View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4076_low_11 (Length: 249)

Name: NF4076_low_11
Description: NF4076
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4076_low_11
NF4076_low_11
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (97-237)||(12143072-12143213)
chr1 (97-237)||(7553016-7553157)
chr1 (97-237)||(23767414-23767555)
chr1 (97-237)||(19315640-19315781)
chr1 (97-237)||(38473626-38473767)
chr1 (97-237)||(41106016-41106157)
chr1 (97-237)||(46825531-46825672)
chr1 (97-237)||(7651662-7651803)
chr1 (97-237)||(28425363-28425504)
chr1 (97-233)||(49094711-49094848)
chr1 (98-237)||(19274559-19274699)
chr1 (97-237)||(36157678-36157818)
chr1 (97-235)||(25988271-25988410)
chr1 (97-235)||(49814302-49814441)
chr1 (97-233)||(45350717-45350852)
chr1 (97-237)||(33325727-33325868)
chr1 (97-237)||(50689943-50690084)
chr1 (97-237)||(16705870-16706011)
chr1 (97-237)||(26549388-26549529)
chr1 (97-237)||(33674017-33674158)
chr1 (97-237)||(46051450-46051591)
chr1 (97-237)||(48802331-48802472)
chr1 (97-235)||(36781172-36781311)
chr1 (97-233)||(9878784-9878921)
chr1 (97-237)||(23228194-23228335)
chr1 (97-233)||(26069896-26070033)
chr1 (97-237)||(52146993-52147134)
chr1 (133-237)||(12964646-12964750)
chr1 (118-233)||(48319067-48319183)
chr1 (98-237)||(50533383-50533523)
chr1 (97-233)||(45670486-45670623)
chr1 (100-237)||(24204474-24204612)
chr1 (97-237)||(7608766-7608907)
chr1 (97-233)||(9962755-9962892)
chr1 (97-237)||(18892329-18892470)
chr1 (97-237)||(43396675-43396816)
chr1 (97-233)||(48669396-48669533)
chr1 (97-237)||(52349924-52350065)
chr1 (98-237)||(18917524-18917664)
chr1 (99-233)||(41982237-41982372)
chr1 (132-233)||(9974846-9974947)
chr1 (97-237)||(17983898-17984039)
chr1 (97-233)||(37216900-37217037)
chr1 (97-237)||(46095075-46095216)
chr1 (97-232)||(5400876-5401011)
chr1 (97-237)||(6711440-6711581)
chr1 (97-233)||(8141486-8141623)
chr1 (97-233)||(21965069-21965206)
chr1 (132-237)||(33194687-33194792)
chr1 (97-233)||(34971084-34971221)
chr1 (136-237)||(52067691-52067792)
chr1 (97-233)||(25800648-25800782)
chr1 (97-232)||(33714361-33714495)
chr1 (97-233)||(18782089-18782226)
chr1 (97-237)||(40721342-40721484)
chr1 (132-233)||(16506824-16506925)
chr1 (132-237)||(30281631-30281736)
chr1 (97-232)||(21929526-21929667)
chr1 (159-237)||(50099220-50099298)
chr1 (189-237)||(44979281-44979329)
chr1 (193-237)||(32373650-32373694)
chr1 (97-197)||(44978768-44978868)
chr1 (193-235)||(17989864-17989906)
chr1 (207-237)||(49973942-49973972)
chr1 (2-31)||(36781077-36781106)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (97-237)||(35600122-35600263)
chr7 (97-237)||(47281124-47281265)
chr7 (97-237)||(47294291-47294432)
chr7 (98-237)||(44544409-44544549)
chr7 (97-237)||(1469493-1469634)
chr7 (97-237)||(27364339-27364480)
chr7 (97-237)||(47271981-47272122)
chr7 (98-237)||(47219145-47219285)
chr7 (97-237)||(30798368-30798509)
chr7 (97-237)||(31684134-31684275)
chr7 (97-237)||(38427563-38427704)
chr7 (97-237)||(48628805-48628946)
chr7 (98-233)||(33884323-33884459)
chr7 (97-237)||(8162712-8162853)
chr7 (97-237)||(11476556-11476697)
chr7 (97-237)||(23842305-23842446)
chr7 (97-237)||(30876259-30876400)
chr7 (97-233)||(37393998-37394135)
chr7 (97-237)||(40851274-40851415)
chr7 (97-237)||(41139408-41139553)
chr7 (97-237)||(45723491-45723632)
chr7 (97-237)||(43752776-43752917)
chr7 (97-224)||(2960640-2960768)
chr7 (97-237)||(30971941-30972082)
chr7 (97-237)||(41113377-41113518)
chr7 (97-237)||(42979338-42979479)
chr7 (97-237)||(43968259-43968400)
chr7 (97-233)||(44800410-44800547)
chr7 (97-237)||(47119991-47120134)
chr7 (102-233)||(4923220-4923352)
chr7 (132-237)||(3797559-3797664)
chr7 (97-233)||(11050261-11050398)
chr7 (140-237)||(47579131-47579228)
chr7 (97-232)||(7336065-7336200)
chr7 (97-214)||(221298-221416)
chr7 (132-233)||(37354299-37354400)
chr7 (144-237)||(40520918-40521011)
chr7 (98-237)||(29248342-29248482)
chr7 (132-237)||(27774108-27774213)
chr7 (97-233)||(18353148-18353285)
chr7 (177-237)||(39034062-39034122)
chr7 (194-237)||(43025112-43025155)
chr7 (188-237)||(29739781-29739829)
chr7 (186-225)||(12583313-12583352)
chr7 (97-149)||(42888937-42888990)
chr7 (3-31)||(7335876-7335904)
chr7 (193-237)||(29739670-29739713)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (97-237)||(6739955-6740096)
chr5 (97-237)||(3352002-3352143)
chr5 (97-233)||(14717609-14717746)
chr5 (97-237)||(27457197-27457338)
chr5 (97-237)||(31710282-31710423)
chr5 (97-237)||(40074950-40075091)
chr5 (97-235)||(39002025-39002164)
chr5 (97-237)||(8215900-8216041)
chr5 (97-237)||(30297749-30297890)
chr5 (97-237)||(38964114-38964254)
chr5 (97-237)||(39824556-39824697)
chr5 (98-237)||(30863253-30863393)
chr5 (97-237)||(4015874-4016015)
chr5 (97-237)||(8689572-8689713)
chr5 (97-237)||(11000728-11000869)
chr5 (97-233)||(14952328-14952465)
chr5 (97-237)||(16095960-16096100)
chr5 (97-237)||(20079258-20079399)
chr5 (97-245)||(23128913-23129062)
chr5 (97-237)||(26593280-26593421)
chr5 (97-237)||(33760470-33760611)
chr5 (97-237)||(35342180-35342321)
chr5 (97-237)||(42993518-42993659)
chr5 (98-237)||(41282342-41282482)
chr5 (97-237)||(6251972-6252113)
chr5 (97-233)||(6600136-6600273)
chr5 (97-237)||(11692147-11692288)
chr5 (97-237)||(19659501-19659642)
chr5 (97-237)||(30208402-30208543)
chr5 (97-237)||(43166269-43166410)
chr5 (135-237)||(6331377-6331479)
chr5 (97-233)||(20408537-20408674)
chr5 (132-237)||(26035382-26035487)
chr5 (118-237)||(16752116-16752236)
chr5 (97-229)||(1052541-1052674)
chr5 (97-237)||(28078405-28078546)
chr5 (97-233)||(27116099-27116236)
chr5 (97-233)||(11935450-11935586)
chr5 (97-233)||(19398193-19398330)
chr5 (132-229)||(444962-445059)
chr5 (97-237)||(8694866-8695007)
chr5 (97-237)||(27509978-27510112)
chr5 (2-31)||(28078310-28078339)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (97-237)||(33151696-33151837)
chr3 (97-233)||(35346471-35346608)
chr3 (97-237)||(21564496-21564637)
chr3 (97-237)||(21656518-21656659)
chr3 (97-237)||(1017044-1017185)
chr3 (97-233)||(1687655-1687792)
chr3 (97-237)||(20813441-20813582)
chr3 (97-237)||(38446476-38446617)
chr3 (97-232)||(42016878-42017014)
chr3 (103-237)||(22851996-22852131)
chr3 (97-237)||(20760071-20760212)
chr3 (97-237)||(26455582-26455723)
chr3 (97-237)||(31122662-31122803)
chr3 (97-237)||(51562162-51562303)
chr3 (97-232)||(21890175-21890311)
chr3 (132-237)||(19268521-19268626)
chr3 (97-237)||(20086314-20086455)
chr3 (97-237)||(36314972-36315113)
chr3 (97-237)||(41250886-41251027)
chr3 (97-237)||(47329175-47329316)
chr3 (97-233)||(50287570-50287707)
chr3 (97-233)||(10618480-10618617)
chr3 (97-237)||(37247956-37248097)
chr3 (97-237)||(42107099-42107240)
chr3 (97-237)||(53196014-53196155)
chr3 (132-237)||(53926015-53926120)
chr3 (102-237)||(19664541-19664677)
chr3 (98-237)||(29677476-29677616)
chr3 (132-237)||(1448768-1448873)
chr3 (105-237)||(12748391-12748524)
chr3 (132-233)||(32650856-32650957)
chr3 (97-233)||(40922165-40922302)
chr3 (97-237)||(44798268-44798408)
chr3 (97-237)||(52821049-52821190)
chr3 (97-235)||(3697148-3697287)
chr3 (97-235)||(20913754-20913893)
chr3 (97-235)||(20921872-20922011)
chr3 (97-237)||(27070739-27070880)
chr3 (97-237)||(35608131-35608272)
chr3 (97-237)||(48651248-48651389)
chr3 (118-237)||(50364908-50365028)
chr3 (132-235)||(50977866-50977969)
chr3 (132-235)||(51080998-51081101)
chr3 (132-233)||(51475282-51475383)
chr3 (97-237)||(55164115-55164256)
chr3 (137-237)||(28699685-28699785)
chr3 (97-237)||(33473239-33473380)
chr3 (97-237)||(39069726-39069867)
chr3 (97-237)||(45380260-45380401)
chr3 (160-237)||(44152700-44152777)
chr3 (172-237)||(47473230-47473295)
chr3 (132-235)||(34019462-34019565)
chr3 (97-222)||(38923998-38924124)
chr3 (132-206)||(42641214-42641288)
chr3 (2-31)||(28775383-28775412)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (97-235)||(2390267-2390406)
chr6 (98-237)||(6503718-6503858)
chr6 (97-237)||(3408189-3408330)
chr6 (97-237)||(1915343-1915484)
chr6 (97-237)||(2707459-2707600)
chr6 (97-237)||(9382519-9382660)
chr6 (97-237)||(10256237-10256378)
chr6 (97-237)||(12626636-12626777)
chr6 (97-233)||(17428272-17428409)
chr6 (97-237)||(26230932-26231073)
chr6 (97-237)||(8178249-8178390)
chr6 (97-233)||(26393009-26393146)
chr6 (97-237)||(29050272-29050413)
chr6 (97-233)||(30379021-30379158)
chr6 (97-233)||(17943040-17943177)
chr6 (132-233)||(16193314-16193415)
chr6 (97-237)||(3258807-3258948)
chr6 (97-226)||(2598099-2598229)
chr6 (97-237)||(11133873-11134015)
chr6 (97-233)||(1077241-1077378)
chr6 (132-237)||(26936607-26936712)
chr6 (97-233)||(26196321-26196458)
chr6 (132-222)||(35223935-35224025)
chr6 (97-237)||(6785101-6785239)
chr6 (136-233)||(10931187-10931288)
chr6 (98-233)||(25820550-25820686)
chr6 (97-183)||(31375971-31376058)
chr6 (97-154)||(12612971-12613029)
chr6 (2-31)||(2390110-2390139)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (97-237)||(2533272-2533413)
chr8 (97-237)||(3875908-3876049)
chr8 (97-233)||(37933646-37933783)
chr8 (97-232)||(15847117-15847253)
chr8 (97-235)||(35884430-35884569)
chr8 (97-237)||(513308-513448)
chr8 (97-237)||(1293486-1293627)
chr8 (97-237)||(28707446-28707587)
chr8 (97-237)||(36400070-36400211)
chr8 (97-233)||(38107103-38107240)
chr8 (97-237)||(43806533-43806674)
chr8 (97-237)||(22683988-22684129)
chr8 (97-237)||(35443311-35443452)
chr8 (97-233)||(259982-260118)
chr8 (97-233)||(655803-655939)
chr8 (97-233)||(841538-841674)
chr8 (97-237)||(9056338-9056479)
chr8 (118-237)||(7434886-7435006)
chr8 (97-233)||(440844-440981)
chr8 (97-237)||(28496355-28496495)
chr8 (97-237)||(38633710-38633851)
chr8 (97-237)||(23972295-23972437)
chr8 (97-233)||(38208756-38208894)
chr8 (97-222)||(41536527-41536653)
chr8 (132-237)||(12010549-12010654)
chr8 (97-237)||(13797089-13797229)
chr8 (132-237)||(23935233-23935338)
chr8 (97-237)||(33651841-33651982)
chr8 (97-233)||(40301893-40302030)
chr8 (102-237)||(39513344-39513480)
chr8 (97-237)||(24430571-24430712)
chr8 (118-237)||(29485287-29485406)
chr8 (132-235)||(6016207-6016310)
chr8 (97-237)||(42988227-42988367)
chr8 (97-233)||(4649154-4649291)
chr8 (97-233)||(36218781-36218917)
chr8 (159-237)||(24193356-24193433)
chr8 (98-161)||(24193131-24193195)
chr8 (173-231)||(8137180-8137238)
chr8 (3-31)||(13797295-13797323)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (97-237)||(4544985-4545126)
chr4 (97-237)||(33807780-33807921)
chr4 (97-237)||(42273802-42273943)
chr4 (97-246)||(11795154-11795304)
chr4 (97-237)||(28264643-28264784)
chr4 (97-237)||(55517185-55517326)
chr4 (97-235)||(24458631-24458770)
chr4 (97-235)||(26017425-26017564)
chr4 (97-237)||(12196469-12196610)
chr4 (97-237)||(19496102-19496243)
chr4 (97-233)||(23135006-23135143)
chr4 (97-237)||(28159953-28160094)
chr4 (97-237)||(31591076-31591216)
chr4 (97-237)||(31973591-31973732)
chr4 (97-233)||(32317957-32318094)
chr4 (97-233)||(48551764-48551901)
chr4 (97-237)||(48707733-48707874)
chr4 (98-237)||(40988633-40988773)
chr4 (97-232)||(49118616-49118752)
chr4 (97-235)||(2055280-2055419)
chr4 (98-236)||(33174021-33174160)
chr4 (97-234)||(48149502-48149640)
chr4 (97-237)||(5227390-5227531)
chr4 (97-237)||(15985010-15985151)
chr4 (97-237)||(28812287-28812427)
chr4 (97-232)||(44490324-44490460)
chr4 (97-235)||(8882013-8882152)
chr4 (97-237)||(9339123-9339267)
chr4 (97-237)||(14564796-14564937)
chr4 (97-237)||(17847096-17847236)
chr4 (97-237)||(35930040-35930180)
chr4 (97-237)||(39995167-39995308)
chr4 (97-237)||(50542354-50542495)
chr4 (98-237)||(32118714-32118854)
chr4 (99-237)||(10588580-10588719)
chr4 (97-237)||(17993017-17993158)
chr4 (132-237)||(24623148-24623253)
chr4 (97-233)||(25734223-25734360)
chr4 (97-233)||(30467003-30467140)
chr4 (97-237)||(39700045-39700186)
chr4 (98-235)||(37381848-37381986)
chr4 (132-237)||(19168831-19168936)
chr4 (97-233)||(23553069-23553205)
chr4 (97-237)||(30141108-30141249)
chr4 (97-237)||(33693333-33693474)
chr4 (97-235)||(50276138-50276274)
chr4 (97-237)||(51371047-51371188)
chr4 (97-233)||(25730244-25730381)
chr4 (97-237)||(31208748-31208885)
chr4 (118-237)||(42549643-42549762)
chr4 (97-237)||(22298517-22298659)
chr4 (156-237)||(56555200-56555281)
chr4 (97-177)||(20534225-20534306)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (97-237)||(16246193-16246334)
chr2 (97-237)||(27328584-27328725)
chr2 (97-237)||(33865267-33865408)
chr2 (97-237)||(921022-921163)
chr2 (97-233)||(25087796-25087933)
chr2 (97-237)||(28650426-28650567)
chr2 (97-237)||(40854609-40854750)
chr2 (97-237)||(41500502-41500643)
chr2 (103-237)||(771981-772116)
chr2 (97-246)||(9276565-9276715)
chr2 (97-237)||(7378963-7379104)
chr2 (97-237)||(11949426-11949567)
chr2 (97-237)||(33106969-33107110)
chr2 (97-237)||(34253142-34253283)
chr2 (97-234)||(2056929-2057067)
chr2 (97-237)||(2456010-2456151)
chr2 (97-237)||(12759750-12759890)
chr2 (97-233)||(37838301-37838438)
chr2 (98-237)||(17134229-17134369)
chr2 (97-235)||(7297234-7297373)
chr2 (97-237)||(1106559-1106700)
chr2 (97-237)||(2094410-2094551)
chr2 (132-237)||(8396587-8396692)
chr2 (97-237)||(19180422-19180562)
chr2 (97-237)||(37732193-37732334)
chr2 (102-237)||(36211046-36211182)
chr2 (98-237)||(36444229-36444369)
chr2 (98-237)||(38751048-38751188)
chr2 (97-235)||(2314975-2315114)
chr2 (104-237)||(3430631-3430765)
chr2 (97-237)||(8899682-8899822)
chr2 (132-237)||(43249448-43249553)
chr2 (97-236)||(45124120-45124260)
chr2 (97-233)||(17484550-17484687)
chr2 (97-237)||(29737748-29737889)
chr2 (136-237)||(41178059-41178160)
chr2 (97-237)||(42629962-42630103)
chr2 (132-233)||(37654112-37654213)
chr2 (132-237)||(19916023-19916128)
chr2 (97-188)||(14630663-14630755)
chr2 (97-236)||(9331757-9331897)
chr2 (97-186)||(23671811-23671901)
chr2 (181-237)||(23672958-23673014)
chr2 (3-31)||(31214113-31214141)
chr2 (3-31)||(42630169-42630197)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (97-237)||(114-255)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (97-237)||(218885-219027)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (97-233)||(5027-5164)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (97-232)||(47967-48103)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (97-237)||(252438-252579)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (97-233)||(5190-5326)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (132-237)||(2009-2114)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (132-233)||(11362-11463)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (97-233)||(13099-13236)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (97-233)||(59608-59745)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (184-237)||(289-342)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (187-237)||(19781-19831)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (97-177)||(599-680)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (97-177)||(1913-1994)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (132-177)||(3407-3452)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (97-177)||(1877-1958)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12143213 - 12143072
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12143213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 12143114  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12143113 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12143072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 7553016 - 7553157
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7553016 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7553115  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7553116 ttagtcatctttttagccatgacaaatggtggataatgctct 7553157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 23767414 - 23767555
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23767414 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 23767513  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767514 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 23767555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19315781 - 19315640
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  19315781 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 19315682  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19315681 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 19315640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 38473626 - 38473767
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38473626 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 38473725  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473726 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38473767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41106157 - 41106016
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  41106157 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 41106058  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41106057 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 41106016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 46825672 - 46825531
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  46825672 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 46825573  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825572 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 46825531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7651803 - 7651662
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7651803 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttgataattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7651704  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7651703 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7651662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 28425363 - 28425504
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  28425363 gaatcgtttcaaacaagtcctattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 28425462  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425463 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28425504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 49094711 - 49094848
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  49094711 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 49094810  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49094811 ttagtcatctttttaggcataacaaatggtggataatg 49094848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19274699 - 19274559
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19274699 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagctggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 19274600  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19274599 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 19274559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 36157678 - 36157818
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatgttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36157678 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 36157777  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36157778 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36157818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Original strand, 25988271 - 25988410
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  25988271 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 25988370  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25988371 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 25988410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 49814441 - 49814302
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||| || || |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  49814441 gaatcgtttcaaataagtcatattctagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 49814342  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49814341 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 49814302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 45350717 - 45350852
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  45350717 gaatcgtttcaaacaa--cctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgatctcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 45350814  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45350815 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 45350852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33325868 - 33325727
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  33325868 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttggtatcaaatctggcttctaagacccacttaaaa 33325769  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33325768 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33325727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50690084 - 50689943
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  50690084 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 50689985  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  50689984 ttagtcatctttttaggcatagcaaatgatggataatgctct 50689943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16706011 - 16705870
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  16706011 gaatcgtttcaaacaagtcttattttagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcgcctaaaacccacttaaaa 16705912  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16705911 ttagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatgctct 16705870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26549529 - 26549388
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26549529 gaatcgttttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 26549430  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26549429 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 26549388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33674158 - 33674017
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33674158 gaatcgtgtcaaacaagtcctattgtagatagcatagctggtaattgcttccttgaactcatctttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33674059  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33674058 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 33674017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 46051591 - 46051450
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  46051591 gaatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 46051492  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46051491 ctagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 46051450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 48802331 - 48802472
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48802331 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacctacttaaaa 48802430  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48802431 ttagtcatctttgtaggcatgataaatggtggataatgctct 48802472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Original strand, 36781172 - 36781311
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36781172 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 36781271  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  36781272 ttagtcgtctttttgggcatggcaaatggtggataatgct 36781311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 9878784 - 9878921
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||  || |||||||||||||||||||    
T  9878784 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccatatcgggttcctaacacccacttaaaa 9878883  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9878884 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 9878921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 23228194 - 23228335
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||    
T  23228194 gaatcgtttcaaacaagtactattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccatttaaaa 23228293  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23228294 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 23228335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26070033 - 26069896
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26070033 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatttttggtatcaaatccggctcctaacacccacttaaaa 26069934  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26069933 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26069896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 52147134 - 52146993
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  52147134 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtatatagcatagtttgtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaa 52147035  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52147034 ttattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 52146993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 133 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12964750 - 12964646
Alignment:
Q  133 ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12964750 ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatgttgtataat 12964651  T
Q  233 gctct 237  Q
    |||||    
T  12964650 gctct 12964646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 233
Target Start/End: Original strand, 48319067 - 48319183
Alignment:
Q  118 attgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 216  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  48319067 attgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatt 48319166  T
Q  217 acaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  48319167 acaaatggtggataatg 48319183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50533523 - 50533383
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    ||||||||||||||| || |||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50533523 aatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaat 50533424  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  50533423 tagtcatctttttaggcatgtcaaattttggataatgctct 50533383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 45670486 - 45670623
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg--ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaa 194  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||    
T  45670486 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacc-acttaaa 45670584  T
Q  195 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45670585 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 45670623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 237
Target Start/End: Original strand, 24204474 - 24204612
Alignment:
Q  100 tcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaatta 198  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  24204474 tcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaatga 24204573  T
Q  199 gtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24204574 gtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgctct 24204612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 7608766 - 7608907
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  7608766 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatcttttgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 7608865  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608866 ttagtcatgtttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7608907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9962892 - 9962755
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||    
T  9962892 gaatcgtttcaaacaagttctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagttcctaacacccacttaaaa 9962793  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9962792 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 9962755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18892470 - 18892329
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18892470 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccactgaaaa 18892371  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18892370 ttagtcatccttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 18892329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43396816 - 43396675
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43396816 gaatcgtttcaaacaaatcctactgtagatagcagagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 43396717  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  43396716 ttagtcatctttttaagcatagcaaatgatggataatgctct 43396675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 48669396 - 48669533
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  48669396 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtgattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 48669495  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  48669496 ttagtcatctttttaggcatgacaaataatggataatg 48669533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 52349924 - 52350065
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  52349924 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaa 52350023  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52350024 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 52350065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18917664 - 18917524
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatgttgg-taattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18917664 aatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcatatttaataattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaat 18917565  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18917564 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataattctct 18917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Original strand, 41982237 - 41982372
Alignment:
Q  99 atcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaatt 197  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  41982237 atcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccatttaaaatt 41982336  T
Q  198 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41982337 agtcatatttttaggcatgacaaatggtggataatg 41982372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9974947 - 9974846
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9974947 gttggtaattgcttccttgaactcatttttggtactaaatatggctcgtaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataa 9974848  T
Q  232 tg 233  Q
    ||    
T  9974847 tg 9974846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 17983898 - 17984039
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||| ||| || || |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||    
T  17983898 gaatcgtttcaaccaagtcctaatgtaaataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgattcataacacccacttaaaa 17983997  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17983998 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 17984039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37217037 - 37216900
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | | |||| ||||||||||||||||    
T  37217037 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaactctagctcataacacccacttaaaa 37216938  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37216937 ttagtcatctttttagacatggcaaatggtggataatg 37216900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 46095075 - 46095216
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  46095075 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttgatatcaaatctgtctcctaacatccacttaaaa 46095174  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  46095175 ttagtcatctttttaaacatgacaaatggtggataatgctct 46095216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5401011 - 5400876
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  5401011 gaatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggtttctaacatccacttaaaa 5400912  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5400911 ttagtcatctttttaggcatg-caaatggtggataat 5400876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6711581 - 6711440
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| | |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6711581 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagacattatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 6711482  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  6711481 ttagccatctttttacacatggtaaatggtggataatgctct 6711440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 8141486 - 8141623
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||  || ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| || ||  ||||||||||||||||    
T  8141486 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataatttgtaattgcttctttgaactcatctttagtaccaaatctgacttgtaacacccacttaaaa 8141585  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8141586 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 8141623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21965206 - 21965069
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| || ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  21965206 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattaaactcatctttggtaccaaatctgactccttacacccacttaaaa 21965107  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21965106 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtgtataatg 21965069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Original strand, 33194687 - 33194792
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  33194687 gttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatggcgaatggtggttaa 33194786  T
Q  232 tgctct 237  Q
    ||||||    
T  33194787 tgctct 33194792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34971221 - 34971084
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||| || |||||||||| |||||||||    
T  34971221 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgtttctttgaactcatatttggtatcaaatctgactcctaacactcacttaaaa 34971122  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34971121 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 34971084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 237
Target Start/End: Original strand, 52067691 - 52067792
Alignment:
Q  136 gtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52067691 gtaattgcttccttgaactcatcgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattattcatctttttagggatgacaaatggtggataatgct 52067790  T
Q  236 ct 237  Q
    ||    
T  52067791 ct 52067792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25800782 - 25800648
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatgttggtaattgcttccttgaactcatc----tttggtacaaaatatggctcctaacacccactta 192  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||      || |||||||||||||    
T  25800782 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatgttggtaattgcttccttgaactcatcttaatttggtaccaaa------tcttaacacccactta 25800689  T
Q  193 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25800688 aaattagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 25800648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Original strand, 33714361 - 33714495
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |     
T  33714361 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagataacatagttgataattgtttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacacc-acttaca- 33714458  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33714459 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 33714495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 18782089 - 18782226
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||| |||||||||| || |||| || ||| ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||    
T  18782089 gaatcatttcaaacaagtcatattctagatagcatagttgataattgcttatttgaactcatctttggtacaaaatctggttcatagcacccacttaaaa 18782188  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18782189 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 18782226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40721484 - 40721342
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacaccca-cttaaa 194  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| | ||||    
T  40721484 gaatcgtttccaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgctttcttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaatacccaacctaaa 40721385  T
Q  195 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40721384 attaattatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40721342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Original strand, 16506824 - 16506925
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16506824 gttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagccatctttttaagcatggcaaatggtggataa 16506923  T
Q  232 tg 233  Q
    ||    
T  16506924 tg 16506925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30281736 - 30281631
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30281736 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaataccagttatctttttaggcatgtaaaatggtggataa 30281637  T
Q  232 tgctct 237  Q
    ||||||    
T  30281636 tgctct 30281631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21929667 - 21929526
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatcttt-------ggtacaaaatatggctcctaacaccca 188  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| |||| |||||||||| |||||    
T  21929667 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttcatctttggtaccaaatctggctcctaaaaccca 21929568  T
Q  189 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  21929567 cttaaaattagtcatctttttag--atggcaaatggtggataat 21929526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50099298 - 50099220
Alignment:
Q  159 tttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50099298 tttggtaccaaatatgacttttaacatccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 50099220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 237
Target Start/End: Original strand, 44979281 - 44979329
Alignment:
Q  189 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44979281 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 44979329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 237
Target Start/End: Original strand, 32373650 - 32373694
Alignment:
Q  193 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32373650 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 32373694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 197
Target Start/End: Original strand, 44978768 - 44978868
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  44978768 gaatcgtttcaaacaagtcagaatgtagatagcataattgataattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaata-ccacttaaaa 44978866  T
Q  196 tt 197  Q
    ||    
T  44978867 tt 44978868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Original strand, 17989864 - 17989906
Alignment:
Q  193 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17989864 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtgaataatgct 17989906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 49973972 - 49973942
Alignment:
Q  207 tttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49973972 tttaggcatgacaaatggtggataatgctct 49973942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 31
Target Start/End: Original strand, 36781077 - 36781106
Alignment:
Q  2 taggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 31  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36781077 taggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 36781106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 35600122 - 35600263
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600122 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaa 35600221  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600222 ttagttatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 35600263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 47281124 - 47281265
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47281124 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 47281223  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281224 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47281265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 47294291 - 47294432
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  47294291 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatcgttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttataa 47294390  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47294391 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47294432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44544549 - 44544409
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44544549 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaat 44544450  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44544449 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 44544409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 1469493 - 1469634
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1469493 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1469592  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469593 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1469634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 27364339 - 27364480
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27364339 gaatcgtttcaaacagatcctattgtagataacatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 27364438  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27364439 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 27364480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47272122 - 47271981
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47272122 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaa 47272023  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47272022 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatgctct 47271981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47219285 - 47219145
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  47219285 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaat 47219186  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47219185 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47219145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 30798368 - 30798509
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30798368 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 30798467  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  30798468 ttagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatgctct 30798509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 31684134 - 31684275
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31684134 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 31684233  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31684234 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31684275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 38427563 - 38427704
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38427563 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38427662  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38427663 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggcggataatgctct 38427704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 48628946 - 48628805
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  48628946 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcattttttgcaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 48628847  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48628846 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 48628805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33884459 - 33884323
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  33884459 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 33884360  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33884359 tagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 33884323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 8162712 - 8162853
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8162712 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8162811  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8162812 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 8162853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 11476556 - 11476697
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11476556 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11476655  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  11476656 ttagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatgctct 11476697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23842446 - 23842305
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23842446 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttcaaa 23842347  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23842346 ttagtcatctttttaggcatggcagatggtggataatgctct 23842305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30876400 - 30876259
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30876400 gaatcgtttcaaacaagtgctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttggtaccaaattgggctcctaacacccacttaaaa 30876301  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30876300 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30876259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 37393998 - 37394135
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  37393998 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacacccagttaaaa 37394097  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37394098 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 37394135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40851415 - 40851274
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40851415 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaggtagaatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 40851316  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40851315 ttagtcatctttttaggcacgacaaatggtggataatgctct 40851274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 41139408 - 41139553
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-----gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccactt 191  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  41139408 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatatatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccgctt 41139507  T
Q  192 aaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41139508 aaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 41139553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 45723491 - 45723632
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  45723491 gaatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcataattagtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 45723590  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45723591 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 45723632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 43752776 - 43752917
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  43752776 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctgactcctaacatccacttaaaa 43752875  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43752876 ttagtcatcttttgaggcaggacaaatggtggataatgctct 43752917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 224
Target Start/End: Original strand, 2960640 - 2960768
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2960640 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 2960739  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgg 224  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2960740 ttagtcatctttttaggcatggcaaatgg 2960768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 30971941 - 30972082
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30971941 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatggcatagttggtaattacttccttaaacccatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 30972040  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30972041 ttagtcatctttttaagcatgacaaattgtggataatgctct 30972082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41113518 - 41113377
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41113518 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 41113419  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  41113418 ttagtcatctttttagacatggcaaatgatgaataatgctct 41113377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 42979338 - 42979479
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  42979338 gaatcgtttcaaacaagtcctactgtagataacatagttggtaattgcttcgttgaactcatctttgatatcaaatctgactcctaacatccacttaaaa 42979437  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42979438 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 42979479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 43968259 - 43968400
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  43968259 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcgtagttggtaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatttggctcataatacccacttaaaa 43968358  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43968359 ttagtcatctttataggcatgacaaatggtggataatgctct 43968400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 44800410 - 44800547
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  44800410 gaattgtttcaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgtttcattgaactcatctttggtaccaaatatggttcctaacacccacttaaaa 44800509  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  44800510 ttagtcatctttttaggcatgatatatggtggataatg 44800547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47120134 - 47119991
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat---gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaa 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| | | |||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  47120134 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagagagcatatagttggtaattgctttcttgaactcatatttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaa 47120035  T
Q  194 aattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47120034 aattagttatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 47119991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4923352 - 4923220
Alignment:
Q  102 gtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagt 200  Q
    ||||||||||| || ||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4923352 gtttcaaacaagtcctattgtggatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaattagt 4923253  T
Q  201 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4923252 catctttttaggcatggcaaatggtggataatg 4923220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Original strand, 3797559 - 3797664
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3797559 gttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgttaaatggtggataa 3797658  T
Q  232 tgctct 237  Q
    ||||||    
T  3797659 tgctct 3797664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 11050261 - 11050398
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatgtt-ggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||    
T  11050261 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatatttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctgcctcctaatacccacttaaaa 11050360  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11050361 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 11050398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 47579131 - 47579228
Alignment:
Q  140 ttgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47579131 ttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaattaaccatctttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 47579228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7336200 - 7336065
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7336200 gaatcgtttcaaacagttc-tattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatcattgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7336102  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7336101 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataat 7336065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 221416 - 221298
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  221416 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221317  T
Q  196 ttagtcatctttttaggca 214  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  221316 ttagtcttctttttaggca 221298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Original strand, 37354299 - 37354400
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37354299 gttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatttggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 37354398  T
Q  232 tg 233  Q
    ||    
T  37354399 tg 37354400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40521011 - 40520918
Alignment:
Q  144 ttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40521011 ttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttagccatggcaaatggtggataatgctct 40520918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29248482 - 29248342
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    |||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||    
T  29248482 aatcatttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcatcaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 29248383  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  29248382 tagtcatctttttaggcatggcaaattgtggataattctct 29248342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27774213 - 27774108
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27774213 gttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaatcagccatctttttaggcatggcaaatggtggataa 27774114  T
Q  232 tgctct 237  Q
    ||||||    
T  27774113 tgctct 27774108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18353285 - 18353148
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||| ||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| | ||||||    
T  18353285 gaatcgtttcaaacaagtcctaaggtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacacctaattaaaa 18353186  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18353185 ttagtcatctttttagacatgataaatggtggataatg 18353148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39034122 - 39034062
Alignment:
Q  177 tcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39034122 tcctaacgcccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 39034062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43025155 - 43025112
Alignment:
Q  194 aattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43025155 aattagtcatctttttaggcatgacaaatgatggatattgctct 43025112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29739829 - 29739781
Alignment:
Q  188 acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29739829 acttaaaattagtcatctttt-aggcatggtaaatggtggataatgctct 29739781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12583352 - 12583313
Alignment:
Q  186 ccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12583352 ccacttaaaattagtcatctttttacgcatgaaaaatggt 12583313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 42888990 - 42888937
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttcctt 149  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42888990 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcctt 42888937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 7335876 - 7335904
Alignment:
Q  3 aggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7335876 aggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 7335904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29739713 - 29739670
Alignment:
Q  193 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29739713 aaattagtcatctttt-aggcatggtaaatggtggataatgctct 29739670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 6739955 - 6740096
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  6739955 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 6740054  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740055 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 6740096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 3352002 - 3352143
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3352002 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 3352101  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3352102 ttagtcatctttttaggcatgacaaagggtggataatgctct 3352143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14717746 - 14717609
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14717746 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 14717647  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717646 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 14717609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 27457197 - 27457338
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  27457197 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccactttaaa 27457296  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27457297 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 27457338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31710423 - 31710282
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31710423 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaa 31710324  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31710323 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 31710282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40075091 - 40074950
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40075091 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaa 40074992  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40074991 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40074950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Original strand, 39002025 - 39002164
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39002025 gaattgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 39002124  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39002125 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 39002164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8216041 - 8215900
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8216041 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8215942  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8215941 ttagtcatctttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 8215900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 30297749 - 30297890
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30297749 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttcaactcatctttggtaccaaatctggctcctagcacccacttaaaa 30297848  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30297849 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30297890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 38964114 - 38964254
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38964114 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38964213  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38964214 ttagtcat-tttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38964254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39824697 - 39824556
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  39824697 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 39824598  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39824597 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 39824556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30863393 - 30863253
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    ||||||||||||||| || || |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30863393 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 30863294  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30863293 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30863253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 4015874 - 4016015
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4015874 gaatcgtttcaagcaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaa 4015973  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4015974 ttagtcatatttttaggcatgataaatggtggataatgctct 4016015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8689713 - 8689572
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8689713 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgattccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8689614  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8689613 ttagtcatctttttaggcatggcaaatagtggataatgctct 8689572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 11000728 - 11000869
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11000728 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11000827  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  11000828 ttagtcatctttttaggcctggcaagtggtggataatgctct 11000869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14952465 - 14952328
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14952465 gaatcgtttcaaacaagtcttgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 14952366  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14952365 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 14952328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 16095960 - 16096100
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16095960 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctt-ggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 16096058  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16096059 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 16096100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 20079258 - 20079399
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  20079258 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 20079357  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20079358 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 20079399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 245
Target Start/End: Original strand, 23128913 - 23129062
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23128913 gaatcgtttcaaacaagtcatatcgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacaaccacttaaaa 23129012  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctctgctgct 245  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23129013 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttgctgct 23129062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 26593280 - 26593421
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26593280 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 26593379  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26593380 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 26593421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 33760470 - 33760611
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33760470 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33760569  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33760570 ttagtcatctttttagtcatgacaaatggtggataatgctct 33760611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35342321 - 35342180
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35342321 gaatcgtttcaaacaagtctcattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35342222  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35342221 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 35342180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42993659 - 42993518
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42993659 gaattgtttcaaacaattcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 42993560  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42993559 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 42993518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41282482 - 41282342
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    |||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41282482 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaat 41282383  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41282382 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 41282342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6252113 - 6251972
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||||||||    
T  6252113 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaaa 6252014  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6252013 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 6251972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 6600136 - 6600273
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6600136 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 6600235  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6600236 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 6600273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 11692147 - 11692288
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  11692147 gaatcgtttcaaacaagtcatattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 11692246  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11692247 ttagtcatctttttaggcatcacaaatggtggataatgctct 11692288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 19659501 - 19659642
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19659501 gaatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttttttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaa 19659600  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19659601 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 19659642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 30208402 - 30208543
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30208402 gaatcatttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacctacttaaaa 30208501  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30208502 ttaatcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 30208543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 43166269 - 43166410
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  43166269 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcataacacccacttaaaa 43166368  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43166369 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatgctct 43166410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 135 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6331479 - 6331377
Alignment:
Q  135 ggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6331479 ggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgc 6331380  T
Q  235 tct 237  Q
    |||    
T  6331379 tct 6331377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20408674 - 20408537
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||    
T  20408674 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatatttggtaccaaatctagctcctaacacccgcttaaaa 20408575  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20408574 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 20408537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Original strand, 26035382 - 26035487
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26035382 gttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaatacccacttaaaatcagtcatctttttaggcacgacaaatggtggataa 26035481  T
Q  232 tgctct 237  Q
    ||||||    
T  26035482 tgctct 26035487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16752236 - 16752116
Alignment:
Q  118 attgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 216  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16752236 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggatcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 16752137  T
Q  217 acaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  16752136 acaaatggtgaataatgctct 16752116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1052674 - 1052541
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1052674 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1052575  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggat 229  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1052574 ttactcatctttttaagcatggcaaatggtggat 1052541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 28078405 - 28078546
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28078405 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28078504  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||| | ||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28078505 ttagtaaactaattaggcatgacaaatggtagataatgctct 28078546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 27116099 - 27116236
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||| ||| |||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||    
T  27116099 gaatcattttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacatccacttcaaa 27116198  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27116199 ttagtcatctttttaggcattacaaatcgtggataatg 27116236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11935586 - 11935450
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11935586 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgtttccttgatctcatctttga-accaaatgtggctcctaacactcacttaaaa 11935488  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11935487 ttagccatctttttaggcataacaaatagtggataatg 11935450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 19398193 - 19398330
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||||    
T  19398193 gaatcatttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgtttctttgaactcatctttggtaccaaatctagcctctaacacccacttaaaa 19398292  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19398293 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 19398330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 445059 - 444962
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggat 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  445059 gttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatatgactcctaaaacccacttaaaatcagtcgtctttttaggcgtggcaaatggtggat 444962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8695007 - 8694866
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||  ||| |||||  ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || |||||||||    
T  8695007 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgataattatttcattgaactcatctttagtaccaaatctggctcataatactcacttaaaa 8694908  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8694907 ttagtcatgttcttaggcatgataaatggtggataatgctct 8694866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27510112 - 27509978
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataa-cat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaa 194  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |      |||| |   |||||||    
T  27510112 gaatcgtttcaaacaagtcctattgta-ataagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaaaa------ctaaaagg-acttaaa 27510021  T
Q  195 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27510020 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 27509978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 31
Target Start/End: Original strand, 28078310 - 28078339
Alignment:
Q  2 taggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 31  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078310 taggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 28078339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33151837 - 33151696
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33151837 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33151738  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33151737 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33151696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 35346471 - 35346608
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35346471 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35346570  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346571 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 35346608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21564637 - 21564496
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21564637 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacccacttaaaa 21564538  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21564537 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 21564496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21656659 - 21656518
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21656659 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 21656560  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21656559 ttagtcacctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 21656518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1017185 - 1017044
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  1017185 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaa 1017086  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017085 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1017044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1687792 - 1687655
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  1687792 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 1687693  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1687692 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 1687655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 20813441 - 20813582
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20813441 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 20813540  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813541 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 20813582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 38446617 - 38446476
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38446617 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38446518  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  38446517 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtagataatgctct 38446476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42017014 - 42016878
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42017014 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 42016915  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42016914 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataat 42016878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22852131 - 22851996
Alignment:
Q  103 tttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtc 201  Q
    ||||||| || || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22852131 tttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtc 22852032  T
Q  202 atctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22852031 atctgtttaggcatgacaaatggtggataatgctct 22851996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 20760071 - 20760212
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  20760071 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 20760170  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20760171 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 20760212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26455723 - 26455582
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26455723 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 26455624  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26455623 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctct 26455582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31122803 - 31122662
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||    
T  31122803 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaagacccgcttaaaa 31122704  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31122703 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31122662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 51562303 - 51562162
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  51562303 gaatcgtttcaaacaagttctaatgtagataacatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 51562204  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51562203 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 51562162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21890311 - 21890175
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatgtt-ggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  21890311 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatatttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaa 21890212  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890211 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 21890175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19268626 - 19268521
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19268626 gttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 19268527  T
Q  232 tgctct 237  Q
    ||||||    
T  19268526 tgctct 19268521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 20086314 - 20086455
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20086314 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatacttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 20086413  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20086414 ttagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatgctct 20086455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 36314972 - 36315113
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36314972 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaa 36315071  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36315072 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36315113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41251027 - 41250886
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41251027 gaattgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 41250928  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41250927 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 41250886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 47329175 - 47329316
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||| ||||| || ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47329175 gaatcgtttccaacaagtcatatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 47329274  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  47329275 ttagtcatctttttaggtatggcaaatggtggataatgctct 47329316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50287707 - 50287570
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  50287707 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattaaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 50287608  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50287607 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 50287570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 10618480 - 10618617
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  10618480 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaa 10618579  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618580 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 10618617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37248097 - 37247956
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  37248097 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 37247998  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||    
T  37247997 ttagtcatcttttcatgcatgacaaatgatgaataatgctct 37247956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 42107099 - 42107240
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42107099 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattacttccttgaactcatctttgacaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 42107198  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42107199 ttagtcatctttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 42107240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 53196155 - 53196014
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  53196155 gaatcgtttcaaagaagtcttattgtagataacatagttggtaattatttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaa 53196056  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53196055 ttagttatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 53196014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Original strand, 53926015 - 53926120
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53926015 gttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataa 53926114  T
Q  232 tgctct 237  Q
    ||||||    
T  53926115 tgctct 53926120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19664677 - 19664541
Alignment:
Q  102 gtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagt 200  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||    
T  19664677 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcataacatccacttaaaattagt 19664578  T
Q  201 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19664577 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 19664541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29677616 - 29677476
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    ||||||||||||||  || ||| ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29677616 aatcgtttcaaacaggtcctatcgtagatatcatagtttgtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccatttaaaat 29677517  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29677516 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 29677476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Original strand, 1448768 - 1448873
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1448768 gttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 1448867  T
Q  232 tgctct 237  Q
    ||||||    
T  1448868 tgctct 1448873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12748524 - 12748391
Alignment:
Q  105 tcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcat 203  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  12748524 tcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgttttctaacacccacttaaaattagtcat 12748425  T
Q  204 ctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12748424 ctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 12748391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Original strand, 32650856 - 32650957
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32650856 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttctaggcatggcaaatggtggataa 32650955  T
Q  232 tg 233  Q
    ||    
T  32650956 tg 32650957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 40922165 - 40922302
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40922165 gaatcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaa 40922264  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40922265 ttagtaatttttttaggcatggaaaatggtggataatg 40922302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44798408 - 44798268
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44798408 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaa 44798309  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44798308 ttactcat-tttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 44798268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 52821049 - 52821190
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||| |||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  52821049 gaatcgttttaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtagtaaaactggctcctaacacccacttaaaa 52821148  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  52821149 ttagtcatctttttaggcataacaaatgatggataatgctct 52821190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3697287 - 3697148
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  3697287 gaatcctttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaattcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaa 3697188  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3697187 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgct 3697148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Original strand, 20913754 - 20913893
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913754 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaa 20913853  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20913854 ttagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatgct 20913893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Original strand, 20921872 - 20922011
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20921872 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaa 20921971  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20921972 ttagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatgct 20922011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 27070739 - 27070880
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||| |||||||||    
T  27070739 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacactcacttaaaa 27070838  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  27070839 ttagtcatcttttcagacattataaatggtggataatgctct 27070880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 35608131 - 35608272
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||     
T  35608131 gaatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatcggactcctaacacccacttaaac 35608230  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35608231 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 35608272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 48651389 - 48651248
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  48651389 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 48651290  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48651289 ttaatcgtctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 48651248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Original strand, 50364908 - 50365028
Alignment:
Q  118 attgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 216  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  50364908 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacactcacttaaaatcagtaatctttttaggcatg 50365007  T
Q  217 acaaatggtggataatgctct 237  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  50365008 gcaaatggtgggtaatgctct 50365028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50977969 - 50977866
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50977969 gttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatgacaaatggtggataa 50977870  T
Q  232 tgct 235  Q
    ||||    
T  50977869 tgct 50977866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51081101 - 51080998
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51081101 gttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatgacaaatggtggataa 51081002  T
Q  232 tgct 235  Q
    ||||    
T  51081001 tgct 51080998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Original strand, 51475282 - 51475383
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51475282 gttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 51475381  T
Q  232 tg 233  Q
    ||    
T  51475382 tg 51475383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 55164115 - 55164256
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| |||||||| || || ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  55164115 gaattgtttcaaataagtcatattgtagatagcatagttgctaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacctacttaaaa 55164214  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  55164215 ttagtcatctttttaggcatgataaatagtggataatgctct 55164256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28699785 - 28699685
Alignment:
Q  137 taattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28699785 taattgcttccttgaactcatctttggcaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctc 28699686  T
Q  237 t 237  Q
    |    
T  28699685 t 28699685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 33473239 - 33473380
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||||    
T  33473239 gaatcgtttcaaacaagttttattgtagataacatagttggtaattgtttccttgattttatctttggtaccaaatctggtttctaacacgcacttaaaa 33473338  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33473339 ttagtcatctttttagtcatgataaatggtggataatgctct 33473380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39069867 - 39069726
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||| ||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39069867 gaatcgtttcaaacaagtcatattgttaatagcatagttgataattgtttcctttaacttatctttggtaccaaatctggctcttaacacccacttaaaa 39069768  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39069767 ttagtcatcttttcatgcatggcaaatggtggataatgctct 39069726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 45380260 - 45380401
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg--ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaa 194  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||   ||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||    
T  45380260 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagtttgataattgcttctttaaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacc-acttaaa 45380358  T
Q  195 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  45380359 attagtcatctttttatgcatggtaaatggtggataatgctct 45380401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44152777 - 44152700
Alignment:
Q  160 ttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44152777 ttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 44152700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47473295 - 47473230
Alignment:
Q  172 atggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47473295 atggctcctaacatccacttaaaattagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47473230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34019565 - 34019462
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||   ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34019565 gttgataattgcttacttgaactcactgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagccatatttttaggcatgtcaaatggtggataa 34019466  T
Q  232 tgct 235  Q
    ||||    
T  34019465 tgct 34019462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 222
Target Start/End: Original strand, 38923998 - 38924124
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  38923998 gaattgtttcaaacaagtcctatcgtagataaaatagttggtaattgcttcgttgaacttatctttggtaccaaattggactcctaacatccacttaaaa 38924097  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaat 222  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  38924098 ttaatcatctctttaagcatgacaaat 38924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 206
Target Start/End: Original strand, 42641214 - 42641288
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42641214 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaagtctgcctcctaacacccacttaaaatcaatcatctt 42641288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 31
Target Start/End: Original strand, 28775383 - 28775412
Alignment:
Q  2 taggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 31  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775383 taggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 28775412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2390406 - 2390267
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2390406 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatagctcctaacacccacttataa 2390307  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390306 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 2390267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6503858 - 6503718
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6503858 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaacccatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 6503759  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6503758 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 6503718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3408330 - 3408189
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3408330 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 3408231  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3408230 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 3408189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 1915343 - 1915484
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1915343 gaatagtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1915442  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1915443 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1915484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2707600 - 2707459
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2707600 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 2707501  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2707500 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 2707459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9382660 - 9382519
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || |  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  9382660 gaatcgtttcaaacaagtcctgatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 9382561  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9382560 ttagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatgctct 9382519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10256378 - 10256237
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10256378 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 10256279  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10256278 ttagtcatctttttaggcattgcaaatggtggataatgctct 10256237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12626777 - 12626636
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12626777 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 12626678  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12626677 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 12626636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 17428272 - 17428409
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17428272 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaa 17428371  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17428372 ttagtcatctttttaggcatgacaaacggtgaataatg 17428409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 26230932 - 26231073
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26230932 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtaaataacatagttggtagtttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 26231031  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26231032 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 26231073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 8178249 - 8178390
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8178249 gaatcgtttcaaacatgtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8178348  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8178349 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 8178390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 26393009 - 26393146
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26393009 gaatcgtttcaaaaaacttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 26393108  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26393109 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26393146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29050413 - 29050272
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29050413 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 29050314  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  29050313 ttagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatgctct 29050272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30379158 - 30379021
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30379158 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 30379059  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30379058 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 30379021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17943177 - 17943040
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17943177 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcataattggtaattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 17943078  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17943077 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 17943040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16193415 - 16193314
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16193415 gttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 16193316  T
Q  232 tg 233  Q
    ||    
T  16193315 tg 16193314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 3258807 - 3258948
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg--ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaa 194  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  3258807 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagataccatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaca-ccacttaaa 3258905  T
Q  195 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3258906 attagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataacgctct 3258948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Original strand, 2598099 - 2598229
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2598099 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgctttattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 2598198  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtg 226  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2598199 ttactcatctttttaggcatggcaaatggtg 2598229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11134015 - 11133873
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttcctt-gaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaa 194  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11134015 gaatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagatggtaattgcttcctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaa 11133916  T
Q  195 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  11133915 attagtcatctttttagacataacaaatgatggataatgctct 11133873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1077378 - 1077241
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1077378 gaatcgtttcaaataagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaa 1077279  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1077278 ttaatcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 1077241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26936712 - 26936607
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26936712 gttgataattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatccggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 26936613  T
Q  232 tgctct 237  Q
    | ||||    
T  26936612 tactct 26936607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 26196321 - 26196458
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg--ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaa 194  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||    
T  26196321 gaatcggttcaaccaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccgtgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacaac-acttaaa 26196419  T
Q  195 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26196420 attaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26196458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 132 - 222
Target Start/End: Original strand, 35223935 - 35224025
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35223935 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctagctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgtcaaat 35224025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 6785101 - 6785239
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || || |||| |||||||  |||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6785101 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacataattggt---tgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 6785197  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||    
T  6785198 ttagtcatctttttagtcatgtcaaattttgtataatgctct 6785239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 233
Target Start/End: Original strand, 10931187 - 10931288
Alignment:
Q  136 gtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg----acaaatggtggataa 231  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||    
T  10931187 gtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctaacacccgcttaaaattagtcatctttttaggcatgcatgagaaatggtggataa 10931286  T
Q  232 tg 233  Q
    ||    
T  10931287 tg 10931288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 25820550 - 25820686
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |  ||| ||||||||| |||||||    
T  25820550 aatcgtttcaaacaattcctatcgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatgtttggtaccaaatctaactcataacacccatttaaaat 25820649  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||  |||||||||    
T  25820650 tagtcataattttagtcatgtcaaattatggataatg 25820686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31376058 - 31375971
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaac 183  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31376058 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgttaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaac 31375971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 154
Target Start/End: Original strand, 12612971 - 12613029
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaact 154  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12612971 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaact 12613029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 31
Target Start/End: Original strand, 2390110 - 2390139
Alignment:
Q  2 taggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 31  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390110 taggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 2390139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2533413 - 2533272
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2533413 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctccaaacacccacttaaaa 2533314  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2533313 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 2533272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3876049 - 3875908
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||    
T  3876049 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactatatctggttcctaacacccacttaaaa 3875950  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875949 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 3875908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37933783 - 37933646
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  37933783 gaatcgtttcaaacaagtcttatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 37933684  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933683 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 37933646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15847253 - 15847117
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15847253 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 15847154  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15847153 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataat 15847117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Original strand, 35884430 - 35884569
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35884430 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaa 35884529  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35884530 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatgct 35884569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 513448 - 513308
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  513448 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 513349  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  513348 ttagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatgctct 513308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1293627 - 1293486
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  1293627 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggtttctaacacccacttaaaa 1293528  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1293527 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1293486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 28707446 - 28707587
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28707446 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagatatcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaa 28707545  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28707546 ttagtcatcttttaaggcatgacaaatggtggataatgctct 28707587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 36400070 - 36400211
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||     
T  36400070 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaac 36400169  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36400170 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36400211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38107240 - 38107103
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38107240 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38107141  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38107140 ttaatcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 38107103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 43806533 - 43806674
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  43806533 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacactcacttaaaa 43806632  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43806633 ttagtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgctct 43806674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 22683988 - 22684129
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22683988 gaatcatttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 22684087  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22684088 ttagtcatctttttagccatgacaaatggtgaataatgctct 22684129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35443452 - 35443311
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35443452 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35443353  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35443352 ttagttatctttttaggcatggcaaatagtggataatgctct 35443311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 260118 - 259982
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  260118 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 260019  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  260018 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 259982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 655803 - 655939
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  655803 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 655902  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  655903 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 655939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 841538 - 841674
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  841538 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 841637  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  841638 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 841674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 9056338 - 9056479
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  9056338 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 9056437  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9056438 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 9056479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7435006 - 7434886
Alignment:
Q  118 attgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 216  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7435006 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttataggcttg 7434907  T
Q  217 acaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7434906 acaaatggtggataatgctct 7434886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 440981 - 440844
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  440981 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 440882  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  440881 ttactcatctttttagacatggcaaacggtggataatg 440844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 28496355 - 28496495
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | || ||| ||||||||||||    
T  28496355 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagttc-taatacccacttaaaa 28496453  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28496454 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatactct 28496495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 38633710 - 38633851
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||    
T  38633710 gaatcgtttcaaacaagttctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgatttctaacacccacttaaaa 38633809  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38633810 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 38633851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 23972295 - 23972437
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||    
T  23972295 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgactcctatcacccacttaaaa 23972394  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgac-aaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  23972395 ttagtcatctttttagacatgacaaaatgttggataatactct 23972437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38208894 - 38208756
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38208894 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgctaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38208795  T
Q  196 ttagtcat-ctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38208794 ttagtcatccattttagacatggcaaatggtggataatg 38208756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 222
Target Start/End: Original strand, 41536527 - 41536653
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  41536527 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 41536626  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  41536627 ttagtcatctttttaggcatgacaaat 41536653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12010654 - 12010549
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12010654 gttggtaattgttgccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttatgcatggcaaatggtggataa 12010555  T
Q  232 tgctct 237  Q
    ||||||    
T  12010554 tgctct 12010549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13797229 - 13797089
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  13797229 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtatatagcatagttggtaattgcttctttgaactcat-tttggtatcaaatctggctcctaacatccacataaaa 13797131  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  13797130 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggacgatgctct 13797089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23935338 - 23935233
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23935338 gttgataattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 23935239  T
Q  232 tgctct 237  Q
    ||||||    
T  23935238 tgctct 23935233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33651982 - 33651841
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  33651982 gaatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagtttgtaattgtttccttgaactcatctttcataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 33651883  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33651882 ttagtcatctttttagacatgacaaacggtggataatgctct 33651841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 40301893 - 40302030
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||    
T  40301893 gaatcgtttcaaaaaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaatttatctttggtaccaaatctagctcctaacactcacttaaaa 40301992  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40301993 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 40302030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 237
Target Start/End: Original strand, 39513344 - 39513480
Alignment:
Q  102 gtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagt 200  Q
    |||||||| || || || |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  39513344 gtttcaaataagtcctaatgtagataacatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaattagt 39513443  T
Q  201 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  39513444 catctttttaggcatggcatatggtggataatactct 39513480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 24430571 - 24430712
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||  || |||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||    
T  24430571 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttgataattgttttattgaactcatctttggtaccaaatctcactactaacacccacttaaaa 24430670  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24430671 ttagtcatctttttaggcatgacaaaaggtggataatgctct 24430712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29485406 - 29485287
Alignment:
Q  118 attgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 216  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29485406 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaatcagtcat-tttttaggcatg 29485308  T
Q  217 acaaatggtggataatgctct 237  Q
     |||||| |||||||||||||    
T  29485307 gcaaatgatggataatgctct 29485287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6016310 - 6016207
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6016310 gttggtaattgcttctttaaactcatctttgatactcaatttggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 6016211  T
Q  232 tgct 235  Q
    ||||    
T  6016210 tgct 6016207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 42988227 - 42988367
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| |||| || |||| |||||||||| || |||| || |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  42988227 gaatcgtttcaaa-aagtcctattgtagataatatagttgataattgcttcatttaacttatatttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaa 42988325  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42988326 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 42988367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4649291 - 4649154
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| || || | |||| ||||||||||    
T  4649291 gaatcgtttcaaacaagtccaattgtagatagcataattggtaattgtttccttgaactcgtctttggtaccaaatctgacttccaacatccacttaaaa 4649192  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4649191 ttagtcatttttttaggcatggcaaatggtggataatg 4649154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 36218781 - 36218917
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || |  |||| |||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||||||||    
T  36218781 gaatcgtttcaaacaagtcatgatgtagataatatagttgataattgcttc-ttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctagcacccacttaaaa 36218879  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36218880 ttagccatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 36218917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 237
Target Start/End: Original strand, 24193356 - 24193433
Alignment:
Q  159 tttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24193356 tttggtaccaaatctggctcctaacacc-acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 24193433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 161
Target Start/End: Original strand, 24193131 - 24193195
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatcttt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24193131 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcttt 24193195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8137238 - 8137180
Alignment:
Q  173 tggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  8137238 tggctcctaacacctacttaaaattagtcatttttttaggcatagcaaatggtggataa 8137180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 13797323 - 13797295
Alignment:
Q  3 aggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13797323 aggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 13797295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 4544985 - 4545126
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  4544985 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 4545084  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545085 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 4545126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 33807780 - 33807921
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33807780 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 33807879  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33807880 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33807921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42273943 - 42273802
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  42273943 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 42273844  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42273843 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 42273802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Original strand, 11795154 - 11795304
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11795154 gaatcgtttcaaacaagtcatattctagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 11795253  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctctgctgctt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11795254 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctt 11795304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28264784 - 28264643
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  28264784 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaa 28264685  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28264684 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28264643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 55517185 - 55517326
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  55517185 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 55517284  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55517285 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 55517326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Original strand, 24458631 - 24458770
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24458631 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaa 24458730  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24458731 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatgct 24458770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26017564 - 26017425
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26017564 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 26017465  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26017464 ttagtcatctttttaggcatgataaatagtggataatgct 26017425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12196610 - 12196469
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12196610 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 12196511  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12196510 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12196469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 19496102 - 19496243
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19496102 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggcgcctaacacccacttaaaa 19496201  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19496202 ttagtcatctttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 19496243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 23135006 - 23135143
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23135006 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 23135105  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23135106 ttagtcatttttttaggcatgccaaatggtggctaatg 23135143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 28159953 - 28160094
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28159953 gaatcatttcaaacaagtcttattgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28160052  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28160053 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28160094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31591216 - 31591076
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31591216 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 31591117  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31591116 ttagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatgctct 31591076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31973732 - 31973591
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  31973732 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 31973633  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31973632 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31973591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32318094 - 32317957
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  32318094 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgtctcctaacacccacttaaaa 32317995  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32317994 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 32317957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 48551764 - 48551901
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  48551764 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatggttggtaattgctttcttgaactcatctttggtacaaaatctgactcctaacacccacttaaaa 48551863  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48551864 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 48551901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 48707733 - 48707874
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  48707733 gaatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 48707832  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48707833 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 48707874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40988773 - 40988633
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40988773 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 40988674  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40988673 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 40988633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49118752 - 49118616
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  49118752 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 49118653  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49118652 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 49118616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2055419 - 2055280
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  2055419 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaag 2055320  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2055319 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 2055280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 98 - 236
Target Start/End: Original strand, 33174021 - 33174160
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33174021 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatttcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33174120  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33174121 tagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctc 33174160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48149640 - 48149502
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  48149640 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctgacacccacttaaaa 48149541  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48149540 ttactcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 48149502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5227531 - 5227390
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||    
T  5227531 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctagtatccacttaaaa 5227432  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227431 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 5227390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15985151 - 15985010
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15985151 gaatcgtttcaaacaagtcatattctagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaa 15985052  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15985051 tcagtaatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 15985010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 28812287 - 28812427
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28812287 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaagtcatctttggtaccaaatctggctcctaacacc-acttaaaa 28812385  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28812386 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 28812427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44490460 - 44490324
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||     
T  44490460 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaag 44490361  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44490360 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 44490324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Original strand, 8882013 - 8882152
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8882013 gaatcgtttcaaacaagtcctattctagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8882112  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8882113 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 8882152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 9339123 - 9339267
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatc---tttggtacaaaatatggctcctaacacccactta 192  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9339123 gaatcatttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccactta 9339222  T
Q  193 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9339223 aaattagtcatctttttatgcatgacaaatggtgaataatgctct 9339267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14564937 - 14564796
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14564937 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaa 14564838  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14564837 ttagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatgctct 14564796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 17847096 - 17847236
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17847096 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 17847195  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17847196 ttagtcatc-ttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 17847236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35930180 - 35930040
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35930180 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35930081  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35930080 ttagtcatctttttaggcatgacaaa-ggtggataatgctct 35930040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 39995167 - 39995308
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39995167 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaa 39995266  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39995267 ttaatcatctttttaggcatggcaaatggtggataatcctct 39995308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 50542354 - 50542495
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  50542354 gaatcgttttaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 50542453  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  50542454 ttaatcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 50542495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32118854 - 32118714
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  32118854 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccccttaaaat 32118755  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32118754 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctct 32118714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10588719 - 10588580
Alignment:
Q  99 atcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaatt 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10588719 atcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaact 10588620  T
Q  198 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  10588619 agtcatctttttaggcatggtaaatggcagataatgctct 10588580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 17993017 - 17993158
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17993017 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaa 17993116  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17993117 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 17993158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24623253 - 24623148
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24623253 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagttatttttttaggcatgacaaatggtggataa 24623154  T
Q  232 tgctct 237  Q
    ||||||    
T  24623153 tgctct 24623148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 25734223 - 25734360
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  25734223 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttaattgaactcatctttcgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 25734322  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25734323 ttagtcatctttttaggcatgacaaacggtggataatg 25734360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 30467003 - 30467140
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||    
T  30467003 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccatttaaaa 30467102  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30467103 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 30467140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39700186 - 39700045
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || |||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||    
T  39700186 gaatcgtttcaaacaagtcttattatagataacataattggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcttaacactcacttaaaa 39700087  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39700086 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtgaataatgctct 39700045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37381986 - 37381848
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    |||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||    
T  37381986 aatcatttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatttttggtaccatatctggttcctaacacccacttaaaat 37381887  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37381886 tagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgct 37381848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Original strand, 19168831 - 19168936
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19168831 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatttgactcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 19168930  T
Q  232 tgctct 237  Q
    ||||||    
T  19168931 tgctct 19168936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23553205 - 23553069
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23553205 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacc-acttaaaa 23553107  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23553106 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 23553069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 30141108 - 30141249
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30141108 gaatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaa 30141207  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  30141208 ttagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatgctct 30141249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 33693333 - 33693474
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  33693333 gaatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaa 33693432  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||    
T  33693433 ttattcatctttttagacatggcaaatgatagataatgctct 33693474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Original strand, 50276138 - 50276274
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  50276138 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaa 50276237  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    ||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  50276238 ttag---tctttttaggcatggcaaacggtggataatgct 50276274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 51371047 - 51371188
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  51371047 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaa 51371146  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  51371147 ttagtcatttttttagacatggcaaatggtgaataatgctct 51371188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25730381 - 25730244
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  25730381 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcactaaatccgactcctaacatccacttaaaa 25730282  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  25730281 ttagtcatctttttaggcatagcaaatagtggataatg 25730244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31208885 - 31208748
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31208885 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcccaacacccacttaaaa 31208786  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||    ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  31208785 ttagtcatc----taaacatgataaatggtggataatgctct 31208748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Original strand, 42549643 - 42549762
Alignment:
Q  118 attgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 216  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42549643 attgtagataacatagttggtaattgcttcattgaacttatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaatcaatcatctttttaggcatg 42549742  T
Q  217 acaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  42549743 acaaa-ggtggaaaatgctct 42549762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22298659 - 22298517
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22298659 gaatcgtttcaaacaagccctattgtagatagcataattggtaattgtttccttaaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 22298560  T
Q  196 ttagtcatct-ttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22298559 ttagtcatcttttttaggcatagcaaatggtggataatgctct 22298517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 237
Target Start/End: Original strand, 56555200 - 56555281
Alignment:
Q  156 atctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56555200 atctttggtaccaaatctggctcctgacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 56555281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20534306 - 20534225
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggct 177  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20534306 gaatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggct 20534225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 16246193 - 16246334
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16246193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 16246292  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16246293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 16246334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27328725 - 27328584
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  27328725 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 27328626  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328625 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 27328584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 33865267 - 33865408
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33865267 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33865366  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33865367 ttagtcatttttttaggcatgacaaatggtggataatactct 33865408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 921163 - 921022
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  921163 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 921064  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  921063 ttagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctct 921022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 25087796 - 25087933
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25087796 gaattgtttcaaacaagtcttattgtatataacatagttgataattgcttccttgaactcatctctggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaa 25087895  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25087896 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 25087933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 28650426 - 28650567
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28650426 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28650525  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28650526 ttagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgctct 28650567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40854750 - 40854609
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40854750 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacatccacttaaaa 40854651  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40854650 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40854609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 41500502 - 41500643
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41500502 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtacatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccgcttaaaa 41500601  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41500602 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 41500643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 237
Target Start/End: Original strand, 771981 - 772116
Alignment:
Q  103 tttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtc 201  Q
    |||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  771981 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtc 772080  T
Q  202 atctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  772081 atctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 772116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9276715 - 9276565
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9276715 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 9276616  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctctgctgctt 246  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9276615 ttagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctt 9276565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7379104 - 7378963
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || || |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7379104 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7379005  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7379004 ttagtcctctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7378963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 11949426 - 11949567
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |    
T  11949426 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaata 11949525  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11949526 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 11949567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 33106969 - 33107110
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||| | || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33106969 gaatcgtttcaaacgagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaa 33107068  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  33107069 ttagtcatctttttaggcatgaaaaatggtaaataatgctct 33107110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34253283 - 34253142
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  34253283 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaata 34253184  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34253183 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 34253142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2057067 - 2056929
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||    
T  2057067 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatccagctcctaacacccacttaaaa 2056968  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 234  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2056967 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgc 2056929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2456151 - 2456010
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  2456151 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttaactcctaacacccacttaaaa 2456052  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2456051 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 2456010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 12759750 - 12759890
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  12759750 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatttgcctc-taacacccacttaaaa 12759848  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12759849 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12759890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37838438 - 37838301
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  37838438 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 37838339  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37838338 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 37838301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17134369 - 17134229
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  17134369 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaag 17134270  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  17134269 tagtcatctttttaggaatggcaaatgatggataatgctct 17134229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Original strand, 7297234 - 7297373
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  7297234 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgtcttcttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaa 7297333  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7297334 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 7297373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 1106559 - 1106700
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||| ||||||| || || ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  1106559 gaatcatttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 1106658  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1106659 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 1106700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 2094410 - 2094551
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2094410 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttgatactaaatttggctccaaacacccacttaaaa 2094509  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2094510 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 2094551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Original strand, 8396587 - 8396692
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8396587 gttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaaaacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 8396686  T
Q  232 tgctct 237  Q
    ||||||    
T  8396687 tgctct 8396692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19180562 - 19180422
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19180562 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagtatagttagtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctc-taacacccacttaaaa 19180464  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19180463 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 19180422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 37732193 - 37732334
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  37732193 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtaaataacatagttggtaattgctttcttgaactcatttttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaa 37732292  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37732293 ttagtcatctttttatgtatgacaaatggtggataatgctct 37732334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36211182 - 36211046
Alignment:
Q  102 gtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagt 200  Q
    ||||||||||| || |||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  36211182 gtttcaaacaagtcctattctagataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagt 36211083  T
Q  201 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36211082 catctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 36211046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Original strand, 36444229 - 36444369
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  36444229 aatcgtttcaaacaagtcctatagtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacctacttaaaat 36444328  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36444329 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 36444369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 38751188 - 38751048
Alignment:
Q  98 aatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaat 196  Q
    ||||||||||||||| || || |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38751188 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatgtggctcctaacatccacttaaaat 38751089  T
Q  197 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38751088 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38751048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Original strand, 2314975 - 2315114
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2314975 gaattgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 2315074  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2315075 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgct 2315114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 237
Target Start/End: Original strand, 3430631 - 3430765
Alignment:
Q  104 ttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtca 202  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3430631 ttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaattagtca 3430730  T
Q  203 tctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3430731 tctttttaggcatggcaaatggtgtataatgctct 3430765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8899822 - 8899682
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8899822 gaatcgtttcaa-caagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8899724  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8899723 ctagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 8899682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Original strand, 43249448 - 43249553
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43249448 gttggtaattgtttccttgaatacatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 43249547  T
Q  232 tgctct 237  Q
    ||||||    
T  43249548 tgctct 43249553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45124260 - 45124120
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  45124260 gaatcgtttcaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttaaactcatctttggtatcaaatcagactcttaacacccacttaaaa 45124161  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 236  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45124160 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 45124120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 17484550 - 17484687
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  17484550 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacaaccacttaaaa 17484649  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  17484650 ttagtcatctttttaagcatggaaaatggtggataatg 17484687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29737889 - 29737748
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||  ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||| ||||||    
T  29737889 gaattgtttcaaacaagtcctattgtcgatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaagatccatttaaaa 29737790  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29737789 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 29737748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 237
Target Start/End: Original strand, 41178059 - 41178160
Alignment:
Q  136 gtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41178059 gtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatttttttaggcatggtaaatggtggataatgct 41178158  T
Q  236 ct 237  Q
    ||    
T  41178159 ct 41178160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42630103 - 42629962
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || |||  || ||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42630103 gaatcgtttcaaacaagtcctatcatagatagcataattgataattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 42630004  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42630003 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggatgatgctct 42629962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37654213 - 37654112
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  37654213 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaaatgatgaataa 37654114  T
Q  232 tg 233  Q
    ||    
T  37654113 tg 37654112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Original strand, 19916023 - 19916128
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19916023 gttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaatatcaatcatctttttaggcttgacaaattgtggataa 19916122  T
Q  232 tgctct 237  Q
    ||||||    
T  19916123 tgctct 19916128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14630755 - 14630663
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacaccca 188  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14630755 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacaccca 14630663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9331897 - 9331757
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||  || ||||||||||||||||  ||  | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  9331897 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtattgttggtaattgcttcccagatattatcttaggtaccaaatttggctcctaacacccacctaaga 9331798  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 236  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9331797 ttagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctc 9331757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Original strand, 23671811 - 23671901
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacc 186  Q
    |||||||||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23671811 gaatcgtttcaaacaagtcttattatagataacatggttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacc 23671901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 237
Target Start/End: Original strand, 23672958 - 23673014
Alignment:
Q  181 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23672958 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggaaaatgctct 23673014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 31214141 - 31214113
Alignment:
Q  3 aggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31214141 aggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 31214113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 42630197 - 42630169
Alignment:
Q  3 aggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42630197 aggtcaaatgcatctaaaggtcttttaag 42630169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 114
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  255 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagtcggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 156  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 219027 - 218885
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacaccc-acttaaa 194  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  219027 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacaccccacttaaa 218928  T
Q  195 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  218927 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 218885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 5027 - 5164
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5027 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacaccctcttaaaa 5126  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5127 ttagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatg 5164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48103 - 47967
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    ||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  48103 gaatcgttttaaacaagtccgattgtatatcacatagttggtaattgcttccttgaactcacctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 48004  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48003 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 47967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 252438 - 252579
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  252438 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaa 252537  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  252538 ttagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatgctct 252579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5326 - 5190
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5326 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacc-acttaaaa 5228  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 5190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Original strand, 2009 - 2114
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2009 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacctacttaaaatcagtcatcttattaggcatgacaaatggtggataa 2108  T
Q  232 tgctct 237  Q
    ||||||    
T  2109 tgctct 2114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11463 - 11362
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 231  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11463 gttggtaattgcttccttaaacttatctatggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataa 11364  T
Q  232 tg 233  Q
    ||    
T  11363 tg 11362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13236 - 13099
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||    
T  13236 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaa 13137  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13136 ttattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatg 13099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 59608 - 59745
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggctcctaacacccacttaaaa 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||    
T  59608 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaa 59707  T
Q  196 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 233  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  59708 ttattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatg 59745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 237
Target Start/End: Original strand, 289 - 342
Alignment:
Q  184 acccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  289 acccacttaaaattattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19831 - 19781
Alignment:
Q  187 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19831 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 19781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 680 - 599
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggct 177  Q
    |||||||||||||||| || || |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  680 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 177
Target Start/End: Original strand, 1913 - 1994
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggct 177  Q
    |||||||||||||||| || || |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1913 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Original strand, 3407 - 3452
Alignment:
Q  132 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggct 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3407 gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 3452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1877
Alignment:
Q  97 gaatcgtttcaaacaaatcgtattgtatataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatatggct 177  Q
    |||||||||||||||| || || |||  ||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  1958 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttgatagcatagttgataattgcttccttgacctcatctttggtaccaaatctggct 1877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University