View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4084_low_7 (Length: 240)

Name: NF4084_low_7
Description: NF4084
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4084_low_7
NF4084_low_7
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (1-231)||(9077953-9078183)
chr5 (3-229)||(24529223-24529449)
chr5 (1-239)||(25421533-25421771)
chr5 (1-239)||(25431396-25431633)
chr5 (1-240)||(23390377-23390616)
chr5 (1-231)||(1096468-1096698)
chr5 (1-235)||(24493570-24493803)
chr5 (1-235)||(8286728-8286963)
chr5 (1-235)||(13025312-13025545)
chr5 (1-235)||(13095496-13095729)
chr5 (1-239)||(22075019-22075258)
chr5 (3-215)||(22412187-22412388)
chr5 (1-235)||(21292856-21293089)
chr5 (1-108)||(21997547-21997654)
chr5 (1-167)||(21808343-21808509)
chr5 (3-166)||(264768-264930)
chr5 (3-166)||(29329934-29330096)
chr5 (3-166)||(29345980-29346142)
chr5 (3-166)||(39363384-39363546)
chr5 (3-153)||(10732953-10733102)
chr5 (1-119)||(21729066-21729184)
chr5 (3-166)||(20909012-20909174)
chr5 (3-166)||(29348453-29348615)
chr5 (3-166)||(29350926-29351088)
chr5 (3-166)||(42245365-42245527)
chr5 (3-215)||(11581151-11581361)
chr5 (3-166)||(32027393-32027555)
chr5 (3-153)||(39245136-39245285)
chr5 (3-166)||(36154783-36154942)
chr5 (3-126)||(20902049-20902172)
chr5 (3-126)||(2154654-2154776)
chr5 (104-231)||(21986037-21986164)
chr5 (6-126)||(18319073-18319193)
chr5 (3-126)||(38619434-38619557)
chr5 (3-126)||(10775715-10775838)
chr5 (3-111)||(31061068-31061175)
chr5 (4-182)||(21565546-21565723)
chr5 (4-126)||(23064512-23064634)
chr5 (7-207)||(37723910-37724108)
chr5 (138-235)||(22107259-22107356)
chr5 (14-215)||(18418594-18418793)
chr5 (66-215)||(20766035-20766174)
chr5 (3-126)||(20917992-20918110)
chr5 (1-118)||(21329500-21329617)
chr5 (19-221)||(22144068-22144271)
chr5 (4-115)||(22959538-22959649)
chr5 (19-118)||(20026942-20027043)
chr5 (6-111)||(24067110-24067214)
chr5 (1-71)||(19660884-19660955)
chr5 (1-98)||(36314578-36314675)
chr5 (1-119)||(21502158-21502276)
chr5 (1-122)||(26012034-26012153)
chr5 (2-148)||(17517174-17517320)
chr5 (1-215)||(40725854-40726069)
chr5 (1-115)||(19668899-19669013)
chr5 (49-122)||(29448052-29448126)
chr5 (49-175)||(18356364-18356488)
chr5 (4-207)||(21873254-21873453)
chr5 (4-68)||(26704075-26704139)
chr5 (4-68)||(26973808-26973872)
chr5 (49-119)||(20910801-20910869)
chr5 (19-122)||(22178218-22178323)
chr5 (3-57)||(20806850-20806904)
chr5 (16-69)||(26732884-26732937)
chr5 (4-68)||(22032323-22032387)
chr5 (19-69)||(26740697-26740747)
chr5 (4-89)||(23201360-23201445)
chr5 (4-73)||(23501403-23501472)
chr5 (4-68)||(18770054-18770118)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (1-231)||(50210103-50210333)
chr1 (3-231)||(34509783-34510011)
chr1 (1-231)||(22532270-22532500)
chr1 (1-239)||(27250611-27250849)
chr1 (1-239)||(21026681-21026919)
chr1 (1-233)||(20135188-20135420)
chr1 (1-214)||(22468604-22468816)
chr1 (3-215)||(433012-433222)
chr1 (3-182)||(23593719-23593897)
chr1 (77-235)||(22354458-22354616)
chr1 (2-126)||(21840766-21840889)
chr1 (3-166)||(13988866-13989028)
chr1 (3-166)||(21923291-21923453)
chr1 (1-126)||(45574882-45575007)
chr1 (3-166)||(21475087-21475249)
chr1 (3-166)||(29776688-29776850)
chr1 (3-166)||(31612313-31612475)
chr1 (1-182)||(16361915-16362095)
chr1 (138-240)||(22356055-22356158)
chr1 (138-240)||(22357741-22357844)
chr1 (3-166)||(29298137-29298298)
chr1 (3-126)||(16275403-16275526)
chr1 (1-206)||(13212821-13213026)
chr1 (3-203)||(21346961-21347161)
chr1 (1-235)||(38801277-38801507)
chr1 (3-126)||(21342096-21342219)
chr1 (3-126)||(21707167-21707289)
chr1 (3-126)||(21711709-21711831)
chr1 (1-102)||(20847173-20847274)
chr1 (3-111)||(15860064-15860171)
chr1 (7-126)||(21754052-21754170)
chr1 (137-216)||(48603651-48603730)
chr1 (3-126)||(22123107-22123230)
chr1 (4-122)||(22921868-22921986)
chr1 (4-182)||(33681011-33681188)
chr1 (19-122)||(21896255-21896358)
chr1 (4-147)||(22237631-22237773)
chr1 (1-115)||(14295557-14295671)
chr1 (1-68)||(20454606-20454673)
chr1 (19-181)||(21861510-21861672)
chr1 (6-111)||(40389157-40389261)
chr1 (4-115)||(20248283-20248394)
chr1 (16-115)||(20918620-20918719)
chr1 (4-184)||(21787979-21788159)
chr1 (15-221)||(16758664-16758872)
chr1 (19-209)||(35260992-35261180)
chr1 (4-207)||(21714546-21714754)
chr1 (19-122)||(50614114-50614219)
chr1 (19-122)||(50621942-50622047)
chr1 (19-122)||(41050033-41050138)
chr1 (15-98)||(52927993-52928076)
chr1 (19-122)||(16368284-16368388)
chr1 (49-182)||(22130850-22130978)
chr1 (49-119)||(33797570-33797638)
chr1 (180-239)||(20847101-20847161)
chr1 (4-68)||(42865266-42865330)
chr1 (4-61)||(21161720-21161778)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (1-231)||(28648934-28649164)
chr8 (1-231)||(6759259-6759487)
chr8 (1-231)||(16092231-16092462)
chr8 (1-235)||(18818295-18818529)
chr8 (1-226)||(22875066-22875291)
chr8 (1-231)||(22626737-22626966)
chr8 (1-235)||(21923814-21924048)
chr8 (1-235)||(20536209-20536443)
chr8 (1-231)||(7372779-7373001)
chr8 (1-230)||(23406380-23406611)
chr8 (1-240)||(18879118-18879351)
chr8 (1-235)||(21918886-21919120)
chr8 (1-235)||(31971258-31971490)
chr8 (1-235)||(23648554-23648788)
chr8 (1-235)||(45130884-45131116)
chr8 (1-235)||(16199532-16199764)
chr8 (3-166)||(14409444-14409606)
chr8 (3-166)||(1484402-1484564)
chr8 (3-166)||(5853292-5853454)
chr8 (7-166)||(16413316-16413474)
chr8 (3-166)||(20403227-20403389)
chr8 (3-166)||(22001753-22001915)
chr8 (3-215)||(41598188-41598399)
chr8 (3-166)||(15203231-15203393)
chr8 (3-126)||(20046235-20046357)
chr8 (3-215)||(26219717-26219918)
chr8 (3-166)||(4483281-4483442)
chr8 (3-126)||(4542413-4542535)
chr8 (1-221)||(21389353-21389570)
chr8 (3-146)||(26225268-26225409)
chr8 (1-216)||(21395888-21396100)
chr8 (1-216)||(21790381-21790593)
chr8 (1-126)||(26223917-26224041)
chr8 (3-166)||(19896265-19896430)
chr8 (1-122)||(38855250-38855371)
chr8 (1-203)||(21778697-21778896)
chr8 (1-118)||(6520369-6520486)
chr8 (137-235)||(25363026-25363124)
chr8 (3-166)||(14823774-14823935)
chr8 (16-126)||(15070571-15070681)
chr8 (3-125)||(19937046-19937168)
chr8 (19-215)||(19801333-19801527)
chr8 (7-182)||(13508024-13508199)
chr8 (7-126)||(45290734-45290853)
chr8 (1-115)||(5866280-5866394)
chr8 (1-103)||(17140917-17141019)
chr8 (4-122)||(21285601-21285719)
chr8 (1-115)||(21490996-21491110)
chr8 (3-166)||(25484275-25484430)
chr8 (7-182)||(13597556-13597731)
chr8 (2-148)||(18678075-18678221)
chr8 (2-148)||(32121734-32121880)
chr8 (4-122)||(23760843-23760961)
chr8 (1-215)||(17612018-17612230)
chr8 (4-121)||(26355699-26355815)
chr8 (15-118)||(983407-983512)
chr8 (12-122)||(21673716-21673826)
chr8 (1-115)||(21249385-21249500)
chr8 (1-115)||(21255223-21255338)
chr8 (19-182)||(20498581-20498744)
chr8 (19-122)||(37116366-37116471)
chr8 (4-184)||(23776772-23776952)
chr8 (4-216)||(17353843-17354060)
chr8 (26-122)||(17439504-17439602)
chr8 (164-215)||(26222987-26223039)
chr8 (19-122)||(17266991-17267096)
chr8 (19-122)||(24353039-24353143)
chr8 (81-122)||(40492850-40492891)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-231)||(3041-3270)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (1-231)||(20593774-20594004)
chr6 (1-231)||(25629245-25629475)
chr6 (1-231)||(29060541-29060771)
chr6 (1-231)||(18409717-18409947)
chr6 (1-227)||(19303435-19303660)
chr6 (1-235)||(20360846-20361080)
chr6 (1-236)||(20638168-20638403)
chr6 (1-239)||(17287678-17287916)
chr6 (1-232)||(22780116-22780347)
chr6 (3-166)||(22782227-22782389)
chr6 (1-167)||(20076701-20076863)
chr6 (3-166)||(2291180-2291342)
chr6 (3-166)||(12742317-12742479)
chr6 (3-166)||(18334592-18334754)
chr6 (3-166)||(19005046-19005208)
chr6 (3-166)||(19858919-19859081)
chr6 (3-166)||(24422547-24422709)
chr6 (3-166)||(33861794-33861956)
chr6 (3-166)||(33864278-33864440)
chr6 (3-153)||(1540924-1541073)
chr6 (1-119)||(16496245-16496363)
chr6 (1-166)||(30676710-30676874)
chr6 (3-166)||(8055029-8055191)
chr6 (3-126)||(25656629-25656751)
chr6 (3-126)||(25688502-25688624)
chr6 (3-166)||(25754809-25754971)
chr6 (3-166)||(26924640-26924802)
chr6 (1-166)||(34963371-34963535)
chr6 (3-147)||(1595549-1595692)
chr6 (19-215)||(18456735-18456930)
chr6 (1-235)||(16920519-16920750)
chr6 (3-124)||(20556934-20557054)
chr6 (15-221)||(25644335-25644543)
chr6 (3-166)||(3852017-3852179)
chr6 (19-153)||(18461895-18462028)
chr6 (6-126)||(16448566-16448686)
chr6 (1-235)||(22831504-22831737)
chr6 (38-239)||(25603267-25603467)
chr6 (27-231)||(15041441-15041644)
chr6 (1-182)||(20109141-20109322)
chr6 (1-175)||(35245587-35245758)
chr6 (4-122)||(19652199-19652316)
chr6 (1-115)||(28496477-28496591)
chr6 (1-115)||(29808888-29809002)
chr6 (1-98)||(27333241-27333338)
chr6 (1-98)||(27393981-27394078)
chr6 (1-215)||(8227416-8227631)
chr6 (19-184)||(18821782-18821946)
chr6 (1-122)||(23019409-23019528)
chr6 (38-239)||(25611605-25611805)
chr6 (1-61)||(25714418-25714478)
chr6 (1-115)||(1561304-1561418)
chr6 (15-115)||(9098518-9098620)
chr6 (15-118)||(19668386-19668491)
chr6 (19-235)||(11185524-11185737)
chr6 (2-119)||(19847997-19848114)
chr6 (12-115)||(4185827-4185930)
chr6 (2-148)||(23992429-23992572)
chr6 (49-119)||(27415943-27416011)
chr6 (21-72)||(33443068-33443119)
chr6 (182-230)||(5834388-5834436)
chr6 (182-230)||(20177096-20177144)
chr6 (182-230)||(22158847-22158895)
chr6 (1-47)||(22080799-22080845)
chr6 (27-68)||(21766718-21766759)
chr6 (4-53)||(31155465-31155514)
chr6 (4-68)||(19873120-19873184)
[»] chr3 (90 HSPs)
chr3 (1-231)||(14972855-14973085)
chr3 (1-231)||(18438535-18438765)
chr3 (3-231)||(40213611-40213838)
chr3 (1-236)||(13442275-13442510)
chr3 (1-240)||(17487857-17488096)
chr3 (1-231)||(25476275-25476505)
chr3 (1-240)||(17499339-17499578)
chr3 (1-235)||(23083247-23083481)
chr3 (1-230)||(26686888-26687117)
chr3 (4-235)||(14576719-14576949)
chr3 (1-240)||(20698317-20698555)
chr3 (1-230)||(43840933-43841162)
chr3 (1-231)||(11424653-11424879)
chr3 (1-239)||(12399210-12399448)
chr3 (18-221)||(42386428-42386632)
chr3 (3-215)||(24153115-24153326)
chr3 (13-235)||(14572602-14572823)
chr3 (3-182)||(29172567-29172745)
chr3 (3-146)||(36166598-36166739)
chr3 (2-166)||(13544024-13544187)
chr3 (3-166)||(9707607-9707769)
chr3 (3-166)||(10247723-10247885)
chr3 (7-166)||(12567564-12567722)
chr3 (3-166)||(17463178-17463340)
chr3 (3-166)||(34159326-34159488)
chr3 (3-166)||(45606907-45607069)
chr3 (3-166)||(55476491-55476653)
chr3 (3-153)||(28848624-28848773)
chr3 (3-166)||(7781347-7781509)
chr3 (3-166)||(8899094-8899256)
chr3 (3-166)||(16454281-16454443)
chr3 (3-126)||(17672626-17672748)
chr3 (3-166)||(38961891-38962053)
chr3 (3-125)||(6469175-6469296)
chr3 (14-215)||(21618460-21618650)
chr3 (3-166)||(13151790-13151953)
chr3 (3-166)||(13154255-13154418)
chr3 (3-126)||(15977515-15977637)
chr3 (3-126)||(17446695-17446816)
chr3 (3-166)||(50242822-50242984)
chr3 (1-147)||(43550497-43550643)
chr3 (3-117)||(55500942-55501055)
chr3 (5-166)||(16282811-16282971)
chr3 (19-166)||(53070653-53070799)
chr3 (3-126)||(12119764-12119887)
chr3 (3-126)||(15412429-15412552)
chr3 (5-166)||(41123892-41124049)
chr3 (3-111)||(8499518-8499625)
chr3 (1-215)||(24340628-24340843)
chr3 (15-239)||(30029855-30030078)
chr3 (7-126)||(32307684-32307802)
chr3 (3-103)||(44494809-44494908)
chr3 (1-115)||(13210333-13210447)
chr3 (137-216)||(14179569-14179648)
chr3 (4-122)||(15470928-15471046)
chr3 (4-182)||(16103784-16103960)
chr3 (137-239)||(16796684-16796786)
chr3 (3-122)||(10556985-10557104)
chr3 (3-110)||(53301562-53301669)
chr3 (4-182)||(16097332-16097509)
chr3 (1-118)||(14234488-14234605)
chr3 (19-215)||(52523633-52523831)
chr3 (4-115)||(12174265-12174376)
chr3 (3-122)||(27165250-27165369)
chr3 (2-148)||(46822267-46822413)
chr3 (1-215)||(37642170-37642385)
chr3 (4-126)||(49668071-49668193)
chr3 (18-215)||(23274705-23274903)
chr3 (2-148)||(12511059-12511205)
chr3 (3-102)||(17737236-17737337)
chr3 (4-106)||(9512924-9513026)
chr3 (4-106)||(9520899-9521001)
chr3 (19-122)||(37251165-37251270)
chr3 (19-122)||(43925977-43926082)
chr3 (3-64)||(28194693-28194755)
chr3 (3-56)||(45577947-45578000)
chr3 (7-126)||(1644670-1644787)
chr3 (19-116)||(12377940-12378039)
chr3 (19-122)||(22110349-22110454)
chr3 (81-182)||(2051138-2051239)
chr3 (4-68)||(856140-856204)
chr3 (4-68)||(23077530-23077594)
chr3 (1-63)||(14665398-14665460)
chr3 (1-215)||(22147431-22147645)
chr3 (164-215)||(36166747-36166799)
chr3 (1-63)||(14668554-14668616)
chr3 (21-70)||(13919350-13919399)
chr3 (4-68)||(14878569-14878633)
chr3 (4-68)||(15878104-15878168)
chr3 (4-68)||(17525211-17525275)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (3-231)||(16377413-16377639)
chr4 (5-231)||(14038653-14038879)
chr4 (1-240)||(44052830-44053069)
chr4 (1-235)||(12902758-12902992)
chr4 (1-235)||(16239856-16240089)
chr4 (1-239)||(7088878-7089116)
chr4 (1-217)||(16270140-16270355)
chr4 (1-235)||(7893704-7893935)
chr4 (2-235)||(22636437-22636669)
chr4 (7-239)||(23374241-23374473)
chr4 (1-184)||(7798775-7798958)
chr4 (3-215)||(54798669-54798872)
chr4 (3-215)||(14280316-14280518)
chr4 (3-215)||(44928829-44929042)
chr4 (1-172)||(6899892-6900062)
chr4 (1-119)||(52873369-52873487)
chr4 (1-166)||(19618172-19618336)
chr4 (3-166)||(18215274-18215436)
chr4 (3-166)||(12307-12469)
chr4 (3-182)||(1837494-1837671)
chr4 (3-166)||(15118352-15118514)
chr4 (3-166)||(44773087-44773249)
chr4 (3-166)||(52312510-52312672)
chr4 (1-235)||(17046488-17046719)
chr4 (3-166)||(3515007-3515169)
chr4 (3-166)||(19242699-19242861)
chr4 (3-166)||(44615288-44615450)
chr4 (3-166)||(50222339-50222501)
chr4 (3-153)||(18239432-18239581)
chr4 (1-235)||(14053188-14053421)
chr4 (3-166)||(23803265-23803427)
chr4 (3-126)||(51463908-51464030)
chr4 (3-215)||(44102214-44102425)
chr4 (3-146)||(8574844-8574985)
chr4 (7-126)||(15355364-15355483)
chr4 (1-126)||(14970747-14970871)
chr4 (3-166)||(12610950-12611105)
chr4 (1-86)||(3096294-3096379)
chr4 (15-215)||(52243099-52243302)
chr4 (1-215)||(15367691-15367905)
chr4 (1-215)||(15402704-15402918)
chr4 (4-126)||(12774011-12774132)
chr4 (1-126)||(15370019-15370144)
chr4 (3-126)||(7641232-7641344)
chr4 (19-182)||(13790-13953)
chr4 (1-215)||(15371203-15371417)
chr4 (1-215)||(15373484-15373698)
chr4 (1-126)||(16223533-16223658)
chr4 (137-235)||(17047958-17048056)
chr4 (19-153)||(21815598-21815731)
chr4 (1-110)||(39706299-39706408)
chr4 (1-115)||(15551818-15551932)
chr4 (138-229)||(3096782-3096872)
chr4 (15-118)||(12288211-12288316)
chr4 (15-182)||(43198492-43198661)
chr4 (4-104)||(8846360-8846460)
chr4 (2-166)||(22353835-22353999)
chr4 (6-111)||(20149832-20149936)
chr4 (19-239)||(6190481-6190701)
chr4 (49-119)||(43256162-43256230)
chr4 (19-122)||(46640453-46640558)
chr4 (164-215)||(8574784-8574836)
chr4 (197-231)||(15091093-15091127)
chr4 (38-103)||(16596686-16596751)
chr4 (82-122)||(15464930-15464970)
[»] chr7 (75 HSPs)
chr7 (3-231)||(3564254-3564482)
chr7 (1-240)||(9509190-9509429)
chr7 (1-235)||(12698832-12699067)
chr7 (3-215)||(18456319-18456530)
chr7 (1-239)||(26211996-26212235)
chr7 (1-235)||(38227482-38227715)
chr7 (1-235)||(10589040-10589273)
chr7 (3-215)||(48273392-48273594)
chr7 (1-236)||(16386132-16386368)
chr7 (15-233)||(15143925-15144143)
chr7 (1-166)||(13647326-13647491)
chr7 (1-166)||(18430710-18430874)
chr7 (2-235)||(40443393-40443624)
chr7 (3-166)||(456321-456483)
chr7 (3-166)||(11972496-11972658)
chr7 (3-166)||(14949122-14949284)
chr7 (3-166)||(15376713-15376875)
chr7 (3-182)||(16213684-16213861)
chr7 (3-166)||(16232520-16232682)
chr7 (3-166)||(18640272-18640434)
chr7 (3-166)||(20385123-20385285)
chr7 (3-166)||(21189595-21189757)
chr7 (3-166)||(24702238-24702400)
chr7 (3-166)||(32125491-32125653)
chr7 (3-166)||(41522917-41523079)
chr7 (3-166)||(41525379-41525541)
chr7 (4-166)||(11393287-11393448)
chr7 (7-153)||(24275175-24275320)
chr7 (3-126)||(16410059-16410181)
chr7 (3-166)||(27216860-27217022)
chr7 (3-126)||(44116509-44116631)
chr7 (1-235)||(27847719-27847950)
chr7 (1-206)||(2280033-2280237)
chr7 (3-126)||(3386333-3386455)
chr7 (3-166)||(24704688-24704847)
chr7 (3-126)||(13869346-13869469)
chr7 (1-123)||(67746-67868)
chr7 (3-126)||(13831373-13831495)
chr7 (3-215)||(17061866-17062077)
chr7 (7-126)||(38898416-38898535)
chr7 (4-122)||(18005650-18005768)
chr7 (1-115)||(34200787-34200901)
chr7 (3-183)||(20110556-20110724)
chr7 (1-122)||(22072914-22073036)
chr7 (1-98)||(28505321-28505418)
chr7 (4-110)||(811142-811248)
chr7 (1-115)||(16495403-16495517)
chr7 (4-113)||(44014182-44014291)
chr7 (1-118)||(47831808-47831925)
chr7 (39-215)||(12756622-12756797)
chr7 (4-119)||(16219719-16219834)
chr7 (1-215)||(19486649-19486864)
chr7 (66-166)||(26355983-26356083)
chr7 (66-166)||(26358435-26358535)
chr7 (1-115)||(11996033-11996147)
chr7 (1-115)||(15754893-15755007)
chr7 (15-221)||(1867895-1868101)
chr7 (15-122)||(16056343-16056449)
chr7 (26-221)||(15008398-15008594)
chr7 (1-122)||(10063817-10063938)
chr7 (27-176)||(15211484-15211633)
chr7 (6-68)||(18154894-18154956)
chr7 (49-119)||(2530140-2530208)
chr7 (4-106)||(14932749-14932851)
chr7 (4-106)||(15356184-15356286)
chr7 (4-106)||(15360298-15360400)
chr7 (19-113)||(20220194-20220290)
chr7 (15-106)||(12901338-12901431)
chr7 (4-68)||(12187019-12187083)
chr7 (4-68)||(17138113-17138177)
chr7 (88-183)||(15113031-15113125)
chr7 (19-70)||(18203831-18203882)
chr7 (1-63)||(2832499-2832561)
chr7 (15-70)||(14044761-14044817)
chr7 (15-70)||(14354791-14354847)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-231)||(16490-16720)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (1-235)||(22337116-22337350)
chr2 (1-230)||(23060514-23060742)
chr2 (1-231)||(23660024-23660253)
chr2 (1-224)||(23076443-23076666)
chr2 (1-235)||(22731120-22731354)
chr2 (1-239)||(23654268-23654506)
chr2 (1-235)||(23285866-23286096)
chr2 (1-235)||(22738066-22738299)
chr2 (3-239)||(298696-298933)
chr2 (1-235)||(38002-38234)
chr2 (3-166)||(22105412-22105575)
chr2 (1-235)||(20309109-20309340)
chr2 (3-166)||(18808943-18809105)
chr2 (3-166)||(23130862-23131024)
chr2 (3-166)||(23133329-23133491)
chr2 (3-166)||(23709532-23709694)
chr2 (3-166)||(23712013-23712175)
chr2 (3-166)||(26505379-26505541)
chr2 (3-166)||(26507857-26508019)
chr2 (3-166)||(34402522-34402684)
chr2 (3-166)||(39682313-39682475)
chr2 (3-153)||(23135590-23135739)
chr2 (1-166)||(32214921-32215085)
chr2 (3-166)||(571397-571559)
chr2 (3-166)||(6725995-6726157)
chr2 (3-166)||(24367774-24367936)
chr2 (6-166)||(21155060-21155219)
chr2 (3-166)||(24898195-24898358)
chr2 (3-166)||(24900678-24900841)
chr2 (3-166)||(24903155-24903318)
chr2 (3-166)||(24905632-24905795)
chr2 (3-166)||(24908107-24908270)
chr2 (3-166)||(32039498-32039660)
chr2 (3-153)||(45029867-45030016)
chr2 (5-166)||(43137301-43137461)
chr2 (3-166)||(28577099-28577261)
chr2 (158-240)||(27753733-27753815)
chr2 (1-148)||(23103370-23103515)
chr2 (1-221)||(23708518-23708737)
chr2 (3-126)||(24529569-24529691)
chr2 (5-122)||(28405981-28406099)
chr2 (1-215)||(19671831-19672043)
chr2 (3-126)||(38967374-38967497)
chr2 (4-122)||(25175854-25175972)
chr2 (1-73)||(8946658-8946730)
chr2 (1-63)||(23040247-23040309)
chr2 (1-126)||(22134203-22134326)
chr2 (4-184)||(22799063-22799243)
chr2 (4-184)||(23019643-23019823)
chr2 (4-118)||(7679589-7679702)
chr2 (1-98)||(23071972-23072069)
chr2 (7-148)||(25616192-25616333)
chr2 (19-239)||(32451811-32452031)
chr2 (30-122)||(7732-7824)
chr2 (19-122)||(23207296-23207401)
chr2 (6-61)||(24643054-24643109)
chr2 (19-221)||(20520092-20520295)
chr2 (89-166)||(24642856-24642933)
chr2 (15-115)||(18786907-18787009)
chr2 (26-122)||(23004774-23004872)
chr2 (21-70)||(23287384-23287433)
chr2 (21-69)||(26392403-26392451)
chr2 (19-221)||(22413035-22413240)
chr2 (19-122)||(23791292-23791397)
chr2 (81-122)||(24697604-24697645)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (2-231)||(39479-39707)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (1-231)||(17105-17337)
scaffold0056 (19-215)||(79235-79430)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (2-231)||(75105-75333)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (7-231)||(25955-26179)
scaffold0122 (3-146)||(44682-44825)
scaffold0122 (125-231)||(33385-33491)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (5-231)||(4513-4738)
scaffold0228 (5-231)||(12095-12320)
scaffold0228 (5-231)||(22047-22272)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-240)||(13212-13451)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-235)||(51914-52148)
scaffold0011 (1-239)||(167861-168098)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-235)||(38762-38995)
scaffold0145 (1-217)||(32943-33158)
scaffold0145 (3-126)||(9749-9871)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-239)||(25897-26134)
scaffold0026 (1-239)||(39859-40096)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (3-231)||(339840-340065)
scaffold0003 (3-166)||(158450-158612)
scaffold0003 (49-119)||(71350-71418)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (1-204)||(3103-3306)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-240)||(1852-2091)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (3-231)||(22886-23113)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-235)||(3471-3705)
scaffold0292 (1-231)||(344-573)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-230)||(8424-8649)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (1-231)||(39914-40143)
scaffold0080 (19-121)||(19883-19987)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-240)||(6002-6244)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-239)||(4850-5088)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-239)||(931-1168)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (63-226)||(3424-3588)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (1-211)||(16114-16323)
scaffold0120 (1-217)||(32863-33076)
scaffold0120 (1-217)||(45929-46142)
scaffold0120 (1-61)||(17389-17449)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-235)||(8480-8710)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (18-240)||(24182-24406)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (82-231)||(27912-28061)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (52-230)||(13144-13322)
scaffold0175 (1-115)||(34124-34238)
scaffold0175 (1-56)||(274-329)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-235)||(32068-32299)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-235)||(20911-21146)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-235)||(13498-13730)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-235)||(1953-2187)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-235)||(15351-15583)
scaffold0114 (4-68)||(7295-7359)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-235)||(4713-4946)
scaffold0358 (65-235)||(1-170)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-235)||(10312-10543)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-235)||(16283-16514)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (1-119)||(28415-28533)
scaffold0046 (1-115)||(11293-11407)
scaffold0046 (1-115)||(1998-2112)
scaffold0046 (1-53)||(4553-4605)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (138-240)||(124723-124825)
scaffold0021 (1-148)||(174767-174912)
scaffold0021 (1-69)||(121767-121835)
scaffold0021 (19-118)||(136370-136471)
scaffold0021 (19-118)||(145078-145179)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-235)||(1290-1521)
scaffold0106 (1-235)||(7267-7498)
scaffold0106 (3-68)||(15291-15356)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (2-126)||(10772-10895)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (3-166)||(4694-4856)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (3-166)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (3-166)||(37821-37983)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (3-166)||(94411-94573)
scaffold0023 (7-166)||(17440-17598)
scaffold0023 (3-153)||(44454-44604)
scaffold0023 (4-122)||(100378-100496)
scaffold0023 (4-122)||(40173-40291)
scaffold0023 (1-71)||(119876-119947)
scaffold0023 (4-207)||(38394-38596)
scaffold0023 (4-71)||(101503-101571)
scaffold0023 (108-207)||(23581-23679)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (3-153)||(13392-13541)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (59-231)||(853-1021)
scaffold0395 (1-66)||(4888-4953)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (3-215)||(16784-16995)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (3-166)||(13947-14109)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (3-166)||(136680-136842)
scaffold0028 (3-166)||(139149-139311)
scaffold0028 (3-166)||(144087-144249)
scaffold0028 (3-166)||(134211-134373)
scaffold0028 (3-166)||(141618-141780)
scaffold0028 (2-122)||(62200-62317)
scaffold0028 (4-126)||(132662-132784)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (3-146)||(116430-116571)
scaffold0022 (19-122)||(128968-129072)
scaffold0022 (26-122)||(78348-78445)
scaffold0022 (164-215)||(116579-116631)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (7-166)||(501088-501246)
scaffold0001 (3-206)||(85539-85742)
scaffold0001 (4-122)||(160688-160805)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (2-126)||(9241-9364)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (3-166)||(82072-82234)
scaffold0037 (15-182)||(22610-22776)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-235)||(938-1169)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (19-218)||(20328-20524)
scaffold0031 (1-167)||(128752-128917)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-126)||(11286-11410)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (3-166)||(106-268)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (3-126)||(40400-40522)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (1-126)||(12289-12413)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-235)||(51583-51814)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (3-206)||(161049-161252)
scaffold0007 (83-206)||(164550-164674)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (6-166)||(4300-4459)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (59-235)||(6669-6845)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-122)||(6536-6657)
scaffold0621 (15-182)||(8481-8650)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (3-166)||(12064-12220)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (3-235)||(5017-5246)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (4-122)||(19268-19386)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (137-235)||(1051-1149)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (3-206)||(2088-2291)
scaffold0247 (1-215)||(17932-18147)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (17-126)||(29946-30054)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (3-126)||(4214-4337)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-117)||(11447-11563)
scaffold0235 (184-235)||(11399-11450)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (21-231)||(4545-4754)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-210)||(46996-47202)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (4-122)||(2805-2923)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (160-231)||(10323-10394)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (1-182)||(11465-11646)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-182)||(38195-38376)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (3-115)||(15664-15776)
scaffold0261 (4-89)||(1339-1424)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (15-182)||(10481-10647)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (159-235)||(3640-3716)
scaffold0165 (159-235)||(7704-7780)
scaffold0165 (15-206)||(27663-27855)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (12-147)||(129917-130051)
scaffold0010 (26-221)||(60614-60811)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (4-126)||(45787-45909)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (4-122)||(14696-14814)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-110)||(6134-6243)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (15-206)||(16014-16206)
scaffold0357 (19-206)||(13147-13336)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (12-122)||(5655-5765)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (6-111)||(1336-1440)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (4-147)||(133-275)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (3-122)||(38701-38820)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-115)||(1075-1189)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-122)||(32539-32657)
scaffold0034 (19-239)||(51766-51985)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-110)||(15788-15897)
scaffold0020 (4-67)||(178898-178961)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (30-182)||(53488-53640)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (179-235)||(17873-17929)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-108)||(6612-6719)
scaffold0333 (1-108)||(13992-14099)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (4-122)||(2644-2762)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (1-118)||(1037-1154)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-118)||(12767-12884)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (19-122)||(1051-1154)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (19-122)||(12587-12690)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (15-122)||(10542-10649)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (4-122)||(1086-1204)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (4-106)||(23898-24000)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (4-207)||(23843-24048)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (27-207)||(16264-16442)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (12-115)||(6824-6927)
scaffold0556 (75-122)||(8090-8137)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (192-240)||(20595-20643)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (15-118)||(8075-8180)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (4-118)||(12943-13057)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (4-71)||(28818-28887)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (26-122)||(38342-38440)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (19-122)||(6281-6386)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (15-122)||(25121-25229)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (57-122)||(2217-2281)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (21-182)||(7998-8161)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (21-70)||(206575-206624)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (57-182)||(225465-225588)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (4-68)||(10575-10639)
scaffold0297 (4-64)||(15736-15796)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (4-184)||(4741-4921)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (4-67)||(36454-36517)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (49-119)||(15418-15486)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (27-176)||(192920-193070)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (19-122)||(97024-97129)
scaffold0006 (19-122)||(106302-106407)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (19-61)||(11982-12024)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (88-126)||(13092-13130)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (4-68)||(1881-1945)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (4-68)||(21856-21920)
scaffold0210 (4-68)||(29748-29812)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (4-68)||(14664-14728)
scaffold0081 (4-68)||(23679-23743)
scaffold0081 (4-68)||(39103-39167)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (19-118)||(569-669)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (112-218)||(32544-32650)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (15-118)||(103632-103737)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (19-122)||(267679-267784)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (4-106)||(29558-29660)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (81-122)||(1795-1836)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (91-179)||(1169-1257)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (4-68)||(6095-6159)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (4-68)||(26828-26892)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (4-68)||(69794-69858)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 9077953 - 9078183
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9077953 catcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaa 9078052  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078053 gtgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 9078152  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078153 acagattataattaacatcatcattaagtct 9078183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529449
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaat 24529322  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529323 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24529422  T
Q  203 agattataattaacatcatcattaagt 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24529423 agattatagttaacatcatcattaagt 24529449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 25421533 - 25421771
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25421533 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 25421632  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25421633 ttgcaagtcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttc 25421732  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25421733 acagattataattaacatcatcattaagtctcaatgcta 25421771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 25431396 - 25431633
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25431396 catcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 25431494  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     |||||||||||||||||| || | | |||| |||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25431495 ttgcaagtcaacaacatcttaaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttc 25431594  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25431595 acagattataattaacatcatcattaagtctcaatgcta 25431633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23390616 - 23390377
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  23390616 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 23390517  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23390516 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagcttc 23390417  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23390416 acagattataattaacatcctcattaagtcttaatactat 23390377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 1096468 - 1096698
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| ||| |||||||||||||||    
T  1096468 catcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaa 1096567  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1096568 atgcaaatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttc 1096667  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||    
T  1096668 ataggttataattaacatcctcattaagtct 1096698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24493570 - 24493803
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24493570 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 24493668  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24493669 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaatagcttc 24493768  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24493769 acagattataattaacatcattattaagtcttaat 24493803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8286963 - 8286728
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaa-catcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  8286963 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatca 8286864  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||  ||| |||   |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286863 attgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 8286764  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8286763 cacataatataattaacatcttcattaagtcttaat 8286728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13025312 - 13025545
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  13025312 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacatattgatatcaa 13025410  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||| |||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13025411 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaacttc 13025510  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025511 acatattataattaacatcatcattaagtcttaat 13025545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13095496 - 13095729
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  13095496 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacatattgatatcaa 13095594  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||| |||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13095595 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaacttc 13095694  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095695 acatattataattaacatcatcattaagtcttaat 13095729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 22075019 - 22075258
Alignment:
Q  1 catcatcat-cttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  22075019 catcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatca 22075118  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    | ||||| |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22075119 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 22075218  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22075219 cacatattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 22075258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412388
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 22412285  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||      ||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412286 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22412375  T
Q  203 agattataattaa 215  Q
    |||||||||||||    
T  22412376 agattataattaa 22412388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21293089 - 21292856
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  21293089 catcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagtatgacataataatatcaa 21292992  T
Q  101 -atgc-aagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 198  Q
     || | || ||| |||||||| |  |||||||| ||   ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| ||    
T  21292991 tattcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacaact 21292893  T
Q  199 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21292892 tcacagattataattaacctcattattaagtcttaat 21292856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 21997654 - 21997547
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21997654 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 21997555  T
Q  101 atgcaagt 108  Q
    ||||||||    
T  21997554 atgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21808509 - 21808343
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  21808509 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaa 21808410  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacat 167  Q
     ||||| |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  21808409 ttgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacat 21808343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264768
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 264832  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  264831 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 264768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330096
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 29330032  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  29330033 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29330096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346142
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29346078  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  29346079 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29346142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363546
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39363482  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  39363483 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39363546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732953
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10733004  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttata 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  10733003 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 10732953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 21729184 - 21729066
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  21729184 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaa 21729085  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatct 119  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  21729084 ttgcaattcaacaacatct 21729066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909174
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20909110  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  20909111 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348615
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29348551  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  29348552 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29348615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351088
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29351024  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  29351025 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29351088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245365
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 42245429  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  42245428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 42245365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581151
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 11581263  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||  ||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| || |||||    
T  11581262 gcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataa-caacatcaa-tcatcataaatcaacttca 11581165  T
Q  202 cagattataattaa 215  Q
    |||||||| |||||    
T  11581164 cagattatcattaa 11581151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027555
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32027491  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  32027492 ccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32027555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245285
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39245234  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttata 153  Q
    ||||||||| ||| || ||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  39245235 gcaagtcaataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatata 39245285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154783
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaca-ca---gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 36154847  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  36154846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 36154783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20902049
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcat-caacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaag 20902074  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  20902073 tgcaagtcaacaacgtctcaattat 20902049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154654
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 2154678  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  2154677 gcaagtcaacaacgtctcaattat 2154654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21986164 - 21986037
Alignment:
Q  104 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 203  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21986164 caagtcaacaacatcttcattataaattcatatctcaagtaatgcatataacattttatcacctcatattcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 21986065  T
Q  204 gattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21986064 aattatagttaacatcatcatcaagtct 21986037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319073
Alignment:
Q  6 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 105  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 18319095  T
Q  106 agtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    |||||| |||| ||||||||||    
T  18319094 agtcaatcaacgtctcaattat 18319073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619557
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38619532  T
Q  103 gcaagtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||    
T  38619533 gcaagtcaatcaacgtctcaattat 38619557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775715
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaat 10775740  T
Q  103 gcaagtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||    
T  10775739 gcaagtcaatcaacgtctcaattat 10775715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061175
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| | | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31061166  T
Q  103 gcaagtcaa 111  Q
    |||||||||    
T  31061167 gcaagtcaa 31061175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565723
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21565644  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  21565645 gcaagtcatcaacatttcaaatat-caaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 21565723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064634
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 103  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatg 23064610  T
Q  104 caagtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    |||||||| |||| ||||||||||    
T  23064611 caagtcaatcaacgtctcaattat 23064634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 207
Target Start/End: Original strand, 37723910 - 37724108
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 105  Q
    |||||||| || ||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||| |||||||| || |||||||||  |    
T  37723910 catcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatcaaattaa 37724006  T
Q  106 agtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc--ttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 203  Q
    | ||| |||||||||||| || || |||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||||  ||  |||||||||||||    
T  37724007 attcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaatta-aacattatatcacatcatattcaacactaacatctc-aaaacagcttcaca 37724104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22107356 - 22107259
Alignment:
Q  138 tcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22107356 tcaagtaatgcataatatattatatcacatcataatcaacaacaacacaccttaaacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaat 22107259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Original strand, 18418594 - 18418793
Alignment:
Q  14 atcaacttagatcgactcatacagcttagttaaa-taacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 112  Q
    |||||||||||  ||||| | || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||| || ||    
T  18418594 atcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatac--aaacagcatgacataataatatcatttgcaattc-ac 18418690  T
Q  113 aacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataa 211  Q
    ||||||| || ||| |||| | |  ||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18418691 aacatcttaa-tattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttcacaggttataa 18418789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766035
Alignment:
Q  66 cagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcac 165  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||      ||||     ||  ||    
T  20766174 cagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtacgac 20766086  T
Q  166 atcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  20766085 atcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 20766035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20917992
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||      
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacaaaataatataaa-- 20918014  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
      ||||||||||| ||||||||||    
T  20918013 --aagtcaacaacgtctcaattat 20917992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21329617 - 21329500
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| ||||||     
T  21329617 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcataatataacaatatcg 21329519  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatc 118  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  21329518 aattcaagtcatcaacatc 21329500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144271
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 117  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
Q  118 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaac 216  Q
    |||||  || ||   |||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||  ||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||| | || |||||     
T  22144167 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaattcatcttataacaacttcacaggtcatcattaat 22144266  T
Q  217 atcat 221  Q
    |||||    
T  22144267 atcat 22144271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959538
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||  |||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaat 22959551  T
Q  103 gcaagtcaacaac 115  Q
    |||| ||||||||    
T  22959550 gcaaatcaacaac 22959538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026942
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatcc-aaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T
Q  116 atc 118  Q
    |||    
T  20026944 atc 20026942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 111
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067214
Alignment:
Q  6 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 24067208  T
Q  106 agtcaa 111  Q
    ||||||    
T  24067209 agtcaa 24067214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 19660955 - 19660884
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 71  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19660955 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 19660884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 36314578 - 36314675
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 98  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  36314578 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 21502276 - 21502158
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||| ||||||     
T  21502276 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat-gtaaatcagcatgatataacaatatcg 21502178  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatct 119  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  21502177 aatgcaagtcatcatcatct 21502158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 26012153 - 26012034
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||    
T  26012153 catcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaagcaacatgatataacaatatca 26012057  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    ||||  | |||||||||||||||    
T  26012056 aatgtgaatcaacaacatctcaa 26012034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517174
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||||||  |||   |||| || ||||||| ||||||||     
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 17517221  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 148  Q
     |||| |||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  17517220 cgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgc 17517174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 40725854 - 40726069
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||| |||||||| | |||| || |||||||| |||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  40725854 catcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaagcatcatgatataataatatcg 40725952  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagct 198  Q
     | | |||| ||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  40725953 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagct 40726052  T
Q  199 tcacagattataattaa 215  Q
    |||||||| || |||||    
T  40726053 tcacagatcatcattaa 40726069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 19668899 - 19669013
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| |||| ||| |||| ||||||     
T  19668899 catcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-aaatcatcgtgatataacaatatcg 19668997  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    ||||||| ||||||||    
T  19668998 aatgcaaatcaacaac 19669013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Original strand, 29448052 - 29448126
Alignment:
Q  49 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29448052 aacaacagcaacataggcagtatat-aaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 29448126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 175
Target Start/End: Original strand, 18356364 - 18356488
Alignment:
Q  49 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||  | ||| |||  ||  || |||||||||    
T  18356364 aacaacagcaacataggcagcatac--aaacagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaatatttcttaagtaatgc 18356461  T
Q  149 ttataacactatatcacatcataatca 175  Q
     || |||| |||||||||| |||||||    
T  18356462 ataaaacattatatcacattataatca 18356488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 21873254 - 21873453
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 103  Q
    |||||||||  ||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| | | || |||||| | ||||||||||       
T  21873254 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataggcaggatacaacatcagcatgacttcataatatcaatct 21873353  T
Q  104 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 203  Q
    ||  |   |||||||| ||  || |||| ||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||    
T  21873354 cattt---caacatcttaaccattcaataatatcttaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcaca 21873449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704139
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcag 26704139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973872
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcag 26973872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 20910869 - 20910801
Alignment:
Q  49 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 119  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  20910869 aacaacagcaacatagacagcatac--aaacagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatct 20910801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178218
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||  ||||||  |||||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatat-aaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  22178224 atctcaa 22178218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806850
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagc 57  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaacagc 20806850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  16 caacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 69  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032387
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 22032387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 69  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Original strand, 23201360 - 23201445
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacat 89  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||| | ||||| |||||||    
T  23201360 catcatcttgttcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacattatgacat 23201445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 23501472 - 23501403
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac 73  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| || |||||| ||||    
T  23501472 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcacaggcagaatac 23501403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 18770118 - 18770054
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  18770118 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggtcgaataacaatagcaacataggcag 18770054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50210103
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 50210234  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210233 atgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 50210134  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210133 acagattataattaacatcatcattaagtct 50210103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34510011
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaat 34509882  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  34509883 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcaa 34509982  T
Q  203 agattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509983 agattataattaacatcatcattaagtct 34510011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22532270 - 22532500
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  22532270 catcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcca 22532369  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| |||||||||||| || ||| || |||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532370 ttgcaattcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 22532469  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  22532470 acagttcataaataacatcatcattaagtct 22532500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27250849 - 27250611
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27250849 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 27250750  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  || | ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27250749 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttc 27250650  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||    
T  27250649 acagattataattaacctcttcattaagtatcaatgcta 27250611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 21026681 - 21026919
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||| |||  |||||||    
T  21026681 catcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatcaa 21026780  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21026781 ttgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacagcaacacatcttaaacagcttc 21026880  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21026881 acagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 21026919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135420
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||     
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatcat 20135287  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| |||||||||||| || ||| |||| | |  ||||||||||| || |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20135288 gtgcaattcaacaacatcttaagtattcaataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatcatatcataatgaacatcaacacatcttaaacagcttc 20135387  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtctta 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20135388 acagattataattaacaacatcattaggtctta 20135420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468604
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| | |||| |||||||| ||||||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaa 22468717  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22468716 ttgcaattcaacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcacatcataat-tacatcagcacatcttaaacagcttc 22468618  T
Q  201 acagattataatta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  22468617 acagattataatta 22468604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433222
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg---gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaat 433108  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||| |    
T  433109 gcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttta 433208  T
Q  202 cagattataattaa 215  Q
    ||||| || |||||    
T  433209 cagatcatcattaa 433222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593719
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23593799  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||  |||| |||||||||    
T  23593798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 23593719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354458
Alignment:
Q  77 aacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaa 176  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 22354517  T
Q  177 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22354516 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22354458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840889
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 21840864  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  21840865 tgcaagtcaacaacgtctcaattat 21840889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13989028
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13988964  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  13988965 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13989028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923291
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21923355  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  21923354 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21923291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 45575007 - 45574882
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||    
T  45575007 catcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaa 45574908  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  45574907 atgcaagtcaacaacgtctcaattat 45574882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475087
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21475151  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  21475150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21475087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776850
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaat 29776786  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  29776787 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29776850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612475
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31612411  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  31612412 gcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 31612475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362095
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-cagtatataaaaacaacatgacataataatatcaa 16362013  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||  |||| |||||||||    
T  16362014 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 16362095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 138 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22356158 - 22356055
Alignment:
Q  138 tcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaa-catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 236  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22356158 tcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 22356059  T
Q  237 ctat 240  Q
    ||||    
T  22356058 ctat 22356055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 138 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22357844 - 22357741
Alignment:
Q  138 tcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaa-catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 236  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22357844 tcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 22357745  T
Q  237 ctat 240  Q
    ||||    
T  22357744 ctat 22357741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298298
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaat 29298234  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  29298235 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29298298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275403
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 16275428  T
Q  103 gcaagtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||    
T  16275427 gcaagtcaatcaacgtctcaattat 16275403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13213026 - 13212821
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13213026 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 13212928  T
Q  101 atgcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagct 198  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| || ||    
T  13212927 atgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcaact 13212829  T
Q  199 tcacagat 206  Q
    ||||||||    
T  13212828 tcacagat 13212821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347161
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21347059  T
Q  103 gcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 200  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  21347060 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 21347158  T
Q  201 aca 203  Q
    |||    
T  21347159 aca 21347161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38801507 - 38801277
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |   |||| || |||||||| ||||||    
T  38801507 catcatcatcttcaacatcttaga-cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgc---aacagcaagacataattatatca 38801412  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    ||| ||| ||| |||||| | |  |||||||| ||   ||||||||||| || |||| |||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  38801411 aattcaattcatcaacatattatatatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcgtaatcaacaacaacatatcttattcagctt 38801313  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||    
T  38801312 cacaaattatagttaatctcattattaagtcttaat 38801277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 21342096 - 21342219
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21342096 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21342194  T
Q  103 gcaagtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||    
T  21342195 gcaagtcaatcaacgtctcaattat 21342219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707289
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21707265  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  21707266 gcaagtcaacaacgtctcaattat 21707289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711831
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21711807  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  21711808 gcaagtcaacaacgtctcaattat 21711831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 20847274 - 20847173
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||  |||||||    
T  20847274 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 20847175  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  20847174 at 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 15860171 - 15860064
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15860171 tcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatattaaat 15860073  T
Q  103 gcaagtcaa 111  Q
    |||||||||    
T  15860072 gcaagtcaa 15860064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 21754052 - 21754170
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  21754052 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgca 21754150  T
Q  106 agtcaacaacatctcaattat 126  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  21754151 a-tcaacaacatctcaattat 21754170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 216
Target Start/End: Original strand, 48603651 - 48603730
Alignment:
Q  137 ctcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 216  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603651 ctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 48603730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123107
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |  |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacacaa-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaatgtctcaattat 22123107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921868
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22921888  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  22921887 gcaaatcaacaacatctcaa 22921868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Original strand, 33681011 - 33681188
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  33681011 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 33681109  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  33681110 gcaagtcgtcaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 33681188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896255
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 117  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
Q  118 ctcaa 122  Q
    |||||    
T  21896259 ctcaa 21896255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Original strand, 22237631 - 22237773
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  22237631 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22237729  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatg 147  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  22237730 gcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatg 22237773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 14295671 - 14295557
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  14295671 catcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcg 14295573  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||| || ||||||||    
T  14295572 aatgtaaatcaacaac 14295557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454606
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861510
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 117  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
Q  118 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatca 181  Q
    |||||  || ||   |||| ||||||||||  ||||  | |||||||||| |||| ||||||||    
T  21861573 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 111
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389261
Alignment:
Q  6 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 105  Q
    ||||||| |||||| ||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 40389255  T
Q  106 agtcaa 111  Q
    ||||||    
T  40389256 agtcaa 40389261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 115
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248394
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 20248381  T
Q  103 gcaagtcaacaac 115  Q
    |||| ||||||||    
T  20248382 gcaaatcaacaac 20248394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 115
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918719
Alignment:
Q  16 caacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 114  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||| || |||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 20918718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21788159 - 21787979
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 103  Q
    |||||||||  ||| |||| || ||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||   || | |||| |||||| |  ||||||||| |     
T  21788159 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataaccatagcagcataggcagatcacaacaacagcatgacttcgtaatatcaattt 21788060  T
Q  104 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaaca 184  Q
    ||  |||||||||||| ||| || |||| ||| || |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21788059 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacattatataacatcataatcaacatcaaca 21787979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758872
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaa 16758762  T
Q  112 caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattata 210  Q
    ||||||| |||  || ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| ||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||| ||     
T  16758763 caacatcacaa-cattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatattataacagcttcacagatcatc 16758861  T
Q  211 attaacatcat 221  Q
    ||||| |||||    
T  16758862 attaatatcat 16758872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35260992
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 117  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||   |    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca---t 35261085  T
Q  118 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattat 209  Q
    |||||  || ||  ||||| ||||||||||| ||||  | || ||||||| || | |||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||    
T  35261084 ctcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacaacttcacatattat 35260992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714754
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataata-----atatc 98  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||| | ||||  ||||||| |||     |||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacatcatataacgatatc 21714645  T
Q  99 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc--ttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 196  Q
    ||||  ||   | |||||||||||| || || |||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||||  || | |||||    
T  21714646 aaataaaaacaagcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaatta-aacattatatcacatcatattcaacactaacatctcat-aacag 21714743  T
Q  197 cttcacagatt 207  Q
    |||||||||||    
T  21714744 cttcacagatt 21714754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50614114
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50614121  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  50614120 atctcaa 50614114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621942
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50621949  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  50621948 atctcaa 50621942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41050033
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaa-acatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 116  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||  ||| |  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  117 tctcaa 122  Q
    ||||||    
T  41050038 tctcaa 41050033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52927993
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 98  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 52927993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368284
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcata-taaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 16368291  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  16368290 atctcaa 16368284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22130978 - 22130850
Alignment:
Q  49 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||| || |||||||   ||||||||| ||| | ||| ||| |||||||    
T  22130978 aacaacagcaacataggcagtat-ccaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattat-caaacttaagtcatgtaatgc 22130884  T
Q  149 ttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
     ||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  22130883 atatacaattatataacattataagcaacatcaa 22130850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Original strand, 33797570 - 33797638
Alignment:
Q  49 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 119  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  33797570 aacaacagcaacatatgcagcatac--aaacaacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatct 33797638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20847161 - 20847101
Alignment:
Q  180 caacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||    
T  20847161 caacacatctttaaacagcttcatagattatggttaacctcttcattaagtcttaatgcta 20847101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 42865330 - 42865266
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42865330 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcaacatatgcag 42865266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 21161720 - 21161778
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaaca 61  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  21161720 catcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaaca 21161778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28648934
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaa 28649065  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649064 atgcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 28648965  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28648964 acatattataattaacatcatcattaagtct 28648934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 6759259 - 6759487
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  6759259 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 6759358  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagctt 199  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6759359 atgcaagt---caacatctcaattatacactcataattcaattaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagctt 6759455  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759456 cacagattataattaacatcatcattaagtct 6759487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16092462 - 16092231
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16092462 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 16092363  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16092362 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataatttaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacaactt 16092263  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16092262 cgcatattataattaacatcatccttaagtct 16092231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18818529 - 18818295
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18818529 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 18818430  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     || ||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818429 ttgtaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 18818330  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18818329 acagattataattaacatcctcattaagtcttaat 18818295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 22875066 - 22875291
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22875066 catcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaa 22875164  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22875165 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagctt 22875264  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcatta 226  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22875265 cacagattataattaacatcaccatta 22875291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22626737 - 22626966
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22626737 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaa 22626835  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    || ||| |||||||||||| || ||| |||| |||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22626836 atacaaatcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagcttc 22626935  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22626936 acagattataattaacatcctcattaagtct 22626966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21924048 - 21923814
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  21924048 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaa 21923949  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     |||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||  ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21923948 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataaccttattttgcatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttc 21923849  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923848 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 21923814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 20536209 - 20536443
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20536209 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 20536308  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20536309 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatcttaaacaacttc 20536408  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20536409 acagattataattaacatcctcattaagtcttaat 20536443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 7372779 - 7373001
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7372779 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 7372878  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  ||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372879 ttgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgct--------tatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 7372970  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7372971 acagattataattaacatcctcattaagtct 7373001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 23406380 - 23406611
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  23406380 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 23406479  T
Q  101 atgcaagtcaac--aacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 198  Q
     |||||||||||  | ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  23406480 ttgcaagtcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacatagtcaacatcaacacatcttaaacaact 23406579  T
Q  199 tcacagattataattaacatcatcattaagtc 230  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23406580 tcacatattataattaacatcctcattaagtc 23406611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18879351 - 18879118
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||    
T  18879351 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acataataatatcaa 18879257  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  18879256 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatctt-atcagcttc 18879158  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18879157 acagattatagttaacatcatcattaagtcttgatgctat 18879118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21919120 - 21918886
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21919120 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 21919021  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatac-aatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
     ||||| |||||||||||| || ||| | ||| ||   ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21919020 ttgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcagcagcaacacatcttaaacagctt 21918922  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21918921 cacagatcgtaattaacctcatcgttaagtcttaat 21918886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 31971258 - 31971490
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31971258 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaa 31971356  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     | ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  31971357 ttccaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacatcttc 31971455  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  31971456 acagattataattaacctcattgttaagtcttaat 31971490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648788
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||||     
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatcat 23648653  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     |||||  ||||||||||| || ||| |||| | |  |||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23648654 ttgcaatacaacaacatcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctta 23648753  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23648754 acagattataattaacatcatcattaggtcttaat 23648788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45131116 - 45130884
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  45131116 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagcatgacataataatatcaa 45131019  T
Q  101 atgcaagt-caacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
     | ||| | || |||||||| |  |||||||| ||   ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  45131018 tttcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcatcaacaacaaatcttatacagctt 45130920  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45130919 cacagattataattaacctcattattaagtcttaat 45130884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16199764 - 16199532
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  16199764 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattc--aaacaacatgacataataatatca 16199667  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    | | ||| ||| | |||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  16199666 atttcaattcatctacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatattacatcataatcaacaacaacatatcttatacagctt 16199568  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  16199567 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 16199532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409444
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14409508  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  14409507 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14409444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484564
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 1484500  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  1484501 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 1484564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853292
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 5853356  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  5853355 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 5853292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413316
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 106  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 16413376  T
Q  107 gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  16413375 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 16413316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403389
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20403325  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  20403326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20403389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001915
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22001851  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  22001852 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22001915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598399
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41598286  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||| ||||    
T  41598287 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagtttca 41598385  T
Q  202 cagattataattaa 215  Q
    ||||| || |||||    
T  41598386 cagatcatcattaa 41598399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203231
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15203295  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  15203294 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15203231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046235
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 20046259  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  20046258 gcaagtcaacaacgtctcaattat 20046235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219918
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatac-aaaatagtatgacataataatatcaaat 26219814  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||      ||||     ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26219815 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttca 26219904  T
Q  202 cagattataattaa 215  Q
     ||||||| |||||    
T  26219905 tagattatcattaa 26219918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483442
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4483378  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  4483379 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4483442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542413
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4542437  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  4542436 gcaagtcaacaacgtctcaattat 4542413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21389570 - 21389353
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||| ||||||||||| ||||||    
T  21389570 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatca 21389474  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  21389473 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagctt 21389375  T
Q  200 cacagattataattaacatcat 221  Q
    |||| |||| ||||||| ||||    
T  21389374 cacatattacaattaacttcat 21389353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225268
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  || ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-caatatac-aaaacagtatgacataataatatcaaat 26225312  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaat 146  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  26225311 acaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26225268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21396100 - 21395888
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||| ||||| ||||||    
T  21396100 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatca 21396004  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||  ||||||    
T  21396003 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagctt 21395905  T
Q  200 cacagattataattaac 216  Q
    ||||||||| |||||||    
T  21395904 cacagattacaattaac 21395888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21790593 - 21790381
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||| ||||| ||||||    
T  21790593 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatca 21790497  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||  ||||||    
T  21790496 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagctt 21790398  T
Q  200 cacagattataattaac 216  Q
    ||||||||| |||||||    
T  21790397 cacagattacaattaac 21790381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224041
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| | || || ||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaataaag-caatatacaaaaatagcatgacataataatatcaa 26224015  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26224016 atgcaagtcaacaacatctcaattat 26224041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896430
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgac---ataataatatca 99  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||| ||||||   ||||||||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatca 19896363  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  19896364 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19896430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 38855371 - 38855250
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||     
T  38855371 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 38855273  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  38855272 aatgcaaatcaacaacatctcaa 38855250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21778896 - 21778697
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||| ||||||||||| ||||||    
T  21778896 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatca 21778800  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  21778799 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagctt 21778701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 6520369 - 6520486
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||     
T  6520369 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 6520467  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatc 118  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  6520468 aatgcaagtcatcaacatc 6520486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25363124 - 25363026
Alignment:
Q  137 ctcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  25363124 ctcaagtaatgcataaaacattataccacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 25363026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823935
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14823871  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  14823872 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14823935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 126
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070681
Alignment:
Q  16 caacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caa 114  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaa 15070669  T
Q  115 catctcaattat 126  Q
    | ||||||||||    
T  15070670 cgtctcaattat 15070681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19937168 - 19937046
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19937168 tcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataagatcaaat 19937070  T
Q  103 gcaagtcaa-caacatctcaatta 125  Q
    ||||||||| |||| |||||||||    
T  19937069 gcaagtcaatcaacgtctcaatta 19937046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801333
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 118  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
Q  119 tcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 215  Q
    |||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||| ||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataa-caacatcaagtcatcgtaaatcagcttcacagatcatcattaa 19801333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13508199 - 13508024
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 105  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  13508199 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgc-acaacatcatgatataataatatcgaacgca 13508101  T
Q  106 agtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  13508100 agtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13508024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290734
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 106  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 45290755  T
Q  107 gtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    | ||| |||| ||||||||||    
T  45290754 gccaatcaacgtctcaattat 45290734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5866394 - 5866280
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  5866394 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcg 5866296  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||| || ||||||||    
T  5866295 aatgtaaatcaacaac 5866280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 17140917 - 17141019
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||     
T  17140917 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aatccatcatgacataataatatcg 17141015  T
Q  100 aatg 103  Q
    ||||    
T  17141016 aatg 17141019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285719
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaat 21285699  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  21285700 gcaaatcaacaacatctcaa 21285719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 21490996 - 21491110
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||      
T  21490996 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatattg 21491094  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||| || ||||||||    
T  21491095 aatgtaaatcaacaac 21491110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484275
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| |        |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagcta--------gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25484339  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  25484338 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 25484275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13597731 - 13597556
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 105  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || | |||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  13597731 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgc-aaaacatcatgatataataatatcgaacgca 13597633  T
Q  106 agtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    ||| ||||||||| ||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  13597632 agtaaacaacatcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13597556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678075
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||   |||| || ||||||| ||||||||     
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 18678122  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 148  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  18678121 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgc 18678075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 148
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121880
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||   |||| || ||||||| ||||||||     
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 32121833  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 148  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  32121834 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgc 32121880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23760961 - 23760843
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||| |||||  |||    
T  23760961 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-gtaaatcatcatgatataacaatattgaat 23760863  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  23760862 tcaaatcaacaacatctcaa 23760843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17612230 - 17612018
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||| |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||     
T  17612230 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcg 17612132  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagct 198  Q
     | | |||| ||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||   ||||||||  |||| |||| |||||    
T  17612131 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattata---aacatcaaatcatcataaatcagct 17612035  T
Q  199 tcacagattataattaa 215  Q
    |||||||| || |||||    
T  17612034 tcacagatcatcattaa 17612018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355699
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||| || |||| |||||| |||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcacgatataacaatatcgaat 26355717  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctca 121  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  26355716 gcaa-tcaacaacatctca 26355699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983407
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaa-aacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 112  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||  |||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  113 aacatc 118  Q
    ||||||    
T  983412 aacatc 983407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Original strand, 21673716 - 21673826
Alignment:
Q  12 tcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||    
T  21673716 tcatcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca 21673814  T
Q  111 acaacatctcaa 122  Q
    ||||||||||||    
T  21673815 acaacatctcaa 21673826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 21249385 - 21249500
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaat--aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||| | ||  |||||||| |||||||||||    
T  21249385 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgc-aattcatcatgatataataatatc 21249483  T
Q  99 aaatgcaagtcaacaac 115  Q
     |||| || ||||||||    
T  21249484 gaatgtaaatcaacaac 21249500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 21255223 - 21255338
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaat--aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||| | ||  |||||||| |||||||||||    
T  21255223 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgc-aattcatcatgatataataatatc 21255321  T
Q  99 aaatgcaagtcaacaac 115  Q
     |||| || ||||||||    
T  21255322 gaatgtaaatcaacaac 21255338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 182
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498744
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 117  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgt-aaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
Q  118 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    |||||  || ||   |||| ||||||||||  ||||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  20498680 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 20498744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116471
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37116464  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  37116465 atctcaa 37116471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23776952 - 23776772
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 103  Q
    |||||||||  ||| |||| || ||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||   || | | || |||||| |  ||||||||| |     
T  23776952 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataactatagcagcataggcagatcacaacatcagcatgacttcttaatatcaattt 23776853  T
Q  104 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaaca 184  Q
    ||  |||||||||||| ||| || |||| ||| || |||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23776852 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacattatataacatcatattcaacatcaaca 23776772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17354060 - 17353843
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataata-----atatc 98  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||| | ||||| ||||||| |||     |||||    
T  17354060 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacattatgacatcatataacgatatc 17353961  T
Q  99 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatg-cttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 197  Q
    |||| ||||  | || ||||||||| || || |||||| ||||||||||   |  ||||  || |||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||    
T  17353960 aaatacaagcaagcatcatctcaatcattcattcataattcaagtaatgaaatcaaacatcatctcacatcatattcaacataaacatttcat-aacagc 17353862  T
Q  198 ttcacagattataattaac 216  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  17353861 ttcacagattacaattaac 17353843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17439602 - 17439504
Alignment:
Q  26 cgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17439602 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 17439504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26223039 - 26222987
Alignment:
Q  164 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  26223039 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 26222987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266991
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |  |||||   |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacat-aaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 17266998  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  17266997 atctcaa 17266991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353143
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 24353136  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  24353137 atctcaa 24353143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 40492891 - 40492850
Alignment:
Q  81 tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40492891 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 40492850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3270 - 3041
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3270 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaa 3172  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3171 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttc 3072  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3071 acaggttataattaacatcatcattaagtct 3041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 20593774 - 20594004
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20593774 catcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaa 20593873  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593874 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataaatcaagtaatgcgtataacaatatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 20593973  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20593974 acagattataattatcattatcattaagtct 20594004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25629475 - 25629245
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25629475 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaa 25629376  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629375 atgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 25629276  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25629275 acagattataattaacaacatcattaagtct 25629245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 29060541 - 29060771
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  29060541 catcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 29060640  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060641 atgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatctcatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 29060740  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29060741 acagattataattaatatcatcattaagtct 29060771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409717
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaa 18409848  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409847 atgcaagtcaacaacatctcaatcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 18409748  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18409747 acatattataattaacatcatcattaagtct 18409717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19303660 - 19303435
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19303660 catcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaggaagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaa 19303562  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19303561 atgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttcaacagcttc 19303462  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19303461 acagattataattaacatcatcattaa 19303435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20361080 - 20360846
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20361080 catcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 20360981  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20360980 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttc 20360881  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20360880 acatattataattaacctcatcattaagtcttaat 20360846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20638403 - 20638168
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20638403 catcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 20638304  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| | | ||||||||  | ||| ||| |||   ||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638303 ttgcaatttatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcataaaacgttatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 20638204  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638203 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 20638168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17287916 - 17287678
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  17287916 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaa 17287817  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||| ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17287816 ttgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatgtcataacataatcaacctcaacacatcttaaacagcttc 17287717  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17287716 acaggttataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 17287678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22780347 - 22780116
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  22780347 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatcaa 22780248  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780247 ttgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 22780148  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtctt 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22780147 acagattatgattaacatcatcattaagtctt 22780116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782389
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22782325  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  22782326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22782389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 20076701 - 20076863
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  20076701 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac-aaaacagcatgacataataatatcaa 20076799  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacat 167  Q
    |||||| ||||||   ||| ||  || |||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20076800 atgcaaatcaaca---tcttaaaaattcaattatacttcaagtaatgcgtataacattatatcacat 20076863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291180
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2291244  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  2291243 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 2291180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742479
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12742415  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  12742416 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12742479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334592
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18334656  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  18334655 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18334592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005208
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19005144  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  19005145 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19005208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858919
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19858983  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  19858982 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19858919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422709
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24422645  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  24422646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24422709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861956
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33861892  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  33861893 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33861956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864440
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33864376  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  33864377 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33864440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540924
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaat 1540975  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttata 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  1540974 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 1540924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 16496245 - 16496363
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  16496245 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaa 16496344  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatct 119  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  16496345 ttgcaattcaacaacatct 16496363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676710
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 30676776  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  30676775 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 30676710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055191
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaaa-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8055127  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  8055128 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8055191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656751
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25656727  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    |||||| || ||| ||||||||||    
T  25656728 gcaagttaataacgtctcaattat 25656751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688624
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 25688600  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  25688601 gcaagtcaacaacgtctcaattat 25688624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754971
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25754907  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  25754908 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 25754971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924640
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 26924704  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  26924703 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26924640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963535
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 34963469  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  34963470 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 34963535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595692
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 1595647  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatg 147  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||    
T  1595648 gcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatg 1595692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456930
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 118  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18456833  T
Q  119 tcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 215  Q
    |||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  18456834 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 18456930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16920750 - 16920519
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||    
T  16920750 catcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatac---aacatcatgacataagtatatca 16920654  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    ||| | | ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||    
T  16920653 aattccattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataccacatcataatcaacaacaacttatcttattcagctt 16920555  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16920554 catagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 16920519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556934
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaat 20556956  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaatt 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  20556955 gcaagtcaacaacgtctcaatt 20556934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644543
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  114 acatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataat 212  Q
    |||||||||  || ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||| || |||||||||  |||| || | ||||||||||||| || ||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacatcaaatcatcatatatcagcttcacagatcatcat 25644534  T
Q  213 taacatcat 221  Q
    ||| |||||    
T  25644535 taatatcat 25644543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852017
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaat 3852081  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  3852080 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 3852017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462028
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 118  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18461993  T
Q  119 tcaattatacaatcataactcaagtaatgcttata 153  Q
    |||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  18461994 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 18462028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448566
Alignment:
Q  6 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 105  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16448588  T
Q  106 agtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    |||||| |||| ||||||||||    
T  16448587 agtcaatcaacgtctcaattat 16448566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22831504 - 22831737
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| ||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |   |||  ||||||||||| ||||||    
T  22831504 catcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcactgttc---aacgacatgacataatcatatca 22831600  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctca-at-tatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 197  Q
    ||| ||| ||| |||||||| | || ||||||| |||   ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||    
T  22831601 aattcaattcatcaacatcttagatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagc 22831699  T
Q  198 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||    
T  22831700 ttcacagattatagttaacctcattctcaagtcttaat 22831737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25603467 - 25603267
Alignment:
Q  38 cttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataac 137  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||  |  || ||| | ||||||||||||| |||| | |      
T  25603467 cttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattca-ctacatctcaattattcaataaaact 25603369  T
Q  138 tcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgc 237  Q
    ||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||| ||    
T  25603368 tcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttcacagattctattaaacatcgtcattaagtcttaaagc 25603269  T
Q  238 ta 239  Q
    ||    
T  25603268 ta 25603267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15041644 - 15041441
Alignment:
Q  27 gactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| || | |||||||||   || | |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |||    
T  15041644 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatcttaagtat 15041545  T
Q  127 acaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcatta 226  Q
     |||| | | ||||||||||||  || ||| || | || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  15041544 tcaataaaatctcaagtaatgcacat-acattaaaccaaatcttaattatcatcaacacatcttaaacagctttacagattgtatctaacatcatcatta 15041446  T
Q  227 agtct 231  Q
     ||||    
T  15041445 ggtct 15041441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 20109141 - 20109322
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||| | |||| |||||||    
T  20109141 catcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacataatataacaatatca 20109237  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttat--aacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||  |||  || | |||||||||| |||| |||||||||    
T  20109238 aatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 20109322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 35245587 - 35245758
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  35245587 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatac---aacaacatgacataataatatca 35245683  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatca 175  Q
    | | ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||    
T  35245684 atttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatca 35245758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652316
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19652297  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  19652298 gcaa-tcaacaacatctcaa 19652316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 28496591 - 28496477
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  28496591 catcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcg 28496493  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||| || ||||||||    
T  28496492 aatgtaaatcaacaac 28496477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 29809002 - 29808888
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  29809002 catcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcg 29808904  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||| || ||||||||    
T  29808903 aatgtaaatcaacaac 29808888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 27333338 - 27333241
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  27333338 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27333241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 27394078 - 27393981
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  27394078 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27393981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8227631 - 8227416
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||     
T  8227631 catcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcg 8227533  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagct 198  Q
     | | |||| ||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  8227532 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagct 8227433  T
Q  199 tcacagattataattaa 215  Q
    |||||||| || |||||    
T  8227432 tcacagatcatcattaa 8227416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821782
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-cat 117  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||| ||||| |||||| || ||||| |||||| |||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatc-aacgcaagccaacaatcat 18821849  T
Q  118 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcat-aatcaacatcaaca 184  Q
    ||||||||| || | | |  ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18821848 ctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataaatcaacattaaca 18821782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 23019409 - 23019528
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||    
T  23019409 catcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatca 23019505  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23019506 aatgcaagtcaacaacatctcaa 23019528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25611805 - 25611605
Alignment:
Q  38 cttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataac 137  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||  |  || ||| | ||||||||||||| |||| | |      
T  25611805 cttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattca-ctacatctcaattattcaataaaact 25611707  T
Q  138 tcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgc 237  Q
    ||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| |||||||||| ||| ||    
T  25611706 tcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttcatagattctgttaaacatcgtcattaagtcctaaagc 25611607  T
Q  238 ta 239  Q
    ||    
T  25611606 ta 25611605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 25714418 - 25714478
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaaca 61  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25714418 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 1561304 - 1561418
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  1561304 catcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcg 1561402  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    ||||||| ||||||||    
T  1561403 aatgcaaatcaacaac 1561418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098518
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||| |||| |||||||||||||  ||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgc-aaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaa 9098522  T
Q  112 caac 115  Q
    ||||    
T  9098521 caac 9098518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668491
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| | ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgc-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 19668484  T
Q  112 caacatc 118  Q
    |||||||    
T  19668485 caacatc 19668491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185737
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 117  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||   |||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| || |||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatgtgcagtgtac---aacaacatgacataattatatcaaattcaattcatcagcat 11185620  T
Q  118 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaaca 217  Q
    ||    ||||||| |||   ||||||||||| || |||  |||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||  || ||||||||||||   |||||     
T  11185621 cttttgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aactttataacacttcataatcagcaacaacatatcttattcatcttcacagattacggttaacc 11185719  T
Q  218 tcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||  |||||||||||||    
T  11185720 tcactattaagtcttaat 11185737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19847997
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||   |||| ||  |||||| ||||||||     
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaat 19848015  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatct 119  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  19848014 tgcaattcaacaatatct 19847997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 4185930 - 4185827
Alignment:
Q  12 tcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtca 110  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||| |||||| ||||||| |||    
T  4185930 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca 4185832  T
Q  111 acaac 115  Q
     ||||    
T  4185831 tcaac 4185827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 148
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992572
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||   |||| || ||||||| ||||||||     
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 23992528  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 148  Q
    ||||| |   |||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  23992529 tgcaatt---caacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgc 23992572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 27416011 - 27415943
Alignment:
Q  49 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    
T  27416011 aacaacagcaacataggcagcatac--aaacagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatct 27415943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443119
Alignment:
Q  21 tagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtata 72  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagtata 33443119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5834436 - 5834388
Alignment:
Q  182 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 230  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  5834436 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtc 5834388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 230
Target Start/End: Original strand, 20177096 - 20177144
Alignment:
Q  182 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 230  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  20177096 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtc 20177144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22158895 - 22158847
Alignment:
Q  182 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 230  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  22158895 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtc 22158847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 22080845 - 22080799
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaa 47  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22080845 catcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 68
Target Start/End: Original strand, 21766718 - 21766759
Alignment:
Q  27 gactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21766718 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcag 21766759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 31155514 - 31155465
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa 53  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  31155514 catcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaa 31155465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873184
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 19873184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 90)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14972855 - 14973085
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  14972855 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 14972954  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972955 atgcaaatcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 14973054  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973055 atagattataattaacatcatcattaagtct 14973085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18438535 - 18438765
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  18438535 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 18438634  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438635 atgcaagtcaacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttc 18438734  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18438735 acagattatagttaacatcatcattaagtct 18438765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213611
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaat 40213740  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40213739 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctttac 40213640  T
Q  203 agattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213639 agattataattaacatcatcattaagtct 40213611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 13442275 - 13442510
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13442275 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 13442374  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442375 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 13442474  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442475 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 13442510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 17487857 - 17488096
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17487857 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 17487956  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17487957 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagattc 17488056  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488057 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 17488096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25476505 - 25476275
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25476505 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 25476406  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25476405 atgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagcttc 25476306  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25476305 acagattgtaattaacatcctcattaagtct 25476275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 17499339 - 17499578
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17499339 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 17499438  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17499439 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagattc 17499538  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 240  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499539 acaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 17499578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23083481 - 23083247
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  23083481 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaa 23083382  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     |||||||||||||||||| || ||| ||||  ||  || ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23083381 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatatcaacacatcttaaacagcttc 23083282  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23083281 acagattgtaattaacatcatcactaagtcttaat 23083247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26686888 - 26687117
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  26686888 catcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 26686987  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     |||||||||||| ||||| || ||| | || |||  |||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686988 ttgcaagtcaacatcatcttaaatattccattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 26687087  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtc 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26687088 acagattataattaacatcctcattaagtc 26687117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14576949 - 14576719
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 103  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14576949 catcatcaacatcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtataa-acaacagcatgacataataatatcaattg 14576851  T
Q  104 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 203  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14576850 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 14576751  T
Q  204 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14576750 gattataattaacatcatcattaaatcttaat 14576719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20698555 - 20698317
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  20698555 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaa 20698456  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| |  ||| |||  ||   ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20698455 ttgcaattcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacttcaacacatcttgaacagcttc 20698357  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20698356 acagattataattaacatcatcattaagtcttaattctat 20698317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 43840933 - 43841162
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  43840933 catcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 43841032  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841033 ttgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 43841132  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtc 230  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  43841133 acagattataattaacatcctcgttaagtc 43841162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11424879 - 11424653
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  11424879 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataacaatatcaa 11424781  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
      |||| ||||||   |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11424780 tagcaaatcaaca---tctcaattatgcattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataaacaacttcaacacatcttaaacagcttc 11424684  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11424683 acagattaaaattaacatcaacattaagtct 11424653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 12399210 - 12399448
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  12399210 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaa 12399309  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    |||||| |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12399310 atgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataagacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaatagcttc 12399409  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||    
T  12399410 acagattatagttaacctcttcattatgtcttaatgcta 12399448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386632
Alignment:
Q  18 acttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 117  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
Q  118 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaac 216  Q
    ||||| ||| || |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaaacagcttcacagattatcattaac 42386627  T
Q  217 atcat 221  Q
    |||||    
T  42386628 atcat 42386632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153115
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 24153228  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 202  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153227 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24153128  T
Q  203 agattataattaa 215  Q
    |||||||||||||    
T  24153127 agattataattaa 24153115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 14572602 - 14572823
Alignment:
Q  13 catcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 112  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  14572602 catcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaac 14572700  T
Q  113 aacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataat 212  Q
    ||||||| || ||| |||| |||  |||| |||||   | |||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14572701 aacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgaaaaaaacattatatcacatcataaacaacataaacaaatcttaaacaacttcacaaattataat 14572800  T
Q  213 taacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14572801 taacatcatcattaagtcttaat 14572823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172567
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29172647  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||  |  |||||||||||    
T  29172646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatactatcaacatcaa 29172567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166739
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 36166695  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaat 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  36166696 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 36166739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 166
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544187
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 13544122  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  13544123 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 13544187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707607
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 9707671  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  9707670 acaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 9707607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247723
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10247787  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  10247786 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 10247723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567722
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 106  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 12567662  T
Q  107 gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  12567663 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12567722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463340
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17463276  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  17463277 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17463340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159488
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34159424  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  34159425 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34159488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606907
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 45606971  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  45606970 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45606907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476653
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55476589  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  55476590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 55476653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848624
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 28848675  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttata 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  28848674 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 28848624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781347
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 7781411  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  7781410 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7781347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899256
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8899192  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  8899193 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8899256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454281
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16454345  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  16454344 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16454281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672748
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17672724  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  17672725 gcaaatcaacaacgtctcaattat 17672748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961891
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38961955  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  38961954 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 38961891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469175
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6469198  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaatta 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  6469197 gcaagtcaacaacgtctcaatta 6469175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Original strand, 21618460 - 21618650
Alignment:
Q  14 atcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618460 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 21618557  T
Q  114 acatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataat 212  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||      ||||     ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||    
T  21618558 acatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcat 21618647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151790
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13151855  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  13151854 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13151790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154255
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13154320  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  13154319 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13154255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977637
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 15977613  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  15977614 gcaagtcaacaacgtctcaattat 15977637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446695
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttaga-cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17446719  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  17446718 gcaagtcaacaacgtctcaattat 17446695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242984
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 50242920  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  50242921 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 50242984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 43550643 - 43550497
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  43550643 catcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaa 43550544  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatg 147  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||    
T  43550543 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatg 43550497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55501040  T
Q  103 gcaagtcaacaacat 117  Q
    |||||||||||||||    
T  55501041 gcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282811
Alignment:
Q  5 atcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgc 16282873  T
Q  105 aagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  16282872 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16282811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070653
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 118  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 53070701  T
Q  119 tcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  53070700 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 53070653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119764
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12119789  T
Q  103 gcaagtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||    
T  12119788 gcaagtcaatcaacgtctcaattat 12119764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412552
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15412527  T
Q  103 gcaagtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||    
T  15412528 gcaagtcaatcaacgtctcaattat 15412552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124049
Alignment:
Q  5 atcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacacaa----cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 41123987  T
Q  105 aagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  41123988 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41124049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499625
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 8499616  T
Q  103 gcaagtcaa 111  Q
    |||||||||    
T  8499617 gcaagtcaa 8499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24340843 - 24340628
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||| |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | | |||||||||| |||||||||||     
T  24340843 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgc-acaacatcatgatataataatatcg 24340745  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagct 198  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  24340744 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagct 24340645  T
Q  199 tcacagattataattaa 215  Q
    |||||||| || |||||    
T  24340644 tcacagatcatcattaa 24340628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Original strand, 30029855 - 30030078
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 114  Q
    ||||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||| |||  ||| | |||| |||||||||| |||||||  ||||| ||| |||    
T  30029855 tcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaatatcatttgcaattca-caa 30029953  T
Q  115 catctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 214  Q
    | ||| || ||| |||| | |  ||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  30029954 cgtcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaacagcttcacatattatattaa 30030053  T
Q  215 acatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  30030054 acatcatcattaagtcttaaagcta 30030078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 32307684 - 32307802
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  32307684 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 32307782  T
Q  106 agtcaacaacatctcaattat 126  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  32307783 a-tcaacaacatctcaattat 32307802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 103
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494908
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaat 44494907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 13210447 - 13210333
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  13210447 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcg 13210349  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    ||||||| ||||||||    
T  13210348 aatgcaaatcaacaac 13210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 216
Target Start/End: Original strand, 14179569 - 14179648
Alignment:
Q  137 ctcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 216  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14179569 ctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 14179648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 15470928 - 15471046
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  15470928 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 15471026  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  15471027 gcaagtcatcaacatctcaa 15471046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16103960
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16103882  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||  |||||  ||||| | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  16103883 gcaa-tcaacaacatctcaaatat-caaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaa 16103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 239
Target Start/End: Original strand, 16796684 - 16796786
Alignment:
Q  137 ctcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 236  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  16796684 ctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaaaaacaacacatcttaaacaacttcacatattataattagcctcttcattaagtcttaatg 16796783  T
Q  237 cta 239  Q
    |||    
T  16796784 cta 16796786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557104
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-tcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaat 10557083  T
Q  103 gcaagtcaa-caacatctcaa 122  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  10557084 gcaagccaatcaacatctcaa 10557104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301562
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||    
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaa 53301571  T
Q  102 tgcaagtca 110  Q
    |||||||||    
T  53301570 tgcaagtca 53301562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097509
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| |||||| | |||| |||||| |||    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaat 16097430  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  16097431 gcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 16097509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 14234488 - 14234605
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||     
T  14234488 catcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 14234586  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatc 118  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  14234587 aatgcaagtcatcaacatc 14234605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523633
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
Q  116 atctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataatta 214  Q
    |||||||  || ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| || ||||    
T  52523732 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa-tcatcttataacagcttctcagatcatcatta 52523634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174265
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 12174278  T
Q  103 gcaagtcaacaac 115  Q
    ||||  |||||||    
T  12174277 gcaaaacaacaac 12174265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165369
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | |||||| ||||| |||  |||||||||    
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgc-aaaacaacatgatataccaatatcaaa 27165348  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    ||||||||| ||| |||||||    
T  27165349 tgcaagtcatcaatatctcaa 27165369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 148
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822413
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||   |||| || ||||||| ||||||||     
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaat 46822366  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 148  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  46822367 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgc 46822413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 37642385 - 37642170
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||| |||||||| | |||| || |||||||| |||||||||||  |||  | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||     
T  37642385 catcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcg 37642287  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagct 198  Q
     | | |||| ||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  37642286 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagct 37642187  T
Q  199 tcacagattataattaa 215  Q
    |||||||| || |||||    
T  37642186 tcacagatcatcattaa 37642170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49668071
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 49668095  T
Q  103 gcaagtcaac-aacatctcaattat 126  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||    
T  49668094 gcaa-tcaacaaacatctcatttat 49668071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274903
Alignment:
Q  18 acttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 116  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
Q  117 tctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaa-acagcttcacagattataattaa 215  Q
    |||||| ||| ||   |||| |||||||| |  ||||  | || ||||||| |||| |||||||||  |||| |||  ||||||||||||| || |||||    
T  23274804 tctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcagcttcacagatcatcattaa 23274903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 148
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511205
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||   |||| || ||||||| ||||||||     
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaat 12511158  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 148  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  12511159 tgcaattcaacaacatcttcaatattcaataatatctcaagtaatgc 12511205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737337
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta---tacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||   ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcaatatactacaacaacagcatgacataataatatca 17737334  T
Q  100 aat 102  Q
    |||    
T  17737335 aat 17737337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9513026
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 9513022  T
Q  103 gcaa 106  Q
    ||||    
T  9513023 gcaa 9513026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9521001
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 9520997  T
Q  103 gcaa 106  Q
    ||||    
T  9520998 gcaa 9521001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251165
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37251172  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  37251171 atctcaa 37251165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926082
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacat-aaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 43926075  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  43926076 atctcaa 43926082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacatag 64  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577947
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacag 56  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 45577947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1644787 - 1644670
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 106  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |||||| ||| |||    
T  1644787 catcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcattatataacaatatcgaatacaa 1644689  T
Q  107 gtcaacaacatctcaattat 126  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  1644688 -tcaacaatatctcaattat 1644670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 116
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378039
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaa-ataacaacagcaacataggcagtatacgaaa-acatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||  ||| |  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 12378039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110349
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagc 22110356  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  22110355 atctcaa 22110349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2051239 - 2051138
Alignment:
Q  81 tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatc 180  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  || ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||    
T  2051239 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatc 2051140  T
Q  181 aa 182  Q
    ||    
T  2051139 aa 2051138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856204
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaacataggcag 856204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077530
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665460
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacata 63  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacata 14665460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22147645 - 22147431
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||| |||||||| | |||| || ||| |||| |||||||||||  |||  | ||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||     
T  22147645 catcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgc-aaaacatcatgatataataatatcg 22147547  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagct 198  Q
     | | |||| ||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||| ||  |||| |||| |||||    
T  22147546 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat-aaatcatcataaatcagct 22147448  T
Q  199 tcacagattataattaa 215  Q
    |||||||| || |||||    
T  22147447 tcacagatcatcattaa 22147431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 36166747 - 36166799
Alignment:
Q  164 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  36166747 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 36166799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668616
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacata 63  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 14668616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 70
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  21 tagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 70  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 14878633 - 14878569
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    |||||||||  ||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14878633 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 14878569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878104
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 15878104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 17525275 - 17525211
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    |||||| || |||| |||| |||||||||| || | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17525275 catcattttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcataggcag 17525211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377413
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacataataatatcaaat 16377542  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16377541 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctccac 16377442  T
Q  203 agattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377441 agattataattaacatcatcattaagtct 16377413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038879
Alignment:
Q  5 atcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgc 14038752  T
Q  105 aagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14038753 aagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatgttaaacagcttcacag 14038852  T
Q  205 attataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14038853 attataattaatatcatcattaagtct 14038879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 44052830 - 44053069
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  44052830 catcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 44052929  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44052930 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatcttaaacagcttc 44053029  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44053030 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 44053069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 12902758 - 12902992
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12902758 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 12902857  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     || || ||| |||||||| || ||| |||  || | ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12902858 ttgtaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttc 12902957  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12902958 acagattataattaacctcttcattaagtcttaat 12902992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16240089 - 16239856
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16240089 catcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 16239991  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  | |||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16239990 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatcatatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 16239891  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16239890 gcagattataattaacatcatcattaagtcttaat 16239856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 7088878 - 7089116
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7088878 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 7088977  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| |  ||| |||  || | ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||    
T  7088978 ttgcaattcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattagcaacaacacatcttaaacaacttc 7089077  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7089078 acagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 7089116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16270355 - 16270140
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16270355 catcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 16270257  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    |||||||| |||||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270256 atgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 16270157  T
Q  201 acagattataattaaca 217  Q
    |||||||||||| ||||    
T  16270156 acagattataatcaaca 16270140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 7893704 - 7893935
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7893704 catcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 7893803  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  ||| || ||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  7893804 ttgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcacatcataat---cagcaacacatcttaaacagcttc 7893900  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7893901 acagattataattaacatcatcgttaagtcttaat 7893935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636669
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 22636536  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 201  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22636537 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatctt-aacagcttca 22636635  T
Q  202 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22636636 cagattataattaacatcctcgttaagtcttaat 22636669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374241
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 106  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||  ||||||| |||||    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaa 23374374  T
Q  107 gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 206  Q
     |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  23374373 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacagatcttaaaaagcttcagagat 23374274  T
Q  207 tataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  23374273 tatagttaacctcttcattaagtcttaatgcta 23374241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 7798775 - 7798958
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7798775 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 7798874  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaaca 184  Q
     ||||||||| |||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  7798875 ttgcaagtcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaaca 7798958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798669
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 54798773  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54798772 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 54798683  T
Q  202 cagattataattaa 215  Q
    |||||||| |||||    
T  54798682 cagattatcattaa 54798669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280518
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-ggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 14280414  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14280415 gcaagtcaacaacatctcaaatatagattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 14280504  T
Q  202 cagattataattaa 215  Q
    |||||||| |||||    
T  14280505 cagattatcattaa 14280518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928829
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaat 44928943  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||  |||| |||||| ||  |||| |||| ||||||||    
T  44928942 gcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacataaaatcatcataaatcagcttca 44928843  T
Q  202 cagattataattaa 215  Q
    ||||| || |||||    
T  44928842 cagatcatcattaa 44928829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 6899892 - 6900062
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||    
T  6899892 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatagcataataatatcaa 6899990  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataa 172  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  ||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  6899991 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataa 6900062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 52873487 - 52873369
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  52873487 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 52873388  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatct 119  Q
     |||||||||||| |||||    
T  52873387 ttgcaagtcaacatcatct 52873369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618172
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 19618238  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  19618237 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19618172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215274
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18215338  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  18215337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18215274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12307
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12371  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  12370 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837494
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaat 1837573  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  1837572 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattataa-caacatcaa 1837494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118352
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15118416  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  15118415 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15118352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773087
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44773151  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  44773150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44773087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312672
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 52312608  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  52312609 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 52312672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 17046488 - 17046719
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||| ||||||    
T  17046488 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatag---aacaacatgacataattatatca 17046584  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||  || |||| |||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  17046585 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaacatatcttattcagctt 17046683  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  17046684 cacagattataattaaccttattattaagtcttaat 17046719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515169
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaat 3515105  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  3515106 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 3515169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 19242699 - 19242861
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19242699 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19242797  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  19242798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19242861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615450
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 44615386  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  44615387 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44615450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222339
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 50222403  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  50222402 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 50222339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239432
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18239483  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttata 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  18239482 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 18239432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14053421 - 14053188
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| || || ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  14053421 catcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatac--aaacagcatgacataataatatca 14053324  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacat-ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 198  Q
    | | ||| ||| |||||| || |   ||||||  ||   ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  14053323 atttcaattcatcaacattcttatgcatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacggct 14053225  T
Q  199 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  14053224 tcacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 14053188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803265
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23803329  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  23803328 gcaaatcaacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 23803265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463908
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 51463932  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  51463931 gcaaatcaacaacgtctcaattat 51463908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102425
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44102312  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 201  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||  |||| || ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  44102313 gcaagtaaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttca 44102411  T
Q  202 cagattataattaa 215  Q
    ||||| || |||||    
T  44102412 cagatcatcattaa 44102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574844
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 8574888  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaat 146  Q
    | || ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  8574887 gtaattcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 8574844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355364
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 106  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15355385  T
Q  107 gtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  15355384 gtcaatcaacgtctcaattat 15355364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970747
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaacag-caatatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 14970773  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14970772 atgcaagtcaacaacgtctcaattat 14970747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611105
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |        || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca--------acaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12611041  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  12611042 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12611105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 3096294 - 3096379
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatga 86  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3096294 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243099
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||| |||| ||||||||||| || ||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaa 52243204  T
Q  112 caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattata 210  Q
    |||||||||||  || ||   ||||  |||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  52243203 caacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcatc 52243104  T
Q  211 attaa 215  Q
    |||||    
T  52243103 attaa 52243099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15367691 - 15367905
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15367691 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 15367789  T
Q  101 atgcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagct 198  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||   |||| |||| ||| || ||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  15367790 atgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagct 15367888  T
Q  199 tcacagattataattaa 215  Q
    |||||||| || |||||    
T  15367889 tcacagatcatcattaa 15367905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15402704 - 15402918
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15402704 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 15402802  T
Q  101 atgcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagct 198  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||   |||| |||| ||| || ||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  15402803 atgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagct 15402901  T
Q  199 tcacagattataattaa 215  Q
    |||||||| || |||||    
T  15402902 tcacagatcatcattaa 15402918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774132
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 12774109  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
     ||| |||||||||||||||||||    
T  12774110 acaa-tcaacaacatctcaattat 12774132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 15370019 - 15370144
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15370019 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 15370117  T
Q  101 atgcaagtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15370118 atgcaagtcaatcaacgtctcaattat 15370144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641232
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||           || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaac-----------acaaaaacaacatgacataataatatcaaat 7641256  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  7641255 gcaagtcaacaacgtctcaattat 7641232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13790
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 117  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
Q  118 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    ||||| ||| ||   |||| ||||||||||  ||||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  13854 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15371203 - 15371417
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15371203 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 15371301  T
Q  101 atgcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagct 198  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| ||   |||| |||| ||| || ||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  15371302 atgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagct 15371400  T
Q  199 tcacagattataattaa 215  Q
    |||||||| || |||||    
T  15371401 tcacagatcatcattaa 15371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15373484 - 15373698
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15373484 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 15373582  T
Q  101 atgcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagct 198  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| ||   |||| |||| ||| || ||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  15373583 atgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagct 15373681  T
Q  199 tcacagattataattaa 215  Q
    |||||||| || |||||    
T  15373682 tcacagatcatcattaa 15373698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 16223533 - 16223658
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  16223533 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcta 16223631  T
Q  101 atgcaagtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16223632 atgcaagtcaatcaacgtctcaattat 16223658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17048056 - 17047958
Alignment:
Q  137 ctcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   || |||||||||||||||    
T  17048056 ctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacaggttgtaattagtctcttcattaagtcttaat 17047958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815598
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 118  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-ctgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtc 21815633  T
Q  119 tcaattatacaatcataactcaagtaatgcttata 153  Q
    |||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  21815632 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 21815598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 39706408 - 39706299
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||     
T  39706408 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 39706310  T
Q  100 aatgcaagtca 110  Q
    |||||||||||    
T  39706309 aatgcaagtca 39706299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 15551818 - 15551932
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||     
T  15551818 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aatccatcatgatataataatatcg 15551916  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    || | || ||||||||    
T  15551917 aaggtaaatcaacaac 15551932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 229
Target Start/End: Original strand, 3096782 - 3096872
Alignment:
Q  138 tcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagt 229  Q
    ||||||||||| || |||| | |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3096782 tcaagtaatgcata-aacattgtatctcatcataatcagcaacaacacatcttaaacagcttcacatattataattaacctcatcattaagt 3096872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288211
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaa 12288218  T
Q  112 caacatc 118  Q
    |||||||    
T  12288217 caacatc 12288211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198492
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||     
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgc-aaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcat 43198563  T
Q  112 caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    ||| ||||||| ||| ||   |||| ||||||||||  ||||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  43198562 caatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 43198492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 104
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846460
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgagataacaatatcgaat 8846458  T
Q  103 gc 104  Q
    ||    
T  8846459 gc 8846460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 166
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353999
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||| |||| || |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |     |||| |||||||||| ||||||||     
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaat 22353934  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    | ||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  22353935 tacaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22353999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 111
Target Start/End: Original strand, 20149832 - 20149936
Alignment:
Q  6 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 105  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| || |||  | ||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 20149930  T
Q  106 agtcaa 111  Q
    ||||||    
T  20149931 agtcaa 20149936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190701
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-ca 116  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||||||| |||||| |||| |||  ||||| ||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgtaagcgaacaatca 6190579  T
Q  117 tctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcata-atcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 215  Q
    |||||||||| || | | |  ||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||  || | |||||||||||  ||| |||||||    
T  6190580 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattagatcacatcatacatcaacattaacatctcat-aacagcttcacgaattgtaattaa 6190677  T
Q  216 catcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
     |||||  | ||||||||||||||    
T  6190678 tatcatattcaagtcttaatgcta 6190701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 43256230 - 43256162
Alignment:
Q  49 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  43256230 aacaacagcaacataggcagcataccaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatct 43256162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640453
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||  |||||| |||| ||||||||||| || |||| |||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataac 46640460  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  46640459 atctcaa 46640453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8574836 - 8574784
Alignment:
Q  164 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  8574836 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 8574784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 231
Target Start/End: Original strand, 15091093 - 15091127
Alignment:
Q  197 cttcacagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15091093 cttcacagattataattaacatcttcattaagtct 15091127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 103
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596751
Alignment:
Q  38 cttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 16596751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15464970 - 15464930
Alignment:
Q  82 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15464970 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 15464930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 75)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564254
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 3564383  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  3564382 gtaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcat 3564283  T
Q  203 agattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3564282 aggttataattaacatcatcattaagtct 3564254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 9509190 - 9509429
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  9509190 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaa 9509289  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509290 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 9509389  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9509390 acagattataattaacatcctcattaagtcttaatgctat 9509429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 12698832 - 12699067
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaa-acatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12698832 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatca 12698931  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698932 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 12699031  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12699032 cacagattataattaacatcctcattaactcttaat 12699067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456319
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 18456432  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 202  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456431 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 18456332  T
Q  203 agattataattaa 215  Q
    |||||||||||||    
T  18456331 agattataattaa 18456319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 26211996 - 26212235
Alignment:
Q  1 catcatcat-cttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  26211996 catcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 26212095  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    | ||||| |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26212096 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 26212195  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26212196 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 26212235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 38227482 - 38227715
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38227482 catcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 38227580  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||| |||||   ||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  38227581 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatatcacatcttaatcaacatcaacatatcttaaatatcttc 38227680  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227681 acatattataattaacatcatcattaagtcttaat 38227715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 10589040 - 10589273
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  10589040 catcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatcaa 10589139  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||||||||||||  | | | |||  ||   ||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  10589140 ttgcaattcaacaacatcttcaatgttcaaatattcttcaagcaatgcata-aacattatatcacatcataatcagcaacaacacatcttaaatagcttc 10589238  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10589239 acagattataattaacctcatcattaagtcttaat 10589273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273594
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 48273491  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48273492 gcaagtcaacaacatctcaa-tatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 48273580  T
Q  202 cagattataattaa 215  Q
    |||||||| |||||    
T  48273581 cagattatcattaa 48273594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16386368 - 16386132
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||| || ||||||||||  ||||||    
T  16386368 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 16386269  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    | || |  ||| |||||||| || ||| ||| ||   |||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16386268 attgtatttcatcaacatcttaaatattcaaacaattctcaagtaatgcataaaacattatattacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 16386169  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 236  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16386168 cacagattatagttaacctcttcattaagtcttaatg 16386132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15143925
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 114  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | | |||| || || || ||||||||||||||||| ||||||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatct-cagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaa 15144045  T
Q  115 catctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataatt 213  Q
    |||||||| |||||| |||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |     
T  15144044 catctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttgacagattatatta 15143945  T
Q  214 aacatcatcattaagtctta 233  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15143944 aacatcatcattaagtctta 15143925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 13647326 - 13647491
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  13647326 catcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaa 13647425  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  13647426 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13647491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 18430710 - 18430874
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18430710 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatataaaaacatcatgacataataatatcaa 18430808  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  18430809 atgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18430874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443624
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaac--aaacagcatgacataataatatcaa 40443490  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     | ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  40443491 tttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagcttc 40443589  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  40443590 acagattataattaacctcattgttaagtcttaat 40443624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456483
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 456419  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  456420 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 456483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972658
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11972594  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  11972595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11972658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949122
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14949186  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  14949185 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14949122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376713
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15376777  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  15376776 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15376713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213861
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16213782  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
     |||||||||||| ||| |||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  16213783 ccaagtcaacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaacataa-caacatcaa 16213861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232682
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16232618  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  16232619 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16232682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640434
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18640370  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  18640371 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18640434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385123
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20385187  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  20385186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20385123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189595
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21189659  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  21189658 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21189595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702400
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 24702336  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  24702337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24702400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125653
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32125589  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  32125590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32125653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523079
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41523015  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  41523016 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41523079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525541
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41525477  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  41525478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41525541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393287
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 103  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 11393350  T
Q  104 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  11393349 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11393287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275320
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 106  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 24275273  T
Q  107 gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttata 153  Q
    ||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  24275274 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 24275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410181
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16410157  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  16410158 gcaagtcaacaacgtctcaattat 16410181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27217022
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 27216958  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  27216959 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 27217022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116631
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 44116607  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  44116608 gcaagtcaacaacgtctcaattat 44116631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27847950 - 27847719
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||   ||||  |||||||||| ||||||    
T  27847950 catcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtgtac---aacagtatgacataattatatca 27847854  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || |||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  27847853 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatcacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagctt 27847755  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||    
T  27847754 cacagattatagttaatctcattattaagtcttaat 27847719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2280237 - 2280033
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  2280237 catcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataataatatca 2280141  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagct 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||   |||| |||| |||| | ||||| | |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||    
T  2280140 aatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagct 2280041  T
Q  199 tcacagat 206  Q
    ||||||||    
T  2280040 tcacagat 2280033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386455
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaat 3386431  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  3386432 gcaagtcaacaacgtctcaattat 3386455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704847
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||   || ||||||||||||||||||    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaa---caagacataataatatcaaat 24704783  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  24704784 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24704847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869469
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13869444  T
Q  103 gcaagtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||    
T  13869445 gcaagtcaatcaacgtctcaattat 13869469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 67746 - 67868
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||     
T  67746 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 67844  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaat 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  67845 aatgcaaatcaacaacatctcaat 67868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831495
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacac-ggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaat 13831471  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  13831472 gcaagtcaacaacgtctcaattat 13831495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061866
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatac-aaaatagcatgacataataatatcaaa 17061980  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 200  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  |   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  17061979 tgcaagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 17061881  T
Q  201 acagattataattaa 215  Q
    |||||| || |||||    
T  17061880 acagatcattattaa 17061866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898416
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 106  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacag-cagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 38898437  T
Q  107 gtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  38898436 gtcaatcaacatctcaattat 38898416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005768
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtat-ggaaatcatcatgatataacaatatcgaat 18005748  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  18005749 gcaaatcaacaacatctcaa 18005768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 34200787 - 34200901
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  34200787 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcg 34200885  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||| || ||||||||    
T  34200886 aatgtaaatcaacaac 34200901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 183
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110724
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc-----------tatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20110644  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaac 183  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||  |||| ||||||||||    
T  20110645 gcaagtcaataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaac 20110724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 22072914 - 22073036
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||||    
T  22072914 catcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 22073013  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  22073014 aatgtaagtcaacaacatctcaa 22073036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 28505418 - 28505321
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  28505418 catcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811142
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 811150  T
Q  103 gcaagtca 110  Q
    ||||||||    
T  811149 gcaagtca 811142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 16495403 - 16495517
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  16495403 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcg 16495501  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||| || ||||||||    
T  16495502 aatgtaaatcaacaac 16495517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014291
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 44014280  T
Q  103 gcaagtcaaca 113  Q
    |||| ||||||    
T  44014281 gcaaatcaaca 44014291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 47831808 - 47831925
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | | | |||||||| |||| ||||||     
T  47831808 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-atatcatcatgatataacaatatcg 47831906  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatc 118  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  47831907 aatgcaagtcatcaacatc 47831925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12756797 - 12756622
Alignment:
Q  39 ttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataact 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||   | || |    
T  12756797 ttagttaaataacaacagcaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtctcaattattcacataaaatt 12756699  T
Q  139 caagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 215  Q
    |||||||||| ||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||| |||||||| || |||||    
T  12756698 caagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcatcacagatcatcattaa 12756622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16219834 - 16219719
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  16219834 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16219736  T
Q  103 gcaagtcaacaacatct 119  Q
    |||||||| ||||||||    
T  16219735 gcaagtcatcaacatct 16219719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19486864 - 19486649
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||| |||||||| | |||| || |||||||| |||||||||||  |||  | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||     
T  19486864 catcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcg 19486766  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagct 198  Q
     | | |||| ||||||||||||| ||  ||   |||| |||||| |||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  19486765 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagct 19486666  T
Q  199 tcacagattataattaa 215  Q
    |||||||| || |||||    
T  19486665 tcacagatcatcattaa 19486649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26356083 - 26355983
Alignment:
Q  66 cagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcac 165  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | ||||||||    
T  26356083 cagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 26355984  T
Q  166 a 166  Q
    |    
T  26355983 a 26355983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26358535 - 26358435
Alignment:
Q  66 cagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcac 165  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | ||||||||    
T  26358535 cagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 26358436  T
Q  166 a 166  Q
    |    
T  26358435 a 26358435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11996147 - 11996033
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||      
T  11996147 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatattg 11996049  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||| || ||||||||    
T  11996048 aatgtaaatcaacaac 11996033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 15755007 - 15754893
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  15755007 catcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcg 15754909  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    ||||||| ||||||||    
T  15754908 aatgcaaatcaacaac 15754893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867895
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| |||||| ||||||| | ||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaa 1868004  T
Q  112 caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataa 211  Q
    |||||||||||  || ||   |||| ||| ||||||| ||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||||||||| |||||||||||| || |    
T  1868003 caacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaaaaagcttcacagatcatca 1867905  T
Q  212 ttaacatcat 221  Q
    |||| |||||    
T  1867904 ttaatatcat 1867895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056449
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |  ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgc--aaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 16056440  T
Q  114 acatctcaa 122  Q
    |||||||||    
T  16056441 acatctcaa 16056449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15008594 - 15008398
Alignment:
Q  26 cgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||  ||||||  |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  15008594 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatat-aaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacacctcaa 15008497  T
Q  123 ttatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaacatcat 221  Q
      ||   || |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15008496 acatcatat-ataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagattatcattaatatcat 15008398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10063938 - 10063817
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||| || ||||| | |||||||  ||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||     
T  10063938 catcaacaccttcaacgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgc-acaacatcatgatataataatatcg 10063840  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    ||  ||||| |||||||||||||    
T  10063839 aacacaagtaaacaacatctcaa 10063817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Original strand, 15211484 - 15211633
Alignment:
Q  27 gactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaatta 125  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || | ||||||||||||||| |||||||  |  || || |||||||||||||||    
T  15211484 gactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattc-acaacatctcaatta 15211582  T
Q  126 tacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaa 176  Q
    | |||| | |  |||||  |||  || |||| |||||||||||||||||||    
T  15211583 ttcaataaaacttcaagcgatgtatacaacattatatcacatcataatcaa 15211633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154894
Alignment:
Q  6 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggcag 18154894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 2530208 - 2530140
Alignment:
Q  49 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 119  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  2530208 aacaacagcaacataggcaacatac--aaacaacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatct 2530140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932749
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 103  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||| | || | ||||||||||||||||||| ||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 14932752  T
Q  104 caa 106  Q
    |||    
T  14932751 caa 14932749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356184
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 103  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||| | || | ||||||||||||||||||| ||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15356187  T
Q  104 caa 106  Q
    |||    
T  15356186 caa 15356184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360298
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 103  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||| | || | ||||||||||||||||||| ||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15360301  T
Q  104 caa 106  Q
    |||    
T  15360300 caa 15360298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220194
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 20220194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 106
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901431
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaa-acatcatgacataataatatcaaatgcaa 106  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaa 12901431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187083
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 12187083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138113
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 17138113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 183
Target Start/End: Original strand, 15113031 - 15113125
Alignment:
Q  88 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaac 183  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||   ||||  | |||||||||| ||||| |||||||||    
T  15113031 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa-tattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaac 15113125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 18203831 - 18203882
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 70  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  18203831 cttagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacaacaacatagacagta 18203882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832499
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacata 63  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 2832499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 70
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044817
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 70  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagta 14044817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 70
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354847
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 70  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagta 14354847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16720 - 16490
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16720 catcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaa 16621  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620 atggaagtcaacagcatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 16521  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16520 acagactataattaacatcatcattaagtct 16490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22337116 - 22337350
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  22337116 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaa 22337215  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22337216 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaacaacttc 22337315  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337316 acaaattataattaacatcatcattaagtcttaat 22337350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 23060514 - 23060742
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  23060514 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 23060613  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     |||||||||||||||||| || |||  ||| |||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060614 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 23060713  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23060714 aca-attataattaacatcatcattaagtc 23060742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 23660024 - 23660253
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  23660024 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatcaa 23660122  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    |||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23660123 atgcaaatcaacaacatcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttt 23660222  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23660223 acaaattataattaacatcatcaataagtct 23660253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 23076443 - 23076666
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  23076443 catcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 23076542  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||||||||||| |||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23076543 ttgcaagtcaacaatatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacagcttaaacagcttc 23076642  T
Q  201 acagattataattaacatcatcat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23076643 acagattataattaacatcatcat 23076666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22731354 - 22731120
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22731354 catcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 22731255  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||| | || ||| |||  ||   |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731254 ttgcaattcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 22731155  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22731154 acagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22731120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23654506 - 23654268
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23654506 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaa 23654407  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  || ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  23654406 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaacaacaacacatcttaaacagcttc 23654307  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23654306 acagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 23654268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 23285866 - 23286096
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||    
T  23285866 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca----gacataataatatcaa 23285961  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||   |   ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23285962 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttc 23286061  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23286062 acagattataattaacatcttcattaagtcttaat 23286096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22738299 - 22738066
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22738299 catcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 22738201  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738200 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 22738101  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22738100 acagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22738066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298696
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||  |||||||     
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 201  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| || |||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaataacaacacatcttatacagcttca 298734  T
Q  202 cagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    || |||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  298733 catattatagttaacctcttcattaagtcttaatgcta 298696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38234 - 38002
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38234 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 38136  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     | | | ||| || ||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  38135 tttcgattcatcatcatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatgtcttatacagcttc 38037  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    | |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  38036 agagattataattaacctcattgttaagtcttaat 38002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105575
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22105511  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  22105512 gcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22105575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 20309109 - 20309340
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||    
T  20309109 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatca 20309205  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  20309206 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagctt 20309304  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  20309305 cacagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 20309340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809105
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18809041  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  18809042 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18809105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23131024
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23130960  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  23130961 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23131024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133491
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23133427  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  23133428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23133491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709532
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23709596  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  23709595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23709532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712013
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23712077  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  23712076 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23712013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505541
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26505477  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  26505478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26505541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26508019
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26507955  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  26507956 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26508019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402522
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34402586  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  34402585 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34402522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682475
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39682411  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  39682412 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39682475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135739
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23135688  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttata 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  23135689 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 23135739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214921
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 32214987  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  32214986 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 32214921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571559
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 571495  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  571496 gcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 571559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726157
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6726093  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  6726094 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 6726157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367936
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24367872  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  24367873 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24367936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155060
Alignment:
Q  6 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 21155121  T
Q  106 agtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  21155120 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21155060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898195
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24898260  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  24898259 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24898195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900678
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24900743  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  24900742 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24900678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903155
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24903220  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  24903219 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24903155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905632
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24905697  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  24905696 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24905632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908107
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24908172  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  24908171 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24908107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039498
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32039562  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  32039561 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32039498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029867
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 45029918  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttata 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  45029917 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 45029867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137461
Alignment:
Q  5 atcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 43137399  T
Q  105 aagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  43137400 aagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 43137461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577261
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 28577197  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  28577198 gcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 28577261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 158 - 240
Target Start/End: Original strand, 27753733 - 27753815
Alignment:
Q  158 tatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27753733 tatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacatattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 27753815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23103515 - 23103370
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||    
T  23103515 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacatgattatatcaa 23103418  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 148  Q
    || ||| ||| |||||||||||| || || |||||| |||||| ||||    
T  23103417 attcaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtcatgc 23103370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23708737 - 23708518
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||    
T  23708737 catcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatca 23708641  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagct 198  Q
    | ||||| ||| | |||||||||  || |||  |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||    
T  23708640 attgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatcttataacagct 23708541  T
Q  199 tcacagattataattaacatcat 221  Q
    |||||||| || ||||| |||||    
T  23708540 tcacagatcatcattaatatcat 23708518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529569
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagt 24529593  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    
T  24529592 gcaagttaacaacgtctcaattat 24529569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 122
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406099
Alignment:
Q  5 atcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 103  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  104 caagtcaacaacatctcaa 122  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  28406081 caaatcaacaacatctcaa 28406099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 19671831 - 19672043
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||| |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||     
T  19671831 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcg 19671929  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagct 198  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||  |||| || | |||||    
T  19671930 aacgcaagtaaacaacatctcaa-tattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa-caacatcaa-tcatcatagatcagct 19672026  T
Q  199 tcacagattataattaa 215  Q
    ||||||||||| |||||    
T  19672027 tcacagattatcattaa 19672043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967497
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |  || ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacaca-acaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaat 38967472  T
Q  103 gcaagtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  38967473 gcaagtcaatcaacatctcaattat 38967497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25175972
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 25175952  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  25175953 gcaaatcaacaacatctcaa 25175972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 8946658 - 8946730
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac 73  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8946658 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaacataggcagtatac 8946730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23040309 - 23040247
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacata 63  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040309 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134203
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |||||| |    
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcataatataacaatatcga 22134228  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||    
T  22134227 atgcaa-tcaataacatctcatttat 22134203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22799243 - 22799063
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 103  Q
    |||||||||  ||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||   || | ||||||||||| | |||||||||| |     
T  22799243 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacatcatgacttcataatatcaattt 22799144  T
Q  104 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaaca 184  Q
    ||  |||||||||||| ||| || |||| ||| || |||||| ||  |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22799143 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaaggcacataacattatatcacatcatattcaacattaaca 22799063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23019823 - 23019643
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 103  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||   || | |||| |||||| | |||||||||| |     
T  23019823 catcatcttaatcatcttatattgactcataaaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacatgacttcataatatcaattt 23019724  T
Q  104 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaaca 184  Q
    ||  |||||||||||| ||| || |||| ||| || |||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23019723 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaaca 23019643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 118
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679702
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc-aat 7679686  T
Q  103 gcaagtcaacaacatc 118  Q
    | |||||| |||||||    
T  7679687 gtaagtcatcaacatc 7679702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23072069 - 23071972
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  23072069 catcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 23071972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616333
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 106  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||   |||| || ||||||| |||||||| |||||    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaa 25616291  T
Q  107 gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 148  Q
     |||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  25616292 ttcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgc 25616333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451811
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-ca 116  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgcaagccaacaatca 32451933  T
Q  117 tctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcat-aatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 215  Q
    |||||||||| || | | |  ||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||||| ||||   | | |||||||||||| ||| |||||||    
T  32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acataatatcacatcataaatcaacattaacatcccat-aacagcttcacaaattgtaattaa 32451835  T
Q  216 catcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
     |||||  | ||||||||||||||    
T  32451834 tatcatattcaagtcttaatgcta 32451811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7824 - 7732
Alignment:
Q  30 tcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7824 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa 7732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207401
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgac 23207394  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  23207395 atctcaa 23207401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643054
Alignment:
Q  6 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaaca 61  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520092
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 20520198  T
Q  116 atctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataatta 214  Q
    |||||||  || ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| || | | |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  20520197 atctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaatcatcttataacaacttcacagattatcatta 20520099  T
Q  215 acatcat 221  Q
    | |||||    
T  20520098 atatcat 20520092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24642933 - 24642856
Alignment:
Q  89 taataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  24642933 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24642856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786907
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| | ||| ||  |||||| |||| ||| |||||||||| ||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaa 18786911  T
Q  112 caac 115  Q
    ||||    
T  18786910 caac 18786907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 122
Target Start/End: Original strand, 23004774 - 23004872
Alignment:
Q  26 cgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaa-acatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| |  ||| |  ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23004774 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 23004872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 70
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  21 tagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 70  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 69
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  21 tagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 69  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413035
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataata--atatcaaatgcaagtcaaca 113  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaaca 22413142  T
Q  114 acatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataat 212  Q
    |||||||||    | ||  |||| ||| ||||||| ||||    |||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  22413141 acatctcaacatcataa--ataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagattaacat 22413044  T
Q  213 taacatcat 221  Q
    ||| |||||    
T  22413043 taatatcat 22413035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791397
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||  | ||| || |||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacat-aaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaac 23791390  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  23791391 atctcaa 23791397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24697645 - 24697604
Alignment:
Q  81 tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24697645 tcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaa 24697604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39707
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaa 39577  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39578 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 39677  T
Q  202 cagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39678 tagattataattaacatcattattaagtct 39707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 17105
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaa--catcatgacataataatatc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatc 17238  T
Q  99 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17237 aaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacgtcttaaacagct 17138  T
Q  199 tcacagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17137 ttacagattataattaacatcatgattaagtct 17105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79235
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 118  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-gacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtc 79332  T
Q  119 tcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 215  Q
    |||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||| ||| || |||||    
T  79331 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcactgatcatcattaa 79235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 75105
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaa 75235  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75234 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 75135  T
Q  202 cagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  75134 tagattataattaacatcattattaagtct 75105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 25955
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 26080  T
Q  107 gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 206  Q
     |||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26079 ttcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagat 25980  T
Q  207 tataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  25979 tataattaacatcatcattaagtct 25955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44682
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44726  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaat 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  44725 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 44682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33491 - 33385
Alignment:
Q  125 atacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcat 224  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33491 atacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcataggttataattaacatcatcat 33392  T
Q  225 taagtct 231  Q
    |||||||    
T  33391 taagtct 33385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 4513 - 4738
Alignment:
Q  5 atcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgc 104  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4513 atcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 4611  T
Q  105 aagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4612 aagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 4711  T
Q  205 attataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4712 attataattaacatcatcattaagtct 4738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 12095 - 12320
Alignment:
Q  5 atcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgc 104  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12095 atcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 12193  T
Q  105 aagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12194 aagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 12293  T
Q  205 attataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12294 attataattaacatcatcattaagtct 12320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 22047 - 22272
Alignment:
Q  5 atcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgc 104  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22047 atcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 22145  T
Q  105 aagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22146 aagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 22245  T
Q  205 attataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22246 attataattaacatcatcattaagtct 22272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 13212 - 13451
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13212 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13311  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13312 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 13411  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 240  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13412 acaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 13451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 51914 - 52148
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  51914 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 52013  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52014 ttgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatctacatcaacacatcttaaacagcttc 52113  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52114 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 52148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 168098 - 167861
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  168098 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaa 167999  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  || | ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  167998 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagcttc 167900  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  167899 aaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 167861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 38762 - 38995
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38762 catcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 38860  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    |||||| | |||||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38861 atgcaaataaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 38960  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 38995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 32943 - 33158
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  32943 catcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 33041  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    |||||||| |||||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33042 atgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 33141  T
Q  201 acagattataattaaca 217  Q
    |||||||||||| ||||    
T  33142 acagattataatcaaca 33158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 9749 - 9871
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |    
T  9749 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaagt 9847  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  9848 gcaagtcaacaacgtctcaattat 9871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 25897 - 26134
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25897 catcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaatatcatgacataataatatcaa 25995  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25996 atgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttc 26095  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26096 acagattataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 26134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 39859 - 40096
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  39859 catcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaatatcatgacataataatatcaa 39957  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39958 atgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttc 40057  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40058 acaaattataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 40096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339840
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-caacaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 339968  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 202  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339967 -caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 339869  T
Q  203 agattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  339868 agattataattaacgtcatcattaagtct 339840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158450
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 158514  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  158513 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 158450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Original strand, 71350 - 71418
Alignment:
Q  49 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    
T  71350 aacaacagcaacataggcagcatac--aaacagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatct 71418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3103
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 3207  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3206 atgtaattcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 3107  T
Q  201 acag 204  Q
    ||||    
T  3106 acag 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 1852 - 2091
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  1852 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 1951  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1952 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagcttc 2051  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2052 acagattataattaacatcctcattaagtcttaatactat 2091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23113
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacac-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22984  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 202  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22985 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 23084  T
Q  203 agattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23085 agattataaataacatcatcattaagtct 23113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 3471 - 3705
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3471 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 3570  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3571 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 3670  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3671 atagattataattaacatcctcattaagtcttaat 3705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 344 - 573
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  344 catcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatac-aaaatagcatgacgtaataatatcaa 442  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     || ||||||||||||||| || ||| | || |||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443 ttggaagtcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 542  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    | | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  543 atatattataattaacatcctcattaagtct 573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8649 - 8424
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  8649 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca---gcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatcaa 8554  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8553 ttgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 8454  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtc 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8453 acagattataattaacatcctcattaagtc 8424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 39914 - 40143
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  39914 catcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaa 40012  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    ||||| ||||| ||||||| || |||   || |||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40013 atgcatgtcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcataaagagcttc 40112  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40113 acagattataattaacatcatcattaagtct 40143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19883
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 19889  T
Q  116 atctca 121  Q
    ||||||    
T  19888 atctca 19883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6002
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaaca---taggcagtatacgaaaacatcatgacataataatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  6244 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatat 6145  T
Q  98 caaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 197  Q
    ||| ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144 caattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 6045  T
Q  198 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 240  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6044 ttcacattttataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 6002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 4850 - 5088
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  4850 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaa 4949  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
    |||||| |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4950 atgcaattcaacaacatcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttc 5049  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    ||||||||||  ||||  | ||||||||||||| |||||    
T  5050 acagattatagctaaccccttcattaagtcttattgcta 5088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1168 - 931
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  1168 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaa 1069  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| |||  || | ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  1068 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagcttc 970  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  969 aaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3424
Alignment:
Q  63 aggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatat 162  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacattatat 3489  T
Q  163 cacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatcatcatta 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3488 cacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcatagattataattaacatcatcatta 3424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 16114 - 16323
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||    
T  16114 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaa 16213  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagctt 199  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  16214 atgcaagccaacatcatctcaagtatacattcataactcaagtaatgcatataacattatatcacgtcatgatcaacatca--acatcttaaaacagctt 16311  T
Q  200 cacagattataa 211  Q
    ||||||||||||    
T  16312 cacagattataa 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33076 - 32863
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33076 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 32978  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaaca-catcttaaacagctt 199  Q
     ||||| |||||||||||| || ||| | || |||  || |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||| || ||  | ||| |||||    
T  32977 ttgcaattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatcagcatca--taaaatagctt 32881  T
Q  200 cacagattataattaaca 217  Q
    |||||||||||| |||||    
T  32880 cacagattataactaaca 32863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 45929 - 46142
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45929 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 46027  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaaca-catcttaaacagctt 199  Q
     ||||| |||||||||||| || ||| | || |||  || |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||| || ||  | ||| |||||    
T  46028 ttgcaattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatcagcatca--taaaatagctt 46124  T
Q  200 cacagattataattaaca 217  Q
    |||||||||||| |||||    
T  46125 cacagattataactaaca 46142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 17449 - 17389
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaaca 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17449 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 8480 - 8710
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  8480 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaa 8579  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     |||||||||||||||||| ||  || |||   ||  |||||||||||  |||||| ||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8580 ttgcaagtcaacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgcacataacatta----acatcataatcaacatcaacacatcctaaacagcttc 8675  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8676 acagattgtaattaacatcatcattaagtcttaat 8710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24182
Alignment:
Q  18 acttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaa-acatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 116  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
Q  117 tctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataat-caacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 215  Q
    ||| || ||| |||  ||   |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataattcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 24207  T
Q  216 catcatcattaagtcttaatgctat 240  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  24206 catcctcaataagtcttaatactat 24182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Original strand, 27912 - 28061
Alignment:
Q  82 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 28011  T
Q  182 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28012 acaaatcttaaacaacttcacaggttataattaacatcatcattaagtct 28061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 13144 - 13322
Alignment:
Q  52 aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgctta 151  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |    
T  13144 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcaca 13243  T
Q  152 taacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 230  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13244 taacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacagattataattaacatcttcattaagtc 13322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 34124 - 34238
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||     
T  34124 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac-aacccatcatgatataataatatcg 34222  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||| || ||||||||    
T  34223 aatgtaaatcaacaac 34238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 274 - 329
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacag 56  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  274 catcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacag 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 32068 - 32299
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  32068 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacaacatgacataataatatcaa 32165  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     | ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  32166 tttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagcttc 32264  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  32265 acagattataattaacctcattgttaagtcttaat 32299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 20911 - 21146
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  20911 catcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatca 21010  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    | ||||| |||||||||||| |  ||| |||   |    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21011 attgcaattcaacaacatcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcagcatcaacacatcttaaacagctt 21110  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21111 cacaggttataattaacatcttcattaagtcttaat 21146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13498 - 13730
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  13498 catcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacatgataatatcaa 13596  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     | | | ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  13597 tttcgattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagcttc 13695  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  13696 acagattataattaacctcattgttaagtcttaat 13730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 1953 - 2187
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||    
T  1953 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaa 2052  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| |||||||||||| || ||| ||| ||| | ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||     
T  2053 ttgcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacattatatctcatcataatcaacaacaacatatcatatacagcttt 2152  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  2153 acatattattaataaccttatcattaagtcttaat 2187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15583 - 15351
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15583 catcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaa 15485  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     | ||| ||| |||||||| |  |||| ||  ||   ||||||||||| || || | |||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  15484 tttcaattcatcaacatcttatgtataaaaatattcttcaagtaatgcata-aatattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttc 15386  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  15385 acagattataattaaccttattattaagtcttaat 15351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7359
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 7359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 4713 - 4946
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||||    
T  4713 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatcaa 4812  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 200  Q
     ||||| ||| ||| |||| |  |||||||  ||   |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  4813 ttgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacaacttc 4911  T
Q  201 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4912 acagattatacttaacctcattgttaagtcttaat 4946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 235
Target Start/End: Original strand, 1 - 170
Alignment:
Q  65 gcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatca 164  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||||| ||| ||| |||| |  |||||||  ||   |||||||| || || |||| |||||||    
T  1 gcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatcaattgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcata-aacattatatca 99  T
Q  165 catcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  100 catcataatcaacaacaacatatcttatacaacttcacagattatacttaacctcattgttaagtcttaat 170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10543 - 10312
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  10543 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataataatatca 10447  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    | | ||| |||||||||||| || |||||||  ||   ||||||||||| || | || |||||||||||||||||| || | ||| |||||| |||||||    
T  10446 atttcaattcaacaacatcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacgacatatcttatacagctt 10348  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  10347 cacagattataattaaccttattattaagtcttaat 10312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 16283 - 16514
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||    
T  16283 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatca 16379  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    ||| ||| ||| |||||| | |  ||||||| |||   ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  16380 aattcaattcatcaacatattatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagctt 16478  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  16479 cacagattatagttaacctcattattaagtcttaat 16514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 28415 - 28533
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28415 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 28514  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatct 119  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  28515 ttgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 11293 - 11407
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  11293 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcg 11391  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||| || ||||||||    
T  11392 aatgtaaatcaacaac 11407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 1998 - 2112
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  1998 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcg 2096  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||| || ||||||||    
T  2097 aatgtaaatcaacaac 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 4553 - 4605
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa 53  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4553 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 138 - 240
Target Start/End: Original strand, 124723 - 124825
Alignment:
Q  138 tcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgc 237  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  124723 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgc 124822  T
Q  238 tat 240  Q
    |||    
T  124823 tat 124825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174912
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||||||| || ||||||    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatca 174863  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 148  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  174864 aattcaattcaacaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgc 174912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 121767 - 121835
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 69  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  121767 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136370
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||||||||| || ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacac-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 136373  T
Q  116 atc 118  Q
    |||    
T  136372 atc 136370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 145078
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||||||||| || ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacac-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 145081  T
Q  116 atc 118  Q
    |||    
T  145080 atc 145078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 1290 - 1521
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||    
T  1290 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtac---aacatcatgacataattatatca 1386  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  1387 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagctt 1485  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  1486 catagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 7267 - 7498
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||| ||||| ||||||    
T  7267 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacaacatgaaataattatatca 7363  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  7364 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagctt 7462  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  7463 catagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10895
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 10870  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  10871 tgcaagtcaacaacgtctcaattat 10895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4856
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 4792  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  4793 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20909
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20845  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  20846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37983
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 37919  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  37920 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 37983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94573
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 94509  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  94510 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 94573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17440
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 106  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 17500  T
Q  107 gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  17499 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 17440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44604
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaa-catcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44552  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttata 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  44553 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 44604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100496
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaat 100476  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  100477 gcaaatcaacaacatctcaa 100496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40173
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 40193  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  40192 gcaaatcaacaacatctcaa 40173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 119876 - 119947
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 71  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  119876 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 119947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38394
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 103  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| |||   || | |||| |||||| |  ||||||||| |     
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcatagacagatcacaacaacaacatgacttcttaatatcaattt 38497  T
Q  104 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 203  Q
    ||  |||||||||||| ||| || |||| ||| || |||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||    
T  38496 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcaca 38398  T
Q  204 gatt 207  Q
    ||||    
T  38397 gatt 38394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 71
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101571
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 71  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtat 101571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23679 - 23581
Alignment:
Q  108 tcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagatt 207  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||| || |||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||||||    
T  23679 tcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcacagatt 23581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13541
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13490  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttata 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  13491 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 13541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1021 - 853
Alignment:
Q  59 acataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacact 158  Q
    |||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||||| |    
T  1021 acataggcagtatac---aacagcatggcataataatatcaa-tgcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacatt 926  T
Q  159 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||    
T  925 atatcacatcgtaatcgacatcaacacatcttaaacagcttcacatatcataaatagcatcaccattaagtct 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 4953 - 4888
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggc 66  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4953 catcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16995
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16882  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||  |||| || ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  16883 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttca 16981  T
Q  202 cagattataattaa 215  Q
    ||||| || |||||    
T  16982 cagatcatcattaa 16995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14109
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14045  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  14046 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136842
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 136778  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  136779 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 136842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139311
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 139247  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  139248 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 139311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144249
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 144185  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  144186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 144249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134373
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 134309  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  134310 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 134373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141780
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 141716  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  141717 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 141780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Original strand, 62200 - 62317
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||||||| || || ||||| | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||| |    
T  62200 atcatcatcatcttcgacttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat-gaaaaacatcatggtataataatatcga 62298  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||||   ||||||||||||||    
T  62299 atgca---caacaacatctcaa 62317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132784
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||||| | || |||||| |||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaat 132761  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    | || ||| |||| ||||||||||    
T  132762 gtaa-tcatcaacgtctcaattat 132784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116571
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatac-aaaacagcatgacataatcatatcaaat 116527  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaat 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  116528 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128968
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacat-aaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 128975  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  128974 atctcaa 128968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 122
Target Start/End: Original strand, 78348 - 78445
Alignment:
Q  26 cgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||  |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  78348 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatat-aaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaa 78445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 116579 - 116631
Alignment:
Q  164 acatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 215  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  116579 acatcataatcaacattaacatatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 116631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501246
Alignment:
Q  7 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 106  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 501186  T
Q  107 gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  501187 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 501246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85539
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 85644  T
Q  103 gcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 200  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  85643 gcaagtcaatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 85545  T
Q  201 acagat 206  Q
    ||||||    
T  85544 acagat 85539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160805
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 160786  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  160787 gcaa-tcaacaacatgtcaa 160805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9364
Alignment:
Q  2 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaa 9339  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  9340 tgcaagtcaacaacgtctcaattat 9364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82234
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 82170  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  82171 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 82234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22610
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22678  T
Q  114 acatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  22677 acatctcaaatat-caaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 22610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 938
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  1169 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattatatca 1073  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    | | ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  1072 atttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatattttatacagctt 974  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||    
T  973 cacagattatagttaacctcattcttaagacttaat 938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20328
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 118  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacat-cagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 20427  T
Q  119 tcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaaca 217  Q
    |||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||  ||||  ||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||||    
T  20426 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa--aacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaaca 20329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 128752 - 128917
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||| ||||||| |   |  | |  |||||| |||||||||||||||||||    
T  128752 catcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaacaaaaaaaaaaaaa-aaaacagcatgacataataatatcaa 128850  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacat 167  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  ||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  128851 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacat 128917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11410
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 11384  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11385 atgcaagtcaacaacgtctcaattat 11410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 106 - 268
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 204  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  205 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40522
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaat 40498  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  40499 gcaagtcaacaacgtctcaattat 40522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12289
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaa 12315  T
Q  101 atgcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12314 atgcaagtcaacaacgtctcaattat 12289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 51583 - 51814
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||    
T  51583 catcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattataaca 51679  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  51680 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatatccttcaagaaatgcata-aacattataacacttcatattcaacaacaacatatcttattcagctt 51778  T
Q  200 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||| ||||| |||   ||||||||||||    
T  51779 cacagattatagttaacctcactcttaagtcttaat 51814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161049
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacacag-cagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaat 161154  T
Q  103 gcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  | |||||||||  |||| ||| |||||  |||| |||| |||||||    
T  161153 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caatatcaaatcatcataaatcagcttc 161055  T
Q  201 acagat 206  Q
    ||||||    
T  161054 acagat 161049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164550
Alignment:
Q  83 atgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  | |||||||||  |||| ||||||||    
T  164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatca 164576  T
Q  182 acacatcttaaa-cagcttcacagat 206  Q
    |  |||| |||| |||||||||||||    
T  164575 aatcatcataaatcagcttcacagat 164550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 166
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4459
Alignment:
Q  6 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 4398  T
Q  106 agtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    | |||||||| |||||||||  ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  4399 aatcaacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 235
Target Start/End: Original strand, 6669 - 6845
Alignment:
Q  59 acataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacact 158  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| || ||| ||| ||| | ||||||||||| || |||  |    
T  6669 acataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacgtt 6768  T
Q  159 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||    
T  6769 atatcacatcataatcaacaacaacatatcatatacagctttacagattataaataaccttatcattaaatcttaat 6845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 6536 - 6657
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||     
T  6536 catcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 6634  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  6635 aatgcaaatcaacaacatctcaa 6657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 182
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8650
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 8579  T
Q  114 acatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttat--aacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    ||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||  |||  || | |||||||||| |||| |||||||||    
T  8580 acatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12220
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||      |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa------cagcaacacag-cagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaat 12156  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcaca 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  12157 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 5017
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatac---aacatcatgacataattatatcaaa 5150  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 201  Q
    | ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||  || |||| |||| |||||| ||||||||| ||||| || |||  ||| ||||    
T  5149 ttcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaacatattttattcagtttca 5051  T
Q  202 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    || |||||||||||| | || ||||| |||||||    
T  5050 catattataattaaccttattattaaatcttaat 5017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19386
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19366  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  19367 gcaaatcaacaacatctcaa 19386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1149
Alignment:
Q  137 ctcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  1051 ctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacatcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2088
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2193  T
Q  103 gcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 200  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  2192 gcaagtcaattaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 2094  T
Q  201 acagat 206  Q
    ||||||    
T  2093 acagat 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18147 - 17932
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||| |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| | | |||||||||| |||||||||||     
T  18147 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgc-acaacatcatgatataataatatcg 18049  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagct 198  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  18048 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagct 17949  T
Q  199 tcacagattataattaa 215  Q
    |||||||| || |||||    
T  17948 tcacagatcatcattaa 17932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30054
Alignment:
Q  17 aacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 116  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacg 30044  T
Q  117 tctcaattat 126  Q
    ||||||||||    
T  30045 tctcaattat 30054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4337
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaat 4312  T
Q  103 gcaagtcaa-caacatctcaattat 126  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||    
T  4313 gcaagtcaatcaacgtctcaattat 4337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 11563 - 11447
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11563 catcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 11464  T
Q  101 atgcaagtcaacaacat 117  Q
     | ||| ||| ||||||    
T  11463 tttcaattcatcaacat 11447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11399
Alignment:
Q  184 acatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11450 acatgttaatcagcttcacagattataattaacctcatcattaagtcttaat 11399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 231
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4754
Alignment:
Q  21 tagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctc 120  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||| | | | || || || || ||||||||||||  || ||||||||||||     
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatctt 4644  T
Q  121 aattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatc 219  Q
    || ||| || | |||  ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4645 aaatattcatttatacttcaagtaatgcataatacattatatcacatcatgatcaacatca--acatcttaaaacagcctcacaaattataattaacatc 4742  T
Q  220 atcattaagtct 231  Q
     ||| |||||||    
T  4743 ttcaataagtct 4754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 46996 - 47202
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||   | || ||||||||||||||||||    
T  46996 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtttac---agcagcatgacataataatatca 47092  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 199  Q
    | | ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||    |||||||||| || |||| ||||||||||||||| || || ||||| |||||| |||||||    
T  47093 atttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattctccaagtaatgcata-aacattatatcacatcataaacatcaacaacatatcttatacagctt 47191  T
Q  200 cacagattata 210  Q
    |||||||||||    
T  47192 cacagattata 47202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2805
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 2825  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  2824 gcaaatcaacaacatctcaa 2805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 231
Target Start/End: Original strand, 10323 - 10394
Alignment:
Q  160 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10323 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattattattaacatcattattaagtct 10394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 11465 - 11646
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||     
T  11465 catcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcg 11563  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
     | | |||| ||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  11564 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 11646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 38376 - 38195
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||     
T  38376 catcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcg 38278  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
     | | |||| ||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  38277 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 38195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 115
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15776
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccatcatgatataataatatcgaa 15762  T
Q  102 tgcaagtcaacaac 115  Q
    || || ||||||||    
T  15763 tgtaaatcaacaac 15776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Original strand, 1339 - 1424
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacat 89  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||  |||| |||||| ||||||||||||||  ||| | ||||| |||||||    
T  1339 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttgtttaagtaacaatagcaacataggcagattacaacaacattatgacat 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10481
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10549  T
Q  114 acatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  10548 acatctcaaatat-caaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 10481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 235
Target Start/End: Original strand, 3640 - 3716
Alignment:
Q  159 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  3640 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 3716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 235
Target Start/End: Original strand, 7704 - 7780
Alignment:
Q  159 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  7704 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 7780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27663
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 27757  T
Q  114 acatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagat 206  Q
    |||||||||  || ||   |||| || |||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  27756 acatctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 27663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 147
Target Start/End: Original strand, 129917 - 130051
Alignment:
Q  12 tcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  129917 tcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 130015  T
Q  111 acaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatg 147  Q
     ||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  130016 tcaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatg 130051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 60811 - 60614
Alignment:
Q  26 cgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  60811 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatac-aaaacagctcatgatataccaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaa 60714  T
Q  123 ttatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaacatcat 221  Q
      || ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  60713 acattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaatcattttataacagcttcacagattatcattaatatcat 60614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45787
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 45811  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    | |||||| |||||||||||||||    
T  45810 gtaagtcatcaacatctcaattat 45787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14696
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||| ||||||| |||    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagta-agaaaatcatcatgatatagtaatatcgaat 14716  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  14715 gcaaatcaacaacatctcaa 14696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 6243 - 6134
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||     
T  6243 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 6145  T
Q  100 aatgcaagtca 110  Q
    |||||||||||    
T  6144 aatgcaagtca 6134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16014
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 16108  T
Q  114 acatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagat 206  Q
    |||||||||  || |    |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  16107 acatctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 16014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13336
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 117  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  118 ct-caattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagat 206  Q
    ||  ||  || ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  13246 ctgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 13336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Original strand, 5655 - 5765
Alignment:
Q  12 tcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaa-catcatgacataataatatcaaatgcaagtc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||    
T  5655 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtat--gaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatc 5752  T
Q  110 aacaacatctcaa 122  Q
    |||||||||||||    
T  5753 aacaacatctcaa 5765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1336
Alignment:
Q  6 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| | | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 1342  T
Q  106 agtcaa 111  Q
    ||||||    
T  1341 agtcaa 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Original strand, 133 - 275
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 231  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatg 147  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  232 gcaaatcaacaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatg 275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38701
Alignment:
Q  3 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||    
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaa 38722  T
Q  102 tgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    ||||||||| ||| |||||||    
T  38721 tgcaagtcatcaatatctcaa 38701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 1189 - 1075
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  1189 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcg 1091  T
Q  100 aatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||| || ||||||||    
T  1090 aatgtaaatcaacaac 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 32539 - 32657
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||    
T  32539 catcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatca 32635  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  32636 aatgcaa-tcaacaacatctcaa 32657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51766
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-ca 116  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || | |||| | || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatc-aatgcaagccaacaatca 51888  T
Q  117 tctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcat-aatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 215  Q
    |||||||||| || | | |  ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |  || | |||||||||||| ||| |||||||    
T  51887 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataaatcaacattaatatctcat-aacagcttcacaaattgtaattaa 51790  T
Q  216 catcatcattaagtcttaatgcta 239  Q
     |||||  | ||||||||||||||    
T  51789 tatcatattcaagtcttaatgcta 51766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 15897 - 15788
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||     
T  15897 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatcg 15799  T
Q  100 aatgcaagtca 110  Q
    |||||||||||    
T  15798 aatgcaagtca 15788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178961
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggca 67  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggca 178961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 53640 - 53488
Alignment:
Q  30 tcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatac 128  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  53640 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattc 53542  T
Q  129 aatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    |   |||| ||||||||||  ||||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  53541 atatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 53488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17929 - 17873
Alignment:
Q  179 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17929 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 17873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 6612 - 6719
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||     
T  6612 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatcg 6710  T
Q  100 aatgcaagt 108  Q
    |||||||||    
T  6711 aatgcaagt 6719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 13992 - 14099
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||     
T  13992 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatcg 14090  T
Q  100 aatgcaagt 108  Q
    |||||||||    
T  14091 aatgcaagt 14099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2644
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||| |||||||  |||| |||||  |||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtat-gtaaatcatcatgttataacaatattgaat 2664  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  2663 gcaaatcaacaacatctcaa 2644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1037
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | | | |||||||| |||| || |||     
T  1154 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgc-agatcatcatgatataacaacatcg 1056  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatc 118  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  1055 aatgcaagtcatcaacatc 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 12767 - 12884
Alignment:
Q  1 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||| |||| ||||||     
T  12767 catcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 12865  T
Q  100 aatgcaagtcaacaacatc 118  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  12866 aatgcaagtcatcaacatc 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1154
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 117  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||| | | ||| ||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacat 1149  T
Q  118 ctcaa 122  Q
    |||||    
T  1150 ctcaa 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12690
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 117  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
Q  118 ctcaa 122  Q
    |||||    
T  12686 ctcaa 12690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10649
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10640  T
Q  114 acatctcaa 122  Q
    |||||||||    
T  10641 acatctcaa 10649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1204
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 1184  T
Q  103 gcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
     || |||| |||||| ||||    
T  1185 acaggtcatcaacatttcaa 1204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24000 - 23898
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  24000 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 23902  T
Q  103 gcaa 106  Q
    ||||    
T  23901 gcaa 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 23843 - 24048
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgac-----ataataatatc 98  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||| | ||||  |||||     |||| ||||||    
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaccataggcagattacaacaacagtatgacatcatataacaatatc 23942  T
Q  99 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 198  Q
    ||||  ||  || |||||||||||| || || |||||  ||||||||||    ||||| |||||||||||||| ||||||  ||||  |||| |||||||    
T  23943 aaat--aaaacagcaacatctcaatcattcattcatagttcaagtaatgaaattaacattatatcacatcatattcaacactaacatctctt-aacagct 24039  T
Q  199 tcacagatt 207  Q
    |||||||||    
T  24040 tcacagatt 24048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16442 - 16264
Alignment:
Q  27 gactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaatta 125  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || | ||||||||||| | |||||||||| |  |  |||||||||||| ||| |    
T  16442 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggca-tatcacaacaacatcatgacttcataatatcaatta-atttcaacaacatcttaatca 16345  T
Q  126 tacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagatt 207  Q
    | |||| ||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16344 ttcaataatatcttaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcacagatt 16264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 115
Target Start/End: Original strand, 6824 - 6927
Alignment:
Q  12 tcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtca 110  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||  ||||||| |||    
T  6824 tcatcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatca 6922  T
Q  111 acaac 115  Q
    |||||    
T  6923 acaac 6927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 122
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8137
Alignment:
Q  75 aaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8090 aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 8137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 240
Target Start/End: Original strand, 20595 - 20643
Alignment:
Q  192 aacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595 aacagcttcacagattatagttaacatcatcattaagtcttaatgctat 20643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 8075
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaa 8082  T
Q  112 caacatc 118  Q
    |||||||    
T  8081 caacatc 8075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 118
Target Start/End: Original strand, 12943 - 13057
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 102  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  12943 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcagcatgatataacaatatcgaat 13041  T
Q  103 gcaagtcaacaacatc 118  Q
    |||||||| |||||||    
T  13042 gcaagtcatcaacatc 13057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28818
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataaca--acagcaacataggcagtat 71  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtat 28818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 122
Target Start/End: Original strand, 38342 - 38440
Alignment:
Q  26 cgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38342 cgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatat-aaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaa 38440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6281
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |||||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatat-aaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  6287 atctcaa 6281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25229
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||  ||||| ||||||| ||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaa 25218  T
Q  112 caacatctcaa 122  Q
    |||||||||||    
T  25219 caacatctcaa 25229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2217
Alignment:
Q  57 caacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 2217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7998
Alignment:
Q  21 tagatcgactcatacagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 117  Q
    |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| | ||| ||  |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgc-aaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacat 8063  T
Q  118 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
    || ||  || ||   |||| ||||||||||  ||||| | |||||||||| |||| |||||||||    
T  8062 cttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaa 7998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  21 tagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 70  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 182
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225588
Alignment:
Q  57 caacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataaca 156  Q
    |||||||| |||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||   |||| ||||||||||| ||||  |    
T  225465 caacatagtcagtatgc-aaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaa 225562  T
Q  157 ctatatcacatcataatcaacatcaa 182  Q
     |||||||||| |||| |||||||||    
T  225563 ttatatcacattataaacaacatcaa 225588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10575
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcaacataggcag 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15796 - 15736
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacatag 64  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  15796 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatag 15736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4921 - 4741
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 103  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||| || ||||||||||||| || |||| |||||||||   || | |||| | |||| | |||||||||| |     
T  4921 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataataatagcagcataggcagatcacaacaacagcttgacttcataatatcaattt 4822  T
Q  104 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacatcaaca 184  Q
    ||  |||||||||||| ||| || |||| ||| || |||||||    |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4821 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatatacataacgttatatcacatcatattcaacattaaca 4741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36517
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggca 67  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || | ||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagtagcataggca 36517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15486 - 15418
Alignment:
Q  49 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  15486 aacaacatcaacataggcagcatac--aaacagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatct 15418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 193070 - 192920
Alignment:
Q  27 gactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaatta 125  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || | ||||||||||||||| |||||||  |  || || |||||||||||||||    
T  193070 gactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattc-acaacatctcaatta 192972  T
Q  126 tacaatcataactcaagtaatg-cttataacactatatcacatcataatcaa 176  Q
    | |||| | |  |||||| |||  ||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  192971 ttcaataaaacttcaagtgatgtattacaacattatatcacaccataatcaa 192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97129
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||  || || ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 97122  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  97123 atctcaa 97129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106407
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||  || || ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 106400  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  106401 atctcaa 106407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaaca 61  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 126
Target Start/End: Original strand, 13092 - 13130
Alignment:
Q  88 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13092 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 13130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 1881 - 1945
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21856
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 21856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29748
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 29748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 14664 - 14728
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  14664 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 14728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 23679 - 23743
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  23679 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 23743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 39103 - 39167
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  39103 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 39167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Original strand, 569 - 669
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcata-taaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 666  T
Q  116 atc 118  Q
    |||    
T  667 atc 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 218
Target Start/End: Original strand, 32544 - 32650
Alignment:
Q  112 caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataa-cactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattata 210  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||   ||| || || ||||||| ||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||  |    
T  32544 caacatctcaatcattcattcataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacattaacatttcat-aacagcttcacagattgca 32642  T
Q  211 attaacat 218  Q
    ||||||||    
T  32643 attaacat 32650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103632
Alignment:
Q  15 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 111  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||  || || |||||||||||| ||||||  ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||  |||    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataa-aaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacaa 103639  T
Q  112 caacatc 118  Q
    |||||||    
T  103638 caacatc 103632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267784
Alignment:
Q  19 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 115  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||     
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaat 267777  T
Q  116 atctcaa 122  Q
    |||||||    
T  267778 atctcaa 267784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29660
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 103  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||    |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||| | || | ||||||||||||||||||| ||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaataatagcatgacataataatatcaattg 29657  T
Q  104 caa 106  Q
    |||    
T  29658 caa 29660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1836 - 1795
Alignment:
Q  81 tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 122  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1836 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 1795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1257 - 1169
Alignment:
Q  91 ataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacactatatcacatcataatcaacat 179  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||||| ||| || |||| ||| || || ||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1257 ataatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaaataatgcacataacattatatcacatcatattcaacat 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 6095 - 6159
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  6095 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 6159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 26828 - 26892
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    |||||| || |||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  26828 catcattttaatcatcttatatcgactcatgcatcttggttaaataacaatagcagcataggcag 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69858
Alignment:
Q  4 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 68  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 69858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University