234 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaattt |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |
|
|
| T |
146761 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacagttcaattatacataacttcatacatctaaacatgtcatcataattaaagcatgaattt |
146848 |
T |
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Target: scaffold0025; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 53305 - 53703
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33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||| || ||| |||||| | ||| | |||||||||||||| || | |||||| | || | |
|
|
| T |
53305 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacacgtcaattctcatcatcaaatcatgattaatg-actcccaagccatgaatcattaacaacaatgtcactt |
53403 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||| | || || ||||||| || ||||||||| || |||| |
|
|
| T |
53404 |
agcaacaacaacatccattgaacatgaatctcatcacaattcatcaacaaaatagcataattgaacatttagagcataatt-caacatataacaccttca |
53502 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || |||| ||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||| | || || |
|
|
| T |
53503 |
catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcattattagagcatgaattctaacaacta |
53602 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa |
426 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53603 |
tgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaa |
53700 |
T |
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Target: scaffold0025; HSP #3
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Target Start/End: Original strand, 85489 - 85818
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atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||| | |||| | ||| | ||||||| ||||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
85489 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacctatttttcatcaacaaaccatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctc |
85588 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||| |||| || | ||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||| || || ||||| || || |
|
|
| T |
85589 |
ttagcaacaacaatatcacttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcattaatttgagcataatt-cacaatatatcatttt |
85687 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca |
328 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
85688 |
cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-taaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaac |
85786 |
T |
 |
| Q |
329 |
tatgaccaattaatcaattcatccaattaagca |
361 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
85787 |
tatgaacaattaatcactt-attcaattaagca |
85818 |
T |
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Target: scaffold0025; HSP #4
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aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| || | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8917 |
aacatcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
8982 |
T |
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Target: scaffold0095 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
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Target: scaffold0095; HSP #1
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ttttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
139 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| || |
|
|
| T |
34008 |
ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaa |
33910 |
T |
 |
| Q |
140 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttc-tcatactt |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |
|
|
| T |
33909 |
caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcata-tttcaacatataac-acttcttcatactt |
33812 |
T |
 |
| Q |
238 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
337 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| | || ||||| ||| |
|
|
| T |
33811 |
taaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaa |
33712 |
T |
 |
| Q |
338 |
ttaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33711 |
ttaatcaatt-actcaattaagcatttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
33622 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:
Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
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Target Start/End: Original strand, 5900 - 6251
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acccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| | ||||||||| ||||| || || ||| ||||| || ||| | || |||||||||||| |||| |||||| || || || |
|
|
| T |
5900 |
acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
5999 |
T |
 |
| Q |
134 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctc |
231 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
6000 |
caacaacaacatcaattgaacatgaatattatcacaattcaacaaccacatagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatataccatttttctc |
6099 |
T |
 |
| Q |
232 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatat |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6100 |
atactttgaacatgaaattctaccaacaacaatccaattatccataacttcatacattcaaacatgtcgtcataattagagcacgaatttcatcatttat |
6199 |
T |
 |
| Q |
332 |
gaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
384 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6200 |
gaacaattaatcaattcaccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaa |
6251 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 736 - 572
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acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaac |
143 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | | |||||| |
|
|
| T |
736 |
acaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaacaaattattaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgagtaaatatcaacaac |
637 |
T |
 |
| Q |
144 |
atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
636 |
aaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0092 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
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Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
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64 |
ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaact |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
3308 |
ctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacatcaacatcaattgatcatgaatct |
3407 |
T |
 |
| Q |
163 |
tatcacaattcaacaacaacaatgcataatt-caccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaac |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
3408 |
tatcacaattcaactacaacatagcataattggaccaattgagcatattttc-acatataccactttctcatactttgaacattaaatttctctaacaac |
3506 |
T |
 |
| Q |
262 |
aattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagca |
361 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
3507 |
aattcaattataaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagca |
3605 |
T |
 |
| Q |
362 |
ctta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3606 |
cttattcatac-aataattgtaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
3671 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:
Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 319
Target Start/End: Original strand, 28466 - 28781
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5 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaa-caatcatgaatcatgcaaacccaag |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
28466 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaag |
28565 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttg |
202 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
28566 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacataattcttactacaattcaacaacaacataccataattcaacaatttg |
28665 |
T |
 |
| Q |
203 |
agcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatc |
302 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| | || ||||| ||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
28666 |
agcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatc |
28764 |
T |
 |
| Q |
303 |
ataaatagagcacgaat |
319 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28765 |
ataattagagcacgaat |
28781 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 55
Target Start/End: Original strand, 21637 - 21687
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acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccacc |
55 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21637 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccacc |
21687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0053 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:
Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 77129 - 76734
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||| || || || ||| | |
|
|
| T |
77129 |
atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcacttagcaaca |
77030 |
T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| || ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
77029 |
acaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgaacataatt-caacatatatcactttctcatactt |
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T |
 |
| Q |
238 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
337 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || |||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
76930 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaatttcatcatctatgaacaa |
76831 |
T |
 |
| Q |
338 |
ttaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
||| |||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
76830 |
ttactcaatt-actcaattaagtacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
76734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0816 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:
Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 274 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3112 - 2961
Alignment:
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274 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3112 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttatcatacaa |
3013 |
T |
 |
| Q |
374 |
ataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3012 |
ataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
2961 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0876 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
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Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 301 - 431
Target Start/End: Original strand, 1 - 131
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| Q |
301 |
tcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattat |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1 |
tcataaatagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattat |
100 |
T |
 |
| Q |
401 |
gatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
101 |
gatgaacactaacccccttaccttaattatc |
131 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 788 - 618
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
788 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagtaacaacaacatcaatt |
689 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacatata |
221 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
688 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacatata |
618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 206
Target Start/End: Original strand, 19216 - 19339
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| Q |
82 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaa |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||| | || || || |||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |
|
|
| T |
19216 |
tcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaa |
19314 |
T |
 |
| Q |
182 |
caatgcataattcaccaattgagca |
206 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19315 |
cttagcaaaattcaccaattgagca |
19339 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 206
Target Start/End: Original strand, 21300 - 21423
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| Q |
82 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaa |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||| | || || || |||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |
|
|
| T |
21300 |
tcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaa |
21398 |
T |
 |
| Q |
182 |
caatgcataattcaccaattgagca |
206 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21399 |
cttagcaaaattcaccaattgagca |
21423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:
Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Original strand, 35444 - 35724
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| Q |
40 |
attttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
138 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| | |
|
|
| T |
35444 |
attttacaaaaccaccaaca-caactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca |
35542 |
T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
237 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||| || ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
35543 |
aaaacatcaattgaacatgactcttaccacatttcaacaacaacatagcataaatcaacaatttgagtataatt-caacatatatcactttctcatactt |
35641 |
T |
 |
| Q |
238 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
320 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| | | ||||||||||| |
|
|
| T |
35642 |
tgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaatt |
35724 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0243 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:
Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2211
Alignment:
| Q |
32 |
atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
2607 |
atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaaacatgaattatgaacgcccaagccatgaatcatcatcaacaacatcac |
2508 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| || || |
|
|
| T |
2507 |
ttaggaacaacaacatcaattgaacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacatatgtcacttt |
2409 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | | |
|
|
| T |
2408 |
ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaataat |
2309 |
T |
 |
| Q |
329 |
tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt--acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||| |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2308 |
tatgattaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattaaaaattgcactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
2211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0091 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:
Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 215
Target Start/End: Original strand, 32180 - 32344
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| | | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
32180 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
32279 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32280 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttcaa |
32344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42123 - 41959
Alignment:
| Q |
52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| | | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
42123 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
42024 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42023 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttcaa |
41959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Original strand, 69415 - 69814
Alignment:
| Q |
33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
69415 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacacctcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
69514 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
69515 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttca |
69613 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
69614 |
catactttaaacatgcaatttcacctacaacaattcaattataaccaatttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta |
69713 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa |
426 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
69714 |
tgaacaattaatcactttct-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttatcttaa |
69811 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 94061 - 93728
Alignment:
| Q |
33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
94061 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacatctcatttctcaccaacaaatcatgaattatgttcacccaaatcatgaattatcatcaacaacatcactt |
93962 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| || ||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
93961 |
attaataacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaatttaacaaca-catagcatacttcaataatttgagcatattt-caacaaataccattttct |
93864 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttc-atcacat |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||||||| | ||||||||||||| | || | |
|
|
| T |
93863 |
catactttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattatcaaaaacttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaatttctaacagtt |
93764 |
T |
 |
| Q |
330 |
atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat |
366 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
93763 |
atgaacaattaat-aatttacccaattaagcacttat |
93728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Original strand, 55553 - 55715
Alignment:
| Q |
48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacat |
145 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| |||||||| |
|
|
| T |
55553 |
aaaccaacaacaacaacttattttacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat |
55652 |
T |
 |
| Q |
146 |
caattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55653 |
ctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
55715 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 104887 - 104793
Alignment:
| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
104887 |
acaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt |
104793 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:
Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 320
Target Start/End: Original strand, 6622 - 6907
Alignment:
| Q |
36 |
acccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatc |
134 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| || || |
|
|
| T |
6622 |
acccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaaaacatcacttagg |
6721 |
T |
 |
| Q |
135 |
aaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcat |
233 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | || |||||||||| ||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
6722 |
agtaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatagcatagcataattcaacaatttgagcaaaatt-caacatatatcactttctcat |
6820 |
T |
 |
| Q |
234 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
6821 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaatt |
6907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0700 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:
Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 344
Target Start/End: Original strand, 2483 - 2795
Alignment:
| Q |
33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| || ||| |||||| | ||| | |||||| |||||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
2483 |
tcaacccattttagaaaaccaacaacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
2582 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |
|
|
| T |
2583 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttca |
2681 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
2682 |
tatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta |
2781 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatca |
344 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |
|
|
| T |
2782 |
tgaacaattaatca |
2795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 197545 - 197143
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33 |
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128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||| || ||| ||||| | ||| | |||||| |||||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
197545 |
tcaacccattttacaaaactaacaacaacaacaactcaattctcatcatcaaagcatgatttatgaagacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatca |
197446 |
T |
 |
| Q |
129 |
catatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaact |
227 |
Q |
| |
|
| || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | | |||||| || || ||||||| || |||| |||| || | |
|
|
| T |
197445 |
cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacataggacaattcaacatttagagcataatt-caacttataacactt |
197347 |
T |
 |
| Q |
228 |
tctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcac |
327 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||| |||| || |
|
|
| T |
197346 |
tcacatactttgaacttgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatacattcaaacatatcatcataattagagcccgaaattcaacat |
197247 |
T |
 |
| Q |
328 |
atatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctt |
424 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
197246 |
ctaagaacaattaatcactt-atccaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctt |
197148 |
T |
 |
| Q |
425 |
aatta |
429 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
197147 |
aatta |
197143 |
T |
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Target: scaffold0686 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0686
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Target: scaffold0686; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 6373 - 6204
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138 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || || | ||| | |
|
|
| T |
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atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatattactaaacaaca |
6274 |
T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6273 |
acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
6204 |
T |
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Target: scaffold0686; HSP #2
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Target Start/End: Complemental strand, 5808 - 5771
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394 |
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431 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
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5808 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
5771 |
T |
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Target: scaffold0686; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 394 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6014 - 5977
Alignment:
| Q |
394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6014 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
5977 |
T |
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Target: scaffold0234 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:
Target: scaffold0234; HSP #1
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aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaaca-atcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
146 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
17686 |
aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacatattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc |
17587 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17586 |
tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
17525 |
T |
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Target: scaffold0184 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
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Target: scaffold0184; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 40 - 208
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138 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| | |
|
|
| T |
31570 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
31471 |
T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31470 |
acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
31401 |
T |
 |
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Target: scaffold0078 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:
Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Original strand, 41274 - 41443
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40 |
attttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
138 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| | |
|
|
| T |
41274 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
41373 |
T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41374 |
acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
41443 |
T |
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Back To:
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Target: scaffold0162 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7287 - 7025
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158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||| || || || || ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7287 |
acaactcatttctcatcaacaattcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattgaacatga |
7188 |
T |
 |
| Q |
159 |
aacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaa |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
7187 |
ttcttatcacaatccaataacaacataacataattaaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacattaaatttcactaa |
7089 |
T |
 |
| Q |
258 |
caacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaattt |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7088 |
caacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
7025 |
T |
 |
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Target: scaffold0597 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
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Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
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145 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| || || ||| |||||||| |
|
|
| T |
1261 |
aaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacat |
1162 |
T |
 |
| Q |
146 |
caattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1161 |
ctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
1099 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0251 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:
Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
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Target Start/End: Complemental strand, 13669 - 13507
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48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacat |
145 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| |||||||| |
|
|
| T |
13669 |
aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat |
13570 |
T |
 |
| Q |
146 |
caattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13569 |
ctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21634 - 21481
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| Q |
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acaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatc |
154 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21634 |
acaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatc |
21535 |
T |
 |
| Q |
155 |
atgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21534 |
atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21481 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0175 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
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Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
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aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacat |
145 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| |||||||| |
|
|
| T |
14921 |
aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat |
15020 |
T |
 |
| Q |
146 |
caattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15021 |
ctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15083 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
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Target: scaffold0116; HSP #1
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138 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | |
|
|
| T |
30056 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaaca |
30155 |
T |
 |
| Q |
139 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaac |
182 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
30156 |
acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116; HSP #2
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394 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
431 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tgattatgatgaaaaataacccccttaccttaattatc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:
Target: scaffold0123; HSP #1
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52 |
caccgacaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
150 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7987 |
caccgataacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaatt |
8086 |
T |
 |
| Q |
151 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttct-catactttgaacatgtaa |
248 |
Q |
| |
|
|| |||| || |||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| | || | |||| | ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
8087 |
gaacatggttctcatcataattccacaacaacatagcataattcacccaattgagcata-aatcataagttagc-acttatacatactttgaacatgcaa |
8184 |
T |
 |
| Q |
249 |
ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattc |
348 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
8185 |
attcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-attt |
8283 |
T |
 |
| Q |
349 |
atccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8284 |
atccaattaatcacttattcatac-aataattgaaaaattacattaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
8363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0706 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:
Target: scaffold0706; HSP #1
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57 |
acaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatca |
155 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
6816 |
acaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaagatctattgatca |
6717 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6716 |
tcaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
6664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:
Target: scaffold0589; HSP #1
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195 |
accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaac |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
7927 |
accaattgagcatattttca-catataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaac |
8025 |
T |
 |
| Q |
295 |
atgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-a |
391 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |
|
|
| T |
8026 |
ataacatcataattggagcacgaattctaacaaatatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgtaaaattgcaata |
8123 |
T |
 |
| Q |
392 |
agtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8124 |
aatgattacgatgaattctaacccccttacctta |
8157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 153
Target Start/End: Original strand, 7807 - 7913
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| Q |
48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
146 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
7807 |
aaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatc |
7906 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgat |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
7907 |
aattgat |
7913 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0574 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:
Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9789 - 9628
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| Q |
48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
146 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| | || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
9789 |
aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaacaacaacaacatc |
9690 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9689 |
tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataagtcactaattgagcata |
9628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:
Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12802 - 12641
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| Q |
48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
146 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | |
|
|
| T |
12802 |
aaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaac |
12703 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12702 |
cattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
12641 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19183 - 19049
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| Q |
48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
146 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | |
|
|
| T |
19183 |
aaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaac |
19084 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaa |
181 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19083 |
cattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa |
19049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0465 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:
Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10248 - 10094
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| Q |
48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
146 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
10248 |
aaaccatcaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc |
10149 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10148 |
cattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccaagcataattcgccaatt |
10094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:
Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Original strand, 30978 - 31377
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33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||| || ||| || ||| | ||| | || |||||||||||| |||| ||||| || || | |
|
|
| T |
30978 |
tcaacccattttacaaaagcaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcttgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacagtatcactt |
31077 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||||| || || |||||| ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
31078 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaagaacatagcacaattcaacatttaaagcata-attcaacatataacactttca |
31176 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || ||||||||| |||||||| || ||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
31177 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaacta |
31276 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa |
426 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31277 |
tgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaa |
31374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:
Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 193770 - 193609
Alignment:
| Q |
48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacat |
145 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| |||||||| |
|
|
| T |
193770 |
aaaccaacaacaacaacttatttcgcaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat |
193671 |
T |
 |
| Q |
146 |
caattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
193670 |
ctattgatcatgaaacatatcacaa-taatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
193609 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 186799 - 186647
Alignment:
| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatc |
154 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
186799 |
acaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatc |
186700 |
T |
 |
| Q |
155 |
atgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
186699 |
atgaaacatatcacaa-taatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
186647 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 429
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27856
Alignment:
| Q |
32 |
atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||| |||||| | ||| | |||||||| |||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
27453 |
atcaacccatttttacaaaaccgacaacaacaactcatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
27552 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| ||| |||| |||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| | ||| |||||| || || | ||| | |||| ||||| || || |
|
|
| T |
27553 |
ttaacaacaacatcatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacatttagggcaca-attcacaatatatcatttt |
27651 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca |
328 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
27652 |
cacatactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaac |
27751 |
T |
 |
| Q |
329 |
tatga-ccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacct |
423 |
Q |
| |
|
||||| | || ||||| ||| || ||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27752 |
tatgagcaaaataatc-atttattcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttacct |
27850 |
T |
 |
| Q |
424 |
taatta |
429 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
27851 |
taatta |
27856 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Original strand, 130486 - 130634
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| Q |
5 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
130486 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttattaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag |
130585 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
152 |
Q |
| |
|
|||| | | || ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
130586 |
ccataattcataatcaacaacatatctcaacaacaacaacatcaattga |
130634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 89652 - 89584
Alignment:
| Q |
138 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89652 |
aacaacatcaattgttcatgaaacttatcacaatttaacaacaacaaagcataattcaccaattgagca |
89584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 425
Target Start/End: Original strand, 79521 - 79891
Alignment:
| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatca |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||| || || || || ||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
79521 |
acaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaca |
79620 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaac |
254 |
Q |
| |
|
|| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| | || || | | ||||||| ||||||| |||| || |
|
|
| T |
79621 |
tggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcata-attcacaagttaacacttacacatacttagaacatgcaatttcac |
79719 |
T |
 |
| Q |
255 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaa |
354 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| | || ||||| ||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
79720 |
caccaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattttagcatctatgaacaattaatc-atttatccaa |
79818 |
T |
 |
| Q |
355 |
ttaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
79819 |
ttaatcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaaaataattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
79891 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1272 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:
Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Original strand, 270 - 436
Alignment:
| Q |
36 |
acccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatc |
134 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||||| || || | |
|
|
| T |
270 |
acccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcacttagc |
369 |
T |
 |
| Q |
135 |
aaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt |
201 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
370 |
aacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatt |
436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:
Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 44087 - 43688
Alignment:
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33 |
tcaacccattttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
44087 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
43988 |
T |
 |
| Q |
132 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
230 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||| || || || | | ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
43987 |
agcaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaatttgacatttagaaccca-attcaacatatatcactttca |
43889 |
T |
 |
| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| | || || |
|
|
| T |
43888 |
tatcctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattagagcattaattttaacaacta |
43789 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa |
426 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43788 |
tgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aacaattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaa |
43691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23893 - 23562
Alignment:
| Q |
100 |
caagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||| || | || ||| |||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| || |
|
|
| T |
23893 |
caagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacgtcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacat |
23794 |
T |
 |
| Q |
200 |
tt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgt |
298 |
Q |
| |
|
|| ||||| | || || ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||| | || ||||| || |||||| | |
|
|
| T |
23793 |
ttagagcacaatt-cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttctccaacaacaattcaattatcaaaaatttcatgtatacaaacatat |
23695 |
T |
 |
| Q |
299 |
catcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa-aagtga |
396 |
Q |
| |
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|
|
| T |
23694 |
caccataattaaagcacgaatttcaacaactatgaacaaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaatca |
23596 |
T |
 |
| Q |
397 |
ttatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
429 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23595 |
ttatgattgaattctaacccccttatcttaatta |
23562 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Name: scaffold0303
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Target: scaffold0303; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 301 - 149
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57 |
acaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatca |
155 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
301 |
acaacaacttatttcacaacaataaattatgaatcatgcatactcaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatttattgatca |
202 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
201 |
tgaaacttatcataattcatcaattattatgcataattcaccaattgagcata |
149 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
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Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1611 - 1440
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256 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
355 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
1611 |
aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaat |
1513 |
T |
 |
| Q |
356 |
taagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1512 |
taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttacctta |
1440 |
T |
 |
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Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 8756 - 8585
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| Q |
256 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
355 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
8756 |
aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaat |
8658 |
T |
 |
| Q |
356 |
taagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8657 |
taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttacctta |
8585 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0389 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:
Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 425
Target Start/End: Original strand, 10644 - 11014
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57 |
acaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatca |
155 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
10644 |
acaacaattcatttttcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatgatcaacaacaacatcacttagcaaaaacaacatcaattgaaca |
10743 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttct-catactttgaacatgtaattcaa |
253 |
Q |
| |
|
|| || |||| ||||| |||||||| |||||| || |||||| |||||| || || | || || ||| | ||||||||||||||| || | |
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|
| T |
10744 |
tggttctcatcataattcgacaacaacgtatcataatccaaccaattaagcataatt-cacaagttaaca-cttatacatactttgaacatgcaaattct |
10841 |
T |
 |
| Q |
254 |
ctaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcca |
353 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
10842 |
ccgacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaattataacatctatgaacaattaat-tatttatcca |
10940 |
T |
 |
| Q |
354 |
attaagcactta-tcatacaaataattgaaaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10941 |
attaatcacttattcatac-aataattgaaaattatactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11014 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0020 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:
Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
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Target Start/End: Original strand, 107967 - 108208
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| Q |
32 |
atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgaca |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||| | |||||||| |||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
107967 |
atcaacccatttttaaaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcaaaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatatct |
108066 |
T |
 |
| Q |
131 |
tatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttc |
229 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || ||||||| |||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
108067 |
taacaacaacaacatcaattaaacatgatcttcatcacaattcaacaataacaa-gcataattcaacatttagagcata-attcataatataccattttc |
108164 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc |
273 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
108165 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
108208 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0521 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:
Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
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Target Start/End: Original strand, 11067 - 11326
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48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
146 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
11067 |
aaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatctatgaacacctaagccatgaatcataaacaacaacatcacatagcaacaacaacatc |
11166 |
T |
 |
| Q |
147 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
245 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || |||| ||||||||||||| | ||||| ||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
11167 |
aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaagatagcatatttcaactatttgagcata-attcaacatatatcactttcacacactttgaacatg |
11265 |
T |
 |
| Q |
246 |
taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
306 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11266 |
aaatttcacaaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataa |
11326 |
T |
 |
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Target: scaffold0409 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:
Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
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Target Start/End: Complemental strand, 1438 - 1242
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231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||| || || || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
1438 |
catactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatcta |
1339 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1338 |
tgaacaattaatcattt-atccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
1242 |
T |
 |
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Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9693 - 9497
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| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||| || || || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
9693 |
catactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatcta |
9594 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9593 |
tgaacaattaatcattt-atccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
9497 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0970 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:
Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
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Target Start/End: Original strand, 2411 - 2564
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| Q |
32 |
atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | | |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| || |
|
|
| T |
2411 |
atcaacctattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaataaggaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcac |
2510 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
2511 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca |
2564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
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| Q |
256 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
355 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || ||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
89929 |
aacaacaattcaagtatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttaa-catctatgaacaattaatcaatt-atccaat |
89832 |
T |
 |
| Q |
356 |
taagcacttat-catacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89831 |
taatcacttattcatacaa-taattgaaaattacactaaaaagattatgatgaattctaacccccttacctta |
89760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0058 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:
Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
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Target Start/End: Complemental strand, 70569 - 70418
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| Q |
59 |
aacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatg |
157 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
70569 |
aacaacccatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccaagaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatg |
70470 |
T |
 |
| Q |
158 |
aaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattca-ccaattgagcata |
208 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
70469 |
gtcctcatcataattcaacaacaatataacataattcacccaattgagcata |
70418 |
T |
 |
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Target: scaffold0058; HSP #2
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| Q |
329 |
tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt--acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70298 |
tatgaacaattaatcaatt-atacatttaatcacttattcatacaa-taattgaaaatttcacaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
70201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Name: scaffold0231
Description:
Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
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| Q |
8 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaact |
65 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
13048 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaccatcaacaacaact |
12990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0165 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:
Target: scaffold0165; HSP #1
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acaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatca |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| ||||| | || || |||||||| ||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | || |
|
|
| T |
21981 |
acaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatacatacccaagctgtgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaaca |
22080 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaac |
254 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||| | |||| |||||||| ||| |||||| |||||||| |||| || |
|
|
| T |
22081 |
tgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcccaattcaacatttagagcaca-attcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttcac |
22179 |
T |
 |
| Q |
255 |
taacaacaattcaattatc |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22180 |
caacaacaattcaattatc |
22198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 273
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30163
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| Q |
57 |
acaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatca |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| ||||| | || | |||||||| |||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | || |
|
|
| T |
29946 |
acaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatacgtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcgcttaacaacaacaacatcaattaaaca |
30045 |
T |
 |
| Q |
156 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaac |
254 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||| ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| || |
|
|
| T |
30046 |
tgattctcatcacaattcaacaaaaacatagcacaattcaacaattagagca-aaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcac |
30144 |
T |
 |
| Q |
255 |
taacaacaattcaattatc |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30145 |
ctacaacaattcaattatc |
30163 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0670 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
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Target: scaffold0670; HSP #1
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32 |
atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| || || || |||||| | ||| | |||||||| |||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
7966 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
7867 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaactt |
228 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||| ||||| || || |
|
|
| T |
7866 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcaca-attcacaatatatcatttt |
7768 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc |
273 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7767 |
cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
7723 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
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Target: scaffold0138; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 22516 - 22323
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234 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| | ||| || |||||||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
22516 |
actttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcctagttagagcacgaattttaacatctatga |
22417 |
T |
 |
| Q |
334 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatta---caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22416 |
acaatcaatcaat-catccaattaatcacttattcatacaa-taattaaaaaataacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22323 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0125; HSP #1
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| Q |
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tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaa |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41658 |
tcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaa |
41756 |
T |
 |
| Q |
182 |
caatgcataattcaccaattga |
203 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41757 |
catagcaaaattcaccaattga |
41778 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0132; HSP #1
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| Q |
82 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaa |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13516 |
tcatgaat-atgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaa |
13614 |
T |
 |
| Q |
182 |
caatgcataattcaccaattgagca |
206 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13615 |
catagcaaaattcatcaattgagca |
13639 |
T |
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5 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttta |
45 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12694 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcactatcaacccatttta |
12734 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0387; HSP #1
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| Q |
231 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
330 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||| ||||||||| | || || |
|
|
| T |
1052 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagaacacgaattttaacaacta |
953 |
T |
 |
| Q |
331 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
425 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| || || |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
952 |
tgaacaaataatcactt-atttaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttacctta |
855 |
T |
 |
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5 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaccca |
40 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3427 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaccca |
3392 |
T |
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58 |
caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
3387 |
caacaactcatttcacaataaaaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaacat |
3318 |
T |
 |
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Target: scaffold1734; HSP #1
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| Q |
40 |
attttacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaa |
97 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1364 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaa |
1422 |
T |
 |
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Target: scaffold0244; HSP #1
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48 |
aaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatc |
118 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
22786 |
aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatc |
22715 |
T |
 |
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Target: scaffold0367 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
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Target: scaffold0367; HSP #1
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100 |
caagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||| || | || | | ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
17542 |
caagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaccacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaa |
17443 |
T |
 |
| Q |
200 |
ttgagcatattttca |
214 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||| |
|
|
| T |
17442 |
ttaagcataatttca |
17428 |
T |
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Target: scaffold0253; HSP #1
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atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| || | |||||||| | ||| ||||||||||||||| || | |||||| || | |
|
|
| T |
7358 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatctc |
7457 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaaca |
180 |
Q |
| |
|
|| ||| | ||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7458 |
ttagcaacaccaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaaca |
7508 |
T |
 |
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Target: scaffold0253; HSP #2
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32 |
atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| || | |||||||| | ||| ||||||||||||||| || | |||||| || | |
|
|
| T |
16783 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatctc |
16882 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaaca |
180 |
Q |
| |
|
|| ||| | ||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16883 |
ttagcaacaccaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaaca |
16933 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
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Target: scaffold0023; HSP #1
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100 |
caagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||| || | || | | ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
61455 |
caagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaccacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaa |
61356 |
T |
 |
| Q |
200 |
ttgagcatattttca |
214 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||| |
|
|
| T |
61355 |
ttaagcataatttca |
61341 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0335 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
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36 |
acccattt-tacaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatc |
134 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||| || | ||||||||| | | | |
|
|
| T |
5875 |
acccatttatacaaaacaaccaacaacatctcatttctcaccaacaatcatgacatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatttctcagc |
5776 |
T |
 |
| Q |
135 |
aaaaacaacatcaattga |
152 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
5775 |
aacaacaacatcaattga |
5758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0151 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
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32 |
atcaacccatttt-acaaaaccaccgacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| || | |||||| | ||||| | |||||| | |||||| ||| |||||| || | |
|
|
| T |
22713 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcataattcatgaacacccaaactatgaatcttcaacaacaatatcaa |
22614 |
T |
 |
| Q |
130 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
183 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | ||||| | ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22613 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattcacatctcaattcaacaacaaca |
22560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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138 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagca |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51380 |
aacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcatcaaccacataacataattcaccaattgagca |
51312 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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